View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15566_low_3 (Length: 783)

Name: NF15566_low_3
Description: NF15566
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15566_low_3
NF15566_low_3
[»] chr7 (44 HSPs)
chr7 (17-464)||(734853-735300)
chr7 (463-643)||(19329840-19330020)
chr7 (465-643)||(8080305-8080483)
chr7 (465-643)||(7389389-7389566)
chr7 (465-643)||(38837217-38837395)
chr7 (465-643)||(4999436-4999614)
chr7 (470-647)||(35522881-35523058)
chr7 (468-627)||(3783998-3784157)
chr7 (463-617)||(35137531-35137685)
chr7 (465-638)||(19436114-19436287)
chr7 (464-625)||(38267039-38267200)
chr7 (465-643)||(40957707-40957885)
chr7 (466-643)||(32951415-32951592)
chr7 (463-647)||(21234399-21234583)
chr7 (465-643)||(3434562-3434730)
chr7 (465-647)||(46033719-46033901)
chr7 (463-618)||(3694365-3694520)
chr7 (463-647)||(31735882-31736059)
chr7 (463-647)||(8238210-8238395)
chr7 (465-647)||(26296644-26296826)
chr7 (465-574)||(36361904-36362013)
chr7 (465-643)||(36362026-36362192)
chr7 (465-645)||(41915741-41915921)
chr7 (465-647)||(38044197-38044379)
chr7 (464-647)||(41423681-41423864)
chr7 (465-647)||(22343361-22343543)
chr7 (506-646)||(16374743-16374883)
chr7 (465-645)||(18207180-18207359)
chr7 (465-643)||(11044188-11044356)
chr7 (464-645)||(39255844-39256024)
chr7 (465-645)||(7727906-7728086)
chr7 (465-647)||(35468773-35468955)
chr7 (505-647)||(27744227-27744369)
chr7 (465-591)||(36208173-36208299)
chr7 (465-647)||(12310906-12311086)
chr7 (465-647)||(46374742-46374902)
chr7 (465-647)||(40846031-40846213)
chr7 (464-617)||(32564374-32564527)
chr7 (465-597)||(10343531-10343663)
chr7 (470-646)||(2318160-2318338)
chr7 (466-646)||(32045838-32046018)
chr7 (551-644)||(1766702-1766795)
chr7 (465-645)||(45223042-45223222)
chr7 (602-643)||(36361847-36361888)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (461-643)||(53982007-53982189)
chr3 (464-643)||(33644199-33644378)
chr3 (466-643)||(31456690-31456867)
chr3 (465-643)||(49607414-49607592)
chr3 (465-643)||(54868817-54868995)
chr3 (470-643)||(52629305-52629478)
chr3 (462-647)||(26141448-26141635)
chr3 (465-647)||(8076393-8076575)
chr3 (465-647)||(51419278-51419460)
chr3 (465-650)||(11347837-11348022)
chr3 (465-647)||(41189682-41189864)
chr3 (465-647)||(47531865-47532047)
chr3 (464-647)||(20764833-20765016)
chr3 (465-643)||(17470405-17470583)
chr3 (465-647)||(33118768-33118951)
chr3 (470-647)||(26754700-26754877)
chr3 (465-643)||(36707350-36707524)
chr3 (464-647)||(30801651-30801834)
chr3 (465-647)||(35536626-35536808)
chr3 (469-643)||(48587023-48587187)
chr3 (465-643)||(9562999-9563177)
chr3 (465-643)||(11095289-11095453)
chr3 (465-647)||(14623757-14623939)
chr3 (465-647)||(24699873-24700054)
chr3 (465-574)||(27714882-27714991)
chr3 (466-645)||(13897975-13898154)
chr3 (465-645)||(48375626-48375806)
chr3 (464-647)||(45058471-45058653)
chr3 (465-647)||(8956762-8956944)
chr3 (487-648)||(36331246-36331407)
chr3 (465-648)||(35965699-35965874)
chr3 (473-642)||(39670019-39670188)
chr3 (470-647)||(42823116-42823293)
chr3 (506-645)||(1758379-1758515)
chr3 (465-582)||(11907371-11907488)
chr3 (472-647)||(35093592-35093767)
chr3 (468-647)||(25407065-25407245)
chr3 (465-591)||(41080709-41080833)
chr3 (465-647)||(21746106-21746283)
chr3 (550-645)||(43746424-43746519)
chr3 (579-643)||(27714825-27714889)
chr3 (465-527)||(36331416-36331478)
chr3 (609-654)||(11140954-11140999)
[»] chr8 (37 HSPs)
chr8 (465-643)||(14547922-14548100)
chr8 (462-643)||(23122519-23122700)
chr8 (463-643)||(504043-504223)
chr8 (465-643)||(12831047-12831225)
chr8 (462-643)||(34012218-34012399)
chr8 (465-647)||(37038479-37038661)
chr8 (466-646)||(5957831-5958011)
chr8 (463-643)||(15197331-15197511)
chr8 (464-644)||(40423864-40424044)
chr8 (463-647)||(43414499-43414683)
chr8 (465-627)||(1179878-1180040)
chr8 (464-647)||(15048099-15048282)
chr8 (465-625)||(44507027-44507187)
chr8 (465-650)||(10284546-10284731)
chr8 (484-647)||(8841350-8841513)
chr8 (465-647)||(4854781-4854963)
chr8 (466-643)||(9122196-9122363)
chr8 (470-605)||(10621047-10621182)
chr8 (465-643)||(34307216-34307394)
chr8 (465-643)||(24307715-24307893)
chr8 (465-647)||(42221515-42221697)
chr8 (465-647)||(15258847-15259029)
chr8 (465-609)||(16383377-16383521)
chr8 (465-644)||(16056322-16056501)
chr8 (465-643)||(30479396-30479574)
chr8 (558-631)||(42710228-42710301)
chr8 (465-647)||(32032725-32032906)
chr8 (465-645)||(17443825-17444005)
chr8 (465-646)||(25838197-25838370)
chr8 (462-591)||(20074916-20075037)
chr8 (519-647)||(42354506-42354634)
chr8 (465-625)||(14055532-14055692)
chr8 (520-647)||(40467755-40467882)
chr8 (541-647)||(32707921-32708029)
chr8 (461-647)||(30183794-30183979)
chr8 (465-528)||(24307629-24307692)
chr8 (507-584)||(38229470-38229547)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (465-643)||(41236347-41236525)
chr4 (465-647)||(29239886-29240068)
chr4 (465-643)||(48182971-48183149)
chr4 (464-643)||(6034043-6034222)
chr4 (464-643)||(54473455-54473634)
chr4 (465-647)||(50052346-50052528)
chr4 (456-643)||(42044289-42044476)
chr4 (465-630)||(480382-480547)
chr4 (464-625)||(11511402-11511563)
chr4 (464-647)||(31910191-31910374)
chr4 (464-647)||(50526089-50526272)
chr4 (465-643)||(24995029-24995207)
chr4 (465-643)||(23608235-23608413)
chr4 (463-645)||(40574777-40574959)
chr4 (465-605)||(29234205-29234345)
chr4 (509-647)||(41823926-41824064)
chr4 (465-647)||(19670634-19670816)
chr4 (463-647)||(3481652-3481826)
chr4 (459-645)||(29977879-29978065)
chr4 (465-647)||(55475191-55475373)
chr4 (470-643)||(53352496-53352660)
chr4 (465-647)||(50813810-50813992)
chr4 (465-647)||(29547877-29548059)
chr4 (465-647)||(47986208-47986389)
chr4 (483-644)||(17983664-17983825)
chr4 (473-647)||(28480186-28480360)
chr4 (473-647)||(28481061-28481235)
chr4 (473-647)||(28481936-28482110)
chr4 (465-647)||(32766958-32767140)
chr4 (462-647)||(18924413-18924598)
chr4 (465-646)||(48647645-48647826)
chr4 (473-647)||(29589658-29589831)
chr4 (503-644)||(56300086-56300227)
chr4 (465-647)||(44536664-44536845)
chr4 (465-593)||(55079685-55079814)
chr4 (465-593)||(8343135-8343263)
chr4 (465-644)||(47104544-47104723)
chr4 (550-645)||(43487793-43487883)
chr4 (509-641)||(18768972-18769103)
chr4 (509-617)||(18769153-18769260)
chr4 (464-588)||(29535376-29535499)
chr4 (596-647)||(1771315-1771366)
[»] chr6 (24 HSPs)
chr6 (462-643)||(32869675-32869856)
chr6 (463-643)||(17598552-17598732)
chr6 (468-643)||(22880580-22880755)
chr6 (465-647)||(31976248-31976430)
chr6 (465-643)||(11427616-11427796)
chr6 (465-643)||(29857827-29858005)
chr6 (465-643)||(6209388-6209565)
chr6 (465-647)||(31110679-31110859)
chr6 (465-631)||(15832577-15832743)
chr6 (464-614)||(31109351-31109501)
chr6 (459-647)||(15989960-15990148)
chr6 (465-647)||(30341278-30341460)
chr6 (468-625)||(23128067-23128224)
chr6 (464-647)||(15507942-15508125)
chr6 (463-647)||(31952948-31953132)
chr6 (469-645)||(28536408-28536582)
chr6 (464-647)||(4231547-4231730)
chr6 (466-609)||(946377-946520)
chr6 (509-645)||(30870058-30870193)
chr6 (465-587)||(12732482-12732604)
chr6 (470-617)||(9379660-9379807)
chr6 (601-647)||(22421997-22422043)
chr6 (465-530)||(22422053-22422118)
chr6 (596-647)||(26466799-26466850)
[»] chr1 (38 HSPs)
chr1 (462-643)||(27564657-27564838)
chr1 (464-643)||(48716204-48716383)
chr1 (465-647)||(32813247-32813429)
chr1 (464-643)||(9474798-9474977)
chr1 (465-643)||(2581915-2582093)
chr1 (465-631)||(38632255-38632421)
chr1 (465-647)||(51898601-51898783)
chr1 (463-643)||(47452242-47452422)
chr1 (465-643)||(3000319-3000497)
chr1 (465-643)||(38595154-38595332)
chr1 (465-643)||(41758805-41758983)
chr1 (463-643)||(37649196-37649376)
chr1 (465-636)||(50630458-50630629)
chr1 (465-643)||(8346309-8346488)
chr1 (465-645)||(49811447-49811627)
chr1 (465-643)||(43132-43310)
chr1 (485-647)||(45044478-45044640)
chr1 (459-594)||(44548347-44548482)
chr1 (459-643)||(26274426-26274607)
chr1 (466-647)||(11152296-11152476)
chr1 (464-647)||(50590918-50591101)
chr1 (465-647)||(5958918-5959100)
chr1 (465-647)||(37926356-37926538)
chr1 (462-647)||(3302451-3302636)
chr1 (464-647)||(41608411-41608594)
chr1 (470-647)||(44453984-44454165)
chr1 (465-645)||(23597011-23597191)
chr1 (495-614)||(13414791-13414910)
chr1 (463-647)||(26440732-26440906)
chr1 (463-647)||(6260868-6261052)
chr1 (463-647)||(47748441-47748624)
chr1 (508-605)||(48489343-48489440)
chr1 (506-647)||(44332289-44332430)
chr1 (470-645)||(34339968-34340133)
chr1 (506-560)||(44334175-44334229)
chr1 (465-629)||(7740733-7740897)
chr1 (590-647)||(35003294-35003351)
chr1 (619-648)||(37814777-37814806)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (459-635)||(9058474-9058650)
chr2 (463-643)||(13438341-13438521)
chr2 (463-647)||(40613820-40614004)
chr2 (460-643)||(10249304-10249487)
chr2 (468-643)||(28863458-28863633)
chr2 (465-643)||(17473020-17473198)
chr2 (462-643)||(28381577-28381758)
chr2 (465-643)||(7465657-7465835)
chr2 (465-647)||(20700815-20700997)
chr2 (465-643)||(32505570-32505748)
chr2 (463-643)||(19930742-19930922)
chr2 (464-643)||(40701477-40701656)
chr2 (465-636)||(33436029-33436200)
chr2 (465-643)||(30915463-30915641)
chr2 (464-643)||(4060684-4060863)
chr2 (465-647)||(36168836-36169018)
chr2 (465-647)||(38273061-38273242)
chr2 (465-647)||(42257193-42257375)
chr2 (465-647)||(2533124-2533305)
chr2 (465-643)||(38882733-38882913)
chr2 (648-770)||(2294825-2294947)
chr2 (465-643)||(5574422-5574588)
chr2 (471-647)||(3439985-3440161)
chr2 (465-647)||(26891422-26891604)
chr2 (463-631)||(27864702-27864857)
chr2 (463-647)||(43490119-43490303)
chr2 (481-647)||(13365369-13365535)
chr2 (465-647)||(38732354-38732536)
chr2 (483-644)||(2997408-2997569)
chr2 (459-608)||(17819961-17820110)
chr2 (508-647)||(3737986-3738125)
chr2 (465-647)||(45097653-45097835)
chr2 (465-591)||(33436211-33436337)
chr2 (465-647)||(17823784-17823970)
chr2 (487-645)||(41758607-41758767)
chr2 (550-646)||(44152012-44152108)
chr2 (466-594)||(41575138-41575267)
chr2 (515-647)||(3034901-3035033)
chr2 (648-711)||(2304667-2304730)
chr2 (717-770)||(2310704-2310757)
chr2 (472-645)||(21301420-21301593)
chr2 (515-625)||(3154193-3154303)
chr2 (465-643)||(15428663-15428840)
[»] chr5 (33 HSPs)
chr5 (465-643)||(2740274-2740452)
chr5 (465-631)||(36732876-36733042)
chr5 (462-643)||(33149560-33149741)
chr5 (465-648)||(15409527-15409710)
chr5 (468-643)||(18520806-18520981)
chr5 (461-643)||(40145403-40145585)
chr5 (465-638)||(13811652-13811825)
chr5 (463-643)||(14831812-14831992)
chr5 (464-643)||(35785198-35785377)
chr5 (465-645)||(35943812-35943992)
chr5 (465-646)||(6679698-6679879)
chr5 (464-647)||(26720515-26720698)
chr5 (464-647)||(26990264-26990447)
chr5 (463-604)||(28177773-28177914)
chr5 (465-647)||(31008988-31009170)
chr5 (465-647)||(3921183-3921365)
chr5 (463-592)||(42414275-42414404)
chr5 (465-647)||(2252086-2252268)
chr5 (466-644)||(36875537-36875702)
chr5 (456-647)||(6259919-6260110)
chr5 (465-646)||(33825243-33825424)
chr5 (509-647)||(21370048-21370186)
chr5 (465-647)||(39688815-39688997)
chr5 (513-643)||(31132392-31132512)
chr5 (465-647)||(20073434-20073616)
chr5 (466-647)||(16327902-16328083)
chr5 (537-647)||(2177436-2177546)
chr5 (488-625)||(39557457-39557594)
chr5 (465-645)||(9603813-9603993)
chr5 (465-556)||(41470425-41470516)
chr5 (465-614)||(38296203-38296352)
chr5 (470-528)||(10356639-10356698)
chr5 (586-647)||(33855082-33855143)
[»] scaffold1268 (1 HSPs)
scaffold1268 (463-646)||(848-1031)
[»] scaffold1267 (1 HSPs)
scaffold1267 (463-646)||(848-1031)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (465-643)||(4029-4207)
[»] scaffold0321 (1 HSPs)
scaffold0321 (465-643)||(10031-10209)
[»] scaffold0110 (1 HSPs)
scaffold0110 (459-647)||(8781-8969)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (481-646)||(152514-152679)
[»] scaffold0316 (2 HSPs)
scaffold0316 (561-647)||(17199-17285)
scaffold0316 (508-574)||(17097-17163)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 440; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 440; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 17 - 464
Target Start/End: Original strand, 734853 - 735300
Alignment:
Q  17 acataccaaatataaagaaagcagcaatccaaccaccagtttttgaaagatcctcaatggattttccatgaatattaacaggtgtagaacctcttgtata 116  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  734853 acataccaaatataaagaaagcagcaatccaaccaccagtttttgaaagatcctcaatggattttccatgaatattaacaggtgtagaacctcttgtata 734952  T
Q  117 acctcgccctaaagccatccttctatcctcagactcaatgaagaaaataccaagtttctttctgctcattgaagtgcatggtgtcccttgttgaggtgct 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  734953 acctcgccctaaagccatccttctatcctcagactcaatgaagaaaataccaagtttctttctgctcattgaagtgcatggtgtcccttgttgaggtgct 735052  T
Q  217 tctggtgacttgatctcacaagtatccattttactagctctaacacacaagagtgctagttagcacaaaaaactcacttttacatagaagggttcattac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  735053 tctggtgacttgatctcacaagtatccattttactagctctaacacacaagagtgctagatagcacaaaaaactcacttttacatagaagggttcattac 735152  T
Q  317 ttcatttgctcacctactcatgcatctaatgagagtgttatttgtgtgtaagagtggatgtagctaggactatataaccaaccatacacatttaatttat 416  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  735153 ttcatttgctcacctactcatgcatctaatgagagtgttatttgtgtgtaagagtggatgtagctaggactatataaccaaccatacacatttaatttat 735252  T
Q  417 gatcattttaaagagtttcatgactttatcgttttcacttttaaatat 464  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  735253 gatcattttaaagagtttcatgactttattgttttcacttttaaatat 735300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 19329840 - 19330020
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19329840 atgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacactt 19329939  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  19329940 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 19330020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 8080483 - 8080305
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8080483 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8080384  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  8080383 tcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 8080305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 7389389 - 7389566
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7389389 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 7389488  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  7389489 tcttttctctcctactctctcttcctaatacatggggtgtac-agggtgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 7389566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 38837217 - 38837395
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38837217 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacccttgtacacctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 38837316  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  38837317 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 38837395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 4999614 - 4999436
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4999614 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgatacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactttc 4999515  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4999514 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 4999436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 470 - 647
Target Start/End: Original strand, 35522881 - 35523058
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  35522881 atgatacatagacatccttaagtggcaatacaccatttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggatcccgcacaagcacactttctcttt 35522980  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  35522981 tctctcttcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtttatgtaacattttcc 35523058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 468 - 627
Target Start/End: Original strand, 3783998 - 3784157
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3783998 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttctct 3784097  T
Q  568 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagg 627  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||| |||||||||    
T  3784098 tttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagaatgtatgtgaataaagg 3784157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 463 - 617
Target Start/End: Original strand, 35137531 - 35137685
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  35137531 atgagtaatgataaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacactt 35137630  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 617  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35137631 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatg 35137685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 465 - 638
Target Start/End: Complemental strand, 19436287 - 19436114
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  19436287 gagtaatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcataagcacactttc 19436188  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgta 638  Q
    |||||||||| || || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||    
T  19436187 tcttttctcttctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgta 19436114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Original strand, 38267039 - 38267200
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38267039 tgagtaatgatacatagacacccttatgtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 38267138  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| ||||||    
T  38267139 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacgaaggtgtatggaaataaa 38267200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 40957707 - 40957885
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  40957707 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacactctttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgtacaagcacactttc 40957806  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| |||||| ||||    
T  40957807 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataatgggtgtctatgtatcatt 40957885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 466 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 32951592 - 32951415
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| || ||||| | | ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32951592 agtaatgatacatagacactcttagatgacaatacatcctttaacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 32951493  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||    
T  32951492 cttttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaggggtgtctatgtatcatt 32951415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 21234399 - 21234583
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||||||||||| ||    
T  21234399 atgagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacaccctttgacactcacacaaaaatttgacacgtagccacatgtaccccgcacaagcacattt 21234498  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21234499 tctcttacctctcctttcctctcttcctaatgtatggggtgtacaatggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 21234583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 3434562 - 3434730
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3434562 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 3434661  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||          |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  3434662 tctt----------ttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggctgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 3434730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 46033901 - 46033719
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||| |  |||||||||||||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||||| | ||||    
T  46033901 gagttatgatacatagatattcttaggtggcaatacaccctttaacacccacataaaaatctgacacgtggtcacatgaactccgcacaagcatattttc 46033802  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46033801 tcttttctctcctcttctctattcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46033719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 463 - 618
Target Start/End: Original strand, 3694365 - 3694520
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3694365 atgaataatgatatatacacacccttaggtgacaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggatcccgcacaagcacactt 3694464  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgg 618  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  3694465 tctcttttctctcctcttctctcttcccaatgcatggggtgtacaagagtgtatgg 3694520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 31735882 - 31736059
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||| |||||||||||||       ||||| | ||| |||| |||||||||||||||||    
T  31735882 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttaacacccacacaaa-------cacgtggccacatggatcccgcacaagcacactt 31735974  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| |||||||||||    
T  31735975 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtatctatctaacattttcc 31736059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 8238210 - 8238395
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacaccct-taggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||| |||||    
T  8238210 atgagttatgatacataaacaccctgtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcatatggaccccgcacaagtacact 8238309  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| || || |||||||||||||||    
