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 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15569_low_6 (Length: 256)

Name: NF15569_low_6
Description: NF15569
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15569_low_6
NF15569_low_6
[»] chr4 (7 HSPs)
chr4 (1-256)||(14354740-14354995)
chr4 (1-244)||(10271696-10271939)
chr4 (1-244)||(10282418-10282661)
chr4 (56-241)||(14476030-14476217)
chr4 (1-132)||(9620884-9621015)
chr4 (147-256)||(14476219-14476329)
chr4 (110-243)||(13163543-13163676)
[»] chr6 (10 HSPs)
chr6 (1-256)||(3008325-3008580)
chr6 (1-256)||(13803229-13803484)
chr6 (1-256)||(18451339-18451596)
chr6 (1-168)||(17736324-17736491)
chr6 (1-244)||(35055584-35055827)
chr6 (39-256)||(24506785-24507002)
chr6 (1-209)||(31347339-31347551)
chr6 (15-47)||(35058011-35058043)
chr6 (12-143)||(10444435-10444569)
chr6 (187-244)||(10444651-10444707)
[»] chr1 (5 HSPs)
chr1 (1-253)||(28452844-28453095)
chr1 (1-256)||(20709468-20709723)
chr1 (1-256)||(21190799-21191056)
chr1 (155-244)||(34391446-34391536)
chr1 (1-129)||(35892779-35892909)
[»] scaffold0125 (4 HSPs)
scaffold0125 (1-256)||(44006-44261)
scaffold0125 (1-256)||(7623-7878)
scaffold0125 (110-256)||(567-712)
scaffold0125 (1-115)||(3145-3259)
[»] chr7 (10 HSPs)
chr7 (1-256)||(21659668-21659923)
chr7 (1-256)||(10664038-10664275)
chr7 (4-256)||(33058959-33059212)
chr7 (1-256)||(18985845-18986104)
chr7 (1-256)||(19000473-19000732)
chr7 (50-256)||(42567119-42567327)
chr7 (1-244)||(33557624-33557868)
chr7 (1-208)||(9044859-9045069)
chr7 (14-244)||(30236369-30236599)
chr7 (1-244)||(13317372-13317615)
[»] chr3 (6 HSPs)
chr3 (1-256)||(6001597-6001852)
chr3 (1-256)||(3162023-3162280)
chr3 (1-256)||(19165406-19165662)
chr3 (18-199)||(12919101-12919285)
chr3 (1-244)||(25200380-25200623)
chr3 (112-244)||(3528881-3529012)
[»] scaffold0117 (1 HSPs)
scaffold0117 (1-256)||(22624-22881)
[»] chr2 (8 HSPs)
chr2 (1-255)||(19818747-19819005)
chr2 (1-244)||(36733385-36733630)
chr2 (12-242)||(36737541-36737773)
chr2 (1-256)||(45526970-45527226)
chr2 (1-256)||(19644125-19644378)
chr2 (21-216)||(45535461-45535657)
chr2 (144-256)||(30212874-30212986)
chr2 (1-120)||(30212986-30213101)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-256)||(39121-39377)
[»] scaffold0058 (1 HSPs)
scaffold0058 (1-256)||(61078-61335)
[»] chr5 (5 HSPs)
chr5 (2-256)||(21402998-21403252)
chr5 (12-256)||(21419232-21419476)
chr5 (1-117)||(23295337-23295453)
chr5 (110-244)||(26766263-26766398)
chr5 (1-80)||(21401607-21401685)
[»] chr8 (8 HSPs)
chr8 (109-256)||(7464190-7464338)
chr8 (144-256)||(22709446-22709558)
chr8 (1-120)||(22709558-22709677)
chr8 (71-256)||(38049831-38050016)
chr8 (1-244)||(20518650-20518894)
chr8 (1-244)||(23884913-23885157)
chr8 (1-171)||(22618155-22618326)
chr8 (1-244)||(20878037-20878282)
[»] scaffold0217 (1 HSPs)
scaffold0217 (31-256)||(27203-27430)
[»] scaffold0007 (1 HSPs)
scaffold0007 (88-256)||(83429-83596)
[»] scaffold0337 (1 HSPs)
scaffold0337 (39-256)||(2371-2588)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (140-256)||(22249-22366)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (21-115)||(1151-1245)
[»] scaffold0394 (1 HSPs)
scaffold0394 (14-244)||(8770-8999)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (187-244)||(74013-74069)
[»] scaffold1716 (1 HSPs)
scaffold1716 (1-48)||(891-939)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 240; Significance: 1e-133; HSPs: 7)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 14354995 - 14354740
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14354995 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacatcggaaatatttaatct 14354896  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  14354895 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatgg 14354796  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  14354795 aaaataaaacacataagaatccccatcctgttacgtatcagagcatgactcctatg 14354740  T

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Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 10271696 - 10271939
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10271696 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaattcactatttttttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 10271795  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaa-gatacgtaacaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || | || |||||| |||| |||||  || || |||||||  ||| ||||||||    
T  10271796 ttaagcattacttggcactaaggcctcaacgtcatcaacat-aattaatttcatctaaaaatggttcaacaataagttcataaaaataatatgtaacaat 10271894  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10271895 ggaaaataaaataca-attaatcctcatcccgttacgtatcagagc 10271939  T

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Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 10282418 - 10282661
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10282418 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaattcactatttttttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 10282517  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaa-gatacgtaacaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || | || |||||| |||| |||||  || || |||||||  ||| ||||||||    
T  10282518 ttaagcattacttggcactaaggcctcaacgtcatcaacat-aattaatttcatctaaaaatggttcaacaataagttcataaaaataatatgtaacaat 10282616  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10282617 ggaaaataaaataca-attaatcctcatcccgttacgtatcagagc 10282661  T

