View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF1556R-Insertion-2 (Length: 1002)

Name: NF1556R-Insertion-2
Description: NF1556R
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF1556R-Insertion-2
NF1556R-Insertion-2
[»] chr7 (41 HSPs)
chr7 (393-691)||(31012024-31012321)
chr7 (393-691)||(25341005-25341302)
chr7 (709-925)||(25341355-25341575)
chr7 (502-691)||(41064854-41065043)
chr7 (770-925)||(31012375-31012533)
chr7 (393-683)||(12910305-12910579)
chr7 (393-516)||(4035882-4036004)
chr7 (393-516)||(25191292-25191414)
chr7 (392-516)||(26826915-26827038)
chr7 (393-516)||(298099-298221)
chr7 (393-519)||(32451295-32451420)
chr7 (407-516)||(1999670-1999778)
chr7 (393-516)||(39957937-39958059)
chr7 (393-515)||(39857517-39857638)
chr7 (393-514)||(41065305-41065425)
chr7 (393-516)||(43664278-43664400)
chr7 (393-502)||(47085272-47085380)
chr7 (393-516)||(15000416-15000538)
chr7 (393-507)||(40233849-40233962)
chr7 (455-516)||(11341955-11342016)
chr7 (393-506)||(26827194-26827306)
chr7 (817-923)||(41064608-41064717)
chr7 (393-492)||(25472203-25472301)
chr7 (393-516)||(30139260-30139382)
chr7 (397-500)||(30825715-30825816)
chr7 (393-466)||(37371257-37371329)
chr7 (441-499)||(26169402-26169459)
chr7 (827-892)||(25970466-25970531)
chr7 (393-466)||(45203101-45203173)
chr7 (569-618)||(47238756-47238805)
chr7 (830-894)||(19544570-19544634)
chr7 (609-660)||(40725766-40725817)
chr7 (459-492)||(2839263-2839296)
chr7 (827-892)||(14999901-14999966)
chr7 (827-892)||(25472765-25472830)
chr7 (827-892)||(26826415-26826480)
chr7 (827-892)||(30825223-30825288)
chr7 (827-892)||(37371112-37371177)
chr7 (830-924)||(39857075-39857172)
chr7 (438-491)||(41625597-41625649)
chr7 (827-892)||(43664814-43664879)
[»] chr6 (18 HSPs)
chr6 (393-691)||(30019591-30019888)
chr6 (704-925)||(30018848-30019073)
chr6 (502-691)||(31745853-31746043)
chr6 (393-691)||(21515133-21515415)
chr6 (35-177)||(32416010-32416152)
chr6 (35-177)||(32421851-32421993)
chr6 (393-516)||(31745442-31745564)
chr6 (393-516)||(27825541-27825663)
chr6 (416-516)||(4147374-4147473)
chr6 (393-506)||(10683721-10683833)
chr6 (393-502)||(921607-921714)
chr6 (393-515)||(20837942-20838063)
chr6 (817-923)||(31746179-31746288)
chr6 (830-890)||(4146847-4146907)
chr6 (830-894)||(20838498-20838562)
chr6 (853-893)||(30134179-30134219)
chr6 (830-893)||(27825056-27825119)
chr6 (457-491)||(29682119-29682153)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (393-691)||(29541849-29542146)
chr5 (393-691)||(3260365-3260662)
chr5 (393-691)||(42663748-42664045)
chr5 (687-925)||(29542330-29542572)
chr5 (709-925)||(3260749-3260969)
chr5 (705-925)||(42663431-42663655)
chr5 (393-691)||(27737992-27738275)
chr5 (393-691)||(33232828-33233110)
chr5 (393-691)||(7071457-7071744)
chr5 (393-533)||(14083023-14083162)
chr5 (393-533)||(33115166-33115305)
chr5 (787-925)||(14082888-14083029)
chr5 (787-925)||(33115031-33115172)
chr5 (393-519)||(33082380-33082505)
chr5 (392-516)||(33386910-33387033)
chr5 (393-516)||(10900676-10900798)
chr5 (394-516)||(40979959-40980080)
chr5 (393-516)||(31905981-31906103)
chr5 (393-516)||(41741655-41741777)
chr5 (393-506)||(25256272-25256384)
chr5 (393-506)||(25320061-25320173)
chr5 (393-506)||(37046116-37046228)
chr5 (416-516)||(2526848-2526947)
chr5 (393-516)||(8957935-8958057)
chr5 (393-516)||(4295474-4295596)
chr5 (393-516)||(11017868-11017990)
chr5 (393-492)||(41039585-41039683)
chr5 (399-516)||(20069125-20069241)
chr5 (393-517)||(39236064-39236186)
chr5 (393-516)||(53074-53196)
chr5 (393-430)||(19357091-19357128)
chr5 (853-894)||(40979450-40979491)
chr5 (853-922)||(53693-53765)
chr5 (830-890)||(2526319-2526379)
chr5 (830-894)||(10900163-10900227)
chr5 (830-894)||(19375409-19375473)
[»] chr4 (43 HSPs)
chr4 (393-691)||(24035629-24035926)
chr4 (393-691)||(24246918-24247215)
chr4 (393-691)||(39382447-39382744)
chr4 (393-691)||(49128029-49128326)
chr4 (687-925)||(18140449-18140690)
chr4 (687-925)||(24037950-24038192)
chr4 (687-925)||(39382846-39383088)
chr4 (687-925)||(49127662-49127904)
chr4 (740-925)||(31430977-31431166)
chr4 (766-925)||(24246615-24246777)
chr4 (502-691)||(51833905-51834094)
chr4 (393-691)||(56560879-56561151)
chr4 (393-516)||(16202570-16202692)
chr4 (393-516)||(39733359-39733481)
chr4 (393-516)||(26459526-26459648)
chr4 (393-516)||(50523306-50523428)
chr4 (393-516)||(30417832-30417954)
chr4 (393-516)||(51833496-51833618)
chr4 (393-516)||(5937353-5937475)
chr4 (393-516)||(28963295-28963417)
chr4 (393-516)||(29385483-29385605)
chr4 (393-516)||(45106320-45106442)
chr4 (393-506)||(22605796-22605906)
chr4 (393-514)||(8510686-8510806)
chr4 (393-516)||(53663072-53663194)
chr4 (591-691)||(52056607-52056705)
chr4 (392-517)||(53403562-53403686)
chr4 (393-506)||(38768352-38768460)
chr4 (419-516)||(51677532-51677628)
chr4 (393-516)||(28912154-28912273)
chr4 (393-477)||(48407491-48407574)
chr4 (393-488)||(36212790-36212884)
chr4 (804-923)||(51834225-51834347)
chr4 (830-894)||(39732841-39732905)
chr4 (830-894)||(50523874-50523938)
chr4 (830-893)||(16203097-16203160)
chr4 (827-892)||(53404111-53404176)
chr4 (830-894)||(5937846-5937910)
chr4 (829-892)||(22606362-22606425)
chr4 (392-430)||(49724390-49724428)
chr4 (827-892)||(30418397-30418462)
chr4 (827-892)||(52058252-52058317)
chr4 (827-892)||(53663635-53663700)
[»] chr3 (47 HSPs)
chr3 (393-691)||(1527879-1528176)
chr3 (393-691)||(47140778-47141075)
chr3 (393-691)||(51124798-51125095)
chr3 (393-691)||(38469554-38469851)
chr3 (393-691)||(52692913-52693210)
chr3 (687-925)||(51128903-51129145)
chr3 (687-925)||(47141290-47141532)
chr3 (687-925)||(52692002-52692244)
chr3 (709-925)||(1527606-1527826)
chr3 (751-925)||(38469143-38469321)
chr3 (782-925)||(47697074-47697220)
chr3 (393-528)||(47697226-47697360)
chr3 (393-519)||(28884218-28884343)
chr3 (393-516)||(30811251-30811373)
chr3 (393-516)||(33329393-33329515)
chr3 (393-516)||(39252024-39252146)
chr3 (393-516)||(48181608-48181730)
chr3 (393-516)||(33025217-33025339)
chr3 (393-516)||(39267094-39267216)
chr3 (393-516)||(50392254-50392376)
chr3 (393-506)||(11264250-11264362)
chr3 (393-512)||(44610268-44610385)
chr3 (393-516)||(42074877-42074999)
chr3 (393-499)||(45151168-45151277)
chr3 (393-516)||(48253930-48254052)
chr3 (393-499)||(44329195-44329300)
chr3 (392-500)||(42275090-42275202)
chr3 (418-524)||(40244033-40244138)
chr3 (393-518)||(45488536-45488660)
chr3 (393-516)||(51230247-51230369)
chr3 (397-513)||(41536321-41536436)
chr3 (393-516)||(40237799-40237921)
chr3 (440-515)||(53686566-53686640)
chr3 (827-922)||(33025798-33025896)
chr3 (393-479)||(5104737-5104822)
chr3 (827-892)||(48181102-48181167)
chr3 (830-894)||(30809840-30809904)
chr3 (830-894)||(44610827-44610891)
chr3 (829-892)||(11263724-11263787)
chr3 (826-922)||(53687376-53687475)
chr3 (827-922)||(42074392-42074490)
chr3 (827-922)||(51229727-51229825)
chr3 (827-892)||(42274551-42274616)
chr3 (830-893)||(44328691-44328754)
chr3 (829-892)||(48254506-48254569)
chr3 (827-892)||(45150631-45150696)
chr3 (857-894)||(45489141-45489178)
[»] chr2 (32 HSPs)
chr2 (393-691)||(14380478-14380775)
chr2 (393-691)||(31686348-31686645)
chr2 (393-691)||(31787021-31787318)
chr2 (393-691)||(40254881-40255178)
chr2 (687-925)||(40254419-40254661)
chr2 (704-925)||(14379735-14379960)
chr2 (502-691)||(2443068-2443257)
chr2 (780-925)||(31686770-31686918)
chr2 (393-533)||(44282704-44282843)
chr2 (393-691)||(13896370-13896649)
chr2 (393-691)||(14036987-14037266)
chr2 (787-925)||(44282569-44282710)
chr2 (788-925)||(31786774-31786914)
chr2 (393-516)||(43341703-43341825)
chr2 (393-506)||(7474086-7474198)
chr2 (393-516)||(17481337-17481459)
chr2 (393-513)||(43695580-43695699)
chr2 (393-516)||(2442659-2442781)
chr2 (393-516)||(35457613-35457735)
chr2 (393-506)||(37640190-37640302)
chr2 (795-923)||(2443663-2443794)
chr2 (393-516)||(44003192-44003311)
chr2 (393-492)||(16765721-16765819)
chr2 (393-516)||(32496637-32496759)
chr2 (393-514)||(19860809-19860929)
chr2 (393-516)||(31047820-31047942)
chr2 (393-481)||(33597637-33597724)
chr2 (830-891)||(37551592-37551653)
chr2 (827-892)||(37640761-37640826)
chr2 (830-894)||(44002678-44002742)
chr2 (827-889)||(17480850-17480912)
chr2 (827-892)||(43342277-43342342)
[»] chr1 (49 HSPs)
chr1 (393-691)||(5271034-5271331)
chr1 (393-691)||(50978354-50978651)
chr1 (393-691)||(51487903-51488200)
chr1 (393-688)||(15353534-15353828)
chr1 (393-691)||(26999819-27000116)
chr1 (393-691)||(38843688-38843985)
chr1 (393-691)||(7592734-7593030)
chr1 (393-614)||(26821785-26822005)
chr1 (687-925)||(38843226-38843468)
chr1 (687-925)||(51488384-51488626)
chr1 (687-925)||(50979124-50979366)
chr1 (687-925)||(27000155-27000397)
chr1 (705-925)||(7593123-7593334)
chr1 (502-691)||(27576217-27576406)
chr1 (393-691)||(35606701-35606986)
chr1 (393-691)||(46407859-46408141)
chr1 (766-925)||(5271472-5271634)
chr1 (393-533)||(36495908-36496047)
chr1 (393-533)||(38627748-38627887)
chr1 (786-925)||(26821457-26821599)
chr1 (787-925)||(36496041-36496182)
chr1 (787-925)||(38627613-38627754)
chr1 (800-925)||(15353303-15353431)
chr1 (393-516)||(31099891-31100013)
chr1 (393-517)||(6706666-6706789)
chr1 (393-519)||(45179870-45179995)
chr1 (416-516)||(27576681-27576780)
chr1 (393-516)||(42137126-42137249)
chr1 (393-516)||(4484660-4484782)
chr1 (393-516)||(47655133-47655255)
chr1 (392-506)||(50031388-50031501)
chr1 (412-516)||(11050575-11050679)
chr1 (393-497)||(16342896-16342999)
chr1 (440-516)||(27067670-27067745)
chr1 (393-516)||(7385764-7385889)
chr1 (393-515)||(11829559-11829680)
chr1 (393-516)||(41512692-41512813)
chr1 (409-510)||(46033182-46033282)
chr1 (440-516)||(13509411-13509487)
chr1 (393-492)||(50521045-50521143)
chr1 (393-491)||(1763271-1763368)
chr1 (817-923)||(27575972-27576081)
chr1 (830-894)||(1762249-1762313)
chr1 (393-468)||(24076060-24076134)
chr1 (392-486)||(44740674-44740767)
chr1 (393-503)||(49431179-49431287)
chr1 (827-892)||(47655888-47655953)
chr1 (827-892)||(6706165-6706230)
chr1 (827-892)||(13509940-13510005)
[»] chr8 (34 HSPs)
chr8 (393-691)||(30210955-30211252)
chr8 (393-691)||(30982638-30982935)
chr8 (393-691)||(34773857-34774154)
chr8 (393-691)||(193758-194054)
chr8 (393-691)||(721362-721658)
chr8 (393-691)||(882469-882765)
chr8 (687-925)||(30984190-30984432)
chr8 (393-587)||(629189-629382)
chr8 (719-925)||(30210469-30210679)
chr8 (687-862)||(189774-189950)
chr8 (687-862)||(717378-717554)
chr8 (687-862)||(878485-878661)
chr8 (765-925)||(34774315-34774478)
chr8 (393-691)||(44240493-44240775)
chr8 (393-522)||(924567-924695)
chr8 (418-516)||(13016219-13016316)
chr8 (393-506)||(35801744-35801856)
chr8 (393-516)||(26575770-26575892)
chr8 (849-925)||(629476-629555)
chr8 (393-516)||(2026056-2026178)
chr8 (393-516)||(8417202-8417324)
chr8 (393-516)||(45275830-45275952)
chr8 (392-485)||(17073662-17073754)
chr8 (392-485)||(17574516-17574608)
chr8 (393-516)||(23018296-23018418)
chr8 (827-892)||(35164381-35164446)
chr8 (393-516)||(36821056-36821176)
chr8 (407-486)||(2598506-2598584)
chr8 (857-924)||(924099-924169)
chr8 (827-922)||(35802344-35802442)
chr8 (827-892)||(45276403-45276468)
chr8 (830-893)||(3590106-3590169)
chr8 (612-654)||(31778710-31778752)
chr8 (827-892)||(8416695-8416760)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (393-516)||(9210-9332)
[»] scaffold0097 (1 HSPs)
scaffold0097 (393-506)||(32497-32609)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (393-516)||(38252-38374)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (407-516)||(92086-92196)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (393-516)||(4636-4759)
[»] scaffold0069 (1 HSPs)
scaffold0069 (407-516)||(17360-17471)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (409-516)||(301717-301823)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 41)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 31012024 - 31012321
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012024 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 31012122  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012123 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 31012222  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012223 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 31012321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 25341005 - 25341302
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25341005 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 25341103  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25341104 agacatagttaaatacaaataactagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 25341203  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25341204 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 25341302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-99
Query Start/End: Original strand, 709 - 925
Target Start/End: Original strand, 25341355 - 25341575
Alignment:
Q  709 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatg 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  25341355 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcaggaatg 25341454  T
Q  808 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctatttt 905  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25341455 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctatttt 25341554  T
Q  906 gaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  25341555 gaaaagccaaaccaaacatgt 25341575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 502 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 41065043 - 41064854
Alignment:
Q  502 taaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaatt 601  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||||||||||||||||    
T  41065043 taaatacaaagaaatagaaattactaaattaagataattaagtacaatatagtcctaaaatataagttattagaatactaaaagcatgaaaataaaaatt 41064944  T
Q  602 acaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41064943 agaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaatttaatgtgtatcatagtactaaaatattga 41064854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 770 - 925
Target Start/End: Original strand, 31012375 - 31012533
Alignment:
Q  770 ttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagc 869  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31012375 ttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagc 31012474  T
Q  870 ttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31012475 ttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 31012533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 393 - 683
Target Start/End: Complemental strand, 12910579 - 12910305
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  12910579 tttatgtttggatataataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 12910482  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  12910481 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 12910394  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaa 683  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||    
T  12910393 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaa 12910305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4036004 - 4035882
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4036004 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactaaatgttgtttggatagtt-ttaatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 4035906  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||| |||||| ||||||||    
T  4035905 agacatagctaaatataaataaat 4035882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 25191292 - 25191414
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  25191292 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttaaatgtataattactaaaat 25191390  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
      |||||| |||||||||||||||    
T  25191391 gcacatagctaaatacaaataaat 25191414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 392 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 26827038 - 26826915
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26827038 gtttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaa 26826940  T
Q  492 tagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    | ||||||| ||||| ||| |||||    
T  26826939 tggacatagctaaattcaagtaaat 26826915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 298099 - 298221
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||| ||||  ||||||||||||||||||   | |||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  298099 tttatgtttggatacaaaaatgtggaattgattaaacagaatggatgttgtttagatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 298197  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  298198 ggacatagctaaatacaaataaat 298221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 32451420 - 32451295
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||| | ||||||||||||| ||| | | ||||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32451420 tttatgtttcgatacaataatgtaaaattgattaaacataatgaatgttgtttaaatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 32451322  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaataga 519  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||    
T  32451321 ggacatggttaaatacaaataaataga 32451295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 407 - 516
Target Start/End: Original strand, 1999670 - 1999778
Alignment:
Q  407 caataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaat 506  Q
    |||||||| ||||||||||||| ||||||| | ||||||| |||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||    
T  1999670 caataatgtagaattgattaaatagaataaatgttgtttgaatagtt-ttgatcaaacttgcttttgaatgtataattactaaaatggacatagctaaat 1999768  T
Q  507 acaaataaat 516  Q
    ||||||||||    
T  1999769 acaaataaat 1999778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 39957937 - 39958059
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| | | |||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  39957937 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactaaatgtcgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 39958035  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
      |||||| |||||| ||||||||    
T  39958036 taacatagctaaataaaaataaat 39958059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 39857638 - 39857517
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||| ||| | | | |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39857638 tttatgtttggatacaataacgtagaatcgattaaacaaaatgaatgtcgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 39857540  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaa 515  Q
     ||||||| |||||| |||||||    
