View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15580_low_6 (Length: 220)

Name: NF15580_low_6
Description: NF15580
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15580_low_6
NF15580_low_6
[»] chr8 (84 HSPs)
chr8 (1-204)||(5236996-5237198)
chr8 (1-204)||(24662400-24662602)
chr8 (1-204)||(43684455-43684657)
chr8 (4-200)||(24718576-24718768)
chr8 (1-204)||(16042191-16042392)
chr8 (38-204)||(24930305-24930470)
chr8 (1-204)||(16874094-16874294)
chr8 (38-204)||(16040551-16040716)
chr8 (1-200)||(3432735-3432927)
chr8 (38-204)||(24107777-24107942)
chr8 (42-172)||(13722367-13722495)
chr8 (42-172)||(13722515-13722643)
chr8 (42-172)||(13722663-13722791)
chr8 (42-172)||(13722811-13722939)
chr8 (42-172)||(13722959-13723087)
chr8 (39-200)||(28836399-28836559)
chr8 (38-200)||(6775422-6775583)
chr8 (1-141)||(16040408-16040545)
chr8 (42-204)||(13663832-13663991)
chr8 (42-204)||(13723107-13723266)
chr8 (85-200)||(272442-272556)
chr8 (85-200)||(643293-643407)
chr8 (85-200)||(829099-829213)
chr8 (38-200)||(22908675-22908837)
chr8 (1-174)||(38532493-38532665)
chr8 (42-200)||(700770-700926)
chr8 (12-174)||(21696396-21696556)
chr8 (1-204)||(29759095-29759293)
chr8 (1-172)||(13663644-13663812)
chr8 (42-200)||(224357-224513)
chr8 (42-200)||(737980-738136)
chr8 (42-200)||(861875-862031)
chr8 (100-204)||(43374835-43374938)
chr8 (1-204)||(20648593-20648794)
chr8 (42-146)||(17151344-17151445)
chr8 (1-204)||(20480475-20480674)
chr8 (1-172)||(13722179-13722347)
chr8 (1-204)||(20655178-20655379)
chr8 (1-174)||(17730617-17730789)
chr8 (100-203)||(24386960-24387063)
chr8 (99-204)||(19994402-19994507)
chr8 (35-154)||(17151443-17151561)
chr8 (42-141)||(18618031-18618129)
chr8 (1-171)||(21680040-21680207)
chr8 (11-196)||(41245475-41245655)
chr8 (113-201)||(16195001-16195089)
chr8 (100-204)||(24548022-24548126)
chr8 (41-163)||(37654830-37654952)
chr8 (1-156)||(22007643-22007792)
chr8 (1-71)||(28836633-28836703)
chr8 (42-163)||(23148749-23148869)
chr8 (1-200)||(25121350-25121544)
chr8 (101-204)||(16417064-16417168)
chr8 (101-204)||(37610170-37610274)
chr8 (100-204)||(22322687-22322791)
chr8 (1-174)||(20568422-20568591)
chr8 (1-174)||(20574615-20574784)
chr8 (135-200)||(15320347-15320412)
chr8 (135-200)||(15500716-15500781)
chr8 (135-200)||(22089731-22089796)
chr8 (4-71)||(16406226-16406291)
chr8 (1-69)||(22908532-22908600)
chr8 (42-159)||(33612255-33612372)
chr8 (135-183)||(18618138-18618186)
chr8 (1-69)||(24930161-24930229)
chr8 (136-183)||(17151288-17151335)
chr8 (1-69)||(18611449-18611513)
chr8 (1-68)||(24386863-24386930)
chr8 (7-68)||(22322598-22322657)
chr8 (159-204)||(270540-270585)
chr8 (159-204)||(645335-645380)
chr8 (159-204)||(831070-831115)
chr8 (136-172)||(224301-224337)
chr8 (136-172)||(700714-700750)
chr8 (136-172)||(737924-737960)
chr8 (136-172)||(861819-861855)
chr8 (17-73)||(31195514-31195570)
chr8 (43-141)||(18042708-18042806)
chr8 (1-69)||(22144149-22144213)
chr8 (43-102)||(33171202-33171260)
chr8 (1-71)||(28556922-28556991)
chr8 (11-71)||(19994318-19994376)
chr8 (7-72)||(23836155-23836219)
chr8 (7-71)||(24107642-24107704)
[»] chr7 (79 HSPs)
chr7 (1-204)||(15442716-15442918)
chr7 (1-204)||(30263281-30263483)
chr7 (38-204)||(13912307-13912472)
chr7 (35-204)||(11514926-11515094)
chr7 (1-204)||(13757383-13757583)
chr7 (38-204)||(32495749-32495914)
chr7 (1-183)||(2191704-2191884)
chr7 (38-200)||(15952290-15952451)
chr7 (38-204)||(2027362-2027527)
chr7 (38-200)||(7291662-7291823)
chr7 (38-200)||(16417273-16417434)
chr7 (38-204)||(16480130-16480295)
chr7 (85-200)||(27102790-27102904)
chr7 (85-200)||(27110138-27110252)
chr7 (85-200)||(27175422-27175536)
chr7 (85-200)||(38784882-38784996)
chr7 (42-204)||(15761567-15761729)
chr7 (42-189)||(26010389-26010535)
chr7 (38-200)||(2191890-2192051)
chr7 (85-200)||(7821730-7821844)
chr7 (85-200)||(7829041-7829155)
chr7 (1-173)||(13273589-13273760)
chr7 (1-204)||(112455-112656)
chr7 (1-200)||(369696-369891)
chr7 (1-174)||(16571248-16571418)
chr7 (1-174)||(16594244-16594414)
chr7 (1-204)||(3893900-3894099)
chr7 (1-174)||(15629616-15629787)
chr7 (1-180)||(11286042-11286217)
chr7 (1-196)||(45453416-45453607)
chr7 (101-204)||(13038362-13038465)
chr7 (1-172)||(15851163-15851329)
chr7 (1-200)||(18981064-18981262)
chr7 (1-174)||(49048949-49049120)
chr7 (1-204)||(142432-142634)
chr7 (106-204)||(11582103-11582201)
chr7 (101-203)||(39047947-39048049)
chr7 (100-196)||(12544967-12545063)
chr7 (100-204)||(36051468-36051571)
chr7 (101-204)||(16210584-16210687)
chr7 (38-200)||(15926173-15926334)
chr7 (1-202)||(125633-125829)
chr7 (7-187)||(10862007-10862187)
chr7 (101-196)||(26071522-26071616)
chr7 (101-196)||(26095309-26095403)
chr7 (110-200)||(13867339-13867429)
chr7 (106-203)||(1938032-1938129)
chr7 (115-204)||(3058852-3058941)
chr7 (1-172)||(12753718-12753885)
chr7 (7-204)||(12249276-12249472)
chr7 (1-69)||(13912164-13912232)
chr7 (1-69)||(32495606-32495674)
chr7 (100-196)||(47288588-47288683)
chr7 (1-69)||(11515272-11515340)
chr7 (100-190)||(15823662-15823751)
chr7 (1-71)||(16417507-16417575)
chr7 (110-196)||(44864056-44864142)
chr7 (1-69)||(7291898-7291966)
chr7 (35-146)||(11515092-11515200)
chr7 (1-102)||(3048633-3048731)
chr7 (7-159)||(9057802-9057952)
chr7 (1-69)||(15952149-15952215)
chr7 (11-71)||(16210694-16210752)
chr7 (135-183)||(15761510-15761558)
chr7 (7-133)||(48354249-48354373)
chr7 (11-71)||(39047861-39047919)
chr7 (143-204)||(42057461-42057522)
chr7 (7-133)||(9610150-9610274)
chr7 (7-133)||(9837722-9837846)
chr7 (4-67)||(13038290-13038351)
chr7 (2-65)||(26071427-26071488)
chr7 (2-65)||(26095214-26095275)
chr7 (43-102)||(9322230-9322288)
chr7 (7-69)||(7285374-7285436)
chr7 (49-102)||(13376572-13376623)
chr7 (17-71)||(13867249-13867303)
chr7 (11-71)||(11582034-11582092)
chr7 (11-71)||(14252362-14252420)
chr7 (13-69)||(47288712-47288766)
[»] chr5 (77 HSPs)
chr5 (1-204)||(21234679-21234881)
chr5 (1-204)||(20615415-20615617)
chr5 (1-204)||(37051787-37051989)
chr5 (38-204)||(4201276-4201441)
chr5 (35-204)||(25901633-25901801)
chr5 (38-200)||(7424484-7424646)
chr5 (42-200)||(1169857-1170013)
chr5 (35-204)||(11341439-11341607)
chr5 (1-183)||(35792276-35792456)
chr5 (38-200)||(18779303-18779466)
chr5 (38-204)||(9731977-9732142)
chr5 (38-200)||(11155-11316)
chr5 (38-200)||(1221042-1221203)
chr5 (38-200)||(21074800-21074961)
chr5 (38-200)||(22367795-22367956)
chr5 (38-204)||(27185025-27185190)
chr5 (38-200)||(11582683-11582844)
chr5 (38-200)||(25425426-25425587)
chr5 (35-204)||(110290-110458)
chr5 (35-200)||(10779487-10779651)
chr5 (42-204)||(17473084-17473245)
chr5 (38-200)||(29191931-29192092)
chr5 (1-204)||(16535110-16535308)
chr5 (1-200)||(22884459-22884653)
chr5 (38-197)||(23513607-23513765)
chr5 (31-200)||(19498604-19498766)
chr5 (85-200)||(21933519-21933633)
chr5 (85-200)||(21939689-21939803)
chr5 (85-200)||(35581059-35581173)
chr5 (85-200)||(37010523-37010637)
chr5 (1-146)||(25901493-25901635)
chr5 (42-198)||(43445069-43445223)
chr5 (1-199)||(24184368-24184564)
chr5 (1-203)||(21649635-21649835)
chr5 (110-200)||(21392997-21393087)
chr5 (129-204)||(25192397-25192472)
chr5 (106-204)||(11212980-11213078)
chr5 (1-183)||(1169671-1169848)
chr5 (11-204)||(4864071-4864261)
chr5 (18-200)||(21652574-21652754)
chr5 (1-174)||(19404416-19404586)
chr5 (100-196)||(20710950-20711045)
chr5 (1-174)||(23453786-23453958)
chr5 (1-174)||(23465291-23465463)
chr5 (1-91)||(23505645-23505733)
chr5 (1-183)||(17472897-17473075)
chr5 (1-141)||(25425593-25425731)
chr5 (1-200)||(28258408-28258604)
chr5 (1-69)||(1220899-1220967)
chr5 (1-69)||(4201133-4201201)
chr5 (1-69)||(27184882-27184950)
chr5 (1-199)||(11338021-11338218)
chr5 (1-146)||(11341605-11341744)
chr5 (1-69)||(22367652-22367720)
chr5 (149-204)||(35792553-35792608)
chr5 (1-69)||(23513840-23513908)
chr5 (1-71)||(11389-11457)
chr5 (1-71)||(10779349-10779417)
chr5 (2-69)||(18779161-18779228)
chr5 (1-71)||(29191790-29191858)
chr5 (135-200)||(23327758-23327823)
chr5 (38-163)||(37982287-37982411)
chr5 (143-200)||(24595306-24595363)
chr5 (159-204)||(24474398-24474443)
chr5 (49-163)||(3672849-3672962)
chr5 (1-204)||(23510794-23510991)
chr5 (49-174)||(5452008-5452132)
chr5 (7-128)||(23492930-23493050)
chr5 (1-69)||(9731836-9731902)
chr5 (7-141)||(21615884-21616016)
chr5 (136-172)||(43445013-43445049)
chr5 (7-128)||(431320-431440)
chr5 (3-74)||(28901007-28901078)
chr5 (3-74)||(28937402-28937473)
chr5 (49-141)||(19861095-19861186)
chr5 (38-118)||(35792462-35792541)
chr5 (42-74)||(19498830-19498862)
[»] chr4 (75 HSPs)
chr4 (1-204)||(10487471-10487673)
chr4 (1-204)||(16329078-16329280)
chr4 (38-204)||(22355756-22355920)
chr4 (38-204)||(26678835-26679000)
chr4 (38-203)||(14950821-14950984)
chr4 (38-204)||(7133641-7133805)
chr4 (38-200)||(15288200-15288362)
chr4 (1-200)||(14995000-14995197)
chr4 (38-200)||(18167596-18167756)
chr4 (38-200)||(15295310-15295472)
chr4 (1-183)||(18109858-18110038)
chr4 (1-200)||(19999331-19999527)
chr4 (38-204)||(15273951-15274116)
chr4 (35-204)||(8373155-8373323)
chr4 (35-204)||(9294325-9294493)
chr4 (38-200)||(18246992-18247153)
chr4 (42-204)||(5684097-5684259)
chr4 (7-183)||(34394020-34394194)
chr4 (42-171)||(18294363-18294490)
chr4 (42-200)||(47356131-47356287)
chr4 (40-204)||(15212143-15212307)
chr4 (1-200)||(16521594-16521789)
chr4 (85-200)||(23271161-23271276)
chr4 (1-183)||(18294174-18294354)
chr4 (42-204)||(34393855-34394011)
chr4 (115-204)||(110282-110371)
chr4 (1-196)||(821270-821460)
chr4 (11-204)||(13245252-13245440)
chr4 (1-174)||(13810774-13810946)
chr4 (101-204)||(53706043-53706146)
chr4 (1-183)||(5683911-5684088)
chr4 (5-196)||(12900931-12901120)
chr4 (11-196)||(33739075-33739255)
chr4 (85-204)||(8044060-8044180)
chr4 (1-204)||(25120280-25120478)
chr4 (42-146)||(8373321-8373422)
chr4 (1-69)||(26679075-26679143)
chr4 (129-204)||(8873775-8873850)
chr4 (1-204)||(45460114-45460313)
chr4 (129-204)||(53909051-53909126)
chr4 (7-200)||(21960732-21960920)
chr4 (7-151)||(15014430-15014574)
chr4 (1-69)||(18251104-18251172)
chr4 (38-171)||(18110044-18110176)
chr4 (1-196)||(44054732-44054922)
chr4 (1-102)||(9794245-9794343)
chr4 (100-204)||(10642988-10643092)
chr4 (101-174)||(30233796-30233869)
chr4 (42-109)||(19019316-19019381)
chr4 (1-69)||(22355613-22355681)
chr4 (1-71)||(18247226-18247294)
chr4 (99-204)||(44345629-44345734)
chr4 (101-174)||(18495659-18495732)
chr4 (135-200)||(26338288-26338353)
chr4 (1-204)||(54119430-54119618)
chr4 (1-74)||(18167827-18167898)
chr4 (1-74)||(7133499-7133570)
chr4 (11-71)||(53705978-53706036)
chr4 (135-183)||(19019390-19019438)
chr4 (136-183)||(8373431-8373478)
chr4 (1-69)||(19698521-19698585)
chr4 (1-69)||(19709106-19709170)
chr4 (11-71)||(8873715-8873773)
chr4 (49-159)||(15043789-15043897)
chr4 (49-159)||(15110527-15110635)
chr4 (1-69)||(15273810-15273876)
chr4 (11-159)||(41257517-41257665)
chr4 (9-167)||(14900330-14900486)
chr4 (136-172)||(47356307-47356343)
chr4 (11-71)||(110391-110449)
chr4 (38-102)||(34197365-34197427)
chr4 (11-71)||(53908970-53909028)
chr4 (1-69)||(55377742-55377808)
chr4 (7-133)||(18275724-18275848)
chr4 (49-128)||(41167154-41167231)
[»] chr2 (67 HSPs)
chr2 (1-204)||(14907592-14907794)
chr2 (1-204)||(23818980-23819182)
chr2 (1-204)||(20013923-20014122)
chr2 (38-200)||(3800304-3800465)
chr2 (35-204)||(34822999-34823167)
chr2 (35-204)||(12726854-12727022)
chr2 (13-200)||(12637333-12637517)
chr2 (38-204)||(12643216-12643381)
chr2 (38-200)||(21275718-21275879)
chr2 (38-200)||(21140680-21140841)
chr2 (2-196)||(25600772-25600964)
chr2 (41-200)||(19887974-19888132)
chr2 (85-200)||(5889534-5889649)
chr2 (1-200)||(8942452-8942649)
chr2 (85-200)||(11232491-11232605)
chr2 (85-200)||(22514338-22514452)
chr2 (31-200)||(24827753-24827922)
chr2 (85-200)||(28776939-28777053)
chr2 (1-198)||(4449386-4449581)
chr2 (106-204)||(8886943-8887041)
chr2 (7-174)||(22581094-22581259)
chr2 (38-140)||(3800197-3800297)
chr2 (100-196)||(36891963-36892058)
chr2 (1-204)||(22273688-22273886)
chr2 (1-174)||(24572546-24572717)
chr2 (44-200)||(24967104-24967259)
chr2 (1-204)||(22282921-22283119)
chr2 (39-174)||(7320322-7320456)
chr2 (115-204)||(43644243-43644332)
chr2 (101-204)||(461539-461642)
chr2 (1-174)||(22787181-22787353)
chr2 (110-204)||(25877212-25877307)
chr2 (106-204)||(22862290-22862388)
chr2 (28-174)||(721315-721460)
chr2 (106-204)||(20628656-20628751)
chr2 (1-146)||(34823165-34823304)
chr2 (42-204)||(15632199-15632359)
chr2 (4-165)||(16900207-16900364)
chr2 (4-165)||(16993598-16993755)
chr2 (1-146)||(12727126-12727265)
chr2 (42-163)||(19658805-19658925)
chr2 (1-71)||(19887830-19887898)
chr2 (1-203)||(6878246-6878447)
chr2 (1-69)||(21140916-21140982)
chr2 (35-146)||(12727020-12727128)
chr2 (49-127)||(19670339-19670416)
chr2 (135-200)||(23773340-23773405)
chr2 (135-200)||(24686956-24687021)
chr2 (1-71)||(3800056-3800124)
chr2 (1-67)||(270092-270158)
chr2 (3-102)||(66470-66567)
chr2 (102-154)||(27260414-27260466)
chr2 (7-101)||(9782077-9782168)
chr2 (3-163)||(24088524-24088683)
chr2 (1-69)||(12643075-12643141)
chr2 (11-71)||(20628587-20628645)
chr2 (1-69)||(21275577-21275643)
chr2 (101-170)||(22691206-22691275)
chr2 (101-170)||(22695853-22695922)
chr2 (1-68)||(27260497-27260562)
chr2 (7-163)||(24276753-24276903)
chr2 (85-146)||(19665539-19665600)
chr2 (143-204)||(22693069-22693130)
chr2 (143-204)||(22697716-22697777)
chr2 (7-71)||(25211913-25211975)
chr2 (159-203)||(9654140-9654184)
chr2 (135-171)||(28972876-28972912)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (1-204)||(25704-25906)
scaffold0141 (1-204)||(21449-21651)
[»] chr1 (53 HSPs)
chr1 (1-204)||(51451412-51451614)
chr1 (1-204)||(22365555-22365756)
chr1 (1-204)||(17147581-17147781)
chr1 (38-204)||(20826421-20826586)
chr1 (1-204)||(15862597-15862795)
chr1 (42-197)||(41393258-41393412)
chr1 (1-204)||(22250118-22250316)
chr1 (42-204)||(22352928-22353088)
chr1 (85-200)||(17003626-17003740)
chr1 (1-174)||(51657474-51657646)
chr1 (85-200)||(7641839-7641953)
chr1 (1-204)||(44036065-44036262)
chr1 (7-200)||(18506161-18506349)
chr1 (85-204)||(18060853-18060972)
chr1 (1-198)||(35523582-35523777)
chr1 (113-204)||(20526919-20527010)
chr1 (1-204)||(35053643-35053842)
chr1 (113-204)||(20444547-20444638)
chr1 (113-204)||(20530312-20530403)
chr1 (112-203)||(21858358-21858449)
chr1 (1-200)||(49966454-49966647)
chr1 (1-199)||(21717012-21717203)
chr1 (101-200)||(2422230-2422329)
chr1 (1-146)||(20956134-20956278)
chr1 (1-172)||(22353108-22353274)
chr1 (1-196)||(22407359-22407549)
chr1 (113-203)||(37845737-37845827)
chr1 (11-196)||(5675774-5675955)
chr1 (100-204)||(45050483-45050587)
chr1 (101-204)||(41210847-41210949)
chr1 (42-120)||(20253161-20253237)
chr1 (101-204)||(20894953-20895055)
chr1 (2-160)||(27330936-27331088)
chr1 (3-163)||(27673692-27673851)
chr1 (135-200)||(21651230-21651295)
chr1 (135-200)||(22034650-22034715)
chr1 (7-159)||(8539112-8539264)
chr1 (7-159)||(8604351-8604503)
chr1 (135-200)||(22031009-22031074)
chr1 (7-102)||(17607868-17607960)
chr1 (7-141)||(5769344-5769478)
chr1 (7-159)||(21194021-21194173)
chr1 (135-200)||(22029499-22029564)
chr1 (27-174)||(22836424-22836570)
chr1 (135-183)||(20253246-20253294)
chr1 (1-71)||(2422134-2422202)
chr1 (100-204)||(41218254-41218359)
chr1 (159-204)||(9785551-9785596)
chr1 (1-69)||(20826280-20826346)
chr1 (7-141)||(37235133-37235265)
chr1 (3-74)||(16655454-16655525)
chr1 (50-163)||(22144588-22144701)
chr1 (11-71)||(37845661-37845719)
[»] scaffold0034 (4 HSPs)
scaffold0034 (1-200)||(78360-78557)
scaffold0034 (3-204)||(44602-44800)
scaffold0034 (100-204)||(39015-39119)
scaffold0034 (1-71)||(39250-39319)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (1-203)||(266-466)
[»] chr6 (72 HSPs)
chr6 (38-200)||(33315773-33315934)
chr6 (38-204)||(16827067-16827232)
chr6 (38-204)||(16230388-16230553)
chr6 (35-204)||(18824949-18825117)
chr6 (1-200)||(23976379-23976575)
chr6 (38-200)||(15736372-15736533)
chr6 (38-200)||(18004164-18004325)
chr6 (38-200)||(25174364-25174525)
chr6 (35-200)||(4989707-4989871)
chr6 (42-200)||(27655282-27655439)
chr6 (38-204)||(14627801-14627966)
chr6 (1-204)||(18569394-18569595)
chr6 (42-204)||(1554646-1554808)
chr6 (42-204)||(18843016-18843177)
chr6 (85-200)||(10487688-10487802)
chr6 (85-200)||(16377525-16377639)
chr6 (85-200)||(16384849-16384963)
chr6 (1-200)||(35016839-35017034)
chr6 (1-200)||(18087866-18088064)
chr6 (38-200)||(13622304-13622465)
chr6 (100-200)||(18431445-18431544)
chr6 (1-204)||(18776018-18776217)
chr6 (1-204)||(19984363-19984561)
chr6 (1-174)||(25368502-25368674)
chr6 (63-200)||(15861538-15861676)
chr6 (100-204)||(16105366-16105470)
chr6 (11-200)||(25645995-25646179)
chr6 (1-69)||(16826924-16826992)
chr6 (101-204)||(25745585-25745689)
chr6 (100-204)||(16084888-16084992)
chr6 (7-163)||(22846992-22847148)
chr6 (100-204)||(1651203-1651307)
chr6 (1-204)||(23152067-23152266)
chr6 (100-204)||(1658964-1659068)
chr6 (135-204)||(26088642-26088711)
chr6 (1-71)||(25174598-25174666)
chr6 (1-68)||(26088806-26088873)
chr6 (1-71)||(27655152-27655220)
chr6 (1-196)||(32897539-32897729)
chr6 (1-71)||(33315633-33315701)
chr6 (1-71)||(13622161-13622231)
chr6 (129-199)||(31627251-31627321)
chr6 (1-174)||(28195931-28196104)
chr6 (42-128)||(35137187-35137272)
chr6 (135-200)||(16557303-16557368)
chr6 (135-200)||(16650533-16650598)
chr6 (135-200)||(29870762-29870827)
chr6 (101-204)||(22431055-22431159)
chr6 (38-77)||(19609309-19609348)
chr6 (1-74)||(14627659-14627730)
chr6 (1-74)||(18004022-18004093)
chr6 (7-69)||(18582224-18582286)
chr6 (49-164)||(16888946-16889060)
chr6 (143-204)||(23993968-23994029)
chr6 (135-183)||(1554817-1554865)
chr6 (42-128)||(33323659-33323744)
chr6 (42-141)||(34965814-34965913)
chr6 (1-174)||(18397765-18397934)
chr6 (1-69)||(19628374-19628438)
chr6 (1-55)||(25903976-25904028)
chr6 (1-69)||(16230628-16230694)
chr6 (135-200)||(22226928-22226993)
chr6 (11-74)||(15736240-15736301)
chr6 (7-71)||(22867094-22867158)
chr6 (115-197)||(16239179-16239262)
chr6 (7-101)||(22363361-22363452)
chr6 (7-71)||(4989941-4990003)
chr6 (137-197)||(11214953-11215014)
chr6 (7-71)||(18824713-18824775)
chr6 (7-71)||(18840568-18840630)
chr6 (7-39)||(13015967-13015999)
chr6 (42-74)||(21776784-21776816)
[»] chr3 (98 HSPs)
chr3 (38-204)||(16745362-16745526)
chr3 (38-200)||(16819712-16819872)
chr3 (35-204)||(51159667-51159834)
chr3 (38-204)||(17957526-17957691)
chr3 (38-204)||(53769460-53769625)
chr3 (7-204)||(19945428-19945624)
chr3 (38-200)||(18909493-18909654)
chr3 (38-200)||(22273848-22274009)
chr3 (1-183)||(16260014-16260187)
chr3 (38-200)||(2450520-2450680)
chr3 (38-204)||(7852610-7852775)
chr3 (38-204)||(33340645-33340810)
chr3 (30-200)||(49231019-49231187)
chr3 (38-204)||(16259843-16260008)
chr3 (85-200)||(1468892-1469006)
chr3 (85-200)||(8269641-8269755)
chr3 (85-200)||(8276752-8276866)
chr3 (1-174)||(12562632-12562803)
chr3 (1-174)||(14294262-14294432)
chr3 (1-174)||(14299889-14300059)
chr3 (11-196)||(50113300-50113480)
chr3 (11-204)||(47786049-47786239)
chr3 (1-199)||(35122494-35122690)
chr3 (11-204)||(15860315-15860503)
chr3 (1-174)||(11198726-11198897)
chr3 (13-204)||(13816315-13816502)
chr3 (85-202)||(44228230-44228347)
chr3 (11-204)||(19571939-19572127)
chr3 (7-163)||(33370013-33370169)
chr3 (1-163)||(39654757-39654918)
chr3 (1-198)||(53899677-53899872)
chr3 (110-200)||(6148103-6148193)
chr3 (101-174)||(17099547-17099620)
chr3 (100-200)||(15469720-15469820)
chr3 (100-204)||(15574843-15574947)
chr3 (100-204)||(15613862-15613966)
chr3 (114-201)||(12031249-12031336)
chr3 (129-204)||(17913532-17913607)
chr3 (113-204)||(19230862-19230953)
chr3 (115-202)||(22145541-22145628)
chr3 (99-204)||(16183261-16183366)
chr3 (1-203)||(23491309-23491510)
chr3 (114-204)||(2048862-2048953)
chr3 (42-120)||(9303811-9303887)
chr3 (1-203)||(25057650-25057851)
chr3 (1-202)||(318769-318968)
chr3 (101-204)||(12351097-12351201)
chr3 (1-72)||(49231252-49231321)
chr3 (1-71)||(22274082-22274150)
chr3 (4-170)||(47983750-47983913)
chr3 (4-170)||(47993037-47993200)
chr3 (4-170)||(48002324-48002487)
chr3 (4-170)||(48011610-48011773)
chr3 (1-70)||(2450379-2450446)
chr3 (110-200)||(8630653-8630743)
chr3 (7-174)||(11062197-11062362)
chr3 (135-200)||(16935168-16935233)
chr3 (4-69)||(51159530-51159595)
chr3 (7-103)||(54652868-54652962)
chr3 (1-71)||(17957384-17957452)
chr3 (1-174)||(40938564-40938734)
chr3 (1-74)||(16819943-16820014)
chr3 (135-204)||(18897984-18898053)
chr3 (135-200)||(30152138-30152203)
chr3 (1-58)||(38166993-38167050)
chr3 (49-159)||(12951901-12952010)
chr3 (1-174)||(11883410-11883582)
chr3 (112-183)||(17937320-17937391)
chr3 (100-174)||(14297331-14297405)
chr3 (100-174)||(14302958-14303032)
chr3 (3-163)||(15516590-15516749)
chr3 (143-200)||(12265785-12265842)
chr3 (43-163)||(41660473-41660593)
chr3 (135-183)||(9303754-9303802)
chr3 (1-73)||(17138408-17138480)
chr3 (1-71)||(13837797-13837865)
chr3 (122-204)||(14522580-14522663)
chr3 (5-71)||(15469630-15469694)
chr3 (7-101)||(17203596-17203687)
chr3 (7-128)||(34558780-34558899)
chr3 (7-69)||(7852850-7852912)
chr3 (42-128)||(17937226-17937310)
chr3 (2-71)||(54423008-54423075)
chr3 (85-126)||(10737398-10737439)
chr3 (1-69)||(18909729-18909795)
chr3 (11-71)||(33340884-33340942)
chr3 (1-69)||(53769700-53769766)
chr3 (1-62)||(54039683-54039744)
chr3 (135-191)||(5227527-5227583)
chr3 (7-66)||(22145438-22145495)
chr3 (1-39)||(8630808-8630846)
chr3 (11-71)||(12031172-12031230)
chr3 (115-200)||(14843815-14843900)
chr3 (2-39)||(17099677-17099714)
chr3 (38-102)||(48420584-48420646)
chr3 (42-102)||(55442006-55442064)
chr3 (42-74)||(14079526-14079558)
chr3 (1-69)||(17523626-17523693)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (1-200)||(2732-2930)
scaffold0124 (101-173)||(22959-23030)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (38-201)||(2325-2486)
scaffold0597 (1-66)||(2182-2247)
[»] scaffold0383 (3 HSPs)
scaffold0383 (42-204)||(1168-1327)
scaffold0383 (1-204)||(6037-6236)
scaffold0383 (1-172)||(1347-1513)
[»] scaffold0116 (2 HSPs)
scaffold0116 (42-204)||(28688-28848)
scaffold0116 (1-183)||(28857-29035)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (38-204)||(17451-17616)
scaffold0315 (1-69)||(17691-17759)
[»] scaffold0044 (3 HSPs)
scaffold0044 (42-201)||(95128-95285)
scaffold0044 (1-183)||(95294-95471)
scaffold0044 (152-204)||(66745-66797)
[»] scaffold0025 (5 HSPs)
scaffold0025 (42-200)||(145338-145493)
scaffold0025 (4-183)||(145502-145680)
scaffold0025 (8-102)||(84501-84594)
scaffold0025 (113-201)||(147597-147685)
scaffold0025 (38-74)||(52246-52281)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (38-200)||(155548-155709)
scaffold0023 (135-200)||(734-799)
scaffold0023 (1-67)||(155407-155471)
[»] scaffold0251 (2 HSPs)
scaffold0251 (38-200)||(15057-15218)
scaffold0251 (1-69)||(14916-14982)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (38-204)||(41510-41675)
[»] scaffold0032 (4 HSPs)
scaffold0032 (50-204)||(109286-109439)
scaffold0032 (1-58)||(14591-14648)
scaffold0032 (1-71)||(54563-54633)
scaffold0032 (106-203)||(54442-54532)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (38-200)||(90077-90238)
scaffold0028 (35-200)||(129191-129355)
scaffold0028 (42-163)||(78535-78655)
scaffold0028 (11-71)||(89945-90003)
scaffold0028 (7-71)||(129425-129487)
[»] scaffold0078 (4 HSPs)
scaffold0078 (38-200)||(38524-38685)
scaffold0078 (106-204)||(40295-40393)
scaffold0078 (1-69)||(38381-38449)
scaffold0078 (1-71)||(40424-40492)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (38-200)||(5985-6146)
scaffold0003 (114-199)||(217016-217101)
scaffold0003 (1-71)||(6219-6287)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (42-174)||(53139-53270)
scaffold0066 (135-183)||(53279-53327)
[»] scaffold0234 (2 HSPs)
scaffold0234 (42-200)||(18776-18931)
scaffold0234 (1-183)||(18585-18767)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (85-200)||(38092-38206)
[»] scaffold0103 (1 HSPs)
scaffold0103 (8-204)||(32387-32582)
[»] scaffold0138 (5 HSPs)
scaffold0138 (42-183)||(28472-28611)
scaffold0138 (42-204)||(28301-28463)
scaffold0138 (42-204)||(40297-40459)
scaffold0138 (42-183)||(40468-40607)
scaffold0138 (106-204)||(14524-14622)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (1-174)||(2613-2785)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (1-200)||(20455-20649)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (11-204)||(8237-8426)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (100-204)||(52528-52632)
scaffold0018 (100-204)||(56480-56584)
[»] scaffold0447 (1 HSPs)
scaffold0447 (1-204)||(3429-3628)
[»] scaffold1734 (2 HSPs)
scaffold1734 (42-196)||(1-155)
scaffold1734 (1-183)||(164-344)
[»] scaffold0761 (2 HSPs)
scaffold0761 (38-197)||(2884-3042)
scaffold0761 (1-69)||(2741-2809)
[»] scaffold0009 (3 HSPs)
scaffold0009 (87-195)||(270934-271043)
scaffold0009 (11-203)||(236986-237177)
scaffold0009 (3-133)||(68399-68527)
[»] scaffold0021 (4 HSPs)
scaffold0021 (100-196)||(138065-138161)
scaffold0021 (100-200)||(87247-87346)
scaffold0021 (110-174)||(10500-10564)
scaffold0021 (2-68)||(137972-138036)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-204)||(27825-28023)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (106-204)||(248799-248897)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (7-174)||(6727-6893)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (11-196)||(6359-6539)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (85-189)||(17328-17433)
[»] scaffold0195 (4 HSPs)
scaffold0195 (1-204)||(7812-8011)
scaffold0195 (1-204)||(13201-13400)
scaffold0195 (106-204)||(18111-18209)
scaffold0195 (106-204)||(20195-20293)
[»] scaffold0338 (1 HSPs)
scaffold0338 (1-204)||(7597-7797)
[»] scaffold0068 (2 HSPs)
scaffold0068 (1-204)||(46929-47129)
scaffold0068 (1-204)||(60377-60577)
[»] scaffold0037 (3 HSPs)
scaffold0037 (1-200)||(70555-70750)
scaffold0037 (100-200)||(25979-26078)
scaffold0037 (1-174)||(93530-93699)
[»] scaffold0011 (6 HSPs)
scaffold0011 (113-205)||(75959-76051)
scaffold0011 (113-204)||(124558-124649)
scaffold0011 (7-204)||(256073-256266)
scaffold0011 (7-204)||(262679-262872)
scaffold0011 (106-204)||(193416-193514)
scaffold0011 (11-71)||(193517-193575)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (101-204)||(6404-6507)
[»] scaffold0162 (1 HSPs)
scaffold0162 (101-204)||(27767-27870)
[»] scaffold0184 (2 HSPs)
scaffold0184 (106-204)||(32451-32549)
scaffold0184 (1-71)||(32352-32420)
[»] scaffold0014 (1 HSPs)
scaffold0014 (1-173)||(145761-145930)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (110-200)||(21467-21557)
scaffold0008 (4-41)||(129381-129418)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (101-200)||(14487-14587)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (100-196)||(12995-13090)
scaffold0359 (106-172)||(161-227)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (101-200)||(649-748)
[»] scaffold0465 (2 HSPs)
scaffold0465 (100-203)||(11179-11282)
scaffold0465 (1-68)||(11082-11149)
[»] scaffold0407 (1 HSPs)
scaffold0407 (106-204)||(5868-5967)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (7-174)||(2263-2429)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (100-196)||(3472-3568)
scaffold0434 (2-71)||(3594-3661)
[»] scaffold0269 (5 HSPs)
scaffold0269 (1-69)||(1008-1076)
scaffold0269 (1-69)||(15264-15332)
scaffold0269 (38-77)||(894-933)
scaffold0269 (38-77)||(15150-15189)
scaffold0269 (1-33)||(12023-12055)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (3-169)||(23621-23786)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (85-204)||(34373-34493)
[»] scaffold0120 (1 HSPs)
scaffold0120 (101-200)||(29995-30095)
[»] scaffold0083 (2 HSPs)
scaffold0083 (101-204)||(13002-13106)
scaffold0083 (1-71)||(13134-13202)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (106-204)||(1986-2084)
scaffold1140 (11-71)||(2087-2145)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (99-204)||(6613-6718)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (100-174)||(3046-3120)
scaffold0346 (1-33)||(2951-2983)
[»] scaffold0244 (2 HSPs)
scaffold0244 (1-204)||(17558-17758)
scaffold0244 (101-204)||(24073-24177)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (138-204)||(40402-40468)
[»] scaffold0022 (3 HSPs)
scaffold0022 (2-174)||(113718-113885)
scaffold0022 (1-69)||(108598-108666)
scaffold0022 (4-146)||(130764-130905)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (135-204)||(11324-11393)
[»] scaffold0396 (2 HSPs)
scaffold0396 (101-204)||(13448-13552)
scaffold0396 (1-71)||(13352-13420)
[»] scaffold0673 (1 HSPs)
scaffold0673 (99-204)||(2093-2198)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (107-204)||(1886-1983)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (135-200)||(30156-30221)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (9-159)||(6301-6450)
[»] scaffold0158 (1 HSPs)
scaffold0158 (1-172)||(23909-24076)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (129-204)||(69570-69645)
scaffold0031 (38-133)||(98352-98445)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (101-196)||(71707-71801)
[»] scaffold0554 (1 HSPs)
scaffold0554 (101-163)||(754-816)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (130-204)||(8883-8957)
[»] scaffold1752 (1 HSPs)
scaffold1752 (101-174)||(427-500)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (42-151)||(558-666)
scaffold0786 (42-151)||(5613-5721)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (42-151)||(4146-4254)
[»] scaffold0310 (1 HSPs)
scaffold0310 (38-141)||(1460-1562)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (101-174)||(20543-20616)
scaffold0150 (101-174)||(27372-27445)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (115-197)||(4651-4734)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (143-200)||(5800-5857)
[»] scaffold0750 (2 HSPs)
scaffold0750 (101-173)||(6596-6667)
scaffold0750 (1-47)||(5583-5629)
[»] scaffold0010 (1 HSPs)
scaffold0010 (7-133)||(30003-30127)
[»] scaffold0091 (1 HSPs)
scaffold0091 (11-174)||(43127-43285)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (38-160)||(24793-24915)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (100-170)||(59561-59631)
scaffold0051 (148-195)||(59375-59422)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (1-55)||(330965-331019)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (117-197)||(365-446)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (1-69)||(1527-1593)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (49-123)||(78037-78110)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (7-151)||(3573-3710)
[»] scaffold0456 (1 HSPs)
scaffold0456 (42-133)||(12135-12225)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (7-102)||(34371-34463)


Alignment Details
Target: chr8 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 84)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 5237198 - 5236996
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  5237198 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 5237100  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5237099 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 5237000  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  5236999 attg 5236996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 24662400 - 24662602
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24662400 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 24662498  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24662499 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 24662598  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  24662599 attg 24662602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 152; E-Value: 1e-80
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 43684657 - 43684455
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||   ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  43684657 ttcttgtatgactaagtgaggttgcatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 43684559  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43684558 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 43684459  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  43684458 attg 43684455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 127; E-Value: 1e-65
Query Start/End: Original strand, 4 - 200
Target Start/End: Original strand, 24718576 - 24718768
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||    
T  24718576 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaat 24718671  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24718672 gcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 24718768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 126; E-Value: 4e-65
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16042191 - 16042392
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  16042191 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccatattacttggaatatga- 16042287  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  16042288 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgattt 16042387  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  16042388 aattg 16042392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 117; E-Value: 9e-60
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 24930305 - 24930470
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24930305 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 24930402  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24930403 gttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 24930470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16874094 - 16874294
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |    | | |  ||||||||||||||||||    
T  16874094 ttcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatg---tatgctatattacttggaatatgag 16874190  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  16874191 aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattta 16874290  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  16874291 attg 16874294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 16040551 - 16040716
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  16040551 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccttattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16040648  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16040649 gttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 16040716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 3432735 - 3432927
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||  ||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  3432735 ttcttatatggctaagtgaa--tgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgag 3432828  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  3432829 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatattatgattta 3432927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 24107777 - 24107942
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  24107777 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 24107874  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24107875 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 24107942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722367 - 13722495
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13722367 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 13722464  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13722465 aatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13722495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722515 - 13722643
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13722515 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 13722612  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13722613 aatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13722643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722663 - 13722791
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13722663 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 13722760  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13722761 aatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13722791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722811 - 13722939
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13722811 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 13722908  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13722909 aatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13722939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 42 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722959 - 13723087
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  13722959 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 13723056  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13723057 aatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13723087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 39 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28836559 - 28836399
Alignment:
Q  39 tatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  28836559 tatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgat 28836462  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  28836461 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 28836399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 6775422 - 6775583
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6775422 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggtatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 6775519  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  6775520 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgattta 6775583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Original strand, 16040408 - 16040545
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||     
T  16040408 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccatattacttggaatatga- 16040504  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  16040505 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 16040545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 13663832 - 13663991
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  13663832 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagaatgcttgaactggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 13663928  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13663929 aataacattgttgattattgatgatcatg-tgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattg 13663991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 13723107 - 13723266
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  13723107 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagaatgcttgaactggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 13723203  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     || |||||||||||||||||| |||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13723204 aataacattgttgattattgatgatcatg-tgatgtgatgatgatgaatgctatgatttaattg 13723266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 272442 - 272556
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  272442 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 272540  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  272541 tgaatactatgattta 272556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 643407 - 643293
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  643407 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 643309  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  643308 tgaatactatgattta 643293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 829213 - 829099
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  829213 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 829115  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  829114 tgaatactatgattta 829099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 22908675 - 22908837
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||  ||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22908675 ttatatgttagatatgatatttgtcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 22908772  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  22908773 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgattta 22908837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 38532665 - 38532493
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||  |||||  ||| | |     
T  38532665 ttcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctct--tacttataatgtaat 38532568  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || ||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  38532567 aaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 38532493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 700770 - 700926
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  700770 atgttgaatataatatttatcatgagatgttg--ttttcccttttactttgaatattagaatgcccgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 700866  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  700867 aataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 700926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 12 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21696556 - 21696396
Alignment:
Q  12 ctaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaa 110  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||    
T  21696556 ctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaagaaatgcttgaa 21696460  T
Q  111 atggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||| |  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21696459 atggtgaaactatataaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 21696396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 29759293 - 29759095
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||||| ||    
T  29759293 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatataag 29759200  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  29759199 gaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 29759100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 13663644 - 13663812
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||   | | | | |  | ||||||||||| ||||    
T  13663644 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgaga---tatgtatgctatcttacttggaatgtgag 13663740  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13663741 aaatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13663812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 224357 - 224513
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||  |||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  224357 atgttgaatataatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttagaatataagaatgcccgaatcggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 224453  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  224454 aataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 224513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 737980 - 738136
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||  |||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  737980 atgttgaatataatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttagaatataagaatgcccgaatcggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 738076  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  738077 aataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 738136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 861875 - 862031
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||  |||  |||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  861875 atgttgaatataatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttagaatataagaatgcccgaatcggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 861971  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  861972 aataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 862031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 43374835 - 43374938
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  43374835 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattt 43374933  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  43374934 aattg 43374938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20648593 - 20648794
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| ||  ||||||| |||||||||||   |||  | | |  | |||||| |||| | ||    
T  20648593 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtatttttgatatgatgtttatcatgag---ttgggtatgctatcttacttagaatgtaag 20648689  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||||||||||||  |||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  20648690 gaatgcttgaaatggtgaaagcatatgtgataattgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgattt 20648789  T
Q  200 aattg 204  Q
     ||||    
T  20648790 gattg 20648794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Original strand, 17151344 - 17151445
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  17151344 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagaatgcttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 17151440  T
Q  142 catga 146  Q
     ||||    
T  17151441 aatga 17151445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20480674 - 20480475
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| | | |  | |||||| | || | ||    
T  20480674 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaga---tgtgtatgctatcttacttaggatgtaag 20480578  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||| | |||||| ||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || |||||  ||||||||    
T  20480577 aaatgcttgaatttgtgaaattatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgttatgattt 20480480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Original strand, 13722179 - 13722347
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||   | | | | |  | ||||||||||| ||||    
T  13722179 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgcttatcatgaga---tatgtatgctatcttacttggaatgtgag 13722275  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||| | ||| |||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13722276 aaatgcttgaattagtg-aactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgtt 13722347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 20655178 - 20655379
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||   |||  | |    | |||||| |||| | ||    
T  20655178 ttcttgtatgactaagtgaagttttataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgag---ttgggtatggtatcttacttagaatgtaag 20655274  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||||||||||||| |||||  ||| | ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||    
T  20655275 gaatgcttgaaatggtgaaacgatatgtgataattgatgttggatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcttatgattt 20655374  T
Q  200 aattg 204  Q
     ||||    
T  20655375 gattg 20655379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 17730617 - 17730789
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||| | |||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||| | ||| ||  ||||| | || | ||    
T  17730617 ttcttctatgattgagtgaatttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgttctct--tacttaggatgtaag 17730714  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || || ||||||| || ||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17730715 aaatgtttgaaatagtaaaactgtatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 17730789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Original strand, 24386960 - 24387063
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||| | |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  24386960 gaatgtttgaattggtgaatccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgattt 24387059  T
Q  200 aatt 203  Q
    ||||    
T  24387060 aatt 24387063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Original strand, 19994402 - 19994507
Alignment:
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||    
T  19994402 agaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgat 19994500  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  19994501 ttaattg 19994507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 35 - 154
Target Start/End: Original strand, 17151443 - 17151561
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||  |||||    
T  17151443 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaattgtttgaaatagtgaaactatatgtgatagt 17151540  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttg 154  Q
     ||||||| ||||||||||||    
T  17151541 tgatgttgaatgacattgttg 17151561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 18618129 - 18618031
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgctt-gaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18618129 atgttgaatatgatatttatcatgagatgt--tattttccttcttacttggaatatgagaatgcttggaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 18618032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 21680207 - 21680040
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  21680207 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 21680112  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgt 171  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  21680111 aaatgcttgaaatggtgaaaatatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgt 21680040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 41245655 - 41245475
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga-gaatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||||| | ||||||||||    
T  41245655 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatataaagaatgcttga 41245561  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    | |||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| |  |||||||||||    
T  41245560 a-tggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaagaagaatactatga 41245475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 113 - 201
Target Start/End: Original strand, 16195001 - 16195089
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaa 201  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  16195001 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatattgatgtgtgatgatgaatactatgatttaa 16195089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24548126 - 24548022
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  24548126 gaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 24548027  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  24548026 aattg 24548022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 41 - 163
Target Start/End: Original strand, 37654830 - 37654952
Alignment:
Q  41 tatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgt 139  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  37654830 tatgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctct-ttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgt 37654928  T
Q  140 tgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    || |||| |||| |||||||||||    
T  37654929 tgaatgatattgatgattattgat 37654952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 156
Target Start/End: Original strand, 22007643 - 22007792
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||| |||||||   ||| | | |  | ||||||||||||||||    
T  22007643 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttaacatgaga---tgtgtatgctatcttacttggaatatgag 22007737  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgat 156  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||    
T  22007738 aatgcttgaataggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat 22007792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28836703 - 28836633
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  28836703 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgt 28836633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 23148869 - 23148749
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| || | || |||    
T  23148869 atgttgtatatgatatttatcatgagatgttgtatttt--ctcttacttggaatatgagaaatatttgaaatggtgaaactatatgatgtatttgacgtt 23148772  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgat 163  Q
    | |||| |||| |||| ||||||    
T  23148771 gaatgatattgatgatcattgat 23148749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25121544 - 25121350
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||| |   |||   | |  | |||||| |||| | ||    
T  25121544 ttcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaaa---tgtgcatgctatcttacttagaatgtaag 25121450  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||| |||||| ||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||    
T  25121449 aaatgcttg-aatggtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaccttgttgattattgataattatgttaatgtgtgatggtgaatattatgattt 25121351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16417168 - 16417064
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  16417168 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttgagtattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgattt 16417069  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  16417068 aattg 16417064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37610274 - 37610170
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  37610274 aatgcttgaatcggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgattt 37610175  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  37610174 aattg 37610170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 22322687 - 22322791
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgtt-gattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| ||||||||| | |||  ||||| ||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||| |    
T  22322687 gaatgcttgaa-tggtgaaaccacatgtgatagttgatgttgaatgacattttttgattattgataatcatgttgatgtgagatgatgaatactatgaat 22322785  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  22322786 taattg 22322791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20568422 - 20568591
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||  | ||||||||||||    | | |  | |||||| |||| ||||    
T  20568422 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtgag 20568517  T
Q  101 a-atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20568518 acatg-ttgaaatggtgagactacatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 20568591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 20574615 - 20574784
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| | ||||||||  | ||||||||||||    | | |  | |||||| |||| ||||    
T  20574615 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattaatatgatgat-atcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtgag 20574710  T
Q  101 a-atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    | ||| |||||||||||| |||| |||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20574711 acatg-ttgaaatggtgagactacatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 20574784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 15320347 - 15320412
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15320347 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 15320412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 15500716 - 15500781
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  15500716 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 15500781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 22089731 - 22089796
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22089731 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 22089796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 4 - 71
Target Start/End: Original strand, 16406226 - 16406291
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  16406226 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttggatatgatatttatcatgagatgt 16406291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22908532 - 22908600
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22908532 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaattattgtattttggatatgatttttatcatgagat 22908600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 159
Target Start/End: Original strand, 33612255 - 33612372
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||| |  |||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  33612255 atgttggatatgatattgatcataagatgttgtgttttctcg-ttacttgtaatatgagaaatatttgaaatgatgaaactatatgatgtagtcgatgtt 33612353  T
Q  141 gcatgacattgttgattat 159  Q
    | | || |||| |||||||    
T  33612354 gaaagatattgatgattat 33612372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 18618186 - 18618138
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18618186 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18618138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 24930161 - 24930229
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||| |||||||  ||||||||||||    
T  24930161 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagat 24930229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Original strand, 17151288 - 17151335
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17151288 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17151335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18611513 - 18611449
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18611513 ttcttatatgactaagtgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 18611449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 24386863 - 24386930
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  ||||||| |||||||||||    
T  24386863 ttcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatgataattatcatgaga 24386930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 68
Target Start/End: Original strand, 22322598 - 22322657
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  22322598 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaga 22322657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 270585 - 270540
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  270585 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 270540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 645335 - 645380
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  645335 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 645380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 831070 - 831115
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  831070 ttgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 831115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 224301 - 224337
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  224301 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 224337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 700714 - 700750
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  700714 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 700750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 737924 - 737960
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  737924 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 737960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 861819 - 861855
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  861819 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 861855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 17 - 73
Target Start/End: Original strand, 31195514 - 31195570
Alignment:
Q  17 tgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttg 73  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||    |||||||||||||||||||||||||    
T  31195514 tgaagttgtatgaatgagttatgatatgaatgatatgatatttatcatgagatgttg 31195570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 141
Target Start/End: Original strand, 18042708 - 18042806
Alignment:
Q  43 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||  |||||||||| ||||| || ||| | ||||  |||||||| ||||||| |||||||    
T  18042708 tgttgaatatgatatttatcataaggtgttgtattttctcta-aacttggaatacgagaagtgtttggagtggttgaactatattatatagttgatgttg 18042806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 22144213 - 22144149
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  22144213 ttcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 22144149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 33171260 - 33171202
Alignment:
Q  43 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  33171260 tgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttctct-ttacttggaatatgagaa 33171202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 28556991 - 28556922
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  28556991 ttcttatatgactaa-tgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatgtttattatgagatgt 28556922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 19994318 - 19994376
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||||||||||| | |||||||||||||    
T  19994318 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttgaatatgatgtgtatcatgagatgt 19994376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 23836219 - 23836155
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 72  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  23836219 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttatatgttga-tatgatatttatcataagatgtt 23836155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 24107642 - 24107704
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  24107642 tatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 24107704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 79)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15442716 - 15442918
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15442716 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 15442814  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15442815 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 15442914  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  15442915 attg 15442918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 8e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 30263281 - 30263483
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30263281 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 30263379  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30263380 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 30263479  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  30263480 attg 30263483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 143; E-Value: 3e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 13912307 - 13912472
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  13912307 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttttcccc-attacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 13912405  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  13912406 gttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaaatgtgatggtgaatactatgatttaattg 13912472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11515094 - 11514926
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  11515094 tgattatatgttgaatatgatatctatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtt 11514996  T
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11514995 gatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 11514926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13757583 - 13757383
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |    | | |  ||||||||||||||||||    
T  13757583 ttcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatg---tatgctatattacttggaatatgag 13757487  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  13757486 aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattta 13757387  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  13757386 attg 13757383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 32495749 - 32495914
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  32495749 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttagaatatgagaatgcttaaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 32495846  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  32495847 gttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 32495914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 2191704 - 2191884
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||     
T  2191704 ttcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttattatgagatattgtttt--ccctattacttggaatatgat 2191801  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  2191802 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 2191884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 15952290 - 15952451
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15952290 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 15952387  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15952388 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 15952451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2027527 - 2027362
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttga-aatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||| |||  || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2027527 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgataattgtttagaatggtgaaactatatgatatagttga 2027430  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2027429 tgttcaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 2027362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7291823 - 7291662
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7291823 ttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 7291726  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7291725 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgattta 7291662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16417434 - 16417273
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16417434 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 16417337  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  16417336 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataattta 16417273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 16480130 - 16480295
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16480130 ttatatgttggatatgatatttgtcatgtgatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 16480227  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| ||||||    
T  16480228 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatgtaattg 16480295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 27102790 - 27102904
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  27102790 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27102888  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  27102889 tgaatactatgattta 27102904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 27110138 - 27110252
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  27110138 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27110236  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  27110237 tgaatactatgattta 27110252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 27175536 - 27175422
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  27175536 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 27175438  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  27175437 tgaatactatgattta 27175422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 38784882 - 38784996
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  38784882 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 38784980  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  38784981 tgaatactatgattta 38784996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 15761567 - 15761729
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttg-aaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  15761567 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttatttt--ccatcttacttggaatatgagaatgcttggaaatggtgaaactatatgtgatagtcgatgtt 15761664  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |  | | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15761665 gggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 15761729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 189
Target Start/End: Original strand, 26010389 - 26010535
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26010389 atgttgaatatgatatttgtgatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgtt 26010486  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaat 189  Q
    | |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  26010487 gaatgacattgtggattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaat 26010535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 2191890 - 2192051
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||| ||||| ||||||||||||||  |    
T  2191890 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatagtgaagctatatgatatagttaa 2191987  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2191988 tgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgattta 2192051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7821844 - 7821730
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||     
T  7821844 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgat-attatgttgatgtgtgatga 7821746  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  7821745 tgaatactatgattta 7821730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7829155 - 7829041
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||     
T  7829155 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgat-attatgttgatgtgtgatga 7829057  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  7829056 tgaatactatgattta 7829041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 13273760 - 13273589
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||||| |||| | ||    
T  13273760 ttcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgtt--ctcttacttagaatgtaag 13273663  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttg 173  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||    
T  13273662 aaatgcttgaaatggtaaaactatatgagttagttgatgttgaattacattgttgattattgatgatcatgttg 13273589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 112455 - 112656
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| || || ||| ||| |||||||| |||||||||||| |    | | |  | |||||| | || | ||    
T  112455 ttcttgtatgactaagtgaagttgtacgaatgaatggttgtattttggatatgataattatcatgagatatg---tatgctatcttacttaggatgtaag 112551  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || |||||||  |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  112552 aaatgcttgatttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattt 112651  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  112652 aattg 112656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 369891 - 369696
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||| | || | |   ||  ||||| |||| | ||    
T  369891 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgtgatct--tacttagaatgtaag 369797  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  369796 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaaggacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattt 369697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 16571248 - 16571418
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | ||    
T  16571248 ttcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaag 16571344  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16571345 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 16571418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 16594414 - 16594244
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||||   ||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | ||    
T  16594414 ttcttatatcactaagtgaagttgtatgaaagaatgattatatgttggatatgatgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaag 16594318  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16594317 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 16594244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3894099 - 3893900
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttcccta--ttacttggaatatg 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||     | | | |||  |||||| | || |     
T  3894099 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatg-----tgtacgctatcttacttaggatgta 3894005  T
Q  99 ag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgat 197  Q
    || |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||    
T  3894004 agaaatgcttgaagtggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgat 3893907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15629787 - 15629616
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||  ||||||| | ||  || |||||| |||| | ||    
T  15629787 ttcttatatgactaagtgaagtggtatgaatgaatga-tatatgttgaatataatgtttatcatggaatgttgtatgtt--ctcttacttagaatgtaag 15629691  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||||||||||||| | ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15629690 aaatgcttgaaatgataaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 15629616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 11286217 - 11286042
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||  || ||||||| | ||||||||||||| || | ||  ||  ||||| |||||| ||    
T  11286217 ttcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtat--tggatatgatgtgtatcatgagatgt-gtatgttatct--tacttagaatataag 11286123  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg 180  Q
     |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11286122 gaatgattgaaatggtgaaactatatgagatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtg 11286042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 45453416 - 45453607
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| |||| || | ||  ||  ||||| |||| | ||    
T  45453416 ttcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgagtgattatat-ttggatatgatgtttatcatgaaatgt-gtatattatct--tacttagaatgtaag 45453511  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
     |||||||||| |||  ||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  45453512 gaatgcttgaa-tgggaaaattatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 45453607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 13038362 - 13038465
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||    
T  13038362 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattta 13038461  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  13038462 attg 13038465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15851329 - 15851163
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  15851329 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 15851235  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15851234 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 15851163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 18981064 - 18981262
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    | | || | ||||||   || | ||    
T  18981064 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtg---tatgccatcttacttaagatgtaag 18981160  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||| ||||| | |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18981161 gaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatt 18981260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 49048949 - 49049120
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||||| |||| | ||    
T  49048949 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatgtgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgtt--ctcttacttagaatgtaag 49049046  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||||||||||||||| ||||| |||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||| |||| ||||||||||    
T  49049047 aaatgcttgaaatggtaaaactgtatgaggtagttgatgttgaatgacattgttaatta-tgatgatcatgttga 49049120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 142634 - 142432
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||  || | ||   | |||||| | || | ||    
T  142634 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatg-ggtatgtt--atcttacttaggatgtaag 142538  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| || ||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  142537 aaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgattatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatt 142438  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  142437 taattg 142432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 11582103 - 11582201
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||    
T  11582103 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaattg 11582201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 101 - 203
Target Start/End: Original strand, 39047947 - 39048049
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  39047947 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatggcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 39048046  T
Q  201 att 203  Q
    |||    
T  39048047 att 39048049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 12544967 - 12545063
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  12544967 gaatgcttgaaatggtgaaactatatttgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatga 12545063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 36051571 - 36051468
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  36051571 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattt 36051473  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  36051472 aattg 36051468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16210687 - 16210584
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||    
T  16210687 aatgtttgaattggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgttggtgaatactatgattta 16210588  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  16210587 attg 16210584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15926334 - 15926173
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||||||| |||| | ||| ||  ||| |||||||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  15926334 ttatatgttggatatgttaattttcatgagatattgtatgttctct--tacatggaatatgagaattgtttggagtggtgaaactatatgatatagttga 15926237  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  15926236 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgatgatgatgaatgctatgattta 15926173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 125829 - 125633
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| || ||||||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||    
T  125829 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat-ttga-tatgatgttaatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaag 125736  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  125735 gaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 125636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 7 - 187
Target Start/End: Original strand, 10862007 - 10862187
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| | ||   | |||||| |||| |||| ||| |    
T  10862007 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--atcttacttagaatgtgagaaatac 10862104  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgatta-ttgataatcatgttgaag-tgtgatggtga 187  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| ||||||||||| ||||| || ||||||| | |||||||||||    
T  10862105 ttgaaatggtaaaactatatga-atagttgatgttgaatgatattgttgattatttgatgattatgttgatgatgtgatggtga 10862187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 26071522 - 26071616
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  26071522 aatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatgatgaatactatga 26071616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 26095309 - 26095403
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  26095309 aatgcttgaaacggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatgatgaatactatga 26095403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Original strand, 13867339 - 13867429
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  13867339 aatgatgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 13867429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 106 - 203
Target Start/End: Original strand, 1938032 - 1938129
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||||| ||||||||||||    
T  1938032 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataataatgttgatgtgtaatgatgaatattatgatttaatt 1938129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3058941 - 3058852
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3058941 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatactgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 3058852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 12753885 - 12753718
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||| | | || ||    |||||| |||| | |    
T  12753885 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatc----ttacttagaatgtaa 12753792  T
Q  100 g-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
      ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12753791 ataatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgtt 12753718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 12249276 - 12249472
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||| |||||| || | ||  ||  ||||| | || | |||| |||    
T  12249276 tatgactaactaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcataagatgt-gtatgttatct--tacttaggatgtaagaaatgc 12249372  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  12249373 ttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgataatgaatcctatgatttgattg 12249472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 13912164 - 13912232
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  13912164 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 13912232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 32495606 - 32495674
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  32495606 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 32495674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 47288683 - 47288588
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  47288683 gaatgcttgaa-tggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatga 47288588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 11515340 - 11515272
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||    
T  11515340 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagat 11515272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 190
Target Start/End: Original strand, 15823662 - 15823751
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaata 190  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||    
T  15823662 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttaatatgtgatggtgaata 15823751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16417575 - 16417507
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  16417575 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 16417507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44864142 - 44864056
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||    
T  44864142 aatggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatcattgataatcatgctaatgtgtgatgatgaatactatga 44864056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7291966 - 7291898
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  7291966 ttcttgtatgactacgtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagat 7291898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11515200 - 11515092
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtg 134  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||  |||||     
T  11515200 tgattatatgttggatatgataattgccatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaatccttg-aatggtgaaactatatgtgatagtt 11515104  T
Q  135 gatgttgcatga 146  Q
    ||||||| ||||    
T  11515103 gatgttgaatga 11515092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 3048731 - 3048633
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||| ||| |||||| |||||| | ||  || |||||||| |||||||    
T  3048731 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattttggatatgata-ttaacatgaggtgttgtatgtt--ctcttacttggtatatgag 3048635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 9057802 - 9057952
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||  ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |      
T  9057802 tatgactaaatgaaaatgtgtgaatgaattgttatatgttga-tatgatacttatcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaataa 9057898  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  9057899 ttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatgttgatgattat 9057952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 15952149 - 15952215
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| || || ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  15952149 ttcttgtatgactaagcgaagttgtatgaatgaatgtttgta--ttgaatatgatgtttatcatgagat 15952215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 16210752 - 16210694
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  16210752 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tatgtgggatatgatatttatcatgagatgt 16210694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 15761510 - 15761558
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  15761510 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 15761558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 48354373 - 48354249
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |      
T  48354373 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttga-tatgataattatcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaatat 48354277  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  48354276 ttggagtggtgaaactatatgatgtagt 48354249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 39047861 - 39047919
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  39047861 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttggatatgatatttatcatgagatgt 39047919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Original strand, 42057461 - 42057522
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||   |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  42057461 atgatattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 42057522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9610274 - 9610150
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||  |||||||||| |||||| |      
T  9610274 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttga-tatgatatttatcatatgatgttgtatgttctct--tacttggaatgtgagaaatat 9610178  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  9610177 ttggactggtgaaactatatgatgtagt 9610150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 9837846 - 9837722
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||| | ||| ||  |||||||||| |||||| |      
T  9837846 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttga-tatgatatttatcatatgatgttgtatgttctct--tacttggaatgtgagaaatat 9837750  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  9837749 ttggactggtgaaactatatgatgtagt 9837722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 67
Target Start/End: Original strand, 13038290 - 13038351
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgag 67  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  13038290 ttgtataactaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tatgtgggatatgatgtttatcatgag 13038351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 26071427 - 26071488
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatg 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||    
T  26071427 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatg 26071488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 2 - 65
Target Start/End: Original strand, 26095214 - 26095275
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatg 65  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||    
T  26095214 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatg 26095275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 102
Target Start/End: Original strand, 9322230 - 9322288
Alignment:
Q  43 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||  ||||| || ||||||||||||||||||    
T  9322230 tgttgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttctct-ttacttggaatatgagaa 9322288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Original strand, 7285374 - 7285436
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||| ||||||    
T  7285374 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcttgagat 7285436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 13376623 - 13376572
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||  ||||||||||||||||||    
T  13376623 atatgatatttatcatgtgatgttgtatgttccc--ttacttggaatatgagaa 13376572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 17 - 71
Target Start/End: Original strand, 13867249 - 13867303
Alignment:
Q  17 tgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13867249 tgaagttgtatgaatgaatgattgttttttggatatgatgtttatcatgagatgt 13867303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 11582034 - 11582092
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| |||| || |||||||||| ||||    
T  11582034 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattata--ttggatataatgtttatcatgaaatgt 11582092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 14252362 - 14252420
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  14252362 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttggatatgatgtttatcatgagatgt 14252420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 47288766 - 47288712
Alignment:
Q  13 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  47288766 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 47288712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 77)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 21234679 - 21234881
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21234679 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 21234777  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234778 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 21234877  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  21234878 attg 21234881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20615617 - 20615415
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20615617 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttctcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 20615519  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20615518 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgatacatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 20615419  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  20615418 attg 20615415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 37051989 - 37051787
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  37051989 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatatttctcatgagatgttgttttttcc-tattacttggaatatgag 37051891  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37051890 aatgcttggaatggtgaaactatatgatatagctgatgttgcatgacattgttgactattgataattacgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 37051791  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  37051790 attg 37051787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 4201276 - 4201441
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4201276 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 4201374  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4201375 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 4201441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 142; E-Value: 1e-74
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 25901633 - 25901801
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtg 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25901633 tgattatatgttgaatatgatatctatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtt 25901731  T
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25901732 gatgttgcttgacattgttaattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 25901801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 7424646 - 7424484
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  7424646 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 7424548  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  7424547 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgattta 7424484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 1169857 - 1170013
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| |||||||    
T  1169857 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttg 1169954  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1169955 aatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 1170013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 11341607 - 11341439
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341607 tgattatatgttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 11341510  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11341509 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 11341439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 35792276 - 35792456
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||     
T  35792276 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatattg--ttttccctattacttggaatatgat 35792373  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  35792374 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 35792456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 18779303 - 18779466
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18779303 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttt-ccctattagttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 18779401  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatg-ttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||    
T  18779402 tgttgaatgacattgttgattatcgataatcatgattgatgggtgatggtgaatactatgattta 18779466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 9731977 - 9732142
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  9731977 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 9732074  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9732075 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 9732142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11316 - 11155
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11316 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 11219  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11218 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 11155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 1221042 - 1221203
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  1221042 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttatatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 1221139  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  1221140 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 1221203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 21074800 - 21074961
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21074800 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 21074897  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21074898 tgttgaacgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 21074961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 22367795 - 22367956
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22367795 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagctgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 22367892  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22367893 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 22367956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 27185025 - 27185190
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  27185025 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttctc--tattacttggaatatgagaatgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 27185122  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  27185123 gttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgaagatgaatgctatgatttaattg 27185190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 11582844 - 11582683
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| | | ||| ||  |||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  11582844 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttatatgttctct--tacttgtaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 11582747  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  11582746 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 11582683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25425587 - 25425426
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgctt-gaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||  ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25425587 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatct--tacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttga 25425490  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25425489 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 25425426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 110290 - 110458
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  110290 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tccttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 110387  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  110388 tgatgttggatgacattgttgattattaataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttgattg 110458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 96; E-Value: 3e-47
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Original strand, 10779487 - 10779651
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgctt-gaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||  || | ||||||||||||||||||||||||    
T  10779487 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagt 10779584  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||    
T  10779585 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatattatgattta 10779651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 17473084 - 17473245
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  || ||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17473084 atgttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tatttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttaatgtt 17473181  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | ||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17473182 gaatgatgttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 17473245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 29191931 - 29192092
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||  | |||||||| |||||||||| | ||| | |||||||||||||||||||||| ||    
T  29191931 ttatatgttggatatgatatttgtcacgagatgttgtatgttc--ttttacttgggatatgagaattgtttggagtggtgaaactatatgatatagttga 29192028  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  29192029 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 29192092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16535308 - 16535110
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  16535308 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 16535214  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16535213 aaatgctt-aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattt 16535115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 22884459 - 22884653
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||| | | || ||    |||||||||||||||    
T  22884459 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtatatgttatc----ttacttggaatatga 22884552  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  | ||| ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  22884553 gaatgcttgaattggtg-aactatatgtgacagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatt 22884651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 23513765 - 23513607
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| |||  ||||| |||    
T  23513765 ttatattttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgtttgaattggtaaaactaaatgtgatagttgat 23513668  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgat 197  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  23513667 gttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgattactatgat 23513607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19498766 - 19498604
Alignment:
Q  31 tgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgct-tgaaatggtgaaactatatgata 129  Q
    ||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||  | || ||||||||||||||||||||    
T  19498766 tgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattatctggaatggtgaaactatatgata 19498669  T
Q  130 tagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||      |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498668 tagttgatg------gacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 19498604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 21933519 - 21933633
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  21933519 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 21933617  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  21933618 tgaatactatgattta 21933633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 21939689 - 21939803
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  21939689 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 21939787  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  21939788 tgaatactatgattta 21939803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 35581173 - 35581059
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||     
T  35581173 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgctaat-atgttgatgtgtgatga 35581075  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  35581074 tgaatactatgattta 35581059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 37010523 - 37010637
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  37010523 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 37010621  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
     |||||||||||||||    
T  37010622 cgaatactatgattta 37010637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 25901493 - 25901635
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||    
T  25901493 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatacgatgtttatcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgag 25901590  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    ||| |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  25901591 aatccttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatga 25901635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 198
Target Start/End: Original strand, 43445069 - 43445223
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  43445069 atgttgaatataatatttatcatgtgatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgctcgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 43445165  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatt 198  Q
     ||  |||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  43445166 aatatcattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatt 43445223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 24184368 - 24184564
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||||||| |||||||||||   |||| | | |  | |||||| |||| | ||    
T  24184368 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgag---ttgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 24184464  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||    
T  24184465 gaatgcttgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattccatgattt 24184564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21649835 - 21649635
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    | | |  | ||||||   || | ||    
T  21649835 ttcttgtatgactaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtg---tatgctatcttacttaagatgtaag 21649739  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  21649738 gaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatcgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgattt 21649639  T
Q  200 aatt 203  Q
    ||||    
T  21649638 aatt 21649635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21393087 - 21392997
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21393087 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 21392997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 25192397 - 25192472
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25192397 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 25192472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 11212980 - 11213078
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  11212980 ttgaattggtgaaactatatgcgataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatctaattg 11213078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 1169671 - 1169848
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||  |||||||||||| | || | |  | | |||||| |||| | ||    
T  1169671 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgattatcatgagatat-gtatgt--catcttacttagaatgtaag 1169765  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1169766 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1169848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 4864261 - 4864071
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||||| || | ||  ||  ||||| | || | |||| ||||||     
T  4864261 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt--tggatatgatatttatcatgagatgt-gtatgttatct--tacttaggatgtaagaaatgcttgt 4864167  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  4864166 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 4864071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 18 - 200
Target Start/End: Original strand, 21652574 - 21652754
Alignment:
Q  18 gaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtg 116  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | || |||| ||||| |||||    
T  21652574 gaagttgtatgaatgaatgattgtagtttgaatatgatgtttatcatgagatgta---tatgctatcttacttaggatgtaaggaatgtttgaattggtg 21652670  T
Q  117 aaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| |  |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21652671 aaactatacgtgatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 21652754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 19404586 - 19404416
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| || ||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  19404586 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtt-atcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 19404491  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || ||||||||||||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19404490 aaatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 19404416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 20711045 - 20710950
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  20711045 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatgatgaatactatga 20710950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23453958 - 23453786
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||| | ||  || |||||| | || | ||    
T  23453958 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtt--ctcttacttaggatgtaag 23453861  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23453860 aaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttga 23453786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23465463 - 23465291
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||||  ||||||| | ||  || |||||| | || | ||    
T  23465463 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattaaatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtatgtt--ctcttacttaggatgtaag 23465366  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23465365 aaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgattttgaatgacattgttggtttttgatgatcatgttga 23465291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 23505733 - 23505645
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttg 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  23505733 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtaattatattttggatatgatgattatcatgagatgttg--ttttccctattacttg 23505645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 17472897 - 17473075
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| ||||||||||||||     | | |  | |||||| | || | ||    
T  17472897 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgag---tatgctatcttacttaggatgtaag 17472991  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    || |||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  17472992 aaatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 17473075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 25425731 - 25425593
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||||| | ||   | |||||| |||| | |     
T  25425731 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgtt--atcttacttagaatgtaag 25425634  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  25425633 gaatgcttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 25425593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 28258604 - 28258408
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||||  || | ||    
T  28258604 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttgagatgtaag 28258510  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacatt-gttgattattgataatcatg-ttgaagtgtgatggtgaatactatgat 197  Q
     |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  28258509 gaatgattgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacatttgttgattaatgataatcatgattgatgtgtgatggtgaatactatgat 28258411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 1220899 - 1220967
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1220899 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 1220967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 4201133 - 4201201
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  4201133 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 4201201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 27184882 - 27184950
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  27184882 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 27184950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Original strand, 11338021 - 11338218
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||| | ||||    | | |  | |||||| |||  | ||    
T  11338021 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgattgattgtagtttggatatgatgtttatcataaaatgtg---tatgctatcttacttagaaggtaag 11338117  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    || |||||||||||||| |||||||||| |||||  |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||    
T  11338118 aaatgcttgaaatggtgcaactatatgagatagttaatgttgaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtagtgatgatgaatcttatgatt 11338217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 11341744 - 11341605
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||   ||| | | |  | ||||||||||||||||    
T  11341744 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgaga---tgtatatgctatcttacttggaatatgag 11341650  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  11341649 aatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 11341605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22367652 - 22367720
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  22367652 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagat 22367720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 149 - 204
Target Start/End: Original strand, 35792553 - 35792608
Alignment:
Q  149 ttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35792553 ttgttgattattgataatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 35792608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 23513908 - 23513840
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  23513908 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatgtttaccatgagat 23513840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 11457 - 11389
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  11457 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 11389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 10779349 - 10779417
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  10779349 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 10779417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 69
Target Start/End: Original strand, 18779161 - 18779228
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18779161 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagat 18779228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 29191790 - 29191858
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  29191790 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 29191858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23327823 - 23327758
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23327823 gatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 23327758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 38 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 37982411 - 37982287
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||    
T  37982411 ttatatgtaggatatgatatttatcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagttga 37982314  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  37982313 tgttgaatgatgttgatgattattgat 37982287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24595363 - 24595306
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24595363 atgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 24595306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 24474443 - 24474398
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24474443 ttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 24474398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 49 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 3672962 - 3672849
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |  || ||  ||| ||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  3672962 atatgatatttatcataagatgttgtatgctctct--tacctggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatttagttgatgttgaatgat 3672865  T
Q  148 attgttgattattgat 163  Q
    |||| |||||||||||    
T  3672864 attgatgattattgat 3672849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23510991 - 23510794
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||  || | ||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||   |||||| | |||| | |     
T  23510991 ttcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgaatga--atgtattggatatgatgtttatcatgagatg-tgtatgtt--atattac-tagaatgtaag 23510898  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||| |||||  |||||||||| |||  ||||| |||| ||| ||  ||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| ||||||||    
T  23510897 gaatgtttgaatcggtgaaactaaatgtgatagttgatgattgaatagcattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgatt 23510800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Original strand, 5452008 - 5452132
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |  ||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||  |  |||| ||||||| ||||     
T  5452008 atatgatatttatcatgtgatgttgtatgt--cctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatacaaggtagttgatgttgaatgat 5452105  T
Q  148 attgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    | |||||||||||||| || |||||||    
T  5452106 actgttgattattgatgattatgttga 5452132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 23493050 - 23492930
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||| ||||     
T  23493050 tatgactaagtagagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaaatga 23492953  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    ||| | || ||||||||||||||    
T  23492952 ttggagtgatgaaactatatgat 23492930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 9731836 - 9731902
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  9731836 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 9731902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 21616016 - 21615884
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||| ||| ||||| ||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||      
T  21616016 tatgaataaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaaataa 21615920  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
     || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  21615919 atggaatggtgagactatatgaaatagttgatgttg 21615884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Original strand, 43445013 - 43445049
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43445013 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 43445049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 431440 - 431320
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    |||||||||||  || ||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||||||| |||| ||||     
T  431440 tatgactaagtagagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcattagatgttgtatgtt--cttttacttggaatgtgagaaatga 431343  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    ||| | || ||||||||||||||    
T  431342 ttggagtgatgaaactatatgat 431320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28901078 - 28901007
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28901078 cttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcataagatgttgt 28901007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 28937473 - 28937402
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  28937473 cttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcataagatgttgt 28937402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 19861186 - 19861095
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| |||  ||||||||||||| ||||   || |||||||| ||||||||| ||||| |||||||    
T  19861186 atatgatatttatcataagatgttgtatgttctcta--acttggaatatgaggaataaatggaatggtgagactatatgacatagttgatgttg 19861095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 118
Target Start/End: Original strand, 35792462 - 35792541
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaa 118  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  35792462 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaa 35792541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 19498862 - 19498830
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19498862 atgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgt 19498830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 75)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10487673 - 10487471
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  10487673 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 10487575  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10487574 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 10487475  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  10487474 attg 10487471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 16329078 - 16329280
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16329078 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 16329176  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16329177 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 16329276  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  16329277 attg 16329280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 22355756 - 22355920
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22355756 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttctc--tattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 22355853  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22355854 gttgaatgacattgttgaatattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 22355920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 139; E-Value: 7e-73
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26679000 - 26678835
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  26679000 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 26678902  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||| |||||    
T  26678901 gttgcatgacattgttgattattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatatcatgattaaattg 26678835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 123; E-Value: 2e-63
Query Start/End: Original strand, 38 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 14950984 - 14950821
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  14950984 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 14950887  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||    
T  14950886 gttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgatttaatt 14950821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 7133641 - 7133805
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  7133641 ttatatgttggttatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 7133738  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  7133739 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgcgatggtgaatactatgatttgattg 7133805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 15288200 - 15288362
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15288200 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 15288298  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  15288299 tgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgattta 15288362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14995197 - 14995000
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  14995197 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgag 14995100  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||    
T  14995099 aatgcttg-aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgattt 14995001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18167756 - 18167596
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  18167756 ttatatgttggatatgatatttatcatgatatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatggttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 18167659  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18167658 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 18167596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 15295310 - 15295472
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15295310 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgctgttttt-ccctattacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 15295408  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||    
T  15295409 tgttgaatgacattgttgattattcataatcatgttgataggtgatggtgaatactatgattta 15295472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18109858 - 18110038
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||     
T  18109858 ttcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttataatgagatattgtttt--ccctattacttggaatatgat 18109955  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18109956 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18110038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 19999527 - 19999331
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  19999527 ttcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgag 19999432  T
Q  101 aat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19999431 aattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattt 19999332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 15273951 - 15274116
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15273951 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 15274048  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15274049 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 15274116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8373323 - 8373155
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  8373323 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 8373226  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8373225 tgatgttgaatgacattgttggttattgataatcatgttgcggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 8373155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 9294493 - 9294325
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  9294493 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatattagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 9294396  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  9294395 tgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 9294325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18247153 - 18246992
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18247153 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttaggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 18247056  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18247055 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 18246992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 5684097 - 5684259
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatattt-atcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  5684097 atgttgaatatgatattttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 5684194  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5684195 gaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 5684259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 7 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 34394194 - 34394020
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgct 106  Q
    |||||||||||| || | | ||| ||| || ||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  34394194 tatgactaagtggagatatgtgattgaatggttacatgttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgct 34394097  T
Q  107 tgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  34394096 tgaaatggtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 34394020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 42 - 171
Target Start/End: Original strand, 18294363 - 18294490
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18294363 atgttgaatatgatatttatcttgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 18294460  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgt 171  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||    
T  18294461 aataacattgttgattattgatgatcatgt 18294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 47356287 - 47356131
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||  ||||| |||||||    
T  47356287 atgttgaatataatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagaatgcccgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttg 47356191  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  47356190 aataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 47356131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 40 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15212307 - 15212143
Alignment:
Q  40 atatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg 138  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15212307 atatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgataaatgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatg 15212210  T
Q  139 ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||    
T  15212209 ttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgatttaattg 15212143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16521789 - 16521594
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||| | || | |   ||  ||||| |||| | ||    
T  16521789 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgtgatct--tacttagaatgtaag 16521695  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  16521694 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgattt 16521595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 23271161 - 23271276
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||     
T  23271161 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttggataacattgttgattattgataatcatgttgttgtgcgatga 23271260  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||| ||||||    
T  23271261 tgaatactacgattta 23271276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18294174 - 18294354
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||  |||||||||||| |    | | |  | ||||||||||| | ||    
T  18294174 ttcttgtataactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatttttgatatgatgattatcatgagatatg---tatgctatcttacttggaatgtaag 18294270  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||||||||||| |||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18294271 gaatgcttgaaatcgtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18294354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34394011 - 34393855
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| | |     || ||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  34394011 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatgtaa-----ctggaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 34393919  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  34393918 aataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 34393855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 110371 - 110282
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  110371 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 110282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 821270 - 821460
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||| ||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  821270 ttcttatatgaccaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaaatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 821364  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
     ||| |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  821365 gaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatga 821460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13245440 - 13245252
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaa 110  Q
    ||||||||||  ||||||||||  ||||||| |  || ||||||||||||||||||||||| || | ||  ||  ||||| |||| | ||||   |||||    
T  13245440 actaagtgaaaatgtatgaatggatgattattt--tggatatgatatttatcatgagatgt-gtatgttatct--tacttagaatgtaagaaatgttgaa 13245346  T
Q  111 atggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13245345 ttggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatttgtgatgatgaatactatgatttaattg 13245252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 13810774 - 13810946
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||  || |||||| |||| | ||    
T  13810774 ttcttatatgactaagtgaagttgtatggatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgtt--cttttacttagaatgtaag 13810871  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||||||||||||| | ||| ||| | |  |||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| ||||||||||    
T  13810872 aaatgcttgaaatgataaaattatctcaggtagtggatgttgaatgacgttgttgattgttgatgatcatgttga 13810946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 53706043 - 53706146
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||    
T  53706043 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttggtgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattta 53706142  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  53706143 attg 53706146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 5683911 - 5684088
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  5683911 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 5684005  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||    
T  5684006 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatttttatgtgtgatg 5684088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 5 - 196
Target Start/End: Original strand, 12900931 - 12901120
Alignment:
Q  5 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-t 103  Q
    ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | |||| |    
T  12900931 tgtatgactaattgaagttgtataaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagatgta---tatgctatcttacttaggatgtaagaaat 12901027  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||    
T  12901028 gcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtttaatgatattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatgctatga 12901120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 33739255 - 33739075
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | || |||||||||    
T  33739255 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttga 33739161  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    | ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||| ||||||||||||||    
T  33739160 a-tggtgaagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgaaggtgaatactatga 33739075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8044180 - 8044060
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatg 183  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||| || || |||||||||| ||| |||||    
T  8044180 ttacttggaatatgaaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattgtttatgatcatgttgaggtgatgatg 8044081  T
Q  184 gtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  8044080 atgaatgctatgatttaattg 8044060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 25120280 - 25120478
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||   || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||    
T  25120280 ttcttgtatgactaagtgaatttgtatgaatgaatgattataa--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaag 25120373  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  25120374 gaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgacgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 25120473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 42 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 8373422 - 8373321
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  8373422 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttctctcttacttggaatatgagaatgc-tggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 8373326  T
Q  142 catga 146  Q
     ||||    
T  8373325 aatga 8373321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 26679143 - 26679075
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  26679143 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 26679075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 8873775 - 8873850
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  8873775 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttaattg 8873850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 45460114 - 45460313
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||  || ||||||| ||||||||||| ||| || | ||  ||  ||||| |||| | ||    
T  45460114 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgattaaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgaggtgt-gtatgttatct--tacttagaatgtaag 45460208  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||||    
T  45460209 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatcttatgatt 45460307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 53909051 - 53909126
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  53909051 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattg 53909126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Original strand, 21960732 - 21960920
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaat--atgagaatg 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||| ||| |||||| |||||||| || |  | |||  ||||| ||||  ||| |||||    
T  21960732 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatacgatgtttatcttgagatgt-gtatgctacct--tacttagaatgtatg-gaatg 21960825  T
Q  105 cttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||    
T  21960826 cttgaa-tggtgaaactatatgtaatagttgatgttaaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgattta 21960920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Original strand, 15014430 - 15014574
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||      
T  15014430 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttctct-ttacttggaatatgagaaatat 15014528  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattg 151  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  15014529 ttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattg 15014574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 18251104 - 18251172
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||||||||    
T  18251104 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggaaatgatgtttatcatgagat 18251172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 38 - 171
Target Start/End: Original strand, 18110044 - 18110176
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||| |||| | ||| |||||| || ||||||||||||||  |    
T  18110044 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgggaattgtttggaatggttaagctatatgatatagttaa 18110141  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgt 171  Q
    ||||| ||||  |||||||||||||||||||||||    
T  18110142 tgttgaatgatgttgttgattattgataatcatgt 18110176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 44054922 - 44054732
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||   | | | | |  | |||||| |||| | ||    
T  44054922 ttcttatatgactaagtgaagttatatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcacgaga---tatgtatgctatcttacttagaatgtaag 44054828  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
     |||||||| ||||||||| ||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||    
T  44054827 aaatgcttg-aatggtgaagctaaatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatga 44054732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 9794343 - 9794245
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||| |||||| |||||| | ||  || |||||||| |||||||    
T  9794343 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgactatatgttggatatgata-ttaacatgaggtgttgtatgtt--ctcttacttggtatatgag 9794247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 10643092 - 10642988
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  10643092 gaatgcttgaa-tggtggaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatt 10642994  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  10642993 taattg 10642988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 30233796 - 30233869
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30233796 aatgcttgaaatggcgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatagtcatgttga 30233869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 42 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 19019381 - 19019316
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  19019381 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagagtgcttga 19019316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 22355613 - 22355681
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||| |||||    
T  22355613 ttcttgtatgattaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcacgagat 22355681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 18247294 - 18247226
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  18247294 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 18247226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44345734 - 44345629
Alignment:
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| | || |||| | ||||| |||||||    
T  44345734 agaatgcttgaa-tgttgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattaataatcatgttaatgtggtgaagatgaatgctatgat 44345636  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  44345635 ttaattg 44345629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Original strand, 18495659 - 18495732
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  18495659 aatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttgttgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 18495732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 26338353 - 26338288
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  26338353 gatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 26338288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 54119430 - 54119618
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||| ||||||||    |   |  | |||||| |||| | ||    
T  54119430 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttatcttgagatgtg---taagctatcttacttagaatgtaag 54119524  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||   ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | ||||||||||||||          |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  54119525 aaatgttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaatgacattgttgat----------catgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 54119614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 18167898 - 18167827
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||| ||||||| ||||||||||    
T  18167898 ttcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgagtgattgta--ttggatatgatgtttatcaagagatgttgt 18167827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 7133499 - 7133570
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  7133499 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgttgt 7133570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 53705978 - 53706036
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53705978 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattata--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 53706036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 19019438 - 19019390
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  19019438 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 19019390  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 8373478 - 8373431
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  8373478 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 8373431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 19698521 - 19698585
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19698521 ttcttatatgactaagtgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 19698585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 19709106 - 19709170
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||    ||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  19709106 ttcttatatgactaagtgaagttg----aatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 19709170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 8873715 - 8873773
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  8873715 actaagtgaagttatatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttatcatgagatgt 8873773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 15043897 - 15043789
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||   || |||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  15043897 atatgatatttatcataagatgtttatgtt---ctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgat 15043801  T
Q  148 attgttgattat 159  Q
    |||| |||||||    
T  15043800 attgatgattat 15043789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Original strand, 15110527 - 15110635
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||  | ||   || |||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  15110527 atatgatatttatcataagatgtttatgtt---ctcttacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgat 15110623  T
Q  148 attgttgattat 159  Q
    |||| |||||||    
T  15110624 attgatgattat 15110635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 15273810 - 15273876
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15273810 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 15273876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 159
Target Start/End: Original strand, 41257517 - 41257665
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttga 109  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||| ||||||| || ||| |  |||||||| || |||||||||||| || |  |||     
T  41257517 actaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgataattatcataaggtgtggcattttccct-ttgcttggaatatgaaaaatatttgg 41257615  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    | ||||||||||||||||| || | ||||||| |||| |||| |||||||    
T  41257616 agtggtgaaactatatgatgtatttgatgttgaatgatattgatgattat 41257665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 9 - 167
Target Start/End: Complemental strand, 14900486 - 14900330
Alignment:
Q  9 tgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgctt 107  Q
    ||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| || ||||| || |||||||||||||| | ||  || ||| ||| |||| ||||| |  ||    
T  14900486 tgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatgtgata-ttgtcatgagatgttgtgtgtt--ctcttatttgaaatacgagaattattt 14900390  T
Q  108 gaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatc 167  Q
    | |||||||||||||| |||||||||   ||||| ||||  ||  |||||||||||||||    
T  14900389 ggaatggtgaaactatgtgatatagttattgttgaatgatgttagtgattattgataatc 14900330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 136 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 47356343 - 47356307
Alignment:
Q  136 atgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47356343 atgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 47356307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 110449 - 110391
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  110449 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 110391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Original strand, 34197365 - 34197427
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||    
T  34197365 ttatgtgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 34197427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 53908970 - 53909028
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  53908970 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttggatatgatgtttatcatgagatgt 53909028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 55377742 - 55377808
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  55377742 ttcttatatgactaagtgaagttgtaaaattgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagat 55377808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 18275848 - 18275724
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| |||||  || ||||||| |  ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||| ||||||||| |||      
T  18275848 tatgactaaatgaagaggtgtgaatgaattgttatacgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttagaatatgagaaatat 18275752  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| | |||||||||||| |||||||||    
T  18275751 ttggagtggtgaaactatgtgatatagt 18275724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 49 - 128
Target Start/End: Original strand, 41167154 - 41167231
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    ||||||||||||||||| |||||||  | || ||  ||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||||||||    
T  41167154 atatgatatttatcatgtgatgttgaatgtttcc--ttacttgaaatatgagaataattggagtggtgaaactatatgat 41167231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 168; Significance: 3e-90; HSPs: 67)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 14907592 - 14907794
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14907592 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgag 14907690  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14907691 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 14907790  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  14907791 attg 14907794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 168; E-Value: 3e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23819182 - 23818980
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23819182 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 23819084  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23819083 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 23818984  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  23818983 attg 23818980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 155; E-Value: 2e-82
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20014122 - 20013923
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||    
T  20014122 ttcttgtatgactaagtgaatttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgtt----tttccctattacttggaatatgag 20014027  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20014026 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 20013927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 3800304 - 3800465
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3800304 ttatatgttgaatatgatatttatcaagagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 3800402  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  3800403 gttgcatgacatggttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 3800465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34823167 - 34822999
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34823167 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttcgct--tacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 34823070  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34823069 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 34822999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 112; E-Value: 9e-57
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 12727022 - 12726854
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12727022 tgattatatgtcggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 12726925  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12726924 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactaagatttaattg 12726854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 200
Target Start/End: Original strand, 12637333 - 12637517
Alignment:
Q  13 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||    
T  12637333 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaa 12637428  T
Q  112 tggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12637429 tggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 12637517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 12643216 - 12643381
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  12643216 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 12643313  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12643314 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 12643381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 21275718 - 21275879
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21275718 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 21275815  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21275816 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 21275879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21140841 - 21140680
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgctt-gaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  21140841 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattatttggaatggtgaaactatatgatatagttga 21140744  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21140743 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 21140680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 2 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 25600964 - 25600772
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga 101  Q
    |||||||||||||| || || ||| ||||||| |  |||| || || |||||||||||||||| |||| |||| | ||| ||  ||||||||||||||||    
T  25600964 tcttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgctggatatgatatttatcataagatattgtatgttctct--tacttggaatatgaga 25600867  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25600866 atgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 25600772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 41 - 200
Target Start/End: Original strand, 19887974 - 19888132
Alignment:
Q  41 tatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgt 139  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| || ||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19887974 tatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatgtgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgt 19888071  T
Q  140 tgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19888072 tgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 19888132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 92; E-Value: 7e-45
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 5889534 - 5889649
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5889534 ttacttggaatatgagagtgcttgaaatggtgaaactatacggtatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg 5889633  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  5889634 tgaatactatgattta 5889649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8942649 - 8942452
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  8942649 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgag 8942554  T
Q  101 aat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  8942553 aattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgatt 8942454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 11232491 - 11232605
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  11232491 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 11232589  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  11232590 tgaatactatgattta 11232605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 22514338 - 22514452
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  22514338 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 22514436  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  22514437 tgaatactatgattta 22514452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 31 - 200
Target Start/End: Original strand, 24827753 - 24827922
Alignment:
Q  31 tgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgata 129  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||||||  |    
T  24827753 tgagtgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaataggagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtga 24827850  T
Q  130 tagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||    
T  24827851 tagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgattta 24827922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 1e-37
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 28776939 - 28777053
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  28776939 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 28777037  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||||||||    
T  28777038 tgaattctatgattta 28777053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 4449386 - 4449581
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||||||| |||||||||||   |||| | | |  | |||||| |||| | ||    
T  4449386 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgag---ttgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 4449482  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    || |||||||||||||||||| ||| || |||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  4449483 aaatgcttgaaatggtgaaaccataggagataaatgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatt 4449581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8887041 - 8886943
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  8887041 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 8886943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 22581094 - 22581259
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| | ||  || |||||| |||| | || |||||    
T  22581094 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatg-tgtatgtt--ctcttacttagaatgtaagaaatgc 22581190  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  22581191 ttgaattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcatgttga 22581259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 38 - 140
Target Start/End: Original strand, 3800197 - 3800297
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||| |||    
T  3800197 ttatatgttgaatatgatatttatcaagagatgttg-tttttccctattacttggaatatgagaatgcttg-aatagtgaaactatatgtgatagttgat 3800294  T
Q  138 gtt 140  Q
    |||    
T  3800295 gtt 3800297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 36891963 - 36892058
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  36891963 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagtcgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatg-tgatgtgtgatgatgaatactatga 36892058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22273886 - 22273688
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||    
T  22273886 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaag 22273793  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22273792 gaatgattgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 22273693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 24572546 - 24572717
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||  || |||||||||| ||| | ||  || |||||| |||| |||     
T  24572546 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattatatgttggatatgatgcttgtcatgagatg-tgtatgtt--ctcttacttagaatgtgag 24572642  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  24572643 gaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagtagatgtcgaatgacattgttgatttttgatgatcatgttga 24572717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 44 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 24967259 - 24967104
Alignment:
Q  44 gttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgc 142  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||| | | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||||     
T  24967259 gttggatatgatatttgtcaagagatgttatatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttaatgttga 24967162  T
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||    
T  24967161 atgatgttgttgattattgataatcatgataacgtgtggtgatgaatactatgattta 24967104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22283119 - 22282921
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||| ||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||    
T  22283119 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcttgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaag 22283026  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| ||   ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  22283025 gaatgtttgaattggtgaaactaaatttgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 22282926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 39 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 7320456 - 7320322
Alignment:
Q  39 tatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||| | ||| ||  ||||| |||| | |||| ||||||||||||| |||||||||||  |||| |||    
T  7320456 tatatgttggatatgatgtttatcatgggatgttgtatgttctct--tacttagaatgtaagaaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgat 7320359  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  7320358 gttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 7320322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 115 - 204
Target Start/End: Original strand, 43644243 - 43644332
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  43644243 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgatttaattg 43644332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 461642 - 461539
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||   ||||  ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  461642 aatgtttgaattggtgaaactatatctgatagctgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattta 461543  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  461542 attg 461539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 22787181 - 22787353
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||| || |||| ||||    
T  22787181 ttcttatatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttgaatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttaattagaatgtgag 22787278  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||| |||||||| || |||| ||||||  |||| ||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||||    
T  22787279 aaatacttgaaattgtaaaaccatatgaggtagttgatgttgaatgatattgtggattattgatgatcatgttga 22787353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 110 - 204
Target Start/End: Original strand, 25877212 - 25877307
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacatt-gttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||| |||||||    
T  25877212 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattcgttgattattgataatcatgttgatgtgtgataatgaatactatgaattaattg 25877307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22862388 - 22862290
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22862388 ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatattgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattg 22862290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 28 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 721460 - 721315
Alignment:
Q  28 gaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatg 126  Q
    |||||| || ||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | |  ||| |||||| |||| |||||| | ||||||||||| ||||||||||    
T  721460 gaatgaatggttatatgttgaatgtgatatttgtcataagatgttgtatgt--cctcttacttagaatgtgagaaatacttgaaatggtaaaactatatg 721363  T
Q  127 atatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  721362 aggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgttga 721315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 20628656 - 20628751
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20628656 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgtcattgttgattattgataatca---tgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 20628751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 34823304 - 34823165
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||   ||| | | |  | ||||||||||||||||    
T  34823304 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgaga---tgtatatgctatcttacttggaatatgag 34823210  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  34823209 aatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 34823165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15632359 - 15632199
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| |||||||||| ||||| | | ||||| |||||  | |||||||| ||||||||     ||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15632359 atgttggatatgatattaatcataatacgttgtgttttct-tgttacttgggatatgagatataatgaaatgatgaaactatttgatatagtg-atgttg 15632262  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||  | |||||||||||||||||||||| | ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  15632261 aatgatgtcgttgattattgataatcatgttaatgtgggatgatgaatactatgatttaattg 15632199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16900364 - 16900207
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  |||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | || ||    
T  16900364 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgggtatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaaggaa 16900270  T
Q  103 tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16900269 tgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16900207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 4 - 165
Target Start/End: Complemental strand, 16993755 - 16993598
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  ||  |||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | || ||    
T  16993755 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgggtatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaaggaa 16993661  T
Q  103 tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataa 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||  |||||| ||||||||||||||||    
T  16993660 tgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttaaatgacaatgttgattattgataa 16993598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12727265 - 12727126
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||   ||| | | |  | ||||||||||||||||    
T  12727265 ttcttgtatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgaga---tgtatatgctatcttacttggaatatgag 12727171  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||    
T  12727170 aatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagttgatgttgaatga 12727126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19658925 - 19658805
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| || | ||||||    
T  19658925 atgttggatatgatatttatcatgagatgttgtatttt--cttttacttggaatatgagaaatatttgaattggtgaaactatatgatgtatttgatgtt 19658828  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgat 163  Q
    | |||| |||  |||| ||||||    
T  19658827 gaatgatattaatgatcattgat 19658805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 19887830 - 19887898
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19887830 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 19887898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 6878447 - 6878246
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||| |||| || | ||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | ||    
T  6878447 ttcttatataactaagtgaagttgtgtgaacgaataattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaag 6878351  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    || |||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||| ||||| ||||||||    
T  6878350 aaatgcttgaattgttgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggcgatgatgaatgctatgatt 6878251  T
Q  199 taatt 203  Q
    |||||    
T  6878250 taatt 6878246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 21140982 - 21140916
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||    
T  21140982 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagat 21140916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 35 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 12727128 - 12727020
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtg 134  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||  |||||     
T  12727128 tgattatatgttggatatgatgtttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaatgcttgaattggtg-agctatatgtgatagtt 12727032  T
Q  135 gatgttgcatga 146  Q
    ||||||| ||||    
T  12727031 gatgttgaatga 12727020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 127
Target Start/End: Original strand, 19670339 - 19670416
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatga 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||    
T  19670339 atatgatatttatcatgagatgttgtatttt--ctcttacttggaatatgagaaatatttgaaatggtgaaactatatga 19670416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23773405 - 23773340
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  23773405 gatgttgaatgacattgttgattatttataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 23773340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 24686956 - 24687021
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  24686956 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 24687021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 3800056 - 3800124
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  3800056 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 3800124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 270158 - 270092
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgag 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||||||| |||||||||||    
T  270158 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgag 270092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 66567 - 66470
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||    
T  66567 cttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttgtatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 66470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 154
Target Start/End: Complemental strand, 27260466 - 27260414
Alignment:
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttg 154  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||    
T  27260466 atgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttg 27260414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 9782077 - 9782168
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  | ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  9782077 tatgactaaatgaagatgtatgaatgaattgtgatatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgaga 9782168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Original strand, 24088524 - 24088683
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||| || || |||  |||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || | |  ||| |||||| |||| |||| |    
T  24088524 cttgtatgactaaatggagatgtgagaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtggtatgt--cctcttacttagaatgtgagaa 24088621  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    || |||||| |||| | |||||||||  |||| ||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  24088622 atacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgatgttaaatgatattgttgattattgat 24088683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 12643075 - 12643141
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  12643075 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 12643141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 20628587 - 20628645
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  20628587 actaagtgaagttgtatgaatgaataattata--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 20628645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 21275577 - 21275643
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  21275577 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 21275643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 170
Target Start/End: Original strand, 22691206 - 22691275
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22691206 aatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcatg 22691275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 101 - 170
Target Start/End: Original strand, 22695853 - 22695922
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
    ||||||||| || ||||||||| |||| |||||  |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  22695853 aatgcttgagatagtgaaactacatgagatagttaatgttgaatgactttgttgattattgatgatcatg 22695922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 27260562 - 27260497
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  27260562 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaacgatttta--ttggatatgatgtttatcatgaga 27260497  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 24276903 - 24276753
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||  ||||| ||||||||||||||||  | |||||| ||||  || |||||||||||||||||| | |    
T  24276903 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaatttttaggtgttggatatgatatttatcatagggtgttgtatttt--ctcttacttggaatatgagaagtac 24276806  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||||     ||||||||||| || |||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  24276805 ttga-----tgaaactatattatgtagttgatgttgaatgatgttgatgattattgat 24276753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 85 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 19665600 - 19665539
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    ||||||| ||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  19665600 ttacttgcaatatgagaaacgttgaaatgttgaaactatatgatatagttaatgttgaatga 19665539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22693130 - 22693069
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22693130 atgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattg 22693069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22697777 - 22697716
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||    ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22697777 atgatattgttgattgttgataatcaagttattatgtgatgatgaatactatgatttaattg 22697716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25211975 - 25211913
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  25211975 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 25211913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 203
Target Start/End: Original strand, 9654140 - 9654184
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    |||||||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||    
T  9654140 ttgataatcatgttgttatgtgatgatgaatactatgatttaatt 9654184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 171
Target Start/End: Complemental strand, 28972912 - 28972876
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgt 171  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||    
T  28972912 gatgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgt 28972876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 160; Significance: 2e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 2e-85
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 25906 - 25704
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25906 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 25808  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25807 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 25708  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  25707 attg 25704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 21651 - 21449
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||| ||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21651 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaggaagtgattatattttggatatgatgtttatcatgacatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 21553  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21552 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 21453  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  21452 attg 21449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 156; Significance: 5e-83; HSPs: 53)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 5e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 51451614 - 51451412
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51451614 ttcttgtatgaccaagtgaagttgtatgaaggagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt-ccctattacttggaatatgag 51451516  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51451515 aatgcatgaaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgcatgacattgttgactattgataattatgttgaagtgtgatggtgaatgctatgattta 51451416  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  51451415 attg 51451412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22365756 - 22365555
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||    
T  22365756 ttcttgtattactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgag 22365659  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||| | ||| ||||| |||||||||    
T  22365658 aatgcttgaattggtg-aactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgataatgatgaatgctatgattt 22365560  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  22365559 aattg 22365555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17147781 - 17147581
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||||| ||||||||||||| |    | | |  ||||||||||||||||||    
T  17147781 ttcttctatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggacatgatgtttatcatgagatatg---tatgctatattacttggaatatgag 17147685  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  17147684 aatgcttgcaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgagaatcatgttgatgtgtgttgatgaatactatgattta 17147585  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  17147584 attg 17147581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 20826421 - 20826586
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  20826421 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 20826518  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20826519 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 20826586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 15862597 - 15862795
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  15862597 ttcttgcatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatttttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 15862691  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  15862692 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattt 15862790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 41393412 - 41393258
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41393412 atgttgaatatgatatttgtgatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgtt 41393315  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgat 197  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  41393314 gaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgatgatgaatgctatgat 41393258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 22250118 - 22250316
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||||||||||||||    
T  22250118 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgta---tatgctatcttacttggaatatgag 22250212  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||||    
T  22250213 aatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgattt 22250311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22353088 - 22352928
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  || | |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |||||||    
T  22353088 atgttgaatataatatttatcatgagatgttgtttt--ccatcttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttg 22352992  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     || |||||||||||||||||| |||||||||| ||  ||||| ||||| ||||||||||||||    
T  22352991 aataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtaatgatgatgaatgctatgatttaattg 22352928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 17003740 - 17003626
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||     
T  17003740 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgggatga 17003642  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||||||||    
T  17003641 tgaattctatgattta 17003626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 51657474 - 51657646
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||| || | ||  || |||||| |||| | |     
T  51657474 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgtttatcatgagatgtcgtatgtt--ctcttacttagaatgtaac 51657571  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||||||||||||||||||| |||||||  | || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  51657572 caatgcttgaaatggtgaaaatatatgaggtggttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 51657646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 7641839 - 7641953
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  7641839 ttacttggaatgtgagaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 7641937  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  7641938 tgaatactatgattta 7641953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 44036065 - 44036262
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||||| ||    
T  44036065 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatataag 44036158  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| |||||| ||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  44036159 gaatg-ttgaattggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 44036257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 7 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18506349 - 18506161
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | || |||||    
T  18506349 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaaggaatgc 18506255  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    || ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18506254 tt-aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 18506161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Original strand, 18060853 - 18060972
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatg 183  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  18060853 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatg 18060951  T
Q  184 gtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  18060952 atgaatgctatgatttaattg 18060972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 35523582 - 35523777
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || || ||| ||| ||||||| |||||||||||   |||| | | |  | |||||| |||| | ||    
T  35523582 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatgtttatcatgag---ttgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 35523678  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||| ||||||||||||||| |||||| |||   |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  35523679 gaatgtttgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgggtgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatt 35523777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20527010 - 20526919
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20527010 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 20526919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 35053842 - 35053643
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| |   ||| | | |  | |||||| | || | ||    
T  35053842 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgata---tgtgtatgctatcttacttaggatgtaag 35053746  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||| |||||||| ||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||    
T  35053745 aaatgcttgaattggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgattt 35053648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20444638 - 20444547
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20444638 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 20444547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20530403 - 20530312
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  20530403 ggtgaaactatatgtgatatttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 20530312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 21858449 - 21858358
Alignment:
Q  112 tggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  21858449 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaatt 21858358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49966647 - 49966454
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| |||||||||| ||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  49966647 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga-tgattgtat-ttga-tatgatgtttatcatgaaatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 49966554  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||    
T  49966553 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgattt 49966455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 21717203 - 21717012
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||  || | ||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  21717203 ttcttatatgacgaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggacatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 21717109  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||    
T  21717108 gaatgcttgaaatgttgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttg---attgataatcatgttgatatgtgatgatgaattctatgattt 21717012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 2422230 - 2422329
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||| | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  2422230 aatgcttgtattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatattatgattta 2422329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 146
Target Start/End: Original strand, 20956134 - 20956278
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||| | ||  || |||||| |||| ||||    
T  20956134 ttcttatatgactaagtgaaattgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttagaatgtgag 20956231  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||    
T  20956232 aaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatga 20956278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 22353274 - 22353108
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  22353274 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 22353180  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22353179 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattattgataatcatgtt 22353108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Original strand, 22407359 - 22407549
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  22407359 ttcttatatgactaagtgaagttatatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 22407453  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    || |||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || ||||| ||||||||||||    
T  22407454 aaatgcttgaa-tggtgaaactaaatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtatgatgatgaatactatga 22407549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 203
Target Start/End: Original strand, 37845737 - 37845827
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    ||||| ||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  37845737 ggtgagactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtaatgatgaatactatgatttaatt 37845827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 5675774 - 5675955
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||| |  |||| ||||||| ||||||||||||| | || | || |||  ||||| | || | |||| |||||||    
T  5675774 actaagtgaagttgtatgaatgaataattgt--gttggatatgatgtttatcatgagatat-gtatgttacct--tacttaggatgtaagaaatgcttga 5675868  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||    
T  5675869 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaaggtggatactatga 5675955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45050587 - 45050483
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  45050587 gaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 45050488  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  45050487 aattg 45050483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41210949 - 41210847
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||  ||||| |  |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  41210949 aatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttggcgttgaatgacattgttgattgttgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 41210851  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  41210850 attg 41210847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Complemental strand, 20253237 - 20253161
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  20253237 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagagtgcttgatttggtgaaac 20253161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 20894953 - 20895055
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| | |||||||||||||  ||||| ||||| | |||| ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||    
T  20894953 aatgtttgaattcgtgaaactatatgtgatagttgatgt-gaatgatattgttgattattgaaaatcatgttgatgtgtgatgatgaatactattattta 20895051  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  20895052 attg 20895055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 2 - 160
Target Start/End: Original strand, 27330936 - 27331088
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga 101  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||| ||||| || |     |||||  || |||| | |||    
T  27330936 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgtgatgt-gtatg----ctattgattagaatgtaaga 27331028  T
Q  102 a-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattatt 160  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  27331029 aatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattatt 27331088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 27673851 - 27673692
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||| |  |||| ||||| |||||||||||||||| |||||| || | ||  || |||||||||||||||| |    
T  27673851 cttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggatatgatatttatcataagatgtcgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 27673754  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||| ||| | || |||||||||||||  |||| ||||||| |||| || |||||||||||||    
T  27673753 atgattggagtgatgaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatatggttgattattgat 27673692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 21651230 - 21651295
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  21651230 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 21651295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22034715 - 22034650
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22034715 gatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 22034650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 8539112 - 8539264
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||      
T  8539112 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttctct-ttacttggaatatgagaaatat 8539210  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    ||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||    
T  8539211 ttggagctgtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgttattgatgattat 8539264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Original strand, 8604351 - 8604503
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||| || |||||||||||||||| |||      
T  8604351 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataacgtgttgtattttctct-ttacttggaatatgagaaatat 8604449  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    ||| |   ||||||||||||||| |||| ||||||| |||  |||| |||||||    
T  8604450 ttggagctgtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgttattgatgattat 8604503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 22031009 - 22031074
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  22031009 gatgttgaatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgaggaatactatgattta 22031074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 17607960 - 17607868
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||    
T  17607960 tatgactaaatgaagatgtatgagtgaattgttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 17607868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 5769344 - 5769478
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| | | |||||||||  ||| |||| |||||||||||||||||| || |||||  ||||| || |||||||||||||||||| |      
T  5769344 tatgactaaatgaagatatgtgaatgagttgttagatgtcgaatatgatatttatcataaggtgttgcattttctct-ttacttggaatatgagaagtat 5769442  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| || |||||||    
T  5769443 ttgaagtggtggaactatattatattgttgatgttg 5769478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 21194173 - 21194021
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |   ||||||||| |||||||||||||||| |  |||||| ||||| | ||||||||| ||||||| |||      
T  21194173 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgatatatgttggatatgatatttatcataaagtgttgtattttctc-attacttgggatatgagaaattt 21194075  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    ||| | || |||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| |||||||    
T  21194074 ttggagtgatgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatgttgatgattat 21194021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22029564 - 22029499
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  22029564 gatgttgaatgacattgttgactattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattta 22029499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 174
Target Start/End: Original strand, 22836424 - 22836570
Alignment:
Q  27 tgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatg-cttgaaatggtgaaactatat 125  Q
    ||||||| || |||||||||| |||||||| || |||| ||||||||| |    ||| |||||| |||| ||||||   ||||||||||  |||||||||    
T  22836424 tgaatgaatggttatatgttggatatgataattgtcataagatgttgtatga--cctcttacttagaatgtgagaaacacttgaaatggaaaaactatat 22836521  T
Q  126 gatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| || |||||||    
T  22836522 gaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgattatgttga 22836570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 20253294 - 20253246
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  20253294 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 20253246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 2422134 - 2422202
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| | |||||||||||||    
T  2422134 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgactgaatgattgta--ttgaatatgatgtgtatcatgagatgt 2422202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41218359 - 41218254
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattg-ttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgat 197  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  || || ||||| | || ||| || |||||||||||| |||||||||| ||| ||||| ||||| |||||||    
T  41218359 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgattgttgatgtagaataacaatgattgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaattctatgat 41218261  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  41218260 ttaattg 41218254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 159 - 204
Target Start/End: Original strand, 9785551 - 9785596
Alignment:
Q  159 ttgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  9785551 ttgataatcatgttgatgtgcgatgatgaatactatgatttaattg 9785596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 20826280 - 20826346
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  20826280 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 20826346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 141
Target Start/End: Original strand, 37235133 - 37235265
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  || |||||||| ||||||||||||||| | ||| ||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |      
T  37235133 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgttga-tatgatatttatcataaaatgctgtatgttctct--tacttggaatatgagaaatat 37235229  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37235230 ttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttg 37235265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 3 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16655525 - 16655454
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||| |||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  16655525 cttgtatgactaaatgaagatgtgtgaatgaattgttatgtgttggctatgatatttatcataagatgttgt 16655454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 163
Target Start/End: Original strand, 22144588 - 22144701
Alignment:
Q  50 tatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgaca 148  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| ||||| || ||||| | |||| ||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||| |||| || |||| |    
T  22144588 tatgatattgatcataagatgttgtattttctct-ttactcgaaataggagaaatatttgaaatggtaaaactatatgatgtagttgatgatgaatgata 22144686  T
Q  149 ttgttgattattgat 163  Q
    ||| |||| ||||||    
T  22144687 ttgatgatcattgat 22144701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 37845661 - 37845719
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  37845661 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 37845719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 4)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 78557 - 78360
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  78557 ttcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgattatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgag 78460  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  78459 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatagtgaatactatgattta 78360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 3 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 44800 - 44602
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | || |    
T  44800 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat-ttggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaagga 44705  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||    
T  44704 atgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatcctatgattta 44606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 39119 - 39015
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||    
T  39119 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatt 39021  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  39020 taattg 39015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 39319 - 39250
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||  |||||| |||||||||||||||    
T  39319 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat-ttggttatgatgtttatcatgagatgt 39250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 140; Significance: 2e-73; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 140; E-Value: 2e-73
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 466 - 266
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |    
T  466 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatttgattttggatatgatgtttatcatgagatgttgttttt--cctattacttggaatatggg 369  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||    
T  368 aatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtcgatgtgtgatggtggatactatgattta 269  T
Q  201 att 203  Q
    |||    
T  268 att 266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 72)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 33315773 - 33315934
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33315773 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt-ttttttccctattacttggaatatgagaatggttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 33315871  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||    
T  33315872 gttgcatgacatggttgattattgataatcatgtggatgtgtgatggtgaatactatgattta 33315934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 16827067 - 16827232
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||    
T  16827067 ttataggttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttgaaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttga 16827164  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16827165 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 16827232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16230553 - 16230388
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  16230553 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 16230456  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16230455 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 16230388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 18824949 - 18825117
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  18824949 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 18825046  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18825047 tgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 18825117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 23976575 - 23976379
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||| |||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||    
T  23976575 ttcttatatggctaagtgaagttatatgaatgaatgattgtat--tggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgag 23976480  T
Q  101 aat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  23976479 aattgtttggaatggtgaaactatatcatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgctgaatactatgattt 23976380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 15736372 - 15736533
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||  |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15736372 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgttttgaatggtgaaactatatgatatagttga 15736469  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15736470 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 15736533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 18004164 - 18004325
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18004164 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagattttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 18004261  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18004262 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 18004325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 25174525 - 25174364
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  25174525 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 25174428  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  25174427 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 25174364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 100; E-Value: 1e-49
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 4989871 - 4989707
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  4989871 tgattatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 4989774  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  4989773 tgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatgctatgattta 4989707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 27655282 - 27655439
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27655282 atgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgtt 27655379  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27655380 gaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 27655439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 14627801 - 14627966
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgctt-gaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||||| || | |||||||||||||||||||||||| ||    
T  14627801 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaatgttttggaatggtgaaactatatgatatagttga 14627898  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  |||||| ||||||    
T  14627899 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgttatgatgtaattg 14627966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18569595 - 18569394
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | ||    
T  18569595 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaag 18569499  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || |||||||| | |||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  18569498 aaatgcttgaattagtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattt 18569399  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  18569398 aattg 18569394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 86; E-Value: 3e-41
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1554808 - 1554646
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttg-aaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  1554808 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttatttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttggaaatggtgaaactatatgtgatagtcgatgtt 1554711  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |  | | |||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1554710 gggtaaaattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 1554646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Original strand, 18843016 - 18843177
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  18843016 atgttggatatgatatttgtcatgatatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 18843113  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | || | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  18843114 gaataaaattgttgatttttgataatcatgttgaggtgtgatggtgaatactatgatttaattg 18843177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 10487802 - 10487688
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  10487802 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 10487704  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  10487703 tgaatactatgattta 10487688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 16377525 - 16377639
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16377525 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 16377623  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  16377624 tgaatactatgattta 16377639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 16384849 - 16384963
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  16384849 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 16384947  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  16384948 tgaatactatgattta 16384963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 35016839 - 35017034
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||  |||||||||||| | || | ||  ||  |||||||||||||||    
T  35016839 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgattatcatgagatat-gtatgttatct--tacttggaatatgag 35016933  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||||    
T  35016934 aatgcttgaaatggttaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgattt 35017033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 18087866 - 18088064
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    | | || | ||||||   || | ||    
T  18087866 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaggtg---tatgccatcttacttaagatgtaag 18087962  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||| ||||| | |||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  18087963 gaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatactatgatt 18088062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 13622304 - 13622465
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  13622304 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttaa 13622401  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| ||||  |||||||||| | ||||||||| | | ||||| || ||||||||||||||||    
T  13622402 tgttgaatgatgttgttgattagtaataatcatgataatgtgtggtgatgaatactatgattta 13622465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18431544 - 18431445
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18431544 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattt 18431446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18776217 - 18776018
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||||||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | ||    
T  18776217 ttcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattctggatatgatatttatcatgagatgta---tatgctatcttacttaggatgtaag 18776121  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||    
T  18776120 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgattt 18776023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 19984363 - 19984561
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||    
T  19984363 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaag 19984456  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  19984457 gaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 19984556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 25368502 - 25368674
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||| |||||||  | | | || ||||||  ||  ||||    
T  25368502 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgtcggatatgatgtttatcatgtgatgttg--tatgctctcttacttaaaaggtgag 25368599  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     ||||||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||| || ||||||||||    
T  25368600 aaatgcttgaaatggtaaaactatatgaggtagtttatgttgaatgatattgttgattattaatgatcatgttga 25368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 63 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 15861676 - 15861538
Alignment:
Q  63 atgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg--catgacattgttgattatt 160  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||   || |||||||||||| ||    
T  15861676 atgagatgttgtttt--ccctattacttggataatgagaatgcttgaactggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatataacattgttgattgtt 15861579  T
Q  161 gataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||| |||||||||| || |||||| ||||||||||||||||    
T  15861578 gatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatactatgattta 15861538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16105470 - 16105366
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg-ttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16105470 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactatgatt 16105372  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  16105371 taattg 16105366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 200
Target Start/End: Original strand, 25645995 - 25646179
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||   |  |  |   |||||| |||| | || |||||||||    
T  25645995 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtgcatgctatc---ttacttagaatgtaaggaatgcttga 25646089  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    | |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  25646090 a-tggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 25646179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 16826924 - 16826992
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16826924 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 16826992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 25745585 - 25745689
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| | || ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  25745585 aatgcttgaattagtaaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgattt 25745684  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  25745685 aattg 25745689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16084992 - 16084888
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg-ttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    |||||||||||  ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| || ||||||||| ||||    
T  16084992 gaatgcttgaag-ggtgaaactatatgtaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgattgatgtgtggtgatgaatactacgatt 16084894  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  16084893 taattg 16084888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 22847148 - 22846992
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||| ||||||||| |||      
T  22847148 tatgactaaatgaagatgtttgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagttgttgtattttctct-ttactttgaatatgagaaatat 22847050  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||  ||| |||||||||||    
T  22847049 ttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatgttgatgattattgat 22846992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 1651203 - 1651307
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||| |    
T  1651203 gaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatat 1651302  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  1651303 aattg 1651307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23152266 - 23152067
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||  | ||||| ||| |||||||||||||||||||   | ||    | |||| | | || | ||    
T  23152266 ttcttgtatgattaagttaagttgtatgaatgaatgat--tgtgttggataagatatttatcatgagatgtgcatgtt---atcttacctaggatgtaag 23152172  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||| ||||| ||||| | |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||||||||     
T  23152171 aaatgtttgaattggtggagctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattc 23152072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 1658964 - 1659068
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgatt 198  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| | |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||    
T  1658964 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgaccatgttgatgtgatgatgatgaatgctatgatt 1659062  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  1659063 taattg 1659068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 26088711 - 26088642
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  26088711 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 26088642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25174666 - 25174598
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  25174666 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 25174598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Complemental strand, 26088873 - 26088806
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||    
T  26088873 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgaga 26088806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 27655152 - 27655220
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  27655152 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 27655220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32897729 - 32897539
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  32897729 ttcttatatgactaagtgaagttatatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 32897635  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    || || ||||| ||||||||||| |||  ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||    
T  32897634 aaatgtttgaa-tggtgaaactaaatgtaataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgtgatgatgaataccatga 32897539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 33315633 - 33315701
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  33315633 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 33315701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 13622161 - 13622231
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  13622161 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgactgtattttggatatgatgtttatcatgagatgt 13622231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 129 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 31627321 - 31627251
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| || |||||||||||||||    
T  31627321 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtggtgatgaatactatgattt 31627251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 28195931 - 28196104
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||| ||| | ||||| ||||||||| | |||||| |  || ||  ||||| | || | ||    
T  28195931 ttcttatatgactaagtgaggttgtatgaataattgattatatattggacatgatgtttatcatgggttgttgtatgatctct--tacttaggatgtaag 28196028  T
Q  101 aa-tgcttgaaa-tggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || ||||||||| |||| |||||||||||  |||| || |||| || | |||||||||||||||||||||||||||    
T  28196029 aaatgcttgaaaatggtaaaactatatgaagtagttgaggttgaataatattgttgattattgataatcatgttga 28196104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 42 - 128
Target Start/End: Original strand, 35137187 - 35137272
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||  || |||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||    
T  35137187 atgttgaatatgatacttatcctgagatgttgtatttt--ctcttacttggaatatgagaaatatttgaaatggtgaaactatatgat 35137272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 16557303 - 16557368
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16557303 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 16557368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 16650533 - 16650598
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16650533 gatgttggatgacattgttgattattggtaaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 16650598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 29870762 - 29870827
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  29870762 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattta 29870827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 22431159 - 22431055
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||||||   | ||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| | ||| |||||||||    
T  22431159 aatgcttgaattggtgaaactatatatgaaagttgatgtagaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgattaatgctatgattt 22431060  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  22431059 aattg 22431055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 19609348 - 19609309
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19609348 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 19609309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 14627659 - 14627730
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||| ||||||  ||||||||||||||||||    
T  14627659 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgta--ttggatatgacgtttatcatgagatgttgt 14627730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Original strand, 18004022 - 18004093
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  18004022 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgttgt 18004093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18582286 - 18582224
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  18582286 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatgtttatcatgagat 18582224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 164
Target Start/End: Original strand, 16888946 - 16889060
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||| ||||     
T  16888946 atatgataattatcatgagatgttgtatttt--ctcttacttgaaatatgagaaataattgaattggtgaaactatatgatgtagttaatgttgaatgat 16889043  T
Q  148 attgttgattattgata 164  Q
     ||| |||| |||||||    
T  16889044 gttgatgatcattgata 16889060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23994029 - 23993968
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| ||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23994029 atgatattgttgattgttgataatcaagttgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 23993968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 1554865 - 1554817
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  1554865 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 1554817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 33323744 - 33323659
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  33323744 atgtggaatatgatacttatcttgagatgttgtattt--cctcttacttggaatatgagaaatatttgaaacggtgaaactatatgat 33323659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 34965913 - 34965814
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||| || |||| | ||||| || |||||||||||||||||| || ||| | |||||  ||||||| ||||||| ||||||    
T  34965913 atgttgaatatgatatttatcataaggtgttttattttctct-ttacttggaatatgagaagtgtttggagtggtgggactatattatatagttgatgtt 34965815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18397934 - 18397765
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||| |  |||||||  | |||||||||||| || | ||  ||  ||||| |||| ||||    
T  18397934 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaataattgtatgattgatatgatgat-atcatgagatgt-gtatgttatct--tacttagaatgtgag 18397839  T
Q  101 a-atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    | ||| ||||||||| ||| ||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||    
T  18397838 acatg-ttgaaatggggaagctacatgagatagtgaatgttgaatgacattgttgagtattgatgatcatattga 18397765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 19628438 - 19628374
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||||||||| |||||||    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  19628438 ttcttatatgactaagcgaagttg----aatgagtgattatattttgaatatgatgtttatcatgagat 19628374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Complemental strand, 25904028 - 25903976
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgat 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||    
T  25904028 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgat 25903976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 16230694 - 16230628
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  16230694 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 16230628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 22226928 - 22226993
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||| |||||||| ||| |||| |||||||    
T  22226928 gatgttggatgacattgttgattactgataaatatgttgacgtgtgatgatgagtactttgattta 22226993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 74
Target Start/End: Original strand, 15736240 - 15736301
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| ||||||||||||||||||    
T  15736240 actaagtaaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgttgt 15736301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22867158 - 22867094
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||| |||| ||   |||||||||||||    
T  22867158 tatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtatgttggatataatgaatatcatgagatgt 22867094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 16239262 - 16239179
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgat 197  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||   ||||| ||||||||||| |||||    
T  16239262 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatacgatgat 16239179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Original strand, 22363361 - 22363452
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |  | |||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  22363361 tatgactaaatgaagatgtatgaatgaattgtgatatgttg-atatgatacttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgaga 22363452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4990003 - 4989941
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  4990003 tatgactaagtgaagatgtttgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 4989941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 137 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 11215014 - 11214953
Alignment:
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgat 197  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||    
T  11215014 tgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgat 11214953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 18824713 - 18824775
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18824713 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 18824775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Original strand, 18840568 - 18840630
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  18840568 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 18840630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 39
Target Start/End: Original strand, 13015967 - 13015999
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 39  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13015967 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 13015999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Original strand, 21776784 - 21776816
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21776784 atgttgaatatgatgtttatcatgagatgttgt 21776816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 135; Significance: 2e-70; HSPs: 98)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 2e-70
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 16745362 - 16745526
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16745362 ttatatgttgaatatgatatttgtcatgagatgttgtttt-tccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagttgat 16745460  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16745461 gttgcatgac-ttgttgattattgttaatcatgttgaagtgtgttggtgaatactatgatttaattg 16745526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 124; E-Value: 6e-64
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 16819872 - 16819712
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  16819872 ttatatgttggatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 16819775  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16819774 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 16819712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 119; E-Value: 6e-61
Query Start/End: Original strand, 35 - 204
Target Start/End: Original strand, 51159667 - 51159834
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtg 134  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  |||||     
T  51159667 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--cccttttacttggaatatgagaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagtt 51159764  T
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  51159765 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattg 51159834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Original strand, 17957526 - 17957691
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  17957526 ttatatgttggatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 17957623  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17957624 tgttgaatgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 17957691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 53769625 - 53769460
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  53769625 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 53769528  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53769527 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 53769460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 104; E-Value: 5e-52
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19945624 - 19945428
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgct 106  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||  ||||||| ||||||||||||| | |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  19945624 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgtttgatatgatgtttatcatgagatatcgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgct 19945527  T
Q  107 tgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||  |||||||||||||    
T  19945526 tgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgatatgatttaattg 19945428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 18909654 - 18909493
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  18909654 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 18909557  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18909556 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 18909493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 22274009 - 22273848
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  22274009 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 22273912  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  22273911 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 22273848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 16260187 - 16260014
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||     
T  16260187 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatat-------atgatatttatcatgagatattgtttt--ccctattacttggaatatgat 16260097  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | |  ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  16260096 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaacaacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 16260014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 2450520 - 2450680
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  2450520 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 2450617  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  2450618 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgg-gaatactatgattta 2450680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7852775 - 7852610
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||| |||||||||||||||||||| ||    
T  7852775 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatagtgaaactatatgatatagttga 7852678  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||    
T  7852677 tgttgaatgacattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgaggaatactatgatttaattg 7852610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 33340810 - 33340645
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||  ||||| ||    
T  33340810 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgtgatagttga 33340713  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  33340712 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattg 33340645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 30 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 49231187 - 49231019
Alignment:
Q  30 atgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgata 129  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  |    
T  49231187 atgaatgattatatgttggatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccatattacttggaatatgagaatgcttgaattggtg-aactatatgtga 49231091  T
Q  130 tagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatggtgaatactatgattta 200  Q
     ||| ||||||| || ||||||| |||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  49231090 cagttgatgttgaataacattgtggattattgatgatcatgttgatgtgatgatggtgaatactatgattta 49231019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 16260008 - 16259843
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||||||||  |    
T  16260008 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaagctatatgatatagttaa 16259911  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16259910 tgttgaatgatgttgttgattattgattatcatgttggagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 16259843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 1468892 - 1469006
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  1468892 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 1468990  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  1468991 tgaatactatgattta 1469006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 8269641 - 8269755
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8269641 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8269739  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  8269740 tgaatactatgattta 8269755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Original strand, 8276752 - 8276866
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  8276752 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatga 8276850  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  8276851 tgaatactatgattta 8276866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 12562632 - 12562803
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| ||| | ||  || |||||| |||| | |     
T  12562632 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatatttatcttgagatg-tgtatgtt--ctcttacttagaatgtaag 12562728  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12562729 gaatgcttgaattggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 12562803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14294432 - 14294262
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | ||    
T  14294432 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaag 14294336  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14294335 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 14294262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14300059 - 14299889
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | ||    
T  14300059 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaaggaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaag 14299963  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14299962 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 14299889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 74; E-Value: 4e-34
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Original strand, 50113300 - 50113480
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga-gaatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||||| | ||||||||||    
T  50113300 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattatat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatataaagaatgcttga 50113394  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  50113395 a-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgagtgatgatgaatactatga 50113480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 47786049 - 47786239
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatat--gagaatgcttg 108  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||| ||    | | |  | |||||| |||| |  |||||||||||    
T  47786049 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagacgtg---tatgctatcttacttagaatgtaagagaatgcttg 47786143  T
Q  109 aaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  47786144 aaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacaatgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattg 47786239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 35122690 - 35122494
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| || || ||| ||| |||||||  ||||||||||   |||| | | |  | |||||| |||| | ||    
T  35122690 ttcttgtatgactaagtgaaattgtataaatgaatgcttgtattttggatatgatggttatcatgag---ttgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 35122594  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
     |||||||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||    
T  35122593 gaatgcttgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattattgacaatcatgttgatgtgtgatgatgaattctatgattt 35122494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 15860315 - 15860503
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaa 110  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || |||||||||||||||| ||||||    | | |  | |||||| |||| | ||||   |||||    
T  15860315 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt--tggatatgatatttatcataagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaagaaatgttgaa 15860409  T
Q  111 atggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||||| |||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  15860410 ttggtgaagctatatgtgatagttgatgttggatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgataaatactatgatttaattg 15860503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 11198726 - 11198897
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||   ||||||||||||| || | ||| ||  ||||| |||| | ||    
T  11198726 ttcttatatgactaagtgaggttgtatgaatgaatgattgtatgttggatatgatgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttagaatgtaag 11198822  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || || |||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11198823 aaatgtttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 11198897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13816502 - 13816315
Alignment:
Q  13 taagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaa 111  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |  || ||||||||||||||||||||   ||| |   |  | |||||| |||| | || |||| |||||     
T  13816502 taagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt--tggatatgatatttatcatgaga---tgtgtaagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttgaat 13816408  T
Q  112 tggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||    
T  13816407 tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgggtgatggtgaatgctatgattcaattg 13816315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 85 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 44228347 - 44228230
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtg-tgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  44228347 ttacttggaatatgagaatgcttgaatcggtgaa-ctatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgatgatg 44228249  T
Q  184 gtgaatactatgatttaat 202  Q
     ||||| ||||||||||||    
T  44228248 atgaatgctatgatttaat 44228230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Original strand, 19571939 - 19572127
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |  || |||||||||||||||||||||||    |   |  | |||||| |||| | |||| || ||||    
T  19571939 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgttt--tggatatgatatttatcatgagatgtg---taagctatcttacttagaatgtaagaaatgtttga 19572033  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | ||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  19572034 attggtgaaactatatg-tgtagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatgctatgattcaattg 19572127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 7 - 163
Target Start/End: Original strand, 33370013 - 33370169
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||  |  |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| || |||||||||||||||||| |      
T  33370013 tatgactaaatgaagatgtgtgaatggattgttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctct-ttacttggaatatgagaaatat 33370111  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  33370112 ttgaagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgat 33370169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 39654918 - 39654757
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | |  ||| |||||| |||| ||||    
T  39654918 ttcttatatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgt--cctcttacttagaatgtgag 39654821  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
     ||| ||||||||||| |||||||||||  ||||  |||||| |||| ||||||||||||||||    
T  39654820 aaatacttgaaatggtaaaactatatgaggtagttaatgttgaatgatattgttgattattgat 39654757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 198
Target Start/End: Original strand, 53899677 - 53899872
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  || ||| ||| ||||||| |||||||||||   |||| | | |  | |||||| |||| | ||    
T  53899677 ttcttgtatgactaagtgaagttgtataaatgaatacttgtattttggatatgatgtttatcatgag---ttgtgtatgctatcttacttagaatgtaag 53899773  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||||||| ||||||||||| |||||| |||   ||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| ||||||||    
T  53899774 gaatgcttggaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgatattgttgattattgataattatgttgatgtgtgatgatgaattctatgatt 53899872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Original strand, 6148103 - 6148193
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||   ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  6148103 aatggtgaaactatatatgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaatggtgaatactatgattta 6148193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 17099620 - 17099547
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17099620 aatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 17099547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 15469720 - 15469820
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15469720 gaatgtttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 15469819  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  15469820 a 15469820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15574947 - 15574843
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15574947 gaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 15574848  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  15574847 aattg 15574843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 15613966 - 15613862
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| |||   |||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  15613966 gaatgtttgaagtggtgaaactaaatgtggtagttgatgttgaatgacattgatgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgattt 15613867  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  15613866 aattg 15613862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 114 - 201
Target Start/End: Original strand, 12031249 - 12031336
Alignment:
Q  114 gtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaa 201  Q
    ||||||| |||||  ||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  12031249 gtgaaacgatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaa 12031336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Original strand, 17913532 - 17913607
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17913532 atagttgatgttgaatggcattgttgattattgataagcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 17913607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 19230953 - 19230862
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||    
T  19230953 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacgttgttgattattgataattatgttgatgtgtgataatgaatactatgatttaattg 19230862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 115 - 202
Target Start/End: Original strand, 22145541 - 22145628
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaat 202  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  22145541 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaat 22145628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Original strand, 16183261 - 16183366
Alignment:
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||||||    
T  16183261 agaatgcttgaa-tgatgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctatgat 16183359  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  16183360 ttaattg 16183366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 23491510 - 23491309
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||||| ||    | | |  | ||||||   || | ||    
T  23491510 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgagaagtg---tatgctatcttacttaagatgtaag 23491414  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
     |||| ||||| | |||||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||| ||| ||||||||||||||    
T  23491413 gaatgtttgaatttgtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacatcgttgattattgataatcacgttgatgtgtaatgatgaatactatgatt 23491314  T
Q  199 taatt 203  Q
    |||||    
T  23491313 taatt 23491309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2048953 - 2048862
Alignment:
Q  114 gtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  2048953 gtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 2048862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 42 - 120
Target Start/End: Original strand, 9303811 - 9303887
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaac 120  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||| |||||||  |||||||||    
T  9303811 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttg--ttttccctcttacttggaatatgagagtgcttgatttggtgaaac 9303887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 25057851 - 25057650
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatg-- 98  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||| ||||||||| | ||    | | |  | ||||||  || |||      
T  25057851 ttcttgtatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgataattatcatgataagtg---tatgctatcttactt--aagatgta 25057757  T
Q  99 -agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
     |||||| ||||| | | |||||||||||  ||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||| ||||||||||||    
T  25057756 aagaatgtttgaatttgcgaaactatatgtgatagttgatgattggatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtaatgatgaatactatga 25057657  T
Q  197 tttaatt 203  Q
    |||||||    
T  25057656 tttaatt 25057650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 202
Target Start/End: Original strand, 318769 - 318968
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattactt--ggaatatg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||| ||||||    | | |  | ||||||  ||  || |    
T  318769 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttatcatcagatgtg---tatgctatcttacttaaggtgtaag 318863  T
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgata-tagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatga 196  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| |||||  |||||    
T  318864 a-aatgcttgaattggtgaaactatatgtgaatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgttatga 318962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 12351097 - 12351201
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| ||||| |||||||||    
T  12351097 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgttgtggtgatgatgaatgctatgattt 12351196  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  12351197 aattg 12351201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 49231321 - 49231252
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgtt 72  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49231321 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgtt 49231252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22274150 - 22274082
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  22274150 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 22274082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47983913 - 47983750
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| |  ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||     
T  47983913 ttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttgggatatgagaaa 47983816  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  47983815 tattgaaatgatgaaactatttgatatagt-gatgttgaatgataatgatgattattgatgatcatg 47983750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 47993200 - 47993037
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| |  ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||     
T  47993200 ttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttgggatatgagaaa 47993103  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  47993102 tattgaaatgatgaaactatttgatatagt-gatgttgaatgataatgatgattattgatgatcatg 47993037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48002487 - 48002324
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| |  ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||     
T  48002487 ttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttgggatatgagaaa 48002390  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  48002389 tattgaaatgatgaaactatttgatatagt-gatgttgaatgataatgatgattattgatgatcatg 48002324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 48011773 - 48011610
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    |||||||||||| || || ||| ||||||| |  ||||||| |  ||||||||||| |||||||||||||| | ||  || |||||||| |||||||||     
T  48011773 ttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatatgatcgatatgatatttgtcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttgggatatgagaaa 48011676  T
Q  104 gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
      |||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||| |||| | || ||||||||||| ||||||    
T  48011675 tattgaaatgatgaaactatttgatatagt-gatgttgaatgataatgatgattattgatgatcatg 48011610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 70
Target Start/End: Original strand, 2450379 - 2450446
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatg 70  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||    
T  2450379 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatg 2450446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 8630743 - 8630653
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||  ||| | || |||| ||||| |||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||||||||||    
T  8630743 aatggtgaaactatatgtgataattgacgttgaatgactttgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgattta 8630653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Original strand, 11062197 - 11062362
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||| || |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | |||| |||    
T  11062197 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattatggatataatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgc 11062293  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||||| |  |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11062294 ttgaaatggtaaggctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 11062362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 16935168 - 16935233
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16935168 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 16935233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 4 - 69
Target Start/End: Original strand, 51159530 - 51159595
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  51159530 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaaagagtaattatattttggatatgatgtttatcatgagat 51159595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 7 - 103
Target Start/End: Original strand, 54652868 - 54652962
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat 103  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| | ||  || |||||||||||||||||||    
T  54652868 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttgtatatgatatttgtcatgggatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaat 54652962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 17957384 - 17957452
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  17957384 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatttta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 17957452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 40938734 - 40938564
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  |   ||||||||||||| || | ||| ||  |||||  ||| | |     
T  40938734 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatggatgattgtatgttggatatagtgaatatcatgagatgt-gtatgttctct--tacttataatgtaaa 40938638  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||| ||||| |||| |||||    
T  40938637 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgagatagtaaatgttgaatgacattgttgattgttgatgatcaagttga 40938564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 16820014 - 16819943
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  16820014 ttcttgtatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgttgt 16819943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 18897984 - 18898053
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  | ||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||    
T  18897984 gatgttggatgacattgttgattattgataaatacgttgatgtgggatgatgaatactatgatttaattg 18898053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30152203 - 30152138
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30152203 gatgttggatgacattgttgattattgattaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 30152138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 38167050 - 38166993
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||    
T  38167050 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatt 38166993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 159
Target Start/End: Complemental strand, 12952010 - 12951901
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgac 147  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| | ||| ||  ||||||||||||||||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||     
T  12952010 atatgatatttatcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaaatatttggagtggtgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgat 12951913  T
Q  148 attgttgattat 159  Q
    |||| |||||||    
T  12951912 attgatgattat 12951901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 11883410 - 11883582
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| |||||||| |||||  ||| ||||||| || |||||||||| |||||  |||| ||||  ||| |||| | |  ||| |||||| |||| ||||    
T  11883410 ttcttatatgactaggtgaaaatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatggaatttgtcataggatattgtatgt--cctcttacttagaatgtgag 11883507  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    || | || |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||| || |||||||    
T  11883508 aaattctcgaaatggtaaaactatatgagatagttgatgttgaatgatattgttgattatcgatgattatgttga 11883582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 112 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 17937391 - 17937320
Alignment:
Q  112 tggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    |||||||| ||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||    
T  17937391 tggtgaaagtatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgaagacgtgtgatg 17937320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14297405 - 14297331
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14297405 gaatgattgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattga 14297331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 14303032 - 14302958
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||| |||   ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  14303032 gaatgattgaaatggtgaaaccatatgagataaatgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatattga 14302958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 15516749 - 15516590
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||| || || ||| ||||||| || |||||||||| ||||||||||| |||| |||| | || | |  ||| |||||| |||| |||| |    
T  15516749 cttgtatgactaaatggagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatatgatatttgtcataagatatggtatgt--cctcttacttagaatgtgagaa 15516652  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    || |||||| |||| | |||||||||  |||| | ||||| |||| ||||||||||||||||    
T  15516651 atacttgaagtggtaagactatatgaggtagttgctgttgaatgatattgttgattattgat 15516590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Original strand, 12265785 - 12265842
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||    
T  12265785 atgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgataaatactatgattta 12265842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 41660593 - 41660473
Alignment:
Q  43 tgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||| |||||||||||||||| || |||||| ||||| || ||||||| |||||||||| |  ||| | |||||||| ||||| || |||| |||||||    
T  41660593 tgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttctct-ttacttgaaatatgagaaatatttggagtggtgaaattatattatgtagttgatgttg 41660495  T
Q  142 catgacattgttgattattgat 163  Q
     |||| |||| |||||||||||    
T  41660494 aatgatattgatgattattgat 41660473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Original strand, 9303754 - 9303802
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  9303754 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 9303802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 73
Target Start/End: Complemental strand, 17138480 - 17138408
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttg 73  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||| ||||||| | |||||||    
T  17138480 ttcttatatgattaagtgaagttatatgaatgaatgattatatgttggaaatgatgtttatcaagtgatgttg 17138408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13837865 - 13837797
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  | | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  13837865 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatg--tttgttttggatatgatatttatcatgagatgt 13837797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 204
Target Start/End: Original strand, 14522580 - 14522663
Alignment:
Q  122 atatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14522580 atatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtattatgatttgattg 14522663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 71
Target Start/End: Original strand, 15469630 - 15469694
Alignment:
Q  5 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  15469630 tgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 15469694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 101
Target Start/End: Complemental strand, 17203687 - 17203596
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga 101  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| || | | ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||||    
T  17203687 tatgactaaatgaagatgtatgaatgaatggtgaaatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgaga 17203596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 34558899 - 34558780
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| |||  |||||| |  ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||      
T  34558899 tatgactaaatgaagatgtgcgaatgaattgttatatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaaatat 34558803  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  34558802 ttggagtggtgaaactatatgat 34558780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 7 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 7852912 - 7852850
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  7852912 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatattttggatatgatgtttatcatgagat 7852850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 42 - 128
Target Start/End: Complemental strand, 17937310 - 17937226
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgat 128  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||| || ||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||| ||||    
T  17937310 atgttggatatgatatt-atcatgagattttgtattttctct-ttacttgtaatatgagaaatattgaaatggtgaaactatttgat 17937226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 54423075 - 54423008
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  54423075 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgtgatgt 54423008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 10737439 - 10737398
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatg 126  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10737439 ttacttggagtatgagaatgcctgaaatggtgaaactatatg 10737398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18909795 - 18909729
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  18909795 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 18909729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 33340942 - 33340884
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  | | ||| |||||||||||||||||||||||    
T  33340942 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tgttttggatatgatatttatcatgagatgt 33340884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 53769766 - 53769700
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  53769766 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 53769700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 62
Target Start/End: Original strand, 54039683 - 54039744
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatc 62  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||||||| || |||| ||||||    
T  54039683 ttcttgtatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatggttatatgttggatgtgatgtttatc 54039744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 5227583 - 5227527
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatac 191  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||| |||||||    
T  5227583 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtaatgatgaatac 5227527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 66
Target Start/End: Original strand, 22145438 - 22145495
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatga 66  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||||||||||||||    
T  22145438 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatatttatcatga 22145495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 8630846 - 8630808
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 39  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  8630846 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 8630808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 12031172 - 12031230
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| | ||||||| | |||||||||||||    
T  12031172 actaagtgaagttgtatgaatgaatgat--tatgtgggatatgatgtctatcatgagatgt 12031230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 115 - 200
Target Start/End: Original strand, 14843815 - 14843900
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||  ||||||| ||||| |||| ||||||||||  ||||||||| |||    ||||||| ||||| ||||||||||    
T  14843815 tgaaactatatgtgatagtgggtgttgaatgatattgttgattggtgataatcaagttattatgtgatgatgaatgctatgattta 14843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 2 - 39
Target Start/End: Complemental strand, 17099714 - 17099677
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgatt 39  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17099714 tcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgatt 17099677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 38 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 48420646 - 48420584
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||||||||||||||    
T  48420646 ttatgtgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 48420584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 102
Target Start/End: Original strand, 55442006 - 55442064
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||    
T  55442006 atgttggatatgatatttatcatgagctgttgtcttt--cctcttatttggaatatgagaa 55442064  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 42 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 14079558 - 14079526
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14079558 atgttggatatgatatttatcatgagatgttgt 14079526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 17523626 - 17523693
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||||||| ||| |||| |||||||| ||||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17523626 ttcttatatgactaa-tgacgttgcatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttatcatgagat 17523693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 130; Significance: 2e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 2732 - 2930
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||    
T  2732 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaaggagtggttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgag 2829  T
Q  101 aat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2830 aattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattt 2929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 22959 - 23030
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttg 173  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22959 aatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 23030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 129; Significance: 6e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 6e-67
Query Start/End: Original strand, 38 - 201
Target Start/End: Original strand, 2325 - 2486
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  2325 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgat 2422  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaa 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2423 gttgaatgacattgttgattattgataatcatattgatgtgtgatggtgaatactatgatttaa 2486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 66
Target Start/End: Original strand, 2182 - 2247
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatga 66  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||    
T  2182 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatga 2247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 121; Significance: 4e-62; HSPs: 3)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 1327 - 1168
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  1327 atgttgaatataatatttatcatgagatgttgttt---ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 1231  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1230 aatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttgattg 1168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 6236 - 6037
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | ||    
T  6236 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtg---tatcctatcttacttaggatgtaag 6140  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||    
T  6139 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgattt 6042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 1513 - 1347
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  |||||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  1513 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 1419  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1418 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 120; Significance: 1e-61; HSPs: 2)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 1e-61
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28848 - 28688
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  28848 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 28751  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28750 aatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 28688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 29035 - 28857
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||  |||||||||||| |    | | |  | ||||||||||| | ||    
T  29035 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgattatcatgagatatg---tatgctattttacttggaatgtaag 28941  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     ||||||||||||||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  28940 gaatgcttgaaatggtgaaactatctgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 28857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 17616 - 17451
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||   ||||| ||    
T  17616 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctattacctggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatatgatagttga 17519  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  17518 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgagttgtgatggtgaatactatgatttaattg 17451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 17759 - 17691
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  17759 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 17691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 113; Significance: 2e-57; HSPs: 3)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 42 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 95285 - 95128
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||| ||||||     
T  95285 atgttgaatatgatatttatcatgagatgctgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgaaagttgatgtta 95188  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaa 201  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  95187 aatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaa 95128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 95471 - 95294
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || |||||||| |||||||||||| | | |  | |||    ||||| |||| | |    
T  95471 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgataattatcatgagatatgtatgctatcc----tacttagaatgtaa 95378  T
Q  100 g-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  95377 ggaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 95294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 152 - 204
Target Start/End: Original strand, 66745 - 66797
Alignment:
Q  152 ttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||| ||||||||||  |||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  66745 ttgattgttgataatcaaattgttgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 66797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 108; Significance: 2e-54; HSPs: 5)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 108; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 145493 - 145338
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  145493 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 145397  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  145396 gataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatggtgaatactatgattta 145338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 4 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 145680 - 145502
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aa 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||   ||| | | |  | |||||| | || | || ||    
T  145680 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattttattttggatatgatatttatcatgaga---tgtgtatgctatcttacttaggatgtaagaaa 145584  T
Q  103 tgcttgaaatggtgaaactata-tgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    || ||||| ||||||||||||| ||  ||||| ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  145583 tgtttgaattggtgaaactatattgtgatagttgatgttaaatgaccttgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 145502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 8 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 84594 - 84501
Alignment:
Q  8 atgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    |||||||| ||||| ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||| || | |||| ||||| || ||||||| ||||||||||    
T  84594 atgactaaatgaagatgtgtgaatgaattattatatgttggatatgatatttatcataaggtattgtattttctct-ttacttgaaatatgagaa 84501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 147685 - 147597
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaa 201  Q
    ||||||||||||||  || || ||||||| | ||  || |||||| |||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||    
T  147685 ggtgaaactatatgtgattgttgatgttgaaggatcttattgattgttgataatcatgttgatgtgtggtgatgaatactatgatttaa 147597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #5
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 74
Target Start/End: Complemental strand, 52281 - 52246
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgt 74  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  52281 ttatatgttga-tatgatatttatcatgagatgttgt 52246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 155548 - 155709
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  155548 ttatatgttggatatgatatttgtcatgacatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgcttggaatggtgaaactatatgatatagttga 155645  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  155646 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 155709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Original strand, 734 - 799
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  734 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 67
Target Start/End: Original strand, 155407 - 155471
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgag 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||    
T  155407 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgag 155471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 2)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 15057 - 15218
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  15057 ttatatgttggatatgatatttgtcatgaaatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 15154  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  15155 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 15218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 14916 - 14982
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  14916 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 14982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41675 - 41510
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| | |||    
T  41675 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatattgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgataattgat 41578  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||| | |||||| |||||||    
T  41577 gttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgagtgctatgacttaattg 41510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 4)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 50 - 204
Target Start/End: Original strand, 109286 - 109439
Alignment:
Q  50 tatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgaca 148  Q
    |||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  109286 tatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgaca 109383  T
Q  149 ttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  109384 ttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 109439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 14591 - 14648
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatt 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  14591 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttggatatgatatt 14648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 54633 - 54563
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||| ||| ||| |||||||    
T  54633 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatgtttctcaggagatgt 54563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 54532 - 54442
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||       ||||||||| | |||| ||| |||||||||||||||||||    
T  54532 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgat-------aatcatgttaatgtgtaatgatgaatactatgatttaatt 54442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 101; Significance: 3e-50; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 3e-50
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 90077 - 90238
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  90077 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 90174  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  90175 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 90238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 35 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 129355 - 129191
Alignment:
Q  35 tgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||  |||||    
T  129355 tgattatatattggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaattgtttgaaatggtgaaactatatgtgatagt 129258  T
Q  134 ggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||| ||||||||||    
T  129257 tgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggcatgatggtgaatgctatgattta 129191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 42 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 78655 - 78535
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||  || ||||||| |||||||| |||  ||||| ||||||||||||||||| ||||  |||||    
T  78655 atgttggatatgataattatcatgagatgttgtatttt--ctcttacttgaaatatgagaaatatttgaattggtgaaactatatgatgtagttaatgtt 78558  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgat 163  Q
    | |||| |||| |||| ||||||    
T  78557 gaatgatattgatgatcattgat 78535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 89945 - 90003
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| | |  || |||||||||||||||||||||||    
T  89945 actaagtgaagttgtatgaacgaatgattgttt--tggatatgatatttatcatgagatgt 90003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 7 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 129487 - 129425
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  129487 tatgactaagtgaagatgtgtgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 129425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 97; Significance: 8e-48; HSPs: 4)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Original strand, 38524 - 38685
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  38524 ttatatgttggatatgatatttgtcataagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 38621  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  38622 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgattta 38685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40393 - 40295
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40393 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattg 40295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 38381 - 38449
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  38381 ttcttgtatgactaattgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 38449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40492 - 40424
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  40492 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgta--ttggatatgatgtttatgatgagatgt 40424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 38 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 6146 - 5985
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||||||||| | ||| ||  ||||||| |||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  6146 ttatatgttggatatgataattgtcatgagatgttgtatgttctct--tacttgggatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttga 6049  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  6048 tgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataattta 5985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 114 - 199
Target Start/End: Original strand, 217016 - 217101
Alignment:
Q  114 gtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||||||  ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  217016 gtgaaactatatgtgatagttgattttgaatgacattgttgattattgataaacatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattt 217101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 6287 - 6219
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| |||||||||||||||    
T  6287 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgagatgt 6219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 89; Significance: 5e-43; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 5e-43
Query Start/End: Original strand, 42 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 53270 - 53139
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  53270 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttt-ccctcttacttagaatatgcgaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 53172  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     || |||||||||||||||||| ||||||||||    
T  53171 gataacattgttgattattgatgatcatgttga 53139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 135 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 53327 - 53279
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  53327 gatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 53279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 88; Significance: 2e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 42 - 200
Target Start/End: Original strand, 18776 - 18931
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||||||  ||||| |||||||    
T  18776 atgttgaatatgatatttatcattagatgttgtttt--ccctcttacttggaagatgagaatacttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttg 18872  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
     || ||||||||||||||||||||||||||| | |||| || |||||||||||||||||    
T  18873 gataacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtaattgtgaatactatgattta 18931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Original strand, 18585 - 18767
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||| ||| |  |  || |||||| | || | ||    
T  18585 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatattttggatatgatatttatcgtgagatg-tgtatgctatct-ttacttaggatgtaag 18682  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactata-tgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||| |||||  | |||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  18683 aaatgtttgaatggatgaaactatattgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 18767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 85 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 38206 - 38092
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgg 184  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||     
T  38206 ttacttggaatatgagaatgcttgaattggtgaaactatatgatatagttgatgttgagtgacattgttgattattgataat-atgttgatgtgtgatga 38108  T
Q  185 tgaatactatgattta 200  Q
    ||||||||||||||||    
T  38107 tgaatactatgattta 38092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 8 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 32582 - 32387
Alignment:
Q  8 atgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgct 106  Q
    |||||||| || || ||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||||| |||| |||||| | ||    
T  32582 atgactaaatggagatgtgtgaatgaattgttatgtgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtatgttctct--tacttagaatgtgagaaatact 32485  T
Q  107 tgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  32484 tgaaatggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgtcgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattg 32387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 79; Significance: 4e-37; HSPs: 5)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 28611 - 28472
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | |||||||    
T  28611 atgttggatatgatgtttatcatgagatattgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaattatatgtgataattgatgttg 28514  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  28513 aatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 28472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28463 - 28301
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  28463 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 28366  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  28365 gaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 28301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 2e-36
Query Start/End: Original strand, 42 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40459 - 40297
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  40459 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 40362  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  40361 gaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgatttaattg 40297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 42 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 40607 - 40468
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| | ||| |||    
T  40607 atgttggatatgatgtttatcatgagatattgtttt--ccctcttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaattatatgtgatatttgattttg 40510  T
Q  142 catgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     |||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||    
T  40509 aatgacattgttgattagtgataatcatgttgatgtatgatg 40468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #5
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 14524 - 14622
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||  |  || |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14524 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgaggagtgtcattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 14622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 76; Significance: 3e-35; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 3e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Original strand, 2613 - 2785
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatat-ga 99  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| | ||||| ||||||||| |||||||| ||||| |||  |||| |||| |  |    
T  2613 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgattatatgttggacatgatgtttatcatgggatgttgtattttctcta--acttagaatgtaaa 2710  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2711 aaatgtttgaaatggtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 2785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 20455 - 20649
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  20455 ttcttgtatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaag 20549  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||    | ||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  20550 aaaaaataaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactataattta 20649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8426 - 8237
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgaga-atgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| ||| ||||||||||||||||||| || | ||  ||  ||| | | || | ||| ||| ||||    
T  8426 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggataagatatttatcatgagatgt-gtatgttatct--tacctaggatgtaagatatgtttga 8332  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    | |||||||| ||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8331 attggtgaaattatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatggtgaatactatgatttaattg 8237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 73; Significance: 2e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 52528 - 52632
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  52528 gaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgattt 52627  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  52628 aattg 52632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 100 - 204
Target Start/End: Original strand, 56480 - 56584
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||    
T  56480 gaatgcttgaaatggtgaaactgtatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgttgtgtgatgatgaatactatgattt 56579  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  56580 aattg 56584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 72; Significance: 6e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 3628 - 3429
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | ||    
T  3628 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgtattttggatatgatatttatcatgagatgtg---tatcctatcttacttaggatgtaag 3532  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||  |||| || ||||| |||||||||    
T  3531 aaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttga--tgtggtgatgaatgctatgattt 3434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold1734
Description:

Target: scaffold1734; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 42 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 155 - 1
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgtt 140  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||||||   |||| ||| |||| |||||||||||||||  ||||| ||||||    
T  155 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt--ccctcttacttggaatgaaagaaatgcatgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgtt 58  T
Q  141 gcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatga 196  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| ||||||    
T  57 gaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatga 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1734; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 183
Target Start/End: Complemental strand, 344 - 164
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| | ||| ||| |||||||  |||||||||||| |    | | |  | |||||| |||| | ||    
T  344 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgagtgaatgaatgtattttggatatgatgattatcatgagatatg---tatgctatcttacttagaatgtaag 248  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
     ||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  247 gaatccttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtatgatg 164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 38 - 197
Target Start/End: Original strand, 2884 - 3042
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggat 137  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||||||||| |||  |||||  ||    
T  2884 ttatatgttgaatatgatatttatcattagatgtcgtttt--ccctattacttggaatatgagaatgtttgactttgtgaaactaaatgtgatagtttat 2981  T
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgat 197  Q
    |||| ||||||||||||||| || ||||||| ||| | ||||| ||||| |||||||||||    
T  2982 gttgaatgacattgttgattgttcataatcaagttaatgtgtgaatggtaaatactatgat 3042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 2741 - 2809
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||| |||| ||||||||    
T  2741 ttcttgtatgactaagtggagttgtatgaatgagtgattatactttggatatgatttttaccatgagat 2809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 70; Significance: 1e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 87 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 271043 - 270934
Alignment:
Q  87 acttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggt 185  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |    
T  271043 acttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgat 270944  T
Q  186 gaatactatg 195  Q
    ||||||||||    
T  270943 gaatactatg 270934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 237177 - 236986
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||    | | |  | |||||| | || | |||| |||||||    
T  237177 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtattttggatatgatatttatcatgaaatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaagaaatgcttga 237081  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatttaatt 203  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||| |||| || | |||| ||||| |||||||||||||    
T  237080 attggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgatgatcatattgatgtggagatgatgaatgctatgatttaatt 236986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 3 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 68527 - 68399
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||| ||||| ||| ||||||  |  ||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || ||||||| |||||||| |    
T  68527 cttgtatgactaaatgaaggtgtgtgaatggattgttacatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttgaaatatgagaa 68431  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| ||| | ||||||||||| ||||| ||||    
T  68430 atgtttggagtggtgaaactacatgatgtagt 68399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 69; Significance: 4e-31; HSPs: 4)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 138065 - 138161
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  138065 gaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 138161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 87346 - 87247
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| ||||||||| |||||    
T  87346 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactacgattt 87248  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 110 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 10564 - 10500
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||| ||||||| |||  |||| ||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10564 aatggtaaaactatgtgaggtagttgatattgaatgacattgttgattgttgataatcatgttga 10500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 2 - 68
Target Start/End: Original strand, 137972 - 138036
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||| ||||||| ||||||||||||    
T  137972 tcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgaga 138036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 28023 - 27825
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||   ||| |   |  | ||||||||||||||||    
T  28023 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttgaatatgatgtttatcatgaga---tgtgtaggctatcttacttggaatatgag 27929  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| ||||| |||||| ||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||  | |||    |||| |||||||||||||||||||    
T  27928 aatgcttgaattggtg-aactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgatttttgataaataagttattttgtgaatggtgaatactatgattt 27830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 248799 - 248897
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||| ||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  248799 ttgaattggtgaaactatttgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 248897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 6893 - 6727
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||   ||  || |||||| |||  | || |||||    
T  6893 tatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagtt--ctcttacttagaacgtaagaaatgc 6796  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||| | | |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6795 ttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgatcatgttga 6727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 6539 - 6359
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | |  |||||||||    
T  6539 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaaataatgcttga 6445  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    | |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  6444 a-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatga 6359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 85 - 189
Target Start/End: Original strand, 17328 - 17433
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatg 183  Q
    ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||    
T  17328 ttacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatatagttgatgttgaatgacattgttgattactgataatcgtgttgatgtgtgatg 17427  T
Q  184 gtgaat 189  Q
     |||||    
T  17428 atgaat 17433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 4)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 7812 - 8011
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |  | |||    ||||| |||| | |    
T  7812 ttcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgatatcc----tacttagaatgtaa 7905  T
Q  100 g-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  7906 ggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatt 8005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 13201 - 13400
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| | |  | |||    ||||| |||| | |    
T  13201 ttcttatatgactaagtaaagttgtatgaatgaattattatat--tgaatatgatgtttatcatgagatgtgtatgatatcc----tacttagaatgtaa 13294  T
Q  100 g-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    | ||||| |||||||||||||| |||||| ||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||    
T  13295 ggaatgcatgaaatggtgaaaccatatgagataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatt 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 18209 - 18111
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18209 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattg 18111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 20293 - 20195
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| | ||||||||||||||||||||    
T  20293 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatcttgatgtgtgaggatgaatactatgatttaattg 20195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 7797 - 7597
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga- 99  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| | |||||||||||||    | | |  | |||||| |||| | |     
T  7797 ttcttatatgaataagtgaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtgtatcatgagatgtg---tatgctatcttacttagaatgtaat 7703  T
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||  |||||||    
T  7702 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgagatagtttatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtggtgatgatgaatcttatgatt 7603  T
Q  199 taattg 204  Q
    | ||||    
T  7602 tgattg 7597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 47129 - 46929
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||   | ||  |   |||||| | || | ||    
T  47129 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatc---ttacttaggatgtaag 47035  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||| ||||||||    
T  47034 aaatgcttgaattggtgaaactatatgcgatagttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatt 46935  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  46934 taattg 46929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 60577 - 60377
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||   | ||  |   |||||| | || | ||    
T  60577 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttatcatgagatgtgcatgttatc---ttacttaggatgtaag 60483  T
Q  101 aa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgatt 198  Q
    || |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| | || |||||| | ||| ||||||||    
T  60482 aaatgcttgaattggtgaaactatatgcgatagttgatgttgaatgacattgttaattattgataatcatgttaatgtggtgatgattaatgctatgatt 60383  T
Q  199 taattg 204  Q
    ||||||    
T  60382 taattg 60377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 3)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 200
Target Start/End: Original strand, 70555 - 70750
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctat--tacttggaatatg 98  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||      | | ||||  ||||| | || |     
T  70555 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg-----tacactatcttacttaggatgta 70647  T
Q  99 agaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||    
T  70648 agaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgat 70747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 200
Target Start/End: Original strand, 25979 - 26078
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |||||||||||||||    
T  25979 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgataatgtgtgatgatgaatactatgattt 26077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 93699 - 93530
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||  |||||||||||||| |||  | ||    |||||| |||| | |    
T  93699 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgag--atatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatc----ttacttagaatgtaa 93606  T
Q  100 gaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| || || ||||||||||||||| ||||||||||    
T  93605 gaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttga 93530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 65; Significance: 1e-28; HSPs: 6)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 1e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 205
Target Start/End: Original strand, 75959 - 76051
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattga 205  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  75959 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgaaattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgaagaatactatgatttaattga 76051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 113 - 204
Target Start/End: Original strand, 124558 - 124649
Alignment:
Q  113 ggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  124558 ggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgattttgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatgatgaatactatgatttaattg 124649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 256073 - 256266
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | || |||||    
T  256073 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaaggaatgc 256167  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacatt-gttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  256168 ttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattg 256266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 7 - 204
Target Start/End: Original strand, 262679 - 262872
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||  || ||||||| |||||||||||||||    | | |  | |||||| | || | || |||||    
T  262679 tatgactaagttaagttgtatgaatgaatgattgtat--tggatatgatgtttatcatgagatgtg---tatgctatcttacttaggatgtaaggaatgc 262773  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacatt-gttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| || |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  262774 ttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgaagttgaatgacatttgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattg 262872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 193514 - 193416
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||   |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  193514 ttgaactggtgaaacgatatgtggtagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtttatgtgtgttgaagaatactatgatttaattg 193416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 193575 - 193517
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  193575 actaattgaagttgtatgaatgaatgattata--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 193517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 6404 - 6507
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||||||||||||||    
T  6404 aatgtttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtgttgatgaatactatgattta 6503  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  6504 attg 6507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 64; Significance: 4e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 27767 - 27870
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||| ||||| || ||||||||||||  | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  27767 aatgtttgaattgttgaaactatatgtgaaagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 27866  T
Q  201 attg 204  Q
    ||||    
T  27867 attg 27870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 32451 - 32549
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32451 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgctgattattgataatcatgttgatatgtgatgatgaatactatgatttaattg 32549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 32352 - 32420
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||  ||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  32352 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaataaatgattgta--ttggatatgatgtttatgatgagatgt 32420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 173
Target Start/End: Complemental strand, 145930 - 145761
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||||||||||| ||| | ||  || |||||| |||| | ||    
T  145930 ttcttatatgactaagtgaagttgtataaatgaatgattgtatgttggatatgatgattatcatgagatg-tgtatgtt--ctcttacttagaatgtaag 145834  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttg 173  Q
     ||| |||||| |||| ||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  145833 aaattcttgaattggtaaaactatatgagatagtggatg-tgaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 145761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 110 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 21557 - 21467
Alignment:
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||||    
T  21557 aatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgattta 21467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 4 - 41
Target Start/End: Original strand, 129381 - 129418
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattat 41  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  129381 ttgtataactaagtgaagttgtatgaatgaatgattat 129418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 14587 - 14487
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttg-attattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  14587 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattgataatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgattt 14488  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  14487 a 14487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 61; Significance: 2e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Original strand, 12995 - 13090
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||    
T  12995 gaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgaagatgaatactatga 13090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 227 - 161
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  227 ttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Original strand, 649 - 748
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  |||||  | |||| |||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  649 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaacgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtaaatgtgtgatggtgaatactatgattta 748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 100 - 203
Target Start/End: Original strand, 11179 - 11282
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    ||||| ||||| ||||||| |||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||| |||||||||||||||    
T  11179 gaatgtttgaattggtgaatctatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcttgttgatgtgtaatgttgaatactatgattt 11278  T
Q  200 aatt 203  Q
    ||||    
T  11279 aatt 11282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 68
Target Start/End: Original strand, 11082 - 11149
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgaga 68  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||| |||  |||| || |||||||||||    
T  11082 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatgaaagattgtattttggttatggtaattatcatgaga 11149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Original strand, 5868 - 5967
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatg-ttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| |||||||||||||||  ||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  5868 ttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgattgaatgacattgttgattattgataatcatgttgaggtgtgatgataaatactatgatttaattg 5967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 7 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 2429 - 2263
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||   ||  || |||||| |||  | || |||||    
T  2429 tatgactaagagaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgtttatcatggaatgttgtaagtt--ctcttacttagaacgtaagaaatgc 2332  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||| | | |||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  2331 ttgaaatgataagactatatgaggtagttgatgttgaatgacattgttgattatagatgatcatgttga 2263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 100 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 3568 - 3472
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||| ||||||    
T  3568 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgtgatagttgatgctgaatgacattgttgattatcgataatcatgttgatgtgtgatgaggaatgctatga 3472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 2 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3661 - 3594
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  3661 tcttttatgactaagtgaagttgtatgaatgaattattgta--ttggatatgatgtttatcatgagatgt 3594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 5)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 1076 - 1008
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1076 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 1008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 15332 - 15264
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  15332 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatattttggatatgatgtttatcatgagat 15264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 933 - 894
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  933 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 38 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 15189 - 15150
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 77  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15189 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgtttt 15150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 12055 - 12023
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 33  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12055 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 12023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 169
Target Start/End: Original strand, 23621 - 23786
Alignment:
Q  3 cttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-a 101  Q
    ||||||||||||| || || | | ||||||| |  |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||| |    
T  23621 cttgtatgactaaatggagatatgtgaatgaattgttatatgttggatatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaa 23718  T
Q  102 atgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcat 169  Q
    ||  ||||| |||||||||||| |||| |||| ||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||    
T  23719 ataattgaagtggtgaaactatctgatgtagttgatgttgaatgatattgatgattattgatgatcat 23786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 85 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 34493 - 34373
Alignment:
Q  85 ttacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatg 183  Q
    ||||||||||||  | |||||||||| |||||||||||||||  |||||  |||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||    
T  34493 ttacttggaataccaaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttaatgttgaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatg 34394  T
Q  184 gtgaatactatgatttaattg 204  Q
     ||||| ||||||||||||||    
T  34393 atgaatgctatgatttaattg 34373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30095 - 29995
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttg-attattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| | |||||||| |||||||||||||||    
T  30095 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgaattattggtaatcatgttaatgtgtgatgatgaatactatgattt 29996  T
Q  200 a 200  Q
    |    
T  29995 a 29995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 57; Significance: 6e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 13106 - 13002
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaag-tgtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| ||||| |||||||||    
T  13106 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgaggtgatgatgaatgctatgattt 13007  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  13006 aattg 13002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13202 - 13134
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| |||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||    
T  13202 ttcttatatggctaagtgaatttgtatgaatgaatgattgt--gttggatatgatatttatcatgagatgt 13134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 106 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 2084 - 1986
Alignment:
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||||| |||||  ||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  2084 ttgaagtggtgaaaccatatgtgatagttgatgttgaataacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgttgaagaatactatgatttaattg 1986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 2145 - 2087
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2145 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattata--ttgcatatgatgtttatcatgagatgt 2087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Original strand, 6613 - 6718
Alignment:
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| || || |||||||    
T  6613 agaatgcttgaa-tggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatggatgctatgat 6711  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  6712 ttaattg 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 100 - 174
Target Start/End: Original strand, 3046 - 3120
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3046 gaatacttgaaatggtgaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttga 3120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 2951 - 2983
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatga 33  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  2951 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaatga 2983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 204
Target Start/End: Original strand, 17558 - 17758
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt-tgttttttccctattacttggaatatga 99  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||||    |||||||  |||||||||||||| |||  | ||    |||||| |||| | |    
T  17558 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgtatgag--atatgatgattatcatgagatgtgtgtgctatc----ttacttagaatgtaa 17651  T
Q  100 gaa-tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    ||| |||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  17652 gaaatgcttgaattggtgaaactatatgtgatagttgatgttgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtagtgatgatgaatgctatgat 17751  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  17752 ttaattg 17758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 24073 - 24177
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| |||||||||||||||  ||| | ||| ||| || || ||||||||||||||| |||||||||| || |||||| |||||  ||||||||    
T  24073 aatgcttgaattggtgaaactatatgtgataattgatattgaataactttgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgttatgattt 24172  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  24173 aattg 24177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 138 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 40468 - 40402
Alignment:
Q  138 gttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  40468 gttgaatgacattgttgattattgataatcatgttgatgtgtgatgatgaatactatgatttaattg 40402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 2 - 174
Target Start/End: Original strand, 113718 - 113885
Alignment:
Q  2 tcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag- 100  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||    | | |  | ||||| | ||| | ||     
T  113718 tcttatatgactaagggaagttgtatgaatgaatgattgtat--tgaatatgatatttatcatgagatgtg---tatgctatcttactag-aatgtaagg 113811  T
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||  ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  113812 aatgcttgaaacggtgaaactacatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgataattgataatcatgttga 113885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 108666 - 108598
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||||    
T  108666 ttcttatatgattaagtgaagttgtatgaatgaatgattatatgttggatatgatgcttatcatgagat 108598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 4 - 146
Target Start/End: Complemental strand, 130905 - 130764
Alignment:
Q  4 ttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa- 102  Q
    |||||||||||| ||||| |||  |||||| |  |||  ||||| ||||||||||||||||| | |||||| ||||  || ||||||| ||||||||||     
T  130905 ttgtatgactaaatgaagatgtgggaatgaattgttaattgttggatatgatatttatcatggggtgttgtatttt--ctcttacttgaaatatgagaag 130808  T
Q  103 tgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatga 146  Q
    | |||| | || ||||||||||| || |||| ||| ||| ||||    
T  130807 tacttggagtgatgaaactatattatgtagttgatattgaatga 130764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 11324 - 11393
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11324 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgaggtgtgatgatgaatactatgatttaattg 11393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 49; Significance: 3e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 3e-19
Query Start/End: Original strand, 101 - 204
Target Start/End: Original strand, 13448 - 13552
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgattt 199  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  ||||| ||||| | || |||||||||||||||||| |||||||||| || |||||| ||||| |||||||||    
T  13448 aatgcttgaattggtgaaactaaatgtgatagttgatgtggaataacattgttgattattgatgatcatgttgatgtggtgatgatgaatgctatgattt 13547  T
Q  200 aattg 204  Q
    |||||    
T  13548 aattg 13552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 71
Target Start/End: Original strand, 13352 - 13420
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgt 71  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||  | |||||||  ||||||||||||||    
T  13352 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgattgaatgattgtatg--ggatatgatgcttatcatgagatgt 13420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 99 - 204
Target Start/End: Original strand, 2093 - 2198
Alignment:
Q  99 agaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagt-gtgatggtgaatactatgat 197  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||| |||| ||    
T  2093 agaatgcttgaa-tgataaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgttaatgtggtgatgatgaatgctataat 2191  T
Q  198 ttaattg 204  Q
    |||||||    
T  2192 ttaattg 2198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 107 - 204
Target Start/End: Original strand, 1886 - 1983
Alignment:
Q  107 tgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||||||||||||| |||||| ||| | | |||||  |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  ||||| ||||||||| ||||    
T  1886 tgaaatggtgaaaccatatgagataattgttgttgagtgacattgttgattattgataatcgtgttgatgtgtgataatgaatcctatgatttgattg 1983  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 30221 - 30156
Alignment:
Q  135 gatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  30221 gatgttggatgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgatgatgaatactatgattta 30156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 9 - 159
Target Start/End: Original strand, 6301 - 6450
Alignment:
Q  9 tgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa-tgctt 107  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||| |  ||| |||||| |||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |  ||||||| |||||||||| |  ||    
T  6301 tgactaagtgaagatgtatga-tgaattgttagatgttggatatgatattgatcataagatgttgtgttttctcg-ttacttgcaatatgagaaataatt 6398  T
Q  108 gaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattat 159  Q
    | |||||||||||||||||| |||||  |||||| |||| |||| |||||||    
T  6399 ggaatggtgaaactatatgacatagttaatgttgaatgatattgatgattat 6450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24076 - 23909
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag 100  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||  ||||||||||| || |||||||||   ||  | | |  | |||||| | || | ||    
T  24076 ttcttgtataactaagtgaagttgtatgattgaatgattgta--ttgaatatgatgttcatcatgaga---tgagtatgctatcttacttaggatgtaag 23982  T
Q  101 -aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgtt 172  Q
     |||||||| | |||||||| | |||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23981 aaatgcttgtactggtgaaattgtatgttatagttgatgttgaatgacattgttgattattgataatcatgtt 23909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 129 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 69645 - 69570
Alignment:
Q  129 atagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||    
T  69645 atagttgatgttgaatgacattgttgattattgattatcatgatgatgtgtgatgatgaatcctatgatttgattg 69570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 38 - 133
Target Start/End: Original strand, 98352 - 98445
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  98352 ttatatgttga-tatgatatttatcataagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaaataattggagtggtgaaactatatgatgtagt 98445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 101 - 196
Target Start/End: Original strand, 71707 - 71801
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatga 196  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||  |||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||| || | ||| |||| ||||||||||||    
T  71707 aatgcttgaa-tggtgaaactaaatgtaatagttcatgttgaatgacattgttgattattgataatcatattaatgtgcgatgatgaatactatga 71801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0554 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0554
Description:

Target: scaffold0554; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 101 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 816 - 754
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgat 163  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||| |||||||||||||||||||||    
T  816 aatgcttgaaatggtaaaactatatgagatagttaatgttgaatgacattgttgattattgat 754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 130 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 8957 - 8883
Alignment:
Q  130 tagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgatttaattg 204  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||||| | |||| ||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  8957 tagttgatgttgaatgacattgttgattattgatgaacatgatgatgtgtgatgatgaatactatgaattaattg 8883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1752 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1752
Description:

Target: scaffold1752; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 500 - 427
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  500 aatgcttgaaattgttaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttga 427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 666 - 558
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  666 atgttggatatgatatttatcatgaggtgttttgttttctct-ttacttataatatgagaaatattggaatggtgaaactatatgatgtagttgatgttg 568  T
Q  142 catgacattg 151  Q
     |||| ||||    
T  567 aatgatattg 558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 42 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 5721 - 5613
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||    
T  5721 atgttggatatgatatttatcatgaggtgttttgttttctct-ttacttataatatgagaaatattggaatggtgaaactatatgatgtagttgaagttg 5623  T
Q  142 catgacattg 151  Q
     |||| ||||    
T  5622 aatgatattg 5613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 42 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 4254 - 4146
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttg 141  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |||| | ||||| || ||||||  ||||||||||   ||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  4254 atgttggatatgatatttatcatgaggtgttttgttttctct-ttacttataatatgagaaatattggaatggtgaaactatatgatgtagttgatgttg 4156  T
Q  142 catgacattg 151  Q
     |||| ||||    
T  4155 aatgatattg 4146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 38 - 141
Target Start/End: Original strand, 1460 - 1562
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaat-gcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||  ||  |||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | || ||    
T  1460 ttatatgttggatatgatatttgtcatgagatgttgtatgttatct--tacttggaatatgagaattgtttggaatggtgaaactatatgatgtggttga 1557  T
Q  137 tgttg 141  Q
    |||||    
T  1558 tgttg 1562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 20616 - 20543
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  20616 aatgcttgaaattgtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttga 20543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 27445 - 27372
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    |||||||||||| || |||||||||||  |||| ||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  27445 aatgcttgaaattgtaaaactatatgaggtagttgatgttgaatgatattgttgattattgatgatcatgttga 27372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 40; Significance: 0.00000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 115 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 4734 - 4651
Alignment:
Q  115 tgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtg-atggtgaatactatgat 197  Q
    ||||||||||||  ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||   ||||| |||||||||||||||||    
T  4734 tgaaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattgttgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgat 4651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 143 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 5857 - 5800
Alignment:
Q  143 atgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatgattta 200  Q
    |||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||| | ||||||||||||||||    
T  5857 atgacattgttgattattgataaatatgttgatgtgtgaggatgaatactatgattta 5800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 101 - 173
Target Start/End: Original strand, 6596 - 6667
Alignment:
Q  101 aatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttg 173  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||| ||| | ||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  6596 aatgcttgaattggtaaaactatatgagataattgatgt-gaatgacattgttgattattgatgatcatgttg 6667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 47
Target Start/End: Original strand, 5583 - 5629
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttg 47  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| || ||| |||||||||    
T  5583 ttcttatatgactaagtgaagttgtatgaacgaatgactatatgttg 5629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 7 - 133
Target Start/End: Complemental strand, 30127 - 30003
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||||||| ||| |  |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| | ||  || |||||||||||||||| |||      
T  30127 tatgactaaatgaagatgtatgagtgaattgttatagcttga-tatgatatttatcatgagatgttgtatgtt--ctcttacttggaatatgagaaataa 30031  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||    
T  30030 ttggagtggtgaaactatatgatgtagt 30003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0091 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0091
Description:

Target: scaffold0091; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 174
Target Start/End: Original strand, 43127 - 43285
Alignment:
Q  11 actaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga-gaatgcttga 109  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||  || |||||||| ||||||||||||   ||| | | |  | |||||| |||| | | |||||||||     
T  43127 actaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttaaatatgatgtttatcatgaga---tgtgtatgctatcttacttagaatgtaaggaatgcttg- 43220  T
Q  110 aatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttga 174  Q
    ||||||||||  |||||  ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| | |||||||    
T  43221 aatggtgaaatcatatgtgatagttgatgtttaatgacattgttgattattgatagttatgttga 43285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 38 - 160
Target Start/End: Original strand, 24793 - 24915
Alignment:
Q  38 ttatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatga-gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtgga 136  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| ||||| |  ||||||| |||||||  |||  ||| | ||||||||||||||||| || | ||    
T  24793 ttatatgttgaatataatatttatcatgaggtgttgtattttctc-gttacttgaaatatgataaatatttggagtggtgaaactatatgatgtatttga 24891  T
Q  137 tgttgcatgacattgttgattatt 160  Q
    ||||| ||||  ||| ||||||||    
T  24892 tgttgaatgatgttgatgattatt 24915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 100 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 59631 - 59561
Alignment:
Q  100 gaatgcttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatg 170  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| | ||| | ||||||| |||||||||||| ||||| || ||||||    
T  59631 gaatgtttgaaatggtgaaactatataagataattgatgttgaatgacattgttggttattaatgatcatg 59561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 148 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 59422 - 59375
Alignment:
Q  148 attgttgattattgataatcatgttgaagtgtgatggtgaatactatg 195  Q
    |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  59422 attgatgattattgatgatcatgatgatgtgtgatggtgaatactatg 59375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 55
Target Start/End: Original strand, 330965 - 331019
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgat 55  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| ||| |||||||    
T  330965 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgaatgaatgtattttggatatgat 331019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 446 - 365
Alignment:
Q  117 aaactatatgatatagtggatgttgcatgacattgttgattattgataatcatgttgaagtgtga-tggtgaatactatgat 197  Q
    ||||||||||  ||||| ||||||| |||||||| |||||| |||||||||| |||   |||||| ||||||||||||||||    
T  446 aaactatatgtgatagttgatgttgaatgacattattgattgttgataatcaagttattgtgtgaatggtgaatactatgat 365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 69
Target Start/End: Original strand, 1527 - 1593
Alignment:
Q  1 ttcttgtatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagat 69  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||| ||  ||| ||||||| |||||||||||||    
T  1527 ttcttatatggctaagtgaagttgtatgaatgaatgattgta--ttggatatgatgtttatcatgagat 1593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 49 - 123
Target Start/End: Original strand, 78037 - 78110
Alignment:
Q  49 atatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgcttgaaatggtgaaactat 123  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||  |||||||||||||||| |||  ||||| ||||||||||||    
T  78037 atatgatatttatcatgtgatgttgtatgttccc--ttacttggaatatgagaaataattgaagtggtgaaactat 78110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 7 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 3710 - 3573
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgag-aatgc 105  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||       ||||||||||||| |||      
T  3710 tatgactaa-tgaagatgtgtgaatgaatg-ttatatgttggatatgatatttatcataaggtgttgtattttc------tcttggaatatgagaaatat 3619  T
Q  106 ttgaaatggtgaaactatatgatatagtggatgttgcatgacattg 151  Q
    ||| | ||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||| ||||    
T  3618 ttggagtggcgaaactatatgatgtagttgatgttgaatgatattg 3573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.00000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 42 - 133
Target Start/End: Original strand, 12135 - 12225
Alignment:
Q  42 atgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaatgct-tgaaatggtgaaactatatgatatagt 133  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||  |||||| ||||||||||   | || ||||||||||| ||||||| ||||    
T  12135 atgttggatatgatattaatcatgagatgttgtattttctct--tacttgtaatatgagaaatatgtgtaatggtgaaaccatatgatttagt 12225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 7 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 34463 - 34371
Alignment:
Q  7 tatgactaagtgaagttgtatgaatgagtgattatatgttgaatatgatatttatcatgagatgttgttttttccctattacttggaatatgagaa 102  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||| |  || |||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| | ||| ||  |||||||||||||||||    
T  34463 tatgactaaatgaagatgtgtgaatgacttgttgtatgtt-aatatgaaatttatcataagatgttgtatgttctct--tacttggaatatgagaa 34371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University