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Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 56 - 241
Target Start/End: Original strand, 14476030 - 14476217
Alignment:
Q  56 gctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccac 154  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  14476030 gctttcaataatttcaaataatgtcgcagcggaaagtattcaatgtttaaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacgtaaataaaatccac 14476129  T
Q  155 ctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaat-ccccatcccgttacgtatcag 241  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||| ||||||||||||    
T  14476130 ctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaaggaaaacaaaacacataaatatcccccatcctgttacgtatcag 14476217  T

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Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 132
Target Start/End: Original strand, 9620884 - 9621015
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  9620884 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaattt 9620983  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatat 132  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9620984 ttaagcattacttggcactaagacctcaatat 9621015  T

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Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 67; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 147 - 256
Target Start/End: Original strand, 14476219 - 14476329
Alignment:
Q  147 aaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaat-ccccatcccgttacgtatcagagca 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||  || |||||||| |||||||||||||||     
T  14476219 aaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaaggaaaacaaaacacataaatatcccccatcctgttacgtatcagagcc 14476318  T
Q  246 tgactcctatg 256  Q
    |||||||||||    
T  14476319 tgactcctatg 14476329  T

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Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 110 - 243
Target Start/End: Original strand, 13163543 - 13163676
Alignment:
Q  110 acttggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaagatacgtaacaatgaaaaataa 207  Q
    |||||||||||| |||||||| |||| |||||||| |||  |||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  13163543 acttggcactaaaggcctcaacatcatcaacataattaat-tccatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaagaatatgtaacaatggaaaataa 13163641  T
Q  208 aacacataagaatccccatcccgttacgtatcagag 243  Q
    || ||| |  ||||||||||||||||||||||||||    
T  13163642 aataca-attaatccccatcccgttacgtatcagag 13163676  T

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Target: chr6 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 10)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3008580 - 3008325
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||||    
T  3008580 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgtagcgaatatatttaatct 3008481  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  3008480 ttaagcattacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacttaacaatgg 3008381  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3008380 aaaataaaacacataagaatccctatcccgttatgtatcagagcatgactcctatg 3008325  T

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Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 13803484 - 13803229
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13803484 ttcaaaatatcatttaacacaaataaagttaaatttactatttatttaaacaattgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 13803385  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||     
T  13803384 ttaaacattacttggaactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattatacgaagatacgtaacaatgg 13803285  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||    
T  13803284 aaaataaaacacataagaatcctcatctcgttacgtatcagagcatgattcctatg 13803229  T

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Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 18451339 - 18451596
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatc 99  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| |||     
T  18451339 ttcaaaatatcattcaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataat-taaaacaatgtcgcagtggaaaatattcaatg 18451437  T
Q  100 tt-taagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaa-caa 197  Q
    || | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||  ||    
T  18451438 ttgttaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacatcaataaaattcacctaaaagtggttcaacatcaagttatagaaagatacgtaataaa 18451537  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     |||||| |||||||| ||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18451538 ggaaaaacaaaacacacaaacatccctatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 18451596  T

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Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 7e-64
Query Start/End: Original strand, 1 - 168
Target Start/End: Original strand, 17736324 - 17736491
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||  |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17736324 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttttttaaacaactgctttacataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 17736423  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtcca 168  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  17736424 ttaagcattacttgacactaaggcctcaacaccaacaacataaataaaatccacctaaaagtgatcca 17736491  T

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Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 35055584 - 35055827
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  35055584 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgcttttaaaaattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 35055683  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaag-atacgtaacaat 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||  || || |||||||| |||  |||||||    
T  35055684 ttaagcattacttggcactaaggcctcaacgtcatcaacat-aattaattccatctaaaaatggttcaacaataagttcataaaaagaatatataacaat 35055782  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    | ||||||||| ||| |  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  35055783 ggaaaataaaataca-attaatccacatcccgttacgtatcagagc 35055827  T

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Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 24507002 - 24506785
Alignment:
Q  39 tatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaaca 137  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  24507002 tatttaattaaacaactcctttcaataat-tgaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaacgtttagacaatccttggcactaaggcctcaacatcaaca 24506904  T
Q  138 acataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgta 237  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||   ||| ||||||||||||||    
T  24506903 acataataaaatttcacctaaaagtagtccaagatcaacttagaaaaagatacgtaacaaaggaaaacaaaacacataaacttcctcatcccgttacgta 24506804  T
Q  238 tcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||    
T  24506803 tcagagcatgactcctatg 24506785  T

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Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 31347551 - 31347339
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattc-actatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||| || ||| |||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||||| |||| ||    
T  31347551 ttcaaaatatcattaaatgtaaatagagttaaaatccactctttatttaaaacatctgctttcaataat-taaaacaatgttgcagcggaaaatattcaa 31347453  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaaga-tacgtaa 194  Q
      | ||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  |||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||    
T  31347452 cgtctaaacaatacttggcactaaaggcctcaacgtcatcaacataattaat-tccatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatacgtaa 31347354  T
Q  195 caatgaaaaataaaa 209  Q
    ||||| |||||||||    
T  31347353 caatggaaaataaaa 31347339  T

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Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 47
Target Start/End: Original strand, 35058011 - 35058043
Alignment:
Q  15 taacacaaatagagttaaattcactatttattt 47  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35058011 taacacaaatagagttaaattcactatttattt 35058043  T

