View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1550_high_12 (Length: 205)

Name: NF1550_high_12
Description: NF1550
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1550_high_12
NF1550_high_12
[»] chr6 (37 HSPs)
chr6 (1-156)||(11450304-11450460)
chr6 (1-152)||(34127700-34127853)
chr6 (1-156)||(7022020-7022176)
chr6 (1-156)||(34023341-34023498)
chr6 (1-156)||(12698696-12698853)
chr6 (1-156)||(24130043-24130200)
chr6 (1-152)||(2660641-2660794)
chr6 (1-156)||(15469292-15469448)
chr6 (1-178)||(8560628-8560808)
chr6 (1-156)||(23258753-23258910)
chr6 (1-152)||(26468651-26468804)
chr6 (5-154)||(9078857-9079008)
chr6 (1-154)||(24635271-24635426)
chr6 (1-143)||(16461220-16461365)
chr6 (1-125)||(12996488-12996613)
chr6 (1-124)||(11450449-11450573)
chr6 (1-93)||(12698584-12698677)
chr6 (1-109)||(24130204-24130313)
chr6 (1-124)||(2660783-2660907)
chr6 (1-124)||(7021907-7022031)
chr6 (1-100)||(9079024-9079124)
chr6 (1-124)||(15469179-15469303)
chr6 (1-100)||(23258923-23259024)
chr6 (1-124)||(26468538-26468662)
chr6 (1-110)||(16461368-16461478)
chr6 (1-128)||(7536546-7536675)
chr6 (1-94)||(8560515-8560609)
chr6 (1-140)||(14882977-14883117)
chr6 (1-133)||(13405298-13405432)
chr6 (1-124)||(34023487-34023611)
chr6 (1-88)||(14883142-14883231)
chr6 (1-100)||(24635439-24635539)
chr6 (1-100)||(34127587-34127687)
chr6 (1-124)||(12996373-12996499)
chr6 (1-99)||(10290547-10290647)
chr6 (1-100)||(23259037-23259137)
chr6 (19-100)||(31968960-31969044)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (1-184)||(29125815-29126000)
chr3 (1-179)||(11231931-11232111)
chr3 (1-152)||(32270722-32270876)
chr3 (1-152)||(44254404-44254557)
chr3 (1-156)||(28952191-28952348)
chr3 (1-152)||(16908622-16908775)
chr3 (1-152)||(35083995-35084148)
chr3 (1-156)||(50527433-50527590)
chr3 (1-156)||(52202184-52202341)
chr3 (1-179)||(22729422-22729602)
chr3 (1-178)||(49656989-49657168)
chr3 (1-156)||(1092677-1092834)
chr3 (1-156)||(12251307-12251464)
chr3 (1-156)||(25246137-25246294)
chr3 (1-152)||(27742688-27742841)
chr3 (1-156)||(21259120-21259277)
chr3 (7-151)||(7160208-7160354)
chr3 (9-156)||(44205510-44205658)
chr3 (1-156)||(18163807-18163963)
chr3 (1-152)||(36633689-36633835)
chr3 (1-104)||(13594725-13594830)
chr3 (10-152)||(52571236-52571380)
chr3 (1-151)||(45045412-45045563)
chr3 (1-100)||(21259290-21259391)
chr3 (1-124)||(11232100-11232224)
chr3 (1-124)||(12251453-12251577)
chr3 (1-124)||(32270865-32270989)
chr3 (1-124)||(44254546-44254670)
chr3 (1-124)||(49657157-49657281)
chr3 (1-124)||(22729309-22729433)
chr3 (1-128)||(31174500-31174629)
chr3 (1-124)||(52202071-52202195)
chr3 (1-144)||(4618240-4618382)
chr3 (1-110)||(29126003-29126113)
chr3 (1-110)||(36633576-36633686)
chr3 (8-100)||(16908788-16908881)
chr3 (1-124)||(1092823-1092947)
chr3 (1-124)||(13594819-13594943)
chr3 (1-124)||(35083882-35084006)
chr3 (1-124)||(49169882-49170006)
chr3 (1-124)||(50527579-50527703)
chr3 (1-100)||(27742575-27742675)
chr3 (1-124)||(28952337-28952461)
chr3 (1-100)||(52571394-52571494)
chr3 (1-58)||(744056-744112)
chr3 (1-46)||(49169995-49170040)
chr3 (1-114)||(34660835-34660949)
chr3 (18-128)||(2618989-2619102)
chr3 (1-100)||(21259404-21259504)
chr3 (72-128)||(18657979-18658035)
chr3 (7-124)||(45045304-45045423)
chr3 (72-152)||(49170172-49170252)
chr3 (1-46)||(18657930-18657975)
[»] chr4 (68 HSPs)
chr4 (1-179)||(31663943-31664123)
chr4 (1-178)||(11650743-11650922)
chr4 (1-178)||(13612869-13613048)
chr4 (1-178)||(18491389-18491568)
chr4 (1-178)||(44134695-44134874)
chr4 (1-156)||(12700367-12700524)
chr4 (1-156)||(38141356-38141513)
chr4 (1-178)||(16925308-16925487)
chr4 (1-178)||(31581527-31581706)
chr4 (1-156)||(52581658-52581816)
chr4 (1-154)||(43564620-43564775)
chr4 (1-178)||(13233432-13233611)
chr4 (1-148)||(41832579-41832728)
chr4 (1-156)||(44745389-44745546)
chr4 (1-154)||(19653446-19653601)
chr4 (1-156)||(36584625-36584782)
chr4 (1-148)||(2654717-2654866)
chr4 (1-156)||(22647313-22647470)
chr4 (1-148)||(36954817-36954966)
chr4 (1-152)||(40228233-40228386)
chr4 (1-178)||(6756031-6756209)
chr4 (1-152)||(51001565-51001717)
chr4 (1-148)||(50767236-50767385)
chr4 (1-152)||(54795532-54795685)
chr4 (1-142)||(10096270-10096412)
chr4 (80-178)||(45670168-45670266)
chr4 (1-152)||(27270555-27270708)
chr4 (2-150)||(4632509-4632659)
chr4 (1-124)||(41832465-41832590)
chr4 (1-124)||(44745535-44745659)
chr4 (7-110)||(45670055-45670159)
chr4 (1-127)||(13857701-13857829)
chr4 (8-128)||(13869238-13869360)
chr4 (1-124)||(13233319-13233443)
chr4 (1-124)||(36584512-36584636)
chr4 (1-124)||(36954955-36955079)
chr4 (1-100)||(50767123-50767224)
chr4 (1-100)||(54795697-54795798)
chr4 (1-58)||(44817449-44817506)
chr4 (7-124)||(18491282-18491400)
chr4 (1-134)||(36801795-36801930)
chr4 (1-128)||(7638698-7638826)
chr4 (1-124)||(12700513-12700637)
chr4 (1-100)||(19653613-19653713)
chr4 (1-124)||(31581695-31581819)
chr4 (1-100)||(31664136-31664236)
chr4 (1-110)||(6755918-6756028)
chr4 (1-94)||(11650941-11651035)
chr4 (1-94)||(27270442-27270537)
chr4 (1-124)||(2654855-2654979)
chr4 (1-100)||(16925195-16925295)
chr4 (1-100)||(40228399-40228499)
chr4 (72-129)||(9046035-9046092)
chr4 (18-124)||(44134599-44134706)
chr4 (1-110)||(4632663-4632774)
chr4 (72-128)||(7776931-7776987)
chr4 (32-100)||(38141526-38141595)
chr4 (1-124)||(13613037-13613161)
chr4 (1-124)||(43564507-43564631)
chr4 (9-124)||(52581553-52581669)
chr4 (72-128)||(5734198-5734254)
chr4 (1-124)||(10096401-10096525)
chr4 (72-148)||(26653056-26653132)
chr4 (32-124)||(22647231-22647324)
chr4 (1-128)||(10393912-10394041)
chr4 (1-57)||(44817562-44817618)
chr4 (1-46)||(5734149-5734194)
chr4 (7-128)||(18707776-18707898)
[»] chr1 (71 HSPs)
chr1 (1-179)||(40567168-40567348)
chr1 (4-156)||(51139891-51140045)
chr1 (1-156)||(16692747-16692904)
chr1 (1-156)||(47561929-47562086)
chr1 (1-178)||(24542556-24542735)
chr1 (1-178)||(25298864-25299043)
chr1 (1-156)||(29981505-29981662)
chr1 (1-179)||(44052234-44052414)
chr1 (1-186)||(23177544-23177731)
chr1 (1-152)||(46224564-46224715)
chr1 (1-152)||(33011859-33012012)
chr1 (1-156)||(40428579-40428736)
chr1 (1-152)||(42372172-42372325)
chr1 (1-152)||(919512-919665)
chr1 (1-156)||(8086432-8086589)
chr1 (1-156)||(37125895-37126052)
chr1 (1-156)||(45837046-45837203)
chr1 (1-156)||(48708215-48708372)
chr1 (7-152)||(37343082-37343229)
chr1 (1-152)||(17285095-17285249)
chr1 (1-178)||(29170144-29170323)
chr1 (1-156)||(8530291-8530448)
chr1 (1-183)||(9042190-9042374)
chr1 (1-156)||(24790637-24790795)
chr1 (1-156)||(6849955-6850111)
chr1 (1-100)||(24542748-24542849)
chr1 (1-100)||(24542862-24542963)
chr1 (1-100)||(24542976-24543077)
chr1 (1-100)||(24543090-24543191)
chr1 (1-100)||(24543204-24543305)
chr1 (1-100)||(24543318-24543419)
chr1 (1-100)||(24543432-24543533)
chr1 (1-100)||(24543546-24543647)
chr1 (1-100)||(24543660-24543761)
chr1 (1-100)||(24543774-24543875)
chr1 (1-100)||(24543888-24543989)
chr1 (1-100)||(24544002-24544103)
chr1 (1-100)||(24544116-24544217)
chr1 (1-100)||(24544230-24544331)
chr1 (1-100)||(24544344-24544445)
chr1 (1-100)||(24544458-24544559)
chr1 (1-100)||(24544572-24544673)
chr1 (7-156)||(44317662-44317812)
chr1 (1-124)||(919654-919778)
chr1 (1-124)||(8086319-8086443)
chr1 (1-110)||(33012015-33012125)
chr1 (1-133)||(32540528-32540662)
chr1 (1-100)||(17285262-17285362)
chr1 (1-124)||(24790524-24790648)
chr1 (1-124)||(25299032-25299156)
chr1 (1-124)||(29981651-29981775)
chr1 (1-124)||(48708361-48708485)
chr1 (1-124)||(51139775-51139899)
chr1 (1-139)||(49001410-49001549)
chr1 (1-100)||(16692917-16693017)
chr1 (1-100)||(24544686-24544786)
chr1 (1-124)||(42372059-42372183)
chr1 (1-110)||(8530172-8530282)
chr1 (1-128)||(9246840-9246969)
chr1 (1-128)||(21852090-21852219)
chr1 (1-124)||(40428725-40428849)
chr1 (1-124)||(40567055-40567179)
chr1 (1-124)||(45836933-45837057)
chr1 (1-125)||(46601091-46601217)
chr1 (1-124)||(23177431-23177555)
chr1 (1-124)||(37125782-37125906)
chr1 (1-124)||(46224704-46224828)
chr1 (4-114)||(29055887-29055999)
chr1 (1-94)||(6849842-6849936)
chr1 (7-100)||(44052427-44052521)
chr1 (20-100)||(9042387-9042468)
[»] chr5 (47 HSPs)
chr5 (1-178)||(7440257-7440436)
chr5 (1-156)||(26525028-26525185)
chr5 (1-148)||(43348836-43348985)
chr5 (1-178)||(3631461-3631640)
chr5 (8-154)||(16823340-16823488)
chr5 (1-156)||(9595964-9596121)
chr5 (1-152)||(30773081-30773234)
chr5 (1-156)||(43358612-43358769)
chr5 (1-154)||(9737621-9737775)
chr5 (1-142)||(15374302-15374445)
chr5 (1-156)||(25701220-25701376)
chr5 (1-143)||(32304464-32304608)
chr5 (19-156)||(15374447-15374586)
chr5 (1-152)||(26785032-26785185)
chr5 (1-156)||(13013053-13013210)
chr5 (1-156)||(13084441-13084598)
chr5 (1-152)||(8074041-8074194)
chr5 (1-152)||(10925711-10925864)
chr5 (1-144)||(20487061-20487206)
chr5 (1-150)||(41084386-41084537)
chr5 (1-152)||(20656773-20656926)
chr5 (1-115)||(29390358-29390473)
chr5 (1-134)||(41817542-41817677)
chr5 (1-152)||(26296811-26296964)
chr5 (6-124)||(26525174-26525293)
chr5 (4-128)||(22578874-22579000)
chr5 (1-124)||(3631348-3631472)
chr5 (1-124)||(7440425-7440549)
chr5 (1-128)||(19577120-19577249)
chr5 (1-110)||(43348723-43348833)
chr5 (7-123)||(25701366-25701483)
chr5 (1-124)||(43358499-43358623)
chr5 (1-123)||(8074184-8074307)
chr5 (1-94)||(16823220-16823314)
chr5 (1-94)||(26296982-26297077)
chr5 (1-124)||(30772968-30773092)
chr5 (1-124)||(32304597-32304721)
chr5 (1-100)||(41084549-41084650)
chr5 (1-94)||(9596140-9596234)
chr5 (1-52)||(37042571-37042622)
chr5 (7-94)||(10925604-10925692)
chr5 (1-90)||(5844195-5844285)
chr5 (1-97)||(15374204-15374301)
chr5 (1-44)||(20071239-20071282)
chr5 (1-100)||(13084611-13084711)
chr5 (72-134)||(28662279-28662341)
chr5 (6-100)||(13013223-13013318)
[»] chr8 (62 HSPs)
chr8 (1-156)||(7242435-7242592)
chr8 (1-156)||(28565087-28565244)
chr8 (1-156)||(28572710-28572867)
chr8 (1-178)||(43117552-43117731)
chr8 (1-178)||(41837732-41837911)
chr8 (1-156)||(21435042-21435199)
chr8 (1-150)||(1184025-1184176)
chr8 (1-179)||(5589950-5590130)
chr8 (1-179)||(24796830-24797010)
chr8 (1-156)||(6317079-6317236)
chr8 (1-152)||(36060560-36060713)
chr8 (1-156)||(41388208-41388365)
chr8 (1-156)||(42555893-42556050)
chr8 (1-179)||(4698009-4698189)
chr8 (1-156)||(1098260-1098417)
chr8 (1-152)||(22658150-22658303)
chr8 (1-178)||(3659600-3659779)
chr8 (1-156)||(2317264-2317421)
chr8 (1-152)||(4231422-4231575)
chr8 (1-144)||(197292-197437)
chr8 (1-144)||(312129-312274)
chr8 (1-152)||(10092457-10092610)
chr8 (1-156)||(3886580-3886737)
chr8 (1-152)||(7012540-7012692)
chr8 (1-154)||(9830697-9830851)
chr8 (1-152)||(7413234-7413387)
chr8 (72-156)||(34934284-34934368)
chr8 (1-124)||(4231309-4231433)
chr8 (1-124)||(42556039-42556163)
chr8 (1-125)||(25642676-25642802)
chr8 (1-156)||(38567332-38567467)
chr8 (1-100)||(7413121-7413222)
chr8 (1-124)||(22658292-22658416)
chr8 (1-124)||(43117438-43117563)
chr8 (2-128)||(36108859-36108987)
chr8 (1-126)||(17836517-17836644)
chr8 (1-124)||(4697896-4698020)
chr8 (1-124)||(5590119-5590243)
chr8 (1-124)||(7012427-7012551)
chr8 (1-128)||(11635849-11635978)
chr8 (1-100)||(21434929-21435029)
chr8 (1-124)||(7242581-7242704)
chr8 (1-100)||(2317151-2317251)
chr8 (1-124)||(3886726-3886850)
chr8 (1-124)||(24796999-24797123)
chr8 (1-94)||(6316966-6317060)
chr8 (1-94)||(41837930-41838024)
chr8 (72-151)||(7421860-7421939)
chr8 (8-128)||(25382979-25383101)
chr8 (1-124)||(3659768-3659892)
chr8 (1-128)||(8995060-8995189)
chr8 (1-124)||(10092344-10092468)
chr8 (1-100)||(28564974-28565074)
chr8 (1-100)||(28572597-28572697)
chr8 (1-124)||(36060447-36060571)
chr8 (1-88)||(41169901-41169989)
chr8 (1-100)||(41388095-41388195)
chr8 (1-110)||(7422008-7422118)
chr8 (1-100)||(1098147-1098247)
chr8 (1-124)||(38567219-38567343)
chr8 (72-127)||(8996509-8996564)
chr8 (1-124)||(1183912-1184036)
[»] chr2 (54 HSPs)
chr2 (1-156)||(36435981-36436138)
chr2 (1-156)||(6749805-6749962)
chr2 (1-156)||(34983478-34983635)
chr2 (1-179)||(1114814-1114994)
chr2 (1-154)||(23869865-23870020)
chr2 (1-156)||(1020867-1021024)
chr2 (1-156)||(26293362-26293519)
chr2 (1-152)||(44545532-44545685)
chr2 (1-178)||(12995168-12995347)
chr2 (1-178)||(16194454-16194633)
chr2 (1-178)||(26860439-26860618)
chr2 (1-152)||(2249783-2249936)
chr2 (1-152)||(7366353-7366506)
chr2 (1-156)||(38527375-38527532)
chr2 (1-178)||(31392748-31392926)
chr2 (1-152)||(11764996-11765149)
chr2 (1-156)||(13615762-13615919)
chr2 (1-156)||(22674652-22674809)
chr2 (1-152)||(42016705-42016858)
chr2 (1-178)||(34494366-34494544)
chr2 (1-152)||(19283847-19283999)
chr2 (1-178)||(41699273-41699449)
chr2 (1-156)||(28745303-28745449)
chr2 (1-152)||(3836144-3836295)
chr2 (1-125)||(11935205-11935331)
chr2 (1-128)||(31643551-31643680)
chr2 (1-152)||(43471370-43471523)
chr2 (1-110)||(26293249-26293359)
chr2 (1-100)||(1021037-1021137)
chr2 (1-124)||(36436127-36436251)
chr2 (1-124)||(38763803-38763927)
chr2 (2-140)||(2077580-2077720)
chr2 (1-110)||(2249670-2249780)
chr2 (1-124)||(31392636-31392759)
chr2 (1-124)||(1114983-1115107)
chr2 (1-100)||(12995055-12995155)
chr2 (1-124)||(16194341-16194465)
chr2 (1-124)||(34983365-34983489)
chr2 (1-124)||(42016592-42016716)
chr2 (1-124)||(44545674-44545798)
chr2 (1-109)||(11935335-11935445)
chr2 (106-178)||(38763964-38764036)
chr2 (1-124)||(13615908-13616032)
chr2 (1-124)||(23869752-23869876)
chr2 (1-128)||(29141871-29142000)
chr2 (1-94)||(3836314-3836409)
chr2 (1-124)||(7366240-7366364)
chr2 (1-124)||(11764883-11765007)
chr2 (1-124)||(26860607-26860731)
chr2 (1-110)||(28745452-28745561)
chr2 (1-94)||(38527263-38527357)
chr2 (1-45)||(38763916-38763960)
chr2 (1-128)||(32100020-32100154)
chr2 (4-128)||(29035340-29035466)
[»] scaffold0050 (2 HSPs)
scaffold0050 (1-150)||(19248-19399)
scaffold0050 (1-124)||(19135-19259)
[»] chr7 (61 HSPs)
chr7 (1-178)||(9624198-9624377)
chr7 (1-178)||(36358087-36358266)
chr7 (1-178)||(40055793-40055972)
chr7 (1-178)||(44142963-44143142)
chr7 (1-178)||(45350253-45350432)
chr7 (1-156)||(31065422-31065579)
chr7 (1-154)||(43859293-43859448)
chr7 (1-152)||(31931827-31931980)
chr7 (1-179)||(17167069-17167249)
chr7 (1-152)||(23469199-23469352)
chr7 (1-179)||(26873905-26874085)
chr7 (1-179)||(46027882-46028062)
chr7 (1-178)||(8461788-8461967)
chr7 (1-178)||(36675264-36675443)
chr7 (1-154)||(44723864-44724019)
chr7 (1-149)||(44467827-44467977)
chr7 (1-152)||(22723579-22723732)
chr7 (1-150)||(16834080-16834231)
chr7 (1-152)||(42241732-42241885)
chr7 (1-151)||(39976523-39976675)
chr7 (1-152)||(41367861-41368014)
chr7 (1-152)||(31428939-31429092)
chr7 (1-144)||(18104243-18104388)
chr7 (1-150)||(29075000-29075141)
chr7 (1-109)||(26873792-26873901)
chr7 (4-144)||(46828761-46828902)
chr7 (8-151)||(29663010-29663155)
chr7 (1-124)||(22723721-22723845)
chr7 (1-124)||(17166955-17167080)
chr7 (1-128)||(25174236-25174365)
chr7 (1-124)||(29075130-29075254)
chr7 (1-124)||(36675432-36675556)
chr7 (1-124)||(44467966-44468090)
chr7 (1-124)||(44724008-44724132)
chr7 (1-134)||(22499716-22499847)
chr7 (1-124)||(31065568-31065692)
chr7 (1-124)||(42241874-42241998)
chr7 (1-124)||(46027769-46027893)
chr7 (72-152)||(23562564-23562644)
chr7 (1-124)||(23469341-23469465)
chr7 (1-128)||(28754895-28755023)
chr7 (1-124)||(45350140-45350264)
chr7 (1-128)||(16649537-16649665)
chr7 (1-100)||(16834246-16834346)
chr7 (1-128)||(17623898-17624026)
chr7 (1-128)||(29502072-29502201)
chr7 (1-128)||(30781100-30781228)
chr7 (1-124)||(36358255-36358379)
chr7 (1-100)||(43859180-43859280)
chr7 (72-124)||(6961194-6961246)
chr7 (4-134)||(9021516-9021648)
chr7 (1-94)||(31428826-31428920)
chr7 (1-94)||(39976410-39976504)
chr7 (72-130)||(9013977-9014035)
chr7 (1-124)||(9624085-9624209)
chr7 (1-124)||(44142851-44142974)
chr7 (1-134)||(9014481-9014623)
chr7 (1-124)||(40055680-40055804)
chr7 (16-121)||(4248865-4248972)
chr7 (1-44)||(22566606-22566649)
chr7 (72-129)||(8727884-8727941)
[»] scaffold0014 (3 HSPs)
scaffold0014 (1-151)||(65250-65402)
scaffold0014 (1-124)||(65136-65261)
scaffold0014 (1-100)||(65023-65123)
[»] scaffold0978 (2 HSPs)
scaffold0978 (1-152)||(1306-1459)
scaffold0978 (1-124)||(1193-1317)
[»] scaffold0002 (3 HSPs)
scaffold0002 (1-89)||(331974-332064)
scaffold0002 (1-124)||(331861-331985)
scaffold0002 (81-150)||(332441-332510)
[»] scaffold0131 (2 HSPs)
scaffold0131 (1-54)||(11380-11433)
scaffold0131 (1-94)||(11267-11361)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (1-44)||(303844-303887)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 119; Significance: 5e-61; HSPs: 37)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 11450460 - 11450304
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11450460 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 11450362  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11450361 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 11450304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 34127700 - 34127853
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34127700 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccggaaaatttaaataattcaattataggtc 34127799  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  34127800 taatttgcgagactttaaacaattttacaatagttaattttagtggcgcaccct 34127853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 7022020 - 7022176
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7022020 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 7022118  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7022119 taatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccctgaca 7022176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34023498 - 34023341
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||  |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34023498 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgaaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtc 34023399  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34023398 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 34023341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 12698696 - 12698853
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  12698696 ttatacaattttatgtcgcttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtc 12698795  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12698796 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 12698853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 24130200 - 24130043
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||     
T  24130200 ttatacgattttatgccggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcatattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtt 24130101  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24130100 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 24130043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 2660794 - 2660641
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2660794 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtc 2660695  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2660694 taatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 2660641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 15469292 - 15469448
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15469292 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtt-atcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 15469390  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15469391 taatttgcgagactttaaataatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgaca 15469448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 8560628 - 8560808
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatg-t 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||| | |    
T  8560628 ttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtgcacctgaaaaatttaaataattcaattataggat 8560727  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  8560728 ctaatttgtaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 8560808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23258910 - 23258753
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  23258910 ttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 23258811  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23258810 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 23258753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 26468651 - 26468804
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | | |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  26468651 ttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggacaaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 26468750  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26468751 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 26468804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 5 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9079008 - 9078857
Alignment:
Q  5 acaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaat 102  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  9079008 acaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggaccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaat 9078909  T
Q  103 ttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    ||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  9078908 ttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtccaccctga 9078857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24635426 - 24635271
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24635426 ttatacaaatttaaatcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 24635327  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  24635326 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccaccctga 24635271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 16461365 - 16461220
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcgg-ttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgt 97  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||  |||||| | |   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16461365 ttatataattttatgtcgggttttaggtttcagttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtggcctatccgaaaaatttaaataattcaattataggt 16461266  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtg 143  Q
     |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461265 ttaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtg 16461220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 12996488 - 12996613
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12996488 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 12996586  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaattttt 125  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  12996587 tattttgcgagactttaaacaattttt 12996613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11450573 - 11450449
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||  |||    
T  11450573 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattattggtc 11450475  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||||||||| |||  ||||||||    
T  11450474 tattttacgagattttatacaatttt 11450449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 93
Target Start/End: Original strand, 12698584 - 12698677
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattat 93  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||    
T  12698584 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattat 12698677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 24130313 - 24130204
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24130313 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 24130215  T
Q  99 taatttacgag 109  Q
    || ||| ||||    
T  24130214 tattttgcgag 24130204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2660907 - 2660783
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| || ||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2660907 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggatgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 2660809  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  2660808 tattttgcgagattttatacaatttt 2660783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 7021907 - 7022031
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  7021907 ttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 7022005  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7022006 tattttgcgagattttatacaatttt 7022031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 9079124 - 9079024
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9079124 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 9079026  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  9079025 ta 9079024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 15469179 - 15469303
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  15469179 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 15469277  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  15469278 tattttgcgagattttatacaatttt 15469303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23259024 - 23258923
