View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15513_low_23 (Length: 247)

Name: NF15513_low_23
Description: NF15513
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15513_low_23
NF15513_low_23
[»] chr6 (70 HSPs)
chr6 (6-247)||(30676640-30676881)
chr6 (6-247)||(34963364-34963605)
chr6 (19-247)||(12742321-12742549)
chr6 (19-247)||(22782231-22782459)
chr6 (19-247)||(24422551-24422779)
chr6 (19-247)||(33861798-33862026)
chr6 (19-247)||(33864282-33864510)
chr6 (19-247)||(8055033-8055261)
chr6 (19-247)||(18334522-18334750)
chr6 (19-247)||(19005050-19005278)
chr6 (19-247)||(19858849-19859077)
chr6 (19-247)||(1540841-1541069)
chr6 (19-247)||(2291110-2291338)
chr6 (19-247)||(26924570-26924798)
chr6 (19-244)||(25656633-25656858)
chr6 (20-247)||(25688507-25688734)
chr6 (19-229)||(1595553-1595763)
chr6 (19-203)||(25754813-25754997)
chr6 (31-194)||(18456735-18456898)
chr6 (19-203)||(20556868-20557050)
chr6 (19-189)||(16448514-16448685)
chr6 (19-193)||(3852001-3852175)
chr6 (31-164)||(18461895-18462028)
chr6 (13-177)||(25629310-25629475)
chr6 (10-177)||(18409782-18409950)
chr6 (13-174)||(29060541-29060703)
chr6 (13-177)||(20593774-20593939)
chr6 (13-160)||(17287768-17287916)
chr6 (6-194)||(19847932-19848122)
chr6 (13-177)||(20360915-20361080)
chr6 (13-177)||(16496245-16496410)
chr6 (13-177)||(19303496-19303660)
chr6 (27-177)||(25644335-25644487)
chr6 (13-177)||(20076701-20076862)
chr6 (13-192)||(22780166-22780347)
chr6 (31-177)||(18821801-18821946)
chr6 (13-162)||(20638253-20638403)
chr6 (27-192)||(20109153-20109322)
chr6 (177-246)||(12942363-12942432)
chr6 (13-194)||(8227448-8227631)
chr6 (178-247)||(28289265-28289334)
chr6 (13-73)||(25714418-25714478)
chr6 (182-247)||(18913994-18914059)
chr6 (182-247)||(18937252-18937317)
chr6 (6-124)||(23992421-23992540)
chr6 (13-73)||(27333277-27333338)
chr6 (13-73)||(27394017-27394078)
chr6 (178-246)||(15875469-15875537)
chr6 (31-173)||(23019425-23019567)
chr6 (27-173)||(9098473-9098620)
chr6 (198-247)||(31630577-31630626)
chr6 (13-177)||(35245587-35245749)
chr6 (27-126)||(19668386-19668488)
chr6 (29-126)||(28496477-28496575)
chr6 (29-126)||(29808888-29808986)
chr6 (13-59)||(22080799-22080845)
chr6 (26-133)||(19652209-19652316)
chr6 (13-65)||(1561304-1561356)
chr6 (211-247)||(17377778-17377814)
chr6 (39-160)||(15041522-15041644)
chr6 (31-65)||(11185524-11185558)
chr6 (6-110)||(25603406-25603512)
chr6 (6-110)||(25611744-25611850)
chr6 (13-162)||(16920602-16920750)
chr6 (214-247)||(19847898-19847931)
chr6 (33-73)||(22831524-22831565)
chr6 (199-247)||(23992604-23992655)
chr6 (33-73)||(33443068-33443108)
chr6 (142-194)||(23076862-23076915)
chr6 (26-73)||(4185880-4185928)
[»] chr2 (71 HSPs)
chr2 (6-247)||(32214851-32215092)
chr2 (19-247)||(18808947-18809175)
chr2 (19-247)||(23709462-23709690)
chr2 (19-247)||(23711943-23712171)
chr2 (19-247)||(39682317-39682545)
chr2 (19-247)||(6725999-6726227)
chr2 (19-247)||(21154990-21155218)
chr2 (19-247)||(23130866-23131094)
chr2 (19-247)||(23133333-23133561)
chr2 (19-247)||(26505383-26505611)
chr2 (19-247)||(26507861-26508089)
chr2 (19-247)||(34402452-34402680)
chr2 (19-247)||(571401-571629)
chr2 (19-247)||(23135594-23135822)
chr2 (19-247)||(24898125-24898354)
chr2 (19-247)||(24900608-24900837)
chr2 (19-247)||(24903085-24903314)
chr2 (19-247)||(24905562-24905791)
chr2 (19-247)||(24908037-24908266)
chr2 (23-247)||(24367782-24368006)
chr2 (19-247)||(28577103-28577331)
chr2 (19-247)||(32039428-32039656)
chr2 (19-247)||(22105416-22105645)
chr2 (19-247)||(45029784-45030012)
chr2 (19-247)||(38967378-38967606)
chr2 (19-193)||(43137303-43137477)
chr2 (19-194)||(24529511-24529687)
chr2 (100-247)||(24642784-24642933)
chr2 (13-177)||(22337116-22337281)
chr2 (13-177)||(23060514-23060679)
chr2 (13-177)||(23076443-23076608)
chr2 (13-192)||(19671831-19672010)
chr2 (13-177)||(22731189-22731354)
chr2 (13-177)||(22738135-22738299)
chr2 (19-177)||(298769-298929)
chr2 (13-177)||(23285866-23286027)
chr2 (13-177)||(23660024-23660188)
chr2 (19-93)||(24643034-24643108)
chr2 (13-177)||(23654341-23654506)
chr2 (27-192)||(23708558-23708725)
chr2 (13-111)||(38136-38234)
chr2 (177-246)||(20261381-20261450)
chr2 (13-160)||(23103369-23103515)
chr2 (31-177)||(7688-7835)
chr2 (138-203)||(22173803-22173868)
chr2 (26-133)||(28405990-28406099)
chr2 (13-73)||(23040249-23040309)
chr2 (6-140)||(25616179-25616314)
chr2 (13-162)||(20309109-20309257)
chr2 (13-88)||(8946658-8946734)
chr2 (178-246)||(10684694-10684764)
chr2 (31-194)||(20520130-20520295)
chr2 (31-194)||(23207296-23207461)
chr2 (19-173)||(7679592-7679745)
chr2 (107-183)||(22459511-22459587)
chr2 (178-247)||(23707252-23707323)
chr2 (178-247)||(24918196-24918267)
chr2 (31-164)||(32451896-32452031)
chr2 (93-194)||(23791357-23791458)
chr2 (26-173)||(25175864-25176010)
chr2 (199-247)||(25616365-25616413)
chr2 (154-194)||(29601478-29601518)
chr2 (10-73)||(22134266-22134329)
chr2 (27-65)||(18786971-18787009)
chr2 (178-247)||(24671081-24671152)
chr2 (13-63)||(23072019-23072069)
chr2 (93-194)||(24697543-24697644)
chr2 (33-73)||(23287384-23287424)
chr2 (178-247)||(24681500-24681571)
chr2 (33-73)||(26392403-26392443)
chr2 (214-247)||(24529477-24529510)
[»] chr8 (72 HSPs)
chr8 (17-247)||(16413246-16413476)
chr8 (19-247)||(14409374-14409602)
chr8 (19-247)||(1484406-1484634)
chr8 (19-247)||(5853222-5853450)
chr8 (19-247)||(20403231-20403459)
chr8 (19-247)||(22001757-22001985)
chr8 (19-247)||(15203161-15203389)
chr8 (19-247)||(20046125-20046353)
chr8 (19-247)||(4483285-4483512)
chr8 (19-247)||(4542303-4542531)
chr8 (19-247)||(19896269-19896501)
chr8 (15-247)||(45290624-45290857)
chr8 (19-247)||(14823778-14824007)
chr8 (19-194)||(41598192-41598367)
chr8 (19-247)||(19936933-19937164)
chr8 (28-247)||(15070571-15070792)
chr8 (10-194)||(26223914-26224098)
chr8 (31-192)||(19801367-19801527)
chr8 (19-203)||(25484249-25484426)
chr8 (13-177)||(16092297-16092462)
chr8 (13-177)||(6759259-6759421)
chr8 (13-192)||(18818348-18818529)
chr8 (10-177)||(28648999-28649167)
chr8 (128-247)||(24485974-24486093)
chr8 (13-165)||(7372779-7372932)
chr8 (13-177)||(20536209-20536374)
chr8 (19-157)||(26219721-26219858)
chr8 (13-177)||(22875066-22875230)
chr8 (13-178)||(23406380-23406548)
chr8 (138-247)||(32810054-32810163)
chr8 (13-160)||(21923900-21924048)
chr8 (13-162)||(21918969-21919120)
chr8 (19-157)||(26225268-26225405)
chr8 (13-177)||(22626737-22626901)
chr8 (15-194)||(13508022-13508203)
chr8 (15-194)||(13597554-13597735)
chr8 (13-177)||(18879191-18879351)
chr8 (13-183)||(17612059-17612230)
chr8 (31-194)||(20498581-20498746)
chr8 (13-162)||(31971258-31971407)
chr8 (6-177)||(23648547-23648719)
chr8 (6-140)||(18678094-18678229)
chr8 (13-173)||(38855212-38855371)
chr8 (13-111)||(45131019-45131116)
chr8 (13-126)||(6520369-6520483)
chr8 (6-140)||(32121726-32121861)
chr8 (21-133)||(21285606-21285719)
chr8 (31-194)||(37116366-37116532)
chr8 (13-111)||(16199666-16199764)
chr8 (198-247)||(38550041-38550090)
chr8 (13-126)||(5866280-5866394)
chr8 (13-114)||(17140917-17141019)
chr8 (13-126)||(21490996-21491110)
chr8 (27-126)||(983410-983512)
chr8 (31-194)||(17266930-17267096)
chr8 (13-126)||(21389458-21389570)
chr8 (13-126)||(21395988-21396100)
chr8 (13-126)||(21778784-21778896)
chr8 (13-126)||(21790481-21790593)
chr8 (199-247)||(32121912-32121960)
chr8 (31-177)||(17439461-17439609)
chr8 (27-73)||(23760903-23760950)
chr8 (13-62)||(21249385-21249434)
chr8 (13-62)||(21255223-21255272)
chr8 (199-247)||(18677995-18678043)
chr8 (26-65)||(26355766-26355805)
chr8 (26-133)||(21673718-21673826)
chr8 (198-247)||(27472347-27472395)
chr8 (178-230)||(1326990-1327042)
chr8 (211-247)||(16401960-16401996)
chr8 (178-224)||(35026849-35026895)
chr8 (198-247)||(20982657-20982710)
[»] chr4 (71 HSPs)
chr4 (6-247)||(19618102-19618343)
chr4 (19-247)||(3515011-3515239)
chr4 (6-243)||(14970641-14970878)
chr4 (19-247)||(18215204-18215432)
chr4 (19-247)||(15118282-15118510)
chr4 (19-247)||(12237-12465)
chr4 (19-247)||(52312514-52312742)
chr4 (19-247)||(19242703-19242932)
chr4 (19-247)||(44615292-44615520)
chr4 (15-247)||(15355254-15355487)
chr4 (19-247)||(18239349-18239577)
chr4 (19-247)||(50222269-50222497)
chr4 (19-247)||(1837439-1837667)
chr4 (19-247)||(44773013-44773245)
chr4 (19-203)||(51463842-51464026)
chr4 (19-203)||(23803239-23803423)
chr4 (19-194)||(44102218-44102393)
chr4 (19-203)||(12610954-12611131)
chr4 (19-230)||(7641139-7641340)
chr4 (19-183)||(44928873-44929038)
chr4 (13-194)||(15367691-15367873)
chr4 (13-194)||(15402704-15402886)
chr4 (31-194)||(21815568-21815731)
chr4 (13-194)||(15371203-15371385)
chr4 (13-194)||(15373484-15373666)
chr4 (13-194)||(15370019-15370200)
chr4 (13-191)||(16223533-16223712)
chr4 (19-189)||(20149833-20150004)
chr4 (19-157)||(54798729-54798868)
chr4 (19-133)||(14280320-14280434)
chr4 (13-192)||(7798775-7798956)
chr4 (19-177)||(14038655-14038814)
chr4 (20-177)||(16377478-16377634)
chr4 (13-177)||(7088878-7089043)
chr4 (13-177)||(12902758-12902923)
chr4 (14-177)||(22636437-22636601)
chr4 (31-188)||(22353852-22354010)
chr4 (13-177)||(7893704-7893869)
chr4 (13-124)||(52873375-52873487)
chr4 (13-177)||(16270191-16270355)
chr4 (19-157)||(8574844-8574981)
chr4 (13-177)||(44052830-44052995)
chr4 (31-194)||(13788-13953)
chr4 (13-177)||(6899892-6900056)
chr4 (13-175)||(16239927-16240089)
chr4 (17-177)||(23374314-23374475)
chr4 (27-194)||(52243131-52243302)
chr4 (27-192)||(43198492-43198661)
chr4 (177-246)||(15534343-15534412)
chr4 (178-246)||(36038033-36038101)
chr4 (13-97)||(3096294-3096379)
chr4 (178-246)||(14048740-14048808)
chr4 (178-247)||(15497001-15497070)
chr4 (178-246)||(49547705-49547773)
chr4 (179-247)||(52873108-52873176)
chr4 (13-121)||(39706299-39706408)
chr4 (86-175)||(15464888-15464977)
chr4 (198-247)||(362268-362317)
chr4 (26-137)||(12774021-12774132)
chr4 (27-126)||(12288214-12288316)
chr4 (178-247)||(14746547-14746618)
chr4 (31-194)||(46640393-46640558)
chr4 (13-73)||(15551818-15551879)
chr4 (31-194)||(53082089-53082254)
chr4 (31-164)||(6190481-6190616)
chr4 (13-111)||(14053323-14053421)
chr4 (13-73)||(17046488-17046549)
chr4 (178-230)||(19857607-19857659)
chr4 (26-73)||(8846370-8846418)
chr4 (104-192)||(8846465-8846553)
chr4 (33-73)||(17333298-17333338)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (14-247)||(10772-11005)
[»] chr3 (91 HSPs)
chr3 (6-247)||(13544016-13544257)
chr3 (6-247)||(12567551-12567792)
chr3 (19-247)||(17463182-17463410)
chr3 (19-247)||(45606837-45607065)
chr3 (19-247)||(7781277-7781505)
chr3 (19-247)||(8899098-8899326)
chr3 (19-247)||(9707537-9707765)
chr3 (19-247)||(34159330-34159558)
chr3 (19-247)||(55476495-55476723)
chr3 (19-247)||(6469064-6469292)
chr3 (19-247)||(10247653-10247881)
chr3 (19-247)||(16282741-16282969)
chr3 (19-247)||(16454211-16454439)
chr3 (19-247)||(28848541-28848769)
chr3 (19-247)||(13154185-13154414)
chr3 (23-247)||(38961821-38962045)
chr3 (19-247)||(41123894-41124119)
chr3 (19-241)||(13151726-13151949)
chr3 (19-218)||(17446614-17446812)
chr3 (19-247)||(8499522-8499752)
chr3 (19-247)||(15412433-15412663)
chr3 (19-194)||(29172565-29172741)
chr3 (23-203)||(50242830-50243010)
chr3 (19-194)||(17672630-17672805)
chr3 (19-194)||(12119707-12119883)
chr3 (31-194)||(53070636-53070799)
chr3 (19-247)||(27165254-27165484)
chr3 (31-203)||(43550452-43550625)
chr3 (19-247)||(53301434-53301665)
chr3 (19-146)||(15977519-15977646)
chr3 (13-177)||(14972855-14973020)
chr3 (19-177)||(40213676-40213834)
chr3 (19-126)||(55500946-55501053)
chr3 (19-157)||(36166602-36166739)
chr3 (13-177)||(17487857-17488022)
chr3 (13-177)||(17499339-17499504)
chr3 (13-177)||(25476340-25476505)
chr3 (30-193)||(42386428-42386593)
chr3 (20-192)||(43840940-43841114)
chr3 (13-192)||(26686888-26687069)
chr3 (25-157)||(21618459-21618590)
chr3 (13-177)||(13442275-13442440)
chr3 (13-177)||(18438535-18438700)
chr3 (13-177)||(23083316-23083481)
chr3 (13-162)||(12399210-12399360)
chr3 (13-162)||(20698405-20698555)
chr3 (26-177)||(14576788-14576939)
chr3 (13-194)||(24340660-24340843)
chr3 (19-118)||(10556989-10557088)
chr3 (19-177)||(24153164-24153322)
chr3 (19-114)||(44494813-44494908)
chr3 (13-177)||(11424718-11424879)
chr3 (19-113)||(17737240-17737337)
chr3 (26-158)||(14572603-14572735)
chr3 (31-192)||(52523666-52523831)
chr3 (30-194)||(23274705-23274871)
chr3 (13-194)||(37642202-37642385)
chr3 (178-246)||(54520985-54521053)
chr3 (180-246)||(29544773-29544839)
chr3 (185-246)||(12305315-12305376)
chr3 (93-192)||(2051138-2051238)
chr3 (131-194)||(17248224-17248287)
chr3 (6-140)||(46822259-46822394)
chr3 (27-173)||(15470939-15471085)
chr3 (6-140)||(30029834-30029968)
chr3 (16-137)||(32307681-32307802)
chr3 (6-126)||(12511051-12511172)
chr3 (178-247)||(15977696-15977765)
chr3 (26-192)||(16097342-16097509)
chr3 (26-192)||(16103794-16103960)
chr3 (86-183)||(22147474-22147571)
chr3 (19-68)||(45577947-45577996)
chr3 (13-126)||(13210333-13210447)
chr3 (13-126)||(14234488-14234602)
chr3 (19-73)||(28194697-28194752)
chr3 (31-194)||(37251105-37251270)
chr3 (178-247)||(11913980-11914051)
chr3 (26-126)||(12174265-12174366)
chr3 (31-175)||(43925977-43926123)
chr3 (199-247)||(46822445-46822493)
chr3 (198-247)||(10557091-10557140)
chr3 (26-117)||(49668091-49668183)
chr3 (26-117)||(9512934-9513026)
chr3 (26-117)||(9520909-9521001)
chr3 (12-73)||(14665397-14665458)
chr3 (33-73)||(13919350-13919390)
chr3 (19-73)||(856143-856197)
chr3 (16-70)||(3389999-3390053)
chr3 (12-70)||(14668553-14668611)
chr3 (19-73)||(23077537-23077591)
chr3 (16-73)||(1644733-1644790)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (14-247)||(21840766-21840999)
chr1 (6-247)||(16361908-16362150)
chr1 (19-247)||(23593664-23593893)
chr1 (19-247)||(13988870-13989098)
chr1 (19-247)||(21923221-21923449)
chr1 (19-247)||(21475017-21475245)
chr1 (19-247)||(29776692-29776920)
chr1 (19-247)||(29298141-29298368)
chr1 (19-247)||(31612317-31612545)
chr1 (19-247)||(22122997-22123226)
chr1 (19-247)||(16275293-16275522)
chr1 (19-247)||(15859938-15860167)
chr1 (13-194)||(13212844-13213026)
chr1 (19-194)||(21346965-21347141)
chr1 (19-194)||(21342100-21342276)
chr1 (19-194)||(21707171-21707346)
chr1 (19-194)||(21711713-21711888)
chr1 (31-203)||(45574816-45574989)
chr1 (19-194)||(433016-433190)
chr1 (19-189)||(40389158-40389329)
chr1 (10-177)||(50210168-50210336)
chr1 (19-177)||(34509787-34509946)
chr1 (13-177)||(27250684-27250849)
chr1 (13-177)||(22532270-22532435)
chr1 (6-177)||(22468651-22468823)
chr1 (31-194)||(21896193-21896358)
chr1 (31-191)||(21861510-21861672)
chr1 (6-175)||(20135181-20135351)
chr1 (28-177)||(21026696-21026846)
chr1 (31-194)||(35261018-35261180)
chr1 (6-73)||(20454613-20454680)
chr1 (13-113)||(20847173-20847274)
chr1 (27-183)||(16758664-16758822)
chr1 (27-192)||(33681022-33681188)
chr1 (16-137)||(21754049-21754170)
chr1 (31-194)||(41049973-41050138)
chr1 (32-194)||(14295493-14295652)
chr1 (27-173)||(22237642-22237788)
chr1 (200-247)||(22050819-22050866)
chr1 (28-192)||(20918620-20918782)
chr1 (26-133)||(22921868-22921976)
chr1 (178-231)||(43543214-43543267)
chr1 (19-70)||(21714549-21714600)
chr1 (27-65)||(52928038-52928076)
chr1 (88-177)||(22354527-22354616)
chr1 (211-247)||(27161569-27161605)
chr1 (26-126)||(20248293-20248394)
chr1 (93-190)||(50686695-50686792)
chr1 (99-183)||(12271642-12271725)
chr1 (31-194)||(16368224-16368388)
chr1 (12-70)||(24783155-24783213)
chr1 (13-73)||(38801447-38801507)
chr1 (14-57)||(21533948-21533989)
[»] scaffold0023 (7 HSPs)
scaffold0023 (17-247)||(17370-17600)
scaffold0023 (19-247)||(94415-94643)
scaffold0023 (19-174)||(44458-44614)
scaffold0023 (26-173)||(100388-100534)
scaffold0023 (13-73)||(119876-119937)
scaffold0023 (26-173)||(40135-40281)
scaffold0023 (26-65)||(101513-101552)
[»] scaffold0716 (1 HSPs)
scaffold0716 (19-247)||(4698-4926)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (6-247)||(11279-11521)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (14-247)||(9241-9474)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (6-247)||(501075-501316)
scaffold0001 (19-194)||(85562-85738)
scaffold0001 (26-192)||(160698-160864)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (19-247)||(20751-20979)
[»] scaffold0134 (1 HSPs)
scaffold0134 (19-247)||(37825-38053)
[»] chr7 (87 HSPs)
chr7 (19-247)||(456325-456553)
chr7 (19-247)||(11393217-11393445)
chr7 (19-247)||(15376643-15376871)
chr7 (19-247)||(16232524-16232752)
chr7 (19-247)||(20385053-20385281)
chr7 (19-247)||(21189525-21189753)
chr7 (19-247)||(32125495-32125723)
chr7 (19-247)||(41522921-41523149)
chr7 (19-247)||(41525383-41525611)
chr7 (19-247)||(11972500-11972728)
chr7 (19-247)||(14949052-14949280)
chr7 (19-247)||(18640276-18640504)
chr7 (19-247)||(24702242-24702470)
chr7 (19-247)||(27216864-27217092)
chr7 (19-247)||(16213688-16213916)
chr7 (19-247)||(16410063-16410291)
chr7 (13-247)||(18430710-18430944)
chr7 (19-247)||(24704692-24704917)
chr7 (19-247)||(13869350-13869580)
chr7 (19-194)||(44116513-44116688)
chr7 (19-193)||(3386337-3386511)
chr7 (6-164)||(24275162-24275320)
chr7 (31-203)||(13647344-13647517)
chr7 (19-194)||(17061898-17062073)
chr7 (19-243)||(26355915-26356152)
chr7 (19-243)||(26358367-26358604)
chr7 (19-192)||(20110560-20110723)
chr7 (19-194)||(38898359-38898535)
chr7 (31-194)||(12756654-12756817)
chr7 (19-134)||(48273396-48273512)
chr7 (19-177)||(3564319-3564478)
chr7 (19-141)||(13831377-13831499)
chr7 (108-247)||(15081877-15082019)
chr7 (19-177)||(18456368-18456526)
chr7 (13-177)||(12698832-12698998)
chr7 (13-177)||(38227482-38227646)
chr7 (13-177)||(9509190-9509355)
chr7 (27-194)||(2280056-2280225)
chr7 (28-183)||(26212012-26212168)
chr7 (160-247)||(13841157-13841244)
chr7 (27-177)||(15143993-15144143)
chr7 (28-126)||(10589055-10589154)
chr7 (177-246)||(11303409-11303478)
chr7 (166-245)||(18627717-18627796)
chr7 (178-246)||(16108620-16108688)
chr7 (13-194)||(19486681-19486864)
chr7 (13-134)||(67746-67868)
chr7 (13-133)||(22072914-22073036)
chr7 (178-247)||(14269992-14270061)
chr7 (178-247)||(8468803-8468872)
chr7 (178-246)||(23664884-23664952)
chr7 (34-192)||(12255730-12255892)
chr7 (13-194)||(16495403-16495581)
chr7 (13-111)||(16386268-16386368)
chr7 (13-65)||(47831808-47831860)
chr7 (178-246)||(29796771-29796841)
chr7 (178-246)||(29800590-29800660)
chr7 (13-126)||(34200787-34200901)
chr7 (14-162)||(40443393-40443541)
chr7 (26-173)||(18005660-18005806)
chr7 (27-194)||(1867932-1868101)
chr7 (27-173)||(16056343-16056488)
chr7 (178-247)||(8940335-8940406)
chr7 (13-194)||(10063760-10063938)
chr7 (99-183)||(15113031-15113114)
chr7 (178-247)||(38898158-38898229)
chr7 (13-109)||(28505321-28505418)
chr7 (26-121)||(811142-811238)
chr7 (99-183)||(15116568-15116651)
chr7 (27-173)||(16219677-16219823)
chr7 (26-124)||(44014192-44014291)
chr7 (19-117)||(14932749-14932848)
chr7 (19-117)||(15356184-15356283)
chr7 (19-117)||(15360298-15360397)
chr7 (31-194)||(20220127-20220290)
chr7 (19-73)||(18154901-18154955)
chr7 (35-194)||(15008436-15008597)
chr7 (13-65)||(15754955-15755007)
chr7 (6-110)||(15211450-15211557)
chr7 (13-126)||(27847838-27847950)
chr7 (198-247)||(45847691-45847739)
chr7 (13-65)||(11996095-11996147)
chr7 (27-58)||(14044761-14044792)
chr7 (27-58)||(14354791-14354822)
chr7 (6-37)||(16213622-16213653)
chr7 (12-70)||(2832504-2832562)
chr7 (27-117)||(12901338-12901431)
[»] chr5 (66 HSPs)
chr5 (19-247)||(264698-264926)
chr5 (19-247)||(39363388-39363616)
chr5 (19-247)||(10732870-10733098)
chr5 (19-247)||(20909016-20909244)
chr5 (19-247)||(29345984-29346212)
chr5 (19-247)||(42245295-42245523)
chr5 (19-247)||(29348457-29348685)
chr5 (19-247)||(29350930-29351158)
chr5 (19-247)||(39245140-39245368)
chr5 (19-247)||(29329938-29330163)
chr5 (19-247)||(32027397-32027625)
chr5 (19-247)||(20917882-20918106)
chr5 (19-247)||(38619438-38619668)
chr5 (19-247)||(23064515-23064745)
chr5 (19-194)||(36154766-36154938)
chr5 (19-192)||(11581184-11581357)
chr5 (19-194)||(20901991-20902168)
chr5 (19-194)||(2154596-2154772)
chr5 (19-189)||(18319021-18319192)
chr5 (19-194)||(10775659-10775834)
chr5 (19-194)||(31061072-31061248)
chr5 (19-189)||(24067111-24067282)
chr5 (13-177)||(1096468-1096633)
chr5 (13-177)||(9077953-9078118)
chr5 (13-177)||(23390451-23390616)
chr5 (13-177)||(25421533-25421698)
chr5 (19-177)||(24529227-24529386)
chr5 (13-177)||(21729019-21729184)
chr5 (13-177)||(21808344-21808509)
chr5 (13-177)||(24493570-24493734)
chr5 (13-119)||(21997547-21997654)
chr5 (13-177)||(8286797-8286963)
chr5 (32-177)||(25431414-25431560)
chr5 (19-157)||(22412191-22412329)
chr5 (13-177)||(13025312-13025476)
chr5 (13-177)||(13095496-13095660)
chr5 (28-177)||(22075035-22075185)
chr5 (31-177)||(22144068-22144215)
chr5 (13-194)||(40725854-40726037)
chr5 (26-192)||(21565556-21565723)
chr5 (15-160)||(37723906-37724050)
chr5 (178-246)||(9776521-9776589)
chr5 (6-140)||(17517193-17517328)
chr5 (70-157)||(20766095-20766181)
chr5 (13-73)||(21329556-21329617)
chr5 (31-126)||(20026945-20027043)
chr5 (13-111)||(21292992-21293089)
chr5 (13-121)||(21502167-21502276)
chr5 (178-246)||(37804834-37804902)
chr5 (22-110)||(18418590-18418678)
chr5 (19-74)||(20806845-20806900)
chr5 (26-126)||(22959538-22959639)
chr5 (13-73)||(19660894-19660955)
chr5 (31-190)||(22178161-22178323)
chr5 (199-247)||(17517094-17517142)
chr5 (27-173)||(26011995-26012141)
chr5 (13-73)||(36314578-36314639)
chr5 (19-70)||(26704078-26704129)
chr5 (19-70)||(26973811-26973862)
chr5 (31-73)||(26740705-26740747)
chr5 (214-247)||(2154562-2154595)
chr5 (214-247)||(20901957-20901990)
chr5 (28-73)||(26732892-26732937)
chr5 (13-65)||(19668899-19668951)
chr5 (39-111)||(21873277-21873350)
chr5 (87-183)||(18356389-18356485)
[»] scaffold0494 (1 HSPs)
scaffold0494 (6-232)||(12194-12420)
[»] scaffold0230 (1 HSPs)
scaffold0230 (19-247)||(13951-14179)
[»] scaffold0028 (7 HSPs)
scaffold0028 (19-247)||(136684-136912)
scaffold0028 (19-247)||(139153-139381)
scaffold0028 (19-247)||(144091-144319)
scaffold0028 (19-247)||(134215-134443)
scaffold0028 (19-247)||(141622-141850)
scaffold0028 (26-137)||(132672-132784)
scaffold0028 (30-116)||(62216-62303)
[»] scaffold0444 (1 HSPs)
scaffold0444 (19-247)||(13396-13624)
[»] scaffold0044 (1 HSPs)
scaffold0044 (19-247)||(40404-40632)
[»] scaffold0003 (2 HSPs)
scaffold0003 (19-194)||(158433-158608)
scaffold0003 (27-177)||(339905-340053)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (19-203)||(82076-82260)
scaffold0037 (27-192)||(22610-22776)
[»] scaffold1439 (1 HSPs)
scaffold1439 (19-203)||(110-294)
[»] scaffold0142 (1 HSPs)
scaffold0142 (19-194)||(16788-16963)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (19-194)||(4301-4476)
[»] scaffold0145 (4 HSPs)
scaffold0145 (19-194)||(9753-9929)
scaffold0145 (13-177)||(32943-33107)
scaffold0145 (13-177)||(38762-38926)
scaffold0145 (216-247)||(9932-9963)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (19-203)||(12068-12246)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (29-194)||(29946-30111)
scaffold0149 (214-247)||(30112-30145)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (31-194)||(79267-79430)
scaffold0056 (10-177)||(17170-17340)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (19-203)||(1254-1439)
[»] scaffold0819 (1 HSPs)
scaffold0819 (19-194)||(4218-4393)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (31-194)||(20363-20524)
scaffold0031 (13-177)||(128752-128916)
[»] scaffold0247 (2 HSPs)
scaffold0247 (23-194)||(2111-2283)
scaffold0247 (13-194)||(17964-18147)
[»] scaffold0074 (1 HSPs)
scaffold0074 (19-247)||(38586-38816)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (19-194)||(161072-161248)
scaffold0007 (94-194)||(164573-164674)
[»] scaffold0231 (1 HSPs)
scaffold0231 (19-177)||(22890-23048)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (19-157)||(44682-44821)
scaffold0122 (19-177)||(26020-26179)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (13-177)||(3106-3270)
[»] scaffold0011 (2 HSPs)
scaffold0011 (13-183)||(51914-52085)
scaffold0011 (13-162)||(167948-168098)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (13-177)||(16555-16720)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (13-177)||(13212-13377)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (10-177)||(3141-3309)
[»] scaffold0228 (3 HSPs)
scaffold0228 (26-177)||(4522-4673)
scaffold0228 (26-177)||(12104-12255)
scaffold0228 (26-177)||(22056-22207)
[»] scaffold0022 (4 HSPs)
scaffold0022 (19-157)||(116434-116571)
scaffold0022 (178-247)||(53802-53873)
scaffold0022 (31-194)||(128907-129072)
scaffold0022 (35-194)||(78345-78505)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (21-177)||(39486-39642)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (21-177)||(75170-75326)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (13-177)||(1852-2017)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (13-162)||(1018-1168)
[»] scaffold0695 (1 HSPs)
scaffold0695 (138-247)||(6070-6179)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (13-177)||(4850-5015)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (13-177)||(3471-3636)
scaffold0292 (13-177)||(344-508)
[»] scaffold0120 (4 HSPs)
scaffold0120 (13-177)||(32913-33076)
scaffold0120 (13-177)||(45929-46092)
scaffold0120 (13-176)||(16114-16278)
scaffold0120 (13-74)||(17388-17449)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (13-192)||(8472-8649)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (20-177)||(25904-26061)
scaffold0026 (13-177)||(39859-40023)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (27-192)||(8481-8650)
scaffold0621 (13-173)||(6536-6695)
[»] scaffold0647 (1 HSPs)
scaffold0647 (13-177)||(6076-6244)
[»] scaffold0046 (4 HSPs)
scaffold0046 (13-126)||(28415-28529)
scaffold0046 (13-126)||(11293-11407)
scaffold0046 (13-65)||(1998-2050)
scaffold0046 (13-65)||(4553-4605)
[»] scaffold0042 (1 HSPs)
scaffold0042 (30-177)||(24257-24406)
[»] scaffold0639 (1 HSPs)
scaffold0639 (13-160)||(8480-8628)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (27-194)||(27686-27855)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (76-177)||(3485-3586)
[»] scaffold0461 (1 HSPs)
scaffold0461 (13-194)||(11465-11648)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (13-194)||(38193-38376)
[»] scaffold0490 (1 HSPs)
scaffold0490 (13-162)||(1953-2103)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (31-194)||(53486-53651)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (99-172)||(13092-13165)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (13-177)||(39914-40078)
scaffold0080 (31-132)||(19883-19987)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (31-194)||(13147-13313)
scaffold0357 (27-194)||(16037-16206)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (31-194)||(12587-12751)
[»] scaffold0358 (1 HSPs)
scaffold0358 (13-102)||(4713-4803)
[»] scaffold0175 (3 HSPs)
scaffold0175 (64-192)||(13144-13274)
scaffold0175 (20-68)||(281-329)
scaffold0175 (13-126)||(34124-34238)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (31-160)||(174785-174913)
scaffold0021 (13-73)||(121767-121827)
scaffold0021 (101-177)||(124675-124751)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (86-194)||(225482-225590)
[»] scaffold1427 (1 HSPs)
scaffold1427 (178-246)||(1591-1659)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (13-177)||(10381-10543)
[»] scaffold0422 (1 HSPs)
scaffold0422 (178-246)||(3186-3254)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (13-162)||(32068-32216)
[»] scaffold0235 (1 HSPs)
scaffold0235 (19-111)||(11464-11557)
[»] scaffold0114 (2 HSPs)
scaffold0114 (13-177)||(15420-15583)
scaffold0114 (184-247)||(27958-28021)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (27-192)||(10481-10647)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (28-111)||(13513-13596)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (13-177)||(20911-21077)
[»] scaffold0503 (2 HSPs)
scaffold0503 (121-194)||(12039-12112)
scaffold0503 (31-91)||(11982-12042)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (19-126)||(15668-15776)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (92-177)||(27911-27996)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (31-194)||(60652-60818)
scaffold0010 (26-173)||(129919-130066)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (33-194)||(7996-8161)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (15-194)||(6220-6400)
scaffold0420 (15-58)||(13813-13854)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (13-121)||(6134-6243)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (26-173)||(19278-19424)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (13-194)||(1011-1189)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (26-192)||(45732-45899)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (13-65)||(1102-1154)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (13-65)||(6612-6664)
scaffold0333 (13-65)||(13992-14044)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (27-194)||(25121-25289)
scaffold0123 (93-194)||(620-720)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (13-65)||(15845-15897)
scaffold0020 (19-70)||(178901-178952)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (26-173)||(5657-5803)
[»] scaffold0106 (4 HSPs)
scaffold0106 (19-73)||(15298-15352)
scaffold0106 (178-247)||(15202-15273)
scaffold0106 (13-126)||(1290-1402)
scaffold0106 (13-126)||(7267-7379)
[»] scaffold0070 (1 HSPs)
scaffold0070 (33-162)||(4545-4675)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (26-173)||(143-290)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (26-133)||(2805-2913)
[»] scaffold0513 (1 HSPs)
scaffold0513 (178-243)||(10821-10886)
[»] scaffold0351 (1 HSPs)
scaffold0351 (13-126)||(16283-16395)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (26-133)||(14696-14804)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (31-194)||(97024-97190)
scaffold0006 (31-194)||(106302-106468)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (31-113)||(1051-1134)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (21-65)||(1091-1135)
[»] scaffold0747 (1 HSPs)
scaffold0747 (178-247)||(645-716)
[»] scaffold0741 (1 HSPs)
scaffold0741 (178-247)||(4233-4304)
[»] scaffold0599 (1 HSPs)
scaffold0599 (178-247)||(1256-1327)
[»] scaffold0395 (2 HSPs)
scaffold0395 (13-73)||(4893-4953)
scaffold0395 (88-177)||(918-1006)
[»] scaffold0306 (1 HSPs)
scaffold0306 (178-247)||(15083-15154)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (27-133)||(32551-32657)
scaffold0034 (31-177)||(51839-51985)
[»] scaffold0100 (2 HSPs)
scaffold0100 (178-247)||(35995-36065)
scaffold0100 (27-117)||(23898-23989)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (86-173)||(8090-8176)
scaffold0556 (26-126)||(6826-6927)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (26-65)||(2713-2752)
[»] scaffold0198 (1 HSPs)
scaffold0198 (19-70)||(23846-23897)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (35-177)||(38339-38483)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (31-126)||(51601-51695)
[»] scaffold0309 (1 HSPs)
scaffold0309 (76-162)||(6675-6761)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (27-194)||(8011-8180)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (104-193)||(18176-18265)
scaffold0138 (27-126)||(12954-13054)
[»] scaffold0131 (1 HSPs)
scaffold0131 (19-65)||(36457-36503)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (31-194)||(267679-267844)
[»] scaffold0150 (1 HSPs)
scaffold0150 (26-137)||(32112-32224)
[»] scaffold0317 (1 HSPs)
scaffold0317 (211-247)||(6866-6902)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (27-133)||(10542-10649)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (26-65)||(12780-12819)
[»] scaffold0205 (1 HSPs)
scaffold0205 (19-117)||(29561-29660)
[»] scaffold0718 (1 HSPs)
scaffold0718 (31-65)||(5196-5230)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (26-64)||(28839-28877)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (13-111)||(46996-47093)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (13-162)||(1021-1169)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (13-110)||(192997-193097)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (93-194)||(1735-1835)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (93-194)||(88-189)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (33-73)||(206584-206624)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 70)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 30676881 - 30676640
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30676881 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgatataataa 30676782  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30676781 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 30676682  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30676681 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 30676640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 34963364 - 34963605
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963364 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataa 34963463  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34963464 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 34963563  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34963564 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 34963605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 12742321 - 12742549
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742321 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 12742420  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  12742421 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 12742520  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12742521 tatatacatataacacttcatcaatcatg 12742549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 22782231 - 22782459
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782231 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22782330  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  22782331 tcaacaacgtctcaattattcacacataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca 22782430  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22782431 tatatacatataacacttcatcaatcatg 22782459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 24422551 - 24422779
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422551 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 24422650  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24422651 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24422750  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24422751 tatatacatataacacttcatcaatcatg 24422779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 33861798 - 33862026
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861798 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 33861897  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33861898 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 33861997  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33861998 tatatacatataacacttcatcaatcatg 33862026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 33864282 - 33864510
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864282 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 33864381  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  33864382 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 33864481  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33864482 tatatacatataacacttcatcaatcatg 33864510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 8055033 - 8055261
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055033 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaaaagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 8055132  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8055133 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 8055232  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8055233 tatatacatataacacttcatcaatcatg 8055261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18334750 - 18334522
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334750 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18334651  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18334650 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 18334551  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334550 tatatacatataacacttcatcaatcatg 18334522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 19005050 - 19005278
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19005050 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 19005149  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  19005150 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 19005249  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19005250 tatatacatataacatttcatcaatcatg 19005278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19859077 - 19858849
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19859077 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 19858978  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  19858977 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataacaatcaacatcttaaaacatca 19858878  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19858877 tatatacatataacacttcatcaatcatg 19858849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1541069 - 1540841
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1541069 catcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaaatgcaag 1540970  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1540969 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 1540870  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1540869 tatatacatataacacttcatcaatcatg 1540841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2291338 - 2291110
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2291338 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 2291239  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  2291238 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 2291139  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2291138 tatatacatataacacttcatcagtcatg 2291110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 26924798 - 26924570
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26924798 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 26924699  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26924698 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 26924599  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26924598 tatgtacatataacacttcatcaatcatg 26924570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 244
Target Start/End: Original strand, 25656633 - 25656858
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25656633 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 25656732  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25656733 ttaataacgtctcaattattcacatataattcaactaatacatatataattatatcacaatataaaaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatct 25656832  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  25656833 tatatacatataacacttcatcaatc 25656858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 20 - 247
Target Start/End: Original strand, 25688507 - 25688734
Alignment:
Q  20 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 119  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  25688507 atcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaagt 25688606  T
Q  120 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcat 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  25688607 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataatcatatcacaatataacaacaccaaatggtaatcaacatcttaaaacatcat 25688706  T
Q  220 atatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25688707 ttatacatataacacttcctcaatcatg 25688734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 229
Target Start/End: Original strand, 1595553 - 1595763
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  1595553 catcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaat 1595652  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1595653 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatggatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 1595752  T
Q  219 tatatacatat 229  Q
    |||||||||||    
T  1595753 tatatacatat 1595763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 25754813 - 25754997
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25754813 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 25754912  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  25754913 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 25754997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 18456735 - 18456898
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456735 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18456834  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18456835 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 18456898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 20557050 - 20556868
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20557050 catcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatggcataataatatcaaatgcaag 20556951  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  20556950 tcaacaacgtctcaat--ttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 20556868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 16448685 - 16448514
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16448685 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16448586  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16448585 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 16448514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3852175 - 3852001
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3852175 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtttaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatataaaatgcaag 3852076  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3852075 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3852001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Original strand, 18461895 - 18462028
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461895 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 18461994  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 164  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18461995 caattattcacatataattcaagtaatgcatata 18462028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25629475 - 25629310
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  25629475 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaattacaacaggaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataacaatatcaa 25629376  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  25629375 atgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 25629310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18409950 - 18409782
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 108  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18409950 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacgaaaacaacatgacataataatat 18409851  T
Q  109 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| || ||   ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||    
T  18409850 caaatgcaagtcaacaacatctcaatcatccattcataattcaaataatacatataacattatatcaca 18409782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 174
Target Start/End: Original strand, 29060541 - 29060703
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  29060541 catcatcatcttcatcagcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 29060640  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 174  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  ||||||||    
T  29060641 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatc 29060703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 20593774 - 20593939
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20593774 catcatcatcttcatcaacttagaccgaatcatgcagctcagttaaataaaaacagcaacacatgcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 20593873  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  | |||||||||    
T  20593874 atgcaagtcaacaacatctcaattatacaatcataaatcaagtaatgcgtataacaatatatcaca 20593939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 17287916 - 17287768
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17287916 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggtagtatacaaacacagcatgacataataatatcaa 17287817  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  17287816 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 17287768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 6 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19848122 - 19847932
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || || |||  ||||  |||||||  |||||| |    
T  19848122 acatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaacacataaaa 19848023  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattatt-cacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||| ||||| |||||||  ||| || |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19848022 atatcaattgcaattcaacaatatcttaaatatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 19847932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 20361080 - 20360915
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20361080 catcatcattttcatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagcatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20360981  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  20360980 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 20360915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 16496245 - 16496410
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16496245 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 16496344  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  16496345 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 16496410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 19303660 - 19303496
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  19303660 catcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaggaagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 19303562  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  19303561 atgcaagtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgtacataacattatatcaca 19303496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Original strand, 25644335 - 25644487
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||| ||    
T  25644335 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcgtgatataacaatatcaaatgtaagtcatca 25644434  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || ||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  25644435 acatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcgtatacaattatatcaca 25644487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 20076701 - 20076862
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  20076701 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac-aaaacagcatgacataataatatcaa 20076799  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| ||||||   ||| ||  |||||  |||| |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  20076800 atgcaaatcaaca---tcttaaaaattcaattatacttcaagtaatgcgtataacattatatcaca 20076862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22780347 - 22780166
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22780347 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacaaaaacataggcaatatacaaaaacagcttgacataataatatcaa 22780248  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||||   |  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  22780247 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacgcaacattatatcacaacataatcaacatcaa 22780166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18821946 - 18821801
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cgtc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||| |||||| | ||    
T  18821946 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgccataacaatatc-aacgcaagccaacaatcatc 18821848  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||  || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  18821847 tcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 18821801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20638403 - 20638253
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  20638403 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 20638304  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| | | |||| |||  | |||||| | ||  |||||||||||||||    
T  20638303 ttgcaatttatcaacatctttaatattcaaacattcttcaagtaatgcata 20638253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Original strand, 20109153 - 20109322
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||| | |||| |||||||||||||||||| ||    
T  20109153 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacataatataacaatatcaaatgcaagtcatca 20109251  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  20109252 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 20109322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 12942363 - 12942432
Alignment:
Q  177 aatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12942363 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 12942432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8227631 - 8227448
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||  || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  8227631 catcaacatcttcaacaacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcg 8227533  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8227532 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 8227448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28289334 - 28289265
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28289334 atataacgacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 28289265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 25714418 - 25714478
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25714418 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 25714478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 18913994 - 18914059
Alignment:
Q  182 aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18913994 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 18914059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 182 - 247
Target Start/End: Original strand, 18937252 - 18937317
Alignment:
Q  182 aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18937252 aacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 18937317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 124
Target Start/End: Original strand, 23992421 - 23992540
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |    
T  23992421 acatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagctaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaa 23992520  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||| ||||| ||||||    
T  23992521 atatcaattgcaattcaaca 23992540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27333338 - 27333277
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27333338 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27333277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 27394078 - 27394017
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27394078 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 27394017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 15875469 - 15875537
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  15875469 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacatttcattaatcat 15875537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 173
Target Start/End: Original strand, 23019425 - 23019567
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  23019425 cttagaccgacttatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 23019523  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    |||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  23019524 ctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 23019567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 9098620 - 9098473
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| |   ||||| |||| |||||||||||||  |||||    
T  9098620 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacaaaggcagtatgcaaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcatttcaac 9098521  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| || |||    ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9098520 aacttcacaa--catcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat 9098473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 31630626 - 31630577
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31630626 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 31630577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 35245587 - 35245749
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||||||||||    
T  35245587 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacaccaacataggcagtatac---aacaacatgacataataatatca 35245683  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | | ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  35245684 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 35245749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 19668386 - 19668488
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||  ||||| | |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  19668386 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaaacagcaacatagatagtatgc-aaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaa 19668484  T
Q  123 caac 126  Q
    ||||    
T  19668485 caac 19668488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28496575 - 28496477
Alignment:
Q  29 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  28496575 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 28496477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 29 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 29808986 - 29808888
Alignment:
Q  29 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || ||||||||    
T  29808986 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaattagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaac 29808888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 13 - 59
Target Start/End: Complemental strand, 22080845 - 22080799
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa 59  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22080845 catcatcatcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaa 22080799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 19652209 - 19652316
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19652209 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 19652306  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  19652307 aacatctcaa 19652316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1561304 - 1561356
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1561304 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 1561356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17377814 - 17377778
Alignment:
Q  211 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17377814 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 17377778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 39 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 15041644 - 15041522
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || | || || |||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||    
T  15041644 gactcatgcaacttagttaaataacaatagtagcataggcagatcacaacaacagcatgacattataatatcaaatgcaattcaataacatcttaagtat 15041545  T
Q  138 tcacatataat-tcaagtaatgca 160  Q
    ||| ||| ||| ||||||||||||    
T  15041544 tca-ataaaatctcaagtaatgca 15041522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Original strand, 11185524 - 11185558
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11185524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 11185558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25603512 - 25603406
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| ||||||||||     
T  25603512 acatcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataac 25603413  T
Q  104 aatatca 110  Q
    |||||||    
T  25603412 aatatca 25603406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 25611850 - 25611744
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataat 103  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||| || | ||||  ||||| |||| ||||||||||     
T  25611850 acatcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcgacttagttaattaacaacagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataac 25611751  T
Q  104 aatatca 110  Q
    |||||||    
T  25611750 aatatca 25611744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 16920750 - 16920602
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |||||||||   |||| ||||||||||  ||||||    
T  16920750 catcatcatcttcaacatctttgaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcagcataggcagtatac---aacatcatgacataagtatatca 16920654  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    ||| | | ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  16920653 aattccattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 16920602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19847931 - 19847898
Alignment:
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19847931 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 19847898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 22831524 - 22831565
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22831524 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 22831565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 23992604 - 23992655
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatc---atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23992604 atcaacatcttaaaacatcatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 23992655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 33443068 - 33443108
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  33443068 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 33443108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 142 - 194
Target Start/End: Original strand, 23076862 - 23076915
Alignment:
Q  142 atataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  23076862 atataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 23076915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4185928 - 4185880
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaaca 73  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||    
T  4185928 atcaacttggaccgactcatgcagcatagttaaacaacagacagcaaca 4185880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 234; Significance: 1e-129; HSPs: 71)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32215092 - 32214851
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32215092 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 32214993  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32214992 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 32214893  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32214892 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 32214851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 18808947 - 18809175
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18808947 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18809046  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18809047 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 18809146  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18809147 tatatacatataacacttcatcaatcatg 18809175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23709690 - 23709462
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709690 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23709591  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23709590 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 23709491  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23709490 tatatacatataacacttcatcaatcatg 23709462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23712171 - 23711943
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23712171 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23712072  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23712071 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 23711972  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23711971 tatatacatataacacttcatcaatcatg 23711943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 39682317 - 39682545
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682317 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 39682416  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39682417 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 39682516  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39682517 tatatacatataacacttcatcaatcatg 39682545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 6725999 - 6726227
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6725999 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaag 6726098  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  6726099 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 6726198  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6726199 tatatacatataacacttcatcaatcatg 6726227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21155218 - 21154990
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21155218 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 21155119  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21155118 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 21155019  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21155018 tatatacatataacacttcatcaatcatg 21154990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 23130866 - 23131094
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23130866 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23130965  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23130966 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 23131065  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23131066 tatatacatataacacttcatcaatcatg 23131094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 23133333 - 23133561
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133333 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23133432  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  23133433 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 23133532  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23133533 tatatacatataacacttcatcaatcatg 23133561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 26505383 - 26505611
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505383 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaag 26505482  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26505483 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 26505582  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26505583 tatatacatataacacttcatcaatcatg 26505611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 26507861 - 26508089
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26507861 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaag 26507960  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  26507961 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 26508060  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26508061 tatatacatataacacttcatcaatcatg 26508089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 34402680 - 34402452
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402680 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 34402581  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  34402580 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 34402481  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34402480 tatatacatataacacttcatcaatcatg 34402452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 571401 - 571629
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  571401 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 571500  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  571501 tcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 571600  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  571601 tatatacatataacacttcattaatcatg 571629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 23135594 - 23135822
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135594 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23135693  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  23135694 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaatgataatcagcatcttaaaacatca 23135793  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23135794 tatatacatataacacttcatcaatcatg 23135822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24898354 - 24898125
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898354 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24898255  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24898254 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 24898155  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24898154 atatatacatataacacttcatcaatcatg 24898125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24900837 - 24900608
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900837 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24900738  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24900737 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 24900638  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24900637 atatatacatataacacttcatcaatcatg 24900608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24903314 - 24903085
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903314 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24903215  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24903214 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 24903115  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24903114 atatatacatataacacttcatcaatcatg 24903085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24905791 - 24905562
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905791 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24905692  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24905691 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 24905592  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24905591 atatatacatataacacttcatcaatcatg 24905562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24908266 - 24908037
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908266 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 24908167  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  24908166 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 24908067  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24908066 atatatacatataacacttcatcaatcatg 24908037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Original strand, 24367782 - 24368006
Alignment:
Q  23 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24367782 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 24367881  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatata 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  24367882 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 24367981  T
Q  223 tacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  24367982 tacatataatacttcatcaatcatg 24368006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 28577103 - 28577331
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  28577103 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacgcaacagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaaatgcaag 28577202  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28577203 ccaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 28577302  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28577303 tatatacatataacacttcatcaatcatg 28577331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 32039656 - 32039428
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32039656 catcttaatcaacttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaacagtaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 32039557  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  32039556 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca 32039457  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  32039456 tatatacatataacacttcatcgatcatg 32039428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 22105416 - 22105645
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105416 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 22105515  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22105516 gtcaacaacttctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaattataatcaacatcttaaaacatc 22105615  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22105616 atatatacatataacacttcatcaatcatg 22105645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45030012 - 45029784
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45030012 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 45029913  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||  ||||||  ||||||||||||||    
T  45029912 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacatttatatcacaatataacaacatgaaataataatcatcatcttaaaacatca 45029813  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45029812 tatatacatataacacttcatcaatcatg 45029784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 38967378 - 38967606
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  38967378 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacatcgacacaacaatatacaaaaatagcatgaaataataatatcaaatgcaag 38967477  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||    
T  38967478 tcaatcaacatctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaataataatcaacatcttaagacatc 38967576  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38967577 atatatacatataacacttcatcaatcatg 38967606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 43137303 - 43137477
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43137303 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 43137402  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  43137403 tcaacaacgtctcaattgttcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 43137477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24529687 - 24529511
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24529687 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaacaacaacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaag 24529588  T
Q  119 tcaacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    | |||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24529587 ttaacaacgtctcaattatttcatatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 24529511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24642933 - 24642784
Alignment:
Q  100 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaa 199  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24642933 taataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataa 24642834  T
Q  200 tcaaaatc--ttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24642833 tcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 24642784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 22337116 - 22337281
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22337116 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggctgtatataaaaacagcatgacataataatatcaa 22337215  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22337216 atgcaagacaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22337281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23060514 - 23060679
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23060514 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23060613  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || |||| |  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23060614 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattaaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23060679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23076443 - 23076608
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23076443 catcatcatcttcatccacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 23076542  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||  ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23076543 ttgcaagtcaacaatatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23076608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 19671831 - 19672010
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  19671831 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcg 19671929  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 192  Q
    || |||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  19671930 aacgcaagtaaacaacatctcaat-attcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataacaacatcaa 19672010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22731354 - 22731189
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22731354 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaa 22731255  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| | | || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22731254 ttgcaattcatcaacatattaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22731189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22738299 - 22738135
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22738299 catcatcatcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacattaaataggcagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22738200  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22738199 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 22738135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 298929 - 298769
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| ||||    
T  298929 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgca 298830  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  298829 attcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 298769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23285866 - 23286027
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    ||||||||||||||||    
T  23285866 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca----gacataataatatcaa 23285961  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| || |  ||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23285962 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatgttcttcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23286027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 23660024 - 23660188
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||| || |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23660024 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtatcttagttaaacaacaacagcaacataggcagtatacgaaa-caggatgacataataatatcaa 23660122  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| |||||||| ||| || ||||||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  23660123 atgcaaatcaacaacatcttaaatattcaatcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 23660188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 19 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 24643108 - 24643034
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagc 93  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24643108 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaaacagc 24643034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23654506 - 23654341
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  23654506 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacagcataggcagcatacaaatacatcatgacataataatatcaa 23654407  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || ||||||  ||| | |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23654406 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaagtattactcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23654341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 23708725 - 23708558
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||| ||||| ||| |     
T  23708725 tcaacttagaccgactcaagcagcttagttaaataacagatagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaattgcaaatcatcg 23708627  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  23708626 acatctcaaacattcaaatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 23708558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 38234 - 38136
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  38234 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 38136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 20261381 - 20261450
Alignment:
Q  177 aatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20261381 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 20261450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23103515 - 23103369
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || |||||||    
T  23103515 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataaaaacagcaacataggcagtatac--aaacagcatgacatgattatatcaa 23103418  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
    || ||| ||| |||| ||||||| |||||   ||||||||||| |||||    
T  23103417 attcaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtcatgca 23103369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 7835 - 7688
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  7835 cttagactgaatcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 7737  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  7736 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcaca 7688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 138 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 22173868 - 22173803
Alignment:
Q  138 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  22173868 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 22173803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 28405990 - 28406099
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| ||||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  28405990 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 28406089  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  28406090 aacatctcaa 28406099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23040309 - 23040249
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23040309 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 23040249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 25616179 - 25616314
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |    
T  25616179 acatcattattaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaattacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaa 25616278  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  25616279 atatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 25616314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 20309109 - 20309257
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  20309109 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatca 20309205  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    ||| ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  20309206 aattcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 20309257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 8946658 - 8946734
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa 88  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||    
T  8946658 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttagataacaatagcaacataggcagtatacaaaa 8946734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 10684764 - 10684694
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcata--tatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  10684764 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcat 10684694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20520295 - 20520130
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  20520295 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatatgcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaac 20520198  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||| |||||||||    
T  20520197 atctcaaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacgacatcaaat 20520130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 23207296 - 23207461
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||| ||    
T  23207296 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacgac 23207394  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  ||| | | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  23207395 atctcaa-catt-ataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 23207461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 19 - 173
Target Start/End: Original strand, 7679592 - 7679745
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |    
T  7679592 catcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatc-aatgta 7679689  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||||| |||| ||  ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  7679690 agtcatcaacatcataaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatataattatat 7679745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22459587 - 22459511
Alignment:
Q  107 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22459587 atcaaatgaaagtcatcaacatctcaaatattcacatataactcaagtaatgtatatacaattatatcacattataa 22459511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23707323 - 23707252
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23707323 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 23707252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 24918196 - 24918267
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24918196 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 24918267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Complemental strand, 32452031 - 32451896
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 127  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||||||| |||||| |     
T  32452031 cttagaccgactcatgcagcttggttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgcaagccaacaatca 32451933  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 164  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
T  32451932 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 32451896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 23791357 - 23791458
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||| | |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  23791357 catgatataaaaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacatt-atatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 23791455  T
Q  192 aat 194  Q
    |||    
T  23791456 aat 23791458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 25175864 - 25176010
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  25175864 atcaacttagacagattcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 25175962  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||| | ||||||||||||||    
T  25175963 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataacgtatatataattatat 25176010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 25616365 - 25616413
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25616365 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatg 25616413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 154 - 194
Target Start/End: Original strand, 29601478 - 29601518
Alignment:
Q  154 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29601478 taatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 29601518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 10 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 22134329 - 22134266
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||||| |||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22134329 catcatcatcatcatcatcatcatagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcaaca 22134266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 18787009 - 18786971
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18787009 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 18786971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 24671081 - 24671152
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||| |||   | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24671081 atataacaatatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataatacttcatcaatcatg 24671152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 23072069 - 23072019
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac 63  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  23072069 catcatcatcttcaacaacttagtccgactcatgcagcttagttaaataac 23072019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24697644 - 24697543
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||   |||| ||| |||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||| |    
T  24697644 catgatataacaatatcaaatgcaattcaacaacatctcaa-acttcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacataa 24697546  T
Q  192 aat 194  Q
    |||    
T  24697545 aat 24697543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 23287384 - 23287424
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  23287384 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 23287424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 24681500 - 24681571
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |||   | ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  24681500 atataacaacatcaaatgatgatcaacatcaacttaaacatcatatatacatctaatacttcatcaatcatg 24681571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 26392403 - 26392443
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26392403 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26392443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24529510 - 24529477
Alignment:
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24529510 catcatatacacatataacacttcatcaatcatg 24529477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 227; Significance: 1e-125; HSPs: 72)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16413476 - 16413246
Alignment:
Q  17 aacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413476 aacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 16413377  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16413376 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacat 16413277  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16413276 catatatacatataacacttcatcaatcatg 16413246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14409602 - 14409374
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 14409503  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14409502 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 14409403  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14409402 tatatacatataacacttcatcaatcatg 14409374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 1484406 - 1484634
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484406 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 1484505  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1484506 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 1484605  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  1484606 tatatacatataacacttcatcaatcatg 1484634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5853450 - 5853222
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853450 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 5853351  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  5853350 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 5853251  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5853250 tatatacatataacacttcatcaatcatg 5853222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 20403231 - 20403459
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403231 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20403330  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20403331 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20403430  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20403431 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20403459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 22001757 - 22001985
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001757 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22001856  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  22001857 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 22001956  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22001957 tatatacatataacacttcatcaatcatg 22001985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15203389 - 15203161
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  15203389 catcttaatcaacttagagcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaag 15203290  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15203289 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 15203190  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15203189 tatatacatataacacttcatcaatcatg 15203161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20046353 - 20046125
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20046353 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 20046254  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20046253 tcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20046154  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20046153 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20046125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 4483285 - 4483512
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483285 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 4483383  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4483384 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 4483483  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4483484 tatatacatataacacttcatcaatcatg 4483512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4542531 - 4542303
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542531 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacaagatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 4542432  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  4542431 tcaacaacgtctcaattattcacatatagttcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 4542332  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4542331 tatatacatataacacttcatcaatcatg 4542303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 19896269 - 19896501
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataa---taatatcaaatgc 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||    
T  19896269 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacggtatacaaaaacagcatgacataataataatatcaaatgc 19896368  T
Q  116 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatctt-aaaac 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||     
T  19896369 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaaat 19896468  T
Q  215 atcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19896469 atcatatatacatataacacttcatcaatcatg 19896501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45290857 - 45290624
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290857 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 45290758  T
Q  115 caagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaa 213  Q
     ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||| |||||||||    
T  45290757 taagccaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcagatacaattatatcacagtataacaacgtcaaataataatcaacatcttaaaa 45290658  T
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45290657 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 45290624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 14823778 - 14824007
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823778 catcttaatcaatttagacc-actcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 14823876  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc- 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||||||||     
T  14823877 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatcttaaaacatca 14823976  T
Q  218 -atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14823977 tatatatacatataacacttcatcaatcatg 14824007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 41598192 - 41598367
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598192 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 41598291  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41598292 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 41598367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19937164 - 19936933
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19937164 catcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataagatcaaatgcaag 19937065  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatc--ttaaaaca 215  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||    
T  19937064 tcaatcaacgtctcaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacagttatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaaca 19936965  T
Q  216 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19936964 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 19936933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 15070571 - 15070792
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15070571 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaac 15070670  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatac 225  Q
    |||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  15070671 gtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatctgaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcataaatac 15070770  T
Q  226 atataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||    
T  15070771 atataaaacttcatcaatcatg 15070792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 10 - 194
Target Start/End: Original strand, 26223914 - 26224098
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26223914 catcatcaacatcttaatcaacttagatcgacccatgcagcttaattaaataacaacagcaataaagcaatatacaaaaatagcatgacataataatatc 26224013  T
Q  110 aaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26224014 aaatgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataatttaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 26224098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 19801527 - 19801367
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19801527 cttagaccggctcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaacgcaagtcaacaacgtct 19801429  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 192  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  19801428 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattataacacaatataacaacatcaa 19801367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25484426 - 25484249
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |       |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25484426 catcttaatcaacttagaccaactcgtgcagcttagttaaataacaacagcta-------gtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 25484334  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  25484333 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaatcataatcaa 25484249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16092462 - 16092297
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16092462 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 16092363  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16092362 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataatttaagtaatgcgtataacattatatcaca 16092297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 6759259 - 6759421
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6759259 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 6759358  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||   |||||||||| |||  ||||||||| |||||| ||||  |||||||||||    
T  6759359 atgcaagtcaaca---tctcaattatacactcataattcaattaatgcgtataacattatatcaca 6759421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 18818529 - 18818348
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18818529 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 18818430  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
     || ||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  18818429 ttgtaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 18818348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 28649167 - 28648999
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 108  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28649167 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatat 28649068  T
Q  109 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  28649067 caaatgcaagtcaacaacatcttaattatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 28648999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 128 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 24486093 - 24485974
Alignment:
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacat 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24486093 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttagaacatcatatatacat 24485994  T
Q  228 ataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  24485993 ataacacttcatcaatcatg 24485974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 165
Target Start/End: Original strand, 7372779 - 7372932
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7372779 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7372878  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatat 165  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| |||||||||||| |||||    
T  7372879 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcttatat 7372932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 20536209 - 20536374
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20536209 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagaaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 20536308  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  20536309 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 20536374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 26219721 - 26219858
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  26219721 catcataatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaatagtatgacataataatatcaaatgcaag 26219819  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26219820 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26219858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 22875066 - 22875230
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22875066 catcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcagcagcaacacaggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 22875164  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22875165 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22875230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 178
Target Start/End: Original strand, 23406380 - 23406548
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23406380 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23406479  T
Q  112 atgcaagtcaac--aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaa 178  Q
     |||||||||||  | | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||||||||||    
T  23406480 ttgcaagtcaacatatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaa 23406548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Original strand, 32810054 - 32810163
Alignment:
Q  138 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32810054 tcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatgtaacacttc 32810153  T
Q  238 atcaatcatg 247  Q
    ||||||||||    
T  32810154 atcaatcatg 32810163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 21924048 - 21923900
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  21924048 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtctacaaaaacaacatgacatgataatatcaa 21923949  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||||    
T  21923948 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgca 21923900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 21919120 - 21918969
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21919120 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 21919021  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacat-ataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| |||||||| ||| || |||||| || ||  |||||||||||||||    
T  21919020 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattcttcaagtaatgcata 21918969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 26225405 - 26225268
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  26225405 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacaatatac-aaaacagtatgacataataatatcaaatacaag 26225307  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  26225306 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 26225268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 22626737 - 22626901
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  22626737 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 22626835  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || ||| |||||||| ||| || ||||||  |||| |||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  22626836 atacaaatcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtgtataacattatatcaca 22626901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13508203 - 13508022
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| || || || ||||| ||||||||||| ||    
T  13508203 tcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcacaa-catcatgatataataatatcgaa 13508105  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13508104 cgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13508022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13597735 - 13597554
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||| || ||||| || ||||| ||||||||||| ||    
T  13597735 tcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataagcagaatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaa 13597637  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     |||||| |||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13597636 cgcaagtaaacaacatcccaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13597554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18879351 - 18879191
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||     |||||||||||||||    
T  18879351 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaca-----acataataatatcaa 18879257  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  18879256 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 18879191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17612230 - 17612059
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| || ||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  17612230 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcaacaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcg 17612132  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  17612131 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 17612059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 20498581 - 20498746
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||  ||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  20498581 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgtaaaat-agcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 20498679  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  20498680 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 20498746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 31971258 - 31971407
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  31971258 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 31971356  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     | ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  31971357 ttccaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 31971407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Original strand, 23648547 - 23648719
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||| | ||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  23648547 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatagcaacataggcagattacaacaacaacatgacataata 23648646  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||  |||||  ||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||| | |  |||||||||||    
T  23648647 atatcatttgcaatacaacaacatcttaaatattca-ataaaacttcaagtaatgcacacaacattatatcaca 23648719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 18678229 - 18678094
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |    
T  18678229 acatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaa 18678130  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  18678129 atatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 18678094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 38855371 - 38855212
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  38855371 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 38855273  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  38855272 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 38855212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 45131116 - 45131019
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  45131116 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 45131019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 6520369 - 6520483
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  6520369 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6520467  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||| ||||    
T  6520468 aatgcaagtcatcaac 6520483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 32121726 - 32121861
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |    
T  32121726 acatcattatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaa 32121825  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  32121826 atatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 32121861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 21 - 133
Target Start/End: Original strand, 21285606 - 21285719
Alignment:
Q  21 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| ||||||||||||||     
T  21285606 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaa 21285704  T
Q  119 tcaacaacgtctcaa 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  21285705 tcaacaacatctcaa 21285719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 37116366 - 37116532
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37116366 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37116464  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  37116465 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 37116532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16199764 - 16199666
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |  ||||| ||||||||||||||||||    
T  16199764 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacagtattc--aaacaacatgacataataatatca 16199667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38550090 - 38550041
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38550090 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 38550041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 5866394 - 5866280
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||     
T  5866394 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 5866296  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| || ||||||||    
T  5866295 aatgtaaatcaacaac 5866280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 114
Target Start/End: Original strand, 17140917 - 17141019
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||  || |||||||||||||||||     
T  17140917 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aatccatcatgacataataatatcg 17141015  T
Q  111 aatg 114  Q
    ||||    
T  17141016 aatg 17141019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 21490996 - 21491110
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||      
T  21490996 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatattg 21491094  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| || ||||||||    
T  21491095 aatgtaaatcaacaac 21491110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 983512 - 983410
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaa-aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| |||| ||   ||||| |||| ||| |||||||||| |||||    
T  983512 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgcaaacaagttcatgatataacaatctcaaatgcaattcaac 983413  T
Q  124 aac 126  Q
    |||    
T  983412 aac 983410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17267096 - 17266930
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| | |  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17267096 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cggttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17266998  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  | ||| |||||||||  |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  17266997 atctcaaaca-tcatatataattcttgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 17266930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21389570 - 21389458
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  21389570 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatca 21389474  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  21389473 aattcaattcatcaac 21389458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21396100 - 21395988
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  21396100 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatca 21396004  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  21396003 aattcaattcatcaac 21395988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21778896 - 21778784
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | | |||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  21778896 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggtagtatac---aacagcatgacataattatatca 21778800  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  21778799 aattcaattcatcaac 21778784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 21790593 - 21790481
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||||||||| ||||| ||||||    
T  21790593 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacagcatgagataattatatca 21790497  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  21790496 aattcaattcatcaac 21790481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 32121912 - 32121960
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  32121912 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatg 32121960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17439609 - 17439461
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  17439609 cttagtccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 17439511  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  17439510 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcaca 17439461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 27 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23760950 - 23760903
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23760950 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 23760903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 21249385 - 21249434
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 62  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21249385 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21249434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 62
Target Start/End: Original strand, 21255223 - 21255272
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 62  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21255223 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa 21255272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18678043 - 18677995
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18678043 atcaacatcttaaaacatcatacataaatataacacttcatcaatcatg 18677995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 26355805 - 26355766
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26355805 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaa 26355766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Original strand, 21673718 - 21673826
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  21673718 atcaacttagaccgactcatgcatcatagttaaataacaaacaacaacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 21673816  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  21673817 aacatctcaa 21673826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27472395 - 27472347
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27472395 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatg 27472347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 1327042 - 1326990
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatata 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  1327042 atataacaacatcaaataataatcaacatctcaaaacatcgtatatacatata 1326990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16401996 - 16401960
Alignment:
Q  211 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  16401996 aaacatcatatatacatataacatttcatcaatcatg 16401960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 178 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 35026895 - 35026849
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatata 224  Q
    ||||||||| |||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  35026895 atataacaatatcaaacgataatcaacatcttaaaacatcatatata 35026849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20982710 - 20982657
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatata----acacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||    |||||||||||||||||    
T  20982710 aatcaacatcttaaaacatcatatatatatatatataacacttcatcaatcatg 20982657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 226; Significance: 1e-125; HSPs: 71)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 226; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 19618343 - 19618102
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19618343 acattatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataa 19618244  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19618243 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacctataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 19618144  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19618143 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 19618102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 3515011 - 3515239
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  3515011 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaaaaacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcaagacataataatatcaaatgcaag 3515110  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3515111 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatca 3515210  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3515211 tatatacatataacacttcatcaatcatg 3515239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 14970878 - 14970641
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14970878 acatcatcatcaacattttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaacagcaatatacaaaaacagcatgacataataa 14970779  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  14970778 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 14970679  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaat 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14970678 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaat 14970641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18215432 - 18215204
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215432 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18215333  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18215332 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca 18215233  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18215232 tatatacatataacacttcatcaatcatg 18215204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15118510 - 15118282
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118510 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15118411  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15118410 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 15118311  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15118310 tatatacatataacacttcatcaatcatg 15118282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 12465 - 12237
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12465 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 12366  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||    
T  12365 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatccaataataatcaacatcttaaaacatca 12266  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12265 tatatacatataacacttcatcaatcatg 12237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 52312514 - 52312742
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52312514 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 52312613  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  52312614 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 52312713  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  52312714 tatatacatataacacttcattaatcatg 52312742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 19242703 - 19242932
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242703 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 19242802  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||| |||||||||||||    
T  19242803 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaactccaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 19242902  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19242903 atatatacatataacacttcatcaatcatg 19242932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 44615292 - 44615520
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615292 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44615391  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  44615392 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 44615491  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44615492 tatatacatataacacttcatcaatcatg 44615520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 15 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15355487 - 15355254
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 114  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15355487 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 15355388  T
Q  115 caagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaa 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  15355387 caagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaa 15355288  T
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15355287 catcatatatacatataacatttcatcaatcatg 15355254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 18239577 - 18239349
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239577 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18239478  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18239477 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 18239378  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18239377 tatatacatataacacttcatcaatcatg 18239349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 50222497 - 50222269
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222497 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacattatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 50222398  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  50222397 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaatatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 50222298  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  50222297 tatatacatataacacttcatcaatcatg 50222269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1837667 - 1837439
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1837667 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaag 1837568  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  1837567 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacgattatatcacattataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 1837468  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  1837467 tatatacatataaaacttcatcaatcatg 1837439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 44773245 - 44773013
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773245 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44773146  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc- 217  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| |||     
T  44773145 tcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatca 44773046  T
Q  218 ---atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44773045 tatatatatacatataacacttcatcaatcatg 44773013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 51464026 - 51463842
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  51464026 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 51463927  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  51463926 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 51463842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23803423 - 23803239
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23803423 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 23803324  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||    
T  23803323 tcaacaacgtctaaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacataaaatcataatcaa 23803239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 44102218 - 44102393
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44102218 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 44102317  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44102318 taaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 44102393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 12610954 - 12611131
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  12610954 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-------acaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 12611046  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12611047 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 12611131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 19 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 7641340 - 7641139
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  7641340 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca----------aaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 7641251  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||| ||||    
T  7641250 tcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaatatca 7641151  T
Q  219 tatatacatata 230  Q
    |||||| |||||    
T  7641150 tatatatatata 7641139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 44929038 - 44928873
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44929038 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatgtcaaatgcaa 44928939  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44928938 gtcaataacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa 44928873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 15367691 - 15367873
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367691 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15367790  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15367791 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15367873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 15402704 - 15402886
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402704 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15402803  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15402804 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15402886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21815731 - 21815568
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21815731 cttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacgacagcaacacaactgtatacaaaaacagcatgacataataatataaaatgcaagtcaacaacgtct 21815632  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21815631 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcataatataacaacatcaaat 21815568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 15371203 - 15371385
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371203 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15371302  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15371303 tgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15371385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 15373484 - 15373666
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373484 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15373583  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15373584 tgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaactaacgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15373666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 15370019 - 15370200
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370019 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 15370118  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15370119 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaact-acgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 15370200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 191
Target Start/End: Original strand, 16223533 - 16223712
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16223533 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatctaa 16223632  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatca 191  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16223633 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaactaacccatatacaattatatcacaatataacaacatca 16223712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 20149833 - 20150004
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||  | ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20149833 catcttaatcaacttagactgactcatgcaacttgataaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20149932  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 189  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20149933 tcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 20150004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 54798868 - 54798729
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54798868 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttgaataacaacagcaacacaagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 54798769  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  54798768 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 54798729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 133
Target Start/End: Original strand, 14280320 - 14280434
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14280320 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 14280419  T
Q  119 tcaacaacgtctcaa 133  Q
    |||||||| ||||||    
T  14280420 tcaacaacatctcaa 14280434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 7798775 - 7798956
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7798775 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7798874  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
     ||||||||| |||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||| |||||||| |||| |||||||||    
T  7798875 ttgcaagtcatcaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattgtatcacaacataatcaacatcaa 7798956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 14038655 - 14038814
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  14038655 catcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatgcagtatacaaaaacaacatggcataataatatcaaatgcaa 14038754  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   ||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  14038755 gtcaacaacatctcaattatacattcatatttcaagtaatgcacataacattatatcaca 14038814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16377634 - 16377478
Alignment:
Q  20 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16377634 atcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaa--cagcatgacataataatatcaaatgcaag 16377537  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16377536 tcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16377478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 7088878 - 7089043
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7088878 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7088977  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| |  |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  7088978 ttgcaattcatcaacatcttacatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 7089043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 12902758 - 12902923
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12902758 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 12902857  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     || || ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  12902858 ttgtaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 12902923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 14 - 177
Target Start/End: Original strand, 22636437 - 22636601
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22636437 atcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtttacaaaaacagcatgacataataatatcaat 22636536  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  22636537 tgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 22636601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 31 - 188
Target Start/End: Original strand, 22353852 - 22354010
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || || |||  |  |  |||| |||||||||| |||||||| | ||| |||||||||||    
T  22353852 cttagaccgactcatgcagcttaggtaaataacaacagcagcataggcagattgtagcaacaacatgacataacaatatcaattacaattcaacaacgtc 22353951  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaca 188  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22353952 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaaca 22354010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 7893704 - 7893869
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7893704 catcatcatcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 7893803  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||    
T  7893804 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataccattatttcaca 7893869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 124
Target Start/End: Complemental strand, 52873487 - 52873375
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873487 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 52873388  T
Q  112 atgcaagtcaaca 124  Q
     ||||||||||||    
T  52873387 ttgcaagtcaaca 52873375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16270355 - 16270191
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16270355 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 16270257  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  16270256 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 16270191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8574981 - 8574844
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||     
T  8574981 catcttaattaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaatgtaat 8574883  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  8574882 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 8574844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 44052830 - 44052995
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44052830 catcatcatcttcatcaacttaggccgactcatgcagctcagttaaataacaacatcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 44052929  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  44052930 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgctcataacattatatcaca 44052995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13953 - 13788
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  13953 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 13855  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  13854 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 13788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 6899892 - 6900056
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||  ||||||||||||||    
T  6899892 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatagcataataatatcaa 6899990  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  6899991 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 6900056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 16240089 - 16239927
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||| | || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16240089 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttaattaaataacaatagcaaaataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 16239991  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 175  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| || |||||||||| |||  |||||||||    
T  16239990 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatactttaagtaatgcaaataacattatatca 16239927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 17 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23374475 - 23374314
Alignment:
Q  17 aacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgc 115  Q
    |||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||| |||    
T  23374475 aacatcttcaacaacttagaacgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatcaattgc 23374376  T
Q  116 aagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  23374375 aattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 23374314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52243302 - 52243131
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| ||||||||||| || ||||    
T  52243302 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaat-cagttcatgatataacaatatcaaatgaaattcaa 52243204  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    |||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  52243203 caacatctcaaacattcatatataatccaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 52243131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 43198661 - 43198492
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||| |||||  |  ||||| ||||  ||||||||||||||||| |    
T  43198661 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacatagacaatatgcaaaacaattcatgatataaccatatcaaatgcaagtcatc 43198562  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||  |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  43198561 aatatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 43198492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 15534343 - 15534412
Alignment:
Q  177 aatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15534343 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 15534412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 36038033 - 36038101
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36038033 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 36038101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 3096294 - 3096379
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatga 97  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  3096294 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatga 3096379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 14048740 - 14048808
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14048740 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacctcatcaatcat 14048808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15497070 - 15497001
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15497070 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 15497001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 49547773 - 49547705
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  49547773 atataacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacatcatagatacatataacacttcatcaatcat 49547705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 179 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 52873176 - 52873108
Alignment:
Q  179 tataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52873176 tataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 52873108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 39706408 - 39706299
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  39706408 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 39706310  T
Q  111 aatgcaagtca 121  Q
    |||||||||||    
T  39706309 aatgcaagtca 39706299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 15464977 - 15464888
Alignment:
Q  86 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 175  Q
    |||| ||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15464977 aaaatagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtattgcatatacaattatatca 15464888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Original strand, 362268 - 362317
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  362268 aatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 362317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 137
Target Start/End: Original strand, 12774021 - 12774132
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||| ||| |||||    
T  12774021 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatacaa-tcaac 12774118  T
Q  124 aacgtctcaattat 137  Q
    ||| ||||||||||    
T  12774119 aacatctcaattat 12774132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12288316 - 12288214
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  12288316 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaa 12288218  T
Q  123 caac 126  Q
    ||||    
T  12288217 caac 12288214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14746618 - 14746547
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14746618 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 14746547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 46640558 - 46640393
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| || |||||||  |||||||  ||||| |||| ||||||||||| || |||| |||    
T  46640558 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacatagacagtata-taaaacagttcatgatataacaatatcaaatgaaaatcaataac 46640460  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||    
T  46640459 atctcaa--catcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacatcattaacaacatcaaat 46640393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 15551818 - 15551879
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15551818 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 15551879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53082254 - 53082089
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| | |||||| | |||| |||  ||||| |||| ||||||||| |||| |||| |||    
T  53082254 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataagcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataac 53082157  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  53082156 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 53082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 31 - 164
Target Start/End: Original strand, 6190481 - 6190616
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||  ||||| |     
T  6190481 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagcaacataggcagcattcaaaaatagcatgacataacaatatc-aatgtaagcgaacaatca 6190579  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 164  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||    
T  6190580 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata 6190616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 14053421 - 14053323
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| || || || ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  14053421 catcatcatcttcaacatcttagatcgactcatgcaacttagttaaataacaaacaacagcatagacagtatac--aaacagcatgacataataatatca 14053324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 17046488 - 17046549
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17046488 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 17046549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 230
Target Start/End: Original strand, 19857607 - 19857659
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatata 230  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19857607 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatatatata 19857659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 73
Target Start/End: Original strand, 8846370 - 8846418
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8846370 atcaacttagaccgacttattcagcttagttaaataacaaacagcaaca 8846418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 104 - 192
Target Start/End: Original strand, 8846465 - 8846553
Alignment:
Q  104 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  8846465 aatatcgaatgcaagtcatcaacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 8846553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 17333298 - 17333338
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  17333298 tagactgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 17333338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 10772 - 11005
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10772 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaat 10871  T
Q  114 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10872 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaa 10971  T
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10972 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 11005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 91)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 13544016 - 13544257
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  13544016 acatcattatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataa 13544115  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  13544116 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaaca 13544215  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13544216 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 13544257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 12567551 - 12567792
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  12567551 acatcataaacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacatcatgacataataa 12567650  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  12567651 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatgataatcaaca 12567750  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12567751 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 12567792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 17463182 - 17463410
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463182 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 17463281  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  17463282 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17463381  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17463382 tatatacatataacacttcatcaatcatg 17463410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45607065 - 45606837
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45607065 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 45606966  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  45606965 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 45606866  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45606865 tatatacatataacacttcatcaatcatg 45606837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 7781505 - 7781277
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7781505 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 7781406  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  7781405 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 7781306  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7781305 tatatacatataacacttcatcaatcatg 7781277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 8899098 - 8899326
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899098 catcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 8899197  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  8899198 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacatcttaaaacatca 8899297  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899298 tatatacatataacacttcatcaatcatg 8899326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 9707765 - 9707537
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9707765 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatacaag 9707666  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  9707665 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 9707566  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9707565 tatatacatataaaacttcatcaatcatg 9707537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 34159330 - 34159558
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159330 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 34159429  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  34159430 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 34159529  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  34159530 tatatacatataacacttcatcaatcatg 34159558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 55476495 - 55476723
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476495 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 55476594  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  55476595 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 55476694  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  55476695 tatatacatataacacttcatcaatcatg 55476723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6469292 - 6469064
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469292 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 6469193  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  6469192 tcaacaacgtctcaattagtcacatataattgaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 6469093  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6469092 tatatacatataacacttcatcaatcatg 6469064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10247881 - 10247653
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247881 catcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcagcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 10247782  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10247781 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 10247682  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10247681 tatatacatataacacttcatcaatcatg 10247653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16282969 - 16282741
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  16282969 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatattgaatgcaag 16282870  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16282869 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 16282770  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16282769 tatatacatataacacttcatcaatcatg 16282741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16454439 - 16454211
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454439 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16454340  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16454339 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 16454240  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16454239 tatatacatataacacttcatcaatcatg 16454211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 28848769 - 28848541
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848769 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 28848670  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  28848669 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 28848570  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28848569 tatatacatataacacttcatcaatcatg 28848541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 13154414 - 13154185
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154414 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 13154315  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13154314 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 13154215  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154214 atatatacatataacacttcatcaatcatg 13154185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38962045 - 38961821
Alignment:
Q  23 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38962045 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 38961946  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatata 222  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  38961945 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatata 38961846  T
Q  223 tacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  38961845 tacatataatacttcatcaatcatg 38961821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 41123894 - 41124119
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41123894 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca---acacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 41123990  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  41123991 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 41124090  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41124091 tatatacatataacacttcaccaatcatg 41124119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 13151949 - 13151726
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctt-agttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13151949 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 13151850  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  13151849 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatc 13151750  T
Q  218 atatatacatataacacttcatca 241  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  13151749 atatatacatatcacacttcatca 13151726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 17446812 - 17446614
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17446812 catcttaatcaacttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 17446714  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  17446713 tcaacaacgtctcaattattcacatatcattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 17446614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 8499522 - 8499752
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8499522 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 8499621  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  8499622 tcaatcaatgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacat 8499721  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  8499722 catatatacatataaaacttcattaatcatg 8499752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 15412433 - 15412663
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15412433 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15412532  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||| |    
T  15412533 tcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaactt 15412632  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15412633 catatatacatataaaacttcatcaatcatg 15412663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 29172741 - 29172565
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29172741 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 29172642  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  29172641 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatactatcaacatcaaat 29172565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 23 - 203
Target Start/End: Original strand, 50242830 - 50243010
Alignment:
Q  23 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  50242830 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaatcaa 50242929  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  50242930 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 50243010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 17672630 - 17672805
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  17672630 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 17672729  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17672730 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaaataatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 17672805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12119883 - 12119707
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119883 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagctttgttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 12119784  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12119783 tcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12119707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53070799 - 53070636
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53070799 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataacagtatacaaaaacaacaagacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 53070700  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53070699 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatctaacaacatcaaat 53070636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 27165254 - 27165484
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | || |||||| ||||| || ||||| |||  |||||||||||||    
T  27165254 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaatatagacagtatgcaaaa-caacatgatataccaatatcaaatgca 27165352  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaaca 215  Q
    ||||| |||  |||||| |||||| |||||||| ||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27165353 agtcatcaatatctcaaatattcatatataatttaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 27165452  T
Q  216 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27165453 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 27165484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 43550625 - 43550452
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| | ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43550625 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataatgacagcaacatatgcagtatgcaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 43550526  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  43550525 tcaattattcacatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 43550452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53301665 - 53301434
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  53301665 catcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 53301567  T
Q  117 agtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaac 214  Q
    |||||  |||  |||||| |||||| |||||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  53301566 agtcattcaatatctcaaatattcatatataattcaagtattacgtatacaattatatcacaatataaacaacataaaatggtaatcaacatcttaaaac 53301467  T
Q  215 atcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53301466 atcatatatacatataacacttcatcaatcatg 53301434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 19 - 146
Target Start/End: Original strand, 15977519 - 15977646
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  15977519 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 15977618  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatata 146  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15977619 tcaacaacgtctcaattattcacatata 15977646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 14972855 - 14973020
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14972855 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 14972954  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14972955 atgcaaatcaacaacatctcatatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 14973020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 40213834 - 40213676
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  40213834 catcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacatcaacacagcagtatacataaacatcatgacataataatatcaaatgcaag 40213735  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||||||| ||   ||||| |||||||||| ||||  |||||||||||    
T  40213734 tcaacaacatctcaattatacattcataatccaagtaatgcgtataacattatatcaca 40213676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 55500946 - 55501053
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55500946 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 55501045  T
Q  119 tcaacaac 126  Q
    ||||||||    
T  55501046 tcaacaac 55501053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 36166602 - 36166739
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36166602 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 36166700  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  36166701 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 36166739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 17487857 - 17488022
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17487857 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 17487956  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17487957 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17488022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 17499339 - 17499504
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17499339 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaaatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 17499438  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  17499439 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 17499504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 25476505 - 25476340
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25476505 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaaaaacaacagcaacacaggtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 25476406  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||  |||  |||||||||||    
T  25476405 atgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgcataacattatatcaca 25476340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 30 - 193
Target Start/End: Original strand, 42386428 - 42386593
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  42386428 acttagaccgactcatgcagtttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataacaatatcaaatgcaagtcaacaacat 42386527  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaa 193  Q
    ||||| ||||||   |||||||||| ||||||||||  |||||||||||  |||| ||||||||||    
T  42386528 ctcaaatattcattcataattcaagcaatgcatataacattatatcacatcataatcaacatcaaa 42386593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 20 - 192
Target Start/End: Original strand, 43840940 - 43841114
Alignment:
Q  20 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  43840940 atcttcatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacatagacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 43841039  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
    |||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  43841040 tcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 43841114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Original strand, 26686888 - 26687069
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26686888 catcatcatcttcttcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 26686987  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
     |||||||||||| | ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  26686988 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattccattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 26687069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 25 - 157
Target Start/End: Original strand, 21618459 - 21618590
Alignment:
Q  25 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21618459 aatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 21618557  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    || |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  21618558 acatctcaaatatacattcataattcaagtaat 21618590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 13442275 - 13442440
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13442275 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacggcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 13442374  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  13442375 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 13442440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 18438535 - 18438700
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18438535 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatatcaa 18438634  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||   |||| ||   |||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  18438635 atgcaagtcaacaacatcttttttatacattcatatctcaagtaatgcatataacattatatcaca 18438700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23083481 - 23083316
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23083481 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaa 23083382  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| ||| || ||||||  | || ||| ||||||||| |||  |||||||||||    
T  23083381 ttgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattttacttctagtaatgcacataacattatatcaca 23083316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 12399210 - 12399360
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12399210 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 12399309  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||| |||    ||||||||||||||    
T  12399310 atgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcata 12399360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 20698555 - 20698405
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20698555 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacgtaataatatcaa 20698456  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| ||| |||| ||| |  |||||| ||||  |||||||||||||||    
T  20698455 ttgcaattcatcaacatcttatatattcaaatattcttcaagtaatgcata 20698405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 14576939 - 14576788
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  14576939 atcaacttagaccgactcattcaacttagttaaataacaacagcaacatagacagtata-aacaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaaca 14576841  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || ||| || ||||||  |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14576840 acatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcatataacattatatcaca 14576788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 24340843 - 24340660
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||| || || || ||||| |||||||||||     
T  24340843 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcagtatgcacaa-catcatgatataataatatcg 24340745  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  24340744 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 24340660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 118
Target Start/End: Original strand, 10556989 - 10557088
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10556989 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacatcagcatacaaaaacggcatgacataataatatcaaatgcaag 10557088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24153322 - 24153164
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24153322 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggtagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 24153224  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||||| |||  || ||||||||    
T  24153223 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgcacataacataatatcaca 24153164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 19 - 114
Target Start/End: Original strand, 44494813 - 44494908
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatg 114  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44494813 catcttaatcaacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcataacataataatatcaaatg 44494908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 11424879 - 11424718
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11424879 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacataacaatatcaa 11424781  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
      |||| ||||||   |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  11424780 tagcaaatcaaca---tctcaattatgcattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 11424718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 19 - 113
Target Start/End: Original strand, 17737240 - 17737337
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagta---tacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17737240 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatactacaacaacagcatgacataataatatcaaat 17737337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 26 - 158
Target Start/End: Original strand, 14572603 - 14572735
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  14572603 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaattgagagtcaaca 14572701  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatg 158  Q
    || ||| || ||||||  |||| ||||| |||||    
T  14572702 acatcttaaatattcaattatacttcaaataatg 14572735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 52523831 - 52523666
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||  ||||| |||| |||||| ||||||| ||||||||    
T  52523831 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagttcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaacaac 52523733  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  52523732 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 52523666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 30 - 194
Target Start/End: Original strand, 23274705 - 23274871
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 127  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| ||||||||||| || |||||| ||||||     
T  23274705 acttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcgaacgcaagtaaacaaca 23274803  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  23274804 tctcaaatattcacatataattcaagtaaagaatatacaattacatcacattataaacaacatcaaat 23274871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37642385 - 37642202
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||     
T  37642385 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 37642287  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  37642286 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 37642202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 54520985 - 54521053
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54520985 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 54521053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 180 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 29544839 - 29544773
Alignment:
Q  180 ataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29544839 ataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 29544773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 185 - 246
Target Start/End: Original strand, 12305315 - 12305376
Alignment:
Q  185 aacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12305315 aacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 12305376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 93 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 2051238 - 2051138
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2051238 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatca 2051139  T
Q  192 a 192  Q
    |    
T  2051138 a 2051138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 131 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17248287 - 17248224
Alignment:
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17248287 caattattcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17248224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 56; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 46822259 - 46822394
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |    
T  46822259 acatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaa 46822358  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| || ||||||    
T  46822359 atatcaattgcaattcaacaacatcttaaatattca 46822394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Original strand, 15470939 - 15471085
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  15470939 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 15471037  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  15471038 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 15471085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Original strand, 30029834 - 30029968
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || || |||  ||||| ||||||||||||||| |    
T  30029834 acatcatcatcaacatctcattcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcatagacagattacaacaacagcatgacataaga 30029933  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    ||||||  ||||| || ||||||||| || ||||||    
T  30029934 atatcatttgcaattc-acaacgtcttaaatattca 30029968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 32307681 - 32307802
Alignment:
Q  16 caacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||    
T  32307681 caacatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaat 32307779  T
Q  114 gcaagtcaacaacgtctcaattat 137  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  32307780 gcaa-tcaacaacatctcaattat 32307802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 6 - 126
Target Start/End: Original strand, 12511051 - 12511172
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | ||||  ||||  |||| || ||||||| |    
T  12511051 acatcattatcaacatcttaatcaacttagaatgactcatgcaacttagttaaataacaatagcagcataggcagattacatcaacaacaagacataaaa 12511150  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||| ||||| ||||||||    
T  12511151 atatcaattgcaattcaacaac 12511172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 15977696 - 15977765
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15977696 atataacaacatcaaataataaccaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttatcaatcatg 15977765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 16097342 - 16097509
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| | ||| || ||| | |||| |||||| ||||||||||| |    
T  16097342 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcaatatgc-aaatcatcatcatataacaatatcgaatgcaagtcatc 16097440  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16097441 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 16097509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 16103794 - 16103960
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  16103794 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacgaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa-tcaac 16103891  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||| |||||| || ||| | ||||||||  ||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  16103892 aacatctcaaata-tcaaacataattcatttaatgtatataaaattatataacattataaacaacatcaa 16103960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 86 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 22147571 - 22147474
Alignment:
Q  86 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||||| ||||| |||||||||||  | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  22147571 aaaacatcatgatataataatatcgcacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 22147474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 45577996 - 45577947
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45577996 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 45577947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 13210447 - 13210333
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||     
T  13210447 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 13210349  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||| ||||||||    
T  13210348 aatgcaaatcaacaac 13210333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 14234488 - 14234602
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  14234488 catcatcatcttaatcaacttagactgattcatgcagcttagttaaataacaagcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 14234586  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||| ||||    
T  14234587 aatgcaagtcatcaac 14234602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 28194697 - 28194752
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28194697 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 28194752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 37251270 - 37251105
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37251270 cttagaccgagtcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 37251172  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||    ||| | |||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  37251171 atctcaa--catcataaataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 37251105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11914051 - 11913980
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11914051 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 11913980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 12174366 - 12174265
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||  ||||    
T  12174366 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaaacaac 12174268  T
Q  124 aac 126  Q
    |||    
T  12174267 aac 12174265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 175
Target Start/End: Original strand, 43925977 - 43926123
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||||| | |||| ||||  |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  43925977 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtacataaaa-cagctcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 43926075  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 175  Q
     ||||||  | ||| ||| |||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  43926076 atctcaaaca-tcatatacaattcatgtaatgcatatacatttatatca 43926123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Original strand, 46822445 - 46822493
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  46822445 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatg 46822493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Original strand, 10557091 - 10557140
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10557091 aatcaacatctcaaaacatcatatatacatataaaacttcatcaatcatg 10557140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 49668183 - 49668091
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  49668183 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 49668091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 9512934 - 9513026
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  9512934 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9513026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 117
Target Start/End: Original strand, 9520909 - 9521001
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  9520909 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 9521001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 73
Target Start/End: Original strand, 14665397 - 14665458
Alignment:
Q  12 tcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  14665397 tcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagcaaca 14665458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Original strand, 13919350 - 13919390
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13919350 tagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 13919390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Original strand, 856143 - 856197
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  856143 catcttaatcatcttatatcgactcatgcaacttagttgaataacaatagcaaca 856197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 16 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 3390053 - 3389999
Alignment:
Q  16 caacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||||||| ||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3390053 caacatcttattcatcttataatgactcatgcaacttagttaaataacaacagca 3389999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Original strand, 14668553 - 14668611
Alignment:
Q  12 tcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  14668553 tcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 14668611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 23077591 - 23077537
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  23077591 catcttaatcatcttatatagactcatgcaacttggttaaataacaacagcaaca 23077537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 16 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 1644790 - 1644733
Alignment:
Q  16 caacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  1644790 caacatcgtcatcaacttagaccaacttatgttgcttagttaaataacaacaacaaca 1644733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 21840766 - 21840999
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21840766 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacatcatgacataataatatcaaat 21840865  T
Q  114 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21840866 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaa 21840965  T
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21840966 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 21840999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 16361908 - 16362150
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  16361908 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcaacacaacagtatataaaaacaacatgacataataa 16362007  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaa 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  16362008 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacaaataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaac 16362107  T
Q  205 atcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16362108 atcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 16362150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23593893 - 23593664
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23593893 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 23593794  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  23593793 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatc 23593694  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  23593693 atatatacatataacacttcattaatcatg 23593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 13988870 - 13989098
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13988870 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 13988969  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13988970 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 13989069  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13989070 tatatacatataacacttcatcaatcatg 13989098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21923449 - 21923221
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923449 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 21923350  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21923349 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 21923250  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21923249 tatatacatataacacttcatcaatcatg 21923221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21475245 - 21475017
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475245 catcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 21475146  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21475145 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 21475046  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21475045 tatatacatataacacttcatcaatcatg 21475017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29776692 - 29776920
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  29776692 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaataacatgacataataatatcaaatgcaag 29776791  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29776792 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 29776891  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29776892 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29776920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29298141 - 29298368
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  29298141 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatga-ataataatatcaaatgcaag 29298239  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29298240 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataataacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 29298339  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29298340 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29298368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 31612317 - 31612545
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31612317 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 31612416  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  31612417 tcaacaacatctcagttattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatca 31612516  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31612517 tatatacatataatacttcatcaatcatg 31612545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22123226 - 22122997
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  22123226 catcttaatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaatagcaaacagcaacacaacagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaaatgcaa 22123127  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||    
T  22123126 gtcaacaatgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatc 22123027  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22123026 atatatacatataacacttcatcaatcatg 22122997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16275522 - 16275293
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16275522 catcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacgacatagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaag 16275423  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||    
T  16275422 tcaatcaacgtctcaattattcacataaaattcaattaatgcatataccattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttgaaacatc 16275323  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16275322 atatatacatataacacttcatcaatcatg 16275293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 162; E-Value: 1e-86
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15860167 - 15859938
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  15860167 catcttaatcaacttggaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatattaaatgcaag 15860068  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc 217  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||  |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  15860067 tcaatcaacgtcttaattactcacaaataattcaatcaatgcacatacaattatatcacaatataacaacatcagatggtaatcaacatcttaagacatc 15859968  T
Q  218 atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15859967 atatatacatataacacttcatcaaccatg 15859938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 13213026 - 13212844
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13213026 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacgcaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaa 13212927  T
Q  113 tgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212926 tgcaagtcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 13212844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 21346965 - 21347141
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21346965 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 21347064  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21347065 tcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 21347141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 21342100 - 21342276
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342100 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaaagacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 21342199  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21342200 tcaatcaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaat 21342276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 21707171 - 21707346
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21707171 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaag 21707270  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21707271 tcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21707346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 21711713 - 21711888
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21711713 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacaatagtatacaaaaaaagcatgacagaataatatcaaatgcaag 21711812  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21711813 tcaacaacgtctcaattattcacatataaatcatgtaatgcctatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 21711888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 45574989 - 45574816
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45574989 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataataccaaatgcaagtcaacaacgtc 45574890  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  45574889 tcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataagaacatcaaatcataatcaa 45574816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 433016 - 433190
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||||| ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  433016 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacg---gcaacacaggcagtatacaaaaacatcaagacataataatatcaaatgcaa 433112  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  433113 gtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataaacaacatcaaat 433190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 40389158 - 40389329
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40389158 catcttaatcaacctagactgactcatgcaacttggttaaataacaacagcgacacatcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 40389257  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 189  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40389258 tcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 40389329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 50210336 - 50210168
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatat 108  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50210336 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatat 50210237  T
Q  109 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  50210236 caaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 50210168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 34509787 - 34509946
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34509787 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataatgatatcaaatgcaa 34509886  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  34509887 gtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 34509946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 27250849 - 27250684
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27250849 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 27250750  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |  |||||||||||    
T  27250749 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcataaaacattatatcaca 27250684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 22532270 - 22532435
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22532270 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaatttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcca 22532369  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22532370 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 22532435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 6 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22468823 - 22468651
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | ||||  ||||| ||||||||||||| |||    
T  22468823 acatcttcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaataacaatagcaacataggcagattacaacaacagcatgacatcata 22468724  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||| |||||||||   |||  |||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22468723 atatcaattgcaattcaacaacatcttaattattcaataatatctcaagtaatgcacataacattatatcaca 22468651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 21896358 - 21896193
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21896358 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21896260  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    |||||  ||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  21896259 ctcaaacattcatatataattcatgtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 21896193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 31 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 21861672 - 21861510
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  21861672 cttagaccgactcatgcagcttagctaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 21861574  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatca 191  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21861573 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatca 21861510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 6 - 175
Target Start/End: Original strand, 20135181 - 20135351
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| || | ||||  ||||| |||| ||||||||||||    
T  20135181 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagttaaacaacaatagcagcataggcagattacaacaacatcatgacataata 20135280  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataa-ttcaagtaatgcatatataattatatca 175  Q
    ||||||  ||||| |||||||| ||| || |||||| ||| || ||||||||||||||| |  |||||||||    
T  20135281 atatcatgtgcaattcaacaacatcttaagtattca-ataaaacttcaagtaatgcatacaacattatatca 20135351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 21026696 - 21026846
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||||| |||  ||||||| ||||| ||||||||    
T  21026696 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaatataggcagtatacaaaatcagcatgacgtaaatatatcaattgcaattcaacaac 21026795  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21026796 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21026846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 35261180 - 35261018
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||   |    
T  35261180 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca---t 35261085  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||||  ||||| | ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  35261084 ctcaaacattcatacataattcaagtaatgcatatacaattacatcacattattaacaacatcaaat 35261018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 6 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 20454680 - 20454613
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20454680 acattatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 20454613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 113
Target Start/End: Complemental strand, 20847274 - 20847173
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  20847274 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtacacaaaatcagcatgacataaatatatcaa 20847175  T
Q  112 at 113  Q
    ||    
T  20847174 at 20847173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 183
Target Start/End: Original strand, 16758664 - 16758822
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||  |||  ||||| |||| |||||||||| |||  |||    
T  16758664 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgcaaac-cagttcatgatataacaatatcaaatacaatacaa 16758762  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||| || |||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16758763 caacatcacaac-attcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataa 16758822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Original strand, 33681022 - 33681188
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||  ||    
T  33681022 tcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcgtca 33681120  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  33681121 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 33681188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 16 - 137
Target Start/End: Original strand, 21754049 - 21754170
Alignment:
Q  16 caacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||||||    
T  21754049 caacatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaat 21754147  T
Q  114 gcaagtcaacaacgtctcaattat 137  Q
    |||| |||||||| ||||||||||    
T  21754148 gcaa-tcaacaacatctcaattat 21754170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 41050138 - 41049973
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||| || ||||||| |||| |   ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  41050138 cttagaccgactcatgcagcttagttactaaacgaacagcaacataggcagtatataaaatagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 41050039  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    ||||||    ||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||| ||||||    
T  41050038 tctcaaca--tcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacgtcaaat 41049973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 32 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 14295652 - 14295493
Alignment:
Q  32 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||   |    
T  14295652 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggtagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa---c 14295557  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||| ||| |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14295556 tcaatta-tcagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 14295493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Original strand, 22237642 - 22237788
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22237642 tcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaaacagcgacataggcattatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22237740  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  22237741 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 22237788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 200 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22050866 - 22050819
Alignment:
Q  200 tcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22050866 tcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 22050819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 28 - 192
Target Start/End: Original strand, 20918620 - 20918782
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| |||| || |||||||    
T  20918620 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaactgcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcgaatgtaaatcaacaa 20918718  T
Q  126 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
       |||||||| ||| |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||    
T  20918719 ---ctcaatta-tcaaacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataagcaacatcaa 20918782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 22921976 - 22921868
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  22921976 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 22921878  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  22921877 aacatctcaa 22921868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 178 - 231
Target Start/End: Original strand, 43543214 - 43543267
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataa 231  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43543214 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataa 43543267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 21714549 - 21714600
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  21714549 catcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 21714600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 52928076 - 52928038
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52928076 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 52928038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 22354616 - 22354527
Alignment:
Q  88 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  22354616 aacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgtatataacattatatcaca 22354527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27161605 - 27161569
Alignment:
Q  211 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27161605 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 27161569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 20248293 - 20248394
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  20248293 atcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaaaaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 20248391  T
Q  124 aac 126  Q
    |||    
T  20248392 aac 20248394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 93 - 190
Target Start/End: Original strand, 50686695 - 50686792
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 190  Q
    ||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  50686695 catgatataacaatgtcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 50686792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 12271642 - 12271725
Alignment:
Q  99 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||| |||| || ||||| | |||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  12271642 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaa-tatttacgtataactaaagtaatatatatacaattatatcacattataa 12271725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16368388 - 16368224
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||| ||||  |  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||     
T  16368388 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaacaattcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaaca 16368290  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    ||||||    ||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  16368289 tctcaaca--tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 16368224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 24783213 - 24783155
Alignment:
Q  12 tcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||||||||||| ||||  | |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  24783213 tcatcatcatcttaatcatcttattcagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 24783155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 38801507 - 38801447
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38801507 catcatcatcttcaacatcttagac-gactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 38801447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 21533989 - 21533948
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtta 57  Q
    ||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||    
T  21533989 atcaacatctta--catcttagaccgactcatgcagcttagtta 21533948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 7)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 17 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17600 - 17370
Alignment:
Q  17 aacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17600 aacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 17501  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17500 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacagtataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacat 17401  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17400 catatatacatatgacacttcatcaatcatg 17370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 94415 - 94643
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  94415 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 94514  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  94515 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 94614  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  94615 tatatacatataacacttcatcaatcatg 94643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 174
Target Start/End: Original strand, 44458 - 44614
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44458 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 44557  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatc 174  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  44558 gtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatagaattatatc 44614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 100388 - 100534
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  100388 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataataatatcgaatgcaaatcaac 100486  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||| ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  100487 aacatctcaaatattaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 100534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 119876 - 119937
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  119876 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 119937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 40281 - 40135
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||||  | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  40281 atcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtaggc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 40183  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  40182 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 40135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #7
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Original strand, 101513 - 101552
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  101513 atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaa 101552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0716 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 1)
Name: scaffold0716
Description:

Target: scaffold0716; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 4698 - 4926
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4698 catcctaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 4797  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  4798 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacaaca 4897  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4898 tatatacatataacacttcatcaatcatg 4926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 211; Significance: 1e-116; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 11279 - 11521
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11279 acattatcatcaacatcttaatcaaattagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 11378  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  11379 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatatgattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaaaatcaaatggtaatcaaca 11478  T
Q  206 tcttaaaacatc-atatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11479 tcttaaaacatcaatatatacatataacacttcatcaatcatg 11521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0363 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 14 - 247
Target Start/End: Original strand, 9241 - 9474
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9241 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaat 9340  T
Q  114 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaa 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9341 gcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataatttaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaa 9440  T
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9441 catcaaatatacatataacacttcatcaatcatg 9474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 6 - 247
Target Start/End: Original strand, 501075 - 501316
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  501075 acataatcaacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcaatatacaaaaacaacatgacataataa 501174  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  501175 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatagtaatcaaca 501274  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  501275 tcttaaaacattatatatacatataacacatcatcaatcatg 501316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 85738 - 85562
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85738 catcttaatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 85639  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  85638 tcaatcaacgtctgaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 85562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 160698 - 160864
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  160698 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaac 160795  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||| | |||| || ||| | |||| ||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  160796 aacatgtcaaata-tcaaacataagtcatgtaatatatatacaattatataacattataaacaacatcaa 160864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 20751 - 20979
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20751 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20850  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20851 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20950  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20951 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 37825 - 38053
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37825 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 37924  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  37925 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 38024  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  38025 tatatacatataacacttcatcaatcatg 38053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 87)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 456325 - 456553
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  456325 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 456424  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  456425 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 456524  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  456525 tatatacatataacacttcatcaatcatg 456553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11393445 - 11393217
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393445 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 11393346  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  11393345 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 11393246  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11393245 tatatacatataacacttcatcaatcatg 11393217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15376871 - 15376643
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376871 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 15376772  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  15376771 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 15376672  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15376671 tatatacatataacacttcatcaatcatg 15376643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 16232524 - 16232752
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232524 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16232623  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16232624 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 16232723  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16232724 tatatacatataacacttcatcaatcatg 16232752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20385281 - 20385053
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385281 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20385182  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20385181 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20385082  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20385081 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20385053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 21189753 - 21189525
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189753 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 21189654  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  21189653 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 21189554  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  21189553 tatatacatataacacttcatcaatcatg 21189525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 32125495 - 32125723
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125495 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 32125594  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  32125595 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 32125694  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32125695 tatatacatataacacttcatcaatcatg 32125723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 41522921 - 41523149
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41522921 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 41523020  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  41523021 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 41523120  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41523121 tatatacatataacacttcatcaatcatg 41523149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 41525383 - 41525611
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525383 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 41525482  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  41525483 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 41525582  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41525583 tatatacatataacacttcatcaatcatg 41525611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 11972500 - 11972728
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11972500 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 11972599  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  11972600 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaatatcttaaaacatca 11972699  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11972700 tatatacatgtaacacttcatcaatcatg 11972728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14949280 - 14949052
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949280 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 14949181  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14949180 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 14949081  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14949080 tatatacatataacacttcatcaatcatg 14949052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 18640276 - 18640504
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640276 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18640375  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  18640376 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacataaaataataatcaacatcttaaaacatca 18640475  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18640476 tatatacatataacacttcatcaatcatg 18640504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 24702242 - 24702470
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24702242 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 24702341  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24702342 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24702441  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24702442 tatatacatataacacttcatcaatcatg 24702470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 27216864 - 27217092
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27216864 catcttaatcaacttagaccaactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 27216963  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  27216964 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 27217063  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27217064 tatatacatataacacttcatcaatcatg 27217092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 16213688 - 16213916
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  16213688 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatccaag 16213787  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||||||    
T  16213788 tcaacaacgtcttaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaacataacaacatcaaatggtaatcaacatatgaaaacatca 16213887  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213888 tatatacatataacacttcatcaatcatg 16213916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 16410063 - 16410291
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410063 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 16410162  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  16410163 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcatagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 16410262  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16410263 tatatacatataacacttcatcaatcatg 16410291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 13 - 247
Target Start/End: Original strand, 18430710 - 18430944
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18430710 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatataaaaacatcatgacataataatatcaaa 18430809  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaa 212  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||    
T  18430810 tgcaagtcaacaacatctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaa 18430909  T
Q  213 acatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18430910 acatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 18430944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 24704692 - 24704917
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||    
T  24704692 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaa---gacataataatatcaaatgcaag 24704788  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  24704789 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 24704888  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24704889 tatatacatataacacttcatcaatcatg 24704917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 4e-87
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 13869350 - 13869580
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13869350 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 13869449  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||| | |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  13869450 tcaatcaacgtctcaattattcaaagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacat 13869549  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13869550 catatatacatataaaacttcatcaatcatg 13869580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 44116513 - 44116688
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  44116513 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 44116612  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44116613 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 44116688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 193
Target Start/End: Original strand, 3386337 - 3386511
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3386337 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacagcatgacatgataatatcaaatgcaag 3386436  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaa 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  3386437 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatacatatacaattatatcacaatataacatcatcaaa 3386511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 6 - 164
Target Start/End: Original strand, 24275162 - 24275320
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275162 acataatcaacaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 24275261  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24275262 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatata 24275320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 31 - 203
Target Start/End: Original strand, 13647344 - 13647517
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 129  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13647344 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatgcaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtc 13647443  T
Q  130 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  13647444 tcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 13647517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 17062073 - 17061898
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  17062073 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatcagcaactcagcagtatacaaaat-agcatgacataataatatcaaatgcaa 17061975  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17061974 gtcagcaacgtctcaattattaacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 17061898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26356152 - 26355915
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-----------gtatacaaaaacagcatgacataataata 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||           ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26356152 catcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataata 26356053  T
Q  108 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  26356052 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatc 26355953  T
Q  208 ttaaaacatcata--tatacatataacacttcatcaat 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26355952 ttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaat 26355915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 19 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 26358604 - 26358367
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagca-----------gtatacaaaaacagcatgacataataata 107  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||| ||           ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26358604 catcttaatcaatttagactgactcatgcagcaaagttaaataacaacaacaacacaacataaacacaacagtatacaaaaacagcataacataataata 26358505  T
Q  108 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatc 207  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||    
T  26358504 tcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacattaaataataatcaacatc 26358405  T
Q  208 ttaaaacatcata--tatacatataacacttcatcaat 243  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  26358404 ttaaaacatcatatatatacatataacacttcatcaat 26358367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 131; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Original strand, 20110560 - 20110723
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20110560 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagc----------tatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20110649  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 192  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20110650 tcaataacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 20110723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38898535 - 38898359
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898535 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 38898436  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  38898435 tcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacagtataacaacgtcaaat 38898359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 12756817 - 12756654
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12756817 cttagaccgactcgagcagtttagttaaataacaacagcaacacaacaatatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtaaacaacgtct 12756718  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12756717 caattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 12756654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 101; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 19 - 134
Target Start/End: Original strand, 48273396 - 48273512
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48273396 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 48273495  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaat 134  Q
    ||||||||| |||||||    
T  48273496 gtcaacaacatctcaat 48273512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3564478 - 3564319
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  3564478 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgtaa 3564379  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||||||||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||| ||||||    
T  3564378 gtcaacaacatctcaattatacattcataattcaagtaatgcgtataacattagatcaca 3564319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 141
Target Start/End: Original strand, 13831377 - 13831499
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  13831377 catcttaatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacacggtagtatacaaaaacaacatgacataataatataaaatgcaag 13831476  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcac 141  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  13831477 tcaacaacgtctcaattattcac 13831499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 108 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15082019 - 15081877
Alignment:
Q  108 tcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaat 206  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||    
T  15082019 tcaaatgcaagtcaatcaatgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaacat 15081920  T
Q  207 c--ttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15081919 caacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 15081877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 92; E-Value: 8e-45
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 18456526 - 18456368
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  18456526 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgatagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaa 18456428  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  18456427 gtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 18456368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 12698832 - 12698998
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12698832 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataataatatca 12698931  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  12698932 attgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 12698998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 38227482 - 38227646
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38227482 catcatcatcttcatctacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 38227580  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||| |||||||||||    
T  38227581 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaattaatgtacatatcattatatcaca 38227646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 9509190 - 9509355
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9509190 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagtaacataggcagtatacaataacagcatgacataataatatcaa 9509289  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  | |||||||||    
T  9509290 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacactatatcaca 9509355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2280225 - 2280056
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  2280225 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataataatatcaaatgcaaatcaaca 2280127  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  2280126 acatctcaaatattcatatataattcaaataatacatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 2280056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 183
Target Start/End: Original strand, 26212012 - 26212168
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26212012 caacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 26212111  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  26212112 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 26212168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 160 - 247
Target Start/End: Original strand, 13841157 - 13841244
Alignment:
Q  160 atatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13841157 atatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 13841244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15144143 - 15143993
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||| ||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  15144143 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatctcagtatgcaataacagcaagatatcataatatcaaatgcaagccaacaac 15144044  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||| ||| ||   |||||| ||||||||| ||||  || ||||||||    
T  15144043 atctcaagtatacattcataatttaagtaatgcgtataacatcatatcaca 15143993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 28 - 126
Target Start/End: Original strand, 10589055 - 10589154
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||    
T  10589055 caacttagatcgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatatgcagtatacaaaaacaacatgacataatcatatcaattgcaattcaacaac 10589154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 66; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 177 - 246
Target Start/End: Original strand, 11303409 - 11303478
Alignment:
Q  177 aatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11303409 aatataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 11303478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 245
Target Start/End: Original strand, 18627717 - 18627796
Alignment:
Q  166 aattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatca 245  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18627717 aattatatcacaatataacaagatcaaatactaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatca 18627796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 16108688 - 16108620
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16108688 atataacaacatcaaacggtaatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 16108620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 19486864 - 19486681
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||||||||||     
T  19486864 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacataggcagtatgc-aaaacatcatgatataataatatcg 19486766  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  19486765 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagttatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 19486681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 134
Target Start/End: Original strand, 67746 - 67868
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  67746 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 67844  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaat 134  Q
    ||||||| |||||||| |||||||    
T  67845 aatgcaaatcaacaacatctcaat 67868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 133
Target Start/End: Original strand, 22072914 - 22073036
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||| ||| ||||| |||||||| |||| |||||||    
T  22072914 catcatcatcttaatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcactatgcaaaaccagcatgatataacaatatca 22073013  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaa 133  Q
    |||| ||||||||||| ||||||    
T  22073014 aatgtaagtcaacaacatctcaa 22073036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 14270061 - 14269992
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14270061 atataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 14269992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 8468803 - 8468872
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8468803 atataacaacatcaaataataatcaacatcataaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 8468872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 23664952 - 23664884
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  23664952 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacctttcatcaatcat 23664884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 12255892 - 12255730
Alignment:
Q  34 agaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||   |  ||||| |||| ||||||||||| || || ||||| |||    
T  12255892 agacagactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacatagtcagtatgcaaatcaattcatgatataacaatatcaaatgaaattctacaacatct 12255793  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    |||  ||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  12255792 caaacattcatatataattcaagtaatacatatacaattatatcacattataaacaacatcaa 12255730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 16495403 - 16495581
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  || ||||| |||||||||||     
T  16495403 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcg 16495501  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| || ||||||||   |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  16495502 aatgtaaatcaacaac---tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 16495581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 16386368 - 16386268
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||| | ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||    
T  16386368 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacgacataggcagtatacaaaatcagcatgacataaatatatca 16386269  T
Q  111 a 111  Q
    |    
T  16386268 a 16386268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 47831808 - 47831860
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47831808 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 47831860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 29796771 - 29796841
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc--atatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29796771 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcat 29796841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 29800590 - 29800660
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatc--atatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  29800590 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatatacatataacccttcatcaatcat 29800660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 34200787 - 34200901
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||     
T  34200787 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 34200885  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| || ||||||||    
T  34200886 aatgtaaatcaacaac 34200901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 14 - 162
Target Start/End: Original strand, 40443393 - 40443541
Alignment:
Q  14 atcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    |||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  40443393 atcatcatcttcaacatcttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacatacgcagtaaac--aaacagcatgacataataatatcaa 40443490  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     | ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  40443491 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 40443541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 18005660 - 18005806
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||   ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  18005660 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataagcagtat-ggaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 18005758  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  18005759 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 18005806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1868101 - 1867932
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||  |||||||  ||||| |||| |||||| ||||||| | ||    
T  1868101 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaactaacaacaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacaatatc-aatgcaaatgaa 1868004  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  1868003 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 1867932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Original strand, 16056343 - 16056488
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| || || ||| |  ||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  16056343 tcaacttagaccgactgatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacattatgc--aaacaacatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca 16056440  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16056441 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16056488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 8940335 - 8940406
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8940335 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 8940406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10063938 - 10063760
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||| ||| | | |||||||| |||||||||| ||||||||| |||||| |||||||| || | |||| || || || ||||| |||||||||||     
T  10063938 catcaacaccttcaacgacttagactgactcatgcaacttagttaattaacaatcagcaacataggcggtatgcacaa-catcatgatataataatatcg 10063840  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    ||  ||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||      |||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  10063839 aacacaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaa-----acatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 10063760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 15113031 - 15113114
Alignment:
Q  99 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15113031 ataacaatatcaaatgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15113114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38898229 - 38898158
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38898229 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 38898158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 28505418 - 28505321
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatc 109  Q
    ||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||    
T  28505418 catcatcatcttcatcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatc 28505321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 26 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 811238 - 811142
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtca 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||||||    
T  811238 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtca 811142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 99 - 183
Target Start/End: Original strand, 15116568 - 15116651
Alignment:
Q  99 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    |||| |||||||| ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||||||| |||||    
T  15116568 ataacaatatcaattgcaagtcatcaacatctcaat-attcacatataactcaagtaatatatatacaattatatcacattataa 15116651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 16219823 - 16219677
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  16219823 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 16219725  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    || ||| ||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  16219724 acatcttaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 16219677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 124
Target Start/End: Original strand, 44014192 - 44014291
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  44014192 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 44014290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 14932848 - 14932749
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14932848 catcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 14932749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15356283 - 15356184
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15356283 catcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 15356184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 15360397 - 15360298
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  15360397 catcttaatcaacttagactgactcatgcgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaacaatagcatgacataataatatcaattgcaa 15360298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20220290 - 20220127
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||  ||||| || ||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||      
T  20220290 cttagaccgactcatacagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaaca-- 20220194  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||    
T  20220193 -tctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacaattatatcacattattaacaacatcaaat 20220127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 18154955 - 18154901
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||    
T  18154955 catcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaaca 18154901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 15008597 - 15008436
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagc-agtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||  |||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| ||||||||  ||    
T  15008597 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacacct 15008500  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||  || || ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  15008499 caaacat-catatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 15008436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15755007 - 15754955
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15755007 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaa 15754955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 6 - 110
Target Start/End: Original strand, 15211450 - 15211557
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtat-acaaaaacagcatgacataa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| ||||||||||    
T  15211450 acatcaacatcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataa 15211549  T
Q  103 taatatca 110  Q
     |||||||    
T  15211550 caatatca 15211557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 27847950 - 27847838
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||| | ||||| |||   ||||| |||||||||| ||||||    
T  27847950 catcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataataaacagcaacataggcagtgtac---aacagtatgacataattatatca 27847854  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  27847853 aattcaattcatcaac 27847838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 198 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 45847739 - 45847691
Alignment:
Q  198 aatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  45847739 aatcaacatcttaaa-catcatatatacatataaaacttcatcaatcatg 45847691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 11996147 - 11996095
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  11996147 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcatcttagttaattaacaa 11996095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Original strand, 14044761 - 14044792
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14044761 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14044792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Original strand, 14354791 - 14354822
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14354791 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 14354822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 6 - 37
Target Start/End: Original strand, 16213622 - 16213653
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagac 37  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213622 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagac 16213653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 70
Target Start/End: Complemental strand, 2832562 - 2832504
Alignment:
Q  12 tcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  2832562 tcatcatcatcttaatcatcttatatagactcatgcaacttagttaaataacaatagca 2832504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Original strand, 12901338 - 12901431
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | ||||||||||||| |   ||||| |||| ||||||||||||||    
T  12901338 tcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatacaaaataattcatgatataacaatatcaaatgcaa 12901431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 66)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 264926 - 264698
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  264926 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 264827  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  264826 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 264727  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  264726 tatatacatataacacttcatcaatcatg 264698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 39363388 - 39363616
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363388 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 39363487  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39363488 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 39363587  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39363588 tatatacatataacacttcatcaatcatg 39363616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10733098 - 10732870
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10733098 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 10732999  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  10732998 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaccgtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 10732899  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10732898 tatatacatataacacttcatcaatcatg 10732870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 20909016 - 20909244
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909016 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaaagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 20909115  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20909116 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20909215  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20909216 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20909244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29345984 - 29346212
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29345984 catcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 29346083  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29346084 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 29346183  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29346184 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29346212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 42245523 - 42245295
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245523 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 42245424  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  42245423 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 42245324  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  42245323 tatatacatataacacttcatcaatcatg 42245295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29348457 - 29348685
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348457 catcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 29348556  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29348557 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 29348656  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29348657 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29348685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29350930 - 29351158
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29350930 catcttaatcaacttagaccgactcatacagcttagttaaataagaacagcatcacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 29351029  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  29351030 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 29351129  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29351130 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29351158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 39245140 - 39245368
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245140 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 39245239  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  39245240 tcaataacgtcccaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 39245339  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39245340 tatatacatataacacttcatcaatcatg 39245368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 29329938 - 29330163
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  29329938 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 29330037  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||   ||||||||||||||    
T  29330038 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatc---atcttaaaacatca 29330134  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29330135 tatatacatataacacttcatcaatcatg 29330163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 32027397 - 32027625
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  32027397 catcttaatcaacttagaccgactcatacaacttagttaaataacaacaacaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatccaag 32027496  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  32027497 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 32027596  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  32027597 tatatacatataacacttcatcaatcatg 32027625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20918106 - 20917882
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    ||    
T  20918106 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacaaaataatataaaa----ag 20918011  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  20918010 tcaacaacgtctcaattattcacatctaattcaagtaaagcatatataattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 20917911  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20917910 tatatacatataacacttcatcaatcatg 20917882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 159; E-Value: 9e-85
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 38619438 - 38619668
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38619438 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 38619537  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  38619538 tcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatattccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacat 38619637  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  38619638 catatatacatataaaacttcatcaatcatg 38619668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 23064515 - 23064745
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23064515 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacgacacagtagtatacaaaaacagcatgacctaataatatcaaatgcaag 23064614  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacat 216  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||  || | ||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23064615 tcaatcaacgtctcaattattcacagataatctaattgatgcatatacaattatatcccaatataaacaacatcaaatgataatcaacatcttaaaacat 23064714  T
Q  217 catatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23064715 aatatatacatataaaacttcatcaatcatg 23064745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 36154938 - 36154766
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36154938 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaca---acacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 36154842  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36154841 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 36154766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 11581357 - 11581184
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11581357 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 11581258  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 192  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  11581257 tcaataacgtctcaattattcacgtataattcaagtaatgtatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 11581184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20902168 - 20901991
Alignment:
Q  19 catcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20902168 catcttaattcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgcaa 20902069  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20902068 gtcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 20901991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2154772 - 2154596
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2154772 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaactgcaag 2154673  T
Q  119 tcaacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154672 tcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2154596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18319192 - 18319021
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18319192 catcttaatcaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 18319093  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 189  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18319092 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 18319021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 10775834 - 10775659
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10775834 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacgacagcgacacagcagtatataaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaag 10775735  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10775734 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 10775659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 31061072 - 31061248
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061072 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaaacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 31061171  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  31061172 tcaatcaacgtatcaattattcacaaataatttaattaatgcatataaaattatatcacaatataacaacatcaaat 31061248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 128; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 19 - 189
Target Start/End: Original strand, 24067111 - 24067282
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24067111 catcttaatcaacttagaccgaccaatgcagcttggttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 24067210  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacat 189  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24067211 tcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacat 24067282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 1096468 - 1096633
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  1096468 catcaacatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggtagtatgcaaaaacaacataacataataatatcaa 1096567  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| |||||||| |||||  ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  1096568 atgcaaatcaacaacatctcacatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 1096633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 9077953 - 9078118
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9077953 catcatcatcttcatcaacttagactgacccatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 9078052  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||||| |||||||||| ||   |||| ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  9078053 gtgcaagtcaacaacatctcaattatacattcataactcaagtaatgcgtataacattatatcaca 9078118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 23390616 - 23390451
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23390616 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 23390517  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  23390516 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23390451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 25421533 - 25421698
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25421533 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 25421632  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25421633 ttgcaagtcaacagcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25421698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 24529227 - 24529386
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24529227 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataatgatatcaaatgcaa 24529326  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| ||| |||||| ||   |||  ||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  24529327 gtcaacaacatcttaattatacattcatatctcaagtaatgcttataacattatatcaca 24529386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21729184 - 21729019
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21729184 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21729085  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21729084 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaatattatatcaca 21729019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 21808509 - 21808344
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21808509 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 21808410  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21808409 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 21808344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 24493570 - 24493734
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24493570 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaagtaacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 24493668  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||| ||||| |||  |||||||||||    
T  24493669 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtgatgcacataacattatatcaca 24493734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 21997654 - 21997547
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21997654 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 21997555  T
Q  112 atgcaagt 119  Q
    ||||||||    
T  21997554 atgcaagt 21997547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 8286963 - 8286797
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatac-aaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8286963 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaacagcatgacataataatatca 8286864  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | ||||| ||| |||| ||| || || ||| | ||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  8286863 attgcaattcatcaacatcttaaataatcaaacattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 8286797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 32 - 177
Target Start/End: Original strand, 25431414 - 25431560
Alignment:
Q  32 ttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  25431414 ttagaccgactcatgcatcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaagtcaacaacatct 25431513  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     || | ||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  25431514 taaatgttcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 25431560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 22412191 - 22412329
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22412191 catcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacgataacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaa 22412289  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  22412290 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 22412329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 13025312 - 13025476
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  13025312 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaa 13025410  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13025411 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13025476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 13095496 - 13095660
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||| | |||||||    
T  13095496 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcatagttaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacagcatgacatattgatatcaa 13095594  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||    
T  13095595 atgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaaataatgtacataacattatatcaca 13095660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 177
Target Start/End: Original strand, 22075035 - 22075185
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  22075035 caacttagaccgactcattcagcttagttaaataacaacagcaacataggaagtatacaaaatcaacatgacataataatatcaattgcaattcaacaac 22075134  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  22075135 atcttaaatattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 22075185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Original strand, 22144068 - 22144215
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | | ||||| | |||||| ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |    
T  22144068 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacagacatcaacataggtagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaattgcaaatcaacaacat 22144166  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22144167 ctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcaca 22144215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 40725854 - 40726037
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||||||||  |||  | |||||||  || |||||| ||||  || ||||| |||||||||||     
T  40725854 catcaacatcttcaacgacttggaccgactcatgcagcttagttagttaatgatcagcaacgtaggcagtatgcaaag-catcatgatataataatatcg 40725952  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  40725953 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 40726037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Original strand, 21565556 - 21565723
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  21565556 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaatagcaacataggcagtat-ccaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 21565654  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||| | |||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21565655 aacatttcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 21565723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 15 - 160
Target Start/End: Original strand, 37723906 - 37724050
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    |||||||||| | || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||||   ||||||||||||| || ||||||||    
T  37723906 tcaacatcttcaacatcttagactgactcatgcagcttagttaaataacagacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacatgattatatcaaa 37724002  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
    |  || ||| |||| ||||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  37724003 ttaaattcatcaacatctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 37724050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 9776521 - 9776589
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9776521 atataacaacatcaaatggtaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacccttcaccaatcat 9776589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 6 - 140
Target Start/End: Complemental strand, 17517328 - 17517193
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataata 104  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||| |||| || | ||||  ||||  ||||||| ||||||| |    
T  17517328 acatcattatcaacatcttaatcaacttagactgactcatgcaacttagtttaataacaatagcagcataggcagattacatcaacagcaagacataaaa 17517229  T
Q  105 atatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattca 140  Q
    |||||||  |||| |||||||| ||| || ||||||    
T  17517228 atatcaatcgcaattcaacaacatcttaaatattca 17517193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 70 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 20766181 - 20766095
Alignment:
Q  70 aacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  20766181 aacacaacagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 20766095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 21329617 - 21329556
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21329617 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 21329556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 20027043 - 20026945
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||  ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20027043 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtat-ccaaaacagttcatgatataataatatcaaatgcaattcaacaac 20026945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 21293089 - 21292992
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  21293089 catcatcatcttcaacatcttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacagtatgacataataatatcaa 21292992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 21502276 - 21502167
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||   ||| |||||||| |||| ||||||     
T  21502276 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtat-gtaaatcagcatgatataacaatatcg 21502178  T
Q  111 aatgcaagtca 121  Q
    |||||||||||    
T  21502177 aatgcaagtca 21502167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Complemental strand, 37804902 - 37804834
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||  |||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  37804902 atataacaacatcaaattctaattaacatcttaaaacatcatatatacatataacgcttcattaatcat 37804834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 22 - 110
Target Start/End: Original strand, 18418590 - 18418678
Alignment:
Q  22 cttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagtt-aaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  18418590 cttaatcaacttagactgactcgtgcaacttagttaaaataacaacatcaacataggcagtatac--aaacagcatgacataataatatca 18418678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 19 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 20806900 - 20806845
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 74  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  20806900 catcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttaattaaataacaacagcgacac 20806845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 22959639 - 22959538
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  22959639 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 22959541  T
Q  124 aac 126  Q
    |||    
T  22959540 aac 22959538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 19660955 - 19660894
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19660955 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 19660894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 22178323 - 22178161
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||||||||| ||||||||    
T  22178323 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatcaaatgcaaatcaacaac 22178225  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatc 190  Q
     ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||    
T  22178224 atctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatc 22178161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 199 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 17517142 - 17517094
Alignment:
Q  199 atcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17517142 atcaacatcttaaaacatcatacatacatataacacttcatcaatcatg 17517094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 26012141 - 26011995
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||  | ||||||    
T  26012141 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaagcaacatgatataacaatatcaaatgtgaatcaaca 26012043  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    || ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  26012042 acatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 26011995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 36314578 - 36314639
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36314578 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaaca 36314639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 26704078 - 26704129
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26704078 catcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26704129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 26973811 - 26973862
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  26973811 catcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 26973862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26740747 - 26740705
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26740747 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26740705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 2154595 - 2154562
Alignment:
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2154595 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 2154562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20901990 - 20901957
Alignment:
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20901990 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 20901957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 26732937 - 26732892
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  26732937 caacatagaccgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 26732892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 19668899 - 19668951
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19668899 catcatcatcatcatcaacttagaccgactcttgcagctcagttaaataacaa 19668951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 39 - 111
Target Start/End: Original strand, 21873277 - 21873350
Alignment:
Q  39 gactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| |||| || | |||| |||||| | ||||||||| | ||||||||||    
T  21873277 gactcatgcaacttagttaaataacaaaagcagcataggcaggatacaacatcagcatgacttcataatatcaa 21873350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 87 - 183
Target Start/End: Original strand, 18356389 - 18356485
Alignment:
Q  87 aaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||| |||  | |||||| ||||   | |||||||||||| |  ||||||||||| |||||    
T  18356389 aaacagcatgatataataatatcaatttcaattcaacaacatcttgaatattcaaatatttcttaagtaatgcataaaacattatatcacattataa 18356485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0494 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0494
Description:

Target: scaffold0494; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 6 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 12420 - 12194
Alignment:
Q  6 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataa 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12420 acatcatcatcaacatcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagaatacaaaaacagcatgacaaaataa 12321  T
Q  106 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaa 205  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12320 tatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatttaattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaca 12221  T
Q  206 tcttaaaacatcatatatacatataac 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  12220 tcttaaaacatcatatatacatataac 12194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0230 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0230
Description:

Target: scaffold0230; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 13951 - 14179
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13951 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagataaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 14050  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  14051 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 14150  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14151 tatatacatataacacttcatcaatcatg 14179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 7)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 136684 - 136912
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  136684 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 136783  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  136784 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 136883  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  136884 tatatacatataacacttcatcaatcatg 136912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 139153 - 139381
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  139153 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 139252  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  139253 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 139352  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  139353 tatatacatataacacttcatcaatcatg 139381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 144091 - 144319
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  144091 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 144190  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  144191 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 144290  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  144291 tatatacatataacacttcatcaatcatg 144319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 134215 - 134443
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  134215 catcttaatcaacatagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 134314  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  134315 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 134414  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  134415 tatatacatataacacttcatcaatcatg 134443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 141622 - 141850
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  141622 catcttaatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaatacagcatgacataataatatcaaatgcaag 141721  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  141722 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 141821  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  141822 tatatacatataacacttcatcaatcatg 141850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 137
Target Start/End: Original strand, 132672 - 132784
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||| ||||| || ||||| | || |||||| |||| || ||| |    
T  132672 atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacagcaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatacaacaatatcgaatgtaa-tcatc 132770  T
Q  124 aacgtctcaattat 137  Q
    ||||||||||||||    
T  132771 aacgtctcaattat 132784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #7
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 116
Target Start/End: Original strand, 62216 - 62303
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | |||||||  ||||||| ||||  ||||||||||| ||||||    
T  62216 acttaaaccgactcatgcagcttagttaaacaacaaacagcaacataggcagtat-gaaaaacatcatggtataataatatcgaatgca 62303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0444 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0444
Description:

Target: scaffold0444; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 13396 - 13624
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13396 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 13495  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||    
T  13496 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattacatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatca 13595  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13596 tatatacatgtaacacttcatcaatcatg 13624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Original strand, 40404 - 40632
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40404 catcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacaggatgacataataatatcaaatgcaag 40503  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatca 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||    
T  40504 tcaacaacgtctcaattattcacataaaattcaagtaatgcatatacaattatatcacagtataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacttca 40603  T
Q  219 tatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40604 tatatacatataacacttcatcaatcatg 40632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 158608 - 158433
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  158608 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 158509  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  158508 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 158433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 340053 - 339905
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  340053 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-acaacaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaaat-caagtcaacaa 339957  T
Q  126 cgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | |||||| ||| ||   |||||||||||||||  ||||  |||||||||||    
T  339956 catctcaagtatacattcataattcaagtaatgtgtataacattatatcaca 339905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 165; Significance: 2e-88; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 82076 - 82260
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  82076 catcttaatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaaa 82175  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  82176 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 82260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 22776 - 22610
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  22776 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcgacatagacagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 22678  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  22677 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 22610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1439 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold1439
Description:

Target: scaffold1439; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 110 - 294
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     
T  110 catcttaatcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaatagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaaa 209  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  210 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0142 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0142
Description:

Target: scaffold0142; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 16788 - 16963
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16788 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaag 16887  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16888 tcaacaacgtctcaattatttacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacatcatcaaat 16963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 4301 - 4476
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||     
T  4301 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaattgcaaa 4400  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4401 tcaacaacgtctcaattaatcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacatcatcaaat 4476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145 (Bit Score: 149; Significance: 8e-79; HSPs: 4)
Name: scaffold0145
Description:

Target: scaffold0145; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 8e-79
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 9753 - 9929
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  9753 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagaatgacataataatatcaagtgcaag 9852  T
Q  119 tcaacaacgtctcaatta-ttcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9853 tcaacaacgtctcaattatttcacatataattcaaataatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 9929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 32943 - 33107
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32943 catcatcatcttcatcaagttagaccgactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 33041  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  33042 atgcaagttaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 33107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #3
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 38762 - 38926
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  38762 catcatcatcttcatcaacttagaccgagtcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaa 38860  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| | |||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  38861 atgcaaataaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 38926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0145; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 216 - 247
Target Start/End: Original strand, 9932 - 9963
Alignment:
Q  216 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9932 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 9963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0394 (Bit Score: 146; Significance: 5e-77; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Original strand, 12068 - 12246
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12068 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaa------cagcaacacagcagtatactaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 12161  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12162 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 12246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 142; Significance: 1e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 29 - 194
Target Start/End: Original strand, 29946 - 30111
Alignment:
Q  29 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  29946 aacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaagtgtaagtcaacaacgt 30045  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  30046 ctcaattattcacatataattcaaataattcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 30111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 214 - 247
Target Start/End: Original strand, 30112 - 30145
Alignment:
Q  214 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30112 catcatatatacatataacacttcatcaatcatg 30145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 79430 - 79267
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  79430 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacgacagtatataaaaacagcatgacataataatttcaaatgcaagtcaacaacgtct 79331  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  79330 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaagtatatcacaatataacaacatcaaat 79267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 17340 - 17170
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatac--aaaaacagcatgacataataat 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  17340 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaaaacagcatgacataataat 17241  T
Q  107 atcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  17240 atcaaatgcaagtcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 17170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 1439 - 1254
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1439 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaacaataacacatgagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 1340  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaa 203  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  1339 tcaatcatcgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaatcataatcaa 1254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0819 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0819
Description:

Target: scaffold0819; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Original strand, 4218 - 4393
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4218 catcttaatcaacttagaccgactcatgcaacttagttaaataacgacagcgacacagcagtatacaaaaccagcatgacataataatatcaaatgcaag 4317  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4318 tcaatcaacgtctcaattattcacatataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatat-acaacatcaaat 4393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 136; Significance: 5e-71; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 20524 - 20363
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20524 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacatcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 20426  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20425 caattattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacaatataa-aacatcaaat 20363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 128752 - 128916
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaa 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||| ||||||| |  |  | | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  128752 catcatcatcttaatcaaattagaccaactcatgcaacttagttaaataacaaaagcaacaaaaaaaaaaaaaaaaacagcatgacataataatatcaaa 128851  T
Q  113 tgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||    
T  128852 tgcaagtcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgtacataacattatatcaca 128916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 23 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 2283 - 2111
Alignment:
Q  23 ttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2283 ttaatcaacttagaccgactcttgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaaatgcaagtcaa 2184  T
Q  123 -caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
      ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2183 ttaacgtctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaaat 2111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17964
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||| || || || ||||| |||||||||||     
T  18147 catcaacatcttcaacgacttagactgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacatatgcattatgcacaa-catcatgatataataatatcg 18049  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    || |||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  18048 aacgcaagtaaacaacatctcaaatattcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 17964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 132; Significance: 1e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 38816 - 38586
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||    
T  38816 catcttaatcaacttagacctactcatgcaccttagttaaataacaaacagcaacatagacagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgca 38718  T
Q  117 agtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaaca 215  Q
    ||||| |||  |||||| |||| | |||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  38717 agtcatcaatatctcaaatatttatatataattcaagtattgcgtatacaattatatcacaatataaacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaca 38618  T
Q  216 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38617 tcatatatacatataacacttcatcaatcatg 38586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 129; Significance: 7e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 19 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 161248 - 161072
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  161248 catcttaaccaacttagaccgactcatgcagcttagttaaatatcaacagcgacacagcagtatacaaaaacataatgacataataatatcaaatgcaag 161149  T
Q  119 tcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  161148 tcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaatatcaaat 161072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 94 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 164674 - 164573
Alignment:
Q  94 atgacataataatatcaaatgcaagtcaa-caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaa 192  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  164674 atgacataataatatcaaatgcaagtcaatcaacatctcaattattcacaaataattcaattaatgcatatacaattatatcacaatataacaacatcaa 164575  T
Q  193 at 194  Q
    ||    
T  164574 at 164573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0231 (Bit Score: 119; Significance: 6e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0231
Description:

Target: scaffold0231; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Original strand, 22890 - 23048
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22890 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaccagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 22989  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  22990 tcaacaacatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 23048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 104; Significance: 6e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 44821 - 44682
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44821 catcttaatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 44722  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    ||||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  44721 gtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 44682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 19 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 26179 - 26020
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26179 catcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgtaa 26080  T
Q  118 gtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||||||||||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  26079 ttcaacaacgtctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 26020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 102; Significance: 9e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3270 - 3106
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  3270 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaa-caacatgacataataatatcaa 3172  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  3171 atgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 3106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 100; Significance: 1e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 183
Target Start/End: Original strand, 51914 - 52085
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51914 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcaatatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 52013  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa 183  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  52014 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataa 52085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 168098 - 167948
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  168098 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 167999  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  167998 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 167948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0217 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 16720 - 16555
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16720 catcatcatcttcatcaatttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatacgaaaacagcatgacataataatatcaa 16621  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||| ||||||||| | |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  16620 atggaagtcaacagcatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 16555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 13212 - 13377
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13212 catcatcatcttcatcaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 13311  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13312 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 13377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 10 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3309 - 3141
Alignment:
Q  10 catcatcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 108  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3309 catcatcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgatataataatat 3210  T
Q  109 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| || |||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||| | ||  |||||||||||    
T  3209 caaatgtaattcaacaacatctcaagtatacattcataattcaagtaatgcgtttaacattatatcaca 3141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 97; Significance: 9e-48; HSPs: 3)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 4522 - 4673
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4522 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 4620  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  4621 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 4673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 12104 - 12255
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12104 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 12202  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  12203 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 12255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 26 - 177
Target Start/End: Original strand, 22056 - 22207
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22056 atcaacttagaccgactcatgc-gcttagttaaataacaacagcaacacaagcagtatataaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 22154  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    || |||||| ||| ||   |||||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  22155 acatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcgtataacattatatcaca 22207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 95; Significance: 1e-46; HSPs: 4)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 19 - 157
Target Start/End: Original strand, 116434 - 116571
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  116434 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcgacacaacagtatac-aaaacagcatgacataatcatatcaaatgcaag 116532  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaat 157  Q
    |||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||    
T  116533 tcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaat 116571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 53873 - 53802
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53873 atataacaacatcaaatgataatcaacatctacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 53802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 129072 - 128907
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag-catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || ||||| | ||||  |  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||     
T  129072 cttagaccgactcatgcagcttagttaa-taacaaacagcaacataggcagtacataaaacaattcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaaca 128974  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    ||||||  | ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  128973 tctcaaaca-tcatatataattcatgtaatggatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 128907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 194
Target Start/End: Original strand, 78345 - 78505
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || ||| ||| |||| |||  ||||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  78345 gaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagcatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaa-tgcaaatcaacaacatct 78442  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
    |||    ||   ||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||||||||||||    
T  78443 caaca--tcgtttataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatcaaat 78505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Original strand, 39486 - 39642
Alignment:
Q  21 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39486 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 39584  T
Q  120 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  39585 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 39642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 21 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 75326 - 75170
Alignment:
Q  21 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagt 119  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  75326 tcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaa-cagcatgacataataatatcaaatgcaagt 75228  T
Q  120 caacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||| |||||| ||| ||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  75227 caacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 75170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 1852 - 2017
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  1852 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacatagacagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 1951  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1952 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 2017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1168 - 1018
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1168 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaatagcatgacataataatatcaa 1069  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  1068 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattattcaagtaatgcata 1018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0695 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0695
Description:

Target: scaffold0695; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 138 - 247
Target Start/End: Original strand, 6070 - 6179
Alignment:
Q  138 tcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6070 tcacatataattcaagtaatgcatatgcaattaaatcacaatataacaacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttc 6169  T
Q  238 atcaatcatg 247  Q
    ||||||||||    
T  6170 atcaatcatg 6179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 4850 - 5015
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4850 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagattagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaatcagcatgacataataatatcaa 4949  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||| |||||||| ||| || |||||| |||    |||||||||||||| |  |||||||||||    
T  4950 atgcaattcaacaacatcttaagtattcaaataattctcaagtaatgcataaaacattatatcaca 5015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 3471 - 3636
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3471 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataactaaagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 3570  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  3571 ttgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcaaataacattatatcaca 3636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 344 - 508
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  344 catcatcatctttatcgacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaataacataggcagtatac-aaaatagcatgacgtaataatatcaa 442  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     || ||||||||||| ||| || |||||   |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  443 ttggaagtcaacaacatcttaaatattcgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 86; Significance: 3e-41; HSPs: 4)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 33076 - 32913
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33076 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 32978  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  32977 ttgcaattcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 32913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 45929 - 46092
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  45929 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcaacacaggcagtatac-aaaacagcatgacataataatatcaa 46027  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     ||||| |||||||| ||| || ||||||  |||| ||| |||||||||||||  |||||| ||||    
T  46028 ttgcaattcaacaacatcttaaatattca-ttatacttcgagtaatgcatataacattataacaca 46092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Original strand, 16114 - 16278
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| || || ||||||||||    
T  16114 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcaagatatcataatatcaa 16213  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcac 176  Q
    ||||||| ||||| | |||||| ||| ||   |||| ||||||||||||||||  ||||||||||    
T  16214 atgcaagccaacatcatctcaagtatacattcataactcaagtaatgcatataacattatatcac 16278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 17449 - 17388
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacac 74  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  17449 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaacagcaacac 17388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 84; Significance: 5e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8649 - 8472
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  8649 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca---gcaacataggcagtat-caaaaacagcatgacataataatatcaa 8554  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
     |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  8553 ttgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcacataacattatatcacaacataatcaacatcaa 8472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 20 - 177
Target Start/End: Original strand, 25904 - 26061
Alignment:
Q  20 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaag 118  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||    
T  25904 atcttcatcaacttagaccgactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaaatgcaag 26002  T
Q  119 tcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  26003 taaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 26061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 39859 - 40023
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  39859 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgaagcttagttaaataacaatagcaacataggcagtatacaaaat-atcatgacataataatatcaa 39957  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||| |||||| |||||| ||||||  |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  39958 atgcaagtaaacaacatctcaaatattcaattatacttcaagtaatgcatttaacattatatcaca 40023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 80; Significance: 1e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Original strand, 8481 - 8650
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  8481 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatca 8579  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatata--attatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |  ||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8580 acatctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaatattatatcacattataaacaacatcaa 8650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 13 - 173
Target Start/End: Original strand, 6536 - 6695
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  6536 catcatcatcatcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6634  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||||||| |||||||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  6635 aatgcaaatcaacaacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 6695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 6244 - 6076
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca-ca---gcagtatacaaaaacagcatgacataataatat 108  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   | ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6244 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacaacataggtagtatacaaaaacagcatgacatgataatat 6145  T
Q  109 caaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||| ||||| ||| |||| ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  6144 caattgcaattcatcaacatcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 6076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 79; Significance: 5e-37; HSPs: 4)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 28415 - 28529
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28415 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 28514  T
Q  112 atgcaagtcaacaac 126  Q
     ||||| ||||||||    
T  28515 ttgcaattcaacaac 28529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 11293 - 11407
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||||||||||     
T  11293 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaccatcatgatataataatatcg 11391  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| || ||||||||    
T  11392 aatgtaaatcaacaac 11407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #3
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 1998 - 2050
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1998 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 4553 - 4605
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4553 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 4605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 30 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 24406 - 24257
Alignment:
Q  30 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaa-acagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacg 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||     
T  24406 acttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatacaaaacacagcatgacataaaaatatcaattgcaattcatcaaca 24307  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||| || |||||| ||||  ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  24306 tcttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcacataacattatatcaca 24257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0639 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0639
Description:

Target: scaffold0639; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 13 - 160
Target Start/End: Original strand, 8480 - 8628
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8480 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagcaacataggtagtatacaaaaacagtatgacataataatatcaa 8579  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
     |||||||||||||| ||| ||  |||||  | || |||||||||||||    
T  8580 ttgcaagtcaacaacatcttaaacattcaagtgtacttcaagtaatgca 8628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 27855 - 27686
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| | | ||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  27855 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 27757  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 194  Q
    || ||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27756 acatctcaaacattcacatataattctagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 27686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 74; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 76 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 3586 - 3485
Alignment:
Q  76 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatca 175  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  3586 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaattatacactcataattcaagtaatgcgtataacattatatca 3487  T
Q  176 ca 177  Q
    ||    
T  3486 ca 3485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0461 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0461
Description:

Target: scaffold0461; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Original strand, 11465 - 11648
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  11465 catcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcg 11563  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  11564 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 11648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 38376 - 38193
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | |||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||||||||||     
T  38376 catcaacatcttcaacgacttagattgactcatgcagcttagttaattaacaatcagcaacataggcagtatgcaaaa-catcatgatataataatatcg 38278  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
     | | |||| |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  38277 cacgtaagtaaacaacatctcaaataatcacatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 38193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0490 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0490
Description:

Target: scaffold0490; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 1953 - 2103
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||| || ||||||||||| |||||||    
T  1953 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaacaacagcgacataggcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaa 2052  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     ||||| |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  2053 ttgcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 2103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 53651 - 53486
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| || ||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  53651 cttagactgattcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 53553  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  53552 ctcaaatattcatatataattcaagtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 53486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 99 - 172
Target Start/End: Original strand, 13092 - 13165
Alignment:
Q  99 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattata 172  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13092 ataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattgaagtaatgcatatataattata 13165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 39914 - 40078
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  39914 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcagcttaattaaataacaatagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 40012  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||| ||||| ||| ||| || ||||    |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  40013 atgcatgtcaataacatcttaaatatttgattatacttcaagtaatgcacataacattatatcaca 40078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 19987 - 19883
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19987 cttagaccgactcatgcagcttaattaataaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaattcaacaac 19889  T
Q  127 gtctca 132  Q
     |||||    
T  19888 atctca 19883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 13147 - 13313
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |    
T  13147 cttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacat 13245  T
Q  129 ctcaatt-attcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 194  Q
    || ||   ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  13246 ctgaaaccattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 13313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 16206 - 16037
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacagc-agtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||| ||  ||||| ||||| || ||||| |||| ||||||||||| || ||||||    
T  16206 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacaacaacataggtagtatgcaaaa-caacatgatataacaatatcaaatgtaaatcaaca 16108  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataa-caacatcaaat 194  Q
    || ||||||  ||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  16107 acatctcaaacattcttatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaccaacatcaaat 16037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 12587 - 12751
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||| |||| |    
T  12587 cttagaccgactcatgtagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgcaaaa-cagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcatcaacat 12685  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    ||||| || | | ||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  12686 ctcaaatacttatatataattc-agtaatgtatatacaattatatcacattataaacaacatcaaat 12751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 102
Target Start/End: Original strand, 4713 - 4803
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataa 102  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  4713 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataa 4803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 64 - 192
Target Start/End: Original strand, 13144 - 13274
Alignment:
Q  64 aacagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| || ||||||  |||| ||||||||||||| |    
T  13144 aacagcaacataggcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaattgcaagtcaacatcatcttaaatattcaattatacttcaagtaatgcaca 13243  T
Q  163 tataattatatcacaatataa-caacatcaa 192  Q
    ||  |||||||||||| |||| |||||||||    
T  13244 taacattatatcacaacataatcaacatcaa 13274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 20 - 68
Target Start/End: Original strand, 281 - 329
Alignment:
Q  20 atcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacag 68  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  281 atcttcatcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaataacaacag 329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 34124 - 34238
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||  || ||||| |||||||||||     
T  34124 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatacagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac-aacccatcatgatataataatatcg 34222  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| || ||||||||    
T  34223 aatgtaaatcaacaac 34238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 31 - 160
Target Start/End: Original strand, 174785 - 174913
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||   ||||||||||| || ||||||||| ||| |||||||| |    
T  174785 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacatgattatatcaaattcaattcaacaacat 174881  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgca 160  Q
    |||||| |||||   |||||||||||||||||    
T  174882 ctcaatcattcattcataattcaagtaatgca 174913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Original strand, 121767 - 121827
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  121767 catcatcatcttcatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaaca 121827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 177
Target Start/End: Original strand, 124675 - 124751
Alignment:
Q  101 aataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||| ||||| ||| |||||| | || |||||| ||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  124675 aataatatcaattgcaattcatcaacgttttaaatattcaaatattcttcaagtaatgcatataacattatatcaca 124751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 62; Significance: 7e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 86 - 194
Target Start/End: Original strand, 225482 - 225590
Alignment:
Q  86 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aac 184  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||    
T  225482 aaaacagcgtgatataataatatcaaatgcaa-tcaacaacatctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaattatatcacattataaac 225580  T
Q  185 aacatcaaat 194  Q
    ||||||||||    
T  225581 aacatcaaat 225590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1427 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1427
Description:

Target: scaffold1427; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 1591 - 1659
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1591 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaaaatcatatatacatataacacttcatcaatcat 1659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 10543 - 10381
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| || ||||||||||   |||||||||||||||||||||    
T  10543 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcatagttaattaacaaacagcaacataggcagtatacaa---cagcatgacataataatatca 10447  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | | ||| |||||||| ||| || ||| || ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  10446 atttcaattcaacaacatcttaagtatacaaatattcttcaagtaatgcata-atcattatatcaca 10381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0422 (Bit Score: 61; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0422
Description:

Target: scaffold0422; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 178 - 246
Target Start/End: Original strand, 3186 - 3254
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcat 246  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3186 atataacaacatcaaatggtaatcaacatcttaaaacatcatatctacatataacacttcatcaatcat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 60; Significance: 1e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Original strand, 32068 - 32216
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  32068 catcatcatcttcaacaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtaaac--aaacaacatgacataataatatcaa 32165  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
     | ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  32166 tttcaattcatcaacatcttaggtatacaaatattcttcaagtaatgcata 32216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 19 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 11557 - 11464
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11557 catcttcaacaacttaaaccgactcatgcagcttagttaaataacaacaacaacataggtagtatacaaaaacaacatgacataataatatcaa 11464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 58; Significance: 2e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 15583 - 15420
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    ||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  15583 catcatcatcttcaacaacttagactgactcatgcagcttagttaaataacaagagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacataataatatcaa 15485  T
Q  112 atgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
     | ||| ||| |||| ||| |  |||  | ||||  ||||||||||||||| || |||||||||||    
T  15484 tttcaattcatcaacatcttatgtataaaaatattcttcaagtaatgcataaat-attatatcaca 15420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 184 - 247
Target Start/End: Original strand, 27958 - 28021
Alignment:
Q  184 caacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27958 caacatcaaataataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 28021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 27 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 10647 - 10481
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10647 tcaacttagaccgacttatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10549  T
Q  125 acgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    || |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  10548 acatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 10481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 111
Target Start/End: Original strand, 13513 - 13596
Alignment:
Q  28 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaa 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||    
T  13513 caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacataggcagtatac-aaaacaacatgacatgataatatcaa 13596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 177
Target Start/End: Original strand, 20911 - 21077
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||||  ||||||||||| |||||| |||||||| || || ||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  20911 catcaacatcttcaacgacttagaccgactcataaagcttagttaattaacaatcagcaacataggcaatatgcaaaaacaacatgacataataatatca 21010  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    | ||||| |||||||| ||| |  |||||| || |  | ||||||||||||| |  |||||||||||    
T  21011 attgcaattcaacaacatcttatatattcaaatgttctacaagtaatgcataaaacattatatcaca 21077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0503
Description:

Target: scaffold0503; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 121 - 194
Target Start/End: Original strand, 12039 - 12112
Alignment:
Q  121 aacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||    
T  12039 aacaacgcctcaattattcacatataattcaagcaatgcatatacaattatatcacaatataacagtatcaaat 12112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0503; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 31 - 91
Target Start/End: Original strand, 11982 - 12042
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacagcagtatacaaaaaca 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  11982 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacacaacagtataccaaaaca 12042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 19 - 126
Target Start/End: Original strand, 15668 - 15776
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgca 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||| ||| || ||||| ||||||||||| |||| |    
T  15668 catcttaatcaacttagaccgactcgtgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccatcatgatataataatatcgaatgta 15766  T
Q  117 agtcaacaac 126  Q
    | ||||||||    
T  15767 aatcaacaac 15776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 92 - 177
Target Start/End: Original strand, 27911 - 27996
Alignment:
Q  92 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||   |||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  27911 gcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaatatacattcataattcaagtaatgcatataacattatatcaca 27996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 60818 - 60652
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || |||||||||||| ||||  |||| |||  |||||||| ||||| ||||||||    
T  60818 cttaaaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatacaaaa-cagctcatgatataccaatatcaa-tgcaaatcaacaac 60721  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca-atataacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |  ||||||||||||||    
T  60720 atctcaaacattcatatataattcaagtaatgcatatacaaatatatcacataattaacaacatcaaat 60652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 129919 - 130066
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca-acagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| |    
T  129919 atcaacttagaccgactcatgcatcttagttaaataacacacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatc 130017  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  130018 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 130066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 33 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8161 - 7996
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaac-agcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgt 128  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||  |||| || || |||||| ||||  ||||  |||| |||||||||||||||| || |||||||| |    
T  8161 tagaccgacgcatgcagcttaattaaataacaaatagcagcataggcagtatgcaaat-cagctcatgatataataatatcaaatgaaattcaacaacat 8063  T
Q  129 ctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    || ||  ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  8062 cttaaacattcatatataattcaagtaatgtatataaaattatatcacattataaacaacatcaaat 7996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 15 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 6400 - 6220
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagc--atgacataataatatca 110  Q
    ||||||||||  ||| |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| |||||||| || ||||||| |||| ||||  |||| || | |||||||    
T  6400 tcaacatctt--tcatcttagaccgactcatgcaacttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtatataaaa-cagctcatgatatgacaatatca 6304  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaat 194  Q
    ||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | |||||||||||||||    
T  6303 aatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaat 6220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13854 - 13813
Alignment:
Q  15 tcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaa 58  Q
    ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13854 tcaacatctt--tcatcttagaccgactcatgcagcttagttaa 13813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 13 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 6243 - 6134
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| ||||||     
T  6243 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagtaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcg 6145  T
Q  111 aatgcaagtca 121  Q
    |||||||||||    
T  6144 aatgcaagtca 6134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 51; Significance: 2e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 19278 - 19424
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  19278 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 19376  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  19377 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 19424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1189 - 1011
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || |||||| ||||  || ||||| |||||||||||     
T  1189 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgcaaac-catcatgatataataatatcg 1091  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| || ||||||||   |||||||| || |  ||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  1090 aatgtaaatcaacaac---tcaattat-cagacttaagtcatgtaatgtatatacaattatataacattataacaacatcaaat 1011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 45899 - 45732
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||| |||||| |    
T  45899 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagaaaaataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaagtcatc 45801  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaa 192  Q
    ||| ||||||||| ||| | |||||||| || ||| ||||| |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  45800 aacatctcaatta-tcaaacataattcatgtgatgtatatacaattatataacattataaacaacatcaa 45732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 1154 - 1102
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1154 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 6612 - 6664
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6612 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 6664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 13992 - 14044
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13992 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 14044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Original strand, 25121 - 25289
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| ||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25121 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatataacgatatc-aatgcaaatcaa 25218  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatataacaacatcaaat 194  Q
    |||| ||||||  | ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25219 caacatctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgtatatacaaatatatcacattattacaacatcaaat 25289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 620 - 720
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 191  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || |||||||||||    
T  620 catgatataacaatatcaaa-gcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacatca 717  T
Q  192 aat 194  Q
    |||    
T  718 aat 720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 49; Significance: 4e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 15897 - 15845
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15897 catcatcatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 15845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 178901 - 178952
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  178901 catcttgatcgacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 178952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 5657 - 5803
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||  |||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  5657 atcaacttagaccgactcatgcagcttagtaaaataacaaacagcaacataggcagtat-gaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 5755  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| |||  ||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||||    
T  5756 aacatctcaaatatcaac--ataattcatataatgtatatacaattatat 5803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 4)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 19 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 15352 - 15298
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15352 catcttaatcaacgtagaccgactcatgcagcttagttaaataacaatagcaaca 15298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 15273 - 15202
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15273 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 15202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #3
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 1290 - 1402
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  1290 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtgtac---aacatcatgacataattatatca 1386  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  1387 aattcaattcatcaac 1402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 7267 - 7379
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||| ||||| ||||||    
T  7267 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtatac---aacaacatgaaataattatatca 7363  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  7364 aattcaattcatcaac 7379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 47; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 33 - 162
Target Start/End: Original strand, 4545 - 4675
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctc 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| || || | ||||||| ||| | ||||| || || ||||||||||||  || |||||||| |||     
T  4545 tagaccgactcatgcaacttagttaaataacaacaacagcataggcagtatgcaacagcagcaagatatcataatatcaaatataattcaacaacatctt 4644  T
Q  132 aattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    || ||||||  |||| |||||||||||||||    
T  4645 aaatattcatttatacttcaagtaatgcata 4675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 173
Target Start/End: Original strand, 143 - 290
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||| |||||    
T  143 atcaacttagaccgattcatgcagcttagttaaacaacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaaatcaac 241  T
Q  124 aacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    ||| |||||| || ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  242 aacatctcaaata-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 2913 - 2805
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  2913 atcatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagctacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaac 2815  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  2814 aacatctcaa 2805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0513 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0513
Description:

Target: scaffold0513; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 243
Target Start/End: Complemental strand, 10886 - 10821
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaat 243  Q
    |||||||||||||||||  || |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10886 atataacaacatcaaataatactcaacattttaaaacatcatatatacatataacacttcatcaat 10821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0351 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0351
Description:

Target: scaffold0351; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 16283 - 16395
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||||||||   |||||||||||||||| ||||||    
T  16283 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaaataagaaacagcaacataggcagtatac---aacagcatgacataattatatca 16379  T
Q  111 aatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||| ||| ||| ||||    
T  16380 aattcaattcatcaac 16395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 26 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 14804 - 14696
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| | |||||| | |||| || ||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  14804 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaactaacaaacagcaacataggcagta-agaaaatcatcatgatatagtaatatcgaatgcaaatcaac 14706  T
Q  124 aacgtctcaa 133  Q
    ||| ||||||    
T  14705 aacatctcaa 14696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 97024 - 97190
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  97024 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 97122  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  97123 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 97190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 106302 - 106468
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| || ||||| | |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  106302 cttagacccactcatgcagcttagttaataaataaacagcaacataggcagtacataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaac 106400  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||  | ||| |||||||||| |||||||||||| || ||||||||| || ||||||||||||||    
T  106401 atctcaaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacaaatatatcacattattaacaacatcaaat 106468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 31 - 113
Target Start/End: Original strand, 1051 - 1134
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaat 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | |||||||||||| |||| ||||||||||    
T  1051 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacagcatgatataacaatatcaaat 1134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 21 - 65
Target Start/End: Original strand, 1091 - 1135
Alignment:
Q  21 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1091 tcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 1135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0747 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0747
Description:

Target: scaffold0747; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 645 - 716
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  645 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0741 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0741
Description:

Target: scaffold0741; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 4304 - 4233
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4304 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 4233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0599 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0599
Description:

Target: scaffold0599; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1256
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1327 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 1256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 4953 - 4893
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4953 catcatcatcttcatcaacttagaccaactcatgcaacttagttaaataacaacagcaaca 4893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 88 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 1006 - 918
Alignment:
Q  88 aacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||   ||||||||||||||||| |||  |||||||||||    
T  1006 aacagcatggcataataatatcaa-tgcaagtcaacaaaatctcaaatattcaatcataattcaagtaatgcacataacattatatcaca 918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0306 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0306
Description:

Target: scaffold0306; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Original strand, 15083 - 15154
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatct--taaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| |||   | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15083 atataacaacatcaaatgataatcaacatcaacttaaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 15154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 45; Significance: 9e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 32551 - 32657
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||| | |||||| ||||| |||| |||||||||||||| ||||||    
T  32551 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaataaacaaacagcaacataggcagtatgc-aaaacaacatgatataacaatatcaaatgcaa-tcaaca 32648  T
Q  125 acgtctcaa 133  Q
    || ||||||    
T  32649 acatctcaa 32657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 31 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 51985 - 51839
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacacag-cagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaa-cg 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||| || || ||| || |||||| |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |     
T  51985 cttagaccgactcatgcagcttagttaaacatcaaacagca-cataggcagcattcaaaaatagcaagacataataatatc-aatgcaagccaacaatca 51888  T
Q  128 tctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||||||||||||  || | |||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  51887 tctcaattattcatttaaacttcaagtaatgcgtata-cattatatcaca 51839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 178 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 36065 - 35995
Alignment:
Q  178 atataacaacatcaaatggtaatcaaaatcttaaaacatcatatatacatataacac-ttcatcaatcatg 247  Q
    |||||| |||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  36065 atataagaacatcaaaaaataatcaacatcttaaaacatcatatatacatataacactttcatcaatcatg 35995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23989 - 23898
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| |||||||    
T  23989 tcaacttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaa 23898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 86 - 173
Target Start/End: Original strand, 8090 - 8176
Alignment:
Q  86 aaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatat 173  Q
    |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||  | ||| | |||||||| |||||| ||||| ||||||||    
T  8090 aaaacagcatgatataacaatatcaaatgcaagtcaacaacatctcaaaca-tcaaacataattcatgtaatgtatatacaattatat 8176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6927
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||  ||||||| |||||    
T  6826 atcatcttagaccgactcatgcagctcagttaaataacaaacagcaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatattgaatgcaaatcaac 6924  T
Q  124 aac 126  Q
    |||    
T  6925 aac 6927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 2752 - 2713
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2752 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 2713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0198 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0198
Description:

Target: scaffold0198; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 19 - 70
Target Start/End: Original strand, 23846 - 23897
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagca 70  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23846 catcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaatagca 23897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Original strand, 38339 - 38483
Alignment:
Q  35 gaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtct 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||  |||||||  ||||| || | |||||||||||||| |||||||| |||    
T  38339 gaccgactcatgcagcttagttaatgaacaaacagcaacataggcagtata-taaaacagctcatgatatgacaatatcaaatgcaattcaacaacatct 38437  T
Q  131 caattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcaca 177  Q
    |||  | ||| |||||||||| |||||||||||| |  |||||||||    
T  38438 caaaca-tcatatataattcatgtaatgcatatacatatatatcaca 38483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 126
Target Start/End: Original strand, 51601 - 51695
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||| ||||| ||| ||| ||||    
T  51601 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaaacagcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattataacaaattcaattcatcaac 51695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 76 - 162
Target Start/End: Original strand, 6675 - 6761
Alignment:
Q  76 gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| |||||||  |||| |||||||| ||| || |||||| | || ||||||||||||||||    
T  6675 gcagtatacaaaatcaacatgacataatgatatcaatagcaattcaacaacatcttaaatattcaaacattattcaagtaatgcata 6761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 27 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 8180 - 8011
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaa 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | ||||||||| ||| |||  ||||| |||| |||||||||| ||| ||||    
T  8180 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaacaaacaaacagcaacataggcagtatac-aaaccagttcatgatataacaatatcaaatacaaatcaa 8082  T
Q  123 caacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaatat-aacaacatcaaat 194  Q
    |||| || |||    ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||| ||| |||||||| ||||    
T  8081 caacatcacaa--catcatatataattcatgtaatgtatatacaactatataacattatcaacaacattaaat 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 104 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18265 - 18176
Alignment:
Q  104 aatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaat-ataacaacatcaaa 193  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| | ||||||||||||||    
T  18265 aatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattaataacaacatcaaa 18176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 126
Target Start/End: Original strand, 12954 - 13054
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| |||||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  12954 tcaacttagaccgactcatgctgctcagttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcagcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 13052  T
Q  125 ac 126  Q
    ||    
T  13053 ac 13054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0131 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0131
Description:

Target: scaffold0131; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 19 - 65
Target Start/End: Original strand, 36457 - 36503
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36457 catcttgatcaacttagaccgactcatgcagcttggttaaataacaa 36503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 31 - 194
Target Start/End: Original strand, 267679 - 267844
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa-cagcaacaca-gcagtatacaaaaacag--catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaac 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||  ||||| || ||||| | |||||||| |||| |||  ||||| |||| |||||||||||||| |||||||     
T  267679 cttagaccgactcatgcaacttagttaataaacaaacatcaacatatgcagtatataaaa-cagttcatgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaat 267777  T
Q  127 gtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatcaaat 194  Q
     ||||||    ||| |||||||||| |||||||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  267778 atctcaaca--tcatatataattcatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaccatcaaat 267844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 137
Target Start/End: Original strand, 32112 - 32224
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaaca-cagcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaac 123  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||| ||||| || ||||| |||| |||||| |||| || ||| |    
T  32112 atcatcttagaccgactcatgcagcttagataaataacaaacaacaacataagtagtatgcaaaatcatcatgatataacaatatcgaatgtaa-tcatc 32210  T
Q  124 aacgtctcaattat 137  Q
    ||||||||||||||    
T  32211 aacgtctcaattat 32224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0317 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0317
Description:

Target: scaffold0317; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 211 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 6902 - 6866
Alignment:
Q  211 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 247  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6902 aaacatcatatatacatataacacttcatcaatcatg 6866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 27 - 133
Target Start/End: Original strand, 10542 - 10649
Alignment:
Q  27 tcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaagtcaaca 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||| | ||||||| | ||| || ||||| |||| |||||| ||||||||||| ||    
T  10542 tcaacttagaccgactcatgcagcttttttaaataacaaacaacaacataggcagtatgc-aaatcatcatgatataacaatatcgaatgcaagtcatca 10640  T
Q  125 acgtctcaa 133  Q
    || ||||||    
T  10641 acatctcaa 10649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 65
Target Start/End: Original strand, 12780 - 12819
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12780 atcaacttagaccgactcatgcagcttagctaaataacaa 12819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0205 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0205
Description:

Target: scaffold0205; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 117
Target Start/End: Original strand, 29561 - 29660
Alignment:
Q  19 catcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatcaaatgcaa 117  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||||||| || | || | | ||  ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||    
T  29561 catcttaatcaacttagactgactcatgtgacttagttaaataacaatagtagcataggtagattacaataatagcatgacataataatatcaattgcaa 29660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0718 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0718
Description:

Target: scaffold0718; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 31 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 5230 - 5196
Alignment:
Q  31 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 65  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5230 cttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaa 5196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 26 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 28877 - 28839
Alignment:
Q  26 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataaca 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28877 atcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaacaaca 28839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 13 - 111
Target Start/End: Original strand, 46996 - 47093
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataac-aacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||||| | ||||| |||   | |||||||||||||||||||||    
T  46996 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgtagcttagttaaataacaaacaacaacataggcagtttac---agcagcatgacataataatatca 47092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 1169 - 1021
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaatcaacttagaccgactcatgcagcttagttaaataa-caacagcaacaca-gcagtatacaaaaacagcatgacataataatatca 110  Q
    ||||| |||||| | || |||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||| | |||||||||   |||| ||||||||||| ||||||    
T  1169 catcatcatcttcaacatcttagaccgactcatgcagcttagttaattaataaacatcaacataggcagtatac---aacatcatgacataattatatca 1073  T
Q  111 aatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcata 162  Q
    | | ||| ||| |||| ||| |  ||| || ||||  |||||||||||||||    
T  1072 atttcaattcatcaacatcttatgtatacaaatattcttcaagtaatgcata 1021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 193097 - 192997
Alignment:
Q  13 catcaacatcttaat-caacttagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaacaca-gcagtat-acaaaaacagcatgacataataatatc 109  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| || | |||| || |||| |||| |||||||||| ||||||    
T  193097 catcaacatcttaattcaacatggactgactcatgcaacttagttaattaacaacagcagcataggcagaatcacaacaacatcatgacataacaatatc 192998  T
Q  110 a 110  Q
    |    
T  192997 a 192997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 1835 - 1735
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 191  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||| ||||||    ||| |||||||| | |||||||||||| | |||||||||| || ||||||| |||    
T  1835 catgatataacaatatcaaatgcaaatcaacaacatctcaa--catcatatataatttatgtaatgcatatacatttatatcacattattaacaacgtca 1738  T
Q  192 aat 194  Q
    |||    
T  1737 aat 1735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 93 - 194
Target Start/End: Original strand, 88 - 189
Alignment:
Q  93 catgacataataatatcaaatgcaagtcaacaacgtctcaattattcacatataattcaagtaatgcatatataattatatcacaata-taacaacatca 191  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||| |||| ||| ||||||  || || |||||||||| |||||||||||| | |||||| ||| || |||||||||||    
T  88 catgatataacaatatcagatgcaaatcaataacatctcaaacat-catatataattcatgtaatgcatatacatttatataacattattaacaacatca 186  T
Q  192 aat 194  Q
    |||    
T  187 aat 189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 33 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 206624 - 206584
Alignment:
Q  33 tagaccgactcatgcagcttagttaaataacaacagcaaca 73  Q
    |||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  206624 tagatcgactcatgcagcttagttaataaacaacagcaaca 206584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University