T  8238310 ttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggcgtctatgtaacattttcc 8238395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 26296644 - 26296826
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||| |||| | ||  |||||||||||||||| || ||||    
T  26296644 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatataccctttaacatccacataaaaatctgatacgtggccatatggaccccgcacaagcgcattttc 26296743  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||    
T  26296744 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgtatgaggtgtacaagggtgtatggaaatatatggtgtctacgtaacattttcc 26296826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 36362013 - 36361904
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36362013 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36361914  T
Q  565 tcttttctct 574  Q
    ||||||||||    
T  36361913 tcttttctct 36361904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 36362026 - 36362192
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  36362026 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 36362125  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||            ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36362126 tcttt------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36362192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 41915741 - 41915921
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  41915741 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacctacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 41915840  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||    
T  41915841 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 41915921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 38044197 - 38044379
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||||||| |||| ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38044197 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctgacatgtagccatatggaccccgcacaagtacactttc 38044296  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || || ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38044297 tctttcttcttctcttttctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38044379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 88; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Original strand, 41423681 - 41423864
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| | |||| ||| |||| |||  |||||||  |||||||||||||||| || ||||||| || |||| ||||||| | |||    
T  41423681 tgagttatgatacatagacatcattagatggtaatacacctcttgacacttacacaaaaatctgacatgtggtcacgtagatcccgtacaagcatatttt 41423780  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  |||||| ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  41423781 ctctttcatctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 41423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 22343361 - 22343543
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  22343361 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttc 22343460  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  22343461 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 22343543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 506 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 16374883 - 16374743
Alignment:
Q  506 ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| | | ||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||||||||||||||||| |||||    
T  16374883 ttgacatccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggatctcacacaagcacacattctctttcatctctttttctctcttcctaatgtatggagtgta 16374784  T
Q  606 caagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16374783 caaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttc 16374743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 18207180 - 18207359
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||| |||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  18207180 gagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctaacacgtgg-cacgtgaaccccacacaagcacactttc 18207278  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||  |||||| ||||||||||||| || || | |||||||||||||||||  |||||||||| | ||| |||||||||    
T  18207279 tctttcatctcctcttctctcttcctagtggatagagtgtacaagggtgtatgataataaagggtatctatctaacatttt 18207359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 11044188 - 11044356
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||          ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  11044188 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcctttgacaccc----------ctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagtacactttc 11044277  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||| ||||    
T  11044278 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaaaggtgtatgaaaataaagagtgtctatgtatcatt 11044356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 82; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 464 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 39256024 - 39255844
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||||||||||| | ||||||||| || |||||| |||||||    
T  39256024 tgagttatgatacatagacaaccttaggtggcaatacaccacttgatacccatacaaaaatctgacacgt-ggcacgtggactccacacaagaacacttt 39255926  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||||  |||||| |||||||||||   || || |  ||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||    
T  39255925 ctctttcatctcctcttctctcttcccggtggatagaatgtacaagggtgtatgataataaagggtgtctatgtaacatttt 39255844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 7727906 - 7728086
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||| |||| |||  ||||||  |||| |||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  7727906 gagttatgatacataaacacccttaggtggtaatacacctcttgacattcacataaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 7728005  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    | |||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||    
T  7728006 tgtttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatttt 7728086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 35468955 - 35468773
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||| | | ||   || |||||||| |||||| |||||||||    
T  35468955 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctaatatgtgaccatgtggaccctgcacaaacacactttc 35468856  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| |  ||| | |||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35468855 tctttcctatcctcttctctcttcctagttcatgagatgtataaggatgtatgagaataaaaggtgtatatgtaacattttcc 35468773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 505 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 27744369 - 27744227
Alignment:
Q  505 tttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgt 604  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || | |||||||| ||| || ||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||| || ||||| |||    
T  27744369 tttgatacccacacaaaaatctgacatgtggccacgtggatccctcataagcacattttctctatcctctcctcttctctcttcctagtgcatgggatgt 27744270  T
Q  605 acaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||| | |||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  27744269 acaaggatatatgggaataaatggtgtttatataacattttcc 27744227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Original strand, 36208173 - 36208299
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  36208173 gagttatgatacatagacacccttaggtggtaatacattcattgacacccacacaaaaagctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 36208272  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttccta 591  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  36208273 tctttcctctcctcttctctcttccta 36208299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 12310906 - 12311086
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |  | || | ||| |||||||||||||| || |||||||||| || | ||||||||| |||     
T  12310906 gagttatgatacatagacacccttaggtggaaatatatc--tggatatccatacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcctgaacaagcacatttta 12311003  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||| | ||   | ||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  12311004 tctttcctttcctcttctctcttcctagtatacaagatgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 12311086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 46374902 - 46374742
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||         
T  46374902 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaacacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcaca----- 46374808  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  46374807 -----------------tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 46374742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 40846213 - 40846031
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||| |||||||||||||| ||| ||||| |  ||||||||||||||  ||||||||    
T  40846213 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacatccacacaaaaatctaacatgtagttatatggaccccgcacaaatacactttc 40846114  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||   ||| | ||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  40846113 tctttcttcttctcttctctcttcctaaaagatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 40846031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 464 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 32564527 - 32564374
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||| |||  |||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || |  |  ||||||||||||||  |||||||    
T  32564527 tgagttatgatacataaacattcttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggctatatggaccccgcacaaatacacttt 32564428  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 617  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||    
T  32564427 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatg 32564374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 465 - 597
Target Start/End: Complemental strand, 10343663 - 10343531
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||   |||||||||||||||||||||||||| |  |  ||||||| | ||| | ||||||||||    
T  10343663 gagtaatgatacatagacacccttaggtggaaatacacatcttgacacccacacaaaaatctgacacatgtttccgtggactctgcagacgcacactttc 10343564  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtat 597  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| |||||    
T  10343563 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgtat 10343531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 470 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 2318338 - 2318160
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||  ||| || |||||||||| | |||  ||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||  || ||||| |||||||||||    
T  2318338 atgatacattaacaaccataggtggcaagacacctcttgacacccacacaaaaatctgacgtgtggtcacgtggacccgacataagcatactttctcttt 2318239  T
Q  570 tctctcctattctctct-tc-ctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
      |||| | |||||||| || |||||| |||| |||||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||    
T  2318238 catctcatcttctctctctctctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatggaaataaagtgtgtctatgtaacattttc 2318160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 466 - 646
Target Start/End: Original strand, 32045838 - 32046018
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    |||||||||||||| | |  ||||||||||||||||  | | |||||||||| ||||||||||||||||  ||  | ||||||  || |||| |||||||    
T  32045838 agtaatgatacatatatattcttaggtggcaatatattactggacacccacataaaaatctgacacgtaaccatatagaccccatactagcatactttct 32045937  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
     |||  |||| | ||||||||| | ||| |||| | ||||||||||||||||  |||||||  ||| ||||||||||||||    
T  32045938 ttttcatctcatcttctctctttcaaatatatgagatgtacaagggtgtatgtaaataaagaatgtctatgtaacattttc 32046018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 551 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 1766795 - 1766702
Alignment:
Q  551 acaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || | |||| ||| |||||| || |||| ||| |||| |||| ||||||||||||    
T  1766795 acaagcacactttctctttcctctcctcttctctcttcgtagtatatgaggtatacaagagtatatgagaacaaagtgtgtctatgtaacattt 1766702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 45223042 - 45223222
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |   ||  ||| | |||||||||||||||||||| |||  |  ||| |  |||||| || ||||    
T  45223042 gagtaatgatatatatacatccttaggtggcaatacattcttgaacatctacacaaaaatctgacacgtaatcatattaacctcatacaagcgcattttc 45223141  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||  |||| | ||||||||| | ||| |||||||||||||| | ||||||  |||||||| ||| ||||| |||||||    
T  45223142 tctttcatctcatcttctctctttcaaatatatggggtgtacaaagatgtatgtaaataaaggatgtctatgtgacatttt 45223222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 602 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 36361888 - 36361847
Alignment:
Q  602 tgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  36361888 tgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 36361847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 155; Significance: 7e-82; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 7e-82
Query Start/End: Original strand, 461 - 643
Target Start/End: Original strand, 53982007 - 53982189
Alignment:
Q  461 atatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53982007 atatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 53982106  T
Q  561 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  53982107 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggttgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 53982189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Original strand, 33644199 - 33644378
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33644199 tgagtaatgatacatagacacccttgggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 33644298  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  33644299 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 33644378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 466 - 643
Target Start/End: Original strand, 31456690 - 31456867
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31456690 agtaatgatacatagacacccataggcggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttct 31456789  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  31456790 cttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgcatgggaataaagggtgtttatgtatcatt 31456867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 49607414 - 49607592
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  49607414 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttc 49607513  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  49607514 tcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatgacgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 49607592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 54868995 - 54868817
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  54868995 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacactttc 54868896  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  54868895 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 54868817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 470 - 643
Target Start/End: Original strand, 52629305 - 52629478
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  52629305 atgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttctcttt 52629404  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  52629405 tctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 52629478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 2e-66
Query Start/End: Original strand, 462 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 26141635 - 26141448
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  26141635 tatgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccacacaagcacact 26141536  T
Q  562 ttctcttttctctcctattc--tctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  26141535 ttctcttttctctcctcttctttctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 26141448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 8076393 - 8076575
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8076393 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 8076492  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8076493 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8076575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 51419460 - 51419278
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| | | ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||||||||||||||||||||    
T  51419460 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatagaccccgcacaagcacactttc 51419361  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  51419360 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtttatgtaacattttcc 51419278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 122; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 465 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 11348022 - 11347837
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| | | ||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||| ||| ||||||||||||    
T  11348022 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacatcctttgacatccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccctgcataagcacactttc 11347923  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaa 650  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  11347922 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtataagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaccattttcccaa 11347837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 41189864 - 41189682
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41189864 gagttatgatacatatacatccttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 41189765  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  41189764 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggagtgtacaagagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 41189682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 47531865 - 47532047
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||| ||| |||||||| |||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||||||    
T  47531865 gagttatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttaacatccacacaagaatctgacacgtggccatatgaaccccgcacaagcacactttc 47531964  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47531965 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggaatgtacaagtgtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 47532047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 116; E-Value: 1e-58
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 20765016 - 20764833
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||||||||    
T  20765016 tgagttatgagacatagacatccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgtacaagcacacttt 20764917  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20764916 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 20764833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 17470405 - 17470583
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  17470405 gagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 17470504  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| |||||||   |||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  17470505 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaatatgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 17470583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 33118951 - 33118768
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||    
T  33118951 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatccctcagaaacacactttc 33118852  T
Q  565 tcttttctctcct-attctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| |||||||  |||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  33118851 tctttcctctcctccttctctctccctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctacgtaacattttcc 33118768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 470 - 647
Target Start/End: Original strand, 26754700 - 26754877
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26754700 atgattcatagacacccttaggtggcaatacacccttggacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctcttt 26754799  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     ||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||    
T  26754800 cctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagagtgtctatgtaacattttcc 26754877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 36707524 - 36707350
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    ||||||||||    
T  36707524 gagtaatgatacatagatacccttaggtgacaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgc----gcacactttc 36707429  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  36707428 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagaatgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 36707350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 5e-49
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 30801834 - 30801651
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||  |||||||| |||||||||| |||    
T  30801834 tgagcaatgatacatagacacccttaggtgataatacaccctttgatacccacacaaaaatatgacatgtagtcatatggaccccacacaagcacatttt 30801735  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||| ||||| | ||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  30801734 ctctttcctctcatcttctctcttcctagtacatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 30801651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 35536626 - 35536808
