View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15567_low_21 (Length: 333)

Name: NF15567_low_21
Description: NF15567
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15567_low_21
NF15567_low_21
[»] chr7 (12 HSPs)
chr7 (152-309)||(267825-267982)
chr7 (152-310)||(278891-279049)
chr7 (154-310)||(48853502-48853658)
chr7 (152-310)||(32517018-32517176)
chr7 (165-310)||(26451000-26451141)
chr7 (167-310)||(40771155-40771296)
chr7 (152-305)||(40771726-40771877)
chr7 (222-313)||(5172840-5172931)
chr7 (160-211)||(29148922-29148973)
chr7 (151-231)||(21910422-21910502)
chr7 (158-201)||(25189443-25189485)
chr7 (223-310)||(29148795-29148882)
[»] chr8 (13 HSPs)
chr8 (152-310)||(44626023-44626181)
chr8 (152-310)||(32038187-32038345)
chr8 (170-305)||(1262238-1262373)
chr8 (152-309)||(45266201-45266354)
chr8 (152-310)||(26005619-26005777)
chr8 (195-312)||(18324737-18324854)
chr8 (152-240)||(34548215-34548303)
chr8 (152-262)||(38143786-38143896)
chr8 (152-216)||(17497646-17497710)
chr8 (154-309)||(39517250-39517399)
chr8 (259-310)||(17497592-17497643)
chr8 (274-306)||(34548178-34548210)
chr8 (242-294)||(45272805-45272857)
[»] chr4 (22 HSPs)
chr4 (152-310)||(42567727-42567885)
chr4 (152-314)||(2228757-2228919)
chr4 (152-314)||(54256144-54256304)
chr4 (152-310)||(6262105-6262263)
chr4 (152-310)||(36048790-36048948)
chr4 (152-314)||(35905066-35905228)
chr4 (152-310)||(33361539-33361697)
chr4 (152-310)||(24423286-24423443)
chr4 (152-310)||(33366655-33366816)
chr4 (152-309)||(18891187-18891344)
chr4 (152-310)||(13393757-13393916)
chr4 (152-310)||(13396896-13397055)
chr4 (151-267)||(43444804-43444920)
chr4 (37-107)||(53593834-53593904)
chr4 (152-314)||(44160796-44160958)
chr4 (154-208)||(123440-123494)
chr4 (152-200)||(2544838-2544886)
chr4 (186-276)||(18888167-18888257)
chr4 (157-205)||(30425735-30425783)
chr4 (158-205)||(36166221-36166268)
chr4 (152-205)||(38791956-38792009)
chr4 (16-45)||(53592908-53592937)
[»] scaffold0502 (2 HSPs)
scaffold0502 (152-314)||(8837-8999)
scaffold0502 (152-314)||(4122-4299)
[»] chr6 (13 HSPs)
chr6 (152-314)||(18338013-18338175)
chr6 (152-314)||(23848646-23848808)
chr6 (151-310)||(7553497-7553654)
chr6 (152-314)||(9972674-9972836)
chr6 (152-310)||(32932395-32932546)
chr6 (152-314)||(22958160-22958312)
chr6 (152-314)||(23830080-23830232)
chr6 (152-310)||(15121604-15121762)
chr6 (152-231)||(19543398-19543477)
chr6 (152-231)||(27101433-27101512)
chr6 (152-231)||(27143255-27143334)
chr6 (280-314)||(27101530-27101564)
chr6 (280-314)||(27143352-27143386)
[»] chr5 (7 HSPs)
chr5 (152-310)||(36950213-36950371)
chr5 (154-310)||(22729735-22729891)
chr5 (152-310)||(10491096-10491254)
chr5 (152-310)||(43097346-43097504)
chr5 (152-310)||(35941199-35941350)
chr5 (197-310)||(11339770-11339883)
chr5 (152-200)||(16057789-16057837)
[»] chr3 (20 HSPs)
chr3 (152-310)||(39032825-39032982)
chr3 (152-306)||(3469752-3469906)
chr3 (152-310)||(11172093-11172251)
chr3 (152-306)||(19240600-19240754)
chr3 (151-314)||(41272864-41273027)
chr3 (152-310)||(29961003-29961161)
chr3 (152-310)||(30010208-30010366)
chr3 (152-310)||(31112280-31112438)
chr3 (152-310)||(32280854-32281012)
chr3 (152-310)||(39039837-39039994)
chr3 (152-310)||(32285798-32285956)
chr3 (154-314)||(38445548-38445708)
chr3 (152-310)||(50158075-50158233)
chr3 (152-310)||(45677969-45678127)
chr3 (222-310)||(10626371-10626459)
chr3 (152-231)||(10657253-10657329)
chr3 (158-254)||(11457240-11457334)
chr3 (152-199)||(46611745-46611792)
chr3 (225-310)||(46611791-46611876)
chr3 (154-208)||(19242073-19242130)
[»] chr2 (19 HSPs)
chr2 (152-310)||(18341652-18341810)
chr2 (152-309)||(3949901-3950058)
chr2 (152-310)||(40113309-40113469)
chr2 (152-309)||(669913-670070)
chr2 (152-310)||(23888477-23888635)
chr2 (152-310)||(23892553-23892711)
chr2 (152-310)||(39190009-39190167)
chr2 (159-310)||(24138292-24138443)
chr2 (152-310)||(17527391-17527552)
chr2 (208-310)||(41826520-41826622)
chr2 (235-310)||(15144345-15144420)
chr2 (219-314)||(25336147-25336242)
chr2 (152-222)||(14661188-14661258)
chr2 (152-297)||(33425823-33425968)
chr2 (152-211)||(4840927-4840986)
chr2 (152-216)||(25335751-25335815)
chr2 (152-310)||(662699-662839)
chr2 (249-299)||(17530121-17530171)
chr2 (162-206)||(304610-304654)
[»] chr1 (17 HSPs)
chr1 (152-310)||(39574395-39574553)
chr1 (152-310)||(24515435-24515590)
chr1 (152-267)||(39580411-39580526)
chr1 (152-310)||(41140774-41140932)
chr1 (152-310)||(9765057-9765215)
chr1 (152-310)||(47858008-47858166)
chr1 (152-310)||(9758442-9758587)
chr1 (157-267)||(47854629-47854739)
chr1 (152-208)||(24526361-24526417)
chr1 (222-310)||(12017810-12017899)
chr1 (234-310)||(24523185-24523261)
chr1 (158-284)||(38279796-38279923)
chr1 (152-204)||(39183711-39183762)
chr1 (152-240)||(38278809-38278895)
chr1 (152-199)||(5996229-5996275)
chr1 (248-304)||(38278927-38278983)
chr1 (281-313)||(39581073-39581105)
[»] scaffold0045 (1 HSPs)
scaffold0045 (172-314)||(30003-30145)
[»] scaffold0040 (3 HSPs)
scaffold0040 (152-310)||(67675-67833)
scaffold0040 (165-310)||(60212-60357)
scaffold0040 (152-180)||(60166-60194)
[»] scaffold1634 (1 HSPs)
scaffold1634 (152-310)||(109-267)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (151-302)||(40232-40383)
[»] scaffold0027 (1 HSPs)
scaffold0027 (153-314)||(134625-134786)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (164-207)||(143309-143352)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 12)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 267982 - 267825
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  267982 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcact 267883  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  267882 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 267825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 279049 - 278891
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  279049 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcact 278950  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  278949 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 278891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 48853502 - 48853658
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 253  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| |    
T  48853502 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactca 48853601  T
Q  254 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48853602 ttagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 48853658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 32517018 - 32517176
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  32517018 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 32517117  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  32517118 tattagttgatgaatatgtatgattgggctattcttactaaattgaccgtgatgggttg 32517176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26451141 - 26451000
Alignment:
Q  165 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatga 264  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  26451141 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcactaattagatgatga 26451042  T
Q  265 atacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||  | |||||| ||||    |||||||||||| |||||||||||    
T  26451041 atatttgtgattgggcta----ttctaaatggactgtgatgggttg 26451000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 167 - 310
Target Start/End: Original strand, 40771155 - 40771296
Alignment:
Q  167 ttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaat 266  Q
    ||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||  |||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  40771155 ttaattattgaattatggattgacgataatcaattattataagttaatctca--atataaattatggtctattgtgttaaacactaattagttgatgaat 40771252  T