T  39857539 ggacatagctaaataaaaataaa 39857517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 41065425 - 41065305
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || | |||| | ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41065425 tttatgtttgaatacgataacgtagaattgattaaagagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 41065327  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataa 514  Q
     ||||||| |||||| ||||||    
T  41065326 ggacatagctaaataaaaataa 41065305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 43664278 - 43664400
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | | | | || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43664278 tttatgtttggatacaataatgcagaattgtttaaacaaactgaatattatttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 43664376  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  43664377 ggacatagctaaattcaagtaaat 43664400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 502
Target Start/End: Original strand, 47085272 - 47085380
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||| |     |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  47085272 tttatgtttggatacaataatgcaaaattgattaaatagagtggaggttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 47085370  T
Q  493 agacatagtt 502  Q
     |||||||||    
T  47085371 ggacatagtt 47085380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 15000538 - 15000416
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| ||| |    
T  15000538 tttatgtttgaataaaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttttaa-caaaattgcttttgaatgtataattactaaact 15000440  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||    
T  15000439 agacatagctaaattcaagtaaat 15000416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 507
Target Start/End: Complemental strand, 40233962 - 40233849
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||| | | |||||||||||| |||| | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||    
T  40233962 tttatgtttagatacaataacgtataattgattaaacggaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattatttttgaatgtatgattacttaaat 40233864  T
Q  493 agacatagttaaata 507  Q
     ||||||||||||||    
T  40233863 ggacatagttaaata 40233849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 455 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 11342016 - 11341955
Alignment:
Q  455 ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11342016 ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaatagacatagttaaatacaaataaat 11341955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 26827194 - 26827306
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| | | |   |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||| |||||| |||||    
T  26827194 tttatgtttggatacaatattgcagaattgattaaacaaattgaaagttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtacaattactaaaat 26827292  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  26827293 ggacatagctaaat 26827306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 817 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 41064717 - 41064608
Alignment:
Q  817 gaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaa-gca 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| |||| |||| ||| |||||| |||    
T  41064717 gaattgagggtgtagaattgattctagaaaagtcagaagctaggaattgtagctttatggagaattgtttttggaggatagaagcaattatgaaaaggca 41064618  T
Q  914 aaccaaacat 923  Q
    ||||||||||    
T  41064617 aaccaaacat 41064608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 25472203 - 25472301
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||| ||||||||| |||||    
T  25472203 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatatataattactaaaat 25472301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 30139260 - 30139382
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| | | | | | ||| |||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  30139260 tttatgtttggatacaataattcataattgattaaacaaactgaatgtcgttcggatagttttt-atcaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 30139358  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  30139359 ggacatagctaaattcaagtaaat 30139382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 397 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 30825816 - 30825715
Alignment:
Q  397 tgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagac 496  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||   | | | || |||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  30825816 tgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaatctgaatgttatttggataatt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataa-tactaaaatagac 30825719  T
Q  497 atag 500  Q
    ||||    
T  30825718 atag 30825715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 37371329 - 37371257
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaatt 466  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||    
T  37371329 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaagtgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaatt 37371257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 441 - 499
Target Start/End: Original strand, 26169402 - 26169459
Alignment:
Q  441 tgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacata 499  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  26169402 tgtttgaatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaatggacata 26169459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 25970531 - 25970466
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  25970531 tgtagaattgattctaagaaagccaaaagctaggaattgtagctttaaagagaattacttttggag 25970466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45203173 - 45203101
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaatt 466  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||  | | | | |||||||||||||| ||||||||||||    
T  45203173 tttatgtttagatacaataatgcagaattgattaaaccaattgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaatt 45203101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 569 - 618
Target Start/End: Original strand, 47238756 - 47238805
Alignment:
Q  569 tattacaatactaacatcatgaaaataaaaattacaagtagataatagaa 618  Q
    |||||||||||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47238756 tattacaatactaataccatggaaataaaaattacaaatagataatagaa 47238805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 19544634 - 19544570
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    |||||||||||||| ||| | | |||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||||||    
T  19544634 agaattgattctagtaaactcaaaagctatgaattgtagcttcaaccataattacttttggagat 19544570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 609 - 660
Target Start/End: Complemental strand, 40725817 - 40725766
Alignment:
Q  609 gataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaa 660  Q
    |||||||||||||| |||| |||| |||| |||||||| |||||||||||||    
T  40725817 gataatagaatttatagtgtaatatagtactaaaatatcattacaaaactaa 40725766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 459 - 492
Target Start/End: Complemental strand, 2839296 - 2839263
Alignment:
Q  459 tcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2839296 tcaaaattatttttgaatgtataattaccaaaat 2839263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 14999966 - 14999901
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||  ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||    
T  14999966 tgtagaattgattctaggaaagccaaaaattaggaattgtagctttaaggagaattacttttggag 14999901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 25472765 - 25472830
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| |||   |||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  25472765 tgtagaattgattctagaaaatgtagaagctatgatttgtagcttcaaggataattgcttttggag 25472830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 26826480 - 26826415
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||| ||||||||||| ||| ||  |||||| |||||||||    
T  26826480 tgtagaattgattataggaaaggaaaaagttaggaattgtacctttaaggagaattacttttggag 26826415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 30825288 - 30825223
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||| ||||||  | ||||||||||||||| ||| ||  ||||||| ||||||||    
T  30825288 tgtagaattgattcttggaaagccaaaagctaggaattgtaactttaaggagaattgtttttggag 30825223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 37371177 - 37371112
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  37371177 tgtagaattgattctagaaaagctagaagttaggatttgtagctttaaagataattgcttttggag 37371112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 830 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 39857172 - 39857075
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-caaaccaaacatg 924  Q
    ||||||||||||||  || | | |||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  39857172 agaattgattctagttaactcaaaagctatgaattgtagcttcatccagaattacttttggaggatagaagcaattctgaaaagtcaaaccaaacatg 39857075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 438 - 491
Target Start/End: Original strand, 41625597 - 41625649
Alignment:
Q  438 ttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  41625597 ttttgtttggatagttga-gatcaaaattgcttttgaaggtataattaccaaaa 41625649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 43664814 - 43664879
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||| | | | ||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  43664814 tgtagaattgattctaggaaagtcaaaggttagaaattgtagctttaagaaaaattgcttttggag 43664879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 18)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 30019888 - 30019591
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30019888 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 30019790  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30019789 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 30019690  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30019689 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 30019591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 704 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 30019073 - 30018848
Alignment:
Q  704 tagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30019073 tagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgaggacag 30018974  T
Q  803 ggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagct 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  30018973 ggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagataggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagct 30018874  T
Q  901 attttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  30018873 attttgaaaagccaaaccaaacatgt 30018848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 5e-77
Query Start/End: Original strand, 502 - 691
Target Start/End: Original strand, 31745853 - 31746043
Alignment:
Q  502 taaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaatt 601  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  31745853 taaatacaaagaaatataaattactaaattaagattattaagtgcaatatagtcctaaaatataagttattacaatactaacagcatgaaaataaaaatt 31745952  T
Q  602 acaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatta-caaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31745953 acaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattaccaaaactaatttaatgtgtatcatagtactaaaatattga 31746043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 21515133 - 21515415
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| || ||    
T  21515133 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaatat 21515230  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  21515231 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 21515318  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21515319 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 21515415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32416152 - 32416010
Alignment:
Q  35 aaagtaattactatagaaagtgttcaaaagagaggttgatatcattcatgttcttaaagaaattttatatgtaatttaaggatgtgttatca-atacctt 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||     
T  32416152 aaagtgattactagagaaagtgttaaaaagagtggttgatatcattcatgttcttaaagaaattttatatgt-atttaacgatgtgttatcacatacctc 32416054  T
Q  134 atttaataattaatacgtgttaatatgtttaagatacacgtgtg 177  Q
     || ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32416053 gttaaataattaaaatgtgctaatatttttaagatacacgtgtg 32416010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 80; E-Value: 5e-37
Query Start/End: Original strand, 35 - 177
Target Start/End: Complemental strand, 32421993 - 32421851
Alignment:
Q  35 aaagtaattactatagaaagtgttcaaaagagaggttgatatcattcatgttcttaaagaaattttatatgtaatttaaggatgtgttatca-atacctt 133  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||     
T  32421993 aaagtgattactagagaaagtgttaaaaagagtggttgatatcattcatgttcttaaagaaattttatatgt-atttaacgatgtgttatcacatacctc 32421895  T
Q  134 atttaataattaatacgtgttaatatgtttaagatacacgtgtg 177  Q
     || ||||||||| | ||| |||||| |||||||||||||||||    
T  32421894 gttaaataattaaaatgtgctaatatttttaagatacacgtgtg 32421851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 31745442 - 31745564
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| | |||| | | ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31745442 tttatgtttggatacgataacgtataattgattaaacagaataaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 31745540  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  31745541 ggacatagctaaataaaaataaat 31745564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27825663 - 27825541
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||  | |||||  ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||    
T  27825663 tttatgtttggacacgataatatagaattgattaaatagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttaaatgtataattattaaaat 27825565  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  27825564 ggacatagctaaatacaaataaat 27825541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4147473 - 4147374
Alignment:
Q  416 agaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaa 515  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  4147473 agaattgattaaacagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgctcttgaatgtataattactaaaatagacataactaaataaaaataaa 4147375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 10683833 - 10683721
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  10683833 tttatgtctcgatgcaataatgcagaattaattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaatttcttttgaatgtataattactaaaat 10683735  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  10683734 ggacatagctaaat 10683721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 502
Target Start/End: Complemental strand, 921714 - 921607
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||||   | |||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  921714 tttatgtttggatacaataaagtaggattgattaaacagaatggatgttgtttggatagt--ttgatcaaaattatttttgaatgtataattattaaaat 921617  T
Q  493 agacatagtt 502  Q
     || ||||||    
T  921616 ggatatagtt 921607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 393 - 515
Target Start/End: Original strand, 20837942 - 20838063
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||  ||| |||||||||| ||||||||||| | | | | | ||||||| ||| || |||||||||||| ||||||||  ||||||||| |||||    
T  20837942 tttatgttatgatacaataatgcataattgattaaataaattgaatgttgtttgaataatt-ttgatcaaaattgcttttgaacatataattactaaaat 20838040  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaa 515  Q
     ||||||||||||||||||||||    
T  20838041 ggacatagttaaatacaaataaa 20838063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 817 - 923
Target Start/End: Original strand, 31746179 - 31746288
Alignment:
Q  817 gaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-ca 913  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||  | ||| ||||||||||||||  |   ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||    
T  31746179 gaattgaggatgtagaattgattctagaaaagccataagttaggaattgtagctatatggagaattgcttttggaggatagaagcaattttgaaaagtca 31746278  T
Q  914 aaccaaacat 923  Q
    ||||||||||    
T  31746279 aaccaaacat 31746288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 4146907 - 4146847
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgg 890  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  4146907 agaattgattctagttaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttgg 4146847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Original strand, 20838498 - 20838562
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    |||||||||| ||| ||| | | ||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20838498 agaattgattatagtaaactcaaaagttaggatttgtagcttcaaccagaattgcttttggagat 20838562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 853 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 30134219 - 30134179
Alignment:
Q  853 aagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaga 893  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  30134219 aagctagaaattgtagcttcaaccagaattgcttttggaga 30134179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 27825119 - 27825056
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaga 893  Q
    ||||||||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  27825119 agaattgattctagttaactgaaaagttaggaattgtagcttcaaccataattgcttttggaga 27825056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 457 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 29682153 - 29682119
Alignment:
Q  457 gatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29682153 gatcaaaattacttttgaaggtataattaccaaaa 29682119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 29541849 - 29542146
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541849 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 29541947  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29541948 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 29542047  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542048 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 29542146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 3260365 - 3260662
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260365 tttatgtttggatgcaataatacagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 3260463  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260464 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 3260563  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260564 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 3260662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 42664045 - 42663748