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||| |||| |||||||   ||||||||||||| |    
T  35536626 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccatttgacacccacataaaaatgtgacacgtggtcatgtggaccttacacaagcacacttcc 35536725  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  35536726 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 35536808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 469 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 48587187 - 48587023
Alignment:
Q  469 aatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 568  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  48587187 aatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacacctacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagtacactttctctt 48587088  T
Q  569 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||          ||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48587087 ttc----------tctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtatatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48587023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 9562999 - 9563177
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| || ||||| | | ||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||    
T  9562999 gagtaatgatacataaacaccattagatgacaatacaacctttgacatccatataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaacacactttc 9563098  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||| ||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  9563099 tctcttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagttgtacaaaggtgtatgggaataaagggtatctatgtatcatt 9563177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 11095453 - 11095289
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| || |||||||||    
T  11095453 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt--accccgcataaacacactttc 11095356  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||            ||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11095355 tcttt------------tctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11095289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 14623939 - 14623757
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| | |||||||||||||||    
T  14623939 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttc 14623840  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||| ||| || ||| |||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  14623839 tctttcatcttctcttctctctttctagtgcatgaggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 14623757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 24700054 - 24699873
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||| | |||| |||||||||    
T  24700054 gagtaatgatacatagacatccttagttggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctggcacgtggccacgtggaccctgtacaaacacactttc 24699955  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | |||| |||||| || | |||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  24699954 tctttcctctcctcttctctcttcctagtttatgaggtgtataa-gatgtatgagaataaaagatgtctatgtaacattttcc 24699873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 465 - 574
Target Start/End: Complemental strand, 27714991 - 27714882
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27714991 gagtaatgatacatagacacctttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactttc 27714892  T
Q  565 tcttttctct 574  Q
    |||| |||||    
T  27714891 tcttctctct 27714882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 80; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 466 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 13898154 - 13897975
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    |||||||||| ||| ||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||||||| | ||||||||||||||||    
T  13898154 agtaatgatagataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtggacctcacacaagcacactttct 13898055  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||  ||| || |||||||| |||| ||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  13898054 ctttcatcttctcttctctctccctagtgtatggggtgtagaaaagtgtatgagaataaatggtgtctatctaacatttt 13897975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 48375806 - 48375626
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| |||  |  | | ||| |||||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  48375806 gagttatgattcatagacacccttaggtgacaatacacccctgaaaatccatacaaaaatctgacgtgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttc 48375707  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| |||||||||| | ||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  48375706 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatatagggtgtacaaagatgtatggaaataaagggtgtctatgtaacatttt 48375626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 45058653 - 45058471
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||||| |||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||| | |||||    
T  45058653 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccacataaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtatacttt 45058555  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  45058554 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaatggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 45058471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 8956762 - 8956944
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||   ||||||||||||| |    
T  8956762 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacatcctttgacacccacataaaaatgtgacacgtgttcatgtggaccttacacaagcacacttcc 8956861  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||| || |  ||||||| ||||||||||| ||||||| | ||| |||||||||||||||    
T  8956862 tctttcatcttctcttctctcttcctagtgcacagggtgtagaagggtgtatgagaataaatgctgtctatgtaacattttcc 8956944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 487 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 36331407 - 36331246
Alignment:
Q  487 ttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctct 586  Q
    ||||||||||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||    
T  36331407 ttaggtggcaatgcaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttctctct 36331308  T
Q  587 tcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 648  Q
    |||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| | ||| ||||||||||||||||    
T  36331307 tcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaagatgtatatgtaacattttccc 36331246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 35965874 - 35965699
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||| |||  |||| | | ||||||||||||| |||||||||||||||        ||| || ||||||||||||||||    
T  35965874 gagtaatgatacatatacatccttaagtgataatacatcctttgacacccacataaaaatctgacacgt--------ggatcctgcacaagcacactttc 35965783  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 648  Q
    ||||| ||||||| || ||| ||| ||||  ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  35965782 tctttcctctcctcttttcttttcttaattcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtaacattttccc 35965699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 473 - 642
Target Start/End: Original strand, 39670019 - 39670188
Alignment:
Q  473 atacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 572  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||| |  |||||| | | | |||||| ||||||||  ||| ||||||| || ||| |||||||| |||||||||    
T  39670019 atacatagacatccttatgtggcaatatatcccttgacatctatataaaaatttgacacgtgatcatgtggacctcgtacacgcacacttcctcttttct 39670118  T
Q  573 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacat 642  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||| | |||||||||||||| || |||||| | ||| | ||||||||    
T  39670119 ctcctcttctctcttcttaatgtatgagatgtacaagggtgtacggaaataaatgatgtctgtgtaacat 39670188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 470 - 647
Target Start/End: Original strand, 42823116 - 42823293
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||| ||||| ||| |||| |||| |||  |||||||||||| |||||| ||||| || ||||  ||||||||||| ||| | |||||||||||    
T  42823116 atgatacataaacaccattatgtggtaatacaccccttgacacccacaaaaaaatttgacatgtggtcatatggaccccgcataagtatactttctcttt 42823215  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
      | | || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  42823216 cttattctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 42823293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 506 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 1758515 - 1758379
Alignment:
Q  506 ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | || |||||||| || ||||| |||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  1758515 ttgacacccacacaaaaatctgacatatggttacgtggactccacacaaacacattttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcat-gggtgta 1758417  T
Q  606 caagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||||    
T  1758416 caaaggtgtat--gaataaacagtgtttatgtaacatttt 1758379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 465 - 582
Target Start/End: Original strand, 11907371 - 11907488
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |  |||| ||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  11907371 gagttatgatacatagacacccttaggtgacaatacacacctgaacactcacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagcacattttc 11907470  T
Q  565 tcttttctctcctattct 582  Q
    ||||||||||||| ||||    
T  11907471 tcttttctctcctcttct 11907488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 472 - 647
Target Start/End: Original strand, 35093592 - 35093767
Alignment:
Q  472 gatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 571  Q
    |||||||||||| | ||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||| || |||| ||| || ||  ||||||||||||||||||       
T  35093592 gatacatagacaactttaggtgacaatacaacatttgacatccacgcaaaaatctgacatgtggtcatgtgaactccatacaagcacactttctcttgca 35093691  T
Q  572 tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||  | ||||||||||||| || ||| | ||||||| |||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  35093692 tctttttttctctcttcctagtgcatgagatgtacaaaggtgtatgagaataaatgatgtctaggtaacattttcc 35093767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 468 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 25407245 - 25407065
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacac-aaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctc 566  Q
    |||||||||||| ||| || ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||  |||  |||| ||| ||||| |||||||||||    
T  25407245 taatgatacatacacaaccataggtggcaatataccccttgacacacacacaaaaaatctgacacgtgatcatatggatcccacacaaacacactttctc 25407146  T
Q  567 ttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||  |||||| ||||||||  |||||||||  |||||| ||   | |||  ||||||||||||  ||| |||||||||||    
T  25407145 tttcatctcctcttctctctcactaatgtataaggtgtataaatatatataagaataaagggtgactatataacattttcc 25407065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Original strand, 41080709 - 41080833
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||| | ||| |||||||||||| ||||||||||| | || |||| ||||||||  |||||||||| ||||    
T  41080709 gagtaatgatacatagacatccttag-tagcaaaacaccctttgacacccacgcaaaaatctgatatgtggtcatgtggaccca-cacaagcacattttc 41080806  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttccta 591  Q
    |||||  |||||| |||||||||||||    
T  41080807 tctttcatctcctcttctctcttccta 41080833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 21746283 - 21746106
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacaccc--acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    | |||||||  ||||||||||||||||||||        ||||||  ||||||||||||    
T  21746283 gagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctggacacccccacacaaaaatctgacacgtaa-------gaccccatacaagcacactt 21746191  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||  |||||| | |||  |||||| |||||||    
T  21746190 tctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatgaggtgtacaagggtgtatgtaaataaatgatgtccatgtaatattttcc 21746106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Original strand, 43746424 - 43746519
Alignment:
Q  550 cacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||| |||| |||||||||  |||||| |||| |||||||| || ||| ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||    
T  43746424 cacaaacacaatttctctttcatctcctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgacaacaaagggtgtttatgtaacatttt 43746519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 579 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 27714889 - 27714825
Alignment:
Q  579 ttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||| ||||    
T  27714889 ttctctcttcccaatacatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagagtgtatatgtatcatt 27714825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 465 - 527
Target Start/End: Complemental strand, 36331478 - 36331416
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctg 527  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||||||  |||  |||||| |||||||||||||||    
T  36331478 gagttatgatacataaacacccttagatggcaatgcaccccttgacatccacacaaaaatctg 36331416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 609 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 11140999 - 11140954
Alignment:
Q  609 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaacaca 654  Q
    ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  11140999 gggtgtatgagactaaagggtgtctatgtaacattttccaaacaca 11140954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 37)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 14547922 - 14548100
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14547922 gagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 14548021  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14548022 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14548100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 23122700 - 23122519
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23122700 tatgagtaatgatacatagacacccttaagtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacact 23122601  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  23122600 ttctcttttctctcctgttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 23122519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 504223 - 504043
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  504223 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacat 504124  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  504123 tctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 504043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 12831047 - 12831225
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12831047 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 12831146  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  12831147 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtatcatt 12831225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 34012399 - 34012218
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  34012399 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacact 34012300  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  34012299 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 34012218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 37038479 - 37038661
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37038479 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 37038578  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  37038579 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 37038661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 466 - 646
Target Start/End: Original strand, 5957831 - 5958011
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    ||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  5957831 agtaatgatacatagacattcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaatcacactttct 5957930  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  5957931 ctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttc 5958011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 15197331 - 15197511
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15197331 atgagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 15197430  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||| ||||    
T  15197431 tctcttttctctcctcttttctcttccaaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaagtgtctatgtatcatt 15197511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 464 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 40424044 - 40423864
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  40424044 tgagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacacttt 40423945  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  40423944 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcattt 40423864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 43414683 - 43414499
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||||||||||||||||    
T  43414683 atgagttatgatacatagacatccttagatggcaacacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtggtcacatggatcccgcacaagcacactt 43414584  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  43414583 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggcaataaagggtgtctatgtaacattttcc 43414499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 1180040 - 1179878
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||    
T  1180040 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggattccgcacaagcacactttc 1179941  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagg 627  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  1179940 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatatatgggaataaagg 1179878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15048282 - 15048099
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  15048282 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacacttt 15048184  T
Q  564 ctcttttc-tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15048183 ctctttttatctcctcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagggtgtatcggaataaagggtgtctatataacattttcc 15048099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 465 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 44507187 - 44507027
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  44507187 gagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacactctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcatactttc 44507088  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  44507087 tcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaa 44507027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 465 - 650
Target Start/End: Complemental strand, 10284731 - 10284546
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10284731 gagttatgatacatagacacccttaagtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 10284632  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcccaa 650  Q
    ||||| || || | ||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||  ||||||| ||||| ||||||||||||||||||    
T  10284631 tctttcctttcatcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaggttgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcccaa 10284546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 484 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 8841513 - 8841350
Alignment:
Q  484 cccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctc 583  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  8841513 cccttaggtggcagtacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttcctctcctcttctc 8841414  T
Q  584 tcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | |||||| || |||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8841413 ttttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 8841350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 4854963 - 4854781
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| |||||||||| | || | ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  4854963 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacataaaaatctgatatgtggccacatggaccctgcacaagcacactttc 4854864  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  4854863 tcttttctctcctcttctctcttactaatgtatgggatgtacaagggtatatgagaataaagagtgtctatgtaacattttcc 4854781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 466 - 643
Target Start/End: Original strand, 9122196 - 9122363
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||          ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  9122196 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaata----------cacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 9122285  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||| |||||| ||||    
T  9122286 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagaatgtctatgtatcatt 9122363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 470 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 10621182 - 10621047
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||    
T  10621182 atgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatcgatcccgcacaagcacactttctcttt 10621083  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||    
