View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15509_low_5 (Length: 294)

Name: NF15509_low_5
Description: NF15509
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15509_low_5
NF15509_low_5
[»] chr3 (76 HSPs)
chr3 (28-286)||(3135432-3135699)
chr3 (51-217)||(43346793-43346959)
chr3 (27-217)||(37990953-37991145)
chr3 (27-205)||(15772856-15773035)
chr3 (49-217)||(37990639-37990807)
chr3 (49-207)||(35946522-35946680)
chr3 (49-205)||(22304571-22304727)
chr3 (49-205)||(29644902-29645058)
chr3 (39-218)||(42342377-42342557)
chr3 (26-205)||(15773194-15773376)
chr3 (49-205)||(29644581-29644737)
chr3 (26-205)||(32589706-32589885)
chr3 (40-205)||(54017806-54017972)
chr3 (49-205)||(54018198-54018354)
chr3 (52-217)||(32462903-32463069)
chr3 (51-205)||(42342092-42342246)
chr3 (49-205)||(21832345-21832499)
chr3 (57-198)||(39934963-39935104)
chr3 (49-205)||(12114562-12114718)
chr3 (49-201)||(33803252-33803404)
chr3 (49-217)||(52634666-52634833)
chr3 (47-217)||(45901703-45901874)
chr3 (49-205)||(25739425-25739581)
chr3 (49-217)||(25755384-25755552)
chr3 (49-205)||(53577366-53577522)
chr3 (49-185)||(41359765-41359901)
chr3 (57-218)||(22303963-22304117)
chr3 (48-218)||(31190006-31190168)
chr3 (26-217)||(32462535-32462727)
chr3 (70-205)||(4823657-4823792)
chr3 (58-205)||(39389072-39389219)
chr3 (75-200)||(3135099-3135224)
chr3 (47-205)||(8327906-8328068)
chr3 (37-207)||(33175646-33175822)
chr3 (60-205)||(39914254-39914399)
chr3 (52-205)||(45395656-45395809)
chr3 (38-205)||(53117964-53118130)
chr3 (57-217)||(49336694-49336855)
chr3 (49-205)||(50612447-50612608)
chr3 (38-205)||(51886563-51886724)
chr3 (37-205)||(1634302-1634471)
chr3 (49-205)||(44160547-44160700)
chr3 (50-204)||(11661954-11662108)
chr3 (52-146)||(22303662-22303756)
chr3 (65-204)||(33362305-33362451)
chr3 (49-205)||(37726506-37726654)
chr3 (27-205)||(39336208-39336385)
chr3 (49-123)||(41359491-41359565)
chr3 (91-197)||(42584864-42584970)
chr3 (100-205)||(3384317-3384422)
chr3 (56-205)||(9240151-9240300)
chr3 (100-157)||(52634990-52635047)
chr3 (49-137)||(54017548-54017636)
chr3 (141-207)||(11661535-11661601)
chr3 (79-165)||(39336000-39336086)
chr3 (75-205)||(47964544-47964674)
chr3 (115-204)||(7767380-7767469)
chr3 (152-205)||(22304248-22304301)
chr3 (49-98)||(22304302-22304351)
chr3 (95-141)||(16871005-16871051)
chr3 (151-205)||(43346652-43346706)
chr3 (50-103)||(8328374-8328427)
chr3 (49-127)||(43978865-43978947)
chr3 (100-204)||(46546376-46546480)
chr3 (49-205)||(47964915-47965071)
chr3 (75-144)||(25317221-25317290)
chr3 (101-141)||(17735043-17735083)
chr3 (101-141)||(19036312-19036352)
chr3 (1-40)||(3134993-3135032)
chr3 (27-80)||(9239940-9239994)
chr3 (95-141)||(17731950-17731996)
chr3 (95-141)||(19033181-19033227)
chr3 (89-139)||(53596028-53596078)
chr3 (89-139)||(53596343-53596393)
chr3 (108-205)||(25991405-25991502)
chr3 (95-139)||(16143506-16143550)
[»] chr7 (62 HSPs)
chr7 (27-205)||(1085593-1085772)
chr7 (38-221)||(45433227-45433411)
chr7 (37-219)||(7517568-7517751)
chr7 (49-205)||(37533011-37533166)
chr7 (49-217)||(30244260-30244428)
chr7 (49-205)||(40094774-40094930)
chr7 (37-219)||(22567026-22567208)
chr7 (27-206)||(47129096-47129275)
chr7 (27-217)||(30245067-30245254)
chr7 (49-206)||(6054561-6054718)
chr7 (26-217)||(34218010-34218202)
chr7 (27-204)||(37533341-37533519)
chr7 (49-218)||(23377-23546)
chr7 (49-217)||(45434626-45434794)
chr7 (49-200)||(11845198-11845349)
chr7 (49-219)||(30032555-30032725)
chr7 (28-205)||(36622962-36623140)
chr7 (60-217)||(45754706-45754862)
chr7 (52-205)||(29157567-29157720)
chr7 (59-199)||(19122740-19122879)
chr7 (49-205)||(24177437-24177593)
chr7 (78-205)||(7554027-7554154)
chr7 (52-217)||(20599304-20599471)
chr7 (57-205)||(36939741-36939889)
chr7 (51-204)||(9901648-9901799)
chr7 (100-205)||(22566713-22566818)
chr7 (40-205)||(118290-118457)
chr7 (87-205)||(16569198-16569316)
chr7 (87-205)||(16596346-16596464)
chr7 (72-217)||(24838724-24838870)
chr7 (52-205)||(14681512-14681663)
chr7 (49-205)||(8128441-8128597)
chr7 (29-165)||(30253534-30253667)
chr7 (53-205)||(40230295-40230447)
chr7 (27-126)||(47129450-47129549)
chr7 (81-205)||(1085280-1085405)
chr7 (55-204)||(41910592-41910749)
chr7 (39-159)||(28300242-28300364)
chr7 (49-205)||(41854637-41854792)
chr7 (51-146)||(37167842-37167937)
chr7 (119-205)||(28301613-28301699)
chr7 (141-205)||(30244703-30244767)
chr7 (141-205)||(36109009-36109073)
chr7 (86-205)||(43241497-43241616)
chr7 (141-205)||(30245496-30245560)
chr7 (141-205)||(30255341-30255405)
chr7 (58-205)||(36534795-36534940)
chr7 (28-119)||(37532729-37532821)
chr7 (50-124)||(28300569-28300644)
chr7 (144-219)||(36967325-36967399)
chr7 (26-105)||(30244454-30244534)
chr7 (26-105)||(30253672-30253752)
chr7 (102-202)||(44361517-44361616)
chr7 (89-139)||(21416181-21416231)
chr7 (60-141)||(40094424-40094505)
chr7 (89-165)||(4124128-4124204)
chr7 (90-138)||(23569043-23569091)
chr7 (49-105)||(30245257-30245313)
chr7 (49-137)||(37393128-37393216)
chr7 (161-205)||(40094506-40094550)
chr7 (37-97)||(7517767-7517828)
chr7 (37-97)||(7518033-7518094)
[»] chr4 (84 HSPs)
chr4 (40-205)||(25483338-25483504)
chr4 (50-205)||(36629239-36629394)
chr4 (27-198)||(44620362-44620531)
chr4 (34-207)||(39792842-39793016)
chr4 (49-218)||(50002415-50002584)
chr4 (49-205)||(41370359-41370515)
chr4 (50-201)||(1731646-1731797)
chr4 (50-217)||(34646648-34646815)
chr4 (37-207)||(39404018-39404189)
chr4 (50-217)||(39404388-39404555)
chr4 (37-205)||(50630740-50630909)
chr4 (47-205)||(3340809-3340967)
chr4 (49-223)||(10245904-10246077)
chr4 (40-205)||(54017583-54017749)
chr4 (56-205)||(32941128-32941277)
chr4 (27-198)||(44621011-44621180)
chr4 (49-205)||(55933122-55933278)
chr4 (29-205)||(44620662-44620838)
chr4 (49-217)||(36572009-36572177)
chr4 (49-205)||(36608659-36608815)
chr4 (27-205)||(22027936-22028115)
chr4 (49-207)||(20825836-20825994)
chr4 (50-204)||(50459724-50459878)
chr4 (50-205)||(16889535-16889690)
chr4 (49-184)||(18932747-18932882)
chr4 (59-205)||(52884697-52884844)
chr4 (49-197)||(54343006-54343147)
chr4 (48-205)||(16888813-16888970)
chr4 (49-218)||(22183262-22183431)
chr4 (59-192)||(54108928-54109060)
chr4 (70-205)||(4955336-4955471)
chr4 (49-205)||(22028367-22028525)
chr4 (27-205)||(49076807-49076984)
chr4 (48-204)||(49302907-49303065)
chr4 (89-207)||(41707503-41707620)
chr4 (48-205)||(3244448-3244605)
chr4 (49-219)||(54936188-54936353)
chr4 (27-153)||(23817654-23817783)
chr4 (78-192)||(45496820-45496934)
chr4 (59-205)||(52884889-52885038)
chr4 (49-205)||(3341130-3341286)
chr4 (54-201)||(20826223-20826370)
chr4 (50-217)||(45489331-45489497)
chr4 (70-205)||(49880162-49880296)
chr4 (49-155)||(43827492-43827597)
chr4 (49-205)||(54108540-54108694)
chr4 (52-205)||(4390102-4390255)
chr4 (37-217)||(43174496-43174677)
chr4 (52-201)||(51768061-51768210)
chr4 (37-205)||(2740702-2740869)
chr4 (26-205)||(34004559-34004737)
chr4 (89-205)||(54741216-54741332)
chr4 (100-205)||(2741073-2741178)
chr4 (55-156)||(31691203-31691306)
chr4 (49-189)||(3271802-3271947)
chr4 (75-205)||(23556890-23557020)
chr4 (84-201)||(6975489-6975606)
chr4 (49-205)||(49076449-49076602)
chr4 (52-205)||(3700367-3700512)
chr4 (61-217)||(19504695-19504842)
chr4 (49-181)||(48111696-48111828)
chr4 (67-207)||(40067043-40067184)
chr4 (51-159)||(18879854-18879962)
chr4 (89-205)||(28034231-28034347)
chr4 (118-205)||(10246349-10246436)
chr4 (100-194)||(54017751-54017845)
chr4 (27-204)||(34544107-34544286)
chr4 (140-218)||(44620285-44620363)
chr4 (140-205)||(44621428-44621493)
chr4 (46-202)||(760194-760348)
chr4 (70-193)||(15841387-15841510)
chr4 (40-94)||(23817444-23817498)
chr4 (53-127)||(41370738-41370812)
chr4 (49-115)||(43174233-43174299)
chr4 (161-205)||(45050603-45050647)
chr4 (140-206)||(44620945-44621012)
chr4 (49-207)||(45489712-45489870)
chr4 (89-139)||(11197294-11197344)
chr4 (155-205)||(50788087-50788137)
chr4 (34-93)||(11702281-11702341)
chr4 (58-97)||(19895406-19895445)
chr4 (27-121)||(39698919-39699014)
chr4 (100-141)||(1868117-1868158)
chr4 (91-135)||(11706584-11706628)
[»] chr2 (66 HSPs)
chr2 (27-206)||(6421386-6421566)
chr2 (49-205)||(36178605-36178761)
chr2 (55-217)||(15880253-15880415)
chr2 (49-205)||(37105926-37106082)
chr2 (49-205)||(41283475-41283631)
chr2 (51-205)||(37106190-37106344)
chr2 (49-205)||(14745667-14745823)
chr2 (27-205)||(5542602-5542781)
chr2 (52-205)||(962600-962753)
chr2 (40-200)||(15511486-15511646)
chr2 (27-205)||(5542975-5543154)
chr2 (49-217)||(6712966-6713135)
chr2 (56-217)||(36005887-36006047)
chr2 (26-185)||(36178147-36178307)
chr2 (27-205)||(42514651-42514830)
chr2 (25-191)||(6422126-6422293)
chr2 (51-202)||(33731653-33731804)
chr2 (49-205)||(35580724-35580879)
chr2 (49-199)||(29676543-29676687)
chr2 (26-194)||(23346250-23346418)
chr2 (52-201)||(40679632-40679781)
chr2 (37-205)||(37632586-37632753)
chr2 (27-205)||(1769894-1770073)
chr2 (27-205)||(7598230-7598409)
chr2 (70-203)||(28254260-28254391)
chr2 (50-205)||(38796619-38796776)
chr2 (49-207)||(40733883-40734040)
chr2 (49-207)||(40733517-40733675)
chr2 (50-202)||(29676908-29677065)
chr2 (27-196)||(40163349-40163520)
chr2 (51-205)||(28531316-28531470)
chr2 (28-145)||(6421793-6421911)
chr2 (56-201)||(14745300-14745446)
chr2 (100-205)||(16542451-16542556)
chr2 (63-207)||(5367455-5367599)
chr2 (59-222)||(12529038-12529201)
chr2 (54-205)||(7598611-7598754)
chr2 (100-205)||(31468801-31468902)
chr2 (40-153)||(3673122-3673236)
chr2 (24-117)||(31899077-31899170)
chr2 (119-204)||(31899496-31899581)
chr2 (100-205)||(36178320-36178425)
chr2 (40-135)||(3672773-3672869)
chr2 (75-205)||(30313180-30313309)
chr2 (91-204)||(31259658-31259774)
chr2 (49-204)||(9231252-9231407)
chr2 (27-205)||(33561429-33561607)
chr2 (95-199)||(37895107-37895211)
chr2 (130-205)||(38796299-38796374)
chr2 (53-145)||(6421688-6421780)
chr2 (56-205)||(16590890-16591034)
chr2 (100-207)||(29874074-29874181)
chr2 (150-205)||(36785664-36785719)
chr2 (102-191)||(28254165-28254254)
chr2 (161-217)||(6421294-6421350)
chr2 (62-154)||(36784273-36784365)
chr2 (90-205)||(30323466-30323581)
chr2 (76-205)||(31385739-31385868)
chr2 (38-205)||(29873525-29873693)
chr2 (51-204)||(3594180-3594333)
chr2 (53-139)||(35580443-35580530)
chr2 (89-201)||(37894732-37894844)
chr2 (100-205)||(41678419-41678525)
chr2 (101-208)||(34481265-34481372)
chr2 (111-152)||(13091833-13091874)
chr2 (148-192)||(42515031-42515075)
[»] chr6 (45 HSPs)
chr6 (40-205)||(35210206-35210371)
chr6 (49-205)||(29518505-29518661)
chr6 (49-205)||(29518922-29519078)
chr6 (49-205)||(32741181-32741337)
chr6 (20-217)||(16454897-16455095)
chr6 (21-217)||(2578414-2578610)
chr6 (23-206)||(2843555-2843740)
chr6 (49-205)||(14748342-14748494)
chr6 (27-205)||(2579850-2580028)
chr6 (59-205)||(3409261-3409407)
chr6 (49-206)||(2377755-2377912)
chr6 (49-205)||(2378128-2378284)
chr6 (58-217)||(16107668-16107827)
chr6 (27-220)||(16454562-16454756)
chr6 (49-205)||(1846750-1846906)
chr6 (34-205)||(2578819-2578990)
chr6 (49-205)||(3058228-3058384)
chr6 (29-206)||(5832007-5832183)
chr6 (57-205)||(10074371-10074519)
chr6 (37-202)||(2579479-2579645)
chr6 (49-205)||(3409662-3409818)
chr6 (27-217)||(2579087-2579273)
chr6 (49-203)||(3415462-3415618)
chr6 (48-205)||(10073990-10074147)
chr6 (52-221)||(6999799-6999968)
chr6 (49-201)||(1127366-1127518)
chr6 (27-205)||(10073593-10073770)
chr6 (59-205)||(26544051-26544197)
chr6 (55-201)||(5958613-5958755)
chr6 (50-217)||(16108053-16108208)
chr6 (64-217)||(1950200-1950353)
chr6 (37-205)||(593694-593865)
chr6 (100-202)||(32460631-32460733)
chr6 (53-205)||(10911567-10911720)
chr6 (82-201)||(9062383-9062501)
chr6 (88-205)||(8481929-8482045)
chr6 (34-205)||(12071675-12071847)
chr6 (75-205)||(6071134-6071264)
chr6 (48-205)||(12092481-12092638)
chr6 (34-124)||(12085018-12085109)
chr6 (49-203)||(17135069-17135223)
chr6 (52-144)||(31714732-31714823)
chr6 (56-103)||(3409405-3409452)
chr6 (37-82)||(2975296-2975341)
chr6 (107-140)||(22605313-22605346)
[»] chr1 (62 HSPs)
chr1 (49-217)||(26661522-26661690)
chr1 (49-205)||(44290824-44290981)
chr1 (49-205)||(41156993-41157149)
chr1 (39-202)||(3537589-3537752)
chr1 (49-205)||(41142374-41142531)
chr1 (49-217)||(34649428-34649596)
chr1 (49-205)||(44290458-44290614)
chr1 (50-205)||(41157377-41157532)
chr1 (52-207)||(17294577-17294733)
chr1 (49-205)||(41759485-41759641)
chr1 (26-205)||(5319942-5320121)
chr1 (28-205)||(37850579-37850756)
chr1 (29-218)||(26661877-26662067)
chr1 (47-205)||(34364927-34365085)
chr1 (52-205)||(48588491-48588644)
chr1 (49-205)||(29798201-29798357)
chr1 (58-217)||(37556101-37556260)
chr1 (64-215)||(38804370-38804521)
chr1 (49-207)||(11977280-11977438)
chr1 (47-205)||(34364509-34364667)
chr1 (27-204)||(50052001-50052178)
chr1 (49-205)||(22077495-22077651)
chr1 (49-205)||(31767161-31767317)
chr1 (57-205)||(40082409-40082556)
chr1 (27-205)||(45084384-45084557)
chr1 (53-205)||(3550722-3550871)
chr1 (56-205)||(24600321-24600470)
chr1 (34-197)||(3875315-3875479)
chr1 (81-205)||(32594748-32594872)
chr1 (49-199)||(14318875-14319025)
chr1 (57-197)||(5528762-5528902)
chr1 (27-201)||(24131965-24132137)
chr1 (49-205)||(39066201-39066356)
chr1 (27-203)||(9955911-9956090)
chr1 (53-205)||(66476-66628)
chr1 (40-205)||(45493965-45494135)
chr1 (59-205)||(30630648-30630794)
chr1 (113-205)||(41184489-41184581)
chr1 (26-205)||(32168673-32168843)
chr1 (58-204)||(37555733-37555878)
chr1 (29-205)||(19283434-19283611)
chr1 (49-182)||(22077110-22077243)
chr1 (60-205)||(66100-66245)
chr1 (130-205)||(3537228-3537303)
chr1 (39-205)||(22077818-22077984)
chr1 (57-201)||(5575110-5575252)
chr1 (59-217)||(45839617-45839779)
chr1 (113-205)||(44685458-44685551)
chr1 (49-125)||(11977026-11977102)
chr1 (71-205)||(22793280-22793415)
chr1 (25-137)||(50051664-50051776)
chr1 (87-170)||(44043810-44043893)
chr1 (34-205)||(1188571-1188744)
chr1 (24-205)||(1187336-1187520)
chr1 (161-219)||(35154151-35154209)
chr1 (60-180)||(4956218-4956340)
chr1 (130-205)||(21378122-21378197)
chr1 (47-89)||(21378057-21378099)
chr1 (89-165)||(10351202-10351278)
chr1 (146-205)||(50469178-50469237)
chr1 (57-102)||(31767047-31767092)
chr1 (100-136)||(47380218-47380254)
[»] chr8 (75 HSPs)
chr8 (38-205)||(3670062-3670229)
chr8 (28-205)||(3669689-3669867)
chr8 (57-217)||(34834866-34835026)
chr8 (51-217)||(3038292-3038458)
chr8 (59-205)||(45122067-45122213)
chr8 (40-207)||(34835209-34835377)
chr8 (48-217)||(25561814-25561984)
chr8 (49-205)||(6876862-6877019)
chr8 (40-207)||(34835474-34835643)
chr8 (40-207)||(34835740-34835909)
chr8 (26-205)||(20870549-20870731)
chr8 (27-205)||(30441083-30441266)
chr8 (42-219)||(33113359-33113537)
chr8 (48-217)||(30359261-30359430)
chr8 (53-218)||(30359598-30359763)
chr8 (49-217)||(147441-147609)
chr8 (26-205)||(5915874-5916048)
chr8 (51-205)||(40518584-40518738)
chr8 (49-183)||(45122648-45122782)
chr8 (28-221)||(37544469-37544662)
chr8 (49-205)||(9309357-9309512)
chr8 (45-205)||(9608747-9608907)
chr8 (49-200)||(6651510-6651652)
chr8 (37-182)||(9483174-9483320)
chr8 (52-200)||(70277-70425)
chr8 (57-205)||(1014253-1014401)
chr8 (26-205)||(8918742-8918920)
chr8 (53-200)||(9482608-9482755)
chr8 (49-205)||(40518071-40518229)
chr8 (49-207)||(1513915-1514073)
chr8 (55-205)||(40579512-40579662)
chr8 (49-205)||(45121910-45122066)
chr8 (48-205)||(6731906-6732054)
chr8 (27-197)||(18371970-18372142)
chr8 (59-204)||(32640542-32640682)
chr8 (49-205)||(45123008-45123164)
chr8 (57-205)||(1013879-1014027)
chr8 (52-205)||(41972160-41972316)
chr8 (56-217)||(45121663-45121823)
chr8 (51-205)||(5420653-5420807)
chr8 (35-128)||(41129067-41129161)
chr8 (49-205)||(9308979-9309139)
chr8 (58-203)||(43398077-43398225)
chr8 (89-217)||(8794101-8794229)
chr8 (94-217)||(43274824-43274947)
chr8 (107-203)||(18372992-18373085)
chr8 (49-125)||(8919144-8919220)
chr8 (49-181)||(32305503-32305635)
chr8 (75-205)||(4154694-4154822)
chr8 (27-200)||(18371637-18371807)
chr8 (49-128)||(40579269-40579348)
chr8 (59-205)||(147831-147968)
chr8 (70-184)||(9609108-9609222)
chr8 (142-204)||(18372349-18372411)
chr8 (50-203)||(18380020-18380171)
chr8 (135-204)||(18372785-18372854)
chr8 (28-205)||(9620656-9620832)
chr8 (134-197)||(25561729-25561792)
chr8 (56-170)||(9507819-9507933)
chr8 (130-200)||(41416252-41416322)
chr8 (58-205)||(12283875-12284021)
chr8 (102-202)||(20130454-20130553)
chr8 (27-128)||(20995393-20995495)
chr8 (100-207)||(18372657-18372760)
chr8 (89-201)||(4154321-4154432)
chr8 (49-113)||(43274635-43274699)
chr8 (49-96)||(3037969-3038016)
chr8 (117-204)||(3037776-3037865)
chr8 (75-205)||(5274777-5274907)
chr8 (163-204)||(18372485-18372526)
chr8 (70-126)||(16524446-16524502)
chr8 (115-170)||(18373236-18373291)
chr8 (150-205)||(20995502-20995557)
chr8 (175-205)||(18645713-18645743)
chr8 (108-144)||(11442916-11442952)
[»] chr5 (64 HSPs)
chr5 (50-217)||(36492218-36492385)
chr5 (25-205)||(27502011-27502192)
chr5 (49-205)||(40296315-40296471)
chr5 (37-205)||(6500453-6500621)
chr5 (37-205)||(6500825-6500993)
chr5 (38-205)||(18603108-18603276)
chr5 (28-205)||(3294993-3295170)
chr5 (28-204)||(3295323-3295498)
chr5 (58-207)||(26074612-26074761)
chr5 (28-205)||(35150009-35150185)
chr5 (49-201)||(41170640-41170792)
chr5 (49-219)||(6224184-6224354)
chr5 (56-217)||(26075168-26075330)
chr5 (39-205)||(41632784-41632950)
chr5 (49-205)||(15370101-15370257)
chr5 (37-204)||(25327938-25328106)
chr5 (49-205)||(32487396-32487551)
chr5 (23-205)||(13415734-13415916)
chr5 (34-205)||(299491-299664)
chr5 (58-205)||(26074155-26074302)
chr5 (49-222)||(42405598-42405769)
chr5 (53-218)||(34753029-34753194)
chr5 (29-201)||(9498634-9498806)
chr5 (53-205)||(624198-624350)
chr5 (49-205)||(12662652-12662808)
chr5 (37-207)||(1028504-1028675)
chr5 (49-200)||(11416977-11417128)
chr5 (37-205)||(36568556-36568723)
chr5 (53-195)||(33747783-33747925)
chr5 (49-205)||(623820-623976)
chr5 (35-181)||(15370428-15370575)
chr5 (11-205)||(24489167-24489360)
chr5 (49-204)||(2411010-2411165)
chr5 (70-205)||(5723812-5723947)
chr5 (75-217)||(26074807-26074950)
chr5 (57-170)||(26590918-26591031)
chr5 (72-205)||(29549278-29549411)
chr5 (25-218)||(35914838-35915031)
chr5 (49-217)||(35167838-35168006)
chr5 (26-217)||(41635169-41635359)
chr5 (57-202)||(38427553-38427697)
chr5 (51-207)||(300959-301107)
chr5 (49-121)||(26900017-26900089)
chr5 (112-207)||(42508612-42508707)
chr5 (112-205)||(31509625-31509718)
chr5 (100-205)||(36521947-36522052)
chr5 (49-120)||(38427306-38427377)
chr5 (141-207)||(39309684-39309750)
chr5 (25-123)||(13785607-13785706)
chr5 (130-205)||(26074320-26074395)
chr5 (89-204)||(36522277-36522392)
chr5 (112-207)||(42524717-42524811)
chr5 (132-205)||(7768852-7768925)
chr5 (71-123)||(795254-795306)
chr5 (82-193)||(31509745-31509857)
chr5 (89-139)||(13042607-13042657)
chr5 (53-106)||(24489582-24489635)
chr5 (148-204)||(6225047-6225103)
chr5 (165-205)||(35150749-35150789)
chr5 (165-205)||(35151040-35151080)
chr5 (70-136)||(9498344-9498410)
chr5 (71-137)||(36527117-36527183)
chr5 (160-217)||(26900081-26900138)
chr5 (111-144)||(34103617-34103650)
[»] scaffold0702 (2 HSPs)
scaffold0702 (49-206)||(514-671)
scaffold0702 (49-205)||(147-298)
[»] scaffold0391 (3 HSPs)
scaffold0391 (53-218)||(1110-1275)
scaffold0391 (89-159)||(1731-1801)
scaffold0391 (156-202)||(3092-3138)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (49-205)||(47362-47518)
[»] scaffold0078 (2 HSPs)
scaffold0078 (56-205)||(4984-5133)
scaffold0078 (87-205)||(5359-5477)
[»] scaffold0734 (2 HSPs)
scaffold0734 (58-205)||(5398-5546)
scaffold0734 (58-205)||(5779-5931)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (112-205)||(17519-17612)
[»] scaffold0504 (1 HSPs)
scaffold0504 (130-206)||(10192-10268)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (75-205)||(39459-39588)


Alignment Details
Target: chr3 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 76)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 28 - 286
Target Start/End: Original strand, 3135432 - 3135699
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || | |||||||||||||||    
T  3135432 gttgggtcatgaggagagtcagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatctaaaaccttaaggcaa 3135531  T
Q  127 tgagtttatggg--ttctcttatttata-----aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    || |||||||||  | |||||| | |||     ||||||| ||| |||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  3135532 tgggtttatgggggtcctcttactaatataataaggtgttcaacttttactcttttatctgaggtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 3135631  T
Q  220 ttttcatataaatttaaaacacttt-gttttagcattcggttgcacatgtgaactgtgaagtattatc 286  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||    
T  3135632 ttttcatataaatttaaaacactttggttttagcattcagctgcacatgtgaagtgtgaagtattatc 3135699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Original strand, 43346793 - 43346959
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  43346793 ggaccgtccacatagaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttactta 43346892  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43346893 taaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 43346959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 37990953 - 37991145
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgagggg-agccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  37990953 tgttgggtcatgagggggagcctgagggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 37991052  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
     |||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37991053 gatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 37991145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15773035 - 15772856
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| |||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||| |||    
T  15773035 tgttgggtcatgaggggagtcaaaaggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaagca 15772936  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  15772935 atgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatatgggacatataactcacacttg 15772856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 37990639 - 37990807
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  37990639 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 37990738  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37990739 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 37990807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 35946680 - 35946522
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| | |||||||||| |||||| |    
T  35946680 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaattgcacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaacgggtttatgggtcctcttact 35946581  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35946580 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 35946522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22304727 - 22304571
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  22304727 ggggactgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 22304628  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  22304627 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgtgggacatatagctcacacttg 22304571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 29644902 - 29645058
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  29644902 ggggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 29645001  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  29645002 tataaggtgtttaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttg 29645058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 39 - 218
Target Start/End: Original strand, 42342377 - 42342557
Alignment:
Q  39 aggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||||  |||||||    
T  42342377 aggggagccagggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgg 42342476  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    || |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  42342477 gtcctcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatcggatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacat 42342557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15773376 - 15773194
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaag--agagacacgacactcctacccaaaaccttaag 122  Q
    ||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  |||||| |||||||||| |||||    
T  15773376 ttgttggatcatgaggggagttaggaggatcgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagcaagagacatcacactcttacccaaaactttaag 15773277  T
Q  123 gcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15773276 gcaatgagcttatgagtcctcttacttataagatgttcaacttttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 15773194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 29644581 - 29644737
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||| | || ||||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |    
T  29644581 ggggaccatccacatcgaagctaaaacaaccgcataagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggttctcttact 29644680  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29644681 tataaggtgttcaacctttactctttaatccgatgtgggacatataactcacacttg 29644737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32589885 - 32589706
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||    
T  32589885 ttgttggatcatgaagggagcgagggggaccgtccacatcgagcctagaacaaccacacaagcaagagagacatcgcactcttacccaaaaccttaaggc 32589786  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||    
T  32589785 aatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttattattttatcttatgtgggacatat-actcacacttg 32589706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 54017806 - 54017972
Alignment:
Q  40 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  ||||||| |    
T  54017806 ggggagccagggggaccgcccacatcgaagctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgag 54017905  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  54017906 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttg 54017972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 54018198 - 54018354
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| |    
T  54018198 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcatgagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcgttaggtttatgggtcctcttact 54018297  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||    
T  54018298 tataaggtgttcaatctttactcttttatccgatgcaggacatataactcacacttg 54018354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Original strand, 32462903 - 32463069
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||    
T  32462903 gaccgtacacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcttcttacttat 32463002  T
Q  152 aaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32463003 aaggtattcaaccttttactcttctatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32463069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 42342092 - 42342246
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||    
T  42342092 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttactta 42342191  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||||| | |||||||||    
T  42342192 taaggcattgaacatttactcttttatccgatgtggaacatatgaatcacacttg 42342246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 21832345 - 21832499
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| |    
T  21832345 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagagagacgc--cactcttacccaaaaccttaaggctatgagtttatgagtcctcttact 21832442  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  21832443 tataaggtgttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacacttg 21832499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 57 - 198
Target Start/End: Original strand, 39934963 - 39935104
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||| | |||||| |||||||||    
T  39934963 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaactttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataaggt 39935062  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 198  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  39935063 gttcaacctttactcttttatccgatgtaggacatataactc 39935104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 12114562 - 12114718
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| |||||||| || |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| |    
T  12114562 ggggaccgaccacatcgtggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttact 12114661  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  12114662 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggatatataacttacacttg 12114718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Original strand, 33803252 - 33803404
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  || ||||| | |||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||||| |    
T  33803252 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagagagggagacgccacactcttacccaataccttaatgcaatgggtttatgggtcctcttact 33803351  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  33803352 tatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 33803404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 52634833 - 52634666
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  52634833 ggggacagtctacatcaaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt-ctcttact 52634735  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  52634734 tataaggcgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 52634666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 47 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45901874 - 45901703
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  | ||| ||||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||| || ||||||    
T  45901874 caggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccctataagtaagagagacaccacactcttaccaaaaactttaaggccatgagtttatgcgtcctctta 45901775  T
Q  147 tttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
     |||||||||||| |||| |||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45901774 cttataaggtgttcaacctttttttcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 45901703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 25739425 - 25739581
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||| ||||||||   |||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||| |    
T  25739425 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacaagctagagagacgtcacactcttacccaaaacctaaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 25739524  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| | |||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25739525 tatatgatgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 25739581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 25755552 - 25755384
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  |||||| ||| ||| | |||||  |||||| || |||||| |    
T  25755552 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacacttttacccacaactttaggacaatggatttatgagtcctcttact 25755453  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25755452 tataaggtattcaacctttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 25755384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 53577522 - 53577366
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||  |||||||| | | ||||||    
T  53577522 ggggaccatccacaccgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaagaccttaaggcaatatgtttatggatccacttatt 53577423  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  53577422 tttaagatgttcaacctttactgttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 53577366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 185
Target Start/End: Original strand, 41359765 - 41359901
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41359765 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcgagagagacgccacattcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41359864  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 185  Q
    |||||||| || |||||||||| || |||||||||||    
T  41359865 tataaggtattcaacctttactattgtatccgatgtg 41359901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 57 - 218
Target Start/End: Original strand, 22303963 - 22304117
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| |||||||      
T  22303963 tccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccgcttacttataag-- 22304060  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
         ||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  22304061 -----acctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 22304117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 31190168 - 31190006
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||| |||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||        ||||||| |||| |     
T  31190168 aggggagcgtccaaatcgaggctagaacaacccgacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggc--------tatgggtcctctaac 31190077  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  |||||||||    
T  31190076 ttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatatcactcacacttgcacacaacaacat 31190006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 32462535 - 32462727
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    ||||||||||||||||||||   |||| ||||| ||||||||| || ||||| | ||||| |||||||||| | |||||| || |||||||||||| |||    
T  32462535 ttgttggatcatgaggggagtttgggggccgtctacatcgaggctaaaacaatcccacaaacaagagagaccccacactcttatccaaaaccttaaagca 32462634  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||  |||||||| |  ||||| |||||||||||| |||| |||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  32462635 ataggtttatggatcatcttacttataaggtgttcaaccttttactctttcattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 32462727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 4823792 - 4823657
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    ||||||| || || |||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| ||| |||||    
T  4823792 tagaacatccgcataagcaaaaaagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcctacttataaggtgtttaacttttac 4823693  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4823692 tattttatccgatgtgagacttataactcacacttg 4823657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39389219 - 39389072
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    ||||||| ||| ||||||||   |||| |||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||| || |||||||    
T  39389219 ccacatcaaggctagaacaattgcacaggcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctcttagttttaaggtg 39389120  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39389119 ttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 39389072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 75 - 200
