View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15573_low_7 (Length: 401)

Name: NF15573_low_7
Description: NF15573
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15573_low_7
NF15573_low_7
[»] chr1 (35 HSPs)
chr1 (35-391)||(43988401-43988760)
chr1 (35-391)||(39445291-39445644)
chr1 (36-391)||(25445029-25445382)
chr1 (36-391)||(1054952-1055304)
chr1 (61-391)||(44023814-44024140)
chr1 (61-391)||(41398055-41398381)
chr1 (229-391)||(41390565-41390726)
chr1 (90-391)||(24787314-24787617)
chr1 (247-343)||(24202769-24202865)
chr1 (246-372)||(47703907-47704034)
chr1 (223-372)||(26644869-26645017)
chr1 (247-343)||(19072928-19073026)
chr1 (247-343)||(19120818-19120916)
chr1 (246-372)||(9476260-9476387)
chr1 (246-343)||(16124515-16124614)
chr1 (246-343)||(27104371-27104470)
chr1 (247-343)||(19358843-19358939)
chr1 (247-343)||(19361432-19361528)
chr1 (247-343)||(19380072-19380168)
chr1 (61-142)||(41386566-41386646)
chr1 (246-372)||(13598397-13598524)
chr1 (247-372)||(3281708-3281833)
chr1 (246-343)||(29651810-29651909)
chr1 (223-372)||(21536541-21536689)
chr1 (247-340)||(37069770-37069864)
chr1 (246-332)||(775671-775759)
chr1 (246-343)||(47098824-47098922)
chr1 (247-343)||(13604623-13604720)
chr1 (251-310)||(9459419-9459479)
chr1 (251-310)||(9463246-9463306)
chr1 (251-310)||(16226386-16226446)
chr1 (246-343)||(32889438-32889536)
chr1 (250-310)||(47102874-47102935)
chr1 (251-310)||(23786058-23786118)
chr1 (251-310)||(51752582-51752642)
[»] chr3 (53 HSPs)
chr3 (35-391)||(8516886-8517243)
chr3 (36-391)||(8512007-8512363)
chr3 (35-391)||(2677026-2677383)
chr3 (35-391)||(2672870-2673227)
chr3 (36-391)||(32475276-32475629)
chr3 (35-391)||(32480132-32480487)
chr3 (35-295)||(10207724-10207983)
chr3 (94-391)||(24967957-24968253)
chr3 (61-391)||(18656251-18656579)
chr3 (64-391)||(22173134-22173458)
chr3 (90-391)||(7167092-7167391)
chr3 (86-391)||(28503814-28504108)
chr3 (229-381)||(8739024-8739176)
chr3 (229-381)||(9091262-9091414)
chr3 (229-381)||(40372757-40372908)
chr3 (229-343)||(2671586-2671699)
chr3 (228-343)||(8477344-8477459)
chr3 (246-372)||(18552844-18552971)
chr3 (228-343)||(26928591-26928705)
chr3 (248-372)||(36029094-36029219)
chr3 (223-372)||(8370448-8370596)
chr3 (246-373)||(40592742-40592870)
chr3 (223-343)||(30709779-30709900)
chr3 (250-343)||(1736294-1736389)
chr3 (247-372)||(16264350-16264475)
chr3 (247-343)||(27974942-27975039)
chr3 (247-343)||(1305949-1306045)
chr3 (246-372)||(3715963-3716090)
chr3 (246-372)||(48438213-48438340)
chr3 (246-343)||(21711222-21711320)
chr3 (247-329)||(27986449-27986533)
chr3 (246-343)||(26298987-26299086)
chr3 (247-343)||(25795781-25795879)
chr3 (290-391)||(28501647-28501750)
chr3 (247-343)||(32143321-32143418)
chr3 (247-329)||(33386669-33386753)
chr3 (246-343)||(6794703-6794801)
chr3 (246-343)||(47923895-47923994)
chr3 (247-343)||(27452958-27453055)
chr3 (246-372)||(40844651-40844777)
chr3 (246-310)||(1417513-1417578)
chr3 (246-343)||(24695153-24695252)
chr3 (246-343)||(37466290-37466388)
chr3 (223-329)||(39039995-39040102)
chr3 (277-313)||(4386947-4386983)
chr3 (251-310)||(38210569-38210629)
chr3 (251-310)||(50494198-50494258)
chr3 (251-314)||(53894055-53894119)
chr3 (246-343)||(3328346-3328444)
chr3 (251-310)||(458483-458543)
chr3 (251-310)||(6063444-6063504)
chr3 (251-310)||(10621528-10621588)
chr3 (247-294)||(39153357-39153405)
[»] chr8 (32 HSPs)
chr8 (35-391)||(35745182-35745537)
chr8 (35-391)||(10684203-10684559)
chr8 (61-391)||(39784763-39785091)
chr8 (66-391)||(6311121-6311443)
chr8 (61-391)||(25328218-25328545)
chr8 (66-391)||(7289865-7290188)
chr8 (229-381)||(18853128-18853281)
chr8 (229-391)||(18870511-18870675)
chr8 (90-381)||(33037768-33038056)
chr8 (229-391)||(36979361-36979524)
chr8 (90-391)||(30655488-30655793)
chr8 (229-381)||(10689104-10689256)
chr8 (90-381)||(4760036-4760325)
chr8 (247-329)||(26287902-26287985)
chr8 (247-329)||(26301159-26301242)
chr8 (247-329)||(26313153-26313236)
chr8 (246-372)||(26403201-26403328)
chr8 (247-343)||(1261954-1262050)
chr8 (246-372)||(23799548-23799675)
chr8 (223-372)||(4456005-4456153)
chr8 (250-372)||(7412344-7412466)
chr8 (246-343)||(5702482-5702581)
chr8 (250-343)||(6127224-6127319)
chr8 (247-343)||(19175754-19175851)
chr8 (247-343)||(31071229-31071326)
chr8 (246-315)||(4696624-4696694)
chr8 (249-310)||(9765852-9765914)
chr8 (246-343)||(19752394-19752492)
chr8 (251-310)||(43079877-43079937)
chr8 (251-310)||(43082248-43082308)
chr8 (277-310)||(18810982-18811015)
chr8 (251-310)||(44721118-44721178)
[»] chr6 (35 HSPs)
chr6 (36-391)||(6005209-6005563)
chr6 (35-391)||(33330384-33330741)
chr6 (36-391)||(16838536-16838890)
chr6 (36-391)||(33335881-33336237)
chr6 (61-391)||(28155510-28155837)
chr6 (35-292)||(5343271-5343527)
chr6 (35-391)||(6438293-6438645)
chr6 (35-391)||(11856764-11857120)
chr6 (61-391)||(14737516-14737843)
chr6 (61-391)||(14742376-14742702)
chr6 (61-391)||(28184320-28184650)
chr6 (64-391)||(22010636-22010960)
chr6 (248-343)||(5674770-5674865)
chr6 (247-372)||(5757450-5757575)
chr6 (246-372)||(5572212-5572339)
chr6 (246-343)||(10077164-10077263)
chr6 (246-343)||(31086472-31086571)
chr6 (246-343)||(31979512-31979611)
chr6 (247-343)||(4629954-4630052)
chr6 (247-343)||(21356036-21356133)
chr6 (246-343)||(22963699-22963797)
chr6 (246-343)||(23824596-23824694)
chr6 (259-343)||(21801343-21801429)
chr6 (268-343)||(18232867-18232943)
chr6 (278-329)||(22709050-22709102)
chr6 (246-310)||(31936586-31936651)
chr6 (251-310)||(12195515-12195575)
chr6 (246-329)||(5017482-5017567)
chr6 (251-310)||(4816231-4816291)
chr6 (251-310)||(5273216-5273276)
chr6 (251-310)||(19704567-19704627)
chr6 (251-310)||(20915356-20915416)
chr6 (251-310)||(26932562-26932622)
chr6 (251-310)||(29754709-29754769)
chr6 (251-310)||(33309110-33309170)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (36-391)||(2785167-2785521)
chr5 (35-391)||(33791107-33791462)
chr5 (34-390)||(33767969-33768324)
chr5 (35-391)||(31396930-31397287)
chr5 (35-391)||(31401787-31402144)
chr5 (36-391)||(37561384-37561740)
chr5 (35-391)||(37556562-37556919)
chr5 (36-391)||(28807514-28807868)
chr5 (66-391)||(1457101-1457423)
chr5 (61-391)||(15044507-15044831)
chr5 (86-391)||(43592120-43592425)
chr5 (66-391)||(43598547-43598870)
chr5 (66-391)||(43604039-43604362)
chr5 (66-391)||(43609531-43609854)
chr5 (66-391)||(27444793-27445116)
chr5 (66-391)||(27449637-27449960)
chr5 (86-391)||(30631249-30631553)
chr5 (228-391)||(31180197-31180360)
chr5 (247-343)||(38192174-38192270)
chr5 (247-343)||(38219399-38219495)
chr5 (247-372)||(10281751-10281877)
chr5 (229-391)||(24135831-24135994)
chr5 (247-343)||(35387663-35387759)
chr5 (247-372)||(9353304-9353429)
chr5 (248-372)||(11916943-11917068)
chr5 (247-343)||(36932350-36932447)
chr5 (247-343)||(15464532-15464629)
chr5 (223-372)||(14520207-14520355)
chr5 (246-372)||(3880298-3880425)
chr5 (246-340)||(17003962-17004058)
chr5 (247-343)||(19588746-19588844)
chr5 (223-343)||(12084175-12084295)
chr5 (246-343)||(28832258-28832356)
chr5 (251-310)||(4410241-4410301)
chr5 (246-343)||(42127410-42127508)
chr5 (251-310)||(15552464-15552524)
chr5 (251-310)||(31179371-31179431)
chr5 (251-310)||(31542953-31543013)
chr5 (251-310)||(31545299-31545359)
chr5 (251-304)||(27910675-27910729)
chr5 (246-310)||(31300629-31300694)
chr5 (251-310)||(3373137-3373197)
chr5 (251-310)||(10749919-10749979)
chr5 (251-310)||(15354575-15354635)
[»] scaffold0197 (2 HSPs)
scaffold0197 (35-391)||(19104-19459)
scaffold0197 (35-391)||(14248-14604)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (35-391)||(148895-149250)
[»] scaffold0259 (1 HSPs)
scaffold0259 (36-391)||(2190-2544)
[»] chr2 (43 HSPs)
chr2 (35-391)||(19349069-19349425)
chr2 (36-391)||(19344212-19344567)
chr2 (36-381)||(32246577-32246922)
chr2 (61-391)||(39811928-39812255)
chr2 (64-391)||(44312563-44312887)
chr2 (229-391)||(11098877-11099040)
chr2 (92-381)||(14291337-14291624)
chr2 (229-381)||(9296362-9296514)
chr2 (247-343)||(3491751-3491847)
chr2 (246-372)||(8040059-8040188)
chr2 (247-343)||(25398496-25398592)
chr2 (250-343)||(13569331-13569426)
chr2 (246-343)||(21629943-21630041)
chr2 (247-343)||(25403634-25403730)
chr2 (246-372)||(10445415-10445542)
chr2 (246-372)||(17865202-17865329)
chr2 (246-372)||(34682305-34682432)
chr2 (247-372)||(28259149-28259274)
chr2 (248-372)||(10707223-10707348)
chr2 (248-343)||(34388859-34388956)
chr2 (250-372)||(8390121-8390244)
chr2 (246-372)||(14698979-14699105)
chr2 (246-343)||(20522219-20522318)
chr2 (247-329)||(40738844-40738926)
chr2 (246-372)||(39482930-39483057)
chr2 (247-340)||(31056044-31056139)
chr2 (246-343)||(33528620-33528719)
chr2 (246-372)||(33118135-33118262)
chr2 (246-343)||(16940208-16940307)
chr2 (246-343)||(17010873-17010972)
chr2 (247-372)||(23078442-23078567)
chr2 (277-343)||(25407653-25407719)
chr2 (223-378)||(36757728-36757882)
chr2 (247-343)||(42039669-42039766)
chr2 (251-310)||(35215586-35215646)
chr2 (251-310)||(35217963-35218023)
chr2 (250-343)||(2838029-2838124)
chr2 (250-343)||(2869692-2869787)
chr2 (250-310)||(1345574-1345635)
chr2 (251-307)||(45332181-45332238)
chr2 (251-310)||(23452237-23452297)
chr2 (251-310)||(36558864-36558924)
chr2 (251-310)||(36561141-36561201)
[»] chr7 (47 HSPs)
chr7 (35-391)||(24261262-24261618)
chr7 (36-391)||(24266141-24266496)
chr7 (35-391)||(16879863-16880218)
chr7 (35-391)||(16884719-16885074)
chr7 (36-391)||(19992104-19992458)
chr7 (36-391)||(21812178-21812532)
chr7 (61-391)||(24024266-24024594)
chr7 (61-391)||(31109523-31109849)
chr7 (61-391)||(12406150-12406477)
chr7 (61-391)||(12396730-12397057)
chr7 (90-343)||(20357548-20357797)
chr7 (61-332)||(4866548-4866816)
chr7 (229-381)||(2057949-2058101)
chr7 (228-343)||(18408746-18408860)
chr7 (247-343)||(1533444-1533540)
chr7 (246-372)||(29159802-29159929)
chr7 (247-343)||(21639809-21639905)
chr7 (248-372)||(21983285-21983411)
chr7 (228-343)||(18413623-18413736)
chr7 (247-343)||(21646007-21646103)
chr7 (246-372)||(46516281-46516408)
chr7 (246-343)||(49091660-49091759)
chr7 (246-372)||(2647667-2647794)
chr7 (246-343)||(33332449-33332548)
chr7 (246-372)||(55947-56073)
chr7 (247-343)||(44848684-44848781)
chr7 (246-372)||(2580389-2580515)
chr7 (246-343)||(9190008-9190106)
chr7 (246-310)||(20284088-20284153)
chr7 (246-372)||(4796638-4796765)
chr7 (246-343)||(35960815-35960914)
chr7 (247-372)||(2479337-2479461)
chr7 (246-310)||(9185198-9185263)
chr7 (250-310)||(28617258-28617319)
chr7 (251-310)||(31155911-31155971)
chr7 (248-343)||(21988909-21989005)
chr7 (247-315)||(47263678-47263745)
chr7 (251-310)||(1049296-1049356)
chr7 (251-310)||(2935497-2935557)
chr7 (251-310)||(3035953-3036013)
chr7 (251-310)||(7351652-7351712)
chr7 (247-294)||(8153466-8153514)
chr7 (251-310)||(9027194-9027254)
chr7 (251-310)||(22108295-22108355)
chr7 (251-310)||(22137306-22137366)
chr7 (251-310)||(40550055-40550115)
chr7 (251-310)||(40552333-40552393)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (35-322)||(181973-182259)
[»] chr4 (39 HSPs)
chr4 (36-391)||(18855519-18855871)
chr4 (36-391)||(3813816-3814168)
chr4 (61-391)||(5732481-5732809)
chr4 (35-391)||(9224346-9224699)
chr4 (36-391)||(45357236-45357588)
chr4 (61-391)||(9229133-9229460)
chr4 (66-391)||(51520280-51520603)
chr4 (36-391)||(45347756-45348109)
chr4 (65-378)||(56146664-56146974)
chr4 (229-391)||(24741924-24742087)
chr4 (229-343)||(29760625-29760738)
chr4 (246-372)||(10047378-10047505)
chr4 (246-343)||(39245993-39246092)
chr4 (246-372)||(16623264-16623391)
chr4 (246-372)||(38152410-38152537)
chr4 (247-372)||(3796490-3796616)
chr4 (247-329)||(28468542-28468625)
chr4 (247-372)||(5396643-5396768)
chr4 (246-343)||(36315229-36315327)
chr4 (246-343)||(36329438-36329536)
chr4 (248-372)||(5147678-5147803)
chr4 (248-372)||(5143260-5143385)
chr4 (246-337)||(24333808-24333901)
chr4 (246-372)||(16630651-16630778)
chr4 (247-343)||(31985634-31985730)
chr4 (246-329)||(5269204-5269289)
chr4 (248-372)||(3777550-3777674)
chr4 (252-340)||(6743417-6743507)
chr4 (251-310)||(16931789-16931849)
chr4 (251-310)||(16934143-16934203)
chr4 (251-310)||(22780373-22780433)
chr4 (251-310)||(44599838-44599898)
chr4 (246-329)||(25862035-25862120)
chr4 (284-343)||(5112275-5112335)
chr4 (251-310)||(6765117-6765177)
chr4 (251-310)||(7941596-7941656)
chr4 (251-310)||(18709164-18709224)
chr4 (251-310)||(22782738-22782798)
chr4 (246-372)||(54867183-54867309)
[»] scaffold0464 (1 HSPs)
scaffold0464 (35-391)||(154-507)
[»] scaffold0355 (3 HSPs)
scaffold0355 (61-391)||(9583-9907)
scaffold0355 (61-206)||(13-148)
scaffold0355 (334-391)||(3788-3845)
[»] scaffold0135 (1 HSPs)
scaffold0135 (61-391)||(35001-35328)
[»] scaffold0188 (2 HSPs)
scaffold0188 (247-343)||(17952-18048)
scaffold0188 (247-343)||(24045-24141)
[»] scaffold0140 (3 HSPs)
scaffold0140 (247-343)||(8419-8516)
scaffold0140 (251-310)||(22343-22403)
scaffold0140 (251-310)||(24618-24678)
[»] scaffold0127 (1 HSPs)
scaffold0127 (61-142)||(34136-34216)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (246-372)||(10728-10855)
[»] scaffold0006 (3 HSPs)
scaffold0006 (246-372)||(5682-5809)
scaffold0006 (246-372)||(2491-2618)
scaffold0006 (247-343)||(133280-133377)
[»] scaffold0479 (1 HSPs)
scaffold0479 (35-125)||(13140-13229)
[»] scaffold0777 (1 HSPs)
scaffold0777 (35-84)||(6292-6341)
[»] scaffold0036 (1 HSPs)
scaffold0036 (248-343)||(85684-85780)
[»] scaffold0087 (2 HSPs)
scaffold0087 (247-372)||(43933-44058)
scaffold0087 (222-372)||(36804-36953)
[»] scaffold0098 (1 HSPs)
scaffold0098 (247-315)||(45253-45322)
[»] scaffold0176 (1 HSPs)
scaffold0176 (250-372)||(17266-17389)
[»] scaffold0978 (1 HSPs)
scaffold0978 (228-279)||(300-350)
[»] scaffold0267 (1 HSPs)
scaffold0267 (251-310)||(269-329)
[»] scaffold0154 (1 HSPs)
scaffold0154 (277-310)||(11500-11533)
[»] scaffold0025 (1 HSPs)
scaffold0025 (251-310)||(69292-69352)