T  10621082 tctctcctcttctctcttcctaatatatgggatgta 10621047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 34307216 - 34307394
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  || |||||||||||| ||||||||    
T  34307216 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggacatatgaaccccgcacaagtacactttc 34307315  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  34307316 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 34307394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 24307893 - 24307715
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  24307893 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 24307794  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  24307793 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 24307715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 83; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 42221515 - 42221697
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||| |    | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  ||||||||||||||    
T  42221515 gagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatacattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacactttc 42221614  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  42221615 tctttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtttatataacattttcc 42221697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15259029 - 15258847
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||| || ||||| |||||||| | |  | |||| ||||| |||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  15259029 gagttatgatacatagatactcttagatggcaatacatccctggacatccacataaaaatctgacatgtggtcacgtggaccctgcacaagcacattttc 15258930  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| || |||||||  |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  15258929 tctttcctctcctcttctctcttcctagaatataggatgtacaaaagtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 15258847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 465 - 609
Target Start/End: Original strand, 16383377 - 16383521
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  16383377 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16383476  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaag 609  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  16383477 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaag 16383521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 16056501 - 16056322
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  16056501 gagttatgatacataaacatccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 16056402  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||    
T  16056401 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattt 16056322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 30479574 - 30479396
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||| || |  |  |||||| |||||||| ||||||||    
T  30479574 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacataaaaatctgacatgtggctatatggacctcgcacaagtacactttc 30479475  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||    
T  30479474 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacatt 30479396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 558 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 42710301 - 42710228
Alignment:
Q  558 cactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 631  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42710301 cactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 42710228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 32032725 - 32032906
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||| |||||||||||||||||| || | ||  |||| || ||||||| ||||||||    
T  32032725 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcctgcacaagtacactttc 32032823  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||   || || |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  32032824 tctttctccttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 32032906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 17443825 - 17444005
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||  ||||||||    
T  17443825 gagttatgatacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaagacactttc 17443924  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||  ||| || ||||||||||| | || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||    
T  17443925 tctttcatcttctcttctctcttcccagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacatttt 17444005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 465 - 646
Target Start/End: Original strand, 25838197 - 25838370
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||| ||||| | ||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||||        ||||| ||||| ||||| ||| |||||||||||||     
T  25838197 gagttatgataaatagatatccttaggtggcaatacactttttgacatccacacaa--------cacgttgtcacatggactccgtacaagcacactttt 25838288  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||| | | ||||||||||||||    
T  25838289 tcttttctctcctcttctcttttgctaatgtatagggtgtacaaggttgtatggcaataaaggatatctatgtaacattttc 25838370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 462 - 591
Target Start/End: Complemental strand, 20075037 - 20074916
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| |||||| |||        ||||||||||| |||||||||||||    
T  20075037 tatgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacactctttgacacccacataaaaatgtga--------cacgtggaccctgcacaagcacact 20074946  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttccta 591  Q
    |||||||| |||| || |||||||||||||    
T  20074945 ttctctttcctcttctcttctctcttccta 20074916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 519 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 42354634 - 42354506
Alignment:
Q  519 aaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgg 618  Q
    |||||||||||||||  ||| ||||| | | || |||||||||||||||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||     
T  42354634 aaaaatctgacacgtgttcatgtggatctcacataagcacactttctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaagggtgtatga 42354535  T
Q  619 gaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  42354534 gaataaatggtgtctatgtaacattttcc 42354506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 465 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 14055692 - 14055532
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc-gcacaagcacacttt 563  Q
    |||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||   |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||    
T  14055692 gagttatgatacattgacacccttaggtgacaatacactccttgacatccacacaaaaatcttacatgtagtcacgtggacccctacacaagc-cacttt 14055594  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
     ||||| ||||  | |||||||||| ||||| ||| ||| ||||| |||||||| |||||||    
T  14055593 ttctttcctctgatcttctctcttcttaatgaatgaggtatacaaaggtgtatgagaataaa 14055532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 520 - 647
Target Start/End: Original strand, 40467755 - 40467882
Alignment:
Q  520 aaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatggg 619  Q
    ||||||||||| ||   |||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||   | ||||||    
T  40467755 aaaatctgacatgtgaccacgtggacttcgcacaagcacactttctctttcctctcatcttctctcttcctagtctatggggtgtacaaaaatttatggg 40467854  T
Q  620 aataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  40467855 gataaaaggtgtctatgtaacattttcc 40467882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 541 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 32708029 - 32707921
Alignment:
Q  541 tggaccccgcacaag--cacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgta 638  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||    
T  32708029 tggaccccgcacaagtacacactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgta 32707930  T
Q  639 acattttcc 647  Q
    |||||||||    
T  32707929 acattttcc 32707921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 461 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 30183979 - 30183794
Alignment:
Q  461 atatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 560  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||| |    | ||||| || |||||||||||| ||||| |||  |||||  |  | ||||||||    
T  30183979 atatgagtaatgatacatatacatccttacgtggcaatacattcctggacactcatacaaaaatctgatacgtaatcatatggacttcatataagcacac 30183880  T
Q  561 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||  | || | |||| |||||| ||| ||||||||||||||| |||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  30183879 tttctctttcat-tcatcttctttcttccaaatatatggggtgtacaagagtgtatgtaaataaaggatgtctatctaacattttcc 30183794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 528
Target Start/End: Original strand, 24307629 - 24307692
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctga 528  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||    
T  24307629 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatccattgacacccacacaaaaatctga 24307692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 507 - 584
Target Start/End: Original strand, 38229470 - 38229547
Alignment:
Q  507 tgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctct 584  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||  | | ||||||||| ||||||||| |||| || ||||||    
T  38229470 tgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggattctgtacaagcacattttctctttcctcttctcttctct 38229547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 151; Significance: 2e-79; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 2e-79
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 41236347 - 41236525
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41236347 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 41236446  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  41236447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 41236525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 29239886 - 29240068
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29239886 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 29239985  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29239986 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 29240068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 48183149 - 48182971
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48183149 gagtaatgatacatagacacccttacgtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 48183050  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  48183049 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 48182971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Original strand, 6034043 - 6034222
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6034043 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtagtcacgtggatcccgcacaagcacacttt 6034142  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||    
T  6034143 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatgtatcatt 6034222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 54473634 - 54473455
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54473634 tgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 54473535  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  54473534 atcttttctctcctcttctctcttcctaatacatggagtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgttcatgtatcatt 54473455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 50052528 - 50052346
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50052528 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50052429  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  50052428 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcataaggtgtacaaaggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 50052346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 456 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 42044476 - 42044289
Alignment:
Q  456 tttaaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaag 555  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42044476 tttaaaaaagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatccttgtacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaag 42044377  T
Q  556 cacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  42044376 cacactttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaagggtgtctatgtatcatt 42044289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 130; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 465 - 630
Target Start/End: Complemental strand, 480547 - 480382
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  480547 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 480448  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtg 630  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||| |||||    
T  480447 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaaggtgtatggaaataatgggtg 480382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 126; E-Value: 1e-64
Query Start/End: Original strand, 464 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 11511563 - 11511402
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11511563 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 11511464  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
    ||||||||||| || |||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  11511463 ctcttttctcttctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtacaagggtgtatggaaataaa 11511402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Original strand, 31910191 - 31910374
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  31910191 tgagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagccacatggaccccgcacaagcacacttt 31910290  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31910291 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgtatgggatgtacaagagtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31910374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 50526272 - 50526089
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  50526272 tgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtggattccgcacaagcacgcttt 50526173  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    || ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  50526172 ctatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 50526089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 24995207 - 24995029
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24995207 gagtaatgatatatggacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacataaaaatttgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacattttc 24995108  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  24995107 tcttttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaatggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 24995029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 23608235 - 23608413
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  23608235 gagtaatgatatatagacacccttagatgacaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgaactccacacaagcacactttc 23608334  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||||||| ||| |||||| ||||    
T  23608335 tcttttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacagggatgtatgggaataaaggatgtctatgtatcatt 23608413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 463 - 645
Target Start/End: Original strand, 40574777 - 40574959
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  |  || |||| |||| ||||||||||||    
T  40574777 atgagttatgatacatagacatccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgctgctacatggatcccgaacaagcacactt 40574876  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||    
T  40574877 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatctaacatttt 40574959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 465 - 605
Target Start/End: Complemental strand, 29234345 - 29234205
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29234345 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgataccttcacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 29234246  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29234245 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgta 29234205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 509 - 647
Target Start/End: Original strand, 41823926 - 41824064
Alignment:
Q  509 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  41823926 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 41824025  T
Q  609 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  41824026 aggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 41824064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 19670816 - 19670634
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  19670816 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 19670717  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  19670716 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 19670634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 3481652 - 3481826
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  3481652 atgagtaatgatacatagacacctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccacacaagcacactt 3481751  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||| ||| | | ||||||||| ||| || ||          |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  3481752 tctctttcctcccatcttctctctttctagtgcat----------agggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 3481826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 459 - 645
Target Start/End: Original strand, 29977879 - 29978065
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    ||||| ||||||||||||||| | | || |||||||||||| |||  || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||    
T  29977879 aaataagagtaatgatacatacagaaccataggtggcaatacaccccttaacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatatggaccccacacaagcac 29977978  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||||||||  ||| || || |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | | | |||||||||||||    
T  29977979 actttctctttcatcttctcttttctctcactaatgtatggggtgtacaagtgtgtataggaataaaagatatctatgtaacatttt 29978065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 55475191 - 55475373
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||| ||| ||| ||||||||    
T  55475191 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcataagtacactttc 55475290  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  55475291 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 55475373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 53352660 - 53352496
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |   ||| ||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  53352660 atgatacatagacacccttaggtg-caatacattctttaacacctacacaaaaatctgacacgtagttaagtggaccccgcacaagcatactttctcttt 53352562  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||| |||||||||||||        ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  53352561 tctctcctcttctctcttccta--------ggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 53352496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 50813992 - 50813810
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| |||| ||||||||| |||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||  || |||||||||||| ||||||||    
T  50813992 gagttatgatacataaacactcttaggtggtaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaaccccgcacaagtacactttc 50813893  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| | ||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  50813892 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 50813810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 29548059 - 29547877
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  |||| |||||| ||| |||||||     
T  29548059 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcataagtacactttt 29547960  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  29547959 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 29547877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 47986208 - 47986389
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | |  |||||| |||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  47986208 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacatcccttgacatccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 47986307  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  | | || |||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||| | ||| || ||||| |||||||||||||||    
T  47986308 tctttcttattctcttctctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtat-gcaattaaaggtgtctatgtaacattttcc 47986389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 17983825 - 17983664
Alignment:
Q  483 acccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattct 582  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||    
T  17983825 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 17983726  T
Q  583 ctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||    
T  17983725 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 17983664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 473 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 28480360 - 28480186
Alignment:
Q  473 atacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 572  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28480360 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28480261  T
