View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15611_high_7 (Length: 423)

Name: NF15611_high_7
Description: NF15611
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15611_high_7
NF15611_high_7
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (26-401)||(5845-6221)
[»] scaffold0021 (3 HSPs)
scaffold0021 (25-401)||(138296-138673)
scaffold0021 (135-401)||(76589-76853)
scaffold0021 (155-297)||(10003-10148)
[»] chr7 (95 HSPs)
chr7 (25-401)||(26071753-26072131)
chr7 (25-401)||(26095540-26095918)
chr7 (25-401)||(3893381-3893772)
chr7 (25-401)||(12753172-12753558)
chr7 (136-401)||(15824105-15824371)
chr7 (135-401)||(44863443-44863711)
chr7 (135-401)||(141869-142136)
chr7 (135-401)||(47287976-47288244)
chr7 (25-401)||(112784-113168)
chr7 (25-299)||(45453745-45454016)
chr7 (25-301)||(1938257-1938532)
chr7 (209-401)||(7286328-7286522)
chr7 (209-401)||(12545607-12545802)
chr7 (210-401)||(18305642-18305831)
chr7 (210-401)||(13867887-13868080)
chr7 (208-401)||(7290908-7291102)
chr7 (25-178)||(15913921-15914075)
chr7 (209-401)||(2192606-2192799)
chr7 (209-401)||(369143-369336)
chr7 (209-401)||(14253071-14253263)
chr7 (209-401)||(16480836-16481029)
chr7 (209-401)||(15952859-15953050)
chr7 (44-209)||(9058141-9058311)
chr7 (135-401)||(49049452-49049723)
chr7 (25-174)||(13388493-13388643)
chr7 (45-229)||(15761867-15762051)
chr7 (45-231)||(32496053-32496242)
chr7 (49-174)||(13376200-13376324)
chr7 (155-401)||(15629004-15629255)
chr7 (65-179)||(20587140-20587254)
chr7 (135-231)||(13867688-13867784)
chr7 (136-401)||(13272976-13273246)
chr7 (65-169)||(8565108-8565212)
chr7 (213-386)||(15762262-15762429)
chr7 (49-228)||(18255324-18255505)
chr7 (45-174)||(3058585-3058713)
chr7 (65-174)||(9322594-9322703)
chr7 (135-231)||(11285619-11285715)
chr7 (65-179)||(28718977-28719091)
chr7 (135-231)||(11582535-11582631)
chr7 (126-265)||(15952673-15952813)
chr7 (135-302)||(16571751-16571921)
chr7 (135-302)||(16593741-16593911)
chr7 (45-158)||(125378-125492)
chr7 (332-401)||(16571983-16572053)
chr7 (332-401)||(16593609-16593679)
chr7 (45-169)||(2027097-2027222)
chr7 (134-231)||(13038808-13038905)
chr7 (209-306)||(2024757-2024858)
chr7 (135-301)||(10862515-10862683)
chr7 (135-270)||(12249771-12249908)
chr7 (135-231)||(12545404-12545501)
chr7 (209-283)||(12545553-12545627)
chr7 (151-223)||(36051075-36051147)
chr7 (126-231)||(369364-369471)
chr7 (51-229)||(10988092-10988271)
chr7 (152-223)||(122987-123059)
chr7 (151-231)||(16210183-16210263)
chr7 (51-228)||(26010695-26010874)
chr7 (184-238)||(18305492-18305546)
chr7 (337-401)||(2024692-2024757)
chr7 (152-228)||(2192376-2192453)
chr7 (126-228)||(15518435-15518539)
chr7 (217-401)||(16416509-16416684)
chr7 (211-283)||(16480710-16480782)
chr7 (326-401)||(45455505-45455581)
chr7 (49-228)||(2436110-2436285)
chr7 (171-265)||(2024904-2024998)
chr7 (65-111)||(4483318-4483364)
chr7 (151-209)||(7291277-7291335)
chr7 (135-228)||(7821406-7821500)
chr7 (135-228)||(7828717-7828811)
chr7 (135-228)||(16416949-16417043)
chr7 (151-228)||(16480605-16480683)
chr7 (135-228)||(27103134-27103228)
chr7 (135-228)||(27110482-27110576)
chr7 (135-228)||(27175098-27175192)
chr7 (135-228)||(38785226-38785320)
chr7 (211-283)||(2192480-2192552)
chr7 (127-179)||(4483268-4483320)
chr7 (209-401)||(11582659-11582840)
chr7 (65-228)||(13757060-13757225)
chr7 (184-231)||(3055193-3055241)
chr7 (126-228)||(25293856-25293960)
chr7 (209-313)||(122854-122951)
chr7 (135-228)||(11514604-11514698)
chr7 (272-401)||(13038989-13039114)
chr7 (135-228)||(15443146-15443240)
chr7 (151-228)||(30263727-30263805)
chr7 (126-203)||(42057741-42057819)
chr7 (85-130)||(3193586-3193630)
chr7 (330-401)||(16209975-16210045)
chr7 (52-121)||(19066193-19066262)
chr7 (86-130)||(13460914-13460958)
chr7 (126-224)||(13912691-13912791)
[»] chr6 (91 HSPs)
chr6 (25-401)||(31626739-31627117)
chr6 (29-401)||(18775506-18775886)
chr6 (29-401)||(22428473-22428850)
chr6 (25-401)||(16104850-16105237)
chr6 (135-401)||(25646518-25646786)
chr6 (29-401)||(25745792-25746160)
chr6 (209-401)||(35017451-35017645)
chr6 (210-401)||(35011124-35011316)
chr6 (209-401)||(18128340-18128532)
chr6 (209-401)||(18578834-18579027)
chr6 (215-401)||(13622937-13623121)
chr6 (25-150)||(16083970-16084095)
chr6 (210-401)||(19627498-19627690)
chr6 (209-386)||(14628368-14628545)
chr6 (209-401)||(18004857-18005050)
chr6 (25-208)||(18128776-18128964)
chr6 (209-401)||(23975708-23975902)
chr6 (209-401)||(18843708-18843900)
chr6 (135-401)||(13016436-13016702)
chr6 (45-231)||(19984699-19984887)
chr6 (218-378)||(33316422-33316582)
chr6 (25-174)||(18383173-18383323)
chr6 (45-229)||(1554324-1554508)
chr6 (135-256)||(18422182-18422303)
chr6 (25-174)||(33323342-33323492)
chr6 (25-119)||(23151845-23151939)
chr6 (49-229)||(16238848-16239028)
chr6 (44-169)||(17790652-17790776)
chr6 (269-401)||(23151706-23151839)
chr6 (184-401)||(32896282-32896492)
chr6 (25-168)||(16889236-16889379)
chr6 (209-335)||(18825647-18825774)
chr6 (65-179)||(34965470-34965584)
chr6 (25-150)||(35137439-35137565)
chr6 (135-302)||(25369014-25369184)
chr6 (66-209)||(22846615-22846767)
chr6 (49-228)||(11214623-11214803)
chr6 (135-401)||(18397163-18397434)
chr6 (213-386)||(1553946-1554113)
chr6 (65-169)||(16134814-16134918)
chr6 (49-230)||(4989379-4989561)
chr6 (135-219)||(35017303-35017387)
chr6 (65-179)||(19852795-19852909)
chr6 (272-401)||(16827873-16828003)
chr6 (151-223)||(18740863-18740935)
chr6 (49-228)||(1659212-1659387)
chr6 (151-229)||(13622800-13622878)
chr6 (65-179)||(23220222-23220336)
chr6 (51-228)||(14628111-14628289)
chr6 (51-228)||(23976053-23976231)
chr6 (51-228)||(26088319-26088497)
chr6 (127-228)||(33316158-33316260)
chr6 (321-401)||(17787746-17787827)
chr6 (216-283)||(23975956-23976023)
chr6 (135-231)||(16827462-16827559)
chr6 (135-231)||(18004635-18004732)
chr6 (66-208)||(1651466-1651605)
chr6 (211-283)||(14628316-14628388)
chr6 (330-401)||(25173518-25173590)
chr6 (51-204)||(16650745-16650899)
chr6 (135-230)||(18825420-18825515)
chr6 (209-386)||(4989004-4989171)
chr6 (135-300)||(15738590-15738757)
chr6 (215-269)||(16238711-16238765)
chr6 (209-401)||(18740645-18740828)
chr6 (135-228)||(25174040-25174134)
chr6 (135-228)||(27655670-27655764)
chr6 (66-203)||(15861243-15861375)
chr6 (135-239)||(28196439-28196546)
chr6 (51-204)||(16557515-16557669)
chr6 (135-230)||(18843481-18843576)
chr6 (209-283)||(4989201-4989275)
chr6 (135-228)||(10487364-10487458)
chr6 (135-228)||(16377869-16377963)
chr6 (135-228)||(16385193-16385287)
chr6 (332-401)||(18422115-18422185)
chr6 (218-279)||(33316292-33316353)
chr6 (51-228)||(29870975-29871153)
chr6 (209-279)||(16827663-16827733)
chr6 (151-228)||(17343864-17343942)
chr6 (85-130)||(16374954-16374999)
chr6 (126-228)||(16230065-16230169)
chr6 (126-228)||(23993645-23993749)
chr6 (225-283)||(18004770-18004827)
chr6 (209-401)||(19984915-19985096)
chr6 (151-228)||(22227278-22227356)
chr6 (209-283)||(25173731-25173805)
chr6 (330-401)||(18835474-18835544)
chr6 (135-179)||(21930417-21930462)
chr6 (85-130)||(31162441-31162486)
chr6 (163-207)||(32896494-32896538)
[»] chr8 (99 HSPs)
chr8 (25-401)||(37605283-37605668)
chr8 (59-401)||(41243948-41244277)
chr8 (135-401)||(25120745-25121012)
chr8 (135-401)||(19994802-19995078)
chr8 (135-401)||(20479893-20480166)
chr8 (135-401)||(16416537-16416810)
chr8 (210-401)||(18610428-18610620)
chr8 (209-401)||(41508927-41509122)
chr8 (45-317)||(16203832-16204098)
chr8 (214-401)||(24719328-24719513)
chr8 (209-401)||(13664550-13664743)
chr8 (209-401)||(13723825-13724018)
chr8 (220-401)||(22008366-22008548)
chr8 (209-401)||(22909342-22909535)
chr8 (147-401)||(20655677-20655943)
chr8 (25-153)||(41245210-41245338)
chr8 (209-401)||(24108465-24108657)
chr8 (25-174)||(21192234-21192384)
chr8 (25-174)||(21696086-21696236)
chr8 (25-174)||(21199661-21199811)
chr8 (25-169)||(31195772-31195917)
chr8 (25-174)||(23835746-23835895)
chr8 (209-401)||(23509068-23509261)
chr8 (25-209)||(37655134-37655324)
chr8 (45-231)||(29758768-29758956)
chr8 (209-386)||(22323225-22323398)
chr8 (210-401)||(269950-270138)
chr8 (210-401)||(645782-645970)
chr8 (210-401)||(831517-831705)
chr8 (25-174)||(39448310-39448460)
chr8 (210-401)||(16043054-16043245)
chr8 (45-222)||(270226-270401)
chr8 (45-222)||(645519-645694)
chr8 (45-222)||(831254-831429)
chr8 (248-401)||(17343480-17343632)
chr8 (210-401)||(16041378-16041569)
chr8 (25-111)||(37609956-37610042)
chr8 (135-300)||(17731117-17731286)
chr8 (135-223)||(24719077-24719165)
chr8 (65-180)||(22498832-22498947)
chr8 (49-221)||(24930614-24930789)
chr8 (45-223)||(24387203-24387383)
chr8 (65-174)||(23116349-23116458)
chr8 (135-401)||(38531882-38532152)
chr8 (65-179)||(22312190-22312304)
chr8 (65-179)||(45560747-45560861)
chr8 (119-209)||(25294490-25294582)
chr8 (119-209)||(25756479-25756571)
chr8 (74-179)||(33170785-33170890)
chr8 (44-169)||(33612569-33612694)
chr8 (135-302)||(28543270-28543440)
chr8 (283-401)||(6776303-6776422)
chr8 (25-179)||(23153297-23153452)
chr8 (209-401)||(43375310-43375493)
chr8 (135-401)||(18768422-18768691)
chr8 (135-231)||(22008139-22008236)
chr8 (135-258)||(24108245-24108368)
chr8 (209-401)||(3433535-3433718)
chr8 (135-231)||(22323102-22323197)
chr8 (151-223)||(43375202-43375274)
chr8 (51-204)||(22089943-22090097)
chr8 (65-179)||(24238065-24238177)
chr8 (339-401)||(28543151-28543213)
chr8 (135-228)||(23509397-23509491)
chr8 (135-231)||(13664296-13664393)
chr8 (135-231)||(13723571-13723668)
chr8 (51-228)||(3433076-3433254)
chr8 (211-283)||(13664424-13664496)
chr8 (211-283)||(13723699-13723771)
chr8 (51-228)||(21853396-21853574)
chr8 (135-231)||(22909146-22909242)
chr8 (66-208)||(24547724-24547863)
chr8 (51-204)||(15320559-15320713)
chr8 (51-204)||(15500928-15501082)
chr8 (220-283)||(23509315-23509378)
chr8 (272-401)||(23631046-23631173)
chr8 (65-126)||(11543088-11543149)
chr8 (126-228)||(21846065-21846169)
chr8 (25-84)||(25294581-25294641)
chr8 (25-84)||(25756570-25756630)
chr8 (217-401)||(28835980-28836155)
chr8 (216-283)||(3433285-3433352)
chr8 (135-228)||(272786-272880)
chr8 (135-228)||(642969-643063)
chr8 (135-228)||(828775-828869)
chr8 (135-228)||(5236674-5236768)
chr8 (329-401)||(39448573-39448646)
chr8 (51-228)||(16874439-16874617)
chr8 (346-401)||(17731331-17731387)
chr8 (25-111)||(23148481-23148568)
chr8 (209-313)||(29758643-29758740)
chr8 (126-204)||(224737-224816)
chr8 (126-204)||(738360-738439)
chr8 (126-204)||(862255-862334)
chr8 (126-204)||(16675900-16675979)
chr8 (360-401)||(21695899-21695941)
chr8 (135-228)||(24662830-24662924)
chr8 (218-283)||(3433390-3433455)
chr8 (65-105)||(18043091-18043131)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (62-401)||(37760-38101)
[»] chr3 (134 HSPs)
chr3 (25-401)||(50113612-50113991)
chr3 (26-401)||(319099-319486)
chr3 (45-401)||(51159973-51160335)
chr3 (135-401)||(17098913-17099181)
chr3 (27-401)||(12351332-12351709)
chr3 (25-401)||(47786356-47786735)
chr3 (135-401)||(6148457-6148723)
chr3 (135-401)||(30204696-30204961)
chr3 (25-283)||(7852223-7852482)
chr3 (209-401)||(11812801-11812994)
chr3 (135-401)||(16183665-16183945)
chr3 (25-231)||(8630315-8630521)
chr3 (135-401)||(19572430-19572693)
chr3 (135-401)||(22145882-22146145)
chr3 (209-401)||(38166213-38166407)
chr3 (209-401)||(18737974-18738167)
chr3 (25-277)||(14060726-14060980)
chr3 (209-401)||(19944805-19944998)
chr3 (209-401)||(7851683-7851877)
chr3 (209-401)||(30140984-30141177)
chr3 (218-396)||(12796728-12796908)
chr3 (209-401)||(17936455-17936649)
chr3 (25-210)||(38812481-38812671)
chr3 (47-178)||(18008645-18008776)
chr3 (25-223)||(19230535-19230734)
chr3 (44-174)||(15874690-15874820)
chr3 (209-401)||(16819043-16819234)
chr3 (44-174)||(48420197-48420327)
chr3 (25-174)||(55442252-55442404)
chr3 (51-174)||(12490249-12490372)
chr3 (135-401)||(14287323-14287596)
chr3 (45-231)||(2048535-2048723)
chr3 (25-174)||(11330493-11330643)
chr3 (135-401)||(11199144-11199415)
chr3 (65-179)||(5229607-5229721)
chr3 (45-231)||(33340317-33340506)
chr3 (45-231)||(23490980-23491169)
chr3 (135-401)||(35121921-35122189)
chr3 (45-237)||(19945098-19945289)
chr3 (213-344)||(8630101-8630232)
chr3 (45-231)||(10737033-10737219)
chr3 (135-401)||(14296730-14297000)
chr3 (135-401)||(14302357-14302627)
chr3 (49-228)||(14846160-14846339)
chr3 (135-302)||(11062691-11062861)
chr3 (67-179)||(47983418-47983531)
chr3 (67-179)||(47992705-47992818)
chr3 (67-179)||(48001992-48002105)
chr3 (67-179)||(48011278-48011391)
chr3 (293-401)||(54045594-54045703)
chr3 (135-231)||(11813307-11813403)
chr3 (25-179)||(9592239-9592394)
chr3 (209-306)||(13815973-13816070)
chr3 (135-401)||(14523006-14523278)
chr3 (268-401)||(17958169-17958303)
chr3 (51-265)||(49230655-49230869)
chr3 (45-222)||(5227201-5227378)
chr3 (49-228)||(15939959-15940140)
chr3 (51-231)||(17913751-17913933)
chr3 (65-179)||(41660135-41660249)
chr3 (213-374)||(54686551-54686707)
chr3 (326-401)||(11062944-11063020)
chr3 (135-231)||(17957996-17958093)
chr3 (51-229)||(44227903-44228083)
chr3 (213-374)||(9304664-9304819)
chr3 (51-228)||(16819386-16819565)
chr3 (66-265)||(16259487-16259683)
chr3 (268-401)||(25057035-25057166)
chr3 (135-299)||(15516035-15516197)
chr3 (136-231)||(19262602-19262698)
chr3 (315-401)||(13815856-13815943)
chr3 (209-401)||(19230318-19230499)
chr3 (209-283)||(11813179-11813253)
chr3 (135-277)||(12563136-12563281)
chr3 (135-231)||(25057247-25057344)
chr3 (85-174)||(33370914-33371002)
chr3 (326-401)||(17536847-17536923)
chr3 (217-401)||(18908679-18908854)
chr3 (217-401)||(22273034-22273209)
chr3 (51-228)||(27839184-27839362)
chr3 (159-231)||(45581310-45581382)
chr3 (209-276)||(7851968-7852035)
chr3 (151-229)||(15860824-15860902)
chr3 (151-228)||(18905356-18905434)
chr3 (209-283)||(18908892-18908966)
chr3 (209-386)||(49230262-49230429)
chr3 (49-208)||(15613564-15613720)
chr3 (211-283)||(11813048-11813120)
chr3 (135-277)||(17137827-17137969)
chr3 (66-208)||(23081682-23081821)
chr3 (269-401)||(23490768-23490898)
chr3 (216-279)||(16819292-16819355)
chr3 (135-230)||(30141361-30141456)
chr3 (135-228)||(2450910-2451004)
chr3 (85-131)||(11517010-11517056)
chr3 (135-228)||(18909169-18909263)
chr3 (135-228)||(22273524-22273618)
chr3 (133-283)||(40938085-40938236)
chr3 (66-228)||(12266007-12266167)
chr3 (135-208)||(15574545-15574618)
chr3 (51-228)||(16745670-16745848)
chr3 (326-401)||(53900388-53900463)
chr3 (135-228)||(1469236-1469330)
chr3 (209-283)||(7851857-7851931)
chr3 (135-300)||(17536606-17536774)
chr3 (279-401)||(33340038-33340155)
chr3 (136-228)||(15470048-15470141)
chr3 (216-401)||(19262733-19262907)
chr3 (51-228)||(30151813-30151991)
chr3 (339-401)||(12563334-12563397)
chr3 (135-209)||(12951476-12951555)
chr3 (329-401)||(39654163-39654237)
chr3 (126-228)||(8269976-8270080)
chr3 (126-228)||(8277087-8277191)
chr3 (126-228)||(8305896-8306000)
chr3 (331-401)||(14061039-14061110)
chr3 (126-228)||(53769137-53769241)
chr3 (126-204)||(13956378-13956457)
chr3 (126-204)||(13977211-13977290)
chr3 (49-96)||(18905296-18905343)
chr3 (126-204)||(41268743-41268822)
chr3 (126-204)||(45859521-45859600)
chr3 (135-282)||(53900177-53900326)
chr3 (126-204)||(55314883-55314962)
chr3 (209-283)||(2451155-2451229)
chr3 (209-283)||(22273247-22273321)
chr3 (209-283)||(49230509-49230583)
chr3 (216-265)||(2451035-2451084)
chr3 (268-317)||(10736904-10736953)
chr3 (135-180)||(11883923-11883968)
chr3 (135-180)||(14291910-14291955)
chr3 (135-179)||(38377415-38377460)
chr3 (268-317)||(45581181-45581230)
chr3 (135-174)||(15989508-15989548)
[»] chr5 (96 HSPs)
chr5 (25-401)||(4863551-4863943)
chr5 (25-401)||(27185318-27185699)
chr5 (85-401)||(21661268-21661593)
chr5 (135-401)||(21392432-21392698)
chr5 (209-401)||(34937571-34937764)
chr5 (209-401)||(10307-10500)
chr5 (209-401)||(10780112-10780305)
chr5 (25-178)||(32967661-32967815)
chr5 (209-401)||(43445708-43445901)
chr5 (44-174)||(23492532-23492662)
chr5 (209-401)||(28257781-28257970)
chr5 (209-401)||(22885041-22885234)
chr5 (44-209)||(24226976-24227146)
chr5 (215-401)||(25211796-25211982)
chr5 (215-401)||(25275948-25276134)
chr5 (44-180)||(21615535-21615671)
chr5 (212-401)||(17473704-17473892)
chr5 (25-169)||(7727112-7727257)
chr5 (218-386)||(19497952-19498120)
chr5 (25-180)||(19860756-19860912)
chr5 (25-178)||(28888441-28888598)
chr5 (135-283)||(11582266-11582414)
chr5 (209-401)||(11579922-11580113)
chr5 (135-281)||(1170321-1170467)
chr5 (25-174)||(13793659-13793809)
chr5 (44-174)||(37189637-37189767)
chr5 (135-401)||(23453184-23453454)
chr5 (135-401)||(23460428-23460698)
chr5 (135-401)||(23464689-23464959)
chr5 (51-283)||(1221351-1221584)
chr5 (210-401)||(23986165-23986359)
chr5 (259-401)||(1171320-1171464)
chr5 (209-401)||(9732592-9732782)
chr5 (209-401)||(1221638-1221826)
chr5 (65-179)||(11964472-11964586)
chr5 (135-401)||(24184869-24185137)
chr5 (135-401)||(24470555-24470804)
chr5 (135-231)||(21653052-21653148)
chr5 (51-231)||(11213222-11213404)
chr5 (51-231)||(110604-110785)
chr5 (65-179)||(20455627-20455741)
chr5 (135-265)||(22884887-22885017)
chr5 (151-231)||(17473568-17473648)
chr5 (151-317)||(23510313-23510473)
chr5 (209-401)||(29192671-29192857)
chr5 (213-394)||(17907853-17908030)
chr5 (65-265)||(35792767-35792964)
chr5 (135-265)||(16534750-16534881)
chr5 (209-401)||(35793162-35793345)
chr5 (209-283)||(10554-10628)
chr5 (151-265)||(18779790-18779904)
chr5 (135-231)||(22368188-22368285)
chr5 (51-228)||(19498280-19498458)
chr5 (135-231)||(28257998-28258093)
chr5 (216-283)||(9732495-9732562)
chr5 (51-231)||(10779799-10779980)
chr5 (197-401)||(11338584-11338802)
chr5 (209-401)||(25944566-25944750)
chr5 (209-401)||(11340599-11340782)
chr5 (51-228)||(11341116-11341294)
chr5 (209-401)||(18780052-18780235)
chr5 (126-228)||(25425102-25425206)
chr5 (216-283)||(11341018-11341085)
chr5 (135-228)||(10831-10925)
chr5 (209-386)||(110990-111157)
chr5 (135-209)||(5452432-5452511)
chr5 (217-283)||(19498182-19498248)
chr5 (65-228)||(43445390-43445555)
chr5 (51-228)||(4201586-4201764)
chr5 (126-228)||(9732360-9732464)
chr5 (209-401)||(16534391-16534574)
chr5 (162-258)||(25211623-25211719)
chr5 (162-258)||(25275775-25275871)
chr5 (330-386)||(25424680-25424736)
chr5 (219-283)||(25944472-25944536)
chr5 (211-283)||(43445582-43445654)
chr5 (135-228)||(21075192-21075286)
chr5 (135-228)||(21933863-21933957)
chr5 (135-228)||(21940033-21940127)
chr5 (209-283)||(22368337-22368411)
chr5 (135-228)||(29192321-29192415)
chr5 (135-228)||(35580735-35580829)
chr5 (135-228)||(37010867-37010961)
chr5 (135-209)||(3672421-3672497)
chr5 (211-283)||(10780011-10780082)
chr5 (330-401)||(22368602-22368674)
chr5 (51-228)||(24594981-24595159)
chr5 (65-204)||(23327458-23327598)
chr5 (126-228)||(27008492-27008596)
chr5 (209-279)||(110888-110957)
chr5 (329-401)||(7726919-7726993)
chr5 (127-228)||(25902021-25902123)
chr5 (225-283)||(29192583-29192641)
chr5 (135-228)||(37051465-37051559)
chr5 (269-306)||(21653228-21653265)
chr5 (45-77)||(21649463-21649495)
[»] scaffold0011 (9 HSPs)
scaffold0011 (135-401)||(256560-256827)
scaffold0011 (151-231)||(125009-125089)
scaffold0011 (151-229)||(72028-72106)
scaffold0011 (151-229)||(76409-76487)
scaffold0011 (151-223)||(192985-193057)
scaffold0011 (271-401)||(72191-72317)
scaffold0011 (271-401)||(76572-76698)
scaffold0011 (272-401)||(125173-125298)
scaffold0011 (268-401)||(192768-192897)
[»] chr4 (98 HSPs)
chr4 (25-401)||(21961053-21961440)
chr4 (113-401)||(12837900-12838192)
chr4 (37-401)||(12901269-12901631)
chr4 (135-401)||(44345057-44345333)
chr4 (134-401)||(33738477-33738732)
chr4 (209-401)||(18166874-18167067)
chr4 (25-209)||(8873978-8874162)
chr4 (209-401)||(34393385-34393580)
chr4 (209-401)||(53909555-53909750)
chr4 (135-401)||(16366361-16366624)
chr4 (44-229)||(14899948-14900136)
chr4 (210-401)||(19699414-19699606)
chr4 (210-401)||(19709999-19710191)
chr4 (25-178)||(34197658-34197812)
chr4 (209-401)||(7134310-7134503)
chr4 (209-401)||(8372607-8372800)
chr4 (25-178)||(37958550-37958704)
chr4 (209-401)||(15274470-15274663)
chr4 (25-169)||(27959563-27959708)
chr4 (45-231)||(109957-110143)
chr4 (25-174)||(12245745-12245895)
chr4 (209-401)||(26678179-26678370)
chr4 (135-401)||(44054168-44054427)
chr4 (135-401)||(45460611-45460894)
chr4 (44-174)||(15852829-15852959)
chr4 (44-166)||(41167447-41167569)
chr4 (45-283)||(15211762-15212004)
chr4 (135-401)||(13244606-13244861)
chr4 (207-401)||(53706635-53706828)
chr4 (135-401)||(13811287-13811558)
chr4 (135-401)||(30236147-30236411)
chr4 (209-401)||(22356424-22356616)
chr4 (228-401)||(20813715-20813890)
chr4 (220-401)||(47355509-47355688)
chr4 (135-223)||(53909431-53909519)
chr4 (25-209)||(41257842-41258031)
chr4 (65-179)||(5372228-5372342)
chr4 (65-179)||(10238967-10239081)
chr4 (256-401)||(18294600-18294746)
chr4 (65-174)||(47469867-47469976)
chr4 (49-201)||(16521294-16521447)
chr4 (51-231)||(5684404-5684586)
chr4 (69-179)||(50223696-50223806)
chr4 (135-227)||(43283043-43283138)
chr4 (209-401)||(15211515-15211698)
chr4 (321-401)||(8874265-8874346)
chr4 (135-231)||(10642586-10642683)
chr4 (51-228)||(19999005-19999183)
chr4 (227-283)||(34393610-34393666)
chr4 (135-204)||(52267125-52267196)
chr4 (165-241)||(53706515-53706591)
chr4 (217-319)||(55378542-55378646)
chr4 (216-283)||(8372854-8372921)
chr4 (216-283)||(18167097-18167164)
chr4 (135-401)||(18496065-18496334)
chr4 (151-221)||(54119906-54119976)
chr4 (162-283)||(7134088-7134208)
chr4 (268-401)||(9293712-9293843)
chr4 (135-231)||(9293924-9294021)
chr4 (268-401)||(10642374-10642505)
chr4 (51-230)||(22356065-22356244)
chr4 (126-228)||(15138134-15138238)
chr4 (209-401)||(19998517-19998700)
chr4 (126-228)||(26678522-26678626)
chr4 (126-228)||(47355803-47355907)
chr4 (216-279)||(26678428-26678491)
chr4 (151-228)||(8372951-8373029)
chr4 (135-228)||(14994678-14994772)
chr4 (151-228)||(18167195-18167273)
chr4 (135-228)||(18246668-18246762)
chr4 (217-283)||(19998907-19998973)
chr4 (45-91)||(25120617-25120663)
chr4 (151-231)||(15274361-15274442)
chr4 (218-283)||(19998780-19998845)
chr4 (216-284)||(13751910-13751978)
chr4 (330-401)||(18246178-18246250)
chr4 (219-283)||(47355705-47355769)
chr4 (155-281)||(7848776-7848902)
chr4 (209-401)||(16520801-16520985)
chr4 (268-401)||(54120066-54120195)
chr4 (328-394)||(55378691-55378757)
chr4 (25-62)||(34393690-34393727)
chr4 (126-228)||(14950498-14950602)
chr4 (216-317)||(109828-109922)
chr4 (135-195)||(15043381-15043443)
chr4 (135-195)||(15110981-15111043)
chr4 (218-283)||(16521015-16521080)
chr4 (135-191)||(53706465-53706521)
chr4 (171-265)||(16521168-16521263)
chr4 (135-228)||(10487149-10487243)
chr4 (135-228)||(16329508-16329602)
chr4 (66-108)||(17213378-17213420)
chr4 (209-283)||(18246391-18246465)
chr4 (65-111)||(24237479-24237525)
chr4 (257-301)||(43283140-43283185)
chr4 (337-396)||(5684742-5684802)
chr4 (126-228)||(13049739-13049843)
chr4 (135-179)||(17377040-17377084)
[»] scaffold0068 (1 HSPs)
scaffold0068 (25-401)||(59865-60250)
[»] chr1 (73 HSPs)
chr1 (25-401)||(35053141-35053515)
chr1 (135-401)||(22407894-22408162)
chr1 (135-401)||(2422733-2422997)
chr1 (25-283)||(5676091-5676355)
chr1 (209-401)||(41217544-41217739)
chr1 (217-401)||(5676350-5676535)
chr1 (25-206)||(41217945-41218126)
chr1 (25-231)||(20444214-20444420)
chr1 (210-401)||(20252342-20252534)
chr1 (25-231)||(37845956-37846162)
chr1 (25-231)||(20529978-20530185)
chr1 (135-273)||(49966013-49966151)
chr1 (44-174)||(38035130-38035260)
chr1 (25-169)||(13378250-13378395)
chr1 (209-401)||(9786123-9786315)
chr1 (135-401)||(35524082-35524350)
chr1 (46-169)||(19601713-19601836)
chr1 (25-174)||(36357826-36357976)
chr1 (44-174)||(37235470-37235600)
chr1 (49-223)||(20929955-20930131)
chr1 (25-174)||(21193694-21193844)
chr1 (49-228)||(22226459-22226638)
chr1 (135-301)||(22836911-22837078)
chr1 (209-338)||(22250776-22250905)
chr1 (66-160)||(8539490-8539584)
chr1 (66-160)||(8604729-8604823)
chr1 (49-231)||(22352601-22352785)
chr1 (45-223)||(44036401-44036582)
chr1 (135-401)||(51657986-51658255)
chr1 (65-174)||(5769744-5769853)
chr1 (135-231)||(20895390-20895486)
chr1 (135-283)||(20956627-20956776)
chr1 (49-265)||(15862938-15863149)
chr1 (65-179)||(20821476-20821590)
chr1 (229-401)||(18505646-18505817)
chr1 (25-179)||(5471872-5472028)
chr1 (135-231)||(9785899-9785995)
chr1 (135-401)||(21716430-21716707)
chr1 (25-91)||(20526725-20526791)
chr1 (65-179)||(41213197-41213311)
chr1 (209-375)||(20895514-20895660)
chr1 (66-179)||(22144923-22145036)
chr1 (209-283)||(41217793-41217867)
chr1 (209-401)||(15863325-15863508)
chr1 (209-401)||(21857753-21857934)
chr1 (135-265)||(22250622-22250752)
chr1 (209-401)||(17146820-17147003)
chr1 (135-231)||(27673257-27673355)
chr1 (135-231)||(22365155-22365252)
chr1 (126-228)||(17147258-17147362)
chr1 (211-283)||(22352498-22352570)
chr1 (209-283)||(15863221-15863295)
chr1 (209-401)||(22352285-22352468)
chr1 (151-220)||(21857966-21858035)
chr1 (135-208)||(35935166-35935239)
chr1 (65-228)||(7642105-7642270)
chr1 (135-228)||(17003302-17003396)
chr1 (268-401)||(22364943-22365074)
chr1 (51-228)||(22034325-22034503)
chr1 (66-208)||(45050185-45050324)
chr1 (256-369)||(20589963-20590078)
chr1 (352-401)||(22080190-22080240)
chr1 (135-228)||(41392929-41393023)
chr1 (135-228)||(51451090-51451184)
chr1 (126-228)||(20826805-20826909)
chr1 (126-204)||(5073884-5073963)
chr1 (135-174)||(18505816-18505855)
chr1 (126-204)||(18602627-18602706)
chr1 (279-317)||(20444085-20444123)
chr1 (279-317)||(20529825-20529863)
chr1 (135-179)||(77632-77677)
chr1 (272-317)||(37846241-37846286)
chr1 (256-299)||(27673216-27673260)
[»] scaffold0083 (1 HSPs)
scaffold0083 (25-401)||(12488-12874)
[»] chr2 (94 HSPs)
chr2 (25-319)||(6877821-6878117)
chr2 (135-401)||(36892360-36892628)
chr2 (135-401)||(25877618-25877882)
chr2 (26-401)||(8886450-8886814)
chr2 (29-264)||(22861923-22862158)
chr2 (25-229)||(25600431-25600635)
chr2 (44-283)||(24088880-24089120)
chr2 (25-209)||(19434958-19435144)
chr2 (210-401)||(42180210-42180402)
chr2 (45-262)||(43644471-43644688)
chr2 (25-179)||(19658470-19658625)
chr2 (209-401)||(21276342-21276535)
chr2 (25-231)||(15631864-15632071)
chr2 (215-401)||(24966425-24966609)
chr2 (44-174)||(4795-4925)
chr2 (25-174)||(25304094-25304244)
chr2 (218-386)||(12638003-12638171)
chr2 (25-152)||(27260130-27260257)
chr2 (216-401)||(21140139-21140325)
chr2 (44-174)||(23823027-23823157)
chr2 (44-174)||(23824971-23825101)
chr2 (44-174)||(23832106-23832236)
chr2 (25-180)||(43641346-43641502)
chr2 (135-401)||(7319718-7319989)
chr2 (25-174)||(19670629-19670778)
chr2 (45-223)||(22282601-22282782)
chr2 (25-174)||(24296071-24296221)
chr2 (135-401)||(28972272-28972543)
chr2 (135-401)||(31832-32102)
chr2 (47-223)||(22273368-22273547)
chr2 (126-283)||(12643600-12643758)
chr2 (209-401)||(12643812-12644000)
chr2 (133-401)||(269422-269693)
chr2 (209-301)||(25600309-25600401)
chr2 (136-401)||(24573051-24573320)
chr2 (209-319)||(15631702-15631812)
chr2 (49-228)||(22692768-22692949)
chr2 (49-228)||(22697415-22697596)
chr2 (135-401)||(22581588-22581858)
chr2 (315-401)||(4450084-4450171)
chr2 (65-179)||(18534350-18534464)
chr2 (69-179)||(24272579-24272689)
chr2 (51-179)||(22137341-22137469)
chr2 (151-231)||(461139-461219)
chr2 (209-401)||(3801123-3801306)
chr2 (209-401)||(38706810-38706993)
chr2 (151-223)||(9654507-9654579)
chr2 (51-228)||(12637665-12637843)
chr2 (151-231)||(20629034-20629114)
chr2 (51-228)||(21140355-21140533)
chr2 (209-401)||(34822315-34822498)
chr2 (151-229)||(24966692-24966770)
chr2 (135-284)||(22691607-22691758)
chr2 (135-284)||(22696254-22696405)
chr2 (51-228)||(21276027-21276205)
chr2 (216-283)||(12637873-12637940)
chr2 (315-401)||(22691823-22691910)
chr2 (315-401)||(22696470-22696557)
chr2 (315-401)||(25600173-25600260)
chr2 (44-204)||(24687161-24687322)
chr2 (51-228)||(3800613-3800791)
chr2 (330-401)||(8941712-8941784)
chr2 (330-401)||(19888848-19888920)
chr2 (209-386)||(25210909-25211076)
chr2 (51-228)||(34822676-34822854)
chr2 (216-283)||(34822578-34822645)
chr2 (332-401)||(6877721-6877791)
chr2 (135-228)||(19888362-19888456)
chr2 (209-317)||(20629142-20629243)
chr2 (209-317)||(43644713-43644814)
chr2 (51-228)||(12726531-12726709)
chr2 (209-281)||(25211108-25211180)
chr2 (216-283)||(3800822-3800889)
chr2 (135-228)||(5889880-5889974)
chr2 (209-401)||(9654615-9654792)
chr2 (135-228)||(11232835-11232929)
chr2 (135-228)||(14908022-14908116)
chr2 (135-228)||(22514682-22514776)
chr2 (135-228)||(28777283-28777377)
chr2 (329-401)||(22654339-22654412)
chr2 (151-208)||(24828161-24828218)
chr2 (151-208)||(24832613-24832670)
chr2 (151-231)||(720835-720918)
chr2 (126-228)||(8942124-8942228)
chr2 (51-228)||(23773015-23773193)
chr2 (126-204)||(17398170-17398249)
chr2 (209-283)||(3800969-3801043)
chr2 (135-228)||(20013601-20013695)
chr2 (332-401)||(22273164-22273233)
chr2 (135-228)||(23818658-23818752)
chr2 (209-283)||(24089074-24089146)
chr2 (158-208)||(25211379-25211429)
chr2 (210-263)||(461007-461060)
chr2 (272-317)||(23806359-23806404)
[»] scaffold0462 (1 HSPs)
scaffold0462 (25-401)||(4425-4805)
[»] scaffold0395 (1 HSPs)
scaffold0395 (25-401)||(13964-14354)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (135-401)||(31038-31304)
[»] scaffold0008 (3 HSPs)
scaffold0008 (135-401)||(20860-21128)
scaffold0008 (134-401)||(28450-28719)
scaffold0008 (49-223)||(129700-129877)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (25-317)||(249025-249313)
[»] scaffold0447 (6 HSPs)
scaffold0447 (25-231)||(3095-3301)
scaffold0447 (209-283)||(2737-2811)
scaffold0447 (209-283)||(2865-2939)
scaffold0447 (209-276)||(2616-2683)
scaffold0447 (209-283)||(2993-3067)
scaffold0447 (315-401)||(2475-2561)
[»] scaffold0383 (7 HSPs)
scaffold0383 (25-231)||(5703-5909)
scaffold0383 (135-265)||(813-943)
scaffold0383 (209-276)||(5480-5547)
scaffold0383 (209-283)||(5601-5675)
scaffold0383 (209-401)||(328-511)
scaffold0383 (315-401)||(5339-5425)
scaffold0383 (209-283)||(641-715)
[»] scaffold0622 (3 HSPs)
scaffold0622 (25-283)||(7842-8108)
scaffold0622 (209-385)||(7453-7631)
scaffold0622 (209-286)||(7682-7759)
[»] scaffold0480 (1 HSPs)
scaffold0480 (134-401)||(7012-7287)
[»] scaffold0396 (4 HSPs)
scaffold0396 (25-229)||(13680-13884)
scaffold0396 (49-228)||(15922-16103)
scaffold0396 (209-302)||(13914-14007)
scaffold0396 (326-401)||(14078-14154)
[»] scaffold2147 (1 HSPs)
scaffold2147 (135-401)||(535-802)
[»] scaffold0434 (2 HSPs)
scaffold0434 (25-231)||(3129-3335)
scaffold0434 (209-401)||(2907-3101)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (25-283)||(3784-4044)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (135-401)||(1046-1307)
[»] scaffold0195 (8 HSPs)
scaffold0195 (25-284)||(19799-20067)
scaffold0195 (25-230)||(17776-17983)
scaffold0195 (25-178)||(8140-8293)
scaffold0195 (25-178)||(13529-13682)
scaffold0195 (209-401)||(17526-17716)
scaffold0195 (209-401)||(19556-19746)
scaffold0195 (329-401)||(8466-8539)
scaffold0195 (329-401)||(13855-13928)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (25-208)||(27067-27250)
scaffold0120 (321-386)||(26889-26954)
[»] scaffold0009 (5 HSPs)
scaffold0009 (217-401)||(236412-236597)
scaffold0009 (25-230)||(236652-236857)
scaffold0009 (45-283)||(270545-270785)
scaffold0009 (209-401)||(270329-270515)
scaffold0009 (85-129)||(255963-256007)
[»] scaffold0116 (3 HSPs)
scaffold0116 (209-401)||(27950-28145)
scaffold0116 (135-283)||(28179-28327)
scaffold0116 (209-283)||(28125-28199)
[»] scaffold0051 (2 HSPs)
scaffold0051 (25-264)||(56369-56615)
scaffold0051 (229-401)||(56206-56370)
[»] scaffold0269 (4 HSPs)
scaffold0269 (210-401)||(3055-3248)
scaffold0269 (209-401)||(281-477)
scaffold0269 (49-209)||(577-739)
scaffold0269 (135-223)||(3430-3518)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (210-401)||(30650-30843)
scaffold0049 (135-223)||(31002-31090)
[»] scaffold0190 (2 HSPs)
scaffold0190 (25-284)||(8493-8754)
scaffold0190 (346-401)||(8387-8443)
[»] scaffold0359 (2 HSPs)
scaffold0359 (209-401)||(13548-13740)
scaffold0359 (135-259)||(13434-13557)
[»] scaffold0138 (3 HSPs)
scaffold0138 (135-401)||(15006-15271)
scaffold0138 (210-401)||(26451-26642)
scaffold0138 (25-118)||(23915-24009)
[»] scaffold0673 (2 HSPs)
scaffold0673 (135-319)||(3707-3893)
scaffold0673 (315-401)||(3927-4014)
[»] scaffold0483 (2 HSPs)
scaffold0483 (209-401)||(4638-4831)
scaffold0483 (49-231)||(4250-4435)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (209-401)||(49478-49671)
scaffold0109 (49-231)||(49090-49275)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (135-294)||(26416-26575)
scaffold0037 (25-145)||(70883-71003)
scaffold0037 (141-401)||(66322-66592)
scaffold0037 (332-401)||(26590-26660)
[»] scaffold0077 (1 HSPs)
scaffold0077 (209-401)||(21633-21827)
[»] scaffold0023 (5 HSPs)
scaffold0023 (209-401)||(156183-156376)
scaffold0023 (209-401)||(85966-86149)
scaffold0023 (53-229)||(34811-34989)
scaffold0023 (216-283)||(156062-156129)
scaffold0023 (135-228)||(155937-156031)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (25-178)||(71768-71922)
scaffold0058 (329-401)||(72093-72166)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (218-401)||(2474-2658)
scaffold0342 (135-401)||(4078-4346)
[»] scaffold0034 (3 HSPs)
scaffold0034 (209-399)||(77600-77793)
scaffold0034 (151-209)||(77919-77977)
scaffold0034 (256-303)||(35999-36047)
[»] scaffold0610 (2 HSPs)
scaffold0610 (25-175)||(2112-2262)
scaffold0610 (329-401)||(2438-2511)
[»] scaffold0253 (1 HSPs)
scaffold0253 (218-401)||(14849-15032)
[»] scaffold0022 (6 HSPs)
scaffold0022 (25-174)||(106409-106559)
scaffold0022 (155-401)||(113902-114150)
scaffold0022 (49-228)||(6649-6830)
scaffold0022 (66-179)||(130409-130522)
scaffold0022 (49-228)||(58936-59117)
scaffold0022 (135-231)||(108058-108156)
[»] scaffold0292 (2 HSPs)
scaffold0292 (210-401)||(17735-17928)
scaffold0292 (135-231)||(18055-18151)
[»] scaffold0191 (1 HSPs)
scaffold0191 (215-401)||(499-683)
[»] scaffold0125 (1 HSPs)
scaffold0125 (209-386)||(29653-29830)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (64-241)||(68785-68964)
scaffold0031 (225-398)||(68597-68773)
scaffold0031 (25-72)||(69394-69441)
scaffold0031 (184-401)||(30314-30531)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (209-401)||(33395-33580)
scaffold0184 (45-223)||(32688-32869)
scaffold0184 (135-258)||(33725-33848)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (209-401)||(39264-39449)
scaffold0078 (45-223)||(39975-40156)
scaffold0078 (135-258)||(38996-39119)
[»] scaffold0338 (2 HSPs)
scaffold0338 (209-398)||(6984-7175)
scaffold0338 (135-219)||(7214-7298)
[»] scaffold0507 (1 HSPs)
scaffold0507 (25-174)||(4842-4991)
[»] scaffold0158 (2 HSPs)
scaffold0158 (252-401)||(23040-23190)
scaffold0158 (333-401)||(16376-16445)
[»] scaffold0597 (2 HSPs)
scaffold0597 (45-283)||(2627-2869)
scaffold0597 (209-401)||(2899-3083)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (151-401)||(19248-19489)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (211-370)||(94335-94495)
scaffold0044 (184-231)||(94695-94742)
[»] scaffold0028 (5 HSPs)
scaffold0028 (135-283)||(90600-90748)
scaffold0028 (44-153)||(78228-78337)
scaffold0028 (209-401)||(90802-91018)
scaffold0028 (67-228)||(128867-129026)
scaffold0028 (209-283)||(128730-128804)
[»] scaffold0025 (4 HSPs)
scaffold0025 (45-223)||(145016-145195)
scaffold0025 (45-223)||(147275-147454)
scaffold0025 (209-263)||(144926-144980)
scaffold0025 (209-263)||(147185-147239)
[»] scaffold0095 (2 HSPs)
scaffold0095 (25-174)||(7153-7303)
scaffold0095 (329-401)||(7416-7489)
[»] scaffold0053 (1 HSPs)
scaffold0053 (44-174)||(78342-78472)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (25-174)||(118094-118244)
scaffold0016 (135-219)||(163817-163901)
[»] scaffold0032 (5 HSPs)
scaffold0032 (47-229)||(54118-54300)
scaffold0032 (49-265)||(109582-109799)
scaffold0032 (209-283)||(109897-109971)
scaffold0032 (209-317)||(54011-54112)
scaffold0032 (210-263)||(110002-110055)
[»] scaffold0004 (3 HSPs)
scaffold0004 (45-223)||(197600-197778)
scaffold0004 (65-179)||(84942-85056)
scaffold0004 (65-179)||(26080-26194)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (132-401)||(1652-1925)
[»] scaffold0315 (2 HSPs)
scaffold0315 (209-344)||(16826-16961)
scaffold0315 (151-209)||(17070-17128)
[»] scaffold0080 (1 HSPs)
scaffold0080 (25-195)||(25101-25274)
[»] scaffold0013 (1 HSPs)
scaffold0013 (44-166)||(34006-34128)
[»] scaffold0003 (3 HSPs)
scaffold0003 (45-223)||(217246-217426)
scaffold0003 (217-401)||(5221-5396)
scaffold0003 (135-228)||(5661-5755)
[»] scaffold0193 (1 HSPs)
scaffold0193 (65-209)||(3244-3393)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (209-401)||(9930-10122)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (45-231)||(11532-11716)
scaffold0467 (268-317)||(11796-11845)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (49-228)||(4320-4501)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (135-394)||(6123-6386)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (52-223)||(5102-5274)
scaffold0266 (135-223)||(12788-12876)
[»] scaffold0346 (3 HSPs)
scaffold0346 (25-173)||(14101-14250)
scaffold0346 (209-285)||(15935-16011)
scaffold0346 (157-231)||(15833-15907)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (49-228)||(51511-51690)
[»] scaffold0039 (3 HSPs)
scaffold0039 (209-344)||(21158-21288)
scaffold0039 (135-231)||(20906-21002)
scaffold0039 (209-283)||(21030-21104)
[»] scaffold0808 (1 HSPs)
scaffold0808 (135-401)||(3125-3395)
[»] scaffold0407 (3 HSPs)
scaffold0407 (209-401)||(6410-6583)
scaffold0407 (135-231)||(6310-6406)
scaffold0407 (305-401)||(22-119)
[»] scaffold0225 (2 HSPs)
scaffold0225 (49-228)||(14779-14958)
scaffold0225 (49-228)||(28300-28479)
[»] scaffold0786 (2 HSPs)
scaffold0786 (44-179)||(211-346)
scaffold0786 (44-179)||(5266-5401)
[»] scaffold0390 (1 HSPs)
scaffold0390 (44-179)||(3799-3934)
[»] scaffold0327 (1 HSPs)
scaffold0327 (44-163)||(4568-4686)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (217-401)||(75550-75727)
scaffold0001 (135-206)||(72106-72177)
[»] scaffold1753 (1 HSPs)
scaffold1753 (45-169)||(1-126)
[»] scaffold0134 (2 HSPs)
scaffold0134 (220-343)||(25594-25718)
scaffold0134 (219-283)||(25735-25799)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (49-228)||(106479-106660)
scaffold0026 (209-401)||(27169-27352)
[»] scaffold0103 (2 HSPs)
scaffold0103 (135-300)||(31925-32093)
scaffold0103 (326-401)||(31776-31850)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (49-230)||(1292-1469)
[»] scaffold1404 (1 HSPs)
scaffold1404 (49-228)||(35-215)
[»] scaffold0106 (2 HSPs)
scaffold0106 (135-223)||(40010-40098)
scaffold0106 (330-401)||(37627-37697)
[»] scaffold0073 (1 HSPs)
scaffold0073 (65-169)||(55922-56026)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (213-374)||(44288-44443)
scaffold0066 (228-374)||(52457-52597)
[»] scaffold0132 (1 HSPs)
scaffold0132 (45-223)||(41190-41371)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (49-228)||(9426-9607)
[»] scaffold0014 (2 HSPs)
scaffold0014 (155-283)||(145283-145413)
scaffold0014 (329-401)||(144987-145060)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (49-223)||(7465-7641)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (279-374)||(12989-13085)
scaffold0130 (330-401)||(31120-31192)
scaffold0130 (225-283)||(31333-31391)
[»] scaffold1140 (2 HSPs)
scaffold1140 (151-229)||(1509-1587)
scaffold1140 (268-401)||(1298-1427)
[»] scaffold0018 (2 HSPs)
scaffold0018 (45-111)||(52771-52837)
scaffold0018 (45-111)||(56723-56789)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (209-401)||(804-987)
[»] scaffold0384 (2 HSPs)
scaffold0384 (136-228)||(1-94)
scaffold0384 (209-401)||(264-448)
[»] scaffold0226 (1 HSPs)
scaffold0226 (330-401)||(15167-15239)
[»] scaffold0218 (2 HSPs)
scaffold0218 (151-223)||(6826-6898)
scaffold0218 (209-401)||(6934-7115)
[»] scaffold0450 (2 HSPs)
scaffold0450 (315-401)||(4639-4725)
scaffold0450 (216-284)||(4528-4596)
[»] scaffold0107 (1 HSPs)
scaffold0107 (51-204)||(29855-30009)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (44-228)||(17586-17771)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (135-228)||(37768-37862)
[»] scaffold0057 (1 HSPs)
scaffold0057 (65-111)||(4532-4578)
[»] scaffold0750 (1 HSPs)
scaffold0750 (135-284)||(2839-2989)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (135-284)||(26542-26692)
scaffold0124 (135-228)||(3160-3254)
[»] scaffold0112 (1 HSPs)
scaffold0112 (85-129)||(12285-12329)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (135-228)||(25382-25476)
[»] scaffold0121 (1 HSPs)
scaffold0121 (360-401)||(7299-7341)
[»] scaffold0521 (1 HSPs)
scaffold0521 (154-227)||(7049-7125)


Alignment Details
Target: scaffold0240 (Bit Score: 305; Significance: 1e-171; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 305; E-Value: 1e-171
Query Start/End: Original strand, 26 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6221 - 5845
Alignment:
Q  26 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  6221 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgtt 6122  T
Q  126 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6121 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattgat 6022  T
Q  226 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatga 325  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  6021 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttaatgtaactatatgtatga 5922  T
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  5921 gaatgttattattgatcaaatacatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 5845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 294; Significance: 1e-165; HSPs: 3)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 294; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 138296 - 138673
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  138296 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgt 138395  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  138396 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 138495  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatg 324  Q
    ||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  138496 tgattgtgtataaataattttgaattgatatttgttcatgaaacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtataagtatg 138595  T
Q  325 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    | |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  138596 aaaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgatgatgt 138673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #2
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 76853 - 76589
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  76853 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgca 76754  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||  |||||||||    
T  76753 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatatgaatattat 76654  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||   ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76653 ta---atcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 76589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 155 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 10148 - 10003
Alignment:
Q  155 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 251  Q
    |||||||||||||||||||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||||| ||||  |||    
T  10148 tggtaccacatgcatgtatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattgctgaaatgtgaatgatgattgtgtatgaataaatgtgatttg 10050  T
Q  252 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagata 297  Q
    ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||| |||||    
T  10049 atgattgttcatggcacatgtgattgatgattaattgatgtgagata 10003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 291; Significance: 1e-163; HSPs: 95)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 26071753 - 26072131
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26071753 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26071852  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26071853 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26071952  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26071953 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26072052  T
Q  324 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26072053 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26072131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 26095540 - 26095918
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26095540 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 26095639  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  | |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26095640 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccgataccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 26095739  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  26095740 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 26095839  T
Q  324 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26095840 gagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26095918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3893772 - 3893381
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  3893772 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 3893673  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  3893672 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 3893573  T
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag- 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||     
T  3893572 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggttttgatgtaagt 3893473  T
Q  315 -----tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
         ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  3893472 atatatatatttatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3893381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12753558 - 12753172
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  12753558 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttaaatacgatgtttttgt 12753459  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc---ttattgatatat----- 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||   || |||| || |         
T  12753458 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttttgaaatgtgattg 12753359  T
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg-gggtttgatgtaag 314  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| ||   ||||||  || ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |  | |||| ||||    
T  12753358 gtgattggtgactgtgtatgaataactgcaaattgatgatttttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagaatgtgatataag 12753259  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| | | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12753258 tat-tatttgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 12753172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 136 - 401
Target Start/End: Original strand, 15824105 - 15824371
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtat 235  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |||||    
T  15824105 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgtttggtgattatgtat 15824204  T
Q  236 gaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 335  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15824205 gaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 15824304  T
Q  336 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15824305 attgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15824371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44863711 - 44863443
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  44863711 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 44863612  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44863611 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgcgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtataagtatgagaatatta 44863512  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  44863511 ttattgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 44863443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 142136 - 141869
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||    
T  142136 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgttgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggttattgtgta 142037  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  142036 tgaataattgtgaattgatattcgttcatgacacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 141937  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  141936 tattgatcaagtgcatgatgattaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 141869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47288244 - 47287976
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||    
T  47288244 gtgacaaccttgggatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtaattggtgattgtgta 47288145  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47288144 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggtttttgatgtaagtatatgtacgagaatatta 47288045  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  47288044 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 47287976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 112784 - 113168
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  112784 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaaggattgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 112883  T
Q  125 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-------tgatat 214  Q
    ||||||||| ||   |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||    
T  112884 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgtgttaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgat 112983  T
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 314  Q
      ||||||||| |||| |||||||||| |||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  112984 tggtgattgataattgcgtatgaataaatgtgaattgttgtttgttcatgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattgagttttgatgtaag 113083  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| |   | || |||||||||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  113084 tattgatatgtg---actactattgatcaagtgcataatgtttattttgaaatattcatgctaaatgttatttggattatgatgatgt 113168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 25 - 299
Target Start/End: Original strand, 45453745 - 45454016
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||   ||||||    
T  45453745 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacga---ttttgt 45453841  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   || ||||||||     
T  45453842 tgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaat-tgtgattgg 45453940  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatatt 299  Q
    ||||||||||||||||  |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  45453941 tgattgtgtatgaatagctgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatatt 45454016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 25 - 301
Target Start/End: Original strand, 1938257 - 1938532
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||      
T  1938257 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagagttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttta 1938356  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    | |||| || |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | | |||||||     
T  1938357 t-catcaaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaacgtgattgg 1938455  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 301  Q
    |||||  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  1938456 tgattacgtatgcataattgtgtattgatatttgtccatgacacatgtgattggtggttattgatgtgagatattgg 1938532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 7286328 - 7286522
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  7286328 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttg 7286427  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||||||||    
T  7286428 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgttgattatgatgatgt 7286522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 12545607 - 12545802
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||  |||    
T  12545607 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattgttgatgtgagatattggggttttt 12545706  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||| || |||| |||||||||||    
T  12545707 gatgtaagtatatgtataagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgtaatgtggactatgatgatgt 12545802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 18305642 - 18305831
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  18305642 gatatatgtgattgacgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttggt 18305741  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18305742 gtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18305831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 13867887 - 13868080
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tga 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||| | || |||    
T  13867887 gatatatgtgattggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattgagattatga 13867986  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    | ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  13867987 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 13868080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 208 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7291102 - 7290908
Alignment:
Q  208 ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttg 307  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  7291102 ttgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttg 7291003  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7291002 atgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7290908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 15913921 - 15914075
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15913921 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 15914020  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  15914021 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 15914075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 2192606 - 2192799
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  2192606 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 2192705  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  2192706 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatttggattatgataatgt 2192799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 369336 - 369143
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  369336 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattggtgatgattgatgtgagatattggggtttga 369237  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  369236 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 369143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 14253071 - 14253263
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14253071 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgt-catgacacatgtgattggttattattgatgtgagatattggggtttga 14253169  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14253170 tgtaagtattgatttgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 14253263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 16480836 - 16481029
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16480836 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 16480935  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16480936 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcatgtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 16481029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 15952859 - 15953050
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  15952859 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 15952958  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  15952959 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 15953050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 9058141 - 9058311
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| | |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  9058141 ttgtagctttaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 9058240  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  9058241 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 9058311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 49049452 - 49049723
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||||| | |||||| |||| | |||    
T  49049452 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattgatgaaatgtgaatgattagtgt 49049551  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  49049552 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatgtggat 49049649  T
Q  330 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  49049650 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 49049723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13388643 - 13388493
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  || |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| ||    
T  13388643 catcatagtcatgttgagtcttatagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaatacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttctg 13388544  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13388543 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13388493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Original strand, 15761867 - 15762051
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  15761867 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 15761965  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  15761966 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 15762051  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 32496053 - 32496242
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32496053 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaacgcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32496152  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  32496153 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 32496242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13376324 - 13376200
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13376324 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgg-tgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgag 13376226  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||| ||||||| |||||| ||||    
T  13376225 gtgattcggtaccatatgcatttatg 13376200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15629255 - 15629004
Alignment:
Q  155 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattg 251  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||||||| ||||  |||    
T  15629255 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtgcatgaataaatgtgagttg 15629156  T
Q  252 atatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatta-ttgatcaagtac 348  Q
    ||  |||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| || ||  ||| | |||| |||  | ||||||| | ||||| ||||||    
T  15629155 atgattgttcataacacatctgattggtgattaattgatgtaagatattgggattatg--gtatgaatatatatatggatattatgatttgattaagtac 15629058  T
Q  349 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  15629057 atgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 15629004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 20587140 - 20587254
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20587140 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 20587239  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20587240 tgcatatatgtgtcg 20587254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 13867688 - 13867784
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  13867688 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgt 13867784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 136 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13273246 - 13272976
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 232  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||||||    
T  13273246 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgtg 13273147  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
     ||| |||| ||||  |||||  ||||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||| || ||  ||| | || | |||| | |||    
T  13273146 catggataaatgtgatttgatgattgttccagacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatatcgggattatg--gtatgaatgtatatgtggata 13273049  T
Q  331 ttatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||| ||| || |||||| || |||||||||||||    
T  13273048 ttattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcttgtcaactgttatgtgaattatgatgatgt 13272976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Original strand, 8565108 - 8565212
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8565108 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttattgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 8565207  T
Q  165 tgcat 169  Q
    |||||    
T  8565208 tgcat 8565212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Original strand, 15762262 - 15762429
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  15762262 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 15762354  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  15762355 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 15762429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 18255324 - 18255505
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||| | | | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  18255324 gttgtaaaagggctaagcgcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 18255422  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18255423 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18255505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 3058713 - 3058585
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  3058713 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 3058615  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |  || ||||||||||||||||||| ||||    
T  3058614 tttggagatttggtaccacatgcatttatg 3058585  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 9322594 - 9322703
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9322594 actcttttacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 9322693  T
Q  165 tgcatgtatg 174  Q
    ||||| ||||    
T  9322694 tgcatatatg 9322703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11285715 - 11285619
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  11285715 gtgacgaccttgagttaatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattaatgattgt 11285619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 28719091 - 28718977
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    |||| |||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28719091 actcgtttacttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatgtgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgacttggtaccaca 28718992  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  28718991 tgcatatatgtgtcg 28718977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 11582535 - 11582631
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  11582535 gtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 11582631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 126 - 265
Target Start/End: Original strand, 15952673 - 15952813
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||  | || |||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  15952673 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagacttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgaaaatgtgattgg 15952772  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
     ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  15952773 agattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 15952813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Original strand, 16571751 - 16571921
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16571751 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16571850  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 302  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16571851 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16571921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 16593911 - 16593741
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| | |||||||| |||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  16593911 gtgatgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacaacatgacataagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 16593812  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 302  Q
    ||||||||| ||||  |||||  ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  16593811 tatgaataactgtgagttgatgattgttcacgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaggtattggg 16593741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 158
Target Start/End: Complemental strand, 125492 - 125378
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  125492 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtaaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 125393  T
Q  144 ttgaggtgatttggt 158  Q
    ||  || ||||||||    
T  125392 ttttggagatttggt 125378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Original strand, 16571983 - 16572053
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16571983 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16572053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16593679 - 16593609
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  16593679 tattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 16593609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 45 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 2027222 - 2027097
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||| | |||||||||    
T  2027222 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagtcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcggaggtgacgacc 2027123  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    ||   | |||||||||||||||||||    
T  2027122 ttttcgagatttggtaccacatgcat 2027097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 134 - 231
Target Start/End: Original strand, 13038808 - 13038905
Alignment:
Q  134 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||    
T  13038808 agtgacgaccctgaaatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagttttattgatatatgtgattggtgattgt 13038905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 2024858 - 2024757
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatg----tgattggtgattattgatgtaagatattggggt 304  Q
    |||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| |    |||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  2024858 tgatgtatatgattgatgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattgattggtgattattgatgtgagatattgcggt 2024759  T
Q  305 tt 306  Q
    ||    
T  2024758 tt 2024757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 10862515 - 10862683
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||  ||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||| |||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  10862515 gtgacgaccttgaagtgatttgctactgcatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacataagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 10862614  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgg 301  Q
      ||| |||| ||||  |||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10862615 tcatg-ataaatgtg-gttgatgattgttcatgacacatgtgattggtggttacttaatgtaagatattgg 10862683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 270
Target Start/End: Original strand, 12249771 - 12249908
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||  ||| ||||    
T  12249771 gtgacgactttgaagtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatttcgaaatgtgattagtgaatgtg 12249870  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacat 270  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||    
T  12249871 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacat 12249908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 12545404 - 12545501
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgattt-ggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  12545404 gtgacgaccttgaggtgattttggtaccacatgcatatatgtgtcaattggtgcatatcatgacataagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 12545501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 12545553 - 12545627
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  12545553 tgatatatgggattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtgattggtgatt 12545627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 36051147 - 36051075
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  36051147 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataacataacatgagtcttattgatatatgtgattg 36051075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 126 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 369471 - 369364
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || ||||||||    
T  369471 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattg 369372  T
Q  224 atgattgt 231  Q
     |||||||    
T  369371 gtgattgt 369364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 10988271 - 10988092
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  10988271 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 10988174  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  10988173 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 10988092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 152 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 123059 - 122987
Alignment:
Q  152 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||||| ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  123059 atttggcaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 122987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 16210263 - 16210183
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  |||||||    
T  16210263 gatttggtaccacgtgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgatttgtgattgt 16210183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 26010695 - 26010874
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatta-tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaa-gtgacgaccttgag 148  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||| ||||||||||||      
T  26010695 tgtaaaagggttgaactcttttacttc-gagattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26010793  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||| ||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  26010794 gagatttggcaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 26010874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 184 - 238
Target Start/End: Original strand, 18305492 - 18305546
Alignment:
Q  184 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaa 238  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||||    
T  18305492 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtggttggtgattgtttatgaa 18305546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 337 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2024757 - 2024692
Alignment:
Q  337 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2024757 ttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2024692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 152 - 228
Target Start/End: Original strand, 2192376 - 2192453
Alignment:
Q  152 atttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  2192376 atttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 2192453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 15518435 - 15518539
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  15518435 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 15518534  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  15518535 gtgat 15518539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16416684 - 16416509
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  16416684 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 16416592  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  16416591 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 16416509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 16480710 - 16480782
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16480710 atatttgtgattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 16480782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 45455505 - 45455581
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||| |||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  45455505 gaatatcattattgatcaagtatatgatttttgaattaaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 45455581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 2436285 - 2436110
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||| ||||| |||  | |||| || |||||||||||       
T  2436285 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgtgatgtgttttat-catcaaaggtgacgaccttttt 2436191  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  2436190 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 2436110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 171 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 2024998 - 2024904
Alignment:
Q  171 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    |||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2024998 tatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2024904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4483364 - 4483318
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  4483364 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 4483318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 7291335 - 7291277
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  7291335 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 7291277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7821500 - 7821406
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7821500 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7821406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 7828811 - 7828717
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  7828811 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 7828717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16417043 - 16416949
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  16417043 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 16416949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 16480605 - 16480683
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||| ||||  || ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  16480605 gatttggtaccacatgcatttatgtatcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 16480683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 27103134 - 27103228
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27103134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27103228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 27110482 - 27110576
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27110482 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27110576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27175192 - 27175098
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27175192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 27175098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 38785226 - 38785320
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  38785226 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 38785320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 2192480 - 2192552
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||| |||||||| | ||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  2192480 atatttgttattggtgattgtgaaggaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 2192552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 127 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 4483320 - 4483268
Alignment:
Q  127 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  4483320 catcgaaggtgacgaccttgacgtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 4483268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 11582659 - 11582840
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||| ||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||| ||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  11582659 tgataaatgtggttggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtccatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 11582751  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||| ||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11582752 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattaatcaaatgcatgatgtt--aattgaactattcatgataactgttatttggattatgataatgt 11582840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 13757225 - 13757060
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  13757225 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 13757127  T
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  13757126 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 13757060  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3055241 - 3055193
Alignment:
Q  184 gtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  3055241 gtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 3055193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 25293856 - 25293960
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  25293856 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 25293955  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  25293956 gtgat 25293960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 122951 - 122854
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| || |||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| |||    
T  122951 tgataaatgtaattggtgattgtgaattaatagttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtga 122859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11514698 - 11514604
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  11514698 gtgacgaccttgtagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 11514604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 13038989 - 13039114
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 369  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||||||| |||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  13038989 tgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattatggatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 13039081  T
Q  370 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13039082 tcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13039114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 15443146 - 15443240
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  15443146 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 15443240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 30263727 - 30263805
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  30263727 gatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 30263805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 203
Target Start/End: Original strand, 42057741 - 42057819
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 203  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||    
T  42057741 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagt 42057819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 3193586 - 3193630
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 130  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    
T  3193586 atgtaagacgggtgtgaaatgttacat-tgatgtttttgttgcatc 3193630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16210045 - 16209975
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| |||  |||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16210045 attattattgatcaaatgcatgatgttaata--gaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 16209975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 52 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 19066262 - 19066193
Alignment:
Q  52 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttt 121  Q
    ||||||||| ||  |||||||||||||| ||  |||||||||||  ||||||||||||||  ||||||||    
T  19066262 gtaaaaggggtgtgctcttttacttcggcgaaaatgtaagacggacgtgaaatcttacataggatgtttt 19066193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 86 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 13460958 - 13460914
Alignment:
Q  86 tgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 130  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13460958 tgtaatacgggagtgaaatcttacatttgatgtttttgttgcatc 13460914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 224
Target Start/End: Original strand, 13912691 - 13912791
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| |||  || |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13912691 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccgtaagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13912790  T
Q  224 a 224  Q
    |    
T  13912791 a 13912791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 279; Significance: 1e-156; HSPs: 91)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31627117 - 31626739
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  31627117 catcatagtcgtgttgagaatgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 31627018  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  31627017 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgg 31626918  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtat 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  31626917 tgattgtgtatgaataattgtgaattaatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtat 31626818  T
Q  324 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  31626817 gagaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattaagatgatgt 31626739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 29 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18775886 - 18775506
Alignment:
Q  29 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 128  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||| |    
T  18775886 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtctttgttgta 18775787  T
Q  129 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------gtgat 221  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| |||||||||   | ||       |||||    
T  18775786 tcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacataagtcttatttgaaaatgtgaatggtgat 18775687  T
Q  222 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgt 321  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | |    
T  18775686 tggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatttttgtttatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattttt 18775587  T
Q  322 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |  |||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  18775586 ttttgaattttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattataatgatgt 18775506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 29 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22428850 - 22428473
Alignment:
Q  29 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 128  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  22428850 atagtcgtgttgagtttgtagttgtaaaagggttcaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcgtacatacgatgtttttgttgca 22428751  T
Q  129 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   | ||||||||| ||||    
T  22428750 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgat 22428651  T
Q  229 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtat--atgtatg 324  Q
    ||||||||||||| | || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | ||||||||||||  || |||     
T  22428650 tgtgtatgaataactatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgatgtaagtattgatatatt 22428551  T
Q  325 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     || ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22428550 tgagtattattgttgatcaagtacatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22428473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 198; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16105237 - 16104850
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16105237 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16105138  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| ||  |||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  16105137 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggttatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtacatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgatta 16105038  T
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt-ggggtttgatgtaag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||    
T  16105037 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgataggtgattaattgatgtgagatattgggggtatgatgtaag 16104938  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16104937 tattgttatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttataacgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16104850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 25646518 - 25646786
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||     
T  25646518 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatttgattggtgattgtgtg 25646617  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25646618 tgaatagttgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaaatattggggttttgatgtaagtatatgtatgtgaatatta 25646717  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25646718 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgatgatgt 25646786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 29 - 401
Target Start/End: Original strand, 25745792 - 25746160
Alignment:
Q  29 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  25745792 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacaggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 25745891  T
Q  129 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----gtgat 221  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||| |||  |||||||||||||||||||||||||  || || |     |||||    
T  25745892 tcgagggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataactgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgat 25745991  T
Q  222 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatg 320  Q
    || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||| ||||||||||||||  ||              
T  25745992 tggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacacgtgattggggatttattaatgtgagatattggggttt--tg---------- 25746079  T
Q  321 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  25746080 -atgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 25746160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 35017451 - 35017645
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  35017451 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 35017550  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35017551 atgtaagtatatctatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgatatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35017645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 35011124 - 35011316
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  35011124 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 35011223  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35011224 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35011316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18128532 - 18128340
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18128532 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatatgattggagattattgatgtgagatattggggtttga 18128433  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18128432 tgtaagtatatgtatgggaatgtaattattgatcaagtgcatgatgtttaga-tgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18128340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18579027 - 18578834
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  18579027 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttga 18578928  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18578927 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcatatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatcatgt 18578834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Original strand, 13622937 - 13623121
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  13622937 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 13623036  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13623037 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13623121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Complemental strand, 16084095 - 16083970
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16084095 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 16083996  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 150  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16083995 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 16083970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19627690 - 19627498
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19627690 gatatatatgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19627591  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || | ||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19627590 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataataatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19627498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Original strand, 14628368 - 14628545
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14628368 tgatacatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 14628467  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||||   | || ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  14628468 tgtaagtattgatgtgggaatattattaatgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatgttatatgttatt 14628545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 18004857 - 18005050
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18004857 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18004956  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| | |||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  18004957 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatgttcatgttaactattatttggattatgataatgt 18005050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 18128964 - 18128776
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  18128964 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcgaagattatgtaagacaggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 18128865  T
Q  125 tgc-----atcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
     ||     |||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||||    
T  18128864 ggcatcgaatcgaaggtgacgaactggaggtgatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttat 18128776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23975902 - 23975708
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23975902 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 23975803  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23975802 tgtaagtattgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 18843708 - 18843900
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18843708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggttttg 18843807  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   ||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18843808 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattaaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18843900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 13016436 - 13016702
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat--atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||||||| | || |||| |  || | || |||||| |||||||||||| |||  | |||||  | |||||||    
T  13016436 gtgacgaccttgagatgatatggtaccacatgcatatttgtgtcggtctatatacacatcatg-catgagtcttatcgattgaatgtgacaggtgattgt 13016534  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatat 331  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||| | | |||||||    
T  13016535 gtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatattttttagaatat 13016633  T
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| | | ||||| ||| |||||| |||||||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  13016634 tattattgatcaaatgcttgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgtatttggattatgatgatgt 13016702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 19984699 - 19984887
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  19984699 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 19984798  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||  ||  |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19984799 ttttggatatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19984887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 378
Target Start/End: Original strand, 33316422 - 33316582
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  33316422 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 33316521  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaa 378  Q
       | || ||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| ||||||||    
T  33316522 tgatgtgggaatattattattgatcaagtgcataatgtttaaattgaaatatccatgttaa 33316582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 18383173 - 18383323
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18383173 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggtttagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 18383272  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18383273 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 18383323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1554508 - 1554324
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  1554508 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 1554410  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||| ||| |||||    
T  1554409 tttggagatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgataaatgtggttggtgatt 1554324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 256
Target Start/End: Complemental strand, 18422303 - 18422182
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18422303 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgta 18422204  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatt 256  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  18422203 tgaataattgtgaattgatatt 18422182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 33323492 - 33323342
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| ||||||| || | | ||||||||||||||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33323492 catcatagtcatgttgagttttgcaattgtaaaagggttgagcttttttactacggaaattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 33323393  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| |||||| ||||    
T  33323392 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccaaatgcatttatg 33323342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 119
Target Start/End: Complemental strand, 23151939 - 23151845
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt 119  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  23151939 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtt 23151845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 16239028 - 16238848
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  16239028 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 16238930  T
Q  148 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    || ||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16238929 ggagattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 16238848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Original strand, 17790652 - 17790776
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  17790652 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttatatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 17790750  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||    
T  17790751 tagaggtgattcggtaccacatgcat 17790776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 269 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23151839 - 23151706
Alignment:
Q  269 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 368  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| ||    
T  23151839 atgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaaata 23151740  T
Q  369 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    | |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23151739 tccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 23151706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 32896492 - 32896282
Alignment:
Q  184 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-t 282  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |    
T  32896492 gtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatt 32896393  T
Q  283 tattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg 381  Q
    ||||||| | || |||||||||| ||||||||||||          |||||  ||| |||||||||||| ||||||  ||| ||||||||||| ||| ||    
T  32896392 tattgatatgagttattggggttatgatgtaagtat----------atatttatatcgatcaagtacataatgtttgaattaaattattcatggtaactg 32896303  T
Q  382 tta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  32896302 ttatttggattatgatgatgt 32896282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 25 - 168
Target Start/End: Original strand, 16889236 - 16889379
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  16889236 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagcgattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tgttg 16889334  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 168  Q
     ||||||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  16889335 atgcatcgaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgca 16889379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 335
Target Start/End: Original strand, 18825647 - 18825774
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    |||| ||| |||||| |||||||  |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  18825647 tgatgtatatgattggtgattgttcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 18825746  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattatt 335  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||    
T  18825747 atgtaagtatatatatgagaatattatt 18825774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 34965584 - 34965470
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34965584 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 34965485  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  34965484 tgcatatatgtgtcg 34965470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 150
Target Start/End: Original strand, 35137439 - 35137565
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| ||||||| || | ||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  35137439 catcatagtcatgttgagttttgcagttgtaaaagggttgagctcttttactacgaagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 35137538  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 150  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||    
T  35137539 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggt 35137565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Original strand, 25369014 - 25369184
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  25369014 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 25369113  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggg 302  Q
    | |||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||    
T  25369114 gcatgaataaatgtg-attgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattacttaatgtaagatattggg 25369184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 66 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 22846767 - 22846615
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat----gcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 161  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||     ||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||     
T  22846767 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatcgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgcggtgatttggtact 22846668  T
Q  162 acatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  22846667 acatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 22846615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11214803 - 11214623
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttga- 147  Q
    ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||       
T  11214803 gttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttt 11214705  T
Q  148 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11214704 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattgatgat 11214623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18397434 - 18397163
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg--tgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | | || | |   | || |||||| |||||||||||||| | || |||||||||||||| |    
T  18397434 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatataagtgccggtctagatacacatcatg-catgagtcttattggtgatttgtgattgatgatttt 18397336  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||||||| ||||  | |||| |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| || | ||| | |  |||| || |||||| |||| ||||    
T  18397335 gcatgaataaatgtgattggatacttgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagttgttgagatcgtgatatatgtatatatatgtgaat 18397236  T
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||| ||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||    
T  18397235 attattattgaccaagtacacgaagtttaaattgaaatattcatgttaaacgttatgtggattatgatgatgt 18397163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 213 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 1554113 - 1553946
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  1554113 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 1554021  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  1554020 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 1553946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 16134918 - 16134814
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  16134918 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgaagaccttgaggtgatttggtaccaca 16134819  T
Q  165 tgcat 169  Q
    |||||    
T  16134818 tgcat 16134814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 4989561 - 4989379
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||    
T  4989561 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttg 4989464  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattg 230  Q
      | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||    
T  4989463 ttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattg 4989379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Original strand, 35017303 - 35017387
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 219  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  35017303 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 35017387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19852909 - 19852795
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||| ||||  ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19852909 actcttttatttcgatgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 19852810  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  19852809 tgcatatatgtgtcg 19852795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 16827873 - 16828003
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 371  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  16827873 tgattgatgattattgatgtgagataatggggtttgatgtaagtattgacgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 16827972  T
Q  372 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || |||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16827973 atattaactgttatttggattatgataatgt 16828003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 18740935 - 18740863
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18740935 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 18740863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 1659212 - 1659387
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1659212 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1659306  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1659307 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgaaatatgtgattggtgat 1659387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 13622800 - 13622878
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13622800 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 13622878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 23220336 - 23220222
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||| | ||| || |||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||     | |||||||||||||||||||||||||||    
T  23220336 actcttttacttcagtgataatataagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatggataacgaccttgaggtgatttggtaccaca 23220237  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  23220236 tgcatatatgtgtcg 23220222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 14628111 - 14628289
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  14628111 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 14628208  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| ||||    
T  14628209 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgat 14628289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23976231 - 23976053
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23976231 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23976134  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23976133 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23976053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26088497 - 26088319
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  26088497 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 26088400  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  26088399 gagatttggtaccacatgcatttatgcgtccataagtgcatatcataacatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 26088319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 33316158 - 33316260
Alignment:
Q  127 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 225  Q
    ||||||| ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |    
T  33316158 catcgaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggt 33316257  T
Q  226 gat 228  Q
    |||    
T  33316258 gat 33316260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17787827 - 17787746
Alignment:
Q  321 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  17787827 tatgataatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattattattttgattatgatgatgt 17787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23976023 - 23975956
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23976023 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23975956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 16827462 - 16827559
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||    
T  16827462 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcttgacatgagtcttaaatgatgtatgtgatttatgattgt 16827559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 18004635 - 18004732
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||| | ||||||||| |||||||    
T  18004635 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgagaaatgtgattggtgattgt 18004732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Original strand, 1651466 - 1651605
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  1651466 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 1651560  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  1651561 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 1651605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 14628316 - 14628388
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  14628316 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 14628388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25173590 - 25173518
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25173590 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25173518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 16650745 - 16650899
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16650745 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16650843  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16650844 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16650899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 18825420 - 18825515
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18825420 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18825515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 4989171 - 4989004
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  4989171 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 4989079  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||||  |||| |     |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||| |||||| ||||||||    
T  4989078 tgtaagtattaatgtgt-----tattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttatttgttatt 4989004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 15738757 - 15738590
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||| ||||||||||| |  ||| | | |||||||| ||||||||    
T  15738757 gtgacgacgttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatgatgacatgagtttatttggtgaaatgtgattaatgattgt 15738658  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 300  Q
      ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||  |||||||  || |||||||||||||    
T  15738657 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacgtgtgaacggtgattgtttaatgtaagatattg 15738590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 215 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 16238765 - 16238711
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacaca 269  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  16238765 atgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacaca 16238711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18740828 - 18740645
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| || || ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||  || | |||    
T  18740828 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttttgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatatctggatgtga 18740736  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||| || |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18740735 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattcaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18740645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25174134 - 25174040
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  25174134 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 25174040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 27655670 - 27655764
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  27655670 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 27655764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 15861375 - 15861243
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||||    
T  15861375 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccacat 15861281  T
Q  166 gcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagt 203  Q
    |||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||    
T  15861280 gcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagt 15861243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 239
Target Start/End: Original strand, 28196439 - 28196546
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  28196439 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatataagtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 28196538  T
Q  232 gtatgaat 239  Q
    | ||||||    
T  28196539 gcatgaat 28196546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 16557515 - 16557669
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16557515 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16557613  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||| ||| ||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16557614 gagatttggtaccgcatacatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16557669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Original strand, 18843481 - 18843576
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  18843481 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgcgtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 18843576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 4989275 - 4989201
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  4989275 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 4989201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10487458 - 10487364
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10487458 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 10487364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 16377869 - 16377963
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16377869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16377963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 16385193 - 16385287
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16385193 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 16385287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18422185 - 18422115
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  18422185 tattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 18422115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 218 - 279
Target Start/End: Original strand, 33316292 - 33316353
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 279  Q
    ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||  ||| |||||||||||||    
T  33316292 tgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgtttctgatacatgtgattggt 33316353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 29870975 - 29871153
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  29870975 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29871072  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  29871073 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 29871153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 279
Target Start/End: Original strand, 16827663 - 16827733
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 279  Q
    |||| ||| |||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||    
T  16827663 tgatttatatgattggtgattatgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggt 16827733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 17343864 - 17343942
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||| |||||||||||||| || | ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| ||||    
T  17343864 gattcggtaccacatgcatttacgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatataagtgattggtgat 17343942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Complemental strand, 16374999 - 16374954
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 130  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||    
T  16374999 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttacatc 16374954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16230169 - 16230065
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  16230169 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 16230070  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  16230069 gtgat 16230065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23993749 - 23993645
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  23993749 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 23993650  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  23993649 gtgat 23993645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 18004770 - 18004827
Alignment:
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  18004770 tgattgtgaatgaatagttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 18004827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 19984915 - 19985096
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| || |||| |||||||     ||||  |||| |||  |||||||| |||||||| ||| |||    
T  19984915 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaatcgataattgttca-----catg--attgatgacgattgatgtgagatattgaggtgtga 19985007  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    | |||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19985008 tataagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19985096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 22227278 - 22227356
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22227278 gattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22227356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25173805 - 25173731
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  25173805 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 25173731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Original strand, 18835474 - 18835544
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18835474 attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18835544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 21930462 - 21930417
Alignment:
Q  135 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  21930462 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 21930417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 85 - 130
Target Start/End: Original strand, 31162441 - 31162486
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatc 130  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||    
T  31162441 atgtaagacggatgtcaaatcttacatatgatgtttttgttgcatc 31162486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 163 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 32896538 - 32896494
Alignment:
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta 207  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||    
T  32896538 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctta 32896494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 248; Significance: 1e-137; HSPs: 99)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37605668 - 37605283
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||    
T  37605668 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgt 37605569  T
Q  125 tgcatcgaaagtgac-gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||    
T  37605568 tgcatcgaaggtgacagaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattg 37605469  T
Q  224 a-------tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    |       ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  37605468 atgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgaaatattggggtttgatgtaagta 37605369  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  37605368 tatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaactgttatttagattatgatgatgt 37605283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 59 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41244277 - 41243948
Alignment:
Q  59 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggt 158  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41244277 ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggt 41244178  T
Q  159 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    ||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |              ||||||||||||||||||    
T  41244177 accacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgaatcttattgatatatgtgattgagg--------------attgtgtattgatatttg 41244092  T
Q  259 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttta 358  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  41244091 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttta 41243992  T
Q  359 tattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41243991 aattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41243948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25121012 - 25120745
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  25121012 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttgataattgtgta 25120913  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25120912 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatttatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 25120813  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25120812 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatacatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25120745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 19994802 - 19995078
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     
T  19994802 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgtg 19994901  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatg--------taagtatatgtatga 325  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||        ||  ||||| |||||    
T  19994902 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagttattggggttttgatgtatatatatatatatatatatga 19995001  T
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  19995002 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactattattttgattatgatgatgt 19995078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 136; E-Value: 8e-71
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20480166 - 20479893
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||| |||     
T  20480166 gtgacgacattgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgctcggtgattatgtg 20480067  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagta------tatgtatgaga 327  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||      ||| |||||||    
T  20480066 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatatttgggttttgatgtaagtatatatgtatatatgaga 20479967  T
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||| ||| |||||||| | |||||||||||||||||| ||| |||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  20479966 atatcatt-ttgatcaaatgcatgatgtttatattgaactatccatgttaagtgttattttgattatgatgatgt 20479893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16416810 - 16416537
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | | |||||||||     
T  16416810 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattcatatatgtgttcggtgattgtgtg 16416711  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgaga 327  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||      ||| |||  ||    
T  16416710 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattattgattattgatgtgagatattggggttttgatgtgagtatatatgtatatatttga 16416611  T
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||| |||||||||||| |  ||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  16416610 atatcattattgatcaa-tgtatgatgtttatattgaactatccatgttaattattattttgattatgatgatgt 16416537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18610620 - 18610428
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  18610620 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 18610521  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  18610520 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 18610428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 41508927 - 41509122
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41508927 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgagtggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41509026  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||  |||||| ||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41509027 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcctgatgtttgaattgaaatatccatattaactgttatttggattatgatgatgt 41509122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 45 - 317
Target Start/End: Original strand, 16203832 - 16204098
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||| | ||||||| |||||||||    
T  16203832 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgaattgatccatcgaaggtgacgacc 16203931  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataatt 243  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||    
T  16203932 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatattt 16204031  T
Q  244 gtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    ||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| ||||||||| || ||||| ||||||    
T  16204032 gtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggagtgtgatgcaagtat 16204098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 214 - 401
Target Start/End: Original strand, 24719328 - 24719513
Alignment:
Q  214 tatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaa 313  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||    
T  24719328 tatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgcaa 24719427  T
Q  314 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24719428 gtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24719513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 13664550 - 13664743
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13664550 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13664649  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13664650 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13664743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 13723825 - 13724018
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13723825 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttga 13723924  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  13723925 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 13724018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Original strand, 22008366 - 22008548
Alignment:
Q  220 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatat 319  Q
    |||||||||||||||||||||| | || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||      
T  22008366 attgatgattgtgtatgaataactatgaaatgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattg 22008465  T
Q  320 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22008466 atgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatttatgttaactgttatttggattatgataatgt 22008548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 22909342 - 22909535
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || | |||||||||| |||||    
T  22909342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatttgagatattgggatttga 22909441  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22909442 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgataatgt 22909535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 147 - 401
Target Start/End: Original strand, 20655677 - 20655943
Alignment:
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatga 237  Q
    ||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||| ||  || || ||     |||||| |||||||||||||    
T  20655677 aggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaaatgtgattggtgattggtgattgtgtatga 20655776  T
Q  238 ataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattatt 335  Q
    |||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| |  |||| ||||||||  |||| | ||||||||    
T  20655777 ataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggatcatgatataagtatacatatgtggatattatt 20655876  T
Q  336 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20655877 attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 20655943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 41245338 - 41245210
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  41245338 catcatagtcgtgttgaaattgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 41245239  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgat 153  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  41245238 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgat 41245210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 24108465 - 24108657
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | ||||    
T  24108465 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgacatattggagttttg 24108564  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  24108565 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 24108657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 21192234 - 21192384
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21192234 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21192333  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21192334 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21192384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21696236 - 21696086
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  21696236 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacaatgtttttg 21696137  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||    
T  21696136 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatg 21696086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 21199661 - 21199811
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21199661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21199760  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  21199761 ttgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 21199811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 31195772 - 31195917
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||    
T  31195772 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacgatatttttg 31195871  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  31195872 ttgcatcgaaggtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcat 31195917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23835895 - 23835746
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  23835895 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 23835796  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||    
T  23835795 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtg-ttcggtaccacatgcatttatg 23835746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23509261 - 23509068
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||    
T  23509261 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcaagacacatgtgattggtgatgattgatgtgcgatattggggtttga 23509162  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |  | ||||||||||||||| ||| |  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  23509161 tgtaagtattgatgcgggaatattattattgaccaaatgtaggatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 23509068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 37655134 - 37655324
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37655134 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37655233  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  37655234 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggcaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 37655324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 29758956 - 29758768
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt-tttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||  ||||||| | ||||  |||||| ||||||| |||||||||    
T  29758956 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgatttgttccatcgaaggtgacgacc 29758857  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  29758856 ttttggagatttggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 29758768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Original strand, 22323225 - 22323398
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  22323225 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 22323324  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||| ||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||    
T  22323325 tgtaagcattgttatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcatgttaactgttatt 22323398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 270138 - 269950
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  270138 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 270039  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270038 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 269950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 645782 - 645970
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  645782 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 645881  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  645882 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 645970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 831517 - 831705
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  831517 gatatatgtaattggtgactgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattaatgattattgatgtgagatatttgggtttgat 831616  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   | || |||   ||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  831617 gtaagtattgatgtgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatg-ttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 831705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 39448310 - 39448460
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  39448310 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 39448409  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  39448410 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 39448460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 16043054 - 16043245
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 308  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16043054 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16043153  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16043154 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16043245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 270401 - 270226
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  270401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 270304  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  270303 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 270226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Original strand, 645519 - 645694
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  645519 tgtagttgtaaaagggttgatctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 645616  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  645617 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 645694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Original strand, 831254 - 831429
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||   ||| || |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  831254 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggatgtgaaccatta-atacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 831351  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 222  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  831352 tttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgatt 831429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 248 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17343632 - 17343480
Alignment:
Q  248 attgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagta 347  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||||  |||||   | || |||||||||||||||||||||     
T  17343632 attgatatttgttcatgacacatgtgattggcgattattgatgtgggatattggggtttgatg--agtattgatgtgggaatattattattgatcaagtg 17343535  T
Q  348 catgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17343534 catgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17343480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 16041378 - 16041569
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 308  Q
    |||||||||||| | | ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| | |||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  16041378 gatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacgtgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttttga 16041477  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| ||||||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16041478 tgtaagtattgttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16041569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 37610042 - 37609956
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37610042 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttatttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 37609956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 17731117 - 17731286
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  17731117 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 17731216  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 300  Q
    |||| ||||| ||||  |||||  ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  17731217 gtataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacttgtgattggtgattaattgatgtgagatattg 17731286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 24719077 - 24719165
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24719077 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatatgattg 24719165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 65 - 180
Target Start/End: Original strand, 22498832 - 22498947
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22498832 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 22498931  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcga 180  Q
    ||||| |||| |||||    
T  22498932 tgcatatatgtgtcga 22498947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 221
Target Start/End: Original strand, 24930614 - 24930789
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  24930614 gttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaaagcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 24930713  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgat 221  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  24930714 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatacgtgat 24930789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 24387203 - 24387383
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||||   ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  24387203 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtgagcccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 24387302  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  24387303 cttttga-gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatatgattg 24387383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 23116349 - 23116458
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23116349 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgatgtgatttggtaccaca 23116448  T
Q  165 tgcatgtatg 174  Q
    ||||| ||||    
T  23116449 tgcatatatg 23116458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38532152 - 38531882
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| |||| |||||  || ||| | | ||||||||||||||||| | | | |||||||||||||||||    
T  38532152 gtgacgaccttgaagtgatatggtaccccatgcatatatgtgtcgaactaggtgtacagcatgacatgagtcttatgggtgaaatgtgattgatgattgt 38532053  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || |||||||||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| || || | | ||||||| |||  | ||    
T  38532052 gcat-aataattgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattacttaatgtaagatattgggattatggtatgagtatatatat--ggat 38531957  T
Q  330 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||| ||| ||||| |||| |||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| || |||||||||||||    
T  38531956 attcttatttgattaagtgcatgatatttgaattgaattattcatgtttaactgttatatgaattatgatgatgt 38531882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 22312304 - 22312190
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  22312304 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgactttgaggtgatttggtaccaca 22312205  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  22312204 tgcatatatgtgtcg 22312190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 45560747 - 45560861
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45560747 actcttttaattcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgttaccaca 45560846  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||| ||||    
T  45560847 tgcatgtatgtgtcg 45560861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25294582 - 25294490
Alignment:
Q  119 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25294582 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25294490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 119 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 25756571 - 25756479
Alignment:
Q  119 ttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25756571 ttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcgaactagatgcatatcatgacatgagtcttatt 25756479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 74 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 33170890 - 33170785
Alignment:
Q  74 cttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 173  Q
    |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33170890 cttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatat 33170791  T
Q  174 gcgtcg 179  Q
    | ||||    
T  33170790 gtgtcg 33170785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 44 - 169
Target Start/End: Original strand, 33612569 - 33612694
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| | |||||||| ||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  33612569 ttgtagctttaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 33612668  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  33612669 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 33612694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Complemental strand, 28543440 - 28543270
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| | | || |||||| |||||||    
T  28543440 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatttgattggtgattgt 28543342  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 302  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||    
T  28543341 gcatgaataaatgtgatttgataattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattggg 28543270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 283 - 401
Target Start/End: Original strand, 6776303 - 6776422
Alignment:
Q  283 tattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 382  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  |||    
T  6776303 tattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgt 6776402  T
Q  383 ta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || |||||||||||| ||||    
T  6776403 tatttggattatgataatgt 6776422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 23153297 - 23153452
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| |  ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||    
T  23153297 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatatactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttg 23153396  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    || || |    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  23153397 ttacaccatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 23153452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 43375310 - 43375493
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  43375310 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 43375402  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  43375403 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 43375493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 18768422 - 18768691
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||| |||| ||||  |||||||| ||||||||||| |||||  |  ||||||| ||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||| |    
T  18768422 gtgacgactttgaagtgaaatggtaccatatgcatgtatgtgtcgaacttggtgcataacatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattat 18768521  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||| ||| | || ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||  || || | | ||||||  |||  | ||    
T  18768522 gcatga-taaatatg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattggaattatggtatgagtata--tatttggat 18768617  T
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||  ||||||||||| |||  ||||| ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  18768618 attattattgagtaagtacatgatatttgaattgatttattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 18768691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 22008139 - 22008236
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22008139 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22008236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 258
Target Start/End: Original strand, 24108245 - 24108368
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| |||     
T  24108245 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtg 24108344  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  24108345 tgaataattgtgaattgatgtttg 24108368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 3433535 - 3433718
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3433535 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3433627  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | |||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3433628 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgtatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3433718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 22323102 - 22323197
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  22323102 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttattgataaatgtgtttggtgattgt 22323197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 43375202 - 43375274
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  43375202 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 43375274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 22089943 - 22090097
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22089943 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22090041  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  22090042 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 22090097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24238177 - 24238065
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||| ||    |||||| ||||| ||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24238177 actcttttacttcggcgataatgtaagatgg--acgaaatcgtacatacgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgagctgatttggtaccaca 24238080  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  24238079 tgcatatatgtgtcg 24238065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28543213 - 28543151
Alignment:
Q  339 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28543213 gatcaagtacatgatgttta-attgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 28543151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23509491 - 23509397
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  23509491 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 23509397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 13664296 - 13664393
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13664296 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13664393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 13723571 - 13723668
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  13723571 gtgacgaccttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 13723668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 3433076 - 3433254
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3433076 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3433173  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3433174 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3433254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 13664424 - 13664496
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13664424 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13664496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 13723699 - 13723771
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  13723699 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 13723771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 21853396 - 21853574
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  21853396 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 21853493  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21853494 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21853574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 22909146 - 22909242
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||  |||   | |||||||||||||||||    
T  22909146 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcagatttgaaaatgtgattgatgattgt 22909242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 24547863 - 24547724
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  24547863 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 24547769  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24547768 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24547724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 15320559 - 15320713
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15320559 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15320657  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15320658 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15320713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Original strand, 15500928 - 15501082
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  15500928 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 15501026  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  15501027 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 15501082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 220 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 23509378 - 23509315
Alignment:
Q  220 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  23509378 attgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 23509315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 23631046 - 23631173
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattc 371  Q
    |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |    
T  23631046 tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatcc 23631142  T
Q  372 atgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  23631143 atgttaactgttatttggattatgataatgt 23631173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 65 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 11543149 - 11543088
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 126  Q
    ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||    
T  11543149 actcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttg 11543088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 21846065 - 21846169
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| |||||||||||    
T  21846065 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattg 21846164  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  21846165 gtgat 21846169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25294641 - 25294581
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 84  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25294641 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25294581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 84
Target Start/End: Complemental strand, 25756630 - 25756570
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagatt 84  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25756630 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagatt 25756570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28836155 - 28835980
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  28836155 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 28836063  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  28836062 tta--atgtgta-attattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcaggttaactgttatttggattatgataatgt 28835980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 3433285 - 3433352
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3433285 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3433352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 272786 - 272880
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  272786 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 272880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 643063 - 642969
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  643063 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 642969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 828869 - 828775
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  828869 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 828775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5236768 - 5236674
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5236768 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5236674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 39448573 - 39448646
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39448573 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 39448646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 16874439 - 16874617
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  16874439 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 16874536  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16874537 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 16874617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 346 - 401
Target Start/End: Original strand, 17731331 - 17731387
Alignment:
Q  346 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17731331 tacatgatatttaaattgaatcattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 17731387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 25 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 23148568 - 23148481
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  23148568 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctctttaacttcggtgataatgtaagacgggtgtaaaatcttacat 23148481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 313
Target Start/End: Complemental strand, 29758740 - 29758643
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||| |||       |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  29758740 tgataaatgtaattggtgattgtgaatgaatagttgtgaattgataattgttaatg-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 29758648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 224737 - 224816
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  224737 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 224816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 738360 - 738439
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  738360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 738439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 862255 - 862334
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  862255 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 862334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 16675900 - 16675979
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  16675900 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 16675979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21695941 - 21695899
Alignment:
Q  360 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  21695941 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 21695899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 24662830 - 24662924
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24662830 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 24662924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Original strand, 3433390 - 3433455
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3433390 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3433455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 105
Target Start/End: Original strand, 18043091 - 18043131
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatc 105  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||    
T  18043091 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatc 18043131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 62 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38101 - 37760
Alignment:
Q  62 tgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacc 161  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||    
T  38101 tgaacttttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtacc 38002  T
Q  162 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 261  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  38001 acatgcatgtacgtgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttagtgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttc 37902  T
Q  262 atgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttata 360  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |    
T  37901 atgacacttgttattggtgattattgatgtgagatattggggtcttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaa 37802  T
Q  361 ttgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  37801 ttgaaatatccatggtaactgttatttggattatgatgatgt 37760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 237; Significance: 1e-131; HSPs: 134)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 50113612 - 50113991
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  50113612 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgcaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttat 50113711  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  50113712 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 50113811  T
Q  224 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgt 321  Q
     ||||||||||||||||| |||| ||||||  || ||||||| | ||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||| | |||||||||| ||     
T  50113812 gtgattgtgtatgaataactgtggattgatgattattcatgatatatgtgattgatgattaattgatgtgagatattggggttctaatgtaagtat-tga 50113910  T
Q  322 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  50113911 atgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 50113991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 26 - 401
Target Start/End: Original strand, 319099 - 319486
Alignment:
Q  26 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  319099 atcatagtcgtgttgagattgtagtcgtaaaagggttgaactcttttacttcggaaattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 319198  T
Q  126 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatat---at--gt 218  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || ||   ||  ||    
T  319199 gcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgcgattggt 319298  T
Q  219 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaag-- 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| || | ||||||||||| |||||||||||      
T  319299 gattggtgattgtgtatgaataattgtgcattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatatgagatattggggttttgatgtaagta 319398  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  319399 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 319486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 45 - 401
Target Start/End: Original strand, 51159973 - 51160335
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctt----acatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgac 139  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||    |||| ||||||   ||||| ||||||| |||||    
T  51159973 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgac 51160072  T
Q  140 gaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 239  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  51160073 gaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtctcattgatatatgtgattggtgattgtgtatgaat 51160172  T
Q  240 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattg 339  Q
    || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||   | |||||||||||||||||    
T  51160173 aactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggtttgatgtaagtattgatttgagaatattattattg 51160272  T
Q  340 atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||||||||| |||||  |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  51160273 atcaagtgcatgatgtttaaattgagatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 51160335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17099181 - 17098913
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  17099181 gtgacaaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 17099082  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  17099081 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatttatgagaatatta 17098982  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  17098981 ttattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 17098913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 27 - 401
Target Start/End: Original strand, 12351332 - 12351709
Alignment:
Q  27 tcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttg 126  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12351332 tcatagtggtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttg 12351431  T
Q  127 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatg 226  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| |||||||| ||   | |||||| || ||    
T  12351432 catcgaaggtgacgaccttgaggtgatccagtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacgtgagtcttgttttgaaatgtgactggtg 12351531  T
Q  227 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatg 324  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||  ||||||||| || ||||| |||||||||| ||||||| |||| |||||| | |||  |||||||   ||||    
T  12351532 attgtgtatgaataattatgaattgatgattgttcatgtcatatgtgtttggtgattatttgatgtgagatgttggggatatgacataagtattgatatg 12351631  T
Q  325 agaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     || ||||||| |||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12351632 tgagtattattgttgatcaactgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12351709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 47786356 - 47786735
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  47786356 catcatagtcatgttgag-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 47786454  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgat 221  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| | ||| ||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||    
T  47786455 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatagtaacacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgat 47786554  T
Q  222 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatat 319  Q
    || ||||||||||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||| |||| |||||| |||||||| |||||||||| || |||| |||||||||    
T  47786555 tggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgagattagtgattaattgatgtgagatattgggattgtgatataagtatat 47786654  T
Q  320 gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||| ||| | |||||||||||||||||||||||||   |||||  |||||||| |||  |||| |||||||||||||||||    
T  47786655 atatgtgaaaactattattgatcaagtacatgatgtt--aattgatatattcatgataacagttatttggattatgatgatgt 47786735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 6148457 - 6148723
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||||||||     
T  6148457 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatat--gtgattggtgattgtgtg 6148554  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  6148555 tgaatacttgtgaattgatattcgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatgtgtatgagaatatta 6148654  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  6148655 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 6148723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30204961 - 30204696
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||  || ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  30204961 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttgtg--tcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 30204864  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  30204863 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaacattat 30204764  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||| | ||| |||||||||||||||||    
T  30204763 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatccatattaacttttatttggattatgatgatgt 30204696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 168; E-Value: 7e-90
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7852482 - 7852223
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  7852482 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 7852383  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattg 223  Q
    || |||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||  ||   | |||||||||    
T  7852382 tggatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatgtatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgattg 7852283  T
Q  224 atgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
     ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | |||||||||||||||    
T  7852282 gtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgataaatgtgattggtgatt 7852223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 9e-77
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11812994 - 11812801
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11812994 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 11812895  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  11812894 tgtaagtataaatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 11812801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 16183665 - 16183945
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |     
T  16183665 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtctg 16183764  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-------------gatgtaagtatatgt 321  Q
    ||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||              || ||  ||||| |    
T  16183765 tgaatgattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttttgatatatatatatatatatatatatat 16183864  T
Q  322 atgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  16183865 atgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 16183945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 8630521 - 8630315
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  8630521 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgttcaagt 8630422  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
     |||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| |    
T  8630421 ggcatcgaaggtgacgacctggaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttagaaatgtgattaa 8630322  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  8630321 tgattgt 8630315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 19572430 - 19572693
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |    
T  19572430 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgagtggtgattgtgaa 19572529  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 332  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  19572530 tgaatatttgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 19572624  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19572625 attattgatcaaacacatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19572693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 22145882 - 22146145
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| | |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||  ||    
T  22145882 gtgacgaccttgaggtaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatgtgatgacacgagtcttattgatatatgtgattggtgattgcata 22145981  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||| ||||   |||| |||   |||    
T  22145982 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgttagatattgggg-tggatgtatgtattgatatgtgaa---tat 22146077  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  22146078 tattgatcaagtgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 22146145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 38166407 - 38166213
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| | ||||    
T  38166407 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggagttttg 38166308  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  38166307 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 38166213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18738167 - 18737974
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||||||||| |||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18738167 tgatatatgtaattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattgaagattattgatgtgagatattggggtttga 18738068  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18738067 tgtaagtatatgtatgagaatagtactattgatcaagtgcatgatgtttatattggaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 18737974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 25 - 277
Target Start/End: Original strand, 14060726 - 14060980
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||| |||| ||||||    
T  14060726 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagatgggggtgaactcttacattcgatatttttg 14060825  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 220  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||| |    
T  14060826 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgatttggtatcacatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtaaaatgtaa 14060925  T
Q  221 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 277  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||    
T  14060926 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattg 14060980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19944998 - 19944805
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  19944998 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttga 19944899  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  19944898 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 19944805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7851877 - 7851683
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |     
T  7851877 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttgtc 7851778  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || ||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  7851777 atataagtatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatactaactgttatttggattatgatgatgt 7851683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30141177 - 30140984
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  30141177 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 30141078  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  30141077 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 30140984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 218 - 396
Target Start/End: Complemental strand, 12796908 - 12796728
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  12796908 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 12796809  T
Q  318 --atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 396  Q
      ||||  || ||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  12796808 tgatgtggga-aattttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgat 12796728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17936649 - 17936455
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||||||| |||||| | ||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17936649 tgatatatatgattggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatttgagattattgatgtgagatattggggtttga 17936550  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttat-attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    | |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||  || | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17936549 tataagtatatgtatgggaatattataattgatcaagtgcatgatgtttatgatgaaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 17936455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 210
Target Start/End: Original strand, 38812481 - 38812671
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||    
T  38812481 catcatagtcatgttgagtctagtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacggg-gtgaaatattacatacgatgtttttg 38812579  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttattg 210  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   |||||||||||||||||    
T  38812580 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatggtgacatgagtcttattg 38812671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 47 - 178
Target Start/End: Original strand, 18008645 - 18008776
Alignment:
Q  47 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  18008645 tagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttg 18008744  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    ||||||||  ||||||||||||| ||||||||    
T  18008745 aggtgattcagtaccacatgcatttatgcgtc 18008776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 19230734 - 19230535
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  19230734 catcatagttatgttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggtgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 19230635  T
Q  125 tgcatcgaaa-gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    | |||||||| |||||||| ||  || |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  19230634 ttcatcgaaaggtgacgacgttttggagatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgataaatgtgattg 19230535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15874820 - 15874690
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  15874820 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 15874721  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15874720 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15874690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16819234 - 16819043
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  16819234 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttga 16819135  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  16819134 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 16819043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 48420327 - 48420197
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  48420327 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgttgcatcgaaggtgacgacc 48420228  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  48420227 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 48420197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 55442252 - 55442404
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  55442252 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaatggttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 55442351  T
Q  125 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||| ||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  55442352 tgcattgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatg 55442404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 51 - 174
Target Start/End: Original strand, 12490249 - 12490372
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 150  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  12490249 tgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgagat 12490348  T
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||| |||||||||||||| ||||    
T  12490349 gattcggtaccacatgcatttatg 12490372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14287596 - 14287323
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||| ||    
T  14287596 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattttg 14287497  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggt-ttgatgtaag--tatatgtatgagaa 328  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || ||||||  |  || | ||||  ||||| |||| |||    
T  14287496 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgttgattaattgatgtgaggtattggaatcatggtataagtatatatatatgtgaa 14287397  T
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
      |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14287396 cgttattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14287323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 2048723 - 2048535
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  2048723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 2048624  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||  |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||    
T  2048623 ttttgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgatatatgtgattggtgattgt 2048535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 11330493 - 11330643
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||    
T  11330493 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacatgtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 11330592  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||| || ||||| |||||||||||| | |||||||||||||| ||||    
T  11330593 ttgcatcaaaggtgacaaccttgaggtgactcggtaccacatgcatttatg 11330643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 11199144 - 11199415
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| | ||   || ||||| |||||| |||||||||||||| | | ||||||||| |||||||    
T  11199144 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtggcgggctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattggtgattgt 11199242  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||||| | ||||  |||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | |||||||  |  || | || |||||| |||| ||||    
T  11199243 gcatgaatgaatgtgatttgatgactgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaatattggaatgatggtatatgtatatatatgtgaat 11199342  T
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11199343 attattattgatcaagtacatgatgtttaaattgaattgttcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11199415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 5229607 - 5229721
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5229607 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5229706  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5229707 tgcatatatgtgtcg 5229721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 33340506 - 33340317
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  33340506 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 33340407  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  33340406 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 33340317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 23491169 - 23490980
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    ||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  23491169 tgtagttgtaaaaaggttgtgctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 23491070  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  23491069 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 23490980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35122189 - 35121921
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| || |||||||||||||| ||   |   ||||||| ||||||||    
T  35122189 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacattatgacatgagtcttgttttgaatcgtgattggtgattgtg 35122090  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||  |||||| ||||||| | ||||  ||      
T  35122089 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaatttgggattttgatataagtatttatatgtaaa-- 35121992  T
Q  331 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  35121991 -tattattgatcaagtacacgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 35121921  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 237
Target Start/End: Complemental strand, 19945289 - 19945098
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  || | ||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | ||||||||||    
T  19945289 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggtggttttgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgacct 19945191  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatga 237  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||| |||||    
T  19945190 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtttatga 19945098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 213 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 8630232 - 8630101
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgta 312  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  8630232 atatgtgattggtaattgtgcatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggagattatgaatgtgagatattggggtttgatgta 8630133  T
Q  313 agtatatgtatgagaatattattattgatcaa 344  Q
    |||||||||||| | ||||| |||||||||||    
T  8630132 agtatatgtatgtggatattgttattgatcaa 8630101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10737219 - 10737033
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||| ||||||    
T  10737219 tgtagttgtaaaagggttgagctcttctacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtggcgacct 10737121  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||| | |||||||||||||||| |||||||    
T  10737120 tttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtctgatttgatatatgtgattggtgattgt 10737033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14297000 - 14296730
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14297000 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14296902  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14296901 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14296802  T
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14296801 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14296730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14302627 - 14302357
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| || | |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| |||||||    
T  14302627 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatacgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtggattgtgattggtgattgt 14302529  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||| | ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || | ||||| |  || | ||||||||| |||| ||||    
T  14302528 gcataaatgaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagtttttgggatcatggtataagtatatatatgtgaat 14302429  T
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  14302428 attattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 14302357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 14846160 - 14846339
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14846160 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggggggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14846258  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||| ||||    
T  14846259 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtaatatatgtgattggtgat 14846339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 302
Target Start/End: Original strand, 11062691 - 11062861
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||   |||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||| |||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||    
T  11062691 gtgacgaccttgaagtgaaacggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcaggacatgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtg 11062790  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg 302  Q
    ||||||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  11062791 tatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattggg 11062861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47983531 - 47983418
Alignment:
Q  67 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47983531 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47983432  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  47983431 gcatatatgtgtcg 47983418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 47992818 - 47992705
Alignment:
Q  67 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47992818 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 47992719  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  47992718 gcatatatgtgtcg 47992705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48002105 - 48001992
Alignment:
Q  67 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48002105 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48002006  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  48002005 gcatatatgtgtcg 48001992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 67 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 48011391 - 48011278
Alignment:
Q  67 tcttttacttcggagattatgtaagac-gggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48011391 tcttttacttcggatattatgtaagaccgggtgtgaaatcttacatacgatctgtttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacat 48011292  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  48011291 gcatatatgtgtcg 48011278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 293 - 401
Target Start/End: Original strand, 54045594 - 54045703
Alignment:
Q  293 agatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggatt 391  Q
    |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| | ||| |||||||    
T  54045594 agatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactattatttggatt 54045693  T
Q  392 atgatgatgt 401  Q
    ||||||||||    
T  54045694 atgatgatgt 54045703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 11813403 - 11813307
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  11813403 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgctgattgt 11813307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 9592239 - 9592394
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||| | |||||||||| ||  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   ||||| ||||    
T  9592239 catcatagtcatgttgagtcttgtggctgtaaaagggatgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacacatgatgtgtttg 9592338  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    || ||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  9592339 ttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 9592394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 209 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13816070 - 13815973
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 306  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||    
T  13816070 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgacgtgagatattggagttt 13815973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 14523006 - 14523278
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || |  || |||||| ||| |||||||||| | | |||| ||||||||||||    
T  14523006 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggaacacatcatg-cataagtcttattggtgaaatgtaattgatgattgt 14523104  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatg---taagtatatgtatgaga 327  Q
    | ||| |||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  | | || || | |  |||||   || |||| | || | ||    
T  14523105 gcatgcataagtgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgaataattgagctga-atctttgagaatgatggtatatgtatttatacgtga 14523203  T
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14523204 atattattattgatcaagtacatgatggttaaattggaatattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 14523278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Original strand, 17958169 - 17958303
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||   |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||    
T  17958169 catgtgattggtgattattgatgtgagatattgggggatatgatgtaagtattaatatgggagtattattattgatcaagtacatgatgtttactttgaa 17958268  T
Q  366 ttattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 401  Q
     ||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  17958269 atatccatgttaactgttatt-gattatgttgatgt 17958303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 49230869 - 49230655
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||| |||      
T  49230869 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgacgttgtt 49230772  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 248  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  49230771 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 49230672  T
Q  249 ttgatatttgttcatga 265  Q
    |||||| ||||||||||    
T  49230671 ttgataattgttcatga 49230655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 45 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 5227378 - 5227201
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc- 143  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | |||| ||| |  ||||||| |||||||||     
T  5227378 tgtagttgtaaaagggttgg-ctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacaatgtgttt-tatcatcgaatgtgacgacct 5227281  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgatt 222  Q
    ||  || |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||    
T  5227280 ttttggagattcggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacataacatgagtcttgtttgatatatgtgatt 5227201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 15939959 - 15940140
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| |  |||| | |||||||||||     
T  15939959 gttgtaaaagggctgaacttttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttg-tctatcggaggtgacgaccttt 15940057  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||| ||||    
T  15940058 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgatttatgtgattggtgat 15940140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 17913751 - 17913933
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||| | ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||| | ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  17913751 tgtaaaagggttaagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacgtacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 17913849  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  17913850 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatatgatgtatgtgattgatgattgt 17913933  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 41660249 - 41660135
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41660249 actcttttatttcggtgataatgtaagacaggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 41660150  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41660149 tgcatatatgtgtcg 41660135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 213 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 54686707 - 54686551
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt--gatg 310  Q
    ||||||||| | | ||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||  ||||    
T  54686707 atatgtgatcggtaattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggtttttgatg 54686615  T
Q  311 taagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 374  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  54686614 taagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 54686551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 11062944 - 11063020
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11062944 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 11063020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 17957996 - 17958093
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17957996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatctcatgacatgagtcttatatgatatatgtgattgatgattgt 17958093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 51 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44228083 - 44227903
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  44228083 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 44227985  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  44227984 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 44227903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 213 - 374
Target Start/End: Original strand, 9304664 - 9304819
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||    
T  9304664 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattgaggttttgatgt 9304756  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 374  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  9304757 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 9304819  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16819565 - 16819386
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16819565 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgcaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16819467  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16819466 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 16819386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 66 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16259683 - 16259487
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  16259683 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 16259589  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 263  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||    
T  16259588 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgggtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaatatttgtcaattgataattgttcat 16259489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25057166 - 25057035
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25057166 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaa 25057072  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  25057071 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 25057035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 15516197 - 15516035
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||| |||    |||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  15516197 gtgacgaccttgaagtgatttcgtaccacatgcatatat----cgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 15516102  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 299  Q
      ||| |||| |||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  15516101 tcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 15516035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 136 - 231
Target Start/End: Original strand, 19262602 - 19262698
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  19262602 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 19262698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13815943 - 13815856
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  13815943 tatatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatatcgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 13815856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19230499 - 19230318
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  19230499 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 19230407  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19230406 tgtaagtattaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 19230318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11813253 - 11813179
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  11813253 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacccatgtgattggtgatt 11813179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Original strand, 12563136 - 12563281
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  12563136 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatggcatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 12563235  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 277  Q
    | |||| ||| ||||  |||||  ||  ||||||||||||||||||    
T  12563236 gcatgattaaatgtgatttgatgatttctcatgacacatgtgattg 12563281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 25057344 - 25057247
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  25057344 gtgacgaccttatggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 25057247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 85 - 174
Target Start/End: Original strand, 33370914 - 33371002
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| |    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  33370914 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgat-tttttgttgcaccatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 33371002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 17536847 - 17536923
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  17536847 gaatattattattgatcaagtgcatgaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 17536923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18908854 - 18908679
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  18908854 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 18908762  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18908761 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18908679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22273209 - 22273034
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  22273209 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 22273117  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22273116 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 22273034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27839362 - 27839184
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  27839362 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 27839265  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||    
T  27839264 gagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattgatgat 27839184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 159 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 45581382 - 45581310
Alignment:
Q  159 accacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  45581382 accacatgcatttatgtgtcaataagtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 45581310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 7852035 - 7851968
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 276  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  7852035 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 7851968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 15860824 - 15860902
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||  |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15860824 gatttggtacaacatgcacatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 15860902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Original strand, 18905356 - 18905434
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  18905356 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 18905434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18908966 - 18908892
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18908966 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 18908892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 49230429 - 49230262
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  49230429 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatattggggtgtga 49230337  T
Q  309 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| |||||||    
T  49230336 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtccatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatt 49230262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 49 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15613720 - 15613564
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  15613720 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 15613626  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15613625 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15613564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11813120 - 11813048
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  11813120 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgaaacatgtaattggtgatt 11813048  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 17137969 - 17137827
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgat-atgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||  || | ||||| |||||||||||||| |||||| | || |||| ||||||||||||    
T  17137969 gtgacaaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtgaattaggtgcacatcatgacatgagtgttattggtgtaatgtggttgatgattgtg 17137870  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 277  Q
     || ||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17137869 cat-aataaatgtg-attgatgtttgttcatgacacatgtgattg 17137827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Original strand, 23081682 - 23081821
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  23081682 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 23081776  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  23081777 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 23081821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 269 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23490898 - 23490768
Alignment:
Q  269 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaat 366  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     ||| |||||||||| | ||||||||||||||||||     
T  23490898 atgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttactattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaa 23490804  T
Q  367 tattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || ||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  23490803 tactcatgttatctgttatttggattatgataatgt 23490768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 16819355 - 16819292
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  16819355 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 16819292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 135 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 30141456 - 30141361
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  30141456 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 30141361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 2450910 - 2451004
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  2450910 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 2451004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 85 - 131
Target Start/End: Original strand, 11517010 - 11517056
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 131  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11517010 atgtaaaacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcg 11517056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18909263 - 18909169
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18909263 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18909169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22273618 - 22273524
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22273618 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 22273524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 133 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 40938236 - 40938085
Alignment:
Q  133 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||| |||||||||||||| | | || ||| |||| |||    
T  40938236 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgagctaggtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgaatgataatt 40938138  T
Q  230 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| ||||||||    
T  40938137 gtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgatt 40938085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 228
Target Start/End: Original strand, 12266007 - 12266167
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || |||||||||||||    
T  12266007 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccac 12266101  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  12266102 atgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 12266167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 15574618 - 15574545
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15574618 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 15574545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 16745670 - 16745848
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||| ||||| |||||||||||      
T  16745670 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcattgaaaggtgacgaccttgtt 16745767  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  16745768 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaaatatgtgattggtgat 16745848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 53900388 - 53900463
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||  |||||||||||||||||    
T  53900388 gaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattatttatg-taactgttgtttggattatgatgatgt 53900463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 1469236 - 1469330
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1469236 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 1469330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 7851931 - 7851857
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| | ||||| ||| |||||    
T  7851931 tgatatatgtggttgatggttgagtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatatatgtggttgatgatt 7851857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Original strand, 17536606 - 17536774
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| |  | ||    
T  17536606 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtattggt 17536704  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 300  Q
    |  ||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||| || |||||    
T  17536705 gcgtgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacagatgtgatcggtgattaattgatgtgagttattg 17536774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 279 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33340155 - 33340038
Alignment:
Q  279 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 376  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||| ||||||| | |||| ||||   ||||||||||||||| |    
T  33340155 tgattattgatgttagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattagtgatcaaatgcatgttgtt--aattgaattattcatgat 33340063  T
Q  377 aattgttattggattatgatgatgt 401  Q
    || ||||||||||||||||| ||||    
T  33340062 aactgttattggattatgataatgt 33340038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 15470048 - 15470141
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||| |||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  15470048 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacataagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 15470141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 401
Target Start/End: Original strand, 19262733 - 19262907
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 315  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  19262733 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 19262825  T
Q  316 at--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattg-ttattggattatgatgatgt 401  Q
    ||  |||| ||      |||||||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| || | ||||||||||||| ||||    
T  19262826 attaatgtgtg-----gttattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgctaattggattatgataatgt 19262907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 30151991 - 30151813
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30151991 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 30151894  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  30151893 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 30151813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 339 - 401
Target Start/End: Original strand, 12563334 - 12563397
Alignment:
Q  339 gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||||    
T  12563334 gattaagtacatgatatttaaattgaattattcatgttaagtgttatgtgaattatgatgatgt 12563397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 12951555 - 12951476
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  12951555 gtgacgaccttgaagtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 12951476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 39654237 - 39654163
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  39654237 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 39654163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 8269976 - 8270080
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8269976 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8270075  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  8270076 gtgat 8270080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 8277087 - 8277191
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8277087 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8277186  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  8277187 gtgat 8277191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 8305896 - 8306000
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  8305896 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 8305995  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  8305996 gtgat 8306000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 331 - 401
Target Start/End: Original strand, 14061039 - 14061110
Alignment:
Q  331 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||| |||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||    
T  14061039 ttatcattgattaagtacatgatgttga-attgaattattcatgcttaactgttatgtggattatgatgatgt 14061110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 53769241 - 53769137
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  53769241 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 53769142  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  53769141 gtgat 53769137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 13956378 - 13956457
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13956378 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13956457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 13977211 - 13977290
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  13977211 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 13977290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 49 - 96
Target Start/End: Original strand, 18905296 - 18905343
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggg 96  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  18905296 gttgtaaaagggttgggctcttttactttggagattatgtaaggcggg 18905343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 41268822 - 41268743
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  41268822 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 41268743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 45859600 - 45859521
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  45859600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 45859521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 282
Target Start/End: Original strand, 53900177 - 53900326
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||||||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | |  |||||||| | |||||    
T  53900177 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcggtctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaattgt 53900275  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 282  Q
    | |||||||   |||  |||||| ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  53900276 gcatgaatatacgtgatttgatacttgtttatgacacatgtgattgatgat 53900326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 55314962 - 55314883
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  55314962 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 55314883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 2451155 - 2451229
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  2451155 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 2451229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22273321 - 22273247
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  22273321 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 22273247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 49230583 - 49230509
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  49230583 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 49230509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 265
Target Start/End: Original strand, 2451035 - 2451084
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  2451035 tgtgattgatgtttgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 2451084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 10736953 - 10736904
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| || ||| ||||||||    
T  10736953 catgtgattggtgattattaatgtgagatattggagtgtgacgtaagtat 10736904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Original strand, 11883923 - 11883968
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 180  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  11883923 gtgacgactttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 11883968  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 14291955 - 14291910
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 180  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| ||||||||||    
T  14291955 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgcgtcga 14291910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 38377415 - 38377460
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38377415 gtgacgacctttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgcgtcg 38377460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 45581230 - 45581181
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||| ||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  45581230 catgagattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagtat 45581181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 15989548 - 15989508
Alignment:
Q  135 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15989548 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 15989508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 96)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4863943 - 4863551
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4863943 catcataatcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 4863844  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-------g 217  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||       |    
T  4863843 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacattcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgg 4863744  T
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 316  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  4863743 tgattggtgattgtgtatgaataattgtgctttgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 4863644  T
Q  317 ------tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
          ||| ||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||| |||| ||||  || ||||||||||||||    
T  4863643 tatatgtatatatgagaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattaaattattcatgattaactgttgttttgattatgatgatgt 4863551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 27185318 - 27185699
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27185318 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27185417  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  27185418 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 27185517  T
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27185518 tgattgataattgtgtctgaataaatgtgaattgttgtttgtacatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 27185617  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
       |||| |||   ||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  27185618 tgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcataatgtttatattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 27185699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 85 - 401
Target Start/End: Original strand, 21661268 - 21661593
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatg 184  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |    
T  21661268 atgtaagactggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataag 21661367  T
Q  185 tgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatatg-----tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattg 277  Q
    |||||||||||||||||||||||||  || || ||     |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21661368 tgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatggtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattg 21661467  T
Q  278 gtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgtt 376  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  21661468 gtgattattgttgtgagatattggggtcttgatgtaagcatatgtatgagaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgtt 21661567  T
Q  377 aattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || ||||| |||||||||||||||||    
T  21661568 aactgttatttggattatgatgatgt 21661593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 180; E-Value: 5e-97
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21392698 - 21392432
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21392698 gtgacgaccttgagttgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgta 21392599  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    ||||||||||   | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |    
T  21392598 tgaataattggaaactgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatttt 21392500  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21392499 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21392432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34937764 - 34937571
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  34937764 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgttagatattggggtttga 34937665  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34937664 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34937571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10500 - 10307
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10500 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10401  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10400 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 10780112 - 10780305
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  10780112 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10780211  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  10780212 tgtaagtattgatgtgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 10780305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 32967661 - 32967815
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32967661 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 32967760  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  32967761 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 32967815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 43445708 - 43445901
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  43445708 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 43445807  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  43445808 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 43445901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 23492662 - 23492532
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23492662 ttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23492563  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23492562 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23492532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28257970 - 28257781
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  28257970 tgatgtatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 28257871  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| || ||||||||||||||    
T  28257870 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaatt-ttcattttaactgttattttgattatgatgatgt 28257781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 22885041 - 22885234
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22885041 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggcgatcattgatgtgagatattggggtttga 22885140  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| | | ||||| |||||||||||| ||||    
T  22885141 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgatgactgttatttggattatgataatgt 22885234  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 209
Target Start/End: Original strand, 24226976 - 24227146
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  24226976 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 24227075  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  24227076 ttgaggtgattcggtacgacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 24227146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Original strand, 25211796 - 25211982
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 313  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25211796 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25211895  T
Q  314 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25211896 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25211982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Original strand, 25275948 - 25276134
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttgatgtaa 313  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| | ||||||||||    
T  25275948 atgtgattggtgattctgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggagttttgatgtaa 25276047  T
Q  314 gtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25276048 gtatatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 25276134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 44 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 21615671 - 21615535
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  21615671 ttgtagctgtaaaagagttgaactcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 21615572  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 180  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  21615571 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 21615535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 212 - 401
Target Start/End: Original strand, 17473704 - 17473892
Alignment:
Q  212 tatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgt 311  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  17473704 tatatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacatatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttgatgt 17473803  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| || ||| || |||| ||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17473804 aagtat-tg-atgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17473892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 7727257 - 7727112
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7727257 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaggggttgagctattttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 7727158  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  7727157 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 7727112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 19498120 - 19497952
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  19498120 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 19498021  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
       | || ||||||||||| |||||| |||| | ||||||| |||||| |||||||||||  |||||||    
T  19498020 tgatgtgtgaatattattaatgatcatgtacgtaatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatt 19497952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 19860912 - 19860756
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19860912 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagagttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19860813  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 180  Q
    ||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  19860812 ttgtatcgaaggtgacgaccttggggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcga 19860756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28888598 - 28888441
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28888598 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 28888499  T
Q  124 ttgcatcgaa---agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    ||||||||||     ||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  28888498 ttgcatcgaagatgatgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 28888441  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11582414 - 11582266
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  11582414 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 11582315  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11582314 tgaataactgtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgatt 11582266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11580113 - 11579922
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg-ggtttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||| || |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||| | ||||    
T  11580113 tgatgtatatgattggtgactgcgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattactgatgtgagatattggagttttg 11580014  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  11580013 atgtaagtata--tatgagaatattattattgatcaagtgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 11579922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 135 - 281
Target Start/End: Original strand, 1170321 - 1170467
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||  || ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  1170321 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtatcaataggtgaatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 1170420  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 281  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  1170421 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatgtgatttgtga 1170467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 13793809 - 13793659
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  13793809 catcatagtcatgttgagtcttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgagatcttatatacgatgtttttg 13793710  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  13793709 ttgcatcaaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 13793659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 37189637 - 37189767
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37189637 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37189736  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  37189737 ttgaggtgattcggtaccacttgcatttatg 37189767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23453454 - 23453184
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23453454 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23453355  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23453354 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23453258  T
Q  330 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23453257 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23453184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23460698 - 23460428
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23460698 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23460599  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23460598 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23460502  T
Q  330 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23460501 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23460428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23464959 - 23464689
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  23464959 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggttcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 23464860  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttga-tgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||||||||||  |||||  ||||||||||||||| | |||||||||| |||||||| |||||||| | || || ||||| ||||| | ||   ||    
T  23464859 gcataaataattgtgatttgatgattgttcatgacacatattattggtgattaattgatgtgagatattgagattagattgtaaatatatttgtg---at 23464763  T
Q  330 attattatt-gatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| ||| || | |||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  23464762 attattattggattaaatgcatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 23464689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 51 - 283
Target Start/End: Original strand, 1221351 - 1221584
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||| ||||      
T  1221351 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaacttgtt 1221449  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 248  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| |    
T  1221450 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaa 1221549  T
Q  249 ttgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  1221550 ttgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 1221584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 23986165 - 23986359
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatatt-ggggtttg 307  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| | | ||| ||||| ||    
T  23986165 gatatatgtgaatgatgattgtgtatgaataactgtgaattaatatttgttcctgacacatatgattggtgattacttgatgtgaaacattgggggtatg 23986264  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||   ||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23986265 atgtaagtattgatatgagagtattattatttatcaagtgcatgatgtttatatagaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23986359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 259 - 401
Target Start/End: Original strand, 1171320 - 1171464
Alignment:
Q  259 ttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgttt 357  Q
    ||||||| | ||||||||| || ||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  1171320 ttcatgataaatgtgattgatgtttattaatgtgagatattggggctttgatgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgttt 1171419  T
Q  358 atattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||||||||    
T  1171420 atattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgatgatgt 1171464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 9732592 - 9732782
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| | |||    
T  9732592 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatctttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgcgagatattgggatgtga 9732691  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9732692 tgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatcttgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 9732782  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 1221638 - 1221826
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1221638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggtttga 1221737  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  1221738 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 1221826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 11964586 - 11964472
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  11964586 actcttttacttcggtgataatgtaatacgggtttgaaatcttacatacgatgtttttgttgcattgaaggtgacgaccttgaggtggtttggtaccaca 11964487  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||| ||||    
T  11964486 tgcatgtatgtgtcg 11964472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 24184869 - 24185137
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  24184869 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaagtgtgattggtgattgtg 24184968  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||| |||||||||  |||||||||| |||||||| ||| |||| | || |||| |  |||| | |||| |||      
T  24184969 tatgaataactgtgatttggtgattgttcctgacacatggaattggtgattaattgatgtgagaaattgagattatgatatttgtatttatatgtgaa-- 24185066  T
Q  331 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24185067 -tattattgatcaattacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 24185137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24470804 - 24470555
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||            
T  24470804 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgggtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttactgatatatgtgattgctg-------- 24470713  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
          |||||| ||||||| |||||| ||||| ||||||||| | ||||||| ||| |||||||||||| |||||||| |||   | || |   |||||    
T  24470712 ------attgtgaattgataattgttcgtgacatatgtgattgattattattgttgtgagatattggggtgtgatgtaaatattattgtgtg---attat 24470622  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  24470621 tattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaactattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 24470555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 21653052 - 21653148
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  21653052 gtgacgaccttgaggacatttggtaccacatgcatatatgcgtcgataagtgcatatcatgacacgagtcttattgataaatgtgattggtgattgt 21653148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 11213222 - 11213404
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11213222 tgtaaaagggttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11213320  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||||    
T  11213321 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctcatatgatataagtgattgatgattgt 11213404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 110604 - 110785
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  110604 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 110701  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  110702 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 110785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 20455627 - 20455741
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||  |||||||||||||||||    || |||| ||||||||||||||||||||||    
T  20455627 actcttttacttcggtgataatgtaagacggatgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtaacgatcttgaggtgatttggtaccaca 20455726  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20455727 tgcatatatgtgtcg 20455741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Original strand, 22884887 - 22885017
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| |    
T  22884887 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaa 22884986  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22884987 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22885017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 17473568 - 17473648
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17473568 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 17473648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 151 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 23510473 - 23510313
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtat 249  Q
    |||||||||| |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||    
T  23510473 gatttggtacaacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaat 23510374  T
Q  250 tgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    ||||| ||||||   |||    |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||    
T  23510373 tgataattgttc---aca----tgattgatgactattgatgtgagatattggggtatgatgcaagtat 23510313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 29192671 - 29192857
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||  |||||| |||||||||    
T  29192671 tgataaatgtgattggtgattgtgattgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgcgagatatcggggtttga 29192763  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  29192764 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaagtgaatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 29192857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 213 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 17908030 - 17907853
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  17908030 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgattattgatgtgagatattggggttttggtgt 17907938  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgtta-ttggattatg 394  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| |||| |||| ||||| ||||||||||    
T  17907937 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatgattaactgttatttggattatg 17907853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 265
Target Start/End: Original strand, 35792767 - 35792964
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtacca 162  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||    
T  35792767 actcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtacca 35792861  T
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttca 262  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||| ||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  35792862 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagatcgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttca 35792961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16534881 - 16534750
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgtgt 233  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||  |||||||     
T  16534881 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaactatgtgattggagattgtga 16534782  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16534781 atgaataattgtgaattgataattgttcatga 16534750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 35793162 - 35793345
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  35793162 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 35793254  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  35793255 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 35793345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 10628 - 10554
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  10628 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 10554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 265
Target Start/End: Original strand, 18779790 - 18779904
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 250  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||| | ||||| |||    
T  18779790 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattagagattgtgaatgaacatttgtgaatt 18779889  T
Q  251 gatatttgttcatga 265  Q
    |||| ||||||||||    
T  18779890 gataattgttcatga 18779904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 22368188 - 22368285
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  22368188 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattgt 22368285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19498458 - 19498280
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19498458 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19498361  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19498360 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19498280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 28258093 - 28257998
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| ||| |||||||    
T  28258093 gtgacgaccttgaggagatt-ggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagttttatcgataaatgtggttggtgattgt 28257998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 9732495 - 9732562
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  9732495 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 9732562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 10779799 - 10779980
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  10779799 tgtaaaagggttgagctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 10779896  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  10779897 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 10779980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 197 - 401
Target Start/End: Original strand, 11338584 - 11338802
Alignment:
Q  197 catgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaaga 295  Q
    |||||||||||||   | ||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||     
T  11338584 catgagtcttattttgaaatgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtg-attgataattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagt 11338682  T
Q  296 tattggggt-------------ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgt 382  Q
    ||||||| |             |  || ||  ||||| |||  |||| || |||||||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  11338683 tattgggatcatgatatatatatatatatatatatatatatatgaatgttgttattgatcaagtacatgatcttttaattgaaatattcatgttaattgt 11338782  T
Q  383 tat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  11338783 tatgtggattatgatgatgt 11338802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 25944566 - 25944750
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 307  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | ||||||| |||| ||||||| |||| ||    
T  25944566 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattaatgtgagatattagggtgtg 25944658  T
Q  308 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  25944659 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 25944750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 11340782 - 11340599
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| | ||||||        |||||| ||| |||| |||| |||||| ||||| |||    
T  11340782 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataatcgttcata-------tgattgatgaatatttatgtgagatatcggggtgtga 11340690  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  11340689 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 11340599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 11341294 - 11341116
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  11341294 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 11341197  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11341196 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11341116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 18780052 - 18780235
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| |||  |||||||| |||||| | ||| |||    
T  18780052 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaagattgatgtgagatatcgaggtgtga 18780144  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  18780145 tgtaagtatta--atgtgta-attattattaatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 18780235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25425206 - 25425102
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  25425206 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 25425107  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  25425106 gtgat 25425102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 11341085 - 11341018
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||    
T  11341085 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgaatggtgatt 11341018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10925 - 10831
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  10925 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 10831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Original strand, 110990 - 111157
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  110990 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 111082  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  111083 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 111157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Original strand, 5452432 - 5452511
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  5452432 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 5452511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19498248 - 19498182
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19498248 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19498182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Original strand, 43445390 - 43445555
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||    
T  43445390 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacca 43445488  T
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||| |||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  43445489 catgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgaatcttatgtgaaatatatgattggtgat 43445555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 4201586 - 4201764
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    ||  ||||||||| |||||||||||      
T  4201586 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtgacatcgaaaggtgacgaccttgtt 4201683  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  4201684 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 4201764  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 9732360 - 9732464
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| ||||||    
T  9732360 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatctatgtgttaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatctgattg 9732459  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  9732460 gtgat 9732464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16534574 - 16534391
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||  | ||||| |||    
T  16534574 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagacttcggggtgtga 16534482  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | |||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  16534481 tgtaagtatta--atgtgta-attattgttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaattattatctggattatgataatgt 16534391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 258
Target Start/End: Original strand, 25211623 - 25211719
Alignment:
Q  162 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25211623 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25211719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 162 - 258
Target Start/End: Original strand, 25275775 - 25275871
Alignment:
Q  162 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||| ||||    
T  25275775 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattatgtgtgaataattgtgaattgatgtttg 25275871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25424736 - 25424680
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||    
T  25424736 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatt 25424680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Original strand, 25944472 - 25944536
Alignment:
Q  219 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  25944472 gattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 25944536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 43445582 - 43445654
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||    
T  43445582 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggcgatt 43445654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 21075192 - 21075286
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21075192 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21075286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 21933863 - 21933957
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21933863 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21933957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 21940033 - 21940127
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21940033 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 21940127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 22368337 - 22368411
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  22368337 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcaggatacatgtaattggtgatt 22368411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 29192321 - 29192415
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  29192321 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaagtatgtgattggtgat 29192415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 35580829 - 35580735
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  35580829 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 35580735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 37010867 - 37010961
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37010867 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37010961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3672497 - 3672421
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||| |||| |||||  ||  ||||||||| |||||||||||||||    
T  3672497 gtgacgaccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactagatgcatatcaagacatgagtcttatt 3672421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Original strand, 10780011 - 10780082
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||    
T  10780011 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatt-gttcctgatacatgtgattggtgatt 10780082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Original strand, 22368602 - 22368674
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||| ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22368602 attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattaatgttaactgttatttggattatgataatgt 22368674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 24595159 - 24594981
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  24595159 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 24595062  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  24595061 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 24594981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 23327598 - 23327458
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  23327598 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 23327500  T
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  23327499 catgcatttatgggtccataagtgcatatcatagcatgagtc 23327458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 27008596 - 27008492
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  27008596 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtacctcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 27008497  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  27008496 gtgat 27008492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 279
Target Start/End: Original strand, 110888 - 110957
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 279  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||| |||||||||| |||||| ||||||    
T  110888 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgata-ttgttcatgatacatgtaattggt 110957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7726993 - 7726919
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg-ttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||| |||  |||||| ||||||||||||||||    
T  7726993 tattatcattgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgcttagctgttatctggattatgatgatgt 7726919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 127 - 228
Target Start/End: Original strand, 25902021 - 25902123
Alignment:
Q  127 catcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgat 225  Q
    ||||||| |||||||||||   | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| |    
T  25902021 catcgaaggtgacgaccttatagagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggt 25902120  T
Q  226 gat 228  Q
    |||    
T  25902121 gat 25902123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Original strand, 29192583 - 29192641
Alignment:
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  29192583 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 29192641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37051559 - 37051465
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  37051559 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 37051465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 269 - 306
Target Start/End: Original strand, 21653228 - 21653265
Alignment:
Q  269 atgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt 306  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21653228 atgtgattggtgattattgatgtgagatattgaggttt 21653265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 45 - 77
Target Start/End: Complemental strand, 21649495 - 21649463
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttc 77  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21649495 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttc 21649463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 216; Significance: 1e-118; HSPs: 9)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 216; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 256560 - 256827
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  256560 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 256659  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  256660 tgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 256759  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  256760 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaaatattcatattaactgttatttggattatgatgatgt 256827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 125009 - 125089
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  125009 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 125089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 72028 - 72106
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  72028 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 72106  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Original strand, 76409 - 76487
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  76409 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 76487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 193057 - 192985
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193057 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 192985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 401
Target Start/End: Original strand, 72191 - 72317
Alignment:
Q  271 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 368  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  72191 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 72283  T
Q  369 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  72284 ttcatgataactgttatttggattatgatgatgt 72317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #7
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 271 - 401
Target Start/End: Original strand, 76572 - 76698
Alignment:
Q  271 gtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaatta 368  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| ||    
T  76572 gtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaata 76664  T
Q  369 ttcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| || ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  76665 ttcttgataactgttatttggattatgatgatgt 76698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #8
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 272 - 401
Target Start/End: Original strand, 125173 - 125298
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattat 369  Q
    |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||    
T  125173 tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatat 125265  T
Q  370 tcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||| ||||| || ||||||||||||||    
T  125266 tcatgataactgttatttagattatgatgatgt 125298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #9
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 192897 - 192768
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    ||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  192897 catgtaattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 192805  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  192804 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 192768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 98)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Original strand, 21961053 - 21961440
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21961053 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 21961152  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||   || || |         
T  21961153 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgttttggaaatgtgttta 21961252  T
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| || |||| ||||    
T  21961253 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgatatatgtgattggtgattaattgatgtgagctattgggagtatgatttaag 21961352  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21961353 tattgatatatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 21961440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 113 - 401
Target Start/End: Original strand, 12837900 - 12838192
Alignment:
Q  113 cgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattg 210  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||    
T  12837900 cgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgatgtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgatataggtgcatatcatgacatgagtctttttg 12837999  T
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgat 309  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||    
T  12838000 atatatgtgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtgagctattggggttttgat 12838099  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12838100 ataagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12838192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 37 - 401
Target Start/End: Original strand, 12901269 - 12901631
Alignment:
Q  37 gttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt 136  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||    
T  12901269 gttgaaattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatattacatacgatgtttttgttgcatcgaaggt 12901368  T
Q  137 gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatat-----gtgattgatgattg 230  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||||||||  |||| || |     ||||||| ||||||    
T  12901369 gacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgacatgagtcttctttgaaatgtgattggtgattggtgattg 12901468  T
Q  231 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 328  Q
    |||| |||||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||          |    
T  12901469 tgtacgaataactgtgaattgattattgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat----------a 12901558  T
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12901559 tatttatattgatcaagtacatgatgtttgaatt-aattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12901631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44345333 - 44345057
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||     
T  44345333 gtgacgaccttgaggtgatttgttaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatatgtttggtgattgtgtg 44345234  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaa--------gtatatgtatga 325  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||        |||||| |||||    
T  44345233 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatatga 44345134  T
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||||||||||||    
T  44345133 gaatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttgttttgattatgatgatgt 44345057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33738732 - 33738477
Alignment:
Q  134 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 233  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  33738732 agtgacgaccttaaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatacatgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgattgtgt 33738633  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 332  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||                
T  33738632 atgaataattgtgaattgatatttgctcatggcacatgcgattgttgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatg------------ 33738545  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
      |||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  33738544 --tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 33738477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18167067 - 18166874
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18167067 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 18166968  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18166967 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 18166874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 8873978 - 8874162
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  8873978 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaatgggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 8874077  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8874078 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 8874162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 133; E-Value: 5e-69
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34393580 - 34393385
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    |||||||||||||||  |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  34393580 tgatatatgtgattggcgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacagatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 34393481  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  34393480 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 34393385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 53909555 - 53909750
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 306  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  53909555 tgataaatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 53909654  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  53909655 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgatgatgt 53909750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 16366361 - 16366624
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |    
T  16366361 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattagtgattgtgaa 16366460  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 332  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  16366461 tgaatatttgtgaattgataattgttcatgacacatttgattgatgattattgatgtgagatattagggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 16366555  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||   ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| | ||| |||||||||||||||||    
T  16366556 attattgatcaaacgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactattatttggattatgatgatgt 16366624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 44 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 14900136 - 14899948
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  14900136 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggtgattttgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcggaggtgacgacc 14900037  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgatt 229  Q
    |||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||    
T  14900036 ttgaggtgatttggtatcacatgcatatatgtgtcgaactacgtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgatt 14899948  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 19699414 - 19699606
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19699414 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19699513  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19699514 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19699606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 7e-62
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 19709999 - 19710191
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  19709999 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 19710098  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  19710099 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 19710191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 34197658 - 34197812
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34197658 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 34197757  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  34197758 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 34197812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 7134310 - 7134503
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  7134310 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgggatattggggtttga 7134409  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7134410 tgtaattattgatgtgggaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 7134503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8372800 - 8372607
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  8372800 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 8372701  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8372700 tgtaagtattgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcttgttaactgttatttggattatgataatgt 8372607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 37958550 - 37958704
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  37958550 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 37958649  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    |||||||||| |||| ||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  37958650 ttgcatcgaaggtgatgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 37958704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 15274470 - 15274663
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  15274470 tgatgtatatgattgataattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 15274569  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||| |||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15274570 tgtaagtattgatgtgggaattttattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15274663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 27959708 - 27959563
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  27959708 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtaaaatcttacatacgatgtttttg 27959609  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  27959608 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 27959563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 110143 - 109957
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  110143 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcgaaggtgacgacct 110045  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  110044 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 109957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 12245745 - 12245895
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||| ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  12245745 catcatagtcatgttgagtcttgtatttgtaaaagggtttagctcttttacttcggtgattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 12245844  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  12245845 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 12245895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26678370 - 26678179
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||||||||||||    
T  26678370 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgataggtgaatattgatgtgacatattggggtttga 26678271  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| ||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  26678270 tgtaagtattgatatgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 26678179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 44054427 - 44054168
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  44054427 gtgacggccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 44054328  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatt 332  Q
    ||||||| |||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||| | |||||||||| || ||||||||||||          |||||    
T  44054327 tgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgactggtgatttattgatatgagatattgggattatgatgtaagtat----------atatt 44054238  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
      ||| |||||||||||||||||||  ||| ||||| | ||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  44054237 tatatcgatcaagtacatgatgtttgaattaaattaattatgttaactgttatttggattatgatgatgt 44054168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 45460611 - 45460894
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgatt- 229  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| || | |||||  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| |||||     
T  45460611 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccgcatgcatatacgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaactgtgattggtgattt 45460710  T
Q  230 -------gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatg 320  Q
           |||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||| |||| |||||||||     
T  45460711 ggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattgatgaattattgatgtgaaatattggggttatgatataagtatata 45460810  T
Q  321 --tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
      |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||    
T  45460811 catatgtgaatattatcattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattattatgatgt 45460894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 15852829 - 15852959
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  15852829 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactttggtgaaatcttacatacgatgttttttttgcatcgaaggtgacgacc 15852928  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  15852929 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 15852959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Original strand, 41167447 - 41167569
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||| |||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41167447 ttgtggttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatctcacatacgatgtttttgttacatcgaaggtgacgacc 41167546  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  41167547 ttgaggtgattcggtaccacatg 41167569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 15212004 - 15211762
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | |||||| |    
T  15212004 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgtc 15211905  T
Q  143 cttga-ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt-gatatatgtgattgatgattgtgtatgaata 240  Q
    |||   ||  |||||||||||||||||| ||||  || ||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||| ||    
T  15211904 ctttttggatatttggtaccacatgcatttatgtctcaataagtgcatatcataacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgagta 15211805  T
Q  241 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
     || || |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15211804 tttttgaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15211762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 6e-41
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 13244861 - 13244606
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||| |||  ||||||||| |||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  13244861 gtgacgaccctgaaatgatttggtcccacatgcatatatgtgtcaataggtggatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgaa 13244762  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatatt 332  Q
    |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     |||    
T  13244761 tgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----att 13244674  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  13244673 attattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 13244606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 207 - 401
Target Start/End: Original strand, 53706635 - 53706828
Alignment:
Q  207 attgatatatgtgatt-gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt 305  Q
    |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  53706635 attgatatatgtgatttggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtg 53706734  T
Q  306 tgatgtaagta--tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||   || ||||      ||| |||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  53706735 tgatgtaagtactaatttatg-----tttactattgatcaaatgcatgatgtttatactgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 53706828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 13811287 - 13811558
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||| || || |||||||    
T  13811287 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgcgaatgttgattgt 13811386  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| |||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| || ||  ||| | || | |||  | ||    
T  13811387 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcattacacgtgtgattggtgattaatggatgtaagatattgggattatg--gtatgaatttatatttggat 13811484  T
Q  330 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13811485 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 13811558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 30236147 - 30236411
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttat--tgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||| |  || ||||| |||||||||||||||||||  ||| |  |||||||| ||| ||    
T  30236147 gtgacgaccttgaggtgatatggtaccacatccatatatgtgtcaaattaggtgcacatcatgacatgagtcttatgttgagaattgtgattggtgactg 30236246  T
Q  231 tgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaa 328  Q
    ||||||||||| |||| |||  |  ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||  ||| |||| ||||||||| ||          
T  30236247 tgtatgaataactgtgaattattgattgttcatgacacatgtaattggtgatttattgatgtgagatattgcagttatgatataagtatatata------ 30236340  T
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
       |||||||||||| ||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  30236341 ---tattattgatcaggtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 30236411  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 22356424 - 22356616
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttg 307  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  22356424 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattgatgtgagatattggggtcttg 22356523  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| ||||||   |||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| ||||  |||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  22356524 atgcaagtattgttatgtgagtatttttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattattgttaactgttatttggattatgataatgt 22356616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 228 - 401
Target Start/End: Original strand, 20813715 - 20813890
Alignment:
Q  228 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatga 325  Q
    |||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||| | |||||||| || |||| |||||||||  |||     
T  20813715 ttgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattaatgaattattgatgtgaaatattgggattatgatataagtatatacatgt 20813814  T
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |   || |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  20813815 gtgaat-attattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 20813890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 220 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 47355688 - 47355509
Alignment:
Q  220 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  47355688 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 47355589  T
Q  319 tgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatgatgatgt 401  Q
      |||| ||||||| ||||||||||| | ||| ||||    |||||| | ||| || ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  47355588 gttatgtgaatatttttattgatcaaatgcatcatgt---aattgaaatgttcgtgataactgttattggattatgataatgt 47355509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 53909431 - 53909519
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53909431 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 53909519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 41257842 - 41258031
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaag-ggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttttt 122  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| || ||  ||||| |||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||    
T  41257842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagggtg--ctcttctacttcagtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatattttt 41257939  T
Q  123 gttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatca---tgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||||||||   ||||||||||||||||    
T  41257940 gttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcatatcatgttgacatgagtcttatt 41258031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 5372228 - 5372342
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5372228 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaagtcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgatcttgaggtgatttggtaccaca 5372327  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  5372328 tgcatatatgtgtcg 5372342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 10238967 - 10239081
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    |||||||||||| || ||| |||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10238967 actcttttactttggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttgttgcatcatgtgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 10239066  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  10239067 tgcatatatgtgtcg 10239081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 256 - 401
Target Start/End: Original strand, 18294600 - 18294746
Alignment:
Q  256 ttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgt 355  Q
    ||||||||||   ||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |    
T  18294600 ttgttcatgatttatgtgatcggtgattattgatgtgagatattgggatttaatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtagatgatat 18294699  T
Q  356 ttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18294700 ttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18294746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 47469867 - 47469976
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  47469867 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttggggttatttggtaccaca 47469966  T
Q  165 tgcatgtatg 174  Q
    ||||| ||||    
T  47469967 tgcatatatg 47469976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 16521447 - 16521294
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||| | ||||| | |||||||||||     
T  16521447 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttggcttg-tccatcggaggtgacgaccttt 16521349  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga 201  Q
     |  ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||    
T  16521348 tgaagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatga 16521294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 51 - 231
Target Start/End: Original strand, 5684404 - 5684586
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  5684404 tgtaaaagagttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 5684502  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    | ||||||||| ||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  5684503 gagatttggtatcacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttaaatgatgtatgtgattgatgattgt 5684586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Original strand, 50223696 - 50223806
Alignment:
Q  69 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 168  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||    |||| |||||||||||||||||||| ||||||||    
T  50223696 ttttacttcggtgataatgtaagacgggtatgaaatctaacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgatgaccttgaggtgatttggtatcacatgca 50223795  T
Q  169 tgtatgcgtcg 179  Q
    | |||| ||||    
T  50223796 tatatgtgtcg 50223806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 135 - 227
Target Start/End: Original strand, 43283043 - 43283138
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatga 227  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||    
T  43283043 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatga 43283138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15211698 - 15211515
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||  ||||||| ||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||| ||| |||    
T  15211698 tgataaatgtgattggtgattgttaatgaatatttgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattgaggtgtga 15211606  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  ||||||||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15211605 tgtaagtatgaatgtatga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15211515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 321 - 401
Target Start/End: Original strand, 8874265 - 8874346
Alignment:
Q  321 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  8874265 tatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 8874346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 10642683 - 10642586
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  10642683 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 10642586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 19999183 - 19999005
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  19999183 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 19999086  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19999085 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19999005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 227 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34393666 - 34393610
Alignment:
Q  227 attgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393666 attgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 34393610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 204
Target Start/End: Original strand, 52267125 - 52267196
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  52267125 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtc 52267196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 165 - 241
Target Start/End: Original strand, 53706515 - 53706591
Alignment:
Q  165 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 241  Q
    ||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||| |||||||    
T  53706515 tgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttggtgattgtgtgtgaataa 53706591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 217 - 319
Target Start/End: Original strand, 55378542 - 55378646
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 314  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||  |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| |||||||||  || |||||||||    
T  55378542 gtgattgatgattgtgtatgaatatttgtgatttgatgattgttcatgacacataagattggtgattaattgatgtgagatattggaattatgatgtaag 55378641  T
Q  315 tatat 319  Q
    |||||    
T  55378642 tatat 55378646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8372921 - 8372854
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  8372921 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 8372854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18167164 - 18167097
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  18167164 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcatgatacatgtgattggtgatt 18167097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 18496065 - 18496334
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga-tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| | || ||||| |||||||||||||| ||| || | | || ||| |||||| ||||    
T  18496065 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaactaggtgcacatcatgacatgagttttaatggtgaaatatgagtgatgactgtg 18496164  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
     || ||||| ||||  |||||  || ||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || || | | | ||||| | ||   |||    
T  18496165 cataaataaatgtgatttgatgattattcatgaaacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatggtatgaatatatttgtg---ata 18496261  T
Q  331 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||  ||| || | |||||| |||| |||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  18496262 ttattatcggattaaatgcatgatatttaaattgaactattcatgttatttgttatatggattatgatgatgt 18496334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 151 - 221
Target Start/End: Original strand, 54119906 - 54119976
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 221  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54119906 gatttggtaccagatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgat 54119976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 162 - 283
Target Start/End: Original strand, 7134088 - 7134208
Alignment:
Q  162 acatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttc 261  Q
    |||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| || ||| | ||||||| ||||| |||||||||| |||    
T  7134088 acatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattggtg-ttgcgaatgaatatttgtgaattgatatttattc 7134186  T
Q  262 atgacacatgtgattggtgatt 283  Q
     ||| |||||||||||||||||    
T  7134187 ctgatacatgtgattggtgatt 7134208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 9293843 - 9293712
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||    
T  9293843 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa 9293749  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||| |||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  9293748 atatccatgttatctgttatttggattatgataatgt 9293712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 9294021 - 9293924
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||  || ||| ||||||||| |||||||    
T  9294021 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttgtttcataaatgtgattggtgattgt 9293924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 10642505 - 10642374
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  10642505 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 10642411  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  10642410 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 10642374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 51 - 230
Target Start/End: Original strand, 22356065 - 22356244
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22356065 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22356162  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    | ||||||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||||||    
T  22356163 gagatttggtaccacatgcatttatttgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgattg 22356244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 15138134 - 15138238
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| ||| |||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  15138134 gcatcgaaaggtgatgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 15138233  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  15138234 gtgat 15138238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19998700 - 19998517
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||||||||| |||    
T  19998700 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtgtga 19998608  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| |||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||| | ||||| |||||||||||| ||||    
T  19998607 tgtgagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttgactgttatttggattatgataatgt 19998517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 26678626 - 26678522
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  26678626 gcatcgaaagatgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacacgagtcttatgtgaaatatgtgattg 26678527  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  26678526 gtgat 26678522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 47355907 - 47355803
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| || |||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  47355907 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagttcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 47355808  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  47355807 gtgat 47355803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 279
Target Start/End: Complemental strand, 26678491 - 26678428
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt 279  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  26678491 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggt 26678428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8373029 - 8372951
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  8373029 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 8372951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14994772 - 14994678
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| ||||    
T  14994772 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgat 14994678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 151 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18167273 - 18167195
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18167273 gatttggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcaaatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 18167195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 18246762 - 18246668
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  18246762 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 18246668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 217 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19998973 - 19998907
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  19998973 gtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 19998907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 45 - 91
Target Start/End: Original strand, 25120617 - 25120663
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 91  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25120617 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 25120663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 15274361 - 15274442
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||    
T  15274361 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatttgtgattggtgattgt 15274442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 19998845 - 19998780
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||| ||||||||||    
T  19998845 tgattggtgattgtgtatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtaattggtgatt 19998780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 13751910 - 13751978
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| ||||  |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  13751910 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacatatgtgattggtgatta 13751978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18246250 - 18246178
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  18246250 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 18246178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 47355769 - 47355705
Alignment:
Q  219 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  47355769 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 47355705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 155 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 7848902 - 7848776
Alignment:
Q  155 tggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgat 253  Q
    ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||| | |||| || ||||| || |||||||||  ||||| |||||  ||| |    
T  7848902 tggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatctcatttgaaat-tgtgagtggtgattgtgtgcgaatagttgtggtttggt 7848804  T
Q  254 atttgttcatgacacatgtgattggtga 281  Q
    ||||||| | ||| ||||||||||||||    
T  7848803 atttgtttaggacccatgtgattggtga 7848776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16520985 - 16520801
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||| |||||||||||| ||||| |||    
T  16520985 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatatagatgtaagatatcggggtgtga 16520893  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatg-tttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| |||| |||||| ||| |||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  16520892 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgttttaaattgaaatatccatgttaactattatttagattatgatgatgt 16520801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Original strand, 54120066 - 54120195
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||| | | |||||||||   ||||||    
T  54120066 catgtgattgatgattattgatgtgagatattgaggtgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcgaatgcatgatgtt--aattgaa 54120158  T
Q  366 ttattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
     ||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  54120159 atatccatgttaattgttaattggattatgttgatgt 54120195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 328 - 394
Target Start/End: Original strand, 55378691 - 55378757
Alignment:
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttattggattatg 394  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| ||| ||||||||  ||||||||||||||    
T  55378691 atattattattgattaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaacagttattggattatg 55378757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 34393727 - 34393690
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 62  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34393727 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggtt 34393690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14950602 - 14950498
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||| |||||||    
T  14950602 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgggtcaataagtgcatatcatatcatgagtcctatgtgaaatacgtgattg 14950503  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  14950502 gtgat 14950498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 109922 - 109828
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 315  Q
    ||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||||||       |||||| ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||    
T  109922 tgtgattggcgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatg-------tgattgatgattattgatgtgagatatgggggtgtgatgtaagt 109830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 15043443 - 15043381
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15043443 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15043381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 195
Target Start/End: Original strand, 15110981 - 15111043
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 195  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  15110981 gtgacgaccttgaggtcatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 15111043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 218 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 16521080 - 16521015
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||  ||||||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  16521080 tgattggtgattgtgtatgaataattgttaattgatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 16521015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 191
Target Start/End: Original strand, 53706465 - 53706521
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatat 191  Q
    ||||||||| ||||||||| | ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||    
T  53706465 gtgacgaccctgaggtgatctagtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatat 53706521  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 171 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 16521263 - 16521168
Alignment:
Q  171 tatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatga-gtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    |||| ||| ||| |||||||||||||||||| | ||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  16521263 tatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgatggcttattttgaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcatga 16521168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 10487243 - 10487149
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  10487243 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 10487149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 16329508 - 16329602
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  16329508 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 16329602  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 66 - 108
Target Start/End: Original strand, 17213378 - 17213420
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatctta 108  Q
    |||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||    
T  17213378 ctcttttacttcggcgaaaatgtaagacgggtgtgaaatctta 17213420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 18246465 - 18246391
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| |||| |||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  18246465 tgatgtatatgattggtgatcgtgtatgaataactgtggattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 18246391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #94
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 24237525 - 24237479
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| | ||||||||||||||    
T  24237525 actcttttacttcggcgataatgtaagacgtgcgtgaaatcttacat 24237479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 257 - 301
Target Start/End: Original strand, 43283140 - 43283185
Alignment:
Q  257 tgttcatgacacatgtgattggtgattattg-atgtaagatattgg 301  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  43283140 tgttcatgacatatgtgattggtgattgttgaatgtaagatattgg 43283185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #96
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 337 - 396
Target Start/End: Original strand, 5684742 - 5684802
Alignment:
Q  337 ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgat 396  Q
    |||||||||| |||||||||||  ||| | |||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  5684742 ttgatcaagtgcatgatgtttaatttgtaatattcatgttaactgttatttggattatgat 5684802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 13049739 - 13049843
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||  ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  13049739 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatatgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 13049838  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  13049839 gtgat 13049843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 17377040 - 17377084
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||    
T  17377040 gtgatgaccttgaggtgatttggtaccacattcatatatgtgtcg 17377084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0068 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0068
Description:

Target: scaffold0068; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 60250 - 59865
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  60250 catcatattcgtgttgatattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 60151  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat-----g 217  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||  || || |     |    
T  60150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 60051  T
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat-tattgatgtaagatattggg-gtttgatgtaagt 315  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||  | |||| |||||    
T  60050 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatgtattgatgtgagatattgggaatatgatataagt 59951  T
Q  316 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || | | || | ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  59950 at-tatttgtggatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 59865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 208; Significance: 1e-114; HSPs: 73)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 35053515 - 35053141
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35053515 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtagaagggttgaactcttttacttatgagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 35053416  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga---- 220  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||        
T  35053415 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgaatgg 35053316  T
Q  221 ---ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
       ||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||              
T  35053315 tgtttggtgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacacgtgattggtgattattgatgtgagatattgtggtttg---------- 35053226  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  35053225 atgtatgagaatgttattattgatcaagtacatggtgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 35053141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 22407894 - 22408162
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22407894 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgatatgtgcatatcatgacataagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgtg 22407993  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||    
T  22407994 tgaataattgtgaattgatatttgctcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatatgagaatatta 22408093  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22408094 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 22408162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 2422733 - 2422997
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||| ||||||||||    
T  2422733 gtgacgactttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggtgattgtgta 2422832  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  2422833 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa---tat 2422929  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  2422930 tattgatcaagtgtatgatgtttatattgaaatatccatgttaattgttatttggattatgttgatgt 2422997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 5676091 - 5676355
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5676091 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctcttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 5676190  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg----- 219  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||         
T  5676191 tgcattgaaggtgacgaccttgaggtgatacggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 5676290  T
Q  220 --attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
      |||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676291 taattggtgattgtgtatgaataattatgtattgatatttg-tcatgacacatgtgattggtgatt 5676355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 41217739 - 41217544
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  |||    
T  41217739 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttt 41217640  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  41217639 gatgtaagtatatttatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 41217544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Original strand, 5676350 - 5676535
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  5676350 gtgattggtgattgtgtatgaataattgtgtattgataattgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagta 5676449  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  5676450 tatgcatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttataatgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 5676535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 25 - 206
Target Start/End: Complemental strand, 41218126 - 41217945
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41218126 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactattttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 41218027  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 206  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| || |||   |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41218026 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgtatatatctatcgataggtgcatatcatgacatgagtctt 41217945  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 131; E-Value: 8e-68
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20444420 - 20444214
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20444420 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20444321  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  20444320 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 20444221  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  20444220 tgattgt 20444214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 20252534 - 20252342
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||    
T  20252534 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatattcgttcatgatacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgat 20252435  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20252434 gtaagtattgatatgataatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20252342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Original strand, 37845956 - 37846162
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||||     
T  37845956 catcatagtcatgttgaaattgtagttgtaaaagggctgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgtttga 37846055  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    | ||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||     
T  37846056 ttcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattgg 37846155  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  37846156 tgattgt 37846162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 116; E-Value: 7e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 20530185 - 20529978
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||  ||||| ||||     
T  20530185 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacataagatgtgtttga 20530086  T
Q  125 tgcatcgaa-agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    | |||||||  | |||||| ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  20530085 ttcatcgaagggggacgacgttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 20529986  T
Q  224 atgattgt 231  Q
     |||||||    
T  20529985 gtgattgt 20529978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 135 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 49966151 - 49966013
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  49966151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 49966052  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtg 273  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||    
T  49966051 tgaataattggaaattgatatttgttcatgacacatgtg 49966013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 38035130 - 38035260
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  38035130 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaaacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaatgtgacgacc 38035229  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  38035230 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 38035260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 169
Target Start/End: Original strand, 13378250 - 13378395
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13378250 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 13378349  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  13378350 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcat 13378395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 9786123 - 9786315
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||||||||||| | | ||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| ||||    
T  9786123 tgatatatgtgatgggtaattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacaaatgtgattggagattattgatgtgagacattgggg-ttga 9786221  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  9786222 tgtaagtacatgtatgaggatattattattgatcaagtgtatgatgtttatgatgaaatgttcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 9786315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 35524082 - 35524350
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  35524082 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcacgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 35524181  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    ||||||||| ||||  ||| |  |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||||||||||| | |||| |||||    
T  35524182 tatgaataactgtgatttggtgattgttcatgacacatgcgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatgtaagtatttatatgtgaata 35524281  T
Q  331 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    ||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  35524282 tt---attgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 35524350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 46 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 19601836 - 19601713
Alignment:
Q  46 gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacctt 145  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19601836 gtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgttgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctt 19601737  T
Q  146 gaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    ||||||||| ||||||||||||||    
T  19601736 gaggtgattcggtaccacatgcat 19601713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 36357826 - 36357976
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| |||||||||||    
T  36357826 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcagagattatgtaagactggagtgaaatcttacatacgatgtttttg 36357925  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  36357926 ttgcatcgaagatgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 36357976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 91; E-Value: 6e-44
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 37235470 - 37235600
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| | ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  37235470 ttgtagctataaaatggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttaaatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 37235569  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37235570 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 37235600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 20930131 - 20929955
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  20930131 gttgtaaaatggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttacatcggaggtgacgaccttt 20930032  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20930031 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 20929955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 21193844 - 21193694
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| ||||||| || |||| |||||||| |  |  |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21193844 catcatagtcatgttgagttttgtagctgtaaaagaggggtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 21193745  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21193744 ttgcatcgaaggtgacaaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatg 21193694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22226638 - 22226459
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  22226638 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 22226540  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  22226539 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 22226459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 301
Target Start/End: Original strand, 22836911 - 22837078
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||     
T  22836911 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattgatgattgtt 22837010  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattgg 301  Q
     ||| |||| |||| |||||   ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||||    
T  22837011 catg-ataaatgtg-attgaagattgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatattgg 22837078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 338
Target Start/End: Original strand, 22250776 - 22250905
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22250776 tgatgtatatgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 22250875  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattatt 338  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||    
T  22250876 tgtaagtattgatatgagaatattattatt 22250905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 8539490 - 8539584
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8539490 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8539584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 66 - 160
Target Start/End: Original strand, 8604729 - 8604823
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtac 160  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  8604729 ctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtac 8604823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22352785 - 22352601
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22352785 gttgtaaaagggttgagctctcttacttcagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 22352687  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22352686 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgattgt 22352601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 44036401 - 44036582
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | || ||| |  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  44036401 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcaggggtggacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 44036500  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  44036501 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcagtaagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 44036582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 51657986 - 51658255
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatata-tgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||  ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| |  | ||||| ||||||||||    
T  51657986 gtgacgaccttggagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtggaatgtgaatgatgattgt 51658085  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tg--atgtaagtatatgtatgaga 327  Q
    |||||||||| ||||  |||||| ||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||  || ||  ||| | |||||||||         
T  51658086 gtatgaataaatgtgatttgataattgttcatgccacatgcgattggtgattaattgatgtaagatattggaattatggtatgaatgtatatgta----g 51658181  T
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||  |||| ||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  51658182 atattatt-gtgattaagtatatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 51658255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 174
Target Start/End: Original strand, 5769744 - 5769853
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5769744 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 5769843  T
Q  165 tgcatgtatg 174  Q
    ||||| ||||    
T  5769844 tgcatatatg 5769853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 20895390 - 20895486
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20895390 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20895486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 20956627 - 20956776
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  20956627 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 20956726  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
      ||| || |||||| ||||||  |||||||||| |||||||||||||||||    
T  20956727 tcatg-attattgtg-attgatgattgttcatgatacatgtgattggtgatt 20956776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Original strand, 15862938 - 15863149
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| |||   ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  15862938 gttgtaaaagagttcggctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 15863032  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgta 248  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||  ||||||| ||||||| ||||| |    
T  15863033 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattggagattgtgaatgaatatttgtgaa 15863132  T
Q  249 ttgatatttgttcatga 265  Q
    |||||| ||||||||||    
T  15863133 ttgataattgttcatga 15863149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 20821590 - 20821476
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20821590 actcttttacttcggcgataatgtaagacgggcgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttgataccaca 20821491  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  20821490 tgcatatatgtgtcg 20821476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 18505817 - 18505646
Alignment:
Q  229 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaa 328  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||   |||| |      
T  18505817 tgtgaatgaatatttgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatatttgggtgtgatgtaagtattaatatgtg-t 18505719  T
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||||||||||||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  18505718 gattattattgatcaaatgcatgatg-ttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 18505646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Original strand, 5471872 - 5472028
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||| | |  | ||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  5471872 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaatgaggggtactcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttg 5471971  T
Q  124 ttgcatc-gaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5471972 ttgcatcatggggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5472028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 9785899 - 9785995
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  9785899 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 9785995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21716707 - 21716430
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||| | || ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||  ||| |  || ||||||| | |||||    
T  21716707 gtgacgaccttgagataatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtctatttggtgaattgtgattggtaattgt 21716609  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt------tga-tgtaagtatatgtat 323  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | ||      ||  |||  |||||| |||    
T  21716608 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgatacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagattatggtatgtgtgtgtgtatatatat 21716509  T
Q  324 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  21716508 atgaatattattattgatcaagtacatgatgtttataatgaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 21716430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 25 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 20526791 - 20526725
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaag 91  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  20526791 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaatggttgagctcttttacttcggagattatgtaag 20526725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Original strand, 41213197 - 41213311
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||| |||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41213197 actcttttacttcgatgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttattgtatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 41213296  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  41213297 tgcatatatgtgtcg 41213311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 375
Target Start/End: Original strand, 20895514 - 20895660
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||                        
T  20895514 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgtttatgacacatgtgattggtgattattga-------------------- 20895593  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgt 375  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||    
T  20895594 tgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgt 20895660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Original strand, 22144923 - 22145036
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||| ||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22144923 ctcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaattttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 22145022  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  22145023 gcatatatgtgtcg 22145036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 41217867 - 41217793
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41217867 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 41217793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 15863325 - 15863508
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  15863325 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 15863417  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15863418 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatggttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 15863508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21857934 - 21857753
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| ||||| || ||||||| ||||| ||||||| |||||||     ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  21857934 tgataaatgtgattggtgattatgaatgaatatttgtgcattgataattgttca-----catg--attgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 21857842  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21857841 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatacatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 21857753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Original strand, 22250622 - 22250752
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||| ||| ||||   | |||||||||  || |||| |    
T  22250622 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgtgtcatatttggaaatgtgattggagactgtgaa 22250721  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  22250722 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 22250752  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17147003 - 17146820
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||||| ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| | |||| ||||| |||    
T  17147003 tgatatacgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgaaatatcggggtgtga 17146911  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  17146910 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 17146820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 27673355 - 27673257
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||| |||||| |||| |||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||||||    
T  27673355 gtgacgcccttgaagtgagttggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcatatcatgacatgagtctatttgataaatgtgattgatgattgt 27673257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 22365252 - 22365155
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt-attgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||  |||||| ||||||||| |||||||    
T  22365252 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataatgacatgagtcttgtttgataaatgtgattggtgattgt 22365155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17147362 - 17147258
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  17147362 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 17147263  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  17147262 gtgat 17147258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 211 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 22352570 - 22352498
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  22352570 atatttgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 22352498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 15863221 - 15863295
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  15863221 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatacatgtaattggtgatt 15863295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22352468 - 22352285
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||| | ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||| |||    
T  22352468 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgaaaattgttcata-------tgattgatgaatattgatatgagatattggggtgtga 22352376  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||  |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| | ||| |||||||||||| ||||    
T  22352375 tgtaagtattaatgcgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactattatttggattatgataatgt 22352285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 21858035 - 21857966
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtga 220  Q
    |||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||    
T  21858035 gatttggtaccatatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgacatatgtga 21857966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 208
Target Start/End: Original strand, 35935166 - 35935239
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  35935166 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 35935239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 65 - 228
Target Start/End: Original strand, 7642105 - 7642270
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtacca 162  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  | |||||||||||     
T  7642105 actcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagtccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccg 7642203  T
Q  163 catgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  7642204 catgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaattatgtgattggtgat 7642270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 17003396 - 17003302
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17003396 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17003302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22365074 - 22364943
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||| | |||||||||| || |||||||||| | ||||||||||||  |||| |||     |||||||||||||| | ||||| |||||| |||||    
T  22365074 catgtgatggatgattattgacgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaaatgcatgaggtttatgttgaa 22364980  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  22364979 atattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 22364943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22034503 - 22034325
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  22034503 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 22034406  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  22034405 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 22034325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 66 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 45050324 - 45050185
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||| ||||||  || |||||||||||||    
T  45050324 ctcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgatgaccttttggagatttggtaccac 45050230  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||| |||| ||| | | ||||||||||| |||||||||||||    
T  45050229 atgcatttatgtgtcaacaagtgcatatcataacatgagtcttat 45050185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 256 - 369
Target Start/End: Original strand, 20589963 - 20590078
Alignment:
Q  256 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgat 353  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||| | || |||| |||||||||  ||| | |||||||||||||| || || ||||     
T  20589963 ttgttcatgatacatgcgattggtgatttattgatgtgagatattgtgattatgatataagtatatacatgtggatattattattgattaaatatatgag 20590062  T
Q  354 gtttatattgaattat 369  Q
     |||| ||||||||||    
T  20590063 atttaaattgaattat 20590078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 352 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22080240 - 22080190
Alignment:
Q  352 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  22080240 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 22080190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 41393023 - 41392929
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||   ||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  41393023 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagtatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 41392929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51451184 - 51451090
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  51451184 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 51451090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Original strand, 20826805 - 20826909
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  ||||||||||    
T  20826805 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattg 20826904  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  20826905 gtgat 20826909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 5073884 - 5073963
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  5073884 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 5073963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 135 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 18505855 - 18505816
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    
T  18505855 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatg 18505816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 18602627 - 18602706
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  18602627 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 18602706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20444123 - 20444085
Alignment:
Q  279 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20444123 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20444085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 279 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 20529863 - 20529825
Alignment:
Q  279 tgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  20529863 tgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 20529825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 135 - 179
Target Start/End: Original strand, 77632 - 77677
Alignment:
Q  135 gtgacgacctt-gaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  77632 gtgacgacctttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 77677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 37846241 - 37846286
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| |||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  37846241 tgattgatgatcattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 37846286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 256 - 299
Target Start/End: Complemental strand, 27673260 - 27673216
Alignment:
Q  256 ttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatatt 299  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||||    
T  27673260 ttgttcatgacacatgtgattggtgattgcttaatgtaagatatt 27673216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 12874 - 12488
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  12874 catcatagtcgtgttgagattgtagtcataaaaggcttgaactcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 12775  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12774 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcctatttggaaatgtgattgg 12675  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg---tttgatgtaag------ 314  Q
    ||||||||||||||||||| || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||   |||||||||||          
T  12674 tgattgtgtatgaataattttgaattaat-gttgttcatgacacatgtgattggtgatttattaatgtgagatattggggggttttgatgtaagtatata 12576  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  12575 tatatatatgagaatattattattcatcaagtgcatgatgtctatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 12488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 197; Significance: 1e-107; HSPs: 94)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 25 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 6878117 - 6877821
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  6878117 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 6878018  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  6878017 tgcatcgaaggtgacgactttgaggtgatccggtaccaaatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 6877918  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagata-ttggggtttgatgtaagtatat 319  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  6877917 tgattgtgtatgaataattgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgaatggtgatttattaatgtcagatatttgggttttgatgtaagtatat 6877821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 36892360 - 36892628
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36892360 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 36892459  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36892460 tgaataattgtgaattgatatttgttcataacacatgtgattggtgattattgatgtaagctattggggttttgatgtaagtatatgtatgagaatatta 36892559  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  36892560 ttattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 36892628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 174; E-Value: 2e-93
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 25877618 - 25877882
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25877618 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgatatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 25877717  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||||||| |||||||||||||   |||| |||   |||    
T  25877718 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgcgagatattggggattgatgtaagtattgttatgtgaa---tat 25877814  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  25877815 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 25877882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8886814 - 8886450
Alignment:
Q  26 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgtt 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||    
T  8886814 atcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgtt 8886715  T
Q  126 gcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgat 225  Q
    |||||||| |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  8886714 gcatcgaaggtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatgtgtgattggt 8886615  T
Q  226 gattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtat 323  Q
    |||||||  |||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |    
T  8886614 gattgtgagtgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgcgagatattggagtgtgatgtaggtattgatgtgt 8886522  T
Q  324 gagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |     ||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8886521 g-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgataactgttatttggattatgataatgt 8886450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 6e-78
Query Start/End: Original strand, 29 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 22862158 - 22861923
Alignment:
Q  29 atagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgca 128  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  22862158 atagttgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgttgca 22862059  T
Q  129 tcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| |||||||   |  |||||||| ||||    
T  22862058 tcgaaggtgacgaccttgaggtgatctcgtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgattcttatttggaagtgtgattggtgat 22861959  T
Q  229 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 264  Q
    |||| ||||||| ||||| ||||||| | |||||||    
T  22861958 tgtgaatgaatatttgtgaattgataatcgttcatg 22861923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 25600635 - 25600431
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25600635 catcatagtctcgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 25600536  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  25600535 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtaatatggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 25600436  T
Q  225 tgatt 229  Q
    |||||    
T  25600435 tgatt 25600431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 44 - 283
Target Start/End: Original strand, 24088880 - 24089120
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  24088880 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacgtcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaagatgacgacc 24088979  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaata 240  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||| ||| |||    
T  24088980 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgtgcatg-ata 24089078  T
Q  241 attgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    | |||| ||||||  |||||||||| | ||||||||| |||||    
T  24089079 aatgtg-attgatgattgttcatgataaatgtgattgatgatt 24089120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 25 - 209
Target Start/End: Original strand, 19434958 - 19435144
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  19434958 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgaaaaagggttgagctcttt-acttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacgtacgatgtttttg 19435056  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||||||||||||||||    
T  19435057 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttgataccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgacatgagtcttatt 19435144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Original strand, 42180210 - 42180402
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||  |||||||||||||||||    
T  42180210 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaatagctgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgggagatattggggtttgat 42180309  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| || ||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  42180310 gtaagtattgatatgagaatattattattaatcaagtgcatgatgtttatattgaaataatcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 42180402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 45 - 262
Target Start/End: Original strand, 43644471 - 43644688
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| || ||||||||||  ||||||| ||||||  ||| | || |||| ||||||| ||    
T  43644471 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtgaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgcttgattcaacgaaggtgacgatct 43644570  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattg 244  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||| |||    
T  43644571 tttggagatttggtaccacatgcatatatgcgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtgattggtgattgtgaatgaatatttg 43644670  T
Q  245 tgtattgatatttgttca 262  Q
    || ||||||| |||||||    
T  43644671 tgaattgataattgttca 43644688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 19658625 - 19658470
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19658625 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 19658526  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  19658525 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 19658470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 21276342 - 21276535
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  21276342 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatcgatgtgagatattggggtttga 21276441  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   | || |||||| |||||||||||| | ||||||| |||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  21276442 tgtaagtattgatgtgggaatatgattattgatcaaatgcatgatgcttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 21276535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 15632071 - 15631864
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||   ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||   |     
T  15632071 catcatagtcgtgttgtatttgtagttgtaaaagggttaagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgttcaaga 15631972  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
     ||||| || |||||||||| ||||||||| |||||||||||||| | || ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||    
T  15631971 ggcatcaaaggtgacgacctggaggtgattcggtaccacatgcatttttgagtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgataaatgtgattg 15631872  T
Q  224 atgattgt 231  Q
     |||||||    
T  15631871 gtgattgt 15631864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 24966609 - 24966425
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 314  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  24966609 atgtgattggtgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattggtgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaag 24966510  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  24966509 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgagttattcatgttaacttttatttggattatgatgatgt 24966425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 4795 - 4925
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  4795 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 4894  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4895 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 103; E-Value: 4e-51
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Complemental strand, 25304244 - 25304094
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||| | || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25304244 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttaagctattttacttcggagattatgtaagaagggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 25304145  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  25304144 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 25304094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 218 - 386
Target Start/End: Original strand, 12638003 - 12638171
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  12638003 tgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattagtgattattgatgtgagacattggggtttgatgtaagtat 12638102  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
       | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  12638103 tgatgtgggaatattattattgatcaattgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 12638171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 25 - 152
Target Start/End: Complemental strand, 27260257 - 27260130
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27260257 catcatagtcatgttgtgtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27260158  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtga 152  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||    
T  27260157 tgcatcaaaggtgacgaccttgaggtga 27260130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 216 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21140325 - 21140139
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagt 315  Q
    ||||||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21140325 tgtgattgatgattgtaaatgaatacttgtgaattgatatttgttccttatacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagt 21140226  T
Q  316 atatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||   | || ||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  21140225 attgatgtgggaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 21140139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 23823027 - 23823157
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23823027 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23823126  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23823127 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23823157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 23824971 - 23825101
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23824971 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23825070  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23825071 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23825101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 23832106 - 23832236
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23832106 ttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactgaggtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 23832205  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  23832206 ttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 23832236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 43641502 - 43641346
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  43641502 catcatagtcatgttgagtcttgtagccgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacggatgtgaaatcttacatacgatgttttta 43641403  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga 180  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||    
T  43641402 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatatatgtgtcga 43641346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7319989 - 7319718
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || || || ||||||||||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  7319989 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 7319890  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    |||||||| | ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || ||  ||| | |||| || | | ||    
T  7319889 gtatgaatgaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggattatg--gtatgaatatatacgtggat 7319792  T
Q  330 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7319791 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 7319718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 19670629 - 19670778
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | |||    
T  19670629 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatg-tcttg 19670727  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
     ||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||    
T  19670728 atgcatcgaaggtgacgaccttgaggagattcggcaccacatgcatttatg 19670778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22282782 - 22282601
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  22282782 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 22282683  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22282682 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22282601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 24296071 - 24296221
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| ||||||||| |    
T  24296071 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtaagacttgggtgaaatcttacatacgatgttttag 24296170  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  24296171 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 24296221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28972543 - 28972272
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  28972543 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 28972445  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggttt--gatgtaagtatatgtatgagaa 328  Q
    | |||||||| ||||  |||||  ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| | || |||||  ||  | | || |||||| | || |||    
T  28972444 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcaggacacatgtgattggtgattaattgatgtgaaattttgggaattatggtatatgtatatatgtgtgaa 28972345  T
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28972344 tattattattgatcaagtacatgatgttta-attgaactattcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 28972272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 31832 - 32102
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  31832 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 31931  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||| |||||| ||||||||| ||||||| ||||||||   ||  | ||| | |||| |||| | |||    
T  31932 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacatatgtgactggtgattatttgatgtgagatattgaaattata-gtatgaatatatatgtg-ata 32029  T
Q  331 ttattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| | || ||||||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  32030 ttattatcgaattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 32102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 47 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 22273547 - 22273368
Alignment:
Q  47 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||  ||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||||    
T  22273547 tagttgtaaaagagttgagctcttttacttaagagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgacct 22273448  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  22273447 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 22273368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 126 - 283
Target Start/End: Original strand, 12643600 - 12643758
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | |||||||||     
T  12643600 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttggaaatgtgattgg 12643699  T
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12643700 tgattgtgtatgaatatttctgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12643758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 12643812 - 12644000
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  12643812 tgatgtatatgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagacattggggtttga 12643911  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| || ||| || |||| ||||||||||| | |||||||||   |||||| | |||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  12643912 tgtaagtat-tg-atgtgagtatt-ttattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatgttcatgataactgttatttggattatgataatgt 12644000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 133 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 269693 - 269422
Alignment:
Q  133 aagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||| | |||    
T  269693 aagtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattggtaatt 269595  T
Q  230 gtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgaga 327  Q
    ||| || ||||  ||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| || ||||| | |  || | || ||||||  ||| ||    
T  269594 gtgcataaatatatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattgagatcatggtatatgtatat--atgtga 269497  T
Q  328 atattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  269496 atattgttattgatcaaattcatgatgtttatatttaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 269422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 209 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 25600401 - 25600309
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgg 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  25600401 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattgg 25600309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 136 - 401
Target Start/End: Original strand, 24573051 - 24573320
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtg 232  Q
    |||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||| |||||||    
T  24573051 tgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgggtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgaagattgtg 24573150  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
     || ||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||     
T  24573151 cataaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---att 24573247  T
Q  331 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||  ||| || |||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  24573248 ttattatcggattaaatacatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 24573320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 209 - 319
Target Start/End: Complemental strand, 15631812 - 15631702
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  15631812 tgatatatatgattgataatggtgtatgaataattgtaagttgatattcgttcatgacacatgtgattggagattattgatgtgagatattggagtttga 15631713  T
Q  309 tgtaagtatat 319  Q
    |||||||||||    
T  15631712 tgtaagtatat 15631702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22692949 - 22692768
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22692949 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22692851  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22692850 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22692768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 22697596 - 22697415
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  22697596 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattttgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgacctta 22697498  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| || |||| ||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  22697497 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatataataacattagtcttatttgatatatgtgattggtgat 22697415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 22581588 - 22581858
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  22581588 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatttatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 22581687  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | || ||| | | ||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| | || |  ||| | ||||| | ||   ||    
T  22581688 gcataaatgaatatgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgacgtgagatattgagattatagtgtgaatatatttgtg---at 22581784  T
Q  330 attattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||  ||| || || ||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  22581785 attattatcggattaaataaatgatatttaaattgaattattcatgttatttgttatgtggattatgatgatgt 22581858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Original strand, 4450084 - 4450171
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4450084 tatatatatgagaatattgttattgatcaagttcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4450171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 18534464 - 18534350
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||| ||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18534464 actcttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgcaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacgttgaggtgatttggtaccaca 18534365  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  18534364 tgcatatatgtgtcg 18534350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 69 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 24272689 - 24272579
Alignment:
Q  69 ttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgca 168  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  24272689 ttttacttcggtgataatgtaagacgagtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgca 24272590  T
Q  169 tgtatgcgtcg 179  Q
    | |||| ||||    
T  24272589 tatatgtgtcg 24272579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 51 - 179
Target Start/End: Original strand, 22137341 - 22137469
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggt 150  Q
    |||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    ||||||||||||||||    
T  22137341 tgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgaccttgaggt 22137440  T
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  22137441 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 22137469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 461219 - 461139
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  461219 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 461139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 3801123 - 3801306
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  3801123 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 3801215  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  3801216 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 3801306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 38706810 - 38706993
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||| || |||    
T  38706810 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggtgtgtga 38706902  T
Q  309 tgtaagta-tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||| ||   ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  38706903 tgtaagtacta---atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgttttaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 38706993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 9654507 - 9654579
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  9654507 gatttggtaccacatgcatatatgtgtctataggtgcatatcatgccatgagtcttattgatatatgtgattg 9654579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 12637665 - 12637843
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12637665 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12637762  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  12637763 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 12637843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Original strand, 20629034 - 20629114
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  20629034 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcaagagtcttattgatatatgtgattggtgattgt 20629114  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 21140533 - 21140355
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21140533 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21140436  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  21140435 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 21140355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 34822498 - 34822315
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  34822498 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 34822406  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  34822405 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 34822315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 24966770 - 24966692
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  24966770 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgaatcttattgatatatgtgattggtgatt 24966692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 22691607 - 22691758
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22691607 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22691705  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22691706 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22691758  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 22696254 - 22696405
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||| |||||||||    || ||||||| |||||||    
T  22696254 gtgaagaccttgaggtgatatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgtgtcttattggcgaattgtgattggtgattgt 22696352  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    | |||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22696353 gcatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgatta 22696405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 21276027 - 21276205
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||| ||| |||||||||||      
T  21276027 tgtaaaagggttgagctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagc-cttacatacgatgtgcaagtggcatcggaaggtgacgaccttgtt 21276124  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||    
T  21276125 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatttgattggtgat 21276205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 12637873 - 12637940
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  12637873 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 12637940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Original strand, 22691823 - 22691910
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22691823 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22691910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Original strand, 22696470 - 22696557
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||| |||||||||||| |||||| |||| |||||||||||    
T  22696470 tatatgtatgtgaatattattattgatcaagtgcattaagtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggactatgatgatgt 22696557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 25600260 - 25600173
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| || ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  25600260 tatatgtgtgtgaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 25600173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 44 - 204
Target Start/End: Original strand, 24687161 - 24687322
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagt-gacga 141  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || ||||||||||| |||||    
T  24687161 ttgttgttgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaagttgacga 24687259  T
Q  142 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  24687260 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 24687322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Original strand, 3800613 - 3800791
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  3800613 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 3800710  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  3800711 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 3800791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8941784 - 8941712
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  8941784 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 8941712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Original strand, 19888848 - 19888920
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19888848 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 19888920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 25211076 - 25210909
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| || |||||| |||||| ||||| |||    
T  25211076 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatactgatgtgagatatcggggtgtga 25210984  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  25210983 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 25210909  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 34822854 - 34822676
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  34822854 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 34822757  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  34822756 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 34822676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 34822645 - 34822578
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||||||||||    
T  34822645 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcatgatacatgtaattggtgatt 34822578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 6877791 - 6877721
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||| ||||||  ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  6877791 tattattgttcaagtgtatgatgtttatattgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 6877721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 19888362 - 19888456
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  19888362 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 19888456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Original strand, 20629142 - 20629243
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| |||||       |||||||||| | ||||||||||| ||||| |||||| |||    
T  20629142 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgtt-------catgtgattgataattattgatgtgagataatggggtgtga 20629234  T
Q  309 tgtaagtat 317  Q
    |||||||||    
T  20629235 tgtaagtat 20629243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Original strand, 43644713 - 43644814
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||| | ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||    
T  43644713 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgcgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtga 43644805  T
Q  309 tgtaagtat 317  Q
    |||||||||    
T  43644806 tgtaagtat 43644814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 12726709 - 12726531
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  12726709 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 12726612  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  12726611 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 12726531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 25211180 - 25211108
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga 281  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||| || ||||||||    
T  25211180 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataattgtgaattgataattgttcatgatacaagtaattggtga 25211108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 3800822 - 3800889
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||||    
T  3800822 tgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttattcctgatacatgtgaatggtgatt 3800889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 5889880 - 5889974
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  5889880 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 5889974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 9654615 - 9654792
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| |||||||||| | |||    
T  9654615 tgataaatgtgattggtaattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtga 9654707  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| |   ||||||||||||||| | ||||      |||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  9654708 tgtaagtattaatatgtg---attattattgatcaaatgcatg------atattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 9654792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 11232835 - 11232929
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  11232835 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 11232929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 14908022 - 14908116
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  14908022 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 14908116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 22514682 - 22514776
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  22514682 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 22514776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 28777283 - 28777377
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  28777283 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 28777377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22654412 - 22654339
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  22654412 tattattattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 22654339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #81
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 24828161 - 24828218
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24828161 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24828218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #82
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 208
Target Start/End: Original strand, 24832613 - 24832670
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  24832613 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 24832670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #83
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 151 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 720918 - 720835
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||||  || |||||||||||| || ||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  720918 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgtcacgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 720835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #84
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 126 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8942228 - 8942124
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||||  ||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  8942228 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccaagtgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgtgattg 8942129  T
Q  224 atgat 228  Q
     ||||    
T  8942128 gtgat 8942124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #85
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 51 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23773193 - 23773015
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  23773193 tgtaaaagggatga-ctcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 23773096  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23773095 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23773015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 126 - 204
Target Start/End: Original strand, 17398170 - 17398249
Alignment:
Q  126 gcatcgaaag-tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    |||||||||| |||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  17398170 gcatcgaaaggtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 17398249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 3800969 - 3801043
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  3800969 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattaattattattcatgatacatgtaattggtgatt 3801043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #88
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 20013695 - 20013601
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  20013695 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 20013601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #89
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 22273233 - 22273164
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| || || |||||||||||| ||||    
T  22273233 tattattgatcaaatacatgatgatta-attgaaatattcatgttaactgctatttggattatgataatgt 22273164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 23818752 - 23818658
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  23818752 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaattatgtgattggtgat 23818658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #91
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 24089074 - 24089146
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| |||||||||||||||||  |||| ||| |||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||    
T  24089074 tgataaatgtgattgatgattgttcatga-taaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattgatgatt 24089146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #92
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 158 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 25211429 - 25211379
Alignment:
Q  158 taccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  25211429 taccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttat 25211379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 461060 - 461007
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 263  Q
    |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||| ||||||||    
T  461060 gataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgacttgataattgttcat 461007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 317
Target Start/End: Original strand, 23806359 - 23806404
Alignment:
Q  272 tgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||||||||||    
T  23806359 tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtgatgtaagtat 23806404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0462 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0462
Description:

Target: scaffold0462; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4805 - 4425
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  4805 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgt 4706  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 216  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| || ||   ||||| |         
T  4705 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtattgttttggatatgtgattg 4606  T
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggg-gtttgatgtaag 314  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||| | || ||| ||  |||||       |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| || |||||||||    
T  4605 gtgattggtgaatgtgtatgaataactatgaattaatgattgtt-------catgtgattggtgattaattgatgtgagatattgggagtatgatgtaag 4513  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4512 tattgatatgtgaatattattattgatcaaatacatgatgtttatattgacttattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 4425  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0395 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0395
Description:

Target: scaffold0395; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 25 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 14354 - 13964
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  14354 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaattcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtcaaatcttacatacgatgtttttgt 14255  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt---------attgatata 215  Q
    |||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||         ||||  ||     
T  14254 tgcatcgaagatgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttatgttgaaaattgtgatt 14155  T
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaa 313  Q
     |||||||| ||||||||||||||   ||||  |||||  |||||||||||||||  ||||| ||| ||||| |||| ||||||||||||| |||| |||    
T  14154 ggtgattgacgattgtgtatgaatgtctgtgatttgatgattgttcatgacacatacgattgatgacttattaatgtgagatattggggttatgatataa 14055  T
Q  314 gtatat--gtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||   |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  14054 gtatatacatatgtgaatattattattgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgttgatgt 13964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 188; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 188; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31304 - 31038
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  31304 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 31205  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| | ||||||||||||||    
T  31204 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattgggg-ttgatgtaagtatttttatgagaatattat 31106  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  31105 tattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 31038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 169; Significance: 2e-90; HSPs: 3)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 2e-90
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 21128 - 20860
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || |||||||    
T  21128 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgtgta 21029  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatatta 333  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  21028 tgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttatgattggtgattattgatgtgagatattgggattatgatgtaagtatatgtatgagaatatta 20929  T
Q  334 ttattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || || ||||| | ||||||| ||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  20928 ttgttaatcaaatgcatgatgcttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 20860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28719 - 28450
Alignment:
Q  134 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 233  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| || ||| ||    
T  28719 agtgacgaccttgaggagatttggcaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatgtatgtgattggtgtttgagt 28620  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttgatgtaagtatatgtatgagaatatt 332  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  | |  |||||||||| ||||||||||||||||    
T  28619 atgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacttgtgattggtgattattgatgtgagatattcagatcatgatgtaagtctatgtatgagaatatt 28520  T
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| |||||||| | ||||||||||  |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28519 attgttgatcaaatgcatgatgtttcaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 28450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 5e-32
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Original strand, 129700 - 129877
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||||| | |||||   ||||| ||||| | |||| ||| ||     
T  129700 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacaatgttgagttgttccatcggaggtgaagacgttt 129799  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  129800 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 129877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 164; Significance: 2e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 317
Target Start/End: Original strand, 249025 - 249313
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  249025 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttaggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacataagatgtttttgt 249124  T
Q  125 tgcatcgaaagt---gacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat 221  Q
    ||||||||| ||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||    
T  249125 tgcatcgaaggtgacgacgaccttgaggtgatctggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgat 249224  T
Q  222 tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    || |||||||| ||||||| ||||| ||||||| |||||       |||||||||  ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  249225 tggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgtt-------catgtgattaatgattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtat 249313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 6)
Name: scaffold0447
Description:

Target: scaffold0447; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3301 - 3095
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  3301 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 3202  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  3201 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 3102  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  3101 tgattgt 3095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2811 - 2737
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2811 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #3
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 2939 - 2865
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2939 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #4
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 2683 - 2616
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2683 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 2616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #5
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 3067 - 2993
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3067 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0447; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 2561 - 2475
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  2561 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 2475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 7)
Name: scaffold0383
Description:

Target: scaffold0383; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 5909 - 5703
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||    
T  5909 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaattttacatacgatgtttttgt 5810  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||| |||||||||     
T  5809 tgcatcgaaggtgacgagcttgaggtgatttggtaccacatgcatgtacgtgtcgataggtgcatatcatgctatgagtcttattgataaatgtgattgg 5710  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  5709 tgattgt 5703  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #2
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 135 - 265
Target Start/End: Complemental strand, 943 - 813
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||| ||||||| |    
T  943 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgaagattgtgaa 844  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatga 265  Q
    |||||| ||||| ||||||| ||||||||||    
T  843 tgaatatttgtgaattgataattgttcatga 813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 209 - 276
Target Start/End: Complemental strand, 5547 - 5480
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgatt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5547 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtgatt 5480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #4
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 5675 - 5601
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5675 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 5601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #5
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 511 - 328
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  511 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 419  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  418 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatggtaactgttatttggattatgataatgt 328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #6
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5425 - 5339
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||| |||| |||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  5425 tatatatatgaggatatcattattgatcaaatgcatgatgtttatgttgaa-tattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 5339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0383; HSP #7
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 715 - 641
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||    
T  715 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgataattgttcatgatacatgtaattggtgatt 641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 3)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 8108 - 7842
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8108 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8009  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt---gatatat----- 216  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    | || |         
T  8008 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttgttttgcaaatgtgagtg 7909  T
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| | || ||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||    
T  7908 gtgattggtgattgtgtatgaataactatgaattaatgattgttcatgacaaatgtgattggtgatt 7842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #2
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 209 - 385
Target Start/End: Complemental strand, 7631 - 7453
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||  |||    
T  7631 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtgattattgatgggagatattggggttttt 7532  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat 385  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||    
T  7531 gatgtaagtatatgtatgagaatattattcttgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttat 7453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622; HSP #3
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 209 - 286
Target Start/End: Complemental strand, 7759 - 7682
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 286  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7759 tgataaatgtggttggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattatt 7682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0480 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0480
Description:

Target: scaffold0480; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 134 - 401
Target Start/End: Original strand, 7012 - 7287
Alignment:
Q  134 agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgt 233  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  7012 agtgacgaccttgaggttatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgtttggtgattgtgt 7111  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta------tatgtatgag 326  Q
     ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||      ||| ||||||    
T  7112 gtgaataattgaaaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatatgtatatatgag 7211  T
Q  327 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||| | ||| || ||||||||||||||    
T  7212 aatatcattattgatcaaatgtatgatgtttatattgaattattcatgttaacttttattttgattatgatgatgt 7287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396 (Bit Score: 161; Significance: 1e-85; HSPs: 4)
Name: scaffold0396
Description:

Target: scaffold0396; HSP #1
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 25 - 229
Target Start/End: Original strand, 13680 - 13884
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13680 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 13779  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||     
T  13780 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgtatatcatgacatgaatcttattgataaatgtggttgg 13879  T
Q  225 tgatt 229  Q
    |||||    
T  13880 tgatt 13884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 16103 - 15922
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  16103 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 16005  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || |||||| |||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  16004 tggagatttgataccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 15922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #3
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 302
Target Start/End: Original strand, 13914 - 14007
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg 302  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  13914 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatgttggg 14007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0396; HSP #4
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Original strand, 14078 - 14154
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  14078 gaatactattattgatcaagtgcatgatgtttagtttgaaatattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 14154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2147 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold2147
Description:

Target: scaffold2147; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 802 - 535
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| | |||  |||    
T  802 gtgacgacctttaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcataccatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtaattacgta 703  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    ||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  702 tgaataactgtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattat 603  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||| ||| |||||| |||||||| ||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  602 tattgatcaagtgcatgatgcttaaattgaaatattcatgctaactgttatttgtattatgatgatgt 535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0434
Description:

Target: scaffold0434; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 25 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 3335 - 3129
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3335 catcatagtcttgttgagtttgtagttgaaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 3236  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||     
T  3235 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgtgtcaataggtgcatatcatgccacgagtcttattgataaatgtggttgg 3136  T
Q  225 tgattgt 231  Q
    |||||||    
T  3135 tgattgt 3129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0434; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3101 - 2907
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 307  Q
    ||||||||||||||| | |||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||| ||| |||||||||  ||  |    
T  3101 tgatatatgtgattggtaattgtgtatgaataaccgtgaattgatatttgttcatgacacatatgattagtgactattgctgtgagatattggaattggg 3002  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    || || |||||| |||| ||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  3001 atataggtatatttatgtgaatactattattgttcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 2907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 25 - 283
Target Start/End: Original strand, 3784 - 4044
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3784 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatataagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 3883  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtga 220  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| |||||||||||||| |||||| | | ||||||    
T  3884 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtattattggtgaaatgtga 3983  T
Q  221 ttgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||||||| ||| |||| |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  3984 ttgatgattgtgcatg-ataaatgtg-attgatgattgttcatgacacatgtgattggtgatt 4044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 149; Significance: 1e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 1046 - 1307
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  1046 gtgacgaccttgaggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatattatgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgggta 1145  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattat 334  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||   || | |||          
T  1146 tgaataattgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattgatacgtgaa------ 1239  T
Q  335 tattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| | ||| || ||||||||||||||    
T  1240 tattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgataactattattttgattatgatgatgt 1307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 147; Significance: 2e-77; HSPs: 8)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 20067 - 19799
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20067 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 19968  T
Q  125 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt--gatatat---- 216  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||  || || |        
T  19967 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 19868  T
Q  217 -gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
     ||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  19867 ggtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattgctgatta 19799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 17983 - 17776
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  17983 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagtgttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaactcttacatacgatgtttttgt 17884  T
Q  125 tgcatcgaa--agtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 222  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  ||| ||| ||| ||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||    
T  17883 tgcatcgaaggcgtgacgaccttgaggtgatttggtaccaaatgcattaatgtgtcaataagtgcatatcatgatatgagtcttatttggaaatgtgatt 17784  T
Q  223 gatgattg 230  Q
    | ||||||    
T  17783 ggtgattg 17776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #3
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 8140 - 8293
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  8140 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 8239  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  8240 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 8293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #4
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 13529 - 13682
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||| ||| |||| ||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  13529 catcatagtcatgtagagtttgttgttgtaaataggttgaactcttttacttcggagattatctaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttgt 13628  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||    
T  13629 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatgcgtc 13682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #5
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17716 - 17526
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  17716 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 17617  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  17616 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 17526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #6
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 19746 - 19556
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  19746 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgtccatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 19647  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||| |||   |||||||||| |||| ||| |||||||||||| | ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  19646 tgtaagtattgatatgtgaa---tattattgatgaagtgcataatgtttatattggaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 19556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #7
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 8466 - 8539
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  8466 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 8539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #8
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 13855 - 13928
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  13855 tattatcattgattaagtatatgaaatttgaattgaattattcatgttaattgttattttgattatgatgatgt 13928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 25 - 208
Target Start/End: Complemental strand, 27250 - 27067
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  27250 catcatagtcttgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 27151  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat 208  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  27150 tgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatccggtactacatgcatttatgtgtcgataagtgcatatcatgacatgagtcttat 27067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 321 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 26954 - 26889
Alignment:
Q  321 tatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||| |||||||    
T  26954 tatgtgaatattatttttgatcaagtacatgatgtctgaattgaattattcatgttaactgttatt 26889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 142; Significance: 2e-74; HSPs: 5)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 236597 - 236412
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  236597 gtgattggtgattgtgtatgaataatggtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtcagatattggggttcgatgtaagta 236498  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||    
T  236497 tatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatattcatgttaattgttatttgaattatgatgatgt 236412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #2
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 25 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 236857 - 236652
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||||   ||    
T  236857 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagaaaggtgtgaaatcttacatacgatgttaaagt 236758  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattga 224  Q
     |||||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||||     
T  236757 agcatcgaaggtgacgacctagaggtgataaggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgg 236658  T
Q  225 tgattg 230  Q
    ||||||    
T  236657 tgattg 236652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #3
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 270785 - 270545
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||     
T  270785 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgat 270686  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 241  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| |||||||     
T  270685 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaatat 270586  T
Q  242 ttgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||| ||||||| || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  270585 ttgtgaattgata-ttattcatgatacatgtaattggtgatt 270545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #4
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 270515 - 270329
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  270515 tgataaatgtgattggttattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatattggggtttga 270423  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  270422 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 270329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 129
Target Start/End: Original strand, 255963 - 256007
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 129  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  255963 atgtaagacgggtatgaaatcttacatttgatgtttttgttgcat 256007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 3)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 28145 - 27950
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggg--gttt 306  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||    
T  28145 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtgttt 28046  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  28045 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgctaactgttatttggattatgatgatgt 27950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28327 - 28179
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||    
T  28327 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatttgtgtttgatgattgagta 28228  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||| |||| ||||||||||||| |||| | ||||| ||| |||||    
T  28227 tgaataactgtgaattgatatttgttaatgatatatgtggttgatgatt 28179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 28199 - 28125
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | |||||||||||||||    
T  28199 tgatatatgtggttgatgattgagtatgaataactgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatt 28125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 141; Significance: 9e-74; HSPs: 2)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 9e-74
Query Start/End: Original strand, 25 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 56615 - 56369
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  56615 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcagagattatgtaagacgggtttgaattcttacatacgatgtttttgt 56516  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgat--- 221  Q
    ||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | |||||||       
T  56515 tgcatcgaatgtgacgaccttttggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgattgt 56416  T
Q  222 ----tgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatg 264  Q
        |||||||||||||||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  56415 tgaatgatgattgtgtatgagtaactgtgaattgatgtttgttcatg 56369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 229 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 56370 - 56206
Alignment:
Q  229 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgag 326  Q
    ||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||             
T  56370 tgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgac-catgtgattggtgatttattgatgtgagatattagggttatgatgtaagtat--------- 56281  T
Q  327 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||  |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  56280 -atatttatattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 56206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 4)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 3248 - 3055
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttga 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||    
T  3248 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgagatattggggttttga 3149  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  3148 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatttttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 3055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #2
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 477 - 281
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||| ||||    
T  477 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacacgtgattggtgattgttgaggtaagatattggggttttg 378  T
Q  308 atgtaag--tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||  ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||| ||| |||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  377 atgtaagtatatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttgaattgaaatatccatgctaactgttatttggattatgataatgt 281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #3
Raw Score: 84; E-Value: 9e-40
Query Start/End: Original strand, 49 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 739 - 577
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  739 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 640  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  639 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatt 577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269; HSP #4
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 3518 - 3430
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3518 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 3430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30843 - 30650
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-ga 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||||||| ||    
T  30843 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaagtgatatttgttcatgacacatgtgaatggtgattattaatgtgagatattggggttttga 30744  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  30743 tgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 30650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 31090 - 31002
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31090 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 31002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 135; Significance: 3e-70; HSPs: 2)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 25 - 284
Target Start/End: Complemental strand, 8754 - 8493
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8754 catcatagtcttgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 8655  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgatt 222  Q
    || |||| | |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  || ||||    
T  8654 tgaatcggaggtgacggccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgagatt 8555  T
Q  223 gatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    | ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| || ||||| |||||||||    
T  8554 ggtgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacgtgtgagtggtgatta 8493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 8443 - 8387
Alignment:
Q  346 tacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  8443 tacatgacgtttatagtgaattattcatgttaattgttatttggattatgatgatgt 8387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359 (Bit Score: 134; Significance: 1e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0359
Description:

Target: scaffold0359; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 13548 - 13740
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||    
T  13548 tgatatttgtgattggtgattgtgtataaataattgtgaattgatatt-gttcatgacacatgtgattagtgaatattgatgtgagatattggggtttga 13646  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  13647 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 13740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0359; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 259
Target Start/End: Original strand, 13434 - 13557
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||||    
T  13434 gtgacgaccttgaagtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggttcatatcatgacatgagtctt-ttgatatatgtgtttagtgattgtgta 13532  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgt 259  Q
    ||| |||||||  | ||||||||||    
T  13533 tgagtaattgttaaatgatatttgt 13557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 132; Significance: 2e-68; HSPs: 3)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 15006 - 15271
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatga-ttgtgt 233  Q
    ||||||||| |||| |||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| || ||| |||||     
T  15006 gtgacgaccctgagatgattttgtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatacatgtgactggtgatttgtga 15105  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatat 331  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||  |||||||     ||    
T  15106 atgaatattagtgaattgataattgttcatgacacatgtgattgattattattgatgtgagatattggggtgtgatgtaagtattaatgtatg-----at 15200  T
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  15201 tattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaattattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 15271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #2
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 26642 - 26451
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgat 309  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||| ||||||||||| |||||    
T  26642 gatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattatgaatgtgagatattgggg-ttgat 26544  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  26543 gtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 26451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 25 - 118
Target Start/End: Original strand, 23915 - 24009
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt 118  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23915 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgaagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgt 24009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673 (Bit Score: 127; Significance: 2e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0673
Description:

Target: scaffold0673; HSP #1
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 135 - 319
Target Start/End: Original strand, 3707 - 3893
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||     
T  3707 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatgacatgagttttgttgatatatgtgattgatgatggtgtg 3806  T
Q  235 tgaataattgtgtattgata-tttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagtatat 319  Q
    |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  3807 tgaataattgtgaattgatattttgttcatgacacatgtgattagtgattattaatgtgagatattggggttttgatgtaagtatat 3893  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0673; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Original strand, 3927 - 4014
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||| ||||||||| |||||||    
T  3927 tatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactattatttggattataatgatgt 4014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 4638 - 4831
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4638 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 4737  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  4738 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 4831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 4250 - 4435
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  4250 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 4349  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  4350 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 4435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 126; Significance: 8e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 8e-65
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 49478 - 49671
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  49478 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtaaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 49577  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  49578 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 49671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 49 - 231
Target Start/End: Original strand, 49090 - 49275
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | |||||||||||     
T  49090 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgaccttt 49189  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  49190 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacattactcttatttgatatatgtgattggtgattgt 49275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 135 - 294
Target Start/End: Original strand, 26416 - 26575
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26416 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcttgacatgagtcttattgatatatgtgattggtgattgtgta 26515  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaag 294  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  26516 tgaataattgtgaattgagatttgttcatgacacatgtgattgatgattattgatgtaag 26575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 25 - 145
Target Start/End: Original strand, 70883 - 71003
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  70883 catcatagtcatgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagataggtgtgaaatcttccatacgatgtttttgt 70982  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgacctt 145  Q
    ||||||||| |||||||||||    
T  70983 tgcatcgaaggtgacgacctt 71003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 141 - 401
Target Start/End: Original strand, 66322 - 66592
Alignment:
Q  141 accttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattg-------tgt 233  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   |  |||||||| ||||||       |||    
T  66322 accttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattttgaagtgtgattggtgattgggaattgtgt 66421  T
Q  234 atgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatat 331  Q
    |||| ||| | || ||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||| ||||| | |||||||| | || ||||||||||||   |||| ||||||    
T  66422 atgagtaactatggattgatgattgttcatgattcatgtgattggtgattaattgatatgagatattgagattatgatgtaagtattgatatgtgaatat 66521  T
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||    
T  66522 tattattgagcaagtacatgatgattatattgaattattcatgttaaatgtcatttggattatgatgatgt 66592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 332 - 401
Target Start/End: Original strand, 26590 - 26660
Alignment:
Q  332 tattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||    
T  26590 tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttctttggattatgatgatgt 26660  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 123; Significance: 5e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 5e-63
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 21633 - 21827
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttg 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  21633 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgacattttttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttg 21732  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| |||||||||||||||||    
T  21733 atgtaagtatatatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatatttatgctaactgttatttggattatgatgatgt 21827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 5)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 156183 - 156376
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  156183 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgattattgatgtgagatattggagtttga 156282  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  156283 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 156376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 85966 - 86149
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||||||||        |||||| |||||||||||||  ||||||||||| |||    
T  85966 tgataaatgtgattgttgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgggatattggggtgtga 86058  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     || ||||||||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||    
T  86059 tgtaagtattaatgtgtga-----ttgttattgatcaaatgcatgatgtttatagtgaaatattcatgttaattgttatttggattatgataatgt 86149  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 53 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 34989 - 34811
Alignment:
Q  53 taaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgaggt 150  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| | ||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||  |     
T  34989 taaaaggattgaactcttttacttcg-atattattgtaaggcaggtgtgagcccttacatacgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgttga 34891  T
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| |||||    
T  34890 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgatt 34811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 283
Target Start/End: Original strand, 156062 - 156129
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||| |||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  156062 tgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatgtgattggtgatt 156129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 155937 - 156031
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  155937 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcagatcataacatgagtcttatgtgacatatgtgattggtgat 156031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 119; Significance: 1e-60; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 25 - 178
Target Start/End: Original strand, 71768 - 71922
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagatt-gtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  71768 catcatagtcatgttgagttttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacggttgtgaaatcttacatacgatgtttttg 71867  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtc 178  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||    
T  71868 ttgcatcgaatgtgacgaccttgaggtgatttggtaccacaggcatttatgcgtc 71922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 72093 - 72166
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||| |||  | ||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  72093 tattatcattgattaagtatatgatatttgaaatgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 72166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 117; Significance: 2e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 218 - 401
Target Start/End: Original strand, 2474 - 2658
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||| | ||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  2474 tgattggtaattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattgatgtgagatattggggtttgatgtaagtat 2573  T
Q  318 atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
       | |||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  2574 tgatttgagaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 2658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 4346 - 4078
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtg 232  Q
    ||||||||||||| ||||  |||||||||||| || |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||    
T  4346 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgtatatatgtgtcgggctaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtg 4247  T
Q  233 tatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    ||||||||| ||||  ||| |   ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||    
T  4246 tatgaataactgtgatttggtgagtgttcatgacacatgtgattggttattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatgtatatgtgaata 4147  T
Q  331 ttattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  4146 ctatt---gatcaagcacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttattttgattatgatgatgt 4078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 209 - 399
Target Start/End: Complemental strand, 77793 - 77600
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg--ttt 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||| ||||||| |||  |||    
T  77793 tgatatatgtgattggtgattgtgcatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatttgattggtggttatggatgtgagatattagggttttt 77694  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgat 399  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  77693 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaaatgttatttggattatgatgat 77600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 77977 - 77919
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||| ||||||||| ||||||||||||    
T  77977 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgtatatcatgatatgagtcttatt 77919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 256 - 303
Target Start/End: Complemental strand, 36047 - 35999
Alignment:
Q  256 ttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattgggg 303  Q
    |||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  36047 ttgttcatgatacatgtgattggtgatttattgatgtgagatattgggg 35999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 2)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 175
Target Start/End: Original strand, 2112 - 2262
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt 124  Q
    |||||||||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2112 catcatagtcatgtagagtttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgt 2211  T
Q  125 tgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgc 175  Q
    || |||||| ||||||| |||||||||||  |||||||||||||| |||||    
T  2212 tgaatcgaaggtgacgatcttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgc 2262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 2438 - 2511
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||||| ||||| ||||  |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  2438 tattatcattgattaagtatatgaaatttggattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 2511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0253 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0253
Description:

Target: scaffold0253; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 218 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 15032 - 14849
Alignment:
Q  218 tgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattgggg-tttgatgtaagta 316  Q
    |||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  15032 tgattggtgattgtgtacgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagta 14933  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| | |||||||||   |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  14932 tatatatgagaatattattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 14849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 111; Significance: 7e-56; HSPs: 6)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 7e-56
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 106409 - 106559
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  106409 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 106508  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  106509 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 106559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 155 - 401
Target Start/End: Original strand, 113902 - 114150
Alignment:
Q  155 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 252  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||   || ||||| |||| |||||||||||| ||   |  |||||||| ||||||||||| ||||| | ||  |||     
T  113902 tggtaccacatgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcaagacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtataaataactatgatttgg 114001  T
Q  253 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatta-ttgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacat 350  Q
    |  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | |||| |||||||   |||||||||||||||    
T  114002 tgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttatatgtgaatatt---attgatcaagtacat 114098  T
Q  351 gatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||    
T  114099 gatgtttatattgaattattcatgttaactgttatttgaattatgatgatgt 114150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 6649 - 6830
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  6649 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 6747  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  6748 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 6830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 66 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 130522 - 130409
Alignment:
Q  66 ctcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 165  Q
    |||||||||||||| ||| | ||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130522 ctcttttacttcggtgataacgtaagaccggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccacat 130423  T
Q  166 gcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||| |||| ||||    
T  130422 gcatatatgtgtcg 130409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 58936 - 59117
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  58936 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacataagatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 59034  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
         |||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  59035 ttaaaatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 59117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #6
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 108156 - 108058
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||  | |||||||||||| ||||    
T  108156 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaacttggtgcacatcatgacatgagtcttattgggaaatgtgattgatggttgt 108058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 2)
Name: scaffold0292
Description:

Target: scaffold0292; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 210 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 17928 - 17735
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggt-ttga 308  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || ||||||| |  |||    
T  17928 gatatatgtgattggtgattgtgtattaataactgttaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatgtgaggtattgggataatga 17829  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  17828 tataagtatatatatgagaatattattattgatcaagtacatggtgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattttgatgatgt 17735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0292; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 18151 - 18055
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||    
T  18151 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtggttggtgattgt 18055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0191 (Bit Score: 110; Significance: 3e-55; HSPs: 1)
Name: scaffold0191
Description:

Target: scaffold0191; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 215 - 401
Target Start/End: Original strand, 499 - 683
Alignment:
Q  215 atgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaag 314  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||    
T  499 atgtgattggtgatggtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattggggtttgatgtaag 598  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||   |||| |||   ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  599 tattgatatgtgaa---tattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 106; Significance: 7e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 7e-53
Query Start/End: Original strand, 209 - 386
Target Start/End: Complemental strand, 29830 - 29653
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29830 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataacggtgaattgatatttgttcattacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 29731  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt 386  Q
    |||||||||   | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||||||    
T  29730 tgtaagtattgatttgtgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatt 29653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 105; Significance: 3e-52; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 64 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 68964 - 68785
Alignment:
Q  64 aactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  68964 aactcttttacttgggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgatatggtaccac 68865  T
Q  164 atgcatgtatgcgtcg--atatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataa 241  Q
    |||||| |||| ||||   || ||||| ||||||||||||||||| ||   |  |||||||| |||||||||||||||||    
T  68864 atgcatatatgtgtcggactaggtgcacatcatgacatgagtcttgttttgaattgtgattggtgattgtgtatgaataa 68785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 225 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 68773 - 68597
Alignment:
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat-tgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgta 322  Q
    ||||||||||||||||| ||||  ||| |  |||||||||| ||||||||||||||||||  |||||| ||| |||||| || |||| ||||||| | ||    
T  68773 tgattgtgtatgaataactgtgatttggtgattgttcatgatacatgtgattggtgattaactgatgtgagaaattgggattatgatataagtatttata 68674  T
Q  323 tgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 398  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  68673 tgcgaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 68597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 25 - 72
Target Start/End: Complemental strand, 69441 - 69394
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattgtagttgtaaaagggttgaactctttt 72  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  69441 catcatagtcatgttgagtttgtagttgtaaaagggttgaactctttt 69394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 184 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 30531 - 30314
Alignment:
Q  184 gtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgat 282  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||| | | || |||||||| ||||||| ||||||| |||| |||||    |||||||||||||||||| |||||||    
T  30531 gtgcacatcatg-catgagtcttattggtgaaatatgattgataattgtgtgtgaataaatgtg-attgaagaatgttcatgacacatgtgactggtgat 30434  T
Q  283 t-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaatt 380  Q
    | |||||||| ||||| ||||| ||   ||| | |||| |||| | ||||||||||  ||| || | |||||| |||  |||||||||||||||||||||    
T  30433 tgattgatgtgagata-tggggattatagtatgaatatatatgtg-atattattatcggattaaatgcatgatatttgaattgaattattcatgttaatt 30336  T
Q  381 gttat-tggattatgatgatgt 401  Q
     |||| | ||||||||||||||    
T  30335 attatatagattatgatgatgt 30314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 33580 - 33395
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  33580 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 33481  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  33480 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 33395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 32688 - 32869
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  32688 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 32787  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32788 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 32869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 258
Target Start/End: Complemental strand, 33848 - 33725
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  33848 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 33749  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  33748 tgaataattgtgaattgatgtttg 33725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 101; Significance: 6e-50; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 101; E-Value: 6e-50
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 39264 - 39449
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||| |||||    
T  39264 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataaatgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattgggatttga 39363  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||        ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  39364 tgtaagtat--------gaatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 39449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40156 - 39975
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  40156 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 40057  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40056 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 39975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 258
Target Start/End: Original strand, 38996 - 39119
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||   | ||||||||| ||| | |||     
T  38996 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatttgaaaatgtgattggtgagtatgtg 39095  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttg 258  Q
    |||||||||||| |||||| ||||    
T  39096 tgaataattgtgaattgatgtttg 39119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338 (Bit Score: 100; Significance: 2e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0338
Description:

Target: scaffold0338; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 2e-49
Query Start/End: Original strand, 209 - 398
Target Start/End: Complemental strand, 7175 - 6984
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 307  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| ||| || ||    
T  7175 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgattgttcatgacacgtgtgattggtgattattgatgtgagatatcgggattatg 7076  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatga 398  Q
    |  ||||||||  | |  ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  7075 agataagtatacatgtatgaatattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatga 6984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0338; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 7298 - 7214
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 219  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7298 gtgacgaccttgaggtgatttagtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgataaatgtg 7214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0507 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0507
Description:

Target: scaffold0507; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 4842 - 4991
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4842 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagagttgagctcttttacttcggagattatgtatgacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttg 4941  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  4942 ttgcatc-aaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 4991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 252 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 23190 - 23040
Alignment:
Q  252 atatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatg 351  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  23190 atatttgttcagaacacatgtgattgatgattattaatgtgagatattggggtttgatgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaagtgcatg 23091  T
Q  352 atgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  23090 atgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 23040  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 333 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 16445 - 16376
Alignment:
Q  333 attattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||    
T  16445 attattgatcaagtgcatgatgtttatattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgatgatgt 16376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 98; Significance: 4e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 4e-48
Query Start/End: Original strand, 45 - 283
Target Start/End: Original strand, 2627 - 2869
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||  | ||||||||    
T  2627 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcagaggtgacgac 2726  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtg--catatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgtgtatgaat 239  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  2727 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcacatatcatgacatgagtcttatttgatatttgtgattggtgattgtgaatgaat 2826  T
Q  240 aattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    | ||||| ||| ||  || ||||||| |||||| ||||||||||    
T  2827 atttgtg-attaatgattattcatgatacatgtaattggtgatt 2869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 2899 - 3083
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggt-gattattgatgtaagatattggggtttg 307  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| | |||||||||||| |||||| ||||| ||    
T  2899 tgataaatgtgattggtgtttgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgattgattattgatgtgagatatcggggtgtg 2991  T
Q  308 atgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttatt-ggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||  |||| |||     |||||| ||||||||| ||| ||||||| |||||| ||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  2992 atgtaagtattaatgtgtga-----ttattaatgatcaagtgcattatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgatgatgt 3083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 151 - 401
Target Start/End: Original strand, 19248 - 19489
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtatt 250  Q
    |||||| |||||||||||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||  |||    
T  19248 gatttgataccacatgcatatatgtggcgataggtgcatatcatgacatgagtctttttgatatatgtgattggtgattgtgaatgaatatttgtaaatt 19347  T
Q  251 gatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtac 348  Q
    |||| |||||       ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |    
T  19348 gataattgtt-------catatgattgatgattattgatgtgagatattgggatgtgatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgc 19435  T
Q  349 atgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  19436 atgatgtttatattgaaatattcatgttaaatgttatttggattatgataatgt 19489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 211 - 370
Target Start/End: Complemental strand, 94495 - 94335
Alignment:
Q  211 atatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgat 309  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||| || ||||    
T  94495 atatatgtgattggtggttgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattaatatgagatattgggattatgat 94396  T
Q  310 gtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattatt 370  Q
     ||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||||    
T  94395 ataattatatatatgagaatattattattgatccagtacatgatgtttgaattgaattatt 94335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 184 - 231
Target Start/End: Complemental strand, 94742 - 94695
Alignment:
Q  184 gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||| |||||||    
T  94742 gtgcatatcatgacatgagtcttatatataaatgtgattggtgattgt 94695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 97; Significance: 2e-47; HSPs: 5)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 135 - 283
Target Start/End: Original strand, 90600 - 90748
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgta 234  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  90600 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccaaatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatgtatgtgattggagattgtgta 90699  T
Q  235 tgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
     |||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  90700 agaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 90748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 44 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 78337 - 78228
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  78337 ttgtagttgtaaaagggttcagctcttttacttcggagattatgtaagatgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacc 78238  T
Q  144 ttgaggtgat 153  Q
    ||||||||||    
T  78237 ttgaggtgat 78228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 90802 - 91018
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-g 307  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| |||||||||||||| |    
T  90802 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaatgactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgaatattaatgtgagatattggggttttg 90901  T
Q  308 atgtaag----------------------tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta- 384  Q
    |||||||                      ||||| |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     
T  90902 atgtaagtatatacatatatatatatatatatatatatatgaatattattattgatcaagtgcatgatgtttatattgaattattcatgttaactgttat 91001  T
Q  385 ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||    
T  91002 ttggattatgatgatgt 91018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 67 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 129026 - 128867
Alignment:
Q  67 tcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    |||||||||||||||||||||||||    | ||||   |||||||||||||||   ||||  ||||| | |||||||||||  || ||||||||||||||    
T  129026 tcttttacttcggagattatgtaag----gagtgaccccttacatgcgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttttggagatttggtaccaca 128932  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||| ||||||||||||    
T  128931 tgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgttataggtgattgatgat 128867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 128804 - 128730
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  128804 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgttaattgatatttgttcatgatacatgtaattggtgatt 128730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 96; Significance: 6e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 6e-47
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 145195 - 145016
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||||||||    
T  145195 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgacgacc 145096  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  145095 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 145016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 147454 - 147275
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt-ttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| ||||||   ||||| ||||||| |||| ||||    
T  147454 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgagttgttccatcgaaggtgatgacc 147355  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  147354 ttttggagatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatagcatgagtcttattgatatatgtgattg 147275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 144980 - 144926
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 263  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  144980 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 144926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 147239 - 147185
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 263  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  147239 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 147185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0095
Description:

Target: scaffold0095; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 7153 - 7303
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgagattg-tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  || |||| |||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||    
T  7153 catcatagtcatgttgagtctggtagtcgtaaaaaggttgagctcttttacttcggagattatgtaagactggtgtgaaatcttacacacgatgtttttg 7252  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  7253 ttgcatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcggtaccacatgcatttatg 7303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0095; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Original strand, 7416 - 7489
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||| |||| | ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7416 tattatcattggttaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 44 - 174
Target Start/End: Original strand, 78342 - 78472
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||    
T  78342 ttgtaggtgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacaacc 78441  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    |||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  78442 ttgaggtgattcagtaccacatgcatttatg 78472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 25 - 174
Target Start/End: Original strand, 118094 - 118244
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  118094 catcatagtcatgttgagtcttgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagatggctgtgaaatcttacatacgatgtttttg 118193  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatg 174  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||  ||||||||||||| ||||    
T  118194 ttgaatcgaaggtgacgaccttgaggtgattcagtaccacatgcatatatg 118244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 163901 - 163817
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 219  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  163901 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtg 163817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 5)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 47 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 54300 - 54118
Alignment:
Q  47 tagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||  |||||||||  ||||||| |||||| |||  | |||||||||||||||||||     
T  54300 tagttgtaaaaaggttgagctcttttacttcagagattatgtaagctgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaagtgacgaccttt 54202  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgatt 229  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  54201 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattggtgatt 54118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 49 - 265
Target Start/End: Original strand, 109582 - 109799
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  109582 gttgtaaaatggttgatctcttttacttcggagattatgtaagacgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 109680  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtg 246  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||   ||||||| ||||||| |||||    
T  109681 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatgacatgagtcttatttggaaatgtgatttgagattgtgaatgaatatttgtg 109780  T
Q  247 tattgatatttgttcatga 265  Q
     ||||||| ||||||||||    
T  109781 aattgataattgttcatga 109799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #3
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 109897 - 109971
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  109897 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 109971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 209 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 54112 - 54011
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| || |||||||||| ||||||| |||||||||       |||||||||||||||||||| ||||||||| || |||    
T  54112 tgataaatgtgattggtgatagtgaattaataattgtgaattgataattgttcatg-------tgattggtgattattgatgtgagatattggagtgtga 54020  T
Q  309 tgtaagtat 317  Q
     ||||||||    
T  54019 cgtaagtat 54011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 210 - 263
Target Start/End: Original strand, 110002 - 110055
Alignment:
Q  210 gatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcat 263  Q
    |||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||    
T  110002 gatatatgtgattagtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcat 110055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 197600 - 197778
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||||| ||||||||||    
T  197600 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcagagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtcttt-tatcatcgaaggtgacgacct 197698  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  197699 tttggagatttggtaccacatgtatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 197778  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 85056 - 84942
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85056 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 84957  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  84956 tgcatatatgtgtcg 84942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 65 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 26194 - 26080
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||    ||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26194 actcttttacttcggtgataatgtaagacgtgtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcatcatgggtgacgacctttaggtgatttggtaccaca 26095  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcg 179  Q
    ||||| |||| ||||    
T  26094 tgcatatatgtgtcg 26080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 89; Significance: 9e-43; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 89; E-Value: 9e-43
Query Start/End: Original strand, 132 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1925 - 1652
Alignment:
Q  132 aaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgat 228  Q
    |||| ||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| ||| |  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||||    
T  1925 aaagagacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcaaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgat 1826  T
Q  229 tgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgaga 327  Q
    |||| |||||||| ||||  ||||   |||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||| ||  | ||| | |||| |||| |     
T  1825 tgtgcatgaataaatgtgatttgaagattgttcatgacacatgtgattgatgattaattgatgtgagatattgggattata-gtatgaatatatatgtg- 1728  T
Q  328 atattattattg-atcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||| | || |||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  1727 atattattatcgaattaagtacatgatgtttaaattaaattactcatgttaattgttatgtggattatgatgatgt 1652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315 (Bit Score: 88; Significance: 4e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0315
Description:

Target: scaffold0315; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 209 - 344
Target Start/End: Complemental strand, 16961 - 16826
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  16961 tgatgtatatgattggtgattgtgtgtgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtaattggtgatcattgatgtgagatattggggtttga 16862  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 344  Q
    |||||||||   ||||||||||||||||||||||||    
T  16861 tgtaagtattgatatgagaatattattattgatcaa 16826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0315; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 151 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 17128 - 17070
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttatt 209  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  17128 gatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcatatt 17070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 25 - 195
Target Start/End: Original strand, 25101 - 25274
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  |||||| |||||||| | ||  |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||    
T  25101 catcatagtcatgttgagtcttgtagctgtaaaagaggtgtgctcttttacttcggtgattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatacgatatttttg 25200  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg 195  Q
    ||||||  || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||||    
T  25201 ttgcatttaaggtgacgaccttgaggtgattttgtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatg 25274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 1)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 44 - 166
Target Start/End: Complemental strand, 34128 - 34006
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  34128 ttgtagctgtaaaagggttgagctcttttacttcggtgattatgtaagacaggtgtgaaatgttacatacgatgtttttgttgcatcgaaggtgacgact 34029  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatg 166  Q
    ||||||||||| |||||||||||    
T  34028 ttgaggtgattcggtaccacatg 34006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 87; Significance: 1e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Original strand, 217246 - 217426
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||| ||||| | ||||||||    
T  217246 tgtaattgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggg-gtgaacccttacatacgatgttgagttgttccatcggaggtgacgac 217344  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  217345 cttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 217426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 5396 - 5221
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagta 316  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        ||||||  || ||||||||| |||||| ||||| |||||||||||    
T  5396 gtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgacgaatattgatgtgagatatcggggtgtgatgtaagta 5304  T
Q  317 tatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| | |||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  5303 tta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaaatgaaatattcatgttacctgttatttggattatgataatgt 5221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 5755 - 5661
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||| ||||| ||||| ||||    
T  5755 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcttatgtgaaatatgcgattggtgat 5661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 1)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 65 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 3393 - 3244
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  3393 actcttatacttcggtgattatgtaagacgggcgtgaaatcttacatacaatgtttttgttgcatcgaaggtgacgacctagaggtgatttggtaccaca 3294  T
Q  165 tgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatg---acatgagtcttatt 209  Q
    ||||| |||| |||||  || ||||||||||||   ||||||||||||||    
T  3293 tgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcatgttcacatgagtcttatt 3244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 9930 - 10122
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| | || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9930 tgatgtatatgattggtgattgtgtatgaataactatgaattgatatttattcatgacacatgtgattggtgattattgatgtgagatattggggtttga 10029  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| |   | |||||||| |||||| ||| |||| ||||||| ||| ||||||  || |||||||| ||| | |||||||||||| ||||    
T  10030 tgtaagtgttgatttgagaataatattatcgataaagtgcatgatg-ttaaattgaaaaatacatgttaactgtcatttggattatgataatgt 10122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 45 - 231
Target Start/End: Original strand, 11532 - 11716
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacct 144  Q
    ||||||||||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| |||||| |||  | ||||||| ||||||||||    
T  11532 tgtagttgtaaaagggtggt--tcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcgaaggtgacgacct 11628  T
Q  145 tgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    |  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||    
T  11629 tttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcataacatgacatgagtcttatttgatgtatgtgattggtgattgt 11716  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 268 - 317
Target Start/End: Original strand, 11796 - 11845
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat 317  Q
    |||||||||| ||||||||||||  | |||||||||| ||||||||||||    
T  11796 catgtgattgatgattattgatgagaaatattggggtgtgatgtaagtat 11845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 4501 - 4320
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  4501 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 4403  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  4402 tggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 135 - 394
Target Start/End: Complemental strand, 6386 - 6123
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||| | | |||||||||||||||||    
T  6386 gtgacgaccttgaagtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattggtgaaatgtgattgatgattgt 6287  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtttgatgtaagtatatgtatgagaata 330  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| | ||  | ||| | |||| | || | |||    
T  6286 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcataacacatgtgattggtgattaattgatgtgagatattgagattata-gtatgaatatatgtgtg-ata 6189  T
Q  331 ttattat-tgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatg 394  Q
    |||||||  ||| ||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||||||    
T  6188 ttattatcggattaagtacatgatatttaaattgaattactcatgttaatttttatgtggattatg 6123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 79; Significance: 9e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 9e-37
Query Start/End: Original strand, 52 - 223
Target Start/End: Original strand, 5102 - 5274
Alignment:
Q  52 gtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttgagg 149  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||  |||||  ||||||| ||||||||  ||||  ||||| | |||||||||||  ||    
T  5102 gtaaaagggttgagctcttttactttggagattatgtaaggcggcagtgaacccttacatacgatgtttacttgtc-catcggaggtgacgaccttttgg 5200  T
Q  150 tgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
     ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5201 agatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagttttattgatatatgtgattg 5274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Original strand, 12788 - 12876
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    |||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12788 gtgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 12876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 74; Significance: 8e-34; HSPs: 3)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 25 - 173
Target Start/End: Original strand, 14101 - 14250
Alignment:
Q  25 catcatagtcgtgttgaga-ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttg 123  Q
    |||||||||| |||||||  ||| ||||||||||| |  | ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||  ||||||||||    
T  14101 catcatagtcatgttgagtcttgaagttgtaaaagaggggtactcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaattttacatatgatgtttttg 14200  T
Q  124 ttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 173  Q
    |||||||    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14201 ttgcatcatgggtaacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtat 14250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 209 - 285
Target Start/End: Original strand, 15935 - 16011
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattat 285  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||| || |||| ||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15935 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaacaactgtgaattgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattat 16011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 157 - 231
Target Start/End: Original strand, 15833 - 15907
Alignment:
Q  157 gtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||| ||| |||||||    
T  15833 gtaccacatgcatatatgtgtcaataggtgcatatcatgacgtgagtcttattcataaatgtggttggtgattgt 15907  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 51690 - 51511
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||| ||||||  |    
T  51690 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtcaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgatgaccttttg 51592  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | ||||||||||||| ||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  51591 gagatttggtaccacgtgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 51511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 3)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 209 - 344
Target Start/End: Original strand, 21158 - 21288
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-- 306  Q
    ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||        |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||      
T  21158 tgatatatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtgaattgataattgttcata-------tgattgatgattattgatgtgagatattggggttttt 21250  T
Q  307 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 344  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21251 gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaa 21288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 20906 - 21002
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  20906 gtgacgaccctgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcgataggtgcatatcatggcatgagtcttaatgatatatgtgattggtgattgt 21002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039; HSP #3
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 209 - 283
Target Start/End: Original strand, 21030 - 21104
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21030 tgatatatgtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 21104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0808 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0808
Description:

Target: scaffold0808; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 135 - 401
Target Start/End: Original strand, 3125 - 3395
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||| |||| |||||  || || || |||||| |||||||||||||| | | |||||| | |||||||     
T  3125 gtgacgaccttgaagtgaaatggtatcacatgcatatatgtgtcgaactaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaattatgattgc 3223  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtatatgtatgagaat 329  Q
    | |||||||| ||||  |||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | || ||  ||| | |||| |||| | ||    
T  3224 gcatgaataaatgtgatttgatgattgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtaagatattgagattatg--gtatgaatatatatgtggat 3321  T
Q  330 attatta-ttgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||| |||  ||||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  3322 attattatttgattaagtacatgatatttgaattgaattattcatgttaactattatgtggattatgatgatgt 3395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 3)
Name: scaffold0407
Description:

Target: scaffold0407; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 6410 - 6583
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
T  6410 tgataaatgtggttggtgattgtgtataaataactgtgaattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgat------------------- 6490  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
     ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  6491 -gtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 6583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 135 - 231
Target Start/End: Original strand, 6310 - 6406
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6310 gtgacgaccctgagatgatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattaatgattgt 6406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0407; HSP #3
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 305 - 401
Target Start/End: Original strand, 22 - 119
Alignment:
Q  305 ttgatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtt-attggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||    
T  22 ttgatgtaagtatatgtatgagtatattattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttaattggattatgttgatgt 119  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 69; Significance: 8e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 8e-31
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 14958 - 14779
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  ||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  14958 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggtgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 14860  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  14859 gagatttggttccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 14779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225; HSP #2
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 28479 - 28300
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | |||||||||||  |    
T  28479 gttgtaaaagggttgagctcttttaattcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttg 28381  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    | |||||||| |||||||||| |||| ||| |||  || |||||||  |||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  28380 gagatttggtgccacatgcatttatgtgtcaataaatgaatatcatatcatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 28300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0786
Description:

Target: scaffold0786; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 346 - 211
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  346 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 247  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  246 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0786; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 5401 - 5266
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||| ||||||||||||  |  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  5401 ttgtggttgtaaaagggacgtgctcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 5302  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  5301 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 5266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0390 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0390
Description:

Target: scaffold0390; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 179
Target Start/End: Complemental strand, 3934 - 3799
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||| |||||||||||| ||  |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||| ||||    |||||||||    
T  3934 ttgtggttgtaaaagggatgtgctcttttatttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatgtgtttgttacatcatgggtgacgacc 3835  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcg 179  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  3834 ttgaggtgatttggtaccacatgcatatatgtgtcg 3799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 44 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 4686 - 4568
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||| |||||||||    
T  4686 ttgtagttgtaaaagggttgggctcttttacttcagagattatgtaagacgagtgtgaaatcttacatacgatg-tgttgatgcatcgaaggtgacgacc 4588  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccac 163  Q
    | |||||||||  |||||||    
T  4587 tggaggtgattcagtaccac 4568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 68; Significance: 3e-30; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 217 - 401
Target Start/End: Original strand, 75550 - 75727
Alignment:
Q  217 gtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtga-ttattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaag 314  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||| |||||||||    
T  75550 gtgattggtgattgtgtatgaataactgtgaattgatgtttgttcatgacacatgtgattggtgatttattgatatgagatattggggttatgatgtaag 75649  T
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |         |||| |  |||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  75650 tatatat---------ttatga-cgatcaagtacatgatgtttgaattaaattattcatgttaactattatttggattatgatgatgt 75727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 135 - 206
Target Start/End: Original strand, 72106 - 72177
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctt 206  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  72106 gtgacgaccttgaggtgatccggtaccacatgcatttatgcgtcaataagtgcatatcatgacatgagtctt 72177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1753 (Bit Score: 66; Significance: 5e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold1753
Description:

Target: scaffold1753; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 5e-29
Query Start/End: Original strand, 45 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 1
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgt-ttttgttgcatcgaaagtgacgacc 143  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||||||  |||||| ||||||| ||||||| |    
T  126 tgtagttgtaaaagggttgagcttttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacatacgatgtgatttgttccatcgaaggtgacgagc 27  T
Q  144 ttgaggtgatttggtaccacatgcat 169  Q
    ||  || |||||||||||||||||||    
T  26 ttttggagatttggtaccacatgcat 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0134
Description:

Target: scaffold0134; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 220 - 343
Target Start/End: Complemental strand, 25718 - 25594
Alignment:
Q  220 attgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tgatgtaagtata 318  Q
    |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||| |||||||||||||| | |||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||||     
T  25718 attgatgattatgtatgaataactgtgaattgatatttgtttatgacacatgtgatagatgattattaatgtgagatattggggttctgatgtaagtatt 25619  T
Q  319 tgtatgagaatattattattgatca 343  Q
      |||| ||||||| ||||||||||    
T  25618 gttatgtgaatatttttattgatca 25594  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0134; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 219 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 25799 - 25735
Alignment:
Q  219 gattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  25799 gattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgatatttgttcctgatacatatgattggtgatt 25735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 64; Significance: 8e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 8e-28
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 106660 - 106479
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgttt--ttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||   |||||||  ||||||   ||||  ||||| | |||||||||||     
T  106660 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggggtgatcccttacatatgatgttgacttgtc-catcggaggtgacgaccttt 106562  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
     || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| |||  |||||||||| ||||    
T  106561 tggagatttggtaccacatgcatttatgagtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgacttatgtgattggtgat 106479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 1e-17
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 27352 - 27169
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||| | ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  27352 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgctcata-------tgatcgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 27260  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||  |||| |||     |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| |||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  27259 tgtaagtattaatgtgtga-----ttattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatccatgttaactgttatttggattatgataatgt 27169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103 (Bit Score: 63; Significance: 3e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0103
Description:

Target: scaffold0103; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 135 - 300
Target Start/End: Complemental strand, 32093 - 31925
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatat--gtgcatatcatgacatgagtcttattgatatat-gtgattgatgattgt 231  Q
    ||||||||||||||||||  ||||||||||||||| |||| |||| | |  || || |||||| |||||||||||||| |  || ||||||||| |||||    
T  32093 gtgacgaccttgaggtgaaatggtaccacatgcatatatgtgtcggtctaggtacacatcatg-catgagtcttattggtgaattgtgattgataattgt 31995  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt-attgatgtaagatattg 300  Q
    |||||||||| ||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||    
T  31994 gtatgaataaatgtgatttgatacttgttcatgacacatgtgattggtgattaattgatgtgagttattg 31925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0103; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000006
Query Start/End: Original strand, 326 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31850 - 31776
Alignment:
Q  326 gaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||| ||| |||||| ||| ||||||||||||    
T  31850 gaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatg-taaatgttatgtgggttatgatgatgt 31776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 230
Target Start/End: Original strand, 1292 - 1469
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgag 148  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    | |||||  ||||||| |||||| |||  | ||||| | |||||||||||  |    
T  1292 gttgtaaaagagttgagctcttttactttggagattatgtaag----gagtgaacccttacatacgatgtgttttat-catcggaggtgacgaccttttg 1386  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgattg 230  Q
    | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||    
T  1387 gagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgattg 1469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1404 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1404
Description:

Target: scaffold1404; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 215 - 35
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgacc-ttga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||| |||||  ||||||| |||||| ||| |  ||||| | ||||||||| ||      
T  215 gttgtaaaagggttgagctcttttatttcggagattatgtaaggcgggggtgaacccttacatacgatgtgttt-tatcatcggaggtgacgaccttttt 117  T
Q  148 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    || || |||||||||||||||| |||  ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||    
T  116 ggagaattggtaccacatgcatttatatgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtggttggtgat 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 135 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 40098 - 40010
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40098 gtgacaaccctgaggtgatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattg 40010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 37697 - 37627
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||| | ||||||||| ||  ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  37697 attattattgatcaaatgcatgatgttaat--tgaattattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 37627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0073 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0073
Description:

Target: scaffold0073; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 65 - 169
Target Start/End: Complemental strand, 56026 - 55922
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaagtgacgaccttgaggtgatttggtaccaca 164  Q
    ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||    ||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  56026 actcttttacttcggtgataatgtaagacgggtgtgaaatcttacatatgatatttttgttgcatcatgggtgacgaccttgaggggattttgtaccaca 55927  T
Q  165 tgcat 169  Q
    |||||    
T  55926 tgcat 55922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 61; Significance: 5e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 5e-26
Query Start/End: Original strand, 213 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 44443 - 44288
Alignment:
Q  213 atatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgt 311  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||| | || |||||||||| |||||||||||||| | |||    
T  44443 atatgtgatcggtgattgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgatcgatgtttattgatgtgagatattggggttttggtgt 44351  T
Q  312 aagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 374  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||||||||    
T  44350 aagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatattcatg 44288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 228 - 374
Target Start/End: Complemental strand, 52597 - 52457
Alignment:
Q  228 ttgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgag 326  Q
    |||||||||||||||||||  |||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||| | |||||||||||||| ||| |||||||||| ||| |    
T  52597 ttgtgtatgaataattgtgagttgataattgttcata-------tgattgatgactattgatctgagatattggggttttgatttaagtatatgcatgtg 52505  T
Q  327 aatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 374  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||| |||||| ||| ||||    
T  52504 aatattattattgatcatgtacgtgatgtttaaattgaaatatccatg 52457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 59; Significance: 7e-25; HSPs: 1)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 59; E-Value: 7e-25
Query Start/End: Original strand, 45 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 41371 - 41190
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgac 142  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | || |||||  ||||||| |||||||    |||| ||||| | ||||||||    
T  41371 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcgtagattatgtaaggcaggggtgaacccttacatacgatgttgagctgttccatcggaggtgacgac 41272  T
Q  143 cttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc-ttattgatatatgtgattg 223  Q
    |||  || |||||||||||||||| || |||| ||| ||| |||||||||  ||||| |||| || || |||||||||||||    
T  41271 cttttggagatttggtaccacatgaatttatgtgtcaataagtgcatatccagacataagtctttttttatatatgtgattg 41190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 49 - 228
Target Start/End: Original strand, 9426 - 9607
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgt-tgcatcgaaagtgacgaccttga 147  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||  |||||||  ||| ||    | | ||||| | |||| ||||||      
T  9426 gttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcggggttgaacccttacatatgatattgacatgtccatcggaggtgatgacctttt 9525  T
Q  148 ggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    || ||||||||||||||||||| |||| ||| | | ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  9526 ggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaaaaagtgcatatcataacatgagtcttatgtgatatatgtgattggtgat 9607  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0014
Description:

Target: scaffold0014; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 155 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 145413 - 145283
Alignment:
Q  155 tggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattga 252  Q
    ||||||||||||||| |||| |||||  || ||||| ||||||||||||||||||||   | |||||| |  ||||||||||||||||| |||| |||||    
T  145413 tggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcacatcatgacatgagtcttattttgaaatgtgagtagtgattgtgtatgaataactgtgaattga 145314  T
Q  253 tatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||    
T  145313 tgatttttcatgacacatgtgattggtgatt 145283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0014; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 329 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 145060 - 144987
Alignment:
Q  329 tattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  145060 tattattattgatcaagtacatgatgtttgaattgaattaatcatgttaattgttatgtggattatgataatgt 144987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 55; Significance: 2e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 49 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 7641 - 7465
Alignment:
Q  49 gttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtt--tttgttgcatcgaaagtgacgaccttg 146  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||  |||| || |||||||   ||| | ||||  | |||| ||||||     
T  7641 gttgtaaaagggttgaactcttttactttggagattatgtaaggctggggtgaacccttatatacgatgttgacttg-tccatcagaggtgatgaccttt 7543  T
Q  147 aggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtctta-ttgatatatgtgattg 223  Q
     || |||||||||| |||||||| |||| ||| | | || ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  7542 tggagatttggtacgacatgcatttatgtgtcaacaagtacatatcatgacatgagtcttatttgatatatgtgattg 7465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 53; Significance: 3e-21; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 279 - 374
Target Start/End: Original strand, 12989 - 13085
Alignment:
Q  279 tgattattgatgtaagatattggggttt-gatgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatg 374  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  |||||||| |||||| ||| ||||    
T  12989 tgattattgatgtgagatattggggttttgatgtaagtatatgcatgtgaatattattattgatcatgtacgagatgtttaaattgaaatatccatg 13085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 31192 - 31120
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||    
T  31192 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttatctgttatttggattatgataatgt 31120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 225 - 283
Target Start/End: Complemental strand, 31391 - 31333
Alignment:
Q  225 tgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatt 283  Q
    ||||||||||||||||| |||| |||||||||| || |||| ||| || ||||||||||    
T  31391 tgattgtgtatgaataactgtgaattgatatttatttatgatacaagtaattggtgatt 31333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold1140
Description:

Target: scaffold1140; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 151 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 1587 - 1509
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattgatgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||| |||| |||  || |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  1587 gatttggtaccacatgcatatatgtgtcattaggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatgtgattggtgatt 1509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1140; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 268 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 1427 - 1298
Alignment:
Q  268 catgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttgatgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaa 365  Q
    |||||||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||  |||| ||     ||||||||||||||| | |||||||||   ||||||    
T  1427 catgtgattgatgattattgatgtgagatattggggtgtaatgtaagtattaatgtgtg-----attattattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaa 1335  T
Q  366 ttattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     |||||||| ||| ||||| |||||||||| ||||||    
T  1334 atattcatgataactgttatttggattatgttgatgt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 51; Significance: 4e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Original strand, 52771 - 52837
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  52771 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 52837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 45 - 111
Target Start/End: Original strand, 56723 - 56789
Alignment:
Q  45 tgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||    
T  56723 tgtagttgtaaaagggttgagctcttttacttcggagattatgtaaggcgggtgtgaacccttacat 56789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 49; Significance: 7e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 49; E-Value: 7e-19
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 987 - 804
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||||||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| ||||| |||    
T  987 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattgttcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcggggtgtga 895  T
Q  309 tgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    |||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  894 tgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0384
Description:

Target: scaffold0384; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 136 - 228
Target Start/End: Original strand, 1 - 94
Alignment:
Q  136 tgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||  || ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||    
T  1 tgacgaccttttggagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcataacatgagtcttatgtgaaatatgtgattggtgat 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0384; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 264 - 448
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtt-tg 307  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| ||| ||||        |||||| ||| ||||||||| |||||| |||| | ||    
T  264 tgataaatgtgattggtgattgtgaatgaataattgtaaattgataattggtcata-------tgattgatgaatattgatgtgagatatcgggggtgtg 356  T
Q  308 atgtaagtatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||    ||| | | ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||  ||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  357 atgtaagtatta--atgtgta-attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatatctatgttaactgttatttggattatgataatgt 448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0226 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0226
Description:

Target: scaffold0226; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 330 - 401
Target Start/End: Original strand, 15167 - 15239
Alignment:
Q  330 attattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  15167 attattattgatcaagtgcatgatgtttaaattgaaatattcatgttaactgttatttggattatgataatgt 15239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 151 - 223
Target Start/End: Original strand, 6826 - 6898
Alignment:
Q  151 gatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatatatgtgattg 223  Q
    ||||||||||||||||||| |||| ||  ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  6826 gatttggtaccacatgcatatatgtgttaataggtgcatatcatggcatgagtcttattgatatatatgattg 6898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000004
Query Start/End: Original strand, 209 - 401
Target Start/End: Original strand, 6934 - 7115
Alignment:
Q  209 tgatatatgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgattattgatgtaagatattggggtttga 308  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||| ||| |       ||| |||||| ||| ||||||||| |||||||||| | |||    
T  6934 tgataaatgtgattgatgattgtgaatgaatatttgtgaattgataattggt-------catatgattgatgactattgatgtgagatattgggatgtga 7026  T
Q  309 tgtaagtat--atgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgtta-ttggattatgatgatgt 401  Q
     ||||||||  |||| ||     |||| |||||||||| | |||||||||   ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||| ||||    
T  7027 agtaagtattaatgtgtg-----attactattgatcaaatgcatgatgtt--aattgaattattcatgataactgttatttggattatgataatgt 7115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0450
Description:

Target: scaffold0450; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 315 - 401
Target Start/End: Original strand, 4639 - 4725
Alignment:
Q  315 tatatgtatgagaatattattattgatcaagtacatgatgtttatattgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| | ||| |||||| |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  4639 tatatatatgtgaatattattattgatcaagtgcatgaag-ttaaattgaaatattcatgttaaatgttatgtggattatgatgatgt 4725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0450; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000004
Query Start/End: Original strand, 216 - 284
Target Start/End: Original strand, 4528 - 4596
Alignment:
Q  216 tgtgattgatgattgtgtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    |||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||    
T  4528 tgtgattggtgattgtgcatgaataaatgtgaattgatacttgttcatgatatatgtgattggtgatta 4596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 44; Significance: 7e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 7e-16
Query Start/End: Original strand, 51 - 204
Target Start/End: Complemental strand, 30009 - 29855
Alignment:
Q  51 tgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacgaccttgag 148  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| |||||||||||      
T  30009 tgtaaaagagttgaactcttttacttcg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacgaccttgtt 29911  T
Q  149 gtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtc 204  Q
    | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  ||||||||    
T  29910 gagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtc 29855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 44 - 228
Target Start/End: Original strand, 17586 - 17771
Alignment:
Q  44 ttgtagttgtaaaagggttgaactcttttacttcggagattat-gtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcatcgaaag-tgacga 141  Q
    |||| |||||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||| ||||| | |||||||   ||||||| ||||||    || |||||||||| ||||||    
T  17586 ttgttgttgtaaaagggatga-ctcttttactttg-agattattgtaaggcaggtgtgagcccttacattcgatgtgcaagtggcatcgaaaggtgacga 17683  T
Q  142 ccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    |||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  17684 ccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 17771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 37862 - 37768
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||    
T  37862 gtgacgaccttgttgagatttggtaccacatgcatttatgtgtcaataagtgcatatcatagcatgagtcctatgtgaaatatgtgattggtgat 37768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0057 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0057
Description:

Target: scaffold0057; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 65 - 111
Target Start/End: Complemental strand, 4578 - 4532
Alignment:
Q  65 actcttttacttcggagattatgtaagacgggtgtgaaatcttacat 111  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||    
T  4578 actcttttacttcggagataatgtaagacggacgtgaaatcttacat 4532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0750 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0750
Description:

Target: scaffold0750; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 2839 - 2989
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  2839 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 2936  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  2937 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 2989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000006; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000006
Query Start/End: Original strand, 135 - 284
Target Start/End: Original strand, 26542 - 26692
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgat-atatgtgattgatgattgt 231  Q
    |||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||| ||||   || ||  | |||||| |||||||||||||| | | |||||| ||||||||||    
T  26542 gtgacgaccttgaggtgaat-ggtaccacatgcatatatgtgtcgggctaggtatacatcatg-catgagtcttattggtgaaatgtgaatgatgattgt 26639  T
Q  232 gtatgaataattgtgtattgatatttgttcatgacacatgtgattggtgatta 284  Q
    |||||||||| ||||  |||||  || ||||||| ||| |||| ||| |||||    
T  26640 gtatgaataaatgtgatttgatgattattcatgatacacgtgactggcgatta 26692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3254
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  3160 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0112 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0112
Description:

Target: scaffold0112; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 85 - 129
Target Start/End: Complemental strand, 12329 - 12285
Alignment:
Q  85 atgtaagacgggtgtgaaatcttacatgcgatgtttttgttgcat 129  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  12329 atgtaagatgggtgtgaaatcttacatatgatgtttttgttgcat 12285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 135 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 25476 - 25382
Alignment:
Q  135 gtgacgaccttgaggtgatttggtaccacatgcatgtatgcgtcgatatgtgcatatcatgacatgagtcttat-tgatatatgtgattgatgat 228  Q
    ||||||||||||  | ||||||||||| ||||||| |||| ||| ||| |||||||||||  |||||||| ||| |||  |||||||||| ||||    
T  25476 gtgacgaccttgttgagatttggtaccgcatgcatttatgtgtccataagtgcatatcatagcatgagtcatatgtgaattatgtgattggtgat 25382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0121 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold0121
Description:

Target: scaffold0121; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 360 - 401
Target Start/End: Complemental strand, 7341 - 7299
Alignment:
Q  360 attgaattattcatgttaattgttat-tggattatgatgatgt 401  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||    
T  7341 attgaattattcatgttaactgttatgtggattatgatgatgt 7299  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0521 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0521
Description:

Target: scaffold0521; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 154 - 227
Target Start/End: Complemental strand, 7125 - 7049
Alignment:
Q  154 ttggtaccacatgcatgtatgcgtcga--tatgtgcatatcatgacatgagtcttattgatat-atgtgattgatga 227  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||  || ||||||||||| ||||||||||  ||||| | |||||||||||||    
T  7125 ttggtaccacatgcatatatgtgtcgaactaggtgcatatcataacatgagtctatttgatgtaatgtgattgatga 7049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University