Alignment Details
Target: chr1 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 35)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 43988760 - 43988401
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  43988760 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacgccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 43988661  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988660 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 43988561  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43988560 aaaacaccaagcaagattgtttacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 43988461  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  43988460 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 43988401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 39445291 - 39445644
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||    
T  39445291 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatggc 39445389  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||    
T  39445390 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 39445485  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  39445486 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaa 39445584  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39445585 g-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 39445644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25445382 - 25445029
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25445382 tgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagcgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 25445284  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||  |   ||||| |||||    
T  25445283 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcgtaaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 25445188  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  25445187 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 25445088  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  25445087 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagagctaccctttg 25445029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1055304 - 1054952
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||| ||    
T  1055304 tgttgtgaatccggttctacaatcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgtgaacaaatgtct 1055206  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| |||||    
T  1055205 tccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 1055110  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1055109 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcaactctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag 1055011  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1055010 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 1054952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44024140 - 44023814
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  44024140 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaactgatagtgataatcaatgagaacaaatggcttccaagcaaacaacaacaaa-cagc 44024043  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 257  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||     | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44024042 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaatg---gtaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttga 44023947  T
Q  258 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 357  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  |||||    
T  44023946 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttgtcaag 44023849  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  44023848 ctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 44023814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 41398055 - 41398381
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaa---aac 157  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||  ||||||| |||||||||||   |||    
T  41398055 aaccttcacaccaatga-aataaaccaattatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacatatggtctccaagcaaacaacaacaacaaaac 41398153  T
Q  158 agcc-taagcctaatgtatagcacaa--ccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaa--aagaacaaaacaccaagcaagatt 252  Q
    |||| |||  ||| ||||||||| ||  ||||||  |||| || |||      |  |||||  || || |||||  |||||||||||||| || ||||||    
T  41398154 agccctaa--ctagtgtatagcaaaaaaccacacaaagagataccaa------agcataaa--caagataagaaggaagaacaaaacaccgag-aagatt 41398242  T
Q  253 gttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctat 352  Q
    |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |    
T  41398243 gttgacccaggtcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-ct 41398340  T
Q  353 tcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41398341 tcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41398381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Original strand, 41390565 - 41390726
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttaca 328  Q
    |||||||||||| | || |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||    
T  41390565 aagaacaaaacatcgag-aagattgttgacccagatcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttaca 41390663  T
Q  329 aaagagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| ||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  41390664 aaag-gttacaagactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 41390726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 90 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24787617 - 24787314
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagcta--acaacaacaaaa--cagcctaagcctaatgtatagcacaacca 185  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||| ||||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||  |||||  || || ||||| |||| |||||    
T  24787617 gatgtgtggagcaagagatagtggtaataaatgagca-aaatggtttccaagcaacaacaacaacaaaaaacagccctagacttatgtagagcaaaacca 24787519  T
Q  186 cacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 284  Q
    |||  |||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24787518 cacaaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 24787423  T
Q  285 gggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagc-tttcacaagaacaaaccctaga- 380  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||| || |||||||||||| ||||||     
T  24787422 gggggggagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcattacacaagaacaaatcctagat 24787325  T
Q  381 tctaccctttg 391  Q
    |||||||||||    
T  24787324 tctaccctttg 24787314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24202865 - 24202769
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24202865 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 24202769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 47704034 - 47703907
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  47704034 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 47703935  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  47703934 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 47703907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26645017 - 26644869
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  26645017 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccattatgatgaa 26644920  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26644919 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 26644869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 19072928 - 19073026
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19072928 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19073026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 19120818 - 19120916
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19120818 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19120916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 9476260 - 9476387
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| || |||||||||||||| |||||    
T  9476260 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtattacaaaagagttataagaa 9476359  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  9476360 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 9476387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16124614 - 16124515
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16124614 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16124515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27104470 - 27104371
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  27104470 caagattgttgacacagttcggtccaatataacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 27104371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19358939 - 19358843
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19358939 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19358843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19361528 - 19361432
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19361528 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19361432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19380168 - 19380072
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||| |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  19380168 aagattgttgacccagttcagtcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 19380072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Original strand, 41386566 - 41386646
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagc 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  41386566 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 41386646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 13598397 - 13598524
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13598397 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 13598496  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  13598497 attagct-tataagcttacacaagaacaa 13598524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Original strand, 3281708 - 3281833
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  3281708 aagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccacgatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 3281806  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3281807 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 3281833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 29651810 - 29651909
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  29651810 caagatttttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcactccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 29651909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 21536689 - 21536541
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatg-tggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| |  ||   || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||    
T  21536689 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtaaaaaatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaa 21536592  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21536591 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 21536541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 37069770 - 37069864
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 340  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||    
T  37069770 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatctctccgatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaa 37069864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 332
Target Start/End: Original strand, 775671 - 775759
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | |||| ||||||||||||    
T  775671 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaag 775759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47098922 - 47098824
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  47098922 caagattgttgacccagttcggtccaatatgaccgaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 47098824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 13604720 - 13604623
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  13604720 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaa 13604623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 9459419 - 9459479
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9459419 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9459479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 9463246 - 9463306
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9463246 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 9463306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16226446 - 16226386
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16226446 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16226386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 32889438 - 32889536
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||| | ||||| | ||||| || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  32889438 caagattgttgatctagttcggtccaatatgacctagtctgggggatagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 32889536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 47102935 - 47102874
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||  |||||||||    
T  47102935 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccatccaatcca 47102874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 23786118 - 23786058
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  23786118 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 23786058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 51752642 - 51752582
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51752642 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 51752582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 287; Significance: 1e-161; HSPs: 53)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 287; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 8516886 - 8517243
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8516886 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggc 8516985  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| |||    
T  8516986 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaa 8517084  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8517085 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 8517184  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8517185 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8517243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 8512007 - 8512363
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8512007 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatggct 8512106  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||| ||||| ||||    
T  8512107 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtgtagcacaaccacactaagagttaacaagcatacaagataaaacgat-aaacgaaaacgaac 8512205  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8512206 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 8512305  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  8512306 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 8512363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 280; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2677383 - 2677026
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2677383 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagcaaatgg 2677284  T
Q  134 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2677283 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 2677185  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2677184 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 2677086  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2677085 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2677026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2673227 - 2672870
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  2673227 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagagtaaatgg 2673128  T
Q  134 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  2673127 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 2673029  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2673028 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 2672930  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  2672929 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 2672870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 32475276 - 32475629
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  32475276 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 32475375  T
Q  136 tccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |||    
T  32475376 tccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaa 32475472  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  32475473 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttac-aaaga 32475570  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32475571 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32475629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 32480132 - 32480487
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatc-aatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  32480132 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatccaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatgg 32480231  T
Q  134 cttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-g 231  Q
    | ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| |    
T  32480232 cctccaaactaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacg 32480328  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||    
T  32480329 aacaaaacaccaaccaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt-ttac-aaa 32480426  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  32480427 gagttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 32480487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 35 - 295
Target Start/End: Original strand, 10207724 - 10207983
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  10207724 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 10207823  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10207824 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaa 10207922  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 295  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10207923 c-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagag 10207983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 94 - 391
Target Start/End: Original strand, 24967957 - 24968253
Alignment:
Q  94 tgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttaga 193  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||    
T  24967957 tgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaaga 24968056  T
Q  194 gctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaga 292  Q
    |||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||    
T  24968057 gctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacgaacaaa-caccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaattttggggaga 24968153  T
Q  293 gagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  24968154 gagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaacccgagatctaccctttg 24968253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 18656251 - 18656579
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  18656251 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 18656347  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa----caccaagcaagattgt 254  Q
    | ||||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||     | |||| |||||||||||    |||  | |||||||||    
T  18656348 cctaagc-tagtgtatagaaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacg---gtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgt 18656443  T
Q  255 tgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattc 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| |||||| ||||    
T  18656444 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-attc 18656541  T
Q  355 aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18656542 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 18656579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22173458 - 22173134
Alignment:
Q  64 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 163  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||      
T  22173458 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagccct 22173361  T
Q  164 agcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatac-aagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 261  Q
    || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| |  |||||||   |   ||||| || |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22173360 agactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaataagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22173265  T
Q  262 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22173264 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 22173167  T
Q  361 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22173166 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22173134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 90 - 391
Target Start/End: Original strand, 7167092 - 7167391
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacact 189  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||   |||||| |||||||| ||||||||||||||||||  || ||| |||| |||| ||||||||     
T  7167092 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacaca 7167189  T
Q  190 tagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggg 288  Q
     |||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7167190 aagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 7167286  T
Q  289 gagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tcta 384  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  7167287 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattcta 7167384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 86 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28504108 - 28503814
Alignment:
Q  86 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 185  Q
    ||||||||||||||||||  | ||| ||||||| ||||||  |||||| |||||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||||||| |||||    
T  28504108 caatgatgtgtggagcaaaaggtagtgataatctatgagaa-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaacagcccttgactagtgtatagcaaaacca 28504011  T
Q  186 cacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctg 285  Q
    |||  |||| ||||||      |  |||||  || |||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28504010 cacaaagagataacaa------agcataaa--caagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 28503922  T
Q  286 ggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-t 381  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |    
T  28503921 gggaagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaagaataaaccctagatt 28503824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 8739176 - 8739024
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8739176 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 8739078  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  8739077 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaatccctagat 8739024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 9091414 - 9091262
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9091414 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9091316  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  9091315 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaatccctagat 9091262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 40372908 - 40372757
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  40372908 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 40372810  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc-tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
    ||| | ||||||||||   ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  40372809 aaagg-gttacaagaaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaagccctagat 40372757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2671699 - 2671586
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2671699 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 2671601  T
Q  328 aaaagagttacaagaa 343  Q
     |||| ||||||||||    
T  2671600 -aaagggttacaagaa 2671586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 343
Target Start/End: Original strand, 8477344 - 8477459
Alignment:
Q  228 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 325  Q
    |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  8477344 aaagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgtt 8477442  T
Q  326 acaaaagagttacaagaa 343  Q
    || |||| ||||||||||    
T  8477443 ac-aaagggttacaagaa 8477459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 18552971 - 18552844
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18552971 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18552872  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  18552871 attagct-tataagcttacacaagaacaa 18552844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 26928705 - 26928591
Alignment:
Q  228 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 325  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||    
T  26928705 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgtt 26928608  T
Q  326 acaaaagagttacaagaa 343  Q
    || |||| ||||||||||    
T  26928607 ac-aaagggttacaagaa 26928591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Original strand, 36029094 - 36029219
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  36029094 agattgttgacccagttctgtccaatatgacctaatctgggggagaaagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 36029193  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  36029194 tagct-tacaaacttacacaagaacaa 36029219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8370596 - 8370448
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  8370596 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 8370499  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  8370498 agtgttac-aaagagttacaagaaattagct-taaaagcttacacaagaacaa 8370448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 246 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40592870 - 40592742
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40592870 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagaagctctccaatcgactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40592771  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaaa 373  Q
      ||||| | ||||||| ||||||||||||    
T  40592770 attagct-tacaagcttacacaagaacaaa 40592742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 30709900 - 30709779
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||    
T  30709900 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaa 30709803  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
      ||||||||||||||||||||||    
T  30709802 attgttacaaaagagttacaagaa 30709779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1736389 - 1736294
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  1736389 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 1736294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Original strand, 16264350 - 16264475
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  16264350 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 16264448  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  16264449 atagct-tgcaagcttccacaagaacaa 16264475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 27975039 - 27974942
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  27975039 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 27974942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 1305949 - 1306045
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1305949 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctaggggagatagcagctctccaatccactacgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1306045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3716090 - 3715963
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3716090 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggagagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3715991  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  3715990 attagct-tacaaacttacacaagaacaa 3715963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 48438213 - 48438340
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||| |||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  48438213 caagattattgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 48438312  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      |||| ||  |||||| |||||||||||    
T  48438313 attagc-atataagcttacacaagaacaa 48438340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 21711222 - 21711320
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  21711222 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 21711320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 27986533 - 27986449
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  27986533 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 27986449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 26298987 - 26299086
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  26298987 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatctactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 26299086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 25795781 - 25795879
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| | || | |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25795781 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatctactaagatgaaagtgttacgaaagagttacaagaa 25795879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 290 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28501750 - 28501647
Alignment:
Q  290 agagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctac 385  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  28501750 agagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaagaataaaccctagattctac 28501653  T
Q  386 cctttg 391  Q
    ||||||    
T  28501652 cctttg 28501647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 32143321 - 32143418
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  32143321 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 32143418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 33386753 - 33386669
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  33386753 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 33386669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 6794801 - 6794703
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||| |||  | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  6794801 caagattgttgacccggttaggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 6794703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 47923994 - 47923895
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| | |||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  47923994 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctaggggagagagcagcccttcaatctactatgatgaaagtgctacaaaagagttacaagaa 47923895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 27452958 - 27453055
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||| ||||||| | ||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  27452958 aagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatccgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 27453055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 40844651 - 40844777
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||| ||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  40844651 caagattgttgattcagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctcaaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 40844749  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  40844750 attagct-tataagcttacacaagaacaa 40844777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1417578 - 1417513
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  1417578 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcatccctccaatcca 1417513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24695252 - 24695153
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||| | ||| |||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  24695252 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcaaccctctaatccgctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 24695153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 37466290 - 37466388
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||||| ||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  37466290 caagattgttgacacagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 37466388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 223 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 39040102 - 39039995
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||| ||||| || |||||||||||| |||| ||||    
T  39040102 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctggggaagagaacaactctccaatccactatgatgaa 39040005  T
Q  320 tgtgttacaa 329  Q
     |||||||||    
T  39040004 agtgttacaa 39039995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 4386983 - 4386947
Alignment:
Q  277 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata 313  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4386983 cctactctgggggagagagcagctctccaatccaata 4386947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 38210629 - 38210569
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  38210629 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagctctccaatcca 38210569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 50494258 - 50494198
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  50494258 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 50494198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 314
Target Start/End: Original strand, 53894055 - 53894119
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat 314  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  53894055 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatccaatat 53894119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 3328444 - 3328346
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttca-gccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||||| | |||||||||||| || ||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  3328444 caagattgttgacccagttcattccaatatgacctaatctagaggagagagcagcccttcaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 3328346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 458543 - 458483
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  458543 ttgttgacccagttcggtccaacctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 458483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 6063444 - 6063504
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||| |||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6063444 ttgtggacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6063504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 10621528 - 10621588
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| ||  ||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10621528 ttgttgacccagttcggtccaatctgagctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 10621588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Original strand, 39153357 - 39153405
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagaga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  39153357 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 39153405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 32)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 35745182 - 35745537
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  35745182 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 35745281  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  35745282 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac 35745380  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35745381 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 35745479  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  35745480 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 35745537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 10684559 - 10684203
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  10684559 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 10684460  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  10684459 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 10684363  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10684362 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 10684263  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  10684262 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 10684203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39785091 - 39784763
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| || ||||||||||||||    
T  39785091 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaataacaacaaaacagc 39784993  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 256  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||  |||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  39784992 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaagaacaaaacaccgagcaagattgttg 39784897  T
Q  257 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 356  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||  ||||    
T  39784896 acccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag-gttacaagactctagcttatcaa 39784799  T
Q  357 gcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39784798 gctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 39784763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 6311121 - 6311443
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  6311121 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtttccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 6311218  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagtt 264  Q
     ||| ||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  6311219 actagtgtatagcaaaaccacactaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagtt 6311315  T
Q  265 cagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt- 361  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||  ||||||  ||||||||||     
T  6311316 cagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaaactctagc-cttcaagcttta 6311413  T
Q  362 cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  6311414 cacaag-acaaaccctagattctaccctttg 6311443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 25328545 - 25328218
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| |    
T  25328545 aaccttcacaacaatga-aataaatcaatgatgtgcggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacaac 25328447  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaag-catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    | |||  ||| ||||||||| ||||||||  |||| || |||  |||| | || | || |   ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  25328446 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagataccaaaacataaacgagataaacggtaaaggaaaagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 25328351  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 358  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  25328350 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagc 25328253  T
Q  359 ttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  25328252 tttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 25328218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 7290188 - 7289865
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| || |||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||| |||||  ||    
T  7290188 tcacaccaatga-aataaa-cattgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaacaaacaacaacaaagcagccctag 7290091  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagc---atacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |   | |||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  7290090 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaaccataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 7289995  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  7289994 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 7289897  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  7289896 acacatgaacaaaccctatattctaccctttg 7289865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 18853281 - 18853128
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18853281 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttac 18853183  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18853182 aaaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaaaccctagat 18853128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 18870675 - 18870511
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||    
T  18870675 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcatccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatataatgaaagtgttac 18870577  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18870576 aaaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 18870511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 9e-46
Query Start/End: Original strand, 90 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 33038056 - 33037768
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaa--aacagcctaagcctaatgtatagcacaaccaca 187  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||  |||||||  || ||| |||| |||| |||||||    
T  33038056 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaataaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 33037959  T
Q  188 cttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctg 285  Q
    |  |||| || ||| ||| | ||||||||   || ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33037958 caaagagataccaaagcaaaacaagataag--caagaaaagaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctg 33037864  T
Q  286 ggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33037863 ggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagat 33037768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Original strand, 36979361 - 36979524
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  36979361 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 36979459  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  36979460 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 36979524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 90 - 391
Target Start/End: Original strand, 30655488 - 30655793
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa--cagcctaagcctaatgtatagcacaaccaca 187  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||| |  |||||| |||||||| |||||||||||||  |||||  || ||| |||| |||| |||||||    
T  30655488 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatga-acaaaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccaca 30655585  T
Q  188 cttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaag--aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 284  Q
    | ||||| |||||| ||||| |  | | || || |||| ||| |   || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30655586 catagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaagaacaaaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct 30655684  T
Q  285 gggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga- 380  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||     
T  30655685 gggggagagagcagctctccaatctaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagat 30655782  T
Q  381 tctaccctttg 391  Q
    |||||||||||    
T  30655783 tctaccctttg 30655793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 10689256 - 10689104
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  10689256 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 10689158  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
     | || |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  10689157 -agagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 10689104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 8e-37
Query Start/End: Original strand, 90 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 4760325 - 4760036
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 188  Q
    |||||||||||| || ||||| | |||||||||||   |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  4760325 gatgtgtggagctagagatagtggtaatcaatgagca-aaatggtttccaagc-aacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 4760228  T
Q  189 ttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctggg 287  Q
      |||| |||||| ||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  4760227 aaagagataacaaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacatcaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatggg 4760131  T
Q  288 ggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  4760130 ggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 4760036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Original strand, 26287902 - 26287985
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26287902 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26287985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Original strand, 26301159 - 26301242
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26301159 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26301242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Original strand, 26313153 - 26313236
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  26313153 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 26313236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 26403328 - 26403201
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||||||||| | |||    
T  26403328 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttataggaa 26403229  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  26403228 attagct-tacaagcttgcacaagaacaa 26403201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1262050 - 1261954
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1262050 aagattgttgacccagttcaaccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1261954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23799675 - 23799548
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||| |||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23799675 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttggaggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23799576  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  23799575 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 23799548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Original strand, 4456005 - 4456153
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||| |||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4456005 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgctgacccggttcggtccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaa 4456102  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||||| |||||||||||||||  |||||   ||||||| |||||||||||    
T  4456103 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-ggcaagcttacacaagaacaa 4456153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Original strand, 7412344 - 7412466
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 347  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||  ||    
T  7412344 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaata 7412442  T
Q  348 gctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     || | ||||||| |||||||||||    
T  7412443 act-tgcaagcttacacaagaacaa 7412466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5702581 - 5702482
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| | |||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5702581 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcatccctccaatcccctatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5702482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Original strand, 6127224 - 6127319
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  6127224 attgttgactcagttcggtccaatatgacctaatttggggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 6127319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19175851 - 19175754
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  19175851 aagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 19175754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31071326 - 31071229
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31071326 aagattgttgaccgagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 31071229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 315
Target Start/End: Complemental strand, 4696694 - 4696624
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 315  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  4696694 caagattgttgacccagttcgatccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatg 4696624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 249 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9765914 - 9765852
Alignment:
Q  249 gattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9765914 gattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 9765852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 19752492 - 19752394
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  19752492 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 19752394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43079937 - 43079877
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43079937 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43079877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 43082308 - 43082248
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43082308 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 43082248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 18811015 - 18810982
Alignment:
Q  277 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18811015 cctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 18810982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 44721178 - 44721118
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  44721178 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgcgggagagagcagctctccaatcca 44721118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 35)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 6005209 - 6005563
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  6005209 tgttgtaaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 6005308  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||     
T  6005309 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac- 6005406  T
Q  236 aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6005407 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 6005506  T
Q  336 tacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6005507 tacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 6005563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33330741 - 33330384
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33330741 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaattagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 33330642  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  33330641 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaaga 33330543  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33330542 ac-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 33330444  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33330443 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33330384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 16838536 - 16838890
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  16838536 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatatgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 16838635  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 234  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||||    
T  16838636 ttcaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaac 16838733  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16838734 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 16838832  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16838833 ttacaagaatctagctattcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 16838890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 33336237 - 33335881
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  33336237 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 33336138  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatag-cacaaccacacttagagctaacaagcat-acaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 233  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33336137 tccaaactaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagtaaaaaccacactaagagctaacaagcataacaagat-aaaccatgaaaagaaaagaa 33336039  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33336038 c-aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33335940  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  33335939 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacatgacaaaaccctagatctaccctttg 33335881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28155837 - 28155510
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||    
T  28155837 aaccttcacaccaatgc-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtcttcaagctaacaacaacaaaacagc 28155740  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    ||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | ||||||||||||||| | |||||||||||||    
T  28155739 ctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaagaacaaaacaccgaacaagattgttgac 28155642  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||    
T  28155641 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaatttagct-ttcaagc 28155544  T
Q  359 ttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28155543 tttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 28155510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 35 - 292
Target Start/End: Original strand, 5343271 - 5343527
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  5343271 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataagtcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 5343370  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagc-acaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||    
T  5343371 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaaagtatagcaaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacga 5343468  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaga 292  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  5343469 ac-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggaga 5343527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 6438293 - 6438645
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||    
T  6438293 ttgttgtgattccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaaccaatggc 6438390  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||    
T  6438391 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 6438486  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  6438487 aacaaaacaccgagcaagattgttgtcccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaa 6438585  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  6438586 g-gttacaagactctagcttgtcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 6438645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 11856764 - 11857120
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||     
T  11856764 ttgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 11856861  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaa-aag 231  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||| ||  | || ||| ||| ||     
T  11856862 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagacaag-cgataaaaggaagaac 11856960  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  11856961 aaaaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa 11857059  T
Q  332 gagttacaagaa-tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    | |||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  11857060 g-gttacaagaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 11857120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14737843 - 14737516
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  14737843 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 14737746  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacactta-gagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 257  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  | ||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || |||||||||||    
T  14737745 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttga 14737650  T
Q  258 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaag 357  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||    
T  14737649 tccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaag 14737552  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  14737551 ctttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14737516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14742702 - 14742376
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||  ||||||||||||||||    
T  14742702 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagcatacaacaacaaaacagc 14742605  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  14742604 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagatatcaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 14742509  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagc 358  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||||    
T  14742508 ccagttcagccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagc 14742411  T
Q  359 ttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||| || | |||||||||||||| |||||||||||    
T  14742410 tttacatatgaacaaaccctagattctaccctttg 14742376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 28184320 - 28184650
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaa--tggcttccaagctaacaacaacaaaaca 158  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||  ||||||| |||||||||||||||    
T  28184320 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaaca 28184418  T
Q  159 gcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgtt 255  Q
    |||  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  ||| |||||  ||||||||  |  | |||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  28184419 gccctagactagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagataag-cggtaaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgtt 28184514  T
Q  256 gacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattca 355  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||||| | ||||||  ||||    
T  28184515 gacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaacactctagc-cttca 28184612  T
Q  356 agcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  28184613 agctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 28184650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 22010960 - 22010636
Alignment:
Q  64 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 163  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||      
T  22010960 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 22010863  T
Q  164 agcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 261  Q
    || | | ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||  | || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  22010862 agacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 22010767  T
Q  262 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  22010766 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 22010669  T
Q  361 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  22010668 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 22010636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 5674865 - 5674770
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  5674865 agattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 5674770  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5757575 - 5757450
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  5757575 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 5757477  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  5757476 atagct-tgcaagcttatacaagaacaa 5757450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5572339 - 5572212
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  5572339 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 5572240  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  5572239 attagct-tataagcttacacaagaacaa 5572212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 10077263 - 10077164
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  10077263 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaaagttacaagaa 10077164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31086571 - 31086472
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||||||||    
T  31086571 caagattgttgacccagttcagtccaatatgatctaatctaggggagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaggagttacaagaa 31086472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 31979512 - 31979611
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31979512 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttgcaaaagagttacaagaa 31979611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 4629954 - 4630052
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| || |||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  4629954 aagattgttgactcagttcagtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaatagttacaagaa 4630052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 21356036 - 21356133
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  21356036 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-taagagttacaagaa 21356133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 22963699 - 22963797
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  22963699 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 22963797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 23824694 - 23824596
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  23824694 caagattgttgacccagttcggtgcaatatgaccaaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 23824596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 259 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 21801429 - 21801343
Alignment:
Q  259 ccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||| ||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | | || |||||||||||||||||||||||    
T  21801429 ccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagcgagcagctctccaatccactaagataaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21801343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 268 - 343
Target Start/End: Original strand, 18232867 - 18232943
Alignment:
Q  268 ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| | ||||||| || |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  18232867 ccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaattcactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 18232943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 278 - 329
Target Start/End: Original strand, 22709050 - 22709102
Alignment:
Q  278 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  22709050 ctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 22709102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 31936586 - 31936651
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  31936586 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctagtctgggagagagagcagctctccaatcca 31936651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 12195515 - 12195575
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12195515 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 12195575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5017567 - 5017482
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagccaa-tgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| | || |||||||| |||||||||||| | |||||||| | |||| |||| |||||||||    
T  5017567 caagattgttgacccagttcggtcaaatatgacctaatctaggggagagagcaaccctccaatctactatgatgaaagtgttacaa 5017482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 4816231 - 4816291
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4816231 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 4816291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 5273216 - 5273276
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5273216 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 5273276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 19704567 - 19704627
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19704567 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 19704627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 20915356 - 20915416
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20915356 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 20915416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 26932562 - 26932622
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26932562 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 26932622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 29754709 - 29754769
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  29754709 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 29754769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 33309170 - 33309110
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  33309170 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 33309110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 277; Significance: 1e-155; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 2785167 - 2785521
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||     
T  2785167 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggcc 2785266  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaaca 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||     
T  2785267 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac- 2785364  T
Q  236 aaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 335  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2785365 aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagt 2785464  T
Q  336 tacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| | || |||||||||||||| ||||||||||    
T  2785465 tacaagaatctagcttttcaagctttactcatgaacaaaccctagacctaccctttg 2785521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 33791107 - 33791462
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  33791107 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 33791206  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||    
T  33791207 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaagat-aaacgataaaaggaaaagaac 33791305  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33791306 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggaaagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 33791404  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  33791405 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 33791462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 34 - 390
Target Start/End: Original strand, 33767969 - 33768324
Alignment:
Q  34 cttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  33767969 cttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacatcaatgagaataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatga 33768068  T
Q  134 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||| || ||| ||||||||    
T  33768069 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacatatagagctaacaagcatacaggat-aaacgataaaaggaaaagaa 33768167  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33768168 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggggagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 33768266  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctacccttt 390  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  33768267 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctacccttt 33768324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31397287 - 31396930
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31397287 ttgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 31397188  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| ||     
T  31397187 ctccaagctaacaacaacaaaacatcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacaaa 31397090  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31397089 caaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 31396990  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  31396989 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaaccctagatctaccctttg 31396930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31402144 - 31401787
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  31402144 ttgttgtgaattcggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 31402045  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  31402044 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtaaagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaa 31401947  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31401946 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 31401848  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaag--aacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| ||||||  || |||| ||||||||||||||||    
T  31401847 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaaactctagatctaccctttg 31401787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37561740 - 37561384
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  37561740 tgttgtgaatccggttcaactaatcaaaccttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatggc 37561641  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | |||||    
T  37561640 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaaga 37561543  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37561542 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag 37561443  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
     |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37561442 -gttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 37561384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 37556919 - 37556562
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaac-cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||  |||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  37556919 ttgttgtgaatccggttcaactaatcaaatcttcacaccaatgataataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatctatgagagcaaatgg 37556820  T
Q  134 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||| | ||||    
T  37556819 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctatgacttgtgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaatggaaag 37556722  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37556721 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaa 37556622  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | |||||||| ||||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  37556621 g-gttacaagtatctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 37556562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 28807868 - 28807514
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28807868 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 28807770  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaa--ccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaa 229  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||  |||| |  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||    
T  28807769 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaaaccactcaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaa 28807674  T
Q  230 agaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaa 329  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28807673 agaacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaa 28807575  T
Q  330 aagagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28807574 aag-gttacaagaatctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 28807514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 1457423 - 1457101
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  1457423 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 1457326  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  |||||||| |  | |||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  1457325 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataaga--aagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 1457231  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  1457230 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 1457133  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  1457132 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 1457101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 15044507 - 15044831
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||   |||||| |||| ||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  15044507 aaccttcacaccaatga-aata---caatgacgtgtagagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaaaccaacaacaacaaaacagc 15044602  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 259  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |  | | || || |||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15044603 cctagactagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaacaccaag-aagattgttgacc 15044699  T
Q  260 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 359  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  15044700 cagttcagccaatatggcctaatatgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttcaagct 15044797  T
Q  360 tt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  15044798 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 15044831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 86 - 391
Target Start/End: Original strand, 43592120 - 43592425
Alignment:
Q  86 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  || ||| ||||||||| |||||    
T  43592120 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctagactagtgtatagcaaaacca 43592219  T
Q  186 cacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaat 282  Q
    |||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  43592220 cacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaat 43592315  T
Q  283 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||| |||| ||||||||||||||    
T  43592316 ctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctaga 43592413  T
Q  381 -tctaccctttg 391  Q
     |||||||||||    
T  43592414 ttctaccctttg 43592425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 43598547 - 43598870
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43598547 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43598644  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43598645 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43598740  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43598741 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43598838  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43598839 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43598870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 43604039 - 43604362
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43604039 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43604136  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43604137 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43604232  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43604233 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43604330  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43604331 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43604362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 43609531 - 43609854
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  43609531 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 43609628  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  ||||    
T  43609629 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtccag 43609724  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  43609725 ttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 43609822  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  43609823 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 43609854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 27444793 - 27445116
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27444793 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27444890  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27444891 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27444986  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    ||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27444987 ttcaggcaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 27445084  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27445085 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27445116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 27449637 - 27449960
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| |||||||||| | |||||  ||    
T  27449637 tcacaccaatga-aataaa-caatgatatgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagtacaaatggtctccaagcaaacaacaacatagcagccctag 27449734  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  27449735 actagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 27449830  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  27449831 ttcagccaatatagcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 27449928  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  27449929 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 27449960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 86 - 391
Target Start/End: Original strand, 30631249 - 30631553
Alignment:
Q  86 caatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaacca 185  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| || ||    
T  30631249 caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagaacaaatggttttcaagc-aacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaatca 30631347  T
Q  186 cacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatct 284  Q
    ||  || || |||||| ||||| |  | | ||  | |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  30631348 catatatagataacaaagcataaacaagataagtaagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgactcagttcagccaatgtggcctaatct 30631444  T
Q  285 gggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga- 380  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||| ||||||||| ||||     
T  30631445 gggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccatagat 30631542  T
Q  381 tctaccctttg 391  Q
    |||||||||||    
T  30631543 tctaccctttg 30631553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 228 - 391
Target Start/End: Original strand, 31180197 - 31180360
Alignment:
Q  228 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttac 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  31180197 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac 31180295  T
Q  328 aaaagagttacaagaa--tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| ||||||||||  ||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  31180296 -aaagggttacaagaaactctagc-cttcaagctttacacaag-acaaaccctagattctaccctttg 31180360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 38192174 - 38192270
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38192174 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 38192270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 38219399 - 38219495
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  38219399 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 38219495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Original strand, 10281751 - 10281877
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  10281751 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctgatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 10281850  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10281851 ttagct-tacaagcttacacaagaacaa 10281877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Original strand, 24135831 - 24135994
Alignment:
Q  229 aagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtta 326  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| || || | |||| ||||||    
T  24135831 aagaacaaacacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctatccaatgcactaagatgaaagtgtta 24135929  T
Q  327 caaaagagttacaag-aatctagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    | |||| |||||||| ||  ||||| | ||||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||    
T  24135930 c-aaagggttacaagaaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaagtcctagattctaccctttg 24135994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 35387663 - 35387759
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  35387663 aagattgttgacccaattcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatctactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 35387759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 9353429 - 9353304
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  9353429 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 9353331  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      |||| | ||||||| |||||||||||    
T  9353330 aaagct-tgcaagcttacacaagaacaa 9353304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 11917068 - 11916943
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||      
T  11917068 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaaa 11916969  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  11916968 tag-tttgcaagcttacacaagaacaa 11916943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36932447 - 36932350
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36932447 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36932350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 15464532 - 15464629
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15464532 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 15464629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 372
Target Start/End: Original strand, 14520207 - 14520355
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||| ||||    
T  14520207 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggggagagcagctcttcaatccactatgatgaa 14520304  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  14520305 agtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 14520355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 3880298 - 3880425
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||  |||||| | ||||| || ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  3880298 caagattgttgattcagttctgtccaatatgacctaatctgaggcagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 3880397  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  3880398 attag-tttacaagcttacacaagaacaa 3880425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 17004058 - 17003962
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 340  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||| || || ||||||||||||||    
T  17004058 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctcttcaatccactatgatgaaagtatttcaaaagagttacaa 17003962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 19588746 - 19588844
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  19588746 aagattgttgacccagttcggtccaatatgaactaatcttagggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 19588844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 223 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 12084295 - 12084175
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  || |||||||||||||||| | ||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  12084295 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aatattgttgacccagttcggtccactatgacctaatatggggcagagagcagctctccaatccactatgatgaa 12084198  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
     ||||||| |||||||||||||||    
T  12084197 agtgttac-aaagagttacaagaa 12084175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 28832258 - 28832356
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  28832258 caagattgttgacccggttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 28832356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 4410301 - 4410241
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  4410301 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 4410241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42127508 - 42127410
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  42127508 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccccccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 42127410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 15552524 - 15552464
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15552524 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 15552464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 31179371 - 31179431
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31179371 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31179431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31543013 - 31542953
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31543013 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31542953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31545359 - 31545299
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31545359 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31545299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 251 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 27910729 - 27910675
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctcc 304  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  27910729 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctaatctgggggagagagcagctctcc 27910675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 31300694 - 31300629
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| |||| ||||||||| | ||||||||||||    
T  31300694 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgagggagagagaaactctccaatcca 31300629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 3373137 - 3373197
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| | ||||||||||    
T  3373137 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcaaccctccaatcca 3373197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 10749979 - 10749919
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  10749979 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 10749919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 15354575 - 15354635
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  15354575 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 15354635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0197
Description:

Target: scaffold0197; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 19459 - 19104
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19459 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 19360  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||| |||    
T  19359 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaagaaaacgaa 19262  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||    
T  19261 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccattgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatacaatatgtgagtgtgttacaaaaga 19163  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||    
T  19162 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagatctaccctttg 19104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0197; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 14604 - 14248
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14604 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 14505  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  14504 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 14408  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14407 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 14308  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  14307 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 14248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 263; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 149250 - 148895
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  149250 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatctatgagtgcaaatggc 149151  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| |||    
T  149150 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaa 149053  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  149052 c-aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 148954  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  148953 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttg 148895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0259 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0259
Description:

Target: scaffold0259; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 2544 - 2190
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||     
T  2544 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgataaagataatccatgagtgcaaatggcc 2445  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaac 234  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||| ||||    
T  2444 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagat-aaacgat-aaaggaaaacgaac 2347  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2346 -aaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagtagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 2248  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  ||||| |||||||||||||||    
T  2247 ttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccatagatctaccctttg 2190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 255; Significance: 1e-142; HSPs: 43)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 19349069 - 19349425
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatgg 133  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||    
T  19349069 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatgg 19349167  T
Q  134 cttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaa 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||||||    
T  19349168 cctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgataaaaggaaaagaa 19349266  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19349267 caaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 19349366  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19349367 gttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19349425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 19344212 - 19344567
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  19344212 tgttgtgaatccggttcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 19344310  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| |||||||||    
T  19344311 ctccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcaaaaccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgataaaaggaaaagaac 19344409  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19344410 aaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 19344509  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19344510 ttacaagaatctagcttttcaagctttacacatgaacaaaccctagacctaccctttg 19344567  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 36 - 381
Target Start/End: Original strand, 32246577 - 32246922
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  32246577 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 32246675  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaa--aaga 232  Q
    |||||||||||||||||||||||| |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  ||| ||||| |  | | || || ||||| ||  ||||    
T  32246676 tccaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagataagcaagaaaaaaaggaaga 32246774  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| | ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  32246775 acaaaacaccgaacaagattgttgaccttgttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 32246874  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagat 381  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  32246875 -gttacaagactctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagat 32246922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 39812255 - 39811928
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  39812255 aaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 39812157  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 256  Q
    | ||||| || ||||||||| ||||||||  |||| |  |||    || |||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||    
T  39812156 cctaagc-tagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttg 39812063  T
Q  257 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 356  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  39812062 aaccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaa 39811965  T
Q  357 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  39811964 gctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 39811928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 64 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 44312887 - 44312563
Alignment:
Q  64 cttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagccta 163  Q
    |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| | |||      
T  44312887 cttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagccgccct 44312790  T
Q  164 agcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 261  Q
    || | | ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||  | || ||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||||    
T  44312789 agacaagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag-cgataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgaccca 44312694  T
Q  262 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  44312693 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 44312596  T
Q  361 t-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    | |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  44312595 tacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 44312563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 11099040 - 11098877
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  11099040 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 11098942  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||| |  ||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11098941 -aaagggttacaagaaacaatagct-tgcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 11098877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 92 - 381
Target Start/End: Original strand, 14291337 - 14291624
Alignment:
Q  92 tgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacactt 190  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||||| |   |||||| |||||||| ||||||||||||| |||||  || |||||||| |||| ||||||||      
T  14291337 tgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgggca-aaatggtttccaagcaaacaacaacaaaaacagccctagactaatgtagagcaaaaccacacaa 14291435  T
Q  191 agagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggg 288  Q
    |||| |||||| ||| | ||||||||   || |||| |||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14291436 agagataacaaagcaaaacaagataag--caagaaaggaa--gaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggg 14291530  T
Q  289 gagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14291531 gagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaagccctagat 14291624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 9296514 - 9296362
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  9296514 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 9296416  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  |||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  9296415 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttatacaagaacaagccctagat 9296362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 3491751 - 3491847
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  3491751 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 3491847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 8040059 - 8040188
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaa--agagttacaag 341  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||  |||||||||||    
T  8040059 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagagttacaag 8040158  T
Q  342 aatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  8040159 aaattagct-tacaagcttacacaagaacaa 8040188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 25398496 - 25398592
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25398496 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25398592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Original strand, 13569331 - 13569426
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13569331 attgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 13569426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 21629943 - 21630041
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  21629943 caagattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 21630041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 25403634 - 25403730
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25403634 aagattgttgactcagttcagccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25403730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10445542 - 10445415
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaata-tgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||| ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10445542 caagattgttgatccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactattatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10445443  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  10445442 attagct-tacaatcttacacaagaacaa 10445415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 17865202 - 17865329
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  17865202 caagattgttgacccagttcagtcgaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 17865301  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  17865302 attagct-tataagcttacacaagaacaa 17865329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 34682432 - 34682305
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34682432 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34682333  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | || |||| |||||||||||    
T  34682332 attagct-tacaggcttacacaagaacaa 34682305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 28259274 - 28259149
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  28259274 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 28259176  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  28259175 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 28259149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 10707348 - 10707223
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||      
T  10707348 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaat 10707249  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  10707248 tagct-tacaagcttacacaagaacaa 10707223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Original strand, 34388859 - 34388956
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  34388859 agattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 34388956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 8390244 - 8390121
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 347  Q
    |||||||||||||||| | ||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||||||||||||||  ||    
T  8390244 attgttgacccagttcggtccaaaatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttaaaaaagagttacaagaaatta 8390145  T
Q  348 gctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||    
T  8390144 gct-tacaagcttgcacaagaacaa 8390121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 14699105 - 14698979
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | |||||||||||||||||||||    
T  14699105 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaag-gttacaaaagagttacaagaa 14699007  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  14699006 attagct-tataagcttacacaagaacaa 14698979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 20522219 - 20522318
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20522219 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagggttacaagaa 20522318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Original strand, 40738844 - 40738926
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  40738844 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggggg-gagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 40738926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 39482930 - 39483057
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||  |||||||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  39482930 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatatgggggagagagcaggcctccaatccactatgatgaaaatgttacaaaagagttacaagaa 39483029  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  39483030 attagct-tataagcttacacaagaacaa 39483057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 247 - 340
Target Start/End: Original strand, 31056044 - 31056139
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 340  Q
    ||||||||||||| ||||| |  |||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||||||||||||||||    
T  31056044 aagattgttgacctagttcggttcaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaa 31056139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33528719 - 33528620
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33528719 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33528620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 33118135 - 33118262
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||| | |||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||| |||||||||||    
T  33118135 caagattgttggctcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagagttacaaaatagttacaagaa 33118234  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  33118235 attagct-tataagcttacacaagaacaa 33118262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 16940307 - 16940208
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  16940307 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 16940208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 17010972 - 17010873
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || | |||||||||||| ||| |||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| |||||||||    
T  17010972 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacataatctgggggaaagatcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattacaagaa 17010873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 23078567 - 23078442
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    |||| |||||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||| || |||||||||||| |||| |||| ||||||  |||||||||||||||     
T  23078567 aagaatgttgacccagttcgatccaatatgacctaatatgggggagagaacaactctccaatccactatgatgaaagtgtta-gaaagagttacaagaaa 23078469  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  23078468 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 23078442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 277 - 343
Target Start/End: Original strand, 25407653 - 25407719
Alignment:
Q  277 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  25407653 cctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 25407719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 223 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 36757882 - 36757728
Alignment:
Q  223 aaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaa 319  Q
    ||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||| | ||||| || ||||||||||||| || | ||||||||||||||| |||| ||||    
T  36757882 aaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccaattcggtccaatatgacctaatctgggggggataacagctctccaatccagtatgatgaa 36757785  T
Q  320 tgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaaacccta 378  Q
     ||||| | ||||||||| |||||   |||| ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  36757784 agtgtttc-aaagagttataagaaaaaagct-ttcaagcttacacaagaacaaaaccta 36757728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 42039766 - 42039669
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||| | ||||| | ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||| |||| |||||||  ||||||||||||||    
T  42039766 aagattgttgatctagttcggtccaatatgacctaatctgtgggagagagcagctctctaatccactatgatgaaagtgttac-gaagagttacaagaa 42039669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 35215586 - 35215646
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35215586 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35215646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 35217963 - 35218023
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35217963 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 35218023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2838124 - 2838029
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaat-atgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||  ||||||||||| | |  |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  2838124 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacatctccaatccactaaaatgaaagtgatacaaatgagttacaagaa 2838029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 2869787 - 2869692
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || |||| ||| |||||||||| |||||||||||||| || | |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  2869787 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctaggggagagagtagctctccaatccactaagatgaaagtgatacaaaggagttacaagaa 2869692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 1345635 - 1345574
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1345635 attgttgacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcacctctccgatcca 1345574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 251 - 307
Target Start/End: Original strand, 45332181 - 45332238
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaat 307  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||    
T  45332181 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaat 45332238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 23452237 - 23452297
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23452237 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 23452297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 36558864 - 36558924
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36558864 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36558924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 36561141 - 36561201
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  36561141 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 36561201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 47)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24261618 - 24261262
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  24261618 ttgttgtgaatccggttcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 24261519  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  24261518 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 24261422  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24261421 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 24261322  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24261321 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24261262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24266496 - 24266141
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||     
T  24266496 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggcc 24266397  T
Q  136 tccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-gaa 233  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||| ||||| |||    
T  24266396 tccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaggaaaacgaa 24266300  T
Q  234 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 333  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24266299 caaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaaga 24266200  T
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  24266199 gttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 24266141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 16879863 - 16880218
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16879863 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 16879962  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  16879963 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 16880059  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16880060 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttac-aaag 16880158  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16880159 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16880218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 16884719 - 16885074
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  16884719 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 16884818  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  16884819 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 16884915  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  16884916 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgttttac-aaag 16885014  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||    
T  16885015 agttacaagaatctagcttatcaagctttacacaagacaaaaccctagacctaccctttg 16885074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 19992104 - 19992458
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatg-aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  19992104 tgttgtgaatccggttcaactaatggaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaggtgatagtgataatcaatgagaacaaatggc 19992202  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||    
T  19992203 ttccaagcttacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 19992298  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19992299 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaa 19992398  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  19992399 g-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 19992458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 21812532 - 21812178
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaa-ccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||||||||||    
T  21812532 tgttgtgaatccgattcaactaatgaaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagagcaaatggc 21812434  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  |||| |||||||||||  |||||||||  |   ||||||||||    
T  21812433 ttccaagctaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagttaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaagaaaag 21812338  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||    
T  21812337 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctttccaatccaatatgtgaa-gtcttacaaaa 21812239  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattc-aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | ||| ||||| |||||||  || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21812238 g-gttccaagactctagcttgtcaaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 21812178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 24024594 - 24024266
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  24024594 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 24024497  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa-caccaagcaagattgttgacc 259  Q
    ||| | ||| | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  | | || || |||||| || |||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  24024496 ctatgactagtatatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaaggaa-gaacaaaaacaccgaacaagattgttgacc 24024398  T
Q  260 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  24024397 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaa-tgttacaagactctagc-cttcaagct 24024300  T
Q  360 tt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    || |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  24024299 ttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 24024266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 31109849 - 31109523
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  31109849 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtgcagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagccaacaacaacaaaacagc 31109752  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttg 256  Q
    | |||  ||| ||||||||| ||||||||  |||| |  ||| |||||  |||||||||  || |||||| || |||||||||||| | |||||||||||    
T  31109751 cctaa--ctagtgtatagcaaaaccacaca-agagattccaaagcataaacaagataaa--caagaaaaggaa-gaacaaaacaccgaacaagattgttg 31109658  T
Q  257 acccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaa 356  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  |||||    
T  31109657 acccagttcagccaatatggcctaatctaggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaa 31109560  T
Q  357 gcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    ||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  31109559 gctttgcacatgaacaaaccctagattctaccctttg 31109523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 12406150 - 12406477
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12406150 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12406247  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   |||||||| |||||||||||| || ||||||||||||    
T  12406248 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaagaaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12406343  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||    
T  12406344 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaatagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaag 12406441  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12406442 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12406477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 12396730 - 12397057
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||    
T  12396730 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagc 12396827  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||      | ||||  |||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12396828 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataagcg---gtaaagggaagaacaaaacaccgag-aagattgttgac 12396923  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 357  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  || ||     
T  12396924 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagaacagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-ctttaat 12397021  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12397022 ctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 12397057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 90 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 20357797 - 20357548
Alignment:
Q  90 gatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaa-cagcctaagcctaatgtatagcacaaccacac 188  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||  |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||  || ||| |||| |||| ||||||||    
T  20357797 gatgtgtggagcaagagatagtggtaatctatgagc-caaatggtctccaagctaacaacaacaaaaacagccctagactagtgtagagcaaaaccacac 20357699  T
Q  189 ttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctggg 287  Q
      |||| |||||| ||| |||||||||   || |||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  20357698 aaagagataacaaagcaaacaagataag--caagaaaaggaa-gaacaaaataccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatttggg 20357603  T
Q  288 ggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  20357602 ggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttac-aaagggttacaagaa 20357548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 61 - 332
Target Start/End: Original strand, 4866548 - 4866816
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||  ||||||| ||||||||||||||||     
T  4866548 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgaggacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagt 4866645  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaa-ccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttga 257  Q
    |  || ||| ||||||||| || ||||||  | || || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || |||||||||||    
T  4866646 cctagactagtgtatagcaaaaaccacacaaaaagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttga 4866741  T
Q  258 cccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  4866742 cccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 4866816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 229 - 381
Target Start/End: Original strand, 2057949 - 2058101
