View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15582_low_5 (Length: 222)

Name: NF15582_low_5
Description: NF15582
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15582_low_5
NF15582_low_5
[»] chr2 (15 HSPs)
chr2 (1-209)||(28406037-28406245)
chr2 (1-209)||(25175911-25176118)
chr2 (1-209)||(7585-7793)
chr2 (1-186)||(23791358-23791543)
chr2 (1-186)||(18786755-18786939)
chr2 (1-186)||(23207362-23207546)
chr2 (1-209)||(22134070-22134267)
chr2 (2-72)||(22459415-22459485)
chr2 (1-186)||(25108972-25109157)
chr2 (109-186)||(20520152-20520229)
chr2 (146-186)||(24697603-24697643)
chr2 (141-184)||(23004835-23004878)
chr2 (108-209)||(7679646-7679746)
chr2 (147-209)||(19671891-19671952)
chr2 (102-209)||(23071905-23072009)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (5-209)||(19325-19528)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (1-209)||(22921722-22921929)
chr1 (1-209)||(33681068-33681275)
chr1 (1-209)||(21861422-21861630)
chr1 (1-209)||(22237688-22237896)
chr1 (1-186)||(21896111-21896294)
chr1 (1-162)||(35981541-35981701)
chr1 (1-162)||(49261447-49261607)
chr1 (1-186)||(50686696-50686881)
chr1 (1-186)||(16368139-16368322)
chr1 (1-209)||(21754106-21754303)
chr1 (1-154)||(52927835-52927988)
chr1 (5-209)||(20248340-20248539)
chr1 (4-161)||(20636957-20637113)
chr1 (7-209)||(20918665-20918863)
chr1 (1-72)||(12271744-12271815)
chr1 (4-186)||(41049891-41050072)
chr1 (1-186)||(50613969-50614153)
chr1 (1-186)||(50621797-50621981)
chr1 (102-209)||(14295507-14295611)
chr1 (109-186)||(16093843-16093921)
chr1 (102-186)||(51130647-51130729)
chr1 (102-209)||(22130863-22130967)
chr1 (141-186)||(26065023-26065067)
chr1 (156-209)||(35261086-35261138)
[»] scaffold1257 (1 HSPs)
scaffold1257 (1-209)||(2071-2278)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (1-209)||(40027-40234)
scaffold0023 (1-209)||(100435-100642)
scaffold0023 (1-64)||(101599-101661)
[»] chr7 (26 HSPs)
chr7 (5-193)||(18005722-18005910)
chr7 (5-209)||(67806-68008)
chr7 (1-209)||(44014239-44014440)
chr7 (5-209)||(16219574-16219777)
chr7 (1-186)||(16056410-16056595)
chr7 (2-209)||(47831868-47832074)
chr7 (1-209)||(22072974-22073183)
chr7 (5-209)||(810988-811191)
chr7 (2-186)||(12901408-12901595)
chr7 (1-208)||(15754742-15754946)
chr7 (4-75)||(16324199-16324270)
chr7 (3-209)||(34200847-34201049)
chr7 (1-186)||(20220042-20220224)
chr7 (1-162)||(9389550-9389710)
chr7 (1-81)||(15113131-15113211)
chr7 (3-57)||(28505156-28505210)
chr7 (3-209)||(11995885-11996087)
chr7 (1-72)||(15116677-15116748)
chr7 (143-209)||(2280114-2280179)
chr7 (102-209)||(16495463-16495567)
chr7 (83-185)||(14044832-14044935)
chr7 (83-185)||(14354862-14354965)
chr7 (109-186)||(1867954-1868031)
chr7 (143-209)||(10063813-10063878)
chr7 (109-186)||(15008458-15008535)
chr7 (148-184)||(16324135-16324171)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (1-209)||(2657-2866)
[»] scaffold0621 (2 HSPs)
scaffold0621 (5-209)||(6596-6798)
scaffold0621 (1-209)||(8527-8737)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (5-209)||(5704-5906)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (5-209)||(2502-2705)
[»] scaffold0008 (1 HSPs)
scaffold0008 (5-193)||(14554-14742)
[»] chr8 (22 HSPs)
chr8 (5-209)||(21673765-21673967)
chr8 (5-209)||(23760698-23760904)
chr8 (1-209)||(38855105-38855311)
chr8 (4-209)||(6520429-6520632)
chr8 (1-209)||(21285658-21285865)
chr8 (5-209)||(26355557-26355758)
chr8 (2-186)||(37116432-37116616)
chr8 (1-186)||(20498645-20498831)
chr8 (1-186)||(17266845-17267030)
chr8 (3-209)||(5866132-5866334)
chr8 (1-186)||(983255-983442)
chr8 (3-209)||(21491056-21491258)
chr8 (1-186)||(24353105-24353292)
chr8 (3-209)||(17140977-17141179)
chr8 (1-186)||(22364746-22364930)
chr8 (80-186)||(17439436-17439543)
chr8 (141-186)||(40492844-40492889)
chr8 (3-46)||(21255442-21255485)
chr8 (143-209)||(13508080-13508145)
chr8 (102-209)||(21249446-21249550)
chr8 (102-209)||(21255284-21255388)
chr8 (5-46)||(21249604-21249645)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (1-209)||(10588-10795)
[»] chr3 (28 HSPs)
chr3 (1-209)||(15470985-15471191)
chr3 (1-209)||(16103841-16104047)
chr3 (1-209)||(16097389-16097596)
chr3 (5-209)||(14234548-14234753)
chr3 (1-209)||(32307738-32307935)
chr3 (1-160)||(49389483-49389642)
chr3 (1-209)||(1644537-1644734)
chr3 (1-186)||(37251020-37251204)
chr3 (1-209)||(13210182-13210387)
chr3 (1-162)||(1465264-1465424)
chr3 (1-53)||(12934165-12934217)
chr3 (1-209)||(49667938-49668136)
chr3 (93-209)||(12174206-12174319)
chr3 (5-64)||(9513112-9513171)
chr3 (5-64)||(9521087-9521146)
chr3 (1-75)||(43927327-43927401)
chr3 (146-186)||(52523725-52523765)
chr3 (1-186)||(22110204-22110388)
chr3 (109-186)||(43926043-43926121)
chr3 (146-186)||(2051197-2051237)
chr3 (163-209)||(9512981-9513026)
chr3 (163-209)||(9520956-9521001)
chr3 (143-209)||(23274748-23274813)
chr3 (143-209)||(24340718-24340783)
chr3 (143-209)||(42386470-42386536)
chr3 (143-209)||(12399269-12399335)
chr3 (5-34)||(12171963-12171992)
chr3 (153-186)||(12378006-12378039)
[»] chr4 (16 HSPs)
chr4 (1-209)||(39706142-39706348)
chr4 (5-186)||(12288066-12288246)
chr4 (1-180)||(8846461-8846640)
chr4 (1-209)||(12774068-12774265)
chr4 (1-209)||(13703-13911)
chr4 (4-162)||(15099456-15099613)
chr4 (1-162)||(15190423-15190583)
chr4 (1-186)||(53082003-53082188)
chr4 (3-209)||(16596709-16596911)
chr4 (1-186)||(43198408-43198591)
chr4 (3-46)||(15552036-15552079)
chr4 (1-186)||(46640309-46640492)
chr4 (11-75)||(14164743-14164807)
chr4 (146-186)||(15464929-15464969)
chr4 (102-209)||(15551878-15551982)
chr4 (146-209)||(52243192-52243256)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (9-209)||(62259-62455)
scaffold0028 (1-64)||(132856-132919)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (1-209)||(10394-10601)
[»] scaffold0476 (1 HSPs)
scaffold0476 (1-209)||(12827-13034)
[»] chr6 (19 HSPs)
chr6 (1-209)||(22080592-22080798)
chr6 (2-186)||(23019489-23019673)
chr6 (1-209)||(19652256-19652461)
chr6 (1-186)||(19668456-19668640)
chr6 (1-209)||(28496327-28496531)
chr6 (1-209)||(29808738-29808942)
chr6 (1-208)||(1561365-1561569)
chr6 (1-75)||(27333138-27333212)
chr6 (1-75)||(27393878-27393952)
chr6 (1-209)||(20109199-20109409)
chr6 (1-75)||(9098378-9098452)
chr6 (1-75)||(35008344-35008418)
chr6 (4-184)||(23076817-23076997)
chr6 (154-209)||(4185827-4185881)
chr6 (154-209)||(4668217-4668271)
chr6 (154-209)||(4675064-4675118)
chr6 (82-186)||(18696571-18696675)
chr6 (168-209)||(27333238-27333278)
chr6 (168-209)||(27393978-27394018)
[»] scaffold0556 (2 HSPs)
scaffold0556 (1-186)||(8098-8283)
scaffold0556 (5-209)||(6873-7073)
[»] chr5 (14 HSPs)
chr5 (1-209)||(21502007-21502216)
chr5 (1-209)||(21329350-21329557)
chr5 (1-209)||(21565603-21565810)
chr5 (1-209)||(26011888-26012095)
chr5 (1-186)||(20026793-20026977)
chr5 (5-209)||(19668959-19669161)
chr5 (5-209)||(22959392-22959592)
chr5 (1-186)||(22178072-22178257)
chr5 (3-209)||(19660693-19660895)
chr5 (102-162)||(21741486-21741546)
chr5 (1-60)||(21741398-21741457)
chr5 (141-186)||(29448087-29448132)
chr5 (146-186)||(22144132-22144172)
chr5 (1-64)||(25743925-25743988)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (1-209)||(32597-32803)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (1-209)||(129966-130173)
scaffold0010 (146-186)||(60713-60752)
[»] scaffold1765 (1 HSPs)
scaffold1765 (1-209)||(1143-1350)
[»] scaffold0333 (2 HSPs)
scaffold0333 (1-209)||(6672-6879)
scaffold0333 (1-209)||(14052-14259)
[»] scaffold1984 (1 HSPs)
scaffold1984 (2-209)||(190-395)
[»] scaffold0001 (1 HSPs)
scaffold0001 (1-209)||(160745-160951)
[»] scaffold0138 (2 HSPs)
scaffold0138 (1-209)||(13000-13207)
scaffold0138 (1-186)||(18090-18275)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (5-214)||(5980-6188)
[»] scaffold0037 (1 HSPs)
scaffold0037 (1-209)||(22527-22730)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (1-186)||(7929-8110)
scaffold0218 (3-58)||(29135-29190)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (1-208)||(45645-45851)
[»] scaffold0530 (1 HSPs)
scaffold0530 (5-209)||(892-1094)
[»] scaffold0021 (2 HSPs)
scaffold0021 (2-186)||(136221-136405)
scaffold0021 (2-186)||(144929-145113)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (1-209)||(53401-53609)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (1-209)||(12629-12836)
[»] scaffold1351 (1 HSPs)
scaffold1351 (5-186)||(89-270)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-186)||(6135-6320)
[»] scaffold0040 (1 HSPs)
scaffold0040 (2-186)||(103492-103667)
[»] scaffold0006 (2 HSPs)
scaffold0006 (1-186)||(97090-97274)
scaffold0006 (1-186)||(106368-106552)
[»] scaffold0022 (2 HSPs)
scaffold0022 (32-186)||(128853-129007)
scaffold0022 (4-186)||(78407-78587)
[»] scaffold0020 (2 HSPs)
scaffold0020 (1-75)||(15685-15759)
scaffold0020 (163-209)||(15792-15837)
[»] scaffold0261 (1 HSPs)
scaffold0261 (3-209)||(15722-15924)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (1-186)||(38401-38586)
[»] scaffold0046 (2 HSPs)
scaffold0046 (3-209)||(11353-11555)
scaffold0046 (102-209)||(2058-2162)
[»] scaffold0211 (1 HSPs)
scaffold0211 (1-53)||(28664-28716)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (7-211)||(7917-8123)
[»] scaffold0737 (1 HSPs)
scaffold0737 (1-186)||(1650-1834)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (5-58)||(34331-34384)
[»] scaffold1137 (1 HSPs)
scaffold1137 (1-52)||(2156-2207)
[»] scaffold0150 (2 HSPs)
scaffold0150 (15-64)||(32296-32345)
scaffold0150 (140-202)||(32166-32227)
[»] scaffold1403 (1 HSPs)
scaffold1403 (1-75)||(744-817)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (102-209)||(1025-1129)
[»] scaffold0161 (1 HSPs)
scaffold0161 (3-53)||(2300-2350)
[»] scaffold0123 (2 HSPs)
scaffold0123 (109-186)||(25191-25268)
scaffold0123 (80-186)||(621-727)
[»] scaffold0357 (2 HSPs)
scaffold0357 (150-209)||(13189-13247)
scaffold0357 (146-186)||(16098-16138)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (163-209)||(23898-23943)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (1-186)||(19737-19921)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (146-186)||(27747-27787)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (154-209)||(9139-9193)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (147-186)||(267745-267784)
[»] scaffold2014 (1 HSPs)
scaffold2014 (143-209)||(1093-1158)
[»] scaffold0247 (1 HSPs)
scaffold0247 (143-209)||(18022-18087)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 15)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 28406245 - 28406037
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28406245 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 28406146  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  28406145 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaagttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgattttgcata 28406046  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  28406045 ctgcctatg 28406037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25176118 - 25175911
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  25176118 cacgaattgatgtaagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 25176019  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||| ||||||||| ||||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  25176018 ttaatgttatataattatatatacgttatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 25175920  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  25175919 ctgcctatg 25175911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 91; E-Value: 3e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 7585 - 7793
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  7585 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttg 7683  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  7684 ttaatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgca 7782  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  7783 tactgcctatg 7793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23791543 - 23791358
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  23791543 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggttggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 23791445  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || | || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  23791444 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatataatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatatttttatatcat 23791358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18786755 - 18786939
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| || |||||||  | |||| |||    
T  18786755 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgctgttgttgtttcagtaagcctaaatt-atatgattgaatgttattg 18786853  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   |||||  ||| || |||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  18786854 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgacgttgttgaattgcatttgagattgttatatcat 18786939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23207546 - 23207362
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  23207546 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttcaagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 23207448  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  ||||||||  |  |   ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23207447 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttataatgttgagatgtcgttgatttgcatttgatattgttatatcat 23207362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22134070 - 22134267
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  || ||  |||||| || | |  ||||||   |||| |||||    
T  22134070 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcatttttccagtaagactga-tgcatatga---attggtgttg 22134165  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||     ||||   |||||||||||||  ||| ||||  ||||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  22134166 tt-----tataatgttgtatatacattaaatggattatgttgataaatgagatgttattga-ttgcattcgatattgttatattatgatgatt-tgcata 22134258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 2 - 72
Target Start/End: Original strand, 22459415 - 22459485
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaag 72  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||    
T  22459415 acgagttgatgtgagttgaccttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttattgtttcagtaag 22459485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25109157 - 25108972
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| |||||||| | | | | ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  25109157 cacgagttgatgtaagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 25109059  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||||   |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||| ||||||||||   || ||||||||||||||||    
T  25109058 ataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatattgttgattttgctttgatattgttatatcat 25108972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 20520152 - 20520229
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20520152 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcat 20520229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 24697603 - 24697643
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24697603 tttgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcat 24697643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 141 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23004878 - 23004835
Alignment:
Q  141 tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 184  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  23004878 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatc 23004835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 108 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7679746 - 7679646
Alignment:
Q  108 tatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcct 206  Q
    ||||||||| ||||||||||  ||||||||  || ||| |||  ||||||| ||| || |||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  7679746 tatataattatatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttacatt-gatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcct 7679649  T
Q  207 atg 209  Q
    |||    
T  7679648 atg 7679646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 147 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19671952 - 19671891
Alignment:
Q  147 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  19671952 ttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatg 19671891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 23071905 - 23072009
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   |||| ||||||  |||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  23071905 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgctgatttatattcgatattattatatcatgatggtt-tgcata 23072000  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  23072001 ctgcctatg 23072009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 161; Significance: 5e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 5e-86
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19528 - 19325
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19528 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcagtaaccctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 19429  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  19428 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgc 19330  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  19329 ctatg 19325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 157; Significance: 1e-83; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 1e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22921722 - 22921929
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||    
T  22921722 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttg 22921821  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  22921822 ttaatgttatataattgtatatacattatatgaattttgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 22921920  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  22921921 ctgcctatg 22921929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 33681275 - 33681068
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  33681275 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 33681177  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  33681176 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgacgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 33681078  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  33681077 actgcctatg 33681068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21861422 - 21861630
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |  || |||||| |  |||||||     
T  21861422 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctattgttgtttcagtaagcctga-atattatgatatgatgttgttt 21861520  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
     |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  21861521 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgca 21861619  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  21861620 tactgcctatg 21861630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22237896 - 22237688
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttg-ttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||  ||  || || ||  | |||||  |  |||||||    
T  22237896 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgattgttgttccagcgagactgataca-tatgaattgatgttgtt 22237798  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
      ||| | ||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  22237797 tctaaagttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgca 22237699  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    || ||||||||    
T  22237698 taatgcctatg 22237688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 21896111 - 21896294
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| | | | |||||| |  |||||||     
T  21896111 cacgagttgatgtgagttgatcttagatgtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgtt---tcagtaagcctgaat-attatgatttgatgttgttt 21896206  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tga-tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||||||||||||||||  |||||||| || ||| | |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21896207 ataatgtgatataattgtatatacattacatgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 21896294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 35981541 - 35981701
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct-aatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||  ||  |||||||||  |||  ||||  |||| ||||| |    
T  35981541 cacgaattgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgat 35981638  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    | ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  35981639 gataatgttatataattgcatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgat 35981701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 49261607 - 49261447
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcc-taatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  ||||||||  ||||  ||||  |||| ||||| |    
T  49261607 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtccttccagtaagccggaattgtatat--tctaatgttgat 49261510  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||||||||    
T  49261509 gataatgttatataattgtatatacattatataaattatgttgatatttgagatgttgttgat 49261447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 50686881 - 50686696
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||||   |||||||     
T  50686881 cacgagttgacgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatccgatgttgtta 50686783  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  50686782 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgacattgttatatcat 50686696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 16368139 - 16368322
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  16368139 cacgagttgatgtgagttgatcataggggtaagaaattaagttgtttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 16368237  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16368238 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcat 16368322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21754303 - 21754106
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||| || | |  ||||||   |||| |||||    
T  21754303 cacgagttgatgtgagttgatctcagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactga-tgcatatga---attgatgttg 21754208  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||     ||||   |||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  21754207 tt-----tataatgttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 21754115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 154
Target Start/End: Original strand, 52927835 - 52927988
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  52927835 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctattgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 52927933  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatg 154  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||    
T  52927934 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatg 52927988  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 61; E-Value: 2e-26
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20248539 - 20248340
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatga-tctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||   |||||| || ||  | ||||| || || ||||||  ||    
T  20248539 agttgatgtaaattgatcttagaggttagaaactaagttatttatcttgatgttgttgtcc-agtaagactgatgca-tatgaatccat-gttgtttata 20248443  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatact 202  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  || ||||||| ||   |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  20248442 atgatatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttaag---ttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatact 20248347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 4 - 161
Target Start/End: Complemental strand, 20637113 - 20636957
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  ||||||||| | ||  |||  | || ||||| || ||    
T  20637113 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctgaatt-gtattttttaatgttgatgata 20637015  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttga 161  Q
    ||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||  |||||| |||||||||||    
T  20637014 atgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgtatttgggatgttgttga 20636957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 7 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20918863 - 20918665
Alignment:
Q  7 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatg 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||  ||||  |||||| || | |   |||||  |  ||||| |  |||||    
T  20918863 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttaccttgttgttaatgttccagtaagactca-tgcttatgaattgatgttgcttataatg 20918765  T
Q  107 gtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcc 205  Q
     ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||    
T  20918764 ttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatactgcc 20918669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 12271815 - 12271744
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| ||||||    
T  12271815 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaag 12271744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Original strand, 41049891 - 41050072
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||| || ||||| |||  |||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||| |||||| |   ||||||  ||    
T  41049891 gagttgatgtgagttgatcataggggtaaggaactaggtttcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgttaata 41049989  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||   ||||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  41049990 atgtgatatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 41050072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 50613969 - 50614153
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||  || ||||||||| | ||| |||||| |  ||||| |     
T  50613969 cacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgata 50614066  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50614067 ttaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 50614153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 50621797 - 50621981
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||||||   | ||| |||||||||||||||| ||||   ||||||  || ||||||||| | ||| |||||| |  ||||| |     
T  50621797 cacgagttgatgtgaattgatcaggg-ggtaagaaactaagttgtttgtcttaccgttgttacttcagtaagcctgaatta-tatgatttgatgttgata 50621894  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50621895 ttaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaaagatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 50621981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 14295507 - 14295611
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  14295507 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcata 14295602  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    || ||||||    
T  14295603 ctacctatg 14295611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 16093843 - 16093921
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16093843 atatatttgtatatacattacatgaattacctatgatgtttgagatgttgtttgatttgcatt-gatattgttatatcat 16093921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 51130729 - 51130647
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  51130729 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcat 51130647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 22130863 - 22130967
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  |||| |||| || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || |||    
T  22130863 taatgttatataattgtatatgcattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tggata 22130958  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  22130959 ctgcctatg 22130967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 26065067 - 26065023
Alignment:
Q  141 tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  26065067 tgatctttgagatgttgttgatttgcatt-ggtattgttatatcat 26065023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 156 - 209
Target Start/End: Original strand, 35261086 - 35261138
Alignment:
Q  156 tgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  35261086 tgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatg 35261138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1257 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold1257
Description:

Target: scaffold1257; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2071 - 2278
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||| | ||||||||    
T  2071 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaaataagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatccaatgttgttg 2170  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  2171 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 2269  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  2270 ctgcctatg 2278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 40027 - 40234
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||  ||||||||    
T  40027 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgatgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatcttatgttgttg 40126  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||    
T  40127 ttaatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgccta 40225  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  40226 ctgcctatg 40234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 100642 - 100435
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  100642 cacgagttgatgtgacttgctcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctaaattaatatgatctaatgttgttg 100543  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||    
T  100542 ttaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttaatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatgatt-tgcata 100444  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  100443 ctgcctatg 100435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 101661 - 101599
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  101661 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttg-ttctcttgttgttgttgtt 101599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 153; Significance: 3e-81; HSPs: 26)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 3e-81
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 18005910 - 18005722
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18005910 agttgatatgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgttgttgttaa 18005811  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgatt 193  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18005810 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt 18005722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 2e-76
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 68008 - 67806
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  68008 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtgagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 67909  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    || |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  67908 tgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgata-ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgc 67811  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  67810 ctatg 67806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 116; E-Value: 4e-59
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 44014440 - 44014239
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||| ||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||     
T  44014440 cacgaattgatgtgagttgatc--agaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttt 44014344  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  44014343 ttaatggtatataactgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagat---gttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 44014248  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  44014247 ctgcctatg 44014239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 110; E-Value: 1e-55
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 16219574 - 16219777
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||||||    
T  16219574 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttgttaa 16219672  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  16219673 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 16219771  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  16219772 cctatg 16219777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 16056595 - 16056410
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||| |  | |||| ||||| ||||||||    
T  16056595 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgttgtttcggtaagcctga-atgatataatctaatgttgttg 16056497  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16056496 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 16056410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 97; E-Value: 8e-48
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 47832074 - 47831868
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||| |     
T  47832074 acgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgtcgc 47831976  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||   ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||    
T  47831975 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatga-tatgcata 47831877  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    ||| |||||    
T  47831876 ctgtctatg 47831868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22073183 - 22072974
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||    
T  22073183 cacgagttgatgtgagttgatcttacaggtaaggaactaagttgtttgtcttgatgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttg 22073085  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaa--attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
    |||||| |||||||||| |||||||||  |||| || |   ||||| |||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  22073084 ttaatgttatataattgcatatacattacatgagtttatgtttgatgtttgagatgttgttgacttacatttgatattgttatatcatgctggttttgca 22072985  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    || ||||||||    
T  22072984 tagtgcctatg 22072974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 810988 - 811191
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||| |||    
T  810988 agttgatgtgagttgaccttggaagttagaaactaagttatttatcttgctgttgtagtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgctaa 811086  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  811087 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 811185  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  811186 cctatg 811191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12901595 - 12901408
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggt---ta-gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttg 97  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | | || ||||||| || |||||    
T  12901595 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtacgtaggaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaatt-atatgatttaatgttg 12901497  T
Q  98 ttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||||  ||| ||||||| || |||||||| ||||||||||||||||    
T  12901496 ttgttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtatgat-gttgtgatgttgctgttttgcatttgatattgttatatcat 12901408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 15754742 - 15754946
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatg-atctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  |||||| || | |  ||||| || || ||||| |    
T  15754742 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgct 15754840  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  15754841 tataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtt-tgca 15754936  T
Q  199 tactgcctat 208  Q
    |||| |||||    
T  15754937 tactacctat 15754946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 4 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 16324270 - 16324199
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16324270 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgttgatcttgctgttgttgtttcagtaagcct 16324199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 34201049 - 34200847
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  |||   |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  34201049 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 34200951  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  34200950 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatac 34200855  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  34200854 tgcctatg 34200847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20220042 - 20220224
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||| |||||  || ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||||| |||| | ||||| |  |||||||     
T  20220042 cacgagttgatgtgaggtgatcacaggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcctgattt-agatgatttgatgttgtta 20220140  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  20220141 ataatgtgatataattgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgaga---tgttgatttgcatttgatattgttatatcat 20220224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 9389550 - 9389710
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagccta-atttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |  | |||| ||||||  ||  |||||||||  |||  ||||  |||| | ||| |    
T  9389550 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatcgaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatattgat 9389647  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  9389648 gataatgttatataattgtatatacattgtatgaattatgttgatatatgagatgttgttgat 9389710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15113211 - 15113131
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaattta 81  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||| || |||||    
T  15113211 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctgctgttattgtttcagtaagactgattta 15113131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 57
Target Start/End: Original strand, 28505156 - 28505210
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgt 57  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  28505156 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgt 28505210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 11995885 - 11996087
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||  |||   |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  11995885 cgagttgatgtgagtttatcttagaggttagaaactaatttgtttaccttgctgttaatgtcccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 11995983  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||||||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  11995984 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgatatttga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtt-tgcatac 11996079  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  11996080 tgcctatg 11996087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 15116748 - 15116677
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaag 72  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |  |||| |||||| ||||||    
T  15116748 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcctactgttattgtttcagtaag 15116677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 2280114 - 2280179
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||  || || |||||||||||||||    
T  2280114 atatttgagatgttgttgatttgcatttgatattattatatcatgctg-ttttgcatactgcctatg 2280179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16495567 - 16495463
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  16495567 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcata 16495472  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  16495471 ctgcctatg 16495463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14044935 - 14044832
Alignment:
Q  83 tatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgtta 180  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14044935 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14044837  T
Q  181 tatca 185  Q
    |||||    
T  14044836 tatca 14044832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 83 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 14354965 - 14354862
Alignment:
Q  83 tatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttg-ttgatttgcattcgatattgtta 180  Q
    |||||| || |||| ||| ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||    
T  14354965 tatgatttaatgtttttgataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgattgatttgtatt-gatattgtta 14354867  T
Q  181 tatca 185  Q
    |||||    
T  14354866 tatca 14354862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 1867954 - 1868031
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  1867954 atatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttcatttgcatt-gatattgttatatcat 1868031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 10063813 - 10063878
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||  ||||||||| ||||||||| ||| |||||||||| |||||||    
T  10063813 atatttgagatgttgtttacttgtgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataccgcctatg 10063878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Original strand, 15008458 - 15008535
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| |||||||| ||||   ||||||| || |||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15008458 atatatttgtatatgcattacttgaattatatatgatgtttgaggtgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcat 15008535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 148 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 16324171 - 16324135
Alignment:
Q  148 tgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 184  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16324171 tgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatc 16324135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 2657 - 2866
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  2657 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctattgttgttg 2756  T
Q  101 ttaatggtatataattg----tatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtg 196  Q
    |||||||  ||||||||    |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||    
T  2757 ttaatgg--tataattgtatatatatacattttatgaattaagctgatatttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tg 2853  T
Q  197 catactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||    
T  2854 catactgcctatg 2866  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6798 - 6596
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  6798 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 6700  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  6699 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgc 6601  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  6600 ctatg 6596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 8737 - 8527
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||  |||||| || || | ||||||  |  |||||||     
T  8737 cacgagttgatgtgaattgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtaagactgatgt-atatgaattgatgttgttt 8639  T
Q  101 ttaatggtatata--attgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtg 196  Q
     |||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||    
T  8638 ataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttg 8540  T
Q  197 catactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||    
T  8539 catactgcctatg 8527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 149; Significance: 7e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 7e-79
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 5906 - 5704
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  5906 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagtt-tttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 5808  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||    
T  5807 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-ttcatactgc 5709  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  5708 ctatg 5704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 141; Significance: 4e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 4e-74
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 2502 - 2705
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||||| ||||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  2502 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaattaagttgtttatcttgctgatgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 2601  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||| | ||||||||    
T  2602 tggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcaatattgttataacatgatgatt-tacatactgc 2700  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  2701 ctatg 2705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 137; Significance: 1e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 1e-71
Query Start/End: Original strand, 5 - 193
Target Start/End: Original strand, 14554 - 14742
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||    
T  14554 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtatatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgatttaatatgatctaatgtttttgttaa 14653  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgatt 193  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||    
T  14654 tggtatataatagtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattactatatcatgatgatt 14742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 133; Significance: 3e-69; HSPs: 22)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 3e-69
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21673967 - 21673765
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||||| ||||||||||||    
T  21673967 agttaatgtgagttgatattagaggttaaaaactaagttgtt-atcttgttgttgttgtttcagtaagcttgaattaatatgatctaatgttgttgttaa 21673869  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    |||||||||||||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||    
T  21673868 tggtatataattgtatatacattaaataaattatattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcataatgc 21673770  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  21673769 ctatg 21673765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 130; E-Value: 2e-67
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 23760698 - 23760904
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgt---tgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||   ||||||||||| ||||||||| | | ||||||||||| |||||||||    
T  23760698 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaactaagttgtttaccttgttgttgttgttgtttcagtaagcctgaataaatatgatctaatgttgttgt 23760797  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||| | |||||    
T  23760798 taatggtatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgaattcaatattgttatatcatgatgatt-tacatac 23760896  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  23760897 tgcctatg 23760904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 121; E-Value: 4e-62
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 38855105 - 38855311
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| ||||||||    
T  38855105 cacgagttgatgtgaattgatcttggacattaggaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttg 38855203  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
     ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  38855204 ctaatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 38855302  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  38855303 ctgcctatg 38855311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 4 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6520632 - 6520429
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||| ||    
T  6520632 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttgcta 6520534  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6520533 atgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 6520435  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  6520434 cctatg 6520429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21285865 - 21285658
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| | ||||||    
T  21285865 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagtgctttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatattgttg 21285767  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||   ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||    
T  21285766 ttaatgatatataattgtatatacattacatgaactatgtttgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcat 21285668  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  21285667 actgcctatg 21285658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 26355557 - 26355758
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| || | |  ||||||  |  |||||||  |||    
T  26355557 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctttttgttattgttctagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgtttataa 26355655  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgc 204  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||| | ||  |||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||    
T  26355656 tgttatataattgtatatacattaaatggaatatgttgatggctgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcgtgatgatt-tgcatactgc 26355753  T
Q  205 ctatg 209  Q
    |||||    
T  26355754 ctatg 26355758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 70; E-Value: 1e-31
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 37116616 - 37116432
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    ||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||| |  |||||||      
T  37116616 acgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgattt-agatgatttgatgttgttaa 37116518  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37116517 taatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37116432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 20498831 - 20498645
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||  ||||| || || | ||||||| |  |||||||     
T  20498831 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgatgttgatgtttcggtaagactgatgt-atatgatttgatgttgttt 20498733  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || || |||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  20498732 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatgtttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcat 20498645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 17266845 - 17267030
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||| ||||| | ||| |||||| |  |||||||     
T  17266845 cacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtgagcctgaatta-tatgatttgatgttgtta 17266943  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  | |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17266944 ataatgtgatataaatgtatatgcattacaagaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 17267030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 62; E-Value: 6e-27
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 5866132 - 5866334
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  5866132 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 5866230  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  5866231 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatac 5866326  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  5866327 tgcctatg 5866334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 983255 - 983442
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatc---ttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttg 97  Q
    ||||||||||| |||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| || | || |||||||  | |||||    
T  983255 cacgagttgatatgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcatgttgttgttgttgtttcagtaagtctgaatt-atatgattgaatgttg 983353  T
Q  98 ttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||| ||||| ||||||  ||||||||||||  ||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||    
T  983354 ttgataatgttatatagctgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgagattgttatatcat 983442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21491258 - 21491056
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  21491258 cgagttaatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcctatgaattaatgttgcttat 21491160  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  21491159 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcaatattattatatcatgatggtt-tgcatac 21491064  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  21491063 tgcctatg 21491056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 24353292 - 24353105
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatct---tgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttg 97  Q
    |||||||||||||||||||||| | | | | ||||||||||||| ||||||   |||||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||    
T  24353292 cacgagttgatgtgagttgatcatggggataagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttg 24353194  T
Q  98 ttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||  ||||   |||||| ||||||| ||||  |||||||  ||  ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24353193 ttaataatatgatataaatgtatatgcattacatgaattgtatacgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcat 24353105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17141179 - 17140977
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  17141179 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 17141081  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| |||| |||| |||  | |||||||    
T  17141080 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatgtcatgatggat-tgcatac 17140985  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  17140984 tgcctatg 17140977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22364930 - 22364746
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   | | | | ||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  22364930 cacgagttgatgtgagttgatcagggggataataaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 22364832  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||| |  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||    
T  22364831 ataaagtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgattttc-tttgatattgttatatcat 22364746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Original strand, 17439436 - 17439543
Alignment:
Q  80 taatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgt 178  Q
    ||||||||| || ||||| |  |||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17439436 taatatgatttaatgttgataataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgt 17439535  T
Q  179 tatatcat 186  Q
    ||||||||    
T  17439536 tatatcat 17439543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Original strand, 40492844 - 40492889
Alignment:
Q  141 tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40492844 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 40492889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21255485 - 21255442
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 46  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21255485 cgagttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt 21255442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 13508080 - 13508145
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||||||||    
T  13508080 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatattgcctatg 13508145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21249550 - 21249446
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21249550 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaat-tgcata 21249455  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||| ||||    
T  21249454 ctgcttatg 21249446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21255388 - 21255284
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||| | ||||||    
T  21255388 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatgaat-tgcata 21255293  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||| ||||    
T  21255292 ctgcttatg 21255284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000003
Query Start/End: Original strand, 5 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 21249645 - 21249604
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 46  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||    
T  21249645 agttgatgtgagtttatcttagaggttaggaactaagttgtt 21249604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 118; Significance: 2e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 2e-60
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 10795 - 10588
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||    
T  10795 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttg 10697  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10696 ttaatgtcatataattgtatatacattacatgaattatgttcgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 10598  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  10597 actgcctatg 10588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 114; Significance: 6e-58; HSPs: 28)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 6e-58
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15471191 - 15470985
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | || ||||||||||  |||||||    
T  15471191 cacgagttgatgttagatgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatcta-agttgttg 15471094  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  15471093 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 15470995  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  15470994 actgcctatg 15470985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16104047 - 16103841
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||  | |||||  |  |||||||     
T  16104047 cacgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactaatcca-tatgaattgatgttgttt 16103949  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  16103948 ataatgttatataattttatatacattaaatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 16103851  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  16103850 actgcctatg 16103841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16097596 - 16097389
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  16097596 cacgagttgatgtgagttgatcttagagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 16097498  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  16097497 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatgatgatgatt-tgcat 16097399  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    | ||||||||    
T  16097398 attgcctatg 16097389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 85; E-Value: 1e-40
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14234753 - 14234548
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttt--agtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |  ||||||||| | ||  | | ||||| |||||||| |    
T  14234753 agttgatgttagttgatcttggaggttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgttgttcagtaagcctgaattgtt-taatctaatgttgttgct 14234655  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||    
T  14234654 aatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatac 14234556  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  14234555 tgcctatg 14234548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 72; E-Value: 6e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32307935 - 32307738
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||| ||||||| || | |   |||||  || |||||||     
T  32307935 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttctagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgttt 32307837  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
     |||||        |||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  32307836 ataatg--------ttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 32307747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 160
Target Start/End: Original strand, 49389483 - 49389642
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  49389483 cacgagttgatgtgtgttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 49389581  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttg 160  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||| ||||||||||||||    
T  49389582 ataatgttatataattgtatatacattaaatgaattatgtttgatagttgagatgttgttg 49389642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 1644537 - 1644734
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | |  ||||||   |||| |||||    
T  1644537 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttattgttccagtaagactga-tgcatatga---attgatgttg 1644632  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||     ||||   |||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| ||||||    
T  1644633 tt-----tataatgttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatattgttga-ttgtattcgatattgttatataatgatgatt-tgcata 1644725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 37251020 - 37251204
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||  |||||| || | || ||||||| |  |||||||     
T  37251020 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgtttatcttactgttgttgttccagtaagtctgaatt-atatgatttgatgttgtta 37251118  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  ||||||||  | ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37251119 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatttatgat-gttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 37251204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 57; E-Value: 6e-24
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13210182 - 13210387
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatg-atctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||  |||||| || | |  ||||| ||  | ||||| |    
T  13210182 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttaacattccagtaaggctga-tgcatatgaattcaatgttgct 13210280  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||   | ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  13210281 tataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatattt---aagttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtt-tgca 13210376  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  13210377 tactgcctatg 13210387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Original strand, 1465264 - 1465424
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct-aatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| || |||  ||  |||||||||  |||   |||  |||| ||||| |    
T  1465264 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgctgtcattccagtaagcctggattgtttat--tctaatgttgat 1465361  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    | ||||| |||| |||||||||||||||  ||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  1465362 gataatgttatacaattgtatatacattacatgaattatgttgatatttgagatgttgttgat 1465424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 12934165 - 12934217
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12934165 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttg 12934217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 49667938 - 49668136
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||  |||||| || ||  | |||||      |||| ||    
T  49667938 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgtcattgttccagtaagactgatgca-tatga------gttgatg 49668030  T
Q  101 ttaatggtatataat--tgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgtt-gttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgc 197  Q
    ||    |||||||||  ||||||||| ||  ||| ||||  ||||||  ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  49668031 tt----gtatataatgctgtatatactttaaatggattatgttgataaatgagatgtttgttgatt-gcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgc 49668124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 93 - 209
Target Start/End: Original strand, 12174206 - 12174319
Alignment:
Q  93 tgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatga 191  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||  || |||||||||| |||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12174206 tgttgtttataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttgagttgttgtt---ttgcattcgatattgttatatcatgatga 12174302  T
Q  192 ttgtgcatactgcctatg 209  Q
    || |||||||||||||||    
T  12174303 tt-tgcatactgcctatg 12174319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9513171 - 9513112
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9513171 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgtt 9513112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 5 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 9521146 - 9521087
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9521146 agtttatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgttgttattgtt 9521087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 43927401 - 43927327
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||    
T  43927401 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcct 43927327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 52523725 - 52523765
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52523725 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 52523765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22110204 - 22110388
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||| |||||||||||||||| |   ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | ||  |||||| |   ||||||     
T  22110204 cacgaattgatgtgagttgatcatgagggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtatgatttgaagttgtta 22110302  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||  ||||  |||||||  || ||||  |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22110303 ataatgtgatataaatgtatacgcattacatgaattctatatgat-gttgagatgctgttgatttgcatttgatattgttatatcat 22110388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 43926121 - 43926043
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| ||||||| ||||  |||||||  || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43926121 atataaatgtatatgcattacatgaattgtatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 43926043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 2051197 - 2051237
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2051197 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 2051237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9513026 - 9512981
Alignment:
Q  163 ttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9513026 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatg 9512981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9521001 - 9520956
Alignment:
Q  163 ttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  9521001 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatg 9520956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 23274813 - 23274748
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| || |||||||||||||||    
T  23274813 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttttgcatactgcctatg 23274748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 24340718 - 24340783
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  24340718 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcatactgcatatg 24340783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 42386536 - 42386470
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||  || || || ||||||||||||    
T  42386536 atatttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatgtcatgctgtttttgtatactgcctatg 42386470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12399335 - 12399269
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||| |||||| |||| ||||  ||||| || ||||||||||||    
T  12399335 atatttaagatgttgttgaattgcatttgatattattatgtcatgctgattttgtatactgcctatg 12399269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 5 - 34
Target Start/End: Original strand, 12171963 - 12171992
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttaga 34  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12171963 agttgatgtgagttgatcttagaggttaga 12171992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 153 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 12378039 - 12378006
Alignment:
Q  153 tgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  12378039 tgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 12378006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 109; Significance: 5e-55; HSPs: 16)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 5e-55
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 39706142 - 39706348
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| ||||||||    
T  39706142 cacgagttgatgtgagttgatcttggagattaggaattaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcctgaatta-tatgatctaatgttgttg 39706240  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  ||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  39706241 ctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgttgatgtttatgatgttcatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 39706339  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  39706340 ctgcctatg 39706348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Original strand, 12288066 - 12288246
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| || |||||||| |||    
T  12288066 agttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttggtaa 12288164  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    || |||||| |||||||||||||  ||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  12288165 tgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcat 12288246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 8846640 - 8846461
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  8846640 cacgagttgatgtgagttgaacttagagattagaaactaagttgtttatcttgtagttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 8846542  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgtta 180  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  8846541 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgtta 8846461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12774265 - 12774068
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |  ||||||   |||| |||||    
T  12774265 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatga---attgatgttg 12774170  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||     ||||   |||||||||||||  ||| ||||  |||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  12774169 tt-----tataatgttgtatatacattaaatggattatgttgataattgagatgttgttga-ttgtattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 12774077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 13703 - 13911
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||| || || |  |||||| |  |||||||     
T  13703 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgt-ttatgatttgatgttgttt 13801  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
     |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  13802 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgca 13900  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  13901 tactgcctatg 13911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 69; E-Value: 4e-31
Query Start/End: Original strand, 4 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15099613 - 15099456
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagccta-atttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  |||||||||  |||  ||||  |||| ||||| || |    
T  15099613 gagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgatgat 15099516  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    |||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15099515 aatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgat 15099456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 15190583 - 15190423
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagccta-atttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||| |||| ||||||  ||  |||||||||  |||  ||||  |||| ||||| |    
T  15190583 cacgagttgatgtgagttgatcttgggggttagaaactaagttatttaccttgatgttgtcattccagtaagcctggattgtatat--tctaatgttgat 15190486  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  15190485 gataatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgat 15190423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 53082003 - 53082188
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtta-gaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||    
T  53082003 cacgagttgatgtgagttgatcttggggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtt 53082101  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
      |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||    
T  53082102 aataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgttatatcat 53082188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 16596911 - 16596709
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   ||| |  || ||||| |  |    
T  16596911 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttcaagtaagactga-tgcttataaattaatgttgcttat 16596813  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   |||| |||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  16596812 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgatgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatac 16596717  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    | ||||||    
T  16596716 tacctatg 16596709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 43198408 - 43198591
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||| |   |||||| | |||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||| |||| |  ||||||  |  |||||||     
T  43198408 cacgagttgatgtgagttgct---agaggtaaaaaactaagttgtttatcttgttgttgatgttccagtaagactaa-tgcatatgaattgatgttgttt 43198503  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||| ||| ||| ||||||| ||||| ||||||||||    
T  43198504 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatattgatgacttgcatttgatatggttatatcat 43198591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 3 - 46
Target Start/End: Complemental strand, 15552079 - 15552036
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 46  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15552079 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtt 15552036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000001
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 46640309 - 46640492
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||| ||||| ||| | || ||||||| |  |||||||     
T  46640309 cacgagttgatgtgagttgatcat-ggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaaacctgaatt-atatgatttgatgttgtta 46640406  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     | |||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || ||||  |||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  46640407 atgatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgat-gttgagatgttattgattttcatttgatattgttatatcat 46640492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 14164807 - 14164743
Alignment:
Q  11 tgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||| ||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  14164807 tgtgagatgatcctaggggttgggaactaagttgtttatcttgctgttgttgttctagtaagcct 14164743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 15464929 - 15464969
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15464929 tttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 15464969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15551982 - 15551878
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| | ||||||||| ||||||||| |||  | ||||||    
T  15551982 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttaccttcgatattattatatcatgatggat-tgcata 15551887  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  15551886 ctgcctatg 15551878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 146 - 209
Target Start/End: Original strand, 52243192 - 52243256
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatta--tgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||    
T  52243192 tttgagatgttgttgaatttcatttgatattgttatatcatgaactgatt-tgcatactgcctatg 52243256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 107; Significance: 8e-54; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 8e-54
Query Start/End: Original strand, 9 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 62455 - 62259
Alignment:
Q  9 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggt 108  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||  ||||| ||| || ||||||||||| |    
T  62455 gatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattgttatgaactaatgatgttgttaatgtt 62356  T
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctat 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| ||| ||| || | ||||||||||||    
T  62355 atataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttg---tgcattcgatattattataccatgatg-tttttcatactgcctat 62260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 2e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 132919 - 132856
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  132919 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgtt 132856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 10394 - 10601
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  10394 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 10492  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  10493 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 10591  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  10592 actgcctatg 10601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 106; Significance: 3e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 3e-53
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13034 - 12827
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||| | || |||||||||| |||||||     
T  13034 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtggtttatcttgctgttgttgttccagtaagcctgaatt-atatgatctaatgttgtta 12936  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||  ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  12935 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 12837  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    | ||||||||    
T  12836 attgcctatg 12827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 105; Significance: 1e-52; HSPs: 19)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 1e-52
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22080592 - 22080798
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||| ||||||||||| || |||||| ||| || |||||    
T  22080592 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgcttatcttgctcttgttgtttcagtaagcctaaattgatatgacctaatgatgttg 22080691  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||| ||| |||||    ||| ||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||    
T  22080692 ttaatgttatataaatgtatatacattatattaattatgacgatgtttgagatgttgtt-ctgtgcattcgatattgttatatcatgatg-ttttgcata 22080789  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  22080790 ctgcctatg 22080798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 23019673 - 23019489
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||| ||| |||||    
T  23019673 acgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaact-atataatctaatgtcgttgt 23019575  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23019574 taatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcat 23019489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19652461 - 19652256
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||| || ||  | |||||  |  |||||||     
T  19652461 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttattgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgttt 19652363  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
     ||||| ||||||||||||||||| ||  ||| ||||  ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  19652362 ataatgttatataattgtatatactttaaatggattatgttgatgtttgagatgttgttga-ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 19652265  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  19652264 ctgcctatg 19652256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 87; E-Value: 7e-42
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 19668640 - 19668456
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| || || | ||||||| || ||||||||    
T  19668640 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctgatgt-atatgatgtagtgttgttg 19668542  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  | ||||  ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19668541 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattacgtatgat-gttgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 19668456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 28496327 - 28496531
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |  ||||||  || ||||| |     
T  28496327 cacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgctt 28496425  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  28496426 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcat 28496521  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  28496522 actgcctatg 28496531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 64; E-Value: 4e-28
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 29808738 - 29808942
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |  ||||||  || ||||| |     
T  29808738 cacgagttgatgtgagttgatcttagagtttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgctt 29808836  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||    
T  29808837 ataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcat 29808932  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  29808933 actgcctatg 29808942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 1561569 - 1561365
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatg-atctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||  | ||  |||||| || | |  ||||| || || ||||| |    
T  1561569 cacgagttgatgtgagttgatcctagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttaatattccagtaagactga-tgcatatgaatttaatgttgct 1561471  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
      ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||    
T  1561470 tataatgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattattatatcatgatggtt-tgca 1561375  T
Q  199 tactgcctat 208  Q
    |||| |||||    
T  1561374 tactacctat 1561365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 27333138 - 27333212
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27333138 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcct 27333212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 27393878 - 27393952
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  27393878 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaaattgtttatcttgatgttgctgtttcagtaagcct 27393952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 20109409 - 20109199
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || |||  || ||||||| || || | |||| |  |  |||||||     
T  20109409 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgctgatgtctttctagtaagactgatgt-atatcaattgatgttgttt 20109311  T
Q  101 ttaatggtatata--attgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtg 196  Q
     |||||  |||||  ||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||| ||  || || ||    
T  20109310 ataatgtgatataatattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatattatgttg-ttttg 20109212  T
Q  197 catactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||    
T  20109211 catactgcctatg 20109199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 51; E-Value: 2e-20
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 9098378 - 9098452
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||  ||| |||||| |||||||||    
T  9098378 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaatttgtttatcttgcagttattgtttcagtaagcct 9098452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 35008418 - 35008344
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  |||| |||||| |||||||||    
T  35008418 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttattgtttcagtaagcct 35008344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 4 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23076997 - 23076817
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||| ||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| || | | ||||| |  |||||||  ||    
T  23076997 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaatttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatat-agatgatttgatgttgttaata 23076899  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatc 184  Q
    |||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| ||| || |||||||||||  || | |||||| |||||||    
T  23076898 atgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttaagttgttgttgattatcacttgatattattatatc 23076817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 4185827 - 4185881
Alignment:
Q  154 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4185827 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagt-tgcatactgcctatg 4185881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 4668217 - 4668271
Alignment:
Q  154 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4668217 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagt-tgcatactgcctatg 4668271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Original strand, 4675064 - 4675118
Alignment:
Q  154 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  4675064 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagt-tgcatactgcctatg 4675118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 82 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 18696675 - 18696571
Alignment:
Q  82 atatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgtta 180  Q
    ||||||| || |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| || ||||||||||    
T  18696675 atatgatttaatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgttggagatgttattgatttgcttt-gatattgtta 18696577  T
Q  181 tatcat 186  Q
    ||||||    
T  18696576 tatcat 18696571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 27333238 - 27333278
Alignment:
Q  168 ttcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27333238 ttcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatg 27333278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 30; E-Value: 0.00000007
Query Start/End: Original strand, 168 - 209
Target Start/End: Original strand, 27393978 - 27394018
Alignment:
Q  168 ttcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  27393978 ttcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatg 27394018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0556
Description:

Target: scaffold0556; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 8283 - 8098
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||| | || |||| ||||| ||||||||    
T  8283 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaaggaactaagttgtttatcctgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgttgttg 8185  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  8184 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgacttgcatttgatattgttatatcat 8098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0556; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 2e-42
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7073 - 6873
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || | |  ||||||  || |||||||  |||    
T  7073 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactga-tgcatatgaattaatgttgtttataa 6975  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6974 tgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 6879  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  6878 cctatg 6873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 103; Significance: 2e-51; HSPs: 14)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 2e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21502007 - 21502216
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaa-ctaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    ||||||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||||||    
T  21502007 cacgagttgatgttagttgatcttggaagttagaaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattaatatgatctaatgttgtt 21502106  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| | ||    
T  21502107 gttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttaagatgatgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatt-taca 21502205  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  21502206 tactgcctatg 21502216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 21329350 - 21329557
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| ||||||||    
T  21329350 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaatt-gtataatctaatgttgttg 21329448  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||  ||||||| ||| ||| ||||||||||||||||| || |||||| |||||    
T  21329449 ctaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgaattcgatattgttatattatgatgatt-tgcat 21329547  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  21329548 actgcctatg 21329557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 21565810 - 21565603
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  21565810 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttctagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 21565712  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| || ||    
T  21565711 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgaaatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tggat 21565613  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  21565612 actgcctatg 21565603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 26011888 - 26012095
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||| |  | |||| ||||  ||||||||    
T  26011888 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttgtttatcttgttattgttgtttcagtaagcctgaact-atataatctgatgttgttg 26011986  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    || ||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| ||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||  || || |||||    
T  26011987 ttgatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttgattcacatttgatattgttatatcatgttgctt-tgcat 26012085  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  26012086 actgcctatg 26012095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 79; E-Value: 4e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 20026793 - 20026977
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| | || ||||| | || ||||||||    
T  20026793 cacgagtcgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgtagttgtttcagtaagcctgaatt-atatgttttaatgttgttg 20026891  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   |||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||    
T  20026892 ataatgctatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgat-gttgtgatgttgttgaattgcatttgatattattatatcat 20026977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 73; E-Value: 2e-33
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 19669161 - 19668959
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt--- 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||| || | |  ||||||  ||||| ||||||       
T  19669161 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagtcgtttatcttgttgttgttgttccagtaagactga-tgcatatga-atattgatgttgttta 19669064  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  | || |||   |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||    
T  19669063 taatgttatataattgtatatacattacaggacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcgatattgttatatcacgatgatt-tgcata 19668968  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    ||| |||||    
T  19668967 ctgtctatg 19668959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 22959392 - 22959592
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||| || | |  ||||||   | ||||| |   ||    
T  22959392 agttgatgtgagttgatcttagaggttaaaaaccaagttgtttatcttgttgtttttgttccagtaagactga-tgcatatgaatcaatgttggttaaaa 22959490  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||  |||| |||   |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  22959491 tgttatataattgtatatacattacatgacttatgtttgatatttga---gttgttgatttgcattcaatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 22959586  T
Q  204 cctatg 209  Q
    ||||||    
T  22959587 cctatg 22959592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 22178072 - 22178257
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||    |||||||     
T  22178072 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaaacctaaatt-atatgattggatgttgtta 22178170  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  22178171 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcat 22178257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Original strand, 19660693 - 19660895
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  19660693 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgttccagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 19660791  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   |||||||||||  |||||||||  ||||||||  ||| || |||||||    
T  19660792 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttatattcgatatcattatatcaagatggtt-tgcatac 19660887  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  19660888 tgcctatg 19660895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 45; E-Value: 8e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 162
Target Start/End: Original strand, 21741486 - 21741546
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgat 162  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  21741486 taatgttatataattgtatatacattatatgaattatgttgatatttgagatgttgttgat 21741546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 40; E-Value: 0.00000000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 60
Target Start/End: Original strand, 21741398 - 21741457
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgt 60  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||| ||||||    
T  21741398 cacgagttgatgtgagttgatcttggaggttagaaactaagttaattaccttgatgttgt 21741457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000001
Query Start/End: Original strand, 141 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 29448132 - 29448087
Alignment:
Q  141 tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29448132 tgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 29448087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 22144172 - 22144132
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22144172 tttgagatgttgttgatttgcaattgatattgttatatcat 22144132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 25743988 - 25743925
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| | ||||||||||| ||||  |||||||||||||    
T  25743988 cacgagttgatgtgagttgatcatgggggtaataaactaagttgcttatgctgttgttgttgtt 25743925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 102; Significance: 8e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 102; E-Value: 8e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 32803 - 32597
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| | || |||| ||||| |||| |||    
T  32803 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatcttgttgttattgtttcagtaagcctgaatt-atataatctaatgtttttg 32705  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||  || || |||||    
T  32704 ttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttgagatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgcat 32607  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  32606 actgcctatg 32597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 98; Significance: 2e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 2e-48
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 130173 - 129966
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||  | |||||  |  |||||||     
T  130173 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgttccagtaagactgatgca-tatgaattgatgttgttt 130075  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
      |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  130074 acaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 129976  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  129975 actgcctatg 129966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000003
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 60713 - 60752
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  60713 tttgagatgttgttgatttgcatt-gatattggtatatcat 60752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1765 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold1765
Description:

Target: scaffold1765; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1350 - 1143
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||||| || || | ||||||| |  ||||||||    
T  1350 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttttttatcttgttgttgttgttccagtaagactgatgt-atatgatttgatgttgttg 1252  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||   ||||| ||||| |||||| |||  || |||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  1251 ttaatgttatatagttgtatatacattccatgaattatgtttgatgtttgaaatgttgatgacctgtattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 1153  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  1152 actgcctatg 1143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 94; Significance: 5e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 6879 - 6672
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||    
T  6879 cacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttg 6781  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  6780 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatt-tgcat 6682  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  6681 actgcctatg 6672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333; HSP #2
Raw Score: 94; E-Value: 5e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 14259 - 14052
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | | || |||||||||| ||||||||    
T  14259 cacgagttgatgtgagttgaacttggagattagaatctaagttgtttatcttgctgttgttgttttagtaagcttgaatt-atatgatctaatgttgttg 14161  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||   ||| || | | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  14160 ttaatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttataatgatgataacttgcattcgatattgttatatcatcatgatt-tgcat 14062  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  14061 actgcctatg 14052  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1984 (Bit Score: 93; Significance: 2e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold1984
Description:

Target: scaffold1984; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 2e-45
Query Start/End: Original strand, 2 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 395 - 190
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||| |||| || || ||  | |||||  |  |||||||      
T  395 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactgagttgtt-atcttgctgttgttgttctagtgagactgataca-tatgaattgatgttgttta 298  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||  ||||||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  297 taatattatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcata 199  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  198 ctgcctatg 190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 90; Significance: 1e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 90; E-Value: 1e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 160951 - 160745
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  160951 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtttcggtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 160853  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| |||||||||||||||| |||  |||| |||   ||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||    
T  160852 ataatgttatataattgtatatatattacatgacttatgtttgatatttgacatgttgttga-ttgcatttgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 160755  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    ||||||||||    
T  160754 actgcctatg 160745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 84; Significance: 4e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 4e-40
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13207 - 13000
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct-aatttaatatgatctattgttgtt 99  Q
    |||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||  |||  ||||| |||||||    
T  13207 cacgagttgatgtgagttgatcatggagattagaaactaagttatttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaattggata--atctaatgttgtt 13110  T
Q  100 gttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
    | ||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||   ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  13109 gctaatgttatataattgtatatacattacacgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgctgatt-tgca 13011  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  13010 tactgcctatg 13000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 18090 - 18275
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | || ||||| | |  |||||||     
T  18090 cacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgttttgatgttgtta 18188  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  18189 ttaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcat 18275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 83; Significance: 2e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 2e-39
Query Start/End: Original strand, 5 - 214
Target Start/End: Original strand, 5980 - 6188
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||| | ||  ||| ||||| |||||||| |||    
T  5980 agttgatgttagttgatcttggaggttaaaaactaagttatttatcttgctgttattgtttcagtaagcctgaattg-tataatctaatgttgttgctaa 6078  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactg 203  Q
    || ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||  ||||||  ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  6079 tgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttaatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactg 6177  T
Q  204 cctatgctact 214  Q
    |||||| ||||    
T  6178 cctatgttact 6188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 82; Significance: 7e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 7e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 22527 - 22730
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||  |||||| || ||  |   ||||     ||||||     
T  22527 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttgtcttgatgttgctgttccagtaagactgatgcatattgat-----gttgttt 22621  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||  || |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  22622 ataatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatatttgagatgttgatgacttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 22720  T
Q  200 actgcctatg 209  Q
    |||| |||||    
T  22721 actgtctatg 22730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 81; Significance: 3e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 3e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 7929 - 8110
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||| |||||||| ||||||||| | || ||||||| || ||||||||    
T  7929 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatc---ttgctgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttg 8024  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     ||||| |||||| |||||||||||||  |||||||| || ||||  ||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  8025 ataatgttatatagttgtatatacattacatgaattatatatgat-gttgtgatgttgttgatttgtatttgatattgttatatcat 8110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 1e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 29135 - 29190
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  29135 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtt 29190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 77; Significance: 7e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 77; E-Value: 7e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 208
Target Start/End: Original strand, 45645 - 45851
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  |||||  |||||| || | |  ||||||  |  |||||||     
T  45645 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatattgctgtaattgttccagtaagactga-tgcatatgaattgatgttgttt 45743  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcat 199  Q
     ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||   |||||| ||||||||||| ||| || ||||||||||||||||||||| |||||| |||||    
T  45744 ataatgttatataattgtatatacatcacatgaattatgtttgataattgagatgttgatgacttacattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcat 45842  T
Q  200 actgcctat 208  Q
    |||||||||    
T  45843 actgcctat 45851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0530 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0530
Description:

Target: scaffold0530; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 5 - 209
Target Start/End: Original strand, 892 - 1094
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct-aatt-taatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    ||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||    ||||| |||||||| |    
T  892 agttgatgttagttgatcttggaagttagaaactaagttatttatcttgttgttgttgtttcagtaagcctgaattgtaa----atctaatgttgttgct 987  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||||||   ||||| |||  ||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||| | |||||||    
T  988 aatgttatataattgtatatacattacatgaattatgtttgatgtttatgatgttgatgacttgcattcgatgttgttatatcatgatga-tctgcatac 1086  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    | ||||||    
T  1087 tacctatg 1094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 75; Significance: 1e-34; HSPs: 2)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 136221 - 136405
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatga-tctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || ||||||||    
T  136221 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgattttaatgttgttg 136319  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  |  |||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  136320 ttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 136405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 1e-34
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 144929 - 145113
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatga-tctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| | || |||||| | || ||||||||    
T  144929 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgattttaatgttgttg 145027  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||  |  |||   || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  145028 ttaatgttatatagttgtatatacattacatgaattatgtacgat-gatgtgatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 145113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 71; Significance: 3e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 3e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Original strand, 53401 - 53609
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||| ||||  |||||| || || |  |||||| |  |||||||     
T  53401 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggtaagaaactaagttgtttatctttatgttgatgttccagtaagactgatgt-ttatgatttgatgttgttt 53499  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
     |||||  |||||||||||||||||||   ||||||| || || ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  53500 ataatgtgatataattgtatatacattacttgaattatatatgaatatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgttg-ttttgca 53598  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  53599 tactgcctatg 53609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 68; Significance: 2e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12836 - 12629
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||| |  ||| || |  |||||||     
T  12836 cacgagtggatgtgagttgatcttagaggtaataaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagtctaatgt-gtattatttgatgttgttt 12738  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattga--tatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgca 198  Q
     |||||  ||||||||||||||||| ||  ||||||| ||  |  |||||||||||||| ||| ||||||| ||||||||||||||||  || || ||||    
T  12737 ataatgtgatataattgtatataca-ttactgaattatatataagtatttgagatgttgatgacttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgca 12640  T
Q  199 tactgcctatg 209  Q
    |||||||||||    
T  12639 tactgcctatg 12629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1351 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold1351
Description:

Target: scaffold1351; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 5 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 270 - 89
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaa 104  Q
    |||||||||||||||||| | | ||| |||||||||||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||| |  |||||||  |||    
T  270 agttgatgtgagttgatcatgggggtaagaaactaagttgcatatcttactgttgttgtttcagtaagcctaaattaa-atgatttgatgttgttaataa 172  T
Q  105 tggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    || ||||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||||    
T  171 tgttatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgcatctgatattgttatatcat 89  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 67; Significance: 6e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 67; E-Value: 6e-30
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 6135 - 6320
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||| ||||| | | ||| ||||||||||||| ||||||   ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||     
T  6135 cacgagttgatgtgagatgatcatgggggtaagaaactaagttgcttatctcactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgtta 6233  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  6234 ttaatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgtcatatcat 6320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 66; Significance: 2e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 2e-29
Query Start/End: Original strand, 2 - 186
Target Start/End: Original strand, 103492 - 103667
Alignment:
Q  2 acgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgt 101  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| || |||||||||    
T  103492 acgagttgatgtgagttgatcttggaggtaggaaactaagttctttatcttcctgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttaatgttgttgt 103590  T
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||  ||||||||   || |||    |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  103591 taatgttatgtagttgtatatacattacatgaatta---tg-tat----gatgttgttgttttgcatttgatattgttatatcat 103667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 97274 - 97090
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| |  |||||||     
T  97274 cacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgtta 97177  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  97176 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 97090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006; HSP #2
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 106552 - 106368
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||||||||||||||||||||| | | ||| ||||||||||||| || ||||  ||||||||||| ||||||||| || ||  ||||| |  |||||||     
T  106552 cacgagttgatgtgagttgatcatgg-ggtaagaaactaagttgcttttcttactgttgttgtttcagtaagcctgatatag-atgatttgatgttgtta 106455  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  ||||| |||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  106454 ataatgtgatatatttgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 106368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 60; Significance: 9e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 9e-26
Query Start/End: Original strand, 32 - 186
Target Start/End: Original strand, 128853 - 129007
Alignment:
Q  32 agaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttat 131  Q
    ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| |||||  ||||| |  |||||||  |||||  ||||| |||||||| ||||  ||    
T  128853 agaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgatttag-atgatttgatgttgttaataatgtgatatatttgtatatccattacat 128951  T
Q  132 gaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  128952 gaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 129007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 6e-21
Query Start/End: Original strand, 4 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 78587 - 78407
Alignment:
Q  4 gagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtta 103  Q
    ||||||||||||||||||| | | ||| || |||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||||  ||    
T  78587 gagttgatgtgagttgatcatgggggtaagcaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgttaata 78489  T
Q  104 atggtatataattgtatatacattttatgaatta-aattgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    |||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  78488 atgtgatataaatgtatatgcattacatgaattataaacgat-gttgagatgttgttgatttgcatt-gatattgttatatcat 78407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 59; Significance: 4e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 4e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Original strand, 15685 - 15759
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15685 cacgagttgatgtgagttgatcttggagattagaaactaagttgtttatcttgctgttgttgtttcagtaagcct 15759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 15792 - 15837
Alignment:
Q  163 ttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  15792 ttgcattcgatattgttatatcatcatgatt-tgcatactgcctatg 15837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 58; Significance: 1e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 1e-24
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 15924 - 15722
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  || |  |||||| || | ||  |||||  || ||||| |  |    
T  15924 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgttaatgatccagtaagactga-ttcttatgaaataatgttgcttat 15826  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||||    
T  15825 aatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgtatac 15730  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  15729 tgcctatg 15722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 55; Significance: 9e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 9e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 38586 - 38401
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||   | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||| ||||||||| | || ||||||| |  |||||       
T  38586 cacgagttgatgtgagttgatcacgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgtttcagtaagcctgaatt-atatgatttgatgttgaga 38488  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||  |||||  ||||||| ||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  38487 ttaatgtgatatatatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgaattgcatttgatattgtcatatcat 38401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 54; Significance: 4e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 4e-22
Query Start/End: Original strand, 3 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 11555 - 11353
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgtt 102  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||  ||||  |||||| || | |   |||||  || ||||| |  |    
T  11555 cgagttgatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttggtgttaatgttcaagtaagactga-tgcttatgaattaatgttgcttat 11457  T
Q  103 aatggtatataattgtatatacattttatgaattaa-attgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatac 201  Q
    |||| |||||||| |||||||||||  |||| ||||  |||||| ||||   ||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || |||||||    
T  11456 aatgttatataatagtatatacattacatgacttaagtttgataattga---gttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcatac 11361  T
Q  202 tgcctatg 209  Q
    ||||||||    
T  11360 tgcctatg 11353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 2162 - 2058
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaatt-gatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| || |||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  2162 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtttgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcata 2067  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  2066 ctgcctatg 2058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0211 (Bit Score: 53; Significance: 1e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0211
Description:

Target: scaffold0211; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 1e-21
Query Start/End: Original strand, 1 - 53
Target Start/End: Original strand, 28664 - 28716
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttg 53  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28664 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttg 28716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 50; Significance: 9e-20; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 9e-20
Query Start/End: Original strand, 7 - 211
Target Start/End: Original strand, 7917 - 8123
Alignment:
Q  7 ttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttgttaatg 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| || |||||||  ||| || || || | ||||||| |  |||||||  |||||    
T  7917 ttgatgtgagttgatcttagaggtatgaaactaagttgtttatcttgctgatgttgttccagtgagactgatgt-atatgatttgatgttgtttataatg 8015  T
Q  107 gtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tg-atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcatta--tgattgtgcatact 202  Q
      |||||||| ||||||||||   ||||||| || || || ||| |||||||||||| || |||| |||||| ||||||||| |  ||||| ||||||||    
T  8016 tgatataattttatatacattacttgaattatatatgaatgtttaagatgttgttgaatttcatttgatattattatatcatgagctgatt-tgcatact 8114  T
Q  203 gcctatgct 211  Q
    |||||||||    
T  8115 gcctatgct 8123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0737 (Bit Score: 47; Significance: 5e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0737
Description:

Target: scaffold0737; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 5e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 1650 - 1834
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||  ||||||  | ||||||||  ||||||||| | ||| |||||| |   ||||||     
T  1650 cacgagttgatgtgagttgatcttgagggtaagaaactaagttgcctatcttactattgttgttccagtaagcctgaatta-tatgatttgacgttgtta 1748  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  || ||||| || |||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1749 ataatgtgatataaatgtatatgcattacataaattatatatgatgtt-gagatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcat 1834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 46; Significance: 2e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 2e-17
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 34384 - 34331
Alignment:
Q  5 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgtt 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  34384 agttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttaccttgctgtt 34331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1137 (Bit Score: 44; Significance: 3e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1137
Description:

Target: scaffold1137; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 3e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 52
Target Start/End: Original strand, 2156 - 2207
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 52  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2156 cacgagtggatgtgagttaatcttagaggttagaaactaagttgtttatctt 2207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0150
Description:

Target: scaffold0150; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000005
Query Start/End: Original strand, 15 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 32345 - 32296
Alignment:
Q  15 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgtt 64  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  32345 agttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttactgttgttgtt 32296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0150; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 140 - 202
Target Start/End: Complemental strand, 32227 - 32166
Alignment:
Q  140 ttgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatact 202  Q
    |||||| |||||| |||| |||||  ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||    
T  32227 ttgataattgagacgttgatgatta-cattcgatattgttatatcatgatgattttgcatact 32166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1403 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold1403
Description:

Target: scaffold1403; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 75
Target Start/End: Complemental strand, 817 - 744
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcct 75  Q
    |||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  817 cacgagttgatgtgagttgatcatat-ggtaagaaactaagttgtttatctaactgttgttgtttcagtaagcct 744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 209
Target Start/End: Original strand, 1025 - 1129
Alignment:
Q  102 taatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcata 200  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  |||| |||| | ||||| |||||   |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||    
T  1025 taatgttatataattgtatatacattacatgacttaagtctgataattgag---ttgttgatttacattcgatattattatatcatgatggtt-tgcata 1120  T
Q  201 ctgcctatg 209  Q
    |||||||||    
T  1121 ctgcctatg 1129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0161 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0161
Description:

Target: scaffold0161; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 3 - 53
Target Start/End: Original strand, 2300 - 2350
Alignment:
Q  3 cgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttg 53  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  2300 cgagtttatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttttttaccttg 2350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000003
Query Start/End: Original strand, 109 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 25268 - 25191
Alignment:
Q  109 atataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||| |||||||||||||  |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  25268 atatatttgtatatacattacatgaattatatatgatgtttgagatgttgttgatttgcatt-gatatcgttatatcat 25191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 80 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 727 - 621
Alignment:
Q  80 taatatgatctattgttgttgttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgt 178  Q
    ||||||||| |  |||||||  |||||  |||||| ||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||||||||| ||||||||| || ||||||||    
T  727 taatatgatttgatgttgttaataatgtgatataaatgtatatgcattacatgaattatatatgatgtttgagatgttattgatttgc-tttgatattgt 629  T
Q  179 tatatcat 186  Q
    ||||||||    
T  628 tatatcat 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0357
Description:

Target: scaffold0357; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000002
Query Start/End: Original strand, 150 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 13247 - 13189
Alignment:
Q  150 agatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  13247 agatgttgttgatttgcatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatg 13189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0357; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 16098 - 16138
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  16098 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcat 16138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 163 - 209
Target Start/End: Original strand, 23898 - 23943
Alignment:
Q  163 ttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  23898 ttgcattcgatattgttatatcatgatgatt-tgcatactgcctatg 23943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 35; Significance: 0.00000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.00000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 186
Target Start/End: Original strand, 19737 - 19921
Alignment:
Q  1 cacgagttgatgtgagttgatcttagaggttagaaactaagttgtttatcttgttgttgttgttttagtaagcctaatttaatatgatctattgttgttg 100  Q
    |||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||||||| |||||||  ||||||||||  ||||||| | | || ||||||| |  |||| ||     
T  19737 cacgggttgatatgagttgatcttgggggtaagaaactaagttgcttatcttactgttgttgttccagtaagcatgaatt-atatgatttgatgttatta 19835  T
Q  101 ttaatggtatataattgtatatacattttatgaattaaat-tgatatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
     |||||  |||||| ||||||| ||||  |||| |||  | ||||   |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  19836 ataatgtgatataaatgtatatgcattacatgagttatttatgat-gctgagatgttgttgaattgcatttgatattgttatatcat 19921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000001
Query Start/End: Original strand, 146 - 186
Target Start/End: Original strand, 27747 - 27787
Alignment:
Q  146 tttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  27747 tttgagatgttgttgatttacatttgatattgttatatcat 27787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 154 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 9193 - 9139
Alignment:
Q  154 gttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||    
T  9193 gttgatgaattgcattcgatattgttatatcatgatgagt-tgcatactgcctatg 9139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000005
Query Start/End: Original strand, 147 - 186
Target Start/End: Complemental strand, 267784 - 267745
Alignment:
Q  147 ttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcat 186  Q
    ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  267784 ttgagatattgttgatttgcatttgatattgttatatcat 267745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2014 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold2014
Description:

Target: scaffold2014; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 1158 - 1093
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||  || || |||||||||||||||    
T  1158 atatttgagatgttgatgattcgtatttgatattgttatatcatgctg-ttttgcatactgcctatg 1093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0247 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0247
Description:

Target: scaffold0247; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000002
Query Start/End: Original strand, 143 - 209
Target Start/End: Original strand, 18022 - 18087
Alignment:
Q  143 atatttgagatgttgttgatttgcattcgatattgttatatcattatgattgtgcatactgcctatg 209  Q
    ||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| ||| ||||    
T  18022 atatttgagatgttgtttacttgcgttcgatattattatatcatgatg-ttgtgcataatgcatatg 18087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University