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Alignment Overview

Query: NF15505_high_3 (Length: 318)

Name: NF15505_high_3
Description: NF15505
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15505_high_3
NF15505_high_3
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (24-318)||(36030-36324)
[»] chr4 (44 HSPs)
chr4 (24-318)||(9230164-9230458)
chr4 (13-233)||(6482039-6482262)
chr4 (13-233)||(1724314-1724536)
chr4 (13-122)||(19534324-19534431)
chr4 (13-245)||(12825453-12825687)
chr4 (13-185)||(37348992-37349166)
chr4 (13-236)||(26564700-26564925)
chr4 (13-244)||(39188384-39188616)
chr4 (13-122)||(425692-425799)
chr4 (13-230)||(48459349-48459569)
chr4 (13-230)||(31752324-31752544)
chr4 (13-122)||(37107280-37107387)
chr4 (13-236)||(39375149-39375372)
chr4 (20-165)||(7985193-7985341)
chr4 (19-212)||(47550378-47550574)
chr4 (13-211)||(5902640-5902841)
chr4 (13-191)||(39046821-39047001)
chr4 (13-211)||(43893096-43893297)
chr4 (13-212)||(6382297-6382500)
chr4 (13-125)||(13770571-13770681)
chr4 (13-211)||(7608838-7609039)
chr4 (13-115)||(29755456-29755556)
chr4 (13-122)||(42774629-42774737)
chr4 (13-226)||(47239396-47239612)
chr4 (20-196)||(21423736-21423915)
chr4 (13-212)||(32585356-32585559)
chr4 (20-230)||(11027947-11028161)
chr4 (19-211)||(44317408-44317604)
chr4 (13-122)||(31918678-31918786)
chr4 (13-244)||(32596177-32596410)
chr4 (19-211)||(11122895-11123090)
chr4 (24-115)||(28695268-28695357)
chr4 (13-122)||(42299659-42299767)
chr4 (59-196)||(55826664-55826807)
chr4 (25-109)||(15987372-15987455)
chr4 (13-122)||(4766431-4766540)
chr4 (59-122)||(13015370-13015439)
chr4 (59-122)||(18423480-18423543)
chr4 (20-86)||(53906437-53906501)
chr4 (129-215)||(15987284-15987370)
chr4 (139-236)||(19883057-19883154)
chr4 (61-122)||(24637086-24637147)
chr4 (78-122)||(568326-568370)
chr4 (13-57)||(13015555-13015599)
[»] chr7 (52 HSPs)
chr7 (13-233)||(18825875-18826097)
chr7 (13-233)||(12980244-12980467)
chr7 (13-236)||(5376953-5377178)
chr7 (13-230)||(27850332-27850550)
chr7 (13-225)||(38139802-38140019)
chr7 (13-233)||(2630577-2630799)
chr7 (13-234)||(16078881-16079104)
chr7 (16-155)||(46127264-46127402)
chr7 (13-245)||(3920406-3920640)
chr7 (13-253)||(26622819-26623061)
chr7 (13-245)||(24425249-24425482)
chr7 (13-230)||(45379973-45380194)
chr7 (13-230)||(17885332-17885552)
chr7 (13-236)||(18125228-18125454)
chr7 (13-236)||(37182142-37182367)
chr7 (19-212)||(30650504-30650700)
chr7 (17-234)||(25782909-25783128)
chr7 (13-121)||(37579130-37579236)
chr7 (13-120)||(23328477-23328582)
chr7 (13-230)||(35074336-35074557)
chr7 (19-230)||(7779881-7780095)
chr7 (13-236)||(21702526-21702752)
chr7 (13-236)||(41741450-41741675)
chr7 (13-115)||(44986023-44986124)
chr7 (13-230)||(16866036-16866256)
chr7 (13-212)||(45885789-45885991)
chr7 (13-122)||(39316862-39316970)
chr7 (13-112)||(5916194-5916291)
chr7 (35-122)||(26004590-26004675)
chr7 (13-115)||(43507300-43507401)
chr7 (13-196)||(44794068-44794253)
chr7 (13-122)||(37196116-37196224)
chr7 (21-230)||(41103528-41103743)
chr7 (13-86)||(26004675-26004746)
chr7 (13-164)||(24753043-24753196)
chr7 (59-122)||(44658567-44658631)
chr7 (13-122)||(25905495-25905603)
chr7 (13-227)||(44734366-44734583)
chr7 (13-313)||(45708785-45709088)
chr7 (18-210)||(17851726-17851921)
chr7 (13-122)||(39456131-39456239)
chr7 (13-86)||(3227698-3227769)
chr7 (13-230)||(38152769-38152974)
chr7 (21-120)||(25980037-25980135)
chr7 (62-243)||(16811644-16811829)
chr7 (14-84)||(10072357-10072425)
chr7 (86-122)||(3227064-3227100)
chr7 (59-122)||(29015099-29015162)
chr7 (59-122)||(37103268-37103331)
chr7 (62-122)||(21750678-21750738)
chr7 (133-221)||(29855468-29855556)
chr7 (78-122)||(31425916-31425960)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (13-185)||(31942237-31942411)
chr2 (13-252)||(6027873-6028115)
chr2 (13-191)||(19104886-19105066)
chr2 (13-122)||(14540649-14540752)
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chr2 (19-230)||(37999352-37999566)
chr2 (13-191)||(13705406-13705587)
chr2 (13-230)||(7314654-7314874)
chr2 (13-236)||(12193827-12194053)
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chr2 (20-119)||(16226848-16226945)
chr2 (13-115)||(37106562-37106663)
chr2 (13-115)||(37472854-37472955)
chr2 (19-184)||(10920514-10920682)
chr2 (13-196)||(42798028-42798215)
chr2 (13-212)||(24414156-24414358)
chr2 (13-211)||(9632249-9632450)
chr2 (13-211)||(30846808-30847010)
chr2 (13-212)||(8915961-8916163)
chr2 (19-214)||(10208452-10208650)
chr2 (13-122)||(45115421-45115529)
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chr2 (13-232)||(44746113-44746335)
chr2 (139-233)||(25210369-25210463)
chr2 (20-115)||(18106215-18106309)
chr2 (13-57)||(37319805-37319849)
chr2 (59-122)||(30978810-30978873)
chr2 (59-122)||(38342659-38342722)
chr2 (149-236)||(30978929-30979014)
chr2 (63-106)||(17598816-17598859)
chr2 (59-122)||(26755637-26755701)
chr2 (78-122)||(42576516-42576560)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (13-236)||(1012480-1012706)
chr8 (13-253)||(17469118-17469360)
chr8 (20-236)||(43113626-43113844)
chr8 (13-230)||(29108828-29109048)
chr8 (16-233)||(20399457-20399677)
chr8 (13-122)||(35215367-35215474)
chr8 (19-227)||(24870033-24870243)
chr8 (13-185)||(34139310-34139484)
chr8 (13-185)||(24568802-24568975)
chr8 (20-230)||(1063376-1063589)
chr8 (13-230)||(39445582-39445793)
chr8 (13-245)||(36131908-36132141)
chr8 (13-212)||(45235927-45236129)
chr8 (17-230)||(27932279-27932495)
chr8 (13-211)||(32302922-32303124)
chr8 (13-163)||(2075907-2076060)
chr8 (13-122)||(17220579-17220687)
chr8 (13-115)||(34021341-34021441)
chr8 (21-196)||(24927819-24927997)
chr8 (31-245)||(14186205-14186417)
chr8 (13-115)||(4230844-4230945)
chr8 (13-115)||(29089573-29089672)
chr8 (30-230)||(34776945-34777148)
chr8 (20-122)||(28977232-28977333)
chr8 (13-86)||(40248502-40248573)
chr8 (13-211)||(11255033-11255230)
chr8 (129-236)||(30481421-30481528)
chr8 (59-122)||(4594276-4594339)
chr8 (149-236)||(14155533-14155620)
chr8 (13-86)||(31325127-31325197)
chr8 (131-236)||(29918590-29918695)
chr8 (129-252)||(9642335-9642458)
chr8 (139-236)||(37960962-37961059)
[»] chr6 (28 HSPs)
chr6 (13-171)||(14032419-14032579)
chr6 (13-252)||(14505949-14506190)
chr6 (13-244)||(24602848-24603081)
chr6 (13-230)||(2367188-2367408)
chr6 (13-236)||(12678094-12678318)
chr6 (13-253)||(7393870-7394112)
chr6 (13-119)||(14410954-14411058)
chr6 (21-173)||(30816128-30816285)
chr6 (13-230)||(32853706-32853926)
chr6 (13-119)||(14245110-14245214)
chr6 (45-230)||(27738666-27738854)
chr6 (19-191)||(10142563-10142738)
chr6 (19-230)||(5863389-5863603)
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chr6 (20-211)||(27534553-27534747)
chr6 (13-228)||(11762308-11762525)
chr6 (13-191)||(3483968-3484149)
chr6 (13-185)||(10188124-10188299)
chr6 (19-185)||(12141253-12141422)
chr6 (13-122)||(14254821-14254928)
chr6 (13-212)||(12309441-12309636)
chr6 (13-86)||(32532426-32532497)
chr6 (65-230)||(32053000-32053170)
chr6 (158-253)||(32959870-32959965)
chr6 (145-233)||(14410858-14410946)
chr6 (58-122)||(29200026-29200090)
chr6 (133-236)||(18908878-18908981)
chr6 (58-122)||(9458548-9458612)
[»] chr1 (47 HSPs)
chr1 (13-191)||(9982935-9983115)
chr1 (13-236)||(44615475-44615701)
chr1 (13-236)||(44792868-44793094)
chr1 (13-185)||(49741058-49741232)
chr1 (13-233)||(34673285-34673507)
chr1 (13-122)||(35936935-35937042)
chr1 (13-233)||(12494874-12495096)
chr1 (13-236)||(29871285-29871510)
chr1 (13-230)||(45866191-45866411)
chr1 (13-253)||(16433150-16433386)
chr1 (7-122)||(44632254-44632367)
chr1 (13-230)||(51421721-51421941)
chr1 (13-122)||(40087581-40087689)
chr1 (13-122)||(42707948-42708056)
chr1 (13-230)||(17134810-17135030)
chr1 (13-230)||(18354086-18354306)
chr1 (13-230)||(29936279-29936499)
chr1 (27-225)||(16408823-16409021)
chr1 (13-122)||(5180908-5181016)
chr1 (13-230)||(19572518-19572737)
chr1 (13-191)||(42439715-42439896)
chr1 (13-122)||(50426773-50426881)
chr1 (21-230)||(24236767-24236979)
chr1 (13-211)||(28297796-28297998)
chr1 (13-115)||(34060144-34060245)
chr1 (19-230)||(36187226-36187440)
chr1 (13-191)||(23966735-23966917)
chr1 (13-172)||(17092023-17092185)
chr1 (13-122)||(3628105-3628213)
chr1 (13-212)||(49250797-49250999)
chr1 (13-230)||(34610936-34611156)
chr1 (61-120)||(2514677-2514736)
chr1 (139-252)||(48125667-48125780)
chr1 (21-111)||(13020559-13020648)
chr1 (13-115)||(24710721-24710822)
chr1 (13-122)||(39616166-39616274)
chr1 (13-122)||(20774495-20774603)
chr1 (92-185)||(13390354-13390451)
chr1 (129-236)||(34085217-34085324)
chr1 (61-115)||(38733901-38733955)
chr1 (92-211)||(23490796-23490919)
chr1 (61-121)||(36616796-36616856)
chr1 (13-55)||(13390312-13390354)
chr1 (13-50)||(2514512-2514549)
chr1 (65-122)||(24160001-24160058)
chr1 (131-236)||(41476952-41477057)
chr1 (164-236)||(13798255-13798327)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (13-233)||(4016047-4016269)
chr3 (13-233)||(4557308-4557530)
chr3 (13-236)||(19111598-19111822)
chr3 (13-236)||(34119521-34119744)
chr3 (13-215)||(53631767-53631971)
chr3 (13-185)||(31126846-31127020)
chr3 (13-236)||(42758237-42758462)
chr3 (13-230)||(44172488-44172708)
chr3 (13-230)||(44179188-44179408)
chr3 (24-233)||(54317018-54317229)
chr3 (13-230)||(49579926-49580146)
chr3 (13-230)||(48390823-48391042)
chr3 (13-122)||(22535959-22536067)
chr3 (13-230)||(34025816-34026036)
chr3 (13-225)||(29842170-29842385)
chr3 (16-120)||(41937122-41937224)
chr3 (13-230)||(52198016-52198237)
chr3 (13-122)||(30682684-30682791)
chr3 (13-230)||(830872-831090)
chr3 (19-214)||(44106814-44107012)
chr3 (13-230)||(39655279-39655499)
chr3 (13-227)||(34154280-34154493)
chr3 (13-212)||(52572471-52572673)
chr3 (13-122)||(20086871-20086979)
chr3 (13-191)||(39728533-39728714)
chr3 (13-227)||(43582440-43582656)
chr3 (13-230)||(44953441-44953661)
chr3 (59-212)||(44639180-44639338)
chr3 (13-196)||(6738434-6738620)
chr3 (13-184)||(17146202-17146376)
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chr3 (13-185)||(44252609-44252784)
chr3 (18-211)||(7469803-7469999)
chr3 (20-122)||(10823811-10823912)
chr3 (21-225)||(23580698-23580905)
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chr3 (7-119)||(48306657-48306768)
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chr3 (13-125)||(23547087-23547198)
chr3 (24-92)||(55438828-55438894)
chr3 (59-115)||(14208308-14208363)
chr3 (59-122)||(1772540-1772603)
chr3 (129-233)||(30616284-30616388)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (13-230)||(4582981-4583201)
chr5 (13-122)||(3573087-3573194)
chr5 (13-215)||(35194011-35194215)
chr5 (13-191)||(2412772-2412952)
chr5 (13-122)||(2985010-2985117)
chr5 (13-230)||(4920688-4920908)
chr5 (20-125)||(12447251-12447354)
chr5 (13-173)||(27088416-27088577)
chr5 (13-211)||(5908714-5908915)
chr5 (13-184)||(38006522-38006695)
chr5 (13-191)||(1218619-1218798)
chr5 (13-190)||(30115346-30115525)
chr5 (13-230)||(28045517-28045737)
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chr5 (13-236)||(18206880-18207106)
chr5 (13-115)||(3564853-3564954)
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chr5 (13-227)||(13402014-13402229)
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chr5 (30-196)||(6092559-6092728)
chr5 (13-230)||(15890069-15890288)
chr5 (7-122)||(20973604-20973718)
chr5 (13-185)||(12834626-12834802)
chr5 (13-185)||(12866603-12866779)
chr5 (13-125)||(27302851-27302959)
chr5 (139-242)||(6810149-6810252)
chr5 (77-122)||(33420449-33420494)
chr5 (21-114)||(6369566-6369658)
chr5 (58-122)||(20634064-20634128)
chr5 (58-122)||(20650178-20650242)
chr5 (58-122)||(34259144-34259208)
chr5 (92-244)||(15564576-15564732)
chr5 (13-86)||(10126970-10127041)
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chr5 (59-122)||(2681101-2681164)
chr5 (139-236)||(17153160-17153257)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (13-233)||(33256-33478)
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scaffold0294 (13-112)||(14638-14735)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (13-122)||(6269-6376)
[»] scaffold0189 (1 HSPs)
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[»] scaffold0097 (1 HSPs)
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[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (13-122)||(90460-90567)
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scaffold0014 (13-95)||(14290-14370)
[»] scaffold0519 (1 HSPs)
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[»] scaffold0095 (1 HSPs)
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[»] scaffold0902 (1 HSPs)
scaffold0902 (13-103)||(748-836)
[»] scaffold0015 (1 HSPs)
scaffold0015 (68-116)||(56044-56092)