Target Start/End: Original strand, 3135099 - 3135224
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| || ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| |||||| |||    
T  3135099 caaccgcacaagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttatggcagtgggtttatgggttcttttacttataaggtgttcaacatttactattt 3135198  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  3135199 tatccgatgtgggacatataactcac 3135224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8328068 - 8327906
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaac----cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct 142  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||    | |||  |  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||    
T  8328068 caggggagcgtccacatcgaggctagaacaactgcactcacttgtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattacgtttatgggttct 8327969  T
Q  143 cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| ||||||| | || | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  8327968 cttacttataagatattcatcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 8327906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 33175646 - 33175822
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac---acgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 132  Q
    |||||||||| | |||||| | ||||| ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||   || |||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  33175646 tgaggggagctcgggggactgcccacaccgaggctagaacaatcacacaagtgagagagacgtcac-acactcttacccaaaaccttaaggctatgagtt 33175744  T
Q  133 tat---gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||   ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33175745 tattatgggttctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgagacatataactcacacttgta 33175822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39914399 - 39914254
Alignment:
Q  60 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 159  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||  |||||||||| |||||| || ||||||  |||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39914399 acatcgaggctagaacaaccgcataagtgagagagacaccacactcttatccaaaatattaaggcattaggtttatgggtcctcttatttataaggtgtt 39914300  T
Q  160 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39914299 caacctctactgttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 39914254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Original strand, 45395656 - 45395809
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    |||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||    
T  45395656 gaccctccacatcgaggctagagcaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgggtttatggatcctcttacttat 45395755  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || ||||| ||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||    
T  45395756 aacgtgtttaacctttactcttttattcgatgtgggatatataacttacacttg 45395809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 53117964 - 53118130
Alignment:
Q  38 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||||||  ||||||||| |||||||| | ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||     
T  53117964 gaggggagctgggggaccgttcacatcgatgctagaacaaccacacttgtgagagagacactacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggttt-tga 53118062  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     | |||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  53118063 atcctctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttg 53118130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Original strand, 49336694 - 49336855
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa-gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||| |||| |||||||||| |||||  || ||||||||| |||||| |||||| ||| ||||| | ||| |||||||||| |||||| ||||||||    
T  49336694 tccacattgaggatagaacaaccgcacaaaaaaagagagacaccacactcttacccagaactttaagactatgggtttatgggtcctcttacttataagg 49336793  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    || | |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||    
T  49336794 tggtcaacctttacttttctatccgatgtgagacatgtaactcacacttgtacacaacaaca 49336855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 50612447 - 50612608
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt-----tatgggttctc 143  Q
    ||||||||||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||  |||  |||     |||| || |||    
T  50612447 ggggaccgtccacgtcgaggatggaacaaccactcaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaagataatatgttagatttatgagtcctc 50612546  T
Q  144 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  50612547 ttacttataaggtgttcaatctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 50612608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 51886724 - 51886563
Alignment:
Q  38 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||||||||| |||||  |||| |||||||  |||||| || |||||||      |||||||||||||||    
T  51886724 gaggggagtcagggtaccgttcacatcgagattagaacaatcacacttgcaaaagagacatcacactcttatccaaaac------gcaatgagtttatgg 51886631  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||| ||||| | |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  51886630 gtcctcttacttatatgatgttcaacctttactattttattcgatgtgagacatataactcacacttg 51886563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 1634302 - 1634471
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| | | |  ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  1634302 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccatata-gtgagagagataccgcactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttat 1634400  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacc-tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||| |||| | || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1634401 gggtcctcttacttataatgtgtttaaccttttatttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 1634471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 44160547 - 44160700
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | ||  || ||||||||| | ||| || |||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||    
T  44160547 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgca--agtaagagagacgccacattcttacc-aaaaccttaagacaatgggtttatggatcctcttatt 44160643  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||| | |||||||| || ||| |||||||||| |||||||    
T  44160644 tataaggtgttcaacctttattgttttatccaatatgaaacatataactgacacttg 44160700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11662108 - 11661954
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||  | |||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||| |  |||| | |    
T  11662108 gggactgttcacatcgaggctagaacaaccacacaatga-gagagacacctcactcttacccaaaaaccttaaggcaattggtttatgaggcctctcact 11662010  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||    
T  11662009 tttaaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtggggcatttaactcacactt 11661954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 52 - 146
Target Start/End: Original strand, 22303662 - 22303756
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||| | |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  22303662 gaccgtctacatcgaggctagaacaatcgcacaagtaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 22303756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 65 - 204
Target Start/End: Original strand, 33362305 - 33362451
Alignment:
Q  65 gaggttagaacaaccacacaag----caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 160  Q
    ||||||||||||| ||||||||    ||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||| ||     
T  33362305 gaggttagaacaatcacacaagcaagcaagagagagacgccacacttacccaaaatcttaaggaaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattc 33362404  T
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgaga---catataactcacactt 204  Q
    |||||||| | ||||||||||  |||||   ||||||||||||||||    
T  33362405 aacctttattattttatccgacatgagatatcatataactcacactt 33362451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37726654 - 37726506
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||| |||| | ||   |||||| || ||||||||| |||||||||        | | |||||| |    
T  37726654 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactatacaagtaagataaacgtcacactcttatccaaaacctaaaggcaatg--------gatcctcttact 37726563  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37726562 tataaggtattcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 37726506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 39336208 - 39336385
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||||||| |||||||| |||  ||| ||||||||| ||| |||||| ||  |||||  || |||||||||||| ||    
T  39336208 tgttggatcacgaggggagccaagggggaccatccacatccaggc-agagcaaccacacgagcgagagaggca--acactattatccaaaaccttaaagc 39336304  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| | |||| | |||||| ||||| |||||  |   || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39336305 aatgagtttatggatcctctcacttataaagtgttcaacctccaactttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 39336385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Original strand, 41359491 - 41359565
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||    
T  41359491 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacgccacactcttacccaaaaccttaagg 41359565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 91 - 197
Target Start/End: Original strand, 42584864 - 42584970
Alignment:
Q  91 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagaca 190  Q
    |||||||| |||||| | | ||||| |||||| ||||  |||||||| | |||||| |||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||    
T  42584864 agagacaccacactctttctcaaaatcttaagacaattggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaatctttactcttctatccgatgtgggaca 42584963  T
Q  191 tataact 197  Q
    |||||||    
T  42584964 tataact 42584970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 3384317 - 3384422
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| |||||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||  |||||| ||||| ||||| |||| |||||||  ||||| |||||||||||||    
T  3384317 acactcttacccaaaactttaaggcattaagtttatgggtcctcttccttataaagtgtttaacctatactgttttatcatatgtgggacatataactca 3384416  T
Q  200 cacttg 205  Q
    | ||||    
T  3384417 cgcttg 3384422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9240300 - 9240151
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| |   |||||||||| ||| || || || ||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||| ||||||||    
T  9240300 gtccacatcgaggctagaataaccgcactattgagagagacaccacattcttatccgaaatcttaaggtaatggatttatgggtcctcttacttataagg 9240201  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| | | ||||||  | |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  9240200 tgttcagcttttacttctctatccgatgtggaacatataactcacacttg 9240151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 52635047 - 52634990
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  52635047 acactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctcttatttataaggtg 52634990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Original strand, 54017548 - 54017636
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||||| |||||||||||  | ||||| |||| ||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54017548 ggggaccgaccacatcgaggccaaaacaatcacataagtaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgg 54017636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11661601 - 11661535
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||||| ||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11661601 ctcttacttataagatgtttaaccgttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 11661535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 79 - 165
Target Start/End: Original strand, 39336000 - 39336086
Alignment:
Q  79 cacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 165  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||  | | |||||||| ||||| |||||    
T  39336000 cacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgattttatgagtcttatcatttataaagtgttcaacct 39336086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Original strand, 47964544 - 47964674
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| | |||||  | ||| |||||  ||  ||     
T  47964544 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctctcacttatatagcgttcaacctccacatttc 47964643  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  47964644 tatccgatgcgggacatacaactcacacttg 47964674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 7767380 - 7767469
Alignment:
Q  115 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||| ||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  7767380 accttaagacaatgggtttatgagtcctcttagttataaagtgtccaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcagactt 7767469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22304301 - 22304248
Alignment:
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22304301 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 22304248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 22304351 - 22304302
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacac 98  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22304351 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacac 22304302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 141
Target Start/End: Original strand, 16871005 - 16871051
Alignment:
Q  95 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16871005 acacgacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 16871051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43346706 - 43346652
Alignment:
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  43346706 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatacaactcacacttg 43346652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 8328427 - 8328374
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 103  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  8328427 gggaccgtccacatcgaggctaaaacaaccccacaagcaagagagacaccacac 8328374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Original strand, 43978865 - 43978947
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc----tacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||| | ||||||     |||||||||||||||||||||    
T  43978865 ggggacagtccacatcgaggttagaacaaacacacaagtgagagagacgccacactctagcttacccaaaaccttaaggcaat 43978947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 46546376 - 46546480
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||  ||  ||  |||| ||||  |||||||||||||    
T  46546376 acactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggattctctaacttataaagtgttcaacctccacatttcaatccaatgtaggacatataactca 46546475  T
Q  200 cactt 204  Q
    |||||    
T  46546476 cactt 46546480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 47964915 - 47965071
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||| |||||||||| |||  ||||||| || | |||  |||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| | ||||| |  |||| | |    
T  47964915 ggggaacgtccacatctaggccagaacaatcatataagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggcttatgagccctctcact 47965014  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||   |||| |||||  ||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  47965015 tatataatgtttaacctccacttttctatccgatgtaaaacatataactcacacttg 47965071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 75 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 25317290 - 25317221
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 144  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  25317290 caaccacacaagtgagagacacactacacttttacccaaaaccttaaggcaacaagtttatgggtcctct 25317221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Original strand, 17735043 - 17735083
Alignment:
Q  101 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17735043 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 17735083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 141
Target Start/End: Original strand, 19036312 - 19036352
Alignment:
Q  101 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19036312 cactcttacccaaaaccttaagtcaatgagtttatgggttc 19036352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 40
Target Start/End: Original strand, 3134993 - 3135032
Alignment:
Q  1 ttaaaaactagaaaggtacaatattttgttggatcatgag 40  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  3134993 ttaaaaattagaaaggtacaatattttgttgggtcatgag 3135032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 27 - 80
Target Start/End: Complemental strand, 9239994 - 9239940
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaacca 80  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| ||||| |||||    
T  9239994 tgttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggctagaaaaacca 9239940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 141
Target Start/End: Original strand, 17731950 - 17731996
Alignment:
Q  95 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17731950 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 17731996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 95 - 141
Target Start/End: Original strand, 19033181 - 19033227
Alignment:
Q  95 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    |||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19033181 acaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgggtttatgggttc 19033227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53596078 - 53596028
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596078 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 53596393 - 53596343
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  53596393 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaacgggtttatgggt 53596343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 108 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25991502 - 25991405
Alignment:
Q  108 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||| |  |||||| |||||||| | ||||||  |||| ||| || |||  |||||  |||||| ||||||| |||||||||||    
T  25991502 acccaaaaccttaaggcattaggtttataggttctctcacttataaaatgtttaacattaacttgtttatttgatgtgggacatattactcacacttg 25991405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 95 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 16143550 - 16143506
Alignment:
Q  95 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  16143550 acactacactcttacccaaaactttaaggcaatgagcttatgggt 16143506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 62)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 1085593 - 1085772
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||    
T  1085593 tgttgggtcatgaggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggca 1085692  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1085693 atgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 1085772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 45433411 - 45433227
Alignment:
Q  38 gaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  45433411 gaggggagccagggggaccgaccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaataggtttatg 45433312  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 221  Q
     ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  45433311 agttctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggatcatataactcacacttgtacacaacaacatatt 45433227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7517751 - 7517568
Alignment:
Q  37 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7517751 tgaggggagccaaggggaccacccacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagacagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 7517652  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  7517651 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacata 7517568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 37533011 - 37533166
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  37533011 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaagcgcacaagcaagagagacaccacactt-tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 37533109  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  37533110 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 37533166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30244428 - 30244260
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  30244428 ggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 30244329  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30244328 tataaggtcttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 30244260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 40094774 - 40094930
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |    
T  40094774 ggggaccgaccacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagacgatgggtttatgggtcctcttact 40094873  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40094874 tataaggtgttgaacctttactcttttattcgatgtgagacatataactcacacttg 40094930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 37 - 219
Target Start/End: Original strand, 22567026 - 22567208
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | ||||||| ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  22567026 tgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcccgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgagtttat 22567125  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |  ||||||||||    
T  22567126 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtg-gacatattactcacacttgcatacaacaacata 22567208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 47129275 - 47129096
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||||||||| || |    
T  47129275 tgttggatcatgaggggagctcggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacacttgtgagagagacaccacactcctacccaaaaccttaaagcga 47129176  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    || |||||||||| |||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47129175 tgggtttatgggtcctcttacttataagaggttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 47129096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30245254 - 30245067
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30245254 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30245159  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30245158 atgagtttatgggtcgtcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 30245067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6054718 - 6054561
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  6054718 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccatacaagtaggagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttact 6054619  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6054618 tataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtgagacatataactaacacttgt 6054561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 34218010 - 34218202
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    ||||||||| ||| |||||||  || |||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |    
T  34218010 ttgttggattatggggggagctcggaggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccatacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagac 34218109  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||| ||||||| || |||| | |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||    
T  34218110 aatgggtttatgagtcctctcacttataaggtgttcaacatttacttttttatccgatgtgagacatataactcacatttgtacacaacaaca 34218202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 37533341 - 37533519
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  37533341 tgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 37533440  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||  ||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||   |||||||||||||||||    
T  37533441 atggatttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcaatgtagaacatataactcacactt 37533519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 23377 - 23546
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |    
T  23377 ggggaccgtccaaatcgaggctagaacaaccgcacatgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggtcctcttact 23476  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||| ||| |  |||||||||    
T  23477 tataaggtgttcaacctttactattgtatccgatgtggaacatataactcacaattgcacacaacaacat 23546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45434794 - 45434626
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||  |||||||||| |||||||||  |||||| ||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |    
T  45434794 ggggaccgatcacatcgaggctagaacaactccacaagtaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcagtaagtttatgggtcctcttact 45434695  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  45434694 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 45434626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11845349 - 11845198
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  11845349 ggggaccgtctacatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttact 11845250  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11845249 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11845198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 30032725 - 30032555
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |    
T  30032725 ggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccgcacaagcaagagagatgtcacactcttacccaaaaccttaaggctataggtttatggatactcttact 30032626  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  30032625 tataaggtgttcaacacttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacatgtacgcaacaacata 30032555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36623140 - 36622962
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  36623140 gttgggtcatgaggggagctcaagggaccgtccacatcaaggtcagaacaatcacacaagtaagagaggcaccatactcctacccaaaaccttaaggcaa 36623041  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||  ||||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36623040 tggatttatggatcctcctacttataaaatgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36622962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 60 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45754862 - 45754706
Alignment:
Q  60 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 159  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||| ||  ||||| ||||||||||||    
T  45754862 acatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgagtcatcttacttataaggtgtt 45754763  T
Q  160 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
     ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  45754762 caacatttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttgtacacaacaaca 45754706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29157720 - 29157567
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||| ||  |||| |||| |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| ||||    
T  29157720 gaccgtccacatcaagactagagcaactacacgagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcgtcttacttat 29157621  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  29157620 aaggtgttcaacctttactattttatccggtgtgggacatataactcacacttg 29157567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 19122879 - 19122740
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||    
T  19122879 cacatcgagactagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgagtcctcttacttataaggtgt 19122780  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19122779 tcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactca 19122740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 24177593 - 24177437
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||| |||||| ||  |||||| |||||||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||| | |||| |    
T  24177593 ggggaccgtccacgtcgaggctaagacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttaccaaaaactttaaggcaatgggtttatgggtccgcttact 24177494  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  24177493 tataaggtgttcagcctttactcttttatccgatgtgggacatataactcatacttg 24177437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 78 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7554154 - 7554027
Alignment:
Q  78 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 177  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  7554154 ccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttat 7554055  T
Q  178 ccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||    
T  7554054 ccgatgtgggacatataactcacacttg 7554027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 52 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 20599471 - 20599304
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||| |||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||  || |||||||||    
T  20599471 gaccgttcacatcaaggttaaaacaaccatacaagcaagagagacaccacactctcttacccaaaacgttaaggcaatgagtttatatgtcctcttattt 20599372  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||| ||||| | |||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  20599371 ataaagtgtttatcctttacttttttatccgatatgggacatataactcacacttatagacaacaaca 20599304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 36939741 - 36939889
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||| || |||||||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||||||    
T  36939741 tccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagaaacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcctcttacttataaggt 36939840  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| ||| |||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  36939841 gttcaacttttactattttatacgatttgggacatataactcacacttg 36939889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9901799 - 9901648
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||    
T  9901799 ggacagtccacaccgaggctagaacaaccgcactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatggatcctc-tacgta 9901701  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9901700 taagatgttcaacctttactgttttatccgatgtg-gacatataactcacactt 9901648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 22566713 - 22566818
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22566713 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatattactca 22566812  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  22566813 cacttg 22566818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 118290 - 118457
Alignment:
Q  40 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||||| |||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||| | |||  |||||| |||||||||||||| || |||| ||||||||    
T  118290 ggggagcctggggaccgtccacatcaaagctagaacaaccacacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttacggtaatgggtttatgg 118389  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     | |||||| |||| ||||||| |||||||||| || |||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  118390 atcctcttacttattaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataacttacacttg 118457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16569316 - 16569198
Alignment:
Q  87 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 186  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16569316 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16569217  T
Q  187 gacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16569216 gacatataactcacacttg 16569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Original strand, 16596346 - 16596464
Alignment:
Q  87 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 186  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||||    
T  16596346 caagagagacaccgcactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactgttctatccgatgtga 16596445  T
Q  187 gacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16596446 gacatataactcacacttg 16596464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 72 - 217
Target Start/End: Original strand, 24838724 - 24838870
Alignment:
Q  72 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttct-cttatttataaggtgttaaacctttact 170  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||| ||| | |||||||| | || |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  24838724 gaacaaccacacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaagacaacgggtttatggatccttcttacttataaggtgttcaacctttact 24838823  T
Q  171 cttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||  ||||||||    
T  24838824 cttttattcgatgtgagacatataacttacacttatacacaacaaca 24838870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 14681663 - 14681512
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||||||||||  |   ||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| |||     
T  14681663 gaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacttg--tgagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggccctcttacttac 14681566  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||    
T  14681565 aaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataacttacacttg 14681512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 8128441 - 8128597
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| || |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||| || ||||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||      
T  8128441 ggggactgttcacatcgatgctagaacaaccacataagcgagagtgacaccacactcttaaccaaaaccttaaggttatgggtttatgggtcctcttaca 8128540  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||| | || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  8128541 tataaggtgttcaacctttatttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 8128597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 30253667 - 30253534
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    |||| ||| ||||||||| | ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  30253667 ttgggtcacgaggggagctcgggggaccatccacatcgaggcttgaacaaccacacaag----agagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 30253572  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 165  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||    
T  30253571 gagtttatgggttctcttacttataaggtcttcaacct 30253534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 40230295 - 40230447
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||| ||||  ||||||||||||| | |||  |||||||||||||||| | ||| |||||||||| |||||| |||||    
T  40230295 accgtccacatagaggttagaataactacacttgcaagagagacaccagacttttacccaaaaccttaagactatgggtttatgggtcctcttacttata 40230394  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||| ||| |||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  40230395 agatgttcaacttttacttttttattcgatgtgggacatataacttacacttg 40230447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 47129549 - 47129450
