View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15528_high_8 (Length: 250)

Name: NF15528_high_8
Description: NF15528
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15528_high_8
NF15528_high_8
[»] chr6 (49 HSPs)
chr6 (11-250)||(27287092-27287331)
chr6 (11-250)||(27022365-27022604)
chr6 (11-250)||(27179685-27179924)
chr6 (11-250)||(27269315-27269554)
chr6 (11-250)||(29552786-29553025)
chr6 (11-250)||(13295679-13295918)
chr6 (11-250)||(15421048-15421287)
chr6 (11-250)||(22931612-22931851)
chr6 (11-250)||(23854057-23854296)
chr6 (11-250)||(16677369-16677608)
chr6 (11-250)||(24866945-24867184)
chr6 (11-250)||(16753050-16753289)
chr6 (15-248)||(17089173-17089406)
chr6 (11-250)||(4542502-4542741)
chr6 (11-250)||(4720863-4721102)
chr6 (15-250)||(27626439-27626674)
chr6 (11-250)||(34461234-34461473)
chr6 (11-250)||(3699312-3699551)
chr6 (11-250)||(4760992-4761231)
chr6 (11-250)||(26113140-26113379)
chr6 (11-250)||(26921606-26921845)
chr6 (11-250)||(27010960-27011199)
chr6 (11-250)||(27060735-27060974)
chr6 (11-250)||(28210683-28210922)
chr6 (11-250)||(30554744-30554983)
chr6 (11-250)||(27488362-27488601)
chr6 (11-250)||(29504645-29504884)
chr6 (11-239)||(16940766-16940994)
chr6 (11-250)||(4528514-4528753)
chr6 (11-250)||(29576243-29576482)
chr6 (11-250)||(4776109-4776348)
chr6 (13-250)||(20171778-20172015)
chr6 (13-250)||(22163976-22164213)
chr6 (83-250)||(26992096-26992263)
chr6 (103-250)||(33373159-33373306)
chr6 (121-250)||(14142122-14142251)
chr6 (121-250)||(26789155-26789284)
chr6 (121-250)||(27197524-27197653)
chr6 (121-250)||(27251582-27251711)
chr6 (121-250)||(8902431-8902560)
chr6 (121-250)||(13520920-13521048)
chr6 (121-250)||(26775355-26775484)
chr6 (121-250)||(27358838-27358967)
chr6 (121-250)||(27449181-27449310)
chr6 (121-250)||(28163830-28163959)
chr6 (121-250)||(22455842-22455971)
chr6 (52-230)||(9136101-9136279)
chr6 (14-114)||(18119701-18119801)
chr6 (14-114)||(23971634-23971734)
[»] chr3 (64 HSPs)
chr3 (12-250)||(4793463-4793701)
chr3 (13-250)||(8286298-8286535)
chr3 (6-250)||(18333818-18334062)
chr3 (11-250)||(21677896-21678135)
chr3 (6-250)||(35883954-35884198)
chr3 (11-250)||(15737922-15738161)
chr3 (11-250)||(15889533-15889772)
chr3 (11-250)||(18054455-18054694)
chr3 (11-250)||(18273880-18274119)
chr3 (11-250)||(18289181-18289420)
chr3 (11-250)||(18304482-18304721)
chr3 (11-250)||(29145584-29145823)
chr3 (11-250)||(6205096-6205335)
chr3 (11-250)||(8299164-8299403)
chr3 (11-250)||(4686848-4687087)
chr3 (11-250)||(4724824-4725063)
chr3 (11-250)||(20069233-20069472)
chr3 (11-250)||(22384406-22384645)
chr3 (11-250)||(7076399-7076638)
chr3 (11-250)||(29661798-29662037)
chr3 (13-250)||(16621318-16621555)
chr3 (18-250)||(32442351-32442583)
chr3 (11-250)||(5593185-5593424)
chr3 (11-250)||(10399337-10399576)
chr3 (11-250)||(28112782-28113021)
chr3 (11-250)||(8214928-8215167)
chr3 (11-250)||(28024475-28024714)
chr3 (11-250)||(28342370-28342609)
chr3 (15-248)||(19697687-19697920)
chr3 (11-250)||(5016907-5017146)
chr3 (11-250)||(5470181-5470420)
chr3 (11-250)||(5606142-5606381)
chr3 (19-250)||(20573671-20573902)
chr3 (11-250)||(47026646-47026885)
chr3 (11-250)||(6539570-6539809)
chr3 (11-250)||(24331356-24331595)
chr3 (11-240)||(4343514-4343743)
chr3 (11-250)||(4420108-4420347)
chr3 (11-250)||(7999753-7999992)
chr3 (11-250)||(10646266-10646505)
chr3 (11-250)||(22867676-22867915)
chr3 (11-250)||(22882735-22882974)
chr3 (19-250)||(18245942-18246173)
chr3 (11-250)||(31961283-31961522)
chr3 (11-250)||(48469120-48469359)
chr3 (11-250)||(17981777-17982016)
chr3 (11-250)||(18228389-18228628)
chr3 (11-250)||(51785216-51785455)
chr3 (11-200)||(11107230-11107419)
chr3 (121-250)||(32293931-32294060)
chr3 (121-245)||(4627088-4627212)
chr3 (121-250)||(17992759-17992888)
chr3 (121-250)||(31033064-31033193)
chr3 (121-250)||(5714376-5714505)
chr3 (121-250)||(5725286-5725415)
chr3 (121-250)||(5766953-5767082)
chr3 (52-230)||(5950650-5950828)
chr3 (50-114)||(15918749-15918813)
chr3 (50-107)||(15592882-15592939)
chr3 (50-107)||(20443349-20443406)
chr3 (50-107)||(41440475-41440532)
chr3 (14-114)||(7088991-7089091)
chr3 (14-114)||(11925322-11925422)
chr3 (14-114)||(16431601-16431701)
[»] chr8 (23 HSPs)
chr8 (11-250)||(18793935-18794174)
chr8 (11-250)||(27605651-27605890)
chr8 (11-250)||(14560855-14561094)
chr8 (11-250)||(2134006-2134245)
chr8 (11-250)||(19691329-19691568)
chr8 (11-250)||(29832557-29832796)
chr8 (19-250)||(19205108-19205339)
chr8 (11-250)||(18712715-18712954)
chr8 (19-250)||(28358698-28358929)
chr8 (11-250)||(9357856-9358095)
chr8 (11-250)||(12089469-12089708)
chr8 (11-250)||(19677678-19677917)
chr8 (11-250)||(31357759-31357998)
chr8 (11-250)||(31486617-31486856)
chr8 (11-250)||(33261965-33262204)
chr8 (11-248)||(22077659-22077896)
chr8 (121-250)||(15770915-15771044)
chr8 (121-250)||(44564325-44564454)
chr8 (125-250)||(21344917-21345042)
chr8 (11-72)||(16286632-16286694)
chr8 (14-113)||(19844401-19844500)
chr8 (14-114)||(14212273-14212373)
chr8 (14-114)||(22412172-22412272)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (11-250)||(10913539-10913778)
chr7 (11-250)||(2157803-2158042)
chr7 (11-250)||(26534543-26534782)
chr7 (13-250)||(10844851-10845088)
chr7 (11-250)||(5131225-5131464)
chr7 (11-250)||(26271756-26271995)
chr7 (11-250)||(2106833-2107072)
chr7 (11-250)||(5144010-5144249)
chr7 (11-250)||(11421449-11421688)
chr7 (11-250)||(22145424-22145663)
chr7 (13-250)||(16515100-16515337)
chr7 (11-250)||(26316518-26316757)
chr7 (11-250)||(26438486-26438725)
chr7 (19-250)||(26516029-26516260)
chr7 (11-250)||(4141916-4142155)
chr7 (11-250)||(4202618-4202857)
chr7 (11-250)||(45390449-45390688)
chr7 (13-250)||(10842664-10842901)
chr7 (13-250)||(16044550-16044786)
chr7 (13-250)||(16446676-16446913)
chr7 (11-250)||(26666584-26666823)
chr7 (11-250)||(3448535-3448774)
chr7 (11-250)||(11444116-11444355)
chr7 (19-250)||(16748187-16748418)
chr7 (19-250)||(31561060-31561291)
chr7 (11-250)||(24589204-24589443)
chr7 (11-160)||(9621879-9622028)
chr7 (121-250)||(2776593-2776722)
chr7 (121-250)||(26512366-26512495)
chr7 (121-250)||(26681776-26681905)
chr7 (121-250)||(31127246-31127375)
chr7 (121-250)||(45734652-45734781)
chr7 (121-250)||(31087292-31087421)
chr7 (121-250)||(39209809-39209938)
chr7 (52-230)||(9469590-9469768)
chr7 (52-230)||(16393124-16393302)
chr7 (52-230)||(30369636-30369814)
chr7 (14-125)||(25726729-25726840)
chr7 (14-114)||(2556767-2556867)
chr7 (14-114)||(15193315-15193415)
chr7 (14-114)||(16127624-16127724)
chr7 (50-106)||(16287193-16287249)
chr7 (14-114)||(29089748-29089848)
[»] scaffold0089 (3 HSPs)
scaffold0089 (13-250)||(3301-3538)
scaffold0089 (11-155)||(43871-44015)
scaffold0089 (13-84)||(32096-32167)
[»] chr4 (28 HSPs)
chr4 (11-240)||(14668261-14668490)
chr4 (11-250)||(6573103-6573342)
chr4 (11-250)||(14760091-14760330)
chr4 (11-250)||(17016291-17016530)
chr4 (11-250)||(34185745-34185984)
chr4 (11-250)||(24589146-24589385)
chr4 (11-250)||(54836636-54836875)
chr4 (11-250)||(5009120-5009359)
chr4 (15-250)||(20335206-20335441)
chr4 (11-250)||(24115907-24116146)
chr4 (13-250)||(15281722-15281959)
chr4 (11-250)||(18313963-18314202)
chr4 (11-250)||(36341302-36341541)
chr4 (12-250)||(1903500-1903738)
chr4 (11-249)||(15231117-15231355)
chr4 (11-250)||(27160102-27160341)
chr4 (11-250)||(31123297-31123536)
chr4 (11-250)||(33670585-33670824)
chr4 (19-250)||(39853890-39854121)
chr4 (11-250)||(21972946-21973185)
chr4 (11-250)||(30757005-30757244)
chr4 (11-250)||(14101788-14102027)
chr4 (19-250)||(18797399-18797630)
chr4 (11-250)||(40102422-40102661)
chr4 (11-236)||(15388177-15388402)
chr4 (103-154)||(24459636-24459687)
chr4 (14-114)||(14725720-14725820)
chr4 (14-114)||(19767587-19767687)
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (11-250)||(30525-30764)
scaffold0143 (13-250)||(19304-19541)
scaffold0143 (121-250)||(7302-7431)
[»] chr5 (58 HSPs)
chr5 (11-250)||(11552594-11552833)
chr5 (11-250)||(23629209-23629448)
chr5 (11-250)||(33295767-33296006)
chr5 (11-250)||(33780728-33780967)
chr5 (11-250)||(43081494-43081733)
chr5 (11-250)||(15655440-15655679)
chr5 (11-250)||(22995799-22996038)
chr5 (11-250)||(24684827-24685066)
chr5 (11-250)||(41677944-41678183)
chr5 (11-250)||(24973145-24973384)
chr5 (16-250)||(22891707-22891941)
chr5 (11-250)||(9320715-9320954)
chr5 (11-250)||(12135414-12135653)
chr5 (11-250)||(26483633-26483872)
chr5 (11-250)||(28652481-28652720)
chr5 (11-249)||(34619757-34619995)
chr5 (13-250)||(23895447-23895684)
chr5 (11-250)||(18497407-18497646)
chr5 (11-250)||(30937874-30938113)
chr5 (11-250)||(31434703-31434942)
chr5 (11-240)||(3792780-3793009)
chr5 (11-250)||(8662157-8662396)
chr5 (11-250)||(28956467-28956706)
chr5 (11-250)||(30032667-30032906)
chr5 (11-250)||(30155270-30155509)
chr5 (11-250)||(30171708-30171947)
chr5 (11-250)||(32592956-32593195)
chr5 (11-250)||(33519619-33519858)
chr5 (11-250)||(37355325-37355564)
chr5 (13-250)||(25203519-25203756)
chr5 (13-250)||(25267674-25267911)
chr5 (19-240)||(40470242-40470463)
chr5 (11-250)||(37668168-37668407)
chr5 (11-240)||(37758222-37758451)
chr5 (11-250)||(2514301-2514540)
chr5 (11-250)||(18372216-18372455)
chr5 (11-250)||(24586613-24586852)
chr5 (11-250)||(31823089-31823328)
chr5 (11-250)||(13321512-13321751)
chr5 (11-250)||(37767673-37767912)
chr5 (19-239)||(15755545-15755765)
chr5 (11-250)||(5641027-5641266)
chr5 (11-250)||(24727208-24727447)
chr5 (11-250)||(6877544-6877783)
chr5 (103-250)||(13183475-13183622)
chr5 (121-250)||(9547391-9547520)
chr5 (121-250)||(29887879-29888008)
chr5 (121-250)||(13439365-13439494)
chr5 (121-250)||(33878480-33878608)
chr5 (121-250)||(11326986-11327115)
chr5 (121-250)||(18125098-18125227)
chr5 (52-230)||(15784427-15784605)
chr5 (52-230)||(11944124-11944302)
chr5 (52-230)||(17957376-17957554)
chr5 (52-230)||(5439927-5440105)
chr5 (52-114)||(36375780-36375842)
chr5 (52-114)||(37000434-37000496)
chr5 (50-106)||(34468900-34468956)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (11-250)||(34294385-34294624)
chr2 (11-250)||(11631958-11632197)
chr2 (11-250)||(23125342-23125581)
chr2 (11-250)||(12658767-12659006)
chr2 (19-250)||(13933321-13933552)
chr2 (11-250)||(20841144-20841383)
chr2 (13-240)||(27431225-27431452)
chr2 (11-250)||(37948636-37948875)
chr2 (11-250)||(39893300-39893539)
chr2 (19-250)||(27806942-27807173)
chr2 (11-250)||(39048593-39048832)
chr2 (13-250)||(19453197-19453434)
chr2 (19-250)||(12590047-12590278)
chr2 (11-250)||(28885438-28885677)
chr2 (13-250)||(21699945-21700181)
chr2 (19-250)||(9346760-9346991)
chr2 (11-250)||(16826112-16826351)
chr2 (11-250)||(16895129-16895368)
chr2 (11-250)||(31879517-31879756)
chr2 (11-250)||(37380908-37381147)
chr2 (11-250)||(37682669-37682908)
chr2 (11-250)||(37697934-37698173)
chr2 (11-250)||(37928600-37928839)
chr2 (11-250)||(40236739-40236978)
chr2 (11-250)||(19413275-19413514)
chr2 (11-250)||(32053034-32053273)
chr2 (19-250)||(257427-257658)
chr2 (19-250)||(21673949-21674180)
chr2 (11-250)||(34864915-34865154)
chr2 (11-250)||(12713375-12713614)
chr2 (11-248)||(27394793-27395030)
chr2 (121-250)||(27119865-27119994)
chr2 (121-250)||(16164821-16164950)
chr2 (121-250)||(27779575-27779704)
chr2 (121-250)||(27819332-27819461)
chr2 (121-250)||(3785834-3785963)
chr2 (121-250)||(31890265-31890394)
chr2 (121-250)||(22924922-22925051)
chr2 (121-250)||(34158185-34158314)
chr2 (161-250)||(27827841-27827930)
chr2 (52-230)||(12383932-12384110)
chr2 (52-230)||(22949665-22949843)
chr2 (14-114)||(34701310-34701410)
chr2 (14-114)||(42393769-42393869)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (19-250)||(21894534-21894765)
chr1 (16-250)||(20339086-20339320)
chr1 (11-250)||(10948311-10948550)
chr1 (19-250)||(10965907-10966138)
chr1 (13-250)||(20464212-20464449)
chr1 (14-250)||(16204819-16205055)
chr1 (11-250)||(28588219-28588458)
chr1 (19-250)||(41790095-41790326)
chr1 (11-250)||(51641452-51641691)
chr1 (11-250)||(3644366-3644608)
chr1 (121-250)||(28153080-28153209)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (11-250)||(9268-9507)
[»] scaffold0260 (1 HSPs)
scaffold0260 (16-250)||(1409-1643)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (11-250)||(15813-16052)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (11-250)||(12803-13042)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (11-250)||(11181-11420)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (11-250)||(9254-9493)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (11-250)||(11713-11952)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (11-250)||(22976-23215)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (11-250)||(5964-6203)
scaffold0159 (11-83)||(23111-23183)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (13-250)||(9279-9516)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (13-250)||(5456-5693)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (14-250)||(43513-43762)
[»] scaffold1888 (1 HSPs)
scaffold1888 (11-119)||(1155-1263)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (18-86)||(33699-33770)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (52-230)||(29443-29621)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (25-107)||(35168-35250)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (14-114)||(10453-10553)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 220; Significance: 1e-121; HSPs: 49)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27287331 - 27287092
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27287331 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 27287232  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27287231 actcagaaataatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacct 27287132  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27287131 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27287092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 27022365 - 27022604
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27022365 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgatttatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27022464  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27022465 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27022564  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27022565 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27022604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 27179685 - 27179924
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27179685 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27179784  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27179785 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 27179884  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27179885 gtggacggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27179924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27269554 - 27269315
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27269554 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27269455  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27269454 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagtttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 27269355  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27269354 gtggacggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27269315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 29552786 - 29553025
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29552786 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29552885  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29552886 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29552985  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  29552986 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 29553025  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13295918 - 13295679
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13295918 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 13295819  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13295818 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgctaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 13295719  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13295718 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 13295679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15421287 - 15421048
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15421287 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15421188  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15421187 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15421088  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15421087 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 15421048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22931851 - 22931612
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22931851 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22931752  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  22931751 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccaccc 22931652  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22931651 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 22931612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23854296 - 23854057
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23854296 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 23854197  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  23854196 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaactacctatccttgtcccaccc 23854097  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23854096 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 23854057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 16677369 - 16677608
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  16677369 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaatctgcgggccgatcttcaagct 16677468  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16677469 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16677568  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16677569 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 16677608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24866945 - 24867184
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24866945 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 24867044  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24867045 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24867144  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24867145 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24867184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 16753050 - 16753289
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16753050 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16753149  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16753150 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccaccc 16753249  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  16753250 gtggaaggaaggcctctgattatgtatttggcagtatttg 16753289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 17089406 - 17089173
Alignment:
Q  15 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||    
T  17089406 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgctacctgcgggccaatcttcaagctactc 17089307  T
Q  115 agaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgg 214  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  17089306 aggaagaatcagcctattgtgtggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgg 17089207  T
Q  215 aaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17089206 aaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtt 17089173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4542741 - 4542502
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4542741 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagct 4542642  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4542641 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4542542  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4542541 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4542502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4721102 - 4720863
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4721102 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgattttcaagct 4721003  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4721002 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4720903  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4720902 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4720863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27626674 - 27626439
Alignment:
Q  15 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27626674 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 27626575  T
Q  115 agaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgg 214  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  27626574 agaaagaatcagcctattgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccacccgtgg 27626475  T
Q  215 aaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  27626474 aaggaaggcctttgattatgtacttggcagtatttg 27626439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34461473 - 34461234