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Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 12 - 143
Target Start/End: Original strand, 10444435 - 10444569
Alignment:
Q  12 atttaacacaaatagagtt-aaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaatctttaagcat 108  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||| | |||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||  ||||| ||     
T  10444435 atttaacacaaataaagttaaaattcactctatatttaaagcaactgcttccaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaacgtttaaacaa 10444533  T
Q  109 tacttggcact-aaggcctcaatatcaacaacataa 143  Q
    || |||||||| ||||||||||  ||| ||||||||    
T  10444534 tatttggcactaaaggcctcaacgtcatcaacataa 10444569  T

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Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Original strand, 10444651 - 10444707
Alignment:
Q  187 atacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| |  ||| | |||||||||||||||||||||    
T  10444651 atacgtaacaatgaaaaataaaataca-attaattctcatcccgttacgtatcagagc 10444707  T

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Target: chr1 (Bit Score: 201; Significance: 1e-110; HSPs: 5)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 1 - 253
Target Start/End: Original strand, 28452844 - 28453095
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  28452844 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 28452943  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28452944 ttaagcattacttggcactaaagcctcaacgtcaacatcataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatga 28453043  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcct 253  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  28453044 aaaataaaacacataagaatctccat-ctgttacgtatcagagcatgactcct 28453095  T

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Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 20709723 - 20709468
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  20709723 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcacaatttatttaaacaactgctttcaataatccaaaataatgtcgcagcggaaacatttaatct 20709624  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  20709623 ttaagcattacttggcactaaggccttaacatcaataacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatgg 20709524  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20709523 aaaataaaacacataagaattctcaccccgttacgtatcaaagcatgactcctatg 20709468  T

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Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 21191056 - 21190799
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaat 98  Q
    |||||||||||||||||   |||| ||||||||| |||| |||||||| | ||| |||||||| |||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||    
T  21191056 ttcaaaatatcatttaatgtaaattgagttaaatccactctttatttaaaacaattgctttcagtaat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaat 21190958  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aa 197  Q
     ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| ||    
T  21190957 gtttaaacaatacttgacactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacctaacaaa 21190858  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     |||||| |||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  21190857 ggaaaaacaaaacacataaacatccccatcctattacgtatcagagcatgactcctatg 21190799  T

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Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 244
Target Start/End: Original strand, 34391446 - 34391536
Alignment:
Q  155 ctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaaga-tacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  34391446 ctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatacgtaacaatggaaaataaaataca-attaatccccatcccgttacgtatcagagc 34391536  T

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Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 129
Target Start/End: Original strand, 35892779 - 35892909
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtt-aaattcactatttattt-atacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaa 97  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||| | ||| |||||| ||||||| |  || || ||| |||||| ||||||||||    
T  35892779 ttcaaaatattatttaacataaatagagttaaaatccactctttatttaaaacatctgcttccaataattttcaacaacgtcgcagcggtaaatatttaa 35892878  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaa 129  Q
    ||||| | ||  | ||||||||||||||||||    
T  35892879 tctttcaaca-aaattggcactaaggcctcaa 35892909  T

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Target: scaffold0125 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 4)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 44261 - 44006
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||  ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  44261 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactggtttcaataattcaaaataatgtcgcagcgaaaatatttaatct 44162  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  44161 ttaagcagtactttgcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatgg 44062  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44061 aaaataaaacacttaagaatccctatcccgttgcgtatcagagcatgactcctatg 44006  T

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Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7878 - 7623
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||||| ||    
T  7878 ttcaaaacatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagccgaaatatttaacct 7779  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||     
T  7778 ttaagcattacttggcactaaggccttaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaatatcaaattataagaagatatgtaacaatgg 7679  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  7678 aaagtaaaccacataagaatccccatctcgttacgtatcagagcatgactcctatg 7623  T

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Target: scaffold0125; HSP #3
Raw Score: 99; E-Value: 6e-49
Query Start/End: Original strand, 110 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 712 - 567
Alignment:
Q  110 acttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaa 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||| |||    
T  712 acttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaaaatcaaattataagaagatatgtaacaatggaaaat-aaa 614  T
Q  210 cacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| |||||||||    
T  613 cacataagaatcctcatcctgttacgtaatagagcataactcctatg 567  T

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Target: scaffold0125; HSP #4
Raw Score: 95; E-Value: 1e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 3259 - 3145
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3259 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatataaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 3160  T
Q  101 ttaagcattacttgg 115  Q
    |||||||||||||||    
T  3159 ttaagcattacttgg 3145  T

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Target: chr7 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 10)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 21659668 - 21659923
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| |||||||||||||    
T  21659668 ttcaaaatatcttttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgtagcgaaaatatttaatct 21659767  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  21659768 ttaagcattacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatatgtaacaatgg 21659867  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21659868 aaaataaaacacataagaatcctcatgccgttacgtatcagagcatgacttctatg 21659923  T

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Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 6e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 10664275 - 10664038
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10664275 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcattatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgttacagcggaaatatttaatct 10664176  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||                  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  10664175 ttaagc------------------ctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatgg 10664094  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10664093 aaaataaaacacataagaatccccattccgttacgtatcagagcatgactcctatg 10664038  T

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Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 7e-61
Query Start/End: Original strand, 4 - 256
Target Start/End: Original strand, 33058959 - 33059212
Alignment:
Q  4 aaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatcttt 102  Q
    ||||||||||| ||   ||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||| |||    
T  33058959 aaaatatcattaaatgtaaatagagttaaatttactatttatttaaacaattgctttcaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaatgttt 33059057  T
Q  103 aagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaa 201  Q
    || || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| || |||    
T  33059058 aaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataataaaattccacctaaatgtggtccaagatcaacttagaaaaagatacgtaacaaaggaa 33059157  T
Q  202 aaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    ||| |||||| ||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  33059158 aaacaaaacatataaacatccccatcccgttacgtatcatagcatgacttctatg 33059212  T