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  47129549 tgttgggtcatgaggggagctcggggaccgtccacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 47129450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 81 - 205
Target Start/End: Original strand, 1085280 - 1085405
Alignment:
Q  81 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 180  Q
    |||||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||| |||||| |||||||||    
T  1085280 cacaaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttacttatgagttgttcaacttttactattttatccg 1085379  T
Q  181 atgtgagacat-ataactcacacttg 205  Q
    || || ||||| | ||||||||||||    
T  1085380 atatgggacataaaaactcacacttg 1085405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 55 - 204
Target Start/End: Original strand, 41910592 - 41910749
Alignment:
Q  55 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc--------ttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||| |||| |||||| |||| |||| |        ||||| ||||| |||||||||| |||| |    
T  41910592 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacttgtgagagaaacaccacactcttaccaaaaatccaaaaatcttaagccaatgggtttatgggtcctctca 41910691  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
     ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41910692 gttataaggtattcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacactt 41910749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 39 - 159
Target Start/End: Original strand, 28300242 - 28300364
Alignment:
Q  39 aggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat-g 136  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  28300242 aggggagtcaggaggaccgtccacatcgaggcccgaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttatgg 28300341  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgtt 159  Q
    |||||||||| ||||||||||||    
T  28300342 ggttctcttacttataaggtgtt 28300364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41854792 - 41854637
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |   ||||| |||  ||||  |    
T  41854792 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattatatttataggtcatcttgct 41854693  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||| |||||    
T  41854692 tataaggtgttcaacctttactctttta-ctgatgtgggacatataactcatacttg 41854637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 37167937 - 37167842
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||| | ||||||    
T  37167937 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagtcaatggatttatggatcctctta 37167842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 119 - 205
Target Start/End: Original strand, 28301613 - 28301699
Alignment:
Q  119 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| | | |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28301613 taaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcagcttttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 28301699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30244767 - 30244703
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  30244767 ctcttatttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 30244703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Original strand, 36109009 - 36109073
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  36109009 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagaaatataactcacacttg 36109073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 86 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 43241616 - 43241497
Alignment:
Q  86 gcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 185  Q
    ||||||||||||  | |||  |||| ||||||||||| |||| |||||||| || || ||| |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  43241616 gcaagagagacatcatacttttacctaaaaccttaagtcaataagtttatgagtccttttacttataaggtgttcaacctttatttttttatccgatgtg 43241517  T
Q  186 agacatataactcacacttg 205  Q
      ||||||||||||||||||    
T  43241516 gaacatataactcacacttg 43241497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30245560 - 30245496
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30245560 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 30245496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 141 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30255405 - 30255341
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  30255405 ctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataacgcacacttg 30255341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 36534795 - 36534940
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||  |   ||||||| | |||||| |||||||||||||||| |  |  |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  36534795 ccacatcgaggctggaacaaccacacttgt--gagagacgccacactcttacccaaaaccttaagactttaggtttatgggtcctcttacttataaggtg 36534892  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || ||||| |||| |||||||||| ||| ||||||||| | |||||||    
T  36534893 ttcaacctctactgttttatccgaggtgggacatataagttacacttg 36534940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 119
Target Start/End: Original strand, 37532729 - 37532821
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt 119  Q
    ||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  37532729 gttggatcacgaggggagcgcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaacagcacaagctagagagacaccacactcttacccaaaacctt 37532821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 124
Target Start/End: Original strand, 28300569 - 28300644
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta-cccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  28300569 gggatcgtccacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggc 28300644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 144 - 219
Target Start/End: Original strand, 36967325 - 36967399
Alignment:
Q  144 ttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    ||||||||||| |||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  36967325 ttatttataag-tgtttaatctttacttttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacata 36967399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30244534 - 30244454
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30244534 ttgttgggtcatgaggggagcctgagggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30244454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30253752 - 30253672
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 105  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30253752 ttgttgggtcatgaggggagcctgggggacagtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30253672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Original strand, 44361517 - 44361616
Alignment:
Q  102 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  44361517 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 44361615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Original strand, 21416181 - 21416231
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  21416181 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 21416231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 60 - 141
Target Start/End: Original strand, 40094424 - 40094505
Alignment:
Q  60 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    |||||| || ||||||||||||| ||| |||| ||||   |||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||    
T  40094424 acatcggggctagaacaaccacataagtaagaaagacgtcacactcttacccaaaactttaaagtaatgagtttatgggttc 40094505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Original strand, 4124128 - 4124204
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 165  Q
    |||||||||| |||||  || |||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| | |||||| |||| ||||||    
T  4124128 agagagacaccacacttttatccaaaaccttaatgcaatgagtttattggtcctctcacttataaagtgtcaaacct 4124204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 90 - 138
Target Start/End: Original strand, 23569043 - 23569091
Alignment:
Q  90 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23569043 gagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 23569091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 30245313 - 30245257
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactc 105  Q
    ||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||  |||||||||| ||||||    
T  30245313 ggggaccgtccacattgaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactc 30245257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 137
Target Start/End: Complemental strand, 37393216 - 37393128
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||    |||||| | |||||  ||| |||||||| |||||| |||||||||||    
T  37393216 ggggatcgtccacatcgaggttagagcaaccacataagtggaagagacgccacacttttactcaaaacctcaaggcattgagtttatgg 37393128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Original strand, 40094506 - 40094550
Alignment:
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  40094506 aacctttactcttttatctgatgttggacatataactcacacttg 40094550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7517828 - 7517767
Alignment:
Q  37 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 97  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  7517828 tgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7517767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 7518094 - 7518033
Alignment:
Q  37 tgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 97  Q
    |||||||||||| |||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||    
T  7518094 tgaggggagccaaggggaccacccatatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagaca 7518033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 119; Significance: 8e-61; HSPs: 84)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 8e-61
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 25483504 - 25483338
Alignment:
Q  40 ggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25483504 ggggagccagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgga 25483405  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25483404 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 25483338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 5e-59
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 36629394 - 36629239
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||    
T  36629394 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttactt 36629295  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36629294 ataaggtgtttaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36629239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44620531 - 44620362
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||    
T  44620531 tgttggatcatgagaggagc--ggggaccgtccacatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagaaacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaa 44620434  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 198  Q
    || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  44620433 tgggtttatgggctctcttatttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataactc 44620362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 34 - 207
Target Start/End: Original strand, 39792842 - 39793016
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 132  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  39792842 tcatgaggggagctcagaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtt 39792941  T
Q  133 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    || || | |||||  |||||||||||| ||| |||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  39792942 tacggttcctctttcttataaggtgttcaacatttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttgta 39793016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 50002584 - 50002415
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||||| |||||| |    
T  50002584 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatgggtcctcttact 50002485  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  50002484 taaaaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgcaaacaacaacat 50002415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41370515 - 41370359
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41370515 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacactacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41370416  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| || ||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41370415 tataaggttttcaacatttactattttatccgatttgggacatataactcacacttg 41370359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 201
Target Start/End: Original strand, 1731646 - 1731797
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||    
T  1731646 gggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctcttattt 1731745  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  1731746 ataagatgttcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataactcaca 1731797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 34646648 - 34646815
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||  | |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||    
T  34646648 gggaccgtccacaacaaggctagaacaaccacacagaccagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcctcttagtt 34646747  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34646748 ataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34646815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39404189 - 39404018
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| || ||||||||||    
T  39404189 tgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaatgctatgagtttat 39404090  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    | || |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||    
T  39404089 gagtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttattcaatgtaggacatataactcacacttgta 39404018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 39404555 - 39404388
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||    
T  39404555 gggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacattcttgcccaaaaccttaaggctataggtttatgggtcctcttactt 39404456  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  39404455 ataaggtgttccacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 39404388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 50630740 - 50630909
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| ||| |||||| ||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50630740 tgaggggagctaggcggaccgcccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat 50630839  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  50630840 gggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacgcttg 50630909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3340967 - 3340809
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||    
T  3340967 caggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctctta 3340868  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||||||||| | |||||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  3340867 cttataaggtgctcaacctttactctttcatctgatgcgggacatataactcacacttg 3340809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 10246077 - 10245904
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||  || |||||| ||| |||||| |    
T  10246077 ggggagcgtccacatcgaggctagaacaaccagacaagcaagggagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctttgggtttat-ggtcctcttact 10245979  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatttt 223  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |  ||||||||| ||||    
T  10245978 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggggcatataactcacacttgcacacaacaacatctttt 10245904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 54017583 - 54017749
Alignment:
Q  40 ggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54017583 ggggagctagggagaccgtccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagagacatcacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatggg 54017682  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| || ||| |||||||||||||||||||    
T  54017683 tcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgacgtgggacatataactcacacttg 54017749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 32941128 - 32941277
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||    
T  32941128 gtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagccctcttatttataagg 32941227  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32941228 tgttcaacctttactgttctttccgatgtaagacatataactcacacttg 32941277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 27 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 44621180 - 44621011
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||| |||    
T  44621180 tgttggatcatgagaggagc--ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaagacaa 44621083  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactc 198  Q
    |||||||||| |  |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| | |||| |||||    
T  44621082 tgagtttatgtgccctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggtcatacaactc 44621011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 55933122 - 55933278
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  55933122 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaactgtacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 55933221  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  55933222 tataaggtgttcaacccttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 55933278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44620838 - 44620662
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||    
T  44620838 ttggatcatgaggggagcttgggggaccgtccacatcgaggatataacaaccgcacaagcaagagagaaaccacactcttacccaaaaccttaaggttat 44620739  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44620738 g-gtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctctactatttcatccgatgtgggacatataactcacacttg 44620662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 36572177 - 36572009
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| |||||||||| | ||||  |||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||| |    
T  36572177 ggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcgagagagacaccatactctaacccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtcttcttact 36572078  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36572077 tataaggtgttcaacatttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36572009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 36608659 - 36608815
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||  ||||||| | |||||| |    
T  36608659 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatggatttatggatcctcttact 36608758  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  36608759 tatgaggtgttcaacttttactcttttatccgatgttggacatataactcacacttg 36608815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 22027936 - 22028115
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| |||||||||||||| | ||||| ||||||||||||  || |||||||||| |||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22027936 tgttgggtcatgaggggagcctgagggactgtccacatcgagactaaaacaaccacataagcgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 22028035  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22028036 atatgtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttcgtattttatccgatgtgggacatataagtcacacttg 22028115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 20825994 - 20825836
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||||| || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||| |   |||||||||| ||||||||    
T  20825994 ggggactgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaaggtttatgggtgctcttatt 20825895  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  20825894 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacatttgta 20825836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 50459878 - 50459724
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| || |||||| ||    
T  50459878 gggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacgctcttacctaaaaccttaagataatgggtttatgagtcctcttactt 50459779  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    
T  50459778 ataagatgttcaacctttactcttttaaccgatgtggaacatataactcacactt 50459724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 16889535 - 16889690
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||| |  |||||||  | |||||| ||    
T  16889535 gggaccgtccacatcgaggttagaacaatcacacaaggaagagagacaccatactcttacccaaaactttaaggcagtaggtttatgaatcctcttactt 16889634  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| || |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16889635 ataaggtattcaacctttacttttctatccgatttgagacatataactcacacttg 16889690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 184
Target Start/End: Original strand, 18932747 - 18932882
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||| |||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  18932747 ggggaccgtacacatcgaggctataacaaccactcaagtaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttatt 18932846  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgt 184  Q
    |||||||| || |||||||||| |||||||||||||    
T  18932847 tataaggtattcaacctttactattttatccgatgt 18932882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52884844 - 52884697
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| | |  ||||| ||||||||||    
T  52884844 cacatcgaggctagatcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatcgatcatcttacttataaggtg 52884745  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884744 ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 197
Target Start/End: Original strand, 54343006 - 54343147
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||       |||| |||||| |    
T  54343006 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatg-------gggtcctcttact 54343098  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 197  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  54343099 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataact 54343147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 16888813 - 16888970
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    ||||||||||| |||||||   |||||||| | ||||| |||||||||||  |||||| ||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||     
T  16888813 aggggaccgtctacatcgaaactagaacaatcgcacaaacaagagagacatcacactcttacccaaaaccgtaagacaatgagtttataggttctcttac 16888912  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| || |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16888913 ttataaggtattcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 16888970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 218
Target Start/End: Original strand, 22183262 - 22183431
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |    
T  22183262 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttact 22183361  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    |||||  |||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |  |||||||||    
T  22183362 tataaattgttcaacatttactcttttatccgatgtgggatatataactcacacttgcacacaacaacat 22183431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 59 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 54109060 - 54108928
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||    
T  54109060 cacatcgaagctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaac-ttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgt 54108962  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacata 192  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  54108961 tcaacctttactattttatccgatgtgggacata 54108928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 4955336 - 4955471
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||| ||    
T  4955336 tagagcaaccgcacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaaccttaac 4955435  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4955436 tattttatccgatatgagacatataactcacacttg 4955471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 22028367 - 22028525
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  22028367 ggggaccgtccacattgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacattaagacaatgagtttatgggtcctcttact 22028466  T
Q  149 tataaggtgttaaaccttta--ctcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||||||||| ||||||||   | |||||||||||||  ||||||||| | |||||||    
T  22028467 aataaggtgttcaacctttatttttttttatccgatgtaggacatataagtaacacttg 22028525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 49076807 - 49076984
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||      
T  49076807 tgttgggtcatgaggg-agctcaggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaaagacaccacactctaacccaaaaccttaaggtt 49076905  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| ||||| || || ||  ||||||||||||||||||    
T  49076906 atgggtttatgggttctctta-ctataaggtgttcaacctttactattttagccaatatggaacatataactcacacttg 49076984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 48 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 49303065 - 49302907
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta- 146  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| | || ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  49303065 aggggatcgtccacatcgaggatagaacaatcgcataagtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 49302966  T
Q  147 -tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
     |||||||| |||| |||||||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  49302965 ttttataagatgttcaacctttacttttttatttgatgtgggacatataactcacactt 49302907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 89 - 207
Target Start/End: Original strand, 41707503 - 41707620
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41707503 agagagacaccacactcttacc-aaaaccttaagacaatgagtttatgggttcttttacttatatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtggga 41707601  T
Q  189 catataactcacacttgta 207  Q
    |||||||||||||||||||    
T  41707602 catataactcacacttgta 41707620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 3244448 - 3244605
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||||  ||||||||   ||| || |||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||     
T  3244448 aggggactgcccacatcgaggctggaacaaccatacaagtgagagagacgacacattcttacccaaaactttaagacaatgagtttatgggtcctcttac 3244547  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3244548 ttataagatgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 3244605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 54936353 - 54936188
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  54936353 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 54936255  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |    ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  54936254 tacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtggg----ataactcacacttgtacacaacaacata 54936188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 153
Target Start/End: Original strand, 23817654 - 23817783
Alignment:
Q  27 tgttggatcat-gaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    ||||||||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23817654 tgttggatcatcgaggggagctatgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagg 23817753  T
Q  124 caatgagtttatgggttctcttatttataa 153  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||    
T  23817754 caatgagtttatgaatcctcttacttataa 23817783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 78 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45496934 - 45496820
Alignment:
Q  78 ccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttat 177  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  45496934 ccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacgattttat 45496835  T
Q  178 ccgatgtgagacata 192  Q
    |||||||| ||||||    
T  45496834 ccgatgtgggacata 45496820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 52885038 - 52884889
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagaga--cacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||  ||| ||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||    
T  52885038 cacatcgaggctagatcaaccacacaaataagagagagacaccacattcttaccccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttacttataagg 52884939  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52884938 tgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 52884889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3341286 - 3341130
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||  |||| |||||  |||||| ||||||||| |||||  ||||||  |||||||| |||||| |    
T  3341286 ggggaccgtctacatcgaggttaaaataaccacataattaagaaagacatcacactcttacccaaaatcttaaaacaatgatgttatgggtcctcttact 3341187  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3341186 tataaagtgtttaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttg 3341130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 54 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 20826370 - 20826223
Alignment:
Q  54 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 153  Q
    ||||||||||||||| |||||||| | || ||| ||||||||||  |||||| |||| ||||  ||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20826370 ccgtccacatcgaggctagaacaatcgcataaggaagagagacatcacactcttacctaaaatgttaaggctatgggtttatgggttctcttacttataa 20826271  T
Q  154 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
     ||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20826270 cgtgttcaacttttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 20826223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 45489331 - 45489497
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||| |||| |||| |||||  || |  ||||| | ||||||||| ||    
T  45489331 gggaccatccacatcgaggctagaacaatcacactagcaaaagagacatcacactcttaccaaaaatcttaaa-cagtaggtttaagagttctcttactt 45489429  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  45489430 atatggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataattcacacttgtacacaacaaca 45489497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 49880296 - 49880162
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    ||||||||| ||| || |||||||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  49880296 tagaacaac-acataaacaagagagacaccacgctcttacccaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttac 49880198  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  49880197 tattttattcaatgtgggacatataactcacacttg 49880162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 43827597 - 43827492
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  43827597 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatcc-aaaccttaaggcaatgaatttatgggtcctcttatt 43827499  T
Q  149 tataagg 155  Q
    |||||||    
T  43827498 tataagg 43827492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 54108694 - 54108540
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg-agtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||| | ||||||||| || |||     
T  54108694 ggggaccg-ccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacaccacactcttagccaaaaccttaaggcaatgaattttatgggtccttttac 54108596  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| || || |||  ||||||||||||||    
T  54108595 ttataaggtgttcaacctttactattttatcctatatgggac--ataactcacacttg 54108540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Original strand, 4390102 - 4390255
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||| | | | || | |||||| ||||    
T  4390102 gaccgtccgcatcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgtcacactcttacccaaaaccttaacgcaatgtgctaaaggatcctcttacttat 4390201  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  4390202 aaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggatatgtaactcacacttg 4390255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 37 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 43174677 - 43174496
Alignment:
Q  37 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||| | || |||||||||| | |||||| ||||||| || ||||||  ||  |||||||    
T  43174677 tgaggggagctagggaaccgtccacatcaaggctacaacaaccatataaacaagagagacgccacactcttacccaacactttaaggtcataggtttatg 43174578  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc-ttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
     || |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  43174577 tgtcctcttacttataaggtgttcaacctttactctttttatctgatgtgtggcatataactcacacttgtacacaacaaca 43174496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 51768061 - 51768210
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||||    |||  |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||    
T  51768061 gaccgtccacatcgaggttagaacaatcccataagtaagagagacatcgtacttttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgagtcctcttatttat 51768160  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||    
T  51768161 aaggtgttcaacatttactcttatattcgatataggacatataactcaca 51768210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2740869 - 2740702
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| | |||||| |||  |||||||||||||  || ||||||    
T  2740869 tgaggggagctcgggggaccatccatatcgaggctagaacaaccaca--agtgagagagacgccacactcttacgtaaaaccttaaggctctgggtttat 2740772  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2740771 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 2740702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 34004559 - 34004737
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||| |||||| |||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| || | ||||||||||||     
T  34004559 ttgttgggtcatgagaggagctcgggagaccgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagggagagagacggcacactcttatcgaaaaccttaagg- 34004657  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  34004658 aatgagtttatgggtcctcttacttataagttgttcaacctttagt-ttttatcatatgtgtgacatataactcacacttg 34004737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Original strand, 54741216 - 54741332
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    ||||||| || |||||| || ||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||    
T  54741216 agagagagactacactcttatccaaaaccttaagacaatctgtgtatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgaga 54741315  T
Q  189 catataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||    
T  54741316 catataattcacacttg 54741332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2741178 - 2741073
