View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15541_low_2 (Length: 965)

Name: NF15541_low_2
Description: NF15541
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15541_low_2
NF15541_low_2
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (11-643)||(24097334-24097967)
chr8 (30-642)||(9417726-9418336)
chr8 (161-642)||(7836395-7836874)
chr8 (161-642)||(7806970-7807451)
chr8 (161-493)||(997043-997374)
chr8 (250-627)||(24268399-24268778)
chr8 (306-627)||(31576547-31576871)
chr8 (645-943)||(12729140-12729438)
chr8 (186-639)||(12765926-12766359)
chr8 (45-639)||(42713831-42714392)
chr8 (765-897)||(28696273-28696405)
chr8 (211-632)||(20036231-20036628)
chr8 (210-632)||(20028469-20028867)
chr8 (23-161)||(24268017-24268155)
chr8 (23-161)||(31576871-31577009)
chr8 (45-133)||(12765796-12765884)
chr8 (45-133)||(20025929-20026017)
chr8 (45-133)||(20036092-20036180)
chr8 (46-156)||(7836171-7836281)
chr8 (45-149)||(7806745-7806849)
chr8 (45-105)||(15968871-15968931)
chr8 (598-642)||(988045-988089)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (45-642)||(5382704-5383294)
chr1 (161-639)||(26907713-26908190)
chr1 (161-642)||(35755891-35756370)
chr1 (235-528)||(23550168-23550458)
chr1 (645-943)||(49053554-49053841)
chr1 (16-130)||(26908328-26908442)
chr1 (648-944)||(49061133-49061418)
chr1 (45-132)||(35756508-35756595)
chr1 (758-871)||(17458240-17458353)
chr1 (648-729)||(42263502-42263583)
chr1 (578-642)||(23550479-23550543)
[»] scaffold0091 (2 HSPs)
scaffold0091 (161-642)||(15775-16255)
scaffold0091 (45-130)||(16393-16478)
[»] chr3 (23 HSPs)
chr3 (48-642)||(7786580-7787163)
chr3 (161-638)||(36433913-36434388)
chr3 (250-642)||(9308174-9308565)
chr3 (645-943)||(52653523-52653821)
chr3 (161-457)||(13978313-13978611)
chr3 (393-639)||(23484847-23485084)
chr3 (161-349)||(9294433-9294620)
chr3 (192-639)||(13329567-13329990)
chr3 (818-943)||(50914650-50914776)
chr3 (463-642)||(46280172-46280350)
chr3 (47-156)||(13978718-13978827)
chr3 (45-133)||(23484536-23484624)
chr3 (758-940)||(33709572-33709748)
chr3 (45-132)||(9294757-9294844)
chr3 (45-132)||(9307892-9307979)
chr3 (186-373)||(23484666-23484850)
chr3 (161-223)||(9308116-9308177)
chr3 (645-733)||(40574383-40574471)
chr3 (548-639)||(13953365-13953456)
chr3 (907-944)||(23686023-23686060)
chr3 (907-944)||(24058260-24058297)
chr3 (875-942)||(2257454-2257521)
chr3 (645-739)||(33709783-33709877)
[»] chr6 (7 HSPs)
chr6 (45-636)||(14097225-14097798)
chr6 (161-639)||(2850091-2850568)
chr6 (645-940)||(28612215-28612508)
chr6 (45-448)||(17513876-17514265)
chr6 (45-156)||(2849868-2849979)
chr6 (45-133)||(2847101-2847189)
chr6 (533-639)||(17513735-17513841)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (161-642)||(29910072-29910552)
chr2 (161-611)||(14271709-14272142)
chr2 (52-599)||(18577306-18577829)
chr2 (45-639)||(35875607-35876167)
chr2 (45-639)||(35883096-35883656)
chr2 (45-639)||(36722809-36723369)
chr2 (161-356)||(33402865-33403060)
chr2 (648-944)||(34681175-34681468)
chr2 (645-923)||(14218955-14219233)
chr2 (45-130)||(33402642-33402727)
chr2 (45-130)||(14271486-14271571)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (161-642)||(11221904-11222375)
chr5 (161-642)||(42733687-42734157)
chr5 (186-642)||(26649088-26649538)
chr5 (186-642)||(26920673-26921123)
chr5 (161-627)||(2640939-2641403)
chr5 (765-944)||(36202864-36203043)
chr5 (659-868)||(9851526-9851735)
chr5 (513-642)||(26649562-26649690)
chr5 (513-642)||(26921147-26921275)
chr5 (766-945)||(29006217-29006398)
chr5 (784-949)||(11042983-11043148)
chr5 (11-80)||(14914987-14915056)
chr5 (45-156)||(11221691-11221802)
chr5 (45-133)||(26648959-26649046)
chr5 (45-133)||(26920544-26920631)
chr5 (45-150)||(42734271-42734376)
chr5 (765-942)||(28274014-28274197)
[»] chr7 (19 HSPs)
chr7 (161-642)||(9735476-9735947)
chr7 (335-642)||(4314283-4314589)
chr7 (186-639)||(32816599-32817042)
chr7 (170-627)||(8980593-8981048)
chr7 (186-639)||(2890331-2890777)
chr7 (359-639)||(48712737-48713008)
chr7 (666-937)||(12239713-12239983)
chr7 (161-311)||(4314588-4314738)
chr7 (49-161)||(4314934-4315046)
chr7 (49-150)||(28343551-28343652)
chr7 (49-156)||(8981259-8981366)
chr7 (45-133)||(9735257-9735345)
chr7 (45-133)||(32816469-32816557)
chr7 (186-257)||(48714346-48714417)
chr7 (758-944)||(1840399-1840586)
chr7 (45-133)||(48714459-48714544)
chr7 (759-924)||(24870206-24870370)
chr7 (82-133)||(2890238-2890289)
chr7 (907-937)||(43476893-43476923)
[»] chr4 (33 HSPs)
chr4 (161-638)||(50065953-50066428)
chr4 (195-632)||(11480852-11481290)
chr4 (161-642)||(25514628-25515106)
chr4 (161-642)||(28069370-28069846)
chr4 (161-606)||(50518337-50518784)
chr4 (290-627)||(9243794-9244130)
chr4 (161-488)||(34495225-34495548)
chr4 (170-627)||(7580352-7580809)
chr4 (335-570)||(9204011-9204249)
chr4 (662-943)||(24129429-24129710)
chr4 (335-570)||(9208230-9208468)
chr4 (304-461)||(28257581-28257737)
chr4 (746-942)||(20251147-20251342)
chr4 (758-937)||(48780044-48780222)
chr4 (45-150)||(11477904-11478009)
chr4 (45-130)||(50518923-50519008)
chr4 (759-917)||(1494956-1495114)
chr4 (857-942)||(122829-122914)
chr4 (770-899)||(1516526-1516655)
chr4 (45-132)||(28069146-28069233)
chr4 (77-158)||(34495747-34495828)
chr4 (182-251)||(25254588-25254657)
chr4 (48-156)||(7580033-7580141)
chr4 (290-374)||(9245645-9245729)
chr4 (45-132)||(25514405-25514492)
chr4 (45-132)||(50066565-50066652)
chr4 (170-244)||(9243722-9243796)
chr4 (41-150)||(28257857-28257966)
chr4 (161-201)||(11478127-11478167)
chr4 (778-853)||(1533060-1533135)
chr4 (46-89)||(5211747-5211790)
chr4 (565-639)||(28257413-28257485)
chr4 (911-944)||(47078212-47078245)
[»] scaffold0482 (2 HSPs)
scaffold0482 (161-470)||(11410-11717)
scaffold0482 (45-149)||(11838-11942)
[»] scaffold0753 (4 HSPs)
scaffold0753 (298-627)||(2893-3221)
scaffold0753 (290-608)||(826-1147)
scaffold0753 (45-156)||(1243-1354)
scaffold0753 (170-244)||(3227-3301)
[»] scaffold0959 (2 HSPs)
scaffold0959 (290-590)||(2611-2913)
scaffold0959 (45-132)||(2404-2491)
[»] scaffold0135 (7 HSPs)
scaffold0135 (335-570)||(2094-2332)
scaffold0135 (335-570)||(6309-6547)
scaffold0135 (335-570)||(10524-10762)
scaffold0135 (335-570)||(14739-14977)
scaffold0135 (335-570)||(18954-19192)
scaffold0135 (335-570)||(23169-23407)
scaffold0135 (335-570)||(27384-27622)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (645-944)||(217508-217796)
scaffold0007 (765-937)||(215646-215816)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (210-632)||(399-797)
[»] scaffold0842 (1 HSPs)
scaffold0842 (45-161)||(3051-3163)
[»] scaffold0186 (2 HSPs)
scaffold0186 (45-133)||(3121-3209)
scaffold0186 (496-606)||(3511-3621)
[»] scaffold0771 (1 HSPs)
scaffold0771 (548-639)||(5505-5596)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 11 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 24097967 - 24097334
Alignment:
Q  11 agcagcacagactcaaaagaagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcat 110  Q
    |||| |||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  | ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24097967 agcatcacaaactcaaatgaagatatatcaattgtttgaatcaaaag--tcttgagtgaagattcaacaagaagatgaactttatgattaattgattcat 24097870  T
Q  111 catcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatattcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaaga 210  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || |||||||| |||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |    
T  24097869 catcgtcaccacatgattttcaacaacgtcttaaagattcaaggaagaaaagacatgtctaatttaaaacatctcaaaaatactcaatggacaagaaaca 24097770  T
Q  211 ttgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaag 310  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  24097769 ttgtgtgcaatcaccaagatgtattatgagataaattgcatcattaacaaaataatccaaggttcattaaccgagaaggtattgtcatctcatatagaag 24097670  T
Q  311 agaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaact 410  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||    
T  24097669 agaacattatcaactctgatgaaagaattttctcatgataaggatggctattacacttgaaattattctcatcatttcatcaaaataattagaatcaact 24097570  T
Q  411 ttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcat 510  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  24097569 ttgaagagaaaccaatccataaatgaattattcattaagtcattcattcatgatgttgattggagaattatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcat 24097470  T
Q  511 gaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaa----tcaaagaaatttt 606  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||||| || |||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||    |||||  ||||||    
T  24097469 gaagattctatcatacaagacttagcatgatccaagaatcatccatcactattcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaattactcaaatgaatttt 24097371  T
Q  607 gacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatatt 643  Q
    ||||| | |||| || | ||| |||||||||||||||    
T  24097370 gactttgagaaaagtctttcatgttcctacaaatatt 24097334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 642
Target Start/End: Original strand, 9417726 - 9418336
Alignment:
Q  30 aagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttt 129  Q
    ||||| || ||||| ||||||||||||||||||  ||| || |||| || |||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||    
T  9417726 aagatgtagcaattgtttgaatcaaaagagtgtgcagtaaagattccacgagaagacgaactttatgagtaatttattcatcatcatcaccgcatggttt 9417825  T
Q  130 tcaaaaatgtcttaaatattcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaaga 229  Q
    |||| |||| |||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9417826 tcaacaatgccttaaagattcaaggaagaaaaggcatgcataaactaaaacatcttaaaggtactcaatggacaagaaacattgtgtgcaatcaccaaga 9417925  T
Q  230 ggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctga 329  Q
      |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||    
T  9417926 aaaattatgagataaattgcatcatcaacaaaataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatatcatatagaagagaaaattatcaactccga 9418025  T
Q  330 tgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattca 429  Q
    |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  9418026 tgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatattacactcgaaattattctaatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattca 9418125  T
Q  430 tgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaag 529  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||     
T  9418126 taaatgaattatttattaagtcgttcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaat 9418225  T
Q  530 tcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacg 629  Q
      ||| |||| || || ||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||   ||||||||| ||| |    
T  9418226 atttatgatggtccaagaatcttccatcac-attcaagatataattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttaagaaaggtttatcatg 9418323  T
Q  630 ttcctacaaatat 642  Q
    |||||||||||||    
T  9418324 ttcctacaaatat 9418336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 7836395 - 7836874
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  7836395 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaatattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataatttgcatcatcaacaa 7836493  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || ||||||||||||  |||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  7836494 aataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcata 7836593  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7836594 ttacactggaaattattatcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 7836693  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  || | |||| || || |||| || ||||||    
T  7836694 tgatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtccaagaatcctctatcact 7836793  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| || ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7836794 attcaatatatgattt-ggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatat 7836874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 213; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 7806970 - 7807451
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  7806970 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaatattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataatttgcatcatcaacaa 7807068  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || ||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||  ||    
T  7807069 aataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgcata 7807168  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  7807169 ttacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 7807268  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaag--aataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatca 558  Q
    |||||||||| ||||||  |||||||  || |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||  || | |||| || || |||| || ||||    
T  7807269 tgatattgatcggagaatgatcaaagaaaaaaaaaatcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatactcatgatggtctaagaatcctctatca 7807368  T
Q  559 ctattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||||| || ||||||||| |||||| |  ||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  7807369 ctattcaatatatgattt-ggagaacaacaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttccaacaaatat 7807451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 161 - 493
Target Start/End: Original strand, 997043 - 997374
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  997043 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataaattgcatcatcaacaa 997141  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| |||||||| || || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  997142 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcgtcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcata 997241  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  997242 ttacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 997341  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaa 493  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||    
T  997342 tgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaa 997374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 250 - 627
Target Start/End: Original strand, 24268399 - 24268778
Alignment:
Q  250 atcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgat 349  Q
    |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||    
T  24268399 atcaccaacaaaataattcaaggttaattaaccgagaatttattgtcatctcatatagaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataat 24268498  T
Q  350 aaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaag 449  Q
     | ||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24268499 gaagatgcatattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattataatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaag 24268598  T
Q  450 tcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaat 549  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||| |||| ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||  ||||||||||| || |||    
T  24268599 tcattcattaatgatattgattgaaaaaatataaaagaagaaaattcatgatcacatgcttgatgattctatcgtaaaagatttaggatgatcgaagaat 24268698  T
Q  550 cttccatca--ctattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
    |||||||||   | ||||||||||||||  |||||||| |||| |||||||  |||||| |||| | || ||||||||||    
T  24268699 cttccatcatttttttaaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaacgaatttttactttgagagaggtttctca 24268778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 6e-89
Query Start/End: Original strand, 306 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 31576871 - 31576547
Alignment:
Q  306 agaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggat 405  Q
    ||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||| |||||| || || |||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  31576871 agaagcgaacattatcaactccgatgaaagaatgatctcataatgagtatgcatattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaat 31576772  T
Q  406 caactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcata 505  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |    
T  31576771 caactttgaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcaca 31576672  T
Q  506 tgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactatt---aaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaa 602  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||  || |||||||||||| | ||   ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||  ||    
T  31576671 tgcttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatcatttttttaaaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaa 31576572  T
Q  603 ttttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
    |||| |||| | || ||||||||||    
T  31576571 tttttactttgagagaggtttctca 31576547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 9e-82
Query Start/End: Original strand, 645 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 12729438 - 12729140
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatatt 744  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||  ||| |||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||    
T  12729438 ttctgtcaatttctctcgtgcactagagaaaagaaagaattatttagtataattttcggcagaattttgacacacaacaatgtgattttctgtctatatt 12729339  T
Q  745 cctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatgg 844  Q
      |||||||||| |||||| || | ||  |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||    
T  12729338 tttgacttcttttctgcctccataatgcatctatttacagagaaatttatgtcctgtggtgaagagaaacaactctttagaagagtttgctcatgaatgg 12729239  T
Q  845 ttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaa 943  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12729238 ttatattgcttcaattgtcgagcattacaccttttctctaaaaggtctctatttaaccattgcaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaa 12729140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 3e-66
Query Start/End: Original strand, 186 - 639
Target Start/End: Original strand, 12765926 - 12766359
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||   |||| ||||||||    | |||||| | || ||||||| ||    
T  12765926 aaagacacttaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaaatatgagaagaattgtatcatcaa----acaattcaaggttaattaaccaag 12766021  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatca 384  Q
    ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| |         
T  12766022 aagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattct----- 12766116  T
Q  385 tttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaa 484  Q
       |||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||| ||||||||||||||||||         ||||||| ||||||    
T  12766117 ---catcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattattcattaagtcattcattaat---------tggagaactatcaa 12766204  T
Q  485 agaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaat 584  Q
     ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| | || ||||||| |||| |||||||    
T  12766205 ggaagacaaatcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttccatcatttttcaagatataatttgggagaat 12766304  T
Q  585 ataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    | |||| ||| |||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  12766305 agaaatcaataaaaggaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 12766359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 45 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 42714392 - 42713831
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || | |||||    
T  42714392 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttttcaacaaagccttaa 42714293  T
Q  145 at-attcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  |||| ||||| |||     ||  |||        || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||| ||||||||||      
T  42714292 aagattcgaggaataaa-----tgattaat-------atttgaaagacactcaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagagaaattatgagaag 42714205  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccga-gaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgtt 341  Q
     |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| | |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||    
T  42714204 aattgcatcatcaa----acaattcaaggttgatttaccaaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggtt 42714109  T
Q  342 ctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttat 441  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||||||| ||||||||||   |||||||| ||||    
T  42714108 ctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaggagaaaccaaccgatgaatgaattat 42714009  T
Q  442 ttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataa-aagtcttaggatga 540  Q
    | |||||                     |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  | || |||||    
T  42714008 tcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaaacataagatga 42713930  T
Q  541 tcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    || || |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | |||| |||||||| |||| ||||||    
T  42713929 tccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 42713831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 765 - 897
Target Start/End: Original strand, 28696273 - 28696405
Alignment:
Q  765 caaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtca 864  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |    
T  28696273 caaagtgtctctatttatggagaaacttatgttctttggtgaagagaaacatccctttagaagagtttgttcatgaatggttacattgcttcaattgtta 28696372  T
Q  865 agcattataccttttctctaaaaggtctctatt 897  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||    
T  28696373 agcattacacattttctctaaaagatctctatt 28696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 211 - 632
Target Start/End: Original strand, 20036231 - 20036628
Alignment:
Q  211 ttgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaag 310  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| ||||| ||||||| ||| | |||||||    
T  20036231 ttgtgtggaatcactaagagaaattatgagaagaattgcatcatcaa----acaattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaag 20036326  T
Q  311 agaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaac 409  Q
    |||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||    
T  20036327 agaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaac 20036426  T
Q  410 tttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgca 509  Q
    |||||||||||| |||   |||||||| ||||| ||||                     ||||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||    
T  20036427 tttgaagagaaatcaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgca 20036505  T
Q  510 tgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgac 609  Q
    ||||||||||||||||| |  | ||||||| ||||| |||||||||||| | || |||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| || ||| ||    
T  20036506 tgaagattctatcataataaacataggatggtcaaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaaattttac 20036605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 632
Target Start/End: Original strand, 20028469 - 20028867
Alignment:
Q  210 attgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaa 309  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  20028469 attgtgtggaatcactaagagaaattatgagaagaattgcatcatcaa----acaattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaa 20028564  T
Q  310 gagaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaa 408  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || |  ||||| |||| ||||| |||||    
T  20028565 gagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaa 20028664  T
Q  409 ctttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgc 508  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||                     ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  20028665 ctttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgc 20028743  T
Q  509 atgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttga 608  Q
    |||||||||||||||||| |  |  |||||| || || |||||||||||| | || |||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |||||| |    
T  20028744 atgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaattttta 20028843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Original strand, 24268017 - 24268155
Alignment:
Q  23 tcaaaagaagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccac 122  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| | ||| |    
T  24268017 tcaaaagaagatataacaattgtttgaatcaaaagagtgttaagtgaagattcaacaagaagatggactttatgattaattgattcatcatcgtgaccgc 24268116  T
Q  123 atggttttcaaaaatgtcttaaatattcaaggaagaaaa 161  Q
    |||||||| || || | |||||| |||| ||||| ||||    
T  24268117 atggttttgaacaaagccttaaagattcgaggaataaaa 24268155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 23 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 31577009 - 31576871
Alignment:
Q  23 tcaaaagaagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccac 122  Q
    ||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| |    
T  31577009 tcaaaagaagatataccaattgcttgaatcaaaagagtgttgagtgaagattcaacaaaaagatgaactttatgattagttgattcatcatcgtgaccgc 31576910  T
Q  123 atggttttcaaaaatgtcttaaatattcaaggaagaaaa 161  Q
    |||||||| || || | |||||| |||| ||||| ||||    
T  31576909 atggttttgaacaaagccttaaagattcgaggaataaaa 31576871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 12765796 - 12765884
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12765796 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcatcaccacatggttttcaa 12765884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 20025929 - 20026017
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20025929 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggatttcaa 20026017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 20036092 - 20036180
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||| ||||||    
T  20036092 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggatttcaa 20036180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 46 - 156
Target Start/End: Original strand, 7836171 - 7836281
Alignment:
Q  46 ttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaa 145  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||  || | ||||||    
T  7836171 ttgaattaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatccttgtcaccacatggttttcatcaaagccttaaa 7836270  T
Q  146 tattcaaggaa 156  Q
    ||||| |||||    
T  7836271 tattcgaggaa 7836281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Original strand, 7806745 - 7806849
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||  || | |||||    
T  7806745 tttgaattaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatccttgtcaccacatggttttcatcaaagccttaa 7806844  T
Q  145 atatt 149  Q
    |||||    
T  7806845 atatt 7806849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 105
Target Start/End: Original strand, 15968871 - 15968931
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattga 105  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  15968871 tttgaatcaaatgggtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttataatcaattga 15968931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 598 - 642
Target Start/End: Original strand, 988045 - 988089
Alignment:
Q  598 agaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  988045 agaaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 988089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 45 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 5383294 - 5382704
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  5383294 tttgaatcaaatgagtgttgaatgaagattcaacaagaaggtgaactttttgagtaattgattcatcattctcaccacatggttttcaacaatgccttaa 5383195  T
Q  145 atat-tcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  | |||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5383194 aagtatcaaggaagaaaagacattcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaacattgtgtgcaatcaccaagagaaattatgagata 5383095  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttct 343  Q
     || |||||| ||||||||||||||| | || ||||||  ||||  |||||||||       ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  5383094 aatcgcatcaccaacaaaataattcaaggttaattaacgaagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttct 5383002  T
Q  344 catgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttattt 443  Q
    |||||| ||||||  ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5383001 catgatgaggatgcatattacactcgaaatcagtctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataagttattt 5382902  T
Q  444 attaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatca 543  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| |||| |||| ||     
T  5382901 attaattcactcattaatgatattgtttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggaggttctatcataaaagacttatgatggtcc 5382802  T
Q  544 aaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    || |||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| || |||| |||||||| |||| ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||||    
T  5382801 aagaatctttcatcactattcaagatatgattt-ggagagtagaaatcaatcaaaggaattgtgattttgagaaaggtttctcacgttcctaaaaatat 5382704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 161 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 26908190 - 26907713
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||| |    
T  26908190 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagatacattgtgtgcaatcaccaagaggaattgtgtgataaattgcatcatcaacca 26908091  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| |   || || ||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| | ||||  ||    
T  26908090 aataatttaatgttaatcaaccgagaatgtatcgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaaggttctcatgatgaagatgcata 26907991  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  26907990 ttacactcaaaattatc-tcatcatttcatcaaaatgatcagaatcaactttgaagagaaaccaaatcatgaatgaattatttattaagtcattcattaa 26907892  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||  || || |||||| |||||||    
T  26907891 tgatattgattggagaaatatcatagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatagtctaagaatctttcatcact 26907792  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    ||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| |||||||||||    
T  26907791 attcaagatatgttttgggagaatataaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaatgtttctcatgttcctacaaa 26907713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 35756370 - 35755891
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  35756370 atgcatacctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgcgtgcaatcaccaacatgaactatgagataaattgcatcatcaacaa 35756272  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | ||  ||||||||||| ||||||||||| || |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||| ||||||  ||    
T  35756271 aataattaaaggttagttaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatgttttcatgatgaggatgcata 35756172  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||| ||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  35756171 ttacactagaaattattctcatcatttcataaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 35756072  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    ||||||||||  |||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||   ||| |||| || || |||| || ||||||    
T  35756071 tgatattgatctgagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaatatttatgatggtctaagaatcctctatcact 35755972  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35755971 attcaagatatgattt-ggagaacataaatcaatcaaagaaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 35755891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 235 - 528
Target Start/End: Original strand, 23550168 - 23550458
Alignment:
Q  235 tatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat 334  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||     
T  23550168 tatgagataaattgcatcatcaacaaaataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaa 23550267  T
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaat 434  Q
    ||||||||||||| |   ||||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||| ||| ||||||||||||    
T  23550268 gaatgttctcatggt---gatgcatattacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagataaatcaattcatgaat 23550364  T
Q  435 gagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaa 528  Q
    || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |  ||||||||||||||||    
T  23550365 gaattatttattaagtcattcatttatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataaaa 23550458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 645 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 49053841 - 49053554
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaag-caaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatat 743  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||  | || |||| ||||  |||||||||||||||| | ||| |||    
T  49053841 ttctgccaatttccctcgtgcactagagaagagaaagaatgatttagtataattttttggcagaattatgacacacaacaatgtgattttatgtctctat 49053742  T
Q  744 tcct--gacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaa 841  Q
    |  |  || |||||| |||||  || | ||||| |||||||| | ||| |||||| |||||||||||| | | || | |||| ||||||||||  |||||    
T  49053741 ttttcagaattcttttctgccaccataatgtctatatttatataaaaacttatgtcctttggtgaagagacacaatcatttgaaagagtttgtttatgaa 49053642  T
Q  842 tggttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcac 941  Q
    |||||| |||||              | || |||||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49053641 tggttacattgc--------------aatacaccttttcactaaaaggtctttatttaaccattgcaactttccaaatatattttggaaatttctctcac 49053556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 16 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 26908442 - 26908328
Alignment:
Q  16 cacagactcaaaagaagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatca 115  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||  |||||||| |||| ||||||| |||| |||||||| ||||| |||||| || || ||     
T  26908442 cacaaactcaaaagaagatatagcaattgtttgaatcaaataagtgttgattgaagattcaactagaatatgaatttgatgatcaattgactcgtcctcg 26908343  T
Q  116 tcaccacatggtttt 130  Q
    |||||||||||||||    
T  26908342 tcaccacatggtttt 26908328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 648 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 49061418 - 49061133
Alignment:
Q  648 tgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaag-caaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatattc- 745  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||  | || |||| ||||  |||||||||||||||| | ||| ||||      
T  49061418 tgtcaatttccctcgtgcactagagaaaagaaagaatgatttagtataatttttcggcagaattatgacacacaacaatgtgattttatgtctctatttt 49061319  T
Q  746 -ctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatgg 844  Q
     |||| |||||| |||||   | | |||||||||||||| ||||| |||||| |||| ||||||| | | ||   |||| |||| |||||  ||||||||    
T  49061318 tctgaattcttttctgccactataatgtctctatttatatagaaacttatgtcctttcgtgaagagacacaattatttgaaagaatttgtttatgaatgg 49061219  T
Q  845 ttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    ||| |||||              | || |||| ||| ||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49061218 ttacattgc--------------aatacacctattcactaaaaggtctttatttaaccattgcaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 49061133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 35756595 - 35756508
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    |||||||||||  |||||||| | || ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  35756595 tttgaatcaaataagtgttgattaaagattcaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatcctcgtcaccacatggttttca 35756508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 758 - 871
Target Start/End: Complemental strand, 17458353 - 17458240
Alignment:
Q  758 ctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgcttta 857  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||| |||   ||| |||| ||||| | |||||||||| ||||| | |    
T  17458353 ctgcctttaaagtatctcaatttatagataaacttatgtcctttggtgaagagaaacaactacttgaaagaatttgttcttgaatggttacattgcatga 17458254  T
Q  858 attgtcaagcatta 871  Q
    |||||||| |||||    
T  17458253 attgtcaaacatta 17458240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 648 - 729
Target Start/End: Original strand, 42263502 - 42263583
Alignment:
Q  648 tgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtga 729  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||  ||| ||||| |||| |||||||    
T  42263502 tgtcgatttctctcgtgcactagagaaaagaaagaatgatatagtattattttaggcagtattttgactcacaagaatgtga 42263583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 578 - 642
Target Start/End: Original strand, 23550479 - 23550543
Alignment:
Q  578 ggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23550479 ggagaacagaaatcaatcaaagaaattttaactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 23550543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 2)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 16255 - 15775
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16255 atgcatgcttaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaacattgtgtgcaaccaccaagagaaattatgagataaatcgcatcatcaacaa 16156  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||| ||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||| || |||||||| ||||||  |||||||||| ||| ||||||  ||    
T  16155 aataagtcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaaaagaacatcatcaactccgatgaaacaatgttctcaagatgaggatgcata 16056  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16055 ttacactctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattatgtcattcattaa 15956  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||    
T  15955 tgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaatacatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcact 15856  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| ||||||| |||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15855 attcaagatataattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 15775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091; HSP #2
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16478 - 16393
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggtttt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  16478 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttataatcaattgactcatcctcatcaccacatggtttt 16393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 23)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 48 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 7787163 - 7786580
Alignment:
Q  48 gaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaata 147  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||  || ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||| || |||| |||||| |    
T  7787163 gaatcaaatgagtgttgagtaaagattcaacaagaagatgaaccttttgagtaattgattcatcattctcaccacatggttttgaacaatgccttaaaga 7787064  T
Q  148 ttcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatatt 247  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||| ||     
T  7787063 ttcaagaaagaaaagacatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgtacaagaaacattgtgtgcaatcaccatgagaagttatgagataaatc 7786964  T
Q  248 gcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatg 347  Q
     ||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||       ||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||| ||    
T  7786963 acatcaccaacaaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcgtg 7786871  T
Q  348 ataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttatta 447  Q
    || | ||||  ||||||||||||||||  | | |||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7786870 atgaagatgcatattacactcgaaatttgtctcatcatttcattaaaaagattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttatta 7786771  T
Q  448 agtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaa 547  Q
    | ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||   |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| || || |    
T  7786770 attcattcattaatgatattggttgaggaaatatcaaag---aaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaaga 7786674  T
Q  548 atcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||| | | |||| |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  7786673 atcttccatcactattcacgatatgattt-gaaaaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttcttatgttcctacaaatat 7786580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 161 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 36434388 - 36433913
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  36434388 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataaattgcatcatcaacaa 36434290  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| || ||||||  ||    
T  36434289 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaatagaacattatcaactccggtgaaagaatgttctcattatgaggatgcata 36434190  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  36434189 ttacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaaaagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 36434090  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||| ||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||| |||||  |||| |||| || || |||| || ||||||    
T  36434089 tgatgttgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcgtaaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcact 36433990  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaa 638  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  36433989 attcaagatatgattt-ggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaa 36433913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 3e-97
Query Start/End: Original strand, 250 - 642
Target Start/End: Original strand, 9308174 - 9308565
Alignment:
Q  250 atcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgat 349  Q
    |||||||||||||||| | | | || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9308174 atcatcaacaaaataaataaagattaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgat 9308273  T
Q  350 aaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaag 449  Q
     ||||||  ||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  9308274 gaggatgcatattacacaagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaag 9308373  T
Q  450 tcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaat 549  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||  |||| |||| || || |||    
T  9308374 tcattcatttatgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttaagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaat 9308473  T
Q  550 cttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | || ||||||||| || |||| |||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  9308474 cctctatcactattcaaaatataattt-ggagaagagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttttcatgttcctacatatat 9308565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 645 - 943
Target Start/End: Complemental strand, 52653821 - 52653523
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatatt 744  Q
    |||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||| || | |||| ||||| |||| ||||   ||| |||||||||| ||||||| || |||||    
T  52653821 ttctgtcaattttcctcgtgcactagagaaaagtaagaatgatttagtataattttcagcagaatttaaactcacaacaatgtaattttctgtcgatatt 52653722  T
Q  745 cctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatgg 844  Q
     |||| |||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||| || ||| |||||||||||| | | |||| |||  |||||||||| |||||||||    
T  52653721 actgaattcttttctgcctccaaagtgtctttgtctatagagaaacttgtgtcctttggtgaagagacacaaccatttaaaagagtttgttcatgaatgg 52653622  T
Q  845 ttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaa 943  Q
    ||| ||||| | ||||||||| || || |||||||| ||||||||| | |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52653621 ttacattgcatcaattgtcaaacaatacaccttttcactaaaaggtatttatttaatcattgcaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaa 52653523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 161 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 13978611 - 13978313
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatca-aca 259  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||  ||||||||||||||| | ||  || || |  |||    
T  13978611 atgcatgtctaaactaaaacatttcaaagatactcaatgggcaagaaacattgtgtgaaatcactgagaggaattatgagaaaaatcacaccaccggaca 13978512  T
Q  260 aaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtg 358  Q
    |||||||||| | || ||| ||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||| |||| | ||||      
T  13978511 aaataattcaaggttaattgaccaagaagatattgtcttctcatataaaagagaaccttatcaactttgatgaaaagaatggtctcgtgatgatgatgat 13978412  T
Q  359 tattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcat 457  Q
    ||||||||| ||||||||| |||| | ||||   |||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  13978411 tattacacttgaaattattcttattacttcacggaaatgattagaatcaactttgaagataaacaaatccatgaatgaactattcattaagtcattcat 13978313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 6e-46
Query Start/End: Original strand, 393 - 639
Target Start/End: Original strand, 23484847 - 23485084
Alignment:
Q  393 aaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaa 492  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||| | ||||||||||||||||||||||||         ||||||| |||||| ||| | |    
T  23484847 aaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaataaattatttattaagtcattcattaat---------tggagaactatcaaggaagaca 23484937  T
Q  493 actcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatga 592  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| |||| | || ||||||| |||| |||||||| |||| |    
T  23484938 aatcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagacttaggatgatccaagaatcttcaatcatttttcaagatataatttgggagaatagaaatca 23485037  T
Q  593 atcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    || |||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  23485038 ataaaaggaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 23485084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 161 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 9294620 - 9294433
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||| || | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  9294620 atgcatggctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattatgtgcaatcactaacatgaactatgagataaattgcatcatcaacaa 9294522  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgat 349  Q
    ||||||| |   || ||||||| |||| |||||||||||  | ||| || |||| ||||||||||| ||||||  ||||||||||||||    
T  9294521 aataattaaaagttaattaaccaagaatgtattgtcatcctatatataatagaacattatcaactccgatgaaaaaatgttctcatgat 9294433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 192 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 13329990 - 13329567
Alignment:
Q  192 actcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggta 291  Q
    |||||||| |||||| | |||||||| |||||| ||||||||||||| ||   |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| ||||| ||    
T  13329990 actcaatgaacaagacacattgtgtggaatcactaagaggaattatgggaagaattgcatcatcaa----acaattcaaggttgattgaccaagaagata 13329895  T
Q  292 ttgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcat 390  Q
    ||||| |||   ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||    
T  13329894 ttgtcttcttctatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaatgttctcatggtgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcat 13329795  T
Q  391 caaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaata 490  Q
    | |||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||                     ||||||||| |||||| ||| |    
T  13329794 cgaaataattcgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaaga 13329716  T
Q  491 aaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaat 590  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||| | || |||||||||||| | || |||||||||||   ||||||| ||||    
T  13329715 aaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgaaccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgcgagaatagaaat 13329616  T
Q  591 gaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
     |||||||| |||||| |||| | |||| | |||||| |||| ||||||    
T  13329615 caatcaaaggaatttttactttgagaaaagattctcatgttcttacaaa 13329567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 818 - 943
Target Start/End: Original strand, 50914650 - 50914776
Alignment:
Q  818 cctttggaagagtttgtg-catgaatggttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttcca 916  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||    
T  50914650 cctttggaagagtttgtttcatgaatggttgcattgcttcaattgtcaagcattacacctttactctaaaaggtctctatttaaccattgcaacttttca 50914749  T
Q  917 aatatattttggaaatttctctcacaa 943  Q
    ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  50914750 aatatattttgaaaatttctctaacaa 50914776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 463 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 46280350 - 46280172
Alignment:
Q  463 atattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactat 562  Q
    |||||||| ||||||  ||| ||||| |||| |||||||||||||  |  ||| ||||||||||||  |||| |||| || || |||| || ||||||||    
T  46280350 atattgatcggagaatgatccaagaagaaaattcatgatcatatggtttgagactctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctatcactat 46280251  T
Q  563 taaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||||||||    
T  46280250 tcaagatatgattt-ggagaacaaaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctcatgttcctacaaatat 46280172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 47 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 13978827 - 13978718
Alignment:
Q  47 tgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaat 146  Q
    ||||||||||||||||| | || | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || |||||||||||||||||| || | ||||||     
T  13978827 tgaatcaaaagagtgtttattgtagattcaacaagaagatgaattttatgattatttgactcatcctcgtcaccacatggttttcaacaaagccttaaag 13978728  T
Q  147 attcaaggaa 156  Q
    |||| |||||    
T  13978727 attcgaggaa 13978718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 23484536 - 23484624
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| |||| |||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  23484536 tttgaatcaaatgagtattgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcatcaccacatggttttcaa 23484624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 758 - 940
Target Start/End: Complemental strand, 33709748 - 33709572
Alignment:
Q  758 ctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgcttta 857  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||          ||| ||||||| |    
T  33709748 ctgcctccaaagtgtctctatttatagagaaacttatgtcctttggtgaagggaaagaaccctttgaaagattttgt----------ttacattgcttca 33709659  T
Q  858 attgtcaagcattatacc--ttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaata---tattttggaaatttctctca 940  Q
    ||||| |||||||| |||  |||| | |||||||||||| || ||| ||| ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||    
T  33709658 attgtaaagcattacaccttttttttataaaaggtctct-tttaaccattgcaactttccaaatatattattttggaaatttctctca 33709572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 9294844 - 9294757
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||    
T  9294844 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatcctggtcaccacatggttttca 9294757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 9307892 - 9307979
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  9307892 tttgaatcaaataagtgttgattgaagatttaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatcctcatcaccacatggttttca 9307979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 186 - 373
Target Start/End: Original strand, 23484666 - 23484850
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    ||||| ||| |||| |||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||   |||| ||||||||    | |||||| | || ||| ||| ||    
T  23484666 aaagacacttaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaactatgagaagaattgtatcatcaa----acaattcaaggttaattgaccaag 23484761  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatg-aatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaat 373  Q
    ||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||||||||| | ||||  |||||||||||||||    
T  23484762 aagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaat 23484850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Original strand, 9308116 - 9308177
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatca 223  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  9308116 atgcatgcctaaactaaaacatatcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatca 9308177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 645 - 733
Target Start/End: Original strand, 40574383 - 40574471
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgatttt 733  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||  ||| |||| ||||| |||| |||||||||||    
T  40574383 ttctgtcaatttctctcgtgcactagagaaaagaaagaatgatttaatattattttcggcagaattttgactcacaagaatgtgatttt 40574471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 13953456 - 13953365
Alignment:
Q  548 atcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  13953456 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 13953365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 907 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 23686060 - 23686023
Alignment:
Q  907 caactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23686060 caactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 23686023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 907 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 24058297 - 24058260
Alignment:
Q  907 caactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24058297 caactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 24058260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 875 - 942
Target Start/End: Original strand, 2257454 - 2257521
Alignment:
Q  875 cttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcaca 942  Q
    |||||||||||| |||||||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2257454 cttttctctaaatggtctctatttaagcattgcaacttttcaaatatatttttgaaatttctatcaca 2257521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 645 - 739
Target Start/End: Complemental strand, 33709877 - 33709783
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatct 739  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||  ||||||||  |||| || | |||||||| ||||||||    
T  33709877 ttctgtcaaattctctggtgcactagagaaaagaaagaatgatttagtataattttcggcaaaatttagactcaccagaatgtgatattctatct 33709783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 270; Significance: 1e-150; HSPs: 7)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 45 - 636
Target Start/End: Original strand, 14097225 - 14097798
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||| | | |||||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||| |||||    
T  14097225 tttgaatcaaacgagtgttgactgaagatttaacaagaagatgaactttcttagtaattgattcatcattctcacaacatggttttcaacaatgccttaa 14097324  T
Q  145 atattcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatat 244  Q
    | |||||||       ||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||||||||||||     
T  14097325 agattcaag-------at---tgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaggaaatattgtgtgcaatcaccaaaagaaattatgagataa 14097414  T
Q  245 attgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctc 344  Q
    || |||||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||||||       ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||    
T  14097415 atcgcatcaacaacaaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattgtcat-------agaagagaacattatcaactccgatgaaagaatggtctc 14097507  T
Q  345 atgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttattta 444  Q
     | || ||||||  ||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  14097508 gtaatgaggatgcatattacactcgaaatcaatctcatcatttcatcaaaatgattagaattaactttgaagagaaaccaattcatgaacgaattattta 14097607  T
Q  445 ttaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaa 544  Q
    |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||| |||| || |    
T  14097608 ttaagtcagtcattaatgatattggttggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcataaaagacttatgatggtcca 14097707  T
Q  545 aaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctac 636  Q
    | ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||    
T  14097708 agaatcttccatcactattcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaagaaattttgactttccgaaaggtttctcatgctcctac 14097798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 161 - 639
Target Start/End: Original strand, 2850091 - 2850568
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  2850091 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagatacattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgtgataaattgcatcatcaacaa 2850190  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||||| | || ||||| | |||||||||| |||||| | ||||||||||| || ||||||||||||||| ||| |||||||| |  ||||||  |     
T  2850191 aataattcaaggttaattaatcaagaaggtattatcatcttatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaacgttctcataaagaggatgcctc 2850290  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||||| |||||| | ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  2850291 ttacactcgagattattctcatcatttgattaaaaggattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcactcattaa 2850390  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| ||||||| || |||||||||||| |    
T  2850391 tgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttgaagattctatcataaaagatttaagatgatcgaagaatcttccatcatt 2850490  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
     || ||||||||  || |||||||| |||| |||||||| ||| || |||| | |||||||||||||||||| ||||||    
T  2850491 ttttaagatatg-gttgggagaatagaaatcaatcaaaggaatatttactttgagaaaggtttctcacgttcttacaaa 2850568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 645 - 940
Target Start/End: Original strand, 28612215 - 28612508
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatatt 744  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||  ||| ||||  |||| |||| ||||||||||| | ||||| ||    
T  28612215 ttctgtcaattcccctcgtgcactagagataagaaagaatgatttagtataattttcggcagaatttcgactcacaagaatgtgattttgtctctatttt 28612314  T
Q  745 cctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatgg 844  Q
     |||| | |||| ||||||  ||||||||| | |||||| ||||| ||||||  ||||||||||| ||| || | ||||||||||||||| ||||||| |    
T  28612315 tctgaatacttttctgcctcgaaagtgtctatctttataaagaaacttatgtcatttggtgaagaaaaacaatcatttggaagagtttgttcatgaattg 28612414  T
Q  845 ttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctca 940  Q
    ||||||||||| ||||||||| || || |||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  28612415 ttatattgcttcaattgtcaaacaatacacctttgctctaaaaggcctctatttaaccattacaatttt--aaatatattttggaaatttctctca 28612508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 17514265 - 17513876
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||||||||| || | |||||    
T  17514265 tttgaatcaaatgaatgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatccttgtcaccacatggttttcaacaaagccttaa 17514166  T
Q  145 at-attcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  |||| ||||| |||  |              || || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  17514165 aagattcgaggaataaagggtt------------aatatttgaaagacactcaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaattatgagaag 17514078  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatg-aatgaatgttc 342  Q
     |||||||||||    ||| |||||| | || ||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| ||||| || ||| ||||    
T  17514077 aattgcatcatc----aaacaattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttc 17513982  T
Q  343 tcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatt 442  Q
    ||||||| | ||||  |||||||||| |||||||| | || | |||||| |||| ||| | ||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  17513981 tcatgatcaagatgattattacactcaaaattattctcattacttcatcgaaataatttgaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattatt 17513882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 156
Target Start/End: Original strand, 2849868 - 2849979
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||| ||||||||||||| || | |||||    
T  2849868 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttatgatcaattgactcatcctcgtcacgacatggttttcaacaaagccttaa 2849967  T
Q  145 atattcaaggaa 156  Q
    | |||| |||||    
T  2849968 agattcgaggaa 2849979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 53; E-Value: 7e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 2847101 - 2847189
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  2847101 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttatgatcaattgactcatccttgtcaccacttggttttcaa 2847189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 533 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 17513841 - 17513735
Alignment:
Q  533 taggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttc 632  Q
    |||||||||| || |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||| |||| | ||||||||||||| ||||    
T  17513841 taggatgatccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaagaaatttttactttgagaaaggtttctcatgttc 17513742  T
Q  633 ctacaaa 639  Q
     ||||||    
T  17513741 ttacaaa 17513735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 262; Significance: 1e-145; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 29910072 - 29910552
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  29910072 atgcatgtctaaactaaaacatctcaaagatacttaatggacaagaaacattgtgtgaaatcaccaagaggaattatgtgataaattacatcatcaacaa 29910171  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||||| | || ||||||| |||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||| || | || ||||||  |     
T  29910172 aataattcaaggttaattaaccaagaatgtattgtcatcacatatagaagagaacattatcaactctaatgaaagaatgttttctttatgaggatgcctc 29910271  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  29910272 ttacactcaaaattattttcatcatttcatcaaaatgataaaaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattaa 29910371  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29910372 tgatattgattgaagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatacttgaagattctatcataaaagatttaggatgatccaaaaatcttccatcact 29910471  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| || ||||||||| | |||||| |||| ||||| || ||||||||||| | |||| |||| ||| |||||||| |||||    
T  29910472 attcaaaatatgattt-gtagaatagaaataaatcacaggaattttgactttgagaaaagtttatcatgttcctaccaatat 29910552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 161 - 611
Target Start/End: Original strand, 14271709 - 14272142
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     ||||| |||||  | |||||||||||||    
T  14271709 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaacattgtgtgcaatcgccaa-----attataagataattcgcatcatcaacaa 14271803  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    |||| |||| | || |||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||  ||    
T  14271804 aatagttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagagaacatcatcaactctgatgaaagaatgttctcaagatgaggatgcata 14271903  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  14271904 ttacactctaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaacaaattcatgaataaattatttattaagtcattcattaa 14272003  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||||||||           |||| || || ||||||| ||||||    
T  14272004 tgatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattctatcat-----------gatggtccaagaatcttcaatcact 14272092  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgactt 611  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||    
T  14272093 attcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactt 14272142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 52 - 599
Target Start/End: Original strand, 18577306 - 18577829
Alignment:
Q  52 caaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatattca 151  Q
    ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||| |||||    
T  18577306 caaaagagtgttcggtgaagattcaacaagaagatgaactttatgattaattgattcatcatcgtcatcatatggttttcaacaatgccttaaagattca 18577405  T
Q  152 aggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcat 251  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  18577406 aggaagaaaagacatgtctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaacat--tgtgaaatcaccaaaagaaattatgagataaattgcat 18577503  T
Q  252 catcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataa 351  Q
    |||||||||||||||||| | || |||||  |||||  ||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||         
T  18577504 catcaacaaaataattcaaggttaattaattgagaatctattgtcatctcatatagaaaagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcat----- 18577598  T
Q  352 ggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtc 451  Q
     || || ||         ||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  18577599 -gacgttta---------aaattattcccatcatttcatcaaaatgattagaatcaattttcaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagta 18577688  T
Q  452 attcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatct 551  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||      |||| ||||| ||||||||||| |||| |||| |  |  |||||    
T  18577689 attcattaataatattgattggagaaatatcaaagaagaaaattcatgat------catggagattatatcataaaagacttatgatggtataggaatct 18577782  T
Q  552 tccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaag 599  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||    
T  18577783 tccatcactattaaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaag 18577829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 639
Target Start/End: Original strand, 35875607 - 35876167
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| || | |||||    
T  35875607 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcgccacatggttttcaacaaagccttaa 35875706  T
Q  145 at-attcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  |||| ||||| |||  | ||           || || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  35875707 aagattcgaggaataaa--ggatt----------aatatttgaaagacactcaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaattatgagaag 35875794  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccga-gaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgtt 341  Q
     |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| | |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||    
T  35875795 aattgcatcatcaa----acaattcaaggttgatttaccaaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggtt 35875890  T
Q  342 ctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttat 441  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  35875891 ctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattat 35875990  T
Q  442 ttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgat 541  Q
    | |||||                     |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  35875991 tcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgat 35876069  T
Q  542 caaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    | || |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | |||| |||||||| |||| ||||||    
T  35876070 ccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 35876167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 639
Target Start/End: Original strand, 35883096 - 35883656
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| || | |||||    
T  35883096 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcgccacatggttttcaacaaagccttaa 35883195  T
Q  145 at-attcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  |||| ||||| |||  | ||           || || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  35883196 aagattcgaggaataaa--ggatt----------aatatttgaaagacactcaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaattatgagaag 35883283  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccga-gaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgtt 341  Q
     |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| | |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||    
T  35883284 aattgcatcatcaa----acaattcaaggttgatttaccaaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggtt 35883379  T
Q  342 ctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttat 441  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  35883380 ctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattat 35883479  T
Q  442 ttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgat 541  Q
    | |||||                     |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  35883480 tcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgat 35883558  T
Q  542 caaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    | || |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | |||| |||||||| |||| ||||||    
T  35883559 ccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 35883656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 115; E-Value: 7e-58
Query Start/End: Original strand, 45 - 639
Target Start/End: Original strand, 36722809 - 36723369
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || || ||||||||||||||| || | |||||    
T  36722809 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcgccacatggttttcaacaaagccttaa 36722908  T
Q  145 at-attcaaggaagaaaatgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagata 243  Q
    |  |||| ||||| |||  | ||           || || | ||||| |||||||| |||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||      
T  36722909 aagattcgaggaataaa--ggatt----------aatatttgaaagacactcaatgaacaagaaacattgtgtggaatcactaagaggaattatgagaag 36722996  T
Q  244 tattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccga-gaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaat-gaatgtt 341  Q
     |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| | |||| ||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||    
T  36722997 aattgcatcatcaa----acaattcaaggttgatttaccaaagaagatattgtcttcttatatagaagagaacattatcaactttgatgaaaagaaggtt 36723092  T
Q  342 ctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttat 441  Q
    |||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  36723093 ctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattat 36723192  T
Q  442 ttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgat 541  Q
    | |||||                     |||||||| |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  | |||||||||    
T  36723193 tcattaa---------------------ttggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgcatgaagattctatcataataaacataggatgat 36723271  T
Q  542 caaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    | || |||||||||||| | || |||||||||||  |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | |||| |||||||| |||| ||||||    
T  36723272 ccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttactttgagaaaagtttctcatgttcttacaaa 36723369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 161 - 356
Target Start/End: Original strand, 33402865 - 33403060
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || ||||||||| || |||||||||| ||    
T  33402865 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaagcattgtgtgcaatcaccaagagaaactatgagataaatcgcatcatcaataa 33402964  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatg 356  Q
    |||| |||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || || ||||||||  ||||| ||||||||||| ||| ||||||    
T  33402965 aatagttcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacatcatcaactccaatgaaagaatgttctcaagatgaggatg 33403060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 648 - 944
Target Start/End: Original strand, 34681175 - 34681468
Alignment:
Q  648 tgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatattcct 747  Q
    |||||||||| || || ||| |||||||||||||||| |   ||| |||||||  ||| |||| ||||| |||| ||||||||||||| | | | || ||    
T  34681175 tgtcaatttctctcgttcaccagagaaaagaaagaatta---ggtgttattttcggcataattttgactcacaagaatgtgattttctgtgtctttttct 34681271  T
Q  748 gacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggtta 847  Q
     |||  |||  |||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||| ||| |||| ||||||||||| ||| |||||| |    
T  34681272 aactgattttatgcctaaaaaatgtccctatttatagagaaatttatgtcttttggggaagaaaaacaactcttttgaagagtttgttcatcaatggtaa 34681371  T
Q  848 tattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
     ||||||| ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| | | || ||| ||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34681372 cattgcttcaattgtcaaacattacactttttctctaaaaggtttatgtttaaccattgcaacattccaaatatattttgaaaatttctctcacaat 34681468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 645 - 923
Target Start/End: Original strand, 14218955 - 14219233
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttc-tatctatat 743  Q
    |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| |||| |||| ||||| |||| |||||||||||  || |||| |    
T  14218955 ttctttcaattttcctcgtgcactagagaaaagaaagaatgatttagtattatttttagcataattttgactcacaataatgtgatttttgtacctattt 14219054  T
Q  744 tcctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatg 843  Q
    |  ||| || ||| ||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||| ||| ||||| ||||||| || |||||  |    
T  14219055 ttttgaattattttctgctgccaaagtgtctctatttatagagaaacttatgccatttggtgaagagaaacaacactttgaaagagttggttcatgaccg 14219154  T
Q  844 gttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatat 923  Q
     ||| ||||||| |||||| |||||||  || |||||||| |||| | |||||| ||||||| |||| || |||||||||    
T  14219155 attacattgcttcaattgtaaagcattgcacattttctct-aaagatttctatttaactattgcaacatttcaaatatat 14219233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Original strand, 33402642 - 33402727
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggtttt 130  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  33402642 tttgaatcaaaagagtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttataatcaattgactcatcctcgtcaccacatggtttt 33402727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Original strand, 14271486 - 14271571
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggtttt 130  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||| ||||    
T  14271486 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattaaaaaagaagatgaattttataatcaattgactcatcctcgtcaccacatgatttt 14271571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 250; Significance: 1e-138; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 11221904 - 11222375
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||    
T  11221904 atgcatgcctaagctaaaacatctcaaagatactcaatggacaaaaaacattgtgtgcaatcaccaagagaaattatgtgctaaattgcatcatcaacaa 11222003  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||  ||    
T  11222004 aataattcacggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgacgaaagaatggtctcatgataaggatgcata 11222103  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  11222104 ttacactcgaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaa 11222203  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    ||||||||         |||||||| || |||| |||||||||||| | || ||||| ||||||||||| |||| |||  || || |||||| |||||||    
T  11222204 tgatattg---------atatcaaaaaagaaaattcatgatcatatacttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaagaatcttacatcact 11222294  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  11222295 attcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttctcatgttcctacaaatat 11222375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 42734157 - 42733687
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  42734157 atgcatgcctaagctaaaacatctcaaggatactcaatggacaagaaacattgtgtgcaatcac-aagagaaattatgtgataaattgcatcatcaacaa 42734059  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||||| | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  42734058 aataattcaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgcata 42733959  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  42733958 ttacactcgaaattattatcatcatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaa 42733859  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    ||||||||         ||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||  || || |||||| |||||||    
T  42733858 tgatattg---------atatcaaagaagaaaattcatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatagtccaataatcttacatcact 42733768  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||  |||||||||||||    
T  42733767 attcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgactttgaaaaaggtttatcatcttcctacaaatat 42733687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 642
Target Start/End: Original strand, 26649088 - 26649538
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  26649088 aaagacactcaatgaacaagaaacactgtgtgcaatcaccaagagaaattatgagacaaatcacatcatcaacaaaataattcaaggttaattaagcgag 26649187  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcat 385  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| | | |||||    
T  26649188 agtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatattacacttgaaattagtctcatcat 26649287  T
Q  386 ttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaa-tatcaa 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||      ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26649288 ttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaaatatcaa 26649381  T
Q  485 agaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaat 584  Q
    |||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26649382 agaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgattt-ggagaat 26649480  T
Q  585 ataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26649481 agaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 26649538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 186 - 642
Target Start/End: Original strand, 26920673 - 26921123
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| | ||  ||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||    
T  26920673 aaagacactcaatgaacaagaaacactgtgtgcaatcaccaagagaaattatgagacaaatcacatcatcaacaaaataattcaaggttaattaagcgag 26920772  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcat 385  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| | ||||  ||||||||| ||||||| | | |||||    
T  26920773 agtgtattgtcatctcatatagaagagaacattattaactccggtgaaagaatgttctcatgatgaagatgcatattacacttgaaattagtctcatcat 26920872  T
Q  386 ttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaa-tatcaa 484  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||      ||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26920873 ttcatcaaaatgattagaatcaacttt------aaatcaattcatgaatgaattacttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaaatatcaa 26920966  T
Q  485 agaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaat 584  Q
    |||| |||| |||||||||||||  || ||||||||||||||||| |||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  26920967 agaagaaaattcatgatcatatgtttggagattctatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgattt-ggagaat 26921065  T
Q  585 ataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26921066 agaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 26921123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 215; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 161 - 627
Target Start/End: Original strand, 2640939 - 2641403
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  2640939 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataaattgcatcatcaacaa 2641037  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || ||| |||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||||||  |||||  ||    
T  2641038 aataattaaaggttaatttaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattattaactccgatgaaagaatgttctcatgatggggatgcata 2641137  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |    
T  2641138 ttacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaaatcattcattta 2641237  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||| |||||||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||| || || |||| || || |||    
T  2641238 tgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcacgatcatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaatcctctattact 2641337  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
     || |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | |||| ||||||||    
T  2641338 gttcaagatatgattt-ggagaacagaaataaatcaaaggaattttgactttgagaaaagtttctca 2641403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 765 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 36203043 - 36202864
Alignment:
Q  765 caaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtca 864  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||| || ||||||||    
T  36203043 caaagtgtctctatttatagagaaacttatgtcatttggtgaagagaaataaccctttaaaagagtttgttcatgaatggttacattgattcaattgtca 36202944  T
Q  865 agcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  36202943 agcattacaccttttctctaaaaggtctctttttaaccattgcaacttttcaaatatattttaaaaatttctctcacaat 36202864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 659 - 868
Target Start/End: Original strand, 9851526 - 9851735
Alignment:
Q  659 cttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatattcctgacttctttcc 758  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || | ||||||||||  ||| |||| ||||| |||| ||||||| |||||||| || || ||||||||||| |    
T  9851526 cttgtgcactagagaaaagaaagactgatttagtattatttttggcagaattttgactcacaataatgtgaatttctatccatgtttctgacttcttttc 9851625  T
Q  759 tgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaa 858  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||| ||||||  ||||||||||| ||| |||| ||||  |||||||||  ||||||||| | ||||||| ||    
T  9851626 tgcctccaaaatgtctctatttacagagaaacttatgtcttttggtgaagagaaataaccatttgacagagtttgtttatgaatggtcagattgcttcaa 9851725  T
Q  859 ttgtcaagca 868  Q
    ||||||||||    
T  9851726 ttgtcaagca 9851735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 513 - 642
Target Start/End: Original strand, 26649562 - 26649690
Alignment:
Q  513 agattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttc 612  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  26649562 agattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgacttt 26649660  T
Q  613 gtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26649661 gagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 26649690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 513 - 642
Target Start/End: Original strand, 26921147 - 26921275
Alignment:
Q  513 agattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttc 612  Q
    |||||||||||||||||  ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||||||||||     
T  26921147 agattctatcataaaagatttatgatggtccaagaatcttccatcactattaaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgacttt 26921245  T
Q  613 gtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26921246 gagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 26921275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 766 - 945
Target Start/End: Complemental strand, 29006398 - 29006217
Alignment:
Q  766 aaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtcaa 865  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||  ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| ||||||| ||| || ||    
T  29006398 aaagtgtctctatttatagagaaacttatgtcatttggtgaagggaaacaaccctttaaaagattttgttcatgaatggttacattgcttcaatcgtaaa 29006299  T
Q  866 gcattatac---cttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaata 945  Q
     ||||| ||    |||| |||||||| ||||| || || |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29006298 acattacacttttttttttctaaaagatctct-tttaattattgcaacttttcaattatattttggaaatttctctcacaata 29006217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 784 - 949
Target Start/End: Original strand, 11042983 - 11043148
Alignment:
Q  784 gagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctct 883  Q
    |||||| | |||| |||||||| ||||||  ||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||| || ||| | ||| ||||| |||||||||||    
T  11042983 gagaaactcatgtcctttggtgtagataatcaaccctttgaaagagtttgttcatgaatggctagattgattaaatggacaaacattacaccttttctct 11043082  T
Q  884 aaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaatatatg 949  Q
    ||||| ||| |||| |||   |  |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| || |||||    
T  11043083 aaaagatctttatttaaccgatgaaacttttcaaatatattttgaaaatttcactcagaaaatatg 11043148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 80
Target Start/End: Original strand, 14914987 - 14915056
Alignment:
Q  11 agcagcacagactcaaaagaagatatatcaattatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaa 80  Q
    |||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  14914987 agcatcacaaactcaaaagaagatatatcaattgtttgactcaaaagagtgttgagtcaagattcaacaa 14915056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 45 - 156
Target Start/End: Original strand, 11221691 - 11221802
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| ||| |||| | |||||||||| || |||||||    
T  11221691 tttgaatcaaatgagtgtttattgaagattcaacaagaagatatattttatgagcaattgactcatcctcaccaccgcttggttttcaataaagtcttaa 11221790  T
Q  145 atattcaaggaa 156  Q
    | |||| |||||    
T  11221791 agattcgaggaa 11221802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 26648959 - 26649046
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26648959 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaatatttatttt-tgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttttcaa 26649046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 26920544 - 26920631
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||| ||  ||||| |||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  26920544 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaatatttatttt-tgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttttcaa 26920631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 42734376 - 42734271
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||  |||||||||  |||||| ||||| |||| ||  | |||||||||| || |||||||    
T  42734376 tttgaatcaaatgagtgtttattgaagattcaacaagaagatatattttatgagcaattgactcatcctcataacggcttggttttcaataaagtcttaa 42734277  T
Q  145 atattc 150  Q
    | ||||    
T  42734276 agattc 42734271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 765 - 942
Target Start/End: Original strand, 28274014 - 28274197
Alignment:
Q  765 caaagtgtctctatttatagag-aaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagag--tttgtgcatg--aatggttatattgctttaat 859  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| |  |||||| | | ||| |||||||||||  |||||| |||  |||||||| |||| || |||    
T  28274014 caaagtatctctatttatagagaaaacttatgttctatattgaagagatacaactctttggaagagattttgtg-atgacaatggttacattgtttcaat 28274112  T
Q  860 tgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaa--tatattttggaaatttctctcaca 942  Q
     |||||||| || | | |||| |||||||||   |||| ||| ||| ||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||    
T  28274113 agtcaagcaatacatcgtttcactaaaaggttcatattcaaccattgcaactttccaaatttatattttggaagtttctctcaca 28274197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 242; Significance: 1e-133; HSPs: 19)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 9735476 - 9735947
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  9735476 atgcatgcctaagctaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaacattgtgtgcaatcaccaagagaaattatgtgataaattgcatcatcaacaa 9735575  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||| ||||||  ||    
T  9735576 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatctcatatagaagaaaacattatcaactccgatgaaagaatggtctcatgatgaggatgcata 9735675  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    |||||||||||| |||| | ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||    
T  9735676 ttacactcgaaactattctcatcatttcatcaaaacggttagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaataaattatttatcaagtcattcattaa 9735775  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    ||||||||         ||||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| |||| |||| || || |||||| |||||||    
T  9735776 tgatattg---------atatcaaagaagaaaatttatgatcatatgcttggagattatatcataaaagacttatgatggtccaagaatcttacatcact 9735866  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| ||||||||| || |||||||| |||| |||||||  ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  9735867 attcaagatatgaatt-ggagaatagaaatcaatcaaatgaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaatat 9735947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 335 - 642
Target Start/End: Complemental strand, 4314589 - 4314283
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaat 434  Q
    |||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4314589 gaatgttctcttgatgaggatgcatattacactcgaaattattatcataatttcatcaaaatgattagaatcaactttgaagagaaaccaattcatgaat 4314490  T
Q  435 gagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtctta 534  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  4314489 gaattatttatcaagtcattctttaatgatattgattggagaattatcaaagaagaaaattgatgatcatatgcttggagattatatcataaaagactta 4314390  T
Q  535 ggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcct 634  Q
     |||| || || ||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| ||||   |||||||||||||  |||||    
T  4314389 tgatggtccaagaatcttatatcactattcaagatatgattt-ggagaatagaaatcaatcaaaagaatttttactttcagaaaggtttctcatattcct 4314291  T
Q  635 acaaatat 642  Q
    ||||||||    
T  4314290 acaaatat 4314283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 113; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 186 - 639
Target Start/End: Original strand, 32816599 - 32817042
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| || ||||||  ||||||||||||| |   |||||||||||||    |||||||| | || ||||||| ||    
T  32816599 aaagatactcaatgcacaagaaatattgtttggaatcactgagaggaattatgataagaattgcatcatcaa----ataattcaaggttaattaaccaag 32816694  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaa-tgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatca 384  Q
    ||| |  |||| ||||| |||||||||||  ||||||||| |||||||  || |||| || |||||| ||||  | | ||||||||||||||| | || |    
T  32816695 aagatggtgtcttctcatatagaagagaaccttatcaactttgatgaaaaaaatgttttcttgataaagatgattgtcacactcgaaattattctcatta 32816794  T
Q  385 tttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaa 484  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||||||||         |||||||||  ||||     
T  32816795 cttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaaccaatccatgaatgaattatgaattaagtcattcatta---------attggagaatgatcat 32816885  T
Q  485 a--gaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggaga 582  Q
    |  ||  |||| ||||||||||||||| | || ||||||||||||||  |||||| |||| || |||||||||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  32816886 atggatgaaaattcatgatcatatgcacggaggttctatcataaaagagttaggaagatccaagaatcttccatcattattcaagatatgatttgggaga 32816985  T
Q  583 atataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    ||| |||| ||||||| ||||||| | || | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  32816986 atagaaatcaatcaaataaatttttaatttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 32817042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 170 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 8981048 - 8980593
Alignment:
Q  170 taaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattca 269  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| | |||| |||||||||||||    
T  8981048 taaacttaaacatctcaaagatattcaacggataagaaacagagtgtgcaatcaccaagatgaattatgagaagtattgtagcatcgacaaaataattca 8980949  T
Q  270 ggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcg 369  Q
       || ||| ||| ||||  ||||||||||||| ||||||||||| || ||  ||||| ||||| |||| |||| | ||| | ||||| ||||||||  |    
T  8980948 aagttaattgaccaagaaaatattgtcatctcatatagaagagaacataat-tactcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtttattacacctg 8980850  T
Q  370 aaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattga 469  Q
    || ||||| | || ||||||| |||||| ||   |||||||||||| |||||| ||||  ||||| | ||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  8980849 aatttattctcattatttcataaaaatggttgaaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattcagtcattcattaatgatattga 8980750  T
Q  470 ttggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagat 569  Q
    | |||||| ||||||| || |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||| || |||  | ||||| |||| ||| |    
T  8980749 tcggagaattatcaaataa-aaaattcttgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatcattattcaagtt 8980651  T
Q  570 atgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
    ||   || | |||||| |||| || ||||  ||||||||||| | ||||| |||||||    
T  8980650 atagcttggaagaatagaaatcaaacaaaacaattttgactttgagaaagatttctca 8980593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 186 - 639
Target Start/End: Original strand, 2890331 - 2890777
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgag 285  Q
    ||||| ||||| || |||||||| |||||||| |||||   |||||||||||||||   |||| |||| |||    | |||||| | || ||| ||| ||    
T  2890331 aaagacactcagtgaacaagaaacattgtgtggaatcattgagaggaattatgagaagaattgtatcaacaa----acaattcaaggttaattgaccaag 2890426  T
Q  286 aaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaac---tctgatgaatg-aatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgtta 381  Q
    ||| ||||||| ||| | |||||||||||  ||||||||   | |||||||   ||||||||| |||||| |||   | ||||||||||||||||| | |    
T  2890427 aagatattgtcttcttatatagaagagaacgttatcaacaactttgatgaaaataatgttctcgtgataaagattattgttacactcgaaattattctca 2890526  T
Q  382 tcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatat 481  Q
    | | ||||||||||| ||||| ||||||| |||||| ||| |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||         |||||||  ||    
T  2890527 ttacttcatcaaaataattagaatcaactctgaagaaaaatcaatccatgaatgaattattcattaagtcattaattaat---------tggagaatgat 2890617  T
Q  482 caaa--gaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttagg 579  Q
    || |  ||| |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  2890618 catatggaagaaaattcatgatcatatgtacgaagattctatcataaaagacttaggaagatccaaaaatcttccatcattattcaagatatgatttagg 2890717  T
Q  580 agaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    |||||| |||| |||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  2890718 agaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 2890777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 359 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 48713008 - 48712737
Alignment:
Q  359 tattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcatt 458  Q
    ||||||||||||||||||| | || | |||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  48713008 tattacactcgaaattattctcattacttcatcgaaataattagaatcaactttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcattaagtcattcatt 48712909  T
Q  459 aatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatca 558  Q
    |||         ||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||| || ||||| ||||||    
T  48712908 aat---------tggagaattatcaaggaagaaaattcataatcatatgcatgaagattctatcataataaacttaggatgatccaagaatctgccatca 48712818  T
Q  559 ctattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
     |||| || ||||||| | |||||||| |||| |||||||| |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  48712817 ttattcaaaatatgatctgggagaatagaaatcaatcaaaggaatttttacttagagaaaggtttctcatgttcttacaaa 48712737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 666 - 937
Target Start/End: Original strand, 12239713 - 12239983
Alignment:
Q  666 actagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatattcctgacttctttcctgccttc 765  Q
    |||||||| |||||||||| || |  |||||||||  ||| |||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||| || ||| |    
T  12239713 actagagataagaaagaataatttaatattattttcggcagaattctaacacacaacaatgtgattttctatctatatttcttaattcttttctacctcc 12239812  T
Q  766 aaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtcaa 865  Q
    ||||||||| |||||||||||||| |||| | ||||| | ||||     |||| |||| |||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  12239813 aaagtgtctttatttatagagaaacttatatcctttgatcaagagccgcaaccatttgaaagagtttgttcatgaatggttacattgcatcaattgtcaa 12239912  T
Q  866 gcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctc 937  Q
    ||| || || ||||| ||||||||||| | || ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12239913 gcaatacactttttcactaaaaggtctttctttaaccattgcaacttt-caaatatattttggaaatttctc 12239983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 161 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 4314738 - 4314588
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  4314738 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaacgaacaagaaaaattttgtgcaatccccaagaggaattatgtgataaattgcatcatcgacaa 4314639  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaaga 311  Q
    || |||||| | ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  4314638 aacaattcaaggttagttaaccgagaatgtattatcatctcatatagaaga 4314588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 61; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 49 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 4315046 - 4314934
Alignment:
Q  49 aatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatat 148  Q
    ||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||| || | |||||| ||    
T  4315046 aatcaaaagagtgttgattgaagaatcaacaagaagatgaattatatgattaattgatttatcctcgtcaccacatgtttttcaacaaagccttaaagat 4314947  T
Q  149 tcaaggaagaaaa 161  Q
    || ||||||||||    
T  4314946 tctaggaagaaaa 4314934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 150
Target Start/End: Original strand, 28343551 - 28343652
Alignment:
Q  49 aatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatat 148  Q
    ||||||| |||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||| ||    
T  28343551 aatcaaatgagtgttgatcgaagattcaacaagaagatgaattttatgatcaattgactcatcctcttcaccacatggttttcaacaaagtcttaaagat 28343650  T
Q  149 tc 150  Q
    ||    
T  28343651 tc 28343652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 8981366 - 8981259
Alignment:
Q  49 aatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatat 148  Q
    |||||||||||| |||| |||| ||| ||||||  |||||   | |||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || |||||||| ||    
T  8981366 aatcaaaagagtattgattgaagatttaacaagctgatgagaataatgattaattgattcatcctcatcatcgcatggttttcaacaaagtcttaaagat 8981267  T
Q  149 tcaaggaa 156  Q
    ||||||||    
T  8981266 tcaaggaa 8981259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 9735257 - 9735345
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| |||||||||||| ||  |||||||||| |||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  9735257 tttgaatcaaatgagtgtttattgaagattcaacaagaaaatatattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccgcatggttttcaa 9735345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 32816469 - 32816557
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    |||| |||||| || |||||| || | |||||||||||| ||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  32816469 tttgtatcaaatgaatgttgattgtagattcaacaagaaaatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttttcaa 32816557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 186 - 257
Target Start/End: Complemental strand, 48714417 - 48714346
Alignment:
Q  186 aaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaa 257  Q
    ||||| |||||||| |||| ||| |||||||| |||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  48714417 aaagacactcaatgaacaataaacattgtgtggaatcactaagaggaattatgagaaaaattgcatcatcaa 48714346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 758 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 1840586 - 1840399
Alignment:
Q  758 ctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttc-tttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgcttt 856  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||| | |||| |||||| | | |||  ||| ||||| ||||| |||||||||||| | | |||     
T  1840586 ctgcctccaaaatgtctctatttatagagaaacttatgtccttttgatgaagaaagacaactttttagaagaatttgttcatgaatggttacaatacttg 1840487  T
Q  857 aattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaa--tatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    |||| ||||| |||| ||| |||  ||||||||||||| || ||| ||| ||||||| ||||  ||||||||  ||||| ||||||||||    
T  1840486 aattatcaagaattacaccattt-actaaaaggtctctctt-aaccattgcaacttttcaaatttatattttaaaaattactctcacaat 1840399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48714544 - 48714459
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||   | |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||    
T  48714544 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaa---gtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttctcaa 48714459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 759 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 24870370 - 24870206
Alignment:
Q  759 tgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaa 858  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||  |   ||||||| ||| |||  ||| |||||||||||  || || ||||| | ||||| |     
T  24870370 tgcctccaaagtgtctctatttatagagaaaattatgtcttacagtgaagagaaataactatttagaagagtttgttaataaacggttagactgcttcat 24870271  T
Q  859 ttgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatatt 924  Q
    |  ||| |||||| ||| |||| ||||||||||| | || ||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  24870270 tgatcacgcattacaccctttcactaaaaggtctat-tttaactattgcaacttttcaaatttatt 24870206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 82 - 133
Target Start/End: Original strand, 2890238 - 2890289
Alignment:
Q  82 aagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    |||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||||    
T  2890238 aagatgtattttatgatcaattgactcatcctcgtcaccacatggttttcaa 2890289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 907 - 937
Target Start/End: Original strand, 43476893 - 43476923
Alignment:
Q  907 caactttccaaatatattttggaaatttctc 937  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43476893 caactttccaaatatattttggaaatttctc 43476923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 230; Significance: 1e-126; HSPs: 33)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 230; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 161 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 50066428 - 50065953
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||| ||||||||||||    
T  50066428 atgcatgtctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataaattccatcatcaacaa 50066330  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  50066329 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactatgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcata 50066230  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||  ||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  50066229 ttacaccagaaattattctcatcatttcatcaaaattattagaatcagctttaaagagaaatcaattcatgaatgaattatttattaagtcattcattta 50066130  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| ||||||| |||||| |  ||||||||||||||||  |||| |||| || || || | || ||||||    
T  50066129 tgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgattatatgctttgagattctatcataaaatacttatgatggtccaagaaccctctatcact 50066030  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaa 638  Q
    ||| ||| |||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||    
T  50066029 attcaaggtatgattt-ggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaa 50065953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 195 - 632
Target Start/End: Original strand, 11480852 - 11481290
Alignment:
Q  195 caatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattg 294  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||  |||||    
T  11480852 caatggacaagatacattgtgtgcaatcaccaagagaaattatgtgataaattgcataatcaacaaaataattcaaggttaattaaccgagaatatattg 11480951  T
Q  295 tcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaa 394  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  11480952 tcatctcatatagaagagaacattatcaactccgatgaaataatgttctcatgatgaggatgcatattacactcgaaattattctcatcatttcatcaaa 11481051  T
Q  395 atgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaac 494  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||     
T  11481052 atgattagaatcaactttgaagataaactagttcatgaatgaattatttattaagccattcattaatgatattgattggaaaaatatcaaagaagaaaat 11481151  T
Q  495 tcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatca-ctattaaagatatgatttaggagaatataaatgaa 593  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||||  || ||||||||||||  | || ||||||||||||||||||| | |||  ||    
T  11481152 tcatgatcatatgtttgaagattctatcataaaagatttaggatgattgaagaatcttccatcatttttttaagatatgatttaggagaaaagaaaacaa 11481251  T
Q  594 tcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttc 632  Q
    |||||  |||||| |||| | || |||||||||| ||||    
T  11481252 tcaaatgaatttttactttgagagaggtttctcatgttc 11481290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 25514628 - 25515106
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| | ||| ||||||||| |||| | |||||||||    
T  25514628 atgcatacctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcgccaacatgaactatgagataaattgtaccatcaacaa 25514726  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||  ||    
T  25514727 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatc-catatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcatgatgaggatgcata 25514825  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||  ||||||||| | || |||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  25514826 ttacacctgaaattattctcattattttatcaaaatgattagaatcaactttaaagagaaatcaattcattaatgaattatttattaagtcattcattta 25514925  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |  |||| |||| || ||||||| |  ||||||    
T  25514926 tgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaattcatgatcatatgctttgagattctatcataatatacttatgatggtccaaaaatcctatatcact 25515025  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| |||||||||||| |||||| | |||| |||||||| ||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  25515026 attcaagatatgattt-ggagaacagaaatcaatcaaaggaattttgactttgagaaaggtttctcatgttcctacaaatat 25515106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 161 - 642
Target Start/End: Original strand, 28069370 - 28069846
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  28069370 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaacattgtgtgcaatcaccaacatgaaatatgagataaattgcatcatcaacaa 28069468  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || |||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||  |||||  ||    
T  28069469 aataattaaaggttaattaaccgagaatgtattgtcatcccatatagaagagaacattatcaactccaatgaaagaatgttctcatgat--ggatgcata 28069566  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  28069567 ttacactagaaattattctcatcatttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaatcaattcataaatgaattatttattaagtcattcattta 28069666  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcact 560  Q
    |||||||||| ||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||| |  | |||||||||| |||   | | |||| || |  |||| || ||||||    
T  28069667 tgatattgatcggagaatgatcaaagaagaaaactcatgaacatatgctttgaaattctatcatgaaataatcatgatggtccaggaatcctcaatcact 28069766  T
Q  561 attaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaatat 642  Q
    ||| ||  |||||||| |||||| |  ||| |||||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||    
T  28069767 attcaa-ttatgattt-ggagaacagtaattaatcaaagaaattttgactttgagagaggtttctcatgttcctacaaatat 28069846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 161 - 606
Target Start/End: Complemental strand, 50518784 - 50518337
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  50518784 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatatgcaatggacaaaatacattgtgtgcaatcaccaagagaaattatgtgataaattgcatcatcgacaa 50518685  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaaga-gaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgt 359  Q
    || || ||| | || ||||| | ||||||||||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||| |||||| |||  |||||||||  ||||||  |    
T  50518684 aaaaaatcaaggttaattaatcaagaaggtattgtcatctcatataaaaaaagaacattatcaactccgatgaaagaacattctcatgaagaggatgctt 50518585  T
Q  360 attacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcatta 459  Q
     |||||||| | |||||| | ||||||| || ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50518584 cttacactcaagattattctcatcatttgattaaaatgattagaatcaattttgaagagaaaccaattcatgaatgaattatttattaagtcattcatta 50518485  T
Q  460 atgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatca- 558  Q
    ||||||||||| | | |||||||||| || |||| |   |||||||||| ||||||| ||||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||     
T  50518484 atgatattgatggaaaaaatatcaaaaaagaaaatttgggatcatatgcttgaagatactatcataaaagatttaggatgatcgaagaatcttccatcat 50518385  T
Q  559 ctattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaatttt 606  Q
     | || |||||||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||    
T  50518384 ttttttaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaataaatttt 50518337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 7e-67
Query Start/End: Original strand, 290 - 627
Target Start/End: Original strand, 9243794 - 9244130
Alignment:
Q  290 tattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttca 389  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||| ||||  ||||||||||| || | ||||| |||| |||||||||||||| |  | ||||||    
T  9243794 tattgtcatctcatatagaagataacattatcaactctggtgaaataatgttctcattatgaagatgtttatttcactcgaaattattctcgttatttca 9243893  T
Q  390 tcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa---tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaag 486  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||   ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  9243894 acaaaatgattaggattaattttgaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaagaattatcaaag 9243993  T
Q  487 aataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatat 586  Q
    |  |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||  | ||    ||||| || ||||||||| | ||||||     
T  9243994 atgaaaattcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggatgatccaaaaaattgcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatag 9244089  T
Q  587 aaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
    |||| || ||||| ||||||||| | | |||||||||||||    
T  9244090 aaatcaaacaaagcaattttgacattgagaaaggtttctca 9244130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 161 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 34495548 - 34495225
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  | ||| |  |||| |||||||| ||| |||||||||||   |||||||| ||||       
T  34495548 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatacgcaatgcagtaaaaacaccgtgtacaatcaccgagatgaattatgagaataattgcatcgtcaa--- 34495452  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||||||  || || | || ||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||||||| | ||||  ||    
T  34495451 aataattcagagttaatga-ccaagaagatattgtcttctcatatagatgagaacattatcaactttgatgaaagaatattctcatgatgaagatgatta 34495353  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | || | |||||||||||||| || |||||||||||||||| |||||| || |||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  34495352 ttacacttgaaattattctcattacttcatcaaaatgataagaatcaactttgaagagataccaatccaggaataaattattcattaagtcattcattaa 34495253  T
Q  461 tgatattgattggagaaatatcaaagaa 488  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  34495252 tgatattgattggagaattatcaaagaa 34495225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 170 - 627
Target Start/End: Original strand, 7580352 - 7580809
Alignment:
Q  170 taaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattca 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||    ||||||||||||||| | |||||||||||  ||||| |||||| ||||| |||||||    
T  7580352 taaacttaaacatctcaaagatactcaacggataagaaacggagtgtgcaatcaccaacatgaattatgagaagtattgtatcatcgacaaagtaattca 7580451  T
Q  270 g--gcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacact 367  Q
       |||  ||| ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||| |||| | ||| | ||||| ||||||||     
T  7580452 aaagcta-attgaccaagaagatattgtcatctcatatagaagagaacattattaactcttatgaaagaatattctgaagatgaagatgtttattacacc 7580550  T
Q  368 cgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatatt 467  Q
     ||| ||||| | || ||||||| |||||| || | |||||||||||| |||||| ||||  ||||| | ||||| ||| |||||||||||| |||||||    
T  7580551 tgaatttattctcattatttcataaaaatggttggaatcaactttgaaaagaaactaatttgtgaataaattattcattgagtcattcattattgatatt 7580650  T
Q  468 gattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaag 567  Q
    |||   |||| ||||||| || |||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||||| || |||  | ||||| |||| |||    
T  7580651 gatccaagaattatcaaataa-aaaattcatgatcatatgcatggagattctatcaaaatggacttaggatgatccaataattgttcatcattattcaag 7580749  T
Q  568 atatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
     |||   || | |||||| |||| || ||||| ||||||||||| | |||||||||||||    
T  7580750 ttatagcttggaagaatagaaatcaaacaaagcaattttgactttgagaaaggtttctca 7580809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 9204011 - 9204249
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  9204011 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 9204110  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  9204111 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 9204210  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  9204211 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9204249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 662 - 943
Target Start/End: Original strand, 24129429 - 24129710
Alignment:
Q  662 gtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatattcctgacttctttcctgc 761  Q
    ||||||||||||||||||||||  || | ||||||||||   |  ||||  |||| |||| |||||||| |||||||||  || || |||| |||  |||    
T  24129429 gtgcactagagaaaagaaagaaagatttagtattatttttgacggaatttagactcacaaaaatgtgatgttctatctaattttcttacttattttttgc 24129528  T
Q  762 cttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattg 861  Q
    || || |||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||  ||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  24129529 ctccagagtgtctctatttatagagaaacttatgtcatttggttaaggaaaataaccatttggaagagtttgttcatgaatggttacattgcttcaatta 24129628  T
Q  862 tcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaa 943  Q
    ||||||| || |||||| ||| |||| | || |||| ||| ||| | |||||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  24129629 tcaagcaatacacctttcctccaaaaagcctatatttaaccattgcgactttctaaatatattttgataatttctctcacaa 24129710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 85; E-Value: 5e-40
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 9208230 - 9208468
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  9208230 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattagcatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 9208329  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  9208330 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 9208429  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  9208430 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 9208468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 304 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 28257737 - 28257581
Alignment:
Q  304 atagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattagg 403  Q
    ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||||||||||||| | ||||  |||||||||||||| |||| | || | |||||| |||||||||      
T  28257737 atagaagagaacattatcaactttaatgaaagaatgttctcatgatgaagatgactattacactcgaaaatattctcattacttcatcgaaatgattat- 28257639  T
Q  404 atcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaat 461  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  28257638 atcaactttgaagagaaactaattcatgaatgagttattcattaagtcgttcattaat 28257581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 746 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 20251342 - 20251147
Alignment:
Q  746 ctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggt 845  Q
    ||||||||||| ||||||  ||| | | | |||||||||||||| |||||| ||||||| |||| ||| |||  |||   |||||| || ||||||| ||    
T  20251342 ctgacttcttttctgcctcaaaaatatttttatttatagagaaacttatgtcctttggtaaagaaaaacaactatttaagagagtt-gttcatgaatagt 20251244  T
Q  846 tatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcaca 942  Q
    || |||| || |||| |||| || || || ||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  20251243 tacattgtttcaattatcaaacaatacactttttctctaaaagatctctatttaacaattgcaactttccaaatatattttaaaaatttctctcaca 20251147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 758 - 937
Target Start/End: Original strand, 48780044 - 48780222
Alignment:
Q  758 ctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgcttta 857  Q
    |||||| |||||| ||| |||||||||| ||| | | ||  ||||||| ||| ||| |||| ||   |||| ||| | ||||||| |||||||||||| |    
T  48780044 ctgcctccaaagtatctttatttatagataaactcaagtcttttggtgtagagaaacaacctttgaaaagaatttattcatgaatagttatattgcttca 48780143  T
Q  858 attgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctc 937  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| | || ||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48780144 attgtcaaacattataccttttctctaaaagatct-tgtttaatcattgcaactttccaaatatattttgaaaatttctc 48780222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 150
Target Start/End: Original strand, 11477904 - 11478009
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    |||||||||||  |||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||| |||||||| |  || | |||||    
T  11477904 tttgaatcaaataagtgttcattgaatattcaacaagaagatgaattttatgatcaattgattcatcctcgtcaccatatggtttttagcaaagccttaa 11478003  T
Q  145 atattc 150  Q
    ||||||    
T  11478004 atattc 11478009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 45 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 50519008 - 50518923
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggtttt 130  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  50519008 tttgaatcaaataagtgttgattgaagattcaacaagaagatgaattttatgatcaattgactcatcctcctcaccacatggtttt 50518923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 759 - 917
Target Start/End: Original strand, 1494956 - 1495114
Alignment:
Q  759 tgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagttt-gtgcatgaatggttatattgcttta 857  Q
    ||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||  |||||||||   ||| || |||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||| |    
T  1494956 tgcctccaaaatgtctctttttatagagaaacttatgtcatttggtgaacggaaacaaacctttgaaagaattttgttcatgaatggttatattgcttca 1495055  T
Q  858 attgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaa 917  Q
    | ||| |||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| ||| |||||||||||    
T  1495056 actgtaaagctttacaccttttctctaaatggtctct-tttaaccattgcaactttccaa 1495114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 857 - 942
Target Start/End: Complemental strand, 122914 - 122829
Alignment:
Q  857 aattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcaca 942  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  122914 aattgtcaagcaatacacattttctctaaaatgtttctatttaactattgcaacttttcaaatatactttggaaatttctctcaca 122829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 770 - 899
Target Start/End: Original strand, 1516526 - 1516655
Alignment:
Q  770 tgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtcaagcat 869  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||   ||| ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||| | | || | |||||     
T  1516526 tgtctctatttctagagaaacttatgtcatttggtgaacggaaataaccctttgaaagattttgttcatgaatggttatattgcgtcatttctaaagcac 1516625  T
Q  870 tataccttttctctaaaaggtctctattaa 899  Q
    || ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1516626 tacaccttttctctaaaatgtctcttttaa 1516655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 28069146 - 28069233
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  28069146 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaggataaattttatgatcaattgacacatcctcgtcaccacatggttttca 28069233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 77 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 34495828 - 34495747
Alignment:
Q  77 acaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaatattcaaggaaga 158  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||| || | | |||| ||||||||||||    
T  34495828 acaagaagatgatttttatgattaattgattcatcctcgtcaccacatgattttcaacaaagccataaaaattcaaggaaga 34495747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 182 - 251
Target Start/End: Complemental strand, 25254657 - 25254588
Alignment:
Q  182 tctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcat 251  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||    
T  25254657 tctcaaagatactcattggacaagaaataaagtgtgcaaacaccaagaggaattatgaaagatattgcat 25254588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 48 - 156
Target Start/End: Original strand, 7580033 - 7580141
Alignment:
Q  48 gaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaaata 147  Q
    ||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  || ||   | |||||||||||||||||  |||||| | |||||||||||| || |||||||| |    
T  7580033 gaatcaaaagagtattgattgaagattcaacaagccgacgagaataatgattaattgattcatactcatcatcgcatggttttcaacaaagtcttaaaga 7580132  T
Q  148 ttcaaggaa 156  Q
    |||||||||    
T  7580133 ttcaaggaa 7580141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 290 - 374
Target Start/End: Original strand, 9245645 - 9245729
Alignment:
Q  290 tattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaatt 374  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| |||||||||| |  |||| ||||||||||||||||    
T  9245645 tattgtcgtctcatatagaagagaaaattatcaactctgattgaagaatattctcatgatgaatatgtttattacactcgaaatt 9245729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 25514405 - 25514492
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| || ||||||||| |||||||    
T  25514405 tttgaatcaaataagtgttgattgaagatttaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatcctcgtcaccacatagttttca 25514492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 50066652 - 50066565
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    |||||||||||  |||||||| |||| ||| |||||||| || ||||||||||| ||||||  |||| || |||||||||||||||||    
T  50066652 tttgaatcaaataagtgttgattgaagatttaacaagaaaataaattttatgatcaattgacacatcctcgtcaccacatggttttca 50066565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Original strand, 9243722 - 9243796
Alignment:
Q  170 taaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatat 244  Q
    |||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||||||||| |||| |||| |||||||||||||    
T  9243722 taaactaatacatctcaatgatacttaatgaacaagaaacaatgtgtgcaaacaccgagagaaattatgagatat 9243796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 41 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 28257966 - 28257857
Alignment:
Q  41 attatttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtc 140  Q
    |||||||||||||||  |||||||| |||| ||||||||  || |||||||| |||||||||||| || || || |||| |||| |||||||| || | |    
T  28257966 attatttgaatcaaataagtgttgattgaagattcaacagaaatatgaatttcatgattaattgactcgtcctcgtcacgacatagttttcaacaaagcc 28257867  T
Q  141 ttaaatattc 150  Q
    ||||| ||||    
T  28257866 ttaaagattc 28257857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 161 - 201
Target Start/End: Original strand, 11478127 - 11478167
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga 201  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11478127 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatacgcaatgga 11478167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 778 - 853
Target Start/End: Original strand, 1533060 - 1533135
Alignment:
Q  778 tttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgc 853  Q
    |||||||||||| ||||||  |||| |||||  ||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||||||||||||    
T  1533060 tttatagagaaacttatgtcatttgatgaagggaaacaaccctttgaaagattttgttcataaatggttatattgc 1533135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 46 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 5211790 - 5211747
Alignment:
Q  46 ttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaa 89  Q
    ||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||    
T  5211790 ttgaatcaaaagagtgtagattgaagattcaacaagaagatgaa 5211747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 565 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 28257485 - 28257413
Alignment:
Q  565 aagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| ||||||||||  |  ||| |||||||| |||||||||||    
T  28257485 aagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaaggaattttgact--gaaaaaagtttctcatgttcctacaaa 28257413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 911 - 944
Target Start/End: Original strand, 47078212 - 47078245
Alignment:
Q  911 tttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  47078212 tttcctaatatattttggaaatttctctcacaat 47078245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482 (Bit Score: 154; Significance: 3e-81; HSPs: 2)
Name: scaffold0482
Description:

Target: scaffold0482; HSP #1
Raw Score: 154; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 161 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11717 - 11410
Alignment:
Q  161 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaa 260  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| | ||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  11717 atgcatgcctaaactaaaacatctcaaagatactcaatgga-aagaaatattgtgtgcaatcaccaacatgaactatgagataatttgcatcatcaacaa 11619  T
Q  261 aataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgta 360  Q
    ||||||| | | || ||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| || |||  ||    
T  11618 aataattaaaggttaattaaccgagaatatattgtcatcctatatagaagagaacattatcaactccgatgaaagaatgttctcacgatgagaatgcata 11519  T
Q  361 ttacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaa 460  Q
    ||||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||   |||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  11518 ttacactagaaattattctcatcgtttcatcaaaatgattagaatcagctttaaagagaaaatcattcatgaatgaattatttattaagtca-tcattta 11420  T
Q  461 tgatattgat 470  Q
    ||||||||||    
T  11419 tgatattgat 11410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0482; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 45 - 149
Target Start/End: Complemental strand, 11942 - 11838
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  |||| |  |||||||||||||||||  || | |||||    
T  11942 tttgaattaaatgagtgttgattgaagattcaacaagaagataaattttatgatcaattgacacatccttgtcaccacatggttttcatcaaagccttaa 11843  T
Q  145 atatt 149  Q
    |||||    
T  11842 atatt 11838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753 (Bit Score: 126; Significance: 2e-64; HSPs: 4)
Name: scaffold0753
Description:

Target: scaffold0753; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 298 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 3221 - 2893
Alignment:
Q  298 tctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatg 397  Q
    ||||| |||||||| || |||||||||||||||| | ||||| ||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||    
T  3221 tctcatatagaagataacattatcaactctgatgtaagaatgctctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattg 3122  T
Q  398 attaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa---tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaac 494  Q
    ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||   ||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| | || |||||||||  ||||     
T  3121 attaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaatattgaattattcattgagttattcattaatgatattgattgaataattatcaaagatgaaaat 3022  T
Q  495 tcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaat 594  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| |||| |||||  ||||    ||||| || ||||||||| | |||||| |||| ||     
T  3021 tcatgatcatatgcatggagattctatcataaaatacttaggacgatccaaaaaatttcc----ctattcaaaatatgatttggaagaatagaaatcaaa 2926  T
Q  595 caaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctca 627  Q
    ||||  ||||||||| | | |||||||||||||    
T  2925 caaaacaattttgacattgagaaaggtttctca 2893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 290 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 1147 - 826
Alignment:
Q  290 tattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttca 389  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || ||||||    
T  1147 tattgtcgtctcaaatagaagagaaaattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatggttattacactcgaaattattctcattatttca 1048  T
Q  390 tcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa---tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaag 486  Q
    || | ||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||| ||   | | ||||| || |||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  1047 tctatatgattaggttcaatttttaagagaaaccaattcataaatattaaattattcataaagttattcattaataatattaattggagaattatcaaag 948  T
Q  487 aataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatat 586  Q
    |  |||  |||| |||||||||||| | |||||||| |||||  |||||||||||| || | | || |||||| ||| || ||||||||| | ||||||     
T  947 atgaaacttcattatcatatgcatggatattctatcgtaaaatacttaggatgatccaagagttttacatcaccattcaatatatgatttggaagaataa 848  T
Q  587 aaatgaatcaaagaaattttga 608  Q
    |||| || || || ||||||||    
T  847 aaatcaaacagagcaattttga 826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753; HSP #3
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 1354 - 1243
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||| |||||||||| || | || |||||| |||  |||||  || |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||||   |||||    
T  1354 tttgaatgaaaagagtgtcgattaaagattcaaaaagctgatgagattaatgattaattgattcattctcctcaccacatgattttcaaaaaatccttaa 1255  T
Q  145 atattcaaggaa 156  Q
    | ||||||||||    
T  1254 agattcaaggaa 1243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0753; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 170 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3227
Alignment:
Q  170 taaactaaaacatctcaaagatactcaatggacaagaaagattgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatat 244  Q
    |||||||| |||||||||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| |||| |||  |||||||||||||    
T  3301 taaactaatacatctcaaagatacttaatgaacgagaaacaatgtgtgcaaacaccgagaaaaattatgagatat 3227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959 (Bit Score: 102; Significance: 4e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0959
Description:

Target: scaffold0959; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 4e-50
Query Start/End: Original strand, 290 - 590
Target Start/End: Original strand, 2611 - 2913
Alignment:
Q  290 tattgtcatctcaaatagaagagaagattatcaactctgatgaatgaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttca 389  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||| | ||| | ||| |||||| || ||||| |  | ||||||    
T  2611 tattgtcgtctcatatagaagagaacattatcaactctgatggaagaatgttctcatgatgaagatttttatgacactcaaagttattctccttatttca 2710  T
Q  390 tcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa---tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaag 486  Q
    ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| ||||| || |||| |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||    
T  2711 tcacaatgattaggatcaattttaaagagaaaccaattcatgaatattgaattattcataaagt-attcattaatgacatttattgaagaattatcaaag 2809  T
Q  487 aataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatat 586  Q
    |  |||  || | |||||||||||| ||||||||||  ||||  |||||||||||| || | | ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||     
T  2810 atgaaacttccttatcatatgcatggagattctatcgaaaaatacttaggatgatccaagagttttccatcactattcaagatatgatttggaagaatac 2909  T
Q  587 aaat 590  Q
    ||||    
T  2910 aaat 2913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0959; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 45 - 132
Target Start/End: Original strand, 2404 - 2491
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttca 132  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||| |||  |||||  || |||||||||||||||||  || |||||||||| ||||||    
T  2404 tttgaatcaaaagagtgttgattgatgattcaaaaagctgatgagattaatgattaattgattcattctcctcaccacatgattttca 2491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 89; Significance: 2e-42; HSPs: 7)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 2094 - 2332
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  2094 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 2193  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  2194 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 2293  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  2294 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 2332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 6309 - 6547
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  6309 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 6408  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  6409 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 6508  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  6509 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 6547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #3
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 10524 - 10762
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  10524 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 10623  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  10624 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 10723  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  10724 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 10762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #4
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 14739 - 14977
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  14739 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 14838  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  14839 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 14938  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  14939 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 14977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 18954 - 19192
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  18954 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 19053  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  19054 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 19153  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  19154 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 19192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #6
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 23169 - 23407
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  23169 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 23268  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  23269 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 23368  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  23369 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 23407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 335 - 570
Target Start/End: Original strand, 27384 - 27622
Alignment:
Q  335 gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaactttgaagagaaaccaattcatgaa- 433  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||||| || | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  27384 gaatgttctcatgatgaagatgtttattacactcgaaattattcttgttatttcatcaaattgattaggatcaattttgaagtgaaaccaattcatgaat 27483  T
Q  434 --tgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtc 531  Q
      ||| ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||  |||  || ||||||||| |||||||||  |||||  |    
T  27484 attgaattattcataaagttattcattaatgatattgattggagaattatcaaagatgaaacttcaatattatatgcatggagattctatagtaaaatac 27583  T
Q  532 ttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagata 570  Q
    |||||| |||  || | | | ||||||||||| ||||||    
T  27584 ttaggacgattcaagagtttcccatcactattcaagata 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 76; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 645 - 944
Target Start/End: Complemental strand, 217796 - 217508
Alignment:
Q  645 ttctgtcaatttcccttgtgcactagagaaaagaaagaatcatatggtattattttaagcaaaattctgactgacaacaatgtgattttctatctatatt 744  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||||||||||||||||||| || | | ||||||||  ||| |||||||||  |||||||||||||||| ||| |||| |    
T  217796 ttctgccaatttctctcgtgaactagagaaaagaaagaattatttagaattattttcggcagaattctgacacacaacaatgtgatttt-tatttatact 217698  T
Q  745 cctgacttctttcctgccttcaaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatgg 844  Q
      ||| || ||| ||||||  |||||||||  ||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||| |||| |||| |||||||||| |||||        
T  217697 tttgaattattttctgcctctaaagtgtct--atttatagagaaacttatgtcatttggtaaagataaacaaccttttgaaagagtttgtccatga---- 217604  T
Q  845 ttatattgctttaattgtcaagcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctctcacaat 944  Q
        |||||||| ||||||||| ||||  | ||||||||||||| |||||||| ||| ||| |||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||    
T  217603 ----attgctttgattgtcaagaattacgcattttctctaaaagatctctatttaaccattgcaacttttttattatatttcggaaatttctctcacaat 217508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 765 - 937
Target Start/End: Complemental strand, 215816 - 215646
Alignment:
Q  765 caaagtgtctctatttatagagaaatttatgttctttggtgaagataaagaaccctttggaagagtttgtgcatgaatggttatattgctttaattgtca 864  Q
    |||||||||||| | |||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||  | |  |||||  ||||||||||| |   ||| ||| ||||    
T  215816 caaagtgtctctgtctatagaaaaacttatgtcctttggtgaagagaaatgaccctttaaatggatttgtttatgaatggttacaa--cttcaatcgtca 215719  T
Q  865 agcattataccttttctctaaaaggtctctattaaactattacaactttccaaatatattttggaaatttctc 937  Q
    | ||||| |  ||||||  ||||| |||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  215718 aacattacatattttcttcaaaagatctctatttaaccattgcaactttctaaatatattttggaaatttctc 215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 75; Significance: 5e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 210 - 632
Target Start/End: Original strand, 399 - 797
Alignment:
Q  210 attgtgtgcaatcaccaagaggaattatgagatatattgcatcatcaacaaaataattcaggcttcattaaccgagaaggtattgtcatctcaaatagaa 309  Q
    |||||||| |||||| ||||| ||||||||||   |||||||||||||    | |||||| | || ||| ||| ||||| ||||||| ||| | ||||||    
T  399 attgtgtggaatcactaagagaaattatgagaagaattgcatcatcaa----acaattcaaggttgattgaccaagaagatattgtcttcttatatagaa 494  T
Q  310 gagaagattatcaactctgatgaat-gaatgttctcatgataaggatgtgtattacactcgaaattattgttatcatttcatcaaaatgattaggatcaa 408  Q
    ||||| |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| | ||||  ||||||||||||||||||| | || |  ||||| |||| ||||| |||||    
T  495 gagaacattatcaactttgatgaaaagaaggttctcatgatgaagatgattattacactcgaaattattctcattacctcatcgaaataattagaatcaa 594  T
Q  409 ctttgaagagaaaccaattcatgaatgagttatttattaagtcattcattaatgatattgattggagaaatatcaaagaataaaactcatgatcatatgc 508  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||                     ||||||||| |||||| ||| |||| ||||||||||||||    
T  595 ctttgaagagaaaccaaccgatgaatgaattattcatta---------------------attggagaattatcaaggaagaaaattcatgatcatatgc 673  T
Q  509 atgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttga 608  Q
    |||||||||||||||||| |  |  |||||| || || |||||||||||| | || |||||||||||  ||| |||| |||| |||||||| |||||| |    
T  674 atgaagattctatcataataaacaaaggatggtccaagaatcttccatcattttttaagatatgattcgggaaaatagaaatcaatcaaaggaattttta 773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0842 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0842
Description:

Target: scaffold0842; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 45 - 161
Target Start/End: Original strand, 3051 - 3163
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaaaaatgtcttaa 144  Q
    ||||||||||||||||||||| | || ||||||    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | |||||    
T  3051 tttgaatcaaaagagtgttgattaaagattcaa----aagatgaattttatgattaattgattcatcctcatcaccacatggttttcaacaaagccttaa 3146  T
Q  145 atattcaaggaagaaaa 161  Q
    | ||| |||||||||||    
T  3147 agatttaaggaagaaaa 3163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186 (Bit Score: 57; Significance: 3e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0186
Description:

Target: scaffold0186; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 45 - 133
Target Start/End: Original strand, 3121 - 3209
Alignment:
Q  45 tttgaatcaaaagagtgttgagtgaatattcaacaagaagatgaattttatgattaattgattcatcatcatcaccacatggttttcaa 133  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3121 tttgaatcaaatgagtgttgattgaagattaaacaagaagatgtattttatgatcaattgactcatcctcatcaccacatggttttcaa 3209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0186; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 496 - 606
Target Start/End: Original strand, 3511 - 3621
Alignment:
Q  496 catgatcatatgcatgaagattctatcataaaagtcttaggatgatcaaaaaatcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatc 595  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||| || | || ||||||||| ||||| || | || ||||    
T  3511 catgatcatatgctcgaagattctatcataaaagacttaggatgatcaaagaatctttcatcattactcaaaatatgatttgggagagtagagatcaatc 3610  T
Q  596 aaagaaatttt 606  Q
    ||| |||||||    
T  3611 aaacaaatttt 3621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0771 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0771
Description:

Target: scaffold0771; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 548 - 639
Target Start/End: Complemental strand, 5596 - 5505
Alignment:
Q  548 atcttccatcactattaaagatatgatttaggagaatataaatgaatcaaagaaattttgacttcgtgaaaggtttctcacgttcctacaaa 639  Q
    ||||||||||| | || |||||||||||| |||||||| |||| |||||||  |||||| |||| | ||||||||||||| |||| ||||||    
T  5596 atcttccatcatttttcaagatatgatttgggagaatagaaatcaatcaaatgaatttttactttgagaaaggtttctcatgttcttacaaa 5505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University