View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15528_high_9 (Length: 237)

Name: NF15528_high_9
Description: NF15528
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15528_high_9
NF15528_high_9
[»] scaffold0143 (3 HSPs)
scaffold0143 (1-228)||(7560-7787)
scaffold0143 (1-228)||(19670-19897)
scaffold0143 (1-228)||(30893-31120)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (1-228)||(9622-9849)
[»] chr8 (25 HSPs)
chr8 (1-228)||(15771173-15771400)
chr8 (5-228)||(19204752-19204975)
chr8 (5-228)||(31358131-31358354)
chr8 (3-228)||(44564585-44564810)
chr8 (1-228)||(18713083-18713310)
chr8 (5-228)||(28358342-28358565)
chr8 (1-228)||(9358224-9358451)
chr8 (1-228)||(29832925-29833152)
chr8 (10-228)||(14561232-14561450)
chr8 (10-228)||(19691706-19691924)
chr8 (10-227)||(19678055-19678272)
chr8 (1-228)||(2133650-2133877)
chr8 (1-228)||(19657731-19657958)
chr8 (10-228)||(18794312-18794530)
chr8 (1-228)||(12089113-12089340)
chr8 (1-228)||(27605295-27605522)
chr8 (1-228)||(33262333-33262560)
chr8 (10-224)||(31486265-31486479)
chr8 (10-228)||(33245977-33246195)
chr8 (19-228)||(21344561-21344770)
chr8 (34-227)||(22077316-22077509)
chr8 (5-131)||(22412541-22412667)
chr8 (8-131)||(14212645-14212768)
chr8 (5-131)||(19844770-19844896)
chr8 (10-98)||(16768931-16769019)
[»] chr6 (52 HSPs)
chr6 (1-228)||(28164088-28164315)
chr6 (1-228)||(13520564-13520791)
chr6 (1-228)||(29505013-29505240)
chr6 (1-228)||(14141766-14141993)
chr6 (1-228)||(33372803-33373030)
chr6 (1-228)||(26789413-26789640)
chr6 (1-228)||(27197782-27198009)
chr6 (1-228)||(27251226-27251453)
chr6 (5-228)||(29576615-29576838)
chr6 (1-228)||(34460878-34461105)
chr6 (1-227)||(30554389-30554615)
chr6 (1-228)||(16677737-16677964)
chr6 (1-228)||(27011328-27011555)
chr6 (1-228)||(27061103-27061330)
chr6 (1-228)||(29553154-29553381)
chr6 (10-228)||(13295323-13295541)
chr6 (1-228)||(24302129-24302356)
chr6 (1-228)||(27358482-27358709)
chr6 (1-228)||(27448825-27449052)
chr6 (1-228)||(27626083-27626310)
chr6 (10-228)||(27022742-27022960)
chr6 (1-228)||(4776477-4776704)
chr6 (1-228)||(8902075-8902302)
chr6 (1-228)||(16753418-16753645)
chr6 (1-228)||(24867313-24867540)
chr6 (1-228)||(4528882-4529109)
chr6 (1-228)||(26112784-26113011)
chr6 (1-228)||(26921974-26922201)
chr6 (1-228)||(28211051-28211278)
chr6 (10-228)||(3699689-3699907)
chr6 (22-228)||(22931256-22931462)
chr6 (22-228)||(23853701-23853907)
chr6 (10-228)||(27286736-27286954)
chr6 (5-228)||(4720507-4720730)
chr6 (1-228)||(4761360-4761587)
chr6 (1-228)||(26774999-26775226)
chr6 (19-217)||(27180071-27180269)
chr6 (19-217)||(27268970-27269168)
chr6 (10-227)||(16940400-16940617)
chr6 (5-228)||(4542146-4542369)
chr6 (1-228)||(27488730-27488957)
chr6 (10-228)||(15420692-15420910)
chr6 (1-228)||(17088815-17089042)
chr6 (1-228)||(20172144-20172371)
chr6 (1-228)||(22163620-22163847)
chr6 (78-228)||(15408905-15409055)
chr6 (1-104)||(22455610-22455713)
chr6 (5-131)||(18212138-18212264)
chr6 (8-131)||(18120073-18120196)
chr6 (5-98)||(23971272-23971365)
chr6 (1-155)||(9135798-9135952)
chr6 (10-98)||(27545508-27545596)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (5-228)||(11357-11580)
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (1-228)||(16747831-16748058)
chr7 (5-228)||(26316162-26316385)
chr7 (5-228)||(45390821-45391044)
chr7 (1-228)||(2776851-2777078)
chr7 (5-228)||(26271400-26271623)
chr7 (1-228)||(26512010-26512237)
chr7 (5-228)||(26666228-26666451)
chr7 (1-228)||(26681420-26681647)
chr7 (1-228)||(31127504-31127731)
chr7 (1-228)||(39209453-39209680)
chr7 (10-228)||(2158180-2158398)
chr7 (10-228)||(10913183-10913401)
chr7 (5-228)||(4202990-4203213)
chr7 (1-221)||(16044912-16045132)
chr7 (1-228)||(5161980-5162207)
chr7 (1-228)||(11421093-11421320)
chr7 (1-228)||(16514744-16514971)
chr7 (10-228)||(2106477-2106695)
chr7 (10-228)||(22145801-22146019)
chr7 (10-228)||(26534187-26534405)
chr7 (10-228)||(31086936-31087154)
chr7 (10-227)||(11444493-11444710)
chr7 (5-228)||(5143654-5143877)
chr7 (1-228)||(31560704-31560931)
chr7 (10-228)||(4141560-4141778)
chr7 (19-228)||(5131611-5131820)
chr7 (10-227)||(24588849-24589066)
chr7 (10-228)||(3448912-3449130)
chr7 (19-228)||(16446320-16446529)
chr7 (1-228)||(10842308-10842535)
chr7 (1-228)||(10845217-10845444)
chr7 (10-224)||(26438863-26439077)
chr7 (10-228)||(26516398-26516616)
chr7 (10-228)||(45734919-45735131)
chr7 (5-131)||(2557136-2557262)
chr7 (5-131)||(15193684-15193810)
chr7 (5-131)||(16127229-16127355)
chr7 (5-131)||(29090117-29090243)
chr7 (4-157)||(797908-798061)
chr7 (1-224)||(30369264-30369487)
chr7 (1-155)||(16392821-16392975)
chr7 (1-155)||(9469917-9470071)
chr7 (4-157)||(16286764-16286917)
chr7 (10-98)||(1893019-1893107)
[»] chr5 (59 HSPs)
chr5 (5-228)||(9321087-9321310)
chr5 (1-228)||(18497051-18497278)
chr5 (5-228)||(24586985-24587208)
chr5 (5-228)||(26484005-26484228)
chr5 (1-228)||(33878737-33878964)
chr5 (1-228)||(3793148-3793375)
chr5 (5-228)||(8661801-8662024)
chr5 (5-228)||(12135786-12136009)
chr5 (5-228)||(30155642-30155865)
chr5 (1-228)||(40469876-40470103)
chr5 (1-227)||(33519987-33520213)
chr5 (1-228)||(11552962-11553189)
chr5 (1-228)||(28652849-28653076)
chr5 (1-228)||(31435071-31435298)
chr5 (1-228)||(34620125-34620352)
chr5 (1-228)||(37767317-37767544)
chr5 (1-228)||(43081862-43082089)
chr5 (10-228)||(23629586-23629804)
chr5 (1-228)||(9547035-9547262)
chr5 (1-228)||(11327244-11327471)
chr5 (1-224)||(18371864-18372087)
chr5 (1-228)||(25203885-25204112)
chr5 (1-228)||(25268040-25268267)
chr5 (1-228)||(32592600-32592827)
chr5 (1-228)||(33296135-33296362)
chr5 (10-228)||(22995443-22995661)
chr5 (10-224)||(41678321-41678535)
chr5 (19-228)||(18124742-18124951)
chr5 (1-228)||(13183119-13183346)
chr5 (5-224)||(24727580-24727799)
chr5 (10-228)||(24973522-24973740)
chr5 (10-228)||(28956111-28956329)
chr5 (10-228)||(30938251-30938469)
chr5 (10-224)||(37758599-37758813)
chr5 (1-228)||(13321156-13321383)
chr5 (1-228)||(29887523-29887750)
chr5 (5-224)||(30033039-30033258)
chr5 (1-228)||(37354969-37355196)
chr5 (1-228)||(37667812-37668039)
chr5 (10-228)||(30172085-30172303)
chr5 (10-228)||(6877921-6878139)
chr5 (10-228)||(13439009-13439227)
chr5 (10-227)||(5641404-5641621)
chr5 (1-221)||(15655091-15655311)
chr5 (5-228)||(31822733-31822956)
chr5 (10-228)||(2514678-2514896)
chr5 (1-228)||(33781096-33781319)
chr5 (1-224)||(15755182-15755405)
chr5 (1-227)||(22892070-22892296)
chr5 (8-131)||(3483626-3483749)
chr5 (10-105)||(34469238-34469333)
chr5 (1-155)||(11943821-11943975)
chr5 (1-155)||(5439624-5439778)
chr5 (1-155)||(15784124-15784278)
chr5 (1-155)||(17957704-17957858)
chr5 (1-155)||(36375361-36375515)
chr5 (1-155)||(37000015-37000169)
chr5 (1-155)||(31520914-31521068)
chr5 (28-98)||(20388445-20388515)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (1-228)||(5009488-5009715)
chr4 (1-228)||(18797043-18797270)
chr4 (9-228)||(6573479-6573698)
chr4 (5-228)||(40102066-40102289)
chr4 (1-224)||(14102156-14102379)
chr4 (5-228)||(27159746-27159969)
chr4 (5-228)||(54837008-54837231)
chr4 (1-227)||(21973314-21973540)
chr4 (1-227)||(31122942-31123168)
chr4 (1-228)||(1903867-1904094)
chr4 (17-228)||(15231501-15231712)
chr4 (19-228)||(34185389-34185598)
chr4 (1-228)||(17016659-17016886)
chr4 (1-224)||(36340950-36341173)
chr4 (1-228)||(39854250-39854477)
chr4 (5-227)||(30757377-30757599)
chr4 (17-228)||(20334850-20335061)
chr4 (10-228)||(24116284-24116502)
chr4 (10-228)||(24588790-24589008)
chr4 (10-228)||(33670229-33670447)
chr4 (1-228)||(14668629-14668856)
chr4 (1-228)||(18313607-18313834)
chr4 (10-201)||(14759762-14759953)
chr4 (10-228)||(15281366-15281584)
chr4 (72-228)||(5698219-5698375)
chr4 (81-227)||(15384778-15384924)
chr4 (1-87)||(15387948-15388034)
chr4 (5-192)||(14725264-14725451)
chr4 (5-131)||(19767956-19768082)
chr4 (4-157)||(55784748-55784901)
chr4 (10-98)||(1881658-1881746)
chr4 (5-98)||(12515849-12515942)
chr4 (28-98)||(18044699-18044769)
[»] chr3 (71 HSPs)
chr3 (5-228)||(28112426-28112649)
chr3 (1-224)||(8215296-8215519)
chr3 (1-228)||(32294189-32294416)
chr3 (4-228)||(5714637-5714861)
chr3 (4-228)||(5725547-5725771)
chr3 (4-228)||(5766597-5766821)
chr3 (1-228)||(5017275-5017502)
chr3 (1-227)||(18228757-18228983)
chr3 (10-228)||(22384050-22384268)
chr3 (1-228)||(4627346-4627573)
chr3 (1-228)||(28024843-28025070)
chr3 (5-227)||(51785588-51785810)
chr3 (7-228)||(31032708-31032929)
chr3 (1-228)||(5592829-5593056)
chr3 (5-228)||(5605786-5606009)
chr3 (1-228)||(6205464-6205691)
chr3 (1-228)||(21678264-21678491)
chr3 (1-228)||(24331724-24331951)
chr3 (5-228)||(47027018-47027241)
chr3 (10-228)||(4725201-4725419)
chr3 (10-228)||(4793107-4793325)
chr3 (10-228)||(17981421-17981639)
chr3 (10-228)||(18304126-18304344)
chr3 (10-228)||(18334200-18334418)
chr3 (10-228)||(29145228-29145446)
chr3 (7-228)||(8285942-8286163)
chr3 (19-228)||(11106831-11107040)
chr3 (1-228)||(7076767-7076994)
chr3 (1-228)||(19698051-19698278)
chr3 (1-228)||(35884327-35884554)
chr3 (10-228)||(4687225-4687443)
chr3 (10-228)||(15737566-15737784)
chr3 (10-228)||(18054832-18055050)
chr3 (10-228)||(18273524-18273742)
chr3 (10-228)||(18288825-18289043)
chr3 (7-228)||(8299538-8299759)
chr3 (4-228)||(29661442-29661666)
chr3 (1-228)||(4420476-4420703)
chr3 (1-228)||(15889177-15889404)
chr3 (1-228)||(20069601-20069828)
chr3 (10-224)||(32442721-32442935)
chr3 (4-228)||(20573315-20573539)
chr3 (1-228)||(5470549-5470776)
chr3 (1-228)||(18246302-18246529)
chr3 (10-228)||(10399714-10399932)
chr3 (4-228)||(22867320-22867544)
chr3 (4-228)||(22882379-22882603)
chr3 (5-228)||(4343148-4343371)
chr3 (1-228)||(5653646-5653873)
chr3 (1-228)||(31960927-31961154)
chr3 (10-228)||(48469497-48469715)
chr3 (1-228)||(6539214-6539441)
chr3 (1-228)||(8000121-8000348)
chr3 (1-228)||(10646634-10646861)
chr3 (10-228)||(28342747-28342965)
chr3 (10-224)||(16620966-16621180)
chr3 (101-228)||(17973333-17973460)
chr3 (1-105)||(17992526-17992630)
chr3 (5-131)||(11924927-11925053)
chr3 (5-131)||(16431970-16432096)
chr3 (5-192)||(7088535-7088722)
chr3 (8-131)||(22960021-22960144)
chr3 (10-135)||(6571924-6572049)
chr3 (4-157)||(20443681-20443834)
chr3 (5-160)||(15705038-15705193)
chr3 (1-155)||(5950347-5950501)
chr3 (1-98)||(15919078-15919175)
chr3 (1-224)||(15592387-15592610)
chr3 (1-155)||(37260254-37260408)
chr3 (1-155)||(46380895-46381049)
chr3 (28-98)||(4450363-4450433)
[»] chr2 (48 HSPs)
chr2 (5-228)||(11631602-11631825)
chr2 (5-228)||(34294757-34294980)
chr2 (3-228)||(22924566-22924791)
chr2 (3-227)||(3786094-3786318)
chr2 (1-228)||(13932965-13933192)
chr2 (1-224)||(21673597-21673820)
chr2 (1-228)||(27120123-27120350)
chr2 (1-228)||(27779833-27780060)
chr2 (1-228)||(27819590-27819817)
chr2 (5-228)||(31879889-31880112)
chr2 (1-228)||(34158443-34158670)
chr2 (5-228)||(37682313-37682536)
chr2 (5-228)||(37697578-37697801)
chr2 (1-228)||(9346404-9346631)
chr2 (5-228)||(37928972-37929195)
chr2 (1-228)||(40237107-40237334)
chr2 (1-227)||(16825757-16825983)
chr2 (1-227)||(16895497-16895723)
chr2 (3-228)||(31889909-31890134)
chr2 (1-228)||(257071-257298)
chr2 (1-228)||(19412919-19413146)
chr2 (1-228)||(21699589-21699816)
chr2 (1-228)||(32053402-32053629)
chr2 (4-228)||(12590410-12590634)
chr2 (1-228)||(20841512-20841739)
chr2 (1-228)||(39048237-39048464)
chr2 (4-228)||(27807305-27807529)
chr2 (1-228)||(12659135-12659362)
chr2 (1-228)||(34271338-34271565)
chr2 (5-228)||(34865287-34865510)
chr2 (10-228)||(27430859-27431077)
chr2 (10-228)||(23124987-23125204)
chr2 (7-228)||(12713019-12713240)
chr2 (1-224)||(39893668-39893891)
chr2 (10-228)||(28885887-28886105)
chr2 (10-228)||(16165088-16165306)
chr2 (10-224)||(37381285-37381499)
chr2 (1-227)||(27395161-27395387)
chr2 (10-228)||(37948280-37948498)
chr2 (10-228)||(19452841-19453059)
chr2 (1-68)||(27828059-27828126)
chr2 (5-131)||(34701679-34701805)
chr2 (8-131)||(42394141-42394264)
chr2 (4-157)||(21760104-21760257)
chr2 (1-155)||(22949992-22950146)
chr2 (1-155)||(12384259-12384413)
chr2 (10-98)||(34533991-34534079)
chr2 (10-98)||(26723824-26723912)
[»] chr1 (13 HSPs)
chr1 (5-228)||(10966271-10966494)
chr1 (1-228)||(28588587-28588814)
chr1 (1-228)||(20336845-20337072)
chr1 (1-228)||(28153338-28153565)
chr1 (5-227)||(10948683-10948905)
chr1 (16-228)||(16204463-16204675)
chr1 (1-228)||(3644738-3644965)
chr1 (5-224)||(51641824-51642043)
chr1 (1-228)||(41789739-41789966)
chr1 (1-228)||(21894177-21894404)
chr1 (1-228)||(20464578-20464805)
chr1 (5-131)||(22489627-22489753)
chr1 (1-155)||(5628500-5628654)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (1-228)||(9636-9863)
[»] scaffold0144 (1 HSPs)
scaffold0144 (1-227)||(22621-22847)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (1-228)||(16181-16408)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (1-228)||(3667-3894)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (1-228)||(11549-11776)
[»] scaffold0322 (1 HSPs)
scaffold0322 (16-228)||(9660-9872)
[»] scaffold0159 (1 HSPs)
scaffold0159 (10-228)||(5608-5826)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (19-228)||(13189-13398)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (42-227)||(22757-22942)
[»] scaffold0748 (1 HSPs)
scaffold0748 (1-203)||(5125-5327)
[»] scaffold0032 (1 HSPs)
scaffold0032 (44-228)||(118762-118946)
[»] scaffold0099 (1 HSPs)
scaffold0099 (24-222)||(43145-43354)
[»] scaffold0196 (1 HSPs)
scaffold0196 (101-228)||(1979-2109)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (8-131)||(10825-10948)
[»] scaffold0094 (1 HSPs)
scaffold0094 (1-224)||(34673-34896)
[»] scaffold0029 (1 HSPs)
scaffold0029 (1-155)||(29770-29924)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (5-98)||(4969-5062)


Alignment Details
Target: scaffold0143 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7560 - 7787
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7560 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 7659  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  7660 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 7759  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7760 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19670 - 19897
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  19670 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaac 19769  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  19770 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccga 19869  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19870 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 30893 - 31120
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30893 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaac 30992  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30993 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 31092  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31093 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9622 - 9849
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9622 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 9721  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9722 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 9821  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9822 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 25)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 15771173 - 15771400
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771173 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 15771272  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15771273 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 15771372  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15771373 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15771400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19204975 - 19204752
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19204975 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 19204876  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19204875 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 19204776  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  19204775 cttgcttaccaacctcttgatgat 19204752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 31358131 - 31358354
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31358131 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 31358230  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  31358231 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 31358330  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31358331 cttgcttaccaacctcttgatgat 31358354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Original strand, 44564585 - 44564810
Alignment:
Q  3 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44564585 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 44564684  T
Q  103 gctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatc 202  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44564685 gttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 44564784  T
Q  203 atcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  44564785 atctggcttaccaacctcttgatgat 44564810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18713083 - 18713310
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18713083 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 18713182  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18713183 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 18713282  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18713283 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 18713310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28358565 - 28358342
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  28358565 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgt 28358466  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  28358465 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccgatcat 28358366  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28358365 cttgcttaccaacctcttgatgat 28358342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9358224 - 9358451
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358224 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 9358323  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  9358324 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaagactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcaga 9358423  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9358424 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9358451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29832925 - 29833152
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29832925 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 29833024  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  29833025 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccga 29833124  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  29833125 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 29833152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 14561232 - 14561450
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14561232 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 14561331  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14561332 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 14561431  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14561432 ttaccaacctcttgatgat 14561450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 19691706 - 19691924
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19691706 tgggccgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 19691805  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19691806 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 19691905  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  19691906 ttaccaacctcttgatgat 19691924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 19678055 - 19678272
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19678055 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtta 19678154  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19678155 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 19678254  T
Q  210 ttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  19678255 ttaccaacctcttgatga 19678272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2133877 - 2133650
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133877 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 2133778  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2133777 ctgctgttactgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 2133678  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2133677 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 2133650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19657958 - 19657731
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19657958 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgccattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 19657859  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19657858 ttgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 19657759  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19657758 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19657731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 18794312 - 18794530
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18794312 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18794411  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18794412 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 18794511  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18794512 ttaccaacctcttgatgat 18794530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12089340 - 12089113
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12089340 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 12089241  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  12089240 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 12089141  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  12089140 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 12089113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27605522 - 27605295
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27605522 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27605423  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  27605422 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcga 27605323  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27605322 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27605295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33262333 - 33262560
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33262333 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 33262432  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  33262433 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcatcctcgccga 33262532  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  33262533 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 33262560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 31486479 - 31486265
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31486479 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 31486380  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  31486379 ccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 31486280  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  31486279 ttaccaacctcttga 31486265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 33245977 - 33246195
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  33245977 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgtta 33246076  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  33246077 ctgggaagattgcacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagcttaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 33246176  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  33246177 ctaccaacctcttgatgat 33246195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21344770 - 21344561
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |  | | | |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||    
T  21344770 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaaccgcccagctcaagtatatctctgagaaagctgttgttactgggaaga 21344671  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    |||||||||| || ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  21344670 ttgcacgctgacagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 21344571  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  21344570 tcttgatgat 21344561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 34 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22077509 - 22077316
Alignment:
Q  34 tatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaa 133  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| || |||||||    
T  22077509 tatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgatgttactggaaaaattgcgcgttggcaaa 22077410  T
Q  134 tgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22077409 tgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22077316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 22412541 - 22412667
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  22412541 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 22412640  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  22412641 tttaactggaaggattgctcgctggca 22412667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 14212645 - 14212768
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  14212645 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 14212744  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  14212745 aactggaaggattgctcgctggca 14212768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 19844770 - 19844896
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||| |||||||||||||| || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  19844770 tagcctgggctgccaaacgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagc 19844869  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||| ||| |||||| ||||||||    
T  19844870 tttaactagaaggattgctcgctggca 19844896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 16768931 - 16769019
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  16768931 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 16769019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 52)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28164088 - 28164315
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164088 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28164187  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28164188 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctga 28164287  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28164288 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28164315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13520791 - 13520564
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520791 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 13520692  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13520691 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 13520592  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13520591 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13520564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29505013 - 29505240
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505013 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 29505112  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  29505113 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 29505212  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29505213 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29505240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14141993 - 14141766
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14141993 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 14141894  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14141893 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 14141794  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  14141793 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 14141766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33373030 - 33372803
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  33373030 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaag 33372931  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  33372930 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 33372831  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33372830 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33372803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26789413 - 26789640
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26789413 gctctagcttgggctgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 26789512  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26789513 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 26789612  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26789613 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26789640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27197782 - 27198009
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27197782 gctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27197881  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27197882 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27197981  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27197982 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27198009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27251453 - 27251226
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27251453 gctctagcttgagctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27251354  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27251353 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27251254  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27251253 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27251226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 29576615 - 29576838
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  29576615 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgc 29576714  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29576715 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 29576814  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  29576815 cttgcttaccaacctcttgatgat 29576838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34461105 - 34460878
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34461105 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 34461006  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34461005 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 34460906  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  34460905 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 34460878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 30554615 - 30554389
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30554615 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 30554516  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  30554515 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 30554416  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  30554415 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 30554389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16677737 - 16677964
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16677737 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatgtctttgagaaag 16677836  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||    
T  16677837 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaagggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 16677936  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16677937 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16677964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27011328 - 27011555
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27011328 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27011427  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27011428 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 27011527  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27011528 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27011555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27061103 - 27061330
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061103 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27061202  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27061203 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatattatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27061302  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27061303 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27061330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 29553154 - 29553381
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553154 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 29553253  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  29553254 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 29553353  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  29553354 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 29553381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13295541 - 13295323
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13295541 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 13295442  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13295441 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 13295342  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13295341 ttaccaacctcttgatgat 13295323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24302356 - 24302129
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24302356 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 24302257  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24302256 ctgctgttactgggaagattgcacgctgacagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 24302157  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24302156 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 24302129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27358709 - 27358482
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27358709 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27358610  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27358609 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 27358510  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27358509 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27358482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27449052 - 27448825
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27449052 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27448953  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27448952 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 27448853  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27448852 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27448825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27626310 - 27626083
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27626310 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccaatcaagtatatctttgagaaag 27626211  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27626210 ctgctgttactgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27626111  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27626110 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 27626083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 27022742 - 27022960
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27022742 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 27022841  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27022842 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 27022941  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27022942 ttaccaacctcttgatgat 27022960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4776477 - 4776704
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4776477 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 4776576  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4776577 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 4776676  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4776677 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4776704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8902302 - 8902075
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8902302 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 8902203  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8902202 ctgctgttactgggaatattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 8902103  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8902102 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 8902075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16753418 - 16753645
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16753418 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 16753517  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16753518 cggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 16753617  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16753618 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 16753645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24867313 - 24867540
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867313 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 24867412  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24867413 ctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 24867512  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24867513 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 24867540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4528882 - 4529109
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4528882 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 4528981  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4528982 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 4529081  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4529082 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4529109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26113011 - 26112784
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26113011 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 26112912  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  26112911 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 26112812  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26112811 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 26112784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 26921974 - 26922201
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26921974 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 26922073  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26922074 cggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 26922173  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26922174 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26922201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28211051 - 28211278
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28211051 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28211150  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  28211151 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 28211250  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28211251 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 28211278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 3699689 - 3699907
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3699689 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 3699788  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  3699789 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 3699888  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  3699889 ttaccaacctcttgatgat 3699907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22931462 - 22931256
Alignment:
Q  22 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  22931462 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 22931363  T
Q  122 cacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctct 221  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22931362 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 22931263  T
Q  222 tgatgat 228  Q
    |||||||    
T  22931262 tgatgat 22931256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 22 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23853907 - 23853701
Alignment:
Q  22 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattg 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  23853907 cgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgttactgggaagattg 23853808  T
Q  122 cacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctct 221  Q
    |||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23853807 cacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctct 23853708  T
Q  222 tgatgat 228  Q
    |||||||    
T  23853707 tgatgat 23853701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27286954 - 27286736
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27286954 tgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctatta 27286855  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27286854 ctgggaagattgcacgttggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 27286755  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     || |||||||||||||||    
T  27286754 ctatcaacctcttgatgat 27286736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4720730 - 4720507
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4720730 tagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggc 4720631  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  4720630 cgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcac 4720531  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4720530 cttgcttatcaacctcttgatgat 4720507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4761360 - 4761587
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4761360 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatatagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 4761459  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  4761460 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 4761559  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  4761560 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 4761587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26775226 - 26774999
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26775226 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtatatcttcgagaaag 26775127  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26775126 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 26775027  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  26775026 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 26774999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Original strand, 27180071 - 27180269
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27180071 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27180170  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaac 217  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27180171 ttgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27180269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 217
Target Start/End: Complemental strand, 27269168 - 27268970
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27269168 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcataccacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 27269069  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaac 217  Q
    ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  27269068 ttgcacgctggcaaatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaac 27268970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16940617 - 16940400
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16940617 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgtta 16940518  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  16940517 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgc 16940418  T
Q  210 ttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  16940417 ttatcaacctcttgatga 16940400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4542369 - 4542146
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4542369 tagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggc 4542270  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||     
T  4542269 cgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccaatcac 4542170  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4542169 cttgcttatcaacctcttgatgat 4542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27488730 - 27488957
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27488730 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacctggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27488829  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  27488830 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 27488929  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  27488930 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 27488957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15420910 - 15420692
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15420910 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 15420811  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    || | ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15420810 ctaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaagggaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 15420711  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15420710 ttaccaacctcttgatgat 15420692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17089042 - 17088815
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17089042 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 17088943  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |  ||||||| || ||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17088942 cgactgttacagggaagattgcacgatggcagatgctcttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaatggcaatcaaaggtagcatccttgctga 17088843  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  17088842 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 17088815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20172144 - 20172371
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  20172144 gctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaac 20172243  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20172244 ctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 20172343  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  20172344 tcatcttgcctaccaacccctggatgat 20172371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 132; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22163847 - 22163620
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||     
T  22163847 gctctggcctgggttgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccaaaatggatccgataaagtacatcttcgagaaac 22163748  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22163747 ctgctgttaccgggaagattgcacgttggcagatgcttttatctgaatatgacattgtgttcaaggttcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 22163648  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||| || ||||||    
T  22163647 tcatcttgcctaccaacccctggatgat 22163620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 111; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 78 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15409055 - 15408905
Alignment:
Q  78 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggca 177  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |    
T  15409055 gataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatgttgtgttcaaaactcaaaaggga 15408956  T
Q  178 atcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15408955 atcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15408905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 22455713 - 22455610
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22455713 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 22455614  T
Q  101 ctgc 104  Q
    ||||    
T  22455613 ctgc 22455610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 18212264 - 18212138
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  18212264 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 18212165  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  18212164 tttaactggaaggattgctcgctggca 18212138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 18120073 - 18120196
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  18120073 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 18120172  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  18120173 aactggaaggattgctcgctggca 18120196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 23971365 - 23971272
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23971365 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaa 23971272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 9135952 - 9135798
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  9135952 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 9135853  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||| ||||||||    
T  9135852 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgagtatgatat 9135798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Original strand, 27545508 - 27545596
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  27545508 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 27545596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11580 - 11357
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11580 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 11481  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11480 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 11381  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11380 cttgcttaccaacctcttgatgat 11357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16748058 - 16747831
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16748058 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 16747959  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16747958 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 16747859  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16747858 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 16747831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26316385 - 26316162
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26316385 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 26316286  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26316285 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 26316186  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26316185 cttgcttaccaacctcttgatgat 26316162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 45390821 - 45391044
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45390821 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 45390920  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45390921 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 45391020  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  45391021 cttgcttaccaacctcttgatgat 45391044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 2776851 - 2777078
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2776851 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 2776950  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2776951 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 2777050  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2777051 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2777078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26271623 - 26271400
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  26271623 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgt 26271524  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26271523 tgttacgggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 26271424  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26271423 cttgcttaccaacctcttgatgat 26271400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26512237 - 26512010
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26512237 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 26512138  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26512137 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 26512038  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  26512037 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 26512010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26666451 - 26666228
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26666451 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 26666352  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  26666351 tgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 26666252  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26666251 cttgcttaccaacctcttgatgat 26666228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26681647 - 26681420
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26681647 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 26681548  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||| |||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  26681547 ctgttgttactgggaagattgcacgcgggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 26681448  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26681447 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 26681420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31127504 - 31127731
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31127504 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 31127603  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31127604 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 31127703  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31127704 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 31127731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39209680 - 39209453
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39209680 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 39209581  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  39209580 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 39209481  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39209480 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39209453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 2158180 - 2158398
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2158180 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 2158279  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2158280 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 2158379  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2158380 ttaccaacctcttgatgat 2158398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10913401 - 10913183
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10913401 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 10913302  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10913301 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 10913202  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  10913201 ttaccaacctcttgatgat 10913183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 4202990 - 4203213
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||    
T  4202990 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaaatatatctttgagaaagctgc 4203089  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||     
T  4203090 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccgatcac 4203189  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  4203190 cttgcttaccaacctcttgatgat 4203213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Original strand, 16044912 - 16045132
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16044912 gctctggcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaag 16045011  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16045012 ctgctgttactgggaagattgcacgctggtagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 16045111  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctct 221  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  16045112 tcatcttgcctaccaacctct 16045132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5161980 - 5162207
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5161980 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 5162079  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5162080 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 5162179  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5162180 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5162207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11421320 - 11421093
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11421320 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 11421221  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11421220 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 11421121  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11421120 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 11421093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16514971 - 16514744
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514971 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatagatccgataaagtatatctttgagaaag 16514872  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16514871 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 16514772  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16514771 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16514744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2106695 - 2106477
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2106695 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgtta 2106596  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2106595 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 2106496  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2106495 ctaccaacctcttgatgat 2106477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 22145801 - 22146019
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22145801 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 22145900  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22145901 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcgaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 22146000  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22146001 ttaccaacctcttgatgat 22146019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26534405 - 26534187
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26534405 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 26534306  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  26534305 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcatcttgc 26534206  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  26534205 ttaccaacctctcgatgat 26534187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31087154 - 31086936
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31087154 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 31087055  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  31087054 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 31086955  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||| ||||||    
T  31086954 ttaccaacctctcgatgat 31086936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 11444493 - 11444710
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11444493 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtta 11444592  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11444593 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 11444692  T
Q  210 ttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11444693 ttaccaacctcttgatga 11444710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5143877 - 5143654
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5143877 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcagc 5143778  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
     |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  5143777 cgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcat 5143678  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||    
T  5143677 cttgcctaccaacctctcgatgat 5143654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31560931 - 31560704
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31560931 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 31560832  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31560831 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 31560732  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31560731 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31560704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4141778 - 4141560
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4141778 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgtta 4141679  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4141678 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 4141579  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4141578 ttaccaacctcttgatgat 4141560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 5131611 - 5131820
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  5131611 aaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactaggaaga 5131710  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5131711 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 5131810  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  5131811 tcttgatgat 5131820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 24589066 - 24588849
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589066 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgtta 24588967  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  24588966 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgc 24588867  T
Q  210 ttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  24588866 ttatcaacctcttgatga 24588849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 3448912 - 3449130
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  3448912 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtca 3449011  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  3449012 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 3449111  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  3449112 ctaccaacctcttgatgat 3449130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16446529 - 16446320
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16446529 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgttactgggaaga 16446430  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  16446429 ttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatggtattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgctgatcaccttgcttatcaacc 16446330  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||    
T  16446329 tctcgatgat 16446320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10842535 - 10842308
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10842535 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaac 10842436  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10842435 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccga 10842336  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10842335 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10842308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 10845217 - 10845444
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  10845217 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaac 10845316  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |  |||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  10845317 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccga 10845416  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10845417 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 10845444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 26438863 - 26439077
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26438863 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 26438962  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26438963 ctgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 26439062  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  26439063 ttaccaacctcttga 26439077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 26516398 - 26516616
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  26516398 tgggccgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 26516497  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26516498 ctggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 26516597  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  26516598 ttaccaacctcttgatgat 26516616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 45734919 - 45735131
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||      |||||||||||||||||||||||    
T  45734919 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgat------tatctttgagaaagctgctgtta 45735012  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  45735013 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 45735112  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  45735113 ttaccaacctcttgatgat 45735131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 2557136 - 2557262
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  2557136 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 2557235  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  2557236 tttaactggaaggattgctcgctggca 2557262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 15193684 - 15193810
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  15193684 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 15193783  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  15193784 tttaactggaaggattgctcgctggca 15193810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 16127355 - 16127229
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  16127355 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 16127256  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  16127255 tttaactggaaggattgctcgctggca 16127229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 29090117 - 29090243
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  29090117 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 29090216  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  29090217 tttaactggaaggattgctcgctggca 29090243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 798061 - 797908
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  798061 ctagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaggatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccg 797962  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattg 157  Q
    || | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  797961 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 797908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 30369487 - 30369264
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  30369487 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 30369388  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| |||||||||||| | || |    | || |||||||||||||| || |||||||| ||    
T  30369387 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatatcgagtgccgttcccagaaggcaatcaaaggcagtatccttgctga 30369288  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    |||  | ||| ||||||| |||||    
T  30369287 tcacttggctcaccaaccacttga 30369264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 16392975 - 16392821
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  16392975 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 16392876  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  16392875 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 16392821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 9469917 - 9470071
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  9469917 gctctagcctgggctgccagacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 9470016  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  9470017 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 9470071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16286917 - 16286764
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||| || | | |||||| || ||||||||||| | |||||||||||| |||||  ||||||||||| | |    
T  16286917 ctagcctgggctgcaaaacgcctccgccactatatgattagtcatactacatggttgatatctaagatggatccgatcaagtacgtctttgagaaacccg 16286818  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattg 157  Q
    || | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  16286817 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 16286764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1893107 - 1893019
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1893107 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 1893019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 59)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 9321087 - 9321310
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  9321087 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 9321186  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9321187 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 9321286  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  9321287 cttgcttaccaacctcttgatgat 9321310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18497278 - 18497051
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497278 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 18497179  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18497178 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 18497079  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18497078 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18497051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 24586985 - 24587208
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586985 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 24587084  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24587085 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 24587184  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24587185 cttgcttaccaacctcttgatgat 24587208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 26484005 - 26484228
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26484005 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 26484104  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26484105 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 26484204  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  26484205 cttgcttaccaacctcttgatgat 26484228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33878737 - 33878964
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878737 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 33878836  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33878837 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 33878936  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  33878937 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 33878964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3793148 - 3793375
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  3793148 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggacccgatcaagtatatctttgagaaag 3793247  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3793248 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 3793347  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3793348 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 3793375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8662024 - 8661801
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8662024 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 8661925  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  8661924 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 8661825  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  8661824 cttgcttaccaacctcttgatgat 8661801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 12135786 - 12136009
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12135786 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 12135885  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12135886 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattatgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 12135985  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12135986 cttgcttaccaacctcttgatgat 12136009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 30155642 - 30155865
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30155642 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 30155741  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30155742 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 30155841  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  30155842 cttgcttaccaacctcttgatgat 30155865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40470103 - 40469876
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40470103 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 40470004  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40470003 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 40469904  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40469903 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40469876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 33519987 - 33520213
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33519987 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 33520086  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  33520087 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 33520186  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  33520187 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 33520213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11552962 - 11553189
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11552962 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 11553061  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11553062 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 11553161  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  11553162 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 11553189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28652849 - 28653076
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28652849 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28652948  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  28652949 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcaga 28653048  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28653049 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28653076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 31435071 - 31435298
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31435071 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 31435170  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  31435171 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 31435270  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31435271 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31435298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34620125 - 34620352
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620125 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 34620224  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  34620225 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 34620324  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34620325 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34620352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37767544 - 37767317
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37767544 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 37767445  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37767444 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 37767345  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37767344 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37767317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 43081862 - 43082089
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43081862 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaag 43081961  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  43081962 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcaga 43082061  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  43082062 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 43082089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 23629586 - 23629804
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23629586 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 23629685  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23629686 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 23629785  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  23629786 ttaccaacctcttgatgat 23629804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9547262 - 9547035
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9547262 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 9547163  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9547162 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 9547063  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9547062 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9547035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11327244 - 11327471
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11327244 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 11327343  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11327344 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 11327443  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11327444 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 11327471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 18372087 - 18371864
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  18372087 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatcagatcaagtatatctttgagaaag 18371988  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18371987 ctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 18371888  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  18371887 tcaccttgcttaccaacctcttga 18371864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25203885 - 25204112
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25203885 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 25203984  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25203985 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 25204084  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25204085 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25204112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 25268040 - 25268267
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25268040 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattttttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 25268139  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25268140 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 25268239  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25268240 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 25268267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 32592827 - 32592600
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592827 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 32592728  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  32592727 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 32592628  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  32592627 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 32592600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33296135 - 33296362
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33296135 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 33296234  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33296235 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 33296334  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33296335 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22995661 - 22995443
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22995661 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 22995562  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22995561 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 22995462  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22995461 ttaccaacctcttgatgat 22995443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 41678321 - 41678535
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41678321 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 41678420  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  41678421 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 41678520  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  41678521 ttaccaacctcttga 41678535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18124951 - 18124742
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18124951 aaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 18124852  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18124851 ttgcacgctggcagatgctgttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 18124752  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  18124751 tcttgatgat 18124742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13183346 - 13183119
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13183346 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 13183247  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13183246 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtcttaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 13183147  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  13183146 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 13183119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 24727580 - 24727799
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24727580 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgc 24727679  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24727680 tgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 24727779  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||||| ||||||||||||||    
T  24727780 cttgcctaccaacctcttga 24727799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 24973522 - 24973740
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24973522 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 24973621  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24973622 ctgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 24973721  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24973722 ttaccaacctcttgatgat 24973740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28956329 - 28956111
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  28956329 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgccgtta 28956230  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28956229 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 28956130  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  28956129 ttaccaacctcttgatgat 28956111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 30938251 - 30938469
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30938251 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 30938350  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30938351 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 30938450  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  30938451 ttaccaacctcttgatgat 30938469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 37758599 - 37758813
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37758599 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgtta 37758698  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  37758699 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 37758798  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  37758799 ttaccaacctcttga 37758813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13321383 - 13321156
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13321383 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 13321284  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13321283 cggccgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcgatcaaaggtagcatcctcgccga 13321184  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  13321183 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 13321156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29887750 - 29887523
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  29887750 gctctagcctgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtatatctttgagaaag 29887651  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29887650 ctgttgttactgggaagattgcactctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 29887551  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    | |||| || ||||||||||| ||||||    
T  29887550 taatctcgcctaccaacctctcgatgat 29887523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 30033039 - 30033258
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30033039 tagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggctgc 30033138  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  30033139 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcac 30033238  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||| |||||||||||    
T  30033239 cttgcttatcaacctcttga 30033258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37355196 - 37354969
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37355196 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 37355097  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37355096 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 37354997  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37354996 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 37354969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37668039 - 37667812
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37668039 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 37667940  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  37667939 cggctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 37667840  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| ||||||||| |||||    
T  37667839 tcaccttgcttatcaacctcttaatgat 37667812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 30172085 - 30172303
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30172085 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttgattgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgccgtta 30172184  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30172185 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 30172284  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  30172285 ctaccaacctcttgatgat 30172303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 6877921 - 6878139
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  6877921 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtca 6878020  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6878021 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 6878120  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  6878121 ctaccaacctcttgatgat 6878139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13439227 - 13439009
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  13439227 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtca 13439128  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  13439127 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatatcgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 13439028  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  13439027 ttaccaacctcttgatgat 13439009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 227
Target Start/End: Original strand, 5641404 - 5641621
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5641404 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgtta 5641503  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||    
T  5641504 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcaccttgc 5641603  T
Q  210 ttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| ||||||||||||||    
T  5641604 ttatcaacctcttgatga 5641621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 221
Target Start/End: Complemental strand, 15655311 - 15655091
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15655311 gctctggcctgggctgctaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 15655212  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15655211 cggctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 15655112  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctct 221  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  15655111 tcaccttgcttaccaacctct 15655091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31822956 - 31822733
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  31822956 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggc 31822857  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  31822856 cgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcac 31822757  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  31822756 cttgcttatcaacctcttgatgat 31822733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 2514678 - 2514896
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  2514678 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtca 2514777  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  2514778 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 2514877  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  2514878 ctaccaacctcttgatgat 2514896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 33781096 - 33781319
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33781096 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 33781195  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33781196 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaa----caaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 33781291  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  33781292 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 33781319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15755405 - 15755182
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15755405 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaag 15755306  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  15755305 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 15755206  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| |||||||| |||||||||||    
T  15755205 tcaccttgcttatcaacctcttga 15755182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 22892070 - 22892296
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22892070 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcactatttggtgaatcataaaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 22892169  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  22892170 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgttga 22892269  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| ||||| || ||||| || |||||    
T  22892270 tcaccttgcctatcaaccgctcgatga 22892296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 3483749 - 3483626
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  3483749 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 3483650  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  3483649 aactggaaggattgctcgctggca 3483626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 34469238 - 34469333
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgct 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  34469238 tgggctgccaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctgct 34469333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 11943975 - 11943821
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  11943975 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 11943876  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  11943875 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 11943821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5439778 - 5439624
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  5439778 gctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 5439679  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  5439678 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5439624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 15784278 - 15784124
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  15784278 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 15784179  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  15784178 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 15784124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 17957704 - 17957858
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| ||||||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  17957704 gctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctgatatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 17957803  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | |  |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  17957804 ccgctttgataggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 17957858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 36375515 - 36375361
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || || || || ||||||||      
T  36375515 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaagc 36375416  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  36375415 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 36375361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37000169 - 37000015
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || || || || ||||||||      
T  37000169 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgatcaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaagc 37000070  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  37000069 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 37000015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 31520914 - 31521068
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  31520914 gctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 31521013  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  |||  |||||||||||    
T  31521014 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatcggaatatgatat 31521068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 20388515 - 20388445
Alignment:
Q  28 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  20388515 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 20388445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5009488 - 5009715
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5009488 gctctggcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 5009587  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5009588 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 5009687  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5009688 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5009715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18797270 - 18797043
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797270 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 18797171  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  18797170 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 18797071  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797070 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 18797043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 9 - 228
Target Start/End: Original strand, 6573479 - 6573698
Alignment:
Q  9 ttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6573479 ttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtt 6573578  T
Q  109 actggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttg 208  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6573579 actggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttg 6573678  T
Q  209 cttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  6573679 cttaccaacctcttgatgat 6573698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 40102289 - 40102066
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40102289 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 40102190  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  40102189 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 40102090  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  40102089 cttgcctaccaacctcttgatgat 40102066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 14102156 - 14102379
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14102156 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 14102255  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14102256 ctgccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 14102355  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  14102356 tcatcttgcttaccaacctcttga 14102379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27159969 - 27159746
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27159969 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 27159870  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  27159869 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 27159770  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  27159769 cttgcttatcaacctcttgatgat 27159746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 54837008 - 54837231
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54837008 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 54837107  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54837108 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 54837207  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    
T  54837208 cttgcctaccaacctcttgatgat 54837231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 21973314 - 21973540
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21973314 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 21973413  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  21973414 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 21973513  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21973514 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 21973540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 31123168 - 31122942
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31123168 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 31123069  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  31123068 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 31122969  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  31122968 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 31122942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 1903867 - 1904094
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1903867 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 1903966  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1903967 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 1904066  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1904067 tcatcttgcctaccaacctcttaatgat 1904094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Original strand, 15231501 - 15231712
Alignment:
Q  17 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15231501 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaa 15231600  T
Q  117 gattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaa 216  Q
    | ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15231601 ggttgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaa 15231700  T
Q  217 cctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||    
T  15231701 cctcttgatgat 15231712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34185598 - 34185389
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  34185598 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 34185499  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34185498 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacc 34185399  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  34185398 tcttgatgat 34185389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 17016659 - 17016886
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016659 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 17016758  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  17016759 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 17016858  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17016859 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17016886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 36341173 - 36340950
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36341173 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 36341074  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36341073 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 36340974  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  36340973 tcaccttgcttaccaacctcttga 36340950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 39854250 - 39854477
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39854250 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaag 39854349  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||    
T  39854350 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaagggtagcattcttgcaga 39854449  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  39854450 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 39854477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 30757377 - 30757599
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30757377 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgc 30757476  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  30757477 tgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaagctcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 30757576  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  30757577 cttgcttaccaacctcttgatga 30757599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 17 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20335061 - 20334850
Alignment:
Q  17 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaa 116  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20335061 ccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaa 20334962  T
Q  117 gattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaa 216  Q
    ||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  20334961 gattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccctgcttaccaa 20334862  T
Q  217 cctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||    
T  20334861 cctcttgatgat 20334850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 24116284 - 24116502
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  24116284 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgttgtta 24116383  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24116384 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 24116483  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  24116484 ctaccaacctcttgatgat 24116502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24589008 - 24588790
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24589008 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 24588909  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  24588908 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgc 24588809  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24588808 ttaccaacctcttgatgat 24588790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 33670447 - 33670229
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33670447 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgctgtta 33670348  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33670347 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 33670248  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  33670247 ttatcaacctcttgatgat 33670229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 14668629 - 14668856
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668629 gctctggcctgggccgctaaacgtctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccaagatggatccgataaagtatatctttgagaaag 14668728  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14668729 ctgctgttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctaaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 14668828  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  14668829 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 14668856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18313834 - 18313607
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18313834 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 18313735  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18313734 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 18313635  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18313634 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18313607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 10 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 14759953 - 14759762
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14759953 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 14759854  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgat 201  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14759853 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgat 14759762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15281584 - 15281366
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15281584 tgggccgccaaaagcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 15281485  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15281484 ctgggaagattgcacgctggcaaatgctcttgtccaaatatgacattatgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 15281385  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||    
T  15281384 ctaccaaccgcttgatgat 15281366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 72 - 228
Target Start/End: Original strand, 5698219 - 5698375
Alignment:
Q  72 ggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 171  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698219 ggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaa 5698318  T
Q  172 aaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5698319 aaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5698375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 81 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 15384924 - 15384778
Alignment:
Q  81 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatc 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15384924 aaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagtcaatc 15384825  T
Q  181 aaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||||||||||| |||||  ||||  |||| || || |||||||||||    
T  15384824 aaaggtagcattcttgcatatcacgttgcctatcagcctcttgatga 15384778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 87
Target Start/End: Complemental strand, 15388034 - 15387948
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtat 87  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15388034 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtat 15387948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 14725451 - 14725264
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  14725451 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 14725352  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 192  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||| ||| | || |  ||||||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  14725351 tttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgtccgaatatgatatcgagtatcgcactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 14725264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 19767956 - 19768082
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| ||  | ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  19767956 tagcttgggctgccaagcgtttccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 19768055  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  19768056 tttaactggaaggattgctcgctggca 19768082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 55784748 - 55784901
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| | |||||| ||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  55784748 ctagcctgggctgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggacccgatcaagtacatctttgagaaacccg 55784847  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattg 157  Q
    || | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  55784848 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 55784901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 1881746 - 1881658
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  1881746 tgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 1881658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Original strand, 12515849 - 12515942
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  12515849 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 12515942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 18044699 - 18044769
Alignment:
Q  28 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  18044699 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 18044769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 71)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28112649 - 28112426
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  28112649 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 28112550  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28112549 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 28112450  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  28112449 cttgcttaccaacctcttgatgat 28112426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 8215296 - 8215519
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8215296 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 8215395  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  8215396 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 8215495  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| ||||||||||||||||||||    
T  8215496 tcaccttgcttaccaacctcttga 8215519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32294189 - 32294416
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32294189 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 32294288  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32294289 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 32294388  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32294389 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 32294416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 5714637 - 5714861
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5714637 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5714736  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5714737 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5714836  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  5714837 ccttgcttatcaacctcttgatgat 5714861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 5725547 - 5725771
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5725547 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5725646  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5725647 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5725746  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  5725747 ccttgcttatcaacctcttgatgat 5725771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5766821 - 5766597
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5766821 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 5766722  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5766721 ctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgagtatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 5766622  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  5766621 ccttgcttatcaacctcttgatgat 5766597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5017275 - 5017502
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017275 gctctagcttgggctaccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 5017374  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  5017375 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 5017474  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5017475 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 5017502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 18228757 - 18228983
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18228757 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 18228856  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18228857 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 18228956  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  18228957 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 18228983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22384268 - 22384050
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22384268 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 22384169  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22384168 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 22384069  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  22384068 ttaccaacctcttgatgat 22384050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4627346 - 4627573
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4627346 gctctagcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaag 4627445  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4627446 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 4627545  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4627546 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4627573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28024843 - 28025070
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28024843 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28024942  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  28024943 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 28025042  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  28025043 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 28025070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 51785588 - 51785810
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51785588 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgc 51785687  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51785688 tgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 51785787  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  51785788 cttgcttaccaacctcttgatga 51785810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31032929 - 31032708
Alignment:
Q  7 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 106  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31032929 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 31032830  T
Q  107 ttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatct 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31032829 ttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatct 31032730  T
Q  207 tgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||| ||||||    
T  31032729 tgcttaccaacctctagatgat 31032708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5593056 - 5592829
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5593056 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttaatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 5592957  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5592956 ctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaacgcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 5592857  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5592856 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 5592829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5606009 - 5605786
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5606009 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 5605910  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  5605909 tgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtccgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcac 5605810  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  5605809 cttgcttaccaacctcttgatgat 5605786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 6205464 - 6205691
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205464 gctctggcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 6205563  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  6205564 ctgctgttactgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 6205663  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  6205664 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 6205691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 21678264 - 21678491
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21678264 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggatgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 21678363  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21678364 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 21678463  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  21678464 tcatcttgcctgccaacctcttgatgat 21678491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 24331724 - 24331951
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24331724 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 24331823  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  24331824 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 24331923  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24331924 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 24331951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 47027018 - 47027241
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47027018 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 47027117  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  47027118 tgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 47027217  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  47027218 cttgcttaccaacctcttgatgat 47027241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 4725201 - 4725419
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4725201 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 4725300  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4725301 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggaaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 4725400  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4725401 ttaccaacctcttgatgat 4725419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4793325 - 4793107
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4793325 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgagtcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 4793226  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4793225 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 4793126  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4793125 ttaccaacctcttgatgat 4793107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17981639 - 17981421
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17981639 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgctgtta 17981540  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17981539 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 17981440  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  17981439 ttaccaacctcttgatgat 17981421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18304344 - 18304126
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18304344 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18304245  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18304244 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 18304145  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18304144 ttaccaacctcttgatgat 18304126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 18334200 - 18334418
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18334200 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18334299  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  18334300 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccgatcatcttgc 18334399  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18334400 ttaccaacctcttgatgat 18334418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 179; E-Value: 1e-96
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29145446 - 29145228
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  29145446 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgtta 29145347  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    | || ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29145346 ccgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 29145247  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29145246 ttaccaacctcttgatgat 29145228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8286163 - 8285942
Alignment:
Q  7 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 106  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8286163 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 8286064  T
Q  107 ttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatct 206  Q
    |||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  8286063 ttaccgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatct 8285964  T
Q  207 tgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8285963 tgcttaccaacctcttgatgat 8285942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 178; E-Value: 4e-96
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11107040 - 11106831
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11107040 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactgggaaga 11106941  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  11106940 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacc 11106841  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  11106840 tcttgatgat 11106831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 7076767 - 7076994
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7076767 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgacatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaag 7076866  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  7076867 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagtattcttgccga 7076966  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7076967 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 7076994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 19698051 - 19698278
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19698051 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 19698150  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19698151 ctgctgttactgggaagattgcccgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 19698250  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19698251 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 19698278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 35884327 - 35884554
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884327 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 35884426  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  35884427 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaattaaaggtagcattcttgccga 35884526  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  35884527 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 35884554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 4687225 - 4687443
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4687225 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 4687324  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4687325 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaagacagtcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 4687424  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  4687425 ttaccaacctcttgatgat 4687443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15737784 - 15737566
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15737784 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgctgtta 15737685  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  15737684 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaatgtagcattcttgccgatcatcttgc 15737585  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  15737584 ttaccaacctcttgatgat 15737566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 18054832 - 18055050
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18054832 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18054931  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18054932 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 18055031  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18055032 ttaccaacctcttgatgat 18055050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18273742 - 18273524
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18273742 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18273643  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18273642 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 18273543  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18273542 ttaccaatctcttgatgat 18273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18289043 - 18288825
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18289043 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 18288944  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18288943 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 18288844  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||| |||||||||||    
T  18288843 ttaccaatctcttgatgat 18288825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 174; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Original strand, 8299538 - 8299759
Alignment:
Q  7 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 106  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8299538 gcttgggccgctaaacgcctgcgtcattatttgatgaatcatacaacttggttgatatccataatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 8299637  T
Q  107 ttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatct 206  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8299638 ttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagaattcttgccgatcatct 8299737  T
Q  207 tgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  8299738 tgcttaccaacctcttgatgat 8299759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 4e-93
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 29661666 - 29661442
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  29661666 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 29661567  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29661566 ccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatca 29661467  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||| ||||||    
T  29661466 tcttgcttaccaacctctcgatgat 29661442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 4420476 - 4420703
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4420476 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 4420575  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  4420576 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 4420675  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  4420676 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 4420703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 15889404 - 15889177
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15889404 gctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccggtaaagtatatctttgagaaag 15889305  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15889304 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 15889205  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15889204 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 15889177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20069601 - 20069828
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20069601 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatctggtgaatcatacaacttggttgaaatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 20069700  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20069701 ctgctgttactggaaagattgcacgctagcagatgctgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 20069800  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  20069801 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 20069828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 32442721 - 32442935
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32442721 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 32442820  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  32442821 ctgggaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 32442920  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  32442921 ttaccaacctcttga 32442935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20573539 - 20573315
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  20573539 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 20573440  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  20573439 ccgttactggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatca 20573340  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||||||||||    
T  20573339 tcttgcttatcaacctcttgatgat 20573315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5470549 - 5470776
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5470549 gctctagcgtgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 5470648  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  5470649 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 5470748  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  5470749 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 5470776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 18246302 - 18246529
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18246302 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 18246401  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  18246402 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 18246501  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18246502 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 18246529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 10399714 - 10399932
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10399714 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggctgtta 10399813  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  10399814 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgtcgatcaccttgc 10399913  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||| |||||    
T  10399914 ttaccaacctcttaatgat 10399932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22867544 - 22867320
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22867544 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 22867445  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22867444 ccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatca 22867345  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  22867344 ccttgcttatcaacctcttgatgat 22867320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 165; E-Value: 2e-88
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22882603 - 22882379
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  22882603 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 22882504  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  22882503 ccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatca 22882404  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
     |||||||| |||||||||||||||    
T  22882403 ccttgcttatcaacctcttgatgat 22882379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4343371 - 4343148
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  4343371 tagcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgt 4343272  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||     
T  4343271 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgttgttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcac 4343172  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  4343171 cttgcttatcaacctcttgatgat 4343148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 5653646 - 5653873
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5653646 gctctggcctgggccgctaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 5653745  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5653746 ctgttgttactgggaagattgcacgctgacaggtgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 5653845  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  5653846 tcatcctgcctaccaacctcttgatgat 5653873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31961154 - 31960927
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31961154 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 31961055  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  31961054 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaagacagcattcttgccga 31960955  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  31960954 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 31960927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 48469497 - 48469715
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  48469497 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 48469596  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  48469597 ctggaaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccaatcatcttgc 48469696  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  48469697 ttaccaacctcttgatgat 48469715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 6539441 - 6539214
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6539441 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 6539342  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || ||||| || ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  6539341 cggccgttacggggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 6539242  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  6539241 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 6539214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 8000121 - 8000348
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8000121 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaag 8000220  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  8000221 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 8000320  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  8000321 tcacctggcttaccagcctctcgatgat 8000348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 10646634 - 10646861
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10646634 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaag 10646733  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  10646734 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 10646833  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| || |||||||| ||||| ||||||    
T  10646834 tcacctggcttaccagcctctcgatgat 10646861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 28342747 - 28342965
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  28342747 tgggccgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 28342846  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||    
T  28342847 ctgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccgatcaccttgc 28342946  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||||||||||    
T  28342947 ttatcaacctcttgatgat 28342965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 147; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 16621180 - 16620966
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16621180 tgggccgccaaacgcttgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatcagataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 16621081  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    || | ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16621080 ctaggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 16620981  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
     ||||||||||||||    
T  16620980 ctaccaacctcttga 16620966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17973460 - 17973333
Alignment:
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17973460 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 17973361  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17973360 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 17973333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 17992630 - 17992526
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17992630 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 17992531  T
Q  101 ctgct 105  Q
    |||||    
T  17992530 ctgct 17992526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 11925053 - 11924927
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  11925053 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaggatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 11924954  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  11924953 tttaactggaaggattgctcgctggca 11924927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 16431970 - 16432096
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  16431970 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 16432069  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  16432070 tttaactggaaggattgctcgctggca 16432096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 5 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 7088722 - 7088535
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  7088722 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 7088623  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatc 192  Q
    | | ||||||| |||||| |||||||| ||| | || || || |||||||| | ||     ||||| || ||||||||||||||||||    
T  7088622 tttaactggaaggattgctcgctggcagatgttattgttcgagtatgatatcgagtatcgtactcagaaagcaatcaaaggtagcatc 7088535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 22960021 - 22960144
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  22960021 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 22960120  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  22960121 aactggaaggattgctcgctggca 22960144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 10 - 135
Target Start/End: Original strand, 6571924 - 6572049
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| ||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| | |    
T  6571924 tgggccgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagctttaa 6572023  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatg 135  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||    
T  6572024 ctggaaggatcgctcgctggcaaatg 6572049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Original strand, 20443681 - 20443834
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| |||    
T  20443681 ctagcctgggctgctaaacgtctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacctg 20443780  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattg 157  Q
    || | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  20443781 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 20443834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 44; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 160
Target Start/End: Original strand, 15705038 - 15705193
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||||| || ||||||||  | ||    
T  15705038 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggacccaatcaagtacatatttgagaagccagc 15705137  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgt 160  Q
    | | || |||| |||||| |||||||| ||| | ||||  || |||||||| ||||    
T  15705138 tttaaccggaaggattgctcgctggcagatgttattatccgagtatgatatcgtgt 15705193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5950501 - 5950347
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  5950501 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 5950402  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  5950401 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5950347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 98
Target Start/End: Original strand, 15919078 - 15919175
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| ||||||||||||||||  |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  15919078 gctctggcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggttgatatccaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaa 15919175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 15592610 - 15592387
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| |||| |||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||      
T  15592610 gctctagcctgggttgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaagc 15592511  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||| | || || | |||| | || ||||| ||||| ||||  || |||||||||| || |    |||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  15592510 ccgctttgacagggaggatttcccggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccgttctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgctga 15592411  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||    
T  15592410 tcacctggctcaccaaccacttga 15592387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 37260408 - 37260254
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |  | |||||  | |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  37260408 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatataattaatcacgctacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 37260309  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||    
T  37260308 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcaaatgctactatctgaatatgatat 37260254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 46380895 - 46381049
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| |  |||||||| || || || || |||||||||     
T  46380895 gctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaaatacatatttgagaaac 46380994  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  46380995 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 46381049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 98
Target Start/End: Original strand, 4450363 - 4450433
Alignment:
Q  28 cgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  4450363 cgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 4450433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 48)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11631825 - 11631602
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11631825 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 11631726  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11631725 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 11631626  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  11631625 cttgcttaccaacctcttgatgat 11631602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 34294757 - 34294980
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34294757 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 34294856  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34294857 tgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 34294956  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  34294957 cttgcttaccaacctcttgatgat 34294980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22924791 - 22924566
Alignment:
Q  3 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22924791 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 22924692  T
Q  103 gctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatc 202  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22924691 gttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 22924592  T
Q  203 atcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  22924591 atcttgcttaccaacctcttgatgat 22924566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 3 - 227
Target Start/End: Original strand, 3786094 - 3786318
Alignment:
Q  3 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3786094 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagct 3786193  T
Q  103 gctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatc 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3786194 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 3786293  T
Q  203 atcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  3786294 atcttgcttaccaacctcttgatga 3786318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13933192 - 13932965
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13933192 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcggcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 13933093  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13933092 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 13932993  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13932992 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 13932965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 21673820 - 21673597
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21673820 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccaataaagtatatctttgagaaag 21673721  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  21673720 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 21673621  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  21673620 tcatcttgcttaccaacctcttga 21673597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27120123 - 27120350
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120123 gctctagcttgggctgccaaacgcctgtgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27120222  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27120223 ctgctgttactgggaagattgcgcgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27120322  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27120323 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 27120350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27779833 - 27780060
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27779833 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27779932  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27779933 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27780032  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27780033 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27780060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 27819590 - 27819817
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27819590 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 27819689  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27819690 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 27819789  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27819790 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 27819817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 31879889 - 31880112
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31879889 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 31879988  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  31879989 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcat 31880088  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  31880089 cttgcttaccaacctcttgatgat 31880112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 34158443 - 34158670
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158443 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 34158542  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  34158543 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 34158642  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34158643 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34158670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37682536 - 37682313
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37682536 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 37682437  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37682436 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 37682337  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37682336 cttgcttaccaacctcttgatgat 37682313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37697801 - 37697578
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37697801 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 37697702  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37697701 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 37697602  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37697601 cttgcttaccaacctcttgatgat 37697578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 9346631 - 9346404
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346631 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 9346532  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  9346531 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 9346432  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  9346431 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 9346404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 37928972 - 37929195
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37928972 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 37929071  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  37929072 tgtcactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 37929171  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  37929172 cttgcttaccaacctcttgatgat 37929195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 40237107 - 40237334
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40237107 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 40237206  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  40237207 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 40237306  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40237307 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 40237334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 16825983 - 16825757
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16825983 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 16825884  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16825883 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 16825784  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16825783 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 16825757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 16895497 - 16895723
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16895497 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 16895596  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16895597 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 16895696  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16895697 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 16895723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 3 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 31890134 - 31889909
Alignment:
Q  3 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagct 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31890134 tctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcg 31890035  T
Q  103 gctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatc 202  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31890034 gctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatc 31889935  T
Q  203 atcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||    
T  31889934 accttgcttaccaacctcttgatgat 31889909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 257298 - 257071
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  257298 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 257199  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  257198 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 257099  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  257098 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 257071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19413146 - 19412919
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19413146 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaag 19413047  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  19413046 ctgccgttactggaaagatcgcacgctggcagatgcttttgtcagaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 19412947  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19412946 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 19412919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21699816 - 21699589
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21699816 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 21699717  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21699716 ctgctgttactgggaagattgcatgctggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 21699617  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21699616 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21699589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 32053402 - 32053629
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32053402 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgattaagtatatctttgagaaag 32053501  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  32053502 ctgctgttactggaaagatcgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcagaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 32053601  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  32053602 tcatcttgcttatcaacctcttgatgat 32053629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 12590410 - 12590634
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12590410 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 12590509  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12590510 ccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 12590609  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  12590610 tcttgcttaccaacctcttgatgat 12590634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20841512 - 20841739
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841512 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 20841611  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20841612 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 20841711  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20841712 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 20841739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 39048464 - 39048237
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39048464 gctctagcttgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtaaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 39048365  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  39048364 ctgctgtcactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 39048265  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  39048264 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 39048237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 4 - 228
Target Start/End: Original strand, 27807305 - 27807529
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27807305 ctagcttgggctgctaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcgg 27807404  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatca 203  Q
    | |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27807405 ccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatca 27807504  T
Q  204 tcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||| ||||||||||||||||||    
T  27807505 tcttgcctaccaacctcttgatgat 27807529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 12659135 - 12659362
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659135 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 12659234  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12659235 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 12659334  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  12659335 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 12659362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34271565 - 34271338
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271565 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaaccatacgacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 34271466  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  34271465 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 34271366  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34271365 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 34271338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 176; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 34865287 - 34865510
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  34865287 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggc 34865386  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
     |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||     
T  34865387 cgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcac 34865486  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||| |||||||||||||||    
T  34865487 cttgcttatcaacctcttgatgat 34865510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 175; E-Value: 2e-94
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27431077 - 27430859
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27431077 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 27430978  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27430977 ctgggaagattgcacgttggcagatgcttttgtcggaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 27430878  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  27430877 ttaccaacctcttgatgat 27430859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 171; E-Value: 6e-92
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23125204 - 23124987
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23125204 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 23125105  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23125104 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatacgatattgtgttc-aaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 23125006  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  23125005 gtaccaacctcttgatgat 23124987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 170; E-Value: 2e-91
Query Start/End: Original strand, 7 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12713240 - 12713019
Alignment:
Q  7 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |    
T  12713240 gcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagcggccg 12713141  T
Q  107 ttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatct 206  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  12713140 ttactggaaagattgcacgatggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcacct 12713041  T
Q  207 tgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  12713040 tgcttaccaacctcttgatgat 12713019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Original strand, 39893668 - 39893891
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  39893668 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggacccgataaagtatatctttgagaaag 39893767  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  39893768 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggccatcaaaggtagcattcttgccga 39893867  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  39893868 tcatcttgcttaccaacctcttga 39893891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 28885887 - 28886105
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  28885887 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatatagtatatctttgagaaagctgctgtta 28885986  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| || |||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28885987 ctgggaaaattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 28886086  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  28886087 gtaccaacctcttgatgat 28886105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Original strand, 16165088 - 16165306
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  16165088 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatctagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 16165187  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  16165188 ctggaaagattgcacgatggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcaccttgc 16165287  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||||    
T  16165288 ttaccaacctcttgatgat 16165306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 163; E-Value: 3e-87
Query Start/End: Original strand, 10 - 224
Target Start/End: Original strand, 37381285 - 37381499
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37381285 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 37381384  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||| ||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37381385 ctgggaagattgcacggtggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 37381484  T
Q  210 ttaccaacctcttga 224  Q
    |||||||||||||||    
T  37381485 ttaccaacctcttga 37381499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Original strand, 27395161 - 27395387
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  27395161 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccactatttgatgaatcatacaacttgggtgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaag 27395260  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  27395261 ctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttgtctgaatatgatattttgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctga 27395360  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  27395361 tcaccttgcctatcaacctcttgatga 27395387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 159; E-Value: 8e-85
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37948498 - 37948280
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  37948498 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagcggccgtta 37948399  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  37948398 ctgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgc 37948299  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||  |||||||||||||||    
T  37948298 ttgtcaacctcttgatgat 37948280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 151; E-Value: 5e-80
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19453059 - 19452841
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  19453059 tgggccgccaaacgcctacgtcattatttggtgaatcatataacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgctgtta 19452960  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  19452959 ctgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 19452860  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  19452859 ctaccaacctcttgatgat 19452841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 27828059 - 27828126
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccag 68  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27828059 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccag 27828126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 34701679 - 34701805
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  34701679 tagcttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagc 34701778  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| ||||||||    
T  34701779 tttaactggaaggattgctcgctggca 34701805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 42394141 - 42394264
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  42394141 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 42394240  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  42394241 aactggaaggattgctcgctggca 42394264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 21760257 - 21760104
Alignment:
Q  4 ctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctg 103  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||| || | | |||||| |||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| | |    
T  21760257 ctagcctgggccgccaaacgcctccgtcactatatgattagtcatactacttggttgatatctaagatggatccgatcaagtacatctttgagaaacccg 21760158  T
Q  104 ctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattg 157  Q
    || | || ||||  ||||| || ||||| ||| | ||||  |||||||||||||    
T  21760157 ctttgacaggaagaattgcccggtggcagatgttattatccgaatatgatattg 21760104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 22949992 - 22950146
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  22949992 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 22950091  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  22950092 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 22950146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 12384259 - 12384413
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || || ||| || |||| |  |||||||| || ||||| || ||||||||      
T  12384259 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacgtggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaagc 12384358  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  12384359 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 12384413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 34534079 - 34533991
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  34534079 tgggctgctaagcgtcttcgtcattatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 34533991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 10 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 26723912 - 26723824
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||||||| || || || ||||| ||| |||| ||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| || ||||||||    
T  26723912 tgggctgctaagcgtcttcgtcactatatggttaatcacactacttggttgatatccaaaatggatccgatcaagtacatttttgagaa 26723824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 196; Significance: 1e-107; HSPs: 13)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 5 - 228
Target Start/End: Original strand, 10966271 - 10966494
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10966271 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 10966370  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10966371 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 10966470  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  10966471 cttgcttaccaacctcttgatgat 10966494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28588587 - 28588814
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28588587 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28588686  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28588687 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 28588786  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28588787 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 28588814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20337072 - 20336845
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20337072 gctctggcctgggccgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 20336973  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20336972 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttatctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 20336873  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20336872 tcatcttgcctaccaaccccttgatgat 20336845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 28153338 - 28153565
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28153338 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 28153437  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28153438 ctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatacgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 28153537  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  28153538 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 28153565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 5 - 227
Target Start/End: Original strand, 10948683 - 10948905
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10948683 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgatcaagtatatctttgagaaagctgc 10948782  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  10948783 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcagatcat 10948882  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    |||||||| ||||||||||||||    
T  10948883 cttgcttatcaacctcttgatga 10948905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 6e-98
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16204675 - 16204463
Alignment:
Q  16 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16204675 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 16204576  T
Q  116 agattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttacca 215  Q
    ||||||| |||||| | |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16204575 agattgcccgctggaagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 16204476  T
Q  216 acctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||||    
T  16204475 acctcttgatgat 16204463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3644738 - 3644965
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3644738 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 3644837  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  3644838 cggccgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtattcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgcaga 3644937  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3644938 tcatcttgcttatcaacctcttgatgat 3644965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 5 - 224
Target Start/End: Original strand, 51641824 - 51642043
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  51641824 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattacttggtgaaccatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaagctgc 51641923  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcat 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51641924 tgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatactgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcat 51642023  T
Q  205 cttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  51642024 cttgcttaccaacctcttga 51642043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 4e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41789966 - 41789739
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41789966 gctctagcttgggctgctaagcgcctgcgccattatttggtgaatcatacgacttggctgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 41789867  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  41789866 cggccgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 41789767  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41789766 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 41789739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 9e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21894404 - 21894177
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21894404 gctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 21894305  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  21894304 cggctgttactgggaaggttgcacgctggcagatgctattgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctga 21894205  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21894204 tcatcttgcctaccaacctcttgatgat 21894177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 148; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 20464578 - 20464805
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||     
T  20464578 gctctggcctgggccgcaaaatgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaac 20464677  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  20464678 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtctgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattcttgccaa 20464777  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  20464778 tcatcttgcctgccaacctcttgatgat 20464805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 5 - 131
Target Start/End: Original strand, 22489627 - 22489753
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgc 104  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||    
T  22489627 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatccaatcaagtacatatttgagaagccagc 22489726  T
Q  105 tgttactggaaagattgcacgctggca 131  Q
    | | ||||||| |||||| || |||||    
T  22489727 tttaactggaaggattgctcgatggca 22489753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 5628654 - 5628500
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| || | || || || |||||| || |||| |  |||||||| || ||||| || |||||||||     
T  5628654 gctctagcctgggctgccaagcgcctccgtcattatatgattaaccacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaagtacatatttgagaaac 5628555  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  5628554 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 5628500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 9636 - 9863
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9636 gctctagcttgggctgctaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 9735  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9736 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 9835  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  9836 tcaccttgcttaccaacctcttgatgat 9863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0144 (Bit Score: 183; Significance: 4e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0144
Description:

Target: scaffold0144; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 4e-99
Query Start/End: Original strand, 1 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 22847 - 22621
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22847 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtacatctttgagaaag 22748  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  22747 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcagatgcttctgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattctcgccga 22648  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||||    
T  22647 tcaccttgcttatcaacctcttgatga 22621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 16181 - 16408
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16181 gctctggcctgggccgctaagcgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 16280  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16281 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 16380  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16381 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 16408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 180; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 3667 - 3894
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3667 gctctggcctgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggattcgataaagtatatctttgagaaag 3766  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  3767 ctgctgttactgggaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 3866  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3867 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 3894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 172; Significance: 1e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 1e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 228
Target Start/End: Original strand, 11549 - 11776
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11549 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgccattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaag 11648  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | || |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11649 cggccgttactgggaagatcgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggcagcattcttgccga 11748  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  11749 tcaccttgcttatcaacctcttgatgat 11776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 169; Significance: 9e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 9e-91
Query Start/End: Original strand, 16 - 228
Target Start/End: Original strand, 9660 - 9872
Alignment:
Q  16 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaa 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9660 gccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaaatatatctttgagaaagctgctgttactggga 9759  T
Q  116 agattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttacca 215  Q
    |||||||| ||||||| |||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9760 agattgcaagctggcagatgctcttgtctgaatatgatgttgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctacca 9859  T
Q  216 acctcttgatgat 228  Q
    |||| ||||||||    
T  9860 accttttgatgat 9872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 167; Significance: 1e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 1e-89
Query Start/End: Original strand, 10 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5826 - 5608
Alignment:
Q  10 tgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgtta 109  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |    
T  5826 tgggccgctaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcacacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaagctgccgtca 5727  T
Q  110 ctggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgc 209  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  5726 ctggaaagattgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgc 5627  T
Q  210 ttaccaacctcttgatgat 228  Q
     ||||||||||||||||||    
T  5626 ctaccaacctcttgatgat 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 166; Significance: 6e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 19 - 228
Target Start/End: Original strand, 13189 - 13398
Alignment:
Q  19 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaga 118  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||    
T  13189 aaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccagaatggatccgataaagtatatctttgagaaggcggccgttactgggaaga 13288  T
Q  119 ttgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacc 218  Q
    ||||||||||||| ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  13289 ttgcacgctggcagatgcttttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccgatcaccttgcttaccaacc 13388  T
Q  219 tcttgatgat 228  Q
    ||||||||||    
T  13389 tcttgatgat 13398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 138; Significance: 3e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 42 - 227
Target Start/End: Original strand, 22757 - 22942
Alignment:
Q  42 gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctctta 141  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||     
T  22757 gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaaaattgcgcgttggcaaatgctcttg 22856  T
Q  142 tttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatga 227  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  22857 tctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgctgatcaccttgcctatcaacctcttgatga 22942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0748 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0748
Description:

Target: scaffold0748; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 5327 - 5125
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||      
T  5327 gctctagcctgggctgccaaacgccttcgtcattacctggtaaatcatactacttggttgatatccaggatggatccaatcaagtatatcttcgagaagc 5228  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5227 ctgctgttactgggaagattgcacactggcagatgctcttgtctgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcattcttgccga 5128  T
Q  201 tca 203  Q
    |||    
T  5127 tca 5125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 118946 - 118762
Alignment:
Q  44 atcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatt 143  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |     
T  118946 atcatacaacttgggtgatatccagaatggatccgataaagtatatcttcgagaaacctgttgttactgggaagattgcacgctggcagatgctcttgtc 118847  T
Q  144 tgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    ||||||||| |||||||||||  ||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  118846 tgaatatgacattgtgttcaaggctcaaaaagctatcaaaggtagcattcttgccgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 118762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 24 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43354 - 43145
Alignment:
Q  24 cctgcgtc-attatttggt-gaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagt-atatctttgag-aaagctgctgttactggaaagat 119  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  43354 cctgcgtctattatttggttgaatcatacaacgtggttgatatccagaatggatccgataaagtaatatctttgagtaaagctgctgttactgggaagat 43255  T
Q  120 tgcacgctggcaaatgc-tcttatttgaatat-gatattgtgttc-aaaactc-aaaaggcaatcaaaggtagc--atccttgccgatca-tcttgctta 212  Q
    |||||| ||||| |||| | || | ||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||| |||||||||    
T  43254 tgcacgttggcagatgctttttgtctgaatatagatattgtgttcaaaaactcaaaaaggcaatcaaaggtagctatttcttgccgatcattcttgctta 43155  T
Q  213 ccaacctctt 222  Q
    ||||||||||    
T  43154 ccaacctctt 43145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0196 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0196
Description:

Target: scaffold0196; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 228
Target Start/End: Original strand, 1979 - 2109
Alignment:
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagc---atccttgc 197  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||| | ||||||||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||   || |||||    
T  1979 ctgctgttactaggaagattggacgctggcagatgctcttgtctgaatatggcattgtgttcaaggctcaaaaagcaatcaaaggtagcattattcttgc 2078  T
Q  198 cgatcatcttgcttaccaacctcttgatgat 228  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2079 cgatcatcttgcctaccaacctcttgatgat 2109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 52; Significance: 6e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 8 - 131
Target Start/End: Original strand, 10825 - 10948
Alignment:
Q  8 cttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaagctgctgt 107  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || ||||||||  | ||| |    
T  10825 cttgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcatacaacttggttgatatccaagatggatcctatcaagtacatatttgagaagccagcttt 10924  T
Q  108 tactggaaagattgcacgctggca 131  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  10925 aactggaaggattgctcgctggca 10948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0094 (Bit Score: 48; Significance: 1e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0094
Description:

Target: scaffold0094; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 224
Target Start/End: Complemental strand, 34896 - 34673
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | | |||||| |||||| ||||||| |  ||||||||||| ||||| || ||||||||      
T  34896 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattagtcatactacttggctgatatctaaaatggatccgatcaagtacatatttgagaagc 34797  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatattgtgttcaaaactcaaaaggcaatcaaaggtagcatccttgccga 200  Q
    | ||| | || |||| |||| |  | ||||| ||||| ||||  || |||||||||| || | |  |||| || ||||||||||| || |||||||| ||    
T  34796 ccgctttgacaggaaggatttcctggtggcagatgctattatccgagtatgatattgagtaccattctcagaaagcaatcaaaggcagtatccttgctga 34697  T
Q  201 tcatcttgcttaccaacctcttga 224  Q
    ||| || ||| ||||||| |||||    
T  34696 tcacctggctcaccaaccacttga 34673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 155
Target Start/End: Original strand, 29770 - 29924
Alignment:
Q  1 gctctagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaaag 100  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| || | ||||| || |||||| || |||| |  |||||||| || | ||| || ||||||||      
T  29770 gctctagcctgggctgccaaacgcctccgtcattatatgattaatcacactacttggctggtatctaaaatggatccaatcaggtacatatttgagaagc 29869  T
Q  101 ctgctgttactggaaagattgcacgctggcaaatgctcttatttgaatatgatat 155  Q
    | ||| | || |||| ||||||||| ||||| |||||  ||| ||||||||||||    
T  29870 ccgctttgacaggaaggattgcacggtggcagatgctactatctgaatatgatat 29924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 5062 - 4969
Alignment:
Q  5 tagcttgggctgccaaacgcctgcgtcattatttggtgaatcatacaacttggttgatatccaggatggatccgataaagtatatctttgagaa 98  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||||||| || | ||||| || |||||||||||||| |  |||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5062 tagcctgggctgccaagcgtctccgtcattatatgattaatcacactacttggttgatatctaaaatggatccaatcaagtatgtctttgagaa 4969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University