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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15554_high_2 (Length: 898)

Name: NF15554_high_2
Description: NF15554
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15554_high_2
NF15554_high_2
[»] chr1 (16 HSPs)
chr1 (144-881)||(15375243-15375981)
chr1 (144-451)||(25383336-25383644)
chr1 (148-451)||(31056114-31056417)
chr1 (144-451)||(38145663-38145970)
chr1 (7-105)||(31584970-31585068)
chr1 (7-101)||(29677342-29677436)
chr1 (2-105)||(2191517-2191620)
chr1 (1-105)||(15379035-15379145)
chr1 (7-101)||(25293782-25293876)
chr1 (10-105)||(48378819-48378914)
chr1 (7-105)||(11894559-11894657)
chr1 (7-105)||(47141086-47141184)
chr1 (25-105)||(38264077-38264157)
chr1 (475-511)||(50588910-50588946)
chr1 (7-93)||(25987659-25987745)
chr1 (475-512)||(47295357-47295394)
[»] chr2 (11 HSPs)
chr2 (144-451)||(23341647-23341954)
chr2 (144-451)||(13460091-13460399)
chr2 (146-451)||(35086465-35086769)
chr2 (7-105)||(5110508-5110606)
chr2 (7-105)||(13626045-13626143)
chr2 (7-104)||(31575673-31575770)
chr2 (9-104)||(45150973-45151068)
chr2 (7-93)||(42622401-42622487)
chr2 (38-105)||(13807845-13807912)
chr2 (7-105)||(5938977-5939075)
chr2 (10-93)||(5704909-5704992)
[»] chr7 (15 HSPs)
chr7 (146-451)||(35149788-35150094)
chr7 (225-451)||(349969-350195)
chr7 (148-451)||(3812957-3813263)
chr7 (7-105)||(11038918-11039016)
chr7 (7-105)||(23809407-23809505)
chr7 (25-104)||(2943802-2943880)
chr7 (2-105)||(7767294-7767397)
chr7 (7-98)||(33189625-33189716)
chr7 (7-105)||(38440143-38440241)
chr7 (7-104)||(30541219-30541316)
chr7 (7-78)||(1052792-1052863)
chr7 (7-105)||(5973288-5973386)
chr7 (7-93)||(27337309-27337395)
chr7 (7-105)||(36299102-36299200)
chr7 (468-512)||(47456700-47456744)
[»] scaffold0208 (2 HSPs)
scaffold0208 (144-451)||(10456-10763)
scaffold0208 (144-451)||(29190-29498)
[»] chr6 (16 HSPs)
chr6 (144-451)||(6101560-6101867)
chr6 (191-451)||(17579778-17580037)
chr6 (149-401)||(21192725-21192979)
chr6 (151-451)||(21772382-21772681)
chr6 (146-451)||(32031263-32031568)
chr6 (549-881)||(28299344-28299674)
chr6 (549-881)||(28512399-28512729)
chr6 (146-398)||(8652651-8652905)
chr6 (7-105)||(7622602-7622700)
chr6 (7-105)||(28582464-28582562)
chr6 (9-105)||(35167021-35167116)
chr6 (1-104)||(641756-641859)
chr6 (16-105)||(8577038-8577127)
chr6 (7-104)||(10788777-10788873)
chr6 (260-322)||(12436766-12436828)
chr6 (7-105)||(10408674-10408772)
[»] chr5 (17 HSPs)
chr5 (144-451)||(12687969-12688276)
chr5 (144-451)||(32096003-32096310)
chr5 (144-451)||(28527174-28527480)
chr5 (144-451)||(19061507-19061818)
chr5 (219-451)||(41295388-41295633)
chr5 (7-93)||(35188356-35188442)
chr5 (7-93)||(39206865-39206951)
chr5 (7-101)||(39800177-39800271)
chr5 (7-105)||(3926494-3926592)
chr5 (7-93)||(23429547-23429633)
chr5 (357-451)||(26508441-26508532)
chr5 (10-105)||(42878686-42878781)
chr5 (7-101)||(39886970-39887064)
chr5 (7-93)||(40057163-40057249)
chr5 (7-105)||(42837809-42837906)
chr5 (144-211)||(41293166-41293233)
chr5 (40-78)||(2209879-2209917)
[»] chr4 (19 HSPs)
chr4 (146-451)||(5186886-5187192)
chr4 (148-451)||(26958926-26959228)
chr4 (144-451)||(48165242-48165548)
chr4 (146-398)||(10735194-10735448)
chr4 (146-398)||(10948963-10949217)
chr4 (8-102)||(22279306-22279399)
chr4 (10-103)||(29117308-29117401)
chr4 (8-93)||(36464534-36464619)
chr4 (8-105)||(8819024-8819121)
chr4 (7-78)||(40568669-40568740)
chr4 (7-105)||(41041738-41041836)
chr4 (7-105)||(19842030-19842128)
chr4 (16-78)||(33340926-33340988)
chr4 (27-105)||(43624646-43624721)
chr4 (7-93)||(38951934-38952020)
chr4 (7-105)||(42555637-42555735)
chr4 (25-105)||(17120033-17120113)
chr4 (25-105)||(40714572-40714651)
chr4 (151-286)||(32282793-32282928)
[»] chr3 (15 HSPs)
chr3 (144-451)||(42193021-42193329)
chr3 (144-451)||(10762447-10762754)
chr3 (144-451)||(49155744-49156050)
chr3 (144-451)||(11841534-11841841)
chr3 (146-398)||(10240055-10240310)
chr3 (146-398)||(38450910-38451164)
chr3 (7-105)||(25874434-25874534)
chr3 (9-105)||(13826351-13826447)
chr3 (196-349)||(29596696-29596853)
chr3 (7-105)||(21288390-21288489)
chr3 (7-101)||(12149288-12149382)
chr3 (7-104)||(5295514-5295611)
chr3 (7-100)||(27926366-27926459)
chr3 (32-105)||(36585024-36585097)
chr3 (7-105)||(3778710-3778808)
[»] chr8 (12 HSPs)
chr8 (146-451)||(32895081-32895386)
chr8 (146-451)||(39729034-39729339)
chr8 (144-451)||(5543963-5544282)
chr8 (146-347)||(14414032-14414235)
chr8 (2-104)||(28211642-28211744)
chr8 (260-449)||(30413400-30413588)
chr8 (7-105)||(7986935-7987033)
chr8 (7-105)||(8226973-8227071)
chr8 (7-105)||(36582664-36582762)
chr8 (7-104)||(7968194-7968291)
chr8 (7-105)||(9762659-9762757)
chr8 (7-58)||(31006379-31006430)
[»] scaffold0363 (1 HSPs)
scaffold0363 (146-347)||(4476-4679)
[»] scaffold0115 (1 HSPs)
scaffold0115 (7-101)||(22278-22372)
[»] scaffold0634 (1 HSPs)
scaffold0634 (7-101)||(9003-9097)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (7-105)||(66838-66936)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (10-105)||(6681-6776)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 562; Significance: 0; HSPs: 16)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 562; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 144 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 15375981 - 15375243
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375981 ggagctgcataagatggatgtcaatacaatatattttaatggcaacattaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 15375882  T
Q  244 agtatatggtgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    | |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15375881 attatatgatgcaaaatcatgaaatccacttatgaggtaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaagcaattgtctcatttggttta 15375782  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15375781 gagatagtattatggagagttgtggatttagtaagttcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgttaattatattttatttactcaacaa 15375682  T
Q  444 tgatatattagttatgnnnnnnnn-aatcaataaattttattaaaaactagaactctgctcaagacgaac------cggtgaaacagaaatacaaacgaa 536  Q
    ||||||||||||||||         |||||| |||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||      || ||||||| |||||||||||||    
T  15375681 tgatatattagttatgttgctttttaatcaacaaattttattaaaaaccagaaccctgttcaagacgaacagaaaccgatgaaacataaatacaaacgaa 15375582  T
Q  537 acgaaaggcgccgtgaatataaataagaaggaaattgtgacggaaggtgcagtaataaagtcaggtacctcatttcatttcccattgtaaaatgttattg 636  Q
    |     | |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15375581 a-----gacgccgtgaatataaaagagaaggaaattgtgacggaaggtgcactaataaagtcaggtacctcatttcatttcccattgtaaaatgttattg 15375487  T
Q  637 atattgttgagcgaaatgatgttgacactgagggactgattcagcagttatagaattctcctatacttgaaccggttcaaccattaagtgcaacagaggc 736  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15375486 atattgttgagcgaaatgatgttgacactgagggactgattcagcagttatagaattctcctatacttgaaccggttcaaccattaagtgcagcagaggc 15375387  T
Q  737 tgtgacatctcatgggatgtctacaaccatatcctcacaggaaaccgctctggatactcataacatgcagcaacccccatatgcccagttttgcagaagg 836  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  15375386 tgtgacatctcatgggatgtctacaaccatatcctcacaggaaaccgctctggatactcataacatgcagcagcccccatatgcccagttttgtagaagg 15375287  T
Q  837 acatcaatttgatacgacagatttttgcctccagagacggaggag 881  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15375286 acatcaatttgatacgaca-aattttgcctccagagacggaggag 15375243  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 25383644 - 25383336
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  25383644 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 25383545  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttacc-acgaattctcataaaacaattgtctcatttggt 340  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  25383544 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggt 25383445  T
Q  341 ttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaa 440  Q
    || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | ||||    
T  25383444 tttgagataatattatggagaattgtggacttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaa 25383347  T
Q  441 caatgatatat 451  Q
    | |||||||||    
T  25383346 cgatgatatat 25383336  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 148 - 451
Target Start/End: Original strand, 31056114 - 31056417
Alignment:
Q  148 ctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagta 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  31056114 ctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatacaaagta 31056212  T
Q  248 tatggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctctta-agtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttag 344  Q
     |||||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||  ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| |    
T  31056213 gatggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgttttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttagttttg 31056312  T
Q  345 agatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaat 444  Q
    ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||| ||    
T  31056313 agataatattatggagaattgtggatttagtaagctcagtgggagaaaatttata--tttcaagtttaatgtgtaaattatattttatttagtcaacgat 31056410  T
Q  445 gatatat 451  Q
    |||||||    
T  31056411 gatatat 31056417  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 38145970 - 38145663
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  38145970 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 38145871  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    | || | |||  |||   ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||  ||||||||||||  |||||||| ||||| ||    
T  38145870 attaaacggtttgcatggtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttggcaaaaattctcataaagtaattgtcttatttgctt 38145771  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||| ||| ||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  38145770 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcattggaagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcaatcaac 38145673  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  38145672 gatgatatat 38145663  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 31584970 - 31585068
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| || | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31584970 tggatatccatggataaaataaatgggttttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatgatatccacacccgcggatatccatac 31585068  T