Alignment Details
Target: scaffold0135 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Original strand, 36030 - 36324
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  36030 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 36129  T
Q  124 aatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaa 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  36130 aatggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgttataaatttgggaa 36229  T
Q  224 aaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaattcttcgtccaaatagatttgattcgagtgaataaccacatatatgagttttgttgccatgtctaa 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  36230 aaacccaaacccaatcaaaacgaggaaaattcgtcatccaaatagatttgattcgagtgagtaaccacggatatgaattttgttgccatgtctaa 36324  T

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Target: chr4 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 44)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 24 - 318
Target Start/End: Original strand, 9230164 - 9230458
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9230164 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacagttatcaaacaaaataacatgacatatt 9230263  T
Q  124 aatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaa 223  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||    
T  9230264 aatggtaattttctgcattcgggacgggtttggttatgagtttgggatggatacctatatactcgttatccgtcctatacccgtgttataaatttgggaa 9230363  T
Q  224 aaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaattcttcgtccaaatagatttgattcgagtgaataaccacatatatgagttttgttgccatgtctaa 318  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  9230364 aaacccaaacccaatcaaaacgaggaaaattcgtcatccaaatagatttgattcgagtgagtaaccacggatatgaattttgttgccatgtctaa 9230458  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6482262 - 6482039
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6482262 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttct--cctttaaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 6482165  T
Q  113 catgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| ||||| |||   ||     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||  ||| | |||| |||    
T  6482164 catggcatatcaatataaattagtttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatataccctttactcgtcccatacccgt 6482065  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    ||||| || | ||| |||||||||||    
T  6482064 gtttttaaattggggaaaacccaaac 6482039  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 1724536 - 1724314
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||    
T  1724536 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatctaacaaaataa 1724439  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| |||| | |||| | ||    
T  1724438 catgacatatcaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatataaccgttacccgtcccatacccatg 1724339  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || ||||| |||||||||||    
T  1724338 ttttgaaatcggggaaaacccaaac 1724314  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 19534324 - 19534431
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19534324 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttagatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 19534421  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  19534422 catgacatat 19534431  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 12825687 - 12825453
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12825687 aatatcctcactttaatatttattagaccaattgatttagttgct--cctttaaatatcaattttagtttttataacacgataattatcaaacaaaataa 12825590  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    ||||| |||| |    |  |||||||| |||| ||||||| ||||||| ||| ||||  |||||| ||| ||||||  ||||| |||| | |||| ||||    
T  12825589 catgatatatcaacataaagtaattttctgcactcgggacaggtttgggtataggttcagggtgggtacgtatatatccgttacccgtcccatacccgtg 12825490  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacg 245  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  12825489 ttttgaaatcggggaaaacccaaactcagtcaaaacg 12825453  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 37348992 - 37349166
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  37348992 aatatgctcactttaagatttgttagaccgattaatttagttgct--cctttaaatatcaacggtagtttttataacgcgagaattatcaaacaaaataa 37349089  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| ||||| |    |   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||    
T  37349090 catggcatatcaacataaaataattttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtggatacctatatac 37349166  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 26564700 - 26564925
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||| |||    
T  26564700 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttg--ttccgttaaatatcaatgatagtttttataacacggcagttatcaaacaaactaa 26564797  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  ||| |||| |||||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| || |    
T  26564798 catgacatatcaacataaagtagttttctgcatttgggacgggtttgggtatggtttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgcg 26564897  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||| || ||||| ||| | ||||||||    
T  26564898 ttttgaaatcggggaaagctcaaactca 26564925  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Original strand, 39188384 - 39188616
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  39188384 aatatgttcactttaacatttgttagaacgattgatttagtt--ttttctttaaatataaatggtagttttt-taacacgacagttatcaaacaaaataa 39188480  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta-gccgttctatactcgt 207  Q
    |||||||||| |    |    |||||| ||||||||||| | ||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||  |||||  |||||| |||  |||    
T  39188481 catgacatatcaacataaaacaattttatgcattcgggatgagtttggacatgggtttggggtgg-tacctatatatccgttaccccgttccatagacgt 39188579  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaac 244  Q
    |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||    
T  39188580 gttttaaaatcagggaaaacccaaacccaatcaaaac 39188616  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 425692 - 425799
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  425692 aatatgttcactttaagatttgttagaccgattgatttagttg--ttcttttaaatatcaatggtagtttttataacatgacaattatcaaacaaaataa 425789  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    |||| |||||    
T  425790 catggcatat 425799  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 48459349 - 48459569
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  48459349 aatatgctcactttaacattttttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 48459446  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||||| |||| | |    
T  48459447 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgttccatacccat 48459546  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  48459547 gttttgaaatcggggaaaaccca 48459569  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 31752324 - 31752544
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||| || |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31752324 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcattgttagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 31752421  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  || |||||||||||||  |||   |||| |||    
T  31752422 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggaacctatatactcgttactcgtctcatacccgt 31752521  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  31752522 gttttgaaatcggggaaaaccca 31752544  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 37107280 - 37107387
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  37107280 aatatgctcattttaatatttgtcagaccgattgatttagttgctt--ctttaaataccaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataa 37107377  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  37107378 catgacatat 37107387  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 39375149 - 39375372
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||  |||| |||||||||  ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39375149 aatatgctcactt-aacatttgttcgattgatttatttagttg--ttcctttaaatattagtggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataa 39375245  T
Q  113 catgacat---attaatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgt 209  Q
    ||||||||     ||| |  | ||||||||| | ||||||||||||  |||| | ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| |||||| ||| |    
T  39375246 catgacatcaacgtaaagtaatttttttgcaattgggacgggtttgagtatgtgattggggtggatatctatatacccgttacccgtcctatacccgtat 39375345  T
Q  210 tttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||| || ||||| |||| |||||||||    
T  39375346 tttgaaatcggggaaaagccaaactca 39375372  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 7985341 - 7985193
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttt-ataacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7985341 tcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgct--catttaaatatcaacggtagttttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 7985244  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtt 165  Q
     ||| |    |   || |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7985243 ttatcaacataaaatacttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggtt 7985193  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 47550574 - 47550378
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  47550574 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 47550477  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt 212  Q
    ||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| ||||||||    
T  47550476 catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgtttt 47550378  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5902841 - 5902640
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  5902841 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 5902744  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    | || |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  5902743 agataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 5902644  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  5902643 gttt 5902640  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 39046821 - 39047001
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39046821 aatatgctcattttaacatttgttagacggaatgatttagtt--aatcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 39046918  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||||||| |||||    
T  39046919 acat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggagtgggtacctatatacccgtta 39047001  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 43893096 - 43893297
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  43893096 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 43893193  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||  || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  43893194 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgaattcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 43893293  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  43893294 gttt 43893297  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 6382500 - 6382297
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  6382500 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 6382403  T
Q  112 acatgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| |||||| ||    ||     |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  6382402 acataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 6382303  T
Q  207 tgtttt 212  Q
    ||||||    
T  6382302 tgtttt 6382297  T

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Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 13770681 - 13770571
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13770681 aatatgttcactttaacatttgtttgaccgattgatttagttgct--ccttcaaatattaatggtcgtttttataacacggtaattatcaaacaaaataa 13770584  T
Q  113 catgacatattaa 125  Q
    |||| | ||||||    
T  13770583 catggcttattaa 13770571  T

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Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 7608838 - 7609039
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  7608838 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatgacagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 7608935  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  7608936 acataacatatcaacatagagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 7609035  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  7609036 gttt 7609039  T

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Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 29755556 - 29755456
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  29755556 aatatactcattttaacatttgttagatcgattgatttagttactt--ctttaaatatcaatggtagtgtttataacacggtaattatcaaacaaaataa 29755459  T
Q  113 cat 115  Q
    |||    
T  29755458 cat 29755456  T

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Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 42774629 - 42774737
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42774629 aatatgttcattttaacatttgttagaaggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 42774726  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  42774727 acatgacatat 42774737  T

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Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Complemental strand, 47239612 - 47239396
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||| || |   | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  47239612 aatatgctcactttaacatttgataaatgaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 47239515  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||| ||| ||| ||||||||  ||||||  || ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  47239514 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtatgggtatgggttcagggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 47239415  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaa 226  Q
    |||||||| |||| |||||    
T  47239414 gttttaaaatcggaaaaaa 47239396  T

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Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 20 - 196
Target Start/End: Original strand, 21423736 - 21423915
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| || ||    
T  21423736 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataatataac 21423833  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  21423834 atatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgtgtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgt 21423915  T

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Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 32585356 - 32585559
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggt-agtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaat 110  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  32585356 aatacgctcactttaacaattgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgattagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaat 32585453  T
Q  111 aacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||||| |    |  |||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| | || | |||| ||    
T  32585454 aacaagacatataaacataaagtaagtttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccg 32585553  T
Q  207 tgtttt 212  Q
    ||||||    
T  32585554 tgtttt 32585559  T

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Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 11027947 - 11028161
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11027947 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatataaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataac 11028044  T
Q  119 atattaat----ggtaa-ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    |||| |||     |||| |||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||     
T  11028045 atatcaatataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttg 11028144  T
Q  214 aattcgggaaaaaccca 230  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  11028145 agatcggggaaaaccca 11028161  T

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Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Original strand, 44317408 - 44317604
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  44317408 ctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatcgtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 44317505  T
Q  118 catat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    |||||     ||| |    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  44317506 catatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttt 44317604  T

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Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 31918786 - 31918678
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  31918786 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 31918689  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||| ||||||    
T  31918688 acataacatat 31918678  T

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Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 32596410 - 32596177
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | |||||||||||  |||||| |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||| |    
T  32596410 aatatgctcactttaaaatttgttagacttaatgatttagttg--ttccttcaaatattaatgctagtttttataacatgacaattatcaaaccaaatga 32596313  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    ||||  |||| |    |   ||||||| | |||||| |||  |||||| |||| ||||| |||||  || ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  32596312 catggtatatcaacataaaataattttctacattcgagacaagtttgggtatgagtttgaggtggggacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 32596213  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaac 244  Q
    |||| || ||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  32596212 ttttgaaatcggggaaaaccccaacccattcaaaac 32596177  T

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Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11123090 - 11122895
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||  |    
T  11123090 ctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtactttttattaacatgacaattataaaacaaaataacaaaa 11122993  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    ||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  11122992 catatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttt 11122895  T

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Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 24 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 28695357 - 28695268
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||    
T  28695357 tttaacatttgttaaaccgaatgatttagttgct--cctttaaatattaatgatagtttttataacgtgacaattatcaaataaaataacat 28695268  T

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Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 42299659 - 42299767
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||  | ||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42299659 aatatgttcactttaacatttgttagagaggatgatttagttgct--catttaaatatcaacagtagtttttattaacaagacaattatcaaacaaaata 42299756  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    ||||| |||||    
T  42299757 acatggcatat 42299767  T

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Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 55826807 - 55826664
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggt 152  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||     ||| |    |||||| |||| |||||||||    
T  55826807 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacgtgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggt 55826708  T
Q  153 ttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  55826707 ttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 55826664  T

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Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 15987455 - 15987372
Alignment:
Q  25 ttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaa 109  Q
    |||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  15987455 ttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaa 15987372  T

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Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4766540 - 4766431
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta--taacacgacaattatcaaacaaaat 110  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||   | ||||||||||  | ||||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||||||||||| |||||    
T  4766540 aatatgtttactttaacatttgttagaggtaatgatttagtt--tatcctttaaatatcaatgatagttttttattaacatgacaattatcaaataaaat 4766443  T
Q  111 aacatgacatat 122  Q
    ||||| ||||||    
T  4766442 aacataacatat 4766431  T

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Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 13015439 - 13015370
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataac------acgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||      | || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13015439 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaaaatgaaaattatcaaacaaaataacatgacatat 13015370  T

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Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 18423480 - 18423543
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||||| || || | ||||||||| ||||||||||||||||    
T  18423480 tcctttaactatcaatgaaagtttttatatcaagatagttatcaaaccaaataacatgacatat 18423543  T

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Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 20 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 53906501 - 53906437
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    ||||||||||||||||||||  || |||||||||||   ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  53906501 tcactttaacatttgttagaaggaatgatttagttg--atccattaaatatcaatagtagtttttat 53906437  T

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Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 15987370 - 15987284
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaa 215  Q
    |||||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| || | | |||| |||||||||||    
T  15987370 taattttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccatcccatacccgtgttttaaa 15987284  T

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Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 19883154 - 19883057
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||||||||| |||||  ||| |||| ||||||||||| ||||| | ||||| || | |  ||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19883154 cattcgggacgagtttgtgtatcggttcggggtggatacctatatccccgttacccttcccgtatccgtgttttaaaatcggggaaaacccaaactca 19883057  T

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Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 122
Target Start/End: Original strand, 24637086 - 24637147
Alignment:
Q  61 ctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  24637086 ctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatat 24637147  T

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Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Original strand, 568326 - 568370
Alignment:
Q  78 agtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  568326 agttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 568370  T

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Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 13015599 - 13015555
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct 57  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  13015599 aatatgttcactttaacatctgttagaccgaataatttagttgct 13015555  T