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Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18986104 - 18985845
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaa--ataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| |||  || |||||| |||| ||    
T  18986104 ttcaaaatatcattaaatgtaaatagagttaagtccactatttatttaaacaactgctttcaataattaaaacaatattgttgcaacggaaaatattcaa 18986005  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaa-ca 196  Q
      |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  18986004 cgtttaaataatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaagaa 18985905  T
Q  197 atgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  18985904 aggaaaaacaaaacacataaacatcctcatcccgttatgtatcagagcatgactcatatg 18985845  T

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Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19000732 - 19000473
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaa--ataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||| ||   ||||| |||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||  ||| |||  || |||||| |||| ||    
T  19000732 ttcaaaatatcattaaatgtaaataaagttaagtccactatttatttaaacaactgctttcaataattaaaacaatattgttgcaacggaaaatattcaa 19000633  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaa-ca 196  Q
      |||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||  |    
T  19000632 cgtttaaataatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaagaa 19000533  T
Q  197 atgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    | |||||| |||||||||||  |||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  19000532 aggaaaaacaaaacacataaacatcctcatcccgttatgtatcagagcatgactcatatg 19000473  T

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Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 50 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 42567327 - 42567119
Alignment:
Q  50 acaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaa 148  Q
    |||| |||||||||||||   || ||||||| ||||||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  42567327 acaaatgctttcaataattccaactaatgtcgcagcggaaaatattaaatatttaaacaataattggcactaaggcctcaacatcaacatcataaataaa 42567228  T
Q  149 atccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatg 247  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||| || |||||| ||||||| |||  |||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  42567227 atccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacataacaaaggaaaaacaaaacacgtaaacatcctcatcctgttacgtattagagcatg 42567128  T
Q  248 actcctatg 256  Q
    || ||||||    
T  42567127 acacctatg 42567119  T

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Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 33557868 - 33557624
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaatc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||| |||||| || ||| ||||| | ||      
T  33557868 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaattgctttcaataat-taaaacaatgtcgcaacggaaaataatcaacg 33557770  T
Q  100 tttaagcattacttggcact-aaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaag-atacgtaaca 196  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||  |||   |||| ||| || | || |||||| |||| |||||  ||||| |||||||| ||| ||||||    
T  33557769 tttaaacaatacttggcactaaaggcctcaacgtcattgacat-aattaatttcatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatatgtaaca 33557671  T
Q  197 atgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
     || ||||||||| ||| |  ||||||||| |||||||||||||||||    
T  33557670 gtggaaaataaaataca-attaatccccatgccgttacgtatcagagc 33557624  T

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Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 9044859 - 9045069
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattca-ctatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| || |||||| | | ||||||||| ||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||    
T  9044859 ttcaaaatatcattaaatgtaaatagagttaaaatcaactctttattaaaagcaactgcttccaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaa 9044957  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaagatacgtaac 195  Q
      ||||| || ||||||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  ||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||  |||||||||    
T  9044958 cgtttaaacaatacttggcactaaaggcctcaacgtcatcaacataattaat-tccacctaaaaatggttcaacaataaattcataaaagaatacgtaac 9045056  T
Q  196 aatgaaaaataaa 208  Q
    |||| ||||||||    
T  9045057 aatggaaaataaa 9045069  T

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Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Original strand, 30236369 - 30236599
Alignment:
Q  14 ttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaa-taatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatctttaagcattact 112  Q
    |||| |||| ||||||| || |||||| ||||||| | |||| ||||||| |||| ||||| ||  |||||||||||||||||| || |    ||  |||    
T  30236369 ttaaaacaattagagtttaaatcactacttattta-ataacttctttcaaataat-taaaacaacatcacagcggaaatatttattcatcttacaaaact 30236466  T
Q  113 tggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaaga-tacgtaacaatgaaaaataaaa 209  Q
    ||||||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  |||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  30236467 tggcactaaaggcctcaacgtcatcaacataattaat-tccatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatacgtaacaatggaaaataaaa 30236565  T
Q  210 cacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
     ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  30236566 taca-attaatccccatcccgttacgtatcagagc 30236599  T

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Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 13317615 - 13317372
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtt-aaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaa 97  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||| | || ||| || ||||||| |  || || ||| |||||| |||||||||     
T  13317615 ttcaaaatattatttaacacaaatagagttaaaatccactctttatttaaatcatctgtttccaataattttcaacaacgtcgcagcggaaaatatttat 13317516  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataa--aaagatacgtaa 194  Q
    ||||| | ||  | ||| |||||||||||||| || |||||| | | ||||||||| | |||| ||||||||||  || || ||||  ||| ||||||||    
T  13317515 tctttcaaca-aaattgacactaaggcctcaacataaacaacgtcattaaaatccaac-aaaattggtccaacaataagttcataaggaaaaatacgtaa 13317418  T
Q  195 caatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||||| |||||||   |||| | | ||||||||||||||| |||||||||    
T  13317417 caatg-aaaataa---acatcaaagtccccatcccgttacatatcagagc 13317372  T

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Target: chr3 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 6001597 - 6001852
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6001597 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 6001696  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||     
T  6001697 ttaagcattacttggcactgaggcctcaacatcaacaacatatataaaattcacctaaaagtggtaaaacatcaaattataagaagatacgtaacaatgg 6001796  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6001797 taaataaaacacataagaattcccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 6001852  T