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||| || |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  2741178 acactcttacccaaaaccttaaggcaatggagttatgggtcctcttacttataaggtattcaacctttactattctatctgatgtgggacatataactca 2741079  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  2741078 cacttg 2741073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 55 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31691306 - 31691203
Alignment:
Q  55 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||||| | |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  31691306 cgtccacatcgaggctagaacaatcgtacaagcaagagatagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttata 31691207  T
Q  153 aggt 156  Q
    ||||    
T  31691206 aggt 31691203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 3271947 - 3271802
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa---gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 145  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||   ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  3271947 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacataataaacgagagagacac-acactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatgggttctctt 3271849  T
Q  146 attt---ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 189  Q
    | ||   |||||||||| ||| |||||| || |||| ||||||||||    
T  3271848 acttataataaggtgtttaacttttacttttctatctgatgtgagac 3271802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Original strand, 23556890 - 23557020
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    |||||||||||| |||||||||   |||||| || ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||| |||||  ||| ||     
T  23556890 caaccacacaagtaagagagacgtcacactcttatccaaaactttaaggcaatgattttatggattctcttatttataaaatgttcaacctccacttttc 23556989  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  23556990 tatccgatgtaaaacatttaactcacacttg 23557020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 84 - 201
Target Start/End: Original strand, 6975489 - 6975606
Alignment:
Q  84 aagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 183  Q
    ||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||  ||||  |||||| || |||||| ||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||    
T  6975489 aagcaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaagataatggatttatgagtcctcttacttataagatattcaacctttactattttatcggatg 6975588  T
Q  184 tgagacatataactcaca 201  Q
    ||||||||||||||||||    
T  6975589 tgagacatataactcaca 6975606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 49076449 - 49076602
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | || |||| ||| ||||||  | ||  |||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||| |    
T  49076449 ggggaccgtccacatcgaggctataacaatcgcataagcgagacagacaccgccct--tacccaaa-ctttaagacaatgggtttataggtcctcttact 49076545  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  49076546 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatatggtacatataactcacacttg 49076602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3700512 - 3700367
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||   |||||||||  | |||| || ||||||||||||||||||||||         || ||| ||||    
T  3700512 gaccgtccacatcgaggcttgaataaccacacaaatgagagagacatcatactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtc--------cttttacttat 3700421  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  3700420 aaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtaggacatataactcacacttg 3700367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 61 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 19504842 - 19504695
Alignment:
Q  61 catcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtta 160  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| |||| | |||||| |||||||||| ||||||||||   ||||||||| |||||         |||||     
T  19504842 catcgaggctagaacaaccacacaagcaagatagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaatagatttatgggtcctctt---------gtgttc 19504752  T
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  19504751 aacttttactattttatccgatatgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 19504695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Original strand, 48111696 - 48111828
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||   |  |||||||||| |||||| |||| |||||||||||| ||||  |||||  || || ||| |    
T  48111696 ggggaccgtccacattgaggttagaaaaaccacatttgtgagagagacaccacactcatacctaaaaccttaaggtaatggatttataagtccttttact 48111795  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 181  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  48111796 tataatgtgttcaacctttactcttttatccga 48111828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40067184 - 40067043
Alignment:
Q  67 ggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac-ct 165  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||  ||||||||| ||||||| | ||  | |||| || |||||| |||||| ||||| |||  |    
T  40067184 ggttagaacaaccacataagcaagagagacatcacacttttacccaaaatcttaaggtagtggatctatgtgtcctcttacttataatgtgttcaacttt 40067085  T
Q  166 ttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  40067084 ttacacttttatccgatgtagaacatataactcacacttgta 40067043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 18879962 - 18879854
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||   |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| |||  ||||| |||    
T  18879962 ggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaaccaaaagagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttataggtcatcttactta 18879863  T
Q  151 taaggtgtt 159  Q
    |||||||||    
T  18879862 taaggtgtt 18879854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 89 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 28034347 - 28034231
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    |||||||| | |||||| |||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || ||||||||| | ||    
T  28034347 agagagacgccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatccgatgcggga 28034248  T
Q  189 catataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||    
T  28034247 catataattcacacttg 28034231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 118 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10246436 - 10246349
Alignment:
Q  118 ttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| ||| |||||||||| |||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||    
T  10246436 ttaaggctatgggtttatgggtcctctaacttataagatgttcaacctttactcttttatccgatttgagacatataacagacacttg 10246349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 194
Target Start/End: Original strand, 54017751 - 54017845
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 194  Q
    |||||| |||| ||||||||||| ||||| |  ||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||    
T  54017751 acactcttacctaaaaccttaagacaatgggaatatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggatatata 54017845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34544286 - 34544107
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||  ||   || |||||  |||||  ||||||| || |||||| ||||||||| ||||||||||    
T  34544286 tgttgggtcacgaggggagccaggggaccacccacatcctgggg-gagcaaccgtacaagtgagagagataccacactcttacccaaaaaccttaaggca 34544188  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag--acatataactcacactt 204  Q
    |||||||||||||| |||| |||||||| ||| | |||||  ||| || ||| |||||||||  | |||||||||||||||    
T  34544187 atgagtttatgggtcctctcatttataaagtgatcaacctccacttttctattcgatgtgagatatatataactcacactt 34544107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 44620363 - 44620285
Alignment:
Q  140 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  44620363 tctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcccatgtgggacatataactcatatttgtacacaacaacat 44620285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 140 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44621493 - 44621428
Alignment:
Q  140 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  44621493 tctcttacttataaggtgtttaacctttactgttttatcccatgttggacatataactcacacttg 44621428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 46 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 760348 - 760194
Alignment:
Q  46 ccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 145  Q
    ||||||||||  ||||||| || | ||| |||||||||||   |||||||||| |||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||     
T  760348 ccaggggaccacccacatccag-taagagcaaccacacaaatgagagagacaccacacttttacc-aaaatcttaaggcaatgagtttatgggtcctctc 760251  T
Q  146 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    | |||||| ||  | |||||| | | || ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  760250 acttataaagttctcaaccttcatttttctattcgatgtgggacatataactcacac 760194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 70 - 193
Target Start/End: Original strand, 15841387 - 15841510
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||| ||||||||||||  |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |||| | ||| || ||||| |||||  ||    
T  15841387 tagagcaaccacacaagtgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgtgtttatgaatcctctcacttacaaagtgttcaacctccac 15841486  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatat 193  Q
    | || |||  ||||||||||||||    
T  15841487 ttttctatttgatgtgagacatat 15841510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 40 - 94
Target Start/End: Original strand, 23817444 - 23817498
Alignment:
Q  40 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagag 94  Q
    |||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  23817444 ggggagcctgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagag 23817498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 127
Target Start/End: Complemental strand, 41370812 - 41370738
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||| |  |||| |||| |||||||||||    
T  41370812 accgtccacatcgaggttagaacaaccactcaagtaagagagacatcacatttttacctaaaatcttaaggcaat 41370738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 49 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 43174299 - 43174233
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa 115  Q
    |||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||    
T  43174299 ggggaccgtccacatcaaggcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaa 43174233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 161 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45050647 - 45050603
Alignment:
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  45050647 aacctttactcttttatttgatgtgagacatataactcacacttg 45050603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 140 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 44621012 - 44620945
Alignment:
Q  140 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg-tgagacatataactcacacttgt 206  Q
    ||||||| |||||||||||| |||||||||  |||||||||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  44621012 tctcttacttataaggtgttcaacctttacagttttatccgatgttgggacatctaactcacacttgt 44620945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Original strand, 45489712 - 45489870
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatga-gtttatgggttctcttat 147  Q
    ||||| || ||||||||||  |||||||||||  ||||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||  |  | | ||||| || |  |||||     
T  45489712 ggggatcggccacatcgagactagaacaaccatgcaagcgagagagacaccacactattacccaaaaccttaa-actttaaggtttaaggatcatcttac 45489810  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||| | | || || |||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||    
T  45489811 ttatatgatattcaatctttactcttttatccaatgtgatacatataactcacaattgta 45489870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 11197344 - 11197294
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  11197344 agagagacaccacactcttacccaaaaccctaaggcaatgggtttatgggt 11197294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 155 - 205
Target Start/End: Original strand, 50788087 - 50788137
Alignment:
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  50788087 gtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataacttacacttg 50788137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 93
Target Start/End: Original strand, 11702281 - 11702341
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagaga 93  Q
    ||||||||||||| ||||| || || |||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  11702281 tcatgaggggagcgagggggactgttcacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga 11702341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 58 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 19895445 - 19895406
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca 97  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  19895445 ccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagaca 19895406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 121
Target Start/End: Original strand, 39698919 - 39699014
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 121  Q
    |||||||| |||||| |||| ||  |||| ||||||||||||  ||||| |||| |||||||||||||||  | |||||| ||| |||||||||||    
T  39698919 tgttggatgatgaggagagctcataggactgtccacatcgagactagaataaccgcacaagcaagagagatgctacactcttactcaaaaccttaa 39699014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 100 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 1868158 - 1868117
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttc 141  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  1868158 acactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgggttc 1868117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 91 - 135
Target Start/End: Original strand, 11706584 - 11706628
Alignment:
Q  91 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||| | |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  11706584 agagacgccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttat 11706628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 117; Significance: 1e-59; HSPs: 66)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 27 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 6421566 - 6421386
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  6421566 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgagactagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggca 6421467  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  6421466 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgt 6421386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 36178605 - 36178761
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  36178605 ggggatcgtccacatagaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 36178704  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36178705 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36178761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 55 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 15880415 - 15880253
Alignment:
Q  55 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  15880415 cgtccacatcgaggctaaaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 15880316  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  15880315 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 15880253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37106082 - 37105926
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |    
T  37106082 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtccccttact 37105983  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37105982 tataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttg 37105926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 41283475 - 41283631
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| | |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41283475 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaaacaagagagacgccacactcttacctaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttact 41283574  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  41283575 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatatgggacatataactcacacttg 41283631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 37106344 - 37106190
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |||    
T  37106344 ggaccgtccacatcgaggctagaacaatcgcacaagcaagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaatgggtttatgggtcctcttactta 37106245  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37106244 taaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 37106190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 14745667 - 14745823
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  14745667 ggggactgtccacatcgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 14745766  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  14745767 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 14745823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 5542602 - 5542781
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||    
T  5542602 tgttggatcatggggggagctcgggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggca 5542701  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||| || |||||||||||||||||||    
T  5542702 ataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattcgatatgggacatataactcacacttg 5542781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 962753 - 962600
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| | ||||    
T  962753 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacaacacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgggtcctctcacttat 962654  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  962653 aaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 962600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 40 - 200
Target Start/End: Original strand, 15511486 - 15511646
Alignment:
Q  40 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  15511486 ggggagctcggggatcgtccacatcgagactagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggt 15511585  T
Q  140 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
     |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  15511586 cctcttacttataacgtgttcaacctttactcttttatccgttgtgtgacatataactcac 15511646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 5542975 - 5543154
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||||||||| ||||||| || || |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  5542975 tgttggatcatggggggagctcaaggtaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggca 5543074  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||  |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5543075 ataggtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacacttg 5543154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6713135 - 6712966
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | || ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||||     
T  6713135 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccataagcaagagagacatcacactcttacccaaaaaccttaaagcaataggtttatgggtcctcttac 6713036  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  6713035 ttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtatacaacaaca 6712966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 36005887 - 36006047
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  36005887 gtccacatcgaggctagaacaaccccacaagcaagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagg 36005986  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||| ||| |||||| || ||| ||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  36005987 tgttcaacttttact-ttctattcgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 36006047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 26 - 185
Target Start/End: Original strand, 36178147 - 36178307
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    ||||||| ||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||    
T  36178147 ttgttgggtcacgaggggagcgcgggggaccgtctacatcgaggctataacaaccacacaagcaagagaggcaccacactcttacccaaaatcttaaggc 36178246  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg 185  Q
    |||| |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  36178247 aatgggtttatgggttcccttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg 36178307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 42514830 - 42514651
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||     
T  42514830 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcg 42514731  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  42514730 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtaggacatataactcacacttg 42514651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 6422293 - 6422126
Alignment:
Q  25 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    |||||||| ||||| |||||  |||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  6422293 tttgttgggtcatggggggaatcagggggacagtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 6422194  T
Q  124 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 191  Q
    | ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  6422193 ctatgggtttatgggtcctcttaattataatgtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacat 6422126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 51 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 33731804 - 33731653
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||||||  ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||    
T  33731804 ggaccgtttacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggatcctcttactta 33731705  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33731704 taaggtgctcaacctttactcttttatccgatgtgagatatataactcacac 33731653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 35580724 - 35580879
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| | |    
T  35580724 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttat-ggtcctctcact 35580822  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35580823 tataaggtgttcaacatttattgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35580879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 29676687 - 29676543
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||      ||||||||||||||||||||||| | |    
T  29676687 ggggaccgtccacatcgaggtttgaataaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaa------ggcaatgagtttatgggttctctcact 29676594  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29676593 tataatgtgttcaatctttactcttttatccaatgtgagacatataactca 29676543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 26 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 23346418 - 23346250
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||    
T  23346418 ttgttgggtcatgaggggagctcgggcgaccgtccacatctaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttaccgaaaaccttaaggc 23346319  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 194  Q
     ||| |||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||    
T  23346318 tatgggtttatgggccctctta-ttataaggtgtttaacctttacttttctatacgatgtgagacatata 23346250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 201
Target Start/End: Original strand, 40679632 - 40679781
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||| | |||||| ||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  40679632 gaccgtccacatcgagactagaacaaccccacaagtaagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcgatgggtttatgggttctcttacttat 40679731  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||||||| |||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  40679732 aaggtgttcaacccttacttttctatccgatatgggacatataactcaca 40679781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 37632586 - 37632753
Alignment:
Q  37 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||||| |||| |||||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||    
T  37632586 tgaggggagccagggg-ccgtccacatcgaggctagaacaatcacacttgtaagagatacaccacactcttacccaaaaccttaaagttatgggtttatg 37632684  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  37632685 ggtcctcttacttataaaatgtcaaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 37632753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1770073 - 1769894
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||||  ||||||| ||| ||| ||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  |||| | | || ||     
T  1770073 tgttgggtcattgggggagctaggaggatcgttcacatcgaggctagaacaacctcacaagcaagagagacaccacactcttattcaaagcttcaaagct 1769974  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| || |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1769973 atgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 1769894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7598409 - 7598230
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||  ||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||  |||||||||| | | || ||||||||||||||||||     
T  7598409 tgttgggtcacgaggggagatcaggggaccgttcacatcgaggcttgaacaaccgcacaagtgagagagacaccatattcttacccaaaaccttaaggct 7598310  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||||||   |||||||| |||||||||    
T  7598309 atgagtttatgggtcctcttatttataaggtgttgaacctttacttttctattcgatgtagaacatataattcacacttg 7598230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 70 - 203
Target Start/End: Original strand, 28254260 - 28254391
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  28254260 tagaacaaccccacaag--agagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttac 28254357  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    | || ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  28254358 ttttctatccgatgtgggacatataagtcacact 28254391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Original strand, 38796619 - 38796776
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca--ctcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| | |||  ||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||| ||||||     
T  38796619 gggaccgtcgacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaatagagacgccacatactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggtcctcttac 38796718  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  38796719 ttataaggtgttcaacctttattgttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 38796776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40734040 - 40733883
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| ||| |||||| |||||| |||||||||| |||||||  | || ||||| |  |||||| |    
T  40734040 ggggaccgtccacatcgagacttgaacaaccacacaagcgagacagacaccacactcttacccaaaactttaaggctgt-aggttatgagccctcttact 40733942  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733941 tataaggtgttaaatctttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttgta 40733883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 40733675 - 40733517
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||  | |||| ||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||| ||||||   |  |||||||||| |||||| |    
T  40733675 ggggaccatccacatcgagacttgaactaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggttgtaggtttatgggtcctcttact 40733576  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  40733575 tataaggtgttcaacatttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttgta 40733517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 29677065 - 29676908
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt-----ctct 144  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||  ||| ||||||||||||| ||||||||||      ||||    
T  29677065 gggaccatccacatcgaggttggaacaaccccacaattaagagagacaccacactcttacttaaagccttaaggcaatgggtttatgggtcttctcctct 29676966  T
Q  145 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
     |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29676965 cacctataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 29676908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 27 - 196
Target Start/End: Original strand, 40163349 - 40163520
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggc 124  Q
    |||||| ||||  ||||||| |||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||| ||| |    
T  40163349 tgttgggtcatagggggagctcaggagaccatctacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaagac 40163448  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataac 196  Q
    | |  ||| ||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||    
T  40163449 actaggttaatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataac 40163520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Original strand, 28531316 - 28531470
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||| |||||||||||| |||| ||||  || ||   |||||| ||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||| |||    
T  28531316 ggaccatccacatcgaggctagagcaactgcataactgagagagtcaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggacctcttactta 28531415  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| ||||||| || || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28531416 taaggtgttcaacctttgcttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 28531470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6421911 - 6421793
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  6421911 gttgggtcatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggccagaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 6421812  T
Q  127 tgagtttatgggttctctt 145  Q
    |  |||||||||| |||||    
T  6421811 taggtttatgggtcctctt 6421793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 56 - 201
Target Start/End: Original strand, 14745300 - 14745446
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccac-acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||   |||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||| |||    
T  14745300 gtccacatcgaggctagaacaaccaccacttacaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcatacttacaag 14745399  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
     |||| |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14745400 atgttcaaccattactattttattcgatgtgggacatataactcaca 14745446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16542556 - 16542451
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16542556 acactcttactcaaaatcttaaggcaatgagtttataagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacttataactca 16542457  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  16542456 cacttg 16542451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 63 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 5367599 - 5367455
Alignment:
Q  63 tcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaa 162  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||| |||| |  ||||| |||||||||||| ||    
T  5367599 tcgaggctagaacaactgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggttatgtgttcatggatcatcttacttataaggtgttcaa 5367500  T
Q  163 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||||||||||    
T  5367499 cctttgctcttttatccgatctgggacatatatatcacacttgta 5367455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 5e-28
Query Start/End: Original strand, 59 - 222
Target Start/End: Original strand, 12529038 - 12529201
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||  || || | ||||| ||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||    
T  12529038 cacattgaggttagaacaaccgcacaaacaagagagacactacgttcttatctaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttatacggtgt 12529137  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatattt 222  Q
    | || ||||||| ||||||  |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||    
T  12529138 tcaatctttactgttttatttgatgtaggacatataactcacacttgcatacaacaacgtattt 12529201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 54 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7598754 - 7598611
Alignment:
Q  54 ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataa 153  Q
    ||||||||||||| | | |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||| ||||| ||||||        |||||||| |||||| ||||||    
T  7598754 ccgtccacatcgatgcttgaacaaccacacaagtgagagagacaccacactcttaccaaaaacgttaagg--------ttatgggtcctcttacttataa 7598663  T
Q  154 ggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  7598662 ggtgttcaacctttacttttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 7598611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 31468801 - 31468902
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    ||| | || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||    
T  31468801 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttat----aagatattcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactca 31468896  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  31468897 cacttg 31468902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 40 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 3673236 - 3673122
Alignment:
Q  40 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||  |||||| || |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  3673236 ggggagccagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtaagagagacatcacactcttagccaaaatcttaaagcaatgagtttatgga 3673137  T
Q  139 ttctcttatttataa 153  Q
    | |||||| ||||||    
T  3673136 tcctcttacttataa 3673122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 24 - 117
Target Start/End: Original strand, 31899077 - 31899170
Alignment:
Q  24 ttttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacc 117  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||    
T  31899077 ttttgttggatcatgaggggagcttggggaccgttcacatcgaggttagaagaaccccacaagcaagagagatacctcactcttacccaaaacc 31899170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 119 - 204
Target Start/End: Original strand, 31899496 - 31899581
Alignment:
Q  119 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31899496 taaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactattttatccgatgtggaacatataactcacactt 31899581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 36178320 - 36178425
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| || | |||| ||||||||||||  ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||    
T  36178320 acactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttatgagtccccttacttataaggtgttccacctttactattttatccgaagtgggacatataactca 36178419  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  36178420 cacttg 36178425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 40 - 135
Target Start/End: Complemental strand, 3672869 - 3672773
Alignment:
Q  40 ggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  3672869 ggggagccaggggaaccgtccacatcgagactagaacaaccacacaattaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgggtttat 3672773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30313309 - 30313180