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34461473 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34461374  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34461373 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34461274  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  34461273 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 34461234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 3699312 - 3699551
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3699312 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3699411  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||      
T  3699412 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacgt 3699511  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  3699512 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 3699551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4760992 - 4761231
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  4760992 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 4761091  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4761092 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4761191  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4761192 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4761231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26113379 - 26113140
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26113379 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26113280  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26113279 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26113180  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26113179 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 26113140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 26921606 - 26921845
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26921606 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26921705  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||    
T  26921706 actcagaaagaatcagcctgttgtttggaataatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatctttgtcccaccc 26921805  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||||    
T  26921806 gtggaaggaaggcctctgattatgtatttggcagtatttg 26921845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 27010960 - 27011199
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  27010960 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 27011059  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27011060 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27011159  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27011160 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27011199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 27060735 - 27060974
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27060735 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27060834  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27060835 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27060934  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27060935 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27060974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28210683 - 28210922
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28210683 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28210782  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28210783 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28210882  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28210883 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 28210922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 30554983 - 30554744
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30554983 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30554884  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30554883 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30554784  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30554783 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 30554744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 27488362 - 27488601
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27488362 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27488461  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27488462 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27488561  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27488562 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27488601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 29504645 - 29504884
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29504645 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29504744  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29504745 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29504844  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  29504845 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 29504884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 11 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 16940994 - 16940766
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16940994 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16940895  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16940894 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16940795  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtattt 239  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  16940794 gtggaaggaagacctttgattatgtattt 16940766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4528514 - 4528753
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  4528514 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaact 4528613  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4528614 acttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4528713  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4528714 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4528753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 29576243 - 29576482
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  29576243 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29576342  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  29576343 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 29576442  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  29576443 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 29576482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4776109 - 4776348
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  4776109 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgtgggccgatcttcaagct 4776208  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4776209 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctccc 4776308  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4776309 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4776348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 20171778 - 20172015
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  20171778 cagactgagaaacaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctac 20171877  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  20171878 tcaggaagaatcaacccattgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccat 20171977  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20171978 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 20172015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22164213 - 22163976
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22164213 cagactgagaaacaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgaccgcgacctgcgggccaattttcaagctac 22164114  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |    
T  22164113 tcaggaagaatcaacccattgtgtggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagtatcaagagttatctgcaggaaccacctatccttgtcccacccat 22164014  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  22164013 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 22163976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 136; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 83 - 250
Target Start/End: Original strand, 26992096 - 26992263
Alignment:
Q  83 ccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacct 182  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26992096 ccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaaagaatcagcctattctatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacct 26992195  T
Q  183 gctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26992196 gctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 26992263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33373306 - 33373159
Alignment:
Q  103 ttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcg 202  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  33373306 ttcaagctactcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttg 33373207  T
Q  203 tcccacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33373206 tcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 33373159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14142251 - 14142122
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  14142251 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 14142152  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14142151 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 14142122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 26789155 - 26789284
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26789155 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26789254  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789255 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 26789284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 27197524 - 27197653
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27197524 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27197623  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197624 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 27197653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27251711 - 27251582
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27251711 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27251612  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251611 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 27251582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8902560 - 8902431
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  8902560 aatcggcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcatgaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 8902461  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8902460 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 8902431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13521048 - 13520920
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  13521048 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccg-gaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 13520950  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520949 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 13520920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26775484 - 26775355
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26775484 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 26775385  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  26775384 ggcctttgattatgtatttggcagtatttg 26775355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27358967 - 27358838
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27358967 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27358868  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27358867 ggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27358838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27449310 - 27449181
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27449310 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27449211  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27449210 ggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27449181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 28163830 - 28163959
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28163830 aatcggcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 28163929  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    | ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28163930 gacctttgattatgtatttggcagtatttg 28163959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22455971 - 22455842
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  22455971 aatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtcccacccgtggaaggaa 22455872  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22455871 ggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 22455842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 9136279 - 9136101
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  9136279 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 9136180  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  9136179 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 9136101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 18119701 - 18119801
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  18119701 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 18119800  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  18119801 c 18119801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 23971734 - 23971634
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  ||||||| |||||| |||| || ||||||||||| || || || || || ||||||||| ||||    
T  23971734 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactgaattatatctccagatttatctctcacatgactgccacatgtggaccaattttcaagttact 23971635  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  23971634 c 23971634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 64)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4793701 - 4793463
Alignment:
Q  12 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagcta 111  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4793701 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagcta 4793602  T
Q  112 ctcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccg 211  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4793601 ctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 4793502  T
Q  212 tggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4793501 tggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4793463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8286535 - 8286298
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8286535 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 8286436  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8286435 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 8286336  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  8286335 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 8286298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 18333818 - 18334062
Alignment:
Q  6 agcagcacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttc 105  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18333818 agcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttc 18333917  T
Q  106 aagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  18333918 aagctactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcc 18334017  T
Q  206 cacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18334018 cacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18334062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21677896 - 21678135
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21677896 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 21677995  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21677996 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 21678095  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21678096 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 21678135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 6 - 250
Target Start/End: Original strand, 35883954 - 35884198
Alignment:
Q  6 agcagcacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttc 105  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  35883954 agcaccacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttc 35884053  T
Q  106 aagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcc 205  Q
    |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  35884054 aagctactcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcc 35884153  T
Q  206 cacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  35884154 cacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 35884198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15738161 - 15737922
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15738161 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15738062  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15738061 actcagaaagaatcagcctactgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15737962  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15737961 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 15737922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15889772 - 15889533
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889772 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15889673  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15889672 cctcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15889573  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15889572 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 15889533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 18054455 - 18054694
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18054455 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18054554  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18054555 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18054654  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18054655 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18054694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18274119 - 18273880
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18274119 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18274020  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18274019 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18273920  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18273919 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18273880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18289420 - 18289181
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18289420 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18289321  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18289320 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18289221  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18289220 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18289181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18304721 - 18304482
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  18304721 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 18304622  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18304621 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18304522  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18304521 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18304482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29145823 - 29145584
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29145823 cacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29145724  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29145723 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29145624  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  29145623 gtggagggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 29145584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 6205096 - 6205335
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6205096 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6205195  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  6205196 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgtcccaccc 6205295  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  6205296 gtggaaggaaggcccttgattatgtatttggcagtatttg 6205335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 8299164 - 8299403
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8299164 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8299263  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8299264 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8299363  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  8299364 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 8299403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4686848 - 4687087
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4686848 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4686947  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  4686948 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccaccc 4687047  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  4687048 gtggaaggaaggcccttgattatgtatttggcagtatttg 4687087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4724824 - 4725063