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23259024 ttatacaattttacgtcggttttagcttttggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 23258925  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  23258924 ta 23258923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 26468538 - 26468662
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||   || | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26468538 ttatacaattttgtgtcggttttataatttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 26468636  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  26468637 tattttgcgagattttatacaatttt 26468662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 16461478 - 16461368
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| | |||  |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16461478 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattccttcaaagttgtgtagtggtccac-tcgaaaatttaaataattcaattatatgtc 16461380  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  16461379 tattttgcgaga 16461368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 7536546 - 7536675
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||| ||||| ||||||  ||||| |||||   || ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7536546 ttatacaattttgtgtcaattttaggtttcggctgatctaaattctcgcaaagtggtgtaatgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 7536645  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || |||  |||||||| |||||||||||||    
T  7536646 tattttgtgagactttaaacaatttttcaa 7536675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 8560515 - 8560609
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  8560515 ttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 8560609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 14883117 - 14882977
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaa-attggtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    |||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||| |   || |||  |||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  14883117 ttatacaaatttatgtcggctttagatttcggttgatccaaattcccgcaagaggtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtct 14883018  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaatttta 140  Q
    | ||| | || |||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  14883017 attttgctaggctttaaacaatttttcaacggttaatttta 14882977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 13405432 - 13405298
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    || ||  ||  ||||||| |   ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  13405432 ttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccatgaagtgaagtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaatcataggtc 13405333  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagtt 133  Q
    || ||| ||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  13405332 tattttgcgagattttaaacaatttttcaacagtt 13405298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 34023611 - 34023487
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||| ||||||| |||||  ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  34023611 ttatataattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaatttctgcaaagtggtgtagtgtcccacc-caaaaatttaaataattcaattatagatc 34023513  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||||||||| |||  ||||||||    
T  34023512 tattttacgagattttatacaatttt 34023487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 14883231 - 14883142
Alignment:
Q  1 ttatacaatttta-tgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattca 88  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  14883231 ttatacaattttggtgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacc-aaaaaatttaaataattca 14883142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24635539 - 24635439
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24635539 ttatgcaattttgtattggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 24635441  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24635440 ta 24635439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 34127587 - 34127687
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | ||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34127587 ttatacaattttgtatcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatgccccacc-caaaaatttaaataattcaattataggtc 34127685  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  34127686 ta 34127687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 12996373 - 12996499
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaat-aattcaattatatgt 97  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||  |||| |||||  ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||||  |    
T  12996373 ttatacaattttgtatcggttttaggtttcgattgatgcaaattccctcaaagtggtgtagtgacccacccgaaaaatttaaataaattcaattatagat 12996472  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    ||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  12996473 ctattttgcgagattttatacaatttt 12996499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 99
Target Start/End: Original strand, 10290547 - 10290647
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcg-gttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgt 97  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10290547 ttatacaatttg-tgtcggtgttaggtttcaagttgatccaaatttctgcaaaatggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggt 10290645  T
Q  98 ct 99  Q
    ||    
T  10290646 ct 10290647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 23259137 - 23259037
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||| ||||||| || ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23259137 ttatgcaattttctatcggttttatgttttggttgattcaaatttctgcaaaatgttgtagtggcccaccca-aaaatttaaataattcaattataggtc 23259039  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  23259038 ta 23259037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 19 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31969044 - 31968960
Alignment:
Q  19 gttttaggtttcgg-ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||   ||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  31969044 gttttaggtttcgggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtcta 31968960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 29126000 - 29125815
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29126000 ttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 29125901  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactgaatata 184  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||    
T  29125900 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactgaatata 29125815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11232111 - 11231931
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  11232111 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtc 11232012  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  11232011 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 11231931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 32270876 - 32270722
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaa-tttaaataattcaattatatgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  32270876 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggt 32270777  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32270776 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 32270722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44254557 - 44254404
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44254557 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 44254458  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44254457 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 44254404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28952348 - 28952191
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28952348 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattatgggtc 28952249  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28952248 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 28952191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 16908775 - 16908622
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16908775 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 16908676  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16908675 taatttgctagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 16908622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 35083995 - 35084148
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  35083995 ttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 35084094  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  35084095 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgacccaccct 35084148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 50527590 - 50527433
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  50527590 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 50527491  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  50527490 taatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccactctgaca 50527433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 52202184 - 52202341
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52202184 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccactcaaaaaatttaaataattcaattataggtc 52202283  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  52202284 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgaca 52202341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 22729422 - 22729602
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  22729422 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaccaaccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 22729521  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  22729522 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 22729602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 49657168 - 49656989
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  49657168 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 49657069  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||||| |||| ||||||       |||||||||||||||    
T  49657068 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatgataaattttagtggtccacgctgacatttttttctggctccgccactg 49656989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1092834 - 1092677
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1092834 ttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtc 1092735  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    | |||| ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  1092734 tgatttgcgagacttaaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccctgaca 1092677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12251464 - 12251307
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||    |||||||||||||||||| |||| |||    
T  12251464 ttatacaattttatgtcgattttagatttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtaatggcccactcgaaaaatttaaataattcaactataggtc 12251365  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12251364 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 12251307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25246294 - 25246137
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| | |||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25246294 ttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtctacccgaaaaatttaaataattcaattataagtc 25246195  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  25246194 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacactgaca 25246137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 27742688 - 27742841
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27742688 ttatacaattttatgtcgtttttaggtttcggttgatcccaattcccgtaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 27742787  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  27742788 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggtccaccct 27742841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 21259277 - 21259120
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21259277 ttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 21259178  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||    
T  21259177 taatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgacataccctgaca 21259120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7160354 - 7160208
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7160354 aattttgtgtcagttttaggtttcggttaatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaattt 7160255  T
Q  105 acgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  7160254 gcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtgacccaccc 7160208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 9 - 156
Target Start/End: Original strand, 44205510 - 44205658
Alignment:
Q  9 ttttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttac 106  Q
    |||| ||||||||||| || | ||||||||||||||| |||||| || ||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||| | ||||||||| |    
T  44205510 ttttgtgtcggttttatgtgttggttgatccaaattcttgcaaagtgatgtagtggctcaccc-gaaaatttaaataattcaattaaaggtctaatttgc 44205608  T
Q  107 gagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44205609 gagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 44205658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 18163807 - 18163963
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  18163807 ttattcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 18163905  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    || |||  |||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18163906 tattttgtgagactttaaacaatttctcaatagttaattttcgtggcccaccctgaca 18163963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 36633689 - 36633835
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||        |||    
T  36633689 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggtccaccagaaaaatttaaataattc-------ggtc 36633781  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  36633782 taatttgcgagactttaaataatttttcaatggttaattttagtggtccaccct 36633835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 13594830 - 13594725
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  13594830 ttatacaattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccaacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 13594731  T
Q  99 taattt 104  Q
    ||||||    
T  13594730 taattt 13594725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 10 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 52571380 - 52571236
Alignment:
Q  10 tttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacg 107  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| | |||   |||||||||| |||||||||||| |||||||||  |    
T  52571380 tttatgtcggttttagatttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtctacccaaaaaatttaaacaattcaattataggtctaatttgtg 52571281  T
Q  108 agactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  52571280 agactttaaacaaattttcaatagttaattttagtagtccaccct 52571236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 45045412 - 45045563
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||   |||||| ||||||||||||||||| |     
T  45045412 ttatacaattttatgttggttttaggtttcgattaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-caaaaattcaaataattcaattatatatt 45045510  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||| |  || |||||||||||||||||||    
T  45045511 tattttgcgagactttaaacaattttttataagataattttagtggcccaccc 45045563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21259391 - 21259290
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  21259391 ttatataattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 21259292  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  21259291 ta 21259290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 11232224 - 11232100
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  11232224 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 11232126  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  11232125 tattttgcgagattttatacaatttt 11232100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12251577 - 12251453
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12251577 ttatataattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 12251479  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  12251478 tattttgcgagaatttatacaatttt 12251453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32270989 - 32270865
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  32270989 ttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 32270891  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  32270890 tattttgcgagattttatacaatttt 32270865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44254670 - 44254546
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44254670 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 44254572  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44254571 tattttgcgagattttatacaatttt 44254546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 49657281 - 49657157
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| |||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||  ||    
T  49657281 ttatgcaattttacgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-tgaaaatttaaataattcaattatagatc 49657183  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  49657182 tattttgcgagattttatacaatttt 49657157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 22729309 - 22729433
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22729309 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc-ccaaaatttaaataattcaattataggtc 22729407  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  22729408 tattttgcgagattttatacaatttt 22729433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31174629 - 31174500
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  ||||  || |   |||||||||||||||||||| || |||    
T  31174629 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctagcaaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattgtaggtc 31174530  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  31174529 tattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 31174500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 52202071 - 52202195
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  52202071 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtgacccacc-caaaaatttaaataattcaattatagatc 52202169  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||||||||| |||  ||||||||    
T  52202170 tattttacgagattttatacaatttt 52202195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 4618240 - 4618382
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg-gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||| || | |||| || || |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4618240 ttatacaattttgtgtcggttttattttttg-ttgatccaaactctttcaaagtgtgtagtggtccaccc-gaaaatttaaataattcaattataagtct 4618337  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    | ||| ||||| |||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  4618338 attttgcgagattttatacaatttttcaataattaattttagtgg 4618382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 29126113 - 29126003
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29126113 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 29126015  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  29126014 tattttgcgaga 29126003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 36633576 - 36633686
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36633576 ttatacaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagcggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 36633674  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  36633675 tattttgcgaga 36633686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 8 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16908881 - 16908788
Alignment:
Q  8 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16908881 attttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattccagcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattataggtcta 16908788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1092947 - 1092823
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  1092947 ttatgcaattttgtgtgggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 1092849  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  1092848 tattttgcgagattttatacaatttt 1092823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13594943 - 13594819
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| || |||| ||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13594943 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggctgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 13594845  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  13594844 tattttgcgagattttatacaatttt 13594819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 35083882 - 35084006
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||  |||| |||||  ||||| |||||||||||||||||| |||    
T  35083882 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaagttaaataattcaattataggtc 35083980  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  35083981 tattttgcgagattttatacaatttt 35084006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 49169882 - 49170006
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||| ||||||| |||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||    
T  49169882 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccgaatttctgcaaagtggtgtaatggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatgggtc 49169980  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| | |||||||  ||||||||    
T  49169981 tattttgcaagactttatacaatttt 49170006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 50527703 - 50527579
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  50527703 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 50527605  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  50527604 tattttgcgagattttatacaatttt 50527579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 27742575 - 27742675
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||| | |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  27742575 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcctatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 27742673  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  27742674 ta 27742675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 28952461 - 28952337
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||||  ||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||| | |||    
T  28952461 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttttgcaaaggggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattacaggtc 28952363  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  28952362 tattttgcgagattttatacaatttt 28952337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 52571494 - 52571394
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  52571494 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggccca-ctcaaaaatttaaataattcaattataggtc 52571396  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  52571395 ta 52571394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 744056 - 744112
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg 58  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  744056 ttatacaattttacgtcggttt-aggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtg 744112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 49169995 - 49170040
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  49169995 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcc 49170040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 114
Target Start/End: Original strand, 34660835 - 34660949
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| || |||||||||||  |||||| |||||  |||| |||||   ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  34660835 ttatataattttgtgtcggttttaggttttggctgatccaaatttttgcaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaat-attcaattataggtc 34660933  T
Q  99 taatttacgagacttt 114  Q
    || ||| |||||||||    
T  34660934 tattttgcgagacttt 34660949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 18 - 128
Target Start/End: Original strand, 2618989 - 2619102
Alignment:
Q  18 ggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaat-ttaaataattcaattatatgtctaatttacgagacttt 114  Q
    ||||||| ||||| |||||| |||| ||||||||| |||||  ||||||||||   ||||  |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||    
T  2618989 ggttttaagtttctgttgattcaaactcctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaaaattaaataattcaattataggtctattttgcgacacttt 2619088  T
Q  115 gaacaatttttcaa 128  Q
     |||||||||||||    
T  2619089 aaacaatttttcaa 2619102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 21259504 - 21259404
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21259504 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 21259406  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  21259405 ta 21259404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 128