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    ||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  30313309 caaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttttgggtcctctcacttataa-gtgttcaacctccacttttc 30313211  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  30313210 tatccgatgtgagacatataacacacgcttg 30313180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 91 - 204
Target Start/End: Original strand, 31259658 - 31259774
Alignment:
Q  91 agagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatcc---gatgtgag 187  Q
    ||||| || |||||| |||||||||||||||||  ||  ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||    
T  31259658 agagataccacactcttacccaaaaccttaaggtgataggtttatgggtcatcttacttataaggtgttgaacctttactcttttatccgatgatgtgag 31259757  T
Q  188 acatataactcacactt 204  Q
    ||||||||||| |||||    
T  31259758 acatataactcgcactt 31259774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9231407 - 9231252
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| |||| || |||  ||||||| || |||||| || ||||||| |||||||  || ||| |||| | ||||||||    
T  9231407 ggggatcgtccacatcaaggttagaataaccgcataagttagagagatactacactcttaaccaaaactttaaggcggtgggttgatggatcctcttatt 9231308  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||||  |||| |||||||||| || |||| ||| |||||||||||||||| ||||    
T  9231307 tataatatgttcaacctttacttttctatctgatatgagacatataactcatactt 9231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 33561429 - 33561607
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||   | ||| |||  ||| ||| || | |||  ||||||| |  |||||| |||||||||||||||| |||    
T  33561429 tgttgggtcatgaggggagcccggggaccgcatatatctaggcaagagcaatcataaaagtgagagagatatcacactcttacccaaaaccttaagacaa 33561528  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  33561529 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccacttttctatctgatgtggaacatataactcacacttg 33561607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 95 - 199
Target Start/End: Original strand, 37895107 - 37895211
Alignment:
Q  95 acacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatata 194  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| || |||||| || ||| |||| | || ||||||||||| ||||||||    
T  37895107 acaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgtgttcttttacttttaaggttttcaacttttatttttctatccgatgtgggacatata 37895206  T
Q  195 actca 199  Q
    |||||    
T  37895207 actca 37895211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 38796299 - 38796374
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  38796299 gtttataggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 38796374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 53 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 6421780 - 6421688
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 145  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| || ||||  |||||||||| |||||    
T  6421780 accgtccacatcgaggccggaacaaccacacaagttagagagacaccacactcttacccaaaacctttagtcaataggtttatgggtcctctt 6421688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 16591034 - 16590890
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    |||||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||||||  | | || |||  ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||          
T  16591034 gtccacattgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacattagattcttacttaaaaccttaaggcaatgtgtttatgggtcctcttactt------ 16590941  T
Q  156 tgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| ||||||||| | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  16590940 tgttcaacctttactttttttatttgatgtgggacatataactcacacttg 16590890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Original strand, 29874074 - 29874181
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||| ||    
T  29874074 acactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcccaattataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatataacaca 29874173  T
Q  200 cacttgta 207  Q
    ||||||||    
T  29874174 cacttgta 29874181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Original strand, 36785664 - 36785719
Alignment:
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36785664 ataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 36785719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 191
Target Start/End: Original strand, 28254165 - 28254254
Alignment:
Q  102 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacat 191  Q
    |||| ||||| |||| ||||||||| | ||||||| || |||||| |||||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||    
T  28254165 actcttaccctaaactttaaggcaaagtgtttatgagtcctcttacttataaagtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacat 28254254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 161 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 6421350 - 6421294
Alignment:
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  6421350 aacctttactcttttatccgatgtgggacatataacttacacttgtacacaacaaca 6421294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 62 - 154
Target Start/End: Original strand, 36784273 - 36784365
Alignment:
Q  62 atcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| |||||||    
T  36784273 atcgaggcttgaataaccacacaagcaagagagacacaacacttttatccaaaaccttaagacaaagggtttatgggtcatcttacttataag 36784365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 90 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30323581 - 30323466
Alignment:
Q  90 gagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac 189  Q
    ||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | || ||| ||||| |||||  | | || |||| ||| || |||    
T  30323581 gagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttataggtcctctcacttctaaagtgttcaacctccaattttctatctgatttgggac 30323482  T
Q  190 atataactcacacttg 205  Q
    ||||||| ||||||||    
T  30323481 atataacacacacttg 30323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 76 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31385868 - 31385739
Alignment:
Q  76 aaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctttt 175  Q
    |||||||||||  | |||||||| |||||  | |||||||||||||||||||| |||||||||| || | | |||||||||| | |||||  | | || |    
T  31385868 aaccacacaagtgaaagagacaccacacttattcccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctttcacttataaggtgctcaacctccatttttct 31385769  T
Q  176 atccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||||||| |||| | |||||||||||||    
T  31385768 aaccgatgtcagacttctaactcacacttg 31385739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 29873525 - 29873693
Alignment:
Q  38 gaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||   ||| ||||||||||||  ||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29873525 gaggggagccaggaggaccgcctacatccagaccagagcaaccacacaagtgagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatg 29873624  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     || |||  | ||||||  |||| |||||  ||| || |||| |||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  29873625 agtcctcccacttataaaatgttcaacctccacttttctatctgatgtgggacatgtaacacacccttg 29873693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 3594180 - 3594333
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||| || ||||| || | |||||| |  |||||| ||| ||||| ||||| |||||| |||||||| | || | | |||    
T  3594180 ggaccgttcacatcgaggttagaataaacacactagtatgagagatatcacactcttactcaaaatcttaaagcaatgtgtttatggatcctatcactta 3594279  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||| |||||  ||||  ||| || ||| || ||||| ||||| |||||||||||    
T  3594280 taaagtgttcgacctccacttttctattcgttgtgaaacatacaactcacactt 3594333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 139
Target Start/End: Original strand, 35580443 - 35580530
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||||||||| || ||||| |||| | | | ||||||| | ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35580443 accgtccacatcgaggctaaaacaatcacataggga-gagagacgccacactctcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 35580530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Original strand, 37894732 - 37894844
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    ||||| |||| |||||  || |||||| ||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||||| || | |||||||| || ||| | ||||| ||    
T  37894732 agagacacaccacacttttaaccaaaatcttaaggcaatggatttatgagtcttcttacttataaggtttttagcctttacttttctattcaatgtggga 37894831  T
Q  189 catataactcaca 201  Q
    |||||||||||||    
T  37894832 catataactcaca 37894844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 41678419 - 41678525
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac--atataact 197  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||||||| |||| | |||||| ||||| |||||   || || |||| ||||||||||  ||||||||    
T  41678419 acactcttactcaaaaccttaaggcaaag-gtttatgggtcctctcacttataaagtgtttaacctccccttttctatctgatgtgagacatatataact 41678517  T
Q  198 cacacttg 205  Q
    ||||||||    
T  41678518 cacacttg 41678525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 101 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 34481372 - 34481265
Alignment:
Q  101 cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| | |||| | ||||||||  | || |||||  ||| || ||||||| |||||| ||||||||||     
T  34481372 cactcttacccaaaaccttaaagcaataaatttatagattctatcatttataaaatattcaacctccacttttatatccgacgtgagaaatataactcat 34481273  T
Q  201 acttgtaa 208  Q
    ||||||||    
T  34481272 acttgtaa 34481265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 152
Target Start/End: Original strand, 13091833 - 13091874
Alignment:
Q  111 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  13091833 caaaaccttaagacattgagtttatgggttctctcatttata 13091874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 148 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 42515075 - 42515031
Alignment:
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacata 192  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| ||||||    
T  42515075 ttataaggtgtttaacctttacttttctatccgatgtgggacata 42515031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 114; Significance: 8e-58; HSPs: 45)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 8e-58
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35210371 - 35210206
Alignment:
Q  40 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  35210371 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaaaagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggttttatgggt 35210272  T
Q  140 tctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35210271 cctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 35210206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29518661 - 29518505
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29518661 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518562  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29518561 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29519078 - 29518922
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  29519078 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 29518979  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29518978 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 29518922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32741337 - 32741181
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  32741337 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 32741238  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32741237 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32741181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 20 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16455095 - 16454897
Alignment:
Q  20 aatattttgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacct 118  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  16455095 aatatgttgttggattatgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacct 16454996  T
Q  119 taaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||  |||||||||| || ||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||    
T  16454995 taaggcaataggtttatgggtcctattacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgggacacataactcacatttgtacacaacaaca 16454897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 21 - 217
Target Start/End: Original strand, 2578414 - 2578610
Alignment:
Q  21 atattttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt 119  Q
    |||| ||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||    
T  2578414 atatattgttgggtcatgaggggggctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaacctt 2578513  T
Q  120 aaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  2578514 aaggctatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactcttttatccg-tgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 2578610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 23 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2843740 - 2843555
Alignment:
Q  23 attttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  2843740 attttgttggatcatgaggggagttagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaa 2843641  T
Q  122 ggcaatgagtttat-gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    |||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  2843640 ggcaatgagtttatggggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattattttatccgatgtgaaacatataactcacaattgt 2843555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 14748342 - 14748494
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    | |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  14748342 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagaga----ccacactcttacccaaaaccttaacgcaatgagtttatgggtcctcttatt 14748437  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14748438 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 14748494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 2579850 - 2580028
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||| | |||||||||||  ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||      
T  2579850 tgttgggtaatgaggggagcttggggaccttccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggctg 2579949  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2579950 tgggtttatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2580028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3409407 - 3409261
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  3409407 cacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgt 3409308  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3409307 tcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3409261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 2377912 - 2377755
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  2377912 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 2377813  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  2377812 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgt 2377755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 2378284 - 2378128
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||| |||| |||||||||| |||||| |    
T  2378284 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaaaccttaaggtaatgggtttatgggtcctcttact 2378185  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2378184 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 2378128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16107827 - 16107668
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    ||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| ||||||||||    
T  16107827 ccacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtg 16107728  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16107727 tttaacctttacttttttatccgatgtgacacatataactcacacttgtacacaacaaca 16107668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 27 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 16454756 - 16454562
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||| |||||||||    
T  16454756 tgttgggtcacgaggggagctcgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggca 16454657  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatat 220  Q
    ||| |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  16454656 atgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttattcttttatctgatgtgggacacataactcacacttgtacacaacaacatat 16454562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 1846906 - 1846750
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |    
T  1846906 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatggatttatgggtgctcttact 1846807  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1846806 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatagaattcacacttg 1846750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 2578819 - 2578990
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 132  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  2578819 tcatgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtcagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgagtt 2578918  T
Q  133 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| | |||||||||||||||| || ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||| |||||||||    
T  2578919 tatggatcctcttatttataaggtattcaacatttact-ttttatccgatgagggacatataaatcacacttg 2578990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3058384 - 3058228
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | ||| || |    
T  3058384 ggggacggtccacatcgaggttagaaccaccctacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcatact 3058285  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  3058284 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacacttg 3058228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 29 - 206
Target Start/End: Original strand, 5832007 - 5832183
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 128  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||| |||||||   ||    
T  5832007 ttgggtcatgaggggagcctggggaccgtctacatcgaggctagaacaaccacacaagtaagagagacaccacacttttacccaaaatcttaagg-ggtg 5832105  T
Q  129 agtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
      ||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5832106 gctttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataacttacacttgt 5832183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 10074371 - 10074519
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  10074371 tccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctcttacttataaggt 10074470  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||| ||| | |||||||||||||    
T  10074471 gttcaacctttacttttctatccgatgtgggacctctaactcacacttg 10074519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 37 - 202
Target Start/End: Original strand, 2579479 - 2579645
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    ||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2579479 tgaggggagcctgtggaaccatccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccatacttttacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 2579578  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    |||  |||||| ||||||||| |   ||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2579579 gggccctcttacttataaggtatccgacctttacttttttgtccgatgtgggacatataactcacac 2579645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3409818 - 3409662
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||  | ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  3409818 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaaataaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 3409719  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||| ||| |||||| ||||||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  3409718 tataagatgttcaacttttactattttatctgatgtggtacatataactcacacttg 3409662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 217
Target Start/End: Original strand, 2579087 - 2579273
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| || ||||| |||||| |  |    
T  2579087 tgttgggtcatgaggggagctcggggaccgtgcacatcgaggctagaacaaccacacgagcaagagagacaccacactcttagccaaagccttaaagtta 2579186  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    || |||||||| | |||    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  2579187 tgggtttatggttcctc----ttataaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgggacatataactaacacttgtacacaacaaca 2579273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 3415618 - 3415462
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttaga--acaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  3415618 ggggaccttccacatcgaggctagagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctta 3415519  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
     ||||| |||||| |||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  3415518 cttatatggtgttcaacctttactattttatgtgatgtgggacatataactcacact 3415462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 10073990 - 10074147
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||| | |||| |||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  10073990 aggggaccgtccacgtcgaggctagaacaaccaaataagcgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 10074089  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||    
T  10074090 ttataaggtgttcaacgtttacttttctatccgatgtgggatatataactcacccttg 10074147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 221
Target Start/End: Original strand, 6999799 - 6999968
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||| | |||||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||  |||    
T  6999799 gaccgtccacatcgagactagaacaaccacattagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcagtgagtttatggatcctcttacatat 6999898  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 221  Q
    |||||||| ||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||    
T  6999899 aaggtgttcaacttttacttttttatccgatgtaggacatataactcacacttatacacaataacatatt 6999968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 1127518 - 1127366
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| |    
T  1127518 ggggaccacccacatcgaggttagagcaaccacataagtaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttact 1127419  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| || ||||||||||||    
T  1127418 tataaggtgttcaacctttactattttacccgatgtgggatatataactcaca 1127366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Original strand, 10073593 - 10073770
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| |||||||||| |  |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||    
T  10073593 tgttgggtcacgaggggagcctgaaggaccgtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagcca 10073692  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  10073693 atgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaaccttta--cttttctccgatgtgggacatataactaacacttg 10073770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26544197 - 26544051
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    ||||| |||| |||||||| | |||||||||||||||||  |||||| ||| ||||||||||||||  || |||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  26544197 cacattgaggctagaacaatcgcacaagcaagagagacatcacactcttactcaaaaccttaaggcggtgggtttatgggtcctcttacttataacgtgt 26544098  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26544097 tcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 26544051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 55 - 201
Target Start/End: Original strand, 5958613 - 5958755
Alignment:
Q  55 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    |||||||  ||||||   |||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5958613 cgtccacatcgaggttagaacaatcacacaag----agagacatcacactctatcccaaaactttaagacaatgagtttatgagttctcttatttataag 5958708  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  5958709 gtgttcaacctttactgttttatccgatgtaacacatataactcaca 5958755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 16108208 - 16108053
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||            ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  16108208 gggaccgtccacatcgaggttataacaaccccacaagcaagagagacaccacac------------ccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 16108121  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16108120 ataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgtggaacatataactcacacttgtacacaacaaca 16108053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 64 - 217
Target Start/End: Original strand, 1950200 - 1950353
Alignment:
Q  64 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 163  Q
    ||||| |||||||||| |||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||||||||||| |   ||||||| | |||||| || ||||||||| |||    
T  1950200 cgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccttaaggcattagatttatggctcctcttacttgtaaggtgttcaac 1950299  T
Q  164 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||    
T  1950300 ctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttatacgcaacaaca 1950353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 593694 - 593865
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagaca--cgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagttt 133  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||  ||||||||||  ||||| |||||||| |  | |||||  ||||||||||||||||||| |  ||||    
T  593694 tgaggggagctcgggggaccgtcaacatcgagcctagaacaaccgtacaagtaagagagagataccacactattacccaaaaccttaaggcagtcggttt 593793  T
Q  134 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  593794 atgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatacaactcacacttg 593865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 202
Target Start/End: Original strand, 32460631 - 32460733
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||    
T  32460631 acactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatacgatgtgggacatataactca 32460730  T
Q  200 cac 202  Q
    |||    
T  32460731 cac 32460733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 10911720 - 10911567
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| | ||||||| |||  || ||||||||||  |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  10911720 accgtccacatcgaggcttgaacaacaacattagtaagagagacatcacactcttattcaaaactttaaggcaatgagtttatgagtcctcttacttata 10911621  T
Q  153 aggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| ||||||||| | ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  10911620 aggtgttcaacctttactttttttatctgatgtaggacatataactcacacttg 10911567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 82 - 201
Target Start/End: Original strand, 9062383 - 9062501
Alignment:
Q  82 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccga 181  Q
    ||||| |||||||| || |||||  |||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  9062383 acaagtaagagagataccacacttttacccaaaac-ttaagacaatgagtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccga 9062481  T
Q  182 tgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||| |||||||||||||||    
T  9062482 tgtgggacatataactcaca 9062501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 8482045 - 8481929
Alignment:
Q  88 aagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgag 187  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |    
T  8482045 aagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcatctcatttataaagtgttcaacctccacttttatatctgatgtg-g 8481947  T
Q  188 acatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||||||||    
T  8481946 acatataactcacacttg 8481929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 12071675 - 12071847
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 132  Q
    |||||||||||||  |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||  |||    
T  12071675 tcatgaggggagcttaggggaccgttcacatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtcataggtt 12071774  T
Q  133 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| || || |   |||||| ||||| || ||  | | || |||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  12071775 tatgagtcctttctattataaagtgttcaaactccatttttctatctgatgcgagacatataactcacacttg 12071847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6071264 - 6071134
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    |||||| |||||| |||||||| | |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| |  ||| | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  6071264 caaccatacaagcgagagagacgccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcatctcacttataaagtgttcaacctccacttttc 6071165  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  6071164 tattcaatgtgggacatataactcacacttg 6071134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Original strand, 12092481 - 12092638
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    ||||||||  ||||||| |||  ||| ||||| ||||||  |||||||||| ||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |     
T  12092481 aggggaccacccacatccaggccagagcaacctcacaagtgagagagacaccacagtcttactcaaaaccttaaggcaatgagtttatggatcctctcac 12092580  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||||||| ||||| |||| ||| ||||    
T  12092581 ttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgggacatctaacacacccttg 12092638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 124
Target Start/End: Original strand, 12085018 - 12085109
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||||||||||  ||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| ||||||||||||||||||    
T  12085018 tcatgaggggagcttaggagaccgttcgcatcgaggctagaacaaccacacaagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggc 12085109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 203
Target Start/End: Original strand, 17135069 - 17135223
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| |||   |||||||| ||||||| | |||| |   |||||| || ||||||| ||    |||||||||||||  | |||||  |    
T  17135069 ggggaccgtccacatcaaggccggaacaaccgcacaagcgaaagagccgtcacactcttatccaaaactttctaacaatgagtttatgaatcctcttgct 17135168  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    |||||||| |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17135169 tataaggtattaaacatttacttctctatccgatgtgagacatataactcacact 17135223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 52 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 31714823 - 31714732
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 144  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| | | | || | |||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  31714823 gaccgtccacatcgaggctagagcaaccacacaagcgaaaaa-acgccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgagttaatgggtcctct 31714732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 56 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 3409452 - 3409405
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacac 103  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||    
T  3409452 gtccacatcgaggctagaacaaccgcataagcaagagagacaccacac 3409405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 37 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 2975341 - 2975296
Alignment:
Q  37 tgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccaca 82  Q
    ||||||||| ||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  2975341 tgaggggagtcagaggactgtccacatcgaggctagaacaaccaca 2975296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 107 - 140
Target Start/End: Original strand, 22605313 - 22605346
Alignment:
Q  107 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt 140  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22605313 tacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtt 22605346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 113; Significance: 3e-57; HSPs: 62)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 26661522 - 26661690
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |    
T  26661522 ggggaccgtccatatcgaggcttgaacaaccacacaagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtcctctcact 26661621  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26661622 tataaggtgttcaacctttactcttttacccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26661690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 44290824 - 44290981
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||     
T  44290824 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagatacaccacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttac 44290923  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44290924 ttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41157149 - 41156993
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  41157149 ggggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaatagagacaccacactcttacccaaaaccttaaagcaatgagtttatgggtcctcttact 41157050  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||||||||    
T  41157049 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgttatgggacatataattcacacttg 41156993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 7e-52
Query Start/End: Original strand, 39 - 202
Target Start/End: Original strand, 3537589 - 3537752
Alignment:
Q  39 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||| ||    
T  3537589 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaagccaatgggtttatagg 3537688  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    | |||||| | |||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  3537689 tcctcttactcataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactaacac 3537752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41142531 - 41142374
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || |||     
T  41142531 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactctttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttac 41142432  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41142431 ttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 41142374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34649596 - 34649428
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||| |  |||||||||||||   | |    
T  34649596 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagcaagagagacgcctcactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgggttcttgcact 34649497  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34649496 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtatacaacaaca 34649428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 44290458 - 44290614
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  44290458 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgtacaagcaagaaagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 44290557  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  44290558 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 44290614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 50 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41157532 - 41157377