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4724824 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4724923  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||    
T  4724924 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgaaaccacctatccttgttccaccc 4725023  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| |||| ||||    
T  4725024 gtggaaggaaggcccttgattatgtatttggcagtatttg 4725063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 20069233 - 20069472
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20069233 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 20069332  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  20069333 actcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 20069432  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20069433 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 20069472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22384645 - 22384406
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22384645 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22384546  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22384545 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22384446  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22384445 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 22384406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 7076399 - 7076638
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7076399 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcgcatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagct 7076498  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  7076499 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 7076598  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  7076599 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 7076638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29662037 - 29661798
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29662037 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29661938  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29661937 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29661838  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  29661837 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 29661798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16621555 - 16621318
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16621555 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 16621456  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||    
T  16621455 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaacctcctatccttgtcccacccgt 16621356  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16621355 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 16621318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 18 - 250
Target Start/End: Original strand, 32442351 - 32442583
Alignment:
Q  18 cgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcaga 117  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  32442351 cgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcaga 32442450  T
Q  118 aaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaag 217  Q
    || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  32442451 aagaatcagtctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgcccgtggaag 32442550  T
Q  218 gaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  32442551 gaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 32442583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5593424 - 5593185
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  5593424 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 5593325  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5593324 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5593225  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  5593224 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 5593185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 10399337 - 10399576
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10399337 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10399436  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  10399437 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 10399536  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  10399537 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 10399576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28113021 - 28112782
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28113021 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacagcaacctgcgggccgatcttcaagct 28112922  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28112921 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28112822  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28112821 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 28112782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 8214928 - 8215167
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8214928 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8215027  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8215028 gctcagaaaaaatcagcctgttgtgtggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8215127  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  8215128 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 8215167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28024475 - 28024714
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28024475 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28024574  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  28024575 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 28024674  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28024675 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 28024714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28342370 - 28342609
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  28342370 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccgatcttcaagct 28342469  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28342470 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28342569  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28342570 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 28342609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 15 - 248
Target Start/End: Original strand, 19697687 - 19697920
Alignment:
Q  15 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19697687 gaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccaattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 19697786  T
Q  115 agaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgg 214  Q
    |  || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  19697787 aagaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcgtcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgg 19697886  T
Q  215 aaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtt 248  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19697887 aaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtt 19697920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 5016907 - 5017146
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5016907 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 5017006  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5017007 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5017106  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  5017107 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 5017146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 5470181 - 5470420
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  5470181 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 5470280  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  5470281 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 5470380  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5470381 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 5470420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5606381 - 5606142
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5606381 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5606282  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5606281 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5606182  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5606181 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 5606142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20573902 - 20573671
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||    
T  20573902 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgattttcaagctgcttagaa 20573803  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20573802 agaaccagcctattgtatggaatgaggaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 20573703  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  20573702 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 20573671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 47026646 - 47026885
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  47026646 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagct 47026745  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  47026746 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 47026845  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  47026846 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 47026885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6539809 - 6539570
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6539809 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6539710  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6539709 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6539610  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6539609 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 6539570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24331356 - 24331595
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24331356 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24331455  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24331456 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaaaaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24331555  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24331556 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 24331595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 4343743 - 4343514
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4343743 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4343644  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4343643 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4343544  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4343543 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttg 4343514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4420108 - 4420347
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4420108 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4420207  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  4420208 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 4420307  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  4420308 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 4420347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 7999753 - 7999992
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  7999753 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 7999852  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7999853 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 7999952  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  7999953 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 7999992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 10646266 - 10646505
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10646266 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10646365  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  10646366 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 10646465  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  10646466 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 10646505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22867915 - 22867676
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22867915 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22867816  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22867815 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 22867716  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22867715 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 22867676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22882974 - 22882735
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  22882974 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22882875  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  22882874 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 22882775  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22882774 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 22882735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 18245942 - 18246173
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  18245942 gagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaa 18246041  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18246042 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 18246141  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18246142 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18246173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31961522 - 31961283
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31961522 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31961423  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||    
T  31961422 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctattcttgtccctccc 31961323  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  31961322 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 31961283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 48469120 - 48469359
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  48469120 cacagacagagaaacaagtcataggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 48469219  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48469220 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 48469319  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  48469320 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 48469359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17982016 - 17981777
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17982016 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 17981917  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  17981916 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 17981817  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  17981816 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 17981777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 18228389 - 18228628
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  18228389 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18228488  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  18228489 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 18228588  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  18228589 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 18228628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 51785216 - 51785455
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  51785216 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 51785315  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  51785316 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 51785415  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  51785416 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 51785455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 158; E-Value: 3e-84
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11107419 - 11107230
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  11107419 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagct 11107320  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcct 200  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  11107319 actcagaaagagtcagcctattgtatggaatgaagaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatcct 11107230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 32293931 - 32294060
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  32293931 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 32294030  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294031 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 32294060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 121 - 245
Target Start/End: Original strand, 4627088 - 4627212
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  4627088 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 4627187  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagt 245  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||    
T  4627188 ggcctttgattatgtatttggcagt 4627212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 17992888 - 17992759
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  17992888 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 17992789  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17992788 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 17992759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31033193 - 31033064
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31033193 aatcagcctattatatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31033094  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31033093 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 31033064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 5714376 - 5714505
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5714376 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5714475  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  5714476 ggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 5714505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 5725286 - 5725415
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5725286 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5725385  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  5725386 ggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 5725415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5767082 - 5766953
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5767082 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 5766983  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  5766982 ggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 5766953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5950828 - 5950650
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  5950828 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaggattgcc 5950729  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  5950728 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 5950650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 50 - 114
Target Start/End: Original strand, 15918749 - 15918813
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  15918749 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcggaccgatattcaaactactc 15918813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 15592939 - 15592882
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||| ||||||| |||||    
T  15592939 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacagcaacgtgcaggccgatattcaa 15592882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Original strand, 20443349 - 20443406
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  20443349 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaa 20443406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 50 - 107
Target Start/End: Original strand, 41440475 - 41440532
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaa 107  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  41440475 tgaattacatctcccgtttcatctctcatatgactgcaacatgtgggccgatattcaa 41440532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 7089091 - 7088991
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  7089091 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 7088992  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  7088991 c 7088991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 11925422 - 11925322
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  11925422 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 11925323  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  11925322 c 11925322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 16431601 - 16431701
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  16431601 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 16431700  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  16431701 c 16431701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 23)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 18793935 - 18794174