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Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 29677342 - 29677436
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  29677342 tggatatccatggataaaataaatggattttttaactacccgcaaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatcc 29677436  T

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Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Original strand, 2191517 - 2191620
Alignment:
Q  2 tttattggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||    
T  2191517 tttaatggatatccatggataaaataaacggatattttatctacctgttaattaatggatacagatgcagatttaatggtatccgcacccgcagatatcc 2191616  T
Q  102 atac 105  Q
    ||||    
T  2191617 atac 2191620  T

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Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 15379145 - 15379035
Alignment:
Q  1 ttttattggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaat------gaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcg 94  Q
    ||||| ||||||||||||||  | |||||||||||| |||||| |||||||||||||      | |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  15379145 ttttaatggatatccatggatcaaataaacggatattttaactgcccgctaattaatggatacggatacggatgcagatttaatagtatccacacccgca 15379046  T
Q  95 gatatccatac 105  Q
    |||||||||||    
T  15379045 gatatccatac 15379035  T

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Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 25293782 - 25293876
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    ||||||||||  || || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  25293782 tggatatccacagataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatcc 25293876  T

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Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 48378819 - 48378914
Alignment:
Q  10 atatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||| |||| ||| |||||||| ||||||||    
T  48378819 atatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacatatgcggatttaatgatattcacgcccgcggacatccatac 48378914  T

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Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 11894657 - 11894559
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||||| || ||||| | || | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| |||||||   |||||||||||| ||||||||||||    
T  11894657 tggatatcaatggataaaataaatgaattttttaactacctgctaattaatggatatggatgcggatttaacggtatccacacccgtggatatccatac 11894559  T

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Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 47141184 - 47141086
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || |||| ||||| | || |||||||| ||||||||| ||| | || || |||||||  ||||  |||||||||||||||||||    
T  47141184 tggatatccatggataaaataagcggatttttttactacccgttaattaatggataggaatacatatttaatggtatcagcacccgcggatatccatac 47141086  T

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Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 38264077 - 38264157
Alignment:
Q  25 ataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||    
T  38264077 ataaatggatattttaactacccgctaattaatggatatggatgtgaatttaatggtatccgcacccgcagatatctatac 38264157  T

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Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 475 - 511
Target Start/End: Original strand, 50588910 - 50588946
Alignment:
Q  475 aaattttattaaaaactagaactctgctcaagacgaa 511  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50588910 aaattttattaaaaactagatctctgctcaagacgaa 50588946  T

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Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 25987745 - 25987659
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||| ||||| || ||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||  |||||||||||||    
T  25987745 tggatatctatggataaaataaatgaattttttaactacccgctaattaatggatacaaatgtggatttaatggtatccacacccgc 25987659  T

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Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 475 - 512
Target Start/End: Original strand, 47295357 - 47295394
Alignment:
Q  475 aaattttattaaaaactagaactctgctcaagacgaac 512  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  47295357 aaattttattaaaaactatatctctgctcaagacgaac 47295394  T