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  42664045 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattatttttgaatgtataattaccaaaat 42663947  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42663946 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 42663847  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42663846 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagattattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 42663748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 29542330 - 29542572
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  29542330 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 29542429  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29542430 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 29542529  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29542530 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 29542572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 709 - 925
Target Start/End: Original strand, 3260749 - 3260969
Alignment:
Q  709 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatg 807  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3260749 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatg 3260848  T
Q  808 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctatttt 905  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  3260849 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctatttt 3260948  T
Q  906 gaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  3260949 gaaaagtcaaaccaaacatgt 3260969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 705 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 42663655 - 42663431
Alignment:
Q  705 agaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagg 803  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42663655 agaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgtagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagg 42663556  T
Q  804 gatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagcta 901  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  42663555 gatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagcta 42663456  T
Q  902 ttttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||| ||||||||||||||    
T  42663455 ttttgaaaagtcaaaccaaacatgt 42663431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 142; E-Value: 5e-74
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 27737992 - 27738275
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  27737992 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 27738090  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  27738091 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 27738178  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27738179 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 27738275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 33233110 - 33232828
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33233110 tttatgtttggatacaataatgcagaatcgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 33233013  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  33233012 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 33232925  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33232924 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 33232828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 7071457 - 7071744
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgc--agaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaa 490  Q
    ||||||||||||| |||||||||  | ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  7071457 tttatgtttggatacaataatgcgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattaccaaa 7071555  T
Q  491 atagacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatga 590  Q
    || ||||||| ||||          ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||| | |||||    
T  7071556 atggacataggtaaa----------tagaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagtcttaaaatttaagttattacaatactaataccatga 7071645  T
Q  591 aaataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattg 690  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  7071646 aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatggtactaaaatattg 7071743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 14083162 - 14083023
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14083162 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 14083064  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14083063 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 14083023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 33115305 - 33115166
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115305 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 33115207  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115206 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 33115166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14083029 - 14082888
Alignment:
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14083029 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 14082930  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  14082929 ttggaggataaaagctattttaaaaagtcaaaccaaacatgt 14082888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 6e-55
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 33115172 - 33115031
Alignment:
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33115172 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 33115073  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  33115072 ttggaggataaaaactattttaaaaagccaaaccaaacatgt 33115031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 75; E-Value: 5e-34
Query Start/End: Original strand, 393 - 519
Target Start/End: Original strand, 33082380 - 33082505
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||||   | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33082380 tttatgtttgaatacaataatgtagaattgattaaatagaatggatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 33082478  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaataga 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  33082479 ggacatagttaaatacaaataaataga 33082505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 73; E-Value: 7e-33
Query Start/End: Original strand, 392 - 516
Target Start/End: Original strand, 33386910 - 33387033
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  33386910 gtttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaatagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaa 33387008  T
Q  492 tagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    | ||||||| |||||||||||||||    
T  33387009 tggacatagctaaatacaaataaat 33387033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 10900798 - 10900676
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  10900798 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggataatt-ttgatcaaaattaattttgaatgtataattactaaaat 10900700  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  10900699 ggacatagctaaatacaaataaat 10900676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 3e-29
Query Start/End: Original strand, 394 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 40980080 - 40979959
Alignment:
Q  394 ttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaata 493  Q
    |||||| ||||| |||||||||| ||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||     
T  40980080 ttatgtatggatacaataatgcaaaattgattaaacaaattaaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgattttgaatgtataattactaaaatg 40979982  T
Q  494 gacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||||||| |||||||||||||||    
T  40979981 gacatagctaaatacaaataaat 40979959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 31906103 - 31905981
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31906103 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 31906005  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  31906004 ggacatagataaattcaagtaaat 31905981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 41741655 - 41741777
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  41741655 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttattaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 41741753  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  41741754 ggacatagctaaattcaagtaaat 41741777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 25256272 - 25256384
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  25256272 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacggaattgatgttgtttagatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 25256370  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     |||||||||||||    
T  25256371 ggacatagttaaat 25256384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 25320061 - 25320173
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  25320061 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacggaattgatgttgtttagatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 25320159  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     |||||||||||||    
T  25320160 ggacatagttaaat 25320173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 37046228 - 37046116
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  37046228 tttatgtttgaatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatgatt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 37046130  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
    |||||||| |||||    
T  37046129 agacatagctaaat 37046116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2526947 - 2526848
Alignment:
Q  416 agaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaa 515  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||    
T  2526947 agaattgattaaacagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgctcttgaatgtataattactaaaatagacataactaaataaaaataaa 2526849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 8957935 - 8958057
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  8957935 tttatatttagatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 8958033  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||| |||| ||||| ||| |||||    
T  8958034 agatatagctaaattcaagtaaat 8958057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4295596 - 4295474
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||||  | ||||||||||||| | | | | |||||||||||  | ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||    
T  4295596 tttatgtttgaatacaataatttaaaattgattaaacaaattgaatgttgtttggatatgt-ttgatcaaaattatttttgaatgtataattactaaaat 4295498  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     |||| |||||||||||| |||||    
T  4295497 ggacagagttaaatacaagtaaat 4295474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 11017868 - 11017990
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||  ||||||||||||  |||| |||||    
T  11017868 tttatgtttggatataataatgcagaattgattagacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttcatcaaaattgtttttgaatgtatggttactaaaat 11017966  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||||||||| ||| |||||    
T  11017967 ggacatagttaaattcaagtaaat 11017990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 41039585 - 41039683
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| | | |||||||||||||| ||  |||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  41039585 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacgaaatgaatgttgtttggatagtt-tttttcaaaattgcttttgaatgtgtaattactaaaat 41039683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 399 - 516
Target Start/End: Original strand, 20069125 - 20069241
Alignment:
Q  399 tttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacat 498  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||   | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||    
T  20069125 tttggatacaataatgcaaaattgattaaacacgttgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataagtactaaaaccgacat 20069223  T
Q  499 agttaaatacaaataaat 516  Q
    | ||||||||| ||||||    
T  20069224 aattaaatacatataaat 20069241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 517
Target Start/End: Original strand, 39236064 - 39236186
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||| || |  || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39236064 tttatgtttgaatataataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggataatttt--attaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 39236161  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaata 517  Q
     ||||||| |||||| |||| ||||    
T  39236162 ggacatagctaaatagaaattaata 39236186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 53074 - 53196
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| | || ||||| | |||| |||||| | | | | |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  53074 tttatgtttggatacgatgatgcacagttgaataaacaaattgaatgttgtttggatggtt-ttgatcaaaattgcttttgaaagtataattactaaaat 53172  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||  ||||||||| |||||    
T  53173 ggacataactaaatacaagtaaat 53196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 19357128 - 19357091
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaaca 430  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19357128 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaaca 19357091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 853 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 40979491 - 40979450
Alignment:
Q  853 aagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  40979491 aagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 40979450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 853 - 922
Target Start/End: Original strand, 53693 - 53765
Alignment:
Q  853 aagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaa-gcaaaccaaaca 922  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  53693 aagctaggaattgtagcttcaaccataattgcttttggaggatagaagcaattatgaaaaggcaaaccaaaca 53765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 890
Target Start/End: Complemental strand, 2526379 - 2526319
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgg 890  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2526379 agaattgattctagttaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttgg 2526319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 10900227 - 10900163
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  10900227 agaattgattctagctaactcaaaagttaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 10900163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Original strand, 19375409 - 19375473
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  19375409 agaattgattctagctaactcaaaagttaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 19375473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 43)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 24035629 - 24035926
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24035629 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 24035727  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24035728 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 24035827  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24035828 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 24035926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 24247215 - 24246918
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24247215 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 24247117  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24247116 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 24247017  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24247016 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 24246918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 39382447 - 39382744
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382447 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 39382545  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382546 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 39382645  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382646 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 39382744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 49128326 - 49128029
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49128326 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 49128228  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49128227 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 49128128  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  49128127 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 49128029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 18140690 - 18140449
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaattcggttggagaagggttagaa 786  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18140690 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaattcggttggagaagggttagaa 18140591  T
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18140590 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactaaaattgctt 18140491  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18140490 ttggaggataaaagctattttaaaaagccaaaccaaacatgt 18140449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 24037950 - 24038192
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24037950 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 24038049  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24038050 aaaattaatgaggacagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 24038149  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24038150 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 24038192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 39382846 - 39383088
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  39382846 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 39382945  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  39382946 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagttaggaattgtagcttcaactagaattgct 39383045  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39383046 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 39383088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 49127904 - 49127662
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  49127904 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 49127805  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  49127804 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactaaaattgct 49127705  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  49127704 tttggaggataaaagctattttaaaaagccaaaccaaacatgt 49127662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 158; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 740 - 925
Target Start/End: Original strand, 31430977 - 31431166
Alignment:
Q  740 tttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgat 838  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31430977 tttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgat 31431076  T
Q  839 tctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31431077 tctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 31431166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 766 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 24246777 - 24246615
Alignment:
Q  766 tcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattg 865  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24246777 tcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattg 24246678  T
Q  866 tagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24246677 tagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 24246615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 502 - 691
Target Start/End: Original strand, 51833905 - 51834094
Alignment:
Q  502 taaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaatt 601  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||    
T  51833905 taaatacaaagaaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatataatcctaaaatataagttattacaatattaacagcaagaaaataaaaatt 51834004  T
Q  602 acaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  51834005 acaaatagataatagaatttaaagtgcaacagagtattaaaatataattacaaaactaatttaatgtgtatcataatactaaaatattga 51834094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 56561151 - 56560879
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||| | | | | ||| |||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  56561151 tttatgtttggatacaataacgcagaattgattaaacaaactgaatgttggttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 56561054  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| |||                    |||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  56561053 ggacatagctaa--------------------ctaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 56560976  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  56560975 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 56560879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 16202570 - 16202692
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| | ||| | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16202570 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaatataatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 16202668  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  16202669 ggacatagctaaatacaaataaat 16202692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 39733481 - 39733359
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  39733481 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattaattttgaatgtataattactaaaac 39733383  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  39733382 ggacatagctaaatacaaataaat 39733359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 26459648 - 26459526
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  26459648 tttatgtttggatacaataatgcaaaattgattaaacaaattgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaaagtataattactaaaat 26459550  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||  ||||||||| |||||    
T  26459549 ggacataactaaatacaagtaaat 26459526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 50523306 - 50523428
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||||| |||||    
T  50523306 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgattttgaaggtataattactaaaat 50523404  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||  |||||||||||||||    
T  50523405 ggacatatctaaatacaaataaat 50523428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 30417832 - 30417954
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  30417832 tttatgtttagatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 30417930  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||    
T  30417931 agacataactaaattcaagtaaat 30417954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 51833496 - 51833618
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || | |||| | ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  51833496 tttatgtttgaatacgataacgtagaattgattaaacagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgaacaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 51833594  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  51833595 ggacatagctaaataaaaataaat 51833618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 5937353 - 5937475
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| ||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||     
T  5937353 tttatatttgaatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttgaatattt-ttgatcaaaattgattttgaatgtataattactaaaac 5937451  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     |||||||||||||||||||||||    
T  5937452 ggacatagttaaatacaaataaat 5937475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 28963295 - 28963417
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  28963295 tttatgtttagatacaataatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 28963393  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  28963394 ggacatagctaaattcaagtaaat 28963417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 29385483 - 29385605
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  29385483 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggataattttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 29385581  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  29385582 ggacatagctaaattcaagtaaat 29385605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 45106442 - 45106320
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  45106442 tttatgtttggatacaataatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgattttgaatgtataattaataaaat 45106344  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||    
T  45106343 agacatagctaaattcaagtaaat 45106320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 22605796 - 22605906
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||  || | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  22605796 tttatgtttggatacaataatgcagtattgattaaaca--atgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 22605892  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  22605893 tgacatagctaaat 22605906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 8510806 - 8510686
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||||||| | |||||||  || || ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||    
T  8510806 tttatgtttggatacaataatgcataattgataaaatagaataaatgttgtttgattaatt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattattaaaat 8510708  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataa 514  Q
     || ||||||||||||||||||    
T  8510707 ggatatagttaaatacaaataa 8510686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 53663072 - 53663194
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || | |||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  53663072 tttatgtttggatacaataatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttaacaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 53663170  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||  ||||| ||| |||||    
T  53663171 agacataactaaattcaagtaaat 53663194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 591 - 691
Target Start/End: Original strand, 52056607 - 52056705
Alignment:
Q  591 aaataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattg 690  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||| ||||||||||    
T  52056607 aaataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatggtattaaaatattg 52056704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 392 - 517
Target Start/End: Original strand, 53403562 - 53403686
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | || |||||||| || || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  53403562 gtttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaactgaatgttatttggataattttt-atcaaaattgattttgaatgtataattactaaaa 53403660  T
Q  492 tagacatagttaaatacaaataaata 517  Q
    | ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  53403661 tggacatggttaaattcaagtaaata 53403686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 38768460 - 38768352
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| |     ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  38768460 tttatgtctggatacaatactgcagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatatt-----atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 38768366  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  38768365 ggacatagctaaat 38768352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 419 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 51677628 - 51677532
Alignment:
Q  419 attgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||||||||||| |||| | | ||||||| ||| || ||||||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  51677628 attgattaaacggaatgagtgttgtttgaatattt-ttgatcaaaattatttttaaatatataattactaaaatggacatagttaaatacaaataaat 51677532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 28912273 - 28912154
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||  |||| | | |||||| |||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||    
T  28912273 tttatgtttggatacaataatgtggaattgattaaa--gaatgaatgttgtttagataatt-ttgatcaaa-ttgcttttgaatgtataattactaaaat 28912178  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     |||||| ||||||| ||||||||    
T  28912177 ggacataattaaataaaaataaat 28912154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 477
Target Start/End: Complemental strand, 48407574 - 48407491
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatg 477  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | ||||||||||| || || ||||||||| ||||||||||    
T  48407574 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggataatt-tttatcaaaattgcttttgaatg 48407491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 488
Target Start/End: Complemental strand, 36212884 - 36212790
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattacca 488  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |||   | |||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36212884 tttatgtttggatgcaataatgcatatttgattaaataaaatgtatgttgtttagatagtt-ttgattaaaatcacttttgaatgtataattacca 36212790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 804 - 923
Target Start/End: Original strand, 51834225 - 51834347
Alignment:
Q  804 gatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagcta 901  Q
    ||||||||| || |||||||| ||||| |||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||||||| |||| |||| |    
T  51834225 gatggaattgatggaattgagagtgtataattgattctagaaaagccagaagttaggaattgtagctttatggagaattgcttttggaggatagaagcaa 51834324  T
Q  902 ttttgaaaag-caaaccaaacat 923  Q
    || ||||||| ||||||||||||    
T  51834325 ttctgaaaagtcaaaccaaacat 51834347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 39732905 - 39732841
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  39732905 agaattgattctagctaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 39732841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Original strand, 50523874 - 50523938
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  50523874 agaattgattctagctaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 50523938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 830 - 893
Target Start/End: Original strand, 16203097 - 16203160
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaga 893  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  16203097 agaattgattctagtcaactcaaaagctaggaattgtagcttcaaccaaaattgcttttggaga 16203160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 53404111 - 53404176
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    |||| ||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||    
T  53404111 tgtaaaattgattctaggaaaaccaaaagctaggaattgtagctttaaggagaattgcttttggag 53404176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Original strand, 5937846 - 5937910
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||||    
T  5937846 agaattgattctagctaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccataattgcttttggagat 5937910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 829 - 892
Target Start/End: Original strand, 22606362 - 22606425
Alignment:
Q  829 tagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||   | ||||||||||||||    
T  22606362 tagaattgattcttggaaagtcaaaagctaggatttgtagcttcacgaataattgcttttggag 22606425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 392 - 430
Target Start/End: Complemental strand, 49724428 - 49724390
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaaca 430  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||    
T  49724428 gtttatgtttggatacaataatgcataattgattaaaca 49724390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 30418397 - 30418462
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  30418397 tgtagaattgattctaggaaagctaaaagttaggatttgtagcttgaaggataattgcttttggag 30418462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 52058252 - 52058317
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||  ||||  | ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  52058252 tgtagaattgattctacaaaagccaaaagctaggatttgtagcttcaaggataattgcttttggag 52058317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 53663635 - 53663700
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  53663635 tgtagaattgattataggaaagccaaaagttaggaattgtagctttaaggataattgcttttggag 53663700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 47)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 1528176 - 1527879
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528176 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 1528078  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1528077 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 1527978  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1527977 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 1527879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 47140778 - 47141075
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47140778 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 47140876  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47140877 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 47140976  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47140977 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 47141075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 51124798 - 51125095
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51124798 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 51124896  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51124897 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 51124996  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51124997 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 51125095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 38469851 - 38469554
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38469851 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 38469753  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38469752 agacatagttaaataaaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 38469653  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38469652 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 38469554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 52693210 - 52692913
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52693210 tttatgtttggatgcaataatacagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 52693112  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52693111 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 52693012  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52693011 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 52692913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 51128903 - 51129145
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51128903 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 51129002  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51129003 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 51129102  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51129103 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 51129145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 47141290 - 47141532
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  47141290 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 47141389  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47141390 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaagaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 47141489  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  47141490 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 47141532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 52692244 - 52692002
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  52692244 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 52692145  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  52692144 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagttaggaattgtagcttcaactagaattgct 52692045  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  52692044 tttggaggataaaatctatttttaaaagtcaaaccaaacatgt 52692002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 177; E-Value: 6e-95
Query Start/End: Original strand, 709 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 1527826 - 1527606
Alignment:
Q  709 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatg 807  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1527826 aataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcaggaatg 1527727  T
Q  808 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctatttt 905  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| |||    
T  1527726 gaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctttcggaggataaaagctagttt 1527627  T
Q  906 gaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||||||||||||||    
T  1527626 gaaaagtcaaaccaaacatgt 1527606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 751 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 38469321 - 38469143
Alignment:
Q  751 tgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagt 849  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38469321 tgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattataggaaagt 38469222  T
Q  850 aagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaa-gcaaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| | |||||||||||||    
T  38469221 aagaagctaagaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaaactattttgaaaaggtaaaccaaacatgt 38469143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 123; E-Value: 1e-62
Query Start/End: Original strand, 782 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 47697220 - 47697074
Alignment:
Q  782 tagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaat 881  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47697220 tagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaat 47697121  T
Q  882 tgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaa-gcaaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  47697120 tgcttttggaggataaaagctattttgaaaaggcaaaccaaacatgt 47697074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 120; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 528
Target Start/End: Complemental strand, 47697360 - 47697226
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47697360 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 47697262  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaa 528  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47697261 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaa 47697226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 71; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 393 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 28884343 - 28884218
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||  ||||    
T  28884343 tttatgtttggatacaataatgtataattgattaaagagaatgaatgttgtttggatagtt-ttaatcaaaattatttttgaatgtataattactgaaat 28884245  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaataga 519  Q
     ||||||||||||||||||||||||||    
T  28884244 ggacatagttaaatacaaataaataga 28884218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 30811373 - 30811251
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  30811373 tttatgtttggatacaataattcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 30811275  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  30811274 ggacatagctaaatacaaataaat 30811251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 33329393 - 33329515
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||   | |||||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  33329393 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaaatggatgttgtttggatagtt-tcgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 33329491  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  33329492 ggacatagctaaatacaaataaat 33329515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 39252146 - 39252024
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  39252146 tttatatttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 39252048  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||||||||| ||| |||||    
T  39252047 ggacatagttaaattcaagtaaat 39252024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 48181730 - 48181608
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48181730 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattacttttgaatatataattaccgaaat 48181632  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  48181631 ggacatagctaaattcaagtaaat 48181608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 33025217 - 33025339
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  33025217 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgtttttgaatctataattactaaaat 33025315  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||    
T  33025316 agacatagctaaattcaagtaaat 33025339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 39267094 - 39267216
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||| | ||| | |||||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||    
T  39267094 tttatgtttggatacaatagtgtataattgattaaacaaactaaatgttgttttgatagtt-ttgatcaaaactgcttttgaatgtataattactaaaat 39267192  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  39267193 ggacatagctaaatacaaataaat 39267216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 50392254 - 50392376
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | ||||||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||| || ||    
T  50392254 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaattgaatattgtttggataatt-ttgatcaaaattgattttgaatgtataattactaatat 50392352  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  50392353 ggacatagctaaatacaaataaat 50392376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 7e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 11264362 - 11264250
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  11264362 tttatgtttggatacaaaaatgcagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 11264264  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
      |||||| |||||    
T  11264263 gaacatagctaaat 11264250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 512
Target Start/End: Original strand, 44610268 - 44610385
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| ||||   | ||||||||||||||  |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  44610268 tttatgtttggatacaataatgtaaaattgattaaacggaatggatgttgtttggatagtt--tgatcaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 44610365  T
Q  493 agacatagttaaatacaaat 512  Q
     ||||||| |||||||||||    
T  44610366 ggacatagctaaatacaaat 44610385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 42074999 - 42074877
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  42074999 tttatgtttggatacaatagtgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttctt-atcaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 42074901  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||| |||||||||| ||| |||||    
T  42074900 agagatagttaaattcaagtaaat 42074877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 45151277 - 45151168
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatag---ttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaa 489  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||   || || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||    
T  45151277 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaaataaatgttgtttggatagtttttttttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaa 45151178  T
Q  490 aatagacata 499  Q
    ||| ||||||    
T  45151177 aatggacata 45151168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 48253930 - 48254052
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  48253930 tttatgtttagatacaataatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 48254028  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  48254029 ggacatagctaaattcaagtaaat 48254052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 499
Target Start/End: Complemental strand, 44329300 - 44329195
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || | |||||| | ||||||||||| ||||| | | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  44329300 tttatgtttgtatacgataatgtaaaattgattaaatagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattactaaaat 44329202  T
Q  493 agacata 499  Q
     ||||||    
T  44329201 tgacata 44329195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 392 - 500
Target Start/End: Complemental strand, 42275202 - 42275090
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattg----atcaaaattacttttgaatgtataattacc 487  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||     ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  42275202 gtttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttttttttatcaaaattgcttttgaatgtataattact 42275103  T
Q  488 aaaatagacatag 500  Q
    ||||| |||||||    
T  42275102 aaaatggacatag 42275090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 418 - 524
Target Start/End: Complemental strand, 40244138 - 40244033
Alignment:
Q  418 aattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaata 517  Q
    ||||||||||| | ||||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  40244138 aattgattaaatataataaatattgtttggatagtt-ttaatcaaaattgtttttaaatgtataattaccaaaatggacatggttaaatacatataaata 40244040  T
Q  518 gaaatta 524  Q
     ||||||    
T  40244039 taaatta 40244033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 518
Target Start/End: Original strand, 45488536 - 45488660
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||| | |  | |||||| || ||||||||||||  |||||||||||||| ||| |||||    
T  45488536 tttacgtttggatacaataatgcaaaattgattaaacccactaaatgtcatgtggatattt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataagtactaaaat 45488634  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatag 518  Q
    |||||||| |||||||||||||||||    
T  45488635 agacatagctaaatacaaataaatag 45488660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 51230369 - 51230247
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||| ||  |||||||||||||||||| |||||    
T  51230369 tttatgtttgaatacaataatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaatttgattttgaatgtataattactaaaat 51230271  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    | |||||| ||||| ||| |||||    
T  51230270 aaacatagctaaattcaagtaaat 51230247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 397 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 41536436 - 41536321
Alignment:
Q  397 tgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagac 496  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||  | ||| | |||||||||| ||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||    
T  41536436 tgtttagatacaataatgtagaattgattaaacgaactaaatgttgtttggatggtt-ttgatcaaaattgtttttgaatatataattactaaaattgac 41536338  T
Q  497 atagttaaatacaaata 513  Q
    |||  ||||||||||||    
T  41536337 ataactaaatacaaata 41536321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 40237921 - 40237799
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||||||||||  || || | | ||||||| |||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||  |||||    
T  40237921 tttatgtttgaatacaataacgtagaattgattaattaggatgaatgttgtttgaatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattattaaaat 40237823  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  40237822 ggacatagctaaataaaaataaat 40237799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 440 - 515
Target Start/End: Original strand, 53686566 - 53686640
Alignment:
Q  440 ttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaa 515  Q
    |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| ||||    
T  53686566 ttgtttggatagttttt-atcaaaattacttttgaatatataattactaaaatagacatagctaaattcaagtaaa 53686640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Original strand, 33025798 - 33025896
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-caaaccaaaca 922  Q
    ||||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  33025798 tgtagaattgattataggaaagccaaaagctaggaattgtagctttaaggagaattgcttttggaggatagaagcaattttgaaaagtcaaaccaaaca 33025896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 479
Target Start/End: Original strand, 5104737 - 5104822
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgta 479  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||| ||||||||||| ||| | | ||||||| ||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  5104737 tttatgtttggatataataatgtagatttgattaaacaaaatgaatgttgtttgaataatt-ttgatcaaaattacttttgaatgta 5104822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 48181167 - 48181102
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||    
T  48181167 tgtagaattgattctaggaaagccaaaagctaggaattgtagttttaaggagaattgcttttggag 48181102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 30809904 - 30809840
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30809904 agaattgattctagctaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttggagat 30809840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Original strand, 44610827 - 44610891
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    |||||||||||||  ||| | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  44610827 agaattgattctaataaactcaaaagctagaaattgtagcttcaaccagaattgcttttggagat 44610891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 829 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 11263787 - 11263724
Alignment:
Q  829 tagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  11263787 tagaattgattctaggaaagccaaaagctaggatttgtagcttcaaggataattgcttttggag 11263724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 826 - 922
Target Start/End: Original strand, 53687376 - 53687475
Alignment:
Q  826 gtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-caaaccaaaca 922  Q
    |||||||||||||| ||| ||||  | || |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  53687376 gtgtagaattgattttagaaaagccaaaacctaggaattgtagctttaacaagaattgcttttggaggatagaagcaattatgaaaagtcaaaccaaaca 53687475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 42074490 - 42074392
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-caaaccaaaca 922  Q
    |||||||||||||| || ||||| | ||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||| |||| |||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  42074490 tgtagaattgattcgagcaaagtcaaaagctaggaattgtagctttaaggagaattgtttttggaggatagaagcaattctgaaaagccaaaccaaaca 42074392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Complemental strand, 51229825 - 51229727
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaagc-aaaccaaaca 922  Q
    ||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||||||||||| ||  ||||||  ||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  51229825 tgtagaattgattctaggaaagccaaaagttaggaattgtagctttaaggagaattatttttggaggatagaagcaattttgaaaagctaaaccaaaca 51229727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 42274616 - 42274551
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    |||||||||||||||| |||||  | ||||||||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||    
T  42274616 tgtagaattgattctatgaaagccaaaagctaggaattgtaactttaaggagaattgcttttggag 42274551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 44328754 - 44328691
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaga 893  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  44328754 agaattgattctagttaactcaaaagctaggaattgtagcttcagccaaaattgcttttggaga 44328691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 829 - 892
Target Start/End: Original strand, 48254506 - 48254569
Alignment:
Q  829 tagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  48254506 tagaattgattctagaaaagctagaagctaggatttgtagctttaaggataattgcttttggag 48254569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 45150696 - 45150631
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    |||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||||  | ||||| ||||||||    
T  45150696 tgtagaattgattctaggaaaaccaaaagctaggatttgtagcttcaaggataattgtttttggag 45150631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 857 - 894
Target Start/End: Original strand, 45489141 - 45489178
Alignment:
Q  857 taggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||    
T  45489141 taggaattgtagcttcacctagaattgcttttagagat 45489178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 32)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14380775 - 14380478
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380775 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 14380677  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380676 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 14380577  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14380576 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 14380478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 31686348 - 31686645
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686348 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 31686446  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686447 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 31686546  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686547 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 31686645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 31787318 - 31787021
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31787318 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 31787220  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31787219 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 31787120  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31787119 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 31787021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 40255178 - 40254881
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40255178 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 40255080  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40255079 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 40254980  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40254979 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 40254881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 40254661 - 40254419
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40254661 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 40254562  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40254561 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 40254462  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  40254461 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 40254419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 190; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 704 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 14379960 - 14379735
Alignment:
Q  704 tagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcag 802  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14379960 tagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgtagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcag 14379861  T
Q  803 ggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagct 900  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  14379860 ggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagct 14379761  T
Q  901 attttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||    
T  14379760 attttgaaaagccaaaccaaacatgt 14379735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 502 - 691
Target Start/End: Original strand, 2443068 - 2443257
Alignment:
Q  502 taaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaatt 601  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2443068 taaatacaaagaaatagaatttactaaattaagataattaagtgcaatataatcctaaaatataagttattacaatactaacaacatgaaaataaaaatt 2443167  T
Q  602 acaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  2443168 acaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaatatattattacaaaactaatttaatgtgtatcataatactaaaatattga 2443257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 780 - 925
Target Start/End: Original strand, 31686770 - 31686918
Alignment:
Q  780 gttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactaga 879  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31686770 gttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactaga 31686869  T
Q  880 attgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31686870 attgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 31686918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 44282843 - 44282704
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44282843 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 44282745  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44282744 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 44282704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 13896649 - 13896370
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  13896649 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 13896552  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |    ||||    
T  13896551 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatag---gaaa 13896467  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13896466 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 13896370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 121; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 14037266 - 14036987
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  14037266 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 14037169  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| |    ||||    
T  14037168 ggacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatag---gaaa 14037084  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |||  |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  14037083 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtactaa--tattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 14036987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 44282710 - 44282569
Alignment:
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44282710 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 44282611  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44282610 ttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 44282569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 117; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 788 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 31786914 - 31786774
Alignment:
Q  788 aattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttt 887  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31786914 aattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttt 31786815  T
Q  888 tgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  31786814 tggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 31786774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 43341703 - 43341825
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  43341703 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactaaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 43341801  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  43341802 ggacatagctaaattcaagtaaat 43341825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 7474198 - 7474086
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  7474198 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 7474100  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  7474099 ggacatagctaaat 7474086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 17481459 - 17481337
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||    
T  17481459 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataagtactaaaat 17481361  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||||||||| ||| |||||    
T  17481360 ggacatagttaaattcaagtaaat 17481337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 513
Target Start/End: Complemental strand, 43695699 - 43695580
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  43695699 tttatgtttggatataataatgtagaattgattaaagagaataaatgttgtttggatagtt-tcgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 43695601  T
Q  493 agacatagttaaatacaaata 513  Q
      |||| | ||||||||||||    
T  43695600 gaacattgctaaatacaaata 43695580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 2442659 - 2442781
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| | ||||   ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||    
T  2442659 tttatgtttggatacgataacatagaattgattaaacagaaagaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattatttttgaatgtataattattaaaat 2442757  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  2442758 ggacatagctaaataaaaataaat 2442781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 35457613 - 35457735
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| | | | | |||||||||||||| || || |||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35457613 tttatgtttggatacaataatgcagaattgtttaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttattaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 35457711  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  35457712 ggacatagctaaattcaagtaaat 35457735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 37640190 - 37640302
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| |   |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  37640190 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaaatgaacgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 37640288  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  37640289 ggacatagctaaat 37640302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 795 - 923
Target Start/End: Original strand, 2443663 - 2443794
Alignment:
Q  795 gagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-ga 893  Q
    |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||||||||||||| |   ||||||| ||||||| ||    
T  2443663 gagggcagtgatggaattgatggaattgagggtgtagaattgattctagaaaaggcataagctaggaattgtagctttatggagaattgtttttggagga 2443762  T
Q  894 ta-aagctattttgaaaag-caaaccaaacat 923  Q
    || |||| ||| ||||||| ||||||||||||    
T  2443763 tagaagcaattctgaaaagccaaaccaaacat 2443794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 4e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 44003311 - 44003192
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |   |||| |||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||     
T  44003311 tttacgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaattaaat---gtttagatattt-ttgatcaaaattaattttgaatgtataattactaaaac 44003216  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||| ||||||||    
T  44003215 ggacatagctaaatataaataaat 44003192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 16765721 - 16765819
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | || ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16765721 tttatgtttagatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttatttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 16765819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 32496637 - 32496759
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || | | | | ||||||| |||||| || ||| |||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  32496637 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaagcaaactgaatgttgtttgaatagttttt-atcgaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 32496735  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||| ||||| ||| |||||    
T  32496736 agacatagctaaattcaagtaaat 32496759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 393 - 514
Target Start/End: Complemental strand, 19860929 - 19860809
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||  | ||| | |  | |||||| || ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  19860929 tttacgtttggatacaataatgcaaaattgattaaacccactaaatgtcatgtggatattt-ttgatcaaaattgtttttaaatgtataattactaaaat 19860831  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataa 514  Q
    |||||||| |||||||||||||    
T  19860830 agacatagctaaatacaaataa 19860809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 31047820 - 31047942
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||  | |||||||||| | | || ||||||| |  |||||||| ||||||||  |||||    
T  31047820 tttatatttggatacaataatgcataattgattaaacaaaatagatgttgtttggat-gatgtttatcaaaaatgtttttgaatttataattattaaaat 31047918  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     |||||| ||||||||||||||||    
T  31047919 ggacataattaaatacaaataaat 31047942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 481
Target Start/End: Original strand, 33597637 - 33597724
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtata 481  Q
    ||||||||||||| |||||||  | ||||||||||||| | |||   |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||    
T  33597637 tttatgtttggatacaataatataaaattgattaaacaaactaaaggttgtttggatagtt-ttgatcaaaattatttttgaatgtata 33597724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 891
Target Start/End: Complemental strand, 37551653 - 37551592
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga 891  Q
    ||||||||||||||  || | |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37551653 agaattgattctagttaactcagaaactaggaattgtagcttcaaccagaattgcttttgga 37551592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 37640761 - 37640826
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||    
T  37640761 tgtagaattgattctaggaaagccaaaagctaagatttgtagcttcaaggataattgcttttggag 37640826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000006
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 44002742 - 44002678
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    ||||||||||||||  || | | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  44002742 agaattgattctagctaactcaaaagctaggaattgtagcttcatccagaattgcttttagagat 44002678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 827 - 889
Target Start/End: Complemental strand, 17480912 - 17480850
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttg 889  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||  | |||||||||||    
T  17480912 tgtagaattgattctagaaaagctagaagctaggatttgtagctttaaagataattgcttttg 17480850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 43342277 - 43342342
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||| | ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  43342277 tgtagaattgattctagaaaagctagaagctagaatttgtagctttaaggataattgcttttggag 43342342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 49)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 5271034 - 5271331
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5271034 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 5271132  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5271133 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 5271232  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5271233 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 5271331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 50978354 - 50978651
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50978354 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 50978452  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50978453 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 50978552  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50978553 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 50978651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 51487903 - 51488200
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51487903 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 51488001  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51488002 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 51488101  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51488102 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 51488200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 393 - 688
Target Start/End: Complemental strand, 15353828 - 15353534
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353828 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 15353730  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353729 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 15353630  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatat 688  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15353629 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatat 15353534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 26999819 - 27000116
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999819 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttgaatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 26999917  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26999918 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 27000017  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000018 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 27000116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 38843985 - 38843688
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38843985 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgttcggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 38843887  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38843886 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 38843787  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38843786 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 38843688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 7592734 - 7593030
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592734 tttatgtttg-atgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 7592831  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592832 agacatagttaaataaaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 7592931  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7592932 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtacaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 7593030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 393 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 26822005 - 26821785
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26822005 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 26821907  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821906 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 26821807  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataat 614  Q
    ||||||||||||| ||||||||    
T  26821806 ataaaaattacaaatagataat 26821785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 38843468 - 38843226
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  38843468 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 38843369  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38843368 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 38843269  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38843268 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 38843226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 51488384 - 51488626
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  51488384 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 51488483  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51488484 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 51488583  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  51488584 tttggaggataaaagctattttgaaaagtcaaaccaaacatgt 51488626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 195; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 50979124 - 50979366
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50979124 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 50979223  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  50979224 aaaattaatgaggtcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 50979323  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  50979324 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 50979366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 27000155 - 27000397
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27000155 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 27000254  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27000255 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 27000354  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  27000355 tttggaggataaaaactattttgaaaagccaaaccaaatatgt 27000397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 155; E-Value: 8e-82
Query Start/End: Original strand, 705 - 925
Target Start/End: Original strand, 7593123 - 7593334
Alignment:
Q  705 agaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcaggg 804  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7593123 agaaaataaatgttattctcttcaccaacatttatttt------------gaaagaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcaggg 7593210  T
Q  805 atggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctat 902  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  7593211 atggaattaatagaattgagggtggagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctat 7593310  T
Q  903 tttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  7593311 tttgaaaagccaaaccaaacatgt 7593334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 146; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 502 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 27576406 - 27576217
Alignment:
Q  502 taaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaaataaaaatt 601  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  27576406 taaatacaaagaaatagaaattactaaattaaaataattaagtgcaatatggtcctaaaatataagttattacaatactaacagtatgaaaataaaaatt 27576307  T
Q  602 acaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27576306 acaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaattttattacaaaactaatttaatgtgtatcatagtactaaaatattga 27576217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 145; E-Value: 7e-76
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 35606986 - 35606701
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||| |||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  35606986 tttatatttggatgcaataatacagaattgattaaacataatgatttttatttgaatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattacgaaaat 35606888  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| ||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||| || | |||||||    
T  35606887 tgacatagctaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagtcttaaaatataggttattacaatacaaatagcatgaaa 35606798  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  35606797 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 35606701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 139; E-Value: 3e-72
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 46408141 - 46407859
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  46408141 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 46408044  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
      |||||||||||||          ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  46408043 gaacatagttaaata----------gaaattactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 46407956  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  46407955 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 46407859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 135; E-Value: 7e-70
Query Start/End: Original strand, 766 - 925
Target Start/End: Original strand, 5271472 - 5271634
Alignment:
Q  766 tcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattg 865  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5271472 tcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagttaggaattg 5271571  T
Q  866 tagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  5271572 tagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 5271634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Original strand, 36495908 - 36496047
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36495908 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 36496006  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36496007 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 36496047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 393 - 533
Target Start/End: Complemental strand, 38627887 - 38627748
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38627887 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 38627789  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 533  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38627788 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaa 38627748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 119; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 786 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 26821599 - 26821457
Alignment:
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26821599 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 26821500  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  26821499 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 26821457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 118; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Original strand, 36496041 - 36496182
Alignment:
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36496041 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 36496140  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36496141 ttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 36496182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 787 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 38627754 - 38627613
Alignment:
Q  787 aaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 886  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38627754 aaattaatgagggcagggatgaaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgctt 38627655  T
Q  887 ttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38627654 ttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 38627613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 105; E-Value: 6e-52
Query Start/End: Original strand, 800 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 15353431 - 15353303
Alignment:
Q  800 cagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaa 897  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||    
T  15353431 cagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaa 15353332  T
Q  898 gctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15353331 gctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 15353303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 68; E-Value: 7e-30
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 31099891 - 31100013
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||| ||||| | | |||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  31099891 tttatgtttggatacaataatgtagagttgattaaagagaatgaatgttgtttggatggtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 31099989  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  31099990 ggacatagctaaatacaaataaat 31100013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 65; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 393 - 517
Target Start/End: Complemental strand, 6706789 - 6706666
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  6706789 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactaaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaacgtataattactaaaat 6706691  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaata 517  Q
     ||||||| ||||| ||| ||||||    
T  6706690 ggacatagctaaattcaagtaaata 6706666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 393 - 519
Target Start/End: Complemental strand, 45179995 - 45179870
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| | | |||||| || |||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  45179995 tttatgtttggataaaataatgtagaattgattaaacggaatgaatgttgttttgacagtt-ttgatcaaaattgtttttaaatgtataattactaaaat 45179897  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaataga 519  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||    
T  45179896 ggacatagctaaatacaaataaataga 45179870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 416 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27576780 - 27576681
Alignment:
Q  416 agaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaa 515  Q
    ||||||||||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||    
T  27576780 agaattgattaaacagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaatttgcttttgaatgtataattactaaaatggacatagctaaataaaaataaa 27576682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 3e-23
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 42137126 - 42137249
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataatta-ccaaaa 491  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||   ||||    
T  42137126 tttatgtttgtgtacaataatgcagaattgattaaacagattgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattattaaaaa 42137224  T
Q  492 tagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |  |||||| |||||||||||||||    
T  42137225 tgaacatagctaaatacaaataaat 42137249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 4484660 - 4484782
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | | | | | |||||||||||||| || | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  4484660 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaataaattgaatgttgtttggatagtttttaa-caaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 4484758  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    | |||||| ||||| ||| |||||    
T  4484759 aaacatagctaaattcaagtaaat 4484782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 47655133 - 47655255
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||| ||| || || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  47655133 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttgaataattttt-atcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 47655231  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||||||||| ||| |||||    
T  47655232 ggacatagttaaattcaagtaaat 47655255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 392 - 506
Target Start/End: Complemental strand, 50031501 - 50031388
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    |||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  50031501 gtttatgttttgatacaataatgcataattgattaaacatactgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattacttttgaatatataattactaaaa 50031403  T
Q  492 tagacatagttaaat 506  Q
    | ||||||| |||||    
T  50031402 tggacatagctaaat 50031388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 412 - 516
Target Start/End: Original strand, 11050575 - 11050679
Alignment:
Q  412 atgcagaattgattaaacagaataatttttgttt-ggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaa 510  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| | |||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  11050575 atgcagaattgattaaacaaactaaatgttgttttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaaaggacatagttaaatacaa 11050673  T
Q  511 ataaat 516  Q
    | ||||    
T  11050674 acaaat 11050679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 393 - 497
Target Start/End: Original strand, 16342896 - 16342999
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || ||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  16342896 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaacgtataattactaaaat 16342994  T
Q  493 agaca 497  Q
     ||||    
T  16342995 ggaca 16342999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 440 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 27067745 - 27067670
Alignment:
Q  440 ttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27067745 ttgtttggattgtt-ttgatcaaaatcacttttgaatctataattactaaaatagacatagttaaatacaaataaat 27067670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 7385889 - 7385764
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatag--ttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaa 490  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||  || || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  7385889 tttatttttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagttttttttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaa 7385790  T
Q  491 atagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    || || |||| ||||| ||| |||||    
T  7385789 atggagatagctaaattcaagtaaat 7385764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 51; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 393 - 515
Target Start/End: Complemental strand, 11829680 - 11829559
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||| ||| | | | |||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||| |||||    
T  11829680 tttatgtttggatacaataacatagaattgattaaacaaaatgaatgtcgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttaaatgtataattactaaaat 11829582  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaa 515  Q
     ||||||  |||||| |||||||    
T  11829581 ggacatatctaaataaaaataaa 11829559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 41512813 - 41512692
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||| | | | | |||||||||| ||| ||||||||||||  ||||||||||||||| || |||||    
T  41512813 tttatgtttagatacaata-tgcagaattgataaaacaaactgaatgttgtttggattgtt-ttgatcaaaattgattttgaatgtataatcactaaaat 41512716  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  41512715 ggacatagctaaatacaaataaat 41512692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 46; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 409 - 510
Target Start/End: Original strand, 46033182 - 46033282
Alignment:
Q  409 ataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatac 508  Q
    |||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  46033182 ataatgcataattgattaaacaaattgaatgttgtttggatagttttt-atcaaaattgattttgaatgtataattactaaaattgacatagctaaatac 46033280  T
Q  509 aa 510  Q
    ||    
T  46033281 aa 46033282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 440 - 516
Target Start/End: Original strand, 13509411 - 13509487
Alignment:
Q  440 ttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||    
T  13509411 ttgtttggatagttttttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaatggacatagctaaattcaagtaaat 13509487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 492
Target Start/End: Original strand, 50521045 - 50521143
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||| |  ||||| |||||||||||| | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||| |||||    
T  50521045 tttatgtttggatacaataacgtggaattaattaaacagaatgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatatataattactaaaat 50521143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000006
Query Start/End: Original strand, 393 - 491
Target Start/End: Complemental strand, 1763368 - 1763271
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaa 491  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||| | ||||   | |||||| ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||    
T  1763368 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaagcggaatggatgttgtttagatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaa 1763271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 817 - 923
Target Start/End: Complemental strand, 27576081 - 27575972
Alignment:
Q  817 gaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-ca 913  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||  ||||||| ||| |   ||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||| ||    
T  27576081 gaattgagggtgtagaattgattctagaaaagtcagaagctaaaaattgtaactttatggagaattgcttttggaggatagaagcaattatgaaaagtca 27575982  T
Q  914 aaccaaacat 923  Q
    ||||||||||    
T  27575981 aaccaaacat 27575972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 830 - 894
Target Start/End: Complemental strand, 1762313 - 1762249
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggagat 894  Q
    |||||||||||||| ||| | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1762313 agaattgattctagtaaacttaaaagttaggaattgtagcttcaaccagaattgcttttggagat 1762249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 393 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24076134 - 24076060
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattac 468  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24076134 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattac 24076060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 392 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 44740767 - 44740674
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattac 486  Q
    |||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||| | | | | ||||||||||| || || |||||||||| |||| |||||||||||||    
T  44740767 gtttatatttggatacaataatgtagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggataatt-tttatcaaaattatttttaaatgtataattac 44740674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 39; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 503
Target Start/End: Complemental strand, 49431287 - 49431179
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| ||  ||||||||| |||| |||||||| ||||| | || ||| |||| || | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  49431287 tttatgtttgtatataataatgcataatttattaaaca-aataaatgttatttagataatt-tcgatcaaaattacttttgaatatataattactaaaat 49431190  T
Q  493 agacatagtta 503  Q
     ||||||||||    
T  49431189 ggacatagtta 49431179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000006
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 47655888 - 47655953
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  47655888 tgtagaattgattctagaaaagttagaagctaggatttgtagctttaaggataattgcttttggag 47655953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 6706230 - 6706165
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||| ||||||||    
T  6706230 tgtagaattgattctagaaaagctagaagctaggatttgtagctttaaggataattgtttttggag 6706165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 13509940 - 13510005
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| || |||||| ||  | ||||||||||||||    
T  13509940 tgtagaattgattctagaaaagctagaagctaggatttatagctttaaggataattgcttttggag 13510005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-153; HSPs: 34)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 30211252 - 30210955
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211252 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 30211154  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211153 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagacaattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 30211054  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30211053 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 30210955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 30982638 - 30982935
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30982638 tttatgtttggatgcaataatgcagaattaattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 30982736  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30982737 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 30982836  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30982837 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 30982935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 275; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Original strand, 34773857 - 34774154
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34773857 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 34773955  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34773956 agacatagttaaatacaaataaatagaaatgactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 34774055  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34774056 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 34774154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 194054 - 193758
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  194054 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 193956  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193955 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 193856  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193855 at-aaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 193758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 721658 - 721362
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  721658 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 721560  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  721559 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 721460  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  721459 at-aaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 721362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 267; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 882765 - 882469
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  882765 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 882667  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  882666 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 882567  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  882566 at-aaaattacaaatagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattatcacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 882469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 687 - 925
Target Start/End: Original strand, 30984190 - 30984432
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaa-attcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30984190 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 30984289  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 885  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30984290 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgct 30984389  T
Q  886 tttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30984390 tttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 30984432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 393 - 587
Target Start/End: Complemental strand, 629382 - 629189
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  629382 tttatgtttgaatgcaataatgcagaattgattaaacagaatgattgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 629284  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatca 587  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  629283 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatca 629189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 175; E-Value: 9e-94
Query Start/End: Original strand, 719 - 925
Target Start/End: Complemental strand, 30210679 - 30210469
Alignment:
Q  719 attctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatag 817  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30210679 attctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttagaaaaattaatgaggacagggatggaattaatag 30210580  T
Q  818 aattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caa 914  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |||    
T  30210579 aattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaa 30210480  T
Q  915 accaaacatgt 925  Q
    |||||||||||    
T  30210479 accaaacatgt 30210469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 687 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 189950 - 189774
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  189950 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 189851  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  189850 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagattctaggaa 189774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 687 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 717554 - 717378
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  717554 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 717455  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  717454 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagattctaggaa 717378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 149; E-Value: 3e-78
Query Start/End: Original strand, 687 - 862
Target Start/End: Complemental strand, 878661 - 878485
Alignment:
Q  687 attgagagttaaaaccgtagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaa-ttcggttggagaagggttaga 785  Q
    |||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  878661 attgagagttaagactgcagaaaataaatgttattctcttcaccaacatttattttaataagactgcagaaagaaaaaattcggttggagaagggttaga 878562  T
Q  786 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaa 862  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||    
T  878561 aaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagattctaggaa 878485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 132; E-Value: 4e-68
Query Start/End: Original strand, 765 - 925
Target Start/End: Original strand, 34774315 - 34774478
Alignment:
Q  765 ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaatt 864  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34774315 ttcggttggagaagggttagaaaaattaatgagggcagggatggaattaatagaattgagggtgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaatt 34774414  T
Q  865 gtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34774415 gtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaaactattttaaaaagccaaaccaaacatgt 34774478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 131; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 393 - 691
Target Start/End: Complemental strand, 44240775 - 44240493
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| |  |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  44240775 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtttt--atcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 44240678  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaattactaaattaagataattaagtgcaatatagtcctaaaatataaggtattacaatactaacatcatgaaa 592  Q
     ||||||| |||||| ||||          |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| | |||||||    
T  44240677 ggacatagctaaataaaaat----------tactaaattaggataattaagtgcaatatagt--taaaatataagttattacaatactaatagcatgaaa 44240590  T
Q  593 ataaaaattacaagtagataatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaaaactaacataatgtgtattatagtactaaaatattga 691  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| | |||| |  |||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  44240589 ataaaaattacaaatagataatagaatttaaattgcaacaaagtact--aatattattacaaaactaatttaaagtgtattatagtactaaaatattga 44240493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 8e-36
Query Start/End: Original strand, 393 - 522
Target Start/End: Complemental strand, 924695 - 924567
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  924695 tttatgtttggatgcaataatgcataattgattaaacaaactgaatattgtttagatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattactaaaat 924597  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaatagaaat 522  Q
     ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  924596 ggacatagttaaatacaagtaaatggaaat 924567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 7e-27
Query Start/End: Original strand, 418 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 13016316 - 13016219
Alignment:
Q  418 aattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatacaaataaat 516  Q
    ||||||||||||||||| | | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13016316 aattgattaaacagaatgaatgttgttttaatagtt-ttgatcaaaattacttttgaatgtataattactaaaatggacatagttaaatacaaataaat 13016219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 35801744 - 35801856
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  35801744 tttatgtttgaatacaataatgcagaattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaat 35801842  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     |||||||||||||    
T  35801843 ggacatagttaaat 35801856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 26575892 - 26575770
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| | ||||    | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  26575892 tttatgtttggatacaataatatagaattgattagatagaagggatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 26575794  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  26575793 ggacatagctaaatacaaataaat 26575770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 849 - 925
Target Start/End: Original strand, 629476 - 629555
Alignment:
Q  849 taagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gat-aaagctattttgaaaag-caaaccaaacatgt 925  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  629476 taagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaggataaaagctattttgaaaagccaaaccaaacatgt 629555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 2026178 - 2026056
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||||||||||| || |  ||||||  |||||||||||||||||| |||||    
T  2026178 tttatgttttgatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttaaaaaaaattgattttgaatgtataattactaaaat 2026080  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  2026079 ggacatagctaaatacaaataaat 2026056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 8417324 - 8417202
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | | | | |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  8417324 tttatgtttggatataataatgcagaattgattaaacaaattgaatgttgtttagatagtt-ttaatcaaaattacttttgaatgtagaattactaaaat 8417226  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  8417225 ggacatagctaaattcaagtaaat 8417202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 45275830 - 45275952
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||||| | | | | || ||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  45275830 tttatgtttggatacaacaatgcaaaattgattaaacaaactgaatgttatttggatagttttt-atcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 45275928  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  45275929 ggacatagctaaattcaagtaaat 45275952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 485
Target Start/End: Original strand, 17073662 - 17073754
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacaga-ataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataatta 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  17073662 gtttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaacataa-tgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgtttttgaatgtataatta 17073754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 392 - 485
Target Start/End: Complemental strand, 17574608 - 17574516
Alignment:
Q  392 gtttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacaga-ataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataatta 485  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||||||||||| || |||||||||  |||||||||||||||||    
T  17574608 gtttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaacataa-tgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgtttttgaatgtataatta 17574516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 23018296 - 23018418
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||| | | | | ||||||| |||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||| ||||     
T  23018296 tttacgtttggatacaataatgtaaaattgattaaacacattgagtgttgtttgaatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataattactaaaac 23018394  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||  |||||||| ||||||    
T  23018395 cgacataactaaatacatataaat 23018418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 35164381 - 35164446
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    |||||||||||||| |||||||| | || |||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  35164381 tgtagaattgattcgaggaaagtcaaaaactaggaattgtagcttcaaggagaattgcttttggag 35164446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000009
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 36821056 - 36821176
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| |  || | | | | |||||||||||||| || ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  36821056 tttatgtttggatacaataatgcagaattgatga--caaactgaatgttgtttggatagtt-ttcatcgaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 36821152  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||  ||||| ||| |||||    
T  36821153 ggacataactaaattcaagtaaat 36821176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000009
Query Start/End: Original strand, 407 - 486
Target Start/End: Complemental strand, 2598584 - 2598506
Alignment:
Q  407 caataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattac 486  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||| |   |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  2598584 caataatgctgaattgattaaacaaaatgaacgttgttttgatagtt-ttgatcaaaattacttttgaaaatataattac 2598506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 857 - 924
Target Start/End: Complemental strand, 924169 - 924099
Alignment:
Q  857 taggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag-ata-aagctattttgaaaag-caaaccaaacatg 924  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  924169 taggaattgtagctttaactagaattacttttggagtatagaagcaattttgaaaagtcaaaccaaacatg 924099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000004
Query Start/End: Original strand, 827 - 922
Target Start/End: Original strand, 35802344 - 35802442
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttgga-gata-aagctattttgaaaag-caaaccaaaca 922  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||  |||||||||||  | ||||||||||||| |||| |||| ||||| ||||| |||||||||||    
T  35802344 tgtagaattgattctaggaaagccaaaagctaggatatgtagcttcaaggataattgcttttggaggatagaagcaatttttaaaagtcaaaccaaaca 35802442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Original strand, 45276403 - 45276468
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  45276403 tgtagaattgattctagaaaagctagaagctaggatttgtagctttaaggataattgcttttggag 45276468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 830 - 893
Target Start/End: Complemental strand, 3590169 - 3590106
Alignment:
Q  830 agaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggaga 893  Q
    ||||||||||||||  || | | ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  3590169 agaattgattctagttaactcaaaagttaggaattgtagcttcaaccagaattgtttttggaga 3590106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000009
Query Start/End: Original strand, 612 - 654
Target Start/End: Complemental strand, 31778752 - 31778710
Alignment:
Q  612 aatagaatttaaagtgcaatagagtattaaaatattattacaa 654  Q
    ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  31778752 aatagaatttaaagttcaatatagtactaaaatattattacaa 31778710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 827 - 892
Target Start/End: Complemental strand, 8416760 - 8416695
Alignment:
Q  827 tgtagaattgattctaggaaagtaagaagctaggaattgtagcttcaactagaattgcttttggag 892  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||||||||| ||  | ||||||||||||||    
T  8416760 tgtagaattgattctagaaaagctagaagttaggatttgtagctttaaggataattgcttttggag 8416695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 64; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Original strand, 9210 - 9332
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| | | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||| |||||    
T  9210 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaactgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgattttaaatgtataattactaaaat 9308  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  9309 ggacatagctaaatacaaataaat 9332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0097 (Bit Score: 62; Significance: 3e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0097
Description:

Target: scaffold0097; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 3e-26
Query Start/End: Original strand, 393 - 506
Target Start/End: Original strand, 32497 - 32609
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||| | | |||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  32497 tttatgtttggatacaataatgcataattgattaaacaaaatgaatgttgtttggatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaat 32595  T
Q  493 agacatagttaaat 506  Q
     ||||||| |||||    
T  32596 ggacatagctaaat 32609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 56; Significance: 1e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 38374 - 38252
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | | | | |||||| ||||||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||    
T  38374 tttatgtttggatacaataatgcagaattgattaaacaaactgaatgttgtttcgatagtt-tttatcaaaattgcttttgaatgtttaattactaaaat 38276  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  38275 ggacatagctaaattcaagtaaat 38252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 55; Significance: 4e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 407 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 92196 - 92086
Alignment:
Q  407 caataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattg-atcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaa 505  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  92196 caataatgcagaattgattaaacaaactaaatgttgttaggatagtttttttatcaaaattgcttttgaatgtataattactaaaatggacatagttaaa 92097  T
Q  506 tacaaataaat 516  Q
    | ||| |||||    
T  92096 ttcaagtaaat 92086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 48; Significance: 6e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 6e-18
Query Start/End: Original strand, 393 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 4759 - 4636
Alignment:
Q  393 tttatgtttggatgcaataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaat 492  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||   | |   ||||||||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||    
T  4759 tttatgtttggatacaataatgtagaattgattaaacaagctgaacgttgtttggatatttttttatcaaaatttcttttgaatgtataattactgaaat 4660  T
Q  493 agacatagttaaatacaaataaat 516  Q
     ||||||| ||||| ||| |||||    
T  4659 ggacatagctaaattcaagtaaat 4636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0069 (Bit Score: 45; Significance: 4e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0069
Description:

Target: scaffold0069; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 4e-16
Query Start/End: Original strand, 407 - 516
Target Start/End: Complemental strand, 17471 - 17360
Alignment:
Q  407 caataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattg--atcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaa 504  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| | ||||| |||||||| ||   |||||||||  |||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||    
T  17471 caataatgcagaattgattaaacaaactaaatgttgttcggatagttttttttatcaaaattgtttttgaatatataattactaaaatggacatagttaa 17372  T
Q  505 atacaaataaat 516  Q
    || ||| |||||    
T  17371 attcaagtaaat 17360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000004
Query Start/End: Original strand, 409 - 516
Target Start/End: Original strand, 301717 - 301823
Alignment:
Q  409 ataatgcagaattgattaaacagaataatttttgtttggatagttattgatcaaaattacttttgaatgtataattaccaaaatagacatagttaaatac 508  Q
    |||||||| |||||||||||||   | | | |||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| ||| ||||  |||||| ||||||||    
T  301717 ataatgcaaaattgattaaacacgttgaatgttgtttggatagtt-ttgatcaaaattgtttttgaatgtataagtactaaaaccgacataattaaatac 301815  T
Q  509 aaataaat 516  Q
    | ||||||    
T  301816 atataaat 301823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University