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18793935 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18794034  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18794035 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18794134  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18794135 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18794174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27605890 - 27605651
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27605890 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27605791  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27605790 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27605691  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27605690 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27605651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 14560855 - 14561094
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14560855 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 14560954  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14560955 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14561054  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  14561055 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 14561094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2134245 - 2134006
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2134245 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 2134146  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  2134145 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccaccc 2134046  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2134045 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 2134006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 19691329 - 19691568
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19691329 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19691428  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19691429 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19691528  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19691529 gcggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 19691568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 29832557 - 29832796
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29832557 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 29832656  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  29832657 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 29832756  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  29832757 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 29832796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19205339 - 19205108
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |    
T  19205339 gagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagctactcagga 19205240  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19205239 agaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 19205140  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  19205139 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 19205108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 18712715 - 18712954
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  18712715 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagct 18712814  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18712815 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18712914  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18712915 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18712954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28358929 - 28358698
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28358929 gagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaa 28358830  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  28358829 agaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccatccgcggaagg 28358730  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28358729 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 28358698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 9357856 - 9358095
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  9357856 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 9357955  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9357956 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9358055  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  9358056 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 9358095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12089708 - 12089469
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12089708 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12089609  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12089608 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12089509  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12089508 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 12089469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 19677678 - 19677917
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19677678 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19677777  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19677778 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19677877  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19677878 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 19677917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 31357759 - 31357998
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31357759 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31357858  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| | ||| || || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31357859 acttaaaaagaaccaccctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31357958  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31357959 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 31357998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31486856 - 31486617
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  31486856 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 31486757  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  31486756 gcttagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 31486657  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  31486656 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 31486617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 33261965 - 33262204
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33261965 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 33262064  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  33262065 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 33262164  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33262165 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 33262204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Complemental strand, 22077896 - 22077659
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  22077896 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctgatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 22077797  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  22077796 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 22077697  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtt 248  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  22077696 gtggaaggaaggcccttgattatgtacttgacagtgtt 22077659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 15770915 - 15771044
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  15770915 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 15771014  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771015 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 15771044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 44564325 - 44564454
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44564325 aatcagcctattgtatagaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 44564424  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564425 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 44564454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 125 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21345042 - 21344917
Alignment:
Q  125 agcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcc 224  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21345042 agcctcttgtagggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcc 21344943  T
Q  225 tttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    || |||||||||||||||||||||||    
T  21344942 ttcgattttgtatttgtcagtgtttg 21344917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 72
Target Start/End: Original strand, 16286632 - 16286694
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcg-ggcgtttgaattacatctcccgattcata 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  16286632 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgagacgattgaattacatctcccgattcata 16286694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 113
Target Start/End: Original strand, 19844401 - 19844500
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||| |||| |||||||| ||||| || || || || || ||||||||| ||||    
T  19844401 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagattgaactacatctccagatttatatctcatatgactgccacatgtggaccaattttcaagttact 19844500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 14212273 - 14212373
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  14212273 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 14212372  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  14212373 c 14212373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 22412172 - 22412272
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  22412172 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 22412271  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  22412272 c 22412272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10913778 - 10913539
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10913778 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10913679  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10913678 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 10913579  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  10913578 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 10913539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 2157803 - 2158042
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2157803 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2157902  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2157903 actgaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 2158002  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2158003 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 2158042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26534782 - 26534543
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26534782 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatttcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26534683  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26534682 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26534583  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  26534582 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 26534543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 10844851 - 10845088
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10844851 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10844950  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  10844951 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctgtaaccacctatccttgtcccacccgt 10845050  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10845051 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 10845088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 5131225 - 5131464
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5131225 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5131324  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5131325 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5131424  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5131425 gtggaagggaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 5131464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26271995 - 26271756
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26271995 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26271896  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26271895 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcctttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26271796  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26271795 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 26271756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 2107072 - 2106833
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2107072 cacataccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2106973  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2106972 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 2106873  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2106872 gtggaaggaagacctttgattatgtatttggcagtatttg 2106833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5144249 - 5144010
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5144249 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5144150  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5144149 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5144050  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  5144049 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 5144010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11421688 - 11421449
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11421688 cacagaccgagaagcaagtcagagggttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11421589  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11421588 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11421489  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11421488 gtggaaggaagacctttgattatgtatttggcagtatttg 11421449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 22145424 - 22145663
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22145424 cacagaccgagaaacaagttagaggtttcctcggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22145523  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22145524 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22145623  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  22145624 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 22145663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16515337 - 16515100
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  16515337 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggctgatcttcaagctac 16515238  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16515237 tcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaatcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 16515138  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16515137 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 16515100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26316757 - 26316518
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26316757 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 26316658  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26316657 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26316558  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26316557 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 26316518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 26438486 - 26438725
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438486 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 26438585  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26438586 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 26438685  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  26438686 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 26438725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 26516029 - 26516260
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  26516029 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaagga 26516128  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26516129 agaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 26516228  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  26516229 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 26516260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 4142155 - 4141916
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  4142155 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 4142056  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4142055 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4141956  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4141955 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 4141916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 4202618 - 4202857
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4202618 cacagacagagaagcaagttagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 4202717  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4202718 actcagaaagagccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 4202817  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  4202818 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 4202857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 45390449 - 45390688
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||    
T  45390449 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaaact 45390548  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45390549 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 45390648  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  45390649 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 45390688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 10842901 - 10842664
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10842901 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgcattacatctcccgatttatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 10842802  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  10842801 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 10842702  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10842701 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 10842664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 16044550 - 16044786
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  16044550 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 16044649  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  16044650 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaggcttttaatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 16044749  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16044750 ggaaggaa-gcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 16044786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16446913 - 16446676
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16446913 cagaccgagacacaagtaagaggtttcctcgggtgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcaggccgatcttcaagctac 16446814  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16446813 tcaggaagaatcagactattgtatggaacgatgaatgccaaggggcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 16446714  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16446713 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 16446676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26666823 - 26666584
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  26666823 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 26666724  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  26666723 acttagaaagaaccagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgttccaccc 26666624  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26666623 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 26666584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 3448535 - 3448774
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  3448535 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3448634  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  3448635 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 3448734  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  3448735 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 3448774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 11444116 - 11444355
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11444116 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11444215  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11444216 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11444315  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  11444316 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 11444355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16748418 - 16748187
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| |    
T  16748418 gagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgtgggccgatcttcaagctactcagga 16748319  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748318 agaatcaacctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 16748219  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16748218 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 16748187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31561291 - 31561060