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Target: chr2 (Bit Score: 148; Significance: 1e-77; HSPs: 11)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 23341647 - 23341954
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23341647 ggagttgcataagatggatgtcaatatagtaatttttaatggcaacattaatgatacaatatggtgcaactaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 23341746  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    || | | |||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  23341747 aggagaaggtttgcaaactgatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtattaccacaaattctcatgaaggaattgtctcatttggtt 23341846  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| ||  || ||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||   ||||| | ||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  23341847 ttgagataatataatagagagttttgaatttagtaagttcagtgggagtaaatttatgtttt--gagttttatgtgtcgattttattttatttagtcaac 23341944  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
    ||||||||||    
T  23341945 aatgatatat 23341954  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 13460091 - 13460399
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  13460091 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 13460190  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttacc-acgaattctcataaaacaattgtctcatttggt 340  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  13460191 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggt 13460290  T
Q  341 ttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaa 440  Q
    || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | ||||    
T  13460291 tttgagataatattatggagaattgtggacttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaa 13460388  T
Q  441 caatgatatat 451  Q
    | |||||||||    
T  13460389 cgatgatatat 13460399  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 35086769 - 35086465
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||  || |||| ||||| ||| || ||||  | | ||||| ||||||||| |||||||||||    
T  35086769 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttctcaatggtgacattaatgatactatatggcgcaaccacataaaac-tttgtgtcattagatacaaag 35086671  T
Q  246 tatatgg--tgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || ||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||     
T  35086670 tagatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttagtttt 35086571  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
    |||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  35086570 gagataatattaagtagagttgtggatttagtaagcttagtgggagtaattttata--ttgctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaacga 35086473  T
Q  444 tgatatat 451  Q
    ||||||||    
T  35086472 tgatatat 35086465  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5110606 - 5110508
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| | || | ||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  5110606 tggatatccatggataaaataaatgaattttttaactacccgctaattaatggatacgaatgcggatttaatggtatccacacccgcagatatccatac 5110508  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 13626045 - 13626143
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  13626045 tggatatctatggataaaataaacagattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatctacacccgcgaatatccatac 13626143  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 31575673 - 31575770
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| || |  |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||||    
T  31575673 tggatatgcatggataaaataaacgaattttgtaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaattgtatccacaccagcggatatccata 31575770  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 9 - 104
Target Start/End: Original strand, 45150973 - 45151068
Alignment:
Q  9 gatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||||||||||| | ||||||||||    
T  45150973 gatatccatggataaaataaacggattttttaactatccgctaattaatggatacagatgcggatttaatggtatccacacccacagatatccata 45151068  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 42622401 - 42622487
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  42622401 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatgaatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgc 42622487  T

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Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 38 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13807912 - 13807845
Alignment:
Q  38 ttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13807912 ttaactacccgcttattaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 13807845  T

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Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5939075 - 5938977
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||||| |  ||||| |||| | ||||||||||||||||||||| ||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5939075 tggatattcatggatataataaatggattttttaactacccgctaattaatggatacaaatgcggatttaatggtatctacacccgcggatatccatac 5938977  T

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Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 10 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 5704992 - 5704909
Alignment:
Q  10 atatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||| |||| || ||||| |||| | ||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||||  |||||||||||||    
T  5704992 atatccgtggataaaataaatggattttttaactatccgctaattaatggatacggatgtggatttaatggtatccacacccgc 5704909  T

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Target: chr7 (Bit Score: 137; Significance: 5e-71; HSPs: 15)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 5e-71
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 35150094 - 35149788
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| ||| ||||||   || |||| ||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| ||||||||     
T  35150094 agctgcataagatgaatttcaatatagtgtttcttaatgatgacattaatgatacaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaaat 35149995  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || |||||  |||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||     
T  35149994 tagatggtttgcaacatcatgaaatccacttataagttaaaaaatttgtctctttattgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttggtttt 35149895  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
     ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||  ||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  35149894 aagataatattatggagaattgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatattttgatattttat-gtgtcaattatattttatttagtcaacga 35149796  T
Q  444 tgatatat 451  Q
    ||||||||    
T  35149795 tgatatat 35149788  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 9e-51
Query Start/End: Original strand, 225 - 451
Target Start/End: Original strand, 349969 - 350195
Alignment:
Q  225 tttgtgtcaatagatacaaagtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaa 322  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||    
T  349969 tttgtgtcattagatacaaagtagatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttcccacaaattgtcataaa 350068  T
Q  323 acaattgtctcatttggtttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaat 422  Q
      ||||||||||||| |||| |||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||  |||||||    
T  350069 gtaattgtctcatttagttttgagataatattaagtagagttgtggatttagtaagcttagtgggagtaattttata--ttcctagtttaatatgtcaat 350166  T
Q  423 tatattttatttactcaacaatgatatat 451  Q
    | ||||||||||| ||||| |||||||||    
T  350167 tttattttatttagtcaacgatgatatat 350195  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 148 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 3813263 - 3812957
Alignment:
Q  148 ctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagta 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| |  ||||| |||||||||||    
T  3813263 ctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatacaaagta 3813165  T
Q  248 tatggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaa----gtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
     |||||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||      |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||    
T  3813164 gatggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgttttttttttttgtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttagtt 3813065  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||    
T  3813064 ttgagataatattatggagaattgtggatttagtaagctcagtgggagaaaatttata--tttcaagtttaatgtgtaaattatattttatttagtcaac 3812967  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  3812966 gatgatatat 3812957  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 11038918 - 11039016
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  11038918 tggatattcatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatgaatatggatacggatttaatggtatccacacccgcagatatccatac 11039016  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 23809407 - 23809505
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||||| || |||||| | | | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  23809407 tggatattcatggataaaataaacaggttttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 23809505  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 25 - 104
Target Start/End: Original strand, 2943802 - 2943880
Alignment:
Q  25 ataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  2943802 ataaacggatattttaactacccgctaattaatg-atacgaatgcagatttaatggtatccacatccgcggatatccata 2943880  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7767397 - 7767294
Alignment:
Q  2 tttattggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||| |||||||||||| | || |||||||||| | |||||||||| |||||||||| | |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  7767397 tttaatggatatccatgaataaaataaacggattttttaactaccccctaattaatggacacggattcagatttaatggtatccacacctgcggatatcc 7767298  T
Q  102 atac 105  Q
    ||||    
T  7767297 atac 7767294  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 33189716 - 33189625
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggata 98  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||| |||  ||||||||||||||||||    
T  33189716 tggatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacagatgcgaattcaatggtatccacacccgcggata 33189625  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 38440143 - 38440241
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||||||| || || ||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||  |||||||||| || |||||||||||    
T  38440143 tggatatccatagataaaataaacgaattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttgatggtatccacacctgcagatatccatac 38440241  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 30541219 - 30541316
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||   ||||||| ||||||||||    
T  30541219 tggatatccatggataaaataaacgaatattttaactacccgctaattaatggatatggatgccgatttaatggtatttgcacccgcagatatccata 30541316  T

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Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 1052792 - 1052863
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaat 78  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||  ||||||||    
T  1052792 tggatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggataaggatgtggatttaat 1052863  T

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Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 5973386 - 5973288
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||| |||||| || || ||||||| || | ||||||| || |||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  5973386 tggaaatccattgataaaataaacgaattttttaactatccactaattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacccgcggatatccatac 5973288  T

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Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 27337395 - 27337309
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||||| | | || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  27337395 tggatatccacgaataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatagatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgc 27337309  T

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Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36299200 - 36299102
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||||||||||||||||||| ||||  |||  ||||||||  ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  36299200 tggatatccatggataaaataaatgaatattttaactacccgctaattaatggatacaaatgttgatttaatggtatccgcacccacggatattcatac 36299102  T

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Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 468 - 512
Target Start/End: Original strand, 47456700 - 47456744
Alignment:
Q  468 aatcaataaattttattaaaaactagaactctgctcaagacgaac 512  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  47456700 aatcaacaaattttattaaaaaccagatctctgctcaagacgaac 47456744  T

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Target: scaffold0208 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0208
Description:

Target: scaffold0208; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 10456 - 10763
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10456 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 10555  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  10556 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggtt 10655  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  10656 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaac 10753  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  10754 gatgatatat 10763  T

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Target: scaffold0208; HSP #2
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 29190 - 29498
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  29190 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 29289  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| || ||  ||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  29290 agtagatagtttgcaaagtcatgaaatccacttgtaagttaagaaatttgtctctttagtgttacagcaaattctcataaagtaattgtctcgtttggtt 29389  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |  ||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  29390 ttgagataatattatggagaattatgaatttagtaagctcagtgggagtaaatttata-ttttgagttttaatgtgtcaattttattttatttagtcaac 29488  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     | |||||||    
T  29489 tacgatatat 29498  T