Target Start/End: Original strand, 18657979 - 18658035
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  18657979 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 18658035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 45045304 - 45045423
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||| | |||  |||  |||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  45045304 aattttttgttggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaactagtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtctatttt 45045403  T
Q  105 acgagactttgaacaatttt 124  Q
     ||||| |||  ||||||||    
T  45045404 gcgagattttatacaatttt 45045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Original strand, 49170172 - 49170252
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||| ||||| ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||    
T  49170172 aaaatttaaataactaaattataggtttaatttgcgaaactttaaacaatttttcaatgattaatttttgtggtccaccct 49170252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 18657930 - 18657975
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 46  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18657930 ttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcc 18657975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 68)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 31664123 - 31663943
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31664123 ttataaaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 31664024  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  31664023 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 31663943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 11650922 - 11650743
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11650922 ttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 11650823  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  11650822 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 11650743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 13613048 - 13612869
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  13613048 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 13612949  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  13612948 taatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 13612869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 18491389 - 18491568
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  18491389 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtc 18491488  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||       |||||||||||||||    
T  18491489 taatttgcgagactttaaacaatgtttcaatagttaattttagtgacccaccctaacatttttttctggctccgccactg 18491568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 44134695 - 44134874
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44134695 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtc 44134794  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  44134795 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 44134874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 12700524 - 12700367
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  || |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12700524 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 12700425  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12700424 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 12700367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 38141513 - 38141356
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  38141513 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 38141414  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38141413 taatttgcgatactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcctaccctgaca 38141356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16925308 - 16925487
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16925308 ttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 16925407  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  16925408 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 16925487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 31581706 - 31581527
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||   |||| || |   ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  31581706 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtactggctcatccgaaaaatttaaataactcaattataggtc 31581607  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  31581606 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 31581527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 52581658 - 52581816
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtgg-cccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgt 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |  ||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| ||    
T  52581658 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggtagatccaaatttccacaaattggtgtagtggtcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggt 52581757  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52581758 ctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 52581816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 43564620 - 43564775
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43564620 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggaacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 43564719  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  43564720 taatttgcgagagtttaaacaatttttcaatagttgattttagtggtccaccctga 43564775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 13233432 - 13233611
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  13233432 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatcggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 13233531  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  13233532 taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 13233611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 41832579 - 41832728
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41832579 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 41832678  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41832679 taatttgcgaaactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggccca 41832728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 44745546 - 44745389
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||    |||||||||||||||||||||||  ||    
T  44745546 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccactcaaaaaatttaaataattcaattatagatc 44745447  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||    
T  44745446 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttagtggtccatcctgaca 44745389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 19653601 - 19653446
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| ||| |   ||||||||||||| ||||||||| |||    
T  19653601 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataactcaattataagtc 19653502  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19653501 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 19653446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 36584625 - 36584782
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || ||||||||  ||||| ||||   |||||||||||| |||||||||| |||    
T  36584625 ttatacaattttatgtcggttttaagttttagttgatccaaattcccgctaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaatatttcaattataggtc 36584724  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36584725 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcctaccctgaca 36584782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 2654866 - 2654717
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2654866 ttatacaattttacgtcggttttagatttcggttgatcccaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 2654767  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2654766 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 2654717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22647313 - 22647470
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||  ||||||||||   |||| ||||||||||||||||||||||    
T  22647313 ttatacaattttatgtttgttttaggtttcggttgattcaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattcaattatatgtc 22647412  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22647413 taatttgtgagactttaaacaattttttaatggttaatttcagtggcccaccctgaca 22647470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 36954966 - 36954817
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  36954966 ttatacaattttatgtcgattttacgtttcggttgatccaaatccccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtc 36954867  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36954866 taatttgcgagaatttaaacaatttttcaatagttaatattagtggccca 36954817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 40228386 - 40228233
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40228386 ttatacgattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattgttgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 40228287  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  40228286 taatttgcgagtatttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 40228233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 6756031 - 6756209
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||| |||   ||||||||||| ||||||||||| ||     
T  6756031 ttatactattttatgtcggttttatgtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcc-acccgaaaaatttaaatgattcaattataggtt 6756129  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  6756130 taatttgcgagactttaaacaattttttaattgttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 6756209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 51001565 - 51001717
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51001565 ttatacaattttatgtcttttttaggtttcggttgatccaa-ttcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 51001663  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||   | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51001664 taatttgtaaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 51001717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 50767236 - 50767385
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  50767236 ttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccaaaaaaatttaaacaattcaattataggtc 50767335  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  50767336 tattttacgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggccca 50767385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 54795685 - 54795532
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  54795685 ttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtc 54795586  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  54795585 tattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 54795532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10096412 - 10096270
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  10096412 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcgattgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtc 10096314  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagt 142  Q
    || |||   || |||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  10096313 tattttctaaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagt 10096270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 9e-32
Query Start/End: Original strand, 80 - 178
Target Start/End: Original strand, 45670168 - 45670266
Alignment:
Q  80 aataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  45670168 aataattcaattataggtctaatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacacttttttctggctccgccactg 45670266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 27270555 - 27270708
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  27270555 ttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtc 27270654  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||  |||||||    
T  27270655 tattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtgatccaccct 27270708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 2 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 4632659 - 4632509
Alignment:
Q  2 tatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | || || |||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4632659 tatacaattttgtgtcgattttaggattcggttgatctaaatttccgccaagtggtgtagtggaccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtct 4632560  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    | |||  |||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  4632559 attttgagagaatttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccacc 4632509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 41832465 - 41832590
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   ||  ||||||||||||||||||| |||    
T  41832465 ttatgcaattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaacttttaaataattcaattataggtc 41832564  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  41832565 tattttgcgagattttatacaatttt 41832590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44745659 - 44745535
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||    
T  44745659 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattgtaggtc 44745561  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44745560 tattttgcgagattttatacaatttt 44745535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 110
Target Start/End: Original strand, 45670055 - 45670159
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  45670055 aattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatatgtctatttt 45670153  T
Q  105 acgaga 110  Q
     |||||    
T  45670154 gcgaga 45670159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 127
Target Start/End: Original strand, 13857701 - 13857829
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13857701 ttatacaattttgtgttggttttaagtttcggctgatccaaatttctgtaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 13857800  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttca 127  Q
    || ||| ||||| ||| |||| |||||||    
T  13857801 tattttgcgagattttaaacattttttca 13857829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Original strand, 13869238 - 13869360
Alignment:
Q  8 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || ||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  13869238 attttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaatttctgcaaagtgatgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 13869337  T
Q  106 cgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||||| ||| |||| ||||||||    
T  13869338 cgagattttaaacattttttcaa 13869360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 13233319 - 13233443
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13233319 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattataggtc 13233417  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  13233418 tattttgcgagattttatacaatttt 13233443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 36584512 - 36584636
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36584512 ttatgcaattttgtgttagttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 36584610  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36584611 tattttgcgagattttatacaatttt 36584636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36955079 - 36954955
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36955079 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 36954981  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36954980 tattttgcgagattttatacaatttt 36954955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 50767123 - 50767224
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  50767123 ttatacaattttatgtcggttttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaattaattcaattataggtc 50767222  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  50767223 ta 50767224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 54795798 - 54795697
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  54795798 ttatacaattttgtgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 54795699  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  54795698 ta 54795697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 44817506 - 44817449
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44817506 ttatacaattttatgtcggttttagatttcgattgatccaaattcctgcaaattggtg 44817449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 124
Target Start/End: Original strand, 18491282 - 18491400
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||| || |||| ||||| |||    
T  18491282 aattttatgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgccccacc-cgaaaatttaaataatttaactataggtctatttt 18491380  T
Q  105 acgagactttgaacaatttt 124  Q
     ||||| |||  ||||||||    
T  18491381 gcgagattttatacaatttt 18491400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 36801930 - 36801795
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| | ||| | |||  ||||||||||   |||||||| |||||||||||||| |||    
T  36801930 ttatataattttgtgtcggttttaggtttcggctgaaccaaattcccgtaaaatagtgtagtggcccacccgaaaaatttatataattcaattataagtc 36801831  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    ||  ||  |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36801830 tatattgtgagactttaaacaatttttcaatggtta 36801795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 7638826 - 7638698
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||  ||||| |||||  ||||||||||  |||||||| |||||||| |||||  |||    
T  7638826 ttatacaattttgtgtcgattttacgtttcggctgacccaaattctcgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaattttaataattccattattggtc 7638728  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7638727 tattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7638698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 12700637 - 12700513
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| || ||||||| |||    
T  12700637 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaatagttaaattataggtc 12700539  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  12700538 tattttgcgagattttatacaatttt 12700513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 19653713 - 19653613
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||   ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  19653713 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaaatagtgtaatggccca-cttgaaaatttaaataattcaattataggtc 19653615  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  19653614 ta 19653613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31581819 - 31581695
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| | |||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31581819 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgtaaagtagtgtaatggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtc 31581721  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  31581720 tattttgcgagattttatacaatttt 31581695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31664236 - 31664136
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| |||||||  |||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31664236 ttatgcaattttgagtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 31664138  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  31664137 ta 31664136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 6755918 - 6756028
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  6755918 ttatgcaattttgtgttgtttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 6756016  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  6756017 tattttgcgaga 6756028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 11651035 - 11650941
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  11651035 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 11650941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 27270442 - 27270537
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||||||| | ||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  27270442 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatcaaaattcccgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattata 27270537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 2654979 - 2654855
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| |  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  2654979 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccatc-cgaaaatttaaatagttcaattataggtc 2654881  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || |||| |||| |||  ||||||||    
T  2654880 tattttatgagattttatacaatttt 2654855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 16925195 - 16925295
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16925195 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 16925293  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  16925294 ta 16925295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 40228499 - 40228399
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||||||||||||||||||||| || |||    
T  40228499 ttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattgtaggtc 40228401  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  40228400 ta 40228399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 9046092 - 9046035
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaat 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| || |||||||||||    
T  9046092 aaaatttaaataattcaattatatgtctattttatgagactttaaataatttttcaat 9046035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 18 - 124
Target Start/End: Original strand, 44134599 - 44134706
Alignment:
Q  18 ggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttg 115  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||  |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||     
T  44134599 ggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagatttta 44134697  T
Q  116 aacaatttt 124  Q
     ||||||||    
T  44134698 tacaatttt 44134706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 4632774 - 4632663
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||  ||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| |||    ||||||||||||||||||| ||| |||    
T  4632774 ttatacaattttgtgttagttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggctcacgcgaaaaatttaaataattcaatcataggtc 4632675  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  4632674 tattttgcgaga 4632663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 128
Target Start/End: Original strand, 7776931 - 7776987
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  7776931 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttaaacaatttttcaa 7776987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000007
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 38141595 - 38141526
Alignment:
Q  32 gttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  38141595 gttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtcta 38141526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13613161 - 13613037
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13613161 ttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc-caaaaatttaaataatttaattataggtc 13613063  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  13613062 tattttccgagattttatacaatttt 13613037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 43564507 - 43564631
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||| |||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43564507 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgttgtagtgccccatc-caaaaatttaaataattcaattataagtc 43564605  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  43564606 tattttgcgagattttatacaatttt 43564631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 9 - 124
Target Start/End: Original strand, 52581553 - 52581669
Alignment:
Q  9 ttttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttac 106  Q
    |||| ||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||||| |   |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  52581553 ttttgtgtcggtttcatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtcgcccatcca-aaaatttaaataattcaattatatgtttattttac 52581651  T
Q  107 gagactttgaacaatttt 124  Q
    |||| |||  ||||||||    
T  52581652 gagattttatacaatttt 52581669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 128
Target Start/End: Original strand, 5734198 - 5734254
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||| |||||||    
T  5734198 aaaatttaaataattcaattataggtctattttacgagtctttaaacaaattttcaa 5734254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 10096525 - 10096401
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtggtg-gcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| |||||  | | |||     ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  10096525 ttatataattttgtgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtgtccattcaaaaaatttaaataattcaattataggtct 10096426  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    | ||| ||||| |||  ||||||||    