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||| |||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||    
T  41157532 gggaccgcccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagacagacaccacactcttactcaaaacctaaaggcaatgggtttatgggtcctcttactt 41157433  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  41157432 ataaggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttg 41157377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 52 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 17294733 - 17294577
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaacca-cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||    
T  17294733 gaccgtccacatcgaggctagagcaacctgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttactta 17294634  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  17294633 taaagtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgta 17294577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41759641 - 41759485
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |  ||||| |    
T  41759641 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacataagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatggatttatggatcatcttact 41759542  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41759541 tataaggtgttcaacttttactattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 41759485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 5319942 - 5320121
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    ||||||| ||| || ||||||  |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||     
T  5319942 ttgttgggtcacgaagggagcttggggaccgtctacattgaggctagaacaaccacataagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggct 5320041  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||| |||| | |||||||||||| ||| |||||| || |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  5320042 atgagtttatgggtcctctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtggaacatataactcacacttg 5320121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 37850579 - 37850756
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||||| || || |||||||||  || |    
T  37850579 gttggatcatgaggggagctaggggaccgtccacatcgaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacaccacactcttatccgaaaccttaaaacatt 37850678  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
      ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  37850679 aggtttatgggttctcttacttataaggtgttcaacctctactgttttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 37850756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 29 - 218
Target Start/End: Original strand, 26661877 - 26662067
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    |||| ||| ||||||||| |||| |||| ||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26661877 ttgggtcacgaggggagctagggagaccatccgcatcaaggattgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaat 26661976  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
      ||||||||||  ||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| || || ||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26661977 cggtttatgggtcttctcacttataaggtgttcaacctttactcttttatctgatatgggatatataactcacacttgtacacaacaacat 26662067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34365085 - 34364927
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||  || |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||    
T  34365085 cagggaaccatccacatcgaggttagagcaactgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctctta 34364986  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34364985 cttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 34364927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Original strand, 48588491 - 48588644
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||| ||||    
T  48588491 gaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagagagacaccgcactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttacgggtcttcttacttat 48588590  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||||||    
T  48588591 aaggtgttcaacctttactattttatccgatgtcggacatagaactcacacttg 48588644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 29798357 - 29798201
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| || |||| |||||||||||||| ||||||| || |||||| |    
T  29798357 ggggaccgtctatatcgaggttagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttatccaagaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttact 29798258  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  29798257 tataaggtgttcaacctttactattttatccaatgtaggacatataactcacacttg 29798201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 58 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 37556260 - 37556101
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||| |||||| ||||||| ||    
T  37556260 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttat-ggtcctcttacttataagatg 37556162  T
Q  158 ttaaacctttact-cttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    || ||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  37556161 ttcaacctttactatttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 37556101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 64 - 215
Target Start/End: Original strand, 38804370 - 38804521
Alignment:
Q  64 cgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaac 163  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||| | |||||| |||||| ||||| |||    
T  38804370 cgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacactacactcttacccaaaaccttaaggttatgggtttatggatcctcttacttataatgtgttcaac 38804469  T
Q  164 ctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaa 215  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  38804470 ctttactcttttattcgatgtgggacgtataactcacacttgtaaacaacaa 38804521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 11977438 - 11977280
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || |||||| |    
T  11977438 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacttgcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtgctcttact 11977339  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||| ||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11977338 tataaggtgttcaacatttactgttttacccgatgtgggacatataactcacacttgta 11977280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 47 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 34364667 - 34364509
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    ||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||||| || | ||||||    
T  34364667 cagggaaccatccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttacggatcctctta 34364568  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34364567 cttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 34364509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 27 - 204
Target Start/End: Original strand, 50052001 - 50052178
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| |||||||||| |||||  |    
T  50052001 tgttgggtcacgaggggagctcgggggactgtccacatcgaggttagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaactttaagaaa 50052099  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||  |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  50052100 ataggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 50052178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 22077495 - 22077651
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||| ||||| | | |||||||| || |||  |||||||| | |||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| |    
T  22077495 ggggaccgtccatatcgatgcttgaacaaccgcataagtgagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggctacgagtttatgggtcctcttact 22077594  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22077595 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 22077651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 31767161 - 31767317
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||   |||||| ||||||||||||||||||| |  ||| |||||| |||||| |    
T  31767161 ggggaccgtccacatcgagtctagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcattaggttaatgggtcctcttact 31767260  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  31767261 tataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtggaacatataacccacacttg 31767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40082556 - 40082409
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||| |||||||||    
T  40082556 tccacatcgaggctagaacaaacgcacaagcaagagagataccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttat-gatcctcttacttataaggt 40082458  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  40082457 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 40082409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45084557 - 45084384
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||        
T  45084557 tgttgggtcatgagggaagcctgggggaccgtccgcatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacaccactctcttacccaaaaccttaa---- 45084462  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
      ||  |||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  45084461 --gacgttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggagatataactcacacttg 45084384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3550871 - 3550722
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||  |   ||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||| |||||    
T  3550871 accgtccacatcgaggctagaacaaccgta---gcaagagagacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttata 3550775  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3550774 aggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3550722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Original strand, 24600321 - 24600470
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| || ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||      
T  24600321 gtccacatcgaggctagaacaaccatactagcgagagagacaccacactcttacacaaaaccttaagacaatgagtttatgagttctcttacttataata 24600420  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  24600421 tgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 24600470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 34 - 197
Target Start/End: Original strand, 3875315 - 3875479
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtt 132  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||| | ||| || |||| ||||||||||||||||| |||    
T  3875315 tcatgaggggagctcggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagactccacattcttacctaaaaccttaaggcaatgggtt 3875414  T
Q  133 tatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 197  Q
    |||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3875415 tatgagtcctcttacttataaggtgtacaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataact 3875479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 81 - 205
Target Start/End: Original strand, 32594748 - 32594872
Alignment:
Q  81 cacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 180  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |    
T  32594748 cacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctg 32594847  T
Q  181 atgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||  |||||||||||||||||||    
T  32594848 atgtaggacatataactcacacttg 32594872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 14319025 - 14318875
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||| |    
T  14319025 ggggaccgtccacattgaggctagaacaaccgcacaaataagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatagatttatgggtcttcttact 14318926  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||    
T  14318925 tataaggtgttcaacctttactattttatccgacgtggaacatataactca 14318875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 57 - 197
Target Start/End: Original strand, 5528762 - 5528902
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||| || ||  ||||||||| | ||||   ||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||| |    
T  5528762 tccacatcgaggatagaacaaccgcataaagaagagagacgccacacatttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgagtcctcttatttataagat 5528861  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 197  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5528862 gttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 5528902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 27 - 201
Target Start/End: Original strand, 24131965 - 24132137
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| |||||||||| || |||| || |||| ||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||    
T  24131965 tgttgggtcatgaggggggctcaggagatcgtctacatcgaggctagaacaaccacactagtgagagagacaccacact--tacccaaa-ccttaaggca 24132061  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||| | |||||||||||||||    
T  24132062 atgagtttatggatccccttatttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgagggacatataactcaca 24132137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 39066201 - 39066356
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||| |||||| |||||||||  ||||| |    
T  39066201 ggggaccgtc-acatcaaggctagaacaaccacataagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaagacaatgattttatgggtcatcttagt 39066299  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| || |||||||||||  | ||||||||||||||||    
T  39066300 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtggaatatataactcacacttg 39066356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 27 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 9956090 - 9955911
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagcc-aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| |||| ||||| |||||||||  |||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||    
T  9956090 tgttgggtcacgaggagagcctaggggaccgctcacatcgaggctagagcaaccgcacaagcaagagagacatcacactcttacccaaaaccttaaggca 9955991  T
Q  126 atgagttt-atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac-tcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    ||  |||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  9955990 attggtttaatgggtcctcttacttataatgtgttcaacctttactttttttatctgatgtgggacatataactcacact 9955911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Original strand, 66476 - 66628
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||| | | |||| |||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| |||||    
T  66476 accgtccacattgaggctagaacaaccgcacaagcgagagagacgctatactcttacccaaaaccttaaggccatatgtttatggatcctcttacttata 66575  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  66576 aggtgttcaacctttacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 66628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 40 - 205
Target Start/End: Original strand, 45493965 - 45494135
Alignment:
Q  40 ggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||  |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||||||||| |||||| || ||||||| ||||||||||| |||||||| |    
T  45493965 ggggagctgggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccacataaggaagagagacaccacactcttatccaaaactttaaggcaatgggtttatggat 45494064  T
Q  140 --tct--cttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat-aactcacacttg 205  Q
      |||  ||||| |||| |||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  45494065 catcttacttatatatatggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataaactcacacttg 45494135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 30630648 - 30630794
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    ||||||||||  |||||||||||| |||  | || ||| |  ||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  30630648 cacatcgaggccagaacaaccacataagtgatagggacgccccactcttacccaaaactttaaggcaatgtgtttatgggttctcttacttataaagtgt 30630747  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||||||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30630748 caaacctttaattttttatccgatgtgagacatataaatcacacttg 30630794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 113 - 205
Target Start/End: Original strand, 41184489 - 41184581
Alignment:
Q  113 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41184489 aaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 41184581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 32168673 - 32168843
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagcc--aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    ||||||| |||  |||||||||  ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| ||||    
T  32168673 ttgttgggtcactaggggagccttaggggactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaacctcaagg 32168772  T
Q  124 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| |||||||||| ||||      ||||||||| |||||||||| ||||||||     | |||||||||||||||||||    
T  32168773 caatgggtttatgggtcctct------taaggtgttcaacctttactattttatcc-----gggacatataactcacacttg 32168843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 58 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37555878 - 37555733
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | |  ||||  ||| |||||| |||||| ||     
T  37555878 ccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctaaggattta-aggtcctcttacttataatgta 37555780  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    || |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  37555779 ttcaaccttcactattttatccgatgtgggacttataactcacactt 37555733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 29 - 205
Target Start/End: Original strand, 19283434 - 19283611
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    |||| |||||||||||| || |||||||  ||||||| ||| |||| ||||| ||||||  |||||||| | |||||| || ||||||||||||||| ||    
T  19283434 ttgggtcatgaggggagtcaaggggacctcccacatccaggctagagcaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggcgat 19283533  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| || |||| ||||| || ||| | |||||  ||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||    
T  19283534 gagtttatgtgtcctctcatttacaaagtgctcaacctccacttttctatccggtgtgggacatataactcacacttg 19283611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 182
Target Start/End: Original strand, 22077110 - 22077243
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || |||  || |||||   |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |    
T  22077110 ggggaccgtccacatcgaggcttgaacaaccgcataagtgagggagacgtcacactcttatccaaaaccttagggcaatgagtttatgggtcctcttact 22077209  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgat 182  Q
    |||||||| || |||||||||| || ||||||||    
T  22077210 tataaggtattcaacctttacttttctatccgat 22077243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 60 - 205
Target Start/End: Original strand, 66100 - 66245
Alignment:
Q  60 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 159  Q
    |||||||||  |||||||||| |||||   ||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  66100 acatcgaggccagaacaaccatacaagt--gagaggcgccacactcttacccaaaaccttaaggccataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtt 66197  T
Q  160 -aaacctttactcttttatccgatgtgagacat-ataactcacacttg 205  Q
     ||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  66198 caaacctttacttttctatccgatgtgagacatgattactcacacttg 66245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 3537228 - 3537303
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3537228 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3537303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Original strand, 22077818 - 22077984
Alignment:
Q  39 aggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||| | | |||||||| || |||  | |||||| | |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||    
T  22077818 aggggagcctggaggaccgtccacatcgatgcttgaacaaccgcataagtgaaagagacgccacactcttaccccaaacctta-ggctatgagtttatgg 22077916  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||| ||||||| |||| |||||||| | || |||||||| | | ||||||||||||||||||    
T  22077917 gtcctcttacttataagatgttcaacctttatttttctatccgatttaaaacatataactcacacttg 22077984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 57 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 5575252 - 5575110
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||| ||| || |||  |||||||| | |||||| || |||||||||||| || |||  ||||| ||| |||||| |||||||||    
T  5575252 tccacatcgaggctagaactacctcataag--agagagacgccacactcttatccaaaaccttaaagctatggatttataggtcctcttacttataaggt 5575155  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  5575154 gttcaacctttactcttctatccgacgtgggacatataattcaca 5575110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 59 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 45839779 - 45839617
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg- 157  Q
    ||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||| |   |||||||||  ||||| ||||||||||     
T  45839779 cacatcgaggccagaacaatcccacaagcaagagagacaccacaatcttacccaaaaccttaaggcattacatttatgggtcttcttacttataaggtgt 45839680  T
Q  158 ----ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
        || |||||||| | || ||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  45839679 tcgattcaaccttta-ttttctatccgatgtgggacatataactcatacttgtacacaacaaca 45839617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 44685551 - 44685458
Alignment:
Q  113 aaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt-aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| || ||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  44685551 aaacattaaggcaatgagtttattggtcctcttacttataaggttttcaaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 44685458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11977102 - 11977026
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| |||  ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  11977102 ggggaccgtccacatcgaggctagaactaccgcacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 11977026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 71 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 22793415 - 22793280
Alignment:
Q  71 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa-tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||||||||||||||| |||||||||   |||||| ||| ||||||| |||||||| || |||||||| | |||| | |||||| || || ||||| |||    
T  22793415 agaacaaccacacaagtaagagagacgtcacactcttactcaaaaccgtaaggcaaatgggtttatggatcctctcacttataaagttttcaacctctac 22793316  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | || ||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  22793315 ttttctatacgatgtgggacatataactcacacttg 22793280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 25 - 137
Target Start/End: Original strand, 50051664 - 50051776
Alignment:
Q  25 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    |||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||| ||| || |||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||     
T  50051664 tttgttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacatcgatgctagaacaac-acataaacaagagagacaccacactcttacgcaaaaccttaaga 50051762  T
Q  124 caatgagtttatgg 137  Q
     |||| ||||||||    
T  50051763 taatgggtttatgg 50051776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 87 - 170
Target Start/End: Original strand, 44043810 - 44043893
Alignment:
Q  87 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 170  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  44043810 caagagagacaccacactcttacccaaaatcttaagacaatgggtttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacatttact 44043893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Original strand, 1188571 - 1188744
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagcca--ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagt 131  Q
    ||||||||||||||   ||||||||  |||||| |||| ||| |||||||| |||  |||||||| | |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  1188571 tcatgaggggagcccttggggaccgcacacatctaggtcagagcaaccacataagtgagagagacgccacacttttacccaaaaccttaaagcaatgagt 1188670  T
Q  132 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| ||  ||| | ||||||  | || |||||  ||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||    
T  1188671 ttatgagtcttctcacttataaaatattcaacctccacttttctatccgatatggaacatataactcacacttg 1188744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000007
Query Start/End: Original strand, 24 - 205
Target Start/End: Original strand, 1187336 - 1187520
Alignment:
Q  24 ttttgttggatcatgaggggagcc--aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaa-gcaagagagacacgacactcctacccaaaacctta 120  Q
    ||||||||| | |||||||||||   ||||||||||||||||| |||| |||||||| | | || |  ||||||||   |||||  ||| ||||| ||||    
T  1187336 ttttgttgggtaatgaggggagctctaggggaccgtccacatctaggtcagaacaactataaaaagtgagagagacgtcacacttttactcaaaatctta 1187435  T
Q  121 aggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||||||||  ||| | ||||||  |||| |||||  ||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  1187436 aggtaatgagtttatgggtcttctcacttataaaatgtttaacctccacttttatattcgatgtgagacatataattcacacttg 1187520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 161 - 219
Target Start/End: Original strand, 35154151 - 35154209
Alignment:
Q  161 aacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  35154151 aacctttactcttttatctgatgtgggacatataactcacacttgcacacaacaacata 35154209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 60 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 4956340 - 4956218
Alignment:
Q  60 acatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacg--acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||||||||| | ||| | ||||||||||||| | |||  |||||  |||| ||||| |||  ||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||    
T  4956340 acatcgaggttaaagcaatcgcacaagcaagagatagacgtcacacttttacctaaaactttagagcaatgagtttatggatcctcttacttataagatg 4956241  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccg 180  Q
    || |||||||||| || ||||||    
T  4956240 ttcaacctttacttttctatccg 4956218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Original strand, 21378122 - 21378197
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| |||||| ||||||| | || |||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  21378122 gtttatgggtcctcttacttataagatattcaacctttactgttctatccgatctgggacatataactgacacttg 21378197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 47 - 89
Target Start/End: Original strand, 21378057 - 21378099
Alignment:
Q  47 caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaa 89  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  21378057 caggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaa 21378099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 10351278 - 10351202
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacct 165  Q
    |||||||| | |||||| ||||||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | |||||| ||||| |||||    
T  10351278 agagagacgccacactcttacccaaaatcttaaagtaatgtgtttatgggttctctcacttataaagtgttcaacct 10351202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 146 - 205
Target Start/End: Original strand, 50469178 - 50469237
Alignment:
Q  146 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| | ||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  50469178 atttataaagtgttcaacctttactttattatctgatgtaggacatataactcacacttg 50469237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 57 - 102
Target Start/End: Original strand, 31767047 - 31767092
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgaca 102  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||| |||||||||||||||    
T  31767047 tccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacacgaca 31767092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 100 - 136
Target Start/End: Original strand, 47380218 - 47380254
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  47380218 acactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatg 47380254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 75)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3670229 - 3670062
Alignment:
Q  38 gaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  3670229 gaggggagctagggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggaaataggtttatgg 3670130  T
Q  138 gttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3670129 gtcctcatacttataaggtgttaaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 3670062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 3669867 - 3669689
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  3669867 gttgggtcacgaggggagctagggggaccatccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaa 3669768  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3669767 tgagtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 3669689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 57 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 34835026 - 34834866
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||| |||||||||    
T  34835026 tccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgagtcatcttacttataaggt 34834927  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  34834926 gtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 34834866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 51 - 217
Target Start/End: Original strand, 3038292 - 3038458
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| |||    
T  3038292 ggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtccttttactta 3038391  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  3038392 taaagtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 3038458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Original strand, 45122067 - 45122213
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45122067 cacatcgaggctagaacaaccccacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaagaaaatgagtttatgggttctcttacttataaggtgt 45122166  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45122167 tcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacacttg 45122213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34835377 - 34835209
Alignment:
Q  40 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835377 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835278  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835277 tcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatcggatgtgggacatataactcacccttgta 34835209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 7e-49
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Original strand, 25561814 - 25561984
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctaccc-aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    |||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    |||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  25561814 aggggaccttccacatcgaggctagagcaaccacacaagcaagagagatgtcacactcttaccccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctctta 25561913  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
     |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  25561914 cttataaggtgttcaacgtttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgtagacaacaaca 25561984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 6876862 - 6877019
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||  |||||||    
T  6876862 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaaacaagagaaacaccacactcttacccaaaaccctaagacaatgagtgtatgggtcatcttatt 6876961  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagac-atataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  6876962 tataaggtgttcaacctttacttttttatccgatgtgggactatataactcacacttg 6877019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34835643 - 34835474
Alignment:
Q  40 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835643 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835544  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835543 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgta 34835474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 40 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 34835909 - 34835740
Alignment:
Q  40 ggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34835909 ggggagccagggggaccgtctacatcgaggctagaataaccacacaagcaagagtgacaccacactcttacccaaaactttaaggcaatgagtttatggg 34835810  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatc-cgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    | |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||  || ||| |||||||||||||| ||||||    
T  34835809 tcctcttacttataaggtgttaaacctttactattttatcgggacgtgggacatataactcacccttgta 34835740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 4e-47
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 20870549 - 20870731
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||    
T  20870549 ttgttgggtcatgaggggagccaggaggaccgtccatatcaaggttagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggc 20870648  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacacttg 205  Q
    | || |||||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||||  | | ||||||||||||||||    
T  20870649 agtgggtttatgggtcctcttacttataagatgttcaacctttactattttatctgatgtggaacatatataactcacacttg 20870731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 27 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 30441266 - 30441083
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccaggg-gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| ||||||||||| || ||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  30441266 tgttgggtcacgaggggagccaaggtgactgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 30441167  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttattta----taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||  |||||| |||    ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  30441166 atgggtttatgggccctcttacttataattaaggtgttcaacctttactattttagccgatgtgggacatataactcacacttg 30441083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 219
Target Start/End: Original strand, 33113359 - 33113537
Alignment:
Q  42 ggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggtt 140  Q
    |||||||| |||||||||| ||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  33113359 ggagccagagggaccgtccgcattgagcctagaacaaccacactagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgggtc 33113458  T
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    |||||| |||||||  ||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||  ||||||||||    
T  33113459 ctcttacttataagacgttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcaaacttgtacacaacaacata 33113537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 48 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 30359430 - 30359261