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Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 139; E-Value: 8e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 3162280 - 3162023
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaat 98  Q
    |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||| | || ||||||||| |||| ||||| |||||| ||| ||||| |||| |||    
T  3162280 ttcaaaatatcatttaatgtaaatagagttaaatccactctttatttaaaacacctgctttcagtaat-taaaacaatgtcgcagtggaaaatattcaat 3162182  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aa 197  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  3162181 gtttaaacaatacttggcactaaggcctcaaaatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaa 3162082  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     |||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3162081 ggaaaaacaaaacacataaacatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 3162023  T

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Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 3e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 19165662 - 19165406
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatc 99  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||| || | |||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| |||     
T  19165662 ttcaaaatatcattaaaagtaaatagagttaaatccaatctttatttaaacaactactttcaataat-taaaacaatgtcgcaacggaaaatattcaatt 19165564  T
Q  100 ttta-agcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaat 198  Q
    |||  | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||     
T  19165563 tttttaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatcaacctaaaagtggtccaccatcaagttatagaaagatacgtaacaaa 19165464  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    | ||||  ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19165463 ggaaaaacaaacacataaacatctccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 19165406  T

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Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 18 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 12919285 - 12919101
Alignment:
Q  18 cacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaatctttaagcattacttgg 115  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||||||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||  ||||| || |||||||    
T  12919285 cacaaatagagttaaattcactatttatttaaatcatctgctttcaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaacgtttaaacaatacttgg 12919187  T
Q  116 cact-aaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaag-atacgtaacaatg 199  Q
    |||| ||||||||||  ||| |||||| ||| || | || |||||| |||| |||||  ||||| |||||||| |||||||||||||    
T  12919186 cactaaaggcctcaacgtcatcaacat-aattaatttcatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatacgtaacaatg 12919101  T

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Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 25200380 - 25200623
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtt-aaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaa 97  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||| |||| |||||||| |  |||| ||| ||||||| ||||| |||||| |||||| ||||||| ||    
T  25200380 ttcaaaatattatttaacacaattagagttaaaatccactctttatttaaagaaactacttccaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaa 25200478  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaag-atacgtaac 195  Q
      ||||| || || ||||||||||||||| ||  ||  |||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||  || || |||||||| |||||| ||    
T  25200479 cgtttaaacaata-ttggcactaaggccttaacgtcgtcaacat-aattaattccatctaaaaatggttcaacaataagttcataaaaagaatacgtgac 25200576  T
Q  196 aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    |||| ||||||||| ||| |  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  25200577 aatggaaaataaaataca-attaat-cccatcccgttacgtatcagagc 25200623  T

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Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 112 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 3529012 - 3528881
Alignment:
Q  112 ttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaac 210  Q
    |||||||||||||||||| || |||||| | | ||||||||| | |||| |||| |||||  ||||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||     
T  3529012 ttggcactaaggcctcaacataaacaacgtcattaaaatccaac-aaaattggtgcaacaataaattcataaaataatacgtaacaatggaaaataaaat 3528914  T
Q  211 acataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||| |  |||| |||||  |||||||||||||||    
T  3528913 aca-attaatctccatcatgttacgtatcagagc 3528881  T

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Target: scaffold0117 (Bit Score: 152; Significance: 1e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0117
Description:

Target: scaffold0117; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 22624 - 22881
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactat--ttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  |||||||| |||| ||    
T  22624 ttcaaaatatcatttaacacaaat-gagttaaattcactatatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgtagcggaaaatattaaa 22722  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaa 197  Q
    | |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  22723 tgtttaagcaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaggatatgtaacaa 22822  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     | |||| |||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22823 aggaaaacaaaacacaaatacatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 22881  T

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Target: chr2 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 8)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 1 - 255
Target Start/End: Original strand, 19818747 - 19819005
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaatc 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||   ||||||||||| || ||| ||||||| |||     
T  19818747 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaatttactatttatttaaacaactgctttcaataagtcaaaataatgtcgcatcggaaaatattcaatg 19818846  T
Q  100 tttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac---a 196  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||| | | |||||||||| ||||   |    
T  19818847 tttaaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaaccacataataaaattccacctaaaagtggtccaagatcaactcagaaaaagatacataacaaaa 19818946  T
Q  197 atgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctat 255  Q
    | |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19818947 aggaaaaacaaaaaacataaacatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctat 19819005  T

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Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 131; E-Value: 5e-68
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 36733630 - 36733385
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaat 98  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| ||||||||    
T  36733630 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaagcaactgcttccaataat-taaaacaacgtcgcagcggaaaatatttaat 36733532  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aa 197  Q
     ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  36733531 gtttaaacaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaa 36733432  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
     |||||| ||||||||||   ||||| |||| || ||||||||||||    
T  36733431 ggaaaaacaaaacacatagacatccctatcctgtcacgtatcagagc 36733385  T

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Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 12 - 242
Target Start/End: Complemental strand, 36737773 - 36737541
Alignment:
Q  12 atttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcatt 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| || ||| ||||||||| |||| ||| ||||| || |    
T  36737773 atttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaagcaactgcttccaataat-taaaacaacgtcgcagcggaaaatattcaatgtttaaacaat 36737675  T
Q  110 acttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaa 208  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  36737674 acttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaaggaaaaacaaa 36737575  T
Q  209 acacataagaatccccatcccgttacgtatcaga 242  Q
    |||||||   ||| ||||||||||||||||||||    
T  36737574 acacatagacatcaccatcccgttacgtatcaga 36737541  T

