View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15616_low_1 (Length: 362)

Name: NF15616_low_1
Description: NF15616
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15616_low_1
NF15616_low_1
[»] chr2 (30 HSPs)
chr2 (13-361)||(45367972-45368320)
chr2 (13-361)||(11992454-11992801)
chr2 (13-361)||(41763389-41763744)
chr2 (14-361)||(2610115-2610461)
chr2 (19-361)||(451976-452311)
chr2 (13-361)||(4807179-4807526)
chr2 (13-359)||(3865661-3866006)
chr2 (13-361)||(8180367-8180714)
chr2 (32-361)||(30743210-30743538)
chr2 (13-357)||(24583954-24584297)
chr2 (103-361)||(38453058-38453314)
chr2 (32-311)||(3244018-3244293)
chr2 (13-226)||(41197576-41197792)
chr2 (154-306)||(13148953-13149106)
chr2 (43-246)||(6238132-6238334)
chr2 (13-162)||(23997402-23997551)
chr2 (178-309)||(37281746-37281878)
chr2 (153-297)||(17581121-17581262)
chr2 (13-131)||(38429700-38429818)
chr2 (153-293)||(14769943-14770090)
chr2 (153-298)||(33594757-33594903)
chr2 (13-141)||(36183257-36183385)
chr2 (274-360)||(12475031-12475115)
chr2 (153-290)||(12904624-12904762)
chr2 (246-298)||(876780-876833)
chr2 (200-298)||(7135220-7135319)
chr2 (171-298)||(28317394-28317517)
chr2 (153-297)||(6465370-6465515)
chr2 (153-261)||(7292673-7292782)
chr2 (34-126)||(32443436-32443527)
[»] chr4 (49 HSPs)
chr4 (13-361)||(27450521-27450868)
chr4 (13-361)||(23906649-23906996)
chr4 (13-361)||(435816-436163)
chr4 (13-361)||(31960162-31960509)
chr4 (29-361)||(48174457-48174788)
chr4 (13-348)||(33226809-33227143)
chr4 (29-361)||(1777379-1777710)
chr4 (43-361)||(56374877-56375194)
chr4 (92-361)||(48622954-48623222)
chr4 (13-361)||(53707381-53707728)
chr4 (32-361)||(39708044-39708373)
chr4 (19-292)||(50286625-50286899)
chr4 (32-310)||(16002565-16002842)
chr4 (13-291)||(1211738-1212017)
chr4 (43-348)||(47265580-47265886)
chr4 (13-222)||(43433643-43433852)
chr4 (13-237)||(46583172-46583396)
chr4 (13-234)||(41009698-41009922)
chr4 (153-298)||(17666526-17666669)
chr4 (161-297)||(54787741-54787878)
chr4 (221-295)||(10775975-10776050)
chr4 (170-293)||(1629084-1629208)
chr4 (94-258)||(54914618-54914781)
chr4 (43-259)||(55578722-55578935)
chr4 (76-298)||(39754782-39755005)
chr4 (214-298)||(30807246-30807331)
chr4 (13-210)||(35690042-35690238)
chr4 (162-274)||(52280695-52280807)
chr4 (172-298)||(7092719-7092846)
chr4 (153-307)||(17667817-17667969)
chr4 (204-297)||(42037510-42037604)
chr4 (161-226)||(45185477-45185542)
chr4 (167-298)||(20917630-20917762)
chr4 (140-271)||(3273098-3273229)
chr4 (33-115)||(11389552-11389634)
chr4 (19-87)||(26037836-26037904)
chr4 (13-97)||(45205196-45205280)
chr4 (13-91)||(1793316-1793394)
chr4 (212-297)||(41427488-41427574)
chr4 (232-296)||(30853066-30853131)
chr4 (32-137)||(52569882-52569987)
chr4 (32-100)||(31458875-31458943)
chr4 (153-271)||(8917815-8917938)
chr4 (251-309)||(55768963-55769022)
chr4 (251-309)||(55833219-55833278)
chr4 (13-79)||(12494618-12494684)
chr4 (13-79)||(39100881-39100947)
chr4 (32-121)||(4440682-4440770)
chr4 (19-64)||(27983083-27983128)
[»] chr3 (29 HSPs)
chr3 (13-361)||(25190966-25191313)
chr3 (13-356)||(38849686-38850028)
chr3 (13-361)||(51448057-51448404)
chr3 (43-361)||(47542089-47542406)
chr3 (32-290)||(28245093-28245352)
chr3 (33-309)||(27917209-27917486)
chr3 (13-176)||(5168599-5168762)
chr3 (13-194)||(52138553-52138734)
chr3 (81-357)||(29817096-29817370)
chr3 (128-270)||(54425369-54425511)
chr3 (228-361)||(52138415-52138547)
chr3 (13-180)||(53519353-53519520)
chr3 (13-298)||(26489965-26490251)
chr3 (195-361)||(19757655-19757820)
chr3 (13-298)||(30345179-30345457)
chr3 (167-298)||(48221432-48221564)
chr3 (195-361)||(19736753-19736914)
chr3 (237-361)||(9258470-9258589)
chr3 (34-216)||(3186500-3186682)
chr3 (176-298)||(30724311-30724434)
chr3 (13-126)||(43695113-43695226)
chr3 (174-296)||(44395080-44395200)
chr3 (231-294)||(46145805-46145869)
chr3 (48-112)||(54278855-54278919)
chr3 (190-296)||(32490249-32490356)
chr3 (167-296)||(15750888-15751018)
chr3 (13-87)||(33272376-33272450)
chr3 (44-186)||(40674492-40674634)
chr3 (251-298)||(1470683-1470731)
[»] chr7 (35 HSPs)
chr7 (13-361)||(38606593-38606939)
chr7 (13-361)||(32630194-32630529)
chr7 (43-361)||(46356229-46356546)
chr7 (13-361)||(36651581-36651928)
chr7 (13-361)||(33350154-33350501)
chr7 (13-361)||(31004811-31005157)
chr7 (73-361)||(37616503-37616790)
chr7 (13-355)||(11593552-11593894)
chr7 (19-361)||(39906729-39907074)
chr7 (13-234)||(43281389-43281610)
chr7 (13-361)||(36869637-36869984)
chr7 (13-361)||(49028854-49029210)
chr7 (104-361)||(48918975-48919231)
chr7 (13-260)||(35906549-35906796)
chr7 (32-197)||(34869170-34869335)
chr7 (13-235)||(33072666-33072888)
chr7 (13-207)||(7272780-7272973)
chr7 (184-357)||(24177714-24177886)
chr7 (32-184)||(23404181-23404333)
chr7 (13-163)||(12841623-12841773)
chr7 (154-298)||(24550178-24550318)
chr7 (13-210)||(7189581-7189777)
chr7 (166-298)||(21517826-21517958)
chr7 (217-298)||(43793592-43793674)
chr7 (31-135)||(13859372-13859476)
chr7 (33-201)||(25579439-25579612)
chr7 (153-293)||(18637233-18637371)
chr7 (153-293)||(18650668-18650806)
chr7 (166-257)||(23087603-23087694)
chr7 (171-293)||(18608199-18608319)
chr7 (214-285)||(5843105-5843177)
chr7 (32-88)||(15681216-15681272)
chr7 (214-293)||(18626559-18626639)
chr7 (141-212)||(33139006-33139077)
chr7 (13-65)||(21517674-21517726)
[»] chr8 (39 HSPs)
chr8 (13-361)||(42854352-42854708)
chr8 (14-361)||(36565590-36565936)
chr8 (13-361)||(15215619-15215965)
chr8 (43-361)||(12492220-12492537)
chr8 (88-357)||(4032917-4033185)
chr8 (13-361)||(36544739-36545081)
chr8 (19-294)||(18124830-18125103)
chr8 (81-361)||(8879850-8880129)
chr8 (13-222)||(37077490-37077699)
chr8 (13-201)||(39946603-39946791)
chr8 (43-234)||(25299950-25300141)
chr8 (43-234)||(25288613-25288806)
chr8 (19-136)||(18752227-18752344)
chr8 (139-309)||(13984672-13984842)
chr8 (92-234)||(25439249-25439391)
chr8 (153-298)||(28300596-28300739)
chr8 (161-297)||(19293776-19293913)
chr8 (140-294)||(30113671-30113827)
chr8 (32-155)||(36395320-36395443)
chr8 (145-259)||(35601686-35601799)
chr8 (171-298)||(41444809-41444938)
chr8 (153-296)||(33830721-33830862)
chr8 (165-309)||(29735454-29735592)
chr8 (153-298)||(38667207-38667351)
chr8 (153-298)||(25985190-25985334)
chr8 (32-176)||(2796326-2796470)
chr8 (140-298)||(13589088-13589247)
chr8 (162-290)||(18849624-18849741)
chr8 (90-273)||(6510841-6511026)
chr8 (217-294)||(45332039-45332117)
chr8 (123-186)||(10824546-10824609)
chr8 (166-244)||(6986525-6986603)
chr8 (13-88)||(9905234-9905309)
chr8 (162-259)||(35601501-35601598)
chr8 (155-196)||(43732355-43732396)
chr8 (251-298)||(43732230-43732278)
chr8 (166-219)||(13172147-13172200)
chr8 (33-74)||(17491994-17492035)
chr8 (132-235)||(44681543-44681644)
[»] chr6 (20 HSPs)
chr6 (13-361)||(9706363-9706710)
chr6 (13-361)||(5631404-5631752)
chr6 (13-361)||(10100205-10100552)
chr6 (23-361)||(5258508-5258845)
chr6 (13-361)||(20427984-20428331)
chr6 (13-201)||(607905-608093)
chr6 (13-289)||(2689313-2689590)
chr6 (13-361)||(33495794-33496118)
chr6 (13-195)||(14030558-14030740)
chr6 (45-224)||(6056150-6056329)
chr6 (32-203)||(30679218-30679389)
chr6 (153-361)||(27790743-27790950)
chr6 (13-281)||(26291444-26291712)
chr6 (19-112)||(30031091-30031184)
chr6 (239-309)||(3632653-3632724)
chr6 (14-210)||(2065105-2065302)
chr6 (13-79)||(35043789-35043855)
chr6 (13-126)||(28085197-28085310)
chr6 (278-361)||(30670475-30670556)
chr6 (171-268)||(6641916-6642013)
[»] chr1 (39 HSPs)
chr1 (13-361)||(32083093-32083440)
chr1 (32-361)||(8671507-8671835)
chr1 (13-361)||(1210332-1210679)
chr1 (13-361)||(43240729-43241076)
chr1 (13-361)||(51441113-51441459)
chr1 (32-360)||(51601646-51601973)
chr1 (32-361)||(49347760-49348089)
chr1 (13-266)||(30202478-30202731)
chr1 (19-292)||(19936175-19936450)
chr1 (13-192)||(8391525-8391706)
chr1 (102-307)||(27445537-27445743)
chr1 (45-298)||(34827482-34827736)
chr1 (14-215)||(22089826-22090027)
chr1 (47-309)||(37463249-37463510)
chr1 (13-218)||(9592463-9592668)
chr1 (13-153)||(15085728-15085868)
chr1 (13-147)||(696069-696203)
chr1 (155-309)||(32066761-32066913)
chr1 (140-294)||(51234267-51234421)
chr1 (158-298)||(7921575-7921716)
chr1 (153-298)||(28528229-28528375)
chr1 (166-309)||(35828894-35829038)
chr1 (163-296)||(52739965-52740098)
chr1 (175-298)||(6640774-6640898)
chr1 (13-237)||(46226630-46226853)
chr1 (166-309)||(12807587-12807732)
chr1 (165-298)||(52421078-52421210)
chr1 (123-260)||(21275588-21275725)
chr1 (247-298)||(40419329-40419381)
chr1 (240-308)||(46226887-46226956)
chr1 (175-259)||(3877537-3877621)
chr1 (169-272)||(11331568-11331666)
chr1 (169-272)||(11489589-11489687)
chr1 (160-237)||(52640920-52640997)
chr1 (215-282)||(16142399-16142467)
chr1 (63-175)||(52831830-52831942)
chr1 (244-298)||(52641033-52641085)
chr1 (43-85)||(34792726-34792768)
chr1 (248-296)||(16273415-16273461)
[»] chr5 (27 HSPs)
chr5 (39-361)||(3301436-3301757)
chr5 (67-361)||(3394298-3394593)
chr5 (13-361)||(1274852-1275199)
chr5 (13-361)||(12492735-12493082)
chr5 (13-361)||(10638884-10639231)
chr5 (19-361)||(28977211-28977552)
chr5 (13-361)||(20318578-20318921)
chr5 (13-361)||(1287937-1288284)
chr5 (13-361)||(2075822-2076169)
chr5 (90-361)||(24178111-24178381)
chr5 (141-348)||(16347879-16348084)
chr5 (13-201)||(34272768-34272956)
chr5 (49-298)||(36200430-36200680)
chr5 (166-357)||(27302451-27302638)
chr5 (13-219)||(27622-27828)
chr5 (13-164)||(16347726-16347877)
chr5 (169-298)||(43558318-43558448)
chr5 (212-309)||(17341748-17341846)
chr5 (170-248)||(43423578-43423656)
chr5 (153-260)||(20077305-20077413)
chr5 (153-293)||(38578992-38579130)
chr5 (81-298)||(3096830-3097041)
chr5 (161-223)||(28676253-28676314)
chr5 (218-298)||(6368478-6368559)
chr5 (214-298)||(21915534-21915619)
chr5 (239-298)||(25937720-25937780)
chr5 (239-309)||(37124207-37124278)
[»] scaffold0570 (1 HSPs)
scaffold0570 (13-347)||(2618-2951)
[»] scaffold0024 (1 HSPs)
scaffold0024 (13-311)||(82356-82655)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (32-361)||(31055-31383)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (95-361)||(12028-12293)
[»] scaffold0171 (1 HSPs)
scaffold0171 (228-304)||(5834-5911)
[»] scaffold1493 (1 HSPs)
scaffold1493 (121-234)||(41-156)
[»] scaffold0045 (2 HSPs)
scaffold0045 (13-260)||(86955-87204)
scaffold0045 (256-361)||(88514-88618)
[»] scaffold0606 (1 HSPs)
scaffold0606 (170-294)||(9309-9434)


Alignment Details
Target: chr2 (Bit Score: 313; Significance: 1e-176; HSPs: 30)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 313; E-Value: 1e-176
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 45367972 - 45368320
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45367972 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaatcgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgttgtccgata 45368071  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
    |||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45368072 aaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 45368171  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagaccc 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  45368172 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaatttgggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaccc 45368271  T
Q  313 acacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  45368272 acacttctccttttgttgaagttacattccatataccccgtcttgcttc 45368320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 11992454 - 11992801
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  11992454 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccatcactccgtaccatacaacattgccggtcagactgctgtccgata 11992553  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11992554 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 11992653  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||    
T  11992654 gcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc 11992753  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||| ||||  ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  11992754 --cacttctctttttactgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 11992801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 41763389 - 41763744
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||||||| || | | |||||    
T  41763389 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtctgattgttcttcgata 41763488  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttc--------aaccacccagcttgaatacgataat 204  Q
     ||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||        |||||||||||||||||||||| ||    
T  41763489 gaactttccttttagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaagttttcaaccacccagcttgaatacgatgat 41763588  T
Q  205 ttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaa 303  Q
    ||||||||||||||||||||||  ||||||||| ||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  41763589 ttacatctgcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaatcgtgcaacttggggtatgatataatctccaactttcacctccaa 41763688  T
Q  304 ggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||  |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  41763689 ggtagacc--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 41763744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 14 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 2610461 - 2610115
Alignment:
Q  14 catcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 113  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | | ||||||||| |||||||||     
T  2610461 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccagtctgactgttgtccgatag 2610362  T
Q  114 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctg 213  Q
    ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||  ||||||||||    
T  2610361 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcataaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggtttacatctg 2610262  T
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagaccc 312  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  2610261 cttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc- 2610163  T
Q  313 acacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||| || |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  2610162 -tacttctccttctgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttc 2610115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 451976 - 452311
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||||||||| ||| |    
T  451976 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgatagaactt 452075  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  452076 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttct 452175  T
Q  219 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacact 317  Q
    |||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||      ||| ||||||||||||   |||    
T  452176 atttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctcca------acctccaaggtagacc--tact 452267  T
Q  318 tctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  452268 tctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 452311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 4807526 - 4807179
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||| || ||||| ||  | |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  4807526 acatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgctcaacactctgtgtcatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgata 4807427  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  4807426 gaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccatcttgaatacgatggcttacatct 4807327  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  4807326 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 4807227  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  4807226 --tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 4807179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 13 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 3866006 - 3865661
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||| |||||||||    
T  3866006 acatcatcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtctgactgttgtccgata 3865907  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |    
T  3865906 gaactttcctttcaacttaagtagtactttcttatcacacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacattt 3865807  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  3865806 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagttattgaaaccgtgtaacttgggatacaatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 3865709  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgct 359  Q
    |  ||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  3865708 cgtacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgct 3865661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8180714 - 8180367
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  |  |||||||||| |||||||||    
T  8180714 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgatgtccgata 8180615  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  8180614 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaactcttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 8180515  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  | |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  8180514 gcttctatttctccgtcattttataagaaggacccaaaatatttaaaccgtgtaacttggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 8180415  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||    |||| |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  8180414 --tacttctccttccactgaaattacattccatatactctgtcttgcttc 8180367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30743538 - 30743210
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||| |||| | | ||||||||| |||||||| ||||||||||| ||| |||| |||||| || |||||| ||||    
T  30743538 acttacttgattctcgtgttggcttttaatcgcctaactctccgtaccatacaacatcgtcggtctgaccgctatccggtaaaactttcctttcaactta 30743439  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||| ||||    
T  30743438 agtggtactttcttatcacacaaaacacatgaggctcttctcaatttcaatcactcagcttgaatacgatgatttatatctacttctatttatccgtcat 30743339  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttg 330  Q
    |||||| ||| |||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||   | ||||||||||| ||    
T  30743338 tttgtactattgacctaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatggtatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--aatttctccttttgctg 30743241  T
Q  331 aagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||| ||||    
T  30743240 aagttacattccatatactctgtctttcttc 30743210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 13 - 357
Target Start/End: Original strand, 24583954 - 24584297
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |  ||||| |||||||| |||||||||  | || ||  | |    
T  24583954 acatcttcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattttgtaccatacaacatcgtcggtctggatactatctaaca 24584053  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| ||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||||||  ||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| |||   ||| ||||    
T  24584054 gaacttttctttcaacttaagtggtattttcttttcgcacaaaacacacgaggctattctccatttccaccacccagcttgaatatgatggcttaaatct 24584153  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    || | |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  24584154 gcctatatttctccatcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgcggtctgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 24584251  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttg 357  Q
    || | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  24584252 cataattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttg 24584297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 103 - 361
Target Start/End: Original strand, 38453058 - 38453314
Alignment:
Q  103 ctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgata 202  Q
    |||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  38453058 ctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatg 38453157  T
Q  203 atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgcc 301  Q
      |||||| ||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  38453158 gcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtatgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctcc 38453257  T
Q  302 aaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||||    ||||||||||  | ||| ||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38453258 aaggtagac---tacttctccttccgctgatgttacattccatatactccgtcttgcttc 38453314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 32 - 311
Target Start/End: Original strand, 3244018 - 3244293
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| | |||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| | ||    
T  3244018 acttacttgattctcatgttgactcttaactgtccaacactccgtaccattcaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaacata 3244117  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  3244118 agtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctccatttctaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcat 3244217  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  3244218 tttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg----gatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 3244293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 13 - 226
Target Start/End: Original strand, 41197576 - 41197792
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||  |||||||||| ||| |||||    
T  41197576 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacattgctggtctgactgttgttcgata 41197675  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatac---gataatttaca 209  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||   ||| ||| |||    
T  41197676 gaactttcctttcagcttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatgattcaca 41197775  T
Q  210 tctgcttctatttctcc 226  Q
    | |||||||||||||||    
T  41197776 tatgcttctatttctcc 41197792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 154 - 306
Target Start/End: Complemental strand, 13149106 - 13148953
Alignment:
Q  154 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 253  Q
    ||||||||||  ||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||| ||||  |||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||  |||||    
T  13149106 aaacacctgaagctcttcttcatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttgtatctacttctatttctccgtcattttgtactatggacctgagata 13149007  T
Q  254 tttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggt 306  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  13149006 tttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggt 13148953  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 43 - 246
Target Start/End: Original strand, 6238132 - 6238334
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    |||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| ||| |||| |||| ||||||||| ||  ||  ||||| |||||||||| ||||    
T  6238132 tctcgtgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgtcagtctaactgttgtccgatagaattttcttttcaacttaagtggtatttt 6238231  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
     ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||||||| |||||||| || || |||||||||  ||||||||| ||||    
T  6238232 -ttatcacacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatgatttacatatgtttttatttctccgacattttgtactatg 6238330  T
Q  243 gacc 246  Q
    ||||    
T  6238331 gacc 6238334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 162
Target Start/End: Complemental strand, 23997551 - 23997402
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||| |||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  23997551 acatcttcatctccgttacacttacttggctctcgtgttgactcttaactgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcggtcttactgttgtccgata 23997452  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 162  Q
     ||| || ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  23997451 gaactttcctttcagcttaagtggtattttctcatcgcacaaaacacctg 23997402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 178 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37281878 - 37281746
Alignment:
Q  178 tcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtat 276  Q
    ||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| || |||||| | ||||||||||||  ||||||||| ||||||    
T  37281878 tcaaccacccaacttgaataggatgatttacatctacttctatttctccttcattttatactatggagctaagatatttaaaatgtgtaacttggggtat 37281779  T
Q  277 gatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    || |||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  37281778 gacatgatctcaaactttcacctccaaggtaga 37281746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 17581262 - 17581121
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||| ||  |||||||||||||| |||||||   ||||||||||  ||| ||||||||     
T  17581262 aaaacacctgagactcttctccatttgaaccatccaacttgaatatgaggatttacatctgcttttatttctttgtcattttgtacaatgaacccaaga- 17581164  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| |||||||||    
T  17581163 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaactttcac 17581121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 131
Target Start/End: Complemental strand, 38429818 - 38429700
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  38429818 acatcctcatctccgctacacttactctactctcgtgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgata 38429719  T
Q  113 aaacctttctttcagctta 131  Q
     ||| || |||| ||||||    
T  38429718 gaactttccttttagctta 38429700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 14770090 - 14769943
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc-agcttgaatacgata-----atttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 246  Q
    ||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||     |||||||| |||||  |||||||  |  ||||||| ||||| ||    
T  14770090 aaaacaccttacactcttctccatttcaaccaccccagcttgaatatgatataatgatttacatatgcttgaatttctctgttgttttgtactatggccc 14769991  T
Q  247 caagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 293  Q
     |||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  14769990 taagatatttaaaccgtgtaacttatgctatgatatgatctccaactt 14769943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Original strand, 33594757 - 33594903
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||||| |||| || |||||| |||||||||||| ||||||  |||  ||||||||| |||||||||||||  | ||||||| |||  ||| |||||    
T  33594757 aaaacacctaagacactcctccatctcaaccacccagtttgaatttgatgttttacatctccttctatttctccgacgttttgtactatatacctaagat 33594856  T
Q  253 atttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| |||||| |   |||||||||||| ||||||||||||||    
T  33594857 atttaaactgtgtaaatgctggtatgatatgaactccaactttcacc 33594903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 141
Target Start/End: Complemental strand, 36183385 - 36183257
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  36183385 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgttgtccgata 36183286  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttt 141  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||||||    
T  36183285 gaactttcctttcaacttaagtagttttt 36183257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 274 - 360
Target Start/End: Original strand, 12475031 - 12475115
Alignment:
Q  274 tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgctt 360  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  12475031 tatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgctt 12475115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 153 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 12904762 - 12904624
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||||||||||| ||  |  |||||||||||| | ||||||| | ||  ||||||||| || | | |||||||| |||||||| ||| ||| | | ||    
T  12904762 aaaacacctgagacactcgtttatttcaaccacctaacttgaattctatggtttacatctcctccaacttctccattattttgtactatagacaccatat 12904663  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaa 290  Q
    ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  12904662 atttaaaccgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaa 12904624  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 246 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 876833 - 876780
Alignment:
Q  246 ccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||| |||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  876833 ccaacatatttaaactgtgtaacttgtggtaggatatgatctccaactttcacc 876780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 200 - 298
Target Start/End: Original strand, 7135220 - 7135319
Alignment:
Q  200 ataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||  ||  ||||||| | |||||||||||  ||| ||| |||||||||| ||||||||||||| || || |||||||    
T  7135220 ataatttacttctacttctatttctttattgttttgtactgtggacccaagactttttaactgtgtaacttgtggtatgatatgatatctaaatttcacc 7135319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28317517 - 28317394
Alignment:
Q  171 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 270  Q
    |||| |||||||||| ||||||| || | ||  | ||||||| ||||| ||| |||||||||||||| ||  || |||| |||| ||||  ||||| |||    
T  28317517 ctccgtttcaaccactcagcttggattcaatggtatacatctacttctttttatccatcattttgtactacagatccaaaatatataaattgtgtacctt 28317418  T
Q  271 gggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |    |||||||||||||||||||||||    
T  28317417 g----tgatatgatctccaactttcacc 28317394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 6465515 - 6465370
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||| || |||||||||||||| ||| |||||   |||||||  ||| |||| ||| |||||| |||||||  |||||||||| |||    |||| ||    
T  6465515 aaaacagctaagactcttctccatctcagccacctgacttgaatttgatgatttgcatatgcttcaatttctcagtcattttgtagtataatgccaaaat 6465416  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    ||| |||  |||||||||| | | | ||||||||||||||||||||    
T  6465415 attaaaattgtgtaacttgtgttttaatatgatctccaactttcac 6465370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 261
Target Start/End: Complemental strand, 7292782 - 7292673
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga-cccaaga 251  Q
    |||||||||||| | || || ||||||||||||||| |||| ||  |||  ||||||||| |||||||| | || ||| |||||| ||| || ||| |||    
T  7292782 aaaacacctgagtcactccttcatttcaaccacccaacttggatttgatggtttacatctccttctattcccccgtcagtttgtactatagaccccgaga 7292683  T
Q  252 tatttaaacc 261  Q
    ||||||||||    
T  7292682 tatttaaacc 7292673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 32443527 - 32443436
Alignment:
Q  34 ttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttca 126  Q
    |||||| | ||||||||||  |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||| ||| |||||||| | ||||| ||  |||||||||    
T  32443527 ttacttgattctcgtgttgattcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgt-ggtttgactgctatacgatagaatttttctttca 32443436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 49)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 27450521 - 27450868
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  27450521 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgata 27450620  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27450621 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 27450720  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||    
T  27450721 gcttctatttctccatcattttgcactatggacccaagatatgtaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtatacc 27450820  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||| ||||||||||||    
T  27450821 --cacttctccttttgctgaagttacattccaaatactccgtcttgcttc 27450868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 23906649 - 23906996
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  23906649 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 23906748  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  23906749 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 23906848  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23906849 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 23906948  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23906949 --tacttctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 23906996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 436163 - 435816
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  436163 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 436064  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||    
T  436063 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccactcagcttgaatacgatgacttacatct 435964  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||| ||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  435963 gcttctatttctccgtcattttatacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 435864  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||    
T  435863 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcgtgcttc 435816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 31960162 - 31960509
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  31960162 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgata 31960261  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  31960262 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 31960361  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31960362 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 31960461  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31960462 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 31960509  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 48174457 - 48174788
Alignment:
Q  29 tatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagc 128  Q
    ||||||||||| | | || ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |    
T  48174457 tatacttacttgattttcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaac 48174556  T
Q  129 ttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccat 228  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| |    
T  48174557 ttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgt 48174656  T
Q  229 cattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttg 327  Q
    || ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  |    
T  48174657 cactttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccg 48174754  T
Q  328 ttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
     ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48174755 ctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48174788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 13 - 348
Target Start/End: Complemental strand, 33227143 - 33226809
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||| | | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  33227143 acatcctcatctctgctacacttacatgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 33227044  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  33227043 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgtacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 33226944  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33226943 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 33226844  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatatac 348  Q
       |||| |||||  | ||||||||||| ||||||||    
T  33226843 --tacttgtccttccgctgaagttacattccatatac 33226809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 29 - 361
Target Start/End: Original strand, 1777379 - 1777710
Alignment:
Q  29 tatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagc 128  Q
    ||||||||||| | | || ||||| |||||||||   || ||||||||| | |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||| || |||||| |    
T  1777379 tatacttacttgattttcatgttgactcttaacctttcaacactccgtatcatacaacaacgtcggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaac 1777478  T
Q  129 ttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccat 228  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||  |    
T  1777479 ttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatttgcttctatttctctgt 1777578  T
Q  229 cattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttg 327  Q
    |||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  |    
T  1777579 cattttgtacgaaggacccaagatatttaaaacgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccg 1777676  T
Q  328 ttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
     ||||||||||| |||||||| |||| |||||||    
T  1777677 ctgaagttacattccatatactccgtattgcttc 1777710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 56375194 - 56374877
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |  |  |||||||||||||||||||| | | || ||||||  |||||||||  |||    
T  56375194 tctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaataacgctggtctgactgctgtccgatagatctttcctttcaaattaagtggtacttt 56375095  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  56375094 cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttatatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaag 56374995  T
Q  243 gacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||| |    
T  56374994 gacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgctctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattc 56374897  T
Q  342 catataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  56374896 catatactccgtcttgcttc 56374877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 92 - 361
Target Start/End: Original strand, 48622954 - 48623222
Alignment:
Q  92 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 191  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  48622954 cggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggcttttctccatttcaaccacccagct 48623053  T
Q  192 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 290  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| ||||||| || |||||||||||| |||||||    
T  48623054 tgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaatcgtgtaatttggggtatgatatgctctccaa 48623153  T
Q  291 ctttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||| ||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  48623154 ctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 48623222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 151; E-Value: 8e-80
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 53707728 - 53707381
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||  |||| |||| ||  | ||||| || ||||| ||||||    
T  53707728 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctctaccatacatcaacgccggtcggaatgctggccgata 53707629  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  53707628 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgagtctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 53707529  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  53707528 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttagaccgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 53707429  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||    ||||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  53707428 --tacttctccttccactgaagttacattcgatatactccgtcttgcttc 53707381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 39708373 - 39708044
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||| ||| || |||||| ||||    
T  39708373 acttacttgattctcgtgttgcctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcgatcggactgttgcccgatagaactttcctttcaactta 39708274  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaac-acctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatca 230  Q
    ||||||  ||||||||| || ||||| |||| || ||||| ||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||||| |||    
T  39708273 agtggtactttcttatcacaaaaaaccacctaaggctcttatccatttcaaccatccagcttgaatacgaggatttacacctgcttctatttctccgtca 39708174  T
Q  231 ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgtt 329  Q
    ||||||| ||| ||||||||||||||||||||  ||||||| ||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||   | ||||||||||| |    
T  39708173 ttttgtactatcgacccaagatatttaaaccgcataacttgaggtataatatgatctccaaatttcacctccaagatagacc--taattctccttttgct 39708076  T
Q  330 gaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  39708075 gaagttatattccatatactccgtcttgcttc 39708044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 50286899 - 50286625
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||| | |||||||  |||| |||||| | ||||||||| ||| |    
T  50286899 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtatcatacaacaacgtcgatctgacggttgtccgatagaactt 50286800  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    | |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  50286799 tcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgtgactcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttct 50286700  T
Q  219 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaact 292  Q
    |||||||| ||||||||||  | |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  50286699 atttctccgtcattttgtacgaaggacacaatatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaact 50286625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 32 - 310
Target Start/End: Complemental strand, 16002842 - 16002565
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| |||| |||| ||| | | ||||||| |  ||||| |||| |||| |||||||| ||||||| | ||||    
T  16002842 acttacttgattctcgtgttgactcttaacctcccaacacttcgttcat-acaacatcgctggtctaactgatgtctgataaaacttttctttgaactta 16002744  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  16002743 agtggtactttcttatcacacaaaacacctgaggctcttctcaatttcaaccactcagcttaaatacgatgatttacatctgcttctatgtctccgtcat 16002644  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagac 310  Q
    |||||| |||||| ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||| ||| |||||||||||    
T  16002643 tttgtactatggaaccaagat-tttaaaccgtgtaatttggggtatgatatgatttccaacttttacctccaaggtagac 16002565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 13 - 291
Target Start/End: Original strand, 1211738 - 1212017
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||| | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||  |||||||   ||||||||||| |||||||||    
T  1211738 acatcctcatatccgctacacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacactctgtaccacacaacatcaccggtctgactgttgtccgata 1211837  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| |||||||||| ||||||||||  ||||||||  |||| ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||| ||||||| ||    
T  1211838 gaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcatacaaaacatttgaggctcttctccatttcaactacctaacttgaatacgatgatttacacct 1211937  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaac 291  Q
    |||||||||||||  | |||||||| ||||||| ||||||||||||||  |||||| |  ||||||||||||||||||||    
T  1211938 gcttctatttctctgttattttgtactatggacacaagatatttaaactatgtaacgtaaggtatgatatgatctccaac 1212017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 43 - 348
Target Start/End: Original strand, 47265580 - 47265886
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttt-- 140  Q
    |||||||||| |||||||||| |||  |||  ||||| |||||||| |  |||||||||| |||| |||| ||| ||  ||||| ||||||||||  |      
T  47265580 tctcgtgttgactcttaaccgtccaatactttgtaccatacaacatcgctggtctgactgttgtcagatagaactttcatttcaacttaagtggtactac 47265679  T
Q  141 -ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 239  Q
     ||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||| |||||   |||||| ||||||||||||||| ||||||| || |    
T  47265680 tttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttcttcatttcaatcacccagcttgaa-acgatggcttacatttgcttctatttctccgtcattttatact 47265778  T
Q  240 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttaca 338  Q
    ||||| |||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||    
T  47265779 atggatccaagatatttaaactatgtaacttggggtatgatatgacctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttaca 47265876  T
Q  339 tgccatatac 348  Q
    |  |||||||    
T  47265877 tttcatatac 47265886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 43433852 - 43433643
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||| ||||||||||||    
T  43433852 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgattgctgtccgata 43433753  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||    
T  43433752 gaactttcctttcaacttaagtgacactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaatcacccagcttgaatacgatggtttacatct 43433653  T
Q  213 gcttctattt 222  Q
    ||||||||||    
T  43433652 gcttctattt 43433643  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 46583172 - 46583396
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | || |||||||||||||| |||    
T  46583172 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacagcgccgatctgactgctgtccaata 46583271  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || ||||||  ||||||| |  ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  46583272 gaactttcctttcaaattaagtgatactttcttatcgcacaaaatacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 46583371  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgta 237  Q
    |||||||||||||| ||||||||||    
T  46583372 gcttctatttctccgtcattttgta 46583396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Original strand, 41009698 - 41009922
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||| |||| || |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||  |||||||| |  ||||||| || ||||| |||    
T  41009698 acatcctcatttccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaatcgcccaacactccgtactatacaacatcgctggtctgattgttgtccaata 41009797  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagact---cttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttaca 209  Q
     ||| ||| |  || |||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| ||| |   ||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||    
T  41009798 gaacttttttcccaacttaagtggtattttcttatcatacaaatcacctcagattaatcttctccatttcaaccacctaacttgaatacgaagatttaca 41009897  T
Q  210 tctgcttctatttctccatcatttt 234  Q
    | ||||||||||||||| |||||||    
T  41009898 tttgcttctatttctccgtcatttt 41009922  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Original strand, 17666526 - 17666669
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||  ||||||||||||||||| | ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||| |  ||||||||| | || |||||||||    
T  17666526 aaaacacatgatgctcttctccatttcaacaatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttcttcgacattttgtactttgaacccaagat 17666625  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||| ||| ||||||    
T  17666626 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctctaacgttcacc 17666669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Original strand, 54787741 - 54787878
Alignment:
Q  161 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  54787741 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 54787840  T
Q  261 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  54787841 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 54787878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 221 - 295
Target Start/End: Original strand, 10775975 - 10776050
Alignment:
Q  221 ttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttc 295  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  10775975 ttctccatcattttgtattatagacccaagatatttaaaccatgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttc 10776050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 170 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 1629208 - 1629084
Alignment:
Q  170 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 269  Q
    |||||||||||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||| |  ||||||||||||||  |||||||    
T  1629208 tctccatttcaaccactcaagttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccatcgttttatactatgaattcaagatatttaaactatgtaact 1629109  T
Q  270 tg-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    || || | ||||||||||| |||||    
T  1629108 tgtggcacgatatgatctcaaactt 1629084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 94 - 258
Target Start/End: Original strand, 54914618 - 54914781
Alignment:
Q  94 gtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttg 193  Q
    |||||||| ||| |||||| ||  || |||||| |||||||||| |||||||||| || ||||||||  || || |||||||||||||||||     |||    
T  54914618 gtctgactcctgaccgatagaattttcctttcaacttaagtggtattttcttatcacataaaacaccaaag-cttttctccatttcaaccacatgatttg 54914716  T
Q  194 aatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaa 258  Q
    ||||| |  ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||    
T  54914717 aatacaaggatttacatctgtttctatttctccatcattttataccatggacccaagatatttaa 54914781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 43 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 55578935 - 55578722
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||| | |||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||  || ||| || |||||| |      |    
T  55578935 tctcgtgttggttcttaaccgcccaacacttcataccatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaattttccttccaacttaagcg---acat 55578839  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
     ||||| || |||||| ||||   |||||||||||| ||||||| | ||| |||||||| |||||  | ||||||||||||||  ||||||| || |||     
T  55578838 gttatcacataaaacatctgaagatcttctccattttaaccacctaacttaaatacgatgatttatgtatgcttctatttctcagtcattttatactata 55578739  T
Q  243 gacccaagatatttaaa 259  Q
    || ||||||||||||||    
T  55578738 gatccaagatatttaaa 55578722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 76 - 298
Target Start/End: Original strand, 39754782 - 39755005
Alignment:
Q  76 taccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctcca 175  Q
    |||| |||||||| |||||||  || | |||| |||||||   ||| |||| |||||||||| |||||  ||| || ||||||| |||| | ||  | ||    
T  39754782 taccgtacaacatcgtcggtcataccgttgtctgataaaataattccttcaacttaagtggtattttcgcatcacataaaacacttgaggcactggttca 39754881  T
Q  176 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggt 274  Q
    ||||||||||  | |||| || | || |||||||||| |||||||||||   || ||||||| ||| |||||| ||||||||||  |||| ||||| |||    
T  39754882 tttcaaccactaaacttggattcaatgatttacatctccttctatttctttgtcgttttgtactatagacccatgatatttaaagtgtgtgacttgtggt 39754981  T
Q  275 atgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||||||| |||||||||||    
T  39754982 atgatatgatcttcaactttcacc 39755005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30807331 - 30807246
Alignment:
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||| ||| | | | ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  30807331 cttctatttctcagtcattttgtactatagactccaaacatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacc 30807246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Complemental strand, 35690238 - 35690042
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| |||||| |||||||| | || || ||| || | |||||||| |||||||| |||| |||| ||||    
T  35690238 acatcctcatctcggctacacttacttgattctcatgttggttcttaaccacacaacattccatatcatacaacatcgtcggtctaactgttgtctgata 35690139  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 210  Q
     ||  || || ||| |||||  ||   ||||||||| || |||||||| |  |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  35690138 gaattttcctctcaacttaaacggcactttcttatcacataaaacacccgc-actcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatgatttacat 35690042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 162 - 274
Target Start/End: Original strand, 52280695 - 52280807
Alignment:
Q  162 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 261  Q
    ||||| |||||||||||||||||| || | |||||||||| |||||||  ||||||  ||||||| | |||||||| | | ||||||| ||||||||| |    
T  52280695 gagacccttctccatttcaaccacacaacgtgaatacgattatttacacttgcttcagtttctcctttattttgtactttagacccaaaatatttaaatc 52280794  T
Q  262 gtgtaacttgggt 274  Q
    ||||||| |||||    
T  52280795 gtgtaacctgggt 52280807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 172 - 298
Target Start/End: Original strand, 7092719 - 7092846
Alignment:
Q  172 tccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt- 270  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||  || || ||||||||| ||||||| | | | ||||| || ||| ||||||  ||||||||||||||||| ||     
T  7092719 tccatttcaaccacccaacttgaataatatgatgtacatctgcatctatttattcgttattttatactatagacccacaatatttaaaccgtgtaattta 7092818  T
Q  271 gggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
     | ||||||||||||| |||||||||||    
T  7092819 agatatgatatgatcttcaactttcacc 7092846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 307
Target Start/End: Original strand, 17667817 - 17667969
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||||||||   | ||||| ||||  |||| ||| |||||||||||| |||||||| ||| | |||||||   |||||||||| |||| |||||| ||    
T  17667817 aaaacacctgaagtttttctctatttataccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcgtttatttctaagtcattttgtactatgaacccaatat 17667916  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggta 307  Q
    ||||||||  | ||||||  |||||||||||| ||||||||||||| | ||||||    
T  17667917 atttaaactatataactt--gtatgatatgatatccaactttcacctctaaggta 17667969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 204 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 42037604 - 42037510
Alignment:
Q  204 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    ||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| ||  ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||| ||| ||||||    
T  42037604 tttacatctccttatatttctcagtcattttgtactatagattcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgggatgatatgatcttcaaatttcac 42037510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 161 - 226
Target Start/End: Original strand, 45185477 - 45185542
Alignment:
Q  161 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcc 226  Q
    |||| ||||||||| ||||||||||  ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||    
T  45185477 tgaggctcttctccctttcaaccactaagcttgaatacaatgatttacatctgcttctatttctcc 45185542  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 20917762 - 20917630
Alignment:
Q  167 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 266  Q
    |||||||||||| ||||| | || |||||| |||| | |||||| || |||||||||||| |  |||| || |||||| |   ||||||||||| |||||    
T  20917762 tcttctccattttaaccatctagattgaattcgatgacttacatatgtttctatttctccgttgttttatactatggagctcggatatttaaactgtgta 20917663  T
Q  267 actt-gggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||  ||||||||||||||| |||||||||||    
T  20917662 acttatggtatgatatgatcttcaactttcacc 20917630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 140 - 271
Target Start/End: Complemental strand, 3273229 - 3273098
Alignment:
Q  140 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 239  Q
    |||| |||| || ||||||  |||| ||| ||||||||||||||| ||| ||||||| ||||  |||| || |||||||||||||   || ||||||| |    
T  3273229 tttcgtatcacataaaacaaatgaggctcatctccatttcaaccatccaacttgaattcgatggtttatatttgcttctatttctttgtcgttttgtact 3273130  T
Q  240 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg 271  Q
    ||||||| ||||| ||||||  ||||||||||    
T  3273129 atggacctaagatgtttaaattgtgtaacttg 3273098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 33 - 115
Target Start/End: Complemental strand, 11389634 - 11389552
Alignment:
Q  33 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaa 115  Q
    ||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||| |||| | | || ||||||||||||||||| ||  |||||||||||||    
T  11389634 cttactttattctcgagttggttcttaaccgcccaacactactttccatacaacattgtcggtcttacaactgtccgataaaa 11389552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 19 - 87
Target Start/End: Original strand, 26037836 - 26037904
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaaca 87  Q
    ||||||||| |  |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||    
T  26037836 tcatctccgctccacttacttgattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtatcatacaaca 26037904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 13 - 97
Target Start/End: Original strand, 45205196 - 45205280
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtct 97  Q
    ||||| ||||||||| ||  ||||||| | ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  45205196 acatcctcatctccgctacgcttacttgattctcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccatacaacatcgccggtct 45205280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 13 - 91
Target Start/End: Complemental strand, 1793394 - 1793316
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgt 91  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| | ||| ||||||||||||||||||| | ||||| ||| | |||||||||||    
T  1793394 acatcctcatctccgctacacttacttgattctagtgttggctcttaaccgccaaacactctgtatcatacaacattgt 1793316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 212 - 297
Target Start/End: Complemental strand, 41427574 - 41427488
Alignment:
Q  212 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||  | ||||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||    
T  41427574 tgcttatatttctccgtcattctgtactatgagcacaagatatttaagtcgtgtaacttggggtatgatatgatcttcaattttcac 41427488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 232 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 30853131 - 30853066
Alignment:
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttca 296  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||| ||| ||||||| |||||    
T  30853131 tttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtagcttgtggtatgacatgttctccaaatttca 30853066  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 32 - 137
Target Start/End: Original strand, 52569882 - 52569987
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||||  || ||||||||||| |||||||    ||||||||||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  52569882 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgaacaacactccgtaccatacaacaacaccggtctgactgttgtccaatagaactttcctttcaactta 52569981  T
Q  132 agtggt 137  Q
    ||||||    
T  52569982 agtggt 52569987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 100
Target Start/End: Complemental strand, 31458943 - 31458875
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgac 100  Q
    |||||||||| | ||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||| || ||||| | |||||||||    
T  31458943 acttactttattttcgtgttggttcttaactgcccaacactccgtaccataaaacatcgccggtctgac 31458875  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 153 - 271
Target Start/End: Original strand, 8917815 - 8917938
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-----tatggaccc 247  Q
    ||||||| |||| |||||||| |||||||  | ||| |||||| ||||| |||||  ||||||| ||||||||  |||||||||||      ||| ||||    
T  8917815 aaaacacttgaggctcttctcaatttcaattatccaacttgaaaacgatgatttatgtctgcttttatttctctgtcattttgtataattaaatgaaccc 8917914  T
Q  248 aagatatttaaaccgtgtaacttg 271  Q
    || |||||||||| ||||||||||    
T  8917915 aatatatttaaactgtgtaacttg 8917938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 309
Target Start/End: Original strand, 55768963 - 55769022
Alignment:
Q  251 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  55768963 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55769022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 251 - 309
Target Start/End: Original strand, 55833219 - 55833278
Alignment:
Q  251 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| | ||||||||    
T  55833219 atatttaaaccgtgttacttgtggtatgacatgatcttcaactttcacctctaaggtaga 55833278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Complemental strand, 12494684 - 12494618
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 79  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  12494684 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtacc 12494618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 39100881 - 39100947
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 79  Q
    ||||| ||||||||| || |||||| | ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||    
T  39100881 acatcctcatctccgctacacttacatgactctcgtgttggctcttaactgtccaacactctgtacc 39100947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 32 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 4440770 - 4440682
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttc 121  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||| | ||| ||||| | |||||||  || |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  4440770 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgccaa-caccccgtatcatacaacaacgttggtctgactgctgtccgatagaacttttc 4440682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 19 - 64
Target Start/End: Complemental strand, 27983128 - 27983083
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgc 64  Q
    ||||||||| || ||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  27983128 tcatctccgctacacttactttactctcatgttgactcttaaccgc 27983083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 223; Significance: 1e-123; HSPs: 29)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 25191313 - 25190966
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||  ||||||||||  ||| |||||    
T  25191313 acatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgactcttaacagcccaacactctgtaccatacaacatttccggtctgactattgttcgata 25191214  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     |||||| |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  25191213 gaaccttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacattt 25191114  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  25191113 gcttctatttctccatcattttgtactatagacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggctatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 25191014  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  25191013 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 25190966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 13 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 38850028 - 38849686
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||| |||||| |||||||||    
T  38850028 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacactttgtaccatacaacatcgtcggtgtgactgttgtccgata 38849929  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
    |||  ||||||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||   ||||||||    
T  38849928 aaaaatttctttcaacttaagtggtactttgttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatct 38849829  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  38849828 gcttctatttctccgtcattttgtactgtggacccaagatatttaaaccgtgtaaattgaggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 38849729  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtctt 356  Q
       ||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||    
T  38849728 --tacttctccttttgatgtagttacattccatatactccgtctt 38849686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 51448057 - 51448404
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || ||||| || | |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  51448057 acatcctcatctctgctacacttagttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgata 51448156  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||    
T  51448157 taactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatagcttacatct 51448256  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51448257 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 51448356  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||||||||    
T  51448357 --tacttctccttccgctgaagttacatttcatatactccgtcttgcttc 51448404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Original strand, 47542089 - 47542406
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||    
T  47542089 tctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagaccgctgtccgatagaactttcctttcaacttaagtggtacttt 47542188  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  47542189 cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaag 47542288  T
Q  243 gacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |    
T  47542289 gacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgaaatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattc 47542386  T
Q  342 catataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||| || ||||||||||||    
T  47542387 catacactccgtcttgcttc 47542406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 32 - 290
Target Start/End: Complemental strand, 28245352 - 28245093
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| || ||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  28245352 acttacttaattctcatgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccgtacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaactta 28245253  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||    
T  28245252 agtggtactttcttatcgcacaaaacaactgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccatcat 28245153  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 290  Q
    ||||||  | ||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  28245152 tttgtacgaaggatccaagatatttaagccgtgtaacttggggtattatatgatctccaa 28245093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 33 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 27917486 - 27917209
Alignment:
Q  33 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaa 132  Q
    ||||||| | |||||| |||| ||||||| || || ||||  ||||| |||||||| | |||| |||||| ||| ||||| ||  |||| |||| |||||    
T  27917486 cttacttgattctcgttttggttcttaactgcacatcactttgtaccatacaacatcgccggtgtgactgatgttcgatagaatttttcattcaacttaa 27917387  T
Q  133 gtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatt 232  Q
    |||||  ||| ||||| || ||||||| |||| |||||||| |||||| | ||||| |||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||| |||||    
T  27917386 gtggtacttttttatcacataaaacacatgaggctcttctctatttcagctacccaacttgaatacgatgatttatatatgcttatatttctccgtcatt 27917287  T
Q  233 ttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27917286 ttgtactatggactcaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtaga 27917209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 108; E-Value: 4e-54
Query Start/End: Original strand, 13 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 5168762 - 5168599
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  5168762 acatcctcatctccgctacacttactttactctcatgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgata 5168663  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 176  Q
     ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5168662 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccat 5168599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 52138734 - 52138553
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  52138734 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatcttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 52138635  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 194  Q
     ||| || |||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  52138634 gaactttcctttcaacttaagtggtattttcttatcgcacaagacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 52138553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 81 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 29817370 - 29817096
Alignment:
Q  81 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 180  Q
    ||||||||| ||||||| |||| |||||| || ||  ||||||||| |||||| | |  ||||||||| || ||||||    ||||| ||||| ||||||    
T  29817370 tacaacattatcggtctaactgttgtccggtagaaattttctttcaacttaagcgttactttcttatcacataaaacataacagactattctctatttca 29817271  T
Q  181 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgat 279  Q
    |||||||| |||||||||||| ||||||||||||   ||||| ||| |||||||||| |||||  | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||    
T  29817270 accacccaacttgaatacgatgatttacatctgccgttatttatccgtcattttgtactatgg-tcaaagatatttgaaccgtgtaacttatggtatgat 29817172  T
Q  280 atgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttg 357  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| |||| |   ||||| ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  29817171 atgatctccaactttcacctccaagatagaac--aacttcaccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttg 29817096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 128 - 270
Target Start/End: Original strand, 54425369 - 54425511
Alignment:
Q  128 cttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctcca 227  Q
    ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||||||||| | |||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||||     
T  54425369 cttaagtggtactttcttatcacacaaaacacatgagactctttttcatttcaaccgcctagcttaaatacgatgatttacatatgcttctatttctccg 54425468  T
Q  228 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 270  Q
    ||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  54425469 tcattttttactatggatccaagatatttaaaccgtgtaactt 54425511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 228 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 52138547 - 52138415
Alignment:
Q  228 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctcctttt 326  Q
    ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||      
T  52138547 tcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttcc 52138450  T
Q  327 gttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  52138449 gctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 52138415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 13 - 180
Target Start/End: Complemental strand, 53519520 - 53519353
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||| |||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||   ||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  53519520 acatcctcatttccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcttaacactccgtacaacacaacattgccgatctgactgctgtccgata 53519421  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 180  Q
     |   || |||| |||||||||| |  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  53519420 gatttttcctttaagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttca 53519353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 74; E-Value: 7e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 26490251 - 26489965
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca--acattgtcggtctgactgctgtccga 110  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| || | | |||| ||||  |||| | ||||||||||| |||||||    
T  26490251 acatcctcatctccgctacacttacttgattctcttgttggttcttaaccgcccaaca-tacttaccatacacaacatcgccggtctgactgttgtccga 26490153  T
Q  111 taaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 210  Q
    || ||  || |||| |  ||||| ||| |||||| ||  || ||||| | | || || |||| ||| |||||||| || ||| |||| ||| ||||||||    
T  26490152 tataattttcctttaaatttaagcggtattttctcattacataaaactc-taaggctattcttcatctcaaccactcaacttcaatatgatgatttacat 26490054  T
Q  211 ctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||| |||||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  26490053 ctgcttctatttctccgtcattttatatcatggaaccaagatatttaaatcatgtaacttggagtatgatatgatctcccactttcacc 26489965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19757820 - 19757655
Alignment:
Q  195 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19757820 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19757721  T
Q  294 tcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||| |||||||||  |   ||||  ||||||| | ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19757720 tcacctccaaggtaggac--tactttgccttttgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttc 19757655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 13 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 30345457 - 30345179
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| |||||||| |||    || |||||| ||||||||||||| ||||||||||  || ||||| |||  ||||| |   ||| | ||    
T  30345457 acatcctcatctccgctatacttaattt----tcatgttggttcttaaccgcccatcactccgtacaatataacatcgtcaatctgattttcgtctggta 30345362  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || ||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| || ||||| || |    
T  30345361 gaattttcctttcaatttaagcggtactttcttatcgcataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatactatgatttatatat 30345262  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    | || ||||||||  || ||||||| |||| |||    ||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| || | |||||||||    
T  30345261 gtttttatttctctttctttttgtactatgaacc----atatttaaaccttgtagcttggggtatgatatgagcttccactttcacc 30345179  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 167 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 48221564 - 48221432
Alignment:
Q  167 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 266  Q
    |||||| ||||||||||| |||| |||||| |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||  |||||    
T  48221564 tcttcttcatttcaaccatccagtttgaattcgatgatttacatatgcttctacttctctgtcattttgtactatgaatccaagatatttaaaatgtgta 48221465  T
Q  267 acttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||    
T  48221464 acttgtggtatgatatgatcttcaactttcacc 48221432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 195 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 19736914 - 19736753
Alignment:
Q  195 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactt 293  Q
    ||||||| |||||||||||||  ||||||||  | |||||||| ||||||    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19736914 atacgatgatttacatctgctcttatttctctgttattttgtactatgga----agatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 19736819  T
Q  294 tcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||| |||||||||  | || ||   ||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  19736818 tcacctccaaggtaggactactct--gccttttgctgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 19736753  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 237 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9258589 - 9258470
Alignment:
Q  237 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagtt 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||  |||||| | |    |||||   |||||||||||||||||||||    
T  9258589 attatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatatctaatgttcacctcta----agacc--tacttctccttttgttgaagtt 9258496  T
Q  336 acatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||    
T  9258495 acattccatatactccgtcttgcttc 9258470  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 34 - 216
Target Start/End: Complemental strand, 3186682 - 3186500
Alignment:
Q  34 ttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaag 133  Q
    |||||| | |||||||||| ||||||| |||||| ||||   || | |||||||| || |||  ||||| ||||||||| ||| || |||||| ||||||    
T  3186682 ttacttgattctcgtgttgactcttaatcgcccaacactatatatcatacaacatcgttggtgggactgttgtccgatataactttcctttcaacttaag 3186583  T
Q  134 tggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgctt 216  Q
    || |  ||||||||| |  ||||||| ||| | | |||| ||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  3186582 tgatactttcttatcacctaaaacacatgaaaatattcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatgttttacatctgctt 3186500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 176 - 298
Target Start/End: Original strand, 30724311 - 30724434
Alignment:
Q  176 tttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggt 274  Q
    |||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| |  |||||||||||  | |||||||| |||| | ||||||||| ||||| |||||||||   ||    
T  30724311 tttctaccacccaacttgaattcgataatttacatatcattctatttctcacttattttgtaatatgtatccaagatatctaaactgtgtaacttatagt 30724410  T
Q  275 atgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  30724411 atgatatgatctccaacgttcacc 30724434  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Original strand, 43695113 - 43695226
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||||||||   ||| |||| |||| ||||||||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||    
T  43695113 acatcctcatctctgttacacttacttgattctcgtgttaattctcaaccacccaacactccgtaccatacaacatcgccggtctaactgctgtccgata 43695212  T
Q  113 aaacctttctttca 126  Q
     ||| |||||||||    
T  43695213 gaacttttctttca 43695226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 174 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 44395200 - 44395080
Alignment:
Q  174 catttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-g 272  Q
    ||||||||||||  | ||||||| ||||  |||||||||   ||||||||||  |  ||| ||| ||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |    
T  44395200 catttcaaccacttaacttgaattcgatggtttacatct---tctatttctctgttgtttagtactatggacccgagatatttaaatcgtgtaacttgcg 44395104  T
Q  273 gtatgatatgatctccaactttca 296  Q
     | || ||||||||||||||||||    
T  44395103 ttgtggtatgatctccaactttca 44395080  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 231 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 46145869 - 46145805
Alignment:
Q  231 ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaacttt 294  Q
    ||||||| ||||||| ||| ||||||||||||| ||||||| ||||||| || ||||||||||||    
T  46145869 ttttgtactatggactcaaaatatttaaaccgtataacttgtggtatgacataatctccaacttt 46145805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 48 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 54278919 - 54278855
Alignment:
Q  48 tgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||  |  ||||||||||||||||||||    
T  54278919 tgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaacaacgctggtctgactgctgtccgata 54278855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 190 - 296
Target Start/End: Original strand, 32490249 - 32490356
Alignment:
Q  190 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctcc 288  Q
    ||||||| ||||| |||| ||||  |||||||| | | || | || || ||| ||||||||| |||||||  |||||||||| ||||||||||||||| |    
T  32490249 cttgaattcgatagtttatatctagttctattttttcgtcgtcttataatatagacccaagaaatttaaattgtgtaacttgtggtatgatatgatcttc 32490348  T
Q  289 aactttca 296  Q
    ||||||||    
T  32490349 aactttca 32490356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 167 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 15751018 - 15750888
Alignment:
Q  167 tcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 266  Q
    |||||| ||||||||||||| | | ||| || |||  ||||||| |||||| || ||||| || ||||| |||||| |||||| || |||||| | ||||    
T  15751018 tcttcttcatttcaaccacctaacatgagtatgatgttttacatatgcttcgatgtctccttcgttttgcattatgaacccaaaatgtttaaatcatgta 15750919  T
Q  267 acttg-ggtatgatatgatctccaactttca 296  Q
    | ||| | | | |||||||||||||||||||    
T  15750918 atttgagatgtcatatgatctccaactttca 15750888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 87
Target Start/End: Original strand, 33272376 - 33272450
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaaca 87  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||    
T  33272376 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaactgcccaacactccgtaccatacaaca 33272450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 44 - 186
Target Start/End: Original strand, 40674492 - 40674634
Alignment:
Q  44 ctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttc 143  Q
    |||||||||  ||||| | | ||| ||||||||||  ||||||||||| | |||| ||| | | ||||| ||  || |||||| |||||||| |  ||||    
T  40674492 ctcgtgttgattcttatcagtccaacactccgtactatacaacattgttgatctgcctgatattcgatagaattttcctttcaacttaagtgatactttc 40674591  T
Q  144 ttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 186  Q
    ||||| || |||||| || ||||||||| ||| ||||||||||    
T  40674592 ttatcacataaaacatctcagactcttccccacttcaaccacc 40674634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 251 - 298
Target Start/End: Original strand, 1470683 - 1470731
Alignment:
Q  251 atatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||    
T  1470683 atatttaaaccatgcaacttttggtatgatatgatctccaactttcacc 1470731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 35)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 38606939 - 38606593
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    |||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  38606939 acattatcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgata 38606840  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  38606839 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggtttacatct 38606740  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  38606739 gcttctatttcttcgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgatatgatctccaactttcacc-tcaaggtagacc 38606641  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      ||||||||||||||   || |||||| |||||||| ||||||||||||    
T  38606640 --cacttctccttttgcaaaaattacattccatatactccgtcttgcttc 38606593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 32630529 - 32630194
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  32630529 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggttcttaaccgcccagcactccgtaccatacaacattgtcggtctgattgatgtccgata 32630430  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || ||||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |             
T  32630429 gaactttcctttcagcttaagtgatactttcttatcgcacaaaacactcgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga--------- 32630339  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
       | || ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32630338 ---tgtaattctccatcattttgtaatatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 32630242  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32630241 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 32630194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Original strand, 46356229 - 46356546
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| || |||||||||| |||||||||| ||| || |||||| ||||||| ||  |||    
T  46356229 tctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaatgccggtctgactactgtccgatagaactttcctttcaacttaagtagtacttt 46356328  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  46356329 cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaag 46356428  T
Q  243 gacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||| |    
T  46356429 gacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattc 46356526  T
Q  342 catataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  46356527 catatactccgtcttgcttc 46356546  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36651928 - 36651581
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| |||| |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| || ||||||||||||    
T  36651928 acatcctcatctctgttacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggattgctgtccgata 36651829  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  36651828 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 36651729  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36651728 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgcgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 36651629  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       |||||| |||  | ||||||| ||| |||||||| ||||||||||||    
T  36651628 --tacttcttcttccgctgaagttccattccatatactccgtcttgcttc 36651581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 33350154 - 33350501
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  33350154 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 33350253  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || || ||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  33350254 gaactttcctgtcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 33350353  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  33350354 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaagaccctagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 33350453  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       |||||| |||  | ||||||||||| ||||||||  |||||||||||    
T  33350454 --tacttcttcttccgctgaagttacattccatatacttcgtcttgcttc 33350501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31005157 - 31004811
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||| | ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  31005157 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 31005058  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  31005057 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatct 31004958  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  31004957 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggagccaagatatttaaa-cgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 31004859  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | |||||| |||| |||||||| | ||||||||||    
T  31004858 --tacttctccttccgctgaagtaacattccatatactctgtcttgcttc 31004811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 73 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 37616790 - 37616503
Alignment:
Q  73 ccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttct 172  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  37616790 ccgtaccatacaacaatgtcggtctgactgctggccgatataactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttct 37616691  T
Q  173 ccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-g 271  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  37616690 ccatttcaaccacccagcttgaatacaatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaatcgtgtaacttgg 37616591  T
Q  272 ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||   |||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  37616590 ggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 37616503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11593894 - 11593552
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  | |||||  |||| |||||||||    
T  11593894 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgttgtccgata 11593795  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  11593794 gaactttcctttcaacttaagtggtacttttttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 11593695  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||    
T  11593694 gcttctatttctccatcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtctaacttggggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc 11593595  T
Q  312 cacacttctccttt-tgttgaagttacatgccatataccccgtct 355  Q
       |||||||||||  | |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  11593594 --tacttctcctttccgctgaagttacatttcatatactccgtct 11593552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 39906729 - 39907074
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||| |||| | ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| |    
T  39906729 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaatcgcctaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactt 39906828  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccattt----caaccacccagcttgaatacgataatttacatctgc 214  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    |||||||||||||||||||||||   || ||||| |    
T  39906829 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacatctgaggctcttctccatttcaaccaaccacccagcttgaatacgatggcttgcatctac 39906928  T
Q  215 ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagaccca 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||  |  |||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||      
T  39906929 ttctatttctccgtcattttgtacgaatgacccaagatatttaaaccgtgtaacatgggatatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc-- 39907026  T
Q  314 cacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
     ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  39907027 tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 39907074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 13 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 43281610 - 43281389
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||| ||| || |||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  43281610 acatcctcatccccgctacacttactttactcttgcgttggctcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtccgata 43281511  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43281510 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 43281411  T
Q  213 gcttctatttctccatcatttt 234  Q
    |||||||||||||| |||||||    
T  43281410 gcttctatttctccgtcatttt 43281389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 36869637 - 36869984
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | || ||||||| ||||||  ||| || || |||||||| |||||||| | ||| ||||||| |||||||||    
T  36869637 acatcctcatctctgctacacttacttgattcacgtgttgactcttagtcgctcaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgttgtccgata 36869736  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  36869737 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacccctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 36869836  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||| ||||||| | |||||||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||      
T  36869837 gcttttatttcttcgtcattttgtactatggatccaagatatttaaaccgcgtaatttggggtatgatatgctctccaactttcacctccagggtaga-- 36869934  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    || ||||  ||||||  ||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  36869935 catactttcccttttcctgaagttacattccatatactatgtcttgcttc 36869984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 130; E-Value: 3e-67
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 49029210 - 49028854
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||    ||||  |||||||||||||||    
T  49029210 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacaccggttggactgctgtccgata 49029111  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--------------cccagcttgaatac 198  Q
     ||| || ||||||     |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||              ||||||||||||||    
T  49029110 gaactttcctttca-----agtggtattttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaaccacaaccaaccacccagcttgaatac 49029016  T
Q  199 gataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    |||    ||||||||||||||||||||||||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  49029015 gatggcatacatctgcttctatttctccatcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatctgatctccaactttcac 49028916  T
Q  298 cgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    | ||||||||||||   ||||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  49028915 ctccaaggtagacc--tacttctccttcccctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 49028854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 128; E-Value: 4e-66
Query Start/End: Original strand, 104 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 48919231 - 48918975
Alignment:
Q  104 tgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataa 203  Q
    ||||||||| |||||| |||||| |||||| |||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |    
T  48919231 tgtccgatataaccttcctttcaacttaaggggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaactacccagcttgaatacgatga 48919132  T
Q  204 tttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgcca 302  Q
    || |||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||| ||||| |||  ||    
T  48919131 ttcacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggatccaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtgtaatatgatctcctacttttaccttca 48919032  T
Q  303 aggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    | |||||||   |||||||| |||| |||||| |||| |||||||| ||||||||||||    
T  48919031 atgtagacc--tacttctccatttgctgaagtcacattccatatactccgtcttgcttc 48918975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 35906549 - 35906796
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  35906549 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 35906648  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  35906649 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaagatcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 35906748  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 260  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||    
T  35906749 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaac 35906796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 32 - 197
Target Start/End: Complemental strand, 34869335 - 34869170
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  34869335 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctttcaactta 34869236  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaata 197  Q
    ||||||  |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34869235 agtggtactttcttatcgcacaaaacgcctgaggctcttctccaattcaaccacccagcttgaata 34869170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 13 - 235
Target Start/End: Complemental strand, 33072888 - 33072666
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||||||||||| | || ||||| || | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  | |||||| |||| |||||||||    
T  33072888 acatcatcatctctgctacacttatttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacaacgccggtctaactgttgtccgata 33072789  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||| | ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  33072788 gaactttccttttaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatct 33072689  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttg 235  Q
    ||||||| || ||| ||||||||    
T  33072688 gcttctaattatccgtcattttg 33072666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 207
Target Start/End: Complemental strand, 7272973 - 7272780
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||| | ||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  7272973 acatcctcatctccggtacacttacttgattctcgtgttggctctcaaccgcccaacactctgtatcatacaacattgtcggtttgactgctgaccgata 7272874  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataattta 207  Q
     ||| || || ||| ||||||||||  ||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  7272873 caactttcctctcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaatacctgaggct-ttctcaatctcaaccacccagcttgaatacgatgattta 7272780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 184 - 357
Target Start/End: Original strand, 24177714 - 24177886
Alignment:
Q  184 acccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatg 282  Q
    ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||  |||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  24177714 acccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactattgacccgtgatatttaaaccgtgtaaattggggtatgatatg 24177813  T
Q  283 atctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttg 357  Q
    ||||||||| |||| |  |||| ||||||   |||||| |||||| ||||||||||| |||||||| || |||||    
T  24177814 atctccaaccttcatctacaagctagacc--tacttcttcttttgctgaagttacattccatatactccatcttg 24177886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 32 - 184
Target Start/End: Complemental strand, 23404333 - 23404181
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||  ||| |||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| ||  || |||||| ||||    
T  23404333 acttacttgattctcgtgctggcttttaaccgcccaaaacttcgtaccatacaatatcgtcggtctgactgttgtccgatagaattttcctttcaactta 23404234  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca 184  Q
    ||||||  ||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||| |||||    
T  23404233 agtggtcctttcttatctcagaaaacacctgaggctcttctccattttaacca 23404181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 13 - 163
Target Start/End: Original strand, 12841623 - 12841773
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||| |||||    
T  12841623 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcagactgctgtacgata 12841722  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 163  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  12841723 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 12841773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 154 - 298
Target Start/End: Original strand, 24550178 - 24550318
Alignment:
Q  154 aaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagata 253  Q
    |||||| |||||| || |||||||||||||||||| ||||||| | | ||||||||||| ||||||||  ||| || ||||||| |||||||  ||||||    
T  24550178 aaacacgtgagaccctcctccatttcaaccacccaacttgaattcaacaatttacatctccttctattaatccgtcgttttgtaatatggactaaagata 24550277  T
Q  254 tttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||| |||||||||    ||||||||||||| |||||||||||    
T  24550278 tttaaatcgtgtaact----tatgatatgatcttcaactttcacc 24550318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 13 - 210
Target Start/End: Original strand, 7189581 - 7189777
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||  ||| ||||||| | | | ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| |||||||| |||||||||||| |||||  |||    
T  7189581 acatcctcatctccactatgcttacttgatttttgtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtct-ata 7189679  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 210  Q
    |||  | |||||||  ||||||  |  |||||||||  | ||||||||||||||| ||||||||||||||||| || | | ||||| || ||||||||    
T  7189680 aaatttctctttcaatttaagtaatactttcttatcaaataaaacacctgagacttttctccatttcaaccactcaacataaatacaatgatttacat 7189777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 298
Target Start/End: Original strand, 21517826 - 21517958
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 265  Q
    |||||||| |||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| || |  ||||||| | ||| |||||| |||| | ||||||||||||||| ||||    
T  21517826 ctcttctcgatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatatgttattatttcttcgtca-tttgtactatgaatccaagatatttaaactgtgt 21517924  T
Q  266 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    || ||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  21517925 aaattgaggtatcatgtggtctccaactttcacc 21517958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 298
Target Start/End: Original strand, 43793592 - 43793674
Alignment:
Q  217 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| | |||||||||| ||| |||||||||||||||||  |||||||| | |||||||||||||||| ||||||||||    
T  43793592 ctatttcttcgtcattttgtactatagacccaagatatttaaaatgtgtaactagtggtatgatatgatctctaactttcacc 43793674  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 31 - 135
Target Start/End: Original strand, 13859372 - 13859476
Alignment:
Q  31 tacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctt 130  Q
    ||||||||| | |||||||||  |||||||||||||| || ||||||||  |||||| || |||||| |||||||| | ||| ||| || |||||| |||    
T  13859372 tacttacttgattctcgtgttaactcttaaccgcccaacattccgtaccaaacaacactgccggtctaactgctgttcaatagaactttcctttcaactt 13859471  T
Q  131 aagtg 135  Q
    |||||    
T  13859472 aagtg 13859476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 201
Target Start/End: Original strand, 25579439 - 25579612
Alignment:
Q  33 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaa 132  Q
    |||| |||| ||||||||||| ||||||||||||| || ||||| || |||||||| | |||||| || ||||||||||| ||  || | |||| ||| |    
T  25579439 cttattttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacattccgttccatacaacatcgccggtcttacagctgtccgatagaattttcccttcaacttga 25579538  T
Q  133 gtg---gttttttcttatcgcacaaaacacctgag--actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 201  Q
    | |    ||||||| |||| || |||| ||| |||   ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  25579539 gcgtactttttttcgtatcacataaaatacccgaggctctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgat 25579612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18637371 - 18637233
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18637371 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18637275  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18637274 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18637233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18650806 - 18650668
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  |||||    
T  18650806 aaaacacatgaggcactcctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagat 18650710  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    |||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18650709 atttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18650668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 166 - 257
Target Start/End: Original strand, 23087603 - 23087694
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 257  Q
    ||||| ||||||||||||| | | ||||||||| || ||||||||   ||| ||||||||| |||||||||| |||| |||||||| |||||    
T  23087603 ctcttttccatttcaaccatctaacttgaatacaatgatttacatacacttttatttctccttcattttgtactatgaacccaagagattta 23087694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 293
Target Start/End: Original strand, 18608199 - 18608319
Alignment:
Q  171 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt 270  Q
    ||||||||||||  | ||||||| || ||||  |||||||||   |||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||    
T  18608199 ctccatttcaactgctcagcttggattcgatggtttacatct---tctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaactt 18608295  T
Q  271 g-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    | | ||||||||||||||||||||    
T  18608296 gtgatatgatatgatctccaactt 18608319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 285
Target Start/End: Complemental strand, 5843177 - 5843105
Alignment:
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatc 285  Q
    |||| |||||| |||| |||||||||||  ||| || ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  5843177 cttcgatttcttcatcgttttgtattataaacctaaaatatttaaatcgtgtaacttgtggtatgatatgatc 5843105  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 32 - 88
Target Start/End: Complemental strand, 15681272 - 15681216
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 88  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| ||||||||    
T  15681272 acttacttgagtctcgtgttggctcttaaccgcccaacactctataccatacaacat 15681216  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 214 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 18626639 - 18626559
Alignment:
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    |||||||||| || |||||||||| |||  ||  ||||||||||||  |||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  18626639 cttctatttccccgtcattttgtactatcaacttaagatatttaaaatgtgtaacttgtgatatgatatgatctccaactt 18626559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 141 - 212
Target Start/End: Complemental strand, 33139077 - 33139006
Alignment:
Q  141 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
    |||||| ||||||| |||| | |  |||||||||||||||| |||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  33139077 ttcttagcgcacaatacacattaagctcttctccatttcaatcacccaacatgaatacgatgatttacatct 33139006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 65
Target Start/End: Original strand, 21517674 - 21517726
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcc 65  Q
    |||||||||| ||| |||| |||| |||| ||||||||||| |||||||||||    
T  21517674 acatcatcatatccattatgcttattttattctcgtgttggttcttaaccgcc 21517726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 39)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 42854352 - 42854708
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42854352 acatcgtcatctccgctacactaactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 42854451  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  42854452 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 42854551  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||||||||| | |||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42854552 gcttctatttctcaaacattttgtacgatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccacctttcacctccaaggtagacc 42854651  T
Q  312 cac----actt---ctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||     |||   ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  42854652 cacttctccttttgctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 42854708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 182; E-Value: 2e-98
Query Start/End: Original strand, 14 - 361
Target Start/End: Original strand, 36565590 - 36565936
Alignment:
Q  14 catcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 113  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||     
T  36565590 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgatag 36565689  T
Q  114 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctg 213  Q
    ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||    
T  36565690 aactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctg 36565789  T
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagaccc 312  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||     
T  36565790 cttctatttctccgtcattttgtacaaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc- 36565888  T
Q  313 acacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      ||||||||||  |||||||||||||  ||||||| |  |||||||||    
T  36565889 -tacttctccttccgttgaagttacatttcatatactctatcttgcttc 36565936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 181; E-Value: 1e-97
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 15215619 - 15215965
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  15215619 acatcctcatctccgcttcacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattttcggtctgactactgttcgata 15215718  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || ||||||||||||||| |  ||||||| ||||||| ||||  ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  15215719 gaactttcctttcagcttaagtgatactttcttaccgcacaagacactggaggctcttctccatttcaaccacctagcttgaatacgatgatttacatct 15215818  T
Q  213 gc-ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac-ttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagac 310  Q
    || ||||||||||   ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||    
T  15215819 gctttctatttct--gtcactttgtactatggacccaatatatttaaaccgtgtaactttgggtatgatatgatctccaactttcacctccatggtagac 15215916  T
Q  311 ccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |  |||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  15215917 c--cacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttc 15215965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 43 - 361
Target Start/End: Original strand, 12492220 - 12492537
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | |||||  | ||||| ||| ||||||||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||    
T  12492220 tctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatgcaacaacgccggtcggacggctgtccgatagaactttcctttcatcttaagtggtacttt 12492319  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatg 242  Q
    ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| | |||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  12492320 cttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccaacctgaatacgatagcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaag 12492419  T
Q  243 gacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgc 341  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||||  | ||||||||||| |    
T  12492420 gacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttatccttccgctgaagttacattc 12492517  T
Q  342 catataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  12492518 catatactccgtcttgcttc 12492537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 88 - 357
Target Start/End: Original strand, 4032917 - 4033185
Alignment:
Q  88 ttgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccc 187  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4032917 ttgtcggtctgactgttgtccgataaaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccc 4033016  T
Q  188 agcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatct 286  Q
    | |||||||| ||| |||||||| ||||| ||||||||||||||| |||| |||| |||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4033017 aacttgaatatgatgatttacatatgcttttatttctccatcattgtgtactatgaacccaagatacttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatct 4033116  T
Q  287 ccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttg 357  Q
    |||||||||| | ||||||||||||    || ||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  4033117 ccaactttcatctccaaggtagacc--ttctactccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttg 4033185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 36545081 - 36544739
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||| ||||| |||||||  |  |||     |||| |||||||    
T  36545081 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactcggtaccatacaacaacgctggt-----tgctatccgata 36544987  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| ||  ||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||    
T  36544986 gaactttcttttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttatccatttcaaccacccaacttgaatacgatgacttacatct 36544887  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  |  | |||| |||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  36544886 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaagccccatgatatttaaaccttgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 36544787  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | | ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  36544786 --tacttctccttccgctaaagttacattccatatactctgtcttgcttc 36544739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 19 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 18125103 - 18124830
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||||| || |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18125103 tcatctccgctacacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgttggtctgactgttgtccgatagaactt 18125004  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    | |||||| || |||||||  ||||||||| || ||||||||||||  | ||||||||||||||||  |||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  18125003 tcctttcaact-aagtggtactttcttatcacataaaacacctgaggtttttctccatttcaaccattcagcttgaattcgatgagttacatctgcttct 18124905  T
Q  219 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaacttt 294  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||| | |||||| || |||| ||||||||| ||||||    
T  18124904 atttctccatcattttgtattatgga--caaaatatttaaaccatataacttaggatatggtatgatctcaaacttt 18124830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 81 - 361
Target Start/End: Original strand, 8879850 - 8880129
Alignment:
Q  81 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 180  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  ||||||| ||||||    
T  8879850 tacaacatagtaggtctgactgctgtccgatagaacttttctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggttcttctctatttca 8879949  T
Q  181 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgat 279  Q
    |||| ||| | ||||||||||  | | |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  8879950 accatccaacatgaatacgatgctattcatctggttctatttctccttcattttgtactatgagcccaagatatttaaaccgtgtaacttgggatatgat 8880049  T
Q  280 atgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||| | |||||||||||  || ||| ||||   ||||||||||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||||    
T  8880050 atgattttcaactttcaccttcacggtcgacc--tacttctccttttgctgaagttacatttcatgtactccgtcttgcttc 8880129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 13 - 222
Target Start/End: Complemental strand, 37077699 - 37077490
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||||||||  | |||||||| | ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||| |||| || |    
T  37077699 acatcctcatctccgccacacttacttgattctcgtgttggctcttaactgcccaacactccgtaccatacagcatcgacggtctgactgttgtctgaca 37077600  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| |  |||||| ||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||     
T  37077599 taacttccctttcaacttaagtggtacttacttatcacacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacttagcttgaatacgatgatttacatcg 37077500  T
Q  213 gcttctattt 222  Q
    ||||||||||    
T  37077499 gcttctattt 37077490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 39946791 - 39946603
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||||||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| |||||||||||||||||    
T  39946791 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcgtgttgactcttaaccgcccaacattccgtaccatacaacatcgccggcctgactgctgtccgata 39946692  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 201  Q
     ||| || ||||||  |||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  39946691 gaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccatccagcttgaatacgat 39946603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25300141 - 25299950
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||    
T  25300141 tctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaattggtacttt 25300042  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  25300041 cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccatcatttt 25299950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 43 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25288806 - 25288613
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtttttt 142  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | |||||||| | |||||  |||| |||  |||| ||| || |||||| ||||| ||||  |||    
T  25288806 tctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtagcatacaacatcgccggtcgaactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaattggtacttt 25288707  T
Q  143 cttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 234  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||||||| || |||||||    
T  25288706 cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttctatttccccgtcatttt 25288613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 19 - 136
Target Start/End: Original strand, 18752227 - 18752344
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  18752227 tcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgtccagcactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactt 18752326  T
Q  119 ttctttcagcttaagtgg 136  Q
    | |||| |||||||||||    
T  18752327 tcctttgagcttaagtgg 18752344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 139 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 13984842 - 13984672
Alignment:
Q  139 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 238  Q
    |||||||||| || ||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||||||| |||||||   ||||||| ||     
T  13984842 ttttcttatcacataaaacacttgaggctcttcttcatttcaaccatccaacttaaatacgatgatttacatctgcttttatttctttgtcatttt-tac 13984744  T
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| |  ||||||||  |||||||||    
T  13984743 tatggacccaagatatttaaaccgtgtatcttggggtatgatatgatcttcttctttcaccttcaaggtaga 13984672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 92 - 234
Target Start/End: Complemental strand, 25439391 - 25439249
Alignment:
Q  92 cggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagct 191  Q
    ||||||||||| |||  |||| ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||    
T  25439391 cggtctgactgttgtgtgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccatcctgct 25439292  T
Q  192 tgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcatttt 234  Q
    || ||||||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||    
T  25439291 tgcatacgatgatttacatatgcttctatttctccgtcatttt 25439249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Original strand, 28300596 - 28300739
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||| | ||| |||||||||| || ||||| ||| |||||||||||| || ||||||||||| ||| ||||  ||||||||||  ||| |||||||||    
T  28300596 aaaacatccgagtctcttctccaatttaaccatccaacttgaatacgatgatgtacatctgcttttatatctcagtcattttgtaccatgaacccaagat 28300695  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| |||||||||  ||||||||||||||||| ||||||||    
T  28300696 atttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccagctttcacc 28300739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 161 - 297
Target Start/End: Original strand, 19293776 - 19293913
Alignment:
Q  161 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 260  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| | ||||||  | |||||||| | |||||| |||||||||||||    
T  19293776 tgagactattctccatttcaaccacccaacttaaatacgattatttacatctgcttttttttctctgtgattttgtactctggaccaaagatatttaaac 19293875  T
Q  261 cgtgtaa-cttgggtatgatatgatctccaactttcac 297  Q
    ||||||| || |||| ||||| | ||| ||||||||||    
T  19293876 cgtgtaatctggggtttgatacgttcttcaactttcac 19293913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Original strand, 30113671 - 30113827
Alignment:
Q  140 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttc-tatttctccatcattttgtat 238  Q
    ||||||||| || |||||||||| |||||||||||||||||||||   ||||||||||| || ||||||||||||||| | ||||||| ||||||| |||    
T  30113671 tttcttatcacataaaacacctgcgactcttctccatttcaaccatttagcttgaatacaatgatttacatctgcttcttttttctccgtcattttatat 30113770  T
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaacttt 294  Q
    ||  ||  |||||||||| |||  | ||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  30113771 tacagattcaagatatttgaactatataatttggagtatgatatgatctccaacttt 30113827  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Original strand, 36395320 - 36395443
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||||||||| ||| || |||||| ||||    
T  36395320 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgatagaactttcctttcaactta 36395419  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaa 155  Q
    ||||||  ||||||||||||||||    
T  36395420 agtggtactttcttatcgcacaaa 36395443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 145 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35601799 - 35601686
Alignment:
Q  145 tatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 244  Q
    |||| |||||||||| ||||| ||||||||||||| | ||||||  |||||| ||||||||||||||| | ||||||||||  |||||||||||||||||    
T  35601799 tatcacacaaaacacttgagagtcttctccatttctatcacccaa-ttgaattcgataatttacatctacgtctatttctctgtcattttgtattatgga 35601701  T
Q  245 cccaagatatttaaa 259  Q
     ||||||||||||||    
T  35601700 tccaagatatttaaa 35601686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 171 - 298
Target Start/End: Original strand, 41444809 - 41444938
Alignment:
Q  171 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta-tggacccaagatatttaaaccgtgtaact 269  Q
    ||||||||||||||||  ||||| || | || |||||||  ||||||||||||| ||||||||||||| | || ||||||||||||||||||  ||||||    
T  41444809 ctccatttcaaccaccttgcttgtattcaatgatttacacttgcttctatttctacatcattttgtatcattgaacccaagatatttaaaccaagtaact 41444908  T
Q  270 tg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||    
T  41444909 tgtggtatgatatgatctccacctttcacc 41444938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 296
Target Start/End: Original strand, 33830721 - 33830862
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||||||||||  ||||| ||||| ||| |||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||| | ||||||||||  |||||||||| ||    
T  33830721 aaaacacttgagactcttcaacattttaaccatccaacttgaacacgatgatttacatatgcttttatttcttcgtcattttgtacaatggacccaaaat 33830820  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttca 296  Q
    |||||||| |||||||||   ||||||| ||| |||||||||||    
T  33830821 atttaaactgtgtaactt--atatgataagatatccaactttca 33830862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 165 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 29735592 - 29735454
Alignment:
Q  165 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 264  Q
    |||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||| |||||||| | |||||||        |||||| |||     
T  29735592 actcatctccatttcaaccacccaacttgaataagatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgaactatggac-------gtttaaatcgta 29735500  T
Q  265 taactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||||    
T  29735499 taacttggggtatgatatgatctcccactttcacctccatggtaga 29735454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 38667351 - 38667207
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| | || |||| ||| |||||||||| ||| ||| |||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||| ||||||| |||| |||||||||    
T  38667351 aaaacacattaggctctactctatttcaaccatccaactttaatacgatgatttacatcttcttttatttctctatcgttttgtactatgaacccaagat 38667252  T
Q  253 attt-aaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||||||||||||||||| |||||||    
T  38667251 atttaaaactttgtaactt--gtatgatatgatctccaagtttcacc 38667207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25985334 - 25985190
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||| | || |||||||||||| |||||  ||| || | ||  ||||||||| |||||||||||||||  ||||||| ||| || |||| ||    
T  25985334 aaaacacttgaggcactcctccatttcaactacccattttggattcaatggtttacatctccttctatttctccatatttttgtactatagatccaatat 25985235  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||    
T  25985234 atttaaaccgtgtaacttgtggtatgatatga--tccaactttcacc 25985190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 32 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 2796470 - 2796326
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||||||||| ||||||||| ||||  |||| ||||| || ||||  |||||||| |||| ||||| ||| ||| || |||||| ||||    
T  2796470 acttacttgattctcgtgttgactcttaaccacccaagactcggtaccatataacaacgtcggtctaactgttgtccaatataactttcctttcaactta 2796371  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccat 176  Q
    ||||||  |||||||||||||| ||||||  || |||||||||||    
T  2796370 agtggtactttcttatcgcacagaacaccgaaggctcttctccat 2796326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 140 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 13589247 - 13589088
Alignment:
Q  140 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 239  Q
    |||||||| ||| ||||||| | || ||||||||||||||||||| ||| |||||||| | | |||| ||| ||||||||||||| ||||||||| || |    
T  13589247 tttcttatagcataaaacacatcaggctcttctccatttcaaccatccaccttgaatatggtgattttcatatgcttctatttcttcatcattttatact 13589148  T
Q  240 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |  ||||||| || |||  | | ||||||||||| | ||||||||||||  |||||||||    
T  13589147 aacgacccaatatttttgtatcatgtaacttgggatttgatatgatctctcactttcacc 13589088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 162 - 290
Target Start/End: Original strand, 18849624 - 18849741
Alignment:
Q  162 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaacc 261  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||     ||| |||||||| ||||||||||||||| ||| ||| || ||       ||||||||||||||    
T  18849624 gagactcttatccatttcaaccacccagcttg-----gatgatttacatttgcttctatttctccgtcactttatacta-------aagatatttaaacc 18849711  T
Q  262 gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaa 290  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18849712 gtgtaacttggggtatgatatgatctccaa 18849741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 90 - 273
Target Start/End: Original strand, 6510841 - 6511026
Alignment:
Q  90 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgca-caaaacacctgagactcttctccatttcaaccaccca 188  Q
    ||||||||||||  |||| | || ||| || |||||| ||||||  ||  ||||||||| || |||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6510841 gtcggtctgactaatgtctgttagaactttcctttcaacttaagcagtactttcttatcacatcaaaccacatgagactcttctccatttcaaccactca 6510940  T
Q  189 gcttgaatacgataattta-catctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg 273  Q
     ||||||| | || |||||  | ||||||| |||||||| ||| ||| || || ||| |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  6510941 acttgaatgcaatgatttatgacctgcttccatttctccttcactttatactacggatccaagatatttataccatgtaacttggg 6511026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 294
Target Start/End: Original strand, 45332039 - 45332117
Alignment:
Q  217 ctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaacttt 294  Q
    ||||||||||| | ||||||| |||| | ||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||    
T  45332039 ctatttctccaccgttttgtactatgaagccaggatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgacatgatctccaacttt 45332117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 123 - 186
Target Start/End: Original strand, 10824546 - 10824609
Alignment:
Q  123 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 186  Q
    |||| ||||| |||| ||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10824546 ttcaacttaactggtattttcgtatcacataaaacacctgagactcttctccatttcaaccacc 10824609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 166 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 6986603 - 6986525
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 244  Q
    ||||||| ||||||   ||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  6986603 ctcttcttcatttcggtcactcagattgaattcgataatttacatatgcttcgatttctctatcattttgtattatgga 6986525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 13 - 88
Target Start/End: Original strand, 9905234 - 9905309
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacat 88  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| ||| ||||  ||||| ||||||||    
T  9905234 acatcctcatctccgttatactaactttattctcgtgttggttattaaccgtccaacactatgtaccatacaacat 9905309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 162 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 35601598 - 35601501
Alignment:
Q  162 gagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaa 259  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||| | |||||| ||||||||||||||| | ||| ||||| | || || |||| | | || ||||||||||||||    
T  35601598 gagactattctccatttcaatcacccggattgaattcgataatttacatctacgtctctttcttcgtcgttgtgtactttagatccaagatatttaaa 35601501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 155 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43732396 - 43732355
Alignment:
Q  155 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaat 196  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  43732396 aacacttgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaat 43732355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 298
Target Start/End: Original strand, 43732230 - 43732278
Alignment:
Q  251 atatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  43732230 atatttaaaccgtgttacttgtgctatgatatgatctccaactttcacc 43732278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 166 - 219
Target Start/End: Original strand, 13172147 - 13172200
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttcta 219  Q
    |||||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||| |||| ||||||||    
T  13172147 ctcttctctatttcaaccaccctgcttgaatacaatgattcacatttgcttcta 13172200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 33 - 74
Target Start/End: Original strand, 17491994 - 17492035
Alignment:
Q  33 cttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactcc 74  Q
    ||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  17491994 cttactttattctcgtgttggttcttaaccgcccaacactcc 17492035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 132 - 235
Target Start/End: Original strand, 44681543 - 44681644
Alignment:
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    |||||| ||||| |||| || | ||||| |||  |||||||||||||||| ||| || |||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||| |    
T  44681543 agtggtattttcgtatcacatagaacacttgatgctcttctccatttcaaacactcaacttgaatacgctgatttaca--tacttctttttctccatcgt 44681640  T
Q  232 tttg 235  Q
    ||||    
T  44681641 tttg 44681644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 215; Significance: 1e-118; HSPs: 20)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 9706710 - 9706363
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||| || | |||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  9706710 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccacctaacacttcgtaccatacaacattgccggtctgactgctgttcgata 9706611  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  9706610 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgatgctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacacct 9706511  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||    
T  9706510 gcttctatttctccatcattttgtaccatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtatacc 9706411  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  9706410 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccatcttgcttc 9706363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 5631752 - 5631404
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| |||||| || || |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5631752 acatcctcatcttcgctacacttactttactctcgcgttggctcttaaccgcccaacactccataccatacaacattgtcggtctgactgttgtccgata 5631653  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5631652 gaattttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 5631553  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggaccc-aagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagac 310  Q
    |||||||||||||| |||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||||||    
T  5631552 gcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaaaaatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctctaactttcacctgcaaggtagac 5631453  T
Q  311 ccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  5631452 c--cacttctccttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttc 5631404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 10100205 - 10100552
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  10100205 acatcctcatctccgctacacttacttgactctcgtcttggctcttaacctcccaacactccgtaccatacaacatcgtcggtctgactactgtccgata 10100304  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||     
T  10100305 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatctcacaaaacacatgaggctcttctccattccaaccacccagcttgaatacgatgatttatatca 10100404  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||||||||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  10100405 gcttctatttctccgacattttgtactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 10100504  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||| ||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10100505 --tacttctcattttgctaaagttacattccatatactccgtcttgcttc 10100552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 23 - 361
Target Start/End: Original strand, 5258508 - 5258845
Alignment:
Q  23 ctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttct 122  Q
    ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||  ||||||| ||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||| || ||    
T  5258508 ctccgctacacttactttgctctcgtgttggctcttcgccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgttgtccgatagaactttcct 5258607  T
Q  123 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 222  Q
    |||||||||||||||  ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||    
T  5258608 ttcagcttaagtggtactttctcatcgcaaaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatgtacatcagcttctattt 5258707  T
Q  223 ctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctc 321  Q
    |||| |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||  ||||||||    
T  5258708 ctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacc--cacttctc 5258805  T
Q  322 cttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||| ||||||||||| ||||||||   ||||||||||    
T  5258806 cttttgctgaagttacattccatatactttgtcttgcttc 5258845  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 20427984 - 20428331
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||| || |||||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||  ||||||||| |  || |||||||||||| |||    
T  20427984 acatcctcatctccgctacacttatttgactctcgtgttggctcttaaccacccaacactctgtactatacaacatttttagtttgactgctgtccaata 20428083  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  20428084 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttggatacgatgatttacatct 20428183  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||| ||| || ||||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||    
T  20428184 gcttctatttttccgtcgttttgtactgtggacccaatatatttaaaccgcgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacctcctaggtagacc 20428283  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       | ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20428284 --taattctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 20428331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 608093 - 607905
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  608093 acatcctcatctccgctacacttactttattctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtacaatacaacattgccggtctgactgctgtccgata 607994  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 201  Q
     ||| |||||||||| |||||||||  | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  607993 gaacttttctttcagtttaagtggtcatgtcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 607905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 289
Target Start/End: Complemental strand, 2689590 - 2689313
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||  || | |||||| | ||||| ||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||     
T  2689590 acatcctcatctccactacatttacttaattctcgcgttggctgttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgacggtctgactgctgtccgatt 2689491  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||| ||  ||||||||| ||||||| || |||| | |||||||||||||| || ||||||||| |||||| ||||||||||    
T  2689490 gaactttcctttcaacttaagtagtgctttcttatcacacaaaatacatgaggcacttctccatttcaatcatccagcttgactacgatgatttacatct 2689391  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcca 289  Q
    | |||||||||||| || ||||||| ||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  2689390 gattctatttctccgtcgttttgtactatagacccaaaatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcca 2689313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 33496118 - 33495794
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| | |||| |||||| | ||||||| ||| ||||| ||||| ||||||||||  |||||||||| |||||  ||    
T  33496118 acatcatcatctccgttacacttacttgattctcatgttggtttttaaccgtccaacactctgtaccatacaacattgcaggtctgactgttgtccttta 33496019  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
    ||             ||||||||||  ||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||| | |||||| |    
T  33496018 aa-------------cttaagtggtactttcttatcacacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccatccagcttgaatatgatgagttacatat 33495932  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagaccc 312  Q
    |||||||||||||| | |||||||| ||||||||||||||         |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||     
T  33495931 gcttctatttctccgttattttgtactatggacccaagat---------gtgtaactagggtatgatatgatcttcaactttcacctccaaggtagacc- 33495842  T
Q  313 acacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  33495841 -tacttctccttttgatgaagttacattccatatactctgtcttgcttc 33495794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 13 - 195
Target Start/End: Complemental strand, 14030740 - 14030558
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||    
T  14030740 acatcctcatctctgctacacttactttactctcgtgttgacttttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgctagtttgactgttgtccgata 14030641  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaa 195  Q
     ||| ||  ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  14030640 gaactttcatttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagactattctccatttcaaccacccagtttgaa 14030558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 45 - 224
Target Start/End: Original strand, 6056150 - 6056329
Alignment:
Q  45 tcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttct 144  Q
    ||||||||| |||||||| |||| ||||||||| | || ||||||||||||||||| | ||||||||| ||   | |||||| ||||| || | ||||||    
T  6056150 tcgtgttggttcttaaccacccaacactccgtatcatataacattgtcggtctgaccgttgtccgatagaattatcctttcaacttaaatgatattttct 6056249  T
Q  145 tatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttct 224  Q
    ||||||| ||||||| |||  ||||||| ||||||||||||||| ||||  ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6056250 tatcgcataaaacacttgaagctcttctacatttcaaccacccaacttgcctacgatattttacatatgcttctatttct 6056329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 32 - 203
Target Start/End: Complemental strand, 30679389 - 30679218
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | ||||||||||  ||||||| | ||| || |  | ||| |||||||| ||||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  30679389 acttacttgattctcgtgttgattcttaactgtccaacattatgcaccatacaacatcgtcggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaactta 30679290  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataa 203  Q
     |||||  ||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30679289 tgtggtactttcttatcgctcaaaacacctgagcctcttctctatttcaaccacccaacttgaatacgataa 30679218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 153 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 27790950 - 27790743
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||| |||||||| ||||||||||| || ||| | || ||| ||||| |  ||||||||||| | | |||||||||| |||||| |||||||    
T  27790950 aaaacacttgaggctcttctctatttcaaccactcaactttattatgatgatttagacttgcttctatttatgcgtcattttgtactatggatccaagat 27790851  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatatacccc 351  Q
    ||||||||| ||||| |||| ||||  ||||| |||| || |||||| ||| |||||| |   |||| |||||||||||||||||||  ||||||||||     
T  27790850 atttaaaccatgtaatttggagtattttatgacctcccaccttcacctccatggtagaac--tacttatccttttgttgaagttacactccatataccct 27790753  T
Q  352 gtcttgcttc 361  Q
    ||||||||||    
T  27790752 gtcttgcttc 27790743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 13 - 281
Target Start/End: Complemental strand, 26291712 - 26291444
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    |||||||||||||  ||| |||||||||| |||| |||||| | | ||| ||| | ||||||||||| |||||||||||  || |||  | ||| |||||    
T  26291712 acatcatcatctcaattacacttactttattctcatgttggttttcaac-gcctaacactccgtaccatacaacattgttagtatgatagttgttcgata 26291614  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || ||| || |||||   ||  ||||||||| || |||| || ||||  | |||| ||||||||||| ||| |||||||||| | |||| | | |    
T  26291613 taattttacttccaacttaacatgtgctttcttatcacataaaatacatgaggttattctacatttcaaccatccaacttgaatacgttgatttgcgtat 26291514  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatat 281  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  26291513 gcttctatttctccatcattttctactatggactcaagatatttaaacggtgtaacttagggtatgatat 26291444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 19 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 30031184 - 30031091
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||||||| || ||| |||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||  | ||||||||||||||||||||    
T  30031184 tcatctccgctacactaacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcattggtctgactgctgtccgata 30031091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 44; E-Value: 6e-16
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 3632724 - 3632653
Alignment:
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  3632724 tatggatccaagatatttaaatcgtgtaatttagggtatgatatgatctccaactttcacctcaaaggtaga 3632653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 14 - 210
Target Start/End: Original strand, 2065105 - 2065302
Alignment:
Q  14 catcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 113  Q
    |||| ||||||||| || || ||||| | ||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||| | | || | || | |||||||||     
T  2065105 catcctcatctccgctacacgtacttgattctcgtgttggctcttaaccgtccaacattccgtaccatacaacatcgccagttttacggttgtccgatag 2065204  T
Q  114 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaaca-cctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacat 210  Q
    ||  || |||||| ||||||  ||  |||||||||  | |||||| ||  || ||||| ||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||    
T  2065205 aagtttcctttcaacttaagatgtactttcttatcaaataaaacacccaaagtctcttttccatttcaacaacacatcttgaatacgatgatttacat 2065302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 79
Target Start/End: Original strand, 35043789 - 35043855
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtacc 79  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||    
T  35043789 acatcttcatctccgctacacttacttgactctcatgttggctcttaaccgtccaacactccgtacc 35043855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 13 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 28085310 - 28085197
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||| ||    |||||||||||||||||||||    
T  28085310 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttagccgcccaacactccgtaccatacagcaacaccggtctgactgctgtccgata 28085211  T
Q  113 aaacctttctttca 126  Q
     ||| || ||||||    
T  28085210 gaactttcctttca 28085197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 278 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 30670556 - 30670475
Alignment:
Q  278 atatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| |||   ||||||||||||| | ||| ||||| | |||||| ||||||||||||    
T  30670556 atatgatctccaactttcacctccaaggtatacc--tacttctccttttgctaaagatacattctatatactccgtcttgcttc 30670475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 171 - 268
Target Start/End: Original strand, 6641916 - 6642013
Alignment:
Q  171 ctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 268  Q
    |||||||||||||||||| ||| ||| | ||  ||||||||| ||||||||||||  |||||||||| ||| | || |||||  |||||| |||||||    
T  6641916 ctccatttcaaccacccaactttaattcaatggtttacatctccttctatttctctctcattttgtactatagccctaagatgcttaaactgtgtaac 6642013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 39)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 32083093 - 32083440
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||| ||||    
T  32083093 acatcctcatctccgctacacatactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatacaacattgtcggtctgactgttgtctgata 32083192  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||||||||||||||  |||||||||||| | |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |    
T  32083193 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcatagaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacattt 32083292  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    || ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32083293 gcctctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaattgtgcaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 32083392  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  32083393 --cacttctccttttgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 32083440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 8671835 - 8671507
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||| ||| || | |||||| |||||||  | ||||||||||| |||| |||| ||| || |||||| ||||    
T  8671835 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgtccaacatttcgtaccatacaacaacgccggtctgactgttgtctgatagaactttcctttcaactta 8671736  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| | ||||    
T  8671735 agtggtactttcttatcgcacaaaacacctgagtctcttctccattttaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctgcttctatttcttcgtcat 8671636  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttg 330  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||||||||| || ||    
T  8671635 tttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttctgctg 8671538  T
Q  331 aagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8671537 aagttacattccatatactccgtcttgcttc 8671507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1210679 - 1210332
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||  ||||||||||||||    
T  1210679 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcgaactgctgtccgata 1210580  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1210579 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctcaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 1210480  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  |  |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1210479 gcttttatttctccatcattttgtacgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc 1210380  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1210379 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1210332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 43240729 - 43241076
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||| | |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  43240729 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaacctcccaacactccgtatcatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 43240828  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  43240829 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 43240928  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||  | ||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  43240929 gcttccatttctccgtcattttgtacgaaggatccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagatc 43241028  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  43241029 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 43241076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 51441113 - 51441459
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || ||| |||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||||    
T  51441113 acatcctcatctctgctacactcacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgtccgata 51441212  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||| ||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||| ||||    
T  51441213 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgca-aaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttagatct 51441311  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |  |||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||    
T  51441312 gcttctatttctccgtcattttgtatgaaagacccaagatatttaaactgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcaccttcaaggtagacc 51441411  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  51441412 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 51441459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 163; E-Value: 5e-87
Query Start/End: Original strand, 32 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 51601973 - 51601646
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||| |||||||||| ||| ||  ||||| ||||    
T  51601973 acttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactactgtccgatagaactttcatttcaactta 51601874  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    || |||  |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||| ||||    
T  51601873 aggggtactttcttatcgaacaaaacacctgagactcttctctatttccaccacccagcttgaatacgatggcttacatctgcttctatttctccgtcat 51601774  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttg 330  Q
    ||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  | ||    
T  51601773 tttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgctg 51601676  T
Q  331 aagttacatgccatataccccgtcttgctt 360  Q
    ||||||||| |||||||| |||||||||||    
T  51601675 aagttacattccatatactccgtcttgctt 51601646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 161; E-Value: 8e-86
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Original strand, 49347760 - 49348089
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| |||||||  || |||| ||||||||||||||| |   || |||||| ||||    
T  49347760 acttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacaaggttggtcggactgctgtccgatagatttttcctttcaactta 49347859  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||| ||||    
T  49347860 agtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacacctgcttctatttctccgtcat 49347959  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaacc-gtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgtt 329  Q
    ||||||  | |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||  | |    
T  49347960 tttgtacgaaggacccaagatatttaaaccagtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttccgct 49348057  T
Q  330 gaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||||| | |||||| ||||||||||||    
T  49348058 gaagttacattcgatatactccgtcttgcttc 49348089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 13 - 266
Target Start/End: Original strand, 30202478 - 30202731
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||  ||||||  | ||||| ||||| |||||||||    
T  30202478 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccacacaacaacgccggtcggactgttgtccgata 30202577  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||    
T  30202578 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccggcttgaatacgatggcttacatct 30202677  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgta 266  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||||    
T  30202678 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgta 30202731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 19 - 292
Target Start/End: Complemental strand, 19936450 - 19936175
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||||| ||| |||| || | |||| |||||| ||||||||||||| |||||  |||| || |||||||  ||||| |||||||||||||| ||  |    
T  19936450 tcatctccgctatgcttatttgattctcatgttggttcttaaccgcccaacactctataccctataacattgctggtctaactgctgtccgatataattt 19936351  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    | ||||||  ||||| |||  ||||||||| || ||||||| ||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||    
T  19936350 tcctttcattttaagcggtactttcttatcacataaaacacttgaggttcttatccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatatgcttct 19936251  T
Q  219 atttctccatca-ttttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaact 292  Q
    |||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19936250 atttctccttcatttttgtattatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaact 19936175  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 111; E-Value: 6e-56
Query Start/End: Original strand, 13 - 192
Target Start/End: Complemental strand, 8391706 - 8391525
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttaca--acattgtcggtctgactgctgtccga 110  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||    
T  8391706 acatcttcatctccgctacacttactttactctcgtgttgactcttaaccgcccaacactctgtaccatatacgacattgccggtctgactgctgtccga 8391607  T
Q  111 taaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagctt 192  Q
    |||||| || |||| ||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  8391606 taaaacattcctttaagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagctt 8391525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 307
Target Start/End: Complemental strand, 27445743 - 27445537
Alignment:
Q  102 gctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 201  Q
    |||| |||||| ||| || ||||||  |||||||||  ||||||||| || |||||||  |  |||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  27445743 gctgcccgatagaactttcctttcaatttaagtggtactttcttatcacataaaacactcggaactcttctccatttcaaccaaccaacttgaatacgat 27445644  T
Q  202 aatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgc 300  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||      
T  27445643 gatttacatctgcttctatttctccatcattttgtactatggacccaacataattaaaccgtgtaacttggggtatgataagatctccaactttcacctg 27445544  T
Q  301 caaggta 307  Q
    |||||||    
T  27445543 caaggta 27445537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 45 - 298
Target Start/End: Original strand, 34827482 - 34827736
Alignment:
Q  45 tcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttct 144  Q
    ||||||||| |||||||||  || ||||| ||||| |||||||| || | |||||||| ||||| ||| ||  || ||||||  |||||  ||  |||||    
T  34827482 tcgtgttggttcttaaccgaacaacactctgtaccatacaacatcgttgatctgactgttgtccaatataattttcctttcaatttaagcagtactttct 34827581  T
Q  145 tatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatgga 244  Q
    |||| || ||||||| |||| |||||||||||||||||||  || ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  34827582 tatcacataaaacacatgaggctcttctccatttcaaccattcaacttgaatacaatgatttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatgga 34827681  T
Q  245 cccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||    
T  34827682 cccaagatatttaaaccttgtaacttagggtatgatatgatctcccactttcacc 34827736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 14 - 215
Target Start/End: Complemental strand, 22090027 - 22089826
Alignment:
Q  14 catcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataa 113  Q
    |||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||  ||||||  | ||||| |||||||||||||||     
T  22090027 catcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccacacaacaacgccggtcggactgctgtccgatag 22089928  T
Q  114 aacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctg 213  Q
    ||| || |||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  22089927 aactttcctttcaacttaagtggtattttcttattgcacaaaacatctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatctg 22089828  T
Q  214 ct 215  Q
    ||    
T  22089827 ct 22089826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 101; E-Value: 5e-50
Query Start/End: Original strand, 47 - 309
Target Start/End: Original strand, 37463249 - 37463510
Alignment:
Q  47 gtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttctta 146  Q
    ||||||| |||||||| |||| ||||| ||||| ||||||||||   ||||||||| |||| |||| ||  || |||||| |||||   ||  |||||||    
T  37463249 gtgttggttcttaaccacccaacactctgtaccatacaacattgctagtctgactgttgtctgatagaattttcctttcaacttaatcagtgctttctta 37463348  T
Q  147 tcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacc 246  Q
    ||  ||  ||||||| || ||||||||||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||     
T  37463349 tc--acctaacacctaaggctcttctccatatcaaccacctagcttaaatacaatgatatacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggact 37463446  T
Q  247 caagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37463447 caagatatttaaactgtgtaactcggagtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga 37463510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 13 - 218
Target Start/End: Complemental strand, 9592668 - 9592463
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| |||||  ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||| ||||||||  |||||||||    
T  9592668 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgattcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcagtctgactattgtccgata 9592569  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   |||| |||    
T  9592568 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgagactcttctccatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacctct 9592469  T
Q  213 gcttct 218  Q
    ||||||    
T  9592468 gcttct 9592463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 153
Target Start/End: Complemental strand, 15085868 - 15085728
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||| ||||    
T  15085868 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacattgccggtttgactgctgtctgata 15085769  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcaca 153  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  15085768 gaactttcctttcagcttaagtggtgctttcttatcgcaca 15085728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 87; E-Value: 1e-41
Query Start/End: Original strand, 13 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 696203 - 696069
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  696203 acatcctcatctccgctacacttactttactctcgtgttggctcttaaccacccaacactccgtaccatacaacattgccggtctgactgctgtccgata 696104  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttat 147  Q
     ||| || |||||||||||||||||  ||||||||    
T  696103 gaactttcctttcagcttaagtggtactttcttat 696069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 155 - 309
Target Start/End: Original strand, 32066761 - 32066913
Alignment:
Q  155 aacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatat 254  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||  |||||||||| |||| |||||| ||||    
T  32066761 aacacctgaggctcttctccattttaaccatccaacttgaatacgatgatttacatttgcttttatttctctgtcattttgtactatgaacccaaaatat 32066860  T
Q  255 ttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||| |||||||||  |||||||||||||||||| ||||||| | ||||||||    
T  32066861 ttaaactgtgtaactt--gtatgatatgatctccaattttcacctctaaggtaga 32066913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 140 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 51234421 - 51234267
Alignment:
Q  140 tttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatt 239  Q
    |||| |||| || |||| ||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||  ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| | |    
T  51234421 tttcgtatcacataaaagacctgaggctattctccatttcaaccacccaacttgaatttgatgatttacatctgcttcaatttctccatcattttgcact 51234322  T
Q  240 atggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaacttt 294  Q
    |||||| ||||||||||||||  || ||||||  |||||||||||||||||||||    
T  51234321 atggactcaagatatttaaactatgaaacttgtttatgatatgatctccaacttt 51234267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 158 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 7921716 - 7921575
Alignment:
Q  158 acctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatattta 257  Q
    ||||||||| ||  ||||||||||| ||||| ||||||| ||||  ||||||||| |||||||||||| ||| ||||||| |||||| ||||||||| ||    
T  7921716 acctgagaccctcatccatttcaacaacccaacttgaattcgatggtttacatctccttctatttctcaatcgttttgtactatggatccaagatatata 7921617  T
Q  258 aaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||    
T  7921616 aatcgtgtaacttgtggtaagatatgatctccaactttcacc 7921575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 153 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 28528375 - 28528229
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    |||||||||||| | || ||| ||||||||||||||||| | || ||||  |||||| || |||||||||||||||  |||||||  || ||||||||||    
T  28528375 aaaacacctgaggcactcctcaatttcaaccacccagctcggattcgatggtttacacctccttctatttctccattgttttgtaacatagacccaagat 28528276  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  28528275 atttaaactgtgtaacttgtggtatgctatgatctccaactttcacc 28528229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 35828894 - 35829038
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 265  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| | |||| |||| |||||||| ||||||||||||||| ||  |||||| |||||||||||||| ||||| | | ||    
T  35828894 ctcttttccatttcaaccacacagatcgaattcgatgatttacatatgcttctatttctccgtcgctttgtactatggacccaagatgtttaagcagcgt 35828993  T
Q  266 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||| |||||||||||||||| | |||||||| ||||||||||    
T  35828994 aacttgtggtatgatatgatctctagctttcacctccaaggtaga 35829038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 163 - 296
Target Start/End: Original strand, 52739965 - 52740098
Alignment:
Q  163 agactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccg 262  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| ||||| || ||| | |||||||| ||||||||||||| ||| |||||| ||| |  |||| ||||| ||||||    
T  52739965 agactcttctccatttcaaccatccaacttgagtaagatgacttacatctacttctatttctccgtcactttgtactataggtccaaaatattcaaaccg 52740064  T
Q  263 tgtaacttgggtatgatatgatctccaactttca 296  Q
    || |||||  | ||||||||||||||||||||||    
T  52740065 tgcaacttaagcatgatatgatctccaactttca 52740098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 175 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 6640898 - 6640774
Alignment:
Q  175 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-gg 273  Q
    |||||||||||||| |||| || | ||  |||||| || ||||||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||||||||||||||||||||||| ||    
T  6640898 atttcaaccacccaacttggatccaatggtttacacctccttctatttctccataattttgtactatagactcaagatatttaaaccgtgtaacttgtgg 6640799  T
Q  274 tatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    | | |||||||||| ||||||||||    
T  6640798 tgtaatatgatctctaactttcacc 6640774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 13 - 237
Target Start/End: Original strand, 46226630 - 46226853
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||| | ||||  || || || | |||||| |||||||| |||  | |||| | |||| ||||    
T  46226630 acatcatcatctccgctaaacttacttgattctcgtgttggttgttaattgctcaacatttcgtaccatacaacatcgtcactatgacagttgtctgata 46226729  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  ||||||||| ||||||   |  ||||||| | || ||||||| |||  ||||||||||||||||||| ||| ||||||||| || ||||||||||    
T  46226730 gaatttttctttcaacttaagcactactttcttagcacataaaacacttgatgctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacaat-atttacatct 46226828  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgta 237  Q
    |||| | ||||||||||||||||||    
T  46226829 gcttttgtttctccatcattttgta 46226853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 166 - 309
Target Start/End: Original strand, 12807587 - 12807732
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaa-ccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 264  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||  | ||| |||| ||||||||| |||||||||||| | || |||| || |||||| ||||||||||||||  |||    
T  12807587 ctcttctccatttcaaaccacctagaataaattcgatgatttacatcagcttctatttcttcgtcgttttatactatggatccaagatatttaaattgtg 12807686  T
Q  265 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||||  |||||||| ||||  ||||||||||| | ||||||||    
T  12807687 taacttgtagtatgatacgatcctcaactttcacctctaaggtaga 12807732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 165 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 52421210 - 52421078
Alignment:
Q  165 actcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtg 264  Q
    ||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||| ||| |||| ||||| |||||||   || ||||||| ||  |||||||| |||||||| | ||    
T  52421210 actcttctctatttcaaccacccaacttgaattcgatgattaacatatgcttttatttctatgtc-ttttgtactaaagacccaagctatttaaa-cttg 52421113  T
Q  265 taacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||| || ||||||||||||| ||||||||||    
T  52421112 taacttgtggcatgatatgatctctaactttcacc 52421078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 123 - 260
Target Start/End: Complemental strand, 21275725 - 21275588
Alignment:
Q  123 ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctattt 222  Q
    |||||||||||||||  |||||||||  | ||| ||| ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| || | || |||||||||  ||| ||| |    
T  21275725 ttcagcttaagtggtactttcttatcaaataaagcacatgagactcttctttatttcaaccactcagcttggattcaatgatttacatcaacttttatat 21275626  T
Q  223 ctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 260  Q
    |||  || ||||| | ||| ||||||||||||||||||    
T  21275625 ctctgtcgttttgcactatcgacccaagatatttaaac 21275588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 247 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 40419381 - 40419329
Alignment:
Q  247 caagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  40419381 caagatatttaaactgtgtaacttgtggtatgatatgatctccaactttcacc 40419329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 240 - 308
Target Start/End: Original strand, 46226887 - 46226956
Alignment:
Q  240 atggacccaagatatttaaaccgtgtaact-tgggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtag 308  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||| |||| |||| ||||    
T  46226887 atggacccaagatatttaaaccgtgtaactcaaggtatggtatgatctccaacttgcacctccaaagtag 46226956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 175 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 3877621 - 3877537
Alignment:
Q  175 atttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaa 259  Q
    ||||||| ||||||  ||||||  ||| | ||| || |||||||||||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||||    
T  3877621 atttcaagcacccatattgaatttgatgaattatatttgcttctatttctccatcgttttatattatggacccatgatatttaaa 3877537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 272
Target Start/End: Original strand, 11331568 - 11331666
Alignment:
Q  169 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 268  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11331568 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11331662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 169 - 272
Target Start/End: Original strand, 11489589 - 11489687
Alignment:
Q  169 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 268  Q
    |||||||||| ||||| ||| ||| ||  || |||||||||||||||||||||||||  |||||     ||||||||| || ||||||||| ||||||||    
T  11489589 ttctccatttaaaccatccaacttaaaagcggtaatttacatctgcttctatttctctgtcatt-----ttatggaccaaatatatttaaatcgtgtaac 11489683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 160 - 237
Target Start/End: Original strand, 52640920 - 52640997
Alignment:
Q  160 ctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgta 237  Q
    ||||| ||||||| ||||||||| |  || ||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||  ||||||||||    
T  52640920 ctgaggctcttcttcatttcaacaattcaacttgaatacgataatttacatatgcttttatctctctgtcattttgta 52640997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 215 - 282
Target Start/End: Original strand, 16142399 - 16142467
Alignment:
Q  215 ttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggg-tatgatatg 282  Q
    |||| ||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||||||    
T  16142399 ttctttttcttcgtcattttgtattatgaacccaagatatttaaaatgtgtcacttgggatatgatatg 16142467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 63 - 175
Target Start/End: Complemental strand, 52831942 - 52831830
Alignment:
Q  63 gcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctg 162  Q
    ||||| |||| |||| | ||||||||||||||||| ||||  |||||||| ||  |||||||||  |||| ||    |||||||||||| ||||||| ||    
T  52831942 gcccaacacttcgtatcatacaacattgtcggtctaactgtcgtccgatacaatttttctttcaatttaaatgacactttcttatcgcataaaacacatg 52831843  T
Q  163 agactcttctcca 175  Q
    || ||||||||||    
T  52831842 aggctcttctcca 52831830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 244 - 298
Target Start/End: Original strand, 52641033 - 52641085
Alignment:
Q  244 acccaagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||| |||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||    
T  52641033 acccaatatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttcacc 52641085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 85
Target Start/End: Original strand, 34792726 - 34792768
Alignment:
Q  43 tctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaa 85  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  34792726 tctcgtgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaa 34792768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 248 - 296
Target Start/End: Original strand, 16273415 - 16273461
Alignment:
Q  248 aagatatttaaaccgtgtaacttgggtatgatatgatctccaactttca 296  Q
    ||||||||||||  ||||||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  16273415 aagatatttaaattgtgtaacttg--tatgatatgatctccaactttca 16273461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 205; Significance: 1e-112; HSPs: 27)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 39 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3301757 - 3301436
Alignment:
Q  39 ttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggtt 138  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||| |||||||||||| |||||||| |||||||||| ||| || ||||||  |||||||||     
T  3301757 ttactttcgtgttggctcttaaccgcccaacacttcgtaccatacaacattgtcagtctgactactgtccgatagaactttcctttcaatttaagtggta 3301658  T
Q  139 ttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat 238  Q
     ||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||||| |||     
T  3301657 ctttcttatcgcacaaaacacctgaggctcatctctatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttgcatctgcttctatttctccttcatttggtac 3301558  T
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttac 337  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||||||||    
T  3301557 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaagttac 3301460  T
Q  338 atgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    || |||||||| ||||||||||||    
T  3301459 attccatatactccgtcttgcttc 3301436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 67 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3394593 - 3394298
Alignment:
Q  67 agcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttct---ttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctga 163  Q
    ||||||||||||  |||||||||| ||||||||||||||||||||| ||| || ||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||    
T  3394593 agcactccgtactatacaacattgccggtctgactgctgtccgatagaactttcctcctttcagcttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctga 3394494  T
Q  164 gactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgt 263  Q
    | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  3394493 ggctcatctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatctgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccgt 3394394  T
Q  264 gtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||| |||| |||||| |||||||| | ||||||||||    
T  3394393 gtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--cacttctccttttgctgaa-ttacattccatatactctgtcttgcttc 3394298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 1275199 - 1274852
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | ||| ||||||| | |||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||  | |||||||||||||||||||||    
T  1275199 acatcctcatctctgctatgcttacttgattctcatgttgactcgtaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtctgactgctgtccgata 1275100  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  1275099 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacaccttaggctcttcttcatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 1275000  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  1274999 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcatctccaaggtagacc 1274900  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1274899 --tacttctcctttcgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1274852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 12492735 - 12493082
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  12492735 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaaagccggtcggactgctgtccgata 12492834  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12492835 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 12492934  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| |    
T  12492935 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaacttttacctccaaggtagagc 12493034  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  12493035 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 12493082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 10639231 - 10638884
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||| ||||||||| |||||    
T  10639231 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttcaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggtcggactgctgttcgata 10639132  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  10639131 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctaaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatct 10639032  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||    
T  10639031 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatttccaactttcacctccaaggtagacc 10638932  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||    
T  10638931 --tacttctccttccactgaagttacattccatatactccgtctttcttc 10638884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 19 - 361
Target Start/End: Original strand, 28977211 - 28977552
Alignment:
Q  19 tcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacct 118  Q
    ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  |||| || ||||| ||||||||| ||| |    
T  28977211 tcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcgttcggactgatgtccgatagaactt 28977310  T
Q  119 ttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    | |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||| |||||    
T  28977311 tcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacccgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcttacatctacttct 28977410  T
Q  219 atttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacact 317  Q
    ||| |||| ||||||||||  | |||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||   |||    
T  28977411 attactccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtgacttggggtatgatatgatctccaactttcacctctaaggtagacc--tact 28977508  T
Q  318 tctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||  ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  28977509 tctccttccgttgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 28977552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 20318921 - 20318578
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||| |||||||    
T  20318921 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcgcaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctatccgata 20318822  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||     |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||   ||||||||    
T  20318821 taactttcctttcaacttaagtggta----cttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatatgatggcttacatct 20318726  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  20318725 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaac 20318626  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
       ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20318625 --tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 20318578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 1287937 - 1288284
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | || || ||||||||| |||||    
T  1287937 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccgatcggactgctgttcgata 1288036  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||   ||||||||    
T  1288037 gaactttcctttcaacttaaatggtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctcttctccatttcaaccatccaacttgaatacgatggcttacatct 1288136  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||||||  | |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      
T  1288137 gcttctatttctccgtcattttgtacgaaggactcaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtaga-- 1288234  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |  ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  1288235 cttacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 1288284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 13 - 361
Target Start/End: Original strand, 2075822 - 2076169
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  | ||||| |||||||||||||||    
T  2075822 acatcctcatctctgctacacttacttaattctcatgttgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgccggtcggactgctgtccgata 2075921  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||    
T  2075922 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttattgcacaaaacacctgaggctcttcttcatttcaaccacccaacttgaatacgatggcttacatct 2076021  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||  ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |    
T  2076022 gcttctatttctctgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagaac 2076121  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
        |||||||||  | ||||||||||| |||| ||| | ||||||||||    
T  2076122 --tgcttctccttccgctgaagttacattccatgtactctgtcttgcttc 2076169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 90 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 24178381 - 24178111
Alignment:
Q  90 gtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccag 189  Q
    |||||||||||||||| |||||| ||| || |||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||     
T  24178381 gtcggtctgactgctgcccgatagaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccaa 24178282  T
Q  190 cttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctcc 288  Q
    |||||||| |||   |||||||||||||||||||||| ||||||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24178281 cttgaatatgatggcttacatctgcttctatttctccgtcattttgtacgaaggacccaagatctttaaaccgtgtaacttagggtatgatatgatctcc 24178182  T
Q  289 aactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    |||||||||  ||||||||||||   ||||||||||  | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  24178181 aactttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctgaagttacattccatatactccgtcttgcttc 24178111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 348
Target Start/End: Original strand, 16347879 - 16348084
Alignment:
Q  141 ttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtatta 240  Q
    ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||  |||| ||||||||| |||||||||| ||    
T  16347879 ttcttattgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccaccta-cttgaatacgatgatttacatacgcttttatttctccgtcattttgtacta 16347977  T
Q  241 tggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacat 339  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||| |||||||||||    
T  16347978 tggacacaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacat 16348075  T
Q  340 gccatatac 348  Q
      |||||||    
T  16348076 ttcatatac 16348084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 13 - 201
Target Start/End: Complemental strand, 34272956 - 34272768
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | |||| | ||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||| | ||||||||||||||     
T  34272956 acatcctcatctctgctacacttacttgattctcatattgactcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacaacgtcggccggactgctgtccgatt 34272857  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgat 201  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  34272856 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccattttaaccacccaacttgaatacgat 34272768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 49 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 36200680 - 36200430
Alignment:
Q  49 gttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatc 148  Q
    ||||| ||||||||||| | ||||  ||| | |||||||||| | || |||||| |||||| || ||  || |||||| |||||   |  ||||||||||    
T  36200680 gttggttcttaaccgcctaccactttgtatcatacaacattgccagtttgactgttgtccggtagaattttcctttcaacttaaacagcattttcttatc 36200581  T
Q