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  31561291 gagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaactacttagaa 31561192  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31561191 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 31561092  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  31561091 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 31561060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24589443 - 24589204
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24589443 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24589344  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||| |||||||||    
T  24589343 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaatcacctatccttgtcccaccc 24589244  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  24589243 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 24589204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 11 - 160
Target Start/End: Original strand, 9621879 - 9622028
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9621879 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 9621978  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagctt 160  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9621979 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagctt 9622028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 2776593 - 2776722
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  2776593 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 2776692  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776693 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 2776722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26512495 - 26512366
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26512495 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26512396  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512395 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 26512366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 26681905 - 26681776
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  26681905 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 26681806  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681805 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 26681776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 31127246 - 31127375
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31127246 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31127345  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127346 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 31127375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 45734652 - 45734781
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  45734652 aatcggcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 45734751  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  45734752 gacctttgattttgtatttgtcagtgtttg 45734781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31087421 - 31087292
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31087421 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31087322  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087321 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 31087292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39209938 - 39209809
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  39209938 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 39209839  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209838 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 39209809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 9469590 - 9469768
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  9469590 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 9469689  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  9469690 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 9469768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 16393302 - 16393124
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  16393302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaagtattgtgtggaccgaagattgcc 16393203  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  16393202 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 16393124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30369814 - 30369636
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  30369814 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 30369715  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  30369714 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 30369636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 125
Target Start/End: Original strand, 25726729 - 25726840
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| ||||||||||| ||||||||  | ||  | |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||||| || || || |||||||| |||||| ||||    
T  25726729 agactgagaagcaagttagaggttttttaggaaggttgaattatatctccagattcatctctcatatgactgccacatgtgggccgatattcaagttact 25726828  T
Q  114 cagaaaaaatca 125  Q
    ||| ||| ||||    
T  25726829 cagtaaagatca 25726840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 2556767 - 2556867
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  2556767 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 2556866  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  2556867 c 2556867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 15193315 - 15193415
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  15193315 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 15193414  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  15193415 c 15193415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 16127724 - 16127624
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  16127724 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 16127625  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  16127624 c 16127624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16287249 - 16287193
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttca 106  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  16287249 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggccgatattca 16287193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 29089748 - 29089848
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  29089748 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 29089847  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  29089848 c 29089848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 3)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 3301 - 3538
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3301 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 3400  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3401 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 3500  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  3501 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 3538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 11 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 44015 - 43871
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44015 cacagacccagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 43916  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaga 155  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  43915 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaaga 43871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 13 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 32167 - 32096
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacc 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32167 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgacc 32096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 28)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 14668261 - 14668490
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14668261 cacagaccgagaagcaagtcagagatttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 14668360  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14668361 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14668460  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14668461 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttg 14668490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 6573103 - 6573342
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6573103 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6573202  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6573203 acttagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6573302  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  6573303 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 6573342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 14760330 - 14760091
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  14760330 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 14760231  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14760230 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14760131  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  14760130 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 14760091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 17016291 - 17016530
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17016291 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 17016390  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17016391 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 17016490  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  17016491 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 17016530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 34185984 - 34185745
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  34185984 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagct 34185885  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34185884 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34185785  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  34185784 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 34185745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24589385 - 24589146
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24589385 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24589286  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  24589285 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtcccaccc 24589186  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24589185 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24589146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 54836636 - 54836875
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  54836636 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtctgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 54836735  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54836736 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 54836835  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  54836836 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 54836875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 5009120 - 5009359
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5009120 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5009219  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5009220 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 5009319  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  5009320 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 5009359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 15 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20335441 - 20335206
Alignment:
Q  15 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20335441 gaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactc 20335342  T
Q  115 agaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgg 214  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  20335341 agaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtag 20335242  T
Q  215 aaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  20335241 aaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 20335206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24115907 - 24116146
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24115907 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24116006  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  24116007 actcagaaagaatcagcctgtcgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccccctatccttgtcccaccc 24116106  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24116107 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24116146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15281959 - 15281722
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15281959 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 15281860  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15281859 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagatttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 15281760  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15281759 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 15281722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18314202 - 18313963
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18314202 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18314103  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18314102 actgagcaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18314003  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18314002 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18313963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 36341541 - 36341302
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36341541 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 36341442  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36341441 actcagaaagaatcagcctatcgtatggaatgatgaaagccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 36341342  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  36341341 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 36341302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 12 - 250
Target Start/End: Original strand, 1903500 - 1903738
Alignment:
Q  12 acagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagcta 111  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  1903500 acagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcagcctgcgggccgatcttcaagtta 1903599  T
Q  112 ctcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccg 211  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1903600 ctcaggaagaatcagcctattgtatggaacgttgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccg 1903699  T
Q  212 tggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1903700 tggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 1903738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 15231117 - 15231355
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15231117 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15231216  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15231217 actcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 15231316  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgttt 249  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  15231317 gtggaaggaagacctttgattatgtatttgtcagtgttt 15231355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 27160341 - 27160102
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  27160341 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 27160242  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27160241 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 27160142  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27160141 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27160102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31123536 - 31123297
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31123536 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31123437  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31123436 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31123337  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31123336 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 31123297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 33670824 - 33670585
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33670824 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatcgcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33670725  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33670724 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33670625  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33670624 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 33670585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 39853890 - 39854121
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| || |||||||| || ||||    
T  39853890 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccacaacctgcgggcctatcttcaagctgcttagaa 39853989  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39853990 agaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 39854089  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  39854090 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 39854121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 21972946 - 21973185
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  21972946 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 21973045  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21973046 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 21973145  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21973146 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 21973185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30757005 - 30757244
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30757005 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30757104  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30757105 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30757204  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30757205 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 30757244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 14101788 - 14102027
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  14101788 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 14101887  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14101888 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 14101987  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  14101988 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 14102027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18797630 - 18797399
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||    
T  18797630 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctgcttagaa 18797531  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18797530 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaagtacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 18797431  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  18797430 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 18797399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 40102661 - 40102422
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40102661 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 40102562  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40102561 actaaggaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 40102462  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  40102461 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 40102422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 150; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 11 - 236
Target Start/End: Complemental strand, 15388402 - 15388177
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  15388402 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 15388303  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  15388302 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 15388203  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgta 236  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||    
T  15388202 gtggaaggaaggcccttgattatgta 15388177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 103 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 24459687 - 24459636
Alignment:
Q  103 ttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaag 154  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24459687 ttcaagctactcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaag 24459636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 14725820 - 14725720
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  14725820 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 14725721  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  14725720 c 14725720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 19767587 - 19767687
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  19767587 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 19767686  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  19767687 c 19767687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30525 - 30764