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Target: chr7 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 52)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 18826097 - 18825875
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18826097 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg--ttcttttatatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 18826000  T
Q  113 catgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| || |     ||||||| || ||| |||| |||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  18825999 catggcatatcaacgtaaaataattttctgtatttgggatgggtttgggtacgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 18825900  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || ||||| |||||||||||    
T  18825899 ttttgaaatcggggaaaacccaaac 18825875  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 12980244 - 12980467
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12980244 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataa 12980341  T
Q  113 catgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| ||||| ||    ||     ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| |||| | |||| |||    
T  12980342 catggcatatcaacataaaatattttttttgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccgtcccatacccgt 12980441  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    ||||| || ||||| |||||| ||||    
T  12980442 gttttgaaatcggggaaaaccaaaac 12980467  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 5376953 - 5377178
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5376953 aatatgctcattttaacatttgttaaaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcattggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaatta 5377050  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    ||||| |||| |    |  |||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||| | ||||  |||    
T  5377051 catgatatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtg 5377150  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||    
T  5377151 ttttgaaatcggggaaaacccaaactca 5377178  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 27850550 - 27850332
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27850550 aatatgctca-tttaacatttgttagatcgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgaaagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 27850454  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  |||||||| | |||||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| |||| || ||||| |||| | |||| ||||    
T  27850453 catgacatatcatcgtaaagtaattttctacattcgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatacacccgttacccgtcccatacccgtg 27850354  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  27850353 ttttgaaatcggggaaaaccca 27850332  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Complemental strand, 38140019 - 38139802
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  38140019 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 38139922  T
Q  112 acatgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    ||||||||||| |||   ||     |||||| |||| | |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||||    
T  38139921 acatgacatatcaatataaaataatttttttacatttgagacgggtttggttatgggttcggggtgggtacttatatactcattacccgtcccatactcg 38139822  T
Q  207 tgtttt-aaattcgggaaaa 225  Q
    |||||| ||||| |||||||    
T  38139821 tgttttgaaattggggaaaa 38139802  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 2630799 - 2630577
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  2630799 aatatgttcactttaacatttgatagaccgattgatttagttgct--catttaaatatcaatggtagtttttataatacggcaattatcaaacaaaataa 2630702  T
Q  113 catgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||     ||| |    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||| | |||| | |||| | |    
T  2630701 catggcatatcaacataaagtagtttttttgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacccgtcacccgtcccatacccat 2630602  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||||||| ||||| |||||||||||    
T  2630601 gttttaaa-tcggggaaaacccaaac 2630577  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 16078881 - 16079104
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16078881 aatatgttcactttaacattttttagaccgattgatttagtttct--cctttaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 16078978  T
Q  113 catgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| || |    |||||||| || ||||  |||| |||||| ||| ||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  16078979 catggcatatcaacgtaaagtaattttctgtattcatgacgagtttgggtataggtttggggtgggcacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 16079078  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaact 234  Q
    |||| |  ||||  ||||||||||||    
T  16079079 ttttgagatcggagaaaacccaaact 16079104  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 16 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 46127402 - 46127264
Alignment:
Q  16 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  46127402 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg--ttcctttaaatatcaatggtagttattataacacgacaatgatcaaacaaaataacat 46127305  T
Q  116 gacatatta-atggtaattttttgcattcgggacgggtttg 155  Q
    ||||||| | |   ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  46127304 gacatatcataaaataattttctgcatttgggacgggtttg 46127264  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 3920406 - 3920640
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  3920406 aatacgctcattttaacatttgttagaccgattcatttagttg--ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataa 3920503  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |   ||||||| | |||||||||| | ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | ||||  |||    
T  3920504 catggcatatcaacataaaataattttctacattcgggacagttttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtcccataccagtg 3920603  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacg 245  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  3920604 ttttgaaatcggggaaaacccaaacccagtcaaaacg 3920640  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 26622819 - 26623061
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||| ||| || ||||||||| |||| ||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26622819 aatatgcgcacattgacatttgtttgaccaattgatttaattgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataa 26622916  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |   ||||||||||||||||  ||| |||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| || | | |||| ||||    
T  26622917 catggcatatcaacataaaataattttttgcattcgaaacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattacccatcccatacccgtg 26623016  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaat 253  Q
    |||| || || || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  26623017 ttttgaaatcagggaaaacccaaacccactcaaaacggggaaaat 26623061  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Original strand, 24425249 - 24425482
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  24425249 aatatgctcactttaacatttgttagaccggttgatttatttg---tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgataattatcaaacagaataa 24425345  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    || |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||| |  |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  24425346 catggcatatcaacatatagtaattttatgcatttggaacgggtttggaaatggggtcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 24425445  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacg 245  Q
    |||| || || |  ||||  ||||| |||||||||||    
T  24425446 ttttgaaatcagagaaaattcaaacccaatcaaaacg 24425482  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 45379973 - 45380194
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45379973 aatacgctcactttaacatttgttagacgaactgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 45380070  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    ||||||||| |     ||| |  | |||||| |||| |||||| |||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  45380071 acatgacatgtcaacataaagtaatttttttacatttgggacgagtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 45380170  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    | |||| || ||||||||||||||    
T  45380171 tattttgaaatcgggaaaaaccca 45380194  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 17885332 - 17885552
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttata-acacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||    
T  17885332 aatatgttcactttaacatttgatagatggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattgacatgacaattatcaaacaaaata 17885429  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| |  || ||||||| ||||| |||| | |||| | |    
T  17885430 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggttggaacctatatacccgttacccgtcccatacccat 17885529  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||||| ||||| ||||||||    
T  17885530 gttttaaaatcggggaaaaccca 17885552  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 18125454 - 18125228
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18125454 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatt--ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 18125357  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  18125356 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgcgttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 18125257  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||  |  |||||||||||||| |||||    
T  18125256 gtttcgagatcgggaaaaacccatactca 18125228  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 37182142 - 37182367
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  37182142 aatatgttcactttaacatttgttagacacaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 37182239  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    | | ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| || || ||  ||| ||||||| || || |||| | |||| |||    
T  37182240 acatgacatatcaacataagataattttttacatttgggacgggtatgggtatggg-ttcggatgagtacctatatacccgctacccgtcccatacccgt 37182338  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||||    
T  37182339 gttttgaattcggagaaaacccatactca 37182367  T

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Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 212
Target Start/End: Original strand, 30650504 - 30650700
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| |    
T  30650504 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataa 30650601  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt 212  Q
    ||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  30650602 catatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 30650700  T

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Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 17 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25783128 - 25782909
Alignment:
Q  17 tgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatg 116  Q
    |||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||    
T  25783128 tgctcactttaatatttattataccgattgatttagttgct--cctttaaatattgatgatagtttttataacactgcaattatcaaacaaaataatatg 25783031  T
Q  117 acatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt 212  Q
    | ||||||    |  |||||||| |||||||||||||| ||| | |||| ||| ||||||| ||| ||||||| | ||| ||||   |||| ||||||||    
T  25783030 agatattaacataaagtaattttctgcattcgggacggattttggtatgagttcggggtgggtacctatatacccattatccgtctcatacccgtgtttt 25782931  T
Q  213 aaattcgggaaaaacccaaact 234  Q
    | | ||||  ||||||||||||    
T  25782930 ataatcggagaaaacccaaact 25782909  T

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Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Original strand, 37579130 - 37579236
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  | |||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37579130 aatatgctcactttaacatttgttagatggattgatttagttgct--catttaaatatcaatgataatttttataacatgacaattatcaaacaaaataa 37579227  T
Q  113 catgacata 121  Q
    |||| ||||    
T  37579228 catggcata 37579236  T

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Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 120
Target Start/End: Original strand, 23328477 - 23328582
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  23328477 aatatgctcactttagcatttattagaccgattgatttagtta--ttcctttaaatatcaatgataatttttatagcacgacaattatcaaacaaaataa 23328574  T
Q  113 catgacat 120  Q
    || |||||    
T  23328575 caagacat 23328582  T

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Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 35074336 - 35074557
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  35074336 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 35074433  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||||     ||| |    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  35074434 acataacatatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggttgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 35074533  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||||||  ||||| ||||||||    
T  35074534 tgttttaagatcggggaaaaccca 35074557  T

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Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 7779881 - 7780095
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  7779881 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 7779978  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    ||||| |    |   ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||| | |||| ||||||||     
T  7779979 catatcaacataaaataaatttttacatttgggacgggtttgggtataggttcggggtgggtacctatatacccattatccgtcccatacccgtgttttg 7780078  T
Q  214 aattcgggaaaaaccca 230  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  7780079 agatcggggaaaaccca 7780095  T

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Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 21702526 - 21702752
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21702526 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatataaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 21702623  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| |||||||||| || |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  21702624 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggttggggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 21702723  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||  |  ||||| |||||||| |||||    
T  21702724 gtttcgagatcggggaaaacccatactca 21702752  T

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Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41741675 - 41741450
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  || |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  41741675 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat--ccgttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 41741578  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| || |||||| ||| || |||| ||||| ||||   |||| |||    
T  41741577 acatgacatatcagtataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatggg-ttcgggtgggtacctacatacccgttatccgtctcatacccgt 41741479  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||| || ||||| |||||||| |||||    
T  41741478 gttttgaaatcggggaaaacccatactca 41741450  T

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Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 44986124 - 44986023
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44986124 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 44986027  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  44986026 acat 44986023  T

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Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 16866036 - 16866256
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||  |  | |||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  16866036 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaat--catttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 16866133  T
Q  112 acatgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| ||      |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  ||| | |||| |||    
T  16866134 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgt 16866233  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  16866234 gttttgagatcggggaaaaccca 16866256  T

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Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 45885991 - 45885789
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||| ||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  45885991 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgattaagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 45885894  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||| ||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||| |||| |||| | |||| |||    
T  45885893 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggattttggtatgggttcggggtgggtacctatatacttgttacccgtcccatacccgt 45885794  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  45885793 gtttt 45885789  T

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Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 39316862 - 39316970
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| | | |  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39316862 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaatcgat--ccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 39316959  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  39316960 acatgacatat 39316970  T

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Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 5916291 - 5916194
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||  |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  5916291 aatatactcagtttaacatttgttagaccgattgattgatttact--cctttaaatatcaatggtagttttgataacacagcaattatcaaacaaaataa 5916194  T

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Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 26004675 - 26004590
Alignment:
Q  35 ttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26004675 ttagaccgattgatttagtcgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataagaagacaattatcaaacaaaataacatggcatat 26004590  T

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Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 43507300 - 43507401
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  43507300 aatatgctcactttaaaatttgttagacggaatgatttagttg--atcttttaaatatcaatggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaata 43507397  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  43507398 acat 43507401  T

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Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44794253 - 44794068
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  | ||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  44794253 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--catttaagtatcaatggtagtttttagtaacatgacaattatcaaacaaaata 44794156  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||||||||| ||||    
T  44794155 acataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacct-tatactcgttacccgt 44794068  T

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Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37196224 - 37196116
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   || |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||    
T  37196224 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcttttatatatcaatggtagtttttattaacatgacagttatcaaacaaaata 37196127  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||| ||||||    
T  37196126 acataacatat 37196116  T

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Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Original strand, 41103528 - 41103743
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaat---atcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatg 116  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||   |||||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  41103528 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcatcaatggtaatttgtattaacatgacaattatcaaacaaaataacaag 41103625  T
Q  117 acatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt 212  Q
    | |||| |    |   ||||||||| ||||  ||||||||||   |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  41103626 agatatcaacataaaataattttttacatttaggacgggtttatgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgtttt 41103725  T
Q  213 aaattcgggaaaaaccca 230  Q
     || ||||| ||||||||    
T  41103726 gaaatcggggaaaaccca 41103743  T

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Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 26004746 - 26004675
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26004746 aatatgctcattttaacatttgttagaccgattgatttagtcgc--tcctttaaatatcaatggtagtttttat 26004675  T

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Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 24753043 - 24753196
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24753043 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgat---ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 24753139  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggt 164  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  24753140 acataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggt 24753196  T

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Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44658631 - 44658567
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44658631 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 44658567  T

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Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 25905495 - 25905603
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||| || |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  25905495 aataagctcaccttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 25905592  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||| ||||||    
T  25905593 acataacatat 25905603  T

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Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 44734583 - 44734366
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||  | ||||||| ||| |  |||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  44734583 aatatgctcgctttaatatttgttagacgtaatgatttaattgat--ccttcaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaataaaata 44734486  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| | || | |||| |||    
T  44734485 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatatgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccattaccggtcccatacccgt 44734386  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaac 227  Q
    ||||| || ||| |||||||    
T  44734385 gttttgaaatcgagaaaaac 44734366  T

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Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 45709088 - 45708785
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  45709088 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtaatttttattaatatgacaattatcaaacaaaata 45708991  T
Q  112 acatgacatattaatggtaa-ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtt 210  Q
    | || |||||| ||    || | |||| ||||  |||||||||| | |||| ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||    
T  45708990 atataacatatcaacataaagtattttacattttggacgggtttaggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtccaatacccgtgtt 45708891  T
Q  211 ttaaattcgggaaaaaccc------aaactcaatcaaaacgaggaaaattcttcgtccaaatagatttgattcgagtgaataaccacatatatgagtttt 304  Q
    || |  ||||  |||||||      |||| || ||||||||||||||| |||   || || | ||||||||||| | | |||| ||| ||||||||||||    
T  45708890 ttgagatcggagaaaacccataccaaaacccagtcaaaacgaggaaaa-tct--atcaaattggatttgattcgggcggataatcacgtatatgagtttt 45708794  T
Q  305 gttgccatg 313  Q
    |||||||||    
T  45708793 gttgccatg 45708785  T

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Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 18 - 210
Target Start/End: Original strand, 17851726 - 17851921
Alignment:
Q  18 gctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatg 116  Q
    ||||||||| |||||| |||||   | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||     
T  17851726 gctcactttcacatttattagataaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacata 17851823  T
Q  117 acatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtt 210  Q
    |||||| |    |  ||| |||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||  ||||| |||| | |||| ||||||    
T  17851824 acatatcaacataaagtagttttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtgtt 17851921  T

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Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 39456239 - 39456131
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataac-acgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||||||    
T  39456239 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat--ccttccaatatcaatggtaatttttattaccatggcaattatcaaacaaaata 39456142  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  39456141 acatgacatat 39456131  T

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Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 3227769 - 3227698
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3227769 aatatgctcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttat 3227698  T

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Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 38152769 - 38152974
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  |||||| ||||||||||||||              ||||||||||||||||||    
T  38152769 aatacgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttagatatcaatggtagt--------------aattatcaaacaaaataa 38152852  T
Q  113 catgacatattaatgg----taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| ||       ||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||| | ||    
T  38152853 catgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatagccgttatccgttccatacccatg 38152952  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  38152953 ttttgaaatcggggaaaaccca 38152974  T

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Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 25980135 - 25980037
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| ||    |||||||||||||||||  |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  25980135 cactttaacatttgttagacggaatgatttattt--aatcctttaaatatcaatgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgaca 25980038  T

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Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 62 - 243
Target Start/End: Original strand, 16811644 - 16811829
Alignment:
Q  62 tttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttgg 156  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| | |||| |    |  |||||||||| |||| ||||||| |||||    
T  16811644 tttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaataacataatatatcaacataaagtaattttttacatttgggacggctttgg 16811743  T
Q  157 ttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaa 243  Q
     |||||| || |||||| ||  ||||||| | ||| ||||   |||| |||||||| |  ||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16811744 gtatggg-ttcgggtgggtatctatatacccattatccgtctcatacccgtgttttgagatcggggaaaatccaaactcagtcaaaa 16811829  T

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Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 84
Target Start/End: Original strand, 10072357 - 10072425
Alignment:
Q  14 atatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttt 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||    
T  10072357 atatgctcactttaacatttgttaggcggaatgatttagttg--atcatttaattatcaatggtagttttt 10072425  T

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Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 86 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3227100 - 3227064
Alignment:
Q  86 taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3227100 taacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 3227064  T

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Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29015162 - 29015099
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| |||||||   |||||||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29015162 tcctttaactatcaataaaagtttttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgccatat 29015099  T

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Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 37103331 - 37103268
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  37103331 tcctttaattatcaatgaaagttattatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatat 37103268  T

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Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 62 - 122
Target Start/End: Original strand, 21750678 - 21750738
Alignment:
Q  62 tttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||| ||||||||  ||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21750678 tttaactatcaatgaaagttcatatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 21750738  T

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Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 133 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 29855556 - 29855468
Alignment:
Q  133 tttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcggg 221  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  |||||| |||| ||||||||| | | ||| |||| | ||||||||| ||| || |||||    
T  29855556 tttttacattcgggacaggtttggttatcagtttggtgtgggtacttatatgcccattacccgtcccatactcgtgctttgaaatcggg 29855468  T

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Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Original strand, 31425916 - 31425960
Alignment:
Q  78 agtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31425916 agttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 31425960  T