Q  267 acgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    | || |||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  40771253 atgtgtgattgggctattgtttctaaatggaacgtgataggttg 40771296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 40771877 - 40771726
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| || |  |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  40771877 tgttggattaattgttgaattaatgaattatggattgacgacaatcaattattataagttaatct--taatataaattatggtctattgtgttgagcact 40771780  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatg 305  Q
    |||||| |  |||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  40771779 aattagctagtgaatatgtgtgattgagctattgtttctaaatggaccgtgatg 40771726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 222 - 313
Target Start/End: Original strand, 5172840 - 5172931
Alignment:
Q  222 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaac 313  Q
    |||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||  | ||||||   |||| ||||||||| |||| |||||||||||||    
T  5172840 tataaattatgatctattgtattaagcactaattagttgatgaatatatgtgattggattattgtttctaaattgaccatgatgggttgaac 5172931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 160 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 29148973 - 29148922
Alignment:
Q  160 taattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  29148973 taattatttaattaatcaattatgaattgacaataattaattattataagtt 29148922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 21910422 - 21910502
Alignment:
Q  151 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattat--aagttgatgtcataatataaattat 231  Q
    |||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | ||||||||||||||    
T  21910422 gtgttggattaattgtttaattat--aattatggattgacaataatcaattattataaaagttaatattataatataaattat 21910502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 158 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 25189485 - 25189443
Alignment:
Q  158 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatt 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25189485 attaattatttaattaatcaattatgaattga-aataatcaatt 25189443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 223 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29148882 - 29148795
Alignment:
Q  223 ataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||| || || ||    |||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  29148882 ataaattatagtctatggtattaaacactaattagttgatgaatatgtatgtttcgattattctttctaaatggacggtgattggttg 29148795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 13)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 44626023 - 44626181
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  44626023 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtttattgtgttaagcact 44626122  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44626123 aattagttgatgaatatgtctaattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 44626181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32038345 - 32038187
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  32038345 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 32038246  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32038245 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 32038187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 170 - 305
Target Start/End: Original strand, 1262238 - 1262373
Alignment:
Q  170 attaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacg 269  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||  ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |    
T  1262238 attaaccaattatggattgagaataatcaattattataagttaatgttctaatataaattatgatctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatg 1262337  T
Q  270 tctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatg 305  Q
    | |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  1262338 tgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatg 1262373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 45266354 - 45266201
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||  |||||||||    
T  45266354 tgttggattaattatttaat----caattatggattgacaataataaattattataagttaatgtcataatataaattatagtatattgtattaagcact 45266259  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
    ||||||||||| |||| |  |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45266258 aattagttgataaatatgggtgattgggctattctttctaaatggatcgtgatgggtt 45266201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 26005777 - 26005619
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || | |||  | ||||   |||||||||    
T  26005777 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattataatttataatatggtttattatattaagcact 26005678  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     |||| |||||||||| || |||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  26005677 cattaattgatgaatatgtatgattgggctattcttactaaatggactgtgatgggttg 26005619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 195 - 312
Target Start/End: Original strand, 18324737 - 18324854
Alignment:
Q  195 atcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaat 294  Q
    ||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||  |||||  |||||||||||||||    
T  18324737 atcaattattataagttaatattatattataaattatggtctattgtgttaagcactaattagttgatgaataagtgcgattgaactattctttctaaat 18324836  T
Q  295 ggaccgtgatgggttgaa 312  Q
    ||||||||||||||||||    
T  18324837 ggaccgtgatgggttgaa 18324854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Complemental strand, 34548303 - 34548215
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattg 240  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||  ||||||||||||||  |||||||    
T  34548303 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgatataatataaattatggtctattg 34548215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 262
Target Start/End: Original strand, 38143786 - 38143896
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  38143786 tgttggattaattatttaattaatcaactatagattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 38143885  T
Q  252 aattagttgat 262  Q
     ||||||||||    
T  38143886 cattagttgat 38143896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 17497710 - 17497646
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgt 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17497710 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgataataatcaattattataagttaatgt 17497646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 154 - 309
Target Start/End: Original strand, 39517250 - 39517399
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | || ||      |||||| || ||||| ||||||||||||    
T  39517250 ttggattaattattcaattaatcaattatggatcgacaataatcgattattataagttaacgttat------aattatgatatattgtgttaagcactaa 39517343  T
Q  254 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
    ||||| |||||||| || ||||||  ||||| ||  ||||||||| || |||||||    
T  39517344 ttagtcgatgaatatgtgtgattgaactattgttattaaatggactgtaatgggtt 39517399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 259 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17497643 - 17497592
Alignment:
Q  259 tgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17497643 tgatgaatatgtgtgattgggttattctttctaaatggaccgtgatgggttg 17497592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 34548210 - 34548178
Alignment:
Q  274 attgtgctattctttctaaatggaccgtgatgg 306  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  34548210 attgagctattctttctaaatggaccgtgatgg 34548178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 242 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 45272857 - 45272805
Alignment:
Q  242 gttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaat 294  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || | ||||  |||||||||||||||    