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Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 45526970 - 45527226
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatc 99  Q
    |||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||    
T  45526970 ttcaaaatatcattaaatgtaaatagagttaaatccactctttatttaaacaactgctttcaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaatc 45527068  T
Q  100 tttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aat 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| | ||||| ||||||| ||     
T  45527069 tttaagcattacttggcactaaggcctaaacctcaacaacataataaaattccacctaaaagtggtccgagatcaacttagagaaagacacgtaacaaag 45527168  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||| |||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45527169 gaaaaacaaaacacataaacatctccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 45527226  T

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Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 104; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Original strand, 19644125 - 19644378
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatc 99  Q
    |||||||||||||| || | | |||||||   || |||| |||||||  |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| |||     
T  19644125 ttcaaaatatcattaaatatatatagagt---atccactctttatttgaacaactactttcaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaatg 19644220  T
Q  100 ttta-agcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaat 198  Q
    |||  |  | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||     
T  19644221 tttttaaaaatacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaatatcaaattatagaaagatacgtaacaaa 19644320  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
      |||| |||||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19644321 agaaaacaaaacacaaaaagatctccatcccattacgtatcagagcatgactcctatg 19644378  T

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Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 21 - 216
Target Start/End: Original strand, 45535461 - 45535657
Alignment:
Q  21 aaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcact 119  Q
    |||||||||||||| | || |||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  45535461 aaatagagttaaatccgctctttatttaaacaactgctttcaataat-taaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaatctttaagcatcacttggcact 45535559  T
Q  120 aaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaaacacataa 216  Q
    ||||||||||  ||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||| | ||||| ||||||| || |||||| |||||||||||    
T  45535560 aaggcctcaacctcaacaacataataaaattccacctaaaagtggttcaaaatcaacttagagaaagacacgtaacaaaggaaaaacaaaacacataa 45535657  T

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Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 30212986 - 30212874
Alignment:
Q  144 ataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagag 243  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||     
T  30212986 ataaaatccaactaaaagtggtccaacatcaaattataagaagatacgtaacaatggaaaataaaacacataagaatctccatctcgttacatatcagaa 30212887  T
Q  244 catgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||    
T  30212886 catgactcctatg 30212874  T

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Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 30213101 - 30212986
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    ||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30213101 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttattaa----actactttcaataattcaaaataatgtcgcagcggaaatatttaatct 30213006  T
Q  101 ttaagcattacttggcacta 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  30213005 ttaagcattacttggcacta 30212986  T

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Target: scaffold0092 (Bit Score: 126; Significance: 4e-65; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 39377 - 39121
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaat 98  Q
    ||||||||||||||| |   |||||||||||||| |||| |||||||| | |||||||||||| |||| || || |||||||||||||||| |||| |||    
T  39377 ttcaaaatatcatttgatgtaaatagagttaaatccactctttatttaaaacaactgctttcagtaat-tagaacaatgtcacagcggaaaatattcaat 39279  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaat 198  Q
     ||||| || ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||     
T  39278 gtttaaacaatacatggcactaaggcctcaacatcaacaacaaaaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatgcgtaacaaa 39179  T
Q  199 gaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    | |||| |||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  39178 ggaaaaaaaaacacataaacatccccatcccattacgtatcagagcatgacttctatg 39121  T

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Target: scaffold0058 (Bit Score: 123; Significance: 3e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 3e-63
Query Start/End: Original strand, 1 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 61335 - 61078
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaat 98  Q
    |||||||||||||||||   ||||||| ||||||||||| ||| |||| | ||||| |||||| |||| ||||| |||||  ||||||||| |||| |||    
T  61335 ttcaaaatatcatttaatgtaaatagacttaaattcactctttttttaaaacaactactttcagtaat-taaaacaatgtggcagcggaaaatattcaat 61237  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aa 197  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||    
T  61236 gtttaaacaatacttggcactaaggccttaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaa 61137  T
Q  198 tgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
     | |||| |||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  61136 ggtaaaacaaaacacataaacatccccatctcgttacgtatcagagcatgactcctatg 61078  T

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Target: chr5 (Bit Score: 120; Significance: 2e-61; HSPs: 5)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 2 - 256
Target Start/End: Original strand, 21402998 - 21403252
Alignment:
Q  2 tcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| || || ||| |||| ||| |    
T  21402998 tcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaataattgctttcaataat-taaaacaatgtcgcaacgaaaaatattaaatgt 21403096  T
Q  101 ttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatga 200  Q
    |||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||  |     
T  21403097 ttaaacaatacttggcactaaggcctcaatctcaacaacataataaaatttcacctaaaagtggtccaagatcaacttagtaaaagacacgtaacagagg 21403196  T
Q  201 aaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||| |||||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21403197 aaaaaaaaacacaaaaacatccccatcctgttacgtatcagagcatgactcttatg 21403252  T

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Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 12 - 256
Target Start/End: Original strand, 21419232 - 21419476
Alignment:
Q  12 atttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcatta 110  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| |||||| || || ||| |||| ||| ||||| || ||    
T  21419232 atttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaataattgctttcaataat-taaaacaatgtcgcaacgaaaaatattaaatgtttaaacaata 21419330  T
Q  111 cttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaac 210  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||| | |||||||||||||||||| ||||| |||  |||||| ||||||||  | |||| |||||    
T  21419331 cttggcactaaggcctcaatctcaacaacataataaaatttcacctaaaagtggtccaagatcaacttagtaaaagacacgtaacagaggaaaaaaaaac 21419430  T
Q  211 acataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    ||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  21419431 acaaaaacatccccatcctgttacgtatcagagcatgactcttatg 21419476  T