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Target: chr2 (Bit Score: 101; Significance: 5e-50; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31942411 - 31942237
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31942411 aatatgttcactttaacatttgttagaccgactgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 31942314  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| ||||| |    |  ||| |||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31942313 catggcatatcagcataaagtagttttctgcatttgtgacaggtttggttatgggtttggggtgggtacttatatac 31942237  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 6028115 - 6027873
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttt-ataacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6028115 aatattctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagttttttataacacgacaattatcaaacaaaata 6028018  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||| | ||| |    |   || |||| ||||||| |||||||| ||  |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||   |||| | |    
T  6028017 acatggcttatcaacataaaatacttttctgcattcaggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtctcatacccat 6027918  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaa 252  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  6027917 gttttaaaatcggggaaaacccaaacccaatcaaaacggggaaaa 6027873  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 19105066 - 19104886
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |  |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  19105066 aatatgctcactttaacatttgttagaccgatcgatttagttgctct--tttaaatatcgatagtagtttttataacacggcaattattaaacaaaataa 19104969  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||||||  | |    |  |||||||| |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19104968 catgacacgtcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgagtatggattcgaggtggatacctatatacccgtta 19104886  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 14540649 - 14540752
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14540649 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgct--cctttaaatatc----gtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 14540742  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  14540743 catgacatat 14540752  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Original strand, 45256693 - 45256912
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45256693 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacaagac 45256790  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaa 214  Q
    |||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||   |||| |||||||| |    
T  45256791 atatcaaaataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacttatatacccattaaccgtctcatacccgtgttttga 45256890  T
Q  215 attcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    | ||||| ||||| || |||||    
T  45256891 aatcggggaaaactcatactca 45256912  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Original strand, 37999352 - 37999566
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  37999352 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatt--ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 37999449  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    ||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||     
T  37999450 catatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtctcatacccgtgttttg 37999549  T
Q  214 aattcgggaaaaaccca 230  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  37999550 agatcggggaaaaccca 37999566  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 13705587 - 13705406
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  13705587 aatacgctcactttaacatttgttatacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13705490  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||  |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  13705489 acatgacatatcaacataaagtaatttttcacatttgggacgggtttaggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 13705406  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7314874 - 7314654
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| || | |||||||||||||||    
T  7314874 aatatgcccactttaacatttgatagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgatatttatcaaacaaaata 7314777  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |||||||  || ||||||| ||||| |||| | ||||||||    
T  7314776 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtgtgggtatgggttcggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatactcgt 7314677  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
     ||||||| ||||| ||||||||    
T  7314676 attttaaaatcggggaaaaccca 7314654  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12194053 - 12193827
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||    
T  12194053 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatgtagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 12193956  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||| || | ||||| ||  ||||||| | ||| |||| | |||| |||    
T  12193955 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatggatatggattcgaggtgggtatctatatacccattacccgtcccatacccgt 12193856  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||| | || ||||||||||| || |||||    
T  12193855 gttctgaaatcgggaaaaacacatactca 12193827  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 13830599 - 13830800
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  13830599 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttatttacatgacaattatcaaacaaaata 13830696  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  13830697 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacaggtttgagtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta-ccgtcccatacccgt 13830795  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  13830796 gtttt 13830800  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 20 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 16226945 - 16226848
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16226945 tcactttaacatttcttagaccaattgatttagttgctaa--tttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgaca 16226848  T

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Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 37106562 - 37106663
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37106562 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 37106659  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  37106660 acat 37106663  T

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Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 37472955 - 37472854
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  37472955 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 37472858  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  37472857 acat 37472854  T

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Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Original strand, 10920514 - 10920682
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10920514 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 10920611  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatata 184  Q
    ||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  10920612 catatcaacataaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtggatacctatata 10920682  T

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Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 42798215 - 42798028
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42798215 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 42798118  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||| ||||||     ||| |  | |||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| ||||    
T  42798117 acataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacaggtttgtgtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgt 42798028  T

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Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 24414358 - 24414156
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24414358 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--catttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 24414261  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  24414260 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgt 24414161  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  24414160 gtttt 24414156  T

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Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 9632249 - 9632450
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  9632249 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaata 9632346  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||| | |||| |||    
T  9632347 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgt 9632446  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  9632447 gttt 9632450  T

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Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 30846808 - 30847010
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30846808 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 30846905  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||||     ||| |    |||||| || | ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  30846906 acataacatatcaacataaagtagtttttttacaattgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 30847005  T
Q  207 tgttt 211  Q
    |||||    
T  30847006 tgttt 30847010  T

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Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 8916163 - 8915961
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||  |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  8916163 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttaat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 8916066  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  8916065 acataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgt 8915966  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  8915965 gtttt 8915961  T

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Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 10208650 - 10208452
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10208650 ctcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 10208553  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    |||||||    |  |||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||| ||||| | ||| ||||||  | ||| |||| | |||| |||||||||    
T  10208552 catattaacataaagtaattttttacatttgggactggtttgagtatgggttcggggtaggtacctatatatccattacccgtcccatacccgtgtttta 10208453  T

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Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 45115421 - 45115529
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||  | ||||||| ||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  45115421 aatacgctcactttaacatttattagacaaaatgatttaattgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 45115518  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  45115519 acatgacatat 45115529  T

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Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 20 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 36128326 - 36128151
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  36128326 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataac 36128229  T
Q  119 atat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    ||||     ||| |    |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||    
T  36128228 atatcaacataaagtagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacccgtta 36128151  T

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Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 44746335 - 44746113
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataa-cacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| || | ||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||| |||||| ||||||    
T  44746335 aatatgctcactctaacatttgttagacggaataatttatttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataaccattacaatgatcaaataaaata 44746238  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||| ||||| |    |  || ||||| | |||| ||||||||||||  |||| |||||  |||| ||| ||||||| | ||| |||| | ||| ||||    
T  44746237 acatggcatatcaagataaagtgattttctacatttgggacgggtttgagtatgagtttgaagtgggtacatatatacccattacccgtcccatattcgt 44746138  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaa 232  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||    
T  44746137 gttttgaaatcggggaaaacccaaa 44746113  T

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Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 233
Target Start/End: Original strand, 25210369 - 25210463
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    ||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25210369 cattcgggaggggttttggtatgggtttggggtgggtacatatatcctcgttacccgtcccatacccgtgttttaaagtcgggaaaaacctaaac 25210463  T

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Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 20 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 18106309 - 18106215
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18106309 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttaattgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat 18106215  T

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Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 57
Target Start/End: Original strand, 37319805 - 37319849
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct 57  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37319805 aatatgttcattttaacatttgttagaccgattgatttagttgct 37319849  T

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Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 30978810 - 30978873
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  30978810 tcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 30978873  T

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Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 38342722 - 38342659
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  38342722 tcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 38342659  T

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Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 149 - 236
Target Start/End: Original strand, 30978929 - 30979014
Alignment:
Q  149 gggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||  ||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||    
T  30978929 gggtttgggtatgggttcggggtggatacatatatcctcgttatcc--tccgtacccgtattttgaaatcgggaaaaacccaaactca 30979014  T

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Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 17598816 - 17598859
Alignment:
Q  63 ttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaaca 106  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17598816 ttaaatatcaatgattgtttttataacatgacaattatcaaaca 17598859  T

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Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 26755637 - 26755701
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtt-tttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| |||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26755637 tcctttaactatcaatgaaagttctttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatat 26755701  T

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Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 78 - 122
Target Start/End: Original strand, 42576516 - 42576560
Alignment:
Q  78 agtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  42576516 agttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 42576560  T

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Target: chr8 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 1012480 - 1012706
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  1012480 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtactttttataacacagcaattatcaaacaaaataa 1012577  T
Q  113 catgacatattaatggtaa------ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||| ||    ||      |||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||| | ||||||     
T  1012578 catggcatatcaacataaagtagttttttttgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatactca 1012677  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1012678 tgttttaaa-tcggggaaaacccaaactca 1012706  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Original strand, 17469118 - 17469360
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  17469118 aatatgttcactttaaaattttttagacccattgatttagtttct--cctttaaatatcaatggtagcttttataacaaggcaattatcaaacaaaataa 17469215  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |  ||| |||| |||| | ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  17469216 catggcatatcaacataaagtagttttctgcagttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 17469315  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaat 253  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  17469316 ttttgaaatcggggaaaacccaaacccagtcaaaacggggaaaat 17469360  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 20 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 43113844 - 43113626
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  43113844 tcactttaacatttgttataccgattgatttagttgct--ccttcaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatctaacaaaataacataaca 43113747  T
Q  120 tatta--atg--gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaa 215  Q
    ||| |  |||  ||| |||| |||||||| ||||| ||||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | || | |||||||| ||    
T  43113746 tatcaacatgaagtagttttctgcattcgagacggatttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatgcccgtgttttgaa 43113647  T
Q  216 ttcgggaaaaacccaaactca 236  Q
     ||||||||||||||| ||||    
T  43113646 atcgggaaaaacccaatctca 43113626  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 29109048 - 29108828
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29109048 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat--ccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 29108951  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    | ||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| | |    
T  29108950 atatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccat 29108851  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  29108850 gttttaaaatcgggaaaaaccca 29108828  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 16 - 233
Target Start/End: Original strand, 20399457 - 20399677
Alignment:
Q  16 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattat-caaacaaaataaca 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||    
T  20399457 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttggttggt--cctttaaatatcaatgctagtttttataacacgacaattatataaaaaaaataaca 20399554  T
Q  115 tgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtt 210  Q
    ||  |||| |    |   ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||    
T  20399555 tggtatatcaacataaaataattttttgcattcgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtt 20399654  T
Q  211 ttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    || || ||||  |||||||||||    
T  20399655 ttgaaatcggagaaaacccaaac 20399677  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 35215367 - 35215474
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35215367 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--ccattaaatatcaagggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 35215464  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    |||| |||||    
T  35215465 catggcatat 35215474  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 19 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24870243 - 24870033
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  24870243 ctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagttttattaacatgacaattatcaaacaaattaacatgac 24870146  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaa 214  Q
    |||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||| | |||||| | ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||   |||| ||||||||||    
T  24870145 atatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttaggtatgggctcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcacatacccgtgttttaa 24870046  T
Q  215 attcgggaaaaac 227  Q
    | ||||| |||||    
T  24870045 aatcggggaaaac 24870033  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 34139310 - 34139484
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34139310 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttgtttact--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 34139407  T
Q  113 catgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    ||||   |||     ||| |  | ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||    
T  34139408 catggtctatcaacataaagtaatttttttgcattcgggacgggtttgggtat-ggttcggggtgggtacctatatac 34139484  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 24568802 - 24568975
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  24568802 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataa 24568899  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    | |||||||| |    |  ||| |||| | |||||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||||    
T  24568900 c-tgacatatcaacataaagtagttttctccattcgggacggatttgagtatgggttcggggtggatacctatatac 24568975  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 20 - 230
Target Start/End: Original strand, 1063376 - 1063589
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   || ||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1063376 tcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcgtttaaatatcaatggtaatttttatcaacatgacaattatcaaacaaaataacaagac 1063473  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaa 214  Q
    |||| |    |  |||||||||| || | |||| || ||||| |||| ||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||||||| |    
T  1063474 atatcaacataaagtaattttttacacttgggatggatttgggtatgagttcggggtgggtacttatatacccgttaaccgtcccatacccgtgttttga 1063573  T
Q  215 attcgggaaaaaccca 230  Q
    | ||||||||||||||    
T  1063574 aatcgggaaaaaccca 1063589  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39445793 - 39445582
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |   | |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  39445793 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgat---cattaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 39445697  T
Q  112 acatgacatattaatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    |||||||||||  |     ||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||| || ||||| | || | |||| |||||||    
T  39445696 acatgacatatcta----cattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctataaacccgttacctgtcccatacccgtgttt 39445601  T
Q  212 taaattcgggaaaaaccca 230  Q
    | || ||||||||||||||    
T  39445600 tgaaatcgggaaaaaccca 39445582  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 36132141 - 36131908
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||  |||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36132141 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgattaatttaattgctt--ctttaaattttaatggtaatttttataacacggcaattatcaaacaaaataa 36132044  T
Q  113 catgacatatta---atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgt 209  Q
    |||||||||| |   |   ||| ||| |||||||||||||| ||||  |||| ||| ||||||||||| | ||| | | ||| || | | ||||||||||    
T  36132043 catgacatataacataaaataactttctgcattcgggacggatttgtgtatgagttcggggtggatacctgtatgccctttacccatcccatactcgtgt 36131944  T
Q  210 tttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacg 245  Q
    ||| || | ||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  36131943 tttgaaataggggaaaactcaaacccaatcaaaacg 36131908  T

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Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 45235927 - 45236129
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  45235927 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 45236024  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| | ||| |||| | |||| |||    
T  45236025 acataacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatggatatgggttcggggtgggtacctatatacccattacccgtcccatacccgt 45236124  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  45236125 gtttt 45236129  T

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Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 17 - 230
Target Start/End: Original strand, 27932279 - 27932495
Alignment:
Q  17 tgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27932279 tgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat 27932376  T
Q  116 gacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    ||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||| | ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||  ||| | |||| |||||||    
T  27932377 gacatatcaacataaaataattttttacatttgggacggatatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttactcgtcccatacccgtgttt 27932476  T
Q  212 taaattcgggaaaaaccca 230  Q
    | || ||||| ||||||||    
T  27932477 tgaaatcggggaaaaccca 27932495  T

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Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 32302922 - 32303124
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  32302922 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 32303019  T
Q  112 acatgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| |||||| ||    ||     |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  32303020 acataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 32303119  T
Q  207 tgttt 211  Q
    |||||    
T  32303120 tgttt 32303124  T

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Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 2076060 - 2075907
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2076060 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 2075963  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatggg 163  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||    
T  2075962 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg 2075907  T

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Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 17220579 - 17220687
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |  |||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17220579 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat--ccttcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 17220676  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  17220677 acatgacatat 17220687  T

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Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 34021341 - 34021441
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  34021341 aatatgctcactttaacatttgttagattaattgatttcgttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttatataatgacaattatcaaacaaaataa 34021438  T
Q  113 cat 115  Q
    |||    
T  34021439 cat 34021441  T

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Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 21 - 196
Target Start/End: Original strand, 24927819 - 24927997
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24927819 cactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataaca 24927916  T
Q  120 tat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||     |||  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  24927917 tatccacataa-agtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 24927997  T

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Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 31 - 245
Target Start/End: Original strand, 14186205 - 14186417
Alignment:
Q  31 tttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----at 126  Q
    ||||||||||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    ||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||    |     
T  14186205 tttgttagaccaattgatttagttact--cctttaaatatcaatggtagttt----aacacgactgttatcaaacaaaataacatggcatattaacataa 14186298  T
Q  127 ggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaa 226  Q
      ||||||| | ||||| |||||||||||| ||||||||  |||||  ||| ||||||  ||||| || | | |||| |||||||| || ||| ||||||    
T  14186299 attaattttctacattcaggacgggtttgggtatgggttcagggtgagtacctatatatccgttacccatcccatacccgtgttttgaaatcgagaaaaa 14186398  T
Q  227 cccaaactcaatcaaaacg 245  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  14186399 ctcaaacccaatcaaaacg 14186417  T

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Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 4230945 - 4230844
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4230945 aataagctcacttttacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 4230848  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  4230847 acat 4230844  T

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Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 29089573 - 29089672
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||    
T  29089573 aatatgtttactttaa-atttgttagacccattaatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagttttaataacacaataattatcaaacaaaataa 29089669  T

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Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 30 - 230
Target Start/End: Original strand, 34776945 - 34777148
Alignment:
Q  30 atttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta---- 124  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |        
T  34776945 atttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 34777042  T
Q  125 atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaa 224  Q
    |   ||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||| ||||||| ||| || ||||  ||||  ||||| |||| |||||||| |  ||||||||    
T  34777043 aaaataattttttacatttgggatggatttgggtatgggttcggggtgggtacctaaatacctgttactcgttccatacccgtgttttgagatcgggaaa 34777142  T
Q  225 aaccca 230  Q
    ||||||    
T  34777143 aaccca 34777148  T

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Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 28977333 - 28977232
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  28977333 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--catttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataac 28977236  T
Q  119 atat 122  Q
    ||||    
T  28977235 atat 28977232  T

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Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 40248573 - 40248502
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40248573 aatattctcactttaacatttgttagactgaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttat 40248502  T

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Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 11255230 - 11255033
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||    | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  11255230 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaat---gacggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaata 11255136  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |  |||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  11255135 acat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgttatccgtcccatacccgt 11255037  T

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Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 30481528 - 30481421
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacc 228  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||| ||| |||  |||   |||||||| |||| || || |||||||||    
T  30481528 taattttttacattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatcctcattactcgtctcatactcgtattttgaaatcaggaaaaacc 30481429  T
Q  229 caaactca 236  Q
    ||||||||    
T  30481428 caaactca 30481421  T

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Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 4594339 - 4594276
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4594339 tcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 4594276  T

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Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 149 - 236
Target Start/End: Original strand, 14155533 - 14155620
Alignment:
Q  149 gggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||||| ||||  |||||||||||||  ||||| ||||||| || |  ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  14155533 gggtttgggtatgaatttggggtggataaatatatcctcgttacccatcttatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactca 14155620  T

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Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 31325127 - 31325197
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||    
T  31325127 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat---ctttaaatatcaatggtagtttttat 31325197  T

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Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 131 - 236
Target Start/End: Original strand, 29918590 - 29918695
Alignment:
Q  131 attttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||  ||||| || ||||||| ||| |||||  | |||| ||||||| |||  ||||||| || ||||||||||| ||    
T  29918590 attttttacatttgggacgggtttgtgtatggtttcggggtgggtacatatatctttgttacccgttctgtacatgtgttttgaaatcgggaaaaactca 29918689  T
Q  231 aactca 236  Q
    ||||||    
T  29918690 aactca 29918695  T

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Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 129 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 9642458 - 9642335
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacc 228  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||| ||| ||||||  ||||  | ||||| |||| | |||| |||||||| || ||||| ||||||    
T  9642458 taattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcgggatggatatatataaccccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaacc 9642359  T
Q  229 caaactcaatcaaaacgaggaaaa 252  Q
    ||||| || ||||| || ||||||    
T  9642358 caaacccagtcaaagcggggaaaa 9642335  T

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Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 37961059 - 37960962
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||| ||||||  ||| |||||||  |||| | || | |||| |||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  37961059 catttgggacgggtttgggtatgagttcggggtgtgtacctatatacctgttacctgtcccatacccgtgtttttaaatcggggaaaacccaaactca 37960962  T

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Target: chr6 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 28)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 171
Target Start/End: Original strand, 14032419 - 14032579
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14032419 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaacaaaataa 14032516  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggt 171  Q
    |||||||||| |    |  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14032517 catgacatatcaacataaagtaattttatgcatttgggacgggtttgggtatgggttcggggt 14032579  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 252
Target Start/End: Original strand, 14505949 - 14506190
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14505949 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgct--cctttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 14506046  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    | |||||||| |    |  ||| |||| |||||| |||||||||||   |||||||| ||||||| ||| || ||||| |||| |||| | ||||  |||    
T  14506047 cgtgacatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacgggtttaagtatgggttcggggtgggtacctaaatacttgttacccgtcccatacctgtg 14506146  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaa 252  Q
    |||| || ||||| ||||||||||| || |||||| | ||||||    
T  14506147 ttttgaaatcggggaaaacccaaacccagtcaaaatggggaaaa 14506190  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 24603081 - 24602848
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24603081 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg--ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgtcaattatcaaacaaaataa 24602984  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| || || |    |  |||||||| | |||||| || |||||||| |||||||| ||||||| ||  |||||||  |||| ||||   |||| | ||    
T  24602983 catggcacatcaacataaagtaattttctacattcgtgatgggtttgggtatgggttcggggtgggtatctatatacctgttacccgtcacatacccatg 24602884  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaac 244  Q
    |||| || || || ||||||||||| || |||||||    
T  24602883 ttttgaaatctgggaaaacccaaacccagtcaaaac 24602848  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 2367188 - 2367408
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2367188 aataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagtt--tatcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 2367285  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||||     |||  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  2367286 acataacatatccacataa-agtaattttttccatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccg 2367384  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||| |  ||||| ||||||||    
T  2367385 tgttttgagatcggggaaaaccca 2367408  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 12678318 - 12678094
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12678318 aatatgctcactttaac-tttattagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgataatttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 12678222  T
Q  113 catgacatattaat----ggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |||      ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||| | ||| |||| | ||||  |||    
T  12678221 catgacatatcaatataaaataattttctcaattcgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatataccctttacccgtcccatacctgtg 12678122  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    | || || ||||| ||||| ||||||||    
T  12678121 tcttgaaatcggggaaaacgcaaactca 12678094  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 7394112 - 7393870
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  7394112 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg--ttcctttaaatatcaatgttagtttttataacacggtaattatcaaacaaaataa 7394015  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt-tctatactcgt 207  Q
     |||| |||  |    |   ||| ||| ||||||| ||| | |||||  |||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||| ||| |||||||    
T  7394014 tatgatataccaacataaaataaatttatgcattcaggatgagtttgagtatgggttcggggtggatacctatatacccattatccgtctct-tactcgt 7393916  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaat 253  Q
    ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||||| | |||||||    
T  7393915 gttttgaaatcggggaaaatccaaacccaatcaaaatggggaaaat 7393870  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 14411058 - 14410954
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14411058 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttct--cctttaaatatcaatgatggtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 14410961  T
Q  113 catgaca 119  Q
    || ||||    
T  14410960 cacgaca 14410954  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 21 - 173
Target Start/End: Original strand, 30816128 - 30816285
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||    
T  30816128 cactttaacatttgttagaccgattgatttaggtgct--cctttaaatgtcaatggtagtttttataacacggcaattatccaacaaaataacatcacat 30816225  T
Q  121 attaa-------tggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtgg 173  Q
    || ||       | ||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  30816226 atcaacataaagtagtttttttttgcattcgggacgggtttggatatgggttcggggtgg 30816285  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 32853706 - 32853926
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  | |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  32853706 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--catttaaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 32853803  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  32853804 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 32853903  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  32853904 gttttgagatcggggaaaaccca 32853926  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Original strand, 14245110 - 14245214
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  14245110 aatatgttcactttaacatttattagaccgaatgatttagtcgct--cctttaaatattaatggtagtttttataacacgacaattttcaaacaaaataa 14245207  T
Q  113 catgaca 119  Q
    |||||||    
T  14245208 catgaca 14245214  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 45 - 230
Target Start/End: Original strand, 27738666 - 27738854
Alignment:
Q  45 tgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----atggtaattttttgc 139  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| |    |  |||||||||| |    
T  27738666 tgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcatacaaaataacataacatatcaacataaagtaattttttac 27738763  T
Q  140 attcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||   |||| |||| | |||| |||||||| || ||||| ||||||||    
T  27738764 atttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatatctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatcggggaaaaccca 27738854  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 19 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 10142738 - 10142563
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  10142738 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 10142641  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    ||||| |    |   ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||| ||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  10142640 catatcaacataaaataattttttacatttgggacaggtttgggtatgagttcggggtgggtacctatatacccgtta 10142563  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5863603 - 5863389
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |    
T  5863603 ctcactttcacattttttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacataa 5863506  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    ||||| |    |   || |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||  ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||     
T  5863505 catatcaacataaaatatttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtatctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttg 5863406  T
Q  214 aattcgggaaaaaccca 230  Q
    || ||||| ||||||||    
T  5863405 aaatcggggaaaaccca 5863389  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Original strand, 24225560 - 24225746
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24225560 aataagctgactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 24225657  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  24225658 acataacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggcatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 24225746  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 20 - 211
Target Start/End: Original strand, 27534553 - 27534747
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  27534553 tcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatt--ctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataac 27534650  T
Q  119 atatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    |||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  27534651 atatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttt 27534747  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 228
Target Start/End: Original strand, 11762308 - 11762525
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||| | |||||||  ||||||| | | | |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  11762308 aatatgcttattttaacaaatgttagatccaataatttagttgct--cctataaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatataacaaaataa 11762405  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |  |||||||| | |||| |||| |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||| ||||| |||| | |||| | ||    
T  11762406 catggcatatcaacataaagtaattttctacatttgggatgggtttgggtatgagttcggggtggacacctatatacccgttacccgtcccatacccttg 11762505  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacc 228  Q
    |||  || ||||||||||||    
T  11762506 tttagaaatcgggaaaaacc 11762525  T

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Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 3484149 - 3483968
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||| ||||||||||    
T  3484149 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatgaaacaaaata 3484052  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||| ||||||     |||  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  3484051 acataacatatccacataa-agtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 3483968  T

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Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 10188299 - 10188124
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||||    
T  10188299 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcgaacaaaata 10188202  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| | |||| |    |   ||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  10188201 acataatatatcaacataaaataattttttacatttgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac 10188124  T

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Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 19 - 185
Target Start/End: Original strand, 12141253 - 12141422
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| ||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||| |    
T  12141253 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgttagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacataa 12141350  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    | ||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  12141351 cgtatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac 12141422  T

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Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 14254821 - 14254928
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| ||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||| | |||||||||||||    
T  14254821 aatatgttgactttaacatttattagaccgaatgatttaatcgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacatcaaatttcaaacaaaataa 14254918  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  14254919 catgacatat 14254928  T

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Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 12309441 - 12309636
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| | |||||||||||||||||||  | ||||||| ||||   |||||||||||||||| ||||      || | |||||||||||||||||||||    
T  12309441 aatatgtttactttaacatttgttagacgaaatgatttaattgcc--cctttaaatatcaatgatagt------aatatgacaattatcaaacaaaataa 12309532  T
Q  113 catgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| ||      |||||||||| |||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||||| |||| ||||    
T  12309533 catgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatcggttcggggtgggtacatatatacctgttacccgttccatacccgtg 12309632  T

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Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 32532426 - 32532497
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||    
T  32532426 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--gtcctttaaatatcattggtagtttttat 32532497  T

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Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 65 - 230
Target Start/End: Original strand, 32053000 - 32053170
Alignment:
Q  65 aaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggtta 159  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||      ||| |||||| ||||  |||||||||||| ||    
T  32053000 aaatatcattgtaagtttttattaacatgataattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtatttttttacattttggacgggtttgggta 32053099  T
Q  160 tgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||  | |||||| || ||||| ||||||||    
T  32053100 tgggtttggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatatccatgttttgaaatcggggaaaaccca 32053170  T

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Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 253
Target Start/End: Original strand, 32959870 - 32959965
Alignment:
Q  158 tatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt-aaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaat 253  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||  ||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32959870 tatgggttcggggtggatacctatatccccgttacccgttccgtacccgtgttttgaaattaggg-aaaacccaaacccaatcaaaacgaggaaaat 32959965  T

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Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 145 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 14410946 - 14410858
Alignment:
Q  145 ggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  14410946 ggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttgaaatctgggaaaactcaaac 14410858  T

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Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 29200090 - 29200026
Alignment:
Q  58 ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  29200090 ttcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatggcatat 29200026  T

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Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 133 - 236
Target Start/End: Original strand, 18908878 - 18908981
Alignment:
Q  133 tttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaa 232  Q
    ||||| ||||||||  |||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||| || |||| |||| | |||  ||| |||| || ||||| ||||||||||    
T  18908878 tttttacattcgggtagggtttgggtatgagtttggggtgggtacatatatccttgttacccgtcccatatccgtattttgaaatcggggaaaacccaaa 18908977  T
Q  233 ctca 236  Q
    ||||    
T  18908978 ctca 18908981  T

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Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 9458548 - 9458612
Alignment:
Q  58 ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| || || ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  9458548 ttcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgagaattatcaaaccaaataagatgacatat 9458612  T

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Target: chr1 (Bit Score: 99; Significance: 7e-49; HSPs: 47)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 9983115 - 9982935
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||    
T  9983115 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattaatttagttgct--cctttgaatatcaatggtagttttgataacatgagaattatcaaacaaaataa 9983018  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    ||||| ||||||    |  |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  9983017 catgatatattaacataaagtaattttctgcattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgtta 9982935  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 44615701 - 44615475
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615701 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttct--cctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 44615604  T
Q  113 catgacatattaatggtaa------ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||| || | |||      ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| ||    
T  44615603 catggcatatcaa-gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccg 44615505  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||    
T  44615504 tgtttttaaatcagggaaaacccaaactca 44615475  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 44792868 - 44793094
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44792868 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttagtttct--cctttaaatatcaataatagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 44792965  T
Q  113 catgacatattaatggtaa------ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| ||||| || | |||      ||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| ||    
T  44792966 catggcatatcaa-gataaagtagtttttttggatttgggacgggtttgggtatgagtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccg 44793064  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||| || || || ||||||||||||||    
T  44793065 tgtttttaaatcagggaaaacccaaactca 44793094  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 49741232 - 49741058
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  49741232 aatatgttcactttaacatttgttaaaccgatttatttagttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataa 49741135  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    ||| ||||||||    |  ||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  49741134 cataacatattaacataaagtagttttctgcattcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac 49741058  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 34673507 - 34673285
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34673507 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataa 34673410  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |  ||| |||| | | ||||| || ||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| | ||   |||| ||||    
T  34673409 catggcatatcaacataaagtagttttcttcgttcggaacaggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttaccagtctcatacccgtg 34673310  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || | |||||||||||||||    
T  34673309 ttttgaaattgggaaaaacccaaac 34673285  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 35937042 - 35936935
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||    
T  35937042 aatatgctcactttaacatttgttagaccaattgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttgtaacacggaaattatcaaacaaaataa 35936945  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  35936944 catgacatat 35936935  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 12494874 - 12495096
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  12494874 aatatgttcactttaacatttgttagaccgataaatttagttgct--cctttaaatatcagtggtagtttttataacacgccaattataaaacaaaataa 12494971  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||| | |    || ||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||| ||| ||||||| |||||  ||| | |||  ||||    
T  12494972 catgtcatgtcaacatatagtagttttctacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtgggtacctatatacccgttacacgtcccatatccgtg 12495071  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || |||||||||||| ||||    
T  12495072 ttttgaaatcgggaaaaaccaaaac 12495096  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 29871510 - 29871285
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||    
T  29871510 aatatgctcattttaatatttgttagaccgattgatgtagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacatgggaattatcaaacaaaataa 29871413  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |   ||||||| | |||||||||||||||||| |||| |||  |||||| ||| |||||||  |||| | || | |||| | ||    
T  29871412 catgacatatcaacataaaataattttctacattcgggacgggtttgggtatgagttcagggtgggtacctatataccagttacctgtcccatacccatg 29871313  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||| || ||||  ||||||||||||||    
T  29871312 ttttgaaatcggagaaaacccaaactca 29871285  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 45866411 - 45866191
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  45866411 aatatgttcactttaacatttgttagacagaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 45866314  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| |||| |||| ||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| | ||   |||| |||    
T  45866313 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgggtatgggtatgagtttggggtgggtacctatatactcattacctgtctcatacccgt 45866214  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  45866213 gttttgaaatcggggaaaaccca 45866191  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 253
Target Start/End: Complemental strand, 16433386 - 16433150
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||    
T  16433386 aatatgctcactttaatatttgttagaccaattgatttagttgc--tcctttaaatatcaatggtagtttttataa---tacaattatcaaacaaaataa 16433292  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  |||||||| |||||| |||  |||||||| |||||||| ||   || ||| ||||||  ||||| |||| | |||| ||||    
T  16433291 catgacatatcaacataaagtaattttctgcatttggggtgggtttgggtatgggttcgg---gggtacctatatatccgttacccgtcccatacccgtg 16433195  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaacgaggaaaat 253  Q
    |||| || ||||  ||||| ||||| ||||||||| | |||||||    
T  16433194 ttttgaaatcggagaaaactcaaacccaatcaaaatggggaaaat 16433150  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 44632367 - 44632254
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaaca 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44632367 tcgaacaatatgatcactttaacatttgttagacctattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattgtcaaaca 44632270  T
Q  107 aaataacatgacatat 122  Q
    |||||| ||| |||||    
T  44632269 aaataatatggcatat 44632254  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 51421721 - 51421941
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  51421721 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatagcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 51421818  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  51421819 acataacatatcaacatagagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacatgttacccgtcccatacccgt 51421918  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||||||||||||    
T  51421919 gttttgagatcgggaaaaaccca 51421941  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 40087689 - 40087581
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  40087689 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 40087592  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||| ||||    
T  40087591 acatgatatat 40087581  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 42708056 - 42707948
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42708056 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 42707959  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  42707958 acatgacatat 42707948  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 17134810 - 17135030
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17134810 aatatgttcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 17134907  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||  |||||| || ||| |||||||| ||||  | ||| ||||||| ||||| ||||   |||| |||    
T  17134908 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatatgggacgagtatgggtatgggttcggggatggtacctatatacccgttacccgtctcatacccgt 17135007  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  17135008 gttttgaaatcggggaaaaccca 17135030  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 18354306 - 18354086
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18354306 aatatgttcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 18354209  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |   ||||||||| |||| |||||| || ||| ||| |||| |||||||  |||||||||| ||||| |||| | |||| | |    
T  18354208 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgagtatgggtatcggttcggggtgggaacttatatacccgttacccgtcccatacccat 18354109  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  18354108 gttttgaaatcggggaaaaccca 18354086  T