T  45272857 gttaaacactaattagttgatgaatatgtgtaattggactattctttctaaat 45272805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 131; Significance: 6e-68; HSPs: 22)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 42567885 - 42567727
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |    
T  42567885 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattatggtctattgcgttaagcatt 42567786  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  42567785 aattagttgatgaatatgtctgattgggctattctttttaaatggaccgtgatgagttg 42567727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 2228757 - 2228919
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||| ||||||    
T  2228757 tgttggattaattatttaattaattaattatggatcgacaataatcaattattataagttaatattataatataaattatggtctattgagttgagcact 2228856  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2228857 aattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 2228919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 54256144 - 54256304
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  54256144 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattatatgttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcact 54256243  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||| ||||||||||  | ||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  54256244 aattaattgatgaata--tgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatcggttgaacc 54256304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 6262105 - 6262263
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  6262105 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 6262204  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||| |||| ||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6262205 aattaattgacgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggatcgtgatgggttg 6262263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 111; E-Value: 5e-56
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 36048790 - 36048948
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||| ||| ||||| ||||    
T  36048790 tgttggattaattatttaattaatcaattatggtttgacaataatcaattattataagttaatttcataatataaattatggtcttttgtgttaaacact 36048889  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36048890 aattagatgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 36048948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 35905228 - 35905066
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||| ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  35905228 tgtttgattaattatttaattaatcaattatggattcacaataatcaattattataagtaaatatcataatgtaaattatggtctattgtgttaagcact 35905129  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||||| |  ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35905128 aattagttgatgaatatgggtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 35905066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 33361539 - 33361697
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | ||| | ||||||  |||||||||    
T  33361539 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttatagtatgacctattgtattaagcact 33361638  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     |||||||||| |||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33361639 cattagttgataaatatgtatgattgggttattctttctaaatggaccgtgatgggttg 33361697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24423443 - 24423286
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  24423443 tgttggattaattatttaactaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttattatataaattatggtatattgtgttaagcact 24423344  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||  ||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  24423343 aatta-atgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggatcgtaatgggttg 24423286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 33366655 - 33366816
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac- 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||     
T  33366655 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttatagtatggtctattgtattaagcact 33366754  T
Q  251 --taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
      | ||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33366755 cattattagttgatgaatatgtatgattgggttattctttctaaatggatcgtgatgggttg 33366816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 18891344 - 18891187
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  | |||||  |||||||||    
T  18891344 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtatattgtattaagcact 18891245  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  18891244 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttttgaatggactgtgatgggtt 18891187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13393916 - 13393757
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga-tgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  13393916 tgttgaattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaaagcaatattataatataaattatggtctattgagttaaacac 13393817  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13393816 taattagttgatgaatatgcgtgattaagctattctttttaaatggaccgtgatgagttg 13393757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 13397055 - 13396896
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga-tgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  13397055 tgttgaattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaaagcaatattataatataaattatggtctattgagttaaacac 13396956  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||||||||||| |  |||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  13396955 taattagttgatgaatatgcgtgattaagctattctttttaaatggaccgtgatgagttg 13396896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 151 - 267
Target Start/End: Original strand, 43444804 - 43444920
Alignment:
Q  151 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| || | ||| ||||||||||  ||||||| ||||| |||    
T  43444804 gtgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaatagtcaattattataggttaatattatattataaattatggtctattgtgttaaacac 43444903  T
Q  251 taattagttgatgaata 267  Q
    | |||||||||||||||    
T  43444904 tcattagttgatgaata 43444920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 37 - 107
Target Start/End: Original strand, 53593834 - 53593904
Alignment:
Q  37 gagcataacatgttaacgttgaaatcgtaatttcggctgaaagaatgataactattcataattattgtttt 107  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  53593834 gagcataacatgttaacgttgaaatcgtaatttcggccgaaagaatgataactattcataattcttgtttt 53593904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 44160958 - 44160796
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttga---tgtcataatataaattataatctattgcgttaagc 248  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||| |||||||||||| |   | | ||| ||||||||||  ||||||| ||||||     
T  44160958 tgttagattaattatttaattaatca-tcata-attgacaattatcagttattataagttaatattattatattataaattatggtctattgtgttaagt 44160861  T
Q  249 actaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    || |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||| |||| |||||||||||    
T  44160860 acaaattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttttaaatgga-cgtggtgggttgaacc 44160796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Original strand, 123440 - 123494
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  123440 ttggattaagtatttaattaatcaattatggattgataataatcaattattataa 123494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 2544838 - 2544886
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaat 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2544838 tgttggattaattatttaattaatcaattacggattgacaataatcaat 2544886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 186 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 18888257 - 18888167
