View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15550_high_2 (Length: 572)

Name: NF15550_high_2
Description: NF15550
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15550_high_2
NF15550_high_2
[»] chr6 (46 HSPs)
chr6 (72-562)||(25421208-25421698)
chr6 (72-562)||(6027151-6027638)
chr6 (72-562)||(33341878-33342370)
chr6 (71-562)||(34166983-34167473)
chr6 (72-562)||(34164761-34165251)
chr6 (102-562)||(16554772-16555227)
chr6 (102-562)||(16631328-16631783)
chr6 (102-562)||(16653015-16653470)
chr6 (102-562)||(16578328-16578783)
chr6 (102-562)||(16616597-16617052)
chr6 (72-485)||(13153893-13154308)
chr6 (102-551)||(27647777-27648209)
chr6 (196-551)||(412016-412369)
chr6 (128-551)||(3072596-3073014)
chr6 (127-551)||(6097285-6097695)
chr6 (277-551)||(2171512-2171792)
chr6 (277-548)||(31404656-31404932)
chr6 (72-209)||(6136079-6136216)
chr6 (277-544)||(16452310-16452583)
chr6 (277-548)||(5406181-5406456)
chr6 (277-548)||(5410506-5410781)
chr6 (277-548)||(30834517-30834794)
chr6 (277-548)||(5413376-5413650)
chr6 (72-184)||(13159051-13159164)
chr6 (196-465)||(33160254-33160521)
chr6 (300-465)||(21588931-21589095)
chr6 (300-465)||(21593664-21593828)
chr6 (288-465)||(3808699-3808877)
chr6 (277-548)||(16568953-16569208)
chr6 (277-380)||(5409051-5409151)
chr6 (279-465)||(9183015-9183199)
chr6 (300-462)||(17758026-17758188)
chr6 (300-465)||(2972943-2973107)
chr6 (300-465)||(17762990-17763155)
chr6 (300-463)||(26830127-26830289)
chr6 (300-465)||(22424829-22424995)
chr6 (308-465)||(28137420-28137576)
chr6 (300-445)||(5043648-5043792)
chr6 (293-462)||(26954283-26954450)
chr6 (293-380)||(33211182-33211267)
chr6 (304-380)||(26800674-26800748)
chr6 (289-380)||(603081-603170)
chr6 (320-465)||(3038926-3039071)
chr6 (395-465)||(4045423-4045494)
chr6 (128-221)||(2171366-2171456)
chr6 (277-341)||(21356021-21356084)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (71-562)||(10593161-10593651)
chr5 (72-562)||(25078023-25078513)
chr5 (72-562)||(25135992-25136482)
chr5 (67-562)||(40382206-40382699)
chr5 (72-562)||(40379995-40380483)
chr5 (72-562)||(16544312-16544804)
chr5 (72-562)||(16546534-16547026)
chr5 (103-551)||(29720278-29720721)
chr5 (103-551)||(29722438-29722881)
chr5 (101-551)||(29750968-29751414)
chr5 (102-555)||(22536104-22536545)
chr5 (106-551)||(9789042-9789478)
chr5 (106-551)||(18441462-18441902)
chr5 (176-551)||(16409389-16409764)
chr5 (196-551)||(26177797-26178150)
chr5 (243-551)||(26170688-26170983)
chr5 (277-548)||(25412672-25412947)
chr5 (196-548)||(30182499-30182852)
chr5 (293-548)||(13342971-13343232)
chr5 (188-535)||(13239674-13240025)
chr5 (277-548)||(36074024-36074302)
chr5 (277-446)||(37439161-37439328)
chr5 (300-465)||(213465-213630)
chr5 (196-465)||(32636824-32637088)
chr5 (300-465)||(40147261-40147425)
chr5 (285-465)||(28278316-28278494)
chr5 (293-465)||(42428427-42428598)
chr5 (302-465)||(13488203-13488365)
chr5 (300-380)||(5058131-5058209)
chr5 (18-65)||(193289-193336)
chr5 (277-535)||(16452003-16452266)
chr5 (300-465)||(27637616-27637781)
chr5 (304-548)||(30682930-30683178)
chr5 (277-548)||(31182883-31183157)
chr5 (277-548)||(33831590-33831866)
chr5 (280-465)||(533769-533952)
chr5 (274-447)||(8565926-8566095)
chr5 (320-465)||(13695713-13695859)
chr5 (302-381)||(28750661-28750738)
chr5 (293-365)||(19806463-19806534)
chr5 (300-380)||(27015609-27015687)
chr5 (293-462)||(39468546-39468714)
chr5 (318-365)||(16640961-16641008)
chr5 (317-465)||(42426255-42426403)
chr5 (304-462)||(538028-538185)
chr5 (302-362)||(4160702-4160762)
chr5 (308-411)||(9049354-9049455)
chr5 (277-365)||(3075640-3075726)
[»] chr3 (68 HSPs)
chr3 (72-562)||(3617352-3617842)
chr3 (72-562)||(25637331-25637822)
chr3 (72-562)||(4598299-4598788)
chr3 (72-562)||(4600520-4601009)
chr3 (72-562)||(10211298-10211788)
chr3 (72-562)||(10209078-10209568)
chr3 (72-562)||(10056122-10056612)
chr3 (72-562)||(10058344-10058834)
chr3 (72-562)||(10060566-10061056)
chr3 (72-562)||(10062788-10063278)
chr3 (72-562)||(10065010-10065500)
chr3 (102-551)||(45282897-45283344)
chr3 (124-551)||(54635039-54635462)
chr3 (102-551)||(6716414-6716858)
chr3 (175-551)||(801005-801376)
chr3 (106-502)||(7779821-7780208)
chr3 (72-336)||(10067435-10067699)
chr3 (363-562)||(10067232-10067431)
chr3 (176-551)||(23200020-23200398)
chr3 (178-551)||(23197823-23198199)
chr3 (431-551)||(6718598-6718718)
chr3 (277-548)||(45095075-45095350)
chr3 (277-548)||(9636106-9636385)
chr3 (277-548)||(5258125-5258402)
chr3 (179-462)||(19683774-19684054)
chr3 (277-548)||(5260304-5260581)
chr3 (277-465)||(37408458-37408645)
chr3 (293-465)||(7762265-7762437)
chr3 (179-454)||(7764476-7764747)
chr3 (293-548)||(9581193-9581454)
chr3 (278-465)||(34491212-34491397)
chr3 (285-465)||(49199457-49199638)
chr3 (277-465)||(29196368-29196555)
chr3 (302-465)||(4569952-4570115)
chr3 (285-465)||(43401789-43401970)
chr3 (293-462)||(39153358-39153526)
chr3 (278-548)||(40735293-40735568)
chr3 (285-461)||(30236129-30236304)
chr3 (289-380)||(43403736-43403826)
chr3 (277-380)||(16499115-16499215)
chr3 (293-465)||(40734498-40734669)
chr3 (300-465)||(41819526-41819691)
chr3 (293-465)||(44331545-44331716)
chr3 (277-548)||(760757-761033)
chr3 (304-462)||(22835010-22835167)
chr3 (300-380)||(6095603-6095681)
chr3 (293-446)||(29813083-29813234)
chr3 (285-380)||(40913379-40913472)
chr3 (278-447)||(51398833-51398999)
chr3 (277-463)||(31314447-31314631)
chr3 (300-380)||(54593790-54593868)
chr3 (293-465)||(44700476-44700646)
chr3 (278-465)||(5236440-5236624)
chr3 (293-548)||(29682269-29682530)
chr3 (277-548)||(32744418-32744684)
chr3 (308-465)||(46860474-46860631)
chr3 (304-465)||(53921511-53921671)
chr3 (285-446)||(46173377-46173536)
chr3 (317-445)||(29810889-29811016)
chr3 (277-447)||(9666448-9666616)
chr3 (285-377)||(47304340-47304430)
chr3 (300-380)||(55301975-55302054)
chr3 (305-364)||(27305719-27305777)
chr3 (304-463)||(32891105-32891264)
chr3 (277-460)||(4055745-4055926)
chr3 (277-380)||(23391891-23391991)
chr3 (393-465)||(5433971-5434046)
chr3 (302-365)||(2075081-2075143)
[»] chr7 (67 HSPs)
chr7 (69-562)||(18388533-18389024)
chr7 (72-562)||(18391972-18392460)
chr7 (70-562)||(32060096-32060590)
chr7 (72-562)||(6594334-6594822)
chr7 (72-562)||(6592116-6592604)
chr7 (102-551)||(20343811-20344254)
chr7 (71-386)||(1560440-1560755)
chr7 (230-551)||(24789755-24790074)
chr7 (128-551)||(43503991-43504409)
chr7 (176-551)||(39731283-39731656)
chr7 (395-562)||(1562103-1562268)
chr7 (277-548)||(35853825-35854102)
chr7 (277-551)||(25766940-25767215)
chr7 (277-548)||(29990965-29991240)
chr7 (277-551)||(48408709-48408992)
chr7 (179-535)||(25615785-25616137)
chr7 (179-465)||(23555039-23555323)
chr7 (293-465)||(34310712-34310884)
chr7 (277-548)||(19502088-19502365)
chr7 (278-465)||(22269973-22270158)
chr7 (277-465)||(41317416-41317602)
chr7 (180-548)||(4178685-4179054)
chr7 (279-465)||(14069817-14070001)
chr7 (279-465)||(14379845-14380029)
chr7 (196-465)||(27347817-27348081)
chr7 (300-465)||(8359319-8359485)
chr7 (277-446)||(41648993-41649158)
chr7 (285-447)||(2390301-2390461)
chr7 (300-465)||(29608737-29608901)
chr7 (304-465)||(30024740-30024900)
chr7 (300-380)||(32358058-32358136)
chr7 (301-465)||(6431971-6432134)
chr7 (317-465)||(48491579-48491727)
chr7 (278-465)||(18126644-18126829)
chr7 (300-465)||(3258995-3259159)
chr7 (128-234)||(24790230-24790333)
chr7 (300-465)||(48599338-48599502)
chr7 (293-465)||(8153342-8153513)
chr7 (302-465)||(2360978-2361140)
chr7 (277-465)||(4253510-4253697)
chr7 (302-465)||(43864244-43864406)
chr7 (278-465)||(48489431-48489616)
chr7 (300-465)||(4508710-4508874)
chr7 (293-447)||(31732966-31733118)
chr7 (305-535)||(47673953-47674189)
chr7 (277-465)||(36146390-36146576)
chr7 (302-465)||(4586161-4586323)
chr7 (278-465)||(26417316-26417501)
chr7 (278-465)||(47676119-47676304)
chr7 (277-548)||(38671204-38671480)
chr7 (304-446)||(23565069-23565210)
chr7 (277-380)||(24525484-24525584)
chr7 (304-380)||(31518988-31519063)
chr7 (277-462)||(495965-496148)
chr7 (277-380)||(1113743-1113843)
chr7 (285-380)||(6359941-6360034)
chr7 (302-365)||(18396418-18396481)
chr7 (302-365)||(30814536-30814598)
chr7 (302-381)||(31105399-31105476)
chr7 (306-380)||(2759207-2759279)
chr7 (393-465)||(23343975-23344048)
chr7 (394-465)||(24525992-24526065)
chr7 (300-376)||(4510552-4510626)
chr7 (300-376)||(4512394-4512468)
chr7 (277-361)||(12097849-12097931)
chr7 (302-444)||(22328395-22328538)
chr7 (463-548)||(24514934-24515018)
[»] chr1 (60 HSPs)
chr1 (71-562)||(44203536-44204025)
chr1 (102-562)||(9036320-9036774)
chr1 (101-551)||(21053872-21054315)
chr1 (128-551)||(40282291-40282711)
chr1 (101-551)||(9987116-9987559)
chr1 (128-551)||(20622072-20622492)
chr1 (176-551)||(51765302-51765684)
chr1 (179-462)||(8550670-8550952)
chr1 (293-466)||(13316348-13316521)
chr1 (277-548)||(20762582-20762859)
chr1 (277-465)||(3189330-3189517)
chr1 (277-465)||(3198147-3198334)
chr1 (277-465)||(3206986-3207173)
chr1 (300-465)||(37168297-37168462)
chr1 (285-465)||(42297963-42298143)
chr1 (300-465)||(13547093-13547257)
chr1 (279-465)||(28220210-28220394)
chr1 (293-465)||(37033068-37033241)
chr1 (277-462)||(834149-834332)
chr1 (300-465)||(13549004-13549168)
chr1 (300-465)||(29136247-29136412)
chr1 (300-465)||(47255343-47255508)
chr1 (278-548)||(3156776-3157050)
chr1 (277-465)||(4552619-4552805)
chr1 (277-446)||(28265536-28265702)
chr1 (300-465)||(7482234-7482399)
chr1 (302-465)||(44455160-44455322)
chr1 (300-465)||(11348698-11348862)
chr1 (277-380)||(13659318-13659418)
chr1 (278-465)||(37503540-37503722)
chr1 (278-465)||(49918350-49918535)
chr1 (300-447)||(31925711-31925856)
chr1 (300-465)||(47115171-47115337)
chr1 (279-465)||(28223405-28223589)
chr1 (300-380)||(28242391-28242469)
chr1 (293-465)||(45644351-45644523)
chr1 (277-380)||(46065004-46065104)
chr1 (277-465)||(50169192-50169378)
chr1 (301-447)||(34603595-34603740)
chr1 (300-380)||(193697-193775)
chr1 (302-465)||(19754494-19754657)
chr1 (317-465)||(23555286-23555433)
chr1 (293-465)||(31659238-31659409)
chr1 (277-465)||(50167157-50167343)
chr1 (320-465)||(1833522-1833667)
chr1 (277-462)||(3847103-3847286)
chr1 (277-380)||(36683766-36683866)
chr1 (300-380)||(37876770-37876848)
chr1 (293-411)||(13137973-13138089)
chr1 (304-446)||(196915-197056)
chr1 (293-465)||(19752685-19752857)
chr1 (321-460)||(22079322-22079461)
chr1 (302-444)||(927982-928123)
chr1 (317-447)||(15820326-15820455)
chr1 (389-447)||(32736952-32737009)
chr1 (306-446)||(37282701-37282841)
chr1 (277-380)||(40122178-40122280)
chr1 (308-365)||(8871074-8871130)
chr1 (277-378)||(16455709-16455807)
chr1 (393-460)||(12318618-12318685)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (72-562)||(12647162-12647650)
chr2 (72-485)||(13655805-13656220)
chr2 (128-551)||(6266605-6267023)
chr2 (106-551)||(32289479-32289916)
chr2 (176-551)||(4484211-4484592)
chr2 (176-467)||(30833342-30833633)
chr2 (177-548)||(4503017-4503390)
chr2 (277-548)||(45099665-45099941)
chr2 (277-548)||(5723237-5723512)
chr2 (179-548)||(36987961-36988333)
chr2 (277-548)||(36205646-36205921)
chr2 (277-533)||(2334399-2334661)
chr2 (277-446)||(6594987-6595154)
chr2 (277-447)||(34139752-34139920)
chr2 (300-465)||(45726929-45727093)
chr2 (196-465)||(29867869-29868133)
chr2 (277-447)||(723726-723893)
chr2 (277-447)||(14633807-14633975)
chr2 (300-380)||(35446888-35446966)
chr2 (277-465)||(36773562-36773748)
chr2 (293-465)||(38312240-38312411)
chr2 (278-380)||(17057352-17057451)
chr2 (278-380)||(17085335-17085434)
chr2 (317-548)||(42362262-42362500)
chr2 (300-380)||(1631736-1631814)
chr2 (302-460)||(33648176-33648335)
chr2 (277-465)||(11151573-11151759)
chr2 (277-380)||(36317991-36318091)
chr2 (285-465)||(24398055-24398238)
chr2 (302-411)||(17490154-17490261)
chr2 (302-465)||(26353184-26353346)
chr2 (277-447)||(11067324-11067491)
chr2 (277-447)||(33162432-33162599)
chr2 (293-365)||(39284936-39285007)
chr2 (331-465)||(13121769-13121901)
chr2 (304-462)||(11690504-11690661)
chr2 (293-365)||(17450678-17450748)
chr2 (302-380)||(42288117-42288192)
chr2 (300-380)||(7451204-7451281)
chr2 (347-465)||(7815323-7815441)
chr2 (308-360)||(28672036-28672088)
chr2 (320-365)||(42412118-42412162)
chr2 (277-341)||(1345590-1345653)
[»] chr4 (61 HSPs)
chr4 (72-562)||(8395508-8395996)
chr4 (72-562)||(7124804-7125294)
chr4 (72-562)||(8393299-8393787)
chr4 (72-562)||(7122585-7123075)
chr4 (71-562)||(5138193-5138685)
chr4 (72-562)||(5135967-5136459)
chr4 (128-535)||(31495143-31495556)
chr4 (277-548)||(13992274-13992544)
chr4 (300-548)||(29999809-30000063)
chr4 (277-535)||(56178618-56178882)
chr4 (179-451)||(5369968-5370237)
chr4 (277-465)||(52095344-52095530)
chr4 (285-461)||(2209717-2209894)
chr4 (277-465)||(48143042-48143230)
chr4 (300-465)||(41964415-41964580)
chr4 (278-465)||(9927441-9927626)
chr4 (277-465)||(47038393-47038577)
chr4 (285-465)||(26364236-26364415)
chr4 (278-465)||(12739533-12739718)
chr4 (278-446)||(12743908-12744073)
chr4 (278-446)||(12745297-12745462)
chr4 (300-465)||(46703500-46703666)
chr4 (285-465)||(54883020-54883199)
chr4 (278-465)||(26175619-26175804)
chr4 (278-465)||(34570397-34570582)
chr4 (302-465)||(40632445-40632607)
chr4 (300-447)||(6655975-6656120)
chr4 (277-463)||(46147373-46147557)
chr4 (300-465)||(12073392-12073557)
chr4 (300-465)||(41639426-41639590)
chr4 (300-411)||(50673851-50673960)
chr4 (317-465)||(8665408-8665556)
chr4 (293-465)||(36463386-36463557)
chr4 (277-465)||(45687164-45687351)
chr4 (277-411)||(48893620-48893751)
chr4 (285-380)||(50262689-50262783)
chr4 (302-458)||(5207848-5208003)
chr4 (285-445)||(12119559-12119719)
chr4 (302-465)||(36994524-36994686)
chr4 (304-447)||(379399-379541)
chr4 (306-465)||(37229731-37229890)
chr4 (300-380)||(8648225-8648303)
chr4 (305-548)||(37740536-37740784)
chr4 (277-446)||(6542161-6542328)
chr4 (293-380)||(5429765-5429850)
chr4 (305-465)||(27416974-27417133)
chr4 (305-380)||(35662527-35662600)
chr4 (317-465)||(54199926-54200074)
chr4 (302-411)||(4588014-4588121)
chr4 (277-366)||(52467336-52467423)
chr4 (280-380)||(5871906-5872003)
chr4 (337-446)||(12744087-12744195)
chr4 (302-439)||(26699447-26699585)
chr4 (277-411)||(31474206-31474337)
chr4 (278-380)||(29254580-29254679)
chr4 (335-465)||(12747794-12747924)
chr4 (277-465)||(52082645-52082825)
chr4 (317-380)||(13009464-13009526)
chr4 (335-380)||(3913534-3913578)
chr4 (321-362)||(33989948-33989989)
chr4 (323-375)||(33089970-33090021)
[»] scaffold0565 (1 HSPs)
scaffold0565 (72-562)||(2380-2868)
[»] scaffold0137 (1 HSPs)
scaffold0137 (72-562)||(6177-6667)
[»] scaffold0674 (1 HSPs)
scaffold0674 (115-562)||(3545-3990)
[»] chr8 (50 HSPs)
chr8 (72-562)||(15290427-15290917)
chr8 (72-562)||(15470796-15471286)
chr8 (72-562)||(42575100-42575589)
chr8 (102-555)||(25689865-25690312)
chr8 (102-551)||(3439418-3439860)
chr8 (106-551)||(2627649-2628087)
chr8 (277-548)||(34254312-34254586)
chr8 (277-548)||(17982563-17982840)
chr8 (177-548)||(31218167-31218541)
chr8 (277-548)||(34256488-34256762)
chr8 (196-465)||(42498193-42498459)
chr8 (277-548)||(44303764-44304042)
chr8 (277-548)||(19945340-19945618)
chr8 (277-446)||(1746200-1746366)
chr8 (278-465)||(15212786-15212971)
chr8 (300-465)||(42434995-42435159)
chr8 (278-465)||(43036423-43036608)
chr8 (300-465)||(4283524-4283688)
chr8 (293-465)||(33352150-33352321)
chr8 (293-463)||(40321082-40321251)
chr8 (300-465)||(18655400-18655564)
chr8 (277-465)||(3303652-3303838)
chr8 (277-380)||(4743196-4743296)
chr8 (293-465)||(27811278-27811449)
chr8 (201-447)||(12702542-12702783)
chr8 (285-380)||(10930188-10930281)
chr8 (302-465)||(40221745-40221907)
chr8 (323-462)||(40328782-40328922)
chr8 (277-380)||(1345353-1345453)
chr8 (293-380)||(5689357-5689442)
chr8 (278-465)||(4731658-4731843)
chr8 (303-465)||(18141821-18141981)
chr8 (293-382)||(6599056-6599143)
chr8 (293-382)||(6674509-6674596)
chr8 (317-459)||(30143346-30143488)
chr8 (303-411)||(41366622-41366727)
chr8 (305-465)||(30291606-30291767)
chr8 (302-380)||(4733792-4733868)
chr8 (303-465)||(1292471-1292631)
chr8 (302-465)||(8965697-8965859)
chr8 (347-465)||(9765745-9765863)
chr8 (300-447)||(11384004-11384149)
chr8 (277-365)||(10015180-10015265)
chr8 (335-462)||(44353796-44353923)
chr8 (308-380)||(8153844-8153914)
chr8 (302-382)||(18106087-18106163)
chr8 (302-447)||(4162516-4162658)
chr8 (302-380)||(3073880-3073955)
chr8 (304-365)||(7597715-7597776)
chr8 (202-239)||(32902096-32902133)
[»] scaffold1808 (1 HSPs)
scaffold1808 (115-329)||(1-214)
[»] scaffold0491 (2 HSPs)
scaffold0491 (176-551)||(11042-11423)
scaffold0491 (176-467)||(8616-8907)
[»] scaffold0002 (1 HSPs)
scaffold0002 (196-548)||(434443-434798)
[»] scaffold0286 (1 HSPs)
scaffold0286 (277-465)||(11557-11745)
[»] scaffold1519 (1 HSPs)
scaffold1519 (293-548)||(827-1087)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (293-465)||(114602-114774)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (300-446)||(18007-18151)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (277-380)||(149079-149179)
[»] scaffold0466 (1 HSPs)
scaffold0466 (300-465)||(7327-7491)
[»] scaffold0066 (1 HSPs)
scaffold0066 (196-465)||(20319-20583)
[»] scaffold0236 (1 HSPs)
scaffold0236 (302-380)||(10575-10651)
[»] scaffold0219 (1 HSPs)
scaffold0219 (308-365)||(27453-27510)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 426; Significance: 0; HSPs: 46)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 426; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25421698 - 25421208
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421698 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25421599  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  25421598 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 25421501  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421500 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25421401  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421400 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25421301  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25421300 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25421208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6027638 - 6027151
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||     
T  6027638 tgttgtgaatccccggatctccaagactggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagaggggtaaccacctaacaaggtg 6027539  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |  |||||||    
T  6027538 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaa-atg--gagggaa 6027442  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027441 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 6027342  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027341 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6027242  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6027241 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6027151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 379; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 33341878 - 33342370
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  33341878 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 33341977  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  33341978 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 33342075  T
Q  269 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 367  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33342076 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 33342175  T
Q  368 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342176 gagttctttacaaaaggagtacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 33342275  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33342276 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 33342370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 34167473 - 34166983
Alignment:
Q  71 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      
T  34167473 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaaaa 34167374  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
     ||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  34167373 atattgagcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatcaaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 34167276  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  34167275 agaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaataa 34167176  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34167175 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 34167076  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34167075 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34166983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 34165251 - 34164761
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  34165251 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 34165152  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  34165151 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 34165055  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34165054 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 34164955  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34164954 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 34164855  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34164854 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 34164761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16555227 - 16554772
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16555227 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16555133  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16555132 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16555034  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16555033 cacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16554934  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16554933 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16554834  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16554833 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16554772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16631783 - 16631328
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16631783 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16631689  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16631688 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16631590  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16631589 cacccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16631490  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16631489 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16631390  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16631389 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16631328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16653470 - 16653015
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16653470 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16653376  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16653375 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16653277  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16653276 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16653177  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16653176 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttttacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 16653077  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16653076 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16653015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Original strand, 16578328 - 16578783
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16578328 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16578422  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16578423 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16578521  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16578522 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16578621  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16578622 gaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcc 16578721  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16578722 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16578783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16617052 - 16616597
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| |||||||||||||||    
T  16617052 atcgaaccacaccaatactaa--ataatgatgtgtggagccaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 16616958  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  16616957 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagagattgtt 16616859  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  16616858 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgcactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 16616759  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16616758 gaaattagcttgacaagttcacaatgagcaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaacgtgtttcc 16616659  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16616658 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 16616597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 72 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 13154308 - 13153893
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13154308 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13154209  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  13154208 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 13154111  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154110 agaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 13154011  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13154010 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 13153911  T
Q  468 cactcaatgattctctct 485  Q
    ||||||||||||||||||    
T  13153910 cactcaatgattctctct 13153893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 102 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 27648209 - 27647777
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    ||||||||||||||||||||     ||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||| || ||||||||||||    
T  27648209 atcgaaccacaccaatacaag----aatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccgaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacacc 27648115  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||  ||       |||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  27648114 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaataca-------caagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 27648024  T
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaag 401  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  27648023 acccagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 27647925  T
Q  402 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  27647924 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacatggtgtttccc 27647827  T
Q  502 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27647826 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 27647777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 196 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 412369 - 412016
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||| | ||||||  ||||||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  412369 aacagcacctagatctaatctaggtaacaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaaagag 412273  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg 394  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||| | |    
T  412272 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaaagagatacaaaaag 412174  T
Q  395 --ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 491  Q
      |||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  412173 agttacaagaaattagatttgataagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaa 412075  T
Q  492 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  412074 ggtgtttcccatgttttcaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 412016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 3072596 - 3073014
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaac-accacctagatctaatctaggaaccaag 226  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||||| || ||||||||  | ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  3072596 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaatagcacatagatctaatctaggaaacaag 3072691  T
Q  227 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 326  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  3072692 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 3072788  T
Q  327 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcact 423  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  3072789 actctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcaca 3072887  T
Q  424 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||      
T  3072888 atgaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaag 3072986  T
Q  523 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  3072987 ctctaatcaaag-actctaaaccctagag 3073014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 150; E-Value: 5e-79
Query Start/End: Original strand, 127 - 551
Target Start/End: Original strand, 6097285 - 6097695
Alignment:
Q  127 aatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacctagatctaatctaggaaccaa 225  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||| | || |||||||| || ||||| ||||||||||||| | |||    
T  6097285 aatgatgtgtggagcaacggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagctataatcaacaaaaacagcaccttgatctaatctaggtaacaa 6097380  T
Q  226 gtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttga 323  Q
    |||  ||| |||||  || |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  6097381 gtggaaaaacacaataca-caatcacaagata--caaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttga 6097477  T
Q  324 cctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcac 422  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  |||||||||||||    
T  6097478 cctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcac 6097566  T
Q  423 tatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagat 521  Q
     | |||| || |||||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  6097567 aaagaac-aatcctaatttctaccatttttccaatctcaccaaaacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaaccaaagagat 6097665  T
Q  522 actctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6097666 actctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6097695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 127; E-Value: 3e-65
Query Start/End: Original strand, 277 - 551
Target Start/End: Original strand, 2171512 - 2171792
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2171512 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 2171610  T
Q  377 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| |||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||    
T  2171611 c-aaagagatacaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaaga 2171708  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2171709 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 2171792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 31404656 - 31404932
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31404656 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttggcctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 31404753  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  31404754 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcactgatgaacaaga 31404851  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  31404852 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaagaccctaaacccta 31404932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 106; E-Value: 9e-53
Query Start/End: Original strand, 72 - 209
Target Start/End: Original strand, 6136079 - 6136216
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||     
T  6136079 tgttgtgaatccccggacctccaaggccggatcgaaccataccaatacaaagaataatgatgtgtggagcaacggagagtggtaaccaccaaacaaagtg 6136178  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6136179 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagat 6136216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 544
Target Start/End: Original strand, 16452310 - 16452583
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  16452310 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttc 16452407  T
Q  377 caaa-agggatgcaagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    |||| ||  ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  16452408 caaagagatatgaaag-ggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 16452505  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaac 544  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16452506 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaac 16452583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5406181 - 5406456
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5406181 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5406278  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5406279 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5406376  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5406377 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5406456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5410506 - 5410781
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5410506 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5410603  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5410604 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 5410701  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5410702 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5410781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 30834517 - 30834794
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  30834517 aaacaaacacaccaa-agattattcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 30834613  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  30834614 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 30834712  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   | |||||||| | |||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30834713 gacactcaatgattttcactcaccgaggtgtttacaatgtttctcaacccaagaga-actctaatcaaag-accataaacccta 30834794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5413376 - 5413650
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5413376 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5413472  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  5413473 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaatgaacaaga 5413570  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5413571 cactcaatgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccgagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5413650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 72 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 13159164 - 13159051
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||||||| |||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  13159164 tgttgtgaatcctcggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 13159065  T
Q  171 ttattgtgcaagca 184  Q
    |||||| |||||||    
T  13159064 ttattgagcaagca 13159051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Original strand, 33160254 - 33160521
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  || |||||| | |||| || |||||||| ||||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||    
T  33160254 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa-aaggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-ag 33160349  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag- 393  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||| ||| ||| ||     
T  33160350 attgttcacccagtttggtccaaacttgaaatactctggaggagagattgatctctccaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaaga 33160447  T
Q  394 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  33160448 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 33160521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21589095 - 21588931
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  21589095 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 21588999  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21588998 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21588931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 21593828 - 21593664
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  21593828 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 21593732  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  21593731 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 21593664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 288 - 465
Target Start/End: Original strand, 3808699 - 3808877
Alignment:
Q  288 ccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatg 387  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||     
T  3808699 ccaagagattgttcacctagttcggtccaatcatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagata 3808796  T
Q  388 caaga--ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 465  Q
    ||| |  |||||||||||||||| || | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||||||    
T  3808797 caaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 3808877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 16569208 - 16568953
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16569208 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16569112  T
Q  377 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactcaa 474  Q
    |||            ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||   ||||||||||||    
T  16569111 caa------------aggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatct---caagacactcaa 16569027  T
Q  475 tgattctctctt-tacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||| || |||   |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  16569026 tgattttcacttacccaaggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 16568953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 5409051 - 5409151
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5409051 aaacaaacacaccaa-agattgttcacc-agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5409147  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  5409148 caaa 5409151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 9183015 - 9183199
Alignment:
Q  279 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 378  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  9183015 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 9183110  T
Q  379 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  9183111 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 9183199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 4e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 17758188 - 17758026
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  17758188 tcacctagttcggtccaaacttgaactactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 17758091  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  17758090 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 17758026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 2972943 - 2973107
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  2972943 tcacctagttcggtcgaa-cttgacctactcttgaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 2973039  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2973040 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2973107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 17763155 - 17762990
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||| |||  | |||||    
T  17763155 tcacctagttcggtccaaacttgatctactctggaggagagattgatcactccaatccactatc-aatgagttcttccaaaa-agatacaaatgagttac 17763058  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  17763057 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 17762990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 463
Target Start/End: Original strand, 26830127 - 26830289
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttac 398  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||    
T  26830127 tcacccagttcagtc-aaacttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatggattac 26830223  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 463  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  26830224 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccatttttccaatctcacc 26830289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 22424829 - 22424995
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga---ggtt 396  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||| ||| |   ||||    
T  22424829 tcacccagtacggtccaacaatgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttac-aaagagatacaaaaatgggtt 22424925  T
Q  397 acaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  22424926 acaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 22424995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 308 - 465
Target Start/End: Original strand, 28137420 - 28137576
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaatt 406  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || | ||  ||||||||||||||    
T  28137420 ttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttacaagaaatt 28137516  T
Q  407 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  28137517 agcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 28137576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 5043792 - 5043648
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  5043792 tcacccagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatctactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 5043695  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 445  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||    
T  5043694 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctac 5043648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Original strand, 26954283 - 26954450
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgca-ag 391  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| || |     
T  26954283 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacagat 26954379  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac 462  Q
      ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||    
T  26954380 gagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttataccaatttcccaatctcac 26954450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Original strand, 33211182 - 33211267
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  33211182 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttcttacaaa 33211267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 304 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 26800748 - 26800674
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  26800748 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 26800674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 289 - 380
Target Start/End: Original strand, 603081 - 603170
Alignment:
Q  289 caagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||   |||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  603081 caagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatttctccaatccactatc-aacgagttcttacaaa 603170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 320 - 465
Target Start/End: Original strand, 3038926 - 3039071
Alignment:
Q  320 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaag 417  Q
    |||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||| ||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  | |||    
T  3038926 ttgacctaatctgggggagagattaatctctccaatccactattaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaaaaag 3039023  T
Q  418 ttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| |||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  3039024 ctcacaatgaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 3039071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 395 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4045494 - 4045423
Alignment:
Q  395 ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||| | |||| |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  4045494 ttacaagaaattagcttcaacaagctcataaagaacaaaccctaatttctaccattttcccaatctctccaa 4045423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 128 - 221
Target Start/End: Original strand, 2171366 - 2171456
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaa 221  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||  |||||||| |   |||||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  2171366 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaa 2171456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Original strand, 21356021 - 21356084
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 341  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||    
T  21356021 aaacaaacacaccaaaagattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctaatctggaggagaga 21356084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 420; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 420; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10593651 - 10593161
Alignment:
Q  71 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10593651 ctgttgtgtatccccgtatctccaagatcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 10593552  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
     |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10593551 gtattgtgcaagcaacaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagaggga 10593453  T
Q  271 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10593452 agtagaaaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 10593353  T
Q  371 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 470  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  10593352 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttctcccaatctcaccaagacac 10593253  T
Q  471 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  10593252 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttctacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttccccctttg 10593161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25078513 - 25078023
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078513 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25078414  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25078413 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25078316  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078315 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25078216  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078215 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25078116  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25078115 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25078023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25136482 - 25135992
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||  | |||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136482 tgttgtgaatccccaaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 25136383  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  25136382 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 25136285  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136284 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 25136185  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136184 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 25136085  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25136084 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 25135992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 67 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 40382699 - 40382206
Alignment:
Q  67 attcctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaaca 166  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||    
T  40382699 attcctgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcggcggagagtggtaaccaccaaaca 40382600  T
Q  167 aagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggaga 266  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  40382599 aagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--ga 40382502  T
Q  267 gggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40382501 gggaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaa 40382402  T
Q  366 atgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 464  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40382401 atgagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaacttctacccctttcccaatctcacca 40382302  T
Q  465 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40382301 agacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40382206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 395; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 40380483 - 40379995
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  40380483 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 40380384  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  40380383 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 40380286  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  40380285 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgaactctccaatccactatcaaatgag 40380186  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380185 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 40380086  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40380085 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccgagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 40379995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 359; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16544804 - 16544312
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16544804 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 16544705  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16544704 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16544607  T
Q  269 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 367  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16544606 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16544507  T
Q  368 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544506 gagttctttacaaaagggatacaagaggttatgagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 16544407  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16544406 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16544312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 16547026 - 16546534
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaag-atcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||||||||||   ||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||     
T  16547026 tgttgtgaatccccgagcctccaaggaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtgataaccaccaaacaaagc 16546927  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaac-aaggagagg 268  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || |||||||||||| |||||||||    
T  16546926 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctaaatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaaggagagg 16546829  T
Q  269 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 367  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16546828 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 16546729  T
Q  368 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16546728 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcctaatctcaccaa 16546629  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16546628 gacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 16546534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 103 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29720721 - 29720278
Alignment:
Q  103 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29720721 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tgttgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29720624  T
Q  203 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29720623 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29720527  T
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaaga 402  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29720526 cccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 29720428  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 501  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29720427 aattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 29720328  T
Q  502 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29720327 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29720278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 103 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 29722881 - 29722438
Alignment:
Q  103 tcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacca 202  Q
    |||||||||||||||||||  |||| || |||||||||| | | ||||||||||||||| |||||||| | | || ||||||| || |||||||||||||    
T  29722881 tcgaaccacaccaatacaagaaata-tggtgtgtggagcaaagtagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtacaagcaataatcaacaaaacacca 29722784  T
Q  203 cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtca 302  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  29722783 cctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttca 29722687  T
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaaga 402  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  29722686 cccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaaga 29722588  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 501  Q
    |||||| || ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  29722587 aattagattagacaagttcacaatgaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttccc 29722488  T
Q  502 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29722487 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29722438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 290; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 101 - 551
Target Start/End: Original strand, 29750968 - 29751414
Alignment:
Q  101 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||| || | | |||||||||| || |||||||||||    
T  29750968 aatcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaatgtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacac 29751065  T
Q  201 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgg 299  Q
    ||||||||| |||||||| || |||||| ||||||||   || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  29751066 cacctagatataatctagaaaacaagtgagaaacacagtaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgt 29751162  T
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  29751163 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 29751261  T
Q  400 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 498  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  29751262 agaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgttt 29751361  T
Q  499 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29751362 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 29751414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 102 - 555
Target Start/End: Original strand, 22536104 - 22536545
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaa-caaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||   |||||||| || |||||||| ||    
T  22536104 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaagcaaagtgtat---gcaagcaacaatcaacaaaaaac 22536197  T
Q  201 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 300  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |    
T  22536198 -acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgtt 22536293  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22536294 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactccccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 22536392  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | || |||||||||    
T  22536393 gaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tgcagggtgtttcc 22536490  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 555  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22536491 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 22536545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 106 - 551
Target Start/End: Original strand, 9789042 - 9789478
Alignment:
Q  106 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 205  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  9789042 aaccacaccaatacaaagtat---gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaaaaatcaacaaaacagcacct 9789134  T
Q  206 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacc 304  Q
    ||||||||||||||||  |||||  ||||||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |||||    
T  9789135 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacc 9789231  T
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaa 403  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||||    
T  9789232 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaagaa 9789330  T
Q  404 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 502  Q
    |||||  ||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||||||    
T  9789331 attagatttgacaagttcacaaggaac-aaccttaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttccca 9789429  T
Q  503 tgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9789430 tgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 9789478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 106 - 551
Target Start/End: Original strand, 18441462 - 18441902
Alignment:
Q  106 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacct 205  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||||| |||||    
T  18441462 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacct 18441554  T
Q  206 agatctaatctaggaaccaagtgtgaaa----cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    ||||||||||||||||  |||||  |||    |||||  || ||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| |    
T  18441555 agatctaatctaggaaagaagtgaaaaaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgtt 18441651  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttaca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||    
T  18441652 cacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttaca 18441750  T
Q  400 agaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 498  Q
    |||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   ||||||||||    
T  18441751 agaaattagatttgacaagttcacaaggaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgttt 18441849  T
Q  499 cccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  18441850 cccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 18441902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 163; E-Value: 9e-87
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 16409764 - 16409389
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  16409764 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 16409668  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 372  Q
     ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  16409667 ggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagtt 16409569  T
Q  373 cttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 470  Q
    |||||||||| ||| ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16409568 cttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacac 16409470  T
Q  471 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  16409469 tcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 16409389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 154; E-Value: 2e-81
Query Start/End: Original strand, 196 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26178150 - 26177797
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-ga 293  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||    
T  26178150 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaaga 26178054  T
Q  294 gattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag 393  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||    
T  26178053 gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaag 26177955  T
Q  394 -gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaa 491  Q
     |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||    
T  26177954 agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaa 26177857  T
Q  492 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  26177856 ggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 26177797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 122; E-Value: 3e-62
Query Start/End: Original strand, 243 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 26170983 - 26170688
Alignment:
Q  243 acaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 341  Q
    |||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26170983 acaagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 26170886  T
Q  342 ttgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatt 440  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||           |||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| || |||||||    
T  26170885 ttgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaag----------agttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaac-aatcctaatt 26170798  T
Q  441 tctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccc 539  Q
    |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||  || ||||||||| || |    
T  26170797 tcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagagaagctgtaatcaaag-actc 26170700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 6e-54
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 25412947 - 25412672
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25412947 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 25412850  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||    
T  25412849 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 25412752  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  25412751 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 25412672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 196 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 30182852 - 30182499
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||   ||||||| ||||||| ||    
T  30182852 aacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaacacaccaa-ag 30182759  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-gcaagag 393  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||  |    
T  30182758 attgttcatccagttcggtccaaacttgacatactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatagaaaagg 30182661  T
Q  394 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctc 484  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || |    
T  30182660 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcac 30182562  T
Q  485 tttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||    
T  30182561 tcaccaaggtgtttgcaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaatcccta 30182499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 293 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 13343232 - 13342971
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||   |||| ||| ||| |    
T  13343232 agattgttcacccagttcggtccaaacatgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt--caaagagatacaaaa 13343136  T
Q  393 gg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattct 481  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||||||||||||||| |    
T  13343135 ggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgatttt 13343037  T
Q  482 ctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    | ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||    
T  13343036 cactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcagag-accctaaacccta 13342971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 188 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 13240025 - 13239674
Alignment:
Q  188 aacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaata 285  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||   ||||||| |    
T  13240025 aacaacaataacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagagaaacaaaca 13239930  T
Q  286 caccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggga 385  Q
    |||||| | |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||    
T  13239929 caccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaatttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaga 13239833  T
Q  386 tgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caagacactcaat 475  Q
    | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||||||||||   ||| ||||||||||       |||||||||||||    
T  13239832 tacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccctaatttctaccattttttccaatctcaccaatgaacaagacactcaat 13239734  T
Q  476 gattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 535  Q
    |||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  13239733 gattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 13239674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 36074024 - 36074302
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  36074024 aaacaaacacaccaa-agattgttcatccagttcggtccaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 36074120  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc----ctttcccaatctcac-------c 463  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||| | | |||| |||||||||||||||||     ||||||||||||||       |    
T  36074121 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcgcaaagaac-aaccctaatttctacccttttttttcccaatctcaccaatgaac 36074218  T
Q  464 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36074219 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36074302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 37439328 - 37439161
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37439328 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 37439231  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  37439230 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 37439161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 213630 - 213465
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  213630 tcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 213533  T
Q  399 aagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||| || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  213532 aagaaattagctttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 213465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 32637088 - 32636824
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  |||| ||||   |||| |||||||||||    | |||||||||   ||||||| ||||||| ||    
T  32637088 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaatcacaagcacaagataaa----gggagggaagagagaaacaaacacaccaa-ag 32636994  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 393  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  32636993 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 32636897  T
Q  394 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  32636896 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 32636824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40147425 - 40147261
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  40147425 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 40147329  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40147328 aagaaattagcttcaacaagctcacgaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40147261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 28278494 - 28278316
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| |    
T  28278494 acaccaaga-attgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagag 28278399  T
Q  385 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28278398 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28278316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 42428427 - 42428598
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  42428427 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 42428523  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | ||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  42428524 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaa-aaaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 42428598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13488365 - 13488203
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  13488365 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 13488269  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  13488268 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 13488203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5058209 - 5058131
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5058209 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5058131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 18 - 65
Target Start/End: Complemental strand, 193336 - 193289
Alignment:
Q  18 acaacaataagagtaattttaaattcaaataaaaccctgactttctaa 65  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193336 acaacaataagagtaattttaaattcaaataaaaccctgactttctaa 193289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 16452266 - 16452003
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  16452266 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatttatctctccaatccactat-gaatgagttctta 16452170  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc-------accaag 466  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||  | ||||||| | ||||||||||||  ||| ||||||||       | ||||    
T  16452169 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcagaaagaacaaa-cttaatttctacccatttttccaatctcatcaatgaacaag 16452072  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaaga 535  Q
    ||||||||||||| || |||  |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16452071 acactcaatgattgtcacttaccaaggtgtttacaatgtttccgaacccaagaga-actctaatcaaaga 16452003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 27637616 - 27637781
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    ||||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  27637616 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctgcaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 27637712  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||| ||  ||||| |||  | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  27637713 caagaaattagtttaaacaagctcataaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 27637781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 304 - 548
Target Start/End: Original strand, 30682930 - 30683178
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag--ttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 400  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||  ||||||| ||||  || ||| | ||||||||    
T  30682930 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtattcttac-aaagaaatacaaaagggttacaa 30683026  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaa 491  Q
    |||||||||||  ||||||||||    ||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||   |||    
T  30683027 gaaattagcttcaacaagttcac----aaagaaccctaatttctaccctttttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcaccaa 30683122  T
Q  492 ggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  30683123 ggtgtttacaatgtttcgcaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 30683178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31183157 - 31182883
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| ||| || | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||| |  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  31183157 aaacaaacacaccaa-agaatgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatagatctctccaatccagtatc-aatgagttctta 31183061  T
Q  377 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagac 468  Q
    | |||||||| |||  ||||||||||||||| |||  ||||  |||| | |||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||       ||||||    
T  31183060 c-aaagggatacaaatggttacaagaaattaacttaaacaaactcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttccaatctcacaaatgaacaagac 31182963  T
Q  469 actcaatgattctctctttac-aaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||| || ||   | ||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  31182962 actcaatgattttcactcacctaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 31182883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 33831866 - 33831590
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  33831866 aaacaaaaacaccaa-agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 33831770  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||| ||||||||||        |||    
T  33831769 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcacaaatgaataag 33831672  T
Q  467 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  33831671 acactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 33831590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 280 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 533952 - 533769
Alignment:
Q  280 caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 379  Q
    |||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  533952 caaagacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-a 533857  T
Q  380 aagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | | || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  533856 aagagatacaaatgggttacaaaaaattagcttcaacaagctcacaaag-accaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 533769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 447
Target Start/End: Original strand, 8565926 - 8566095
Alignment:
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
    |||||||||| |||||||||  ||| | ||| |||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8565926 agaaaacaaacacaccaaga--ttgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggtgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttc 8566021  T
Q  374 ttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||| | |||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||| ||||||||    
T  8566022 ttac-agagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaagttctaccc 8566095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 320 - 465
Target Start/End: Original strand, 13695713 - 13695859
Alignment:
Q  320 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagcttga-caag 417  Q
    |||||||||| ||||||||||| |   ||||| |||||||||| || |||||||||   |||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  13695713 ttgacctactatggaggagagaataatctctctaatccactattaa-tgagttctttacaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttaacaag 13695811  T
Q  418 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13695812 ctcacaaagaacaaaccctaatttgtacccttttcccaatctctccaa 13695859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Original strand, 28750661 - 28750738
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa 381  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28750661 acccaattcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa 28750738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 19806534 - 19806463
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  19806534 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 19806463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 27015687 - 27015609
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||  || | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27015687 tcacccagttcggtccaa-cttgacctattttggaggagagattgatctgtacaatccactatc-aatgagttcttacaaa 27015609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Original strand, 39468546 - 39468714
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||  || ||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||      
T  39468546 agattgttgacccagttcagtccaat-ttaacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaat 39468642  T
Q  393 gg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39468643 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 39468714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 318 - 365
Target Start/End: Original strand, 16640961 - 16641008
Alignment:
Q  318 acttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  16640961 acttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa 16641008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 317 - 465
Target Start/End: Original strand, 42426255 - 42426403
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||| || || ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||  ||    
T  42426255 aacttgacctaatcagggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaac 42426352  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  42426353 aatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 42426403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 538185 - 538028
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 402  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  538185 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 538089  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    |||||||||  ||||| |||| | || | |||| ||||||||||||  ||||||||||||||    
T  538088 aattagcttcaacaagctcacaaagagc-aaccttaatttctacccattttcccaatctcac 538028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 4160762 - 4160702
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 362  Q
    |||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  4160762 acccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat 4160702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 411
Target Start/End: Original strand, 9049354 - 9049455
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaatt 406  Q
    |||||||||| ||| ||||||| ||| ||||| ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||||||||    
T  9049354 ttcggtccaa-cttcacctactttgggggagatattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatggttacaagaaatt 9049450  T
Q  407 agctt 411  Q
    |||||    
T  9049451 agctt 9049455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 365
Target Start/End: Original strand, 3075640 - 3075726
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    ||||||| ||||||||| || | ||||||| || ||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||||||||    
T  3075640 aaacaaacacaccaagaaat-gttcacccaatttggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaattcactatcaa 3075726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 418; Significance: 0; HSPs: 68)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 418; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 3617842 - 3617352
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617842 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaataagaatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 3617743  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  3617742 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagata--caaggagagggaa 3617645  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617644 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 3617545  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617544 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 3617445  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3617444 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3617352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 25637822 - 25637331
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  25637822 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtg 25637723  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagc-aacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637722 tattgtgcaagcaggaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaaacaatcacaagataaacaaggagaggga 25637623  T
Q  271 agaagaaaacaaatacacc-aagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637622 agaagaaaacaaaagcaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 25637523  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25637522 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 25637423  T
Q  469 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  25637422 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagatacccctttg 25637331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 4598299 - 4598788
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4598299 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4598398  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598399 tattgagcaagcaagaaacaataaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4598496  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598497 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 4598596  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 468  Q
    ||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4598597 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 4598696  T
Q  469 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4598697 actcaatgattctctc--tacagggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4598788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 4600520 - 4601009
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  4600520 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagct 4600619  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600620 tattgagcaagccagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaatcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 4600717  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600718 gaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 4600817  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 468  Q
    ||| |||||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4600818 ttctttacaaaaggaatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 4600917  T
Q  469 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  4600918 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 4601009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10211788 - 10211298
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     
T  10211788 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10211689  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211688 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 10211591  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    ||| |||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211590 agatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10211491  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10211490 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10211391  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10211390 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10211298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10209568 - 10209078
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||     
T  10209568 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacagagaataatgatgtgtggagtgacggagagtggtaaccaccaatcaaagc 10209469  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209468 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 10209371  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    ||| |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209370 agatgaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 10209271  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10209270 gttctttacaaaaggactacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 10209171  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10209170 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 10209078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10056612 - 10056122
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10056612 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10056513  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10056512 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10056416  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10056415 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10056316  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10056315 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10056216  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10056215 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10056122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10058834 - 10058344
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10058834 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10058735  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10058734 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10058638  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10058637 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10058538  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10058537 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10058438  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10058437 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10058344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10061056 - 10060566
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10061056 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10060957  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10060956 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10060860  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10060859 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10060760  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10060759 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10060660  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10060659 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10060566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10063278 - 10062788
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10063278 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10063179  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10063178 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10063082  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10063081 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10062982  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10062981 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10062882  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10062881 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10062788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10065500 - 10065010
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10065500 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10065401  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||  ||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10065400 ttattgagcaagcaagaaacaacaaa-caccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaaca--aagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10065304  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10065303 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 10065204  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10065203 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 10065104  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10065103 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctttg 10065010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 45283344 - 45282897
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||||||||||    
T  45283344 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaataatcaacaaaacacc 45283249  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 301  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| |||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||    
T  45283248 acctagatctaatctaggaaactagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaagagattgttc 45283150  T
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa---gggatgcaagaggttac 398  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||| |||||||    
T  45283149 actcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaaaagggatacaaaaggttac 45283050  T
Q  399 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 498  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  45283049 aagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttgcaaggtgttt 45282950  T
Q  499 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45282949 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 45282897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 310; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 124 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 54635462 - 54635039
Alignment:
Q  124 aataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaacc 223  Q
    |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54635462 aataatgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaac 54635364  T
Q  224 aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttg 322  Q
    ||||| |||||||||  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  54635363 aagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttg 54635267  T
Q  323 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcac 422  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635266 acctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacaagttcac 54635168  T
Q  423 tatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 522  Q
     |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635167 aatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagata 54635068  T
Q  523 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  54635067 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 54635039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 102 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6716858 - 6716414
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaac-aaaacac 200  Q
    |||||||||||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||| |||||||    
T  6716858 atcgaaccacaccaatgcaaagagt---gatgtgtggagcaacggaaagcggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaaccaaaacac 6716763  T
Q  201 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||   ||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| |||||||     
T  6716762 cacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaactcaaaaatacaatcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgt 6716665  T
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  6716664 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 6716566  T
Q  400 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716565 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 6716466  T
Q  500 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6716465 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 6716414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 175 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 801376 - 801005
Alignment:
Q  175 tgtgcaagcaagaaacaacaaaacac--cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaag 272  Q
    ||||||||||| || |||||||| ||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||   ||| |  |||||||||||  ||||||||||||    
T  801376 tgtgcaagcaataatcaacaaaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaagtg-gaaaaaca---caata--cacaagataaa--aggagagggaag 801285  T
Q  273 aagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagtt 372  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  801284 aagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatc-aatgagtt 801186  T
Q  373 cttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    |||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  801185 cttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagaca 801087  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  801086 ctcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 801005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 184; E-Value: 3e-99
Query Start/End: Original strand, 106 - 502
Target Start/End: Original strand, 7779821 - 7780208
Alignment:
Q  106 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaa-caccacc 204  Q
    |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || |||||||| || ||||    
T  7779821 aaccacaccaatacgaag--taa-gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaaacagcacc 7779913  T
Q  205 tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaa-cacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 303  Q
    ||||||||||||||||| ||||||  ||| |||||  || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7779914 tagatctaatctaggaaacaagtgaaaaaacacaataca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcac 7780010  T
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaa 403  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||    
T  7780011 ccactttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaggttacaagaa 7780109  T
Q  404 attag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccca 502  Q
    |||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  7780110 attagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcacgaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttccca 7780208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 72 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10067699 - 10067435
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||     
T  10067699 tgttgtgaatccccgaacctccaaggtccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaaccaagc 10067600  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac-aatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  10067599 ttattgagcaagcaagaaacaac-aaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaactaaacacaagataaacaaggagaggg 10067503  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 336  Q
    ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067502 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggagg 10067435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 363 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 10067431 - 10067232
Alignment:
Q  363 caaatgagttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 460  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10067431 caaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 10067332  T
Q  461 accaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctt 560  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10067331 accaagacactcaatgattctctct--acaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaactctagagcttcccctt 10067234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 133; E-Value: 7e-69
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Original strand, 23200020 - 23200398
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 274  Q
    |||||||||| || |||||| | | ||||||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| || ||||||||  ||||||||||||||    
T  23200020 gtgcaagcaataatcaacaataaaacacctagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcataagataaa--aggagagggaagaa 23200116  T
Q  275 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 374  Q
    ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  23200117 gaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttct 23200214  T
Q  375 tacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caa 465  Q
    |||||||  ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||    
T  23200215 tacaaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaa 23200312  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23200313 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23200398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 178 - 551
Target Start/End: Original strand, 23197823 - 23198199
Alignment:
Q  178 gcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag-tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    |||||||| || |||||| | | ||| ||||||||||||||||| |||  ||  ||||||||| || ||| |||||||||||  ||||||| ||||| ||    
T  23197823 gcaagcaataatcaacaataaaacacatagatctaatctaggaaacaaaatgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagagaagagga 23197919  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23197920 aaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttctta 23198017  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac------caaga 467  Q
    |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| ||| ||||||||||||   ||||||||||||||      |||||    
T  23198018 caaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaaaac-aactctaatttctaccatttttcccaatctcaccaagaacaaga 23198115  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23198116 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 23198199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 431 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6718718 - 6718598
Alignment:
Q  431 aaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 530  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6718718 aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatc 6718619  T
Q  531 aaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  6718618 aaagaaccctaaaccctagag 6718598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45095350 - 45095075
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    |||||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45095350 aaacaaatacgccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45095253  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||       |||||    
T  45095252 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaatgaacaaga 45095155  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45095154 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45095075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 9636106 - 9636385
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9636106 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactttggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 9636204  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctc-------accaa 465  Q
    |||||  ||| ||| | ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||       |||||    
T  9636205 caaaa-agatacaaaagggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaatgaccaa 9636302  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | || |||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  9636303 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatatttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 9636385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5258125 - 5258402
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5258125 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5258221  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  5258222 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 5258320  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5258321 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5258402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 462
Target Start/End: Original strand, 19683774 - 19684054
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||||||||  || |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  19683774 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaataaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 19683869  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19683870 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19683967  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  19683968 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 19684054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5260304 - 5260581
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  5260304 aaacaaacacaccaa-agattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactttggagaagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 5260400  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctc-------accaa 465  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||       |||||    
T  5260401 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaccaa 5260499  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  5260500 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 5260581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 5e-42
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37408645 - 37408458
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37408645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgagttctta 37408548  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37408547 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 37408458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7762437 - 7762265
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  7762437 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 7762340  T
Q  393 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  7762339 gagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttctcaatctcaccaa 7762265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 78; E-Value: 5e-36
Query Start/End: Original strand, 179 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 7764747 - 7764476
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |||  || |||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  7764747 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatcttggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaaacaaaagataaa--aggagag--aagagag 7764652  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7764651 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtctaaatttgacctactctggaggagagattcatctctccaatccactatc-aatgagttctta 7764554  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttccc 454  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||| || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  7764553 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttccc 7764476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 293 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 9581454 - 9581193
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||     
T  9581454 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 9581357  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 483  Q
     ||||| |||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||| ||||| |||| |||       ||||||||||||||||| ||     
T  9581356 gggttaaaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccatttccgaatcccacaaatgaacaagacactcaatgattttca 9581258  T
Q  484 ct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  9581257 ctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 9581193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 75; E-Value: 3e-34
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 34491397 - 34491212
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34491397 aacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 34491301  T
Q  378 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34491300 aaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34491212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 70; E-Value: 3e-31
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Original strand, 49199457 - 49199638
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  49199457 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctagtctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 49199554  T
Q  385 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  49199555 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 49199638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 29196368 - 29196555
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  29196368 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 29196464  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  |||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29196465 c-aaagagatacaaatgggttccaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29196555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4570115 - 4569952
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  4570115 acccagttcggtccaaacttcacctactctggagtagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 4570018  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  | ||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4570017 gaaattagcttcaataagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4569952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Original strand, 43401789 - 43401970
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  43401789 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 43401886  T
Q  385 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||  || |   ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43401887 ataaaaaatgcgttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43401970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 462
Target Start/End: Original strand, 39153358 - 39153526
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| |||      
T  39153358 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttctta-taaagggatacaaat 39153454  T
Q  393 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    | ||||||||||||||||||  ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  39153455 gagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaatgaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 39153526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 278 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 40735568 - 40735293
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  40735568 aacaaatacaccaa-agattgctgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 40735472  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
     |||| ||| | ||  |||||||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       |||||    
T  40735471 -aaagagatacaaactggttacaataaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaga 40735374  T
Q  468 cactcaatgattctctc-tttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || | ||| |||||||||| | |||||| | ||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  40735373 cactcaatgattttcacttttccaaggtgtttacaatgtttcctaacccaagaga-actttaatcaaag-accctcaacccta 40735293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 30236304 - 30236129
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  30236304 acaccaagaaattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 30236208  T
Q  385 atgcaag-aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 461  Q
    || |||  ||||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  30236207 atacaaataggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctca 30236129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 289 - 380
Target Start/End: Original strand, 43403736 - 43403826
Alignment:
Q  289 caagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43403736 caagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 43403826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 16499215 - 16499115
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16499215 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16499119  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  16499118 caaa 16499115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40734669 - 40734498
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||      
T  40734669 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 40734573  T
Q  393 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | ||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40734572 gtgttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40734498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 41819526 - 41819691
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    |||||||||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  41819526 tcacccagtttggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatgtctccaatccactat--aatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 41819622  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||| |||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  41819623 caagaaattagcttagacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 41819691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44331716 - 44331545
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| |||      
T  44331716 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-taagttcttacaaa-gagatacaaat 44331620  T
Q  393 gg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || ||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  44331619 ggcttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaacaa-ccctaatttctacccattttcctaatctcaccaa 44331545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 761033 - 760757
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||||| ||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  761033 aaacaaacacaccaa-agattgttaacccatttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 760937  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  760936 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaga-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaag 760839  T
Q  467 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||||||||   ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  760838 acactcaatgattttcactcatccaaggtgtttataatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 760757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 304 - 462
Target Start/End: Original strand, 22835010 - 22835167
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 402  Q
    |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  22835010 ccagttcggtccaa-cttgacctaatatggcggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaga 22835106  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  22835107 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 22835167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 6095603 - 6095681
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6095603 tcacacagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 6095681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 29813234 - 29813083
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| | ||||| | ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||     
T  29813234 agattgttgacccagttcggtccaa-catgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagagatgcaaat 29813138  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
     |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  29813137 gggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 29813083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 40913472 - 40913379
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40913472 acaccaagagattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttacaaa 40913379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 51398999 - 51398833
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||    ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51398999 aacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagataaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttac 51398903  T
Q  378 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    ||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  51398902 aaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcactaagaac-aaccctaatttctaccc 51398833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 277 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 31314631 - 31314447
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31314631 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagatattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 31314535  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 463  Q
    |||||  ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  31314534 caaaa-agatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagatcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcacc 31314447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 54593868 - 54593790
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  54593868 tcacccagtttggtccaa-cttgacatactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 54593790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 44700476 - 44700646
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag- 391  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||      
T  44700476 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatgtgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaa-gagatacaaat 44700571  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44700572 aggttacaagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44700646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 5236440 - 5236624
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||||    
T  5236440 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagtttggtccaaa-ttgacctaatctgg-ggaaagattgatctctcgaatccattatcaa-tgagttcttac 5236535  T
Q  378 aaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||| | ||| |||  || |||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  5236536 aaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 5236624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 293 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29682530 - 29682269
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||     
T  29682530 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgatctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaat 29682434  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctc 482  Q
     ||| |||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| ||    
T  29682433 gggtgacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cataatttctacccattttcccaatctcacaaataaacaagacactcaatgattttc 29682335  T
Q  483 tct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
     ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  29682334 actcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-acccttaacccta 29682269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 32744418 - 32744684
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||   |||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  32744418 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggatagatttatctcttcaatccactatcaaa-gagttctta 32744514  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacactca 473  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  |||  |||||||| ||| | |||||    
T  32744515 caaa-gtgatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa--ctaatttctacccattttttcaatctca-caaaatactca 32744610  T
Q  474 atgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||| || ||   ||| |||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  32744611 atgattttcactcaccaatgtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 32744684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 308 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 46860631 - 46860474
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaatt 406  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | ||  ||||||||||||||    
T  46860631 ttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattac-aaagagatacaaatgggttacaagaaatt 46860534  T
Q  407 agctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  46860533 agcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 46860474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 304 - 465
Target Start/End: Original strand, 53921511 - 53921671
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 402  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| || ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  | |||||||||    
T  53921511 ccagttcggtc-aaacttgatctactccgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-tgatacaaatgagttacaaga 53921607  T
Q  403 aattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||| || ||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  53921608 aattagctttaacaagctcacaaacaacaaa-cctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 53921671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 285 - 446
Target Start/End: Complemental strand, 46173536 - 46173377
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| | | | |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |    
T  46173536 acaccaagaaattgttgatctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttac-aaagag 46173440  T
Q  385 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  46173439 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 46173377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 317 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 29811016 - 29810889
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  29811016 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 29810919  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctac 445  Q
    |||||||| | |||| ||| |||||||||||    
T  29810918 aagttcacaaagaac-aactctaatttctac 29810889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Original strand, 9666448 - 9666616
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  9666448 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-ctttacctaatctgggggagagatcaatctctccaatccactatcaaa-gaattctta 9666544  T
Q  377 caaa-agggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||| ||| ||  | || ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||    
T  9666545 caaagaggtataaatga-gttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaatctaatttctaccc 9666616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 285 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 47304430 - 47304340
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    ||||||| | |||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  47304430 acaccaataaattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 47304340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 55301975 - 55302054
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||| ||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  55301975 tcaccaagttcggtccaacaatgacctactatggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 55302054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 305 - 364
Target Start/End: Original strand, 27305719 - 27305777
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatca 364  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  27305719 cagttcggtccaaa-ttgacctactttggaggagagattgatctctccaatccactatca 27305777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 32891264 - 32891105
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 402  Q
    |||||||||||||| | |||||||||| || |||||||||   |||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||| |||  | |||||||||    
T  32891264 ccagttcggtccaa-catgacctactccgggggagagatttatctctccaatccactatcaac-gagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaaga 32891168  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 463  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  32891167 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctacccattttctcaatctcacc 32891105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 460
Target Start/End: Original strand, 4055745 - 4055926
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctac-tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag-ttct 374  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||   |||||||| ||||| |||||||  |  |||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  4055745 aaacaaatacaccaaga-tttggttacccagttcggcccaacaatgacctacatctgggggagaga--gatctcttcaatccactatc-aatgagtttct 4055840  T
Q  375 tacaaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 460  Q
    ||| |||| ||| |  ||||||||||||||||||| | || |||||||| | | ||||||  |||||||||||||| ||||||||||||    
T  4055841 tac-aaagagatacaaaagaggttacaagaaattaacttttacaagttctccaagaacaa--cctaatttctacccatttcccaatctc 4055926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 23391891 - 23391991
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||| ||||||||||||||| ||||||||     
T  23391891 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagatttatctctacaatccactatcaaa-gagttcttg 23391987  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  23391988 caaa 23391991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 393 - 465
Target Start/End: Original strand, 5433971 - 5434046
Alignment:
Q  393 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||  |||||||||||||||    
T  5433971 ggttacaagaaattagctttaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttctcccaatctcaccaa 5434046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Original strand, 2075081 - 2075143
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||||||  ||||| |||||||||||||    
T  2075081 acccagttcgatccaa-cttgacctactctcggggagagattgatctctcaaatccactatcaa 2075143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 414; Significance: 0; HSPs: 67)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 414; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 69 - 562
Target Start/End: Original strand, 18388533 - 18389024
Alignment:
Q  69 tcctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaa 168  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388533 tcctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaa 18388632  T
Q  169 gtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagg 268  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||    
T  18388633 gtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaagagagg 18388730  T
Q  269 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 367  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388731 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 18388830  T
Q  368 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388831 gagttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 18388930  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18388931 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18389024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 18391972 - 18392460
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18391972 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacagagagtggtaaccaccgaacaaagtt 18392071  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18392072 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 18392169  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392170 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 18392269  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392270 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 18392369  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18392370 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 18392460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 70 - 562
Target Start/End: Original strand, 32060096 - 32060590
Alignment:
Q  70 cctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 169  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060096 cctgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 32060195  T
Q  170 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  32060196 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--gg 32060293  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060294 aagaagaaaacaataaacacaaagagattgttcaccaagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 32060393  T
Q  369 agttctt-acaaaa--gggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||| ||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32060394 agttctttacaaaaaggggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 32060493  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  32060494 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttaccctttg 32060590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 6594334 - 6594822
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6594334 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6594433  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  6594434 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaag--gagggaa 6594531  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594532 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6594631  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594632 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6594731  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6594732 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6594822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 399; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 6592116 - 6592604
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6592116 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6592215  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  6592216 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagaaaaacaag--gagggaa 6592313  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592314 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6592413  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6592414 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccatttcccaatctcaccaagaca 6592513  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6592514 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 6592604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 102 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 20344254 - 20343811
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   |||||||||| || | |||||| |||    
T  20344254 atcgaaccacaccaatgcaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcgacaaaaaacc 20344161  T
Q  202 a---cctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagatt 297  Q
    |   ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  20344160 agcacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagatt 20344064  T
Q  298 ggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggtta 397  Q
    | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20344063 gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatacaaaaggtta 20343965  T
Q  398 caagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 497  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343964 caagaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtt 20343865  T
Q  498 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20343864 tcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20343811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 284; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 71 - 386
Target Start/End: Original strand, 1560440 - 1560755
Alignment:
Q  71 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1560440 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagt 1560539  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560540 atattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 1560639  T
Q  271 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1560640 agaagaaaacaaatacaccaagagattggttacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 1560739  T
Q  371 ttcttacaaaagggat 386  Q
    ||||||||||||||||    
T  1560740 ttcttacaaaagggat 1560755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 230 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 24790074 - 24789755
Alignment:
Q  230 gaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaa-caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctac 328  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24790074 gaaacacaatgca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctac 24789978  T
Q  329 tctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatga 427  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  24789977 tctggaggagagatagtactctccaatccactatcaaa-gagtttttacaaaagggatacaaaatgttacaagaaattagctttgacaagttcacaatga 24789879  T
Q  428 acaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 527  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24789878 acaaaccctaatttttacccttttcccaatcttaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactcta 24789779  T
Q  528 atcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  24789778 atcaaagaaccctaaaccctagag 24789755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 172; E-Value: 4e-92
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 43503991 - 43504409
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||||||   || |||||||||||||||||| ||| |    
T  43503991 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccacc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaaa--cagctagatctaatctaggaatcaaag 43504086  T
Q  227 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 326  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  43504087 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcgatccaaacttgacct 43504183  T
Q  327 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaagttcact 423  Q
    ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  |||||||||||||     
T  43504184 actatggaggagagattgaactctccaattcactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcaca 43504282  T
Q  424 atgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagata 522  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||| ||||||||      
T  43504283 atgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcgatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaagccaagagaag 43504381  T
Q  523 ctctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||    
T  43504382 ctctaatcaaag-actctaaaccctagag 43504409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 39731656 - 39731283
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  39731656 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 39731560  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  39731559 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 39731462  T
Q  374 ttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagct-tgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacact 471  Q
    ||||||||| ||| ||| || ||||||||||||||| | |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  39731461 ttacaaaagagatacaaaagagttacaagaaattagatctgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccaatctcaccaagacact 39731363  T
Q  472 caatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39731362 caatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 39731283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 8e-81
Query Start/End: Original strand, 395 - 562
Target Start/End: Original strand, 1562103 - 1562268
Alignment:
Q  395 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggt 494  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  1562103 ttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggt 1562200  T
Q  495 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1562201 gtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 1562268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 6e-57
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 35854102 - 35853825
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35854102 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 35854004  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  35854003 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 35853906  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  35853905 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actcaaatcaaag-accctaaacccta 35853825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 4e-52
Query Start/End: Original strand, 277 - 551
Target Start/End: Original strand, 25766940 - 25767215
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  25766940 aaacaaacacaccaagagattgttcacccagttcggtctaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 25767037  T
Q  377 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctc----accaagac 468  Q
    |||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||| ||||||||    | ||||||    
T  25767038 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatctcaatgaacaagac 25767136  T
Q  469 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25767137 actcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgttt---cccaaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 25767215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 29991240 - 29990965
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  29991240 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttatta 29991143  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
      |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| |  ||| |||||||||||||| || ||||||||||||||       |||||    
T  29991142 -gaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaataac-aaccctaatttctatccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 29991045  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  29991044 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 29990965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 48408992 - 48408709
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||| ||     
T  48408992 aaacaaacacaccaagaaattgttcacccagttcggtctaaacttgacatactctggaggagagattaaactctccaatccactatc-aatgagttattt 48408894  T
Q  377 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    |||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||  ||||||||||||  ||||||||||||||       |||    
T  48408893 caaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagtttacaaagaac-aacattaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaa 48408795  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48408794 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaaactctaatcaaag-accctaaaccctagag 48408709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 179 - 535
Target Start/End: Complemental strand, 25616137 - 25615785
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaacc-aagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||  || |||||| | |||| |||||||||||      ||| ||||||||    
T  25616137 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcgaagtgaaaagcacaaaaccacaagcacaagataaa------gagagaagaaga 25616044  T
Q  277 ---aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
       ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  25616043 gagaaacaaacacaccaa-agattgttcgcccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttc 25615946  T
Q  374 ttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaagacac 470  Q
    ||||||||  ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||  |||   ||||||| ||||||||||||||  |||||||||||   ||||||||    
T  25615945 ttacaaaa-tgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagcgcacatagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatct---caagacac 25615851  T
Q  471 tcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 535  Q
    ||||||||| |||||    |||||||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  25615850 tcaatgattttctctcacccaaggtgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 25615785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 179 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23555323 - 23555039
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| ||   ||||||||  | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  23555323 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtaaaaaacacaataccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 23555228  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23555227 aaacaaacacatcaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttctta 23555130  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||  || | ||| || ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  23555129 caaagagg-tacaaaagtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaa 23555039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 34310712 - 34310884
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||      
T  34310712 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaat 34310809  T
Q  393 g-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | ||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  34310810 gtgttacaagaaattagcttcaacaatttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 34310884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 19502365 - 19502088
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19502365 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccacttcgttccaaacttgacttactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 19502268  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||| ||||||||| ||   |||| |||||||||       |||    
T  19502267 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaaaaac-aaccttaatttctaaccttttttcgcaatctcaccactgaacaa 19502170  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||||||| ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  19502169 gacactcaatgattctcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 19502088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 22270158 - 22269973
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  22270158 aacaaacacaccaagagat-gttcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatcagttcttac 22270062  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  22270061 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 22269973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 41317416 - 41317602
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41317416 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41317512  T
Q  377 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||||||| |||  || ||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  41317513 c-aaagggatacaaatggattacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 41317602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 180 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 4179054 - 4178685
Alignment:
Q  180 aagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaa 277  Q
    |||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| || || |||||  |||||||  ||||   |    
T  4179054 aagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaacca-caagcaaaatataaa--aggagag--aagagaga 4178960  T
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||| |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||||      
T  4178959 aacaaacacaccaa-agattgttcacctagtttggttcaaacttgacctgctctggaggagagattgaactgttcaatccactatc-aatgagttctt-- 4178864  T
Q  378 aaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
     |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||  ||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||||    
T  4178863 caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttcccaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccttttttcccaatctcaccaatgaacaaga 4178765  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  4178764 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 4178685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 14069817 - 14070001
Alignment:
Q  279 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 378  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14069817 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14069912  T
Q  379 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14069913 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14070001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 66; E-Value: 7e-29
Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 14379845 - 14380029
Alignment:
Q  279 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 378  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  14379845 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 14379940  T
Q  379 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  14379941 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 14380029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27348081 - 27347817
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||    | ||| |||||    |||||| ||||||| ||    
T  27348081 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa----gtgagagaagagaggaacaaacacaccaa-ag 27347987  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 393  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  27347986 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgg 27347890  T
Q  394 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| || ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27347889 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27347817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 8359319 - 8359485
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  8359319 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 8359416  T
Q  398 caagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||| || | |||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  8359417 caagaaattagtttaaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctccccaa 8359485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 41648993 - 41649158
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  41648993 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 41649089  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    | |||||||| | ||  ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  41649090 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagctaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacc 41649158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 2390461 - 2390301
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    |||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| | ||||||| |||| |||| |    
T  2390461 acaccaagagattattcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-atatgagttattac-aaagag 2390365  T
Q  385 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  2390364 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 2390301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29608901 - 29608737
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  29608901 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagtgattgatatctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 29608805  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29608804 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29608737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 304 - 465
Target Start/End: Original strand, 30024740 - 30024900
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 402  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  30024740 ccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagtgattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaaga 30024836  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30024837 aattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30024900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 32358058 - 32358136
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32358058 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 32358136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 301 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 6432134 - 6431971
Alignment:
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttaca 399  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||    
T  6432134 cacccagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttaca 6432038  T
Q  400 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  6432037 agaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctacccattttcccaatctaaccaa 6431971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 48491727 - 48491579
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  48491727 aacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctttc-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 48491630  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48491629 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48491579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18126829 - 18126644
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  18126829 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaggtcggtc-aaacttgacctagtctgggggagagattgattcctccaatccactatc-aatgagttcttac 18126733  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagcttg-acaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||| |||||||||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  18126732 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttgaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacacatttttccaatctcaccaa 18126644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3259159 - 3258995
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||| |||  | |||||    
T  3259159 tcacccagttcggttcaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaatgagttac 3259063  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || ||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  3259062 aataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 3258995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 128 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 24790333 - 24790230
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 227  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||     ||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  24790333 atgatgtgtggagcaacggaaagtggtaaccaccaaacaaagtgc---gtgcaagtaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaggt 24790237  T
Q  228 gtgaaac 234  Q
    | |||||    
T  24790236 gagaaac 24790230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 48599338 - 48599502
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||| | |||| ||| |||  | |||||    
T  48599338 tcacccagttcggtccaa-cttgatctgctctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagctctt-ccaaagagatacaaatgagttac 48599434  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48599435 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatatcaccaa 48599502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8153513 - 8153342
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | ||||||||| |||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| | ||| |||      
T  8153513 agattgttgacccagttcagtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttattacaaa-gagatacaaat 8153417  T
Q  393 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||||||||||||||| |||||||  |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  8153416 gagttacaagaaattagctttgacaatctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 8153342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Original strand, 2360978 - 2361140
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||| ||||| ||||||||||   |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  2360978 acccagttcggttcaa-cttgacctaatctgggggagagattgatatctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 2361074  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2361075 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 2361140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 4253510 - 4253697
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||||| || | | ||| ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||  ||||| |||||| |||||| |||||||||     
T  4253510 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacctagttcggtccaaa-ttgacctactctgtgggagagattgatctctctaatccattatcaa-tgagttcttt 4253606  T
Q  377 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| |||  || ||| ||||| ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||    
T  4253607 ccaaagagatataaaagggttacatgaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttctaccattttaccaatttcaccaa 4253697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 43864406 - 43864244
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||| |||| |||| ||| | ||  |||||||     
T  43864406 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggagagagattgatctctccaatccactatc-aattagtttttac-aaagagatacaaatgggttacag 43864310  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  43864309 gaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccacttttccaatctcaccaa 43864244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 48489616 - 48489431
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||| || |    
T  48489616 aacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttattgc 48489520  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||  | | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  48489519 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttttcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 48489431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 4508710 - 4508874
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  4508710 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctgaagaagagattgatctctccaatccactctc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 4508806  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  | ||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  4508807 aagaaattagcttcaataagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 4508874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 447
Target Start/End: Original strand, 31732966 - 31733118
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  31732966 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccagtatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 31733062  T
Q  392 aggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
     ||||||||||||||||||| | |||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  31733063 gggttacaagaaattagcttcaccaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 31733118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 535
Target Start/End: Original strand, 47673953 - 47674189
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 403  Q
    ||||||||||||| |||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  47673953 cagttcggtccaa-cttgacttaatatgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 47674048  T
Q  404 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaagg 493  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||    
T  47674049 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaagg 47674147  T
Q  494 tgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaaga 535  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  47674148 tgtttacaatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaaga 47674189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 36146390 - 36146576
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  36146390 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttctta 36146486  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  |||||| ||||||||||||  ||||| |||| |  ||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36146487 c-aaagagatacaaatgggttac-agaaattagcttcaacaagctcacaaataacaaactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36146576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4586323 - 4586161
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggat-gcaagaggttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||   ||  ||||||||    
T  4586323 acccagttcggtccaag-ttgacataatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaatgggttacaa 4586227  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     ||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4586226 aaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4586161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26417501 - 26417316
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||||| |||| | |||||||| |||||||  ||||||||  |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  26417501 aacaaacacaccaagaaattgttgacccagtttggtccaat-ttgacctaacctgg-ggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 26417405  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||| |||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26417404 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26417316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 47676119 - 47676304
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||||| | |||||||||||    
T  47676119 aacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccattccactatc-attgagttcttac 47676215  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||| ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  47676216 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaaattcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 47676304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 38671204 - 38671480
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||| |||||   |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  38671204 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctattttgggggatagatttatctcttcaatccactatcaa-tgagttctta 38671300  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||| |||||||||| | |||| |||| | |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  38671301 caaa-gtgatacaaatgtgttacaataaattagcttaaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaag 38671398  T
Q  467 acactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  38671399 acactcaatgattttcgctcacccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 38671480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 304 - 446
Target Start/End: Original strand, 23565069 - 23565210
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 402  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||    
T  23565069 ccagttcagtccaa-cttgacctactctaggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagagttacaaga 23565165  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    |||||| ||  ||||| |||| | ||||||  |||||||||||||    
T  23565166 aattagtttcaacaagctcacaaagaacaagacctaatttctacc 23565210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 24525484 - 24525584
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||  | ||||||||| |||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24525484 aaacaaacacaccaa-agattattgacccagttccgtccaa-cttgacctaatcttggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 24525580  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  24525581 caaa 24525584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 31519063 - 31518988
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggag-gagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  31519063 ccagttcggtccaa-cttgacctactctggggagagagattgatctctccaatccactgtc-aatgagttcttacaaa 31518988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 462
Target Start/End: Original strand, 495965 - 496148
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||| |||| |||||| ||||||||||| | | ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  495965 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccggttctgtccaa-cttgacctactataggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 496061  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
      |||| ||| | ||  |||| ||||||||||||||  ||||| |||| | ||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  496062 -taaagagatacaaatgggttgcaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-taccctaatttctacccattttcccaatctcac 496148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 1113843 - 1113743
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || || ||||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  1113843 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcaattcggtc-aaacttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatctactatc-aatgagttctta 1113747  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  1113746 caaa 1113743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Original strand, 6359941 - 6360034
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||| ||||| ||||||||| | ||| | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  6359941 acaccaagaaattgttgacccagttcgatccaa-cttgacctaatatggggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 6360034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 18396481 - 18396418
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||||||||   |||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||    
T  18396481 acccagttcggtccaccattgacctactcttgaggagagattgatctctccaatcctctatcaa 18396418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 30814598 - 30814536
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  30814598 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 30814536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 381
Target Start/End: Original strand, 31105399 - 31105476
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa 381  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||   ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  31105399 acccagttcggtccaa-cttgatctactcttggggagagatttatctctccaatccaccatc-aatgagttcttacaaaa 31105476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 306 - 380
Target Start/End: Original strand, 2759207 - 2759279
Alignment:
Q  306 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2759207 agttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagattgatatctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 2759279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 23344048 - 23343975
Alignment:
Q  393 ggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| |||| | ||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  23344048 ggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaataaaccttaatttctacccttttccaaatctcaccaa 23343975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 394 - 465
Target Start/End: Original strand, 24525992 - 24526065
Alignment:
Q  394 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  24525992 gttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 24526065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 4510552 - 4510626
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4510552 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta 4510626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 376
Target Start/End: Original strand, 4512394 - 4512468
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  4512394 tcacccagtacggtccaa-cttgacctactctacaggagagattgatttcttcaatccactatc-aatgagttctta 4512468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 361
Target Start/End: Original strand, 12097849 - 12097931
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccacta 361  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||   |||||||||||||||    
T  12097849 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattcatctctccaatccacta 12097931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 444
Target Start/End: Original strand, 22328395 - 22328538
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||| ||| |   |||| ||| ||| || |||||||    
T  22328395 acccagttcggtccaacaatgacctactctaggggagagattgatctctcaaatccactat-taatgacttccttgcaaagagatacaaaagagttacaa 22328493  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 444  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||| ||||||||||    
T  22328494 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaactctaatttcta 22328538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 463 - 548
Target Start/End: Original strand, 24514934 - 24515018
Alignment:
Q  463 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  24514934 caagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 24515018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 412; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 412; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 44204025 - 44203536
Alignment:
Q  71 ctgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  44204025 ctgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagt 44203926  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  44203925 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 44203828  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203827 agaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 44203728  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 468  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203727 gttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagac 44203628  T
Q  469 actcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44203627 actcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 44203536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 102 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 9036774 - 9036320
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||    
T  9036774 atcgaaccacaccaatgcaaaggat---gatgtgtggagctaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt-ttgtgcaagcaacaaacaacaaaacacc 9036679  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtc 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9036678 acctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagca-caatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattgttc 9036580  T
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaag 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  9036579 acccagttcggtccaaacttgacctactctcgaggagagattgtactcttcaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaag 9036481  T
Q  402 aaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 501  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9036480 aaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttccc 9036381  T
Q  502 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9036380 atgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 9036320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 101 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 21054315 - 21053872
Alignment:
Q  101 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 200  Q
    |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||| |||| |   |||||||||| || |||||||||||    
T  21054315 aatcgaaccacaccaatacaagaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaactaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacac 21054220  T
Q  201 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 300  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21054219 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggt 21054123  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| |||    
T  21054122 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttgcaa 21054024  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 499  Q
    |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||    
T  21054023 gaaattagatttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacacttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttttctctacaaggtgtttc 21053924  T
Q  500 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21053923 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 21053872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 40282711 - 40282291
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaa-caaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaag 226  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| || |||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  40282711 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaag 40282613  T
Q  227 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 326  Q
    || |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40282612 tgagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 40282516  T
Q  327 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  40282515 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagattagacaagttcacaat 40282417  T
Q  426 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 525  Q
    |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40282416 gaactaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 40282317  T
Q  526 taatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  40282316 taatcaaagaaccctaaaccctagag 40282291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 101 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 9987559 - 9987116
Alignment:
Q  101 aatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacac 200  Q
    ||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||| | ||||||||||||||||| | |||||| |   |||||||||| || |||||||||||    
T  9987559 aatcgaaccacaccaatacgaaaaata-tgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaatcaaagtgt---gtgcaagcaataatcaacaaaacac 9987464  T
Q  201 cacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattgg 299  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |  || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||     
T  9987463 cacctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacactataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgt 9987367  T
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||    
T  9987366 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa-tgagttcttgcaaaagggatacaaaaggttgca 9987268  T
Q  400 agaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgttt 498  Q
    ||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  9987267 agaaattagattagacaagttcacaatgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgttt 9987169  T
Q  499 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9987168 cccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 9987116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Original strand, 20622072 - 20622492
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 227  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||||||| | | |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20622072 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagt 20622170  T
Q  228 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgaccta 327  Q
    | |||||||||  || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622171 gagaaacacaataca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgaccta 20622267  T
Q  328 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaa--gggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcacta 424  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |    
T  20622268 ctctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaa 20622366  T
Q  425 tgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 524  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20622367 tgaacaa-ccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacagtcaatgattttccctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatact 20622465  T
Q  525 ctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  20622466 ctaatcaaagaaccctaaaccctagag 20622492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 51765684 - 51765302
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  51765684 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 51765588  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  51765587 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgtcctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 51765490  T
Q  374 ttacaaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------ 462  Q
    ||||||||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |    ||||||||||||||||| ||  ||||||||  ||          
T  51765489 ttacaaaagagatacaaaaggggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaaggtacaaccctaatttctacccttttctcccaatcaaaccaagaa 51765390  T
Q  463 caagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | |||||| ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  51765389 caagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 51765302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 179 - 462
Target Start/End: Original strand, 8550670 - 8550952
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga-ag 275  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||||||   |||| ||||||||||| |  |||| | |||| ||    
T  8550670 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaatcacaagcacaagataaaga--gagaag-aagagag 8550766  T
Q  276 aaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 375  Q
    |||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8550767 aaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctt 8550864  T
Q  376 acaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    || |||||||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  8550865 ac-aaagggatacaaatgagttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 8550952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 293 - 466
Target Start/End: Original strand, 13316348 - 13316521
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| ||| ||| |    
T  13316348 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt-ccaaagagatacaaaa 13316445  T
Q  393 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaag 466  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  13316446 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaag 13316521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 20762859 - 20762582
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20762859 aaacaaacacaccaa-agattggtcacctagttcggtccaaacttgacctactctgtaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 20762762  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    |  ||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   |||| |||||||||       |||    
T  20762761 c-gaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttctcaatctcaccaatgaacaa 20762664  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    || ||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  20762663 gatactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 20762582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3189517 - 3189330
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3189517 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3189420  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3189419 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3189330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3198334 - 3198147
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3198334 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3198237  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3198236 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3198147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 3207173 - 3206986
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3207173 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3207076  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||  ||| ||| || |||||| |||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| |||||||||||    
T  3207075 caaaa-agatacaaaagagttacaggaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaa 3206986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 7e-32
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 37168462 - 37168297
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  37168462 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 37168366  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37168365 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37168297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Original strand, 42297963 - 42298143
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  42297963 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 42298060  T
Q  385 atgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  42298061 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 42298143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 3e-28
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 13547093 - 13547257
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  13547093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 13547189  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||| ||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13547190 aagaaaatagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13547257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 28220210 - 28220394
Alignment:
Q  279 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 378  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28220210 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28220305  T
Q  379 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||||    
T  28220306 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttccgaatctcaccaa 28220394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 37033068 - 37033241
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| |||||||||||||||||| | ||||||||| ||||| |||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |    
T  37033068 agattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactatggagaagagattaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatgcaaaa 37033165  T
Q  393 --ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
      | |||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37033166 tggattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 37033241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 462
Target Start/End: Original strand, 834149 - 834332
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  834149 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 834245  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcac 462  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||| ||  ||||||||||||||    
T  834246 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcac 834332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 13549004 - 13549168
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  13549004 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 13549100  T
Q  399 aagaaatta-gcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | ||||||| | || ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13549101 atgaaattaggtttaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 13549168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29136412 - 29136247
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||  || | ||  |||| |    
T  29136412 tcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccacgatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaatgggttcc 29136315  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29136314 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29136247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 47255343 - 47255508
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  47255343 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 47255440  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  47255441 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 47255508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 278 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 3157050 - 3156776
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3157050 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 3156954  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| |||||||||       |||||    
T  3156953 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaatgaacaaga 3156856  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   || ||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  3156855 cactcaatgattttcactcaccagggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 3156776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 4552619 - 4552805
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||    
T  4552619 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctgagggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctta 4552715  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||||||| | ||| |||||||||||||||||||  ||||| |||| | | ||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  4552716 c-aaagggatacaaaggggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaggacaaa-cctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 4552805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 28265536 - 28265702
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28265536 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 28265632  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28265633 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 28265702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 7482234 - 7482399
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  7482234 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgaaggagagattgatctctccaattcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 7482330  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  7482331 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttacccaatctcaccaa 7482399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 44455322 - 44455160
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||  | |||||||    
T  44455322 acccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaa-agatacaaatgagttacaa 44455226  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  44455225 gaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 44455160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11348862 - 11348698
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||| | ||  ||||||    
T  11348862 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta-gaaagagatacaaatgggttac 11348766  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11348765 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 11348698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 13659318 - 13659418
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13659318 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 13659414  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  13659415 caaa 13659418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 37503540 - 37503722
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||| ||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  37503540 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcgatccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 37503636  T
Q  378 aaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| ||  ||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  37503637 -aaagagataca--aggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 37503722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 49918535 - 49918350
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  49918535 aacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 49918439  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  49918438 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 49918350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Original strand, 31925711 - 31925856
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  31925711 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 31925807  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||||||    
T  31925808 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-atccctaatttctaccc 31925856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 47115337 - 47115171
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||| ||| |||| |||| ||| ||| |  |||||    
T  47115337 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggagcagagattgatctctccaatccactatc-aatgggtttttac-aaagagatacaaaatgggtta 47115240  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  47115239 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccaattttcccaatctcaccaa 47115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 279 - 465
Target Start/End: Original strand, 28223405 - 28223589
Alignment:
Q  279 acaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttaca 378  Q
    ||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  28223405 acaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac- 28223500  T
Q  379 aaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||  | || | |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  28223501 aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcagaaagatc-aaccataatttctacccattttcccaatctcaccaa 28223589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 28242469 - 28242391
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  28242469 tcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat--aatgagttcttacaaa 28242391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 45644351 - 45644523
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||      
T  45644351 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 45644447  T
Q  393 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | ||| |||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| | ||||||||| ||  |||| ||||||||||||    
T  45644448 gagttgcaagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacttaatttctatccattttctcaatctcaccaa 45644523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 46065104 - 46065004
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  46065104 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcgatccaa-cttgacctactctgggggagagattgatctctccaatccactat-gaatgagttctta 46065008  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  46065007 caaa 46065004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 50169192 - 50169378
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | | |||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||| ||||    
T  50169192 aaacaaacacaccaa-agattgttgatccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagtactta 50169288  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| | ||| |||  | |||||||||||||||| |||||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  50169289 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 50169378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 301 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 34603740 - 34603595
Alignment:
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttac 398  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||| |||  || |  ||||||    
T  34603740 cacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccaccatc-aatgagttcttac-aaagagataaaaaatgggttac 34603644  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34603643 aagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34603595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 193775 - 193697
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  193775 tcacccagttcggtccaa-cttgacatactctggagaagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttattacaaa 193697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19754657 - 19754494
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 400  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  19754657 acccacttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatcggttacaa 19754561  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||   |||| ||||||||||||    
T  19754560 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttctcaatctcaccaa 19754494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 465
Target Start/End: Original strand, 23555286 - 23555433
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-c 414  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||| |||||||||| || | |    
T  23555286 aacttgacctactatgg-ggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttataagaaattagtttcaac 23555382  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||| | |||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  23555383 aagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 23555433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 31659409 - 31659238
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | ||     
T  31659409 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgagggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttcttac-aaagagatacaaat 31659313  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| | |||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  31659312 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-agccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 31659238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 50167157 - 50167343
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||| ||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  50167157 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgagctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttttta 50167253  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |  ||| |||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  50167254 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaataac-aaccctaatttctactaattttcccaatctcaccaa 50167343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 320 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 1833667 - 1833522
Alignment:
Q  320 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttgacaag- 417  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| |||  | |||||||||| ||||||| |  ||     
T  1833667 ttgacctaatctggtggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgagttacaagaatttagcttcaataga 1833570  T
Q  418 ttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  1833569 ttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 1833522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 462
Target Start/End: Original strand, 3847103 - 3847286
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3847103 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccaagttcggtccaa-cttgacctaatctggggaagagatggatctctccaatccactatc-aatgagttctta 3847199  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    | |||||||| | ||  |||||||| || |||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  3847200 c-aaagggatacaaatgggttacaaaaatttagcttaaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcac 3847286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 36683866 - 36683766
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| |||||||||||| | | || |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||   ||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  36683866 aaacaaacacaccaagagat-gtttactcagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgatttctacaatccactatc-aatgagttctta 36683770  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  36683769 caaa 36683766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 37876770 - 37876848
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  37876770 tcacccagttcggttcaa-cttgatgtactctggaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 37876848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 411
Target Start/End: Original strand, 13137973 - 13138089
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | ||||||||||||||||  | |||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||| ||     
T  13137973 agattgttgacccagttcggtccaatat-gacctactctaggggagagattgctctcttcaatccactatc-aatgtgttcttac-aaagagatgcaaat 13138069  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt 411  Q
     |||||||||||||||||||    
T  13138070 gggttacaagaaattagctt 13138089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 304 - 446
Target Start/End: Original strand, 196915 - 197056
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 401  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||||| || ||||||    ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  | ||||||||    
T  196915 ccagttcggtccaa-cttgacctaatctggggggagagataaatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgagttacaag 197011  T
Q  402 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    |||||| |||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||||    
T  197012 aaattaacttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacc 197056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 19752857 - 19752685
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  19752857 agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggagagagattgatctctccaatcctctatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 19752761  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| || | | |||| ||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||    
T  19752760 cggttacaagaaattagcttcaacaagctcgcaaagaac-aaccctaatttctacccattttactcaatctcaccaa 19752685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000008
Query Start/End: Original strand, 321 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 22079461 - 22079322
Alignment:
Q  321 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagt 418  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| || |||||     
T  22079461 tgacctactttggaggagaaattgatctctccaatccaatatc-aatgagttctttacaaagagatacaaaatggttacaagaaattagctttaacaagc 22079363  T
Q  419 tcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 460  Q
    |||| | ||||||| | |||||||||||  ||| ||||||||    
T  22079362 tcacaaagaacaaa-cataatttctaccatttttccaatctc 22079322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 444
Target Start/End: Original strand, 927982 - 928123
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaa 400  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||  ||| | |||| |||  ||||| |||||||||| || |||||| ||||||| | ||| ||| ||| ||||||    
T  927982 acccagttcggtctaa-cttgacctaccttggggaagaggttggtctctctaatccactattaa-tgagtttttacaaa-gagatccaaaagggttacaa 928078  T
Q  401 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttcta 444  Q
    ||||||||||| | |||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  928079 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttcta 928123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 317 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 15820455 - 15820326
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||   |||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||| ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||    
T  15820455 aacttgacctactctggatgagagatttatctcttcaatgcactatc-aatgagttctta-aaaagagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaac 15820358  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    ||| |||| | ||||||| |||||||| |||||    
T  15820357 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttttaccc 15820326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 389 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 32737009 - 32736952
Alignment:
Q  389 aagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||| |||||||||| | |||||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  32737009 aagaggttacaaaaaattagcttaa-aagttcataaagaacaaaccctaatttctaccc 32736952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 306 - 446
Target Start/End: Original strand, 37282701 - 37282841
Alignment:
Q  306 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaa 404  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||   ||||||||||   ||||||||||||||| | |||||||||||   |||| ||||||| | |||||| | |||    
T  37282701 agttcagtccaaa-ttgacctactccaaaggagagatttatctctccaatccacta-ctaatgagttctttacaaagagatgcaaaagggttaccataaa 37282798  T
Q  405 ttagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    |||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||    
T  37282799 ttagcttcaacaagctcacaaggaacaaaccctaatttatacc 37282841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 40122178 - 40122280
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccac--tatcaaatgagttct 374  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| |||||||  ||||||| |||||||    
T  40122178 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatatcaaa-gagttct 40122274  T
Q  375 tacaaa 380  Q
    ||||||    
T  40122275 tacaaa 40122280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 365
Target Start/End: Original strand, 8871074 - 8871130
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||| |||| |||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  8871074 ttcggtccaa-cttggcctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 8871130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 16455807 - 16455709
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||||||||||| || | | || ||||| |||||||  |||||| ||| |||  |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16455807 aaacaaatacaccaagaaat-gtttacacagtttggtccaat-ttgaccgactatgggagagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 16455711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 393 - 460
Target Start/End: Original strand, 12318618 - 12318685
Alignment:
Q  393 ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 460  Q
    |||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  12318618 ggttacaagaaattagcttcaacaagctctccatgaacaaa-cctaatttctacccatttccaaatctc 12318685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 411; Significance: 0; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 411; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 12647162 - 12647650
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647162 tgttgtgaatccccgagcctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 12647261  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  12647262 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 12647359  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647360 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 12647459  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647460 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 12647559  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12647560 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 12647650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 485
Target Start/End: Original strand, 13655805 - 13656220
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  13655805 tgttgtgaatccccggacctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacagagta 13655904  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13655905 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 13656004  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaa-gagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656005 gaagaaaacaacaaacaccaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 13656104  T
Q  370 gttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13656105 gttcttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 13656204  T
Q  470 ctcaatgattctctct 485  Q
    ||||||||||||||||    
T  13656205 ctcaatgattctctct 13656220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 128 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 6267023 - 6266605
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagt 227  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| |   ||| |||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||    
T  6267023 atgatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgtaagcaaaaatcaacaaaacaacacctagatctaatctaggaaagaagt 6266927  T
Q  228 gtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaat-acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacct 326  Q
    |  ||||||||  || ||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6266926 gaaaaacacaataca-caagcacaagataaac--ggagagggaagaagaaaacaaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacct 6266830  T
Q  327 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactat 425  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| ||    
T  6266829 actctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagatttgacaagttcacaat 6266731  T
Q  426 gaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 525  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6266730 gaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctctacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactc 6266631  T
Q  526 taatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  6266630 taatcaaagaaccctaaaccctagag 6266605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 5e-73
Query Start/End: Original strand, 106 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 32289916 - 32289479
Alignment:
Q  106 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacc 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||||     |||||||||| || |||||| |||| ||||    
T  32289916 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaataatcaacaataacaacacc 32289824  T
Q  205 tagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggtca 302  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  ||||||| ||||||| |||    
T  32289823 tagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaggacaccaaagagattgttca 32289727  T
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| || ||||||||    
T  32289726 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctaatttactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaagagttacaag 32289628  T
Q  402 aaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||   |||||||||| |    
T  32289627 aaattagatttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttcta-cccttttccaatctcaccaagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttac 32289530  T
Q  501 catgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||| | |||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  32289529 catgtttccaaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 32289479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Original strand, 4484211 - 4484592
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaag-caacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||  ||||  | |||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  4484211 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaa-gtgaaaagcaaaaaccacaagcacaagataaa--aggagagggaaga 4484307  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
    |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  4484308 agaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttctgtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 4484405  T
Q  374 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------c 463  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||      |    
T  4484406 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatttcaccaagaac 4484504  T
Q  464 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4484505 aagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accctaaaccctagag 4484592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 128; E-Value: 7e-66
Query Start/End: Original strand, 176 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 30833633 - 30833342
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  30833633 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 30833537  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  30833536 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcagtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttc 30833439  T
Q  374 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 467  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  30833438 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 30833342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 177 - 548
Target Start/End: Original strand, 4503017 - 4503390
Alignment:
Q  177 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 274  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  |||||||  ||||     
T  4503017 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--aggagag--aagag 4503111  T
Q  275 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 374  Q
      ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4503112 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttct 4503209  T
Q  375 tacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctc-------acc 463  Q
    |   |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||       | |    
T  4503210 t--caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctctccaatgaac 4503306  T
Q  464 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  4503307 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaagaa-cctaaacccta 4503390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 45099941 - 45099665
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  45099941 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 45099845  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  45099844 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 45099747  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  45099746 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 45099665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 5723237 - 5723512
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5723237 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttaacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 5723334  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| | || |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| || |||||||||||||| |||| |||||||||       |||||    
T  5723335 c-aaagagatacaaaaaggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aagcctaatttctacccttttctcaatctcaccaatgaacaaga 5723432  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  5723433 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accccaaacccta 5723512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 91; E-Value: 8e-44
Query Start/End: Original strand, 179 - 548
Target Start/End: Original strand, 36987961 - 36988333
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||||| |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  36987961 caagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaagccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagag 36988056  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36988057 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36988154  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||| ||| ||| || |||||||||||||||  |||||||| ||||   |||| |||||||||||||||||  ||| |||||| |||       ||||    
T  36988155 c-aaagagatacaaaagagttacaagaaattagttttgacaagctcacatagaac-aaccctaatttctacccttttttccaatcccaccaatgaacaag 36988252  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  36988253 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttactatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 36988333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 3e-43
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 36205646 - 36205921
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||     
T  36205646 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggatagattgaactctccaatccgctgtc-aatgagttctt- 36205742  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcac-------caag 466  Q
      |||| ||| ||| || |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   ||||||||||||||       ||||    
T  36205743 -caaagagatacaaaagagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaatgaacaag 36205840  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| ||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  36205841 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttaccatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 36205921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 533
Target Start/End: Original strand, 2334399 - 2334661
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2334399 aaacaaacacaccaa-agattgttcccccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 2334496  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||| ||| ||| || ||||| ||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||| ||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  2334497 c-aaagagatacaaaagagttactagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aacccttatttctacccattttcccaatctcaccaatgaacaag 2334594  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaa 533  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  2334595 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaa 2334661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 6594987 - 6595154
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6594987 aaacaaacacaccaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6595084  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  6595085 c-aaagagattcaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 6595154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Original strand, 34139752 - 34139920
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34139752 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34139848  T
Q  377 caaaagggatgca-agaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||| || |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  34139849 caaaagggatacatatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 34139920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 45727093 - 45726929
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag-aggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||    
T  45727093 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaataggttac 45726997  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  45726996 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 45726929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 1e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 29868133 - 29867869
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||| |||  |||| |||| | |||| ||||||||||||  ||||||  ||||   ||||||| ||| ||| ||    
T  29868133 aacaacacctagatctaatctagtaatcaaagtgaaaaactcaaaaccacaagcacaagataaac--ggagag--aagagagaaacaaacacatcaa-ag 29868039  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 393  Q
    |||  | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  29868038 attattgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 29867942  T
Q  394 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  29867941 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 29867869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Original strand, 723726 - 723893
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  723726 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 723822  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    | |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  723823 c-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 723893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Original strand, 14633807 - 14633975
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  14633807 aaacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-tatgagttctta 14633903  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| || ||||||||||||||    
T  14633904 caaaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aatcctaatttctaccc 14633975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 35446888 - 35446966
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35446888 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 35446966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36773748 - 36773562
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  36773748 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 36773652  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||| | |||  |||||||||||||||||    
T  36773651 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttattcccattttcccaatctcaccaa 36773562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 38312411 - 38312240
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||| ||| | ||     
T  38312411 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagatcttac-aaagagatacaaat 38312315  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  38312314 gggttacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 38312240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Original strand, 17057352 - 17057451
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17057352 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17057448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Original strand, 17085335 - 17085434
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17085335 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctagtctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 17085431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 317 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 42362500 - 42362262
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  42362500 aacttgacctaatctgggggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaagaaattagcttaaac 42362403  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctct-ttacaaggtgtttcccatgt 505  Q
    ||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||||||||||||||| || ||    |||||||||| | ||||    
T  42362402 aagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcacaaatgaacaagacactcaatgattttcactcacccaaggtgtttacaatgt 42362304  T
Q  506 tt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  42362303 ttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 42362262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Original strand, 1631736 - 1631814
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1631736 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 1631814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 302 - 460
Target Start/End: Complemental strand, 33648335 - 33648176
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||   ||||  || ||| | |||||||     
T  33648335 acccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccgctatc-aatgagttctttacaaagaaatacaaaagggttacag 33648237  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctc 460  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||||||||||||||| ||||  |||| |||||||    
T  33648236 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaatttttaccattttctcaatctc 33648176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 11151573 - 11151759
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  11151573 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagaggttgatctctccaatccactatctaa-gagttctta 11151669  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||||||  |||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  11151670 c-aaagtgatacaaatgggttacaagaaattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-tctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 11151759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 36317991 - 36318091
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36317991 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 36318087  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  36318088 caaa 36318091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 6e-17
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 24398238 - 24398055
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||  |||| ||| ||||||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||   |||| |    
T  24398238 acaccaagtaattgttcagccagttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttctttacaaagag 24398140  T
Q  385 atgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccct--ttcccaatctcaccaa 465  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||| |  ||| ||||||||||||    
T  24398139 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccttaacttctaccctttcttcacaatctcaccaa 24398055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Original strand, 17490154 - 17490261
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| |||||||||||||| |||||||||||||| | | | ||| || |||||||    
T  17490154 acccagttcggtccaaa-ttgacctactctaggggagagattgatctctacaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagttacaaaagagttacaa 17490250  T
Q  401 gaaattagctt 411  Q
    |||||||||||    
T  17490251 gaaattagctt 17490261  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26353346 - 26353184
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||   ||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||| ||| || |||||||    
T  26353346 acccggttcggtccaa-cttgacctactctaagggagagagtgatctctccaatccactatc-aatgagtacttacaaaa-agatacaaaagtgttacaa 26353250  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  ||||  |||| | ||||||||| |||||||||| | |||  ||||||||||||    
T  26353249 gaaattagcttcaacaaactcacaaagaacaaaccttaatttctacacttttttcaatctcaccaa 26353184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11067491 - 11067324
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| ||||||| ||| |||||||||||||    
T  11067491 aaacaaacacaccaa-agattgttgaccgagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccattat-aaatgagttctta 11067395  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| | | || ||| |||||||||||||    
T  11067394 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagctcacaaagtac-aacactaatttctaccc 11067324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 277 - 447
Target Start/End: Original strand, 33162432 - 33162599
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| |||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  33162432 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctta 33162528  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    | | || ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  33162529 c-agagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 33162599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 293 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 39285007 - 39284936
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  39285007 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 39284936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 13121901 - 13121769
Alignment:
Q  331 tggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaac 429  Q
    ||||||||||||||   ||| |||||||||||||| ||||||  |||||| | ||| ||| |||||||||||||||| ||| | |||| |||| | ||||    
T  13121901 tggaggagagattgatttcttcaatccactatcaa-tgagtttctacaaa-gagatacaa-aggttacaagaaattatcttcaacaagctcacaaagaac 13121805  T
Q  430 aaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  13121804 aaaccctaatttctaccattttcccagtctcaccaa 13121769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 304 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 11690661 - 11690504
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 402  Q
    |||||||||||||| |||||| || | ||| |||||| |||  ||||||||||||||||| || || ||||||| |||||||| | ||  ||||||||||    
T  11690661 ccagttcggtccaa-cttgacgtaatatgggggagaggttgatctctccaatccactatc-aacgatttcttac-aaagggatacaaatgggttacaaga 11690565  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  11690564 aattagcttaaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 11690504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 17450748 - 17450678
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  17450748 agattgttcacctagttcggtccaa-cttgacctactctgt-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 17450678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Original strand, 42288117 - 42288192
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  42288117 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgg-ggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagctcttacaaa 42288192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 7451281 - 7451204
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||| | ||||||||||||  |||| |||||||||||| |||||||| |||||||    
T  7451281 tcacccagttcg-tccaa-cttgacctactgtagaggagagattgatctctgcaatccactatc-aatgagttattacaaa 7451204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 465
Target Start/End: Original strand, 7815323 - 7815441
Alignment:
Q  347 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 444  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| || ||||||||||||||||||  ||||| |    | ||||||||||||||||| |    
T  7815323 ctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaagagttacaagaaattagcttcaacaagcttctaaagaacaaaccctaatttcaa 7815420  T
Q  445 cccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||  |||| ||||||||||||    
T  7815421 cctttttctcaatctcaccaa 7815441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28672088 - 28672036
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccact 360  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  28672088 ttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccact 28672036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 42412162 - 42412118
Alignment:
Q  320 ttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  42412162 ttgacctactctgg-ggagagattgatctctccaatccactatcaa 42412118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 277 - 341
Target Start/End: Complemental strand, 1345653 - 1345590
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagaga 341  Q
    ||||||| ||||||||| |||| | |||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||||    
T  1345653 aaacaaacacaccaagaaattgttgacccagttcggtcc-aatatgacctactctgggggagaga 1345590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 409; Significance: 0; HSPs: 61)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 409; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8395996 - 8395508
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8395996 tgttgtgaatccccggacctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 8395897  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8395896 tattgtgcaagcaaaaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8395798  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395797 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 8395698  T
Q  371 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 470  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8395697 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 8395598  T
Q  471 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8395597 tcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 8395508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 402; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7125294 - 7124804
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125294 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatataaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7125195  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7125194 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7125097  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7125096 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 7124997  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124996 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 7124897  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7124896 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7124804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 401; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 8393787 - 8393299
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  8393787 tgttgtgaatccccggacctcaaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacgaagtt 8393688  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||    
T  8393687 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataca-atggagagggaa 8393589  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8393588 gaagaaaacaataaacacaaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 8393489  T
Q  371 ttcttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacac 470  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  8393488 ttcttacaaaagggatacaaaaggttacaagaaattagcttgacatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacac 8393389  T
Q  471 tcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8393388 tcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccataaaccctagagcttcccctttg 8393299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 398; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 7123075 - 7122585
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    ||||||||||||||| | |||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7123075 tgttgtgaatccccgaacctccaaggccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 7122976  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  7122975 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggag--ggaa 7122878  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| |||| |||| |||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122877 gaagaaaacaataaacacaaagaaattgttcacccagttcggtctttgcttgacctactatggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 7122778  T
Q  371 ttctt-acaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122777 ttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagtttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 7122678  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7122677 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 7122585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 365; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 71 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5138685 - 5138193
Alignment:
Q  71 ctgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaag 169  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5138685 ctgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaag 5138586  T
Q  170 tttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagag 267  Q
     |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||||||||||||    
T  5138585 cttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagag 5138489  T
Q  268 ggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 366  Q
    ||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5138488 ggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa 5138389  T
Q  367 tgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 464  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138388 tgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcacca 5138289  T
Q  465 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5138288 agacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5138193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 5136459 - 5135967
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  5136459 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 5136360  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaac--aatcacaagataaacaaggagagg 268  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  5136359 ttattgagcaagcaagagacaacaaaacatcac-tagatctaatctaggaaccaagtgtgaaaca--aagcaaccaaaacacaagataaacaaggagagg 5136263  T
Q  269 gaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaat 367  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5136262 gaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaat 5136163  T
Q  368 gagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136162 gagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 5136063  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatg-ttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5136062 gacactcaatgattctctc--tacaaggtatttcccatgtttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 5135967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 173; E-Value: 9e-93
Query Start/End: Original strand, 128 - 535
Target Start/End: Original strand, 31495143 - 31495556
Alignment:
Q  128 atgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaa-g 226  Q
    |||||||||||||| | ||| ||| ||||||| | |||||||| | | |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  31495143 atgatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccatc-aacaaagtgtgt-gtgcaagcaataatcaacaaaacagcacctagatctaatctaggaaacaaag 31495240  T
Q  227 tgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaac------aaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaact 320  Q
    ||  || || ||| || ||| |||||||||||       |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  31495241 tgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaaaggataaaaggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaact 31495339  T
Q  321 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattag-cttgacaag 417  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |   |||||||||||||||  ||||||||    
T  31495340 tgacctactctggaggagagattgaactctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaaagagatacaaaaagagttacaagaaattagatttgacaag 31495438  T
Q  418 ttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaa 516  Q
    ||||| |||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||  ||||||||    
T  31495439 ttcacaatgaac-aatcctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcccatgtttcccaacccaa 31495537  T
Q  517 gagatactctaatcaaaga 535  Q
    ||||  |||||||||||||    
T  31495538 gagaagctctaatcaaaga 31495556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 13992274 - 13992544
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13992274 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctta 13992371  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcaccaagacactc 472  Q
    ||| ||  || ||| || ||||||||||||||| || ||||||||||| | |||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  13992372 caagag--atacaaaagagttacaagaaattagatttgacaagttcacaaagaacaa-ccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagacactc 13992468  T
Q  473 aatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  13992469 aatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagagactctaatcaaag-accctaaacccta 13992544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 101; E-Value: 9e-50
Query Start/End: Original strand, 300 - 548
Target Start/End: Original strand, 29999809 - 30000063
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||| || |||||    
T  29999809 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaaaaagatacaaaagagttac 29999907  T
Q  399 aagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttaca 490  Q
    ||||||||||| |||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||||||||| |||| || ||   ||    
T  29999908 aagaaattagctttgacatgttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaagacactcaacgattttcactcacca 30000006  T
Q  491 aggtgtttcccatgttttc-aacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||| | |||||| | ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  30000007 aggtgtttacaatgtttccaaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 30000063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 8e-47
Query Start/End: Original strand, 277 - 535
Target Start/End: Original strand, 56178618 - 56178882
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  56178618 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 56178715  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caag 466  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||       ||||    
T  56178716 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttcccaatctcaccaatgaacaag 56178813  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaaga 535  Q
    ||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||||    
T  56178814 acactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaaga 56178882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 179 - 451
Target Start/End: Original strand, 5369968 - 5370237
Alignment:
Q  179 caagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaaga 276  Q
    ||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| | |||| || ||||||||  |||||||  ||||       
T  5369968 caagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagat 5370063  T
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||| ||| |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  5370064 aaacaaacacatcaa-agattgttcactcagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctctagtccactatc-aatgagttctta 5370161  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc--ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt 451  Q
    | |||| ||| ||| | |||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||| ||||    
T  5370162 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctcttt 5370237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 52095344 - 52095530
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  52095344 aaacaaacacaccaaaa-attgttcacccagttcggtccaaacttg-cctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gatttctta 52095440  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  52095441 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 52095530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 285 - 461
Target Start/End: Complemental strand, 2209894 - 2209717
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |    
T  2209894 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaaccatgacctactctggaggagagattaatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gag 2209797  T
Q  385 atgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctca 461  Q
    || ||| |  |||||||||||||||||||  ||||| |||| | ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  2209796 atacaaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaa-aaaccctaatttctacccattttcccaatctca 2209717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 48143230 - 48143042
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  48143230 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagtttggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 48143133  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 465  Q
       ||| ||| ||| | |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  48143132 -tgaagagatacaaaagggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 48143042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41964580 - 41964415
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |  |||||    
T  41964580 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaaatgggtta 41964484  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||| ||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  41964483 caataaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatttcaccaa 41964415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 9927441 - 9927626
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | || ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  9927441 aacaaacacaccaa-agattgttgactcagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 9927537  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  9927538 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 9927626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 47038393 - 47038577
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  47038393 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttactctgggggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagtcctta 47038489  T
Q  377 caaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||  | || |||  | ||||||||||||||||| | |||| |||| | |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47038490 caaacag-atacaaatgattacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa-ccctaatttctacccattttccaatctcaccaa 47038577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 3e-25
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 26364415 - 26364236
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| | ||||||||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||| | |    
T  26364415 acaccaagaaattgttgacccagttcagtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactattaa-tgagttcttacaaa-gag 26364319  T
Q  385 atgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  26364318 atacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 26364236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 12739533 - 12739718
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  12739533 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcatac 12739629  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||  ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12739630 -aaatagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12739718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 446
Target Start/End: Original strand, 12743908 - 12744073
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12743908 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12744004  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12744005 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12744073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 446
Target Start/End: Original strand, 12745297 - 12745462
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12745297 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 12745393  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
     |||| ||| | ||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  12745394 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 12745462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 46703666 - 46703500
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggtta 397  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||| |  |||||    
T  46703666 tcacccaattcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaa-gagatacaaaatgggtta 46703569  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  46703568 caagaaattagcttaaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctactcattttcccaatctcaccaa 46703500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 285 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 54883199 - 54883020
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |    
T  54883199 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacttaatctggaggagagattgatccctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagag 54883103  T
Q  385 atgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || | ||  |||||||||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54883102 atacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54883020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 26175619 - 26175804
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  26175619 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 26175715  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  26175716 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctccccattttcccaatctcaccaa 26175804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Original strand, 34570397 - 34570582
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||| ||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  34570397 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcgatccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 34570493  T
Q  378 aaaagggatgcaa-gaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| |||   |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  34570494 -aaagagatacaattgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctattttcccaatctcaccaa 34570582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40632607 - 40632445
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaag-aggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| |||||| |||| | ||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  |||||||||    
T  40632607 acccagttcggtccaa-cttgacttactttagaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaataggttacaa 40632511  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  40632510 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aactctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 40632445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 6656120 - 6655975
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  6656120 tcacccaattcggtccaa-cttgacctactctggatgagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 6656024  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||||  |||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    
T  6656023 aagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccc 6655975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 277 - 463
Target Start/End: Original strand, 46147373 - 46147557
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  46147373 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggggagagattgatgtctccaatccactatcaaa-gagttctta 46147469  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 463  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  46147470 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcacc 46147557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 12073557 - 12073392
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    ||||| ||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  12073557 tcacctagttcggtccaacaatgacctactctggaagagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 12073460  T
Q  399 aagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 465  Q
    || |||||||||| | |||| |||| | ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  12073459 aataaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaacc-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 12073392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 41639590 - 41639426
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||| |||  ||| | ||  ||||||    
T  41639590 tcactcagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-gatgagttcttac-aaatagatacaaatgggttac 41639494  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  | |||||||| | |||| |||||||||||||||||  ||||||||||| |||||    
T  41639493 aagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatcttaccaa 41639426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 411
Target Start/End: Original strand, 50673851 - 50673960
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  50673851 tcacctagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 50673947  T
Q  399 aagaaattagctt 411  Q
    |||||||||||||    
T  50673948 aagaaattagctt 50673960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 317 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 8665556 - 8665408
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  8665556 aacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 8665459  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||| || | | |||| |||||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  8665458 aagctctcaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccattctcaccaa 8665408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Original strand, 36463386 - 36463557
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||| | ||     
T  36463386 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactgtcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaat 36463482  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| |||||| | |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36463483 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-agccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 36463557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 45687164 - 45687351
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| |||||| || | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  45687164 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacataatatggaggagagatagatctctccaatccactatc-aatgagttctta 45687260  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||  ||| |||  | |||| ||||||||||| |||||||| |||| | ||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  45687261 c-aaatagatacaaatgagttataagaaattagctttgacaagctcacaaagaacaaaacctaatttcttcccattttcccaatctcaccaa 45687351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 411
Target Start/End: Original strand, 48893620 - 48893751
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||    
T  48893620 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttctta 48893716  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt 411  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  48893717 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 48893751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Original strand, 50262689 - 50262783
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  50262689 acaccaagagattgttcacccagttcggtccaacaatgacctactctggaggaaagattgatatctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 50262783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 458
Target Start/End: Original strand, 5207848 - 5208003
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatgcaagaggttacaa 400  Q
    ||||| ||| ||||||| ||||||||||||||  |||||||||  || |||||||||||||||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| |||    
T  5207848 acccaattcagtccaaa-ttgacctactctgggagagagattgatctttccaatccactatcaa-tgagttcttacaaatagatatacaag-ggttgcaa 5207944  T
Q  401 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatc 458  Q
     |||||||||| | ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  5207945 taaattagcttcaacaagttcacaaagaacaaaccctaatttctaccctttttccaatc 5208003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 285 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 12119719 - 12119559
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaaggg 384  Q
    ||||||||| |||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |    
T  12119719 acaccaagaaattgttcacctagttcggtccaacaatgacctactcttg-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttctttacaaagag 12119622  T
Q  385 atgcaaga-ggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac 445  Q
    || ||| | |||||||||||||||||||  | |||||||| | ||||||||| ||||||||||    
T  12119621 atacaaaagggttacaagaaattagcttcaaaaagttcacaaagaacaaaccataatttctac 12119559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 36994686 - 36994524
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||| | ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| | ||  ||||||||    
T  36994686 acccagttcggtccaa-cttgatctaatatgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagggatacaaatgggttacaa 36994590  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  36994589 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttcccaatctcaccaa 36994524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 304 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 379541 - 379399
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaaga 402  Q
    ||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||||    
T  379541 ccagttcggtccaacaatgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aattagttcttac-aaagcgatacaaatgggttacaaga 379444  T
Q  403 aattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||  ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||    
T  379443 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cctaatttctaccc 379399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 306 - 465
Target Start/End: Original strand, 37229731 - 37229890
Alignment:
Q  306 agttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa-agggatgcaagaggttacaagaaa 404  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||  ||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||  ||  ||  |||||||| |||    
T  37229731 agttcggtccaa-cttgacctactatgagggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttacaaagagatataaaaagggttacaacaaa 37229828  T
Q  405 ttagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    || || || ||||| |||| | ||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  37229829 tttgctttaacaagctcacaaagaacacaccctaatttctaccattttcccaatctcaccaa 37229890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8648303 - 8648225
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  8648303 tcacccagtttggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttacaaa 8648225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 305 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 37740784 - 37740536
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  37740784 cagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 37740688  T
Q  404 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac-------caagacactcaatgattctctctttacaaggt 494  Q
    ||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||       ||||||||||| ||||| || ||   ||||||    
T  37740687 attagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttataccctttttccaaatctcaccaatgaacaagacactcagtgattttcactcaccaaggt 37740589  T
Q  495 gtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||    
T  37740588 gtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctcaacccta 37740536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 6542161 - 6542328
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  6542161 aaacaaacacaccaagaaat-gtttacccagttcggtccaa-cttgacctaccctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttctta 6542257  T
Q  377 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    | |||| ||| ||| ||| | |||||||||||| ||  ||||| |||| | ||||||| |||||||||||||    
T  6542258 c-aaagagatacaaaaggctaacaagaaattagtttcaacaagctcacaaagaacaaatcctaatttctacc 6542328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5429850 - 5429765
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5429850 agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5429765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 465
Target Start/End: Original strand, 27416974 - 27417133
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaa 403  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| | ||  |||||||||||    
T  27416974 cagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtttttac-aaagagatacaaatgggttacaagaa 27417070  T
Q  404 attagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||||| |  ||| |||||||||||||    
T  27417071 attagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacacattttaccaatctcaccaa 27417133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 305 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 35662600 - 35662527
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35662600 cagttcggtccaa-cttgacctactcttgaggagatattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 35662527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 317 - 465
Target Start/End: Original strand, 54199926 - 54200074
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||  ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || |||||||||||||||||  ||    
T  54199926 aacttgacctaatctgggggagagaatgatctctctaattcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 54200023  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  54200024 aagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 54200074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 302 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 4588121 - 4588014
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggttacaa 400  Q
    |||||||| ||||||| ||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | ||||||||    
T  4588121 acccagtttggtccaa-cttcacctattatgggggagagattgttctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagggttacaa 4588025  T
Q  401 gaaattagctt 411  Q
    |||||||||||    
T  4588024 gaaattagctt 4588014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 366
Target Start/End: Original strand, 52467336 - 52467423
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa 366  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  52467336 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctcggggagagattgatctctccaatccactatcaaa 52467423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 280 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5872003 - 5871906
Alignment:
Q  280 caaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaa 379  Q
    |||| ||||||| |||||| | ||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  5872003 caaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtc-aaacttgacctaatctgggggagagattgatctctctaatccactatcaaa-gagttcttgcaa 5871907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 337 - 446
Target Start/End: Original strand, 12744087 - 12744195
Alignment:
Q  337 agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaacc 434  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||    
T  12744087 agagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aacc 12744183  T
Q  435 ctaatttctacc 446  Q
    ||||||||||||    
T  12744184 ctaatttctacc 12744195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 302 - 439
Target Start/End: Original strand, 26699447 - 26699585
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||   ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||   |||| ||| ||| || |||||||    
T  26699447 acccagttcggtccaacaatgacctactctgggatagagattgatctctccaatccattat-aaatgagttctttacaaagagatacaaaagagttacaa 26699545  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaat 439  Q
    |||||||||||  ||||| |||| | ||||||||||||||    
T  26699546 gaaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaccctaat 26699585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 411
Target Start/End: Complemental strand, 31474337 - 31474206
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||   |||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  31474337 aaacaaacacaccaagatat-gtttacccagttcggtccaa-cttgatctactctggtggagagatttatctctccaatcaactatcaa-tgagttctta 31474241  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt 411  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||    
T  31474240 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctt 31474206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 29254679 - 29254580
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | |||  |||||||||  ||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  29254679 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatttgggagagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac 29254583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 335 - 465
Target Start/End: Original strand, 12747794 - 12747924
Alignment:
Q  335 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaa 432  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||  | || |||  || ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||    
T  12747794 ggagagattgatctctccaatccactatcaa-tgagttcatacaaatag-atacaaatgggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aa 12747890  T
Q  433 ccctaatttcta-cccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  12747891 ccctaatttctatccattttcccaatctcaccaa 12747924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 52082645 - 52082825
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |       |||||||||||| || ||||||    
T  52082645 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccaaatcggtctaaacttgacctactctggaggagagaatgatc-------tccactatcaaa-gatttctta 52082735  T
Q  377 caaaagggatgc-aagaggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||| ||| | ||  ||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||    
T  52082736 c-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagttttgacaagttcacaaagaac-aaccctagtttctacccattttcccaatctcaccaa 52082825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 317 - 380
Target Start/End: Original strand, 13009464 - 13009526
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||| | |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13009464 aacttgacctaatttggaggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 13009526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 3913578 - 3913534
Alignment:
Q  335 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3913578 ggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 3913534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 321 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33989989 - 33989948
Alignment:
Q  321 tgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactat 362  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||    
T  33989989 tgacctactctggtggagagattgatctctccaatccactat 33989948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000008
Query Start/End: Original strand, 323 - 375
Target Start/End: Complemental strand, 33090021 - 33089970
Alignment:
Q  323 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctt 375  Q
    ||||||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33090021 acctactctagaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttctt 33089970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0565 (Bit Score: 407; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0565
Description:

Target: scaffold0565; HSP #1
Raw Score: 407; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 2380 - 2868
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||   ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2380 tgttgtgaatccccgagcctccaaggtcggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 2479  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  2480 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaa 2577  T
Q  272 gaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2578 gaagaaaacaataaacacaaaaagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 2677  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2678 ttctttacaaaagggatacaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 2777  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2778 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 2868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0137 (Bit Score: 390; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0137
Description:

Target: scaffold0137; HSP #1
Raw Score: 390; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 6667 - 6177
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatcgaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtt 171  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6667 tgttgtgaatccccgagtctccaagaccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatatgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagtt 6568  T
Q  172 tattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat-aaacaaggagaggga 270  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6567 tattgtgcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaaacaaggagaggga 6468  T
Q  271 agaagaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgag 370  Q
    ||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6467 agaagaaaacaataacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttaacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatgag 6368  T
Q  371 ttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 469  Q
    ||| ||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6367 ttctttacaaaagggatacaagggcttacaagaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagaca 6268  T
Q  470 ctcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  6267 ctcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagttgcccctttg 6177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0674 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0674
Description:

Target: scaffold0674; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 115 - 562
Target Start/End: Original strand, 3545 - 3990
Alignment:
Q  115 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3545 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 3644  T
Q  215 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  3645 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 3742  T
Q  314 ccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttg 412  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  3743 ccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaaatgagttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttg 3842  T
Q  413 acaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaac 512  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  3843 acatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaac 3940  T
Q  513 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3941 ccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 3990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 377; Significance: 0; HSPs: 50)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15290917 - 15290427
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15290917 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15290818  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15290817 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15290720  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290719 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15290620  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15290619 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15290520  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15290519 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15290427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 377; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Complemental strand, 15471286 - 15470796
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  15471286 tgttgtgaatccccggacctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagc 15471187  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagaggga 270  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  15471186 ttattgagcaagcaagaaacaacaatacaccacctagatcgaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagaggga 15471089  T
Q  271 agaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatga 369  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  15471088 agaagaaaacaataaacacaaagagattggacacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatga 15470989  T
Q  370 gttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 467  Q
    |||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15470988 gttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaaga 15470889  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15470888 cactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 15470796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 72 - 562
Target Start/End: Original strand, 42575100 - 42575589
Alignment:
Q  72 tgttgtgaatccccggatctccaagatc-gaatcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagt 170  Q
    |||||||||||||||   |||||||| | | |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  42575100 tgttgtgaatccccgagcctccaagacccggatcgaaccacaccaatacaaactataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccaaacaaagc 42575199  T
Q  171 ttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaa-caatcacaagataaacaaggagaggg 269  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||| ||||||||  ||||||||||||    
T  42575200 ttattgagcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatccaatctaggaaacaagtgtgaa--acaaagcaaccaaacacaagat--acaaggagaggg 42575295  T
Q  270 aagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatg 368  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  42575296 aagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaatg 42575395  T
Q  369 agttc-ttacaaaagggatgcaagaggttacaagaaattagcttgacaa-gttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 466  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42575396 agttctttacaaaaggaatacaagaggttacaagaaattagcttgacaatgttcactatgaacaatccctaatttctacccctttcccaatctcaccaag 42575495  T
Q  467 acactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttcccctttg 562  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  42575496 acactcaatgattctctc--tacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagaggtactctaatcaaagaaccctaaaccctagagctttccctttg 42575589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 102 - 555
Target Start/End: Complemental strand, 25690312 - 25689865
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  25690312 atcgaaccacaccaatacaaagaat---gatgtgtggagcaaaggagagtggtaaccaccaaacaaagtgtgt-gtgcaagcaagaatcaacaaaacacc 25690217  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaa-gagattgg 299  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| || || ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||||| |||||||     
T  25690216 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaacacaaaaca-cactcacaagataaa--aggggagggaagaagaaaacaacaaacaccaaagagattgt 25690120  T
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttaca 399  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  25690119 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagtttgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttaca 25690021  T
Q  400 agaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 499  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25690020 agaaattagcttgacaagttcacaatgaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttc 25689921  T
Q  500 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 555  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25689920 ccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagagcttc 25689865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 102 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 3439860 - 3439418
Alignment:
Q  102 atcgaaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacacc 201  Q
    |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |   |||||||||| || ||||||||||||    
T  3439860 atcgaaccacaccaatactaaaaa-aatgatgtgtggagcgacggagagcggtaaccaccaaacaaagtgt---gtgcaagcaacaatcaacaaaacacc 3439765  T
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaa-gagattggt 300  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| || |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||| |    
T  3439764 acctagatctaatctaggaaacaagtgagaaactcaaaaca-caatcacaagataaa--aggagagggaagaagaaaacaaaagcaccaaagagattgtt 3439668  T
Q  301 cacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagaggttacaa 400  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  3439667 catccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaa-gagttcttacaaaagggatacaaaaggttacaa 3439569  T
Q  401 gaaattagcttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3439568 gaaattagcttgccaagttcataatgaacaaaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctttacaaggtgtttcc 3439469  T
Q  501 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3439468 catgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 3439418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 4e-95
Query Start/End: Original strand, 106 - 551
Target Start/End: Complemental strand, 2628087 - 2627649
Alignment:
Q  106 aaccacaccaatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaa-caacaa-aacaccac 203  Q
    ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||| | ||| ||| ||||||||  ||||||||     |||||||||| ||| |||||| |||| |||    
T  2628087 aaccacaccaatacaaag--taa-gatgtgtggagcaaaggaaagtagtaaccact-aacaaagtgg---gtgcaagcaaaaaatcaacaataacaacac 2627995  T
Q  204 ctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattggtcac 303  Q
    |||||||||||||||||| ||||||  || || ||| || ||| |||||||||||  ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||  ||||    
T  2627994 ctagatctaatctaggaaacaagtgaaaagcataaaaca-caagcacaagataaa--aggagagggaagaggaaaacaaagacaccaagagattattcac 2627898  T
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaag 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||| ||| |   ||| ||||    
T  2627897 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttacacaagagatacaaaaagagttgcaag 2627799  T
Q  402 aaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcc 500  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  2627798 aaattagatttgacaagttcacaatgaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaagacactcaatgattttctctcttcaaggtgtttcc 2627700  T
Q  501 catgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    |||||||  ||||||||||||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  2627699 catgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-actctaaaccctagag 2627649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 34254312 - 34254586
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  34254312 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aataagttctta 34254409  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||       |||||    
T  34254410 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttcccaatctcaccaatgaacaaga 34254507  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| | |||| | |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34254508 cactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtctccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 34254586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 17982840 - 17982563
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  17982840 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 17982744  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------caa 465  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||       |||    
T  17982743 ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaacaa 17982645  T
Q  466 gacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  17982644 gacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 17982563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 177 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 31218541 - 31218167
Alignment:
Q  177 tgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaa 274  Q
    ||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| ||  || |||||||||||  |||||||  ||||     
T  31218541 tgcaagcaataatcaacaataacagcacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaaacat-aagcacaagataaa--aggagag--aagag 31218447  T
Q  275 gaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttct 374  Q
      ||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  31218446 agaaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctctaatccactatc-aatgagttct 31218349  T
Q  375 tacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcac-------c 463  Q
    | | |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||       |    
T  31218348 t-ccaaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccattttttcccaatctcaccaatgaac 31218251  T
Q  464 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31218250 aagacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 31218167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 34256488 - 34256762
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  34256488 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctagaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 34256585  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcac-------caaga 467  Q
    | |||| ||| ||| | ||||||||||||||| | ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||  ||| ||||||||||       |||||    
T  34256586 c-aaagagatacaaaagggttacaagaaattaactttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttccaatctcaccaatgaacaaga 34256683  T
Q  468 cactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttttcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    |||||||||||| || |    |||||||||| | |||||| |||||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||    
T  34256684 cactcaatgattttcacacaccaaggtgtttacaatgtttccaacccaagata-actctaatcaaag-accctaaacccta 34256762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 42498459 - 42498193
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||  |||||||  |||| | ||||||| ||||||| ||    
T  42498459 aacaacacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa--aggagag--aagagggaaacaaacacaccaa-ag 42498365  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-g 393  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  || ||| | |    
T  42498364 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagaaatacaaaagg 42498267  T
Q  394 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc--cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||||||||||    |||||||||||||||||    
T  42498266 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacctttttttcccaatctcaccaa 42498193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 5e-45
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 44304042 - 44303764
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44304042 aaacaaacacaccaa-agattgttcacctagttcgatccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctta 44303945  T
Q  377 caaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc---ctttcccaatctcac-------ca 464  Q
     ||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||    ||||||||||||||       ||    
T  44303944 -aaaagagatacaaaaggattacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttttcccaatctcaccaatgaaca 44303847  T
Q  465 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  44303846 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 44303764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 7e-38
Query Start/End: Original strand, 277 - 548
Target Start/End: Original strand, 19945340 - 19945618
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  19945340 aaacaaacacaccaa-agattgttcacccagttcggttcaaacttgacctactctcgaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 19945436  T
Q  377 caaaagggatgc--aagaggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac-------ca 464  Q
    | |||| ||| |  ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||   ||||||||||||||       ||    
T  19945437 ccaaagagatacaaaagtggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccataatttctacccttttttcccaatctcaccaatgaaca 19945535  T
Q  465 agacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||||||||||||||| || ||   |||||||||| | ||||||  | |||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  19945536 agacactcaatgattttcactcaccaaggtgtttacaatgtttcccgacccaagaga-actctaatcaaag-actctaaacccta 19945618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 277 - 446
Target Start/End: Original strand, 1746200 - 1746366
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||     
T  1746200 aaacaaacacaccaac-gattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactatggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttctt- 1746296  T
Q  377 caaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
      |||| ||| ||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  1746297 -caaagagatacaaaagggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacc 1746366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 15212971 - 15212786
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  15212971 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccattatc-aatgagttcttac 15212875  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  15212874 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 15212786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Original strand, 42434995 - 42435159
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  42434995 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatttctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 42435091  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  42435092 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccatttttccaatctcaccaa 42435159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 43036608 - 43036423
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  43036608 aacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctggaggagagattgatctctcaaatccactatc-aatgagttcttac 43036512  T
Q  378 aaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| |||  |  |||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  43036511 -aaagagatacaaatgaattacaagaaattagtttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 43036423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4283688 - 4283524
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  4283688 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactctagaggggagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 4283592  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4283591 aagaaattagcttcaacaagctcacaaaaaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4283524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 33352321 - 33352150
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||     
T  33352321 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaat 33352225  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||| ||  |||||||||| | |||| ||||||||||| |||||  |||||||||||||||||    
T  33352224 gggttacaagaaattaggttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttttacccattttcccaatctcaccaa 33352150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 293 - 463
Target Start/End: Complemental strand, 40321251 - 40321082
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||| | ||     
T  40321251 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagtttttac-aaagagatactaat 40321155  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcacc 463  Q
     ||||||||||||||| |||  ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40321154 gggttacaagaaattaacttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcacc 40321082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 4e-21
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18655564 - 18655400
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  18655564 tcacccagttcggtccaa-cttgacctactttggaggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 18655468  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18655467 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 18655400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Original strand, 3303652 - 3303838
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  3303652 aaacaaacacaccaa-agattgtttacccagttcggtccaa-cttgacctactgtgggggagagattgatctcttcaatccactatcaa-tgagttctta 3303748  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt-cccaatctcaccaa 465  Q
    |||| | ||| |||  | ||||||||||||||| || | |||| |||| | ||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  3303749 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattaggttaaacaagctcacaaagaacaaact-taatttctacccattttcccaatctcaccaa 3303838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 4743196 - 4743296
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4743196 aaacaaacacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctactttgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 4743292  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  4743293 caaa 4743296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 27811449 - 27811278
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aag 391  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||| |||||||||||| |||| |||||||| |||| ||| | ||     
T  27811449 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctcttcaatccactatc-aatgggttcttac-aaagagatacaaat 27811353  T
Q  392 aggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||||||||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  27811352 gggttacaagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 27811278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 51; E-Value: 6e-20
Query Start/End: Original strand, 201 - 447
Target Start/End: Original strand, 12702542 - 12702783
Alignment:
Q  201 cacctagatctaatctaggaa--ccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagagattg 298  Q
    |||||||||||||||||| ||  | |||||  ||||||||| | |||| |||||||||||    | ||| |||||   ||||||| | ||||| ||||||    
T  12702542 cacctagatctaatctagaaaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcacaagataaa----gggagagaagagagaaacaaacataccaa-agattg 12702636  T
Q  299 gtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-ggtta 397  Q
     | |||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||||||| |||| ||  ||| | |||||    
T  12702637 ttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccaatatc-aatgagttcttac-aaagagacacaaaagggtta 12702733  T
Q  398 caagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  12702734 caagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 12702783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 4e-18
Query Start/End: Original strand, 285 - 380
Target Start/End: Original strand, 10930188 - 10930281
Alignment:
Q  285 acaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||| |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| |||| |||||||||||    
T  10930188 acaccaagaaattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgtgttcttacaaa 10930281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 40221907 - 40221745
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| || |||||||||| |||| ||| | ||  ||||||||    
T  40221907 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aacgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaa 40221811  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||| ||  ||||| |||| | |||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  40221810 gaaattagtttcaacaagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttaccaatctcaccaa 40221745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 323 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 40328922 - 40328782
Alignment:
Q  323 acctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga--ggttacaagaaattagctt-gacaagtt 419  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |   ||||||||||||||| ||  ||||| |    
T  40328922 acctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaatgagttacaagaaattagtttaaacaagct 40328825  T
Q  420 cactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  40328824 cacaaagaacaaa-cctaatttctacccattttcccaatctcac 40328782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 1345353 - 1345453
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||     
T  1345353 aaacaaacacaccaa-agattgttgacctagttcggtctaa-cttgacctactctgggggagagattgaactcttcaatccactatc-aatgagttcttt 1345449  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  1345450 caaa 1345453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 9e-16
Query Start/End: Original strand, 293 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 5689442 - 5689357
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||| | ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  5689442 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgaccaaatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttacaaa 5689357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 278 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 4731843 - 4731658
Alignment:
Q  278 aacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttac 377  Q
    |||||| ||||||| |||||| | ||||| |||||||||| ||||||| | ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  4731843 aacaaacacaccaa-agattgttgacccaattcggtccaa-cttgaccgaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac 4731747  T
Q  378 aaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
     |||| ||| | ||  |||||||||||||||| ||  ||||| |||| | || | |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  4731746 -aaagagatacaaatgggttacaagaaattaggttcaacaagctcacaaagagc-aaccctaatttctacccattttcccaatctcaccaa 4731658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000004
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 18141981 - 18141821
Alignment:
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaag 401  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||    
T  18141981 cccagtttggtccaa-cttgacctaatctaggggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gagttcttac-aaagtgatacaaatgggttacaag 18141885  T
Q  402 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||  ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  18141884 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaa--cctaatttctacccattttcacaatctcaccaa 18141821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6599143 - 6599056
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 382  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6599143 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaag 6599056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 293 - 382
Target Start/End: Complemental strand, 6674596 - 6674509
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 382  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||||||||||  ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6674596 agattgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagattgatctctctaatccactatc-aatgagttcttacaaaag 6674509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 317 - 459
Target Start/End: Complemental strand, 30143488 - 30143346
Alignment:
Q  317 aacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaagaaattagctt-gac 414  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  |||||||||||||||||||  ||    
T  30143488 aacttgaccttatctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttacaagaaattagcttcaac 30143391  T
Q  415 aagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatct 459  Q
    ||| |||| | |||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  30143390 aagctcacaaagaac-aaccctaatttctacccattttcccaatct 30143346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 303 - 411
Target Start/End: Original strand, 41366622 - 41366727
Alignment:
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttacaag 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| | ||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| | || |||||| |||    
T  41366622 cccagttcggtccaa-cttgacctaatctag-ggagagattgatctctccaatccactat-aaatgagttcttac-aaagggatacaaataggttaaaag 41366717  T
Q  402 aaattagctt 411  Q
    ||||||||||    
T  41366718 aaattagctt 41366727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000006
Query Start/End: Original strand, 305 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 30291767 - 30291606
Alignment:
Q  305 cagttcggtccaaacttgacctactctggagg-agagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaaga 402  Q
    ||||||||||||| |||| | || |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||| || |||||||||| | ||| |||  | |||||||||    
T  30291767 cagttcggtccaa-cttggcataatctggagggagagattgatctctccaatccactatcaaa-gaattcttacaaa-gtgatacaaatgagttacaaga 30291671  T
Q  403 aattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||| | |||| |||| | ||||||| ||||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  30291670 aattagcttcaacaagctcacaaagaacaaaacctaatttctacccattttctcaatctcaccaa 30291606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000009
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 4733868 - 4733792
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  4733868 acccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagatcgatctctccaatccactatc-aatgaattcttacaaa 4733792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 303 - 465
Target Start/End: Original strand, 1292471 - 1292631
Alignment:
Q  303 cccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaag 401  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||    
T  1292471 cccagttcggtccaa-cttgacctactctgg-ggagagatttatttctcaaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaag 1292566  T
Q  402 aaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||  ||||| |||| | ||||||| | ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  1292567 aaattagcttcaacaagctcacaaagaacaaa-cttaatttctacccattttctcaatctcaccaa 1292631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 465
Target Start/End: Original strand, 8965697 - 8965859
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaa 400  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||   |||||| || ||||||||| |||||||||||||| | |||  || ||| ||| ||    
T  8965697 acccagttcggtccaa-cttgacctaatatgggggagagatttatctctccgatgcactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatataaaagggttataa 8965793  T
Q  401 gaaattagcttga-caagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||| ||| | |||  |||  | |||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  8965794 gaaattaacttcaacaaactcataaagaacaaaccctaatttctacctttttcccaatctcaccaa 8965859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 347 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 9765863 - 9765745
Alignment:
Q  347 ctctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagagg-ttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttcta 444  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  || ||||||||||||||| ||| |||| |||| | |||| ||||||||||||||    
T  9765863 ctctccaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgggttacaagaaattagctttgccaagctcacaaagaac-aaccctaatttcta 9765767  T
Q  445 ccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||  |||||||||||||||||    
T  9765766 cccattttcccaatctcaccaa 9765745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 300 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 11384149 - 11384004
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |   ||||||||||| |||||| || ||||||||||| | ||| |||  | |||||    
T  11384149 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctggaggagagatcgatgtctccaatccagtatcaa-tgggttcttacaaa-gagatacaaatgagttac 11384053  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||||  ||||  |||| | |||| |||||||||||||||||    
T  11384052 aagaaattagcttcaacaaactcacaaagaac-aaccctaatttctaccc 11384004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 10015265 - 10015180
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    ||||||||||||||||| || | | |||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||   |||||||||||||||||||    
T  10015265 aaacaaatacaccaagaaat-gattacccagttcggtccaa-cttgacctactatggag-agagatttatctctccaatccactatcaa 10015180  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 335 - 462
Target Start/End: Complemental strand, 44353923 - 44353796
Alignment:
Q  335 ggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaa 432  Q
    ||||||||||  || | |||||||||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | ||||||||||||||||||  |||||||||| | |||| ||    
T  44353923 ggagagattgatcttttcaatccactatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgtgttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaagaac-aa 44353827  T
Q  433 ccctaatttctaccc-ctttcccaatctcac 462  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  44353826 ccctaatttctacccattttcccaatctcac 44353796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 8153914 - 8153844
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||| ||||||||||||||  | ||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8153914 ttcggtccaa-cttgacctactctgaggaagagattgatctctccaatcaactatc-aatgagttcttacaaa 8153844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 302 - 382
Target Start/End: Original strand, 18106087 - 18106163
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaag 382  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  18106087 acccagttcggtccaa-cttgacctattctgg-ggagagattgatctctccaaac-actatcaa-tgagttcttacaaaag 18106163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 302 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 4162658 - 4162516
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttacaa 400  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||   |||||||||| ||||||| |||||||||||||| | ||| |||  | |||||||    
T  4162658 acccaattcggtccaa-cttgacctactcttggggagagattgatatctccaatcc-ctatcaa-tgagttcttacaaa-gagatacaaatgagttacaa 4162563  T
Q  401 gaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc 447  Q
    |||||||||||  |||||||| | | ||||||| ||||| ||||||||    
T  4162562 gaaattagcttcaacaagttctcaaagaacaaa-cctaacttctaccc 4162516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000005
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Original strand, 3073880 - 3073955
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||| ||| |||||| ||||||||||||||    
T  3073880 acccagttcggcccaa-cttgacctactatgg-ggagagattgatctctccaagccattatcaa-tgagttcttacaaa 3073955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 304 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 7597776 - 7597715
Alignment:
Q  304 ccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7597776 ccagttcggtctaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 7597715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 202 - 239
Target Start/End: Original strand, 32902096 - 32902133
Alignment:
Q  202 acctagatctaatctaggaaccaagtgtgaaacacaaa 239  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  32902096 acctagatctaatctaggaaccaagtgaaaaacacaaa 32902133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1808 (Bit Score: 181; Significance: 2e-97; HSPs: 1)
Name: scaffold1808
Description:

Target: scaffold1808; HSP #1
Raw Score: 181; E-Value: 2e-97
Query Start/End: Original strand, 115 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 214 - 1
Alignment:
Q  115 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccaccgaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  214 aatacaaagaataatgatgtgtggagcgacggagagtggtaaccacctaacaaagtttattgtgcaagcaagaaacaacaaaacaccacctagatctaat 115  T
Q  215 ctaggaaccaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaa-atacaccaagagattggtcacccagttcggt 313  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  114 ctaggaaacaagtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagat--acaaggagagggaagaagaaaacaataaacacaaagagattggtcacccagttcggt 17  T
Q  314 ccaaacttgacctact 329  Q
    ||||||||||||||||    
T  16 ccaaacttgacctact 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:

Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 176 - 551
Target Start/End: Original strand, 11042 - 11423
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| || ||| |||||||||||  |||||||||||||    
T  11042 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaaacacaaacca-caagcacaagataaa--aggagagggaaga 11138  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  11139 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc 11236  T
Q  374 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcac------c 463  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  || |||||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||      |    
T  11237 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaagaac 11335  T
Q  464 aagacactcaatgattctctctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaaccctagag 551  Q
    ||||||||||||||||  | ||   |||||||||| | ||||||  ||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  11336 aagacactcaatgatttacactcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagagaagctctaatcaaag-accataaaccctagag 11423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 176 - 467
Target Start/End: Original strand, 8616 - 8907
Alignment:
Q  176 gtgcaagcaagaaacaacaa-aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaaga 273  Q
    |||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  || ||||||||||    
T  8616 gtgcaagcaataatcaacaataacaacacctagatctaatctaggaaacaaagtgaaaagcacaaacca-caagcacaagataaa--agaagagggaaga 8712  T
Q  274 agaaaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttc 373  Q
     ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||    
T  8713 ggaaaacaaagacaccaa-agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aacgagttc 8810  T
Q  374 ttacaaaagggatgcaaga-ggttacaagaaattag-cttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacccctt--tcccaatctcaccaaga 467  Q
    ||||||||| ||| ||| | ||||||||||||||||  || | |||||||| | |||| ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  8811 ttacaaaagagatacaaaagggttacaagaaattagattttataagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttctcccaatctcaccaaga 8907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0002 (Bit Score: 110; Significance: 4e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0002
Description:

Target: scaffold0002; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 4e-55
Query Start/End: Original strand, 196 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 434798 - 434443
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  || |||||| || ||| |||||||||||  ||| ||| |||||   ||||||| ||||||| |     
T  434798 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaagcacaaaaca-caagcacaagataaa--agg-gagagaagagagaaacaaacacaccaa-at 434704  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga-g 393  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| | |    
T  434703 attgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaagg 434606  T
Q  394 gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccccttt--cccaatctcac-------caagacactcaatgattctct 483  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||       ||||||||||||||||| ||     
T  434605 gttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccctttttccccaatctcaccaatgaacaagacactcaatgattttca 434507  T
Q  484 ctttacaaggtgtttcccatgtttt-caacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
    ||   |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  434506 ctcaccaaggtatttaccatgttttccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 434443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0286 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0286
Description:

Target: scaffold0286; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 277 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 11745 - 11557
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11745 aaacaaatacaccaagagattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatcaa-tgagttctta 11647  T
Q  377 caaaagggatgcaagag-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc-cctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||| | ||| |||  | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||   |||||||||||||||||    
T  11646 caaa-gagatacaaatgagttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctaccatttttcccaatctcaccaa 11557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1519 (Bit Score: 94; Significance: 1e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1519
Description:

Target: scaffold1519; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 293 - 548
Target Start/End: Complemental strand, 1087 - 827
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||   |||| ||| ||| |    
T  1087 agattgttcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgaactctccaatccactatc-aatgagttgtt--caaagagatacaaaa 991  T
Q  393 -ggttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc--ctttcccaatctcac------caagacactcaatgattctc 482  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||      ||||||||||||||||| ||    
T  990 gggttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccctaatttctacccttttttcccaatctcaccaagaacaagacactcaatgattttc 892  T
Q  483 tctttacaaggtgtttcccatgttt-tcaacccaagagatactctaatcaaagaaccctaaacccta 548  Q
     ||   |||||||||| | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  891 actcaccaaggtgtttacaatgtttcccaacccaagaga-actctaatcaaag-accctaaacccta 827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 76; Significance: 7e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 7e-35
Query Start/End: Original strand, 293 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 114774 - 114602
Alignment:
Q  293 agattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaaga 392  Q
    |||||| ||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  114774 agattgttcatccagttcggtctaaacttaacctactctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaaa 114677  T
Q  393 g-gttacaagaaattagc-ttgacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    | |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| |||| ||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  114676 gcgttacaagaaattagctttgacaagttcacaaagaac-aaccttaatttctaccctttttcccaatctcaccaa 114602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 57; Significance: 2e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 300 - 446
Target Start/End: Original strand, 18007 - 18151
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgcaagag-gttac 398  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||| |||| |||| ||| |||  | |||||    
T  18007 tcacccagttcgatccaaacttgacctaccctggaggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagtt-ttac-aaagagatacaaatgagttac 18103  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctacc 446  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18104 aagaaattagcttcaacaagctcacaatgaac-aaccctaatttctacc 18151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 56; Significance: 6e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 6e-23
Query Start/End: Original strand, 277 - 380
Target Start/End: Original strand, 149079 - 149179
Alignment:
Q  277 aaacaaatacaccaagagattggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttctta 376  Q
    ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  149079 aaacaaatacaccaa-agattgttgacccagttcggtccaa-cttaacctactctgggggagagattgatctctccaatccactatc-aatgagttctta 149175  T
Q  377 caaa 380  Q
    ||||    
T  149176 caaa 149179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0466 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0466
Description:

Target: scaffold0466; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 300 - 465
Target Start/End: Complemental strand, 7491 - 7327
Alignment:
Q  300 tcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagaggttac 398  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||  || |||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| | ||  ||||||    
T  7491 tcacccagttcggtccaa-cttaacctactctagaggagagattgatctttccaatccactatc-aatgagttcttac-aaagagatacaaatgggttac 7395  T
Q  399 aagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctaccc-ctttcccaatctcaccaa 465  Q
    |||||||||||||  ||||| |||| | |||| |||| ||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  7394 aagaaattagcttcaacaagctcacaaagaac-aaccttaatttctacccatttttccaatctcaccaa 7327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 49; Significance: 9e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 9e-19
Query Start/End: Original strand, 196 - 465
Target Start/End: Original strand, 20319 - 20583
Alignment:
Q  196 aacaccacctagatctaatctaggaaccaa-gtgtgaaacacaaagcaacaatcacaagataaacaaggagagggaagaagaaaacaaatacaccaagag 294  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||| | |||| || ||||||||    | ||| |||||    |||||| ||||||| |     
T  20319 aacagcacctagatctaatctaggaatcaaagtgaaaaacacaaaaccacaagcaaaagataaa----gggagagaagagaggaacaaacacaccaaaa- 20413  T
Q  295 attggtcacccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaaagggatgc-aagag 393  Q
    |||| | |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||| ||| | ||  |    
T  20414 attgttgacccagttcggtccaa-cttgacctaatctgggggagagattgatctctccaatccaatatcaaa-gagttcttac-aaagagatacaaatgg 20510  T
Q  394 gttacaagaaattagctt-gacaagttcactatgaacaaaccctaatttctac-ccctttcccaatctcaccaa 465  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||| |  |||||| |||||||||| | |  |||||||||||||||||    
T  20511 gttacaagaaattagcttcaacaagttcacaaaaaacaaa-cctaatttctgctcattttcccaatctcaccaa 20583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0236 (Bit Score: 47; Significance: 1e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0236
Description:

Target: scaffold0236; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 302 - 380
Target Start/End: Complemental strand, 10651 - 10575
Alignment:
Q  302 acccagttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaaatgagttcttacaaa 380  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  10651 acccagttcggtccaa-cttgacctactctggaggagagattgatctcttcaatccactatc-aacgagttcttacaaa 10575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0219 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0219
Description:

Target: scaffold0219; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 308 - 365
Target Start/End: Original strand, 27453 - 27510
Alignment:
Q  308 ttcggtccaaacttgacctactctggaggagagattgtactctccaatccactatcaa 365  Q
    ||||||||||   ||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  27453 ttcggtccaacaatgacctactatgggggagagattgatctctccaatccactatcaa 27510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University