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Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 29936279 - 29936499
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  29936279 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattataaaaaaaaata 29936376  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  29936377 acattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 29936476  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
     |||| |  ||||| ||||||||    
T  29936477 attttgagatcggggaaaaccca 29936499  T

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Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 225
Target Start/End: Original strand, 16408823 - 16409021
Alignment:
Q  27 aacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatattaa 125  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||   |    
T  16408823 aacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacatgacatacata 16408920  T
Q  126 tggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt-aaattcgggaaa 224  Q
      |||||||||| |||| ||  ||||||| | |||||||| ||||| | ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||||||| ||||| ||||||    
T  16408921 aagtaattttttacatttggagcgggtttagctatgggttcggggtcggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgtgttttgaaattggggaaa 16409020  T

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Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 5180908 - 5181016
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5180908 aatatgctcactttaaaatttgttagacgaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 5181005  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  5181006 acatgacatat 5181016  T

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Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 19572737 - 19572518
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||| ||| |   | || ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  19572737 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttaattgat---ccttcaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 19572641  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| | || | |||| |||    
T  19572640 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatacccgt 19572541  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||||||||||||    
T  19572540 gttttgaaatcgggaaaaaccca 19572518  T

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Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 42439896 - 42439715
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  42439896 aataagctcactttaacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 42439799  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| |||| | |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  42439798 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggatgagtttggatatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 42439715  T

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Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 50426881 - 50426773
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  50426881 aatatgctcactttaacatttgtaagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 50426784  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  50426783 acatgacatat 50426773  T

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Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 21 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 24236979 - 24236767
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24236979 cactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataaca 24236882  T
Q  120 tatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaa 215  Q
    ||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||  |||||| |||| |||||||| |     
T  24236881 tatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttccccgttccatacccgtgttttgag 24236782  T
Q  216 ttcgggaaaaaccca 230  Q
     ||||| ||||||||    
T  24236781 atcggggaaaaccca 24236767  T

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Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 28297796 - 28297998
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  28297796 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 28297893  T
Q  112 acatgacatattaatggtaa-----ttttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||| |||||| ||    ||     |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||    
T  28297894 acataacatatcaacataaaatagtttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccg 28297993  T
Q  207 tgttt 211  Q
    |||||    
T  28297994 tgttt 28297998  T

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Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 34060245 - 34060144
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34060245 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggttgtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 34060148  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  34060147 acat 34060144  T

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Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 36187440 - 36187226
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  36187440 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--catttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 36187343  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    ||||| |    |   ||| ||||| |||| ||||||||||||| ||||||||  |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||     
T  36187342 catatcaacataaaataactttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcagggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttttg 36187243  T
Q  214 aattcgggaaaaaccca 230  Q
    |  ||||| ||||||||    
T  36187242 agatcggggaaaaccca 36187226  T

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Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 23966735 - 23966917
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23966735 aatatgctcactttaacatttgttagatggaatgatttagttg--atactttaaatatcaatagtagtttttataaacatgacaattatcaaacaaaata 23966832  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||| ||||||     ||| |  | |||||| |||| ||||||||| ||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  23966833 acataacatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgtta 23966917  T

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Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 17092185 - 17092023
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17092185 aatatgttcactttaacatttattagatggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 17092088  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtg 172  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| |||  ||||||| ||||||    
T  17092087 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggcatgggttcggggtg 17092023  T

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Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 3628213 - 3628105
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   ||| |||||||| |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  3628213 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttg--atccgttaaatattaatggtagtttttattaacatgataattatcaaacaaaata 3628116  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  3628115 acatgacatat 3628105  T

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Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 49250999 - 49250797
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| | |  |||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  49250999 aataagctcactttcacatttgttagacaaaataatttagttgatct--tttaaatatcaatgatagtttttatcaacatgacaattatcaaacaaaata 49250902  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
     ||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||| | ||| |||| | |||| |||    
T  49250901 gcataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgaggtggatacctatatacccattacccgtcccatacccgt 49250802  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  49250801 gtttt 49250797  T

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Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 34610936 - 34611156
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34610936 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgatct--tttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 34611033  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    | || |||||| |    |  ||| | |||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| ||||||| |||||   || | |||| |||    
T  34611034 atataacatatcaacataaagtagtattttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgagtacctatatacacgttacatgtcccatacccgt 34611133  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||||||||||||    
T  34611134 gttttgagatcgggaaaaaccca 34611156  T

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Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 120
Target Start/End: Original strand, 2514677 - 2514736
Alignment:
Q  61 ctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacat 120  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2514677 ctttaaatatcaatggtagtttttattacacggcaattatcaaacaaaataacatgacat 2514736  T

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Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 139 - 252
Target Start/End: Complemental strand, 48125780 - 48125667
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactcaat 238  Q
    |||||| |||| |||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |  ||| ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |    
T  48125780 cattcgcgacgagtttgggtatgggttcggggtggatacctatatcctcgttacccgtcccgtacccgtgttttaaaatcaggaaaaatccaaactcagt 48125681  T
Q  239 caaaacgaggaaaa 252  Q
    |||||||| |||||    
T  48125680 caaaacgaagaaaa 48125667  T

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Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 21 - 111
Target Start/End: Original strand, 13020559 - 13020648
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13020559 cactttaatatttgttagacggaatgatttagttgata--ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13020648  T

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Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 24710721 - 24710822
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||| ||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  24710721 aataagctcattttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 24710818  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  24710819 acat 24710822  T

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Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 39616166 - 39616274
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||  || |  | ||||||||||||||||| ||||||| |||| || ||||| |||||||||||    
T  39616166 aatatgctcactttaacatctgttagacggaatgatttaactgat--catttaaatatcaatggtaatttttattaacatgataattagcaaacaaaata 39616263  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  39616264 acatgacatat 39616274  T

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Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 20774495 - 20774603
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||   ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  20774495 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaataaaagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 20774592  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||| ||||||    
T  20774593 acataacatat 20774603  T

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Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 92 - 185
Target Start/End: Original strand, 13390354 - 13390451
Alignment:
Q  92 gacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| ||||||| ||| |||||||    
T  13390354 gacaattatcaaacaaaataacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtgggtacctatatac 13390451  T

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Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 129 - 236
Target Start/End: Original strand, 34085217 - 34085324
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacc 228  Q
    ||||||||| ||||  ||||| || ||| |||||||| ||||||| ||| ||||  | ||||| || | | ||||||||||||| || ||||||||||||    
T  34085217 taattttttacatttaggacgagtatgggtatgggttcggggtgggtacatataaccccgttacccatcccatactcgtgttttgaaatcgggaaaaacc 34085316  T
Q  229 caaactca 236  Q
    ||||||||    
T  34085317 caaactca 34085324  T

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Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 61 - 115
Target Start/End: Original strand, 38733901 - 38733955
Alignment:
Q  61 ctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    |||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  38733901 ctttaaatatcaatgacaatttttataacatgacaattatcaaaccaaataacat 38733955  T

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Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 92 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 23490919 - 23490796
Alignment:
Q  92 gacaattatcaaacaaaataacatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatact 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||     |||   || |||||| |||| ||||||||||| | |||||||| ||||||| ||| |||||||     
T  23490919 gacaattatcaaacaaaataacataacatatccacataaat-tagttttttacatttgggacgggttttggtatgggttcggggtgggtacctatatacc 23490821  T
Q  187 cgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    ||||| |||| | |||| |||||||    
T  23490820 cgttacccgtcccatacccgtgttt 23490796  T

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Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 61 - 121
Target Start/End: Original strand, 36616796 - 36616856
Alignment:
Q  61 ctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacata 121  Q
    ||||||||||||| |  | ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36616796 ctttaaatatcaacgacaatttttataacttgacaattatcaaaccaaataacatgacata 36616856  T

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Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 55
Target Start/End: Original strand, 13390312 - 13390354
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  13390312 aatatgctcactttaacatttgttagacgaaatgatttagttg 13390354  T

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Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 50
Target Start/End: Original strand, 2514512 - 2514549
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgattt 50  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  2514512 aatatgcttattttaacatttgttagaccgattgattt 2514549  T

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Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 24160058 - 24160001
Alignment:
Q  65 aaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||||||  | ||||||||| | |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24160058 aaatatcaatgacaatttttataatatgacaattatcaaatcaaataacatgacatat 24160001  T

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Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 131 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 41477057 - 41476952
Alignment:
Q  131 attttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||| ||| ||||| | ||||| |||| |  ||||||| ||||  | |||  |||||||||    
T  41477057 attttctgctttcgggacgggtttgggtatggattcggggtgggtacatatatccacgttatccgtcccgtactcgtattttccaatcgaaaaaaaccca 41476958  T
Q  231 aactca 236  Q
    ||||||    
T  41476957 aactca 41476952  T

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Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 164 - 236
Target Start/End: Original strand, 13798255 - 13798327
Alignment:
Q  164 tttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| || |   |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  13798255 tttggggtggataaatatatcctcgttacccatctcatacccgtgttttgaaatcgggaaaaacccaaactca 13798327  T

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Target: chr3 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4016269 - 4016047
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4016269 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgct--cctttaaatatcgatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataa 4016172  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    | |||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| | ||    
T  4016171 catgacatatcaacataaggtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttatccgtcccatacccatg 4016072  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || ||||| |||||||||||    
T  4016071 ttttgaaatcggggaaaacccaaac 4016047  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 4557530 - 4557308
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  4557530 aatatgttcactttaacatttgttagaccgatttatttagttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttataacacatcaattatcaaacaaaataa 4557433  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  |||||||| |||||||||||  | ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| | ||    
T  4557432 catgacatatcaacataaagtaattttctgcattcgggatagatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccatg 4557333  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| ||  |||| |||||||||||    
T  4557332 ttttgaaaacggggaaaacccaaac 4557308  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 19111598 - 19111822
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19111598 aatatgatcactttaacatttgttataccaattgatttagttact--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaacaaaataa 19111695  T
Q  113 catgacatatta---atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgt 209  Q
    |||||||||| |   |  |||||||| | ||||  | ||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| || | |  ||| |||||    
T  19111696 catgacatataacataaagtaattttctacattttgtacgggtttgggcatgggtttagggtgggtacttatatacccgttatccatcccgtacccgtgt 19111795  T
Q  210 tttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||| || ||||||||||| ||||||||    
T  19111796 tttgaaatcgggaaaaactcaaactca 19111822  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 34119521 - 34119744
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  34119521 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgc--tcatttcaatatcaatgttagtttttataacacgacaattatcaaacaaaata- 34119617  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
     ||| ||||| |    |  ||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||  |||| ||||   |||| ||||    
T  34119618 -atggcatatcaacacaaagtagttttctgcatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacctgttatccgtctcatacccgtg 34119716  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  34119717 ttttaaaatcgggaaaaactcaaactca 34119744  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Original strand, 53631767 - 53631971
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53631767 aatatgctcactttatcatttgttagaccgatcgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataa 53631864  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |  |||||||| |  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||   |||| ||||    
T  53631865 catggcatatcaacataaagtaattttctagattcgggacgagtttgagtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtctcatacacgtg 53631964  T
Q  209 ttttaaa 215  Q
    |||||||    
T  53631965 ttttaaa 53631971  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 31127020 - 31126846
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31127020 aatatgctcactttaacatttgttagactgattgatttagttgct--cctttcaatatcaatgttagtttttataatacgacaattatcaaacaaaataa 31126923  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| ||||| |    |  ||| |||| |||||| |||||| |||||| |||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  31126922 catggcatatcaacacaatgtagttttctgcatttgggacgagtttgggtatgagttcggggtggatacctatatac 31126846  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 42758237 - 42758462
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  42758237 aatacgctcattttaacatttgttagaccggttgatttaattgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacatggcaattatcaaacaaaataa 42758334  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||||| |    |  |||||||| | | |||||||||||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||  |||| |||| | ||||  |||    
T  42758335 catggcatatcaacataaagtaattttcttcgttcgggacgggtttgggtatgggttcggggtgcatacctatatacctgttacccgtcccatacctgtg 42758434  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||| || |||||  |||||||||||||    
T  42758435 ttttgaaatcgggggaaacccaaactca 42758462  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 44172488 - 44172708
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44172488 aatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 44172585  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  44172586 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgt 44172685  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  44172686 gttttgagatcggggaaaaccca 44172708  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 44179188 - 44179408
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44179188 aatacgctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcagtggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 44179285  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  44179286 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgttacccgtcccatacccgt 44179385  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  44179386 gttttgagatcggggaaaaccca 44179408  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 24 - 233
Target Start/End: Original strand, 54317018 - 54317229
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatt 123  Q
    |||||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  54317018 tttaacatttgttagacatgttgatttagttgct--cctttaaatatcaatagtagtttttataacacggcaattatcaaacaaaataacatggcatatc 54317115  T
Q  124 a----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcg 219  Q
    |    |  |||||||| | | || |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||| || |||    
T  54317116 aacataaagtaattttcttcgtttgggacgggtttgggaatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcctatacttgtgttttgaaatcg 54317215  T
Q  220 ggaaaaacccaaac 233  Q
    || ||||| |||||    
T  54317216 gggaaaactcaaac 54317229  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 49579926 - 49580146
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||    
T  49579926 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaatcatcaaacaaaata 49580023  T
Q  112 acatgacatattaat----ggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |||     |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| | ||||| ||| ||||||||||||| |||| | |||| |||    
T  49580024 acataacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcgaggtgggtacctatatactcgttacccgtcccatacccgt 49580123  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  49580124 gttttgagatcggggaaaaccca 49580146  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 48391042 - 48390823
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| || ||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48391042 aatatgttcacttcaacatttgttagacggaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataa 48390945  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||||||||| |    |  |||||||||| | |||||||||||| ||| ||||||||  || ||| ||| ||||| | ||||| |||| | |||| ||||    
T  48390944 catgacatatcaacataaagtaattttttacgttcgggacgggtatgggtatgggttcaggatgggtacctatattcccgttacccgtcccatacccgtg 48390845  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||| || ||||| ||||||||    
T  48390844 ttttgaaatcggggaaaaccca 48390823  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22536067 - 22535959
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  22536067 aatatgctcactttaacatttgttagacagaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 22535970  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  22535969 acatgacatat 22535959  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 34025816 - 34026036
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  34025816 aatatgctccctttaacatttgatagatggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtaatttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 34025913  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||| | ||||  ||    
T  34025914 acatgacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtatgggtatgagttcggggtggaaacctatatactcgttacccgtcccatacctgt 34026013  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  34026014 gttttgaaatcggggaaaaccca 34026036  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 225
Target Start/End: Original strand, 29842170 - 29842385
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29842170 aatatgctcacttcaacatttgttagacgaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 29842267  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||||||| || |    |  |||||||||| |||| | ||||||| ||  |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||||| | || | |||| |||    
T  29842268 acatgacaaatcaacataaagtaattttttacatttgagacgggtatgagtatgggttcggggtgggtacctatattcccgttaccagtcccatacccgt 29842367  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaa 225  Q
    |||||||| |||||||||    
T  29842368 gttttaaaatcgggaaaa 29842385  T