Alignment:
Q  186 ttgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgatt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  18888257 ttgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactcattagttgatgaatatgtatgatt 18888167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 157 - 205
Target Start/End: Original strand, 30425735 - 30425783
Alignment:
Q  157 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 205  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30425735 gattaattatttaatcaataaattatgaattgacaataatcaattatta 30425783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 158 - 205
Target Start/End: Original strand, 36166221 - 36166268
Alignment:
Q  158 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 205  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  36166221 attacttatttaattaatcaaatatggatttacaataatcaattatta 36166268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 205
Target Start/End: Complemental strand, 38792009 - 38791956
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatta 205  Q
    |||| |||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||||||||    
T  38792009 tgttagattaattatttaactaatcaataatggatcgacaataagcaattatta 38791956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 16 - 45
Target Start/End: Original strand, 53592908 - 53592937
Alignment:
Q  16 atccaatgaattttaccatatgagcataac 45  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53592908 atccaatgaattttaccatatgagcataac 53592937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 2)
Name: scaffold0502
Description:

Target: scaffold0502; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 8837 - 8999
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  8837 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaaagtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 8936  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8937 aattagtttatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 8999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0502; HSP #2
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 4122 - 4299
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatta--------------tta-taagttgatgtcataatataaattataatct 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |              ||| ||| || | |||||||||||||||||  |||    
T  4122 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaatgaatttttttattcttttactaatttaaagtcataatataaattatggtct 4221  T
Q  237 attgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4222 attgtgttaaacactaattagtttatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 4299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 13)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 18338013 - 18338175
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  18338013 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaaagtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 18338112  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||| ||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18338113 aattagtttatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 18338175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 23848808 - 23848646
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| || |||||||    
T  23848808 tgttggattaattatttagttaatcatttatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgtaaagcact 23848709  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23848708 aattaattgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 23848646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7553654 - 7553497
Alignment:
Q  151 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| | ||||||||     
T  7553654 gtgttggattaattatttaattaatcaaatatgg-ttgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctatggtgttaagcat 7553556  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||  ||||||||| ||  ||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  7553555 taatta-atgatgaatatgtgcgattgggctattctttttaaatggatcgtgatgggttg 7553497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 9972674 - 9972836
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| || |    
T  9972674 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacatt 9972773  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  9972774 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctaactaaatggaccgtgatgggttgaacc 9972836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32932546 - 32932395
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||    
T  32932546 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataat-------tataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaaacact 32932454  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  32932453 aattaattgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatgggctgtgatgtgttg 32932395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 22958312 - 22958160
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||    
T  22958312 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaactat----------ggtaagcact 22958223  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||| |||||||| | || |||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22958222 aattaattgatgaaaatgtgtgattaggttattctttttaaatggaccgtgatgggttgaacc 22958160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 152 - 314
Target Start/End: Original strand, 23830080 - 23830232
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||          | ||||||||    
T  23830080 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaactat----------ggtaagcact 23830169  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||| |||||||| | || |||||  | |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  23830170 aattaattgatgaaaatgtgtgattaggttattctttttaaatggaccgtgatgggttgaacc 23830232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15121762 - 15121604
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| || |   ||||||||||||  | ||||| |||||  |||    
T  15121762 tgttggattaattatttaattaatcaattgtagattgacaataatcaattattataagttcatctttcaatataaattatggtatattgtgttaataact 15121663  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | |||| ||| ||||||||| ||||| |||||    
T  15121662 aattagttgatgaatatgtgtgattgagttattgtttataaatggactgtgatcggttg 15121604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 19543398 - 19543477
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 231  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19543398 tgttggattaattatttagttaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattat 19543477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 27101433 - 27101512
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27101433 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattat 27101512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Original strand, 27143255 - 27143334
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  27143255 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattat 27143334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 314
Target Start/End: Original strand, 27101530 - 27101564
Alignment:
Q  280 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27101530 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 27101564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 280 - 314
Target Start/End: Original strand, 27143352 - 27143386
Alignment:
Q  280 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27143352 ctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 27143386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 7)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 36950371 - 36950213