T  10096425 attttgcgagattttatacaatttt 10096401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 72 - 148
Target Start/End: Complemental strand, 26653132 - 26653056
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    ||||||||||||||| ||||||| || || ||| ||||||||  |||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  26653132 aaaatttaaataatttaattataggtttattttgcgagacttaaaacaattttttaatggtaaattttagtggccca 26653056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 124
Target Start/End: Original strand, 22647231 - 22647324
Alignment:
Q  32 gttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| |||  ||||||||    
T  22647231 gttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggcccaccca-aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttatacaatttt 22647324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 10393912 - 10394041
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||| |  |||| |||||  ||||||||||   |||||||| |||| ||||||||| |||    
T  10393912 ttatataattttgtgtcggttttaggtttcgtctgattcaaatttccacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataactcaattataagtc 10394011  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||  ||  |||||| | |||||||||||||    
T  10394012 tatattgtgagactgtaaacaatttttcaa 10394041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 44817618 - 44817562
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggt 57  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| ||||    
T  44817618 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggt 44817562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 46
Target Start/End: Original strand, 5734149 - 5734194
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcc 46  Q
    ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5734149 ttatacaattttgcatcggttttaggtttcggttgattcaaattcc 5734194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Original strand, 18707776 - 18707898
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| |||||||   ||||||||| | ||||||||| | ||||| |||||  || |||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  18707776 aattttgtgtcggtgacaggtttcgggtaatccaaatttccgcaaagtggtgtagtcgcccacccgcaaaatttaaattattcaattataggtctatttt 18707875  T
Q  105 acgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
     |||  |||| |||||||||||||    
T  18707876 gcga-tctttaaacaatttttcaa 18707898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 117; Significance: 8e-60; HSPs: 71)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 8e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 40567168 - 40567348
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40567168 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 40567267  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  40567268 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 40567348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 4 - 156
Target Start/End: Original strand, 51139891 - 51140045
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51139891 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtctaa 51139990  T
Q  102 tttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51139991 tttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 51140045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 16692904 - 16692747
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  16692904 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 16692805  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16692804 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatatttaattttagtggcccaccgtgaca 16692747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 47561929 - 47562086
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  47561929 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 47562028  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47562029 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggctcaccctgaca 47562086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 24542735 - 24542556
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  24542735 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattatagttc 24542636  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  24542635 taattagcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 24542556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 25299043 - 25298864
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25299043 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattagtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 25298944  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  25298943 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 25298864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 29981662 - 29981505
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||   |||| |||||   |||||||||| ||||||||||||||||    
T  29981662 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaacaattcaattatatgtc 29981563  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29981562 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 29981505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 44052414 - 44052234
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44052414 ttatagaattttatgtcggttttaggttttggttgattcaaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 44052315  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  44052314 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 44052234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 23177544 - 23177731
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23177544 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 23177643  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactgaatatatc 186  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||  |||||||    
T  23177644 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactatatatatc 23177731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 46224715 - 46224564
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  46224715 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtc 46224616  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46224615 taatttgcgagac--taaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 46224564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 33012012 - 33011859
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||| | ||    
T  33012012 ttatgcaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatttttc 33011913  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33011912 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 33011859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 40428736 - 40428579
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||| ||||||||||||||||  |     
T  40428736 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaattaaaataattcaattataaatt 40428637  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  40428636 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 40428579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 42372172 - 42372325
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||    
T  42372172 ttatacaattttatgttggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattattgatc 42372271  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42372272 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagcggcccaccct 42372325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 919665 - 919512
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  || | |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  919665 ttatacaattttatgtcggttttaggtttccattgatccaaattccagcaaattggtgtagtagtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 919566  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  919565 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtcgcccaccct 919512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 8086432 - 8086589
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||     
T  8086432 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacacgaaaaatttaaataattcaattataagtt 8086531  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  8086532 taatttgcgagactttaaacaattttttaatggttaattttaatggcccaccctgaca 8086589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 37125895 - 37126052
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  37125895 ttatacaattttatatcagttttaggtttcggttgatcaaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 37125994  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37125995 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 37126052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 45837046 - 45837203
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  45837046 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 45837145  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  45837146 taatttttgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagttgtccaccctgaca 45837203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 48708372 - 48708215
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||| | ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  48708372 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgtctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 48708273  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  48708272 taatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 48708215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 7 - 152
Target Start/End: Original strand, 37343082 - 37343229
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  37343082 aattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattattggtctaattt 37343181  T
Q  105 acgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
     ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37343182 gcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 37343229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 17285249 - 17285095
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaa-tttaaataattcaattatatgt 97  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  17285249 ttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccaccccgaaaaatttaaataattcaattataggt 17285150  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17285149 ctaatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 17285095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 29170144 - 29170323
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||  |||||   |||||||||||||||||| |||| |||    
T  29170144 ttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgcagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaactataggtc 29170243  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  29170244 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 29170323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 8530291 - 8530448
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  8530291 ttatacaattttctgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgcagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 8530390  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8530391 taatttgcgaaactttatacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctgaca 8530448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 9042374 - 9042190
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9042374 ttatacaaatttaagtcggttttaggtttcggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 9042275  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactgaatat 183  Q
    ||||||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||       || |||||||||||||||||    
T  9042274 taatttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggctcaccctaacattttttcctagctccgccactgaatat 9042190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 24790637 - 24790795
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgg-ttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||     ||||||||||||||||||||||| ||    
T  24790637 ttatacaattttatgtcggttttacgttttgggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcaagcgaaaaatttaaataattcaattataggt 24790736  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    | ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  24790737 caaatttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcacaccctgaca 24790795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6849955 - 6850111
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||   ||||  ||||   ||||||||||||||||||||||| ||     
T  6849955 ttatacaaatttatatcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattagtatagtggttcacccgaaaaatttaaataattcaattataggt- 6850053  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  6850054 taatttgtgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctgaca 6850111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24542849 - 24542748
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24542849 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24542750  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24542749 ta 24542748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24542963 - 24542862
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24542963 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24542864  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24542863 ta 24542862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543077 - 24542976
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543077 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24542978  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24542977 ta 24542976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543191 - 24543090
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543191 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543092  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543091 ta 24543090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543305 - 24543204
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543305 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543206  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543205 ta 24543204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543419 - 24543318
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543419 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543320  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543319 ta 24543318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543533 - 24543432
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543533 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543434  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543433 ta 24543432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543647 - 24543546
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543647 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543548  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543547 ta 24543546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543761 - 24543660
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543761 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543662  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543661 ta 24543660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543875 - 24543774
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543875 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543776  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543775 ta 24543774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24543989 - 24543888
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24543989 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24543890  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24543889 ta 24543888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544103 - 24544002
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544103 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544004  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544003 ta 24544002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544217 - 24544116
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544217 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544118  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544117 ta 24544116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544331 - 24544230
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544331 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544232  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544231 ta 24544230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544445 - 24544344
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544445 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544346  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544345 ta 24544344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544559 - 24544458
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544559 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544460  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544459 ta 24544458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544673 - 24544572
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544673 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24544574  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544573 ta 24544572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 156
Target Start/End: Original strand, 44317662 - 44317812
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| ||| | ||||| |||| |||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||    
T  44317662 aattttgtgttgattttatgttttggttgatctaaattcctgtaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataatttaattataggtctatttt 44317760  T
Q  105 acgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
     ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44317761 gcgagattttatacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccttgaca 44317812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 919778 - 919654
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  919778 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-tgaaaatttaaataattcaattataggtc 919680  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  919679 tattttgcgagattttatacaatttt 919654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 8086319 - 8086443
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8086319 ttatgcaattttatgtaggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 8086417  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  8086418 tattttgcgagattttatacaatttt 8086443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 33012125 - 33012015
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  33012125 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 33012027  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  33012026 tattttgcgaga 33012015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 32540662 - 32540528
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||  |  |||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  32540662 ttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggtttatccaaatatccacaaagtggtgtaatggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 32540563  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagtt 133  Q
    || |||  |||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  32540562 tattttgagagactttaaacaaattttcaacagtt 32540528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 17285362 - 17285262
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  17285362 ttatgcaattttatatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 17285264  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  17285263 ta 17285262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 24790524 - 24790648
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24790524 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 24790622  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  24790623 tattttgcgagattttatacaatttt 24790648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 25299156 - 25299032
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  25299156 ttatgcaactttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-ggaaaatttaaataattcaattataggtc 25299058  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  25299057 tattttgcgagattttatacaatttt 25299032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29981775 - 29981651
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29981775 ttatgcaattttgtgtcggttttaagttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 29981677  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  29981676 tattttgcgagattttatacaatttt 29981651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 48708485 - 48708361
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||| ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  48708485 ttatgcaattttatatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacct-gaaaatttaaataattcaattataggtc 48708387  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  48708386 tattttgcgagattttatacaatttt 48708361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 51139775 - 51139899
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  51139775 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtt 51139873  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  51139874 tattttgcgagattttttacaatttt 51139899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 139
Target Start/End: Complemental strand, 49001549 - 49001410
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||| |||||  |||| ||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  49001549 ttatacaattttatgtcggttctaggtttag-ttgatccaaattcccgtaaagtggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 49001451  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaatttt 139  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||    
T  49001450 tattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaatttt 49001410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16693017 - 16692917
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16693017 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 16692919  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  16692918 ta 16692917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 24544786 - 24544686
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24544786 ttatgcaattttgtgtcggttttatgctttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtc 24544688  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  24544687 ta 24544686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 42372059 - 42372183
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42372059 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 42372157  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  42372158 tattttgcgagattttatacaatttt 42372183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 8530172 - 8530282
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  8530172 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttctggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacct-gaaaatttaaataattcaattataggtc 8530270  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  8530271 tattttgcgaga 8530282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 9246969 - 9246840
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  9246969 ttatacaattttgtatcggttttaggtttcggcttatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataattcaattataggtc 9246870  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| | ||||||| |||| ||||||||    
T  9246869 tattttgcaagactttaaacattttttcaa 9246840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 21852090 - 21852219
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| ||||| ||||||||||||  || ||| |||||  |||||||| |   ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  21852090 ttatacaattttgtgtccgttttagatttcgattgatccaaatttttgtaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaattattcaattataggtc 21852189  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  21852190 tattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 21852219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 40428849 - 40428725
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | ||| || ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40428849 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtcca-ctcgaaaatttaaataattcaattatagttc 40428751  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  40428750 tattttgcgagattttatacaatttt 40428725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 40567055 - 40567179
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||    
T  40567055 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaatagttcaattataggtc 40567153  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  40567154 tattttgcgagattttatacaatttt 40567179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 45836933 - 45837057
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  45836933 ttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataatttaattataggtc 45837031  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  45837032 tattttgcgagattttatacaatttt 45837057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Original strand, 46601091 - 46601217
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||  ||| |||| || ||||||| ||||| |||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  46601091 ttatacaactttgtgtcggttttagaattcagttggtctaaattcccgcaaagtggtgcagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataaatc 46601190  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaattttt 125  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||||    
T  46601191 tattttgcgagactttaaacaattttt 46601217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 23177431 - 23177555
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||| |||||  ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  23177431 ttatgcaattttgtatcgattttatattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccaccca-aaaatttaaataattcaattatatgtc 23177529  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  23177530 tattttgcgagattttatacaatttt 23177555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 37125782 - 37125906
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| |||||||  ||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||   ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  37125782 ttatgcaattttgcgtcagttttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtacagtgacccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 37125880  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  37125881 tattttgcgagattttatacaatttt 37125906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 46224828 - 46224704
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  46224828 ttatgcaattttgtatcgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattatagatc 46224730  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  46224729 tattttgcgagattttatacaatttt 46224704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 4 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 29055999 - 29055887
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||||||| ||||| |||||| |||||| | ||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  29055999 tacaattttgtgtcgattttagatttcggcttatccaaatttctgcaaagtggtgtattggcccaaccaaaaaatttaaataattcaattataggtctat 29055900  T
Q  102 tttacgagacttt 114  Q
    ||| |||||||||    
T  29055899 tttgcgagacttt 29055887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 6849842 - 6849936
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||| || |||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6849842 ttatacaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaatttctacaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 6849936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 44052521 - 44052427
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    |||||| ||| ||||||| |||| | ||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44052521 aattttgtgttggttttatgttttgattgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtcta 44052427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 9042468 - 9042387
Alignment:
Q  20 ttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  9042468 ttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcacaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtcta 9042387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 116; Significance: 3e-59; HSPs: 47)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 7440436 - 7440257
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7440436 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaattttaaataattcaattataggtc 7440337  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  7440336 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 7440257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 26525185 - 26525028
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26525185 ttatacaattttatgtcggtttaaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 26525086  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26525085 taatttgcgagactttaaacaatttttcaataattaattttagtggcccaccctgaca 26525028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 148
Target Start/End: Original strand, 43348836 - 43348985
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43348836 ttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 43348935  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 148  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43348936 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggccca 43348985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 3631461 - 3631640
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  3631461 ttatacaattttatgtcgattttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 3631560  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  3631561 taatttgcgggactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 3631640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 7e-51
Query Start/End: Original strand, 8 - 154
Target Start/End: Original strand, 16823340 - 16823488
Alignment:
Q  8 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattta 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  16823340 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttg 16823439  T
Q  106 cgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16823440 cgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctga 16823488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 9596121 - 9595964
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  9596121 ttatacaattttatgtcggttttaggtttgtgttgattcaaattcctgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 9596022  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||    
T  9596021 taatttacgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcctatcctgaca 9595964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 30773081 - 30773234
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30773081 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 30773180  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  30773181 taatttgtgagactttaaacaatttttcagtagttaattttagtggcccaccct 30773234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 43358612 - 43358769
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43358612 ttatacaattttatgtctgttttaggttacggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 43358711  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  43358712 taatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtgacccatcctgaca 43358769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 9737775 - 9737621
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  9737775 ttatgcaattttgtgtcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 9737677  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9737676 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 9737621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 142
Target Start/End: Original strand, 15374302 - 15374445
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15374302 ttatacagttttatatcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtc 15374401  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagt 142  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15374402 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagt 15374445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 25701376 - 25701220
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25701376 ttatacaattt-atgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 25701278  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25701277 taattttttagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 25701220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 143
Target Start/End: Complemental strand, 32304608 - 32304464
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||     
T  32304608 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccggaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataagtt 32304509  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtg 143  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  32304508 taatttgcgagactttaaacattttttcaatagttaattttagtg 32304464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 156
Target Start/End: Original strand, 15374447 - 15374586
Alignment:
Q  19 gttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttga 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| ||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  15374447 gttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgacccaactgaaaaatttaaataattcaattataggtctaatttacgagactttaa 15374546  T
Q  117 acaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  15374547 acaatttttcaatagttaattttagtgatccaccctgaca 15374586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 26785032 - 26785185
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaa-tttaaataattcaattatatgt 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  26785032 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcac-tcgaaaagtttaaataattcaattataggt 26785130  T
Q  98 ctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||  ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  26785131 cttttttgcgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccct 26785185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13013210 - 13013053
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13013210 ttatacaaatttatgtcggttttaggtatcggttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtt 13013111  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13013110 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 13013053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13084598 - 13084441
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||| | ||||||||||   |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| ||     
T  13084598 ttatacaaatttatgtcggttttaggtatcagttgatccaaatttccgcaaattggtatagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtt 13084499  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13084498 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 13084441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 8074194 - 8074041
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8074194 ttatacaatttaatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 8074095  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||    
T  8074094 tattttgcgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtggcccaccct 8074041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 10925711 - 10925864
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||  |||| | |||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10925711 ttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattttggcaaattggtgtagtggtctaccagaaaaatttaaataattcaattataggtc 10925810  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||| ||  |||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10925811 taacttgtgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtgacccaccct 10925864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 20487061 - 20487206
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||  ||||| || |   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  20487061 ttatacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcatccgaaaaatttaaaaaattcaattataagtc 20487160  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20487161 tattttgcgagactttaaacaatttttcaaccgttaattttagtgg 20487206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 41084537 - 41084386
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  41084537 ttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttaattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccaccggaaaaatttaaacaattcaattataggtc 41084438  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  41084437 tattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccacc 41084386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 20656926 - 20656773
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  20656926 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggtccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 20656827  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20656826 taatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgatccaccct 20656773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Original strand, 29390358 - 29390473
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  29390358 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 29390456  T
Q  99 taatttacgagactttg 115  Q
    |||||| ||||||||||    
T  29390457 taatttgcgagactttg 29390473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 41817542 - 41817677
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||| || ||     
T  41817542 ttatacaatttagtgtcagttttagattttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattgtaggta 41817641  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    || |||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  41817642 tattttacgagtctttaaacaatttttcaatggtta 41817677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 26296964 - 26296811
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||  || | |||||   ||||| |||| ||||||||||||  ||    
T  26296964 ttatacatttttatgtcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatgtaaacaattcaattatagatc 26296865  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||  |||||||||    
T  26296864 tattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagcagcccaccct 26296811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26525293 - 26525174
Alignment:
Q  6 caattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatt 103  Q
    ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  26525293 caattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtctattt 26525195  T
Q  104 tacgagactttgaacaatttt 124  Q
    | ||||| |||  ||||||||    
T  26525194 tgcgagattttatacaatttt 26525174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 22579000 - 22578874
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||| |||||  ||||  || |   |||||||||||||||||||||||  ||||     
T  22579000 tacaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccataaagtggtgtagtggttcatccgaaaaatttaaataattcaattataaatctat 22578901  T
Q  102 tttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||    
T  22578900 tttacgagactttaaacaatttttcaa 22578874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 3631348 - 3631472
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  3631348 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttagttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 3631446  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  3631447 tattttgcgagattttatacaatttt 3631472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7440549 - 7440425
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||    
T  7440549 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaactataggtc 7440451  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7440450 tattttgcgagattttatacaatttt 7440425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 19577249 - 19577120
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||||    ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  19577249 ttatacaattttgtgtcggttctagattttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccactcgaaaaatttaaataatttaattataggtc 19577150  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    |  ||| |||||| || |||||||||||||    
T  19577149 tgttttgcgagacattaaacaatttttcaa 19577120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 43348723 - 43348833
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43348723 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattataggtc 43348821  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  43348822 tattttgcgaga 43348833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 25701483 - 25701366
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattt 104  Q
    |||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  25701483 aattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtctatttt 25701385  T
Q  105 acgagactttgaacaattt 123  Q
     ||||| |||  |||||||    
T  25701384 gcgagattttatacaattt 25701366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 43358499 - 43358623
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| | |||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  43358499 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtagtgtagtgacccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtt 43358597  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  43358598 tattttgcgagattttatacaatttt 43358623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 123
Target Start/End: Complemental strand, 8074307 - 8074184
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | |||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  8074307 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtagtgtagtggtccacc-caaaaatttaaataattcaattataaatc 8074209  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaattt 123  Q
    || ||| ||||| |||  |||||||    
T  8074208 tattttgcgagattttatacaattt 8074184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 16823220 - 16823314
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  16823220 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgacccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 16823314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 26297077 - 26296982
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |   || ||||||||||||||||||||    
T  26297077 ttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaatatttaaataattcaattata 26296982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 30772968 - 30773092
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  30772968 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattatagatc 30773066  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  30773067 tattttgcgagattttatacaatttt 30773092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 32304721 - 32304597
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||   |||||| |||||||||||||||| |||    
T  32304721 ttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtattggcccacc-caaaaattgaaataattcaattataggtc 32304623  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  32304622 tattttgcgagattttatacaatttt 32304597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 41084650 - 41084549
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||| | |||||||||||| | ||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41084650 ttatagaattttgtgtcgattttaggttttgattgatccaaatttccgcaaagtggtgtagtggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 41084551  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  41084550 ta 41084549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 9596234 - 9596140
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  |||  ||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  9596234 ttatgcaattttgtgtcggttttatattttagttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattata 9596140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Complemental strand, 37042622 - 37042571
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaa 52  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||    
T  37042622 ttatacaattttatatcggttttagatttcggttgattcaaattcccgcaaa 37042571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 94
Target Start/End: Original strand, 10925604 - 10925692
Alignment:
Q  7 aattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||||| | ||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||| |||||  |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10925604 aattttgtatcggttttatgttttagttgattcaaattcctacaaagtggtgtagtggtccacct-gaaaatttaaataattcaattata 10925692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 90
Target Start/End: Original strand, 5844195 - 5844285
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaat 90  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||| |||| ||||||||||||||  |||||| ||  |||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  5844195 ttatgcaatttggtgtcgattttatgttttggttgatccaaattattgcaaaatggtgtggtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaat 5844285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 97
Target Start/End: Original strand, 15374204 - 15374301
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgt 97  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||| |||||| |||||   ||| |||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  15374204 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatcgaaattcttgcaaagtggtgtaatggtccacc-cacaaatttaaataattcaattatatgt 15374301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 20071282 - 20071239
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  20071282 ttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatt 20071239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13084711 - 13084611
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||| ||||| |||| |||||||||||||| || ||||  ||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  13084711 ttatgcaattttgtatcgattttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgcagtgtcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 13084613  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  13084612 ta 13084611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 134
Target Start/End: Original strand, 28662279 - 28662341
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||| | ||||||| |||| |||||||| |||||    
T  28662279 aaaatttaaataattcaattataggtttattttgcaagactttaaacattttttcaacagtta 28662341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 6 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 13013318 - 13013223
Alignment:
Q  6 caattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    ||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||| || ||||  ||||  ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13013318 caattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaatttctacaaaaaggtgtagtgtcccac-tcgaaaatttaaataattcaattataggtcta 13013223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 62)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 7242592 - 7242435
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7242592 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 7242493  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7242492 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 7242435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 28565087 - 28565244
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28565087 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtc 28565186  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28565187 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 28565244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 28572710 - 28572867
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||  |||    
T  28572710 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgagtc 28572809  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28572810 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 28572867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 8e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 43117552 - 43117731
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43117552 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtttagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 43117651  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  43117652 taatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 43117731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 41837911 - 41837732
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41837911 ttatacaattttatgtcgattttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcacacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 41837812  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  41837811 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 41837732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 21435042 - 21435199
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||    
T  21435042 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaagtttaaataattcaattataggtc 21435141  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21435142 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccatcctgaca 21435199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 1184025 - 1184176
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  1184025 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 1184124  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1184125 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 1184176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5590130 - 5589950
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  5590130 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 5590031  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  5590030 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatggtaaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 5589950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24797010 - 24796830
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  24797010 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattaccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 24796911  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  24796910 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 24796830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 6317079 - 6317236
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  6317079 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggatgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtc 6317178  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6317179 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttacttttagtggcccaccctgaca 6317236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 36060560 - 36060713
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36060560 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 36060659  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  36060660 taatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 36060713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 41388208 - 41388365
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  41388208 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 41388307  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41388308 taatttgcgagactttaaataatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 41388365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 42556050 - 42555893
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  42556050 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaatttggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 42555951  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||    
T  42555950 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagtttattttaatagcccaccctgaca 42555893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 4698009 - 4698189
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4698009 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggtttatccaaattcccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 4698108  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||    
T  4698109 taatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactga 4698189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 1098260 - 1098417
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1098260 ttatacaaatttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccaaccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 1098359  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1098360 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 1098417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22658303 - 22658150
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22658303 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 22658204  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  22658203 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttaatggcccaccct 22658150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3659779 - 3659600
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  ||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3659779 ttatacaattttatatcggttttaggtttcggttgatcaaaatttccgcaaattggtgtagtggctcacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 3659680  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||       |||||||||||||||    
T  3659679 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctaacatttttttctggctccgccactg 3659600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 2317264 - 2317421
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||  ||||   ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  2317264 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggttcacccgaaaaatttaaataattcagttatagatc 2317363  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2317364 tagtttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 2317421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 4231422 - 4231575
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  4231422 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtgccccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 4231521  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  4231522 taatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtccaccct 4231575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 197292 - 197437
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  197292 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataagtc 197391  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  197392 taatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 197437  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Original strand, 312129 - 312274
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  312129 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtaatggcccatccaaaaaatttaaataattcaattataagtc 312228  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  312229 taatttgcgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtgg 312274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 10092457 - 10092610
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  10092457 ttatacaattttatgtcgattttaggttttggtagatccaaattcccgcaaattggtatagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 10092556  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  10092557 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggctcaccct 10092610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 3886737 - 3886580
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||   || ||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  3886737 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatcccaattcccgcaaattggtgtactgacccacccgaaaaatttaaataatttaattataggtc 3886638  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3886637 taatttgtgagactttaaacaattttttaaaagttaattttagtggcccaccctgaca 3886580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 7012540 - 7012692
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||  || |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7012540 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcagttgatccaaattcccgcaaattggagtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 7012639  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  7012640 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatag-taattttagtggtccaccct 7012692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 77; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 9830697 - 9830851
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||| ||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||    
T  9830697 ttatgcaactttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatct-gaaaatttaaataattcaatcataggtc 9830795  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  9830796 taatttgcgaaactttaaacaatttttcaacagttaattttagtggtccaccctga 9830851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 7413234 - 7413387
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  7413234 ttatacatttttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattccctcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtc 7413333  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||  |||||||||| |||||||||||    
T  7413334 tattttgcgagactttaaacaatttttcaacggttaattttaatggcccaccct 7413387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 72 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 34934368 - 34934284
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34934368 aaaatttaaataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 34934284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4231309 - 4231433
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  4231309 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 4231407  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||||||||| |||  ||||||||    
T  4231408 tattttacgagattttatacaatttt 4231433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 42556163 - 42556039
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  42556163 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgcagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 42556065  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  42556064 tattttgcgagattttatacaatttt 42556039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 25642802 - 25642676
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||  |||| |||||   ||||||||||||||| | ||||| | |    
T  25642802 ttatataattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtggtccacccgaaaaatttaaataatttagttataggcc 25642703  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaattttt 125  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  25642702 tattttacgagactttgaacaattttt 25642676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 38567332 - 38567467
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||                      |||||| |||    
T  38567332 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggccca----------------------attataggtc 38567409  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38567410 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 38567467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 7413121 - 7413222
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7413121 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 7413220  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  7413221 ta 7413222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22658416 - 22658292
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22658416 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 22658318  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  22658317 tattttgcgagattttatacaatttt 22658292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 43117438 - 43117563
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||   ||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43117438 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtaatggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 43117537  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  43117538 tattttgcgagattttatacaatttt 43117563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 128
Target Start/End: Original strand, 36108859 - 36108987
Alignment:
Q  2 tatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| || ||||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  36108859 tatacaatgttgtgacggttttaggtttgggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtct 36108958  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    | ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  36108959 attttgcgagactttaaacaaattttcaa 36108987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 126
Target Start/End: Original strand, 17836517 - 17836644
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||  || |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  17836517 ttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgggtgatccaagtttctgcaaagtgatgtagtggcccatccgaaaaatttaaataatttaattataggtc 17836616  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttc 126  Q
    || ||||||||||  | |||||||||||    
T  17836617 tattttacgagacaataaacaatttttc 17836644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 4697896 - 4698020
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4697896 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 4697994  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  4697995 tattttgcgagattttatacaatttt 4698020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 5590243 - 5590119
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  5590243 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtggcccacc-ccaaaatttaaataattcaattataggtc 5590145  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  5590144 tattttgcgagattttatacaatttt 5590119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 7012427 - 7012551
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7012427 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccaccct-aaaatttaaataattcaattataggtc 7012525  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7012526 tattttgcgagattttatacaatttt 7012551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 11635849 - 11635978
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| | ||||| ||||   ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11635849 ttatataattttgtgtcggttttaggtttcgactgatccaaatttccgcaaagtggtctagtgacccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 11635948  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || |||  |||||||| |||||||||||||    
T  11635949 tattttgtgagactttaaacaatttttcaa 11635978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 21434929 - 21435029
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  21434929 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtc 21435027  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  21435028 ta 21435029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 7242704 - 7242581
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||    
T  7242704 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtatagtggcccacc--cgaaatttaaataattcaattatatgtc 7242607  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7242606 tattttgcgagattttatacaatttt 7242581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 2317151 - 2317251
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||   |||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2317151 ttatacaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtaatggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 2317249  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  2317250 ta 2317251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3886850 - 3886726
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  3886850 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaac-caaaaatttaaataattcaattataggtc 3886752  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  3886751 tattttgcgagattttatacaatttt 3886726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 24797123 - 24796999
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  |     
T  24797123 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattatagata 24797025  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||    
T  24797024 taatttgcgagattttatacaatttt 24796999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 6316966 - 6317060
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  6316966 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 6317060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 41838024 - 41837930
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  |||| |||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  41838024 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcatgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 41837930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 72 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 7421939 - 7421860
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||||||||||    
T  7421939 aaaatttaaacaattcaattatatgtctattttgcaagactttaaacaatttttcaacggataatttttgtggcccaccc 7421860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 8 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 25383101 - 25382979
Alignment:
Q  8 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattta 105  Q
    ||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||| |||||  || ||||| |   ||||||||||||||| | ||||| | ||| |||     
T  25383101 attttgtgtcggttttaggttttagttgatccaaattctcgcaaagtggtgaagtagcccatccgaaaaatttaaataatttagttataggcctattttg 25383002  T
Q  106 cgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  25383001 cgagactttgaacaatttttcaa 25382979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 3659892 - 3659768
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||    
T  3659892 ttatgcaattttgtgtcaggtttacgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cggaaatttaaataattcaattataggtc 3659794  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    |  ||| ||||| |||  ||||||||    
T  3659793 tgttttgcgagattttatacaatttt 3659768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 8995060 - 8995189
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||| | ||||||| |||||| |  ||||||||||||   |||| || ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  8995060 ttatacaaatttgtatcggtttaaggttttgtctgatccaaattctcacaaagtgatgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 8995159  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8995160 tattttgcgagactttgagcaatttttcaa 8995189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 10092344 - 10092468
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  10092344 ttatgcaattttgtgttggttttttgttttagttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 10092442  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  10092443 tattttgcgagattttatacaatttt 10092468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 28564974 - 28565074
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28564974 ttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaatgattcaattataggtc 28565072  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  28565073 ta 28565074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 28572597 - 28572697
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| |||    
T  28572597 ttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaatgattcaattataggtc 28572695  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  28572696 ta 28572697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 36060447 - 36060571
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||  ||||| |||| |||||||||||||||||| ||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36060447 ttatgcaattttgtgtcaattttatgttttggttgatccaaattcctggaaagtggtgtagtggcacaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 36060545  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36060546 tattttgcgagattttatacaatttt 36060571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 88
Target Start/End: Original strand, 41169901 - 41169989
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattca 88  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| |||||  |||||||| || ||||||||||||||||||    
T  41169901 ttatataattttatgtcggttctaggttttggttaatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggccca-ctcgaaaatttaaataattca 41169989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 41388095 - 41388195
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||||||||||| |||||  |||  |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41388095 ttatacaattttgtgtcggttttatgatttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgatccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 41388193  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  41388194 ta 41388195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 7422118 - 7422008
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||  || ||| ||||||   ||||||||||| ||||||||||| |||    
T  7422118 ttatacaattttgtgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgaaaagtgatgtagtgacccacccgaaaaatttaaat-attcaattataggtc 7422020  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  7422019 tattttgcgaga 7422008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 1098147 - 1098247
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | || |||||| |||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1098147 ttatgcaattttgtatcagttttatgttttggttgatccaaattcctataaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 1098245  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  1098246 ta 1098247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 38567219 - 38567343
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||| ||||  ||||||||||||||||||||| | |||  ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  38567219 ttatgcaattttgtgttgattttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagttgtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcgattataggtc 38567317  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  38567318 tattttgcgagattttatacaatttt 38567343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 127
Target Start/End: Original strand, 8996509 - 8996564
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttca 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||| ||| ||||||||||||    
T  8996509 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagattttaaacaatttttca 8996564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1183912 - 1184036
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||| |||||||||  ||| | |||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1183912 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgattcaaattcctaaaaagtagtgtagtggaccaccca-aaaatttaaataattcaattataggtc 1184010  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    |||||| ||||| |||  ||||||||    
T  1184011 taatttgcgagattttatacaatttt 1184036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 115; Significance: 1e-58; HSPs: 54)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 36436138 - 36435981
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36436138 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 36436039  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36436038 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 36435981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 6749962 - 6749805
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  6749962 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 6749863  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6749862 taatttgcgagactttaaacagtttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 6749805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 34983478 - 34983635
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34983478 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccagcaaattggtgtagtgacccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 34983577  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34983578 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaatttttgtggcccaccctgaca 34983635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 1114994 - 1114814
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  1114994 ttatacaattttatgttgattttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgtagtggcctacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 1114895  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  1114894 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 1114814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 23869865 - 23870020
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||   ||    
T  23869865 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatgaatc 23869964  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23869965 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 23870020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1021024 - 1020867
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  || ||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  1021024 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtagcccatccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 1020925  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1020924 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 1020867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 26293362 - 26293519
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  26293362 ttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 26293461  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  26293462 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacccagaca 26293519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 44545685 - 44545532
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44545685 ttatacaattttatgttggttttaagtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtc 44545586  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44545585 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 44545532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 12995168 - 12995347
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12995168 ttatacaaatttatgtcggttttaggtttcggttgattcaaatttccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 12995267  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  12995268 taatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 12995347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 16194454 - 16194633
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |||||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  16194454 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtagcccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtc 16194553  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       |||||||||||||||    
T  16194554 taatttgcaagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggcccactctgacatttttttctggctccgccactg 16194633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 26860618 - 26860439
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26860618 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaatttccgcaaattgatgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 26860519  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||       |||||||||||||||    
T  26860518 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcctaccctgacatttttttctggctccgccactg 26860439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 2249783 - 2249936
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  2249783 ttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 2249882  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  2249883 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatgacccaccct 2249936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 7366353 - 7366506
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||||||||    ||||||||||||||||||||||| |||    
T  7366353 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacgcgaaaaatttaaataattcaattataggtc 7366452  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  7366453 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatggttaattttagtggcccaccct 7366506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 38527375 - 38527532
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||| | ||||| |||    
T  38527375 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataatttatttataggtc 38527474  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38527475 taatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttcgtggcccactctgaca 38527532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 31392748 - 31392926
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31392748 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatcccaattctcgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 31392847  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||       |||||||||||||||    
T  31392848 taatttgcgagactttaaacaatttttcaa-agttaattttagtgacccaccctgacatttttttctggctccgccactg 31392926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 11764996 - 11765149
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11764996 ttatacaattttatgtcggttttatgtttcagctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 11765095  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11765096 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccct 11765149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13615919 - 13615762
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  13615919 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaattataggtc 13615820  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||  ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  13615819 taattcgcgagattttaaacaatttttcaatagttaattttactgatccaccctgaca 13615762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 22674809 - 22674652
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||  | |||    
T  22674809 ttatgcaattttgtgtcggttttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattgaaggtc 22674710  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22674709 taatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgaca 22674652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 42016705 - 42016858
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42016705 ttatacaattttatgtcggttttaagttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagcggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 42016804  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  42016805 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttaatggctcaccct 42016858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 34494544 - 34494366
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  34494544 ttatgcaattttgtatcggttttatgtttttgttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 34494446  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||       |||||||||||||||    
T  34494445 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggtccaccctgacatttttttctggctccgccactg 34494366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 19283999 - 19283847
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||| ||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  19283999 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtgtcccaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 19283901  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19283900 taatttatgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 19283847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 41699273 - 41699449
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||| | | || |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  41699273 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcccgcaaattg-tagaggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 41699371  T
Q  101 atttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       |||||||||||||||    
T  41699372 atttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacccagacatttttttctggctccgccactg 41699449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 28745449 - 28745303
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||||          
T  28745449 ttatataattttatgccggttttagattttggttgatctaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacctgaaaaatttaaataattcaatta------ 28745356  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
         | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28745355 -----tgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 28745303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 3836295 - 3836144
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| || ||  ||||||  ||  ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3836295 ttatacaattttatgtctgttttaggtttcagttgatcaaaattcccgcaaagtgatgtagtggccaccc--gaaaatttaaataattcaattatatatc 3836198  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || |||||||| |||| |||||||||| ||  |||||||||||| |||| ||||    
T  3836197 tattttacgaggctttaaacaattttttaacggttaattttagtagccctccct 3836144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 125
Target Start/End: Complemental strand, 11935331 - 11935205
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  11935331 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtattggcccaccagaaaaatttaaataattcaattatagatc 11935232  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaattttt 125  Q
    || |||  |||||||| ||||||||||    
T  11935231 tattttgtgagactttaaacaattttt 11935205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 31643680 - 31643551
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||| ||||| |||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  31643680 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcgcctgattcaaattcccgcaaagtggtgtggtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 31643581  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  31643580 tattttgcgagactttaaacaatttttcaa 31643551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 43471523 - 43471370
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||  ||||| |||||  || | |||||   |||||||||| |||||||||||| |||    
T  43471523 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttgattgatccaaattctcgcaaagtggtgtagtagtccacccgaaaaatttaaacaattcaattataggtc 43471424  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||    
T  43471423 tattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccct 43471370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 26293249 - 26293359
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26293249 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 26293347  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  26293348 tattttgcgaga 26293359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 1021137 - 1021037
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  1021137 ttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 1021039  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  1021038 ta 1021037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36436251 - 36436127
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36436251 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 36436153  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36436152 tattttgcgagattttatacaatttt 36436127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 38763803 - 38763927
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  38763803 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 38763901  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  38763902 tattttgcgagattttatacaatttt 38763927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 2 - 140
Target Start/End: Original strand, 2077580 - 2077720
Alignment:
Q  2 tatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtct 99  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| |||||||  |||| ||| |  ||||  || |   ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2077580 tatacaattttgtgtcggttttagctttcggctgatctaaattcccacaaagtggggtagtggttcatccaaaaaatttaaataattcaattataggtct 2077679  T
Q  100 aatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaatttta 140  Q
    | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||    
T  2077680 attttacgagactttaaacaatttttcaacggttaatttta 2077720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 2249670 - 2249780
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  2249670 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 2249768  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  2249769 tattttgcgaga 2249780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 31392636 - 31392759
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   ||||||||| ||||||||||||| |||    
T  31392636 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc--caaaatttaagtaattcaattataggtc 31392733  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  31392734 tattttgcgagattttatacaatttt 31392759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 1115107 - 1114983
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| | || |||||||||||||| ||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  1115107 ttatacaattttgtgtcggttttatgatttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataatttaattataggtc 1115009  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  1115008 tattttgcgagattttatacaatttt 1114983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 12995055 - 12995155
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  12995055 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaattggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 12995153  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  12995154 ta 12995155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 16194341 - 16194465
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| | |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16194341 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcagagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 16194439  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  16194440 tattttgcgagattttatacaatttt 16194465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 34983365 - 34983489
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  34983365 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccatc-caaaaatttaaataattcaattataggtc 34983463  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  34983464 tattttgcgagattttatacaatttt 34983489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 42016592 - 42016716
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  42016592 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaattgatgcagtggcccacc-caaaaatttaaataattcaattataggtc 42016690  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  42016691 tattttgcgagattttatacaatttt 42016716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44545798 - 44545674
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||| |||||| |||||   ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44545798 ttatacaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtaatggccca-ctcgaaaatttaaataattcaattataggtc 44545700  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44545699 tattttgcgagattttatacaatttt 44545674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 11935445 - 11935335
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||  | ||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11935445 ttatacaattttgtgtcggttttagattttggttgatccaaattctcgtaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 11935346  T
Q  99 taatttacgag 109  Q
    || ||| ||||    
T  11935345 tattttgcgag 11935335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 106 - 178
Target Start/End: Original strand, 38763964 - 38764036
Alignment:
Q  106 cgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  38763964 cgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 38764036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 13616032 - 13615908
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| | ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  13616032 ttatgcaattttgtgttgtttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaaatggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataatttaattataggtc 13615934  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  13615933 tattttgcgagattttatacaatttt 13615908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 23869752 - 23869876
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||     
T  23869752 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtagtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggta 23869850  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  23869851 tattttgcgagattttatacaatttt 23869876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29142000 - 29141871
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||| || ||||| |||||| |||||||||||||||||||    ||| || ||   |||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  29142000 ttatacaatgttgtgtcgattttagatttcggttgatccaaattctcataaaatgatgtaatggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 29141901  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  29141900 tattttgcgagactttaaacaatttttcaa 29141871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 3836409 - 3836314
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || |||||  |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  3836409 ttatacaattttgtgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcgaagtggtgtagtgaaccacctaaaaattttaaataattcaattata 3836314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 7366240 - 7366364
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7366240 ttatgcaattttgtgtgagttttatgttttgcttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatacatc 7366338  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  7366339 tattttgcgagattttatacaatttt 7366364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 11764883 - 11765007
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||| |||||  |||| ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  11764883 ttatacaactttgtgtcggttttatgttttggttgattcaaattcctgcaaagtggtgtagtggtcca-cacaaaaatttaaataattcaattataggtc 11764981  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  11764982 tattttgcgagattttatacaatttt 11765007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 26860731 - 26860607
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||  ||||||||||| |||| |||||||||||||| || |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  26860731 ttatgcaatttcgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctacaaagtggtgtagtggcccaccca-aaaatttaaataattcaattataggtc 26860633  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  26860632 tattttgcgagattttatacaatttt 26860607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 28745561 - 28745452
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28745561 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggtt-atccaaattcctgcaaagtggtgtagtggctcaccc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 28745464  T
Q  99 taatttacgaga 110  Q
    || ||| |||||    
T  28745463 tattttgcgaga 28745452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 38527263 - 38527357
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| || | |||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  38527263 ttatgcaattttgtatcggttttatgtcttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagcccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 38527357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 45
Target Start/End: Original strand, 38763916 - 38763960
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattc 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38763916 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattc 38763960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 32100020 - 32100154
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg-------gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattat 93  Q
    |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||  |||| |||||       ||| ||||||   ||||||||||||||||||||||    
T  32100020 ttatacaattttgtgtcagttttaggtttcggttgatctaaattcccacaaagtggtgtagtggtgtgacccacccgaaaaatttaaataattcaattat 32100119  T
Q  94 atgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    |  |||| |||  ||| |||| || ||||||||||    
T  32100120 agatctattttgtgagtctttaaataatttttcaa 32100154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 4 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29035466 - 29035340
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||   ||||| |||||  ||  |||||    |||||||||||||||||||||||  ||||     
T  29035466 tacaactttgtgtcgattttaggtttcggttgatctaaattttcgcaaagtggtgtagtttcccactcgaaaaatttaaataattcaattatagatctat 29035367  T
Q  102 tttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    ||| | || |||| |||||||||||||    
T  29035366 tttgcaagtctttaaacaatttttcaa 29035340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0050
Description:

Target: scaffold0050; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19399
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  19248 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattccaaaaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 19347  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19348 taatttacgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 19399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0050; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 19135 - 19259
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  19135 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggtttatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 19233  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  19234 tattttgcgagattttatacaatttt 19259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 61)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 9624198 - 9624377
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  9624198 ttatacaattttatgtcggttttaggttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 9624297  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  9624298 taatttacgagactttaaacaatttttcactagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 9624377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36358266 - 36358087
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36358266 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 36358167  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  36358166 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 36358087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 40055793 - 40055972
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  40055793 ttatacaattttatgtcagttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 40055892  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||       |||||||||||||||    
T  40055893 taatttgcgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcgcaccctgacatttttttctggctccgccactg 40055972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 44142963 - 44143142
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  44142963 ttatacaattttatgtcggttttagattttgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 44143062  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||    
T  44143063 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactg 44143142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 45350253 - 45350432
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||  ||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  45350253 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgattcaaattcccgcaaattggtgtagtgtcccacccgaaaaatttaaataattcaattatatgtc 45350352  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  45350353 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 45350432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 31065579 - 31065422
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||| ||||||| | |||    
T  31065579 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgcagtggcccacccgaaaaatttaaataaatcaattacaggtc 31065480  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgaca 156  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31065479 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccactctgaca 31065422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 43859293 - 43859448
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  43859293 ttatacaattttacgtcggttttaggtttcggttgatccaaatttctgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 43859392  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43859393 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 43859448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 31931980 - 31931827
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  31931980 ttatacgattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaattatagatc 31931881  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31931880 taatttacgagattttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 31931827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 17167069 - 17167249
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17167069 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattgatgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 17167168  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||    
T  17167169 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactga 17167249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 99; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23469352 - 23469199
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  23469352 ttatacaattttatgtcggttttaggtttctgttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccatctgaaaaatttaaataattcaattataggtc 23469253  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23469252 taatttgcgagattttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccct 23469199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 26873905 - 26874085
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||| | |||    
T  26873905 ttatacaattttatgtcagttttagatttcgattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattaaaggtc 26874004  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||    
T  26874005 taatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacatttttttctggctccgccactga 26874085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 179
Target Start/End: Original strand, 46027882 - 46028062
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||     
T  46027882 ttatacaattttatgtcagttttagatttaggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggta 46027981  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactga 179  Q
    |||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       ||||||||||||||||    
T  46027982 taatttgcgagactttaaacgatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacatgtttttctggctccgccactga 46028062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Original strand, 8461788 - 8461967
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  8461788 ttatacaattttatgtctgttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 8461887  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||       |||||||||||||||    
T  8461888 taatttgtgatactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctaacatttttttctggctccgccactg 8461967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 1 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 36675443 - 36675264
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  36675443 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 36675344  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctgacannnnnnnctggctccgccactg 178  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||       |||||||||||||||    
T  36675343 taatttgcaagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccatcctaacatttttttctggctccgccactg 36675264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 44724019 - 44723864
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||||| |   | ||||||||||||| ||||||| |||    
T  44724019 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccacaaattggtgtagtggcccatccgaagaatttaaataatttaattataggtc 44723920  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccctga 154  Q
    |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  44723919 taatttgcgagactttaaacaacttttcaatagttaattttagtagcccaccctga 44723864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 44467977 - 44467827
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||  ||    
T  44467977 ttatacaattttatgttggttttaggtttcaattgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggtccacctgaaaaatttaaataattcaattatagatc 44467878  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccac 149  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44467877 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccac 44467827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 22723732 - 22723579
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  22723732 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaatttcccgcaaattggtgtagtggcccacccgcaaaatttaaataattcaattataggtc 22723633  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  22723632 taatttgtgaaactttaaacaatttttcaatagttaattttagtagtccaccct 22723579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16834231 - 16834080
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||| |  ||| ||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  16834231 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcgattgatccaaattctcacaaattggggtagtgtcccacccaaaaaatttaaataatttaattataggtc 16834132  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16834131 taatttgcgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 16834080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 42241885 - 42241732
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||  || | |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  42241885 ttatacaattttatgtcggttttagatttcggttgatccaaattcccggaaattggtgtagtcgtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 42241786  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42241785 taatttgagagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcctaccct 42241732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 39976523 - 39976675
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| |||||||||||||||| ||||  |||||||||||| ||| |||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39976523 ttatacaaatttatgtcggttttagatttcaattgatccaaatttctgtaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 39976622  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
    ||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39976623 taatttgtgagactttaaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 39976675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 41367861 - 41368014
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||||||  |||  |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  41367861 ttatacaaatttatgtcggttttaggttttagttgatccaaatttccgcaaattggtgtagtgatccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatc 41367960  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    ||||||  |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41367961 taatttgtgagactttaaacaattttttaatagttaattttagtggcccaccct 41368014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 31428939 - 31429092
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | |||||||||  |||| |||||   ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  31428939 ttataaaattttatgtcggttttaggtttcagttgatctcaattcccgtaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatgtaaataattcaattataggtt 31429038  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||    
T  31429039 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaatttcagtagcccaccct 31429092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 18104388 - 18104243
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |   ||||||||||||||||||||| |  ||    
T  18104388 ttatgcaattttgtgtcggtttcatgttttggttgatccaaattcccgcaaattggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattcaattaaagatc 18104289  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    |||||||| | ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18104288 taatttactaaactttaaacaatttttcaataattaattttagtgg 18104243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 29075141 - 29075000
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtcta 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |        |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29075141 ttatacaattttatgtcggttttaagtttcggttgatccaaattggtgta--------gtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtcta 29075050  T
Q  101 atttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    |||| ||| ||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  29075049 atttgcgaaactttaaacaattttttaatagttaattttagtggtccacc 29075000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 109
Target Start/End: Original strand, 26873792 - 26873901
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  26873792 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 26873890  T
Q  99 taatttacgag 109  Q
    |||||| ||||    
T  26873891 taatttgcgag 26873901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 4 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 46828902 - 46828761
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||| || |||||||||||||| || ||||||  ||||     
T  46828902 tacaattttatgtcggtattaggtttcggttgatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggtcca-ctcgaaaatttaaataactcgattatagatctat 46828804  T
Q  102 tttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtgg 144  Q
    |||  |||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||    
T  46828803 tttgagagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtgg 46828761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 8 - 151
Target Start/End: Original strand, 29663010 - 29663155
Alignment:
Q  8 attttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaattta 105  Q
    ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||   |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  29663010 attttgtgtcggttttagatttcggctgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttg 29663109  T
Q  106 cgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
    | ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  29663110 caagactttaaacaatttttcaacggttaattttagtggtccaccc 29663155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 22723845 - 22723721
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  22723845 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 22723747  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  22723746 tattttgcgagattttatacaatttt 22723721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 17166955 - 17167080
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17166955 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 17167054  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  17167055 tattttgcgagattttatacaatttt 17167080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 25174236 - 25174365
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||   |||| |||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  25174236 ttatataattatgtgttggttttaggtttcggttgatccaaattctcacaaagtggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 25174335  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  25174336 tattttgcgagactttaaacaatttttcaa 25174365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 29075254 - 29075130
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  29075254 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 29075156  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  29075155 tattttgcgagattttatacaatttt 29075130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36675556 - 36675432
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattg--gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||  || ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  36675556 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtgatgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 36675458  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36675457 tattttgcgagattttatacaatttt 36675432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44468090 - 44467966
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44468090 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 44467992  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44467991 tattttgcgagattttatacaatttt 44467966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 44724132 - 44724008
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||| |||||  | ||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  44724132 ttatacaattttgtgtcggttttatgttttggttgatctaaattcctgcaaagtggtgtagaggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 44724034  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44724033 tattttgcgagattttatacaatttt 44724008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 22499847 - 22499716
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||  |||||||||||  |||    ||| |||||||||||| ||     
T  22499847 ttattcaattttatatcggttttaggtttcggttaatctaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccacctaaaaa----aaaaaattcaattataagtt 22499752  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  22499751 tattttacgagactttaaacaatttttcaatggtta 22499716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 31065692 - 31065568
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  31065692 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttaatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 31065594  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  31065593 tattttgcgagattttatacaatttt 31065568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 42241998 - 42241874
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  42241998 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtgactcacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 42241900  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||||||||| |||  ||||||||    
T  42241899 tattttacgagattttatacaatttt 42241874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 46027769 - 46027893
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||| |||    
T  46027769 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcttgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattaaattataggtc 46027867  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  46027868 tattttgcgagattttatacaatttt 46027893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 72 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 23562644 - 23562564
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  23562644 aaaatttaaacaattcaattataggtctattttgcgaggctttaaacaatttttcaacggttaattttagtggcccaccct 23562564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 23469465 - 23469341
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  23469465 ttatgcaattttgtgtcggttttatattttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagttgtccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 23469367  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  23469366 tattttgcgagattttatacaatttt 23469341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 28754895 - 28755023
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||  |||||  |||||  ||||||||||   |||| |||||||||||||||||| |||    
T  28754895 ttatacaattttatgtcaattttaggtttcagttgatccaaatt-ttgcaaggtggtgtagtggcccacccaaaaaaattaaataattcaattataagtc 28754993  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| | || |||| |||||||||||||    
T  28754994 tattttccaagtctttaaacaatttttcaa 28755023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 45350140 - 45350264
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||   ||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  45350140 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtaatggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 45350238  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  45350239 tattttgcgagattttatacaatttt 45350264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 16649665 - 16649537
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  | ||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16649665 ttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcacccc-aaaatttaaataattcaattataggtc 16649567  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  16649566 tattttgcgagactataaacaatttttcaa 16649537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 16834346 - 16834246
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| |||| |||||| |||| |||||||||||||| ||||||| |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  16834346 ttatgcaattttgtgtcagttttatgttttggttgatccaaatttctgcaaagtggtgtagtggcccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 16834248  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  16834247 ta 16834246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17624026 - 17623898
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| | | | ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||  | ||  ||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  17624026 ttatacaattttgtattgattttaggtttcggctgatccaaattcccgcaaagtggtgtagcggtgcacccc-aaaatttaaataattcaattataggtc 17623928  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| ||||||| | |||||||||||||    
T  17623927 tattttgcgagactataaacaatttttcaa 17623898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 29502201 - 29502072
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||   |||||||||||| ||||| |||||  |||||||| |   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  29502201 ttattcaattttgtgttggttttaggtttcgacagatccaaattcccgcaaagtggtgtagtggcccatccgaaaaatttaaataattgaattataggtc 29502102  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || |||  |||||||| ||| |||||||||    
T  29502101 tattttgtgagactttaaactatttttcaa 29502072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 128
Target Start/End: Original strand, 30781100 - 30781228
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtgg--tggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||| |||||| |||||||||| ||||||||| | | ||| |||||   ||| |||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  30781100 ttatacaattttgtgtaggtttt-ggtttcggttaatccaaatttccgtaaagtggtgcaatggtccacccaaaaaatttaaataattcaattataggtc 30781198  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaa 128  Q
    || ||| |||| |||| |||||||||||||    
T  30781199 tattttgcgagtctttaaacaatttttcaa 30781228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 36358379 - 36358255
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  ||    
T  36358379 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-caaaaatttaaataattcaattatagatc 36358281  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  36358280 tattttgcgagattttatacaatttt 36358255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 43859180 - 43859280
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  43859180 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccatc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 43859278  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  43859279 ta 43859280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 72 - 124
Target Start/End: Original strand, 6961194 - 6961246
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  6961194 aaaatttaaataattcaattataggtctattttgcgagactttgaacaatttt 6961246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 134
Target Start/End: Original strand, 9021516 - 9021648
Alignment:
Q  4 tacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaa-ttg-gtggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaa 101  Q
    ||||||||| ||||  ||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||  ||||     
T  9021516 tacaattttgtgtcaattttaagtttcggctgatctaaatttccgcaaaattgtgtggtggcccacccaaaaaatttatataatttaattatagttctat 9021615  T
Q  102 tttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  9021616 tttgcgagactttaaacaatttttcaatggtta 9021648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 31428826 - 31428920
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  31428826 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttgattgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggtccacc-cgaaaatttaaataatttaattata 31428920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 39976410 - 39976504
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  39976410 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctacaaagtggtgtagtgacccacc-cgaaaatttaaataattcaattata 39976504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 72 - 130
Target Start/End: Original strand, 9013977 - 9014035
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaata 130  Q
    |||||||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  9013977 aaaatttatataatttaattataggtctaatttgcgagactttaaacaatttttcaata 9014035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 9624085 - 9624209
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| |||||||  ||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||   ||||||||||||||| ||||||| |||    
T  9624085 ttatgcaattttgtgttggttttatattttggttgatccaaattcctacaaagtggtgttgtggcccacc-caaaaatttaaataatttaattataggtc 9624183  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  9624184 tattttccgagattttatacaatttt 9624209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 44142851 - 44142974
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||| ||||   |||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| ||||||||||||||||||| |||    
T  44142851 ttatgcaattttgtgttggttttatgttttctttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcc-acctggaaa-tttaaataattcaattataggtc 44142948  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  44142949 tattttgcgagattttatacaatttt 44142974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 134
Target Start/End: Original strand, 9014481 - 9014623
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||  | |||||||||   ||||| |||||  ||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||    
T  9014481 ttatacaattttgtgtcggttttaggtttcgactaatccaaattttcgcaaaatggtgtagtggcccacccgaaaaatttatataatttaattataggtc 9014580  T
Q  99 ta-------atttacgagactttgaacaatttttcaatagtta 134  Q
    ||        ||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9014581 tattttgatttttgcgagactttaaacaatttttcaatagtta 9014623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 40055680 - 40055804
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | |||||| || |||| ||||||||||||||| ||  || |||||  |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  40055680 ttatgcaattttgtatcggttgtatgttttggttgatccaaattcttgataagtggtgtagtggcccatcc-gaaaatttaaataattcaattataggtc 40055778  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  40055779 tattttgcgagattttatacaatttt 40055804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4248972 - 4248865
Alignment:
Q  16 tcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactt 113  Q
    |||||||||| |||| | ||||| |||||  |||||| |||||  ||||||| ||   ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||||    
T  4248972 tcggttttagttttcagctgatctaaatttttgcaaagtggtgtagtggcccgcccgaaaaatttaaataattcaattataggtctattttgcaagactt 4248873  T
Q  114 tgaacaat 121  Q
    | ||||||    
T  4248872 taaacaat 4248865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 22566649 - 22566606
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 44  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  22566649 ttatacaattttgtgtcggttttaagtttcggctgatccaaatt 22566606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 72 - 129
Target Start/End: Original strand, 8727884 - 8727941
Alignment:
Q  72 aaaatttaaataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaat 129  Q
    |||||||||| ||||| ||| || ||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8727884 aaaatttaaacaattcgattgtaggtctattttacgaaactttaaacaatttttcaat 8727941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 3)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 151
Target Start/End: Original strand, 65250 - 65402
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  65250 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 65349  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccc 151  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  65350 taatttgcgagactttaaacaatttttcaaaagttaattttagtggcccaccc 65402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 65136 - 65261
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||    
T  65136 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatcccaattcccgcaaattggtgtagtggcccacccgaaaaatttaaataattcaattataggtc 65235  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  65236 tattttgcgagattttatacaatttt 65261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 8e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 100
Target Start/End: Original strand, 65023 - 65123
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||| |||    
T  65023 ttatgcaattttgtgtcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattataggtc 65121  T
Q  99 ta 100  Q
    ||    
T  65122 ta 65123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 152
Target Start/End: Original strand, 1306 - 1459
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||   |||||||||||||||||||||||  |     
T  1306 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccgaaaaatttaaataattcaattatagatt 1405  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccaccct 152  Q
    |||||| ||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  1406 taatttgcgaaactttaaacagtttttcaatggtaaattttagtggcccaccct 1459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 1193 - 1317
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  1193 ttatgcaattttgtgtcgattttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtggcccacc-cgaaaatttaaataattcaattatatgtc 1291  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  1292 tattttgcgagattttatacaatttt 1317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 52; Significance: 5e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 89
Target Start/End: Original strand, 331974 - 332064
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaa 89  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||   ||||||||||||||||||    
T  331974 ttatacaattttatgtcgattttaggtttcggttgatccaaattctcgcaaattggtgtagtggtccacccaaaaaatttaaataattcaa 332064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 124
Target Start/End: Original strand, 331861 - 331985
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattggtg--gtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattatatgtc 98  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||  || | |||||  ||||||||||||||||||||||||  ||    
T  331861 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcctgcaaagtggtgtagtagtccacc-cgaaaatttaaataattcaattatagatc 331959  T
Q  99 taatttacgagactttgaacaatttt 124  Q
    || ||| ||||| |||  ||||||||    
T  331960 tattttgcgagattttatacaatttt 331985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 81 - 150
Target Start/End: Original strand, 332441 - 332510
Alignment:
Q  81 ataattcaattatatgtctaatttacgagactttgaacaatttttcaatagttaattttagtggcccacc 150  Q
    ||||||||||||||  ||||||||   ||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  332441 ataattcaattatagctctaatttgtaagactttaaacaatttttcaacagttaattttcgtggcccacc 332510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 50; Significance: 8e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 54
Target Start/End: Original strand, 11380 - 11433
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaatt 54  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11380 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcccgcaaatt 11433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 94
Target Start/End: Original strand, 11267 - 11361
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaattcctgcaaattgg--tggtggcccaccttgaaaatttaaataattcaattata 94  Q
    |||| ||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| |||  | |||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  11267 ttatgcaattttgtatcggttttatgttttggttgatccaaattcgtgcaaagtggtatagtggcccatc-caaaaatttaaataattcaattata 11361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 44
Target Start/End: Complemental strand, 303887 - 303844
Alignment:
Q  1 ttatacaattttatgtcggttttaggtttcggttgatccaaatt 44  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||    
T  303887 ttatacaattttatgtcggttttaaatttcggttgattcaaatt 303844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University