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Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 16 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 41937224 - 41937122
Alignment:
Q  16 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41937224 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttg--ttcatttcaatatcaatgttagtctttataacacgacaattatcaaacaaaataatat 41937127  T
Q  116 gacat 120  Q
    |||||    
T  41937126 gacat 41937122  T

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Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 52198016 - 52198237
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaat- 110  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  52198016 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 52198113  T
Q  111 aacatgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||||  ||||| || |    |||||||||| |||| || |||||||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||||  |    
T  52198114 aacatagcatatcaacgtaaagtaattttttacatttggaacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacctg 52198213  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||| |  ||||||||||||||    
T  52198214 tgttttgagatcgggaaaaaccca 52198237  T

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Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 30682684 - 30682791
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  30682684 aatatgttcactttaacatttgttagaacgaatgatttaattgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacatgaccattatcaaacaaaataa 30682781  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  30682782 catgacatat 30682791  T

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Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 830872 - 831090
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||| ||  |||| ||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  830872 aatatgctcacgttaacattttttagaccaattgatttagtttct--ccttaaaatatcaatgatagtttttataagacggcaattatcaaacaaaataa 830969  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||  |||||||    |  |||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||  |||||| |||  |||||||||||| ||||   |||| ||||    
T  830970 catagcatattaacataaagtaattttctgcattcgggacgaatttgggtatgggttcagggtgggtac-catatactcgttatccgtctcatacccgtg 831068  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||| ||  ||||||| |||||    
T  831069 ttttgaaaacgggaaataccca 831090  T

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Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 19 - 214
Target Start/End: Complemental strand, 44107012 - 44106814
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||| ||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  44107012 ctcactttcacatttgtaagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 44106915  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttta 213  Q
    |||||||    |  |||||||||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| ||||||  |||||  ||| | |||| |||||||||    
T  44106914 catattaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgagtatgggttcggggtagatacctatatatccgttacgcgtcccatacccgtgtttta 44106815  T

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Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 39655499 - 39655279
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||   | | |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  39655499 aataagctcactttcacatttgttagagaaaattatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 39655402  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  39655401 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgagacgggtttgggtatgggtttggggtgggtacctatatacctgttacccgtcccatacccgt 39655302  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  39655301 gttttgagatcggggaaaaccca 39655279  T

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Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 34154280 - 34154493
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  34154280 aatatgttcactttaatatttgttagacataatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 34154377  T
Q  112 acatgacatattaatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    ||||  ||   ||| |  | |||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||| ||||| || |||| |||||  |||| | |||||    
T  34154378 acatatcaacataaagtaatttttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtgggtacctatattcttgttacccgtttcatacccatgttt 34154477  T
Q  212 taaattcgggaaaaac 227  Q
    | || ||||| |||||    
T  34154478 tgaaatcggggaaaac 34154493  T

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Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 52572471 - 52572673
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  52572471 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgata--ctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 52572568  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| ||||||||    |  |||||||||| |||| |||||||| |||  ||||| || ||||||| | | ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  52572569 acataacatattaacataaagtaattttttacatttgggacgggcttgagtatggattcggggtgggtccctatatacccgttacccgtcccatacccgt 52572668  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  52572669 gtttt 52572673  T

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Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 20086871 - 20086979
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||    
T  20086871 aatatgcccactttaacatttgttagatggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaagcaaaata 20086968  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  20086969 acatgacatat 20086979  T

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Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 39728533 - 39728714
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||  | |  |||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  39728533 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttaatct--tttaaatatcaatgatagtttttattaacagaacaattatcaaacaaaata 39728630  T
Q  112 acatgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||| |||||| ||      |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||| |||||    
T  39728631 acattacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacttatatacccgtta 39728714  T

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Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Original strand, 43582440 - 43582656
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||   ||| ||||||||||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||    
T  43582440 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttg--atccgttaaatatcaatggtagtttttatttacatgataattatcaaacaaaata 43582537  T
Q  112 acatgacatattaat----ggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |||     |||||||||| |||| ||||||||| ||  |||||| || |||||| ||| || |||| ||||| ||||   |||| |||    
T  43582538 acatgacatatcaatataaagtaattttttacatttgggacgggtatgaatatggg-ttcgggtgggtacctacatacacgttacccgtctcatacccgt 43582636  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaac 227  Q
    ||||| || ||||| |||||    
T  43582637 gttttgaaatcggggaaaac 43582656  T

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Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 44953661 - 44953441
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44953661 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 44953564  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||| ||||||||||||  |||| ||| ||||||  ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  44953563 acataacatatcaacataaagtagttttttacatttgggacgggtttgagtatgagttcggggtgagtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 44953464  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  44953463 gttttgagatcggggaaaaccca 44953441  T

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Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 59 - 212
Target Start/End: Original strand, 44639180 - 44639338
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtt 153  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    |   ||||||||| |||| || |||||||    
T  44639180 tcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataacatatcaacataaaataattttttacatttggaacgggtt 44639279  T
Q  154 tggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt 212  Q
    ||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  44639280 tgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgtttt 44639338  T

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Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6738620 - 6738434
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||| ||| |  ||||  ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||    
T  6738620 aatatgctcactttaacatctgttagacataatgatttaattgat--ccttccaatatcaatggtagtttttattaacatggcaattatcaaacaaaata 6738523  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||  ||||| |||||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  6738522 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgagtatggatttggggtgggtacctatatacccgttacccgt 6738434  T

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Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 17146376 - 17146202
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  17146376 aataagctgactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 17146279  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatata 184  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| |||| |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  17146278 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggaagggtttgtgtatgggttcggggtggatacctatata 17146202  T

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Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 244
Target Start/End: Original strand, 49025543 - 49025776
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  49025543 aataagctcactttcacatttattagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacataacaattatcaaacaaaata 49025640  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| || || ||  ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  49025641 acataacatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatggg-ttcggatgtgtacctatatacctgttacccgtcccatacccgt 49025739  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaac 244  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||||| || |||||||    
T  49025740 gttttgagatcggggaaaacccaaacccagtcaaaac 49025776  T

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Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 44252609 - 44252784
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  44252609 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 44252706  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| |||||| |    |  ||| ||||||  ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  44252707 acataacatatcaacataaagtagttttttatatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac 44252784  T

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Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 18 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 7469999 - 7469803
Alignment:
Q  18 gctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatg 116  Q
    ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||     
T  7469999 gctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaagatgacaattatcaaacaaaataacata 7469902  T
Q  117 acatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttt 211  Q
    ||||||     |||  ||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||||||    
T  7469901 acatatccacataa-agtagtgttttacatttgggacgggtttgtgtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtgttt 7469803  T

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Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 20 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 10823912 - 10823811
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgac 118  Q
    ||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  10823912 tcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataac 10823815  T
Q  119 atat 122  Q
    ||||    
T  10823814 atat 10823811  T

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Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 225
Target Start/End: Original strand, 23580698 - 23580905
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23580698 cactttaacatttgttatacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-aca 23580794  T
Q  120 tatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgtttt-aa 214  Q
    ||| |    |   ||||||||| |||| ||||   || ||| |||||||| || |||| ||| ||||||| ||||| |||||  ||||||||||||| ||    
T  23580795 tatcaacataaaataattttttacatttgggataagtgtgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgttacccgtttcatactcgtgttttgaa 23580894  T
Q  215 attcgggaaaa 225  Q
    ||| |||||||    
T  23580895 attggggaaaa 23580905  T

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Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 29284198 - 29284418
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||| | |  ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  29284198 aataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgatct--tttaaatattaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 29284295  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  ||| |||||| |||  ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  29284296 acataacatatcaacataaagtagttttttacatctgggacgggtttgggtatgggttcgggctgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 29284395  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||  |  ||||||||||||||    
T  29284396 gtttcgagatcgggaaaaaccca 29284418  T

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Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 48306768 - 48306657
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaac 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||   | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  48306768 tcgaacaatacgctcactttaatatttgttagacggaatgatttagttg--atactttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaac 48306671  T
Q  106 aaaataacatgaca 119  Q
    ||| ||||||||||    
T  48306670 aaattaacatgaca 48306657  T

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Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 8e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 23154245 - 23154071
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtt 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||  |||     
T  23154245 tcctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggataggta 23154147  T
Q  154 tggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||  |||||||| || |||| ||| ||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  23154146 tgagtatgggttcggagtgggtacctatatactcgttacccgttccatacccgtgtttgaaa-tcggggaaaaccca 23154071  T

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Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 23547198 - 23547087
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||| ||  | | ||||||||| |  ||||||||||| |||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  23547198 aataagctcactttcacatttgttaaacaaaattatttagttgat--cctttaaatataaatgctagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 23547101  T
Q  112 acatgacatattaa 125  Q
    |||| |||||||||    
T  23547100 acataacatattaa 23547087  T

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Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 24 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 55438894 - 55438828
Alignment:
Q  24 tttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacg 92  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||  ||||  ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  55438894 tttaacatttgttaaagcgattgatttagttgc--tcctccaaatatcgatggtagttttaataacacg 55438828  T

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Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 59 - 115
Target Start/End: Original strand, 14208308 - 14208363
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    |||||||||||||||||  | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  14208308 tcctttaaatatcaatgaca-tttttataacatgacaattatcaaaccaaataacat 14208363  T

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Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 1772603 - 1772540
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| |||||||   |||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1772603 tcctttaagtatcaataaaagttcttatatcatgataattatcaaacaaaataacatgacatat 1772540  T

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Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 129 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 30616388 - 30616284
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacc 228  Q
    ||||||||| | || ||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  ||||  ||||||| |||| | |||  |||||||| || ||||| ||||||    
T  30616388 taattttttacgtttgggacgggtatgggtatgggttcggggtggttatatataacctcgttacccgtcccatatccgtgttttgaaatcggggaaaacc 30616289  T
Q  229 caaac 233  Q
    |||||    
T  30616288 caaac 30616284  T

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Target: chr5 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 4582981 - 4583201
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4582981 aatatgctcactttaacatttgatagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 4583078  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||  || ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  4583079 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggtttggggtgggaacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 4583178  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||| ||||||||    
T  4583179 gttttgaaatcggggaaaaccca 4583201  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 3573087 - 3573194
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  3573087 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttgaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacagaataa 3573184  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  3573185 catgacatat 3573194  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 35194215 - 35194011
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  35194215 aatatgttcactttaacattttttagaccaattgatttagtttatt--ctttaaatatcaatggtagtttttataacacagcaattatcaaacaaaataa 35194118  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||  |||||||    |  |||||||| | |||||||||||||||||  |||| ||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  35194117 catagcatattaacataaagtaattttctacattcgggacgggtttgagtatgagtttggggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgtg 35194018  T
Q  209 ttttaaa 215  Q
    |||||||    
T  35194017 ttttaaa 35194011  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 2412952 - 2412772
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  2412952 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattaatttagttgct--cctttaaatatcaattgtagtttttatgacacaacaattatcaaacaaaataa 2412855  T
Q  113 catgacatattaat----ggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    |||||||||| |||     |||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| ||||  || ||| ||| ||||||| |||||    
T  2412854 catgacatatcaatataaagtaattttctgcatacgggacgagtttgggtattggttcaggatgggtacatatatacccgtta 2412772  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 2985010 - 2985117
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  2985010 aatatgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacaacaattatcaaataaaataa 2985107  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    ||||||||||    
T  2985108 catgacatat 2985117  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 4920688 - 4920908
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  | ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4920688 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--catttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 4920785  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  4920786 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtggatacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 4920885  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| |  ||||| ||||||||    
T  4920886 gttttgagatcggggaaaaccca 4920908  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 125
Target Start/End: Original strand, 12447251 - 12447354
Alignment:
Q  20 tcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 119  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12447251 tcactttaacatttgttagatcgattgatttaactgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgaca 12447348  T
Q  120 tattaa 125  Q
    ||||||    
T  12447349 tattaa 12447354  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 27088577 - 27088416
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  27088577 aatatgcttactttaacatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacataacaattatcaaacaaaataa 27088480  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtgg 173  Q
    ||| |||||| |    |   ||||||| | |||||| ||||||||||| |||||||| |||||||    
T  27088479 cat-acatatcaacataaaataattttctacattcgagacgggtttgggtatgggttcggggtgg 27088416  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 5908915 - 5908714
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | | ||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  5908915 aataagctcactttcacatttgttagacaaaattatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 5908818  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  5908817 acataacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtatgggtttggggtgtgtacatatatacccgttacccgtcccatacccgt 5908718  T
Q  208 gttt 211  Q
    ||||    
T  5908717 gttt 5908714  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 38006695 - 38006522
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38006695 aatatgctcgttttaacaattgttagaccaattgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtggtttttataatacgactattatcaaacaaaataa 38006598  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatata 184  Q
    ||||||||||||    |   |||||||   |||||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||    
T  38006597 catgacatattaacataaattaattttcaacattcgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatata 38006522  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 1218619 - 1218798
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  1218619 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttttaacatgacaattatcaaacaaaataa 1218716  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtta 191  Q
    ||| ||| || |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| || |||| ||| ||||||| |||||    
T  1218717 cat-acaaatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtacctatatacccgtta 1218798  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 190
Target Start/End: Original strand, 30115346 - 30115525
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30115346 aatatgctcactttaacatttgttagactgatcgatttagttgct--cctttaaatataaatggtggtttttataacacggcaattatcaaacaaaataa 30115443  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgtt 190  Q
    |||  ||||| |    |   ||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||| ||| |||  |||||| ||||    
T  30115444 catagcatatcaacataaaataattttatgcattcgggacgggtttgaatatgggttcgggatgggtaccaatatacccgtt 30115525  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 28045517 - 28045737
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta--taacacgacaattatcaaacaaaat 110  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||   ||||||||||||||||| |||||||||  |||||  |||||||| |||||||||    
T  28045517 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatgatagtttttatttaacataacaattataaaacaaaat 28045614  T
Q  111 aacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    |||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | ||| |||    
T  28045615 aacatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatggg-ttcgggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatattcg 28045713  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||||| |||| ||||||||||||    
T  28045714 tgttttgaattagggaaaaaccca 28045737  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 30996459 - 30996684
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||||||||| ||||||| || ||||||| ||| |  |||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  30996459 aatacgctcactttaacatt-gttagacggaatgatttatttgat--cctttaaatatcaacggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 30996555  T
Q  112 acatgacatat----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||| |||||    | |  |||||||||| |||| ||||||||||||| | || ||| ||||||| ||| ||||||| ||||| | || | ||||||||    
T  30996556 acatggcatatcaacttaaagtaattttttacatttgggacgggtttgggtgtgtgttcggggtgggtacctatatacccgttacctgtcccatactcgt 30996655  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  30996656 gttttaaaatcggagaaaacccatactca 30996684  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17853518 - 17853300
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  17853518 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 17853421  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| || |||| ||  ||||||  ||||| |||| | |||| |||    
T  17853420 acat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggagtgggtatctatatatccgttacccgtcccatacccgt 17853322  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    |||| ||| ||||| ||||||||    
T  17853321 gtttgaaa-tcggggaaaaccca 17853300  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Original strand, 35311685 - 35311786
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35311685 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 35311782  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  35311783 acat 35311786  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 9e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 236
Target Start/End: Original strand, 18206880 - 18207106
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgac-aattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  18206880 aatatgcccactttaatatttgttagaccgattgatttagttgc--tcctttaaatatcattagtagtttttataacacggcaaattattaaacaaaata 18206977  T
Q  112 acatgacatat-----taatggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcg 206  Q
    ||||| |||||     ||   |||||||| | |||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||| |||||||  |||| | || | |||| ||    
T  18206978 acatggcatatcaacatagaagtaattttctacattcgggacgggtttgaatatggg-ttcgggtgggtacctatatacctgttacctgtcccatacacg 18207076  T
Q  207 tgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
     ||||| || ||| | ||||||||||||||    
T  18207077 agttttgaaatcgaggaaaacccaaactca 18207106  T