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  36950371 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtttattgtgttaagcact 36950272  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  36950271 aattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttataaatggaccgtgatgggttg 36950213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 154 - 310
Target Start/End: Original strand, 22729735 - 22729891
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  22729735 ttggattaattatttaattaatcaatcatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcactaa 22729834  T
Q  254 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||| || |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22729835 ttagttgatgaatatgtgtgatcgggctattctttctaaatggactgtgatgggttg 22729891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 10491096 - 10491254
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || | |||||| |||||||  ||||||| |||| |||||    
T  10491096 tgttggattaattatttaattaatcaattatggatcgacaataatcaattattataagtttatattataatacaaattatggtctattgtgttaggcact 10491195  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||| ||||||| |  |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10491196 aattagttaatgaatatgagtgattgggctattcttactaaatggaccgtgatgggttg 10491254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 43097346 - 43097504
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  43097346 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattataatataaattatggtctattgagttaagcact 43097445  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    | |||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||| ||||||||| ||||    
T  43097446 agttagttgatgaatatgtgtgattggactattctttttaaatgaaccgtgatgagttg 43097504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 35941350 - 35941199
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||||| ||||||||||    
T  35941350 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgataataatcaattattataagttaatgtcataatataaat-------tattgtgttaagcact 35941258  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35941257 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggactgtgatgggttg 35941199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 197 - 310
Target Start/End: Original strand, 11339770 - 11339883
Alignment:
Q  197 caattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatgg 296  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||||||  |||||||  ||||||||| ||||||| |||||||  | ||||||  |||||||||||||||||    
T  11339770 caattattataaattaatgttataatataaattatggtctattgtattaagcactgattagttaatgaatatatgtgattggactattctttctaaatgg 11339869  T
Q  297 accgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||||||||    
T  11339870 accgtgatgggttg 11339883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 200
Target Start/End: Original strand, 16057789 - 16057837
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaat 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16057789 tgttagattagttatttaattaatcaattatgaattgacaataatcaat 16057837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 20)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39032982 - 39032825
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||||||||    
T  39032982 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatat-aattatggtctattctgttaagcact 39032884  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39032883 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 39032825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Original strand, 3469752 - 3469906
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3469752 tgttggattaattatttaattaatcaattatgaattgacaataatcaattatcataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 3469851  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgg 306  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3469852 aattaattgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgg 3469906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 11172251 - 11172093
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||  | ||||||||    
T  11172251 tgttggattaattatttgattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattctgataagcact 11172152  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11172151 aattagttgatgaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 11172093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 19240754 - 19240600
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||  | ||||| ||||||||||    
T  19240754 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgttataatataaattatggtatattgtgttaagcact 19240655  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgg 306  Q
    |||||||||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||||||||    
T  19240654 aattagttgatgaatatgtgtgattgagatattctttctaaatggaccgtgatgg 19240600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 151 - 314
Target Start/End: Original strand, 41272864 - 41273027
Alignment:
Q  151 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||    
T  41272864 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattattataaaatgttataatataaattatggtctattgtgttaagcac 41272963  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  41272964 taattagttgatgaatatgtatgattgtgctattctttctaaatggaccatgataggttgaacc 41273027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 29961161 - 29961003
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |    
T  29961161 tgttggattaattattaaattaattaattctggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataataaaaattatggtctattgtgttaagcatt 29961062  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29961061 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 29961003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 30010366 - 30010208
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||| |    
T  30010366 tgttggattaattattaaattaattaattctggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataataaaaattatggtctattgtgttaagcatt 30010267  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30010266 aattagttgatgaatatgtgtgattggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 30010208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 31112280 - 31112438
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  31112280 tgttggaataattatttaattaataaattatggatctacaataatcaattattataagttaatatcataatataaattatggtctattgtgttaagtact 31112379  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31112380 aattagttgatgaataagtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 31112438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32281012 - 32280854
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||   |||||||||    
T  32281012 tgttggattaattatttaagtaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattctattaagcact 32280913  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||| | || |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32280912 aattagttgatgaacatgtgtgatttgactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 32280854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 39039994 - 39039837
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||  ||||||  ||||| ||||    
T  39039994 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcagttattataagttaatgtcataatat-aattatggtctattctgttaaacact 39039896  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39039895 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 39039837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 32285956 - 32285798
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||    
T  32285956 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtttattctgttaaacact 32285857  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||   |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  32285856 aattagttgatgaatatgtgtgattgaattatttttcttaaatggaccgtgatgggttg 32285798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 154 - 314