Q  573 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28480260 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28480186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 473 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 28481235 - 28481061
Alignment:
Q  473 atacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 572  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28481235 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28481136  T
Q  573 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28481135 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 473 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 28482110 - 28481936
Alignment:
Q  473 atacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 572  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||| ||   || |||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||  |    
T  28482110 atacatagacaaccttaggtgacaatacacttcttaacactcacacaaaaatctgacatgtagtcatgtggaccccacacaaacacactttctccttcat 28482011  T
Q  573 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||||||||| || ||| | ||||||||| |||||    ||||||||||| |||||||||||||||    
T  28482010 ctcctcttctctcttcctagtgcatgagttgtacaaggatgtattcttataaagggtgtctatgtaacattttcc 28481936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 32766958 - 32767140
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||| ||||||| ||||||||    
T  32766958 gagttatgatacataaacactcttaggtggcaatacaccccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccctgcacaagtacactttc 32767057  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| ||  |||||||| |||||  || | |||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  32767058 tctttcttcttctcctctctctttctaatacatagagtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 32767140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 462 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 18924598 - 18924413
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    ||||||| ||||| |||| | ||||||||||||||||| |||  |||| | |||||||||||||||||| || |  |  || || ||||||||| |||||    
T  18924598 tatgagttatgatccataaatacccttaggtggcaatacaccccttgatatccacacaaaaatctgacatgtggcaatatgaactccgcacaagtacact 18924499  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| |||||| |||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  18924498 ttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaaaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 18924413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 465 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 48647826 - 48647645
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||| ||||| ||| ||||||||  ||||| |||  || ||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||    
T  48647826 gagttatgacacataaacatccttaggtaacaatacacctcttaacacccacataaaaatctaacacgtggtcacgtggactccgcacaagcacaatttc 48647727  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || || |  ||||||| | |||||   |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  48647726 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatagaatgtacaaagatgtataaaaataaatgatgtctatgtaacattttc 48647645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 473 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 29589831 - 29589658
Alignment:
Q  473 atacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttct 572  Q
    ||||||| |||||||||| || ||||| |||  ||||||||||||||||||||||| | || | ||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |    
T  29589831 atacataaacacccttagttg-caatacaccccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggccatatggaccccacacaagtacactttctctttctt 29589733  T
Q  573 ctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    || || |||||||||||||||  ||| |||||||||| |||||||  | |||| ||||| ||||||| |||||||    
T  29589732 cttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaatattttcc 29589658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 503 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 56300227 - 56300086
Alignment:
Q  503 catttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggt 602  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || ||||  || | || |||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||| | |    
T  56300227 catttgacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatgaatcctgcacaaacacactttctctttcctctcctcttctctctttctaatgtatgagat 56300128  T
Q  603 gtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||||  |||||| ||||||||  ||| || |||||||||    
T  56300127 gtacaagattgtatgagaataaagaatgtctacgtaacattt 56300086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 44536845 - 44536664
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||  ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||| || ||||  | |||||| || ||| ||||||||    
T  44536845 gagttatgatacataaacacttttaggtggcaatacaccctt-gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcatatagaccccacataagtacactttc 44536747  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||  ||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  44536746 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagaatgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 44536664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 55079814 - 55079685
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtgga-ccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||||||| |||||||||||||| || | ||  |||| |||| |||||| |||||||    
T  55079814 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacacctcttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggacccccacacaagtacacttt 55079715  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaat 593  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||    
T  55079714 ctctttcttcttctcttctctcttcctaat 55079685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 593
Target Start/End: Complemental strand, 8343263 - 8343135
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |||||||||||| || | ||  ||||||||||| ||| | ||||||    
T  8343263 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcctttgacacctacataaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcataagtatactttc 8343164  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaat 593  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||    
T  8343163 tctttcttcttctcttctctcttcctaat 8343135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 644
Target Start/End: Original strand, 47104544 - 47104723
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||| |||||||  ||||| || ||||| ||  | |||||||||||||||||| |||||||| ||    | |||||| ||||| |||||||||    
T  47104544 gagtaatgatatatagacattcttagatgacaatacactctctgacacccacacaaaaatttgacacgtggttttattgaccccacacaaacacactttc 47104643  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||  |||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||| ||  |||| | |||||||  |||| || |||||||||    
T  47104644 tctttcatctcctcttctctcttcttaatgcatgaggtgtactagaatgtacgagaataaaaagtgtctacgtaacattt 47104723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 550 - 645
Target Start/End: Original strand, 43487793 - 43487883
Alignment:
Q  550 cacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||||||||||||||||| ||||     | || ||||||| |||||||||||||| ||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||    
T  43487793 cacaagcacactttctctttgctct-----tttcacttcctagtgtatggggtgtaccagggtgtactgaaataaagggtgtttatgtgacatttt 43487883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 509 - 641
Target Start/End: Complemental strand, 18769103 - 18768972
Alignment:
Q  509 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||| ||  | ||| ||||| |||| |||||||||  |||| | || ||||||||||||  || ||||||||||    
T  18769103 acacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtaaatcccacacaaacacattttctctttcatctcattttttctcttcctaatacat-gggtgtacaa 18769005  T
Q  609 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaaca 641  Q
    || |||||| |  |||| | |||||||||||||    
T  18769004 ggatgtatgagggtaaatgatgtttatgtaaca 18768972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 509 - 617
Target Start/End: Original strand, 18769153 - 18769260
Alignment:
Q  509 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||  ||||| |||||  ||| |||||||||  |||||| || |||||| ||| |  || ||||||||||    
T  18769153 acacccacacaaaaatctgacacgtggtcatgtaaaccccacacaaatacattttctctttcatctccttttttctctttctagtacat-gggtgtacaa 18769251  T
Q  609 gggtgtatg 617  Q
    | |||||||    
T  18769252 gagtgtatg 18769260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 464 - 588
Target Start/End: Original strand, 29535376 - 29535499
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| ||||||||||||||  |||||||| ||||| | |  |||  | |||||||||||| || ||| | | |||||||| ||| ||||| ||||||||    
T  29535376 tgagttatgatacatagacaatcttaggtgacaatacatctcttggtatccacacaaaaatatg-cacatggccacgtggatcccacacaaacacacttt 29535474  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttc 588  Q
    ||||||  |||| ||||||||||||    
T  29535475 ctctttcatctcttattctctcttc 29535499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 647
Target Start/End: Original strand, 1771315 - 1771366
Alignment:
Q  596 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  1771315 atggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 1771366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 24)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Original strand, 32869675 - 32869856
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32869675 tatgagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 32869774  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  32869775 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 32869856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 141; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 17598552 - 17598732
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17598552 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcttttgacacccacacaaaaatctgacacgttgtcacgtggaccccgcacaagcacactt 17598651  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  17598652 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 17598732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 22880755 - 22880580
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880755 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaattctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 22880656  T
Q  568 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  22880655 tttctctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtatatgtatcatt 22880580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 31976248 - 31976430
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||    
T  31976248 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatataccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatgaaccccgcacaagcacactttc 31976347  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31976348 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31976430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 11427616 - 11427796
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacaccct--taggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11427616 gagtaatgatacatagacaccctcttaggtggcaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 11427715  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  11427716 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 11427796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 29857827 - 29858005
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  29857827 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 29857926  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  29857927 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 29858005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 6209565 - 6209388
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6209565 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacactatttgacactcacacaaaaatctgtcacgtagtcacgtggaccccgcactagcacactttc 6209466  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||| | |||||| ||||    
T  6209465 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaagatgta-gggaataaagggtatctatgtatcatt 6209388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 31110859 - 31110679
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||| ||||  |||||||||||||||  ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  31110859 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacactcaca--aaaatctgacacgtaaccacatggaccctgcacaagcacactttc 31110762  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  31110761 tcttttctctactcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaaggtgtatggaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 31110679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 631
Target Start/End: Original strand, 15832577 - 15832743
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||  ||| ||||    
T  15832577 gagtaatgatacatagacacctttaggtgacaataaatcatttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcctgcacaaatacattttc 15832676  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 631  Q
    |||||| |||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15832677 tcttttttctcctcttctatcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtattggaataaagggtgt 15832743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 464 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 31109501 - 31109351
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||    
T  31109501 tgagtaatgattaatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtagaccccgcaaaagtacacttt 31109402  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 614  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  31109401 ctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtatacaagggtgt 31109351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 459 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15990148 - 15989960
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||    
T  15990148 aaataagagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtac 15990049  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15990048 actttctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15989960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 30341460 - 30341278
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  30341460 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 30341361  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  30341360 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 30341278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 468 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 23128224 - 23128067
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 567  Q
    |||||||| ||||||||| ||| |||  |||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23128224 taatgatatatagacacctttatgtgataatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccacacaagcacactttctct 23128125  T
Q  568 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
    |||||||||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  23128124 tttctctcctcttttctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatggaaataaa 23128067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 96; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 15508125 - 15507942
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  15508125 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 15508026  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  15508025 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 15507942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 31953132 - 31952948
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||  |||||||||||| |||||||||||| ||  ||| ||||||| | ||||| |||||||    
T  31953132 atgagtaatgatagatagacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacataaaaatctgacatgtgttcatgtggacctcacacaaacacactt 31953033  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||  ||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  31953032 tctctttcatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 31952948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 469 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 28536582 - 28536408
Alignment:
Q  469 aatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctt 568  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||| | |  |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28536582 aatgatacataaacatccttaggtggcaatacaacccttgacacccacacaaaaatctgacacg--gtcatgtggaccccacacaagcacactttctctt 28536485  T
Q  569 ttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    || ||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||  |||||| | |||  ||||||||||||    
T  28536484 ttatcttctcttccctcttcctactgcatggggtgtacaagggtgtatgaaaataaatgatgtcgatgtaacatttt 28536408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Original strand, 4231547 - 4231730
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| ||||| |||| ||| | ||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  4231547 tgagttatgattcataaacatcattaggtggcaatacaccccttgccacccacacaaaaatctgacacgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 4231646  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  4231647 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 4231730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 466 - 609
Target Start/End: Original strand, 946377 - 946520
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||||  |||| ||| ||||||||| || |||||||||||||| |||||||||  | ||||| | ||||||||||||    
T  946377 agtaacgatacatagacatccttaggtgataatacaccctttgacacctacccaaaaatctgacacctagtcacgtaaatcccgctctagcacactttct 946476  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaag 609  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| ||| | ||||||||    
T  946477 cttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgagatgtacaag 946520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 509 - 645
Target Start/End: Original strand, 30870058 - 30870193
Alignment:
Q  509 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    ||||||| | |||||||| ||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||| ||| | ||| ||||||||||    
T  30870058 acacccatataaaaatctaacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaa 30870157  T
Q  609 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
     ||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||    
T  30870158 aggtgtatgaaaataaagggtgtctat-taacatttt 30870193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 51; E-Value: 8e-20
Query Start/End: Original strand, 465 - 587
Target Start/End: Original strand, 12732482 - 12732604
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||| || ||||||| ||||    
T  12732482 gagtaatgatacatagacattcttaagtggcaatataatcattgacacccacacaaaaatctgacacgtggctatgtggatcccacataagcacattttc 12732581  T
Q  565 tcttttctctcctattctctctt 587  Q
    |||||  |||||| |||||||||    
T  12732582 tctttcatctcctcttctctctt 12732604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 470 - 617
Target Start/End: Complemental strand, 9379807 - 9379660
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||| |||||| || ||||| | |  |||||||||| |||||||| |||||||| | || ||||| | | ||||| |||| |||||||||    
T  9379807 atgatacatagacatccttagatgacaatacatcccttgacacccatacaaaaatttgacacgtggccatgtggatctcacacaaacacattttctcttt 9379708  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatg 617  Q
      ||| || || ||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||    
T  9379707 catcttctcttttctcttcctaatgcataaggtatacaaggatgtatg 9379660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 601 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 22422043 - 22421997
Alignment:
Q  601 gtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22422043 gtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatgtaacattttcc 22421997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 465 - 530
Target Start/End: Complemental strand, 22422118 - 22422053
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgaca 530  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |  ||||||| || |||||| |||||||    
T  22422118 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatagatctcttgacactcatacaaaattctgaca 22422053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 596 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 26466850 - 26466799
Alignment:
Q  596 atggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||| |||||||| || || | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26466850 atggagtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 26466799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 150; Significance: 7e-79; HSPs: 38)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 27564838 - 27564657
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27564838 tatgagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcacaagcacact 27564739  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  27564738 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 27564657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 148; E-Value: 1e-77
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 48716383 - 48716204
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48716383 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 48716284  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