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  2057949 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 2058047  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctagat 381  Q
     |||| |||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  2058048 -aaagggttacaagaaacaatagc-attcaagcttacacaagaacaagccctagat 2058101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 228 - 343
Target Start/End: Original strand, 18408746 - 18408860
Alignment:
Q  228 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 325  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  18408746 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccagtatgatgaaagtgtt 18408843  T
Q  326 acaaaagagttacaagaa 343  Q
    || |||| ||||||||||    
T  18408844 ac-aaagggttacaagaa 18408860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 1533540 - 1533444
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  1533540 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcatctctccaatccaatatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 1533444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 29159802 - 29159929
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  29159802 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 29159901  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  29159902 attagct-tacaagcttacacaagaacaa 29159929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 21639809 - 21639905
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  21639809 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactataatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 21639905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Original strand, 21983285 - 21983411
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac-aaaagagttacaagaat 344  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| ||||||||||||||||     
T  21983285 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaaa 21983384  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21983385 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 21983411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 228 - 343
Target Start/End: Original strand, 18413623 - 18413736
Alignment:
Q  228 aaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgtt 325  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  18413623 aaagaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatct-ggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtt 18413719  T
Q  326 acaaaagagttacaagaa 343  Q
    || |||| ||||||||||    
T  18413720 ac-aaagggttacaagaa 18413736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Original strand, 21646007 - 21646103
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  21646007 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctagggaagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgtta-aaaagggttacaagaa 21646103  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 46516408 - 46516281
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  46516408 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctaggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 46516309  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  46516308 attagct-taaaagcttacacaagaacaa 46516281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 49091660 - 49091759
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || |||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  49091660 caagattgttgacccagtttagtccaatatgacctaatctggggaagagagcaactctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 49091759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 2647794 - 2647667
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagcc-aatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| ||| ||| || |||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  2647794 caagattgttgacccaattcggcccaatatgacctattctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 2647695  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  2647694 attagct-tataagcttacacaagaacaa 2647667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 33332548 - 33332449
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttc-agccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | | ||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  33332548 caagattgttgacccagttcgatctaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 33332449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 55947 - 56073
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  55947 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 56045  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  56046 attagct-tataagcttacacaagaacaa 56073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 44848781 - 44848684
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  44848781 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaacctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 44848684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 2580389 - 2580515
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||| ||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  2580389 caagattgttgacccaattcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 2580487  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  2580488 aatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 2580515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 9190106 - 9190008
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| || ||||||||||||    
T  9190106 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtctgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttac-aatgagttacaagaa 9190008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Original strand, 20284088 - 20284153
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20284088 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatcca 20284153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 4796765 - 4796638
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||||  || |||||||||||||||| |||||| ||| |||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||    
T  4796765 caagattgttaacccagttcggtccaaaatgacctaatctgggggagaaagcagccctcaaatccactatgatgaaattgttacaaaagagttacaagaa 4796666  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  4796665 attagct-tataagcttacacaagaacaa 4796638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 35960815 - 35960914
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||| ||||| |  |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||| |||| |||||||||| |||||| |||||    
T  35960815 caagattgttgaccgagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaaaccactatgatgaaagtgttacaaatgagttagaagaa 35960914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Original strand, 2479337 - 2479461
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||| |||| ||||||||||||| |||||| |||| |||| ||||||| ||||||||| |||||     
T  2479337 aagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctagggg-gagagcagctctcaaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttataagaaa 2479434  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  2479435 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 2479461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 9185263 - 9185198
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| |  |||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  9185263 caagattgttgacccagttcggtccaatataacctagtctgggggagagagaagctctccaatcca 9185198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 250 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 28617319 - 28617258
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||||| ||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28617319 attgtttacccagttcggtccaatatgacctactctgggggagagagcagctctccaatcca 28617258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 31155911 - 31155971
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31155911 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 31155971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Original strand, 21988909 - 21989005
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac-aaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| |  ||||||| |||||||||||| | || |||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21988909 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggag--gagagcaactctccaatccactttgatgaaagtgttacaaaaagagttacaagaa 21989005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Original strand, 47263678 - 47263745
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 315  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||    
T  47263678 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatatgggggaga--gcagctctccaatccactatg 47263745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 1049296 - 1049356
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1049296 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 1049356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 2935557 - 2935497
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  2935557 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 2935497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 3036013 - 3035953
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3036013 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 3035953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 7351652 - 7351712
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  7351652 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtatgggggagagagcagccctccaatcca 7351712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 8153514 - 8153466
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagaga 294  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||    
T  8153514 aagattgttgacccagttcagtccaacttgacctaatctgggggagaga 8153466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 9027194 - 9027254
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  9027194 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctcctatcca 9027254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22108355 - 22108295
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22108355 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22108295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22137366 - 22137306
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22137366 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22137306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40550115 - 40550055
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40550115 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40550055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 40552393 - 40552333
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  40552393 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 40552333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 35 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 182259 - 181973
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  182259 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaaagatgtgtggagcaagagatagaggtaatctatgagtgcaaatggc 182160  T
Q  135 ttccaagctaa-caacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaa-ga 232  Q
     |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||| ||    
T  182159 ctccaagctaatcaacaacaaaacagcctaagcctaatgta-agcaaatccacactaagagctaacaagcatacaagataaa-cgat-aaaagaaaacga 182063  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  182062 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgt 181973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 39)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 18855519 - 18855871
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || |  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  18855519 tgttgtgaatccggttctacaagcgaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggct 18855617  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| |||||    
T  18855618 tccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaaga 18855713  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18855714 acaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaag 18855812  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
     ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  18855813 -gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 18855871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Original strand, 3813816 - 3814168
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||      
T  3813816 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatcaatgagagcaaatggtc 3813914  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaa-ccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaac 234  Q
    ||||||| |||||||||||||||| |  || ||| ||||| ||| || ||||||  |||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  ||||    
T  3813915 tccaagcaaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtatcgcaaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaac 3814012  T
Q  235 aaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagag 334  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |    
T  3814013 aaaacaccatgcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaaagtgttacaaaag-g 3814111  T
Q  335 ttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3814112 ttacaagactctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 3814168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Original strand, 5732481 - 5732809
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| ||||   ||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  5732481 aaccttcacaccaatgaaaata---caatgatgtgtggagcaagtgatggtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagctaacaacaacaaaacagc 5732577  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaa----caccaagcaagattgt 254  Q
    | ||||| || ||||||| | ||||||||  ||||||||||| ||| ||||||||||     | |||| |||||||||||    |||  | |||||||||    
T  5732578 cctaagc-tagtgtatagtaaaaccacacaaagagctaacaaagcaaacaagataaacg---gtaaaggaaagaacaaaaaaaacactgaacaagattgt 5732673  T
Q  255 tgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattc 354  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||| |||    
T  5732674 tgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagct-ttc 5732771  T
Q  355 aagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5732772 aagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 5732809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9224699 - 9224346
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||     
T  9224699 ttgttgtgaatccggttcaaaaaaaaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggt 9224602  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || ||    
T  9224601 ctccaagcaaacaacaacaaaacagccctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-ga 9224505  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  9224504 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 9224406  T
Q  333 agttacaagaa-tctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| ||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9224405 -gttagaagaactctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9224346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45357588 - 45357236
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  45357588 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45357491  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||| ||||||||  |||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| |||||    
T  45357490 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaaga 45357394  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45357393 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcataatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 45357295  T
Q  333 agttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     ||||||||| ||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45357294 -gttacaagactctagct-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45357236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9229460 - 9229133
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  9229460 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 9229363  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  9229362 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 9229267  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  9229266 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttagaagaactctagc-cttcaag 9229169  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  9229168 ctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 9229133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 66 - 391
Target Start/End: Original strand, 51520280 - 51520603
Alignment:
Q  66 tcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaag 165  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||| |||||  ||    
T  51520280 tcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaagcagccctag 51520377  T
Q  166 cctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccag 262  Q
     ||| ||||||||| ||||| ||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  51520378 actagtgtatagcaaaaccatacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacccag 51520473  T
Q  263 ttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagcttt 361  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  51520474 ttctgccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagcttt 51520571  T
Q  362 -cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  51520572 acacatgaacaaaccctagattctaccctttg 51520603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 36 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 45348109 - 45347756
Alignment:
Q  36 tgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggct 135  Q
    |||||||||||||| || || ||  ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||||      
T  45348109 tgttgtgaatccggttctacaaagaaaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagtgatagtggtaatctatgagaacaaatggtc 45348012  T
Q  136 tccaagctaacaacaacaaaacagcctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaag---catacaagataaaaccatgaaaagaaaaga 232  Q
    | |||||||||||||||||||||| |  || ||| |||| |||| ||||||||  |||| |  |||    || |||||||||   |   ||||| |||||    
T  45348011 ttcaagctaacaacaacaaaacagtcctagactagtgtaaagcaaaaccacaca-agagattccaaagcacaaacaagataag--cggtaaaaggaaaga 45347915  T
Q  233 acaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaag 332  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  45347914 acaaaacaccgag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcttaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag 45347816  T
Q  333 agttacaaga-atctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||||||||  ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  45347815 -gttacaagacctctagc-cttcaagctttacacatgaacaaaccctagattctaccctttg 45347756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 65 - 378
Target Start/End: Complemental strand, 56146974 - 56146664
Alignment:
Q  65 ttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagcctaa 164  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||| |||  ||||||| |||||||||||| |||||  |    
T  56146974 ttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaattggtctccaagcaaacaacaacaaagcagcccta 56146877  T
Q  165 gcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata--caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgaccca 261  Q
    | ||| ||||||||| ||||||||  |||| |||||| |||||  ||||||||    || ||| |||  |||||||||||| || ||||||||||  |||    
T  56146876 gactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataacaaagcataaacaagataagtg-ataaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttggtcca 56146781  T
Q  262 gttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaagctt 360  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||    
T  56146780 gttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagaactctagc-cttcaagctt 56146683  T
Q  361 t-cacaagaacaaacccta 378  Q
    | |||| ||||||||||||    
T  56146682 tacacatgaacaaacccta 56146664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 229 - 391
Target Start/End: Original strand, 24741924 - 24742087
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  24741924 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 24742022  T
Q  328 aaaagagttacaagaatc--tagctattcaagctttcacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
     |||| |||||||||| |  ||||  ||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24742023 -aaagggttacaagaaacaatagc-cttcaagcttacacaagaacaaaccctagattctaccctttg 24742087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 229 - 343
Target Start/End: Original strand, 29760625 - 29760738
Alignment:
Q  229 aagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttac 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  29760625 aagaacaaaacaccaag-aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgatgaaagtgttac 29760723  T
Q  328 aaaagagttacaagaa 343  Q
     |||| ||||||||||    
T  29760724 -aaagggttacaagaa 29760738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 10047378 - 10047505
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10047378 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10047477  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  10047478 attagct-tataagcttacacaagaacaa 10047505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Original strand, 39245993 - 39246092
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  39245993 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 39246092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16623391 - 16623264
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| |  |||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16623391 caagattgttgacccagttcggttcaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16623292  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      |||||| | |||||| || ||||||||    
T  16623291 attagctaat-aagcttacagaagaacaa 16623264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 38152537 - 38152410
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatat-gtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  38152537 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacataatctgggggagagagcagctctccaatccactatggtgaaagtgttacaaaagagttataagaa 38152438  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  38152437 attagct-tataagcttacacaagaacaa 38152410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 3796616 - 3796490
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||| |||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  3796616 aagattgttgacccagttccgtccaatatgacctaatatgggggagagagcaactctctaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaa 3796517  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  3796516 ttagct-tacaagcttgcacaagaacaa 3796490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 28468625 - 28468542
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  28468625 aagattgttgacccagttcagccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 28468542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 5396768 - 5396643
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| | |||||||||||||||     
T  5396768 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctggaggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttgc-aaagagttacaagaaa 5396670  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5396669 atagct-tgcaagcttacacaagaacaa 5396643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36315327 - 36315229
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36315327 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36315229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 246 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 36329536 - 36329438
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  36329536 caagaatgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 36329438  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Original strand, 5147678 - 5147803
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||      
T  5147678 agattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagggagcagctctccagtccattatgatgaaagtgttacaaaatagttacaagaaaa 5147777  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  5147778 tagct-tgcaagcttacacaagaacaa 5147803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Original strand, 5143260 - 5143385
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||| ||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| |||| ||||||||||| | |||||||||      
T  5143260 agattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaacccactatgatgaaagtgttacaaaaaatttacaagaaaa 5143359  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||||| | ||||| | |||||||||||    
T  5143360 tagct-tgcaagcatacacaagaacaa 5143385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 246 - 337
Target Start/End: Original strand, 24333808 - 24333901
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagtta 337  Q
    |||||||||| || |||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||    
T  24333808 caagattgttaactcagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaacgtgttacaaaagagtta 24333901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 16630778 - 16630651
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||| ||||||||| ||||| | ||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||    
T  16630778 caaggttgttgacctagttcggtccaatatgacataatctggaggagagaacagctctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 16630679  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  16630678 attagct-tataagcttacacaagaacaa 16630651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 31985730 - 31985634
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  31985730 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggg-agagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 31985634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 5269289 - 5269204
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  5269289 caagattgttgacctagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 5269204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 248 - 372
Target Start/End: Original strand, 3777550 - 3777674
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatc 345  Q
    |||||||||||||||||| | ||||| |  |||||||| | |||||||| |||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||      
T  3777550 agattgttgacccagttcggtccaatataacctaatctagaggagagagtagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaaa 3777648  T
Q  346 tagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||||| | ||| ||| |||||||||||    
T  3777649 tagct-tgcaaacttacacaagaacaa 3777674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 252 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 6743507 - 6743417
Alignment:
Q  252 tgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaa 340  Q
    |||||||||||||| | ||||| || ||||||||  ||||||||||||| |||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |||||    
T  6743507 tgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctacgggagagagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagctacaa 6743417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 16931789 - 16931849
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16931789 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16931849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 16934143 - 16934203
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16934143 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 16934203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 22780373 - 22780433
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22780373 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22780433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 44599838 - 44599898
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44599838 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 44599898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 246 - 329
Target Start/End: Complemental strand, 25862120 - 25862035
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaa 329  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || |||||| ||||| ||||||| || |||||||||| |||| |||| |||||||||    
T  25862120 caagattgttgactcagttcggtccaatatgacctaatatggggaagagagcggccctccaatccactatgatgaaagtgttacaa 25862035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 284 - 343
Target Start/End: Original strand, 5112275 - 5112335
Alignment:
Q  284 tgggggagagagcagctctccaatccaat-atgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | || |||| |||||||||| | ||||||||||    
T  5112275 tgggggtgagagcagctctccaatccactaatatgaaagtgttacaaatgggttacaagaa 5112335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 6765177 - 6765117
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6765177 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 6765117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 7941656 - 7941596
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7941656 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 7941596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 18709164 - 18709224
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  18709164 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagtcctccaatcca 18709224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 22782738 - 22782798
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||| ||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22782738 ttgttgatccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 22782798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 54867183 - 54867309
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || |||| ||| |||||||||||||| || ||||| | |||| ||||  |||||||||| ||||| |||||    
T  54867183 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctagtct-ggggagagagcagcccttcaatcaactatgatgaaaatgttacaaaatagttataagaa 54867281  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  54867282 attagct-tataagcttacacaagaacaa 54867309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0464 (Bit Score: 183; Significance: 7e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0464
Description:

Target: scaffold0464; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 7e-99
Query Start/End: Original strand, 35 - 391
Target Start/End: Original strand, 154 - 507
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggc 134  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||    
T  154 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatgtgtggagcaagtgatggtgataatcaatgagaacaaatggc 252  T
Q  135 ttccaagctaacaacaacaaaacagcc-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata--caagataaaaccatgaaaagaaaag 231  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||  |   ||||| ||||    
T  253 ttccaagcaaacaacaacaaa-cagccctaagc-tagtgtatagcaaaaccacacaaagagctaacaagcataaacaagataaa--cggtaaaaggaaag 348  T
Q  232 aacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaa 331  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  349 aacaaaacaccgagcaagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaa-gtgttacaaaa 447  T
Q  332 gagttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    | ||||||||| |||||||  ||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  448 g-gttacaagactctagcttatcaagctttacacatgaacaaaccctagaactaccctttg 507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355 (Bit Score: 158; Significance: 6e-84; HSPs: 3)
Name: scaffold0355
Description:

Target: scaffold0355; HSP #1
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 9907 - 9583
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||    
T  9907 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagagcaaatggtctccaaccaaacaacaacaaaacagc 9809  T
Q  161 c-taagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcatacaagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacc 259  Q
    | ||||| || | ||||||| ||||||||  |||||||||||||||| |  | | || || |||| |||  |||||||||||| || |||||||||||||    
T  9808 cctaagc-tagtatatagcaaaaccacaca-agagctaacaagcataaacaagataagcaagaaaggaa--gaacaaaacaccgag-aagattgttgacc 9714  T
Q  260 cagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagct 359  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||  ||||||||    
T  9713 cagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttacaagactctagc-cttcaagct 9616  T
Q  360 tt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9615 ttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 9583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 148 - 13
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacag- 159  Q
    ||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||  ||||||  ||||||||||||||||     
T  148 aaccttcacaccaatta-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgata------atcaatgagagcaaatggtctccaagtaaacaacaacaaaacagc 56  T
Q  160 cctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaagcata 206  Q
    |||||| ||| ||||||||| ||||||||   |||||||||||||||    
T  55 cctaag-ctagtgtatagcaaaaccacac---gagctaacaagcata 13  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0355; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 334 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 3845 - 3788
Alignment:
Q  334 gttacaagaatctagctattcaagcttt-cacaagaacaaaccctagatctaccctttg 391  Q
    ||||||||| ||||||  |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3845 gttacaagactctagcc-ttcaagctttacacatgaacaaaccctagatctaccctttg 3788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0135 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 1)
Name: scaffold0135
Description:

Target: scaffold0135; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 61 - 391
Target Start/End: Complemental strand, 35328 - 35001
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagctaacaacaacaaaacagc 160  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||||    
T  35328 aaccttcacaccaatga-aataaa-caatgatgtgtggagcaagagatagtggtaatcaatgagaacaaatggtctccaagcaaacaacaacaaaacagc 35231  T
Q  161 ctaagcctaatgtatagcacaaccacacttagagctaacaa-gcata-caagataaaaccatgaaaagaaaagaacaaaacaccaagcaagattgttgac 258  Q
    |  || ||| ||||||||| ||||||||  |||| || ||| ||| | ||||||||   |   ||||| || |||||||||||| || ||||||||| ||    
T  35230 cctagactagtgtatagcaaaaccacacaaagagataccaaagcaaaacaagataag--cggtaaaaggaa-gaacaaaacaccgag-aagattgttaac 35135  T
Q  259 ccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgtgaatgtgttacaaaagagttacaagaa-tctagctattcaag 357  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||| ||||| ||||||  ||||||    
T  35134 ccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatgagaaagtgttacaaaag-gttagaagaactctagc-cttcaag 35037  T
Q  358 cttt-cacaagaacaaaccctaga-tctaccctttg 391  Q
    |||| |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  35036 ctttacacatgaacaaaccctagactctaccctttg 35001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 2)
Name: scaffold0188
Description:

Target: scaffold0188; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 18048 - 17952
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  18048 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0188; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 24141 - 24045
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  24141 aagattgttgacccagttcagccaatatggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagggttacaagaa 24045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 3)
Name: scaffold0140
Description:

Target: scaffold0140; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 8516 - 8419
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  8516 aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 8419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 22403 - 22343
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  22403 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 22343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0140; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 24678 - 24618
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| |||| |||||    
T  24678 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccgatcca 24618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0127 (Bit Score: 54; Significance: 7e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0127
Description:

Target: scaffold0127; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 61 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 34216 - 34136
Alignment:
Q  61 aaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgagagcaaatggcttccaagc 142  Q
    ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||    
T  34216 aaccttcacaccaatga-aataaaccaatgatgtgtggagcaagtgatagtgataatcaatgagaacaaatggtctccaagc 34136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 10728 - 10855
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||| |||||||||||| | ||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||||    
T  10728 caagattattgacccagttcggtccaatatgacctaatttgggggagagagcagctctccaatccactaagatgaaagtgttacaaaagagttacaagaa 10827  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||| | | ||||||| |||||||||||    
T  10828 attag-tttacaagcttacacaagaacaa 10855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 5682 - 5809
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| | ||||| || ||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||| |||| |||||||||||||| ||||||||    
T  5682 caagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctgggggagagagcagcccttcaatccactatgatgaaagtgttacaaaagagatacaagaa 5781  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  5782 attagct-tataagcttacacaagaacaa 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 246 - 372
Target Start/End: Original strand, 2491 - 2618
Alignment:
Q  246 caagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || |||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||| |||| ||||||||||||| ||| |||||    
T  2491 caagattgttgacccagttcgctccaatatgacctaatctgggggagacagcagccctccaatccactatgatgaaagtgttacaaaagaattataagaa 2590  T
Q  344 tctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
      ||||| |  |||||| |||||||||||    
T  2591 attagct-tataagcttacacaagaacaa 2618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 247 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 133377 - 133280
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    ||||||||||||||||||  |  |||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||| |||||||||||||||    
T  133377 aagattgttgacccagttaggttcaatatgacctaatatgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaaatgttac-aaagagttacaagaa 133280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0479 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0479
Description:

Target: scaffold0479; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 35 - 125
Target Start/End: Original strand, 13140 - 13229
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaatcaatgatgtgtggagcaagtgatagagataatcaatgaga 125  Q
    ||||||||||||||| || || || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13140 ttgttgtgaatccggttctacaaacgaaccttcacaccaatga-aataaaccaaagatatgtggagcaagtgatagtgataatcaatgaga 13229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0777 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0777
Description:

Target: scaffold0777; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 84
Target Start/End: Original strand, 6292 - 6341
Alignment:
Q  35 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 84  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6292 ttgttgtgaatccggctcaactaatgaaccttcacaccaatgagaataaa 6341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 248 - 343
Target Start/End: Original strand, 85684 - 85780
Alignment:
Q  248 agattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaa 343  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||| ||||||| |||||||||||||||    
T  85684 agattgttgacccagttcagtccaatatgacctaatctgggggagagagcggctctccaatccaccatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaa 85780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087 (Bit Score: 48; Significance: 3e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0087
Description:

Target: scaffold0087; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 247 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 44058 - 43933
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaat 344  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||| |||||||||||||||     
T  44058 aagattgttgacccagttcggtccaatatgatctattctgggggagagagcagctctccaatccactatgatgaaagtgttac-aaagagttacaagaaa 43960  T
Q  345 ctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
     ||||| | |||||||  ||||||||||    
T  43959 atagct-tgcaagcttatacaagaacaa 43933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0087; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 222 - 372
Target Start/End: Complemental strand, 36953 - 36804
Alignment:
Q  222 aaaagaaaagaacaaa-acaccaagcaagattgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tga 318  Q
    |||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||| ||| |||||||||||| |||| ||| |||| |||    
T  36953 aaaagaaaggaacaaacacaccaa--aagattgttgacccagttcggtccaatatgacctaatctagggaagagagcagctcgccaacccactatgatga 36856  T
Q  319 atgtgttacaaaagagttacaagaatctagctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    | ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  36855 aagtgttac-aaagagttacaagaaaatagct-tgcaagcttacacaagaacaa 36804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0098 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0098
Description:

Target: scaffold0098; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 247 - 315
Target Start/End: Original strand, 45253 - 45322
Alignment:
Q  247 aagattgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg 315  Q
    |||||||||||| |||||| |  |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  45253 aagattgttgactcagttcggttcaatatgacctaatctgggggagagagcagctctccaatccactatg 45322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0176 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000009; HSPs: 1)
Name: scaffold0176
Description:

Target: scaffold0176; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 250 - 372
Target Start/End: Original strand, 17266 - 17389
Alignment:
Q  250 attgttgacccagttcagc-caatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatccaatatg-tgaatgtgttacaaaagagttacaagaatcta 347  Q
    |||||||||||||||| |  |||| || |||||| ||||  |||||||| | |||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||||||||  ||    
T  17266 attgttgacccagttcggttcaatatgacctaatatgggaaagagagcaaccctccaatccattatgatgaaagtgttacaaaagagttacaagaaatta 17365  T
Q  348 gctattcaagctttcacaagaacaa 372  Q
    ||| |  |||||| |||||||||||    
T  17366 gct-tataagcttacacaagaacaa 17389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0978 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0978
Description:

Target: scaffold0978; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 228 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 350 - 300
Alignment:
Q  228 aaagaacaaaacaccaagcaagattgttgacccagttcagccaatgtggcct 279  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  350 aaagaacaaaacaccaag-aagattgttgacctagttcagccaatatggcct 300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0267 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0267
Description:

Target: scaffold0267; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 329 - 269
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  329 ttgttgacccagttcggtccaatctgacctagtctgggggagagagcagccctccaatcca 269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0154 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0154
Description:

Target: scaffold0154; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 277 - 310
Target Start/End: Original strand, 11500 - 11533
Alignment:
Q  277 cctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11500 cctagtctgggggagagagcagctctccaatcca 11533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 251 - 310
Target Start/End: Original strand, 69292 - 69352
Alignment:
Q  251 ttgttgacccagttcag-ccaatgtggcctaatctgggggagagagcagctctccaatcca 310  Q
    ||||||||||||||| | ||||  || |||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  69292 ttgttgacccagttcggtccaaattgacctagtctgggggagagagcagctctccgatcca 69352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University