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Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 117
Target Start/End: Complemental strand, 23295453 - 23295337
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  23295453 ttcaaaatattatttaacacaaataaagttaaattcactatttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatatcacagcagaaatatttaatct 23295354  T
Q  101 ttaagcattacttggca 117  Q
    |||| || |||||||||    
T  23295353 ttaaacactacttggca 23295337  T

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Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 110 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 26766398 - 26766263
Alignment:
Q  110 acttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaa 208  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| |||    
T  26766398 acttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaatagaatccacctaaaaatagtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaaggaaaaacaaa 26766299  T
Q  209 acacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    | ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||    
T  26766298 aaacacaaacatctccatcccgttacgtatcagagc 26766263  T

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Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 80
Target Start/End: Original strand, 21401607 - 21401685
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtc 80  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||||| ||||| ||||||    
T  21401607 ttcaagatataatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttaaataattgctttcaataat-taaaacaatgtc 21401685  T

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Target: chr8 (Bit Score: 109; Significance: 6e-55; HSPs: 8)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 109 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 7464338 - 7464190
Alignment:
Q  109 tacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaat-gaaaaataa 207  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  7464338 tacttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaataaaattcacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaatggaaaaataa 7464239  T
Q  208 aacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  7464238 aacacataaacatccccatcccgttacgtaactgagcatgactcctatg 7464190  T

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Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 9e-48
Query Start/End: Original strand, 144 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 22709558 - 22709446
Alignment:
Q  144 ataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagag 243  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22709558 ataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataataagatatgtaacaatggaaaataaaacacataagaatccacatcccgttacgtatcagag 22709459  T
Q  244 catgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||    
T  22709458 catgactcctatg 22709446  T

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Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 22709677 - 22709558
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatct 100  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  22709677 ttcaaaatatcatataacacaaattgagttaaattcactctttatttaaacaactgctttcaataattcaaaataatgtcgtagcggaaatatttaatct 22709578  T
Q  101 ttaagcattacttggcacta 120  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22709577 ttaagcattacttggcacta 22709558  T

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Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 72; E-Value: 8e-33
Query Start/End: Original strand, 71 - 256
Target Start/End: Original strand, 38049831 - 38050016
Alignment:
Q  71 aaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaa 169  Q
    ||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| || || |||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  38049831 aaataatgtccaagcggaaaatattaaatgtttaaacaatatttggcactaaggcctcaacatcaacaacataaacgaaatccacctaaaagtggtccaa 38049930  T
Q  170 catcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||| |||| | || ||| ||||| || |||||  ||||||||| || ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||    
T  38049931 catcaagttat-agaatatatgtaacaaaggaaaacaaaaacacat-agcatccccatcccattacgtatcaaaacatgactcctatg 38050016  T

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Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 20518894 - 20518650
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataata--taaaataatgtcacagcggaaatatttaat 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| | || | ||||||| ||||  ||||| |   || || || |||||||||||    
T  20518894 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtttaaatcactatttattta-ataaattctttcaa-aataattaaaacatcatcgcaacgaaaatatttaat 20518797  T
Q  99 ctttaagcattacttggcact-aaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaaga-tacgtaac 195  Q
    | |    ||  |||||||||| ||||||||||  ||| |||||||| |||  |||| |||||| |||| |||||  ||||| ||||||||| ||||||||    
T  20518796 catcttacaaaacttggcactgaaggcctcaacgtcatcaacataattaat-tccatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaaagaatacgtaac 20518698  T
Q  196 aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    |||| ||||||||| ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  20518697 aatggaaaataaaataca-attaatccccatcccgttacgtatcagagc 20518650  T

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Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 23884913 - 23885157
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaat 98  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | || ||| || ||||||| |  || || ||| |||||| ||| ||||| |    
T  23884913 ttcaaaataatatttaacataaatagagttaaattcactatttatttaaatcatctgtttccaataattttcaacaacgtcgcagcggaaaacatttatt 23885012  T
Q  99 ctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaag-atacgtaaca 196  Q
    |||| | ||  | ||||||||||||||||||  |||  ||||| ||| || |||| |||||| |||| |||||  || || |||||||| ||||||||||    
T  23885013 ctttcaaca-aaattggcactaaggcctcaacgtcattaacat-aatcaattccatctaaaaatggttcaacaataagttcataaaaagaatacgtaaca 23885110  T
Q  197 atgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||| ||||||||| ||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  23885111 atggaaaataaaataca-attaatctccatcccgttacgtatcagagc 23885157  T

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Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 22618326 - 22618155
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtt-aaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaa 97  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| || | || |||||| ||||||| |  || || ||| |||||| |||||||||     
T  22618326 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaaatccactctttatctaaatcatctgcttccaataattttcaacaacgtcgcagcggaaaatatttat 22618227  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaaca 171  Q
    ||||| | ||  | ||||||||||||||||||||| |||| | | | ||||||||| | |||| ||||||||||    
T  22618226 tctttcaaca-aaattggcactaaggcctcaatataaacatcgtcattaaaatccaac-aaaattggtccaaca 22618155  T

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Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 1 - 244
Target Start/End: Original strand, 20878037 - 20878282
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagttaaattca-ctatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaa 97  Q
    |||||||||||||| ||   ||||||||||||| ||| |  |||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| |||||| || |||||| |||| ||    
T  20878037 ttcaaaatatcattaaatgtaaatagagttaaaatcagccctttatttaaagcaactgcttccaataat-taaaacaatgtcgcaacggaaaatattcaa 20878135  T
Q  98 tctttaagcattacttggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaagatacgtaac 195  Q
      ||||| || |||||| |||||| ||||||||  ||| |||||||| |||  |||| |||||| |||  |||||  ||||| ||||||  |||||||||    
T  20878136 cgtttaaacaatacttgacactaaaggcctcaacgtcatcaacataattaat-tccatctaaaaatggctcaacaataaattcataaaataatacgtaac 20878234  T
Q  196 aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    |||| ||||||||| ||| |  ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  20878235 aatggaaaataaaataca-attaatccacatcctgttacgtatcagagc 20878282  T