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||| ||| ||||||| |||| || ||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||      
T  30359430 agggaaccatccacattgaggctaaaacaacatcacaagaaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttgc 30359331  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  30359330 ttataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaaca 30359261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 30359763 - 30359598
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||  ||| ||||||| || |||||| |||||    
T  30359763 accgtccacatcgaagttagaacaaccgcataagtaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggttatgggtttatgagtcctcttacttata 30359664  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30359663 aggtgttcaacttttactcttttatctgatgtgagacatataactcacacttgtacacaacaacat 30359598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 147609 - 147441
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||  ||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  147609 ggggaccacccacatcaatgctagaactaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaactttaaggcaataggtttatgggtcctcttatt 147510  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||    
T  147509 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttacacgcaacaaca 147441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5916048 - 5915874
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    ||||||||||||  ||||||   |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  5916048 ttgttggatcattgggggagttcggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggca 5915949  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||| |||    |||||| |||||||| ||||||  |||||||| ||||  |||||||||||||||||||    
T  5915948 atgagtttatgggtcctc----ttataaagtgttaaa-ctttacatttttatccaatgtaggacatataactcacacttg 5915874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40518738 - 40518584
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||   |||||| |||||||||||||||| || || |||||||||| ||||||||||    
T  40518738 ggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacaagcaagagtgacgtcacactcttacccaaaaccttaagtcattgggtttatgggtcctcttattta 40518639  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||| |||||||||| || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  40518638 taaggtgttcaacctttacttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 40518584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 49 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 45122782 - 45122648
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| |    
T  45122782 ggggaccttccacatcgaggcttgaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaagacaatgagtttatgggtcctcttact 45122683  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatg 183  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  45122682 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatg 45122648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 37544469 - 37544662
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    ||||| ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||| | |||    
T  37544469 gttgggtcatgaggggaactcggggatcgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaagtaat 37544568  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatatt 221  Q
    |  ||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  37544569 ggatttatgggtcctctttcttataatgtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacttataactcacacttgtgcacaacaacatatt 37544662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9309512 - 9309357
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |   | ||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||| |||||| |    
T  9309512 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacatactga-gagagacaccacactcttacccgacaccttaaggcaatgagtttaagggtcctcttact 9309414  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9309413 tataaggtgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 9309357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 89; E-Value: 6e-43
Query Start/End: Original strand, 45 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9608907 - 9608747
Alignment:
Q  45 gccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 144  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||||  |||    
T  9608907 gccagggggccgtccacatcgaggctagaacaacctcactagcaagagagacgccacactcatacccaaaaccttaaggtgatgggtttatgggtcatct 9608808  T
Q  145 tatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||||||||| |||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  9608807 tacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatatgggacatataactcacacttg 9608747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6651652 - 6651510
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6651652 ggggaccatccacatcgaggttagaacaatcgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttatt 6651553  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
             || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6651552 ---------ttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcac 6651510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 37 - 182
Target Start/End: Original strand, 9483174 - 9483320
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  9483174 tgaggggagctatgggaaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacgagcaaaagagacaccacactcttacccaaaaccttaagacaatgggtttat 9483273  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgat 182  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  9483274 gggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgat 9483320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 52 - 200
Target Start/End: Original strand, 70277 - 70425
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttat 151  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||    
T  70277 gaccgtccgcattgaggttagaacaaccacacaagcaagatagacgtcacactcttacctaaaaccttaaggcagtgggtttatgggtcctcttacttat 70376  T
Q  152 aaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||| |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  70377 aagatgttcaacatttactcttttatccgatgtgggacatataactcac 70425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 1014253 - 1014401
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||||||||| |||||| || ||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  1014253 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaggagagacaccacactcttacccaaaactttaaggtaacgagtttacgggtcctcttacttataaggt 1014352  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||||||||||    
T  1014353 gttcaacctttactattttatctgatgtatgacatataactcacacttg 1014401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 205
Target Start/End: Original strand, 8918742 - 8918920
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    ||||||| ||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||   |||||| |||||||||||||||| ||    
T  8918742 ttgttgggtcacgaggggagct-ggggaccgtccacatcgaggttaaaacaaccacacacgcaagaaagacgtcacactcttacccaaaaccttaagtca 8918840  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||  |||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||    
T  8918841 ataggtttatgggtcctcttacttataaagtgttcaacctttactctgctatctgatgtgggacatgtaactcacacttg 8918920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 53 - 200
Target Start/End: Original strand, 9482608 - 9482755
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| || |||||| ||  ||||| ||| |||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  9482608 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagataccacactcttatacaaaatctttaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 9482707  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||    
T  9482708 aggtgttcaacctttactcttttatcccatgtggaacatataactcac 9482755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 6e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 40518229 - 40518071
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||| |  ||| |    
T  40518229 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaccacacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcattgggtttatgggtccatttact 40518130  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttac--tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||  | |||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  40518129 tataaggtgttcaacctttacttttttttatccaatgtggaacatataactcacacttg 40518071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 49 - 207
Target Start/End: Original strand, 1513915 - 1514073
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| | |||||||| || |||||  |||||||||||||||||  ||| ||||| |||| |||||| |    
T  1513915 ggggaccgtccacatcgaggctagaataaccccacatgtaagagagataccacacttttacccaaaaccttaaggttatgggtttaagggtcctcttact 1514014  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||    
T  1514015 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggatatataactcatacttgta 1514073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 55 - 205
Target Start/End: Original strand, 40579512 - 40579662
Alignment:
Q  55 cgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||| |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  40579512 cgtccacatcgaggatagaacaaccgtacaagcaatagagacaccacactcttacctaaaaccttaaagcaataagtttatgggtcctcttacttataag 40579611  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| |||||||||| |||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  40579612 gtgttcaacctttactattttatccaatatgaaacatataattcacacttg 40579662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 45121910 - 45122066
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||| |||||||| ||||| |||||| | |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||| |    
T  45121910 ggggaccttccacatcgaggcttgaataaccacacgagcaaaagagacgccacactgttacccaaaatcttaaggcaatgagtttatgagtcctcttact 45122009  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||| ||||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  45122010 tataaagtgttcaacctttactattttatgcgatgtgggacatataactcacacttg 45122066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 48 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6732054 - 6731906
Alignment:
Q  48 aggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttat 147  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6732054 aggggatcatccacatcgaggttagaacaaccgcataagcaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggcaatgaatttatgggttctcttac 6731955  T
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |         || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6731954 t---------ttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 6731906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 197
Target Start/End: Original strand, 18371970 - 18372142
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagggg--accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||  ||||| ||||| |||| |||| ||||| ||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||| ||    
T  18371970 tgttgggtcatgaggggagctcgggggaaccgttcacattgaggctagagcaaccgcacaagcgagagaaacaccacactcttacccaaaaccttaaagc 18372069  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 197  Q
    ||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  18372070 aatgagtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttattggatgtggtacatataact 18372142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 59 - 204
Target Start/End: Original strand, 32640542 - 32640682
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||  ||     |||    
T  32640542 cacatcgaggctagaacaatcacaaaagcaagagagacgcaacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatcggtcctcttaccta-----tgt 32640636  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  32640637 tcaacctttactcttttatccgatgtgagacagataactcacactt 32640682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 45123164 - 45123008
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc--tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctta 146  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||  |||  ||||||||||  |||||    
T  45123164 ggggaccgtccacatcgagattagaacaaccccacaaataagagagacaccacactctcttacccaaaaccttaagaaaataggtttatgggtcatctta 45123065  T
Q  147 tttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     |||  ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  45123064 ctta--aggtgtttaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 45123008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 57 - 205
Target Start/End: Original strand, 1013879 - 1014027
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||| || |||||||  |||||| ||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||| ||||| |||    
T  1013879 tccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtaaaagagacaacacactcttactcaaaactctaaggcaatgggtttattggtcctcttacttatagggt 1013978  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| ||| |||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  1013979 gttcaacttttactattttatccgatgtggaacatataactcacacttg 1014027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 8e-30
Query Start/End: Original strand, 52 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41972316 - 41972160
Alignment:
Q  52 gaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa---aaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||| ||| | |||||| |||||||   ||| ||| ||||||| |||||||||| || | | |    
T  41972316 gaccgtccatattgaggctggaacaaccacacaagcaagagtgacgccacactcttacccaacaaaactttatggcaatgggtttatgggtcctatcact 41972217  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41972216 tataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 41972160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 45121663 - 45121823
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||||||| |  |||||| ||| ||||||||||||||  |  |||||||| | |||||| ||||||||    
T  45121663 gtccacatcgaggctagaacaaccccataagtaagagagatatcacactcttactcaaaaccttaaggctgtaggtttatggatcctcttacttataagg 45121762  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    || | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||  ||||||||    
T  45121763 tgatcaacctttactcttttatccgatgtgggaca-acaactcacacttgtacacaacaaca 45121823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 51 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5420807 - 5420653
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    |||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  || |||||   |||||| |||  ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||    
T  5420807 ggacggtccacatcgaggcttgaacaaccacacaagtgagggagacgtcacactcttacaaaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttactta 5420708  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||| |||||||||| || ||||||||||| |||||||||  ||||||||    
T  5420707 taagatgttcaacctttactattctatccgatgtgggacatataatacacacttg 5420653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 35 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 41129161 - 41129067
Alignment:
Q  35 catgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 128  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||    
T  41129161 catgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggtttgaacaaccacacaagtaagagagacaccacactcatacccaaaaccttaagacaatg 41129067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 9309139 - 9308979
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactccta---cccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctctt 145  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |  |||||||||| ||||| ||    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  9309139 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacata-gtgagagagacaccacactactcttgcccaaaacctttaggcaatgggtttatgggtcctctt 9309041  T
Q  146 atttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacacttg 205  Q
    | ||||||  |||| ||| |||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||    
T  9309040 acttataacatgttcaacttttactcttttatctgatgtgtaggacatataactcacacttg 9308979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 59; E-Value: 5e-25
Query Start/End: Original strand, 58 - 203
Target Start/End: Original strand, 43398077 - 43398225
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctc---ttatttataag 154  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| || || ||| || | ||| || || ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||   |||||||||||    
T  43398077 ccacatcgaggttagagcaaccgcactagtaaaagaaacgccacattcttatccaaaactttaaggcaatgaatttatgggtcctcctcttatttataag 43398176  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43398177 gtgttcaacctttacttttctatccgatatgagatatataactcacact 43398225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 8e-24
Query Start/End: Original strand, 89 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 8794229 - 8794101
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    ||||||||||  |||||  |||||||||||||||  | |  ||||||| || |||||| ||||||| |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  8794229 agagagacaccgcactctcacccaaaaccttaagatattaggtttatgagtcctcttacttataagatgttcaacatttattcttttatccgatgtgaga 8794130  T
Q  189 catataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  8794129 catataactcacacttgtacacaacaaca 8794101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 217
Target Start/End: Original strand, 43274824 - 43274947
Alignment:
Q  94 gacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatat 193  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||  |||||||||| |||||| ||||||  | || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  43274824 gacaccacactcttactcaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcttacttataatatattcaacctttactcttttatctgatgtgaaacatat 43274923  T
Q  194 aactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| ||  ||||||||    
T  43274924 aactcacacttatacacaacaaca 43274947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 107 - 203
Target Start/End: Original strand, 18372992 - 18373085
Alignment:
Q  107 tacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||    
T  18372992 tacccaaaacct---ggcaatgagtttatgagtcctcttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgaagtgggacatataaatcacact 18373085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 125
Target Start/End: Original strand, 8919144 - 8919220
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||||||||    
T  8919144 ggggaccgtccacatcgaagctagaacaaccacacaagcaaaagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggca 8919220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 32305635 - 32305503
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  || ||| || | |||| | |||||| || |||||| ||||||| |||| |||||| |||  ||||| |    
T  32305635 ggggaccgtccacatcaaggttagaacaactgcataagtaataaagacgccacactcttatccaaaatcttaaggtaatgggtttataggtcttcttact 32305536  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccga 181  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  32305535 tataaggtgttcaacctttactattttatccga 32305503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Original strand, 4154694 - 4154822
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    |||||||||||||  ||||||| | |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| || | | |||||| ||||| |||||  ||| ||     
T  4154694 caaccacacaagc--gagagacgccacactcttacccaaaaccttggggcaatgagtttatgggtcctttcacttataaagtgttcaacctccacttttc 4154791  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  4154792 tatcagatgtgggacatataactcacacttg 4154822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 200
Target Start/End: Original strand, 18371637 - 18371807
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccagggg--accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||| |||||||| ||||  ||||  |||||||||||||| | |||| ||||| |||||   ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  18371637 tgttgggtcatgaggagagctcgggggaaccgtccacatcgaagctagagcaaccgcacaaatgagagacacaccacactcttacccaaaaccttaaggc 18371736  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
     ||| ||||||||||  ||||| |||     |||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18371737 -atgggtttatgggtcttcttactta----atgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcac 18371807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 49 - 128
Target Start/End: Original strand, 40579269 - 40579348
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatg 128  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  40579269 ggggacagtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcctaaggcaatg 40579348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 59 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 147968 - 147831
Alignment:
Q  59 cacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgt 158  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||         ||||| | |||    
T  147968 cacattgaggctagaacaactgcacaagtaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaataggtttatggg---------ttatatgttgt 147878  T
Q  159 taaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||| |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  147877 tcaacatttacttttttatcagatgtgggacatataactcacacttg 147831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 70 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 9609222 - 9609108
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||    
T  9609222 tagaacaaccacactagcaagagagacgccacactcttaccgaaaacattaaggcgatgggtttatgggtcatcttacttataagatgttcaacctttac 9609123  T
Q  170 tcttttatccgatgt 184  Q
    | || |||| |||||    
T  9609122 ttttctatctgatgt 9609108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 142 - 204
Target Start/End: Original strand, 18372349 - 18372411
Alignment:
Q  142 tcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18372349 tcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgagacatataactcacactt 18372411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 50 - 203
Target Start/End: Original strand, 18380020 - 18380171
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||   ||| |||||| ||| ||||||||||||| | || |||||| ||  | |||| ||    
T  18380020 gggactgtccacatcgaagctagaagaatcgcacaagcaagagg--caccacactcttactcaaaaccttaaggtagtgggtttataggcccccttactt 18380117  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacact 203  Q
    |||||||||| |||||||||| |||||| ||||||| || ||||||||||||||    
T  18380118 ataaggtgttcaacctttactattttattcgatgtgggatatataactcacact 18380171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 18372785 - 18372854
Alignment:
Q  135 tgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372785 tgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgtgacatataactcacactt 18372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 9620656 - 9620832
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||| |||   || ||||||||||||  |||||||||  | |||| ||   |||| ||||||||||    
T  9620656 gttgggtcacgaggggagcccgggggaccgtccacatccaggcctgagcaaccacacaagtgagagagacatcaaactcttat--aaaatcttaaggcaa 9620753  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| |||| | |||||| ||| | ||| | |||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  9620754 tgagtttatgggtcctctcacttataaagtgatcaacttctacttttctatctgttgtgagacatataactcacacttg 9620832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 197
Target Start/End: Original strand, 25561729 - 25561792
Alignment:
Q  134 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataact 197  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25561729 atgggtactcttacttataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataact 25561792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 56 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 9507933 - 9507819
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| | ||||||||| | |||  | |||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| ||||||||    
T  9507933 gtccacatcgaggcttgaacaaccatataagagatagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggtaatgggtttatgagtcctcttacttataagg 9507834  T
Q  156 tgttaaacctttact 170  Q
    | || ||||||||||    
T  9507833 tattcaacctttact 9507819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 7e-18
Query Start/End: Original strand, 130 - 200
Target Start/End: Original strand, 41416252 - 41416322
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  41416252 gtttatggatcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcac 41416322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 12284021 - 12283875
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| || ||||||||||||| |  |||||||||| ||  | ||| || |||| |     
T  12284021 ccacatagaggctagaacaaccacacaagtgagagagacactacactcttatccaaaaccttaagac-ttgagtttatgtgtcattttacttttaagata 12283923  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || ||| |||||| ||||||| || ||| ||||||||||| |||||||    
T  12283922 ttcaacatttacttttttatctgacgtgggacatataacttacacttg 12283875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 20130553 - 20130454
Alignment:
Q  102 actcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||| |||| |||||| |||||  ||| |||||||| |  ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20130553 actcttacctaaaaccgtaaggttatgggtttatggatcatcttactta-aaggtgttcaacttttactcttttatccgatgtgagacatatatctcaca 20130455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 128
Target Start/End: Original strand, 20995393 - 20995495
Alignment:
Q  27 tgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    |||||| ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||| |||  ||| ||||||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  20995393 tgttgggtcacgaggggagccagagggaccacccatatctaggccagagcaaccacacaagtgagagagacaccacattcttacccaaaaccttaaggca 20995492  T
Q  126 atg 128  Q
    |||    
T  20995493 atg 20995495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 100 - 207
Target Start/End: Original strand, 18372657 - 18372760
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| ||||||||||||   ||||||| ||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||| ||||||||||  ||  |||||||| |||    
T  18372657 acactcttacccaaaacct---ggcaatgggtttatgagtcctcttacttataag-tgttcaacctttactattttatccgaaatggaacatataaatca 18372752  T
Q  200 cacttgta 207  Q
    ||||||||    
T  18372753 cacttgta 18372760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 89 - 201
Target Start/End: Original strand, 4154321 - 4154432
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    |||||||||  |||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||| |||||  ||| || |||| |||||  ||    
T  4154321 agagagacatcacacacttacccaaaatattaaggcaatgagtttatggg-tctctcacttataaagtgttcaacctccacttttctatctgatgtagga 4154419  T
Q  189 catataactcaca 201  Q
    |||||||||||||    
T  4154420 catataactcaca 4154432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 49 - 113
Target Start/End: Original strand, 43274635 - 43274699
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaa 113  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||| || ||| ||||||||||| |||||| |||||||    
T  43274635 ggggaccgtccacatcgaggctggaacaaccccataagtaagagagacaccacactcatacccaa 43274699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Original strand, 3037969 - 3038016
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagac 96  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||    
T  3037969 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagatagagagac 3038016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 204
Target Start/End: Original strand, 3037776 - 3037865
Alignment:
Q  117 cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtg--agacatataactcacactt 204  Q
    |||||| ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  3037776 cttaagacaatgggtttatgagtcctcttacttataaggtgttcaacatttactatttcatccgatgtggaacatatataactcacactt 3037865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5274907 - 5274777
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttt 174  Q
    |||| |||||||| | |||||||  |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||  ||  |||||||| ||||| ||||| | || |||    
T  5274907 caacaacacaagcgatagagacatcacactcttactcaaaatcttaaggcaatgattttatgggtcttcccatttataaagtgttcaacctctccttttt 5274808  T
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| | ||||   |||||||||||| |||||    
T  5274807 tattcaatgtagaacatataactcatacttg 5274777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 163 - 204
Target Start/End: Original strand, 18372485 - 18372526
Alignment:
Q  163 cctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18372485 cctttactattttatccgatgtgggacatataactcacactt 18372526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 70 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 16524502 - 16524446
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16524502 tagagcaaccacacaagtaagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaagcaa 16524446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 115 - 170
Target Start/End: Original strand, 18373236 - 18373291
Alignment:
Q  115 accttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttact 170  Q
    |||||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18373236 accttaagacaatgggttaatggatcctcttatttataaggtgttcaacctttact 18373291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 150 - 205
Target Start/End: Original strand, 20995502 - 20995557
Alignment:
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| ||||| |||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20995502 ataaagtgttcaacctccacttttttatctgatgtgagacatataactcacacttg 20995557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 175 - 205
Target Start/End: Original strand, 18645713 - 18645743
Alignment:
Q  175 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18645713 tatccgatgtgagacatataactcacacttg 18645743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000004
Query Start/End: Original strand, 108 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 11442952 - 11442916
Alignment:
Q  108 acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 144  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  11442952 acccaaaaccttaaggcattgagtttatgggtcctct 11442916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 64)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 50 - 217
Target Start/End: Original strand, 36492218 - 36492385
Alignment:
Q  50 gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattt 149  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||| |||| |||||| ||| |||||| ||    
T  36492218 gggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaccacactcttatccaaaacctaaaggtaatgtgtttattggtcctcttactt 36492317  T
Q  150 ataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  36492318 ataaggtgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttgcaaacaacaaca 36492385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 205
Target Start/End: Original strand, 27502011 - 27502192
Alignment:
Q  25 tttgttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||| |||||||    
T  27502011 tttgttgggtcatgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggatagaacaaccacacaagcaagagagacaccacacttttaccaaaaatcttaagg 27502110  T
Q  124 caatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  27502111 caataggtttatgggtcctcttacttataaggtgtttaacctttactattttatccaatgtgggacatataactcacacttg 27502192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 7e-55
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 40296315 - 40296471
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  40296315 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 40296414  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  40296415 tataaggtgttcaaccttttctattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 40296471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6500621 - 6500453
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||     
T  6500621 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttaa 6500522  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6500521 aggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttg 6500453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 6500993 - 6500825
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  6500993 tgaggggagcctgggggaccgtccacatcgaggctagaataaccgcacaagtaagagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgagtttat 6500894  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||| || |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6500893 gggtccttttatttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtg-gacatataactcacacttg 6500825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 205
Target Start/End: Original strand, 18603108 - 18603276
Alignment:
Q  38 gaggggagccagggga-ccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  18603108 gaggggagccaggagaaccgtccacatcgaggctagaactaccacacaagcaagagagatgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatg 18603207  T
Q  137 ggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18603208 ggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgggacatataactcacacttg 18603276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Original strand, 3294993 - 3295170
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  3294993 gttggatcatgaggggagcgagggggactgtccacatcgaggctacaacaaccacacaaccaagagagacaccacactcatacccaaaacctcaaggcaa 3295092  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || ||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3295093 tgggtttatgggtcttcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatat-actcacacttg 3295170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 204
Target Start/End: Original strand, 3295323 - 3295498
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaa 126  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||| |||||||||||||||    
T  3295323 gttggatcatgaggggagtgagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccacacaagcaagagagacaacacactcttacc-aaaaccttaaggcaa 3295421  T
Q  127 tgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||||    
T  3295422 ttggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatat-actcacactt 3295498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 58 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 26074761 - 26074612
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  26074761 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtg 26074662  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    || |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  26074661 ttcaacctttactcttttatccgatatggaacatataactcacacttgta 26074612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35150185 - 35150009
Alignment:
Q  28 gttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    ||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||    
T  35150185 gttgggtcatggggggagcaaggggacggtccacattgaggttagaacaaccacactagtgagagagacaccacacttttacccaaaaccttaagacaat 35150086  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |  |||||||| ||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35150085 ggatttatggg-tctcttacttataaggtgttcaaccttgactcttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 35150009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 41170792 - 41170640
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  41170792 ggggaccgtctacaccgaggctagaacaaccacacaagcaagaaaaacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 41170693  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41170692 tataagatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcaca 41170640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 49 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 6224354 - 6224184
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||| || |||| |||| ||||| |||||||||  ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |    
T  6224354 ggggaccgtccatattgaggctagaccaaccgcacaagcaactgaggcaccacactcttaccaaaaaccttaaggcgatgagtttatgggtcctcttact 6224255  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacata 219  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  6224254 tataaggtgttcaacctttactcttttatccgaagtgggacatataactcacacttgtacacaacaacata 6224184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 56 - 217
Target Start/End: Original strand, 26075168 - 26075330
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataag 154  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||    
T  26075168 gtccacatcgaggctaaaacaaccacacttgcaagagagacgacacactctttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataag 26075267  T
Q  155 gtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||    
T  26075268 gtgttcaacctttactcttttatccgatgtgagacatataaatcacacttgtacacaacaaca 26075330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 39 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 41632950 - 41632784
Alignment:
Q  39 aggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatggg 138  Q
    ||||||||  |||||||||||||||||||  || ||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||| || |||||||||    
T  41632950 aggggagctgggggaccgtccacatcgagactaaaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaagcattgggtttatggg 41632851  T
Q  139 ttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||| |||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  41632850 tcctcttacttataaggtgttcaacctttacttttctatccgatgtgagacatataacttacacttg 41632784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 15370257 - 15370101
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||  ||||||||| |||||| |    
T  15370257 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaatcccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggctgtggatttatgggtcctcttact 15370158  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||| |||| |||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  15370157 tataagatgttcaacctttactattttattcgatgtgggacatataactcacacttg 15370101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 37 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25328106 - 25327938
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||    
T  25328106 tgaggggagctcgggggaccgtccacattgaggctagaacaaccacacttgcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttat 25328007  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  25328006 gggtcctcttacttataaggtgttcaacttttactgttttatccgatgtaggacatataactcacactt 25327938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 32487551 - 32487396
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||   |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  32487551 ggggaccatccacatcgaggctagaacaaccacataagcaagagatacgtcacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 32487452  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32487451 tat-aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 32487396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 23 - 205
Target Start/End: Original strand, 13415734 - 13415916
Alignment:
Q  23 attttgttggatcatgaggggagcca-ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 121  Q
    |||||||||| |||  |||||||||| |||||||| |||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||    
T  13415734 attttgttgggtcaccaggggagccacggggaccg-ccatttcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaa 13415832  T
Q  122 ggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13415833 ggtaataggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactaatttatccgatgtgggacatataactcacacttg 13415916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 4e-44
Query Start/End: Original strand, 34 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 299664 - 299491
Alignment:
Q  34 tcatgaggggagc--caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagt 131  Q
    |||||||||||||  | |||||| ||||||||||| | ||||||||||  |||||||| |||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||    
T  299664 tcatgaggggagctccgggggactgtccacatcgatgctagaacaaccgtacaagcaatagagacgccacactcttacacaaaaccttaaggctatgagt 299565  T
Q  132 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  299564 ttatgggtcatcttacttataaggtgttcaacctttactgttttatccgatgtgggacatataactcacacttg 299491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Original strand, 26074155 - 26074302
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtg 157  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||  ||| |||||    
T  26074155 ccacatcgaggttagagcaaccacactagtgagagagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggttcatgggtcctcttacatatgaggtg 26074254  T
Q  158 ttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26074255 ttcaacctttacttttttatccgatgtgtgacatataactcacacttg 26074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 222
Target Start/End: Original strand, 42405598 - 42405769
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||| || || ||| |    
T  42405598 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagaga--caccacactcttacccaaaaccttaaggcattaggtttatgagtccttttact 42405695  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacatattt 222  Q
    | ||||||||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||    
T  42405696 tgtaaggtgttcaacctttactattttatccgatgttggacatataactcacacttgtacacaacaacagattt 42405769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 34753029 - 34753194
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||    
T  34753029 accgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaaccttaaggcaatcggtttatgggtcttcttacttata 34753128  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||||| ||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||  |||||||||    
T  34753129 aggtgttcaacttttacttttctatccaatgtgggacatataacttacatttgtacacaacaacat 34753194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 82; E-Value: 9e-39
Query Start/End: Original strand, 29 - 201
Target Start/End: Original strand, 9498634 - 9498806
Alignment:
Q  29 ttggatcatgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaat 127  Q
    |||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||| || |||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  9498634 ttgggtcacgaggggagctagggggaccgtccacattgaggctagaccagc-acataaacaagagagacaccacactcttacccaaaatcttaaggcaat 9498732  T
Q  128 gagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcaca 201  Q
    | |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  9498733 gggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactattctatctgatgtgagacatataactcaca 9498806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 53 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 624350 - 624198
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  624350 accgtccacatcgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttacccaaaacctcaaggctatgggtttatgggtcatcttacttata 624251  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||||| |||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||    
T  624250 acgtgttcaacctttactattttatacaatgtgggacatataactcacacttg 624198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 12662652 - 12662808
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| || ||| |||||| ||||||||| |||||| |||||  |||||||||| ||||| |    
T  12662652 ggggaccgaccacatcgaggctagaagaaccccacaagcaagaaaggcaccacactcttacccaaaaacttaagacaatggatttatgggttttcttact 12662751  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||  |||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  12662752 tataaaatgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 12662808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 207
Target Start/End: Original strand, 1028504 - 1028675
Alignment:
Q  37 tgaggggagccagggg-accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||  ||  ||||||    
T  1028504 tgaggggagctagggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccgcacaagtgagagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggttataggtttat 1028603  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||| |||||| |||||| ||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1028604 gggtcctcttacttataaagtgttcatcctttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttgta 1028675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 200
Target Start/End: Original strand, 11416977 - 11417128
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||| | |||||||| | ||||||||||||||| |  |||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||| | |||||| |    
T  11416977 ggggaccatccacatcgaagctagaacaatcccacaagcaagagagagatcacactcttacacaaaaccttaaggcaatgggtttatggatcctcttact 11417076  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcac 200  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11417077 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtggaacatataactcac 11417128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 6e-37
Query Start/End: Original strand, 37 - 205
Target Start/End: Original strand, 36568556 - 36568723
Alignment:
Q  37 tgaggggagc-caggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttat 135  Q
    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||     
T  36568556 tgaggggagctcgggggaccttccacatcgaggatagaacaaccacacaag--agagagacgccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttac 36568653  T
Q  136 gggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||  ||| | |||||||||||| ||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  36568654 gggtcatctcacttataaggtgttcaacttttacttttctatccgatgtgggacatataactcacacttg 36568723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 53 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 33747925 - 33747783
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||| || ||| ||||||||||| |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||| |||||    
T  33747925 accgtccacatcaaggctagaacaaccgcataaggaagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgagtttatggatcctcttacttata 33747826  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataa 195  Q
    | || || |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33747825 aagtatttaacctttactattttatccgatgtgggacatataa 33747783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 623976 - 623820
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |   |||| |    
T  623976 ggggaccgtctacattgaggctagaacaaccccacaagtgagagagacaccacactcttactcaaaaccttaaggctataagtttatggctcaacttact 623877  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||| ||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  623876 tgtaaagtgttcaacctttactattatatccgatgtgagacatataactcacacttg 623820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 9e-33
Query Start/End: Original strand, 35 - 181
Target Start/End: Complemental strand, 15370575 - 15370428
Alignment:
Q  35 catgaggggagccagg-ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagttt 133  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| | |||||| ||| |||||||||||||| ||| ||||    
T  15370575 catgaggggagcatggaggaccgtccacatcgaggctagaacaaccccacaaacaagagagacgccacactcttacgcaaaaccttaaggctatgggttt 15370476  T
Q  134 atgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccga 181  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||| ||| ||||||    
T  15370475 atgggtcctcttacttataaggtgttcaacatttactgtttcatccga 15370428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 5e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 205
Target Start/End: Original strand, 24489167 - 24489360
Alignment:
Q  11 gaaaggtacaatattttgttggatcatgaggggagccag-gggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctac 109  Q
    ||||||||| | | |||||||| ||| |||||||| | | ||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||| || |||||| | |||||| |||    
T  24489167 gaaaggtactaaagtttgttgggtcacgaggggagtctgagggaccgcccacatcgagactagaacaaccgcacaagtaaaagagacgccacactcttac 24489266  T
Q  110 ccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||||| |||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||| ||||||| || || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  24489267 gcaaaatcttaaggcaatgggtttatgggt--tcttactaataaggtgtttaaccttttcttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 24489360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2411165 - 2411010
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||  |||| || ||||| || |||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  2411165 ggggaccgtccatatcgaggttagaacaatcattcaagtaatagagaaactacactcttactcaaaaccttaaggcaataagtttatgggttctcttact 2411066  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    || ||| |||| ||| ||||||  | ||||| ||||  ||||||||||||||||||    
T  2411065 tacaagatgttcaacttttacttctctatccaatgtaggacatataactcacactt 2411010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 70 - 205
Target Start/End: Original strand, 5723812 - 5723947
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttac 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| |||| | || |||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||||     
T  5723812 tagaacaaccgcacaagcaagagagacactatactctttcccaaaaccttaagacaataaattaatgggttctcttacatataatgtgttcaacttttat 5723911  T
Q  170 tcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5723912 tattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 5723947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 75 - 217
Target Start/End: Original strand, 26074807 - 26074950
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacgacactcct-acccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 173  Q
    |||||||||  ||||||||||| | |||||| | ||||||||||||||| ||||  |||||||||| ||| || |||||  ||||| |||||||||||||    
T  26074807 caaccacacttgcaagagagacgccacactctttacccaaaaccttaagacaataggtttatgggtcctcctacttatattgtgttcaacctttactctt 26074906  T
Q  174 ttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  26074907 ttatccgatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaaca 26074950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 57 - 170
Target Start/End: Original strand, 26590918 - 26591031
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||| | |||||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| | |||||| |||||||||    
T  26590918 tccacatcgaggttagaacaaccacactagtgagagagacgccacactcttactcaaaaccttaaggcattgaatttatggatcctcttacttataaggt 26591017  T
Q  157 gttaaacctttact 170  Q
    ||| ||||||||||    
T  26591018 gttcaacctttact 26591031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 72 - 205
Target Start/End: Original strand, 29549278 - 29549411
Alignment:
Q  72 gaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactc 171  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| |||||| | ||||||||     
T  29549278 gaacaaccacataagcaagagagacgccacactcttatccaaaaccttaaggtaatgtgtttatgggtcttcttacttatatggtgttcatcctttacta 29549377  T
Q  172 ttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  29549378 ttttatctgatatggaacatataactcacacttg 29549411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 8e-27
Query Start/End: Original strand, 25 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 35915031 - 35914838
Alignment:
Q  25 tttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggc 124  Q
    |||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||| |||||| || ||| || | |||||||||||| || ||| || || |||| |  ||| |||    
T  35915031 tttgttgggtcatgagcggagctgggggaccgtccacattgaggtttgaccaatcatataagcaagagagataccacattcttatccaataatttagggc 35914932  T
Q  125 aatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||  |||| ||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||  |||||||||    
T  35914931 aatggatttacgggtcttcttacttataaaatgttcaacctttactcttttatccgatgtgtgacatataactcatacttatacacaacaacat 35914838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 217
Target Start/End: Original strand, 35167838 - 35168006
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||| ||||||||||| | |||||||||||||| ||   ||||||||  |||||| |||| ||||| | ||||||||   |||||||||  || || |    
T  35167838 ggggacagtccacatcgatgctagaacaaccacactagtgtgagagacatcacactcttaccaaaaacatcaaggcaatagatttatgggtcatcctact 35167937  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| |||||||  ||||||||    
T  35167938 tataaggtgttcaacctttactcttttatctgatgtgagatacataactcatacttgtacacaacaaca 35168006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 217
Target Start/End: Original strand, 41635169 - 41635359
Alignment:
Q  26 ttgttggatcatgaggggagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggca 125  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| || ||||||||  | | |||| |||||| ||||| || ||||| || |||||| |||| ||||  ||||| ||    
T  41635169 ttgttggatcatgaggggagtgaggg-acagtccacattaaagatagagcaaccatacaagtaaaagagatactacactcttacctaaaattttaagaca 41635267  T
Q  126 atgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    |||  ||||||| | ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||| |||| ||  ||||||||    
T  41635268 atggatttatggatcctcttatttataaggtgttcaacatttactcttttatctgatgggaaacatataactcatacttatacacaacaaca 41635359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 57 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 38427697 - 38427553
Alignment:
Q  57 tccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||   |||||| ||| |||||||||||| |||||  || |||||| ||| || ||||||| |    
T  38427697 tccacatcgaggttagaacaaccgcacaagtgagagagacgtcacactcttacacaaaaccttaagacaatggattaatgggtcctc-tacttataagat 38427599  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    ||| |||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  38427598 gttcaacctttacttttctatccaatgtgggacatataactcacac 38427553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 301107 - 300959
Alignment:
Q  51 ggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttattta 150  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||||        |||| |||||||| |||    
T  301107 ggaccgttcacgtcgagacttgaacagccacacaagcaagagagacaccacactcttaccaaaaatcttaaggca--------atggattctcttactta 301016  T
Q  151 taaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||||| || |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  301015 taaggtattcaacctttactgttttatctgatgtgggacatataacccacacttgta 300959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 49 - 121
Target Start/End: Original strand, 26900017 - 26900089
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaa 121  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  26900017 ggggaccgtccacatcaaggctagaacaaacccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaccttaa 26900089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42508707 - 42508612
Alignment:
Q  112 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| || |||||| |||| || |||| |||||||||| || ||||||||||| || |||||| |||||||||||    
T  42508707 aaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctcttacttattagatgtttaacctttacttttctatccgatgtgggatatataattcacacttgta 42508612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 112 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 31509718 - 31509625
Alignment:
Q  112 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31509718 aaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccgatgtgagacatataactcacacttg 31509625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 205
Target Start/End: Original strand, 36521947 - 36522052
Alignment:
Q  100 acactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactca 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||| |  ||||| |||||  ||| || |||| |||||| |||||||||||||    
T  36521947 acactcttacccaaaaccttaaggcaattggtttatgggtcctctcatttaaagagtgttcaacctcaacttttctatctgatgtgggacatataactca 36522046  T
Q  200 cacttg 205  Q
    ||||||    
T  36522047 cacttg 36522052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 49 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 38427377 - 38427306
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctta 120  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||||| ||||    
T  38427377 ggggaccgccaacatcgaggttagaacaaccgcacaagcaagagagacgccacactcttacccaaaatctta 38427306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 141 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 39309750 - 39309684
Alignment:
Q  141 ctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  39309750 ctcttatttataatgtgttcaacatttacccttttatccgatgtgggacatataactcatacttgta 39309684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 25 - 123
Target Start/End: Original strand, 13785607 - 13785706
Alignment:
Q  25 tttgttggatcatgaggg-gagccaggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    |||||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| | ||||| |||| |||||  |||  ||||||||||||    
T  13785607 tttgttgggtcatgaaggagagtcaggggaccgtccacatcgaagttagaacaaccatacaaacgagagaaacaccacacttttacttaaaaccttaagg 13785706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 26074395 - 26074320
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| || ||||| | || |||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26074395 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaatctttagttttctatctgatgtgggacatataactcacacttg 26074320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 204
Target Start/End: Original strand, 36522277 - 36522392
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgaga 188  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||| ||| |||| | ||||||  |||| ||| |  | | || ||||| ||||||||    
T  36522277 agagagacaccacactcttacccaaaaccttaagataatgggtttattggtcctctcacttataaaatgttcaacttccatttttctatccaatgtgaga 36522376  T
Q  189 catataactcacactt 204  Q
    ||||||||||||||||    
T  36522377 catataactcacactt 36522392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 42524811 - 42524717
Alignment:
Q  112 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgta 207  Q
    |||||||| || |||||  |||||| || |||||||| ||||| |||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  42524811 aaaaccttcagacaatggatttatgagtcctcttattcataagatgttcaac-tttacttttctatccgatgtgagacatataattcacacttgta 42524717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 132 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 7768925 - 7768852
Alignment:
Q  132 ttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||  || ||||||||||||||||    
T  7768925 ttatgggtccttttacttataaggtgttcaacctttattattttatccgatgtaggatatataactcacacttg 7768852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 71 - 123
Target Start/End: Original strand, 795254 - 795306
Alignment:
Q  71 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaagg 123  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||    
T  795254 agaacaaccgcacaagcaagagagacaccacactcttacctaaaaccttaagg 795306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 31509857 - 31509745
Alignment:
Q  82 acaagcaagagagacacgacactcctacccaaaa-ccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccg 180  Q
    |||||| |||||||||| ||| || |||| |||| ||| ||||||||||||||||| || |||| | |||||| ||| | |||||  ||| || ||||||    
T  31509857 acaagcgagagagacaccacattcttaccaaaaaacctcaaggcaatgagtttatgagtcctctcacttataaagtgctcaacctccacttttctatccg 31509758  T
Q  181 atgtgagacatat 193  Q
    |||||||||||||    
T  31509757 atgtgagacatat 31509745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 89 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 13042657 - 13042607
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggt 139  Q
    |||||||||| |||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13042657 agagagacaccacactcttatccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggt 13042607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 53 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24489635 - 24489582
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcc 106  Q
    ||||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  24489635 accgttcatatcgaggttagaacaactgcacaagcaagagagacaccacactcc 24489582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 148 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6225103 - 6225047
Alignment:
Q  148 ttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacactt 204  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| || |||||||||| ||||    
T  6225103 ttataaggtgttcaacctttattcttttatctgatgtgggatatataactcagactt 6225047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35150789 - 35150749
Alignment:
Q  165 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35150789 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 35150749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 35151080 - 35151040
Alignment:
Q  165 tttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  35151080 tttactcttttattcgatgtgggacatataactcacacttg 35151040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 70 - 136
Target Start/End: Original strand, 9498344 - 9498410
Alignment:
Q  70 tagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatg 136  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| | |||||| ||| ||||  |||||||||||| |||||||    
T  9498344 tagaacaaccacacttgcaagagagacgccacactcttactcaaatgcttaaggcaatgggtttatg 9498410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 71 - 137
Target Start/End: Original strand, 36527117 - 36527183
Alignment:
Q  71 agaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgg 137  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||  |||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||    
T  36527117 agaacagccacacaagtgagagagacagcacactcttatccaaaatcttaaggcaatgcgtttatgg 36527183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 160 - 217
Target Start/End: Original strand, 26900081 - 26900138
Alignment:
Q  160 aaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaaca 217  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| | |||||  ||||||||    
T  26900081 aaaccttaactcttttatctgatgtgggacatataactcaaatttgtacacaacaaca 26900138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 111 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 34103650 - 34103617
Alignment:
Q  111 caaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctct 144  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  34103650 caaaaccttaaggcaatgagtttatgagttctct 34103617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702 (Bit Score: 106; Significance: 4e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0702
Description:

Target: scaffold0702; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 49 - 206
Target Start/End: Original strand, 514 - 671
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |    
T  514 ggggaccttccacatcgaggctagaaaaaccactcaagcaagaaagacaccacactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctcttact 613  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  614 tataaggtgttcaacctttactcttttaaccgatgtgggacatataactcacacttgt 671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0702; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Original strand, 147 - 298
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||| ||| ||| |||   ||| |||||||| | |||||| |    
T  147 ggggaccgtccacatcgaggctagaacaaccactcaagcaagagagacaccacattcttacctaaa-cctaaagt--atg-gtttatgg-tcctcttact 241  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  242 tataaggtgttcaacctttactattttatccgatgtgggacatataactcacacttg 298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391 (Bit Score: 98; Significance: 3e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0391
Description:

Target: scaffold0391; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 53 - 218
Target Start/End: Original strand, 1110 - 1275
Alignment:
Q  53 accgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| || || ||  |||||    
T  1110 accgtccacatcgaggctagaacaaccacataaacaagagagacaccatactcttacccaaaaccttaaggcaatgggtttatgagtcctttttcttata 1209  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgtaagcaacaacat 218  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1210 aggtgttcaacctttactcttttatccaatgtgggacatataactcacacttgtacacaacaacat 1275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 89 - 159
Target Start/End: Original strand, 1731 - 1801
Alignment:
Q  89 agagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgtt 159  Q
    |||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  1731 agagagacaccacactcttaccaaaaaccttaaggcaatgggtttatgggtcctctcacttataaggtgtt 1801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0391; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 156 - 202
Target Start/End: Original strand, 3092 - 3138
Alignment:
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacac 202  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3092 tgttcaacctttactcttttatccgatgtgggacatataactcacac 3138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 49 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 47518 - 47362
Alignment:
Q  49 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatt 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |  |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |    
T  47518 ggggaccgtccacatcgaggttagaacaaccgcgcaagcaagagagacaccacatttttacccaaaactttaaggcaatgggtttatggattctcttact 47419  T
Q  149 tataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||| || ||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  47418 tataaggtgttcaaactttactattttatcggatgtgagacatttaattcacacttg 47362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 56 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5133 - 4984
Alignment:
Q  56 gtccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataagg 155  Q
    ||||||||||||| |||| ||||| || |||| |||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  | ||| |||||||     
T  5133 gtccacatcgaggctagagcaaccgcataagcgagagagacaccacactcttacccaaaaccataaggcaatgagtttatgggtctttttacttataaga 5034  T
Q  156 tgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    | ||||||||||||| || | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5033 tattaaacctttactgttctctccgatgtgagacatataattcacacttg 4984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 87 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5477 - 5359
Alignment:
Q  87 caagagagacacgacactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtga 186  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||     
T  5477 caagagagacaccacactcttatccaaaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacctttactgttctatccgatgtgg 5378  T
Q  187 gacatataactcacacttg 205  Q
     ||||||||||||||||||    
T  5377 aacatataactcacacttg 5359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734 (Bit Score: 77; Significance: 9e-36; HSPs: 2)
Name: scaffold0734
Description:

Target: scaffold0734; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 9e-36
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5546 - 5398
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaacctt-aaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggt 156  Q
    ||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||  |||||| |||||||||    
T  5546 ccacatcgaggcttgaacaaccccacaagcaagagagacaccacactcttacccaaaaactttaagacaatatgtttatgggccctcttacttataaggt 5447  T
Q  157 gttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  5446 gttcaacctttactattttatccgatgtaggacatataactcacacttg 5398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0734; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 58 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 5931 - 5779
Alignment:
Q  58 ccacatcgaggttagaacaaccacacaagcaagagagacacgacactcctacccaaaac-----cttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttata 152  Q
    ||||||||| ||| |||||||| |||||| || |||||||| |||||| ||| |||||      |||||||||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  5931 ccacatcgaagtttgaacaaccccacaagtaaaagagacaccacactcttactcaaaatttaatcttaaggcaatgggtttatgggtcctcttacttata 5832  T
Q  153 aggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5831 aggtgttcaacctttactattttatccgatgtgcgacatataactcacacttg 5779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 112 - 205
Target Start/End: Original strand, 17519 - 17612
Alignment:
Q  112 aaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  17519 aaaaccttaaggctatgggtttatgggtcctcttacttacaaggtgttcaacctttactattttatctgatgtgtgacatataactcacacttg 17612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0504 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0504
Description:

Target: scaffold0504; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 130 - 206
Target Start/End: Original strand, 10192 - 10268
Alignment:
Q  130 gtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactcttttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 206  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10192 gtttatgggtcctcttacttataaggtgttcaacttttaccattttatccgatgtgagacatataactcacacttgt 10268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 75 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 39588 - 39459
Alignment:
Q  75 caaccacacaagcaagagagacacga-cactcctacccaaaaccttaaggcaatgagtttatgggttctcttatttataaggtgttaaacctttactctt 173  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||||  |||||||||| |||||||||   |||||| | | |||| | |||||||| ||| |||||  ||| ||    
T  39588 caaccacacaagcaagagagacgccaacacttttacccaaaac-ttaaggcaacatgtttatagttcctctcacttataaggagttcaacctccactttt 39490  T
Q  174 ttatccgatgtgagacatataactcacacttg 205  Q
     ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  39489 ctatgcg-tgtgagacatataactcacacttg 39459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University