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Target: chr6 (Bit Score: 128; Significance: 1e-65; HSPs: 16)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 6101560 - 6101867
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  6101560 ggagttgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaatgatacaatatggtgcagctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 6101659  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||| |||||||    
T  6101660 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaggtaattgtctcttttggtt 6101759  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||   | | |||||||  |||||||| |||||||| ||||||||    
T  6101760 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaagtttata--ctcctagtttaatatgtcaattttattttatatactcaac 6101857  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  6101858 gatgatatat 6101867  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 191 - 451
Target Start/End: Original strand, 17579778 - 17580037
Alignment:
Q  191 ttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaat 288  Q
    |||| ||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17579778 ttaatgatacaatatggtgcaacttaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtagatgttttgcaaaatcatgaaatccacttatgagttaagaaat 17579877  T
Q  289 ttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtggga 388  Q
    ||||||||| | | |||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||||| ||| || ||| || |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||    
T  17579878 ttgtctctttatttttactacatattctcataaagcaattatctcatttgcttttgacataatattatggagaattgtggatttagcaaattcagtggga 17579977  T
Q  389 gtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatgatatat 451  Q
    |||| ||||||||| |  |||||||  |||||||| || |||||||| ||||| |||||||||    
T  17579978 gtaagtttatatttat--agtttaatatgtcaatt-tactttatttagtcaacgatgatatat 17580037  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 9e-54
Query Start/End: Original strand, 149 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21192979 - 21192725
Alignment:
Q  149 tgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtat 248  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | || ||||| || |||| ||||||||| ||||||||  || ||  ||||| | || ||||||||||||||     
T  21192979 tgcataagatggatgtcaatacaatgtatcttgatggcgacattaacgatacaatatggtgcaatccaataattcttttatatcgatagatacaaagtag 21192880  T
Q  249 atggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagag 346  Q
    |||||  ||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| |||| |||    
T  21192879 atggtttgcaaagtcatgaaatcgacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttagttttgag 21192780  T
Q  347 atagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatt 401  Q
    ||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  21192779 ataatattaagtagagttgtggatttagtaagcttagtgggagtaattttatatt 21192725  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 151 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 21772681 - 21772382
Alignment:
Q  151 cataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtatat 250  Q
    |||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||   ||||||| ||| ||||| ||||||| | ||  | ||||| |  ||||| ||||||||||| ||    
T  21772681 cataagatggatttcaatatagtgtttcttaatgatgacgttaatgatgcaatatggtgcaactgaatcagactttgga-tcaattgatacaaagtagat 21772583  T
Q  251 ggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagagat 348  Q
    |||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||| |||| |||||    
T  21772582 ggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttatctttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgcctcatttagttttgagat 21772483  T
Q  349 agtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatgata 448  Q
    | || ||||||||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21772482 aatattatggagagttgtggttttagtaagctccgagggagaaaatttata--tttcaagtttaatgtgtcaattatattttatttagtcaacgatgata 21772385  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 32031568 - 32031263
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||  || |||| ||||||||| ||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32031568 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttctcaatggtgacattaatgatacaatatggtgctacttaagaaaactcttgtgtcaatagatacaaag 32031469  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || ||| |  ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| | || ||  ||  |||||| |||| ||||| |||||||||||||     
T  32031468 tagatgttttgcaaaatcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttattggtaggacatattctcgtaaagcaattatctcatttggtttt 32031369  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
    |||||| || |||||||| |||||||||||| ||  |||||||||| || ||||||||  |  |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||  |    
T  32031368 gagataatattatggagaattgtggatttagcaaattcagtgggagaaagtttatattcat--agtttaatatgtcaattttattttatttagtcaatca 32031271  T
Q  444 tgatatat 451  Q
    ||||||||    
T  32031270 tgatatat 32031263  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 549 - 881
Target Start/End: Complemental strand, 28299674 - 28299344
Alignment:
Q  549 gtgaatataaataagaaggaaattgtgacggaaggtgcagtaataaagtcaggtacctcatttcatttcccattgtaaaatgttattgatattgttgagc 648  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  28299674 gtgaatatagatgagaatgaaattgtgaaggaaggtgcactaacgaagtcaggtacctcatttcatttcccattggagaatgtcattgatattgttgaac 28299575  T
Q  649 gaaatgatgttgacactgagggactgattcagcagttatagaattctcctatac-------ttgaaccggttcaaccattaagtgcaacagaggctgtga 741  Q
    |||         |||| |||| |  | |||| |||||| |||| | ||||||||       ||||| ||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||    
T  28299574 gaa---------acaccgaggaaaaggttcaacagttagagaactgtcctatacttgaaagttgaatcggttcagcctctaagtgcaacaacggctgcga 28299484  T
Q  742 catctcatgggatgtctacaaccatatcctcacaggaaaccgctctggatactcataacatgcagcaacc-cccatatgcccagttttgcagaaggacat 840  Q
    ||| || |||||  || ||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28299483 catttcctgggagttccacaaccacatcctcacatgaaactgttccagatactcaaaacatgcagcaaccgcccatatacccagttttgcagaaggatat 28299384  T
Q  841 caatttgatacgacagatttttgcctccagagacggaggag 881  Q
    ||||||| |||| || |||||||  |||||||  |||||||    
T  28299383 caatttgttacggca-atttttggatccagaggtggaggag 28299344  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 549 - 881
Target Start/End: Original strand, 28512399 - 28512729
Alignment:
Q  549 gtgaatataaataagaaggaaattgtgacggaaggtgcagtaataaagtcaggtacctcatttcatttcccattgtaaaatgttattgatattgttgagc 648  Q
    ||||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||| |    
T  28512399 gtgaatatagatgagaatgaaattgtgaaggaaggtgcactaacgaagtcaggtacctcatttcatttcccattggagaatgtcattgatattgttgaac 28512498  T
Q  649 gaaatgatgttgacactgagggactgattcagcagttatagaattctcctatac-------ttgaaccggttcaaccattaagtgcaacagaggctgtga 741  Q
    |||         |||| |||| |  | |||| |||||| |||| | ||||||||       ||||| ||||||| ||  |||||||||||  ||||| ||    
T  28512499 gaa---------acaccgaggaaaaggttcaacagttagagaactgtcctatacttgaaagttgaatcggttcagcctctaagtgcaacaacggctgcga 28512589  T
Q  742 catctcatgggatgtctacaaccatatcctcacaggaaaccgctctggatactcataacatgcagcaacc-cccatatgcccagttttgcagaaggacat 840  Q
    ||| || |||||  || ||||||| ||||||||| ||||| | ||  |||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  28512590 catttcctgggagttccacaaccacatcctcacatgaaactgttccagatactcaaaacatgcagcaaccgcccatatacccagttttgcagaaggatat 28512689  T
Q  841 caatttgatacgacagatttttgcctccagagacggaggag 881  Q
    ||||||| |||| || |||||||  |||||||  |||||||    
T  28512690 caatttgttacggca-atttttggatccagaggtggaggag 28512729  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 8652905 - 8652651
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| | |||||| |||||||||    
T  8652905 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaag 8652807  T
Q  246 tatatggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctctta-agtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttt 342  Q
    || |||||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||| | || ||||||||||||||| |||    
T  8652806 tagatggtttaaaaaagcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcttgaagcaattgtctcatttgattt 8652707  T
Q  343 agagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttat 398  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  8652706 tgagataatattatggagagttgtggatttaacaagttcagtgggagtaagtttat 8652651  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 7622700 - 7622602
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||  |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  7622700 tggatatccatggataaaataaacggattttttatttacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 7622602  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 28582562 - 28582464
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||| |||||| || ||||  || | ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||    
T  28582562 tggatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgttaattagtggatacaaatacggatttaatagtatccacaccctcagatatccatac 28582464  T