Target Start/End: Original strand, 38445548 - 38445708
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaa 253  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||| || ||||||||||||||||  ||||||  |||||||| |||    
T  38445548 ttggattaattatttaattaattaattatggattgacaatgttcaattattataagttaatatcataatataaattatggtctattcagttaagcattaa 38445647  T
Q  254 ttagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||| || ||||||  ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38445648 ttagttgatgaatatgtgtgattgaactattttttctaaatgaaccgtgatgggttgaacc 38445708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 50158075 - 50158233
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||||| || | |||  |||| ||  |||||||||    
T  50158075 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattataatttataatatggtctactgtattaagcact 50158174  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  50158175 cattagttgatgaatatgtatgattgtgctattatttctaaatggaccgtgatgggttg 50158233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 45678127 - 45677969
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||| ||  |    
T  45678127 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattggcaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattatgcgtt 45678028  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  45678027 tattagttgatgaaaatgtatgattgaactattctttttaaatagaccgtgatgggttg 45677969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10626459 - 10626371
Alignment:
Q  222 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10626459 tataaattatggtctattgtgttaagcactaattagtagatggatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 10626371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 152 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10657329 - 10657253
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||||||||||||    
T  10657329 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatgataa---aatgttataatataaattat 10657253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 5e-22
Query Start/End: Original strand, 158 - 254
Target Start/End: Original strand, 11457240 - 11457334
Alignment:
Q  158 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaat 254  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||  |||| |  |||||||||||||    
T  11457240 attaattatttaattaatcaattatggattgaaaataatcaattattataagttaatat--taatataaattatggtctactatgttaagcactaat 11457334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 46611745 - 46611792
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  46611745 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 46611792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 225 - 310
Target Start/End: Original strand, 46611791 - 46611876
Alignment:
Q  225 aaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||| |||| || ||||||  |||||||||||| ||||| ||||||| ||||    
T  46611791 aaattatagtctattgtgttaagcactaattagatgataaatatgtgtgattgaactattctttctagatggatcgtgatgagttg 46611876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 154 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 19242130 - 19242073
Alignment:
Q  154 ttggattaattatttaattaatcaattatgg---attgacaataatcaattattataa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |   || |||||||||||||||||||||    
T  19242130 ttggattaattatttaattaatcaattatagatcatcgacaataatcaattattataa 19242073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 119; Significance: 9e-61; HSPs: 19)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 9e-61
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18341810 - 18341652
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  18341810 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattcacaataattaattattataagttaatgtcataatataaattatgatctattgtgttaagcact 18341711  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18341710 aattagatgatgaatatgtgtgattgagctattctttctatatggaccgtgatgggttg 18341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 3949901 - 3950058
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| || |||||||    
T  3949901 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatagtctattgtgtcaagcact 3950000  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
    ||||| ||||| |||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3950001 aattaattgataaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggtt 3950058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 40113309 - 40113469
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac- 250  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  40113309 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataattaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 40113408  T
Q  251 -taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40113409 ataattagttgatgaatatgtgtgattgagctattctttttaaatggaccgtgatgggttg 40113469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 152 - 309
Target Start/End: Original strand, 669913 - 670070
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || | ||  |||||||| |  ||||||| ||||||||||    
T  669913 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatattattttataaattgtggtctattgtgttaagcact 670012  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 309  Q
    ||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  670013 aattacttgatgaatatgtgtgattgatctattctttctaaatggaccgtgatgggtt 670070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23888635 - 23888477
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  23888635 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 23888536  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23888535 cattagttgatgaatatgtatgatcggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 23888477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23892711 - 23892553
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  23892711 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 23892612  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23892611 cattagttgatgaatatgtatgatcggactattctttctaaatggaccgtgatgggttg 23892553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 39190009 - 39190167
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || | ||||||||||||||  ||||||| ||||| || |    
T  39190009 tgttagattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattatgagttaatcttataatataaattatggtctattgtgttaaacatt 39190108  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| |  |||||| |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  39190109 aattagttgatgaatatgagtgattgggctattgttactaaatggaccgtgatgggttg 39190167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 159 - 310
Target Start/End: Original strand, 24138292 - 24138443
Alignment:
Q  159 ttaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagt 258  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  ||||||||| ||||||    
T  24138292 ttaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcactcattagt 24138391  T
Q  259 tgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24138392 tgatgaatatgtatgattgagttattctttttaaatggaccgtgatgggttg 24138443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 17527552 - 17527391
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattat-aatctattgcgttaagc-- 248  Q
    |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||| | ||||   | ||||| |||||||      
T  17527552 tgttagattaattatttaattaatcaaatatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattat-atttatgggtttattgtgttaagcac 17527454  T
Q  249 -actaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||||||| || |||||| || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17527453 tactaattagttgatgaatatgtgtgattgggccattctttctaaatggaccgtgatgggttg 17527391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 208 - 310
