View Alignment
This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.
| Legend |
| | Query |
| | Query hiting target |
| Query hiting target's complemental strand |
| | Query's complemental strand hiting target |
| Query's complemental strand hiting target's complemental strand |
|
Alignment Overview
Query: NF15608_high_1 (Length: 633)
Name: NF15608_high_1
Description: NF15608
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)
| [»] NF15608_high_1 |
 | |
|
| [»] scaffold0491 (2 HSPs) |
| | |
|
Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 513; Significance: 0; HSPs: 14)
Name: chr7
Description:
Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 513; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 1541238 - 1541790
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541238 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagaaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcagacacact |
1541337 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541338 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcaatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
1541437 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541438 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
1541537 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541538 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
1541637 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541638 |
ctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaacctttccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
1541737 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1541738 |
ccggttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
1541790 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 452; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 614
Target Start/End: Complemental strand, 1604776 - 1604237
Alignment:
| Q |
75 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||| |
|
|
| T |
1604776 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaattatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcacaaacactag |
1604677 |
T |
|
| Q |
175 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
274 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604676 |
cctgccactcatagtttagcaatatattgctactagatacatctctatgcatgattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
1604577 |
T |
|
| Q |
275 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
374 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604576 |
tcctttaatagtgttaaccctttttctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgatag |
1604477 |
T |
|
| Q |
375 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactat |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1604476 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattttcacttcatttttgaaactct |
1604377 |
T |
|
| Q |
475 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1604376 |
catcaaaagatggaacctcttcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
1604277 |
T |
|
| Q |
575 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgct |
614 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |
|
|
| T |
1604276 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcgaagtcttccgttgct |
1604237 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 447; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 1106389 - 1105839
Alignment:
| Q |
75 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
174 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
1106389 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcagcgacactgg |
1106290 |
T |
|
| Q |
175 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
274 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1106289 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctactagatacatctctatgcacgattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
1106190 |
T |
|
| Q |
275 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
374 |
Q |
| |
|
|||||||| |||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||| |||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1106189 |
tcctttaatagtgttaacccttgttctccaattgaattccacggcttctacatcatcatacaagatagagaacaggcttcctttctccatgtactgatag |
1106090 |
T |
|
| Q |
375 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactat |
474 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |
|
|
| T |
1106089 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttttgaaactct |
1105990 |
T |
|
| Q |
475 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
574 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1105989 |
catcaaaagatggaacctcgacttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
1105890 |
T |
|
| Q |
575 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1105889 |
agttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttccgttgctttgattatgtc |
1105839 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 441; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 1089042 - 1088490
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||| |
|
|
| T |
1089042 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtccgcgacact |
1088943 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
1088942 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcggtgcaatcaggatgaagataagatagagcaaatgca |
1088843 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1088842 |
actcctttaacagtgttaaccctttttctccaattgaattccacagcttctacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
1088743 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1088742 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtttgtgctttatttctgataatattctcacttcatttttgaaact |
1088643 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1088642 |
ctcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttctatatgct |
1088543 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
1088542 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcctctgttgctttaataatgtc |
1088490 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 436; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 1596447 - 1595896
Alignment:
| Q |
74 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
1596447 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgatttgatgaatcatattgaaggagtcgggatgtgccaaagtcacaaacacta |
1596348 |
T |
|
| Q |
174 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
273 |
Q |
| |
|
|| ||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1596347 |
gcatgccattcagagtttagtaagatattgctactagatacatctctatgcactattggagtagtgcattcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
1596248 |
T |
|
| Q |
274 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
373 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| |||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1596247 |
ttcctttaacagtgttaacccttgttctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaacaggcttcctttctccatgtactgata |
1596148 |
T |
|
| Q |
374 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaacta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
1596147 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttttgaaactc |
1596048 |
T |
|
| Q |
474 |
tcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1596047 |
tcatcaaaagatggaacctcggcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaacctttccacttggtaattgtgccctgtaaacacttccatatgctc |
1595948 |
T |
|
| Q |
574 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1595947 |
ccgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgattatgtc |
1595896 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 625
Target Start/End: Original strand, 1550473 - 1551024
Alignment:
| Q |
74 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
173 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
1550473 |
taatttaccgggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggaatcgagctgtgccaaagtcagagacacta |
1550572 |
T |
|
| Q |
174 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
273 |
Q |
| |
|
|||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550573 |
gccttccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtacaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
1550672 |
T |
|
| Q |
274 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
373 |
Q |
| |
|
||||||||||||| | | |||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
1550673 |
ttcctttaacagtgctaatcctttttctccaattgaattccacagcttctacatcgtcatacaagacagtgaacaagcttcctctctccatgtactgata |
1550772 |
T |
|
| Q |
374 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaacta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550773 |
gatcaaaaacatgattctcttgtgcaagcagaatccatgaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgtcaatattctcacttcatttctgaaactc |
1550872 |
T |
|
| Q |
474 |
tcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
573 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1550873 |
tcatcaaaagatggaacgtctgcttcatagccatgaagtttctttaaggcgacaaccttgccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
1550972 |
T |
|
| Q |
574 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
1550973 |
cggttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttaataatgtc |
1551024 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 428; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 625
Target Start/End: Original strand, 1557183 - 1557734
Alignment:
| Q |
74 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
173 |
Q |
| |
|
||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||| |
|
|
| T |
1557183 |
taatttaccaggagcaatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccaaagtcacaaacacta |
1557282 |
T |
|
| Q |
174 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
273 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| | || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |
|
|
| T |
1557283 |
gcctgccactcagagttaacaaatatattgctactagatacatctctatgcactattggagcattgcaatcatgatgaagataagatagagcaaatgcaa |
1557382 |
T |
|
| Q |
274 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
373 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557383 |
ctcctttaacagtgttaaccctttttctccaattgaattccacagcttccacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgata |
1557482 |
T |
|
| Q |
374 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaacta |
473 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557483 |
tatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacgatatgtttgtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactc |
1557582 |
T |
|
| Q |
474 |
tcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
573 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557583 |
tcatcaaaagatggaacctcagcttcatagccgtgaagtttctttaaagcaacaacattaccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
1557682 |
T |
|
| Q |
574 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1557683 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
1557734 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 2321582 - 2321032
Alignment:
| Q |
75 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
174 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2321582 |
aatttaccaggagctatatatccaatggttccagcaactatagttcggtttgatgaatcatattgaaggagtcgagctgttccaaagtcagaaacactag |
2321483 |
T |
|
| Q |
175 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
274 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||| ||||| |
|
|
| T |
2321482 |
gatgccactcagagtttagcaagatattgctggtagatacatctctgtgcactattggaggggtacaatcatgatgaagatatgataggccaaaggcaac |
2321383 |
T |
|
| Q |
275 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
374 |
Q |
| |
|
||||||||| || | |||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| || ||| |
|
|
| T |
2321382 |
ccctttaacaacattaagcctttttctccaattgaattccatggcctctgcatcatcatacaagacggagaacaaacttcctctctccatgtaatggtag |
2321283 |
T |
|
| Q |
375 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactat |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |
|
|
| T |
2321282 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatttcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctaaaacttt |
2321183 |
T |
|
| Q |
475 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
574 |
Q |
| |
|
||||||||| ||| | |||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2321182 |
catcaaaagctggcagctctgcttcatagccgtgaagtttcttcaaggcaacaacttttccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
2321083 |
T |
|
| Q |
575 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||| | |||||||| |
|
|
| T |
2321082 |
tgttccaatgcaatatctaatgtcaaaatcttccgttgctctaatgatgtc |
2321032 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 339; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 2330080 - 2329530
Alignment:
| Q |
75 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
174 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2330080 |
aatttacctggagctatatatccaattgttccaacaactatagttcgattcgatgaatcatattgaaggagtcgagatgtgccaaagtcagaaacactag |
2329981 |
T |
|
| Q |
175 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
274 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
2329980 |
gcttccactcagagtttagcaagatattgcccgtagatacatctctatgcacaatggcaggggtgcaatcatgatgaagatatgatagaccaaatgcaac |
2329881 |
T |
|
| Q |
275 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
374 |
Q |
| |
|
||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2329880 |
acctttaataacattaaccctttttctccaattgaattccacggcttcaccttcatcatacaagacagagaacaagctacctttctccatgtactcgtag |
2329781 |
T |
|
| Q |
375 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactat |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2329780 |
atcaaaaacatgattcttctgtggagacagaatccataaagcttcacgatatgccggtgctttatatctgataatattctcacttcatttctgaaactct |
2329681 |
T |
|
| Q |
475 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2329680 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttattgcaacaacttttccacatggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
2329581 |
T |
|
| Q |
575 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
2329580 |
tgttccaatacaatatctaatgtcaaagtcttctgttgctttaatgatgtc |
2329530 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 327; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 75 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 2337979 - 2337429
Alignment:
| Q |
75 |
aatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacactag |
174 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||| |
|
|
| T |
2337979 |
aatttacctggagctatatatccaattgttccaacaactatagttcgatttgatgaatcatattgaaggattcgagatgtgccaaagtcagaaacactag |
2337880 |
T |
|
| Q |
175 |
cctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaac |
274 |
Q |
| |
|
|| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || | || ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |
|
|
| T |
2337879 |
gcttccactccgagtttagcaagatattgccagtagatacatctctatgcacaatggcaggggtgcaatcatgatgaagatatgatagaccaaatgcaac |
2337780 |
T |
|
| Q |
275 |
tcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatag |
374 |
Q |
| |
|
||||||| | || |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||| | ||| |
|
|
| T |
2337779 |
acctttaataacattaaccctttttctccaattgaattccacggcttcaacttcatcatacaagccagagaacaagctacctttctccatgtactcgtag |
2337680 |
T |
|
| Q |
375 |
atcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactat |
474 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||| |||| | || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| | |
|
|
| T |
2337679 |
atcaaaaacatgattcttctgtggagacagaatccataaagcttcacgatatgtcggtgctttatatctgataatattttcacttcatttctgaaactct |
2337580 |
T |
|
| Q |
475 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcc |
574 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
2337579 |
catcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttattgcaacaacttttccacatggtaattgtgccttataaacacttccatatgctcc |
2337480 |
T |
|
| Q |
575 |
tgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
2337479 |
tgtcccaatgcaatatctaatgtcaaagtcttctgttgctttaataatgtc |
2337429 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 74 - 625
Target Start/End: Original strand, 3955231 - 3955782
Alignment:
| Q |
74 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3955231 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccaccaactattgtttgattagatgaatcatattgaaggagtcgagctatgccaaagtcagaaacacta |
3955330 |
T |
|
| Q |
174 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
273 |
Q |
| |
|
| |||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
3955331 |
ggctgccattctgagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagaggtgaaatcatgatgaagatatgatagagcagatgcaa |
3955430 |
T |
|
| Q |
274 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgata |
373 |
Q |
| |
|
||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||| | |||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||| || ||||| |
|
|
| T |
3955431 |
ctcctttaatggtgttaacccttttcctccaatcgaattttatggcttcgacatcatcatgcaagacggagaacaagcttcctttttccatatactgata |
3955530 |
T |
|
| Q |
374 |
gatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaacta |
473 |
Q |
| |
|
|||||||||||| | |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
3955531 |
gatcaaaaacataactcttttatgcaaacaaaatccataaagcttcacaatatttctgtgctttatttctgataatattttcacttcatttctaaaactt |
3955630 |
T |
|
| Q |
474 |
tcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
573 |
Q |
| |
|
||||||| |||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
3955631 |
tcatcaagagatggcacctctgcttcgtagctatgaagtttttttagtgcaacaaatttaccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctc |
3955730 |
T |
|
| Q |
574 |
ctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|| |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| | |||||||| |
|
|
| T |
3955731 |
cttttccaatgcaatatttaatgtcaaagtcttttgttgctctaatgatgtc |
3955782 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 74 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 3852893 - 3852663
Alignment:
| Q |
74 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacacta |
173 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |
|
|
| T |
3852893 |
taatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactattgttcgattggatgaatcacattgaaggagtcgagctataccaaagtcagaaacacta |
3852794 |
T |
|
| Q |
174 |
gcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgcaa |
273 |
Q |
| |
|
| |||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |
|
|
| T |
3852793 |
ggctgccattccgagtttagaaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggaaaggtgaaatcatgatgaagatatgatagagcagatgcaa |
3852694 |
T |
|
| Q |
274 |
ctcctttaacagtgttgacccttttcctcca |
304 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||| | |||||| ||||| |
|
|
| T |
3852693 |
ctcctttaacaatgttaatcctttttctcca |
3852663 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 148; E-Value: 9e-78
Query Start/End: Original strand, 294 - 625
Target Start/End: Original strand, 9532045 - 9532375
Alignment:
| Q |
294 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
393 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||| || |||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
9532045 |
ctttttctccaattgaattccacaacttctacatcatcatacaaaaacgagaacaaacttcctttctc-acgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
9532143 |
T |
|
| Q |
394 |
tgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctc |
493 |
Q |
| |
|
||| ||| || |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||| |
|
|
| T |
9532144 |
tgtacaatcataatccataaagcttaacaatatttatgtgatttattttttataatattctcgcttcatttttgaaactcgcatcaaaagatggcacctc |
9532243 |
T |
|
| Q |
494 |
tgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
593 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||| ||| ||||||||| | |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
9532244 |
tgcttcatagatgtgaagtttctttaaggcgacaactttgtcacatggtaattgagtcttgtatacacttccatatgctcctgtccatatgcaatatcta |
9532343 |
T |
|
| Q |
594 |
atgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||| || | ||||||| || ||||| |
|
|
| T |
9532344 |
atgtcaaagtgttgtattgctttaataatgtc |
9532375 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 109; E-Value: 2e-54
Query Start/End: Original strand, 294 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 30792477 - 30792145
Alignment:
| Q |
294 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
393 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| |||| |||||| | |||| | |||||||||||||||||||| |||||||| |
|
|
| T |
30792477 |
ctttttctccaattgaatttcacaacttctacatcatcatacaaaacaaagaactagcttcttttctctacgtattgatagatcaaaaacacgattcttt |
30792378 |
T |
|
| Q |
394 |
t-gtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacct |
492 |
Q |
| |
|
| ||||||||| |||| ||||||||| ||||||| | ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||| || | |
|
|
| T |
30792377 |
ttgtgcaagcagaatctataaagcttaacaatatttatgtgctttatttatgataatattctcacttcatttatgaaacttgtaacaaaagatgacacat |
30792278 |
T |
|
| Q |
493 |
ctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatct |
592 |
Q |
| |
|
|| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||| || ||| || | |||||| |||||| ||| | ||| ||| | ||| ||||||| |
|
|
| T |
30792277 |
ttgtttcatagttgtgaagtttctataaggcaacaactttgccacatgataaatgagtcttgtatacactttcatgtcctcatgtctcgatgtaatatct |
30792178 |
T |
|
| Q |
593 |
catgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
30792177 |
aatgtcaaagtgttatgttgctttaataatgtc |
30792145 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0491 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0491
Description:
Target: scaffold0491; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 888 - 1440
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
888 |
ttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagctatgccgaagtcacaaacact |
987 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
988 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaaaagcaaatgca |
1087 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
1088 |
actcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
1187 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1188 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
1287 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1288 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
1387 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
1388 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
1440 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: scaffold0491; HSP #2
Raw Score: 449; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 5775 - 6327
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
5775 |
ttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccgaagtcacaaacact |
5874 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
5875 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
5974 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
5975 |
actcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaattgcagggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctatccatgtattgat |
6074 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6075 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaaaccataaagcttcacgatatgtttgtgctttatttctgttaaaattctcacttcatttctgaaact |
6174 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
6175 |
ctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
6274 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
6275 |
cctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtc |
6327 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8 (Bit Score: 485; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: chr8
Description:
Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 18739009 - 18739561
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
18739009 |
ttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagctatgccgaagtcacaaacact |
18739108 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18739109 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaaaagcaaatgca |
18739208 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739209 |
actcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
18739308 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739309 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
18739408 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739409 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
18739508 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18739509 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
18739561 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 485; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 18743973 - 18744525
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
18743973 |
ttaatttacctggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagccgagctatgccgaagtcacaaacact |
18744072 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
18744073 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaaaagcaaatgca |
18744172 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |
|
|
| T |
18744173 |
actcctttaatagtgttaacccttttcctccacttgaattccacgacttttacatcatcatacaagacagagaacaagcttcctttctccatgtattgat |
18744272 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18744273 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
18744372 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18744373 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
18744472 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18744473 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
18744525 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 461; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 18748934 - 18749486
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
18748934 |
ttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccgaagtcacaaacact |
18749033 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18749034 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
18749133 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18749134 |
actcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaattccatggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctatccatgtattgat |
18749233 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18749234 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcacaatatgtttgtgctttatttctgttaaaattctcacttcatttctgaaact |
18749333 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18749334 |
ctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
18749433 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18749434 |
cctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtc |
18749486 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 453; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 73 - 625
Target Start/End: Original strand, 18723282 - 18723834
Alignment:
| Q |
73 |
ttaatttaccaggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagcagtgccaaagtcagacacact |
172 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| | ||||| |
|
|
| T |
18723282 |
ttaatttacccggagctatatatccaatagttccagcaactatagttcgattggatgaatcatattgaaggagtcgagctgtgccgaagtcacaaacact |
18723381 |
T |
|
| Q |
173 |
agcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctctatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
272 |
Q |
| |
|
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723382 |
ggcctgccactcagagtttagcaagatattgctagtagatacatctcgatgcactattggagcagtgcaatcatgatgaagatatgaaagagcaaatgca |
18723481 |
T |
|
| Q |
273 |
actcctttaacagtgttgacccttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgat |
372 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||| || ||||| ||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |
|
|
| T |
18723482 |
actcctttaatagtgttaactctttttctccacttgaatttcatggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctatccatgtattgat |
18723581 |
T |
|
| Q |
373 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaact |
472 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723582 |
agatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcagaatccataaagcttcactatatgtttgtgctttatttctgttaaaattctcacttcatttctgaaact |
18723681 |
T |
|
| Q |
473 |
atcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
18723682 |
ctcatcaaaagatggaacctctgcttcatagccgtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
18723781 |
T |
|
| Q |
573 |
cctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |
|
|
| T |
18723782 |
cctgttccaatacaatatctcatgtcaaagtcttctgtcgctttgattatgtc |
18723834 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000004
Query Start/End: Original strand, 434 - 483
Target Start/End: Original strand, 18732996 - 18733045
Alignment:
| Q |
434 |
ctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaag |
483 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||| |
|
|
| T |
18732996 |
ctttatttctgataatattctcacttcatttctaaaactctaatcaaaag |
18733045 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1 (Bit Score: 132; Significance: 3e-68; HSPs: 2)
Name: chr1
Description:
Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 3e-68
Query Start/End: Original strand, 294 - 625
Target Start/End: Complemental strand, 19250577 - 19250247
Alignment:
| Q |
294 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
393 |
Q |
| |
|
||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||||| ||||||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
19250577 |
ctttttctccaattgaattccacaacttctacatcatcatacaaaaccgagaacaagcttcatttttc-atgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
19250479 |
T |
|
| Q |
394 |
tgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctc |
493 |
Q |
| |
|
|||||||||| |||||||||||||| ||||||| | ||| ||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||| || || || |
|
|
| T |
19250478 |
tgtgcaagcagaatccataaagcttaacaatatttatgtgttttatatatgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaagacggcacatc |
19250379 |
T |
|
| Q |
494 |
tgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
593 |
Q |
| |
|
| |||||||| ||||| ||||||||| || ||||| || |||| ||||||| | | |||||| |||||| |||||| |||||| ||||||||||| |
|
|
| T |
19250378 |
tacttcatagttgtgaaatttctttaaagcgacaactttaccacatggtaatcgagtcttgtatacactttcatatgatcctgtcatgatgcaatatcta |
19250279 |
T |
|
| Q |
594 |
atgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtc |
625 |
Q |
| |
|
|||||||||| || ||||||||| || ||||| |
|
|
| T |
19250278 |
atgtcaaagtgttgtgttgctttaataatgtc |
19250247 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 114; E-Value: 2e-57
Query Start/End: Original strand, 306 - 603
Target Start/End: Original strand, 41668796 - 41669093
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
41668796 |
ttgaattccacagcttctaaatcctcatacaaaactgagaacaaactttcttttttcatgtatcgatagattaaaaacattattcttttgtgcaagcaaa |
41668895 |
T |
|
| Q |
406 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcg |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| | |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
41668896 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttattttttataatattttcacttcaattctgaaactcacatcaaaagatgacacatctgcttcatagtt |
41668995 |
T |
|
| Q |
506 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
41668996 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
41669093 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4 (Bit Score: 123; Significance: 7e-63; HSPs: 4)
Name: chr4
Description:
Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 7e-63
Query Start/End: Original strand, 309 - 603
Target Start/End: Original strand, 42977725 - 42978019
Alignment:
| Q |
309 |
aattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
408 |
Q |
| |
|
|||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
42977725 |
aattccacagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
42977824 |
T |
|
| Q |
409 |
cataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtg |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || |||||||||||| ||| |
|
|
| T |
42977825 |
cataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaattcgcatcaaaagatgacacatctgcttcatagttgtg |
42977924 |
T |
|
| Q |
509 |
aagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
42977925 |
aagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
42978019 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 294 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 54123093 - 54122784
Alignment:
| Q |
294 |
cttttcctccacttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttt |
393 |
Q |
| |
|
|||||||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||| |
|
|
| T |
54123093 |
cttttcctgcaattgaattccacatcttctaaatccgcatacaaaactgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttt |
54122994 |
T |
|
| Q |
394 |
tgtgcaagcaaaatccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctc |
493 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| ||||||||| | |||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||| || || |
|
|
| T |
54122993 |
tgtgcaagcaaaatatataaagcttaaagatatttatctgctttattttttataatattctcacttcaattgtgaaactcacatcaaaagatgacacatc |
54122894 |
T |
|
| Q |
494 |
tgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctc |
593 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |
|
|
| T |
54122893 |
tgcttcatagttgtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatcta |
54122794 |
T |
|
| Q |
594 |
atgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
|||||||||| |
|
|
| T |
54122793 |
atgtcaaagt |
54122784 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 306 - 603
Target Start/End: Original strand, 48712381 - 48712677
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
48712381 |
ttgaattccacaacttctaaatcctcatacaaaatcgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattgaaaatatgattcttttgtgcaagcaaa |
48712480 |
T |
|
| Q |
406 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcg |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | || ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||| | || ||||||| |||| |
|
|
| T |
48712481 |
atccataaagcttaacaatatttatctg-tttatttttgataatattctcacttcaattctgaaaatcgcatcaaaagaagacacatctgcttaatagtt |
48712579 |
T |
|
| Q |
506 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
48712580 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
48712677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 431 - 627
Target Start/End: Complemental strand, 16880331 - 16880134
Alignment:
| Q |
431 |
gtgctttatttctgataatattctcac-ttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtgaagtttctttaaggcaacaac |
529 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || | | |||||||| ||||| |||||||||||| |||| |
|
|
| T |
16880331 |
gtgctttatttctgataatattctcacattcatttctgaaactcgcatcaaaagatgacacttttacttcatagttgtgaaatttctttaaggcggcaac |
16880232 |
T |
|
| Q |
530 |
cttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagtcttctgttgctttgatgatgtcca |
627 |
Q |
| |
|
|||| | ||||||| | | |||||| |||||||||||||||| ||| || ||||||||||| |||||||||| || |||| |||| || ||||||| |
|
|
| T |
16880231 |
tttgcaagatggtaatcgagtcttgtatacacttccatatgctcttgtgccgatgcaatatctaatgtcaaagtgttgtgtttctttaataatgtcca |
16880134 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5 (Bit Score: 113; Significance: 7e-57; HSPs: 3)
Name: chr5
Description:
Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 113; E-Value: 7e-57
Query Start/End: Original strand, 306 - 572
Target Start/End: Complemental strand, 36620768 - 36620505
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| |||| | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
36620768 |
ttgaattccacagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttctcttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
36620669 |
T |
|
| Q |
406 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcg |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
36620668 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaagat---acatctgcttaatagtt |
36620572 |
T |
|
| Q |
506 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
36620571 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtataaacttccatatgct |
36620505 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 306 - 603
Target Start/End: Original strand, 8873042 - 8873340
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
8873042 |
ttgaattccacatcttctaaatcctcatacaaaatcgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
8873141 |
T |
|
| Q |
406 |
a-tccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagc |
504 |
Q |
| |
|
| |||||||||||| | ||||| | |||||||||| | ||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||| || |||||||||||| |
|
|
| T |
8873142 |
aatccataaagcttaataatatttatctgctttattttttataatattctcacttcaattctgaaactggcatcaaacgatgacacatctgcttcatagt |
8873241 |
T |
|
| Q |
505 |
ggtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| ||||||||||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
8873242 |
tgtgaagtttctttaaggtcgcaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
8873340 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 95; E-Value: 4e-46
Query Start/End: Original strand, 306 - 572
Target Start/End: Original strand, 39102236 - 39102501
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||||| |||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| |||| | |||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||| |
|
|
| T |
39102236 |
ttgaattccacaacttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttctcttttcatgtattgatatattaaaaacatgcttcttttgtgcaagcaaa |
39102335 |
T |
|
| Q |
406 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcg |
505 |
Q |
| |
|
||||||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||| |
|
|
| T |
39102336 |
atccataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctaaaactcgcatcaaaagatgacacatctgcttaatagtt |
39102435 |
T |
|
| Q |
506 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgct |
572 |
Q |
| |
|
|||||| |||||||||| ||| ||||||| || |||||| | |||||| | ||||||||||||| |
|
|
| T |
39102436 |
gtgaag-ttctttaaggaggcaaatttgccacatgataattgagtcttgtataaacttccatatgct |
39102501 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr3 (Bit Score: 103; Significance: 6e-51; HSPs: 1)
Name: chr3
Description:
Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 6e-51
Query Start/End: Original strand, 309 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 31658177 - 31657883
Alignment:
| Q |
309 |
aattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
408 |
Q |
| |
|
||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |
|
|
| T |
31658177 |
aattctacagcttctaaatcctcatataaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaaatc |
31658078 |
T |
|
| Q |
409 |
cataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcggtg |
508 |
Q |
| |
|
|||||||||| ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||| ||| ||| ||| |
|
|
| T |
31658077 |
cataaagcttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaattcgcatcaaaagatgacacatctatttcgtagttgtg |
31657978 |
T |
|
| Q |
509 |
aagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
|||||||||||||| |||| ||||||| || |||||| | |||||| |||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
31657977 |
aagtttctttaaggtgacaaatttgccacatgataattgagtcttgtatacacttccatgtgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
31657883 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
Target: chr6 (Bit Score: 98; Significance: 6e-48; HSPs: 1)
Name: chr6
Description:
Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 6e-48
Query Start/End: Original strand, 306 - 603
Target Start/End: Complemental strand, 1257974 - 1257677
Alignment:
| Q |
306 |
ttgaattccacggcttctacatcatcatacaagacagagaataagcttcctctctccatgtattgatagatcaaaaacatgattcttttgtgcaagcaaa |
405 |
Q |
| |
|
||||||||| | ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||| || | | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |
|
|
| T |
1257974 |
ttgaattcctcagcttctaaatcctcatacaaaaccgagaacaaactttcttttttcatgtattgatagattaaaaacatgattcttttgtgcaaacaaa |
1257875 |
T |
|
| Q |
406 |
atccataaagcttcacaatatgtcggtgctttatttctgataatattctcacttcatttctgaaactatcatcaaaagatggaacctctgcttcatagcg |
505 |
Q |
| |
|
|| ||||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||| || ||||||||||| |
|
|
| T |
1257874 |
attcataaagtttaacaatatttatctgctttatttttgataatattctcacttcaattctgaaactcgcatcaaaaaatgacacatctgcttcatattt |
1257775 |
T |
|
| Q |
506 |
gtgaagtttctttaaggcaacaaccttgccacttggtaattgtgccttgtaaacacttccatatgctcctgttccaatgcaatatctcatgtcaaagt |
603 |
Q |
| |
|
||||||||||||||||| ||| | ||||| || |||||| | |||||| |||||| |||||||| ||| | ||||||||||| |||||||||| |
|
|
| T |
1257774 |
gtgaagtttctttaaggtggcaaattggccacatgataattgagtcttgtatacactttcatatgcttatgtcacgatgcaatatctaatgtcaaagt |
1257677 |
T |
|
Back To:
[ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]
© Oklahoma State University