View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15605_high_16 (Length: 357)

Name: NF15605_high_16
Description: NF15605
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15605_high_16
NF15605_high_16
[»] chr4 (38 HSPs)
chr4 (1-336)||(10644219-10644554)
chr4 (1-336)||(47357654-47357989)
chr4 (112-328)||(13048261-13048477)
chr4 (88-336)||(15675105-15675352)
chr4 (103-336)||(31115629-31115861)
chr4 (103-268)||(10104281-10104445)
chr4 (103-336)||(13246430-13246662)
chr4 (104-336)||(54118276-54118507)
chr4 (1-268)||(17145575-17145845)
chr4 (1-268)||(18248286-18248556)
chr4 (1-195)||(18169109-18169308)
chr4 (103-235)||(121990-122121)
chr4 (1-195)||(7131983-7132182)
chr4 (1-195)||(19020625-19020824)
chr4 (1-195)||(20000862-20001061)
chr4 (88-336)||(26680201-26680447)
chr4 (1-195)||(15287163-15287362)
chr4 (103-268)||(40885585-40885749)
chr4 (1-195)||(15294272-15294471)
chr4 (37-191)||(22738412-22738568)
chr4 (1-102)||(22351982-22352086)
chr4 (1-102)||(26339253-26339357)
chr4 (10-110)||(8378377-8378480)
chr4 (88-195)||(10488702-10488809)
chr4 (88-195)||(16327942-16328049)
chr4 (122-268)||(8374576-8374722)
chr4 (247-336)||(111395-111484)
chr4 (88-144)||(33240891-33240947)
chr4 (1-63)||(9795499-9795564)
chr4 (106-172)||(15044990-15045057)
chr4 (106-172)||(15109367-15109434)
chr4 (88-170)||(18238157-18238240)
chr4 (107-245)||(7850090-7850228)
chr4 (88-187)||(13442676-13442777)
chr4 (227-268)||(13590213-13590254)
chr4 (292-336)||(10104450-10104494)
chr4 (1-33)||(14996444-14996476)
chr4 (228-268)||(18276501-18276541)
[»] chr3 (43 HSPs)
chr3 (1-336)||(16821139-16821474)
chr3 (1-336)||(55316219-55316555)
chr3 (1-336)||(41270075-41270411)
chr3 (1-332)||(15614838-15615168)
chr3 (1-336)||(15936553-15936890)
chr3 (1-333)||(15938395-15938729)
chr3 (88-336)||(14842577-14842824)
chr3 (88-336)||(13975738-13975985)
chr3 (88-336)||(45860805-45861052)
chr3 (88-336)||(13954906-13955153)
chr3 (88-336)||(15859040-15859287)
chr3 (88-337)||(51158034-51158282)
chr3 (88-336)||(12030163-12030410)
chr3 (88-336)||(2049810-2050057)
chr3 (1-268)||(12264710-12264981)
chr3 (88-325)||(13838905-13839141)
chr3 (106-336)||(17912516-17912744)
chr3 (1-336)||(15468258-15468596)
chr3 (1-336)||(22275209-22275547)
chr3 (1-195)||(49232575-49232774)
chr3 (1-195)||(12902008-12902207)
chr3 (1-195)||(18911132-18911331)
chr3 (1-195)||(25058878-25059077)
chr3 (1-264)||(54651529-54651795)
chr3 (1-195)||(1467657-1467856)
chr3 (1-196)||(5228451-5228650)
chr3 (1-166)||(18896962-18897130)
chr3 (1-195)||(12811980-12812179)
chr3 (88-336)||(16744131-16744377)
chr3 (88-195)||(2449254-2449361)
chr3 (53-258)||(44229063-44229268)
chr3 (223-336)||(47984650-47984763)
chr3 (223-336)||(47993937-47994050)
chr3 (223-336)||(48003224-48003337)
chr3 (223-336)||(48012510-48012623)
chr3 (88-268)||(11986182-11986362)
chr3 (88-170)||(41661729-41661812)
chr3 (88-170)||(31412333-31412416)
chr3 (227-268)||(11638424-11638465)
chr3 (1-33)||(8268651-8268683)
chr3 (1-33)||(8275751-8275783)
chr3 (224-268)||(15876135-15876179)
chr3 (89-172)||(47784767-47784851)
[»] scaffold0076 (2 HSPs)
scaffold0076 (1-336)||(42997-43333)
scaffold0076 (1-195)||(39242-39441)
[»] chr5 (44 HSPs)
chr5 (1-336)||(27009841-27010177)
chr5 (1-336)||(18777907-18778244)
chr5 (1-336)||(25426628-25426965)
chr5 (1-336)||(43443312-43443647)
chr5 (1-336)||(12374-12711)
chr5 (1-336)||(22366396-22366733)
chr5 (1-336)||(19499899-19500236)
chr5 (1-336)||(21073510-21073847)
chr5 (1-336)||(4199900-4200237)
chr5 (1-284)||(29188201-29188483)
chr5 (104-336)||(23506965-23507196)
chr5 (88-336)||(18531083-18531330)
chr5 (88-336)||(22053849-22054096)
chr5 (1-268)||(35791016-35791287)
chr5 (1-268)||(11211983-11212253)
chr5 (103-336)||(27182578-27182810)
chr5 (88-325)||(34939289-34939524)
chr5 (1-336)||(17471506-17471844)
chr5 (1-195)||(7425463-7425662)
chr5 (1-195)||(23514700-23514899)
chr5 (1-195)||(1219438-1219637)
chr5 (1-195)||(10777888-10778087)
chr5 (1-195)||(21932299-21932498)
chr5 (1-195)||(21938469-21938668)
chr5 (1-195)||(35582175-35582374)
chr5 (1-195)||(36989688-36989887)
chr5 (5-195)||(22883006-22883201)
chr5 (1-102)||(23328791-23328895)
chr5 (1-102)||(24616395-24616499)
chr5 (1-102)||(24712771-24712875)
chr5 (1-102)||(24745789-24745893)
chr5 (88-195)||(20623109-20623216)
chr5 (88-195)||(21233544-21233651)
chr5 (88-195)||(25900422-25900529)
chr5 (88-195)||(16536337-16536444)
chr5 (88-268)||(32950761-32950942)
chr5 (88-195)||(37052884-37052991)
chr5 (88-195)||(23981516-23981625)
chr5 (88-172)||(21310709-21310794)
chr5 (106-172)||(5450861-5450928)
chr5 (88-170)||(26559815-26559898)
chr5 (88-172)||(19862371-19862456)
chr5 (227-268)||(21617083-21617124)
chr5 (292-332)||(29190482-29190522)
[»] chr8 (36 HSPs)
chr8 (1-336)||(21851881-21852217)
chr8 (3-336)||(21844490-21844824)
chr8 (1-336)||(16674308-16674644)
chr8 (1-336)||(30120722-30121060)
chr8 (1-332)||(6774175-6774505)
chr8 (1-332)||(24548986-24549316)
chr8 (146-336)||(222753-222943)
chr8 (146-336)||(736376-736566)
chr8 (146-336)||(860271-860461)
chr8 (88-336)||(43373484-43373731)
chr8 (88-337)||(16193732-16193980)
chr8 (1-268)||(16195298-16195569)
chr8 (88-325)||(24928807-24929043)
chr8 (88-336)||(16404991-16405235)
chr8 (88-325)||(17345581-17345816)
chr8 (1-195)||(22006176-22006375)
chr8 (1-195)||(13720846-13721045)
chr8 (1-195)||(16872969-16873168)
chr8 (1-195)||(271278-271477)
chr8 (1-195)||(644443-644642)
chr8 (1-195)||(830178-830377)
chr8 (1-195)||(13662183-13662382)
chr8 (88-336)||(22907230-22907476)
chr8 (1-195)||(22088712-22088911)
chr8 (1-195)||(15319077-15319276)
chr8 (1-195)||(15499446-15499645)
chr8 (88-195)||(5238227-5238334)
chr8 (88-195)||(24661264-24661371)
chr8 (88-195)||(43685686-43685793)
chr8 (146-208)||(691908-691970)
chr8 (88-172)||(26011656-26011741)
chr8 (227-268)||(5854681-5854722)
chr8 (227-268)||(22497348-22497389)
chr8 (227-268)||(38533716-38533757)
chr8 (88-187)||(45465126-45465227)
chr8 (106-188)||(15933443-15933527)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (1-336)||(13572676-13573012)
chr7 (1-336)||(13910939-13911277)
chr7 (1-336)||(10989410-10989746)
chr7 (1-336)||(2437457-2437794)
chr7 (1-336)||(16478879-16479213)
chr7 (1-336)||(18253761-18254098)
chr7 (106-330)||(25292372-25292595)
chr7 (88-336)||(47481047-47481294)
chr7 (88-334)||(16211768-16212013)
chr7 (88-336)||(13321014-13321263)
chr7 (103-336)||(36052667-36052896)
chr7 (88-336)||(13037030-13037277)
chr7 (88-331)||(11580755-11580997)
chr7 (88-336)||(3059966-3060213)
chr7 (1-195)||(15950709-15950908)
chr7 (1-195)||(18979939-18980138)
chr7 (1-195)||(15927707-15927906)
chr7 (1-195)||(13758509-13758708)
chr7 (1-195)||(15760032-15760231)
chr7 (1-195)||(7822867-7823066)
chr7 (1-195)||(7830178-7830377)
chr7 (1-195)||(27101555-27101754)
chr7 (1-195)||(27108903-27109102)
chr7 (1-195)||(27176572-27176771)
chr7 (1-195)||(38783647-38783846)
chr7 (88-336)||(7293017-7293263)
chr7 (1-195)||(14250816-14251015)
chr7 (37-172)||(48622623-48622758)
chr7 (88-195)||(11516367-11516474)
chr7 (88-195)||(15441580-15441687)
chr7 (88-195)||(30262145-30262252)
chr7 (1-81)||(15862174-15862257)
chr7 (35-102)||(16418731-16418798)
chr7 (35-102)||(10000325-10000392)
chr7 (109-268)||(296003-296162)
chr7 (88-172)||(16914928-16915013)
chr7 (106-172)||(13377691-13377758)
chr7 (88-170)||(28722274-28722357)
chr7 (88-172)||(9611470-9611555)
chr7 (227-268)||(9723946-9723987)
chr7 (88-172)||(9839041-9839126)
chr7 (86-170)||(28390476-28390561)
chr7 (227-268)||(46474068-46474109)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (1-336)||(35-369)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (1-336)||(64439-64780)
scaffold0026 (1-336)||(107747-108084)
[»] chr2 (35 HSPs)
chr2 (1-336)||(19886576-19886913)
chr2 (88-336)||(17396669-17396916)
chr2 (103-336)||(24341420-24341652)
chr2 (88-336)||(19794720-19794967)
chr2 (88-331)||(462743-462985)
chr2 (88-336)||(36982457-36982704)
chr2 (88-336)||(7507860-7508107)
chr2 (88-336)||(20627329-20627576)
chr2 (88-336)||(25265406-25265653)
chr2 (104-336)||(43642989-43643220)
chr2 (88-336)||(8891242-8891489)
chr2 (1-195)||(8943985-8944184)
chr2 (1-195)||(12728531-12728730)
chr2 (1-195)||(16935732-16935931)
chr2 (1-195)||(17006392-17006591)
chr2 (1-195)||(23777963-23778162)
chr2 (1-195)||(34824614-34824813)
chr2 (1-195)||(3798521-3798720)
chr2 (1-195)||(12635786-12635985)
chr2 (1-195)||(11231256-11231455)
chr2 (1-195)||(22513103-22513302)
chr2 (1-195)||(24685699-24685898)
chr2 (1-195)||(28775725-28775924)
chr2 (1-195)||(12641560-12641759)
chr2 (1-195)||(42177887-42178086)
chr2 (1-102)||(23774370-23774474)
chr2 (88-195)||(19689417-19689524)
chr2 (88-195)||(23820211-23820318)
chr2 (35-102)||(5888585-5888652)
chr2 (88-195)||(14906456-14906563)
chr2 (53-258)||(21141973-21142178)
chr2 (88-195)||(20015151-20015258)
chr2 (106-172)||(68154-68221)
chr2 (227-268)||(16292940-16292981)
chr2 (88-172)||(24884848-24884933)
[»] chr1 (24 HSPs)
chr1 (1-336)||(5072304-5072640)
chr1 (19-336)||(18601052-18601370)
chr1 (1-336)||(22227809-22228146)
chr1 (1-336)||(22232506-22232843)
chr1 (1-332)||(2116258-2116589)
chr1 (1-270)||(45051489-45051757)
chr1 (88-336)||(20931345-20931592)
chr1 (88-336)||(20913037-20913277)
chr1 (88-336)||(41394222-41394469)
chr1 (103-336)||(20893657-20893889)
chr1 (104-336)||(20445679-20445910)
chr1 (112-336)||(20531444-20531667)
chr1 (1-195)||(18059676-18059875)
chr1 (1-195)||(17004777-17004976)
chr1 (106-336)||(37844484-37844714)
chr1 (1-195)||(46523528-46523726)
chr1 (8-195)||(17148706-17148898)
chr1 (1-195)||(38055009-38055208)
chr1 (1-195)||(19962417-19962616)
chr1 (1-102)||(22035681-22035785)
chr1 (1-102)||(7640852-7640956)
chr1 (106-195)||(51452632-51452721)
chr1 (88-195)||(22143361-22143470)
chr1 (227-268)||(25093926-25093967)
[»] chr6 (34 HSPs)
chr6 (1-336)||(25175563-25175901)
chr6 (1-336)||(27653898-27654235)
chr6 (12-336)||(16825678-16826006)
chr6 (1-332)||(1650022-1650352)
chr6 (88-332)||(14626134-14626377)
chr6 (88-336)||(35009455-35009702)
chr6 (88-325)||(23153458-23153694)
chr6 (88-325)||(1657764-1657999)
chr6 (52-268)||(29665941-29666157)
chr6 (1-195)||(16232031-16232230)
chr6 (1-195)||(1556144-1556343)
chr6 (88-325)||(15862484-15862718)
chr6 (1-195)||(10488838-10489037)
chr6 (1-195)||(16376291-16376490)
chr6 (1-195)||(16383615-16383814)
chr6 (1-195)||(22225656-22225855)
chr6 (1-195)||(18086741-18086940)
chr6 (1-195)||(23977908-23978107)
chr6 (1-195)||(16556057-16556256)
chr6 (1-195)||(16632613-16632812)
chr6 (1-193)||(19610159-19610356)
chr6 (1-137)||(22251484-22251623)
chr6 (1-195)||(19299376-19299575)
chr6 (1-102)||(29869694-29869798)
chr6 (1-195)||(13620712-13620911)
chr6 (153-336)||(27740838-27741021)
chr6 (88-157)||(27751603-27751672)
chr6 (88-172)||(16887792-16887877)
chr6 (88-170)||(19854319-19854402)
chr6 (88-172)||(18629608-18629693)
chr6 (1-32)||(14626045-14626076)
chr6 (112-170)||(29605614-29605672)
chr6 (227-268)||(18399005-18399046)
chr6 (90-170)||(17083200-17083280)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (1-336)||(36093-36430)
scaffold0023 (88-336)||(48598-48845)
scaffold0023 (4-123)||(169830-169951)
scaffold0023 (1-195)||(153925-154124)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (4-336)||(31593-31928)
scaffold0008 (103-336)||(128200-128431)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (1-336)||(21031-21367)
scaffold0139 (1-336)||(13977-14312)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (1-332)||(9266-9596)
scaffold0215 (1-332)||(16164-16494)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (1-336)||(5130-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (1-336)||(3722-4060)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (1-332)||(2966-3299)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (1-230)||(1220-1450)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (88-313)||(5551-5776)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (104-336)||(8878-9109)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (1-240)||(13242-13480)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (88-334)||(3598-3843)
scaffold0266 (88-336)||(1124-1371)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (88-336)||(12115-12360)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (88-336)||(48187-48434)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (88-336)||(6080-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (88-336)||(972-1218)
[»] scaffold0025 (2 HSPs)
scaffold0025 (103-336)||(148721-148953)
scaffold0025 (88-336)||(8849-9096)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (88-336)||(19206-19453)
scaffold0195 (88-336)||(21290-21537)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (88-336)||(36929-37176)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (88-336)||(34476-34724)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (88-336)||(41648-41895)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (103-336)||(5092-5324)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (88-336)||(26431-26678)
scaffold0162 (88-336)||(8196-8440)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (104-336)||(123196-123427)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (103-325)||(171916-172137)
scaffold0001 (103-325)||(177619-177840)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (88-336)||(13506-13753)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (88-325)||(247458-247694)
scaffold0012 (1-268)||(34076-34346)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (88-332)||(41733-41976)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (88-336)||(550-797)
[»] scaffold0009 (2 HSPs)
scaffold0009 (103-330)||(272031-272257)
scaffold0009 (227-268)||(69524-69565)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (1-268)||(45098-45369)
scaffold0066 (52-268)||(54484-54700)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (1-195)||(1493-1692)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (1-195)||(31448-31647)
scaffold0107 (48-195)||(39785-39934)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (230-336)||(48514-48620)
[»] scaffold1500 (1 HSPs)
scaffold1500 (1-195)||(1432-1631)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (230-336)||(9-115)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (88-218)||(51198-51328)
[»] scaffold0213 (1 HSPs)
scaffold0213 (1-195)||(29301-29500)
[»] scaffold0383 (1 HSPs)
scaffold0383 (1-195)||(2531-2731)
[»] scaffold0361 (1 HSPs)
scaffold0361 (88-268)||(3257-3437)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (1-258)||(7374-7634)
[»] scaffold0078 (1 HSPs)
scaffold0078 (88-336)||(37082-37328)
[»] scaffold0467 (1 HSPs)
scaffold0467 (37-195)||(10296-10456)
[»] scaffold0183 (1 HSPs)
scaffold0183 (1-102)||(6831-6935)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (1-110)||(10666-10778)
[»] scaffold0028 (1 HSPs)
scaffold0028 (88-218)||(89470-89600)
[»] scaffold0892 (1 HSPs)
scaffold0892 (37-172)||(3577-3712)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (88-268)||(56115-56295)
[»] scaffold0017 (1 HSPs)
scaffold0017 (37-172)||(54038-54173)
[»] scaffold0141 (2 HSPs)
scaffold0141 (88-195)||(22680-22787)
scaffold0141 (88-195)||(26935-27042)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (88-195)||(1598-1705)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (35-102)||(7443-7510)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (247-336)||(9382-9471)
[»] scaffold0155 (1 HSPs)
scaffold0155 (5-100)||(23671-23769)
[»] scaffold0516 (1 HSPs)
scaffold0516 (1-102)||(12045-12149)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (88-268)||(22422-22602)
[»] scaffold1666 (1 HSPs)
scaffold1666 (88-195)||(4-113)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (88-172)||(8172-8257)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (1-63)||(13268-13333)
scaffold0032 (88-195)||(104623-104732)
[»] scaffold1272 (1 HSPs)
scaffold1272 (106-172)||(456-523)
[»] scaffold0406 (1 HSPs)
scaffold0406 (88-170)||(14200-14283)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (106-172)||(2334-2401)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (88-170)||(22163-22246)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (88-170)||(108173-108256)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (221-268)||(197386-197433)
[»] scaffold0409 (2 HSPs)
scaffold0409 (88-184)||(1348-1446)
scaffold0409 (88-184)||(9603-9701)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (89-142)||(10854-10908)
[»] scaffold0700 (1 HSPs)
scaffold0700 (88-172)||(2687-2772)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (112-172)||(22453-22514)


Alignment Details
Target: chr4 (Bit Score: 316; Significance: 1e-178; HSPs: 38)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10644554 - 10644219
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644554 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 10644455  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644454 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 10644355  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644354 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 10644255  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10644254 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47357989 - 47357654
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  47357989 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttcctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctct 47357890  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |||    
T  47357889 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagatt 47357790  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357789 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 47357690  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| |||||| || ||||||||||||||||||||    
T  47357689 aattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 112 - 328
Target Start/End: Original strand, 13048261 - 13048477
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattg 211  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||| |||||| || |||||    
T  13048261 tatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattg 13048360  T
Q  212 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 311  Q
     |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  13048361 atgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttattagataatatgattaatgaataattgcttggg 13048460  T
Q  312 tttgcatattcatggat 328  Q
    |||||||||||||||||    
T  13048461 tttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 15675105 - 15675352
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  15675105 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 15675204  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  15675205 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgtt 15675303  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  15675304 gttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 31115861 - 31115629
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||  ||| |    
T  31115861 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattat 31115762  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |    
T  31115761 gctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatca 31115663  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  31115662 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 10104281 - 10104445
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  10104281 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 10104380  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10104381 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13246662 - 13246430
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  13246662 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 13246563  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  13246562 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 13246464  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13246463 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 54118276 - 54118507
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | || || |||||| |||  |||||     
T  54118276 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaattgataagttgtgaaaattgtg 54118375  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgtt-gatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| || | |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  54118376 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattt-agttatgattcttgttcaattgatgttatagttgttaattgatgttgtggttgatgaatca 54118473  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  54118474 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 17145575 - 17145845
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17145575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 17145674  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | | |||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| |||    
T  17145675 tcttactgtgatgctattttcttgtacatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttgtga 17145774  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
      ||| |||| |||| |||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17145775 -aattatactcaattagtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 17145845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18248556 - 18248286
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    |||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  18248556 aaggtaagggggttagttattatcataatcttgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgc 18248457  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||||||| |||||    
T  18248456 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagatatga 18248357  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
      ||| |||| |||| |||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  18248356 -aattatactcaattagtgaattt-taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 18248286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18169308 - 18169109
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  18169308 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18169209  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18169208 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18169109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 103 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 122121 - 121990
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  122121 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 122022  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgtt 235  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||    
T  122021 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtt 121990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 7131983 - 7132182
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  7131983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 7132082  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7132083 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7132182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19020824 - 19020625
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||  |||| ||||||||   | ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  19020824 aaggtaagggggttagttaccatcataatcatgttcaatttttgcattttgtcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 19020725  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19020724 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19020625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20001061 - 20000862
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  20001061 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 20000962  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  20000961 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttctgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 20000862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 26680447 - 26680201
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||  |    
T  26680447 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaa 26680348  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| | |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  26680347 agttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 26680250  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  26680249 gtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15287163 - 15287362
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |  ||||||||||    
T  15287163 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgc 15287262  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15287263 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15287362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 103 - 268
Target Start/End: Original strand, 40885585 - 40885749
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 201  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||  |||     
T  40885585 ctgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtcaagttatga-aatta 40885683  T
Q  202 tactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    | || |||||||||| || | ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40885684 tgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15294272 - 15294471
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||   |  ||||||||||    
T  15294272 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggatgatgaacaattatagctaaattcgtgc 15294371  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  15294372 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatatataaatgttaagttatga 15294471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 22738568 - 22738412
Alignment:
Q  37 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 136  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  22738568 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggctgaggaacaattgatgttaaattcgtgttcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatga 22738469  T
Q  137 taattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagtt 191  Q
    | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||    
T  22738468 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtt 22738412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 22351982 - 22352086
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||    
T  22351982 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcatgc 22352081  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  22352082 tcttg 22352086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 26339357 - 26339253
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  26339357 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 26339258  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  26339257 tcttg 26339253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 10 - 110
Target Start/End: Complemental strand, 8378480 - 8378377
Alignment:
Q  10 gggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgt 106  Q
    |||||||||||||||| |||||||||    |||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||||||||||    
T  8378480 gggttagttattatcataatcatgtacaatttttacattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgt 8378381  T
Q  107 gatg 110  Q
    ||||    
T  8378380 gatg 8378377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10488809 - 10488702
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  10488809 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 10488710  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  10488709 agttatga 10488702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 16327942 - 16328049
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  16327942 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 16328041  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  16328042 agttatga 16328049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 8374722 - 8374576
Alignment:
Q  122 tgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaattt 219  Q
    |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||  ||| |||| |||| ||||||||    
T  8374722 tgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgcttcaaagtatgtataaatgttaagttatgaa-attatactcaattagtgaattt 8374624  T
Q  220 ctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8374623 -taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 8374576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 111484 - 111395
Alignment:
Q  247 tgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  111484 tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 144
Target Start/End: Complemental strand, 33240947 - 33240891
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgta 144  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33240947 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgta 33240891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 9795564 - 9795499
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||| ||||| ||||||||||||||||    
T  9795564 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaattttttcattttctcatgttgtatgaaa 9795499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 15045057 - 15044990
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15045057 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15044990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 15109367 - 15109434
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  15109367 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 15109434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Original strand, 18238157 - 18238240
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatga-attgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  18238157 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgatattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18238240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 107 - 245
Target Start/End: Complemental strand, 7850228 - 7850090
Alignment:
Q  107 gatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtacta 206  Q
    ||||||||||||| ||| ||| |||||||| || |||   |||||||||| ||||  |||| ||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||     
T  7850228 gatgttatgtttgaatgaatgtattgatgaaaactgtgtgattgttggtggaattgtatgtccaattatgtgaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctc 7850129  T
Q  207 aattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagat 245  Q
    || || |||| || | ||||||  ||||||| |||||||    
T  7850128 aagtgatgaaattttgctaagtgattgttgaattgagat 7850090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 13442676 - 13442777
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgt 185  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |   ||||| |||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  13442676 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgtttgtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgt 13442775  T
Q  186 ta 187  Q
    ||    
T  13442776 ta 13442777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 13590213 - 13590254
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  13590213 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 13590254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 336
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  292 ttgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Complemental strand, 14996476 - 14996444
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  14996476 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 14996444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 228 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18276541 - 18276501
Alignment:
Q  228 ttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    |||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18276541 ttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 18276501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 300; Significance: 1e-169; HSPs: 43)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 300; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 16821474 - 16821139
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  16821474 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaatccgtgctct 16821375  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16821374 tgctgtgatgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtatt 16821275  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821274 gtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 16821175  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16821174 aattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 55316555 - 55316219
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  55316555 aaggtaaaggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 55316456  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  55316455 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 55316356  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  55316355 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaa 55316256  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316255 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41270411 - 41270075
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  41270411 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatctactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 41270312  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  41270311 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 41270212  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  41270211 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaa 41270112  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270111 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 15615168 - 15614838
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||| |||||||    
T  15615168 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgtgctct 15615069  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| |||     
T  15615068 tactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaatatg 15614969  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  15614968 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 15614870  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15614869 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 15936553 - 15936890
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||| ||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||    
T  15936553 aaggtatgggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 15936652  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15936653 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15936752  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15936753 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15936851  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  15936852 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 333
Target Start/End: Original strand, 15938395 - 15938729
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   |||| |||||    
T  15938395 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaatacgtgc 15938494  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||   |||| ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  15938495 tccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 15938594  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  15938595 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 15938693  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatg 333  Q
    ||||||||| || || ||||||||||||||||||||    
T  15938694 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 14842577 - 14842824
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||    
T  14842577 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgata 14842676  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  14842677 agttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgtt 14842775  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14842776 atgattgatgaataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 13975738 - 13975985
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  13975738 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgata 13975836  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13975837 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataat 13975936  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13975937 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 45861052 - 45860805
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  45861052 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgata 45860954  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  45860953 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataat 45860854  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  45860853 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 13954906 - 13955153
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||| |     
T  13954906 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaaataagtaaaaatgatc 13955004  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  13955005 agttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataat 13955104  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13955105 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 15859040 - 15859287
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| ||    
T  15859040 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgata 15859139  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  15859140 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtt 15859238  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15859239 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 88 - 337
Target Start/End: Original strand, 51158034 - 51158282
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  51158034 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 51158133  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  51158134 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtt 51158232  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgt 337  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  51158233 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 12030163 - 12030410
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  12030163 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgata 12030262  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||   |||| || ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| || |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  12030263 agttgtgaaagttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgtt 12030361  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  12030362 atggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2050057 - 2049810
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  2050057 aaattcgtgctccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgata 2049958  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    | || |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||  ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  2049957 acttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgtt 2049859  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  2049858 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 12264710 - 12264981
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  12264710 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12264809  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12264810 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12264909  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    | ||| |||| ||||| |||| || |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12264910 g-attatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 12264981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 13839141 - 13838905
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  13839141 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 13839042  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  13839041 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtt 13838943  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     || ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||    
T  13838942 gtggttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 106 - 336
Target Start/End: Original strand, 17912516 - 17912744
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtact 205  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||  ||||| |     
T  17912516 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgca 17912615  T
Q  206 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 305  Q
    |||||| |||||||    || ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||    
T  17912616 aaattgatgaatttga--tatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactg 17912713  T
Q  306 cttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  17912714 cttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 15468258 - 15468596
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||||  ||  ||||||||||    
T  15468258 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgaggaacaattgttgctaaattcgtgc 15468357  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||| ||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  15468358 tcttgctatgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 15468457  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 295  Q
      ||| |||| ||||| |||| || |  || ||| |  ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||| | | |||||  |||| ||||  |  |    
T  15468458 -aattatacttaattgatgaaatt-tgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaa 15468555  T
Q  296 tgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15468556 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22275547 - 22275209
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  22275547 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22275448  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    |||||||||||||  || ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  22275447 tcttgctgtgatgccattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatga 22275348  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 295  Q
      ||| |||| ||||| |||| || |  || ||| |  ||||  |||||||| |||||| ||| ||||||||| | | |||||  |||| ||||  |  |    
T  22275347 -aattatacttaattgatgaaatt-tgatatgttttgattgaaatgagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaa 22275250  T
Q  296 tgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||    
T  22275249 tgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 49232774 - 49232575
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  49232774 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 49232675  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49232674 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 49232575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 12902008 - 12902207
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  12902008 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataatttttgctaaattcgtgc 12902107  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12902108 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12902207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 18911331 - 18911132
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  18911331 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18911232  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18911231 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18911132  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 25059077 - 25058878
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatg---taattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  25059077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgcacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 25058978  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25058977 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 25058878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 1 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 54651795 - 54651529
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||| ||  | |||| ||||||||   | ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||    
T  54651795 aaggtaagggggtttgtcttcatcataatcatgttcaatttttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgc 54651696  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||  |||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  54651695 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgagtgaaattgcatgttgcaaagtatgtataaatgttaagttatga 54651596  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattga 264  Q
      ||| |||| ||||||||||||| |  || |||||||||||  |||||||| |||||||||| |||||    
T  54651595 -aattatactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtaattcatgttccattga 54651529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1467657 - 1467856
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  1467657 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 1467756  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1467757 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1467856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 5228650 - 5228451
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||  ||||||||||| |||||||||| ||  ||  ||||||||||    
T  5228650 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgtgttatgaaaatgggttgatgaaca-ttgttgctaaattcgtgc 5228552  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||||||| |   | |||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||    
T  5228551 tcttgctgtgatgttatttccttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaaatatgtataaatgttaagttatga 5228452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 166
Target Start/End: Original strand, 18896962 - 18897130
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    ||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  18896962 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaagttttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 18897061  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg 166  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||| |||||||||    
T  18897062 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtggaattacatg 18897130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12812179 - 12811980
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  12812179 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatattgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 12812080  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12812079 tcttgctgtaatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12811980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 16744131 - 16744377
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  ||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||  |    
T  16744131 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaatatgtaaaaatgaaa 16744230  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| | |||| | |||||||  |  | ||| | ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || |  || ||    
T  16744231 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaataaatgtt 16744328  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16744329 gtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 2449254 - 2449361
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  2449254 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 2449353  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  2449354 agttatga 2449361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 44229268 - 44229063
Alignment:
Q  53 gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgtt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||| |||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||     
T  44229268 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaatccgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtg 44229169  T
Q  153 ggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 250  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||| |||| |||| |||||| | |  || ||||||||| |  |||||||||||    
T  44229168 gatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga-aattatactcaattagtgaatct-tgatatgttgttgttaaaatgagatgtgat 44229071  T
Q  251 tcatgttc 258  Q
    ||||||||    
T  44229070 tcatgttc 44229063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 223 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  223 ctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattc 322  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  323 atggattgatgatg 336  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Original strand, 11986182 - 11986362
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| || ||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  || || ||||||  |||||    
T  11986182 aaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgttttaaagtatgtattaatgt 11986281  T
Q  186 taagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     |||||||||  ||||| || || | |||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||    
T  11986282 caagttatga-aattgtgctcaaatagtgaattt-tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgtt 11986362  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 41661812 - 41661729
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||| ||| |||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  41661812 aaattcgtgctcttgctatgatgatatgtttgaatacatggaaatgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 41661729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Original strand, 31412333 - 31412416
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||| |||||||| || |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  31412333 aaattcgtgctcttgttatgatgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 31412416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 11638465 - 11638424
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  11638465 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 11638424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 8268651 - 8268683
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8268651 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8268683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 1 - 33
Target Start/End: Original strand, 8275751 - 8275783
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatg 33  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  8275751 aaggtaagggggttagttattatcataatcatg 8275783  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 224 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 15876179 - 15876135
Alignment:
Q  224 taagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    |||||||||||||| ||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  15876179 taagttgttgttgaattgtgataagattcatgttcaattgatgtt 15876135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 89 - 172
Target Start/End: Original strand, 47784767 - 47784851
Alignment:
Q  89 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    ||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  47784767 aattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 47784851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 2)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 43333 - 42997
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttg-ctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43333 aaggtaagggggttagttactatcacaaacatgtaattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgtcaaattcgtgctc 43234  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  43233 ttgctgggatgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagat 43134  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43133 tgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 43034  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43033 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39441 - 39242
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  39441 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 39342  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39341 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 44)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27010177 - 27009841
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27010177 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 27010078  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  27010077 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatat 27009978  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27009977 tgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaa 27009878  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27009877 taattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18777907 - 18778244
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18777907 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttaaattcgtgct 18778006  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  18778007 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 18778106  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778107 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatattatgattgatga 18778206  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18778207 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25426965 - 25426628
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  25426965 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 25426866  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  25426865 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 25426766  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426765 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 25426666  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25426665 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 43443312 - 43443647
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    |||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  43443312 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattgcatattctcatgttatatgaaaatggattgatgaacaattcatgttaaattcgtgctct 43443411  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||    
T  43443412 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatt 43443511  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443512 gtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 43443611  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443612 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12711 - 12374
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  12711 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 12612  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |    
T  12611 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 12512  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12511 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 12412  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12411 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 22366396 - 22366733
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  22366396 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgagcaattcatgctaaattcgtgct 22366495  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  22366496 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 22366595  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366596 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 22366695  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22366696 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19500236 - 19499899
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  |||||||||||    
T  19500236 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacacttcatgctaaattcgtgct 19500137  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  19500136 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 19500037  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19500036 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatta 19499937  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  19499936 ataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21073510 - 21073847
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||  |||||||||||    
T  21073510 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttaatgaacaattcatgctaaattcgtgct 21073609  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  21073610 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 21073709  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21073710 ttgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttgatattatgattgatga 21073809  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21073810 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 4199900 - 4200237
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  4199900 aaggtaagggggttagggattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaataattcatgctaaattcgtgct 4199999  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  4200000 cttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaata 4200099  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    || | ||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4200100 ttatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 4200199  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4200200 atgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 284
Target Start/End: Original strand, 29188201 - 29188483
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||  | |||||||||||    
T  29188201 aaggtaagggggttagtgattattataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggtcgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 29188300  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  29188301 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 29188400  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgat 284  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| |||||    
T  29188401 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgat 29188483  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 23507196 - 23506965
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||     
T  23507196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtg 23507097  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  23507096 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 23506998  T
Q  304 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  23506997 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 18531083 - 18531330
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18531083 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 18531182  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  |||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  18531183 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 18531281  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| |||||| |||| | |||||||||| ||||||||||    
T  18531282 gttgttgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 22053849 - 22054096
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  22053849 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 22053948  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  22053949 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 22054047  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054048 gttgttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 35791016 - 35791287
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  35791016 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 35791115  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35791116 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgagtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35791215  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    | ||| |||| ||||| |||| || |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  35791216 g-attatacttaattgatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 35791287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 3e-51
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 11211983 - 11212253
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  11211983 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 11212082  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  11212083 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtgtgtataaatgttaagttatga 11212182  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
      ||| |||| || | |||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  11212183 -aattatactcaagtagtgaattt-taatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 11212253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 27182578 - 27182810
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  27182578 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 27182677  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  27182678 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 27182776  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| || |||||||||||| ||||||||||    
T  27182777 ttgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 34939524 - 34939289
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  34939524 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 34939425  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||  ||| ||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  34939424 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgctgttaattgatgtt 34939327  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  34939326 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 17471506 - 17471844
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta---attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  17471506 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaattttgtattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgataaattcgtgc 17471605  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| ||||    
T  17471606 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtaatga 17471705  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 295  Q
      ||| |||| ||||| |||| || |  || ||| |  ||||  | |||||| |||||| ||| ||||||||| | | |||||  |||| ||||  |  |    
T  17471706 -aattatacttaattgatgaaatt-tgatatgttttgattgaaataagatgtaattcatattccattgatgttgttattgttaactgatgttattgtgaa 17471803  T
Q  296 tgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||| |||||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  17471804 tgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7425662 - 7425463
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  7425662 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 7425563  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||||||| ||  | ||||||||| |||| | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7425562 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7425463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23514899 - 23514700
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  23514899 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 23514800  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23514799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23514700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1219438 - 1219637
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  1219438 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1219537  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||| |||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1219538 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcattaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1219637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 10777888 - 10778087
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||| |||| ||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  10777888 aaggtaaggggggtagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10777987  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10777988 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10778087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 21932299 - 21932498
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  21932299 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21932398  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21932399 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21932498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 21938469 - 21938668
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  21938469 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 21938568  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21938569 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 21938668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 35582374 - 35582175
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  35582374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 35582275  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  35582274 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 35582175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 36989688 - 36989887
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || |||||| || |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  36989688 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcaatttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 36989787  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||| ||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  36989788 tctagctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 36989887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 5 - 195
Target Start/End: Original strand, 22883006 - 22883201
Alignment:
Q  5 taagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 101  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||| ||||||||    
T  22883006 taagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaatttgtgctctt 22883105  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22883106 gctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22883201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23328895 - 23328791
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23328895 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 23328796  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  23328795 tcttg 23328791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24616499 - 24616395
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24616499 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24616400  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  24616399 tcttg 24616395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24712875 - 24712771
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24712875 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24712776  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  24712775 tcttg 24712771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 24745893 - 24745789
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24745893 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 24745794  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  24745793 tcttg 24745789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20623216 - 20623109
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  20623216 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 20623117  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  20623116 agttatga 20623109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 21233544 - 21233651
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  21233544 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 21233643  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  21233644 agttatga 21233651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 25900422 - 25900529
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||| |||||  ||||||| ||||||  |    
T  25900422 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 25900521  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  25900522 agttatga 25900529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16536444 - 16536337
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  16536444 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 16536345  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  16536344 agttatga 16536337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 32950942 - 32950761
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgtt-caaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || || |||| |||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||| |||||| ||| ||    
T  32950942 aaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtttcaaagtatgtataaaggt 32950843  T
Q  186 taa-gttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     || |||||||  ||||| || || |||||||||| | ||| |||||||||||   |||||||||||||||||| |||||||||    
T  32950842 caaagttatgaa-attgtgctcaaatggtgaattt-tactatgttgttgttgaaaagagatgtgattcatgttccattgatgtt 32950761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 37052991 - 37052884
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||  |||||  |    
T  37052991 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtggaaatgaaa 37052892  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  37052891 agttatga 37052884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 23981516 - 23981625
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  23981516 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgtatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 23981615  T
Q  186 taagttatga 195  Q
    ||| ||||||    
T  23981616 taacttatga 23981625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310794
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 21310794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 5450861 - 5450928
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  5450861 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 5450928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Original strand, 26559815 - 26559898
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||  |||||||| || |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  26559815 aaattcgtgctcttgctatgattatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 26559898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 19862456 - 19862371
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  19862456 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 19862371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 21617124 - 21617083
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  21617124 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 21617083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 292 - 332
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  292 ttgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
    ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 36)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21851881 - 21852217
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21851881 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 21851980  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  21851981 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatat 21852080  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852081 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 21852180  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21852181 taattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 3 - 336
Target Start/End: Original strand, 21844490 - 21844824
Alignment:
Q  3 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 101  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844490 ggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaattgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 21844589  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 201  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  21844590 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatattg 21844689  T
Q  202 tactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaata 301  Q
    | || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844690 tgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaata 21844789  T
Q  302 attgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21844790 attgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16674308 - 16674644
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||  ||||||||||||    
T  16674308 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgttgaacaattcatgctaaattcgtgctc 16674407  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    || |||||||||||||||| |||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  16674408 tttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 16674507  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  16674508 tgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaa 16674607  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16674608 taattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 30121060 - 30120722
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||   | ||||| ||   |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||    
T  30121060 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaatttttgtataatctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 30120961  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |    
T  30120960 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaat 30120861  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120860 attgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 30120761  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  30120760 aataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 6774175 - 6774505
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  6774175 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 6774274  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  6774275 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 6774374  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  6774375 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 6774473  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  6774474 cactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 24549316 - 24548986
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  24549316 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 24549217  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  24549216 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 24549117  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||| ||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  24549116 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 24549018  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  24549017 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  246 gtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  246 gtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 146 - 336
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagat 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  246 gtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 43373484 - 43373731
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  43373484 aaattcgtgctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 43373583  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||||| ||    
T  43373584 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgtt 43373682  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43373683 gtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 337
Target Start/End: Original strand, 16193732 - 16193980
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16193732 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 16193831  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | | || |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  16193832 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 16193930  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatgt 337  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||    
T  16193931 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 16195569 - 16195298
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||| |    
T  16195569 aaggtaagggggttaattattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgttc 16195470  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    || |||||||||| ||||||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16195469 tcgtgctgtgatgctatgttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16195370  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    | ||| |||| ||||  |||| || |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16195369 g-attatacttaatttatgaaattttgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 16195298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 24928807 - 24929043
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  24928807 aaattcgtgctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 24928906  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||||  ||||||||| ||||  ||||| | ||  || ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  24928907 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgtt 24929005  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  24929006 gtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 16404991 - 16405235
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||    
T  16404991 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgtta 16405090  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||   |||||| | |||| || |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  16405091 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttattgttgttaattgatgtt 16405186  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  16405187 ttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17345816 - 17345581
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  17345816 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 17345717  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||| ||||| ||||   ||||| ||||| ||    
T  17345716 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatattattgttgttaattgatgtt 17345619  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  17345618 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22006176 - 22006375
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  22006176 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 22006275  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22006276 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22006375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 13720846 - 13721045
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  13720846 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13720945  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13720946 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13721045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16872969 - 16873168
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  16872969 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 16873068  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16873069 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16873168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 271278 - 271477
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  271278 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 271377  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  271378 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 271477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 644642 - 644443
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  644642 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 644543  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  644542 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 644443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 830377 - 830178
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 830278  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 13662183 - 13662382
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||  ||  ||||||||||    
T  13662183 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgataaacaattgttgctaaattcgtgc 13662282  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||  ||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13662283 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatgnatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13662382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 22907230 - 22907476
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  22907230 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 22907329  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| | |||| | |||||||  |  | ||||| ||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  22907330 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 22907427  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  22907428 gtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22088712 - 22088911
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||  ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  22088712 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgtgttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22088811  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22088812 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttataggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22088911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15319077 - 15319276
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  15319077 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15319176  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  15319177 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15319276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15499446 - 15499645
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  15499446 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 15499545  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgtt--caaatatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||  ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | ||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  15499546 tcttgctgtgatactattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttctaagtatgtataaatgttgagttatga 15499645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 5238334 - 5238227
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  5238334 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 5238235  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  5238234 agttatga 5238227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 24661264 - 24661371
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  24661264 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 24661363  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  24661364 agttatga 24661371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 43685793 - 43685686
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  43685793 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 43685694  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  43685693 agttatga 43685686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 146 - 208
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  146 aattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaa 208  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| |||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011656
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcaaa 26011656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 5854722 - 5854681
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  5854722 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 5854681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 22497348 - 22497389
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  22497348 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 22497389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 38533757 - 38533716
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  38533757 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 38533716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 187
Target Start/End: Original strand, 45465126 - 45465227
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca-aatatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||| || | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||| | ||||| |||||||    
T  45465126 aaattcgtgctcctgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcatagtatgtgaaaatgt 45465225  T
Q  186 ta 187  Q
    ||    
T  45465226 ta 45465227  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 106 - 188
Target Start/End: Complemental strand, 15933527 - 15933443
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgttaa 188  Q
    ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||||||||| ||||| ||| ||||||    
T  15933527 tgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaagtatgtgaaagtgttaa 15933443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 265; Significance: 1e-148; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13573012 - 13572676
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13573012 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 13572913  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||    
T  13572912 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgaatat 13572813  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572812 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaa 13572713  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13572712 taattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 13910939 - 13911277
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  13910939 aaggtaagggggttattgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 13911038  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  13911039 cttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaata 13911138  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcct-aagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    || | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911139 ttatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 13911238  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911239 aataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 10989746 - 10989410
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    |||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  10989746 aaggtatgggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaaatcatgctaaattcgtgct 10989647  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| ||    
T  10989646 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaata 10989547  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989546 ttgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 10989448  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989447 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 2437794 - 2437457
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||  | ||||||||||| ||  |||||||||||    
T  2437794 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggataatgaacaattcttgctaaattcgtgct 2437695  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  2437694 cttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 2437595  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    ||||  | ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437594 ttgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 2437495  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  2437494 ataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 16478879 - 16479213
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  16478879 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatttaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgttagattcgtgctct 16478978  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  16478979 tactgcgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 16479078  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| |  |||||| || || ||||||||| |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  16479079 gtgctcaattggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 16479177  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16479178 cactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 18253761 - 18254098
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||    
T  18253761 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 18253860  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||      
T  18253861 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaaa 18253960  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  18253961 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 18254059  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||    
T  18254060 aataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 106 - 330
Target Start/End: Original strand, 25292372 - 25292595
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtact 205  Q
    ||||| |||||||||||| |||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||| |||||| ||    
T  25292372 tgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgct 25292471  T
Q  206 aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattg 305  Q
     |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  25292472 caattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgactaatgaataattg 25292570  T
Q  306 cttgggtttgcatattcatggattg 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  25292571 cttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 47481047 - 47481294
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47481047 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 47481146  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  |||||  | ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||   | ||| ||||| ||    
T  47481147 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatcgctcttaattgatgtt 47481245  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  47481246 tttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16212013 - 16211768
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16212013 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgata 16211914  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||| |||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  16211913 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgtt 16211815  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatga 334  Q
     || ||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||| ||||    
T  16211814 gtggttgatgattcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13321263 - 13321014
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||    
T  13321263 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgt 13321164  T
Q  186 taagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttg-ttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgat 284  Q
     |||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||    
T  13321163 caagttatga-aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgat 13321066  T
Q  285 attatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || |  ||||||||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  13321065 gttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 1e-56
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36052896 - 36052667
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  36052896 ctgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 36052797  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | ||||   |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||  ||||| ||||| || || |||||||||||    
T  36052796 gctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttgatgaataa 36052701  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36052700 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 13037030 - 13037277
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||| |||||||||||| | | ||||| ||    
T  13037030 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgata 13037129  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||    
T  13037130 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgtt 13037228  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13037229 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 104; E-Value: 9e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Original strand, 11580755 - 11580997
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  11580755 aaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 11580854  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  11580855 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtt 11580953  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 331  Q
     || ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| |||||    
T  11580954 gtggttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 3060213 - 3059966
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||  ||| ||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3060213 aaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 3060114  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    | || |||  ||| | || || |||||||||| |  ||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  3060113 aattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgtt 3060015  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  3060014 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15950709 - 15950908
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  15950709 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 15950808  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15950809 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15950908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18979939 - 18980138
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  18979939 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18980038  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18980039 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18980138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15927906 - 15927707
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||  ||||||||||    
T  15927906 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgatcaattgttgctaaattcgtgc 15927807  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15927806 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgcttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15927707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 13758708 - 13758509
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  13758708 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 13758609  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13758608 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13758509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 15760032 - 15760231
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  15760032 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 15760131  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| ||  ||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15760132 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatgatatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 15760231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7823066 - 7822867
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  7823066 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7822967  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7822966 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7822867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 7830377 - 7830178
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  7830377 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 7830278  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7830277 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 7830178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27101555 - 27101754
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  27101555 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27101654  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27101655 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27101754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 27108903 - 27109102
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  27108903 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27109002  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27109003 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27109102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27176771 - 27176572
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  27176771 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 27176672  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  27176671 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 27176572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 38783647 - 38783846
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  38783647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38783746  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38783747 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38783846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 7293263 - 7293017
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  7293263 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 7293164  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| | |||| | |||||||  |  | ||||||||||| ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  7293163 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 7293066  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  7293065 gtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 14250816 - 14251015
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||  ||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  14250816 aaggtaagggggttagttatcatcgtaatcatgttcattttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 14250915  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14250916 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 14251015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Original strand, 48622623 - 48622758
Alignment:
Q  37 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 136  Q
    |||||||||| |||||||| || |||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  48622623 ttttgcattttctcatgttttacgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 48622722  T
Q  137 taattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    | || |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  48622723 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 48622758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 11516474 - 11516367
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  11516474 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 11516375  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  11516374 agttatga 11516367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 15441580 - 15441687
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  15441580 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 15441679  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  15441680 agttatga 15441687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 30262145 - 30262252
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  30262145 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 30262244  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  30262245 agttatga 30262252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 1 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15862257 - 15862174
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaatt 81  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  15862257 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaatt 15862174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 16418798 - 16418731
Alignment:
Q  35 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 102  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16418798 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 16418731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Original strand, 10000325 - 10000392
Alignment:
Q  35 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 102  Q
    |||||||||| | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  10000325 aattttgcatcttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaatttatgtcaaattcgtgctcttg 10000392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 109 - 268
Target Start/End: Original strand, 296003 - 296162
Alignment:
Q  109 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaa 208  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||  ||  ||||||||||||||| |||||| || ||||||||||||  ||||||| |  ||| ||   ||    
T  296003 tgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttataaaaattatatccaa 296102  T
Q  209 ttggtgaatttctcctaagttgttg-ttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     |||||||||| | |||| ||| || |||| ||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  296103 atggtgaattt-tgctaaattgatgtttgaattgtgttgtgattcatgttcaattgatgtt 296162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915013
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 16915013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 13377758 - 13377691
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  13377758 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 13377691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28722357 - 28722274
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||| | | ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  28722357 aaattcgtgctctagttatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28722274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9611555 - 9611470
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  9611555 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9611470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 9723946 - 9723987
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  9723946 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 9723987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 9839126 - 9839041
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  9839126 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 9839041  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 86 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 28390561 - 28390476
Alignment:
Q  86 tcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||  |   |||||||||||||| ||||||||    
T  28390561 tcaaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattaaattgttgttggtgaaattgcatgttca 28390476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 46474109 - 46474068
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  46474109 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 46474068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 369 - 35
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  369 aaggtaagggggttagttattatcaaaatcatgtaattttgcatt-gctcatgttatatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 271  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||    
T  270 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatgtatatt 171  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  170 gtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattaatgaat 71  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  70 aattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 64439 - 64780
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64439 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 64538  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatg 194  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||     |||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  64539 ttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgataagttatg 64638  T
Q  195 agtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 294  Q
    | |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  64639 aatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatta 64738  T
Q  295 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  64739 atgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 108084 - 107747
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| || | ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||    
T  108084 aaggtaagggggttagttatcattataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttactaaattcgtgc 107985  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| | |      
T  107984 tccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgcaaaaatgataagttgtaaaa 107885  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  107884 attgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 107786  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  107785 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 35)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 19886576 - 19886913
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  19886576 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 19886675  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| || ||||||||||  |    
T  19886676 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagtgataagttatgaaga 19886775  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886776 ttgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 19886875  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19886876 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 17396669 - 17396916
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||    
T  17396669 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaataagtaaaaatgata 17396767  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||||||| |||||| || |||||||||||||||||||||||||  || |||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  17396768 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 17396867  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  17396868 atgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 24341420 - 24341652
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |||||    
T  24341420 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgt 24341519  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    ||||||||| |    
T  24341520 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctgttgatgaatca 24341618  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  24341619 ttgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 19794720 - 19794967
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  19794720 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 19794819  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||    |||| ||||| ||    
T  19794820 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatttccgttaattgatgtt 19794918  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19794919 atagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 88 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 462985 - 462743
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  462985 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 462886  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  |||||  | ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| |     
T  462885 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtc 462787  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattga 331  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  462786 gtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 36982457 - 36982704
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36982457 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 36982556  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  36982557 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgtt 36982655  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  36982656 gttgttgatgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 7507860 - 7508107
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  7507860 aaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 7507959  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatg-ttcaattgatgttatgaatgttatttgatat 286  Q
    ||||||||  |||||  | |||||||||||||   ||||||||||||| | ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| |    
T  7507960 agttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-ggctaagttgttgtt-aattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgt 7508057  T
Q  287 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    | |  ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  7508058 tgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 20627329 - 20627576
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  20627329 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaaatatgtaaaaatgata 20627428  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    | || |||  ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| | |||| |||||||||||| |||||  ||||| ||| | ||    
T  20627429 acttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatggttgttaattggtgtt 20627527  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| || ||||||||| ||||| ||||    
T  20627528 gtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 25265406 - 25265653
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  25265406 aaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 25265505  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||    
T  25265506 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgtt 25265604  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  || |||||| || |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25265605 gttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 43642989 - 43643220
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||  |||||     
T  43642989 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtg 43643088  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || ||||||||||||| | || ||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||||| |||   ||||| ||||| || |  ||||||||| |     
T  43643089 ctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctattgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcac 43643187  T
Q  304 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  43643188 tgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 8891489 - 8891242
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  8891489 aaattcgtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 8891390  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||    
T  8891389 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgtt 8891291  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  8891290 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 8944184 - 8943985
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  8944184 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 8944085  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  8944084 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatatttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 8943985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 12728730 - 12728531
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  12728730 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12728631  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12728630 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12728531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16935931 - 16935732
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||    
T  16935931 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgc 16935832  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16935831 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16935732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17006591 - 17006392
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| |||||| |||    
T  17006591 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcatgc 17006492  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   ||||  ||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17006491 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgcgtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17006392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 23777963 - 23778162
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||| |||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  23777963 aaggtaaaggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 23778062  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  |||||||||||||||||| || |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23778063 tcttgctgtgatgctattttcttatgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23778162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 34824813 - 34824614
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  34824813 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 34824714  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  34824713 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 34824614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 3798521 - 3798720
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  3798521 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 3798620  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3798621 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 3798720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 12635786 - 12635985
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  12635786 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcatttcctcatgttgtatgaaaataggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 12635885  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12635886 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12635985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 11231256 - 11231455
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  11231256 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 11231355  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  11231356 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 11231455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22513103 - 22513302
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  22513103 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 22513202  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22513203 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22513302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 24685699 - 24685898
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  24685699 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 24685798  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  24685799 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 24685898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 28775725 - 28775924
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  28775725 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 28775824  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  28775825 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 28775924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 12641560 - 12641759
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  12641560 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 12641659  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  12641660 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtggctgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 12641759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 42177887 - 42178086
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  42177887 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 42177986  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  42177987 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttttgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 42178086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 23774474 - 23774370
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  23774474 aaggtaagggggttagttattatcataatcaagttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 23774375  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  23774374 tcttg 23774370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 19689417 - 19689524
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  19689417 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 19689516  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  19689517 agttatga 19689524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23820318 - 23820211
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |    
T  23820318 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaa 23820219  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  23820218 agttatga 23820211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Original strand, 5888585 - 5888652
Alignment:
Q  35 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 102  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5888585 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 5888652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 14906456 - 14906563
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  14906456 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 14906555  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  14906556 agttatga 14906563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 53 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 21142178 - 21141973
Alignment:
Q  53 gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgtt 152  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || |||   ||||     
T  21142178 gttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtgctcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaggattatggtatgtttgtg 21142079  T
Q  153 ggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 250  Q
    | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||  ||| |||| |||| |||||| | |  || ||||||||| |  |||||||||||    
T  21142078 gatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga-aattatactcaattagtgaatct-tgatatgttgttgttaaaatgagatgtgat 21141981  T
Q  251 tcatgttc 258  Q
    ||||||||    
T  21141980 tcatgttc 21141973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 20015258 - 20015151
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||   ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  20015258 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 20015159  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  20015158 agttatga 20015151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 68221 - 68154
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  68221 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 68154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Original strand, 16292940 - 16292981
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  16292940 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 16292981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 24884933 - 24884848
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    ||||| |||||||  || ||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  24884933 aaatttgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatggaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 24884848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 24)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 5072304 - 5072640
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  5072304 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttactcaagttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 5072403  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  5072404 ttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 5072503  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5072504 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaa 5072603  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072604 taattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 19 - 336
Target Start/End: Original strand, 18601052 - 18601370
Alignment:
Q  19 attatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtt 117  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601052 attatcacaatcatgtaatttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtt 18601151  T
Q  118 tgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaat 217  Q
    |||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  18601152 tgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaat 18601251  T
Q  218 ttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgca 317  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601252 ttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgca 18601351  T
Q  318 tattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||    
T  18601352 tattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    |||||    ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22227848  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22227847 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    |||||    ||||| ||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22232545  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22232544 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 2116589 - 2116258
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||  | ||||||||| |    
T  2116589 aaggtaaaggggttagtgattatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtataaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgcttt 2116490  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  2116489 tactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 2116390  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgaga-tgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaa 299  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| |||||| | | |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||    
T  2116389 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaa 2116291  T
Q  300 taattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
    | ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  2116290 tcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 1 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 45051757 - 45051489
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | ||||||| |||    
T  45051757 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtgattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgttct 45051658  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||    
T  45051657 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatt 45051558  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttat 270  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||    
T  45051557 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20931592 - 20931345
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20931592 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgata 20931493  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| |||||||||||||||| | |||| |||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  20931492 agttatgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 20931394  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||| ||||||    
T  20931393 gtggttgatgaataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20913277 - 20913037
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||    
T  20913277 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgata 20913178  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||||| | | ||||||||||| |||       |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  20913177 agttatgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatctt 20913086  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  20913085 gtggttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41394469 - 41394222
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  41394469 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaatatgtaaaaatgata 41394370  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||| |||||   ||||||| |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||| ||    
T  41394369 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgtt 41394271  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| | || |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41394270 gttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 20893657 - 20893889
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  20893657 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 20893756  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||  | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  20893757 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttgatgaatca 20893855  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||| |||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  20893856 ttgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20445910 - 20445679
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  |||||     
T  20445910 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtg 20445811  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||    
T  20445810 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcat 20445712  T
Q  304 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  20445711 tgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 20531667 - 20531444
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattg 211  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||||  |||  ||||| || |||||    
T  20531667 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtgaaaattgtgctcaattg 20531568  T
Q  212 gtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttggg 311  Q
    |||||||| | ||||||||||||||| ||| | | |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| ||||||||||    
T  20531567 gtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgcttggg 20531469  T
Q  312 tttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    | |||||||||||| ||||| ||||    
T  20531468 tatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18059676 - 18059875
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  18059676 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtataatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 18059775  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18059776 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18059875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17004976 - 17004777
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  17004976 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 17004877  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17004876 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17004777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 106 - 336
Target Start/End: Original strand, 37844484 - 37844714
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagtta-tgagtattgtac 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || | | ||||| |||  || |||  ||||| |    
T  37844484 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtgaaaattgtgc 37844583  T
Q  205 taaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataatt 304  Q
    | ||||  ||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||| | |||    
T  37844584 tcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgagtcatt 37844682  T
Q  305 gcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  37844683 gcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 46523726 - 46523528
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  |||||||||||    
T  46523726 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgct 46523627  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||| | ||  ||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  46523626 cttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgtttatgttatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 46523528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 8 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 17148898 - 17148706
Alignment:
Q  8 gggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgct 104  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||||||| |    
T  17148898 gggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgctcttgtt 17148799  T
Q  105 gtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    || ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17148798 gtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 17148706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 38055009 - 38055208
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||| | |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  38055009 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcatcttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 38055108  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    | || |||||||||||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  38055109 ttttactgtgatgttattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 38055208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 19962417 - 19962616
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  19962417 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19962516  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||  |||||||||||| || |||   || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19962517 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19962616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 22035785 - 22035681
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22035785 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 22035686  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  22035685 tcttg 22035681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 7640852 - 7640956
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| |  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7640852 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttttcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 7640951  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  7640952 tcttg 7640956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 106 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 51452721 - 51452632
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||  |||||||||    
T  51452721 tgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaaatatgtgaaaatgaaaagttatga 51452632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 22143361 - 22143470
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||  || ||||| | |||||||||||||| ||||  ||||||||| |   ||||||||||| || |||||||||| |||||| ||||||    
T  22143361 aaattcgtgctctaactatgatgatgtgtttgtatgcatgaaatttgtgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaagtatgtataaatgt 22143460  T
Q  186 taagttatga 195  Q
    ||| ||||||    
T  22143461 taacttatga 22143470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 25093967 - 25093926
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||    
T  25093967 gttgttgttgatttgtgatgagattcatgtttaattgatgtt 25093926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 34)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 25175901 - 25175563
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttg-ctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||| |||| || |||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  25175901 aaggtaagggggttagtgattaccataatcatgtataattttgcatttttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgctaaattcgtgc 25175802  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||      
T  25175801 tcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 25175702  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175701 attgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 25175602  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25175601 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 27653898 - 27654235
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||    
T  27653898 aaggtgagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaaatcatgctaaattcgtgct 27653997  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  27653998 cttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 27654097  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27654098 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 27654197  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  27654198 ataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 12 - 336
Target Start/End: Original strand, 16825678 - 16826006
Alignment:
Q  12 gttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgat 109  Q
    |||||| ||||||| ||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  16825678 gttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctcttgctgtgat 16825777  T
Q  110 gttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtac--aattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaa 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  16825778 gttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaa 16825877  T
Q  208 attggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 307  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16825878 attggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatctgatattatgattgatgaataattgct 16825977  T
Q  308 tgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    | | | |||||||||||||||||||||||    
T  16825978 ttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 176; E-Value: 9e-95
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 1650022 - 1650352
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    |||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  1650022 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatgtaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 1650121  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||  |||    
T  1650122 tactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtgaaaatt 1650221  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| | ||| ||||||||| |||||| || ||||||||||||||   ||||||||||| || |  |||||||||    
T  1650222 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaat 1650320  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     | ||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  1650321 cactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Original strand, 14626134 - 14626377
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14626134 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 14626233  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  |||||    |||||||||| || | ||||||||||||| | ||||||| |||||| || |||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  14626234 agttatgaaaattgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgtt 14626332  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  14626333 gtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 35009455 - 35009702
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  35009455 aaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 35009554  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||    
T  35009555 agttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgtt 35009653  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  35009654 gttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23153694 - 23153458
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| ||    
T  23153694 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgata 23153595  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| |||||||||||| |||||  ||||| ||||| ||    
T  23153594 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgtt 23153496  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     || ||||||||| ||| ||||||| | ||||||||||    
T  23153495 gtggttgatgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 1657764 - 1657999
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |    
T  1657764 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtaaaaatgtga 1657863  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||| ||| ||||| | |||||| |||||| ||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  1657864 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttcagttgatgttattgttgttaattgatgtt 1657961  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  1657962 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 29666157 - 29665941
Alignment:
Q  52 tgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgt 151  Q
    ||||||||||||||||  ||||| | ||||  ||| ||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||  |||||    
T  29666157 tgttgtatgaaaatggggtgatggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgt 29666058  T
Q  152 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtga 249  Q
     |||||||||||||| |||||| |||| | |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||  |||||| |||    
T  29666057 gggtgaaattacatgtttcaaagtatgcataaatgtcaagttatga-aattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatga 29665960  T
Q  250 ttcatgttcaattgatgtt 268  Q
    |||||||||||||||||||    
T  29665959 ttcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 16232230 - 16232031
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  16232230 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 16232131  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16232130 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16232031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 1556343 - 1556144
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  1556343 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1556244  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1556243 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1556144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15862718 - 15862484
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||| |    
T  15862718 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaattatgtataaatgtga 15862619  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| || ||||| || |||| | ||||||| ||| ||| ||||| | |||||| ||||| ||| |||||||   || || ||||| ||    
T  15862618 agttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattg-tgaattgagttatgattcttgttc-atttatgttattgctgataattgatgtt 15862522  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     |  ||||||||| | ||||||||| ||||||||||||    
T  15862521 gttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 10489037 - 10488838
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  10489037 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 10488938  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  10488937 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 10488838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16376291 - 16376490
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  16376291 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16376390  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16376391 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16376490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16383615 - 16383814
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  16383615 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16383714  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16383715 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16383814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 22225656 - 22225855
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22225656 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22225755  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    |||| |||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22225756 tctttctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 22225855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 18086741 - 18086940
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||  | |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  18086741 aaggtaagggggttagttattagtataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 18086840  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18086841 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 18086940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 23978107 - 23977908
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||   |  ||||||||||    
T  23978107 aaggtaagggcgttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgtggctaaattcgtgc 23978008  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||||||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  23978007 tcttgttgtaatgttattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 23977908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16556057 - 16556256
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  16556057 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16556156  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    || |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16556157 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16556256  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 16632613 - 16632812
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  16632613 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 16632712  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    || |||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  16632713 tcctgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 16632812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 1 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 19610356 - 19610159
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  19610356 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctgatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattgctaaattcgtgc 19610257  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttat 193  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||| |||| | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||    
T  19610256 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaatcgatggttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttat 19610159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 137
Target Start/End: Original strand, 22251484 - 22251623
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  22251484 aaggtatgggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 22251583  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgat 137  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||||||||||||||||    
T  22251584 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgat 22251623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 19299575 - 19299376
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||  ||| ||||||||||    
T  19299575 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatggacaattgttgttaaattcgtgc 19299476  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||| ||| ||| ||  | ||  |||||||||||| || |||   || | |||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  19299475 tcttgctgtaatgctattttcttgtgtttgaattgatgattatggtatgtttatgggtggaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 19299376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 29869694 - 29869798
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  29869694 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttaaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 29869793  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  29869794 tcttg 29869798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 13620712 - 13620911
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||||||||||  |  ||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  13620712 aaggtaagggggttagtcttcttcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 13620811  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| ||||||||| |||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13620812 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 13620911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 153 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 27741021 - 27740838
Alignment:
Q  153 ggtgaaattacatgttc--aaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgat 250  Q
    ||||||||||||||||   || |||||| |||||| |||||||||  ||||| || ||||||||||||| | |||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  27741021 ggtgaaattacatgtttcgaagtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagtcgttgttgaattgagatatgat 27740924  T
Q  251 tcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||||||  |   | |||| |||| || |  | ||||||| || | |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  27740923 tcatgttcaattgatgtggttgctattatctgatgttgttgtggatgaatcatggtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 27740838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 88 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 27751672 - 27751603
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtga 157  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||    
T  27751672 aaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Original strand, 16887792 - 16887877
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||  || ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  ||||||||||| || ||||||||||    
T  16887792 aaattcgtgctctaactatgataatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaactgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 16887877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 19854402 - 19854319
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  19854402 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 19854319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629693
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||||||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 18629693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 1 - 32
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626076
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcat 32  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcat 14626076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 112 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 29605672 - 29605614
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||||||| |   |||||||||||||||||||||||    
T  29605672 tatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 29605614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18399046 - 18399005
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  18399046 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 18399005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 90 - 170
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083280
Alignment:
Q  90 attcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    |||||||||||   | ||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||  |||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttca 17083280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 36430 - 36093
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||||||    
T  36430 aaggtaagggggttaatgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaactgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgct 36331  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    ||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| ||||||||||  |    
T  36330 cttgtagtgatgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 36231  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36230 ttgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatga 36131  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36130 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48845 - 48598
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||    
T  48845 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgata 48746  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || | ||||||||||| | ||||||||||| |   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||  | ||| ||||| ||    
T  48745 agttgtgaaaattgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgtt 48647  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  48646 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 4 - 123
Target Start/End: Original strand, 169830 - 169951
Alignment:
Q  4 gtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  169830 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtataattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 169929  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatg 123  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  169930 gctgtgatgttatgtttgtatg 169951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 153925 - 154124
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  153925 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 154024  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||| ||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  154025 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaagttacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 154124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 217; Significance: 1e-119; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 4 - 336
Target Start/End: Original strand, 31593 - 31928
Alignment:
Q  4 gtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctctt 101  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||||||  |||||||||| | |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  31593 gtaagggggttagtgattatcataatcatgtgtaattttgcatattctcatgttgtatgaaaatgagttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctctt 31692  T
Q  102 gctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattg 201  Q
    |  ||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||| ||||     
T  31693 gtggtgatgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatatta 31792  T
Q  202 tactaaattggtgaatttctcct-aagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    | || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31793 tgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaat 31892  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31893 aattgcttgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 128200 - 128431
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||| |||  |||||    
T  128200 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaaattgt 128299  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || |||||| |||||| |  || ||||||||| | ||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  128300 gctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatgaataa 128397  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||| |||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  128398 ttgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 21031 - 21367
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  21031 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgct 21130  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  21131 cttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaga 21230  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||  || ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21231 ttgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttgatgttatgattgatga 21329  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  21330 ataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 13977 - 14312
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||  |||| ||||||    
T  13977 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgcacaattcttgctaaat-cgtgct 14075  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||  |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14076 cttgctgtgatgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaaga 14175  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 298  Q
    |||| || ||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||  ||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  14176 ttgtgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatga 14274  T
Q  299 ataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14275 ataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 9266 - 9596
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  9266 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 9365  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  9366 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 9465  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  9466 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 9564  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  9565 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Original strand, 16164 - 16494
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16164 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgcttt 16263  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  16264 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 16363  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaat 300  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| |||||| || |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||||    
T  16364 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaat 16462  T
Q  301 aattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16463 cattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Original strand, 5130 - 5466
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  5130 aaggtaagggagttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcacgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgttaaattcgtgc 5229  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagt 197  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  5230 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 5329  T
Q  198 attgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    |||||  | ||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||    
T  5330 attgtgttcaattggtgaattt-tgctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatg 5428  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5429 aataattgcttggg-ttgcatattcatggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 186; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 1 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 4060 - 3722
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  ||||||||||    
T  4060 aaggtaaggggtttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 3961  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgta-aaaatgttaagttatgag 196  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||      
T  3960 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatgga 3861  T
Q  197 tattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 296  Q
     |||||    ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  3860 aattgtgtccaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgat 3762  T
Q  297 gaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3761 gaataattacttgggtttgcatattcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 3299 - 2966
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--attttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgct 98  Q
    ||||||||||||||| ||||||||| ||| |||||  ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||  |||||||||||    
T  3299 aaggtaagggggttaattattatcataattatgtacaattttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgct 3200  T
Q  99 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagta 198  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||  |    
T  3199 cttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 3100  T
Q  199 ttgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatg-ttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 297  Q
    |||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| || |  ||||||    
T  3099 ttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatg 3001  T
Q  298 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
    ||| | |||||| || |||||||||||| ||||||    
T  3000 aatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 163; Significance: 5e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 1 - 230
Target Start/End: Original strand, 1220 - 1450
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaatttt-gcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctc 99  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  1220 aaggtaggggggttagttattatcacaatcatgtaatttttgcatttactcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctaaattcgtgctc 1319  T
Q  100 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtat 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||    
T  1320 ttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaatat 1419  T
Q  200 tgtactaaattggtgaatttctcctaagttg 230  Q
    ||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  1420 tgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 150; Significance: 3e-79; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 88 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 5776 - 5551
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||    
T  5776 aaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 5677  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||| |||| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  5676 agtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgataat 5577  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtt 313  Q
    |||||| |||||||||||||||||||    
T  5576 atgattaatgaataattgcttgggtt 5551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9109 - 8878
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||  |||||     
T  9109 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaaattgtg 9010  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| || |||||||||||||||    
T  9009 ctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatgaataat 8911  T
Q  304 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  8910 tgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 1 - 240
Target Start/End: Original strand, 13242 - 13480
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||  | |||||||||||    
T  13242 aaggtaagggggttagtgattatcataatcatgtaatttttcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgtgctct 13341  T
Q  101 tgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtatt 200  Q
    |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||     
T  13342 tagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatg 13441  T
Q  201 gtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgattt 240  Q
    || || ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||||    
T  13442 gtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 143; Significance: 5e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 88 - 334
Target Start/End: Original strand, 3598 - 3843
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3598 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 3697  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  3698 agttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgtt 3796  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatga 334  Q
     ||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3797 gtgattgaggaataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 1371 - 1124
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  1371 aaattcgtgctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 1272  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  1271 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatatt 1173  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1172 gtggttgatgaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 12360 - 12115
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||    
T  12360 aaattcgtgctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgata 12261  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||  | ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||    
T  12260 agttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgtt 12164  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12163 atgattcatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48434 - 48187
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  48434 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaaatgata 48335  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| |  |||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||  |||||| ||||| ||    
T  48334 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgttaattgatgtt 48236  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48235 gtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 6080 - 6326
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  6080 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 6179  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| | |  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||    
T  6180 agttgtaaaaattgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgtt 6277  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  6278 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 972 - 1218
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  972 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataata 1071  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||| ||||||| | ||||||||||||| | ||||||| | |||| ||||||| |||||||||| |||||| || || ||    
T  1072 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgtt-aattgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgtt 1169  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  1170 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 130; Significance: 3e-67; HSPs: 2)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 148953 - 148721
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  148953 ctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 148854  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |    
T  148853 gctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatca 148755  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||||||    
T  148754 ttgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9096 - 8849
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  9096 aaattcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 8997  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||   | ||| ||||| ||    
T  8996 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgtt 8898  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  8897 gttgttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 19453 - 19206
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19453 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 19354  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  19353 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 19255  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19254 gttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 21537 - 21290
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  21537 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 21438  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||||||||   ||||| ||||| ||    
T  21437 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgtt 21339  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  21338 gttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 36929 - 37176
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  36929 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgata 37028  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| |||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | ||| || ||||||||||| ||||||  ||||| ||||| ||    
T  37029 agttgtgaaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgtt 37127  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  37128 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 118; Significance: 4e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 4e-60
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 34476 - 34724
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| | |    
T  34476 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattgtgtaaaaatatga 34575  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatg-ttcaattgatgttatgaatgttatttgatat 286  Q
    |||| |||  ||||| || ||| ||||||||| | ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| || ||||||||||||   ||||||||||| |    
T  34576 agttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgt 34674  T
Q  287 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    | |  ||||||||| | | ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  34675 tgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 109; Significance: 9e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 41895 - 41648
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41895 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 41796  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  |||||  | ||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||| |   |||||  |||| ||    
T  41795 agttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaaatgatgtt 41697  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  41696 gttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 103 - 336
Target Start/End: Original strand, 5092 - 5324
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||  |||||    
T  5092 ctgtgacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgt 5191  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     || ||||||||||||| | | |||||||||||    |||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |    
T  5192 gctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatca 5290  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  5291 ttgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 26431 - 26678
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  26431 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgata 26530  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||    |||| | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| ||    
T  26531 agttgtgaaaattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtt 26629  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||    
T  26630 gtgattgatgaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 8196 - 8440
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |    
T  8196 aaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaattatgtaaaaatgtga 8295  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||| | |||   ||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||    
T  8296 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgcta---tgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgtt 8391  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  || |||||| || |||||||| ||||||| |||| ||||||||||    
T  8392 gttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatatacatgaattgatgatg 8440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 104 - 336
Target Start/End: Original strand, 123196 - 123427
Alignment:
Q  104 tgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgta 203  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||     
T  123196 tgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtg 123295  T
Q  204 ctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataat 303  Q
    || ||||||||||||| | |||||||||||||   || || | |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||||||    
T  123296 ctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaataat 123394  T
Q  304 tgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  123395 ggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 99; Significance: 8e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 172137 - 171916
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  172137 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 172038  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  172037 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 171939  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  171938 ttgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 177840 - 177619
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  177840 ctgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 177741  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  177740 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 177642  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
    |||||| ||| ||||||||||||    
T  177641 ttgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 13753 - 13506
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    |||||||||||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |    
T  13753 aaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtga 13654  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||| ||||||| | ||| ||||||||||| ||  |||| ||  ||||||||||||||||| |   ||||| ||||| ||    
T  13653 agttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgttgttgttaattgatgtt 13555  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||    
T  13554 gttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 88 - 325
Target Start/End: Original strand, 247458 - 247694
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||| |||||||||||| | | ||||| ||    
T  247458 aaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgata 247557  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||| ||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  247558 agttgtgaaaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgtt 247656  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatg 325  Q
     || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  247657 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Original strand, 34076 - 34346
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 96  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||   | |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||  ||  |||||||||    
T  34076 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcattgttgtatgaaa-tgggttgatgaaaaattgttgctaaattcgtg 34174  T
Q  97 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 194  Q
    |||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  34175 ctcttgctgtgaagctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatg 34274  T
Q  195 agtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    |   || |||| ||||| |||||||    || |||||||||||  |||||| |||||||||||| ||| |||||    
T  34275 a-agttatacttaattgatgaattt-ggatatgttgttgttgaaatgagatatgattcatgttccattaatgtt 34346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 93; Significance: 3e-45; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 88 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 41976 - 41733
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||    
T  41976 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgata 41877  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    | || |||  ||||| || ||||||||||||| | |||||||||||||   ||||| | |||||| ||||||||||||| ||||  ||||| ||| | ||    
T  41876 atttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgtt 41778  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgat 332  Q
     |   |||||||| |||| |||||| |||||||||||| ||||||    
T  41777 gtagatgatgaatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 89; Significance: 8e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 550 - 797
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |     
T  550 aaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgatg 649  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    |||| |||  |||||||| ||||||||||||| | |||||||  ||||   || || | |||||| |||| |||||||||||||  || || ||||| ||    
T  650 agttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatggctgctaattgatgtt 748  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     || ||||||||| ||||||||||| |||||||||| | ||||| ||||    
T  749 gtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 103 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 272257 - 272031
Alignment:
Q  103 ctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgagtattgt 202  Q
    |||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||  |||| ||| ||||||||||||||||||| | | ||||| |||||| |||  |||||    
T  272257 ctgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaaattgt 272158  T
Q  203 actaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataa 302  Q
     |||||||||||||||| | ||||||||| ||||  ||||| | |||||| |||||||||| ||||||   ||||| ||||| || || ||||||||| |    
T  272157 gctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatgaatca 272059  T
Q  303 ttgcttgggtttgcatattcatggattg 330  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  272058 ttgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 227 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 69565 - 69524
Alignment:
Q  227 gttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  69565 gttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 69524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 1 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 45369 - 45098
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt--aatt-ttgcatttgctcat-gttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 96  Q
    |||||||||||||||||  | |||| ||||||||  |||| ||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||    
T  45369 aaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcaattattgcaatttctcattgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtg 45270  T
Q  97 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 194  Q
    | |||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||||| ||    
T  45269 cccttgttgtgatgctattttgatgtgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttttg 45170  T
Q  195 agtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    |  |||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45169 a-aattgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtgattcatgttccattgatgtt 45098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 52 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 54700 - 54484
Alignment:
Q  52 tgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgt 151  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||  ||| |||||||||  |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||||||||||  |||||    
T  54700 tgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgttaaattcgtgtccttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgt 54601  T
Q  152 tggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtga 249  Q
     ||||||||| |||| |||||| |||||| |||||| |||||||||  |||||||| ||||||||||||| |  || |||||||||||  ||||||||||    
T  54600 gggtgaaattgcatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagttatga-aattgtactcaattggtgaattt-tgatatgttgttgttgaaatgagatgtga 54503  T
Q  250 ttcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  54502 ttcatgttccattgatgtt 54484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1493 - 1692
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||| ||||||    
T  1493 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaaatcgtgc 1592  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
     |||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1593 acttgctgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 31647 - 31448
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||  ||| ||||||||||    
T  31647 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttggtgaacaattgttgttaaattcgtgc 31548  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| |||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  31547 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 31448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 48 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 39934 - 39785
Alignment:
Q  48 ctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaa 147  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||||||||||||||  ||| ||  | |||||||||||||||| || |||       
T  39934 ctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgattctattttcctgtgcatgaattgatgattatggtattt 39835  T
Q  148 ttgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39834 ttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 39785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 230 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  230 gttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 329  Q
    |||||| ||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  330 gatgatg 336  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1500 (Bit Score: 78; Significance: 3e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1500
Description:

Target: scaffold1500; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Original strand, 1432 - 1631
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  1432 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 1531  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||| ||| ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   || | |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  1532 tcttgttgtaatgctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagttatga 1631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 230 - 336
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  230 gttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 329  Q
    |||||| |||||| || |||||| ||||||| |||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  330 gatgatg 336  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Original strand, 51198 - 51328
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||    
T  51198 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgata 51297  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatt 218  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||    
T  51298 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0213 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0213
Description:

Target: scaffold0213; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 29500 - 29301
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgta--at-tttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||  || ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||| ||||||||||    
T  29500 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatctttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgttaaattcgtgc 29401  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||||||||||| ||| ||  | ||| ||||||| |||| ||  ||   || | |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||||||||||||    
T  29400 tcttgctgtgatgctattttcttgtgcttgaattgttgattatgttatgtttatgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgttaagttatga 29301  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 1 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 2731 - 2531
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa----ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||     |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||   ||||||||    
T  2731 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctcaattcgtg 2632  T
Q  97 ctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatg 194  Q
    ||||||| |||||| ||| ||  | |||||||||||||| | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| |||    
T  2631 ctcttgccgtgatgctattttcttgtgcatgaattgatgcttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgttaagtcatg 2532  T
Q  195 a 195  Q
    |    
T  2531 a 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 3437 - 3257
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacat-gttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||||||||  |||||| |||||| |||| |    
T  3437 aaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacatatttcaaagtatgtataaatat 3338  T
Q  186 taagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     |||||||||  |||||||| || |||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||  |||||||||||||||    
T  3337 caagttatga-aattgtactcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgagaggatatgtgattattgttcaattgatgtt 3257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 69; Significance: 7e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 1 - 258
Target Start/End: Original strand, 7374 - 7634
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||   | |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  |   ||||||||||    
T  7374 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgttccatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattattactaaattcgtgc 7473  T
Q  98 tcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    ||||| ||||||| ||| ||  | |||||||||||| ||| || |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||||| |||||| ||| |||||    
T  7474 tcttgttgtgatgctattttcttgtgcatgaattgaagattatggtatgtttgtggatgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgtcaagctatga 7573  T
Q  196 gtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttc 258  Q
      ||| |||| |||| |||||| | |  || ||||||||| |  |||||||||||||||||||    
T  7574 -aattatactcaattagtgaatct-tgatatgttgttgttaaaatgagatgtgattcatgttc 7634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 88 - 336
Target Start/End: Original strand, 37082 - 37328
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  37082 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 37181  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 287  Q
    ||||||||  ||||| | |||| | |||||||  |  | ||||| ||||  ||||| | |||||| ||| ||||||||||| |  ||| || | ||| ||    
T  37182 agttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttgatgctaatagatgtt 37279  T
Q  288 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
     |  ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  37280 gtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 37 - 195
Target Start/End: Original strand, 10296 - 10456
Alignment:
Q  37 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 136  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||||  ||  ||||||||||||||||||||||| ||| ||  | |||||||||||||||    
T  10296 ttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaataattgttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgatattttcttgtgcatgaattgatga 10395  T
Q  137 taattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgttaagttatga 195  Q
    | || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  10396 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtataaatgctaagttatga 10456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0183 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0183
Description:

Target: scaffold0183; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 6935 - 6831
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  6935 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 6836  T
Q  98 tcttg 102  Q
    |||||    
T  6835 tcttg 6831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 1 - 110
Target Start/End: Original strand, 10666 - 10778
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgtaa---ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgc 97  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||  ||||||||||    
T  10666 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgttgctaaattcgtgc 10765  T
Q  98 tcttgctgtgatg 110  Q
    ||||| |||||||    
T  10766 tcttgttgtgatg 10778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 88 - 218
Target Start/End: Original strand, 89470 - 89600
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| | | ||||  ||    
T  89470 aaattcgtgctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattata 89569  T
Q  188 agttatgagtattgtactaaattggtgaatt 218  Q
    |||| |||  ||||| || ||||||||||||    
T  89570 agttgtgaaaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0892 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0892
Description:

Target: scaffold0892; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3577
Alignment:
Q  37 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 136  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  ||||| |||||||| |||||||||| | ||  | | |||||||||||||    
T  3712 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattagtgctcttactgtgatgttgttttcttgtccatgaattgatga 3613  T
Q  137 taattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    | || |||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  3612 ttatggtatgattgtgggtgaaattacatgttcaaa 3577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Original strand, 56115 - 56295
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg--ttcaaatatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||  |||||||||||| || || ||||||| |||||||||||||||  ||||| | ||||||||||||  || || |||||| ||||||    
T  56115 aaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgttttaaagtatgtataaatgt 56214  T
Q  186 taagttatgagtattgtactaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
     |||||||||  ||||| || || |||||||||| | |||||||||||||||   || ||||||||||||||| |||||||||    
T  56215 caagttatga-aattgtgctcaaatggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaaagatatgtgattcatgttccattgatgtt 56295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 37 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 54173 - 54038
Alignment:
Q  37 ttttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatga 136  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||||||| |||||||| | | ||  | |||||||||||||||    
T  54173 ttttgcattttctcatgttttatgaaaatgggttgatgaacaattgatgctaaattcgtgctcttactgtgatgctgttttcttgtgcatgaattgatga 54074  T
Q  137 taattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    | || |||   |||| ||||||||||||||||||||    
T  54073 ttatggtatgtttgtgggtgaaattacatgttcaaa 54038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 22787 - 22680
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  22787 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 22688  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  22687 agttatga 22680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 27042 - 26935
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  27042 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 26943  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  26942 agttatga 26935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 1598 - 1705
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 187  Q
    ||||||||||||   || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||  |    
T  1598 aaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtgaaaatgaaa 1697  T
Q  188 agttatga 195  Q
    ||||||||    
T  1698 agttatga 1705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 7510 - 7443
Alignment:
Q  35 aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 102  Q
    |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7510 aattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctcttg 7443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 247 - 336
Target Start/End: Complemental strand, 9471 - 9382
Alignment:
Q  247 tgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 336  Q
    |||||| ||||||||||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  9471 tgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0155 (Bit Score: 49; Significance: 6e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0155
Description:

Target: scaffold0155; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 100
Target Start/End: Original strand, 23671 - 23769
Alignment:
Q  5 taagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtgctct 100  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||  |   |||||| ||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23671 taagggggttagttattatcatattcaatttcaaattttacatcttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaactcatgtcaaattcgtgctct 23769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0516 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0516
Description:

Target: scaffold0516; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 102
Target Start/End: Original strand, 12045 - 12149
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatg-ttgtatgaaaatggattgatgaacaattcatgtcaaattcgtg 96  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||  |   |||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||    
T  12045 aaggtaagggggttagttattatcataatcaatttcaaatttttcattt-ctcatggttgtatgaaaatgggttgatgaacaattgatgttaaattcgtg 12143  T
Q  97 ctcttg 102  Q
    ||||||    
T  12144 ctcttg 12149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 268
Target Start/End: Original strand, 22422 - 22602
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttc-aaatatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||  |   ||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||     
T  22422 aaattcgtgctctaaatatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataatttaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaaatatgtataaatgc 22521  T
Q  186 taagttatgagtattgtact-aaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||| ||||||  ||| | || |||||  |||| || | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  22522 taacttatga--attatgctcaaattattgaa-ttgtgctatgttgttgttgaattgagatgtgaatcatgtttaattgatgtt 22602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1666 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1666
Description:

Target: scaffold1666; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 4 - 113
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatg-ttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||| ||  | |||||||||||||||| || |||   |||| |||||||||||||| |||||| |||||  ||||||    
T  4 aaattcgtgctcttgctgtgaggctattttcttgtgcatgaattgatgattatggtatgtttgtgggtgaaattacatgtttcaaagtatgtgtaaatgt 103  T
Q  186 taagttatga 195  Q
    ||||||||||    
T  104 taagttatga 113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8172
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 8172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 63
Target Start/End: Original strand, 13268 - 13333
Alignment:
Q  1 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatgt---aattttgcatttgctcatgttgtatgaaa 63  Q
    |||||||||||||||||||| |||| ||||||||   | |||||||||| ||||||||||||||||    
T  13268 aaggtaagggggttagttatcatcataatcatgttcaatttttgcattttctcatgttgtatgaaa 13333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 195
Target Start/End: Original strand, 104623 - 104732
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgca-tgaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatgt 185  Q
    |||||| ||||||  || ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |   ||||||||||| || || ||||||| |||||| |||||     
T  104623 aaattcatgctctaactatgatgatatgtttgtatgcattaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcaggttcaaagtatgtataaatgc 104722  T
Q  186 taagttatga 195  Q
    ||| ||||||    
T  104723 taacttatga 104732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1272 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold1272
Description:

Target: scaffold1272; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 523 - 456
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||| ||   |||||||||||||| ||||||||||    
T  523 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattatattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0406 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0406
Description:

Target: scaffold0406; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 14283 - 14200
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |  |||| |||||||||| ||||||||    
T  14283 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattattgctggtgaaattgcatgttca 14200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 106 - 172
Target Start/End: Original strand, 2334 - 2401
Alignment:
Q  106 tgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  2334 tgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttcaaa 2401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 22246 - 22163
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||  |  ||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  22246 aaattcgtgctcttgctatgatgttatgtttgagtatatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 22163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 88 - 170
Target Start/End: Complemental strand, 108256 - 108173
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttca 170  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||  | |||| ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||    
T  108256 aaattcgtgctcttgttatgatgttatgtttgagtacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 108173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 221 - 268
Target Start/End: Original strand, 197386 - 197433
Alignment:
Q  221 tcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgtt 268  Q
    ||||| ||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  197386 tcctatgttgttgttgaattgtgatgagattcatgttcaattgatgtt 197433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0409
Description:

Target: scaffold0409; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Original strand, 1348 - 1446
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 184  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  1348 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 1446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0409; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 88 - 184
Target Start/End: Original strand, 9603 - 9701
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcat-gaattgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa-tatgtaaaaatg 184  Q
    |||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||  ||||| ||||||||| |   |||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||||||    
T  9603 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcataaaattggtgataattggattgttgttggtgaaattgcatggtcaaagtatgtgaaaatg 9701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 89 - 142
Target Start/End: Complemental strand, 10908 - 10854
Alignment:
Q  89 aattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatg-aattgatgataattg 142  Q
    ||||||||||||  || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10908 aattcgtgctctatctatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattg 10854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0700 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0700
Description:

Target: scaffold0700; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 88 - 172
Target Start/End: Complemental strand, 2772 - 2687
Alignment:
Q  88 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||   | ||||| |||||||| ||||||||| ||| ||||||||| |   |||||||||||||| ||||||||||    
T  2772 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttggatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcaaa 2687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 112 - 172
Target Start/End: Original strand, 22453 - 22514
Alignment:
Q  112 tatgtttgtatgcatgaa-ttgatgataattgtacaattgttggtgaaattacatgttcaaa 172  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |   ||||||||||| || ||||||||||    
T  22453 tatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttcaaa 22514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University