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Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Original strand, 35167021 - 35167116
Alignment:
Q  9 gatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||  ||||  || ||||||||||||||||    
T  35167021 gatatccatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaattgatacggatgtggatttaatggtatctgca-ccgcggatatccatac 35167116  T

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Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 104
Target Start/End: Original strand, 641756 - 641859
Alignment:
Q  1 ttttattggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatc 100  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||  |||  ||||||||  || || || |||||||||||    
T  641756 ttttaatggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaatggatacatatgaggatttaatggtaaccgcatccgcggatatc 641855  T
Q  101 cata 104  Q
    ||||    
T  641856 cata 641859  T

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Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 16 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 8577127 - 8577038
Alignment:
Q  16 atggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||| || |||||||| | | ||||| | ||| ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  8577127 atggataaaataaacggtttttttaaccaaccgttaattaatggatacagatgcagatttaatggtatccacacccgtggatatccatac 8577038  T

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Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 10788873 - 10788777
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||||| || ||||||| || | ||||||||| ||||||||||| ||||  |||  ||||||||| |||||||||||| ||| |||||||    
T  10788873 tggatatccatggataaaataaacgaattt-ttaactacctgctaattaatggatacaaatgtggatttaatagtatccacacccgaggagatccata 10788777  T

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Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 260 - 322
Target Start/End: Original strand, 12436766 - 12436828
Alignment:
Q  260 tcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaa 322  Q
    |||| |||| |||||||| ||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||    
T  12436766 tcataaaatgcacttatgtgttaagaaatttgtctctttattgctaccacaaattctcataaa 12436828  T

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Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 10408674 - 10408772
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||||| | ||||||||||||| || |  |||| |||||||||||| |   |||| || |||| |||||||||||    
T  10408674 tggatattcatggataaaataaacggatatttcaactacccgctaaatagtagatacagatgcagatttattggcatccgcatccgcagatatccatac 10408772  T

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Target: chr5 (Bit Score: 124; Significance: 3e-63; HSPs: 17)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 12688276 - 12687969
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  12688276 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 12688177  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  12688176 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggtt 12688077  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  12688076 ttgagataatattatggagaattgtggatttaacaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaac 12687979  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  12687978 gatgatatat 12687969  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 32096310 - 32096003
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||| | ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  32096310 ggagctgcataagatggattttaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaagatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 32096211  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| |||||  ||||| | ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||  |||||||| ||||||||    
T  32096210 agtaaatggtttgcaaagttatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggtt 32096111  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  32096110 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaac 32096013  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  32096012 gatgatatat 32096003  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 28527480 - 28527174
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  28527480 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatttgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 28527381  T
Q  244 agtatatgg--tgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||  |||| | | ||||||||    
T  28527380 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctt-tgtgttaccaaaaattctcattaagtaattattttatttggtt 28527282  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  ||| |||| ||||||||| | |||||    
T  28527281 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgttaattttattttattcagtcaac 28527184  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  28527183 gatgatatat 28527174  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 19061818 - 19061507
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||| | || ||| |||| || ||||| |||||||    
T  19061818 ggagctgcataagatgaatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaactgaataaagctttcgtttcaattgatacaa 19061719  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||  || ||  ||||| ||||||||| | |||||  ||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||||||||  |||| ||||||||||||    
T  19061718 agttgatagtttgcaaagtcatgaaatccccttatatgttaagaaatttgtctctttagtggtaccaaaaattctcataaagtaattctctcatttggtt 19061619  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaa----atttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttact 437  Q
    | |||||| || | |||| | |||||||||| |||||||||||||||||||     ||| |||||||  |||||||  |||||||| ||||||||||| |    
T  19061618 ttgagataatattctggaaaattgtggattttgtaagctcagtgggagtaattttttttttattttttgagtttaa--tgtcaattttattttatttatt 19061521  T
Q  438 caacaatgatatat 451  Q
    |||| |||||||||    
T  19061520 caacgatgatatat 19061507  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 219 - 451
Target Start/End: Original strand, 41295388 - 41295633
Alignment:
Q  219 aaaacttttgtgtcaatagatacaaagtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttacc--------- 307  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||             
T  41295388 aaaacttttgtgtcaattgatacaaagtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaataaatttgtctctttagtgttaccaaaaaaaaa 41295487  T
Q  308 ----acgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttt 403  Q
        |  ||  ||||||||   ||||||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| | | ||||||||||||| ||||||  ||    
T  41295488 aaaaaaaaaaactcataaagtgattgtcttatttggttttgagataatattatggagaattgtggatttagcaggttcagtgggagtaattttata--tt 41295585  T
Q  404 tcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatgatatat 451  Q
    || |||||||   ||||||| ||||||||| | ||||| |||||||||    
T  41295586 tctagtttaatacgtcaattttattttattcaatcaacgatgatatat 41295633  T

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Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 35188356 - 35188442
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |  |||||||||||||    
T  35188356 tggatatccatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttagtggtatccacacccgc 35188442  T

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Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Original strand, 39206865 - 39206951
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||    
T  39206865 tggatatcgatggataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgc 39206951  T

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Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 39800177 - 39800271
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||  |||||||||||||||    
T  39800177 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatctgcacccgcggatatcc 39800271  T

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Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 3926592 - 3926494
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||||  ||| ||||||| ||  |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  3926592 tggatatctatggataaaataaacggattttttaactacatgcttattaatggatgtggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 3926494  T

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Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 23429633 - 23429547
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| | |||||||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  23429633 tggatatccatgaataacataaacggattttttaactactcgctaattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacccgc 23429547  T

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Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 357 - 451
Target Start/End: Original strand, 26508441 - 26508532
Alignment:
Q  357 ggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatgatatat 451  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  | || | ||||  || |||||| ||||||||||| |||||||||| ||||    
T  26508441 ggagagttgtggattt-gtaagctcagtgggagtaaatttata--tatctattttagtgtatcaattttattttatttagtcaacaatgaaatat 26508532  T

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Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 42878686 - 42878781
Alignment:
Q  10 atatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| || || |||||||||| | |||| |||||  ||||||||| ||| | |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  42878686 atatccatagataaaataaacggattttttaaatacccattaattaatggatatgaatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 42878781  T

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Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 39887064 - 39886970
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    ||||||| |||||| || ||||||| |||| | ||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||| |||||    
T  39887064 tggatatacatggataaaataaacgaatatttcaactacctgctaattaatggatacagatgcagatttcatggtatctacacccgcgggtatcc 39886970  T

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Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 40057249 - 40057163
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    |||||||| | ||| || |||||  ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||    
T  40057249 tggatatctacggataaaataaatagatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgc 40057163  T

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Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42837906 - 42837809
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | ||||||| ||| ||| ||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  42837906 tggatatctatggataaaataaacggattttttaactatccgttaaataatggacact-atgcagatttaatagtatccacacccgcagatatctatac 42837809  T

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Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 144 - 211
Target Start/End: Original strand, 41293166 - 41293233
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgca 211  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||    
T  41293166 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgca 41293233  T

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Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 40 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 2209917 - 2209879
Alignment:
Q  40 aactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaat 78  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2209917 aactacccactaattaatggatacggatgcagatttaat 2209879  T

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Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 1e-62; HSPs: 19)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Original strand, 5186886 - 5187192
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagata-caaa 244  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  5186886 agctacataagatggatgacaatacagtgtttcttaatgacaacattaatgatacaatatggtgcaactgaagaaaactttcgtgtcaattgatataaaa 5186985  T
Q  245 gtatatg--gtgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttt 342  Q
    ||| |||   |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  5186986 gtagatgatttgcaaaatcatgtaatccacttatgagttaagaaatttgtctctttagtgttaccataaattttgataaagtaattgtctcatttggttt 5187085  T
Q  343 agagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaaca 442  Q
     |||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| ||| |  || ||||||||||| |||||     
T  5187086 tgagataatattatgaagaattgtggatttagtaagctcagtgggggtaaacttata--tttctagtttaatgtgccggttttattttatttagtcaact 5187183  T
Q  443 atgatatat 451  Q
    |||||||||    
T  5187184 atgatatat 5187192  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 148 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 26959228 - 26958926
Alignment:
Q  148 ctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagta 247  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| |  ||||| |||| ||||||    
T  26959228 ctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaactttgga-tcaattgatataaagta 26959130  T
Q  248 tatggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttaga 345  Q
     |||||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || ||| ||||||| ||||||||| || |||||||||||||| |||| ||    
T  26959129 gatggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctttttagtattaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttagttttga 26959030  T
Q  346 gatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatg 445  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  26959029 gataatattatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagaaaatttata--tttcaagtttaatgtgtcaattatattttatttagtcaacgatg 26958932  T
Q  446 atatat 451  Q
    ||||||    
T  26958931 atatat 26958926  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 48165242 - 48165548
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||  || ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||| ||| |||||||    
T  48165242 ggagctgcataagatggatttcaatatggt-tttcttaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaactaaataaagcttttgtgttaattgatacaa 48165340  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| || ||  ||||| ||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||  ||||||||| |||||||    
T  48165341 agtagatagtttgcaaagtcatgaaatccacttgtaagttaaaaaatttgtctctttagtgttacaacaaattctcataaagtaattgtctcgtttggtt 48165440  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  48165441 ttgagataatattaagtagagttgtggatttagtaagcttagtgggagtaattttata--ttcctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaac 48165538  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  48165539 gatgatatat 48165548  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10735448 - 10735194
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| || |||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  |||| |||| |||||| |||||||||    
T  10735448 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttcttcatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaac-tttgagtcaattgatacaaag 10735350  T
Q  246 tatatggtgcaaaa--tcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtc-tcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttt 342  Q
    || |||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10735349 tagatggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttggttt 10735250  T
Q  343 agagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttat 398  Q
     |||||| || |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  10735249 tgagataatagtatggagagttgtgaatttaacaagttcagtgggagtaagtttat 10735194  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10949217 - 10948963
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| || |||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  |||| |||| |||||| |||||||||    
T  10949217 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttcttcatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaac-tttgagtcaattgatacaaag 10949119  T
Q  246 tatatggtgcaaaa--tcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtc-tcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttt 342  Q
    || |||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  10949118 tagatggtttaaaaaggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttggttt 10949019  T
Q  343 agagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttat 398  Q
     |||||| || |||||||||||||| |||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  10949018 tgagataatagtatggagagttgtgaatttaacaagttcagtgggagtaagtttat 10948963  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22279399 - 22279306
Alignment:
Q  8 ggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcca 102  Q
    ||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22279399 ggatatccatggataaaataaatggattt-ttaactacccgttaattaatggatacagatgcagatttaatagtatccacacccgcggatatcca 22279306  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 10 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 29117401 - 29117308
Alignment:
Q  10 atatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccat 103  Q
    |||| |||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||   ||||| || ||||||||||||||    
T  29117401 atattcatggataaaataaacggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaacggtatccgcatccgcggatatccat 29117308  T

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Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 8 - 93
Target Start/End: Original strand, 36464534 - 36464619
Alignment:
Q  8 ggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||| |||||||    
T  36464534 ggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaatagatacggatgcggatttaatgatatccgcacccgc 36464619  T

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Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 8 - 105
Target Start/End: Original strand, 8819024 - 8819121
Alignment:
Q  8 ggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||| ||||||| | | ||||||||| ||| |||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  8819024 ggatattcatggataaaataaacggatattttaactatctgttaattaatggatatggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatccatac 8819121  T

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Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 78
Target Start/End: Original strand, 40568669 - 40568740
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaat 78  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40568669 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaat 40568740  T

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Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 41041836 - 41041738
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||  ||||| || ||||| |||| | ||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  41041836 tggatatttatggataaaataaatggattttttaactacccgctaattaatagatacagatgcgaatttaatgatatccacacccgcggacatccatac 41041738  T

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Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 19842128 - 19842030
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | |||||||  |||||||||||| |||  ||||| ||||||||  | |||||||||||| ||||| ||||    
T  19842128 tggatatccatggataaaataaacggattttttaactaatcgctaattaatggataaagatgcggatttaatggtttccacacccgcgaatatcaatac 19842030  T

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Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 33340988 - 33340926
Alignment:
Q  16 atggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaat 78  Q
    ||||| || |||||||||||| |||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33340988 atggataaaataaacggatattttaactacctactaattaatggatacggatgcagatttaat 33340926  T

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Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 43624721 - 43624646
Alignment:
Q  27 aaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||   ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  43624721 aaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggat---atggtatccacactcgcggatatccatac 43624646  T

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Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 93
Target Start/End: Complemental strand, 38952020 - 38951934
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgc 93  Q
    ||||||| || ||| || |||||| ||| | ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||  ||| |||||||||    
T  38952020 tggatattcacggataaaataaacagattttttaactacccgctaattaatggatacagatgcggatttaatggtattcacacccgc 38951934  T

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Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 42555735 - 42555637
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||| | || |||||| ||||| |||||||||  |||||||||||||| | |||  |||||||| |||||| ||||| || ||||||||||    
T  42555735 tggatatcaatgaataaaataaacagatattttaactaccaactaattaatgaatatgaatgtggatttaatgatatccgcacccacgaatatccatac 42555637  T

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Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 17120033 - 17120113
Alignment:
Q  25 ataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |||| || |||||   |||| ||| |||||||||||||||    
T  17120033 ataaacgaatattttaactatccgctaattaatggatacgaatgcggacttaatggcatccgcacgcgcggatatccatac 17120113  T

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Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 105
Target Start/End: Original strand, 40714572 - 40714651
Alignment:
Q  25 ataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||| |||||| |||||||||  ||||||| || |||| ||||||||||||||   |||| |||||||||||||||||||    
T  40714572 ataaatggatattttaactacca-ctaattagtggatacagatgcagatttaatggcatccgcacccgcggatatccatac 40714651  T

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Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000008
Query Start/End: Original strand, 151 - 286
Target Start/End: Original strand, 32282793 - 32282928
Alignment:
Q  151 cataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtatat 250  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||||| || |||||| |||||||  | | |||||  ||||| ||||| | |||||||||||    
T  32282793 cataagatggatgtcaatacaatatttcttaatgtcgacgttaatga-acaatatggtgcaaccagataaaac-attgtgacaatatacacaaagtatat 32282890  T
Q  251 gg--tgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaa 286  Q
     |  |||||| | ||  ||| |||||||||||||||||    
T  32282891 agtttgcaaagtaatagaatacacttatgagttaagaa 32282928  T

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Target: chr3 (Bit Score: 117; Significance: 4e-59; HSPs: 15)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 42193329 - 42193021
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  42193329 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatgtgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 42193230  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttacc-acgaattctcataaaacaattgtctcatttggt 340  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||  |||||||| |||||||    
T  42193229 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttacccaaaaattctcataaagtaattgtcttatttggt 42193130  T
Q  341 ttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaa 440  Q
    || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | ||||    
T  42193129 tttgagataatattatggagaattgtggacttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaa 42193032  T
Q  441 caatgatatat 451  Q
    | |||||||||    
T  42193031 cgatgatatat 42193021  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 10762754 - 10762447
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    |||||||||||||||||||   |||| ||| ||| |||||||  || |||| || |||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  10762754 ggagctgcataagatggattataatatagtgtttcttaatggtgacattaacgacacaatatggtgcatctgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 10762655  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| ||| |  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||| ||  |||||||| ||||||||    
T  10762654 agtaaatgatttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccaaaaattctcatgaagtaattgtcttatttggtt 10762555  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  |||||||| ||||||||| | |||||    
T  10762554 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgtcaattttattttattcagtcaac 10762457  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  10762456 gatgatatat 10762447  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Original strand, 49155744 - 49156050
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| |||||| || || ||||||||||||||||| |||||||    
T  49155744 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatttgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 49155843  T
Q  244 agtatatgg--tgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| ||||  |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||||| ||  |||| | | ||||||||    
T  49155844 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctt-tgtgttaccaaaaattctcattaagtaattattttatttggtt 49155942  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||  |||| |||||||  ||| |||| ||||||||| | |||||    
T  49155943 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgggagtaattttata--tttctagtttaatatgttaattttattttattcagtcaac 49156040  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  49156041 gatgatatat 49156050  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 112; E-Value: 4e-56
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 11841841 - 11841534
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  11841841 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 11841742  T
Q  244 agtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    |||| |||||  ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||   |||||||  |||||||    
T  11841741 agtaaatggtttgcaaagtcatgaaacccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttgccacaaattctcataaagtgattgtcttgtttggtt 11841642  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaac 441  Q
    | |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||  |  |||| ||  |||||||| ||||||||||| |||||    
T  11841641 ttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcagtgtgagtaagtttatattcct--agttcaatatgtcaattttattttatttagtcaac 11841544  T
Q  442 aatgatatat 451  Q
     |||||||||    
T  11841543 gatgatatat 11841534  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 10240310 - 10240055
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||   || |||| ||| ||||| ||||||| | ||  ||||||| | |||||| |||||||||    
T  10240310 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttcttaatgatgacattaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaacttt-gagtcaattgatacaaag 10240212  T
Q  246 tatatggtgcaaaat--catgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctctta--agtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtt 341  Q
    || |||||  ||||   |||||||| ||||||| ||||||||||||||||| ||   ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  10240211 tagatggtttaaaacggcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctttttttagtgttaccacaaattctcatgaaccaattgtctcatttggtt 10240112  T
Q  342 tagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttat 398  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  10240111 ttgagataatattatggagagttgtggatttaacaagttcagtgggagtaagtttat 10240055  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 38451164 - 38450910
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| ||||||   || | || ||| ||||| ||||||| | ||  |||| |||| |||||| |||||||||    
T  38451164 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttcttaatgatgacatcaatgatgcaatatggtgcaactgaatcaaac-tttgagtcaattgatacaaag 38451066  T
Q  246 tatatggtgcaaaa--tcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtc-tcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttt 342  Q
    || |||||  ||||   |||||||| ||||||| |||||||||||||||| | || ||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  38451065 tagatggtttaaaaagacatgaaatccacttataagttaagaaatttgtcttttttagtgttaccacaaattctcatgaagcaattgtctcatttggttt 38450966  T
Q  343 agagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttat 398  Q
     |||||| || ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||| |||||    
T  38450965 tgagataatattatggagagttgtggatttaacaagttcagtgggagtaagtttat 38450910  T

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Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 58; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 25874434 - 25874534
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaa--acataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||||| |  | |||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  25874434 tggatatccatggatataaaataaacggattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccata 25874533  T
Q  105 c 105  Q
    |    
T  25874534 c 25874534  T

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Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 9 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 13826447 - 13826351
Alignment:
Q  9 gatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||| || |||||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  13826447 gatatccatggataaaataaacggattttttaactactcgctaattaatggatatggatacagatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 13826351  T

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Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 196 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29596853 - 29596696
Alignment:
Q  196 gatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaagtatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtc 293  Q
    ||||||||| |||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||||   ||||  ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||    
T  29596853 gatacaatatggtgcaaccaaagaaaactt--gtgtcaatagatacaaagtcgttggtttgcaaagtcatgaaattcatttacgagttaagaaatttttc 29596756  T
Q  294 tct----taagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagagata 349  Q
    |||    ||| |||||| || ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  29596755 tctctattaattgttactacaaattcacataaaacaattgtctcattttgttttgagata 29596696  T

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Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 21288489 - 21288390
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatctt-aactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||| ||||| || |||||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  21288489 tggatatctatggataaaataaacggatttttttaactacccgctaattaatggatagggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatatccatac 21288390  T

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Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 12149382 - 12149288
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||||||||| ||| || ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  12149382 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatggatacggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatcc 12149288  T

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Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 5295611 - 5295514
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||| | || ||||||| || | |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||  |||| ||||| |||||||||||||    
T  5295611 tggatatccatgaataaaataaacgtattttttaactacccactaattaatggatacagatgcagatttaatggtatctacacctgcggatatccata 5295514  T

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Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 100
Target Start/End: Original strand, 27926366 - 27926459
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatc 100  Q
    |||||||||||||| || |||||  ||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||  |||||||||    
T  27926366 tggatatccatggataaaataaatagattttttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccacacatgcggatatc 27926459  T

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Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 46; E-Value: 9e-17
Query Start/End: Original strand, 32 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36585097 - 36585024
Alignment:
Q  32 gatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  36585097 gatattttatctacccgctaattaatggatacggatgcagattaaatggtatccgcacccgcggatatccatac 36585024  T

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Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 3778710 - 3778808
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||| | || |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||| ||||| |||||||   |||||| |||||||||||| |||||    
T  3778710 tggatatccatgaataaaataaacagattttttaactatccgctaattaatggatacagatgcggatttaacggtatccatacccgcggatattcatac 3778808  T

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Target: chr8 (Bit Score: 114; Significance: 2e-57; HSPs: 12)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Original strand, 32895081 - 32895386
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||  || |||| ||||| ||| || ||||  | | ||||  ||||||||| |||||||||||    
T  32895081 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttctcaatggtgacattaatgatactatacggcgcaaccacaaaaaaactttgtgtcattagatacaaag 32895180  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || |||||  ||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||| ||||     
T  32895181 tagatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaagaaatttgtctctttagtgttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttagtttt 32895280  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
    |||||| || || | |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||  || | |||||||  |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  32895281 gagataatattaagtagagttgtggatttagtaagcttagtgggagtaattttata--ttgctagtttaatatgtcaattttattttatttagtcaacga 32895378  T
Q  444 tgatatat 451  Q
    ||||||||    
T  32895379 tgatatat 32895386  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 146 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 39729339 - 39729034
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| | |||||  || |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39729339 agctacataagatggatgtcaatacattttttctcaatggtgacattaatgatacaatatggtgcaacttaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 39729240  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || ||| |  ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| | |||||| ||  ||||||||||| ||||| |||||||| ||||     
T  39729239 tagatgttttgcaaagtcatgaaatccacttatgagttaagaaattagtctctttattgttactacatattctcataaagcaattatctcattttgtttt 39729140  T
Q  344 gagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaa 443  Q
    |||||  || |||||||| ||| |||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||  |  |||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||| |    
T  39729139 gagatgatattatggagaattgcggatttagcaaattcagtgggagtaagtttatattcat--agttgaatatgtcaattttattttatttagtcaacga 39729042  T
Q  444 tgatatat 451  Q
    ||||||||    
T  39729041 tgatatat 39729034  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 83; E-Value: 8e-39
Query Start/End: Original strand, 144 - 451
Target Start/End: Complemental strand, 5544282 - 5543963
Alignment:
Q  144 ggagctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaa 243  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||| ||| |||||||  || |||| ||||||||| ||||||  | || ||||||||||||||||| |||||||    
T  5544282 ggagctgcataagatggatttcaatatagtgtttcttaatggtgacattaacgatacaatatggtgcatatgaataaaacttttgtgtcaattgatacaa 5544183  T
Q  244 agtatatgg--tgcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttacc------------acgaattctcataaaacaattg 329  Q
    || | ||||  |||||| ||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||            |  || |||||||||   ||||    
T  5544182 agaaaatggtttgcaaagtcatgaaatccacttataagttaataaatttgtctctttagtgttaccaaaaaaaaaaaaaaaaaatctcataaagtgattg 5544083  T
Q  330 tctcatttggtttagagatagtaatatggagagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattt 429  Q
    ||| ||||||||| |||||| || |||||||| |||||||||||| ||| || |||||||||| ||||||  |||| |||||||   ||||||| |||||    
T  5544082 tcttatttggttttgagataatattatggagaattgtggatttagcaagttcggtgggagtaattttata--tttctagtttaatacgtcaattttattt 5543985  T
Q  430 tatttactcaacaatgatatat 451  Q
    |||| | ||||| |||||||||    
T  5543984 tattcaatcaacgatgatatat 5543963  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Original strand, 14414032 - 14414235
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||  || |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14414032 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttctcaatggtgacattaatgattcaatatggtgcaacttaagaaaactcttgtgtcaatagatacaaag 14414131  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
    || ||| |  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||  |||||||||||  |||| ||||||||| |||     
T  14414132 tagatgttttgcaaaatcatgaaatccacttatgagttaagaaatttgtctctttattgttactacatattctcataaagtaattatctcatttgatttt 14414231  T
Q  344 gaga 347  Q
    ||||    
T  14414232 gaga 14414235  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 2 - 104
Target Start/End: Original strand, 28211642 - 28211744
Alignment:
Q  2 tttattggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  28211642 tttaatggatatctatggataaaataaacggatattttaactacccactaattaatggatacgaatgcggatttaatagtatccacacccgcagatatcc 28211741  T
Q  102 ata 104  Q
    |||    
T  28211742 ata 28211744  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 260 - 449
Target Start/End: Original strand, 30413400 - 30413588
Alignment:
Q  260 tcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgtt-accacgaattctcataaaacaattgtctcatttggtttagagatagtaatatgg 358  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  | | |||| ||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||| || || |     
T  30413400 tcatgaaatccacttatgagttaagaaatttttctagttaatgtttaccacaaattctcataaagtaattgtctcatttgattttgagataatattaagt 30413499  T
Q  359 agagttgtggatttagtaagctcagtgggagtaaatttatatttttcaagtttaacgtgtcaattatattttatttactcaacaatgatat 449  Q
    ||| ||||| |||||||||||| | ||| |||||||||| |  ||| || ||||| ||||| ||| ||||||||||| | ||| |||||||    
T  30413500 agaattgtgaatttagtaagctaattggaagtaaatttaaa--tttaaattttaatgtgtcgattttattttatttagtaaactatgatat 30413588  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 7986935 - 7987033
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
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T  7986935 tggatatccatggataaaataaacggatttgtcaactacctgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtattcacacccgcggatatccatac 7987033  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 8226973 - 8227071
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| | ||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| |||||    
T  8226973 tggatatacatggataaaataaacggatcttttaactacccgctaattaatagatacggatgcggatttaatggtatccacacccgcggatattcatac 8227071  T

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Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 36582664 - 36582762
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||| | || |||||||||| | ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||    
T  36582664 tggatatccatgaataaaataaacggattttttaactatccactaattaatggatacggatgcggatttaatagtatacacacccgcgaatatccatac 36582762  T

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Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 7 - 104
Target Start/End: Original strand, 7968194 - 7968291
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccata 104  Q
    |||||||||||||| || |||||||||| | | ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||  ||| |||||||||| |||||||||    
T  7968194 tggatatccatggataaaataaacggatttttcaactacccgctaattaatggatacgcatgcggatttaatggtattcacacccgcgtatatccata 7968291  T

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Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Original strand, 9762659 - 9762757
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||| | ||||||||| ||||||||||| ||| |||||| ||||| ||  |||||||| || |||||||||||||    
T  9762659 tggatatccatggataaaataaacagattttttaactacctgctaattaatggatatggatgcggatttgatggtatccacatcctcggatatccatac 9762757  T

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Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 31006430 - 31006379
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatg 58  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  31006430 tggatatccatggataaaataaacggatattttaactatccgctaattaatg 31006379  T

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Target: scaffold0363 (Bit Score: 81; Significance: 1e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0363
Description:

Target: scaffold0363; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 146 - 347
Target Start/End: Complemental strand, 4679 - 4476
Alignment:
Q  146 agctgcataagatggatgtcaatacagtattttttaatggcaacgttaaggatacaataaggtgcaattaaagaaaacttttgtgtcaatagatacaaag 245  Q
    |||| |||||||||||||||||| || | ||| | |||||  || |||| ||| ||||| ||||||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4679 agctacataagatggatgtcaatgcattgtttctcaatggtgacattaatgattcaatatggtgcaacttaagaaaactcttgtgtcaatagatacaaag 4580  T
Q  246 tatatggt--gcaaaatcatgaaattcacttatgagttaagaaatttgtctcttaagtgttaccacgaattctcataaaacaattgtctcatttggttta 343  Q
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T  4579 tagatgttttgcaaaatcatgaaatccacttatgagttaagaaatttgtctctttattgttactacatattctcataaagtaattatctcatttgatttt 4480  T
Q  344 gaga 347  Q
    ||||    
T  4479 gaga 4476  T

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Target: scaffold0115 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0115
Description:

Target: scaffold0115; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 22372 - 22278
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
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T  22372 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgctaattaatggatacggatgcggatttaatggtatccgcacccgcggatatcc 22278  T

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Target: scaffold0634 (Bit Score: 51; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0634
Description:

Target: scaffold0634; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 9003 - 9097
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatcc 101  Q
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T  9003 tggatatccacggataaaataaatggatattttaactacccgttaattaatggatacggatgctgatttaatggtatccgcacccgcggatatcc 9097  T

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Target: scaffold0057 (Bit Score: 39; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 66936 - 66838
Alignment:
Q  7 tggatatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
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T  66936 tggatatccatggataaaataaacggatattttatctaccctctaattgatgaatatggatacatatttaatggtatccctacccgtggatattcatac 66838  T

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Target: scaffold0155 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 10 - 105
Target Start/End: Original strand, 6681 - 6776
Alignment:
Q  10 atatccatggaaaacataaacggatatcttaactacccgctaattaatgaatacggatgcagatttaataatatccacacccgcggatatccatac 105  Q
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T  6681 atatccatggataaaataaatggattttctaactaaccattaattaatggatacagatgcggatttaatggtatccacacccgtggatattcatac 6776  T

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