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Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3564954 - 3564853
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3564954 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 3564857  T
Q  112 acat 115  Q
    ||||    
T  3564856 acat 3564853  T

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Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22695128 - 22694946
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | |||| |||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  22695128 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatatagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 22695031  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttag 192  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| | ||||| ||||||    
T  22695030 acattacatatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctctatacccgttag 22694946  T

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Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 13402229 - 13402014
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||   |||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  13402229 aatatgctcattttaacatttgttagacgaaatgatttagttg--atcctttaaatatcaatagtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 13402132  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| | | | |||||| || |||| ||| || |||| ||||| |||||| |||| |||    
T  13402131 acat-acatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatcggt-tgggttcggagtgggtacctaaatacccgttacccgttccatacccgt 13402034  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaac 227  Q
    |||| ||| |||||||||||    
T  13402033 gtttgaaaatcgggaaaaac 13402014  T

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Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Complemental strand, 6156145 - 6155924
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||  ||||||||||||||||| || |||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  6156145 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttatttgc--tcctttaaatatcaatgatattttttattaccatgacaattatcaaacaaaata 6156048  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||| ||||| |    |  ||||||||   |||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||  | ||| | || |||||| |||    
T  6156047 acatgtcatataaacataaagtaattttcaacatttgtgacggttttgggtatgggttcggggtgggtacatatata--ccttacctgtcctatacccgt 6155950  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||    
T  6155949 gttttgaaatcggggaaaacccaaac 6155924  T

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Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 8453598 - 8453490
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  8453598 aatatgctcattttaacatttgtttgaccgaatgatttagttact--cctttaaatatcaatggtaatttttataacatgacaattattaaacaaaataa 8453501  T
Q  113 catgacatattaa 125  Q
    |  ||||||||||    
T  8453500 c--gacatattaa 8453490  T

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Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 29246178 - 29246003
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  29246178 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgatt--cattaaatatcaatggtagtgtttattaacataacaattatcaaacaaaata 29246081  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    ||||||||||  |    |   ||||||||| |||| |||| |||| ||| |||||||||||||||| ||| |||||||    
T  29246080 acatgacataccaacataaaataattttttacatttgggatgggtatgggtatgggtttggggtgggtacctatatac 29246003  T

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Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 212
Target Start/End: Original strand, 40517668 - 40517870
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  40517668 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 40517765  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |   ||||||||| | || ||||||||||||  |||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||| || | | |||| |||    
T  40517766 acataacatatcaacataaaataattttttacctttgggacgggtttgagtatgggttcggggtgggtaactatatacccgttacccatcccatacccgt 40517865  T
Q  208 gtttt 212  Q
    |||||    
T  40517866 gtttt 40517870  T

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Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 42717849 - 42717756
Alignment:
Q  22 actttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatc-aaacaaaataacatg 116  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  42717849 actttaacatttgttagaccggttgatttagtttct--cctttaaatatcaatgatagtttttataacacgacaattatcaaaacaaaatatcatg 42717756  T

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Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33862409 - 33862303
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |  | ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  33862409 aatatgttcactttaacatttgttagccc-attgatttagttggt--catttaaatatcaatcgtagtttttacaacatgacaattatcaaacaaaataa 33862313  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    |||| |||||    
T  33862312 catggcatat 33862303  T

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Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 19 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 42987700 - 42987532
Alignment:
Q  19 ctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaataacatga 117  Q
    |||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  42987700 ctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaataacataa 42987603  T
Q  118 catatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatata 184  Q
    ||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||| ||||||    
T  42987602 catatcaacataaaataattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcgggatgggtacctatata 42987532  T

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Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 30 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6092728 - 6092559
Alignment:
Q  30 atttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatatta---- 124  Q
    |||||||||||  | ||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| |||||| |        
T  6092728 atttgttagacaaaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtagtttttattaacattgcaattatcaaacaaaataacataacatatcaacat 6092631  T
Q  125 atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgt 196  Q
    |  |||||||||| |||| ||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| ||||    
T  6092630 aaagtaattttttacatttgggacggatttgggtatgggttcggggtgggtacctatatacccgttacccgt 6092559  T

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Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 230
Target Start/End: Original strand, 15890069 - 15890288
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  | | ||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| ||||||    
T  15890069 aatatgttcactttaacatttgttagacgtaattatttaattgat--ccttcaaatatcaatggtagttttcattaatatgacaattatcaaataaaata 15890166  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    ||||||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||| || |||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| |||    
T  15890167 acatgacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatggg-ttcgggtgggtacctatatacccgttacccgtcccatacccgt 15890265  T
Q  208 gttttaaattcgggaaaaaccca 230  Q
    ||||| || ||||  ||||||||    
T  15890266 gttttgaaatcggagaaaaccca 15890288  T

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Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 20973718 - 20973604
Alignment:
Q  7 tcgaagaatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaac 105  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||| |||||| || ||||||||||| |   ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  20973718 tcgaacaatacgctcactttaatattttttagacggaatgatttagttgata--ctttacatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaac 20973621  T
Q  106 aaaataacatgacatat 122  Q
    |||||| ||||||||||    
T  20973620 aaaataccatgacatat 20973604  T

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Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12834802 - 12834626
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |  |||||| ||| |  | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12834802 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacgatttaattgat--cattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 12834705  T
Q  112 acat-gacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| ||||||| |    |   ||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| ||||| | ||| |||||||    
T  12834704 acatagacatatcaacataaattaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcggggtaggtacctatatac 12834626  T

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Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 12866779 - 12866603
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |   ||||| ||| |  | || |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  12866779 aatatgctcactttaacatttgttagacgtaacaatttaattgat--cattcaaatatcaatggtagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 12866682  T
Q  112 acat-gacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||| ||||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||| |||||||    
T  12866681 acatagacatatcaacataaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgcggtgggtacctatatac 12866603  T

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Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 27302959 - 27302851
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |  |||||||||||||||||||  |  ||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  27302959 aatatgatcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgat--cctttaaatatcaatggtacgtagta--acatgacaattatcaaacaaaataa 27302864  T
Q  113 catgacatattaa 125  Q
    |||||||||||||    
T  27302863 catgacatattaa 27302851  T

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Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 139 - 242
Target Start/End: Original strand, 6810149 - 6810252
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactcaat 238  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||| ||||||  ||||||||| ||||||| ||||||  ||| |||||| |||| ||||| |||||||||||||| |    
T  6810149 cattcgggatgggtttgggtatgggttcggggtgagtacttatatcctcgttacccgttccgtacccgtgttctaaaatcggggaaaacccaaactcatt 6810248  T
Q  239 caaa 242  Q
    ||||    
T  6810249 caaa 6810252  T

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Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 77 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 33420494 - 33420449
Alignment:
Q  77 tagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33420494 tagtttttataacacgacaattatcaaataaaataacatgacatat 33420449  T

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Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 21 - 114
Target Start/End: Original strand, 6369566 - 6369658
Alignment:
Q  21 cactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaataaca 114  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||   || |||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  6369566 cactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcttttaaacatcaacggtagttttcattaacatgataattatcaaacaaaataaca 6369658  T

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Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 20634064 - 20634128
Alignment:
Q  58 ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20634064 ttcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 20634128  T

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Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 20650178 - 20650242
Alignment:
Q  58 ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20650178 ttcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 20650242  T

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Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 58 - 122
Target Start/End: Original strand, 34259144 - 34259208
Alignment:
Q  58 ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34259144 ttcctttaactatcaatgaaagttcttatatcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 34259208  T

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Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 92 - 244
Target Start/End: Original strand, 15564576 - 15564732
Alignment:
Q  92 gacaattatcaaacaaaataacatgacatattaatg----gtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactc 187  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||    |||||||| | ||||||||||| |||||  |||| ||| ||| || ||||  |||||| |    
T  15564576 gacaattttcaaaaaaaataacatgacatatcaatgtaaagtaattttctacattcgggacgagtttgagtatgagttcgggatgaatacagatataccc 15564675  T
Q  188 gttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactcaatcaaaac 244  Q
    |||| || | | |||| | | | || || |||||||||||||||||||||| |||||    
T  15564676 gttacccatcccatacgcatttcttgaaatcgggaaaaacccaaactcaattaaaac 15564732  T

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Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 86
Target Start/End: Original strand, 10126970 - 10127041
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat 86  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||  | ||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||    
T  10126970 aataagctcactttcacatttgttagacaaaatgatttagttgatct--tttaaatatcaatggtagtttttat 10127041  T

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Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 129 - 185
Target Start/End: Original strand, 10127062 - 10127118
Alignment:
Q  129 taattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||    
T  10127062 taattttttacatttgggacgggtttgggtatgggttcggggtgggtacctatatac 10127118  T

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Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 59 - 122
Target Start/End: Original strand, 2681101 - 2681164
Alignment:
Q  59 tcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatgacatat 122  Q
    |||||||| ||||||||  |||| ||||  || |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2681101 tcctttaactatcaatgaaagttcttatttcatgacaattatcaaaccaaataacatgacatat 2681164  T

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Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 139 - 236
Target Start/End: Original strand, 17153160 - 17153257
Alignment:
Q  139 cattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtgttttaaattcgggaaaaacccaaactca 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||| |||||  | |||| |||| |  ||| | ||||||||| |||| |||||| ||||||||    
T  17153160 cattcgggacgggtttgggtatgggtttgggatgagtacatatatcatagttatccgtcccgtacccatgttttaaaatcggaaaaaactcaaactca 17153257  T

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Target: scaffold0036 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 233
Target Start/End: Original strand, 33256 - 33478
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  33256 aatatgtttactttaacaattgttagaccgattgatttagttg--ttcctttaaatatcaatcgtagtttttataacacaacaattaccaaacaaaataa 33353  T
Q  113 catgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgtg 208  Q
    |||| ||| | |    |  ||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||| ||| ||||||| ||||| |||| | |||| ||||    
T  33354 catggcatgtcaacataaagtagttttctgcattcgggacgagtttgggtatgggttcggggtgggtacatatatacccgttacccgtcccatacccgtg 33453  T
Q  209 ttttaaattcgggaaaaacccaaac 233  Q
    |||| || ||||| |||||||||||    
T  33454 ttttgaaatcggggaaaacccaaac 33478  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 16 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 197549 - 197407
Alignment:
Q  16 atgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacat 115  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||    
T  197549 atgctcactttaatatttgttagaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttataacaaggtaattatcaaacaaaataacat 197452  T
Q  116 gacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttgg 156  Q
    | ||||| |    |  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  197451 ggcatatcaacataaagtaattttctgcattcgggacgggtttgg 197407  T

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Target: scaffold0294 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0294
Description:

Target: scaffold0294; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 112
Target Start/End: Original strand, 14638 - 14735
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||    
T  14638 aatatgctcactttaacatttgttaaaccgattgatttagttgct--cctttaaatatcaatggtagtttttacaacacaataattatcaaacaaaataa 14735  T

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Target: scaffold0027 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 6269 - 6376
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6269 aatatgttcactttaacatttgttagatcgattgatttagttgct--cctttaaatttcaatggtaatttttatagcacgacaactatcaaacaaaataa 6366  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    |||| |||||    
T  6367 catggcatat 6376  T

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Target: scaffold0189 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0189
Description:

Target: scaffold0189; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 4119 - 4227
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttat-aacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  4119 aatatgttcactttaacatttgttagatggaatgatttagttgct--cctttaaatatcaatgatagtttttattaacatgacaattatcaaacaaaata 4216  T
Q  112 acatgacatat 122  Q
    |||||||||||    
T  4217 acatgacatat 4227  T

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Target: scaffold0097 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 185
Target Start/End: Original strand, 33446 - 33624
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaa-ca---aa 108  Q
    |||||| ||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||   ||    
T  33446 aatatgttcactttaatatttgttacaccgactgatttaattgctt--ctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaaaattatcaaatcaaataa 33543  T
Q  109 ataacatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatac 185  Q
    |||||||| ||||| |    |  ||| |||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||    
T  33544 ataacatggcatatcatcataaagtagttttctgcatttgtgacgggtttggttatgggtttggggtgaggacttatatac 33624  T

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Target: scaffold0022 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 122
Target Start/End: Original strand, 90460 - 90567
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataa 112  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||||||| |||||||||||    
T  90460 aatatactcactttaatatttgttagaccgattgatttatttgct--cctttaaatatcaatggttgttttaataacacatcaattattaaacaaaataa 90557  T
Q  113 catgacatat 122  Q
    |||| |||||    
T  90558 catggcatat 90567  T

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Target: scaffold0014 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 14370 - 14290
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgaca 95  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14370 aatatgttcactttaacatttgttagaccgattgatttaattg--ttcctttaaatatcaatggtagtttttataacatgaca 14290  T

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Target: scaffold0519 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0519
Description:

Target: scaffold0519; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 211
Target Start/End: Original strand, 10163 - 10360
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||   ||||||||||    | ||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||    
T  10163 aatatgttcactttaacatttgttagacggaatgatttagttg--atcctttaaat---gacggtagtttttattaatatgacaattatcaaacaaaata 10257  T
Q  112 acatgacatatta----atggtaattttttgcattcgggacgggtttggttatgggtttggggtggatacttatatactcgttagccgttctatactcgt 207  Q
    |||| |||||| |    |  |||||||||| |||| ||||||||| ||| |||||||| |  |||| ||| |||||||  |||| |||| | |||| |||    
T  10258 acat-acatatcaacacaaagtaattttttacatttgggacgggtatgggtatgggttcgtagtgggtacctatatacctgttatccgtcccatacccgt 10356  T

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Target: scaffold0095 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 118
Target Start/End: Complemental strand, 32755 - 32652
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagttttta-taacacgacaattatcaaacaaaata 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| ||| |   | |||||||||| |||||||||||| || || ||| |||||||  ||||||     
T  32755 aatatgctcactttaacatttgttagacggaatgatttaattgat---cattaaatatcactggtagtttttattaccatgaccattatcactcaaaatc 32659  T
Q  112 acatgac 118  Q
    |||||||    
T  32658 acatgac 32652  T

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Target: scaffold0902 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0902
Description:

Target: scaffold0902; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 103
Target Start/End: Original strand, 748 - 836
Alignment:
Q  13 aatatgctcactttaacatttgttagaccgattgatttagttgctttcctttaaatatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaa 103  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||    
T  748 aatatgttcactataacatttctttgatcgaatgatttggttgcta--ctttaaatatcaatggtaggttttataacatgacaaatatcaa 836  T

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Target: scaffold0015 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 68 - 116
Target Start/End: Complemental strand, 56092 - 56044
Alignment:
Q  68 tatcaatggtagtttttataacacgacaattatcaaacaaaataacatg 116  Q
    ||||||||  |||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  56092 tatcaatgaaagtttttatatcaggacaattatcaaaccaaataacatg 56044  T

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