Target Start/End: Original strand, 41826520 - 41826622
Alignment:
Q  208 agttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatggg 307  Q
    |||| |||| ||| ||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41826520 agttaatgttatagtataaattatggtctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtttgattgagctattctttttaaatggaccgtgatggg 41826619  T
Q  308 ttg 310  Q
    |||    
T  41826620 ttg 41826622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 235 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15144420 - 15144345
Alignment:
Q  235 ctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15144420 ctattgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtgtgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgagttg 15144345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 219 - 314
Target Start/End: Original strand, 25336147 - 25336242
Alignment:
Q  219 taatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    ||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25336147 taatataaactatggtctgttgtgttaagcactaattagttgatgaatatgtgtgattgaactattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 25336242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 222
Target Start/End: Original strand, 14661188 - 14661258
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataat 222  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||    
T  14661188 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataat 14661258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 152 - 297
Target Start/End: Original strand, 33425823 - 33425968
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaatt-atggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| || |  ||||||||||||| || ||||| ||||| |||    
T  33425823 tgttggattaatgatttaattgatcaatttatggattgacaataatcaattattata-gttaatcttttaatataaattatgatgtattgtgttaaacac 33425921  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatgga 297  Q
     |||||| ||||||||| || | |||||| |||  ||||||||||||    
T  33425922 gaattagatgatgaatatgtgtaattgtgttatagtttctaaatgga 33425968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 152 - 211
Target Start/End: Complemental strand, 4840986 - 4840927
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 211  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4840986 tgttggattaatgatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagtt 4840927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 216
Target Start/End: Original strand, 25335751 - 25335815
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgt 216  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  25335751 tgttggattaattatctaattaatcacttatggattgacaataatcaattattataagttaatgt 25335815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 662699 - 662839
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||  ||                   ||||| ||||| ||||    
T  662699 tgttggattaattatttaattaatcaattatggatttacaataataaattattataaattgtggtt------------------tattgtgttaaacact 662780  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  662781 aattacttgatgaatatgtgtgattgagctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 662839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 249 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 17530171 - 17530121
Alignment:
Q  249 actaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggacc 299  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  17530171 actaattagttgatgaatatgtgtgattgtgtcattctttttaaatggacc 17530121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 206
Target Start/End: Original strand, 304610 - 304654
Alignment:
Q  162 attatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattat 206  Q
    |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  304610 attaattaattcatcaattatggatcgacattaatcaattattat 304654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 115; Significance: 2e-58; HSPs: 17)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 2e-58
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 39574395 - 39574553
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  39574395 tgttggattaattatttaattaatcctttatgaattgacagtaatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagcact 39574494  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39574495 aattagttgatgaatatgtgtgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 39574553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24515590 - 24515435
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||| ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  24515590 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaa---atgttataatataaattatggtctattgtgttaagcact 24515494  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24515493 aattagttgatgaatatgtgtgatcgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 24515435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 152 - 267
Target Start/End: Original strand, 39580411 - 39580526
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||| |||||| |||    
T  39580411 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatgtcataatataaattatggtctattgtgttaagtact 39580510  T
Q  252 aattagttgatgaata 267  Q
    ||||||||||||||||    
T  39580511 aattagttgatgaata 39580526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 41140774 - 41140932
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||| ||||||||||||||  ||||||  |||||||| |    
T  41140774 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattattataaaatgttataatataaattatggtctattatgttaagcatt 41140873  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  41140874 aattagttgatgaatatgtatgattggtctattctttttaaatggaccgtgatgggttg 41140932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9765215 - 9765057
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||| ||  |||||||||    
T  9765215 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattttcaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctactgtattaagcact 9765116  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9765115 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttataaatggaccgtgatgggttg 9765057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 47858008 - 47858166
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| ||||    
T  47858008 tgttggattaattatttaattaatcaattatagattgacaataatcaattaaaataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacact 47858107  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| || ||| ||||||||    
T  47858108 cattagttgatgaatatgtatgattgagctattctttctaaattgatcgtaatgggttg 47858166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9758587 - 9758442
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||           ||||  |||  |||| ||  |||||||||    
T  9758587 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattttcaataatcaattattataattt-----------ataa--tatggtctactgtattaagcact 9758501  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9758500 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 9758442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 157 - 267
Target Start/End: Original strand, 47854629 - 47854739
Alignment:
Q  157 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaatta 256  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||| |||| ||||    
T  47854629 gattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattaaaataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaaacactcatta 47854728  T
Q  257 gttgatgaata 267  Q
    |||||||||||    
T  47854729 gttgatgaata 47854739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 152 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24526417 - 24526361