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Target: scaffold0217 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0217
Description:

Target: scaffold0217; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 256
Target Start/End: Original strand, 27203 - 27430
Alignment:
Q  31 aaattcactatttatttata-caactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctca 128  Q
    |||| |||| |||||||| | ||||||||| |||||||   ||||||||||  |||||||| |||| ||| ||||| || |||||| |||||||||||||    
T  27203 aaatccactctttatttaaagcaactgcttccaataattccaaataatgtcgtagcggaaaatattaaatgtttaaacaatacttgacactaaggcctca 27302  T
Q  129 atatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcc 228  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| | |||| |||||||| ||  ||||||||||    
T  27303 acatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatatgtaacaaaggaaaacaaaacacaaaaacatccccatcc 27402  T
Q  229 cgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    | ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27403 ctttacgtatcagagcatgacacctatg 27430  T

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Target: scaffold0007 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 83596 - 83429
Alignment:
Q  88 aaatatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaaga 187  Q
    ||||||| ||| |||||  | ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  83596 aaatattaaatgtttaaaaaatacttggcactgaggcctcaacatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaaga 83497  T
Q  188 tacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||| |  ||| |||||||| ||  | ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  83496 tacgtaacaaag-gaaacaaaacacaaaaacaaccctatcctgttacgtatcagagcatgactcctatg 83429  T

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Target: scaffold0337 (Bit Score: 87; Significance: 8e-42; HSPs: 1)
Name: scaffold0337
Description:

Target: scaffold0337; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 8e-42
Query Start/End: Original strand, 39 - 256
Target Start/End: Original strand, 2371 - 2588
Alignment:
Q  39 tatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcggaaa-tatttaatctttaagcattacttggcactaaggcctcaatatcaaca 137  Q
    |||||| ||| |||||| ||||||||||| | ||| |||||| ||||||||| |||| ||  ||||  || | ||||||||||||||||||| |||||||    
T  2371 tatttaattaaacaactcctttcaataat-tgaaacaatgtcgcagcggaaaatattcaacgtttagacaatccttggcactaaggcctcaacatcaaca 2469  T
Q  138 acataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgta 237  Q
    ||||||  ||| | ||||||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||| |||||||||||  |||| ||||| ||||||||    
T  2470 acataataaaatttcacctaaaagtagtccaagatcaacttagaaaaagatacgtaacaaaggaaaacaaaacacataaacatcctcatcctgttacgta 2569  T
Q  238 tcagagcatgactcctatg 256  Q
    |||||||||||||||||||    
T  2570 tcagagcatgactcctatg 2588  T

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Target: scaffold0017 (Bit Score: 78; Significance: 2e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 140 - 256
Target Start/End: Original strand, 22249 - 22366
Alignment:
Q  140 ataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaattataaaaagatacgtaac-aatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtat 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| || |||||| |||||||||||  ||||||||| | ||||||||    
T  22249 ataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaagttatagaaagatacgtaacaaaggaaaaacaaaacacataaacatccccatctcattacgtat 22348  T
Q  239 cagagcatgactcctatg 256  Q
    ||||||||||||||||||    
T  22349 cagagcatgactcctatg 22366  T

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Target: scaffold0708 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 21 - 115
Target Start/End: Original strand, 1151 - 1245
Alignment:
Q  21 aaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaataatataaaataatgtcacagcgg-aaatatttaatctttaagcattacttgg 115  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||    
T  1151 aaatagagttaaatccactatttatttaaacaactactttcaataat-taaaacaatgtcgcagtggaaaatattcaatgtttaaacaatacttgg 1245  T

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Target: scaffold0394 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0394
Description:

Target: scaffold0394; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 8999 - 8770
Alignment:
Q  14 ttaacacaaatagagttaaattcactatttatttatacaactgctttcaa-taatataaaataatgtcacagcggaaatatttaatctttaagcattact 112  Q
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T  8999 ttaaaacaaatagagtttaaatcactatttatttg-ataacttctttcaaataat-taaaacaacatcgcagcggaaatatttattcatcttacaaaact 8902  T
Q  113 tggcactaa-ggcctcaatatcaacaacataaataaaatccacctaaaagtggtccaacatcaaatt-ataaaaagatacgtaacaatgaaaaataaaac 210  Q
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T  8901 tggcactaaaggcctcaacttgaacaacataattaat-tccatctaaaaatggttcaacaataaattcataaaagaatacgtaataatggaaaataaaat 8803  T
Q  211 acataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||| |  |||||||||||||||||||||||||||    
T  8802 aca-attaatccccatcccgttacgtatcagagc 8770  T

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Target: scaffold0004 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 187 - 244
Target Start/End: Original strand, 74013 - 74069
Alignment:
Q  187 atacgtaacaatgaaaaataaaacacataagaatccccatcccgttacgtatcagagc 244  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  74013 atacgtaacaatggaaaataaaataca-attaatccccaccccgttacgtatcagagc 74069  T

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Target: scaffold1716 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1716
Description:

Target: scaffold1716; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 48
Target Start/End: Original strand, 891 - 939
Alignment:
Q  1 ttcaaaatatcatttaacacaaatagagtt-aaattcactatttattta 48  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  891 ttcaaaataatatttaacacaaatagagttaaaattcactctttattta 939  T

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