View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15611_high_10 (Length: 402)

Name: NF15611_high_10
Description: NF15611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15611_high_10
NF15611_high_10
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (20-377)||(3094-3453)
scaffold0159 (20-216)||(17949-18147)
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (20-377)||(27284224-27284581)
chr6 (20-359)||(13518056-13518395)
chr6 (20-377)||(29555537-29555894)
chr6 (20-376)||(27623569-27623927)
chr6 (20-360)||(4763759-4764099)
chr6 (20-377)||(8899561-8899918)
chr6 (20-361)||(16755815-16756157)
chr6 (20-361)||(27063477-27063817)
chr6 (20-377)||(27355973-27356330)
chr6 (20-360)||(28166490-28166831)
chr6 (28-377)||(26110281-26110629)
chr6 (20-377)||(34458370-34458725)
chr6 (20-359)||(27491130-27491469)
chr6 (20-359)||(16680136-16680476)
chr6 (28-361)||(26791811-26792144)
chr6 (20-377)||(33370293-33370650)
chr6 (20-377)||(22928743-22929102)
chr6 (21-377)||(27200165-27200522)
chr6 (21-377)||(27248711-27249068)
chr6 (28-377)||(26772499-26772847)
chr6 (20-360)||(29507412-29507754)
chr6 (28-377)||(4539628-4539978)
chr6 (28-353)||(29579018-29579342)
chr6 (28-366)||(30551870-30552208)
chr6 (28-377)||(28213433-28213783)
chr6 (34-360)||(4778876-4779203)
chr6 (34-377)||(4531267-4531609)
chr6 (50-361)||(26926763-26927073)
chr6 (38-353)||(13292831-13293140)
chr6 (28-338)||(16937895-16938204)
chr6 (20-361)||(27013728-27014062)
chr6 (20-361)||(14139262-14139597)
chr6 (34-360)||(27031019-27031342)
chr6 (28-275)||(26666528-26666774)
chr6 (20-361)||(27208899-27209236)
chr6 (20-361)||(27239992-27240329)
chr6 (34-361)||(24869705-24870026)
chr6 (37-360)||(27025141-27025460)
chr6 (34-360)||(24299636-24299957)
chr6 (28-360)||(15406403-15406731)
chr6 (28-360)||(15418190-15418518)
chr6 (34-359)||(20174545-20174881)
chr6 (34-359)||(22161110-22161446)
chr6 (283-377)||(23851453-23851547)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (20-365)||(3795539-3795885)
chr5 (20-359)||(33881133-33881472)
chr5 (20-359)||(18369347-18369686)
chr5 (20-360)||(30174471-30174812)
chr5 (20-353)||(11555367-11555699)
chr5 (28-361)||(37746151-37746484)
chr5 (20-360)||(40467368-40467708)
chr5 (20-361)||(9544522-9544864)
chr5 (20-361)||(37760987-37761329)
chr5 (20-354)||(18494583-18494916)
chr5 (20-377)||(22894405-22894761)
chr5 (20-360)||(13180608-13180944)
chr5 (20-361)||(28655247-28655589)
chr5 (28-360)||(13318651-13318982)
chr5 (34-366)||(6880303-6880636)
chr5 (28-359)||(24729977-24730308)
chr5 (28-377)||(37352467-37352816)
chr5 (20-354)||(43084270-43084604)
chr5 (28-377)||(9323466-9323814)
chr5 (28-361)||(30035431-30035763)
chr5 (34-377)||(28953609-28953952)
chr5 (20-359)||(11329644-11329985)
chr5 (28-377)||(12138165-12138513)
chr5 (28-377)||(31820233-31820580)
chr5 (34-361)||(37665315-37665642)
chr5 (28-359)||(8659295-8659625)
chr5 (34-377)||(33298522-33298869)
chr5 (34-360)||(41680710-41681037)
chr5 (20-361)||(13436489-13436836)
chr5 (20-353)||(23631982-23632317)
chr5 (28-352)||(30158048-30158372)
chr5 (20-377)||(32590091-32590447)
chr5 (28-361)||(15752681-15753008)
chr5 (28-366)||(33522382-33522721)
chr5 (20-377)||(2517054-2517412)
chr5 (28-361)||(5643805-5644136)
chr5 (34-361)||(18122245-18122572)
chr5 (20-360)||(34622524-34622865)
chr5 (28-377)||(26486385-26486723)
chr5 (20-361)||(31437469-31437803)
chr5 (20-377)||(25206266-25206630)
chr5 (20-377)||(25270422-25270786)
chr5 (34-361)||(22992953-22993272)
chr5 (34-361)||(15652589-15652914)
chr5 (28-354)||(23897886-23898206)
chr5 (34-361)||(33783492-33783814)
chr5 (34-354)||(24975861-24976175)
chr5 (37-361)||(24608250-24608570)
chr5 (28-360)||(30940642-30940968)
[»] chr3 (57 HSPs)
chr3 (20-377)||(32296574-32296932)
chr3 (20-360)||(5727940-5728281)
chr3 (20-360)||(47029415-47029756)
chr3 (20-360)||(5717030-5717371)
chr3 (20-360)||(5764087-5764428)
chr3 (20-360)||(4422880-4423220)
chr3 (20-338)||(31958413-31958733)
chr3 (20-360)||(4790591-4790932)
chr3 (20-338)||(5603271-5603591)
chr3 (20-338)||(24334157-24334477)
chr3 (20-366)||(4340634-4340980)
chr3 (20-361)||(10402110-10402450)
chr3 (20-360)||(10649033-10649373)
chr3 (20-377)||(29658926-29659283)
chr3 (20-361)||(8217593-8217936)
chr3 (28-377)||(28109917-28110271)
chr3 (34-377)||(4629730-4630072)
chr3 (20-366)||(5590319-5590665)
chr3 (20-361)||(5472949-5473289)
chr3 (20-377)||(48471872-48472233)
chr3 (20-377)||(16422128-16422485)
chr3 (28-360)||(51787984-51788316)
chr3 (20-361)||(20071994-20072337)
chr3 (34-377)||(21680646-21680988)
chr3 (34-361)||(22381553-22381879)
chr3 (28-361)||(22864814-22865145)
chr3 (28-361)||(22879873-22880204)
chr3 (34-377)||(29142726-29143072)
chr3 (20-377)||(18248683-18249040)
chr3 (20-360)||(5019675-5020014)
chr3 (20-361)||(17970824-17971163)
chr3 (20-377)||(28027236-28027591)
chr3 (34-353)||(18286327-18286645)
chr3 (34-353)||(18301628-18301946)
chr3 (20-366)||(17978908-17979255)
chr3 (28-377)||(16618455-16618808)
chr3 (28-338)||(28345155-28345464)
chr3 (20-361)||(6536701-6537042)
chr3 (20-361)||(7079183-7079529)
chr3 (28-360)||(18231155-18231487)
chr3 (20-360)||(11104319-11104660)
chr3 (28-377)||(20570812-20571161)
chr3 (34-360)||(31030217-31030536)
chr3 (34-359)||(18336591-18336910)
chr3 (34-353)||(6207869-6208184)
chr3 (20-360)||(18057222-18057565)
chr3 (28-377)||(19700431-19700792)
chr3 (34-354)||(32445122-32445433)
chr3 (34-353)||(4727602-4727915)
chr3 (34-360)||(15735072-15735393)
chr3 (28-361)||(5658095-5658425)
chr3 (34-353)||(35886733-35887048)
chr3 (28-360)||(4689613-4689939)
chr3 (34-360)||(8283430-8283767)
chr3 (251-361)||(15886894-15887006)
chr3 (275-360)||(8002522-8002607)
chr3 (28-222)||(15886707-15886895)
[»] chr1 (11 HSPs)
chr1 (20-360)||(3647147-3647487)
chr1 (20-360)||(10968666-10969007)
chr1 (28-377)||(51644204-51644555)
chr1 (28-352)||(10951100-10951425)
chr1 (20-361)||(28155726-28156069)
chr1 (28-359)||(28591085-28591415)
chr1 (20-360)||(41787224-41787566)
chr1 (20-377)||(20334330-20334689)
chr1 (20-377)||(16201942-16202307)
chr1 (20-377)||(20466761-20467126)
chr1 (34-377)||(21891691-21892020)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (20-361)||(12034-12374)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (20-361)||(9557-9897)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (20-360)||(20332337-20332678)
chr4 (20-377)||(39856630-39856985)
chr4 (20-360)||(40099551-40099892)
chr4 (20-360)||(27157227-27157569)
chr4 (20-360)||(24586276-24586617)
chr4 (20-359)||(14104554-14104892)
chr4 (20-359)||(30759775-30760112)
chr4 (20-359)||(33667718-33668055)
chr4 (20-361)||(54839400-54839740)
chr4 (28-377)||(18794540-18794889)
chr4 (34-361)||(34182893-34183218)
chr4 (34-361)||(14753423-14753749)
chr4 (20-361)||(5700549-5700890)
chr4 (28-366)||(21975708-21976046)
chr4 (34-361)||(24118672-24118998)
chr4 (28-366)||(31120433-31120772)
chr4 (28-377)||(5011870-5012220)
chr4 (20-377)||(1906245-1906607)
chr4 (34-361)||(36338455-36338774)
chr4 (34-353)||(6575879-6576190)
chr4 (28-377)||(15276552-15276904)
chr4 (20-377)||(15233809-15234170)
chr4 (28-377)||(15380161-15380510)
chr4 (20-353)||(1673877-1674213)
chr4 (34-360)||(14671026-14671349)
chr4 (34-360)||(17019062-17019384)
chr4 (34-280)||(36324246-36324484)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (20-353)||(12661543-12661875)
chr2 (20-360)||(254557-254897)
chr2 (20-360)||(37945770-37946111)
chr2 (20-360)||(27122522-27122860)
chr2 (20-361)||(27809697-27810040)
chr2 (20-338)||(22922048-22922368)
chr2 (28-360)||(13930457-13930791)
chr2 (20-361)||(3788490-3788830)
chr2 (20-361)||(37383673-37384014)
chr2 (20-338)||(39896088-39896405)
chr2 (20-360)||(9343892-9344232)
chr2 (20-360)||(16167475-16167815)
chr2 (20-338)||(19410389-19410709)
chr2 (20-361)||(12592806-12593151)
chr2 (20-360)||(39045727-39046067)
chr2 (20-359)||(34867681-34868019)
chr2 (28-360)||(37931369-37931708)
chr2 (28-361)||(32055798-32056130)
chr2 (28-377)||(12710514-12710863)
chr2 (34-377)||(40239489-40239831)
chr2 (20-361)||(34160840-34161183)
chr2 (28-377)||(27782212-27782561)
chr2 (20-377)||(37679796-37680155)
chr2 (20-377)||(37695061-37695420)
chr2 (28-360)||(31882284-31882615)
chr2 (28-366)||(16823250-16823588)
chr2 (28-366)||(16897892-16898230)
chr2 (20-366)||(21697078-21697427)
chr2 (20-377)||(21671075-21671435)
chr2 (34-377)||(11629104-11629446)
chr2 (20-309)||(31868691-31868979)
chr2 (20-361)||(34297152-34297486)
chr2 (28-377)||(27396303-27396662)
chr2 (28-377)||(19450331-19450689)
chr2 (28-361)||(34268839-34269167)
chr2 (34-361)||(28888275-28888597)
chr2 (34-360)||(23122497-23122818)
chr2 (28-361)||(27428366-27428692)
chr2 (34-360)||(20843909-20844235)
chr2 (20-160)||(23116993-23117133)
chr2 (304-360)||(31887682-31887738)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (20-338)||(4139046-4139366)
chr7 (20-360)||(31558195-31558535)
chr7 (20-361)||(26509496-26509839)
chr7 (20-360)||(26663713-26664054)
chr7 (20-360)||(26678905-26679246)
chr7 (20-371)||(26441238-26441590)
chr7 (20-360)||(26518789-26519127)
chr7 (20-377)||(5141135-5141493)
chr7 (20-366)||(24586336-24586682)
chr7 (20-353)||(5164387-5164720)
chr7 (20-361)||(5154079-5154419)
chr7 (20-377)||(16745321-16745679)
chr7 (17-359)||(45393216-45393558)
chr7 (20-377)||(26268886-26269247)
chr7 (28-360)||(39206948-39207280)
chr7 (23-361)||(45737296-45737636)
chr7 (28-377)||(11446867-11447216)
chr7 (20-353)||(11418580-11418913)
chr7 (28-377)||(16047294-16047640)
chr7 (28-377)||(4205368-4205717)
chr7 (28-377)||(26313658-26314006)
chr7 (28-377)||(31084431-31084781)
chr7 (28-377)||(3451297-3451647)
chr7 (20-363)||(16443804-16444148)
chr7 (20-360)||(2160566-2160908)
chr7 (20-361)||(2779247-2779582)
chr7 (20-361)||(31129900-31130235)
chr7 (28-377)||(10847562-10847915)
chr7 (20-270)||(26595754-26596006)
chr7 (34-361)||(16512255-16512576)
chr7 (28-360)||(10910735-10911061)
chr7 (275-360)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (28-377)||(1639-1988)
scaffold0322 (20-377)||(12028-12396)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (34-360)||(33248365-33248690)
chr8 (20-361)||(9360620-9360960)
chr8 (20-361)||(18796704-18797046)
chr8 (20-366)||(28355827-28356176)
chr8 (28-365)||(29835317-29835653)
chr8 (20-338)||(31483747-31484067)
chr8 (20-360)||(31360527-31360867)
chr8 (20-360)||(44566979-44567322)
chr8 (20-377)||(19680430-19680786)
chr8 (22-361)||(18715478-18715819)
chr8 (20-360)||(15773573-15773913)
chr8 (20-353)||(21342047-21342381)
chr8 (28-361)||(33264729-33265061)
chr8 (28-377)||(12086608-12086958)
chr8 (20-353)||(19911039-19911374)
chr8 (28-377)||(19202260-19202598)
chr8 (101-377)||(16260205-16260480)
chr8 (28-377)||(22074814-22075164)
chr8 (28-361)||(19655232-19655562)
chr8 (34-377)||(27602805-27603141)
chr8 (28-361)||(22138904-22139231)
chr8 (34-360)||(2131159-2131479)
chr8 (34-360)||(19694094-19694416)
chr8 (34-335)||(14569180-14569479)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (20-360)||(18584-18926)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (20-361)||(9912-10252)
scaffold0143 (34-361)||(33295-33619)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (20-361)||(8844-9184)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (20-361)||(4518-4862)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-377)||(13931-14281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (20-377)||(15551-15915)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-377)||(25097-25454)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (34-360)||(6065-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (34-353)||(24835-25150)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (199-377)||(359-537)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (215-377)||(26243-26405)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-145)||(1-126)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (221-353)||(40759-40898)
scaffold0099 (34-80)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: scaffold0159 (Bit Score: 317; Significance: 1e-179; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 317; E-Value: 1e-179
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 3094 - 3453
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3094 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3193  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  3194 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 3293  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3294 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 3393  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 20 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17949
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18147 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 18048  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  18047 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaag 17949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 307; Significance: 1e-173; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 27284224 - 27284581
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27284323  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  27284324 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 27284422  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284423 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27284522  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27284523 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttcagatga 27284581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 13518056 - 13518395
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518056 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 13518155  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 13518255  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518256 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 13518355  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  13518356 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13518395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 283; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 29555894 - 29555537
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  29555894 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaat 29555795  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||    
T  29555794 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagc 29555696  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555695 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 29555596  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555595 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 29555537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 376
Target Start/End: Original strand, 27623569 - 27623927
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27623569 gacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatg 27623668  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaa-tgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27623669 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27623768  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623769 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27623868  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatg 376  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27623869 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4764099 - 4763759
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4764099 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4764000  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4763999 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4763901  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763900 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4763801  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  4763800 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 4763759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 8899561 - 8899918
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899561 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 8899660  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8899661 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 8899759  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899760 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 8899859  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  8899860 acagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 8899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 16756157 - 16755815
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat- 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  16756157 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaata 16756058  T
Q  119 -gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  16756057 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaag 16755959  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755958 ctcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16755859  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16755858 cacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16755815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27063817 - 27063477
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27063817 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 27063718  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  27063717 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 27063620  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27063619 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaac 27063520  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||    
T  27063519 acagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagca 27063477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 27355973 - 27356330
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27355973 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27356072  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27356073 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggc 27356171  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356172 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27356271  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  27356272 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 27356330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 28166831 - 28166490
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28166831 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28166732  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28166731 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaagg 28166633  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166632 ctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28166533  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||    
T  28166532 cacagcaatcattacatttcctggaaactttggattcgcaagc 28166490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 26110281 - 26110629
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26110380  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  26110381 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 26110479  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110480 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26110579  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    
T  26110580 actacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 26110629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 34458370 - 34458725
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  34458370 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 34458468  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  34458469 tttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggct 34458567  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458568 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34458667  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  34458668 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 34458725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 27491469 - 27491130
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  27491469 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27491370  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||    
T  27491369 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagc 27491271  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491270 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 27491171  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    || |||| ||||||| ||| | |||| ||||||||||||||    
T  27491170 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 27491130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 16680476 - 16680136
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680476 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16680377  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| | |    
T  16680376 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaag 16680278  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680277 ctcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16680178  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  16680177 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16680136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26792144 - 26791811
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  26792144 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 26792045  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26792044 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 26791946  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791945 acgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 26791846  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  26791845 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26791811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 33370293 - 33370650
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |    
T  33370293 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaat 33370392  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  33370393 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 33370491  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370492 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 33370591  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  33370592 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 33370650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 22928743 - 22929102
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  22928743 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 22928842  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  22928843 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcatag 22928941  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928942 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22929041  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  22929042 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 22929102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27200522 - 27200165
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27200522 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27200423  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  27200422 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagc 27200325  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27200324 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 27200225  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  27200224 cacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 21 - 377
Target Start/End: Original strand, 27248711 - 27249068
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27248711 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27248810  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||||| | ||    
T  27248811 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aatcaaaagcacaagc 27248908  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27248909 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 27249008  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  27249009 cacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27249068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 26772499 - 26772847
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26772499 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26772598  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  26772599 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 26772696  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772697 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 26772796  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||| | |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    
T  26772797 cactacatttcttagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 26772847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 29507754 - 29507412
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29507754 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 29507655  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||  |||| ||||||||||||||| |     
T  29507654 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaa 29507556  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507555 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 29507456  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  29507455 acacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 29507412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 4539628 - 4539978
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4539628 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 4539727  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagt-agaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  4539728 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 4539826  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  4539827 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 4539926  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
     ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4539927 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4539978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 29579342 - 29579018
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29579342 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgttt 29579243  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  29579242 caagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 29579145  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  29579144 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 29579045  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||    
T  29579044 cattacatttcctggaaactttgaatt 29579018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Original strand, 30551870 - 30552208
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30551870 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 30551969  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  30551970 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 30552068  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30552069 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 30552168  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  30552169 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 30552208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28213783 - 28213433
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  28213783 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 28213684  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  28213683 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 28213585  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28213584 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 28213485  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
     ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  28213484 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 28213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4779203 - 4778876
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4779203 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4779105  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4779104 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatacagcttttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 4779006  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  4779005 taagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 4778906  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  4778905 acatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4531609 - 4531267
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4531609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4531511  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4531510 ttgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 4531412  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    |||||||||| ||||||||||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  4531411 aagagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 4531312  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||  |||| || ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4531311 atttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4531267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 50 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 26927073 - 26926763
Alignment:
Q  50 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26927073 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 26926974  T
Q  149 agaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagc 248  Q
    |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26926973 agaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagc 26926876  T
Q  249 cgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaatttt 348  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| |||    
T  26926875 cgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaacttt 26926776  T
Q  349 gaattcacaagca 361  Q
    |||||| ||||||    
T  26926775 gaattcgcaagca 26926763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 38 - 353
Target Start/End: Original strand, 13292831 - 13293140
Alignment:
Q  38 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtc 137  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  13292831 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatc 13292925  T
Q  138 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagag 237  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  13292926 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagag 13293024  T
Q  238 tggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttc 337  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  13293025 tggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttc 13293124  T
Q  338 ctggaaattttgaatt 353  Q
    || |||| ||||||||    
T  13293125 ctagaaactttgaatt 13293140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Original strand, 16937895 - 16938204
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  16937895 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 16937994  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  16937995 caagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 16938092  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938093 atgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 16938192  T
Q  327 cactacatttcc 338  Q
    || |||||||||    
T  16938193 cattacatttcc 16938204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27014062 - 27013728
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  27014062 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 27013969  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  27013968 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 27013870  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013869 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27013770  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27013769 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 27013728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 14139262 - 14139597
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  14139262 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 14139356  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  14139357 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 14139455  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139456 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 14139555  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  14139556 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 14139597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27031342 - 27031019
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |    |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27031342 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27031248  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| ||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27031247 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 27031149  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |    
T  27031148 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcatt 27031049  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  27031048 acatttcctagaaactttgaattcacaagc 27031019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 275
Target Start/End: Original strand, 26666528 - 26666774
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  26666528 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26666627  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  26666628 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 26666725  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaa 275  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||    
T  26666726 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27209236 - 27208899
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| |||    
T  27209236 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27209145  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  27209144 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcac 27209046  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27209045 acgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacatt 27208946  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27208945 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27208899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 27239992 - 27240329
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| |||    
T  27239992 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27240083  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa---tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    |||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||     
T  27240084 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcac 27240182  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27240183 acgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacatt 27240282  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27240283 gaacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27240329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24870026 - 24869705
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24870026 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24869935  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24869934 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 24869836  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  24869835 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatg 24869736  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  24869735 acatttcctagaaactttgaattcgcaagca 24869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 37 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27025460 - 27025141
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcatt-g 135  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |    
T  27025460 gctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttg 27025368  T
Q  136 tcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||| |||| ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27025367 tcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 27025269  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27025268 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 27025169  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| || | ||||||||| |||||    
T  27025168 atttcctagagactttgaattcgcaagc 27025141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 24299636 - 24299957
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||| | |||||    
T  24299636 ctcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttactcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcat 24299729  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| |||| |||| | ||| ||||| ||| ||| |||||| |||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24299730 ttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacataactttgagagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 24299828  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  ||||| ||    
T  24299829 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcatta 24299928  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24299929 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 24299957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 15406403 - 15406731
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15406403 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15406495  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15406496 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 15406594  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15406595 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagc 15406694  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  15406695 aatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15406731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 15418190 - 15418518
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      ||   ||| |||||||| | |||||||||||    
T  15418190 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15418282  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  15418283 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 15418381  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  15418382 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagc 15418481  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||  ||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  15418482 aatcatgacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 15418518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 20174881 - 20174545
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | |||||||||||    
T  20174881 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 20174782  T
Q  127 -caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  20174781 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaa 20174683  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  20174682 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatgg 20174583  T
Q  323 taatcactacatttcctgga-aattttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  20174582 taaacactatatttcctttagcattttgaattcacaag 20174545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Original strand, 22161110 - 22161446
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| || |  ||      ||| | |||||||||||    
T  22161110 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 22161209  T
Q  127 -caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagta--gaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  ||  ||||||||||||| |||||||||||| || |||||    
T  22161210 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagactcaa 22161308  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  22161309 attgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgagcatgg 22161408  T
Q  323 taatcactacatttcctgga-aattttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||| |||||||  |  ||||||||||||||||    
T  22161409 taaacactatatttcctttagcattttgaattcacaag 22161446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 283 - 377
Target Start/End: Original strand, 23851453 - 23851547
Alignment:
Q  283 aaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23851453 aaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 23851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 3795885 - 3795539
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3795885 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3795786  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  3795785 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 3795686  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795685 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 3795586  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 365  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795585 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 3795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 33881472 - 33881133
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881472 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 33881373  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881372 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 33881273  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881272 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 33881173  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33881172 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33881133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 18369347 - 18369686
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369347 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18369446  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  18369447 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggtt 18369546  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369547 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18369646  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  18369647 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18369686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30174812 - 30174471
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174812 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 30174713  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174712 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 30174613  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174612 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 30174513  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  30174512 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 30174471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 11555699 - 11555367
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11555699 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatg 11555600  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  11555599 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 11555501  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555500 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 11555401  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  11555400 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11555367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 37746151 - 37746484
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746151 catactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37746250  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746251 gagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 37746350  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746351 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 37746450  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  37746451 atgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 37746484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 40467368 - 40467708
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  40467368 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 40467467  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  40467468 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 40467566  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467567 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 40467666  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40467667 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40467708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 9544522 - 9544864
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  9544522 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 9544621  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  9544622 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 9544719  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544720 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 9544819  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9544820 aacacagtaatcattacatttcct-gaaactttgaattcgcaagca 9544864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37761329 - 37760987
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37761329 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 37761230  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  37761229 tgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 37761131  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761130 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 37761031  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  37761030 cacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 37760987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Original strand, 18494583 - 18494916
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494583 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18494682  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18494683 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 18494781  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494782 caaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18494881  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattc 354  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| || ||||||    
T  18494882 cagcaatcattacatttcctggaaacttcgaattc 18494916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 22894761 - 22894405
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  22894761 gacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagat 22894663  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  22894662 gtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggc 22894564  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894563 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 22894464  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22894463 acagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 22894405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 13180608 - 13180944
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| |||    
T  13180608 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatg 13180702  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  13180703 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 13180802  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180803 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 13180902  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13180903 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13180944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28655589 - 28655247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  28655589 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaa 28655490  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||    
T  28655489 atgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacag 28655392  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655391 gctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28655292  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  28655291 acacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 28655247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 13318651 - 13318982
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318651 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 13318750  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  13318751 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 13318849  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318850 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 13318949  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |  ||||||||  |||| ||||||||| |||||    
T  13318950 ataacatttcccagaaactttgaattcgcaagc 13318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 34 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 6880636 - 6880303
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6880636 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 6880537  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  6880536 ttgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacaaaagcacaggctcaatttgatgtat 6880438  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6880437 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 6880338  T
Q  333 atttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||||   |||  |||||||||||||| ||||||    
T  6880337 atttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 6880303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 24730308 - 24729977
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24730308 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 24730209  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||    
T  24730208 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaggctcaattt 24730111  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730110 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 24730011  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  24730010 tcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 24729977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 37352467 - 37352816
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352467 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37352566  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  37352567 aagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 37352665  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352666 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 37352765  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||  ||||||||  |||| ||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    
T  37352766 catgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 37352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 43084604 - 43084270
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43084604 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatg 43084505  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  43084504 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 43084406  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084405 tcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 43084306  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattc 354  Q
    |||||||||| ||||||||| | ||| |||||||||    
T  43084305 acagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattc 43084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 9323814 - 9323466
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9323814 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 9323715  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  9323714 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 9323617  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323616 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 9323517  T
Q  328 actacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9323516 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 9323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30035763 - 30035431
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  30035763 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 30035664  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  30035663 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 30035566  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  30035565 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaat 30035466  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  30035465 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 30035431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 28953609 - 28953952
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||    
T  28953609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagc 28953707  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953708 attgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 28953806  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28953807 taagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 28953906  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||  || | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28953907 cagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 11329985 - 11329644
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  11329985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaat 11329886  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatat--agctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  11329885 gtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaag 11329787  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329786 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11329687  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  11329686 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 11329644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12138513 - 12138165
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  12138513 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 12138414  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  12138413 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 12138316  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138315 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 12138216  T
Q  328 actacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | |||||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12138215 attacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 12138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 31820233 - 31820580
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31820233 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 31820332  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  31820333 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 31820430  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  31820431 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaacc 31820530  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  31820531 actacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 31820580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 37665315 - 37665642
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  37665315 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 37665413  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  37665414 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 37665512  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  37665513 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 37665612  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||  |||||||||||||| ||||||    
T  37665613 catttcccagaaattttgaattcgcaagca 37665642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Original strand, 8659295 - 8659625
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  8659295 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 8659394  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  8659395 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttg 8659493  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8659494 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 8659593  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    || |||||||||  |||| ||||||||||||||    
T  8659594 cattacatttcc-cgaaactttgaattcacaag 8659625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 33298869 - 33298522
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298869 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 33298770  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33298769 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 33298670  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33298669 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 33298570  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33298569 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 33298522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 41681037 - 41680710
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41681037 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 41680939  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41680938 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 41680839  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||| | |||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  41680838 taagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccatta 41680739  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  41680738 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 41680710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 13436489 - 13436836
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aa 115  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    ||    
T  13436489 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 13436588  T
Q  116 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaag-aaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    |||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||    
T  13436589 aatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagag-tttcaaacaaaagca 13436687  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtaca 312  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  13436688 caagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtaca 13436787  T
Q  313 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  13436788 ttgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 13436836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23632317 - 23631982
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  23632317 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaag 23632218  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |     
T  23632217 atgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaa 23632119  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632118 gctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 23632019  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||| ||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  23632018 acacggtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 23631982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 30158372 - 30158048
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  30158372 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 30158273  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||||||||||    
T  30158272 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaggtagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattg 30158174  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  30158173 atgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 30158074  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaat 352  Q
    ||||||||||| | |||| |||||||    
T  30158073 cactacatttcttagaaactttgaat 30158048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 32590091 - 32590447
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32590091 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 32590190  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  32590191 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 32590288  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| | || ||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590289 tcaatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 32590388  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  32590389 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 32590447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 15752681 - 15753008
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15752681 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 15752780  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||| ||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  15752781 aagtattgtcattatcaa----gaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattga 15752874  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15752875 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatc 15752974  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15752975 atgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15753008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 33522721 - 33522382
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  33522721 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 33522622  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  33522621 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaatt 33522523  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33522522 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 33522423  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  33522422 tcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 33522382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 2517412 - 2517054
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  2517412 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 2517313  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | | |||||||||||| |     
T  2517312 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatct-caaacaaaagcacaa 2517215  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517214 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 2517115  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2517114 acacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 2517054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5644136 - 5643805
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  5644136 catactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgttt 5644038  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  5644037 caggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 5643940  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5643939 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgat 5643840  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  ||||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  5643839 catgacatttcctaggaactttgaattcgcaagca 5643805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 18122245 - 18122572
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18122245 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 18122343  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||    
T  18122344 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 18122442  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18122443 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18122542  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18122543 catctcctagaaactttgaattcgcaagca 18122572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 34622865 - 34622524
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||    
T  34622865 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 34622766  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | ||    
T  34622765 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagc 34622667  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  34622666 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 34622567  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  34622566 cacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 34622524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 26486723 - 26486385
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26486723 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26486624  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26486623 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 26486536  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486535 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26486436  T
Q  328 actacattt-cctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | ||||||| ||   ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26486435 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 26486385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31437803 - 31437469
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  ||||||||||||||||||    
T  31437803 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 31437710  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  31437709 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 31437611  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437610 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 31437511  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  31437510 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31437469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25206630 - 25206266
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25206630 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25206532  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25206531 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaag 25206433  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggta 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25206432 cacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggta 25206333  T
Q  311 cattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  25206332 cattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatga 25206266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25270786 - 25270422
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25270786 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25270688  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
    | |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||    
T  25270687 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaag 25270589  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggta 310  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25270588 cacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggta 25270489  T
Q  311 cattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||  ||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  25270488 cattgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatga 25270422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 22992953 - 22993272
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  22992953 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcat 22993045  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  22993046 catcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 22993144  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||    
T  22993145 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgataca 22993244  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  22993245 tttcctgaaaactttgaattcgcaagca 22993272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 15652589 - 15652914
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    | | | ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15652589 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 15652687  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  15652688 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 15652786  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  |||    
T  15652787 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgaca 15652886  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  15652887 tttcctagaaactttgaattcgcaagca 15652914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 28 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 23898206 - 23897886
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||           |||||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  23898206 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttc 23898117  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||||||    
T  23898116 aagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaa 23898018  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23898017 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 23897918  T
Q  323 taatcactacatttcctggaaattttgaattc 354  Q
     ||||| |||||||||| |||| |||||||||    
T  23897917 caatcattacatttcctagaaactttgaattc 23897886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33783814 - 33783492
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33783814 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 33783723  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa--tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    | |||||||| ||||  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33783722 ttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatg 33783624  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||     
T  33783623 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcat 33783524  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  33783523 tacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33783492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 24976175 - 24975861
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |  ||| |||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24976175 ctcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24976084  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| || |||||||||||||    
T  24976083 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacagactcaaattgatgt 24975985  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  24975984 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatt 24975885  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattc 354  Q
    ||||||||| |||| |||||||||    
T  24975884 acatttcctagaaactttgaattc 24975861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24608570 - 24608250
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca-ttg 135  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||| |||    
T  24608570 gctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttg 24608478  T
Q  136 tcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    |||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  24608477 tcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtata 24608379  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  24608378 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattac 24608279  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  24608278 atttcctagaaactttgaattcgcaagca 24608250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 30940968 - 30940642
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |  |||||||||||||| |||||||||||    
T  30940968 catacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttc 30940878  T
Q  128 aagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  30940877 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcaga-atttcaaacaaaagcacaggctcaaat 30940779  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  30940778 agatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagc 30940679  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  30940678 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 30940642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 57)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 32296932 - 32296574
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296932 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 32296833  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||    
T  32296832 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 32296733  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296732 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 32296633  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32296632 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5728281 - 5727940
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728281 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5728182  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728181 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5728082  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728081 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5727982  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5727981 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5727940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 47029756 - 47029415
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029756 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 47029657  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 47029557  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029556 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 47029457  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  47029456 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 47029415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5717371 - 5717030
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717371 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5717272  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717271 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5717172  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717171 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5717072  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  5717071 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5717030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 5764087 - 5764428
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764087 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5764186  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764187 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5764286  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764287 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5764386  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  5764387 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5764428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4423220 - 4422880
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4423220 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4423121  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4423120 gtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4423022  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423021 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4422922  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  4422921 acagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 4422880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 31958413 - 31958733
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31958413 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31958512  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31958513 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31958612  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958613 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31958712  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  31958713 cacagtaatcattacatttcc 31958733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 4790591 - 4790932
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4790591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4790690  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  4790691 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 4790789  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  4790790 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 4790889  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  4790890 cacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4790932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 5603271 - 5603591
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5603271 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5603370  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  5603371 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 5603470  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603471 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5603570  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  5603571 cacagtaatcattacatttcc 5603591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 24334477 - 24334157
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24334477 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 24334378  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24334377 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 24334278  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334277 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 24334178  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  24334177 cacagtaatcattacatttcc 24334157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 268; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 4340634 - 4340980
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |    
T  4340634 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4340733  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4340734 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4340832  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340833 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4340932  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||||||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| ||||||    
T  4340933 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 4340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10402450 - 10402110
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10402450 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10402351  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||||    
T  10402350 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaa-aaaaatagaatttt-aatcaaaagcacaggc 10402253  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402252 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10402153  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  10402152 acagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 10402110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10649373 - 10649033
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649373 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10649274  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10649273 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10649175  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649174 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10649075  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  10649074 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 10649033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 29658926 - 29659283
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  29658926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 29659025  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  29659026 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaaaggc 29659124  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659125 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 29659224  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  29659225 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 29659283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8217936 - 8217593
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  8217936 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 8217837  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  8217836 tgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaag 8217738  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217737 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 8217638  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  8217637 acacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 8217593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 28109917 - 28110271
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat----gtttg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||     |||||    
T  28109917 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttg 28110016  T
Q  124 tttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 223  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110017 tttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 28110116  T
Q  224 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110117 ttgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 28110216  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28110217 aatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28110271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4630072 - 4629730
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4630072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 4629974  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4629973 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 4629875  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  4629874 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 4629775  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4629774 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4629730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 5590319 - 5590665
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590319 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5590418  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||| ||||    
T  5590419 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcacaggc 5590517  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590518 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5590617  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||||||||  |||  || | |||| |||||||||||||| ||||||    
T  5590618 acagtaatcatgacagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaa 5590665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5473289 - 5472949
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  5473289 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaat 5473191  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5473190 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5473092  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473091 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5472992  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  5472991 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 5472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 48472233 - 48471872
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-----ca 114  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||      |    
T  48472233 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaa 48472134  T
Q  115 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||     
T  48472133 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcac 48472035  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    | |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472034 aagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 48471935  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||  || ||||| ||||||    
T  48471934 gaacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaacttttgatga 48471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16422485 - 16422128
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16422485 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatacacaaaaactttttcaattttcaagat 16422387  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||||||    
T  16422386 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaag 16422288  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422287 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16422188  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16422187 acacagtaatcattacatttcc-ggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 16422128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51788316 - 51787984
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  51788316 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 51788217  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  51788216 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 51788118  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51788117 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 51788018  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  51788017 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 51787984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20072337 - 20071994
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  20072337 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 20072238  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  20072237 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 20072140  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072139 ggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 20072040  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  20072039 aacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 20071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 21680988 - 21680646
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680988 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 21680890  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21680889 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 21680791  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21680790 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 21680691  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21680690 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 22381553 - 22381879
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22381553 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 22381651  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  22381652 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 22381750  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  22381751 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 22381850  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  22381851 atttcctagaaactttgaattcgcaagca 22381879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 22864814 - 22865145
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22864814 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22864913  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22864914 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 22865010  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865011 atgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 22865110  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  22865111 catgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22865145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 22879873 - 22880204
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22879873 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22879972  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaa-aatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||   ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  22879973 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagcatag---tttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 22880069  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880070 atgtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 22880169  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  22880170 catgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22880204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 29142726 - 29143072
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142726 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 29142825  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29142826 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 29142925  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29142926 ataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccact 29143025  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  29143026 acagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 29143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 18249040 - 18248683
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||| |    
T  18249040 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 18248941  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  18248940 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgtagctttgaaagtagaagaaaaatagagttc-caaacaaaagcaaaggc 18248842  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248841 tcaacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 18248742  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18248741 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18248683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 5020014 - 5019675
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5020014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 5019915  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||| | ||    
T  5019914 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagtttt-aaacaaaagcacaagc 5019817  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019816 tcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5019717  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||||  |||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5019716 acagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5019675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 17970824 - 17971163
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17970824 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 17970923  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  17970924 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 17971021  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17971022 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaaca 17971121  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  17971122 cagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 17971163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 28027591 - 28027236
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28027492  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | |||    
T  28027491 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagaatttt-aaacaaaagcacaagct 28027394  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027393 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 28027294  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||| ||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  28027293 cagtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 28027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 18286327 - 18286645
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18286327 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18286425  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18286426 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 18286523  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18286524 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18286623  T
Q  332 catttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||  |||| ||||||||    
T  18286624 catttcccagaaactttgaatt 18286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 18301628 - 18301946
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  18301628 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18301726  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  18301727 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 18301824  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  18301825 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 18301924  T
Q  332 catttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||  |||| ||||||||    
T  18301925 catttcccagaaactttgaatt 18301946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 17978908 - 17979255
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttct-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17978908 gacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 17979007  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||     
T  17979008 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagt 17979106  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979107 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 17979206  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  17979207 cacagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 17979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 16618455 - 16618808
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  16618455 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 16618553  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||||    
T  16618554 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctca 16618652  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618653 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 16618752  T
Q  322 gtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16618753 gtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 16618808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 28345464 - 28345155
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  28345464 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 28345365  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  28345364 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcataggctcaatttg 28345267  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345266 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 28345167  T
Q  327 cactacatttcc 338  Q
    || |||||||||    
T  28345166 cattacatttcc 28345155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 6536701 - 6537042
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |    
T  6536701 gacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 6536800  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  6536801 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagc 6536899  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536900 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 6536999  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  6537000 acagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 6537042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 7079529 - 7079183
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||    
T  7079529 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaat 7079430  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa-aatagaaagaaaatgttttgtatata----gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||  |||| ||||||| || |||||||||    
T  7079429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatatatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagca 7079331  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacat 313  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079330 caagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 7079231  T
Q  314 tgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  7079230 tgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 7079183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18231487 - 18231155
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18231487 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgttt 18231388  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18231387 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcaaaggctcaaattg 18231289  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||  |||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18231288 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 18231189  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    || ||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  18231188 cattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 18231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 11104319 - 11104660
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104319 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 11104418  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtata--tagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||   |||||||  |||||||||||||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  11104419 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtaaaaagaaaatagag-tttcaaacaaaagcacagg 11104517  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104518 ctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 11104617  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| ||||| |||| |||||||||| |||||| || |||||    
T  11104618 cacagcaatcattacacttcctggaaactttgaactcgcaagc 11104660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 20570812 - 20571161
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  20570812 catacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttattt 20570911  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  20570912 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 20571010  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20571011 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 20571110  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20571111 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 20571161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 31030217 - 31030536
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31030217 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 31030310  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  31030311 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgacgtata 31030409  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  31030410 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 31030509  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    | |||| |||| ||||||||| |||||    
T  31030510 tctcctagaaactttgaattcgcaagc 31030536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 18336910 - 18336591
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  18336910 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 18336817  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  18336816 tatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtata 18336718  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18336717 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 18336618  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||||| |||| ||||||||| ||||    
T  18336617 atttcctagaaactttgaattcgcaag 18336591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6208184 - 6207869
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| ||| |    
T  6208184 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcct 6208092  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  6208091 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgta 6207992  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  6207991 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatt 6207892  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    ||||||||| |||| ||||||||    
T  6207891 acatttcctagaaactttgaatt 6207869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18057565 - 18057222
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  18057565 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 18057466  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |    
T  18057465 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgg 18057367  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18057366 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18057267  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  18057266 aacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 18057222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19700792 - 19700431
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaatgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||    
T  19700792 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtt 19700694  T
Q  126 tcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-----------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||    
T  19700693 tcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagca 19700595  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacat 313  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19700594 caggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacat 19700495  T
Q  314 tgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  19700494 tgaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacataggagcttctgatga 19700431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 34 - 354
Target Start/End: Complemental strand, 32445433 - 32445122
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  32445433 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 32445342  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  32445341 tatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 32445243  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  32445242 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 32445143  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattc 354  Q
    |||||  |||| |||||||||    
T  32445142 tttcccagaaactttgaattc 32445122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 4727915 - 4727602
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  4727915 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 4727823  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||    
T  4727822 ttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgta 4727724  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4727723 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatca 4727624  T
Q  332 catttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||| |||| ||||||||    
T  4727623 catttcctagaaactttgaatt 4727602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 15735072 - 15735393
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  15735072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 15735165  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15735166 ttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 15735263  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  15735264 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 15735363  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15735364 acatttcctagaaactttgaattcgcaagc 15735393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5658425 - 5658095
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||      |||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  5658425 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcttaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttc 5658333  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||||| |||||||||     
T  5658332 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaaa 5658234  T
Q  225 tgat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||  ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5658233 tgatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacag 5658134  T
Q  323 taatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
     |||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  5658133 caatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5658095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 35887048 - 35886733
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  35887048 ctcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttacacaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 35886956  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  35886955 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 35886857  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  35886856 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcat 35886757  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  35886756 tacatttcctagaaactttgaatt 35886733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 4689939 - 4689613
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||    
T  4689939 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttc 4689848  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||   ||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  4689847 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacttagaaagtaaaagaaagc-agagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 4689750  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||     
T  4689749 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagc 4689650  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  4689649 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 4689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 8283430 - 8283767
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaaatgtttgt 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | | |||||          |||||||||||||| ||| ||||    
T  8283430 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgt 8283529  T
Q  125 ttcaagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||| |||| ||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||| |||||||||||| || | |||||    
T  8283530 ttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggag-tttcaaacaaaaacacatgctca 8283628  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8283629 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 8283728  T
Q  322 gtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
      ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  8283729 tcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 8283767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 251 - 361
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887006
Alignment:
Q  251 aaggcgtaactccacggattt-acaaagcttgaaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaatttt 348  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||| |||    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  349 gaattcacaagca 361  Q
    |||||| ||||||    
T  15886994 gaattcgcaagca 15887006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002522
Alignment:
Q  275 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 8002522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 222
Target Start/End: Original strand, 15886707 - 15886895
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||       ||||  |||||||||||||| ||||||| |||    
T  15886707 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttc 15886798  T
Q  128 aagca-ttgtcatta-tcaaaatagaaagaaaat-gttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
     |||| ||||||||| | ||||||||| |||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||| |||||||||||| || ||||||||    
T  15886799 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 301; Significance: 1e-169; HSPs: 11)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 301; E-Value: 1e-169
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3647487 - 3647147
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647487 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3647388  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3647387 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 3647288  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647287 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3647188  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||| || |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  3647187 cagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 3647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 10969007 - 10968666
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10969007 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10968908  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968907 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10968808  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968807 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10968708  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  10968707 acagtaatcaggacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 10968666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 51644555 - 51644204
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  51644555 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgttt 51644456  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644455 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 51644356  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644355 gatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 51644256  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  51644255 tcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 51644204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 352
Target Start/End: Complemental strand, 10951425 - 10951100
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951425 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 10951326  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10951325 aagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 10951226  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10951225 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 10951126  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaat 352  Q
    || ||||||||||||||| |||||||    
T  10951125 cattacatttcctggaaactttgaat 10951100  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28156069 - 28155726
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  28156069 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28155970  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  28155969 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 28155872  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155871 ggctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 28155772  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28155771 aacacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 28591415 - 28591085
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28591415 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 28591316  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  28591315 aagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 28591217  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28591216 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 28591117  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    | ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  28591116 attacatttcctggaaactttgaattcgcaag 28591085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 41787224 - 41787566
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41787224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 41787323  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  41787324 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaa 41787421  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41787422 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 41787521  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  41787522 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 41787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 20334330 - 20334689
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  20334330 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 20334428  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  20334429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaca 20334527  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334528 atttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 20334627  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20334628 aacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 20334689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 16201942 - 16202307
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    ||||||||||||||     
T  16201942 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaag 16202040  T
Q  117 atgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaa 209  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||     ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||    
T  16202041 atgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgtttttttttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaa 16202139  T
Q  210 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16202140 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 16202239  T
Q  310 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16202240 acattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcacaggagcttctgatga 16202307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 20467126 - 20466761
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttc--------aattt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||  || ||||         |||||    
T  20467126 gacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaggaactttttttttttctaattt 20467028  T
Q  112 tcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg--ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaa 209  Q
    | || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||| ||||||||    
T  20467027 tgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggtttttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagttt-caaacaaa 20466929  T
Q  210 agcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 309  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20466928 agcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 20466829  T
Q  310 acattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||  |||||||||||| |||| ||||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  20466828 acattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcatagaagcttctgatga 20466761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 21891691 - 21892020
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||      |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  21891691 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaaaactt----ttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 21891785  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| |||||||||||           ||||  || || | ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21891786 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttt-----------tgaacataaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 21891873  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21891874 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatcact 21891973  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21891974 acatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatga 21892020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 298; Significance: 1e-167; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 298; E-Value: 1e-167
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12374 - 12034
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12374 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12275  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12274 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 12176  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12175 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 12076  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12075 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagca 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 286; Significance: 1e-160; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 9557 - 9897
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9557 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9656  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  9657 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 9755  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9756 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaaca 9855  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9856 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 20332337 - 20332678
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332337 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 20332436  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332437 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 20332536  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332537 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 20332636  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  20332637 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 20332678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 39856985 - 39856630
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 39856886  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  39856885 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-agagtttt-aaacaaaagcaaaggct 39856788  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856787 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 39856688  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  39856687 cagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 40099551 - 40099892
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099551 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 40099650  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40099651 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 40099750  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099751 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 40099850  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  40099851 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 27157227 - 27157569
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157227 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27157326  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27157327 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27157426  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157427 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27157526  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27157527 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 27157569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 24586276 - 24586617
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586276 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586375  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  24586376 tttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 24586475  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586476 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 24586575  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  24586576 acatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24586617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 14104892 - 14104554
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104892 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 14104793  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||| ||||||||||| | |||    
T  14104792 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagtttt-aaacaaaagcacaagct 14104694  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104693 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 14104594  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  14104593 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 14104554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 30760112 - 30759775
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30760112 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 30760013  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  30760012 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 30759915  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759914 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 30759815  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  30759814 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30759775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 33667718 - 33668055
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  33667718 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 33667817  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  33667818 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 33667915  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667916 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 33668015  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  33668016 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 54839740 - 54839400
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  54839740 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 54839641  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||    
T  54839640 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caagcaaaagcacaggc 54839543  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839542 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 54839443  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  54839442 acagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 54839400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 18794540 - 18794889
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-aatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18794540 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgttt 18794639  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18794640 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttg 18794738  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18794739 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 18794838  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||  | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18794839 cactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18794889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 34182893 - 34183218
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  34182893 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 34182990  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||    
T  34182991 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 34183089  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34183090 aagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 34183189  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  34183190 atttcccagaaactttgaattcgcaagca 34183218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 14753423 - 14753749
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  14753423 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 14753521  T
Q  132 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||    
T  14753522 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aatcaaaagcacaggctcaaattgatgta 14753619  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  14753620 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatga 14753719  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  14753720 catttcccagaaactttgaattcgcaagca 14753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5700890 - 5700549
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  5700890 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 5700791  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||| | ||    
T  5700790 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaataga-atttcaaacaaaagcacaagc 5700693  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5700692 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 5700593  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||| ||||||    
T  5700592 cacagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 5700549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 21976046 - 21975708
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21976046 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 21975947  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||  |||| |||| ||||||||||||||  || |||||||||    
T  21975946 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagag-tttcaaacaaaagcgcagtctcaaattg 21975848  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  21975847 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 21975748  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  21975747 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 21975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24118998 - 24118672
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  24118998 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 24118900  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| || ||||||||| | ||||||||||||||||    
T  24118899 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-cagacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 24118801  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  24118800 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 24118701  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  24118700 atttcccagaaactttgaattcgcaagca 24118672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Original strand, 31120433 - 31120772
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31120433 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgttt 31120532  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || ||||||||    
T  31120533 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaatt 31120631  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31120632 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 31120731  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||| |||||||||||| || || |||| |||||| ||||||    
T  31120732 tcattacatttcctgggaacttcgaatccacaagtacagaa 31120772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 5012220 - 5011870
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5012220 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 5012121  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  5012120 caagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 5012022  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5012021 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaa 5011922  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5011921 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1906607 - 1906245
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  1906607 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1906509  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgttt----tgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagc 212  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    |||| || |||||||||||||||  | | |||||||| |||||||||||    
T  1906508 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagc 1906410  T
Q  213 aaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtaca 312  Q
    | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906409 acagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 1906310  T
Q  313 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  1906309 ttgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatgagcttctgatga 1906245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 36338455 - 36338774
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36338455 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36338547  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36338548 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 36338646  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||    
T  36338647 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgaca 36338746  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    | |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  36338747 tctcctagaaactttgaattcgcaagca 36338774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 6576190 - 6575879
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||       |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6576190 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 6576098  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  6576097 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 6575999  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6575998 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcaca 6575899  T
Q  334 tttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||| |||| ||||||||    
T  6575898 tttcctagaaactttgaatt 6575879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 15276552 - 15276904
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||| ||||||||| ||||   |||||||||| ||||||||    
T  15276552 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaagtttactt-tcaaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 15276650  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaa 222  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |||||| |    
T  15276651 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcga 15276749  T
Q  223 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15276750 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgg 15276849  T
Q  323 taatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15276850 taaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 15276904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15234170 - 15233809
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttc 113  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  15234170 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcccaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttc 15234072  T
Q  114 aaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagca 213  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||||    
T  15234071 aagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagca 15233973  T
Q  214 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacat 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233972 aaggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 15233873  T
Q  314 tgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || ||| ||||| |||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  15233872 tggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaagcttatgatga 15233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 15380161 - 15380510
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| ||||  | |||||| |||||||||||    
T  15380161 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggcttgctt-tcaaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttc 15380259  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  15380260 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcgaatt 15380358  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  15380359 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataa 15380458  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
     ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  15380459 ccactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttcggatga 15380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 1674213 - 1673877
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  1674213 gacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaagtttgctt-tcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1674115  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||  | | |||||||| ||||||||||||     
T  1674114 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaacaaaagcac 1674016  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  1674015 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatatt 1673916  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||    
T  1673915 gaacacagtaaccactacatttcctagaaactttgaatt 1673877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 14671349 - 14671026
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  14671349 ctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 14671256  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtt-ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  14671255 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacgggctcaaattgatgt 14671157  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  14671156 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 14671057  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| |||| |||||||||||||||    
T  14671056 tacatttcctagaaactttgaattcacaagc 14671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 17019384 - 17019062
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  ||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  17019384 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcat 17019292  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17019291 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcataggctcaaattgatgt 17019193  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  17019192 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcat 17019093  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  17019092 tacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 17019062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 280
Target Start/End: Original strand, 36324246 - 36324484
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  36324246 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36324338  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  36324339 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 36324437  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagctt 280  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  36324438 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 282; Significance: 1e-158; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 12661875 - 12661543
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661875 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12661776  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  12661775 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 12661677  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661676 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 12661577  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    ||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  12661576 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 12661543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 254557 - 254897
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  254557 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 254655  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  254656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 254755  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254756 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 254855  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  254856 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 254897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 37945770 - 37946111
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945770 gacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 37945869  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37945870 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 37945969  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37945970 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaac 37946069  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37946070 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37946111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 27122860 - 27122522
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122860 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27122761  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27122760 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaaaggct 27122663  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122662 caatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27122563  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  27122562 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 27122522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 277; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27810040 - 27809697
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27810040 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27809941  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809940 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27809841  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809840 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27809741  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  27809740 cacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27809697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 22922048 - 22922368
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22922048 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 22922147  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22922148 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 22922247  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922248 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 22922347  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  22922348 cacagtaatcattacatttcc 22922368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 13930457 - 13930791
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13930457 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 13930556  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13930557 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 13930656  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13930657 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 13930756  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  13930757 tcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13930791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3788830 - 3788490
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788830 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3788731  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788730 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 3788632  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788631 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3788532  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  3788531 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 3788490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37384014 - 37383673
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  37384014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 37383915  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  37383914 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 37383816  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  37383815 caaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 37383716  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  37383715 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 37383673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Complemental strand, 39896405 - 39896088
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39896405 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 39896306  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||    
T  39896305 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagct 39896207  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896206 caaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 39896107  T
Q  320 cagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||| |||||||||    
T  39896106 cagtaatcattacatttcc 39896088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 9343892 - 9344232
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |    
T  9343892 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaat 9343991  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  9343992 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 9344090  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344091 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 9344190  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9344191 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 9344232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 16167815 - 16167475
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167815 gacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16167716  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16167715 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 16167617  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167616 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 16167517  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  16167516 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 16167475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 19410389 - 19410709
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19410389 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19410488  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19410489 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 19410588  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410589 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 19410688  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  19410689 cacagtaatcattacatttcc 19410709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 12593151 - 12592806
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  12593151 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 12593052  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12593051 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 12592952  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592951 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 12592852  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  12592851 aacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 12592806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 39045727 - 39046067
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  39045727 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 39045826  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| | ||    
T  39045827 gtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagc 39045925  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  39045926 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaac 39046025  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||    
T  39046026 acagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagc 39046067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 34868019 - 34867681
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  34868019 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 34867920  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  34867919 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 34867822  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867821 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 34867722  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||| | ||||||||||||| ||||||||| ||||    
T  34867721 acagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaag 34867681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 37931708 - 37931369
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37931708 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 37931609  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga------aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931608 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 37931509  T
Q  221 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931508 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 37931409  T
Q  321 agtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  37931408 agcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37931369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32056130 - 32055798
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||    
T  32056130 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 32056031  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  32056030 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 32055933  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32055932 atgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaat 32055833  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||  |||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  32055832 catgacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 32055798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 12710514 - 12710863
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  12710514 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 12710613  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  12710614 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaatt 12710711  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710712 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 12710811  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12710812 tcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 40239831 - 40239489
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239831 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 40239733  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 232  Q
    ||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40239732 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 40239634  T
Q  233 aagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactac 332  Q
    ||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  40239633 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 40239534  T
Q  333 atttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  40239533 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34161183 - 34160840
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  34161183 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 34161084  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| |     
T  34161083 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaa 34160985  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160984 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 34160885  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||| ||||||    
T  34160884 acacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34160840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27782561 - 27782212
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  27782561 catacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 27782462  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||    
T  27782461 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 27782363  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27782362 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 27782263  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  27782262 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 27782212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 37679796 - 37680155
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  37679796 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37679895  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37679896 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 37679993  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37679994 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37680093  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  37680094 aacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 37680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 37695061 - 37695420
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaa 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||  ||||    
T  37695061 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37695160  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  37695161 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 37695258  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  37695259 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 37695358  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  37695359 aacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 37695420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31882615 - 31882284
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  31882615 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 31882516  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  31882515 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 31882418  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||    
T  31882417 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaat 31882318  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    || ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31882317 cattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31882284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Original strand, 16823250 - 16823588
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16823250 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16823349  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16823350 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 16823448  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16823449 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 16823548  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  16823549 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16823588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 366
Target Start/End: Complemental strand, 16898230 - 16897892
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16898230 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16898131  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| || |||||||||    
T  16898130 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacagtctcaaattg 16898032  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  16898031 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 16897932  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    || |||||||||||| || ||||||| |||||| ||||||    
T  16897931 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16897892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 21697078 - 21697427
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||   |||||||||||||| |    
T  21697078 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 21697176  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  | | |||||||| ||||||||||||     
T  21697177 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaggaagatagtagagttt-caaacaaaagcac 21697275  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697276 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 21697375  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  21697376 gaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 21697427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 21671075 - 21671435
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagac-aaaaagttttcaattttc--aaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||  |||    
T  21671075 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaa 21671174  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |    
T  21671175 atgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcaca 21671272  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacatt 314  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21671273 ggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacatt 21671372  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||| ||||| ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21671373 gaacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21671435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 11629104 - 11629446
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11629104 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagca 11629202  T
Q  133 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11629203 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaaataaaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 11629300  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 331  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11629301 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatta 11629400  T
Q  332 catttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11629401 catttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 11629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 309
Target Start/End: Original strand, 31868691 - 31868979
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31868691 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31868790  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  31868791 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 31868888  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 309  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31868889 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 34297486 - 34297152
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||| |||||    
T  34297486 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatg 34297393  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  34297392 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 34297294  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297293 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34297194  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  34297193 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 34297152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 27396662 - 27396303
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||  ||||||||           |||||||||||||| |    
T  27396662 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgcttaggtttgctt-tcaaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaaga 27396564  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||| |    
T  27396563 tgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaca 27396465  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27396464 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattg 27396365  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27396364 aacacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttctgatga 27396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 19450331 - 19450689
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaaatgtt 121  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||| ||||      |||||||||| |||||    
T  19450331 catacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttactt-tcaaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtt 19450429  T
Q  122 tgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||| |||||||||||| |     
T  19450430 tgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagttt-caaacaaaagcacat 19450528  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  19450529 gctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattga 19450628  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19450629 acacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 19450689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 34268839 - 34269167
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  ||||||||||| || |||||||||||    
T  34268839 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttc 34268931  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| | |||||| |    
T  34268932 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacatgctcaatt 34269030  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34269031 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaaca 34269130  T
Q  325 atcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||  ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34269131 atcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagca 34269167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 28888597 - 28888275
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  28888597 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 28888505  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28888504 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 28888406  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  28888405 ataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatg 28888306  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  28888305 acatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28888275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 23122497 - 23122818
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  23122497 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 23122589  T
Q  134 t-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 231  Q
    | |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  23122590 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 23122688  T
Q  232 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |    
T  23122689 taagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatt 23122788  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  23122789 acatttcctagaaactttgaattcgcaagc 23122818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 27428366 - 27428692
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |  ||| |||||||||| |||||||||||    
T  27428366 catacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttc 27428456  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     | |||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  27428457 gaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaat 27428555  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  27428556 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagca 27428655  T
Q  325 atcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||| |||||||||| |||| |||||| |||||||||    
T  27428656 atcattacatttcctagaaactttgaactcacaagca 27428692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 20844235 - 20843909
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  20844235 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 20844141  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 228  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  | ||| |||| ||| ||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  20844140 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgat 20844042  T
Q  229 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  20844041 gtataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 20843942  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    | |||||||||| | || ||||||||| |||||    
T  20843941 attacatttcctaggaactttgaattcgcaagc 20843909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 160
Target Start/End: Complemental strand, 23117133 - 23116993
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||||      
T  23117133 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcccaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatggtcaaaaac 23117034  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg 160  Q
     ||  ||||||||||||||| || || |||| | |||||||    
T  23117033 gttagttcaagcattgtcatgatgaagataggaggaaaatg 23116993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 304 - 360
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887738
Alignment:
Q  304 ggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 31887738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 4139046 - 4139366
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139046 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4139145  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  4139146 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 4139245  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139246 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 4139345  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  4139346 cacagtaatcattacatttcc 4139366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 31558195 - 31558535
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  31558195 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31558294  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31558295 gtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31558393  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558394 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31558493  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  31558494 acagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31558535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 26509496 - 26509839
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26509496 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaggttttcaattttcaaaat 26509595  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  26509596 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcacaggc 26509695  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26509696 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 26509795  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||| |||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  26509796 cacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26509839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 26663713 - 26664054
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663713 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26663812  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26663813 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26663912  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663913 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26664012  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26664013 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26664054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Original strand, 26678905 - 26679246
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26678905 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26679004  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26679005 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26679104  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679105 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26679204  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26679205 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26679246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 371
Target Start/End: Complemental strand, 26441590 - 26441238
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441590 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26441491  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  26441490 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggc 26441391  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441390 tcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26441291  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttc 371  Q
    ||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||||    
T  26441290 acagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 26441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 26519127 - 26518789
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26519127 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 26519028  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26519027 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggct 26518930  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518929 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 26518830  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26518829 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26518789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 5141135 - 5141493
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttct-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141135 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 5141234  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5141235 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 5141333  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141334 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5141433  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5141434 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 24586336 - 24586682
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586336 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586435  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| |||||| |||||    
T  24586436 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtctt-aaacgaaagcacaggct 24586534  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586535 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 24586634  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||    
T  24586635 cagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 24586682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 263; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 5164720 - 5164387
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5164720 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5164621  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatata-gctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  5164620 tttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataggctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 5164522  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164521 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5164422  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  5164421 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 5164387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5154419 - 5154079
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5154419 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5154320  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||||||||| | |||    
T  5154319 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacaaaagcacaagct 5154221  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 5154121  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  5154120 cagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5154079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 261; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 16745321 - 16745679
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  16745321 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 16745420  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16745421 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 16745519  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745520 ctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16745619  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||| |||||||||   ||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16745620 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 16745679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 17 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 45393558 - 45393216
Alignment:
Q  17 atggacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393558 atggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 45393459  T
Q  117 a-tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
    | ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  45393458 aatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtatagctttgaaagtagaagaaaagtagagtttt-aaacaaaagcaca 45393360  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
     |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393359 agctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 45393260  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaag 359  Q
    |||||||||||||||||||||| | |||| ||||||| ||||||    
T  45393259 aacacagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaag 45393216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Original strand, 26268886 - 26269247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  26268886 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 26268985  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaa 214  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| ||||||| ||||||||||||     
T  26268986 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcac 26269084  T
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269085 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 26269184  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||  ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  26269185 gaacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 26269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 39206948 - 39207280
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  39206948 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 39207047  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  39207048 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 39207146  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39207147 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 39207246  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    || |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  39207247 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 39207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 45737636 - 45737296
Alignment:
Q  23 atcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa----t 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    |    
T  45737636 atcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaat 45737537  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  45737536 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 45737439  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737438 tcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 45737339  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  45737338 acagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 45737296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 11447216 - 11446867
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaaatgtttgtt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||    
T  11447216 cataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtt 11447117  T
Q  126 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 225  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | |||||||||    
T  11447116 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaatt 11447019  T
Q  226 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447018 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 11446919  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  11446918 tcactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 11446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 11418580 - 11418913
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||| |    
T  11418580 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaat 11418679  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  11418680 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggc 11418778  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418779 tcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 11418878  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  11418879 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 11418913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16047640 - 16047294
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||    
T  16047640 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgctcaggcttgctt-tcaaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttc 16047542  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  16047541 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatagctttgacagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcaaaggctcaaattga 16047444  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  16047443 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatc 16047344  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16047343 actacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 16047294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 4205717 - 4205368
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaaatgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||    
T  4205717 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 4205618  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| |||    
T  4205617 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttg 4205520  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205519 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 4205420  T
Q  327 cactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4205419 cattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4205368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 26313658 - 26314006
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  26313658 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26313757  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  26313758 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 26313855  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313856 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26313955  T
Q  328 actacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | |||||||||   |||  |||||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  26313956 attacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 26314006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 31084431 - 31084781
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  31084431 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgttt 31084530  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||| | ||||||||||    
T  31084531 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaataga-atttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 31084629  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31084630 atgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaa 31084729  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| |||||||||   ||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  31084730 tcattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 31084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 3451647 - 3451297
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa---tgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||    
T  3451647 cataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgt 3451548  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  3451547 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcaccagctcaaat 3451450  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3451449 tgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtg 3451350  T
Q  325 atcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  3451349 atcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 363
Target Start/End: Original strand, 16443804 - 16444148
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  16443804 gacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 16443902  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  16443903 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttt-aaacaaaagcaaag 16444001  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444002 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 16444101  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcaca 363  Q
    |||||||||  |||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16444102 acacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcaca 16444148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2160908 - 2160566
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  2160908 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 2160809  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  2160808 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 2160710  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2160709 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattga 2160610  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  2160609 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 2160566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2779582 - 2779247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  2779582 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 2779488  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  2779487 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 2779389  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779388 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 2779289  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  2779288 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 2779247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31130235 - 31129900
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||     ||||  ||||||||||||||||||    
T  31130235 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 31130141  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | |||    
T  31130140 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagct 31130042  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130041 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 31129942  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  31129941 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31129900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 10847915 - 10847562
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaaatgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| |||||||||    |||||||||||||| ||||||||    
T  10847915 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttactt-tcaaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgt 10847817  T
Q  125 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctca 221  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||   |||||||||||| || ||||||||| ||||||     
T  10847816 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagttt-cagacaaaagcacaggctcg 10847718  T
Q  222 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847717 aattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacaca 10847618  T
Q  322 gtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||| ||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10847617 gtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 10847562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26596006 - 26595754
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  26596006 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 26595907  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26595906 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 26595807  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatt 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||||||    
T  26595806 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatt 26595754  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Original strand, 16512255 - 16512576
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||        |  ||| ||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16512255 ctcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcat 16512346  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  16512347 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggcttaaattgatgt 16512445  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  16512446 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 16512545  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  16512546 acatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16512576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Original strand, 10910735 - 10911061
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| ||| |||||||    
T  10910735 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttc 10910826  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
     |||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10910827 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 10910925  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| |    
T  10910926 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagca 10911025  T
Q  325 atcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| |||||||||| |||| |||| |||| |||||    
T  10911026 atcattacatttcctagaaactttgtattcgcaagc 10911061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 275 - 360
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532011
Alignment:
Q  275 aagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26532011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 1988 - 1639
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1988 catactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 1889  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  1888 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 1791  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1790 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 1691  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1690 tcactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatga 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 12396 - 12028
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  12396 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 12298  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtat-----------atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaaca 207  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |           ||||||||||||||||||  | | |||||||| ||||||    
T  12297 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgtttttttttttttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagttt-caaaca 12199  T
Q  208 aaagcaaaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggt 306  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  12198 aaagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggt 12099  T
Q  307 ggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12098 ggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagtacagaagcttctgatga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 33248690 - 33248365
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33248690 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 33248591  T
Q  134 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtata 233  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  33248590 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttt-aaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 33248492  T
Q  234 agagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactaca 333  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  33248491 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattaca 33248392  T
Q  334 tttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  33248391 tttcctagaaactttgaattcgcaagc 33248365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9360960 - 9360620
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360960 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9360861  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9360860 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 9360762  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360761 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggaca 9360662  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9360661 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 9360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18797046 - 18796704
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18797046 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18796947  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||    
T  18796946 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaagc 18796848  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18796847 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 18796748  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  18796747 cacggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 18796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 366
Target Start/End: Original strand, 28355827 - 28356176
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28355827 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28355926  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa--tagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  28355927 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 28356026  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356027 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28356126  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaa 366  Q
    ||||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| ||||||    
T  28356127 cacagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaa 28356176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 28 - 365
Target Start/End: Complemental strand, 29835653 - 29835317
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  29835653 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 29835554  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||    
T  29835553 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttga 29835455  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29835454 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 29835355  T
Q  328 actacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 365  Q
    | ||||||||| | ||| |||||||||||||| |||||    
T  29835354 attacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 29835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 270; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 20 - 338
Target Start/End: Original strand, 31483747 - 31484067
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31483747 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31483846  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31483847 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31483946  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483947 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31484046  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcc 338  Q
    ||||||||||| |||||||||    
T  31484047 cacagtaatcattacatttcc 31484067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 31360867 - 31360527
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360867 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 31360768  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  31360767 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31360669  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360668 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31360569  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||| ||||| |||| |||||||||| ||||||||| |||||    
T  31360568 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 31360527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 44567322 - 44566979
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  44567322 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 44567223  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaa 215  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |    
T  44567222 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcaca 44567125  T
Q  216 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 315  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567124 ggctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 44567025  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcct-ggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| ||||| |||||||||| ||||| ||||||||| |||||    
T  44567024 aacacagcaatcattacatttcctgggaaactttgaattcgcaagc 44566979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 255; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 19680786 - 19680430
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  19680786 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19680687  T
Q  120 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19680686 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggct 19680589  T
Q  220 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 319  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680588 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 19680489  T
Q  320 cagtaatcactacatttcctggaaat-tttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||| |||||||||   |||  |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  19680488 cagtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 19680430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 22 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 18715819 - 18715478
Alignment:
Q  22 catcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaaa 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||     ||||    
T  18715819 catcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaa 18715720  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  18715719 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacagg 18715622  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715621 ctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 18715522  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||| ||||  ||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  18715521 cacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 18715478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15773913 - 15773573
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  15773913 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 15773814  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| | ||    
T  15773813 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctctgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaagc 15773715  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773714 tcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 15773615  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||||  |||| |||| |||| ||||||||| |||||    
T  15773614 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagc 15773573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 21342047 - 21342381
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaaat 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21342047 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 21342146  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  |||| ||||||||| ||||| ||||    
T  21342147 gcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagag-tttcaaacagaagcacaggc 21342245  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21342246 tcaaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 21342345  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  21342346 cacagtaatcattacatttcctagaaactttgaatt 21342381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33265061 - 33264729
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  33265061 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgttt 33264962  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||||||||||    
T  33264961 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagctcaaattg 33264864  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264863 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 33264764  T
Q  327 cactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||   |||||||| | || ||||||||| ||||||    
T  33264763 catggcatttcctaggaactttgaattcgcaagca 33264729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 12086608 - 12086958
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  12086608 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 12086707  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  12086708 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 12086806  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12086807 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 12086906  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
     ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12086907 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 12086958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 353
Target Start/End: Original strand, 19911039 - 19911374
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  19911039 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 19911138  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   |||||||||||| ||||||||||| ||    
T  19911139 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagtttt-aaacaaaagcacag 19911237  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 316  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911238 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattga 19911337  T
Q  317 acacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||    
T  19911338 acacagtaatcattacatctcctagaaactttgaatt 19911374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 19202260 - 19202598
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19202260 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 19202359  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||           ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  19202360 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttg-----------aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaggctcaatttga 19202447  T
Q  228 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202448 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 19202547  T
Q  328 actacatttcctggaa-attttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | |||||||||   || | |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19202548 attacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 19202598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 101 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260205
Alignment:
Q  101 gttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 200  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  201 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattg 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  301 gttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | |||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 16260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Original strand, 22074814 - 22075164
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | |||||| |||||| ||||||||| ||||  |||||||| | |||||||||    
T  22074814 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcatgcttgctt-tcaaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttc 22074912  T
Q  128 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||||| |||    
T  22074913 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcctaggctcgaat 22075011  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagta 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |    
T  22075012 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggca 22075111  T
Q  325 atcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    | ||||||||||||| |||| ||||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  22075112 accactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagcttctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Original strand, 19655232 - 19655562
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  19655232 catacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttc 19655324  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  19655325 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaat 19655423  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacag 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655424 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacag 19655523  T
Q  323 taatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  19655524 caatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19655562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 377
Target Start/End: Original strand, 27602805 - 27603141
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||        || |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  27602805 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcacaggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27602895  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27602896 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 27602994  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
     |||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  27602995 ctaagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccact 27603094  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27603095 acagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 27603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 22139231 - 22138904
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||||||        |  |||||||||||||| | |||||||||    
T  22139231 catacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgctcaagtttgctt-tcaaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttc 22139141  T
Q  128 aagcatt-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaat 224  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  22139140 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttt-caaacaaaagcacaagctcaaat 22139042  T
Q  225 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagt 323  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||      
T  22139041 tgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaac 22138942  T
Q  324 aatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  22138941 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Original strand, 2131159 - 2131479
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||        ||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  2131159 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 2131250  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2131251 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 2131349  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcact 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||| |    
T  2131350 ataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcatt 2131449  T
Q  331 acatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2131450 acatttcctagaaactttgaattcgcaagc 2131479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 160; E-Value: 4e-85
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 19694416 - 19694094
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||      |||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  19694416 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 19694324  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19694323 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttt-aaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 19694225  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  19694224 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcat 19694125  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  19694124 tacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 19694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 14569479 - 14569180
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||       ||  |||||||||||||| ||| ||||||| |||||    
T  14569479 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 14569388  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgtat-----atagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |     ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  14569387 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 14569289  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  14569288 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaat 14569189  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 251; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 18926 - 18584
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 18827  T
Q  117 atgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaag 216  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |     
T  18826 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagtttt-aaacaaaagcacaa 18729  T
Q  217 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18728 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 18629  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18628 aacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10252 - 9912
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  10252 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10153  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||| ||||    
T  10152 gtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttt-aaacaaaagcacaggc 10055  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10054 tcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaac 9955  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  9954 acagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 34 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33295
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttct-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||     ||||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  33619 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 33526  T
Q  133 tt-gtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    || |||||||| ||||||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33525 tttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 33427  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||     
T  33426 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcat 33327  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    |||||||||| |||| ||||||||| ||||||    
T  33326 tacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 243; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 8844 - 9184
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  8844 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 8943  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 218  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||    
T  8944 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattt-caaacaaaagcacaagc 9041  T
Q  219 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9042 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 9141  T
Q  319 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||  ||||||||   ||| ||||||||| ||||||    
T  9142 acagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 9184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Original strand, 4518 - 4862
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||| |||| |||||||||| ||    
T  4518 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 4617  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | |    
T  4618 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaag 4716  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattg 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  4717 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattg 4816  T
Q  316 aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagca 361  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||||||    
T  4817 aacacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 4862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 14281 - 13931
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||| | |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  14281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 14182  T
Q  127 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 226  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||| |||    
T  14181 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaacagcacaagctcaatttg 14083  T
Q  227 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaa 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  14082 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaa 13983  T
Q  326 tcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
     ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  13982 ccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 15915 - 15551
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttct-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaa- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15915 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 15816  T
Q  118 -----tgtttgtttcaagcattgtcattatc-aaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaag 211  Q
         |||||||||| |||||||||||  |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15815 aaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaag 15717  T
Q  212 caaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtac 311  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15716 caaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 15617  T
Q  312 attgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15616 attgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 25454 - 25097
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaaatgt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||        |||||||||||||| ||||    
T  25454 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgctt-tcaaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgt 25356  T
Q  121 ttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 217  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| |||||||||||  |||    
T  25355 ttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttttcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcgcagg 25257  T
Q  218 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 317  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  25256 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaa 25157  T
Q  318 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  25156 cacggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcacagaagcttctgatga 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 167; Significance: 2e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 34 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6388 - 6065
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||       ||  |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  6388 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcat 6296  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgttttgt--atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 229  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| |  | ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||| |||||||||||| ||||||||  |||||    
T  6295 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagttt-caaacaaaagcacaggctcaatatgatg 6197  T
Q  230 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6196 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatca 6097  T
Q  329 ctacatttcctggaaattttgaattcacaagc 360  Q
     |||||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  6096 ttacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 6065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 161; Significance: 9e-86; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 353
Target Start/End: Original strand, 24835 - 25150
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||      |||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  24835 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24927  T
Q  134 t-gtcattatcaaaa-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 230  Q
    | |||||||| |||| ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  24928 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 25026  T
Q  231 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||     
T  25027 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcat 25126  T
Q  330 tacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    |||||||||| |||| ||||||||    
T  25127 tacatttcctagaaactttgaatt 25150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 199 - 377
Target Start/End: Complemental strand, 537 - 359
Alignment:
Q  199 tttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttat 298  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||    
T  537 tttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttat 438  T
Q  299 tggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| | |||| |||||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  437 tggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 107; Significance: 2e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 377
Target Start/End: Original strand, 26243 - 26405
Alignment:
Q  215 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  26243 aggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtacatt 26342  T
Q  315 gaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 377  Q
    || ||| |||| ||||||||||||| |||| ||||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26343 gagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatga 26405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 20 - 145
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaaat 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||| ||    
T  126 gacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctt-tcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 28  T
Q  119 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  27 gtttgtttcaagcattgtcattatcaa 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 60; Significance: 2e-25; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 353
Target Start/End: Original strand, 40759 - 40898
Alignment:
Q  221 aaattgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtaactcc-acggatttac-aaagctt-gaaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac-att 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||    
T  40759 aaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattggttggtggtacaatt 40858  T
Q  315 g-aacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaatt 353  Q
    | ||||||  ||||| |||||||||| |||| ||||||||    
T  40859 gaaacacaacaatcattacatttcctagaaactttgaatt 40898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Original strand, 40559 - 40606
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 80  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40559 ctcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University