     |||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  48716283 atcttttctttcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 48716204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 32813247 - 32813429
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32813247 gagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaagcacactttc 32813346  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  32813347 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtaacattttcc 32813429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 140; E-Value: 6e-73
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 9474977 - 9474798
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  9474977 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaaacacacttt 9474878  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  9474877 ctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 9474798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 2581915 - 2582093
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2581915 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 2582014  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||    
T  2582015 ttttttctctcctcttctctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtattagaataaagggtgtttatgtatcatt 2582093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 38632421 - 38632255
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  38632421 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttt 38632322  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 631  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38632321 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 38632255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 51898783 - 51898601
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  51898783 gagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 51898684  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51898683 tatttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatagaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 51898601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 47452422 - 47452242
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  47452422 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 47452323  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||| ||||    
T  47452322 tctcttttctctcctcttctctcttcctattgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagagtgtctatgtatcatt 47452242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 1e-67
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 3000319 - 3000497
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3000319 gagtaatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 3000418  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  3000419 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 3000497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 38595154 - 38595332
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38595154 gagtaatgatacataaacacctttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 38595253  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  38595254 tcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 38595332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 41758805 - 41758983
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| |||  |||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  41758805 gagtaatgatacatagacaccattaaatggcaatacaccctttgacaaccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggaccccgcacaaacacactttc 41758904  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  41758905 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 41758983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 37649196 - 37649376
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||    
T  37649196 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacactctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacgtgaattccgcacaagcacactt 37649295  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    || |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  37649296 tcccttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 37649376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 636
Target Start/End: Original strand, 50630458 - 50630629
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | | ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50630458 gagtaatgatacatagatacccttaggtggcaatacatcctttgttacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 50630557  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 636  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  50630558 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatgagaataaatggtgtctatg 50630629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 8346488 - 8346309
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8346488 gagtaatgatacatagtcacctttaggtggcaatacaccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccctgcacaagcacactttc 8346389  T
Q  565 tcttttctctcct-attctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||  || ||||||||||||| |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||| |||||||| ||||    
T  8346388 tcttttctctcctctttttctcttcctaatgcatggagtgtacaaaggtgtatgagaataaatggtatttatgtatcatt 8346309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 3e-59
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 49811627 - 49811447
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  | ||| ||||||||||||||||||    
T  49811627 gagttatgatagatagacatccttaggtgacaatacaccatttgacatccacacaaaaatctgacacgtagccatatagactccgcacaagcacactttc 49811528  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  49811527 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatgtggtgcacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacatttt 49811447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 43132 - 43310
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| | ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  43132 gagtaatgatacatagacagtcttaggagacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggactccgcacaagcacactttc 43231  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||  ||||||||||| | |||||| ||||    
T  43232 tcttttctctcctcctctctctttctaatgcatggggtgtacaagagtgtataagaataaagggtatctatgtatcatt 43310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 107; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 485 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 45044640 - 45044478
Alignment:
Q  485 ccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctct 584  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |||| |||||||||||||| || ||||||    
T  45044640 ccttaggtggcaatacaccatttgacacccatacaaaaatctgacatgtagccacatggaccccgcacaaacacattttctcttttctcttctcttctct 45044541  T
Q  585 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| || ||||||||||||    
T  45044540 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgagaataaatgatgtctacgtaacattttcc 45044478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 104; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 459 - 594
Target Start/End: Complemental strand, 44548482 - 44548347
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44548482 aaatttgattaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccatttgatacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 44548383  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatg 594  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  44548382 actttctcttttctctcttcttctctcttcctaatg 44548347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 459 - 643
Target Start/End: Original strand, 26274426 - 26274607
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||    
T  26274426 aaataagaataatgatacatagacacccttatgtggcaatacatcatttgacatccacagaaaaatctgacacatagtcacgtggatcctgcacaagtac 26274525  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||| |||||||||||   |||||||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  26274526 actttttcttttctctc---ttctctcttcctaatgcatgagatgcacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 26274607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 94; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 466 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 11152476 - 11152296
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  11152476 agtaatgaaacatagacacc-ttaggtggcaatacacccttcgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtagaccccgcacaagcacgctttct 11152378  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     ||| ||||||| ||||||||||| | || |||||||||| |||| |||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||||    
T  11152377 ttttcctctcctcttctctcttcccagtgcatggggtgtagaaggatgtatgagaataaatggtgtctatataacattttcc 11152296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 92; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 50591101 - 50590918
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||    
T  50591101 tgagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacacttt 50591002  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  50591001 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 50590918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 5959100 - 5958918
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  5959100 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacacctcttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 5959001  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||  | ||||  |||| |||||||||||||||    
T  5959000 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaatgtgtctatgtaacattttcc 5958918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 91; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 37926538 - 37926356
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||| | | ||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||||||||||||||| | ||| |||| |||| ||||| ||||||||    
T  37926538 gagttatgatacatagatatctttaggtggcaatacatcttttaacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggatcccgtacaagtacactttc 37926439  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||| |||||||    
T  37926438 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaaggatgtatgtgaataaatggtgtctatataatattttcc 37926356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 462 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 3302636 - 3302451
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||    | ||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||  |||||||||||    
T  3302636 tatgagtaatgatacatatacatccttaggtgacaatatattcctggacacccacacaaaaatctgacacgtaatcatatggaccccatacaagcacact 3302537  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||| |||  |||| | ||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  3302536 ttctttttcatctcatcttctctcttccaaatatatagggtgtacaagggtgtatgttaataaaggatgtttatataacattttcc 3302451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 41608594 - 41608411
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||||| || | ||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  41608594 tgagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacactcacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgtacaagtacacttt 41608495  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||    
T  41608494 ctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtttatgtaacattttcc 41608411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 470 - 647
Target Start/End: Original strand, 44453984 - 44454165
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    |||||||||||||||| ||| ||||||||| | |  |||| |||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| |||||||||||||| |||||    
T  44453984 atgatacatagacacctttaagtggcaatacatctcttgatacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggatcccacacaagcacactttttcttt 44454083  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggt----gtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     ||||| | |||||||||||||||| |||||||    ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  44454084 cctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtcagagtataagggtgtataagaataaatggtgtttatgtaacattttcc 44454165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 77; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 23597191 - 23597011
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| | ||||| ||||  |||||| ||||||||     
T  23597191 gagtaatgatacatagacatcattaggtggcaatacactctttgatacccacataaaaatctgacacgtggccacgttgaccttgcacaaacacacttta 23597092  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |  ||| ||||| ||||| |||||| |||||||   ||| |||||||||||||    
T  23597091 tcttttctctcctattctctattcctagttcatgaggtgtccaaggatgtatgagaataaaaaatgtctatgtaacatttt 23597011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 76; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 495 - 614
Target Start/End: Original strand, 13414791 - 13414910
Alignment:
Q  495 caatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatg 594  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||    
T  13414791 caatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacattttctcttttctatcatcttctctcttcctaatg 13414890  T
Q  595 tatggggtgtacaagggtgt 614  Q
     |||| |||||| |||||||    
T  13414891 catggagtgtactagggtgt 13414910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 26440732 - 26440906
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| | |||| ||||||| |||||| || ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  26440732 atgagttaggatagatagacatccttagatgacaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcataagcacactt 26440831  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||          |||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26440832 tctctt----------ttctctcttcgtaatgtatggaatgtacaagggtgtataggaataaaggatgtttatgtaacattttcc 26440906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 6260868 - 6261052
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||| ||||| | |||||||||| |||| |||  |  ||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  6260868 atgagttatgatagatagatatccttaggtggtaatacacccctgaacacccacataaaaatctaacatgtggtcacgtggaccccgcataagcacattt 6260967  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||| |||  |||||| ||||||||| ||| | ||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  6260968 tctatttcttctcctcttctctctttctagtatatagggtgtacaaaggtgtatgaaaataaatggtgtgtatgtaacattttcc 6261052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 1e-30
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 47748441 - 47748624
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||| || |||||||| | |||||||||||| || | ||  |||| |||||||||| | ||||    
T  47748441 atgagttatgatacataaatacccttaggtggcaatacaccctt-gacacccatataaaaatctgacatgtggccatatggatcccgcacaagtatactt 47748539  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||  ||| || |||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  47748540 tctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagagtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 47748624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 508 - 605
Target Start/End: Original strand, 48489343 - 48489440
Alignment:
Q  508 gacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    |||| |||||||||||||||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||| | ||| |||||||    
T  48489343 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggatcccgcacaagcacattttctattttctcacctcttctctcttcctagtatatagggtgta 48489440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 506 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 44332430 - 44332289
Alignment:
Q  506 ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgta 605  Q
    |||||||||||| |||||||||||| || | |   ||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||||||||||  || | |||||    
T  44332430 ttgacacccacataaaaatctgacatgtggccctatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagagtgta 44332331  T
Q  606 caagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||  | |||| ||| | |||||||||||||||    
T  44332330 caagggtgtatgcaattaaaaggtatctatgtaacattttcc 44332289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 470 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 34340133 - 34339968
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttt 569  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||| |||  ||||  || |||||||||||||||||||        ||||| || | ||||||| ||||| |||    
T  34340133 atgatacatagacactcttaggtggtaatacacctgttgatgcc-acacaaaaatctgacacgt--------ggacctcgtataagcacagtttcttttt 34340043  T
Q  570 tctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||| || ||||||||||| | || || ||||||||||| |||| ||  |||||| ||||| |||||||||||||    
T  34340042 tctcttctcttctctcttccaagtgcatagggtgtacaagagtgt-tgaaaataaaaggtgtctatgtaacatttt 34339968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 506 - 560
Target Start/End: Complemental strand, 44334229 - 44334175
Alignment:
Q  506 ttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 560  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||    
T  44334229 ttgacatccacacaaaaacctgacacgtagtcacatggacccagcacaaacacac 44334175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 465 - 629
Target Start/End: Original strand, 7740733 - 7740897
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||||||| |||| ||||| ||| ||||| | |  |||||||| ||| |||||| |||||||| |  | ||||||||| |||||  | | ||||    
T  7740733 gagttatgatacattgacaaccttatgtgacaatacatccattgacacctacataaaaatatgacacgtggctatgtggaccccacacaaatatattttc 7740832  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggt 629  Q
    | |||  |||||| ||||||||||||  || ||||| ||||||| | |||| | |||||||||||    
T  7740833 tttttcatctcctcttctctcttcctgttgcatgggatgtacaaagatgtacgagaataaagggt 7740897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 590 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 35003351 - 35003294
Alignment:
Q  590 taatgtatggggtgtacaa--gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||    
T  35003351 taatgtatggggtgtacaatagggtgtatg--attaaagggtgttcatgtaacattttcc 35003294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 619 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 37814806 - 37814777
Alignment:
Q  619 gaataaagggtgtttatgtaacattttccc 648  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37814806 gaataaagggtgtttatgtaacattttccc 37814777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 145; Significance: 7e-76; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 459 - 635
Target Start/End: Original strand, 9058474 - 9058650
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  9058474 aaataagagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcac 9058573  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttat 635  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  9058574 actttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtatttat 9058650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 13438341 - 13438521
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13438341 atgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacatcctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 13438440  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  13438441 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 13438521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 40614004 - 40613820
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||    
T  40614004 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactt 40613905  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  40613904 tctcttttctctcctattctttcttcataatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 40613820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 460 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 10249487 - 10249304
Alignment:
Q  460 aatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcaca 559  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10249487 aataagagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcaca 10249388  T
Q  560 ctttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  10249387 ctttctcttttctctcctcttttctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 10249304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 144; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Original strand, 28863458 - 28863633
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28863458 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 28863557  T
Q  568 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28863558 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28863633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 143; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 17473020 - 17473198
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17473020 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 17473119  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  17473120 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 17473198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 28381758 - 28381577
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  28381758 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacacctttcgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacatggactccgcacaagcacact 28381659  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  28381658 ttctcttttctctcatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 28381577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 7465835 - 7465657