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24526417 tgttgaattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataa 24526361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 222 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 12017899 - 12017810
Alignment:
Q  222 tataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattc-tttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  12017899 tataaattatgatctattgtgttaaacactaattagttgatgaatatgtctgattgaattattcttttctaaatggaccgtgatgagttg 12017810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 234 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24523261 - 24523185
Alignment:
Q  234 tctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| || ||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24523261 tctattgtgttaagcactaattaattgatgaatatgtgtgattggtctattctttttaaatggaccgtgatgggttg 24523185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 158 - 284
Target Start/End: Original strand, 38279796 - 38279923
Alignment:
Q  158 attaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatcta--ttgcgtt-aagcactaat 254  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||||  ||||||| |||||||||||| || || |  ||||||||||||| || ||  ||| ||| ||||||||||    
T  38279796 attaattatttaattaatcaaccatggatcaacaataaacaattattataaattaattt--taatataaattatgatttattttgtgttaaagcactaat 38279893  T
Q  255 tagttgatgaatacgtctgattgtgctatt 284  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||    
T  38279894 tagttcatgaatatgtgtgattgttctatt 38279923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Original strand, 39183711 - 39183762
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattatt 204  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  39183711 tgttggatgaattatttaattaatcaattatgaattgacaataa-caattatt 39183762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 240
Target Start/End: Original strand, 38278809 - 38278895
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattg 240  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || ||| ||||||||| ||||| ||||||||| || |  || ||||||||||||| || |||||    
T  38278809 tgttgaattaattatttaattaattaactatagattgacaaaaatcagttattataaattaa--tcttaatataaattatgatttattg 38278895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 152 - 199
Target Start/End: Original strand, 5996229 - 5996275
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaa 199  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5996229 tgttagattaattatttaattaatcaattatgaattga-aataatcaa 5996275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 248 - 304
Target Start/End: Original strand, 38278927 - 38278983
Alignment:
Q  248 cactaattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgat 304  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||  ||||| | ||| |||||||||||||    
T  38278927 cactaattagttgatgaatatgtgtgattggactattgtctctgaatggaccgtgat 38278983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 281 - 313
Target Start/End: Original strand, 39581073 - 39581105
Alignment:
Q  281 tattctttctaaatggaccgtgatgggttgaac 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  39581073 tattctttctaaatggaccgtgatgagttgaac 39581105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 1)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 172 - 314
Target Start/End: Original strand, 30003 - 30145
Alignment:
Q  172 taatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatgaatacgtc 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||     
T  30003 taatcaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattataaattatgatctattgtgttaaacactaattagttgatgaatatgtg 30102  T
Q  272 tgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  30103 tgattgagctattctttctaaatggaccgtgatggattgaacc 30145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 3)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Original strand, 67675 - 67833
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  || | ||||    
T  67675 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattgaacact 67774  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  67775 cattagttgatgaatatgtatgattgggctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 67833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 165 - 310
Target Start/End: Original strand, 60212 - 60357
Alignment:
Q  165 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcactaattagttgatga 264  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  || | |||| ||||||||||||    
T  60212 atttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattgaacactcattagttgatga 60311  T
Q  265 atacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
    ||| || |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  60312 atatgtatgattgggctattcttactaaatggaccgtgatgggttg 60357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 152 - 180
Target Start/End: Original strand, 60166 - 60194
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaatt 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  60166 tgttggattaattatttaattaatcaatt 60194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1634 (Bit Score: 91; Significance: 5e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold1634
Description:

Target: scaffold1634; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 152 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 267 - 109
Alignment:
Q  152 tgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcact 251  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||| || | |||  |||||||  |||||||||    
T  267 tgttggattaattatttaattaattaattatggattgacaataatcaattattataaattaatgttataatttataatatggtctattgtattaagcact 168  T
Q  252 aattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttg 310  Q
     ||||||||||||||| || ||||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  167 cattagttgatgaatatgtatgattggactattctttctaaatggatcgtgatgggttg 109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 151 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 40383 - 40232
Alignment:
Q  151 gtgttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcac 250  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||| ||||||||||  |||| || | |||||||    
T  40383 gtgttggattaattattcaattaattaattatggattgacaataatcaattattataagttaatattatattataaattatggtctactgtgctaagcac 40284  T
Q  251 taattagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtg 302  Q
    ||||||||||||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||    
T  40283 taattagttgatgaatatgtgtgattgagttattctttttaaatggaccgtg 40232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0027 (Bit Score: 86; Significance: 4e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0027
Description:

Target: scaffold0027; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 153 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 134786 - 134625
Alignment:
Q  153 gttggattaattatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattataagttgatgtcataatataaattataatctattgcgttaagcacta 252  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||| || | ||||||||||||||  | ||||  ||||| ||||     
T  134786 gttggattaattatttaattaatcaattatggattgataataataatttattataagttaatcttataatataaattatggtatattctgttaaacactg 134687  T
Q  253 attagttgatgaatacgtctgattgtgctattctttctaaatggaccgtgatgggttgaacc 314  Q
    |||||||||||||||||  ||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  134686 attagttgatgaatacgagtgattggactattgttactaaatggaccgtgatgggttgaacc 134625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 164 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 143352 - 143309
Alignment:
Q  164 tatttaattaatcaattatggattgacaataatcaattattata 207  Q
    ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  143352 tatttaactaatcaattatagattgacaataatcagttattata 143309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University