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30525 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30624  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30625 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30724  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30725 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 30764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 19304 - 19541
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19304 cagaccgagaaacaagttagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19403  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19404 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19503  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19504 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 19541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 7302 - 7431
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7302 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 7401  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  7402 ggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 7431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 58)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 11552594 - 11552833
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11552594 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11552693  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11552694 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11552793  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11552794 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 11552833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 23629209 - 23629448
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23629209 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagct 23629308  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23629309 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 23629408  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23629409 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 23629448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 33295767 - 33296006
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33295767 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33295866  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33295867 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33295966  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33295967 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 33296006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 33780728 - 33780967
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33780728 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33780827  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  33780828 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccaccc 33780927  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  33780928 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 33780967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 43081494 - 43081733
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43081494 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 43081593  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43081594 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 43081693  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43081694 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 43081733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 15655679 - 15655440
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15655679 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 15655580  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  15655579 actcagaaagaatcagcccattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccgccc 15655480  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  15655479 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 15655440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22996038 - 22995799
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22996038 cacagactgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 22995939  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22995938 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 22995839  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  22995838 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 22995799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 24685066 - 24684827
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  24685066 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 24684967  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24684966 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24684867  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24684866 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24684827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 41677944 - 41678183
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    
T  41677944 cacagaccgagaagcaagttagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 41678043  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  41678044 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 41678143  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  41678144 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 41678183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24973145 - 24973384
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24973145 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24973244  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24973245 acttagaaagaatcagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 24973344  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24973345 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24973384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Original strand, 22891707 - 22891941
Alignment:
Q  16 accgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactca 115  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22891707 accgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgcggcccgatcttcaagctactca 22891806  T
Q  116 gaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgga 215  Q
    | || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  22891807 ggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtgga 22891906  T
Q  216 aggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22891907 aggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 22891941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 9320715 - 9320954
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9320715 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 9320814  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9320815 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9320914  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  9320915 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 9320954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 12135414 - 12135653
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  12135414 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 12135513  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12135514 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12135613  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  12135614 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 12135653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 26483633 - 26483872
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  26483633 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccgatcttcaagct 26483732  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26483733 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 26483832  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  26483833 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 26483872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28652481 - 28652720
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28652481 cacagaccgagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 28652580  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28652581 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28652680  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28652681 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 28652720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 191; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 249
Target Start/End: Original strand, 34619757 - 34619995
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34619757 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34619856  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  34619857 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 34619956  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgttt 249  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  34619957 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgttt 34619995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 23895447 - 23895684
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23895447 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 23895546  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23895547 tcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttatgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 23895646  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23895647 ggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 23895684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18497646 - 18497407
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18497646 cacagacagagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 18497547  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18497546 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18497447  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  18497446 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 18497407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30937874 - 30938113
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30937874 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30937973  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  30937974 actgaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcaccaagagttacctgctggaaccacatatccttgtcccaccc 30938073  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  30938074 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 30938113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 31434703 - 31434942
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||||    
T  31434703 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagct 31434802  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31434803 actcagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31434902  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31434903 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 31434942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 3792780 - 3793009
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  3792780 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 3792879  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||    
T  3792880 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccaccc 3792979  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3792980 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttg 3793009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 8662396 - 8662157
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  8662396 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 8662297  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8662296 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 8662197  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8662196 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 8662157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 28956706 - 28956467
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  28956706 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 28956607  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  28956606 gcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 28956507  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  28956506 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 28956467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30032667 - 30032906
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30032667 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatctttaagct 30032766  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30032767 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30032866  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30032867 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 30032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30155270 - 30155509
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  30155270 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 30155369  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30155370 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30155469  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  30155470 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 30155509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 30171708 - 30171947
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  30171708 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 30171807  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30171808 gcttagaaaaaaccagcctattgtatggaatgatgagtgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 30171907  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  30171908 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 30171947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 32593195 - 32592956
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32593195 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctctcggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 32593096  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  32593095 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 32592996  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  32592995 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 32592956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 33519619 - 33519858
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  33519619 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 33519718  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33519719 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 33519818  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  33519819 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 33519858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37355564 - 37355325
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37355564 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 37355465  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37355464 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37355365  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  37355364 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 37355325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 25203519 - 25203756
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  25203519 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25203618  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25203619 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25203718  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25203719 ggaaggaaggcctttgattatgtacttgtcagtgtttg 25203756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 25267674 - 25267911
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||    
T  25267674 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccaatcttcaagctac 25267773  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25267774 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 25267873  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  25267874 ggaaggaaggcctttgattatgtacttgtcagtgtttg 25267911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 40470463 - 40470242
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  40470463 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaa 40470364  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  40470363 agaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggagccccctatccttgtcccacccgtggaagg 40470264  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  40470263 aaggcctttgattatgtatttg 40470242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37668407 - 37668168
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37668407 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37668308  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37668307 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37668208  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  37668207 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 37668168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 11 - 240
Target Start/End: Original strand, 37758222 - 37758451
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37758222 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37758321  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37758322 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37758421  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37758422 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttg 37758451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 2514301 - 2514540
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2514301 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 2514400  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  2514401 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagagttacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 2514500  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  2514501 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 2514540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18372455 - 18372216
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  18372455 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 18372356  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18372355 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 18372256  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  18372255 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 18372216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24586613 - 24586852
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24586613 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24586712  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24586713 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 24586812  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  24586813 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 24586852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31823328 - 31823089
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  31823328 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 31823229  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  31823228 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 31823129  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  31823128 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 31823089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13321751 - 13321512
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  13321751 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 13321652  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  13321651 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 13321552  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13321551 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 13321512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37767912 - 37767673
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  37767912 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaaact 37767813  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37767812 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37767713  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| || |||| ||||    
T  37767712 gtggaaggaaggcctttgattatgtatctggcagtatttg 37767673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 15755765 - 15755545
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15755765 gagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaa 15755666  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15755665 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 15755566  T
Q  219 aaggcctttgattttgtattt 239  Q
    ||||||||||||  |||||||    
T  15755565 aaggcctttgatcatgtattt 15755545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 5641027 - 5641266
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5641027 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 5641126  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  5641127 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 5641226  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  5641227 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 5641266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 24727208 - 24727447