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7465835 gagtaatgatacatagacacccttagatggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccacacaagcacactttc 7465736  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||| |||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  7465735 tcttttatctcttcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 7465657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 20700815 - 20700997
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  20700815 gagtaatgatacatagacatccttatgtggcaatacaccctttgactcctacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcataagcacactttc 20700914  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20700915 tctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtaacattttcc 20700997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 32505748 - 32505570
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32505748 gagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 32505649  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    | ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||| ||||    
T  32505648 tattttctctcctcttctctcttcttaatgcatggggtgtacaagggtgtatgagaataaagagtgtctatgtatcatt 32505570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 19930922 - 19930742
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  19930922 atgaataatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaaacacactt 19930823  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  19930822 tctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaaaggtgtctatgtatcatt 19930742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Original strand, 40701477 - 40701656
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  40701477 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggaccccgcacaatcacacttt 40701576  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  40701577 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatcgggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 40701656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 465 - 636
Target Start/End: Complemental strand, 33436200 - 33436029
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33436200 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctaacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 33436101  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 636  Q
    ||||| ||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  33436100 tctttcctctcatcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgagaataaaaggtgtctatg 33436029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 30915463 - 30915641
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30915463 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacccccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgtacaagcacactttc 30915562  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| || ||| |||||| ||||    
T  30915563 tcttttctctcatcttctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgtatggaaataatggatgtctatgtatcatt 30915641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 120; E-Value: 5e-61
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Original strand, 4060684 - 4060863
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  4060684 tgagtaatgatacatagacacccttaggtgacaatacaccttttgacatccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacacttt 4060783  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||    
T  4060784 cttttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaagatgtttatgtatcatt 4060863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 36168836 - 36169018
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| || ||||| | | ||| || ||||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  36168836 gagttatgatacatagacatccttagatgacaatacatcctttaactcccacacaaaaatttgacacgtggccacatggaccccgcacaagcatactttc 36168935  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  36168936 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatgagaataaagggtgtttatgtaacattttcc 36169018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 38273242 - 38273061
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||||||||||||  ||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||    
T  38273242 gagttatgatacatagacattcttagatggcaatacaccctttaacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcactagcacactttc 38273143  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  38273142 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa-gatgtatgagaataaatggtgtttatgtaatattttcc 38273061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 42257193 - 42257375
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42257193 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacatcatttgacacccacataaaaatctgacacgtggccacatggaccccgcacaagcacactttc 42257292  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||    
T  42257293 tcttttctctcctcttctttcttcctaatgtatggggtgtacaagagtgtatagaaataaagggtgtctatgtaatattttcc 42257375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 2533124 - 2533305
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||     
T  2533124 gagttatgatacatagacatccttaagtggcaatacatcctttgacacc-acacaaaaatctgacacgtagccacatagaccccgcacaagcacactttt 2533222  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  2533223 tcttttatctcctcttctctcttcccaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtatatataacattttcc 2533305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 112; E-Value: 3e-56
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 38882913 - 38882733
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc---gcacaagcacact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| ||||    
T  38882913 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaata-accctttgacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccccccgcacaagcgcact 38882815  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||  | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||| ||||    
T  38882814 ttctcttttctcttatcttatctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtctctatgtatcatt 38882733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 648 - 770
Target Start/End: Original strand, 2294825 - 2294947
Alignment:
Q  648 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgaattcatacaaatactaatttctaattttttaatacttacaacaagta 747  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2294825 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgagttcatacaaatactaatttctaattttttaatacttacaacaagta 2294924  T
Q  748 tcctaaagacactctttaatatt 770  Q
    ||||||||| |||||||| ||||    
T  2294925 tcctaaagatactctttagtatt 2294947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 102; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 5574588 - 5574422
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5574588 gagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 5574489  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||            |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  5574488 tctttt------------ctcttcctaatgcatggcgtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 5574422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 89; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 471 - 647
Target Start/End: Original strand, 3439985 - 3440161
Alignment:
Q  471 tgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctctttt 570  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  3439985 tgatacgtagacacccttaggtggcaatacactcctggacacccacacaaaaatctaacatgtgattacgtggaccccgcacaagcacattttctctttc 3440084  T
Q  571 ctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||| ||||||||| |||   ||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  3440085 ctctcctcttctctctttctagaatatagggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 3440161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 87; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 26891604 - 26891422
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||  | ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  26891604 gagttatgatacatagccacccttaggtggcaatacacccctagacacccacacaaaaatctgacatgtggtcacgtggacctcgaacaagcacattttc 26891505  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||| |||| || ||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  26891504 tctttcctcttctcttctctcttcctaatatacagggtgtaaaaatgtgtatgaaaattaagggtgtatatgtaacattttcc 26891422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 463 - 631
Target Start/End: Original strand, 27864702 - 27864857
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27864702 atgagtaatgatacatagacacccttatgtggcaatacaccctttgacatccacacaaaaatctgacacgtaatcacgtggaccccgcaaaagcacactt 27864801  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 631  Q
    ||||||             ||||||||||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  27864802 tctctt-------------tctcttcctaatacatgggatgtacaagggtgtatgagaataaagggtgt 27864857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 85; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 463 - 647
Target Start/End: Original strand, 43490119 - 43490303
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||    
T  43490119 atgagttatgatacataaacacccttaggtgacaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactt 43490218  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | |||||  ||| || |||||||||||||||  || |||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  43490219 tatctttcttcttctcttctctcttcctaatacatagggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 43490303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 481 - 647
Target Start/End: Original strand, 13365369 - 13365535
Alignment:
Q  481 acacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctatt 580  Q
    |||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||   ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||    
T  13365369 acacccttagatggcaatataccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtgaccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctctt 13365468  T
Q  581 ctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||| |||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  13365469 ctctcttcctaatacatggggtgtacaagggtgaatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 13365535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 75; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 38732354 - 38732536
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  38732354 gagttatgatacataaacacccttatgtgacaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtacactttc 38732453  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  ||| | ||||||||| ||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  38732454 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgagatgtacaaggatgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 38732536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 483 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 2997569 - 2997408
Alignment:
Q  483 acccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattct 582  Q
    ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| |||||||||||||  ||| || ||||    
T  2997569 acccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttctctttcttcttctcttct 2997470  T
Q  583 ctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  | ||||  |||| ||||||||||||    
T  2997469 ctcttcctaatacatgaggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaagtgtctatgtaacattt 2997408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 459 - 608
Target Start/End: Complemental strand, 17820110 - 17819961
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| |||    
T  17820110 aaatttgagttatgatacatagacaactataggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggttacgtggaccccacacaaacac 17820011  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    | |||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17820010 attttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaa 17819961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 508 - 647
Target Start/End: Original strand, 3737986 - 3738125
Alignment:
Q  508 gacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtaca 607  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |||| ||||||||   ||| |||||||||    
T  3737986 gacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatgtggaccccgcacaagcacattttctttttcctctcctcttctttcttcctagaatatagggtgtaca 3738085  T
Q  608 agggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||||||||  |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3738086 aaggtgtatgaaaatatagggtgtctatgtaacattttcc 3738125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 45097835 - 45097653
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| | |  |||||||||| |||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  45097835 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacatcccttgacacccatacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 45097736  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || |||||||||||||||  || || |||||||| |||||||  | |||| | |||||||||||||||||||    
T  45097735 tctttcttcttctcttctctcttcctaatacatcggatgtacaagagtgtatgcaattaaaagatgtttatgtaacattttcc 45097653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 591
Target Start/End: Original strand, 33436211 - 33436337
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||   || ||||||   ||||||||||||||||    
T  33436211 gagtaatgatacatagacatccttagatggcaatacaccttttgacacccacataaaaatctgacacgtgaccatgtggactttgcacaagcacactttc 33436310  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttccta 591  Q
    ||||| || |||| |||||||||||||    
T  33436311 tctttcctatcctcttctctcttccta 33436337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 17823784 - 17823970
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgt----ggaccccgcacaagcacac 560  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |    |  ||||||||||||||||||||||||||   |  |    |||||||  ||||||||||    
T  17823784 gagtaatgatacatatacatccttaggtggcaatacattcctgaacacccacacaaaaatctgacacgtaactatatatatggaccccatacaagcacac 17823883  T
Q  561 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||||||  |||| | ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| ||| |||||||||||||||    
T  17823884 tttctctttcatctcatcttctctcttccaaatatatggggtgtacaagggtgtatgtaaataaaggatgtctatgtaacattttcc 17823970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 9e-29
Query Start/End: Original strand, 487 - 645
Target Start/End: Original strand, 41758607 - 41758767
Alignment:
Q  487 ttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaa--gcacactttctcttttctctcctattctct 584  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||| | | ||||||||||||||||| ||| |  | | |||| ||  ||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  41758607 ttaggtggtaatataccttttgacacctatataaaaatctgacacgtagccacataaatctcgcataaacgcacattttctcttttatctcctcttctct 41758706  T
Q  585 cttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||    
T  41758707 cttcctaatatatggggtgtacaaggatgtatgagaataaaatgtgtctatgtaacatttt 41758767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 61; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 550 - 646
Target Start/End: Original strand, 44152012 - 44152108
Alignment:
Q  550 cacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44152012 cacaagcacactttctctttcatctcctcttctctcttcctaatgcatgagatatacaagggtgtatgcgaataaaaggtgtttatgtaacattttc 44152108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 594
Target Start/End: Original strand, 41575138 - 41575267
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggacccc-gcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||| |||||| ||| |||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||| || |||| |||||||||  |||||||||||||||    
T  41575138 agtaatgatacatagacatccttagatggtaatacaccctttgacattcacacaaaaatttgacatgtggtcatgtggacccctacacaagcacactttc 41575237  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatg 594  Q
    |||||  |||||| ||||||| ||||||||    
T  41575238 tctttcatctcctcttctctcgtcctaatg 41575267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 515 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 3035033 - 3034901
Alignment:
Q  515 acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 614  Q
    |||||||||||||||| || ||||  ||||||||||||||| | |||||||||||  ||| || |||||||||||||||  ||| ||||||| | |||||    
T  3035033 acacaaaaatctgacatgtggtcatatggaccccgcacaagtatactttctctttcttcttctcttctctcttcctaatacatgaggtgtaccaaggtgt 3034934  T
Q  615 atgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3034933 atgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3034901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 648 - 711
Target Start/End: Original strand, 2304667 - 2304730
Alignment:
Q  648 caacacattgggaacttgaacagtttcacctttcatttgataggttaaattgaattcatacaaa 711  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  2304667 caacacattgggaacttgaacaatttcacctttcatttgataggttaaattgagttcgtacaaa 2304730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 717 - 770
Target Start/End: Original strand, 2310704 - 2310757
Alignment:
Q  717 atttctaattttttaatacttacaacaagtatcctaaagacactctttaatatt 770  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  2310704 atttctaattttttaatacttacaacaagtatcctaaagacactctttagtatt 2310757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 472 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 21301593 - 21301420
Alignment:
Q  472 gatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttc 571  Q
    |||| ||||||| | ||| ||||||||||||   | || || |||||||||||| || ||||  ||| |||||| |  ||||| |||||||||||||||     
T  21301593 gatagatagacatctttaagtggcaatatactcctcgatactcacacaaaaatcagatacgtgatcatgtggactctacacaaacacactttctctttta 21301494  T
Q  572 tctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||| || |||| |||||||| || ||| |||||||| | |||||||| |||||||||||| ||| |||||||||    
T  21301493 tcttctcttctttcttcctagtgcatgaggtgtacatgagtgtatggaaataaagggtgtgtatctaacatttt 21301420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 515 - 625
Target Start/End: Original strand, 3154193 - 3154303
Alignment:
Q  515 acacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 614  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||| |||||||||  |||||| || |||||  |||||| | ||||| |||||| || |    
T  3154193 acacaaaaatctgacacgtggtcacatggatcccgcccaaacacagtttctctttcatctcctcttttctctcactaatgcacggggtatacaagtgtct 3154292  T
Q  615 atgggaataaa 625  Q
    || ||||||||    
T  3154293 ataggaataaa 3154303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 15428840 - 15428663
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||| |||  || |||| ||||||||||||||||| || | || ||  ||||| | ||| |||| ||||    
T  15428840 gagttatgatacataaacatccttatgtggccatacaccccttaacactcacacaaaaatctgacatgtggccatgtaaaccccacgcaaacacattttc 15428741  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||  |||||| || |||||| ||| |  || ||||||||||||||||||| |  |||| | ||| |||||||||||    
T  15428740 tctttcatctcctcttttctctttctagtacat-gggtgtacaagggtgtatgagggtaaatgatgtctatgtaacatt 15428663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 139; Significance: 3e-72; HSPs: 33)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 2740274 - 2740452
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2740274 gagtaatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 2740373  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  2740374 tcttttctctccccttctctcttcctaatgcatgggatgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 2740452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 465 - 631
Target Start/End: Complemental strand, 36733042 - 36732876
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36733042 gagtaatgatacatagacacccttaggtagcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacatagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 36732943  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 631  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36732942 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgt 36732876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 462 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 33149741 - 33149560
Alignment:
Q  462 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacact 561  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33149741 tatgagtaatgatacatagacacccttaggtggtaatacaccctttgacacccacacaaaaatttgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacact 33149642  T
Q  562 ttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||    
T  33149641 ttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtacgagaataaagggtgtctatgtatcatt 33149560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 465 - 648
Target Start/End: Complemental strand, 15409710 - 15409527
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  15409710 gagttatgatacatagacatccttaggtgacaatacattctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagccacatggaccccgcacaagcacactctc 15409611  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttccc 648  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15409610 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgcgaataaagggtgtttatgtaacattttccc 15409527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 468 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 18520981 - 18520806
Alignment:
Q  468 taatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 567  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18520981 taatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctct 18520882  T
Q  568 tttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||| ||||    
T  18520881 tttatctcctcttctctcttcctaatgcatgaggtgtacaagggtgtatgaaaataaagggtgtctatgtatcatt 18520806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 135; E-Value: 6e-70
Query Start/End: Original strand, 461 - 643
Target Start/End: Original strand, 40145403 - 40145585
Alignment:
Q  461 atatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 560  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40145403 atatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacac 40145502  T
Q  561 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| | | ||||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||| ||||    
T  40145503 tttctcttttctctcctcttctctcttcctaatgcacgaggtgtacaagggtatatgagaataaagggtgtctatgtatcatt 40145585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 465 - 638
Target Start/End: Original strand, 13811652 - 13811825
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13811652 gagtaaagatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 13811751  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgta 638  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13811752 tcttctctctcctcttctctcttcctaatgcatgggatgtacaaggatgtatgggaataaatggtgtctatgta 13811825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 1e-68
Query Start/End: Original strand, 463 - 643
Target Start/End: Original strand, 14831812 - 14831992
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  14831812 atgagtaatgatacatagacactcttaggtggcaatacaccctttgacacccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactt 14831911  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||| |||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  14831912 tcttttttttctcctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaaggatgtatgggaataaagggtgtctatgtatcatt 14831992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 464 - 643
Target Start/End: Original strand, 35785198 - 35785377
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||    
T  35785198 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcacaatcacacttt 35785297  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||| ||||    
T  35785298 ctcttttctctcatcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaaggtgtctatgtatcatt 35785377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Complemental strand, 35943992 - 35943812
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||||    
T  35943992 gagttatgatacatagacacccttaggtggcaatacatcatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccacacaagcacactttc 35943893  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    ||||| ||||||| || |||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| |||||||||||||    
T  35943892 tctttcctctcctcttttctcttcctagtgcatggggtgtacaagggtgtatggaaataaaatgtgtctatgtaacatttt 35943812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 465 - 646
Target Start/End: Original strand, 6679698 - 6679879
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||    
T  6679698 gagttatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccttttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacattttc 6679797  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||| | ||| ||||||||||||||    
T  6679798 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgtatagggtgtacaagggtgtatgacaataaatgatgtctatgtaacattttc 6679879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Original strand, 26720515 - 26720698
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26720515 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacacttt 26720614  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26720615 ctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26720698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 464 - 647
Target Start/End: Original strand, 26990264 - 26990447
Alignment:
Q  464 tgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacacttt 563  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||| ||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||    
T  26990264 tgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttaacacctacaaaaaaatctgacacgtggccacatggatcccgcacaagcacacttt 26990363  T
Q  564 ctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  26990364 ctcttttctcttctcttctctcttcctaatgtatggggtgtactagggtgtatgagaataaatgatgtctatataacattttcc 26990447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 463 - 604
Target Start/End: Original strand, 28177773 - 28177914
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||    
T  28177773 atgagttatgatacatagacatccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtggtcacatggaccccgcacaaacacactt 28177872  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgt 604  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  28177873 tctcttttctctcctcttccctcttcctaatgtatggggtgt 28177914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Original strand, 31008988 - 31009170
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| ||||| |   ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31008988 gagttatgatacataaacatccttaggtgacaatacattcttccacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggatcccgcacaagcacactttc 31009087  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||| |||| || ||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  31009088 tatttcctcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaaaggtgtatgagaataaagggtgtctatgtaacattttcc 31009170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 3921365 - 3921183
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  3921365 gagttatgatacataaacacccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 3921266  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  3921265 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 3921183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 7e-48
Query Start/End: Original strand, 463 - 592
Target Start/End: Complemental strand, 42414404 - 42414275
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  42414404 atgagtaatgatacatagacaccagtaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcatgtggaccccgcacaagcacactt 42414305  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaa 592  Q
    | |||||||| |||| ||||||||||||||    
T  42414304 tatcttttctttcctcttctctcttcctaa 42414275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 2252268 - 2252086
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || | ||  ||||||||||||||| ||||||||    
T  2252268 gagttatgatacataaacatccttaggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggccatatggaccccgcacaagtacactttc 2252169  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  ||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  2252168 tctttcttcttctcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 2252086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 90; E-Value: 4e-43
Query Start/End: Original strand, 466 - 644
Target Start/End: Complemental strand, 36875702 - 36875537
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||         ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  36875702 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatacaccctttgacacccacacaaaaat---------agtcacgtggatcccgcacaagcacactttct 36875612  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattt 644  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||||    ||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  36875611 cttttttctcctcttctctcttcctaatacatggggtgtacaaggg----tggaaataaatggtgtctatgtaacattt 36875537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 456 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 6260110 - 6259919
Alignment:
Q  456 tttaaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaag 555  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| |||| | ||||| |||||| | || |||    
T  6260110 tttaaatttgagtaatgatacatacacaaccataggtgacaatacaccctttaacacccacgcaaaaatctaacacatggtcacatggacctcacagaag 6260011  T
Q  556 cacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||| | | |||||||||||||||    
T  6260010 cacactttctctttcatctcctcttctctctcactaatgtatgggatgtacaagtgtgtataggaataaaggatatctatgtaacattttcc 6259919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 78; E-Value: 6e-36
Query Start/End: Original strand, 465 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 33825424 - 33825243
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| ||   |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| |||   |||||||||||||||    
T  33825424 gagtaatgatgcatagacattcttaggtggcaatacactccttgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgaaccttacacaagcacactttc 33825325  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    |||||| ||| || ||||||||||||| || |||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||  |||||||||||||    
T  33825324 tcttttatcttctcttctctcttcctagtgcatggggtgtagaaggctgtatgagaataaatggtgtcaatgtaacattttc 33825243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 509 - 647
Target Start/End: Original strand, 21370048 - 21370186
Alignment:
Q  509 acacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaa 608  Q
    |||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||| | |||| |||||||| | |||  | |||||||    
T  21370048 acacccactcaaaaatctgacatgtggtcacgtggaccccgcacaaacacattttctctttcctctcatcttctttcttcctagtatataagatgtacaa 21370147  T
Q  609 gggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
     ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21370148 aggtgtatgaaaataaagggtgtttatgtaacattttcc 21370186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 67; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 39688997 - 39688815
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||| ||||||||| ||||||||| | |  ||||||||||||||||||||||| | || ||||  || |||||||| ||| ||||||||    
T  39688997 gagttatgatacataaacacccttaagtggcaatacatcccttgacacccacacaaaaatctgatatgtggtcatatgaaccccgcataagtacactttc 39688898  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    |||||  |||  | |||||||||||||||  || |||||||||| ||||||||  | |||| ||||| |||||||||||||||    
T  39688897 tctttcttcttttcttctctcttcctaatacatagggtgtacaaaggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttcc 39688815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 513 - 643
Target Start/End: Original strand, 31132392 - 31132512
Alignment:
Q  513 ccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggt 612  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||          ||||||||| |||||| ||| |||||||||||||    
T  31132392 ccacacaaaaatctgacaagtagtcacgtggaccccgcacaagcatactttttctt----------ttctctctttctaatgcatgaggtgtacaagggt 31132481  T
Q  613 gtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||  ||||||||||||||||||| ||||    
T  31132482 gtatgaaaataaagggtgtttatgtatcatt 31132512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 59; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 465 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 20073616 - 20073434
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||| ||||||| | |||| || ||||| ||| |||||||| |||| ||||||||  |||||   ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20073616 gagtaatgatatatagacatcattagatgacaatacaccctttgacactcacataaaaatcttgcacgtgaccacgtggaccctgcacaagcacactttc 20073517  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||| |  ||| | | ||||| |||||||| |||||||   ||| ||| |||||||||||    
T  20073516 tatttcctctcctcttctctcttcctagttcatgagatttacaaaggtgtatgagaataaaaaatgtctatctaacattttcc 20073434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 58; E-Value: 5e-24
Query Start/End: Original strand, 466 - 647
Target Start/End: Original strand, 16327902 - 16328083
Alignment:
Q  466 agtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttct 565  Q
    |||||||||| ||| | | ||||||||||||||| | |  |||||||||||| |||||||||||||||  ||| ||| ||| | |||||||||||||| |    
T  16327902 agtaatgatagataaatatccttaggtggcaatacatccattgacacccacataaaaatctgacacgtgttcatgtgcacctcacacaagcacacttttt 16328001  T
Q  566 cttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||  | | || |||||||| |||||| ||||||||||| ||  || ||||  |||||| ||||||||| |||||||||||    
T  16328002 ctttcattttctcttctctctccctaatatatggggtgtagaaaagtatatgaaaataaatggtgtttatctaacattttcc 16328083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 55; E-Value: 3e-22
Query Start/End: Original strand, 537 - 647
Target Start/End: Original strand, 2177436 - 2177546
Alignment:
Q  537 cacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatg 636  Q
    |||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||||||| |||||||  |||| | ||    
T  2177436 cacgtggatcccacacaagcacattttctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcattggatgtacaagggtgtatgagaataaaatgtgtctctg 2177535  T
Q  637 taacattttcc 647  Q
    |||||||||||    
T  2177536 taacattttcc 2177546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 488 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 39557594 - 39557457
Alignment:
Q  488 taggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctattctctctt 587  Q
    ||||||| |||| |||  || ||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||  |||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  39557594 taggtggtaatacacctcttaacatccacacaaaaatctgacacgtgatcacatggaccccatacaatcacactttctcttttatctcctcttctctctt 39557495  T
Q  588 cctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaa 625  Q
    ||||||  ||| |||||||| || | |||| |||||||    
T  39557494 cctaatacatgaggtgtacatggatctatgagaataaa 39557457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 5e-21
Query Start/End: Original strand, 465 - 645
Target Start/End: Original strand, 9603813 - 9603993
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||  |||| ||   || ||||| ||||||||||||||||| | ||||  ||||||||  |||| |||||||||    
T  9603813 gagtaatgatacatatacatccttaggtgataatacactcattcacacctacacaaaaatctgacacatggtcatatggaccccatacaatcacactttc 9603912  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatttt 645  Q
    |||||  | || | |||||||||| || ||  |||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| || ||||||||||    
T  9603913 tctttcatttcgtcttctctcttcttagtgcttgggatgtacaaaggtgtatgagaataaatggtgtctacgtaacatttt 9603993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 465 - 556
Target Start/End: Complemental strand, 41470516 - 41470425
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 556  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| | | ||| | |  || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41470516 gagtaataatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttaaaattcatataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagc 41470425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 465 - 614
Target Start/End: Original strand, 38296203 - 38296352
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||   |||||||| ||||| |||  || | ||||||||||||||| |||||||||  ||||||| ||  |||||||||||||||    
T  38296203 gagttatgatacatagactatcttaggtgtcaatacacctcttaatacccacacaaaaatcagacacgtagctacgtggatccaacacaagcacactttc 38296302  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgt 614  Q
    || ||  |||||| |||| ||||| || |  |||||||||| || |||||    
T  38296303 tcattcatctcctcttctttcttcttactacatggggtgtataaaggtgt 38296352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000007
Query Start/End: Original strand, 470 - 528
Target Start/End: Original strand, 10356639 - 10356698
Alignment:
Q  470 atgatacatagacacccttaggtggcaatata-ccatttgacacccacacaaaaatctga 528  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||    
T  10356639 atgatacatagacatccttaggtggcaatacatcccattgacacccacacaaaaatctga 10356698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 586 - 647
Target Start/End: Original strand, 33855082 - 33855143
Alignment:
Q  586 ttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||  ||||||||||||| || || | ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33855082 ttcctaatacatggggtgtacaatggggtgtaggaataaagggtgttcatgtaacattttcc 33855143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1268 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1268
Description:

Target: scaffold1268; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 463 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 848
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1031 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactt 932  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1267 (Bit Score: 128; Significance: 9e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold1267
Description:

Target: scaffold1267; HSP #1
Raw Score: 128; E-Value: 9e-66
Query Start/End: Original strand, 463 - 646
Target Start/End: Complemental strand, 1031 - 848
Alignment:
Q  463 atgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactt 562  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  1031 atgagtaatgatacatagacatctttaggtggcaatacaccctttaacatccacacaaaaaactgacacgtagtcacgtgaatcccgcacaagcacactt 932  T
Q  563 tctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  931 tctctttcctctcctcttctctcttcctagtgcatggggtgtacaagagtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 123; Significance: 9e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 9e-63
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Original strand, 4029 - 4207
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||    
T  4029 gagtaatgatacatagacacctttagatggcaatacaccttttaacacccacacaaaaatctgacacgtagttacgtggatcccgcataagcacactttc 4128  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||    
T  4129 tcttttctcttctcttctctcttcctaatgcatggggtgtacaagggtgtatgggaataaatggtgtctatgtatcatt 4207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0321 (Bit Score: 115; Significance: 5e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0321
Description:

Target: scaffold0321; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 5e-58
Query Start/End: Original strand, 465 - 643
Target Start/End: Complemental strand, 10209 - 10031
Alignment:
Q  465 gagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttc 564  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  10209 gagttatgatacatagacacctttaggtggcaatacatcctttgacatccacataaaaatctgacacgtagtcacgtggaccgcgtacaagcacactttc 10110  T
Q  565 tcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacatt 643  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||    
T  10109 tcttttctctcctcttctctcttcctaatgcatagggtgtacaagggtgtatggaaataatgggtgtctatgtatcatt 10031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0110 (Bit Score: 93; Significance: 7e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0110
Description:

Target: scaffold0110; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 459 - 647
Target Start/End: Complemental strand, 8969 - 8781
Alignment:
Q  459 aaatatgagtaatgatacatagacacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcac 558  Q
    |||| ||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||| || |||||||| | |||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  8969 aaatttgagttatgatatatagacatccttaagtgacaatacactatttgacatctacacaaaaatttgacacatagtcacgtggaccccacacaagtac 8870  T
Q  559 actttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    | ||||||||| ||| | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  8869 attttctctttcctcccatcttctctcttcctaatatatggggtgtacaagggtgtataagaataaaaggtgtctatgtaacattttcc 8781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 70; Significance: 4e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 481 - 646
Target Start/End: Original strand, 152514 - 152679
Alignment:
Q  481 acacccttaggtggcaatataccatttgacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctctcctatt 580  Q
    |||||||| |||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||| |||||||||  |||||||||||||  ||| || ||    
T  152514 acacccttgggtggcaatacaccccttgacacccacacaaaaatctgacatgtggtcatatggatcccgcacaaatacactttctctttcttcttctctt 152613  T
Q  581 ctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttc 646  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||||||||    
T  152614 ctctctttctaatacatgggatgtacaagggtgtatgcaattaaaaggtgtctatgtaacattttc 152679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316 (Bit Score: 47; Significance: 2e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0316
Description:

Target: scaffold0316; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 561 - 647
Target Start/End: Original strand, 17199 - 17285
Alignment:
Q  561 tttctcttttctctcctattctctcttcctaatgtatggggtgtacaagggtgtatgggaataaagggtgtttatgtaacattttcc 647  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||   |||  ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  17199 tttctctttcctctcctcttctctcttcctagaatataaggtgtacaaaggtgtatggaaataaagggtgtctatgtaacattttcc 17285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0316; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 508 - 574
Target Start/End: Original strand, 17097 - 17163
Alignment:
Q  508 gacacccacacaaaaatctgacacgtagtcacgtggaccccgcacaagcacactttctcttttctct 574  Q
    |||| |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  17097 gacatccacacaaaaatctgacatgtggtcacatggaccccgcacaagcacattttctctttcctct 17163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University