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  24727208 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 24727307  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24727308 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 24727407  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  24727408 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 24727447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 6877544 - 6877783
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  6877544 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagtt 6877643  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6877644 acttagaaagaaccagcctgttgtatgggatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 6877743  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  6877744 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 6877783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13183622 - 13183475
Alignment:
Q  103 ttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcg 202  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  13183622 ttcaagctactcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaattccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgttggaaccacctatccttg 13183523  T
Q  203 tcccacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13183522 tcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 13183475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9547520 - 9547391
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  9547520 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagtatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 9547421  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547420 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 9547391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 29888008 - 29887879
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||    
T  29888008 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtctcatccgtggaaggaa 29887909  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887908 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 29887879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13439494 - 13439365
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13439494 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 13439395  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13439394 ggcctttgattatgtatttggcagtatttg 13439365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 33878480 - 33878608
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  33878480 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccg-gaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 33878578  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878579 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 33878608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 11326986 - 11327115
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  11326986 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctagaaccacctatccttgtccctcccatggaaggaa 11327085  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327086 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 11327115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 102; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 18125227 - 18125098
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  18125227 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 18125128  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  18125127 ggcctttgattatgtatttggcagtatttg 18125098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 15784605 - 15784427
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||||||||  || |||||||    
T  15784605 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtatggaccgaagaatgcc 15784506  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || ||||| || ||||||||    
T  15784505 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaagggagacctttgat 15784427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 11944302 - 11944124
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  11944302 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 11944203  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  11944202 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 11944124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 17957376 - 17957554
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  17957376 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 17957475  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  17957476 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 17957554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 5440105 - 5439927
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||  ||||  || || ||||    
T  5440105 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgcgtggaccgaagattgcc 5440006  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  5440005 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 5439927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 36375842 - 36375780
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  36375842 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 36375780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 52 - 114
Target Start/End: Complemental strand, 37000496 - 37000434
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactc 114  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  37000496 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactc 37000434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 34468900 - 34468956
Alignment:
Q  50 tgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttca 106  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||    
T  34468900 tgaattacatctcccgtttcatttctcatatgactgcaacatgtgggccgatattca 34468956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 34294385 - 34294624
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34294385 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34294484  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  34294485 actcagaaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 34294584  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  34294585 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 34294624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11632197 - 11631958
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11632197 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11632098  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11632097 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11631998  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  11631997 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 11631958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23125581 - 23125342
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23125581 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 23125482  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  23125481 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaaaaattacctgctggaaccacctatccttgtgccaccc 23125382  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  23125381 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 23125342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 12658767 - 12659006
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12658767 cacaaaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12658866  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12658867 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 12658966  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  12658967 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 12659006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 13933552 - 13933321
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  13933552 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactaagga 13933453  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13933452 agaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 13933353  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  13933352 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 13933321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 20841144 - 20841383
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20841144 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 20841243  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20841244 actcagaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtcccaccc 20841343  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
     |||||||||||||||||||| |||| ||| |||| ||||    
T  20841344 atggaaggaaggcctttgattatgtacttggcagtatttg 20841383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 13 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 27431452 - 27431225
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27431452 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgattgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 27431353  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27431352 tcagaaagaattagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgt 27431253  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttg 240  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27431252 ggaaggaaggcctttgattatgtatttg 27431225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37948875 - 37948636
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37948875 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 37948776  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37948775 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37948676  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  37948675 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 37948636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 39893300 - 39893539
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  39893300 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 39893399  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39893400 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 39893499  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  39893500 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 39893539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 27806942 - 27807173
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  27806942 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctgcttagaa 27807041  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27807042 agaaccagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 27807141  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  27807142 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 27807173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 39048832 - 39048593
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39048832 cacagactgagaagcaagtaagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 39048733  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39048732 actaaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 39048633  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  39048632 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 39048593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19453434 - 19453197
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19453434 cagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 19453335  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||    
T  19453334 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatggcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgt 19453235  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19453234 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtgtttg 19453197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 12590047 - 12590278
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12590047 gagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactcagaa 12590146  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  12590147 agaaccagcctgttgtatggaacgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 12590246  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  12590247 aaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 12590278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28885438 - 28885677
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  28885438 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccggtcttcaagct 28885537  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28885538 actcagaaagaatcaacctattgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28885637  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| ||| || |||||||| |||| ||||    
T  28885638 gtggaaggaaggcccttggttatgtatttggcagtatttg 28885677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21700181 - 21699945
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21700181 cagaccgagaaacaa-tcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctac 21700083  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  21700082 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccaccaatccttgtcccacccgt 21699983  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  21699982 ggaaggaaggcctttgattatgtatttgtcagtatttg 21699945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 9346991 - 9346760
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  9346991 gagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaa 9346892  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  9346891 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgacagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 9346792  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  9346791 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 9346760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16826351 - 16826112
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16826351 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16826252  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16826251 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16826152  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16826151 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 16826112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 16895129 - 16895368
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16895129 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 16895228  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16895229 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16895328  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  16895329 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 16895368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 31879517 - 31879756
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31879517 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 31879616  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31879617 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 31879716  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  31879717 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 31879756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 37380908 - 37381147
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  37380908 cacagaccgagaaacaagtcagaggtttcctcggacacttgaattacatctcccggttcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37381007  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37381008 actcaggaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37381107  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  37381108 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 37381147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37682908 - 37682669
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37682908 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37682809  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37682808 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37682709  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37682708 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 37682669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 37698173 - 37697934
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37698173 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37698074  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37698073 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37697974  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37697973 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 37697934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 37928600 - 37928839
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  37928600 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 37928699  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37928700 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 37928799  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  37928800 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 37928839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 40236739 - 40236978
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40236739 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 40236838  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40236839 gcttagaaagaaccagcctattgtatggaataatgaatgccaagaagctttcgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 40236938  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  40236939 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 40236978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 19413514 - 19413275
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19413514 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 19413415  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  19413414 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 19413315  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  19413314 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 19413275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 32053034 - 32053273
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  32053034 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 32053133  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  32053134 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 32053233  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  32053234 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 32053273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 257658 - 257427
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||    
T  257658 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcggaccgatcttcaagctgcttagaa 257559  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  257558 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 257459  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  257458 aaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 257427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21674180 - 21673949
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21674180 gagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaa 21674081  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21674080 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 21673981  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21673980 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 21673949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 34864915 - 34865154
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  34864915 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 34865014  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  34865015 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctccc 34865114  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  34865115 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 34865154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 12713614 - 12713375
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  12713614 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 12713515  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  12713514 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctactggaaccacctatccttgtccctccc 12713415  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  12713414 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 12713375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 154; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 11 - 248
Target Start/End: Original strand, 27394793 - 27395030
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  |    
T  27394793 cacagaccgaaaagcaagtccgaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccaattttcaaatt 27394892  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||     
T  27394893 actcagaaagaatcaacctattgtgtggaataatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaaagattatctgctggaaccacctatccttgtcccgcca 27394992  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtt 248  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||    
T  27394993 gtggaaggaaggcccttgattatgtacttgacagtgtt 27395030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 27119865 - 27119994
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27119865 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaa 27119964  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27119965 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 27119994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 16164821 - 16164950
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  16164821 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 16164920  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16164921 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 16164950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 27779575 - 27779704
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27779575 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27779674  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779675 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 27779704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 27819332 - 27819461
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  27819332 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 27819431  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819432 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 27819461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 3785834 - 3785963
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  3785834 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattaactgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 3785933  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3785934 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 3785963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 31890394 - 31890265
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  31890394 aatcagcctattgtatggaacaatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 31890295  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31890294 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 31890265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 22925051 - 22924922
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  22925051 aatcaacctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 22924952  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924951 gacctttgattttgtatttgtcagtgtttg 22924922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 4e-53
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 34158185 - 34158314
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  34158185 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 34158284  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  34158285 ggcctctgattttgtatatgtcagtgtttg 34158314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 161 - 250
Target Start/End: Original strand, 27827841 - 27827930
Alignment:
Q  161 ttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  27827841 ttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 27827930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 12383932 - 12384110
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  12383932 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 12384031  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  12384032 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 12384110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 22949665 - 22949843
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||| | ||   |||||| ||||  || || ||||    
T  22949665 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaagaacaaggtattgtgtggaccgaagattgcc 22949764  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| || || ||| |||| |||||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||||    
T  22949765 agaaggcttttgacagcataaaaaagtacttgctagaaccaccgattctcatccctccagttgaaggaagacctttgat 22949843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 34701310 - 34701410
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  34701310 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 34701409  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  34701410 c 34701410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 42393769 - 42393869
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  42393769 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacgtgtggaccaattttcaagttact 42393868  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  42393869 c 42393869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 21894765 - 21894534
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21894765 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctacttagaa 21894666  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21894665 agaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 21894566  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  21894565 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 21894534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 20339320 - 20339086
Alignment:
Q  16 accgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  20339320 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 20339221  T
Q  116 gaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgga 215  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20339220 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 20339121  T
Q  216 aggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  20339120 aggaaggcctttgattatgtatttgtcaatgtttg 20339086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 10948311 - 10948550
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10948311 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 10948410  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10948411 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 10948510  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10948511 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 10948550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Original strand, 10965907 - 10966138
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  10965907 gagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccaatcttcaagctactcagga 10966006  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10966007 agaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 10966106  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  10966107 aaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 10966138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 20464212 - 20464449
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  20464212 cagaccgagaaacaagtctgaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctacgggccgatcttcaagctac 20464311  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  20464312 tcaggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaacacctatccttgtcccacccgt 20464411  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20464412 ggaaggaagacctttaattatgtatttgtcagtgtttg 20464449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 7e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 16205055 - 16204819
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16205055 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcagacgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctact 16204956  T
Q  114 cagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtg 213  Q
    ||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16204955 caggaagaatcagcctattgtatggaacgatgactgccaaagagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtg 16204856  T
Q  214 gaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16204855 gaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 16204819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 28588219 - 28588458
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28588219 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtctgaattacatctcccggttcatatctcatatgaccgcaacctgtgggccgattttcaagct 28588318  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
     || ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28588319 gcttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 28588418  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  28588419 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 28588458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 19 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 41790326 - 41790095
Alignment:
Q  19 gagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaa 118  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||    
T  41790326 gagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagctacttagaa 41790227  T
Q  119 aaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaagg 218  Q
    | || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41790226 agaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccacccgtggaagg 41790127  T
Q  219 aaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  41790126 aaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 41790095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 51641452 - 51641691
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||    
T  51641452 cacagacagagaagcaagtcagaggcttcctcggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcacatgaccgcaacttgcgggccaatcttcaagct 51641551  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51641552 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 51641651  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  51641652 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 51641691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 3644366 - 3644608
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3644366 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 3644465  T
Q  111 actcagaaaa-aatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc-aagaagcttttgatagcatc-aagaattacctgctggaaccacctatcctcgtccca 207  Q
     || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  3644466 gcttagaaaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaagaagcttttgatagcatcaaagaattacttgttggaaccacctatccttgtccca 3644565  T
Q  208 cccgtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  3644566 cccgtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 3644608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 121 - 250
Target Start/End: Original strand, 28153080 - 28153209
Alignment:
Q  121 aatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  28153080 aatcagcctattgtatggaacgatgaatgccaggaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtccctcccgtggaaggaa 28153179  T
Q  221 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153180 ggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 28153209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 9268 - 9507
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9268 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 9367  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9368 actcagaaagaatcagcctgttgtatggaatgatgaatgtcaagaagcttttgatagcatcaagagttacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9467  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  9468 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 9507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0260 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0260
Description:

Target: scaffold0260; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 16 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 1643 - 1409
Alignment:
Q  16 accgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactca 115  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  1643 accgaaaagcaagtcagaggtttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagctactca 1544  T
Q  116 gaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtgga 215  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  1543 ggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaaggagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaacctcctatccttgtcccacccgtgga 1444  T
Q  216 aggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  1443 aggaaggcctttgattatgtatttgtcaatgtttg 1409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 15813 - 16052
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  15813 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgtgggccgatcttcaagct 15912  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15913 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattatctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 16012  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  16013 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 16052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 12803 - 13042
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  12803 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcctgggacgcttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccaatcttcaagct 12902  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12903 actcagaaaaaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttatcccaccc 13002  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||| ||||    
T  13003 gtggaaggaaggcctttgatcatgtatttggcagtatttg 13042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 184; Significance: 1e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 11181 - 11420
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11181 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11280  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11281 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11380  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11381 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 11420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Original strand, 9254 - 9493
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  9254 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 9353  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9354 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 9453  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  9454 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 9493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 11952 - 11713
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11952 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgactgcaacctgcgggccgatcttcaagct 11853  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||| ||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11852 acttagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 11753  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||    
T  11752 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtatttg 11713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 180; Significance: 3e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 23215 - 22976
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||||||    
T  23215 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctctcgattcatatctcatatgactgcaacttgcgggccaatcttcaagct 23116  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23115 actcaggaagaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccaccc 23016  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  23015 gtggaaggaaggcctttgattatgtatttggcagtgtttg 22976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 168; Significance: 4e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 11 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 6203 - 5964
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6203 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 6104  T
Q  111 actcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccaccc 210  Q
    ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||    
T  6103 actcagaaagaaccagcctgttgtatggaatgatgaatgccaagaggcttttgatagtatcaagaattacttgttggaaccacctatccttgtcccaccc 6004  T
Q  211 gtggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||| |||||  |||||||| |||| ||||    
T  6003 gtggaaggaaggccgttgatcatgtatttggcagtatttg 5964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 83
Target Start/End: Original strand, 23111 - 23183
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgac 83  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  23111 cacagacagagaagcaagtcagaggtttcttgggacgtttgaattacatctcccgattcatatctcatatgac 23183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Original strand, 9279 - 9516
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  9279 cagaccgagaaacaagtcagaggcttcctcgggcgattgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagttac 9378  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    || | || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||    
T  9379 tctggaagaatcagcctattgtatggaacgatgaatgtcaaggggcttttgataacatcaagaattacctgctggaaccacctatccttgtcccacttgt 9478  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9479 ggaaggaaggcctttgattatgtatctgtcagtgtttg 9516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 134; Significance: 7e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 13 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 5693 - 5456
Alignment:
Q  13 cagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctac 112  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||    
T  5693 cagactgagaagcaagtcagaggttttctcgggcgtttgaattatatctcaaggttcatatctcacatgactgccacctgcgggccgatcttcaagctac 5594  T
Q  113 tcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgccaagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgt 212  Q
    |||| |||||||| ||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||    
T  5593 tcaggaaaaatcaacctgtggtatgaaatgatgaatgccaagaggcttttgatagcatcaagaattacctgttagagccacctatccttgtcccacctgt 5494  T
Q  213 ggaaggaaggcctttgattttgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||| | |||||  ||||| | ||||||||||    
T  5493 ggaaggaaggtcgttgatcatgtatctatcagtgtttg 5456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 112; Significance: 1e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 14 - 250
Target Start/End: Complemental strand, 43762 - 43513
Alignment:
Q  14 agaccgagaa-gcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaa-ttacatctcccgattcatatctcacatgaccgc-aacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  43762 agaccgagaaagcaagtcagaggtttcctcggacgcttaaaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaaacctgcgggccgatcttcaagct 43663  T
Q  111 ac-tcagaaaaaatcag-cctattgtatggaatga--tgaatgccaagaagctttt--gatagcatcaag-aattacctgctggaaccacc-tatcctcg 202  Q
    || | ||||| |||||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |    
T  43662 actttagaaagaatcagtcctattgtatggaattaattgaatgccaagaagctttttgtatagcatcaagaaattacctgctggaaccaccttatccttg 43563  T
Q  203 tcccacccgtggaaggaaggcc-tttgattt-tgtatttgtcagtgtttg 250  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||    
T  43562 tcccacccgtggaaggaaggccttttgatttatgtatttggcagtatttg 43513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1888 (Bit Score: 85; Significance: 1e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold1888
Description:

Target: scaffold1888; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 11 - 119
Target Start/End: Original strand, 1155 - 1263
Alignment:
Q  11 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagct 110  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1155 cacagaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgaacgaatgaataacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgatcttcaagct 1254  T
Q  111 actcagaaa 119  Q
    |||||||||    
T  1255 actcagaaa 1263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 44; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 18 - 86
Target Start/End: Original strand, 33699 - 33770
Alignment:
Q  18 cgagaagcaagtcagaggtttcctc-gggcgtttgaattacatctcccga-ttc-atatctcacatgaccgc 86  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33699 cgagaaacaagtcagaggtttcctcggggcgtttgaattacatctcccgacttctatatctcacatgaccgc 33770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 230
Target Start/End: Original strand, 29443 - 29621
Alignment:
Q  52 aattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctactcagaaaaaatcagcctattgtatggaatgatgaatgcc 151  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||| | ||||| ||   |||||| |||| ||| || ||||    
T  29443 aattacatctcccggttcatttctcatatgactgcaacttgtgggccgatattcaaactactccgcaaaaaacaaggtattgtgtggactgaagattgcc 29542  T
Q  152 aagaagcttttgatagcatcaagaattacctgctggaaccacctatcctcgtcccacccgtggaaggaaggcctttgat 230  Q
    |  | |||||||| ||||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||  |||| || || |||||||| ||||||||    
T  29543 agaaggcttttgacagcataaagaagtacttgctagaaccaccgattcttatccctccagttgaaggaagacctttgat 29621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 25 - 107
Target Start/End: Complemental strand, 35250 - 35168
Alignment:
Q  25 caagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaa 107  Q
    ||||| ||||| || ||||| ||  |||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  35250 caagtaagagggtttctcggacgactgaattacatctcccgtttcatttctcatatgacggcaacgtgcgggccgatattcaa 35168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 114
Target Start/End: Original strand, 10453 - 10553
Alignment:
Q  14 agaccgagaagcaagtcagaggtttcctcgggcgtttgaattacatctcccgattcatatctcacatgaccgcaacctgcgggccgattttcaagctact 113  Q
    |||| |||||||||||||||||||| || ||  |  | ||||| |||||| |||| || |||||||||||||| || || || || ||||||||| ||||    
T  10453 agacagagaagcaagtcagaggttttcttggtagactcaattatatctccagatttatctctcacatgaccgccacatgtggaccaattttcaagttact 10552  T
Q  114 c 114  Q
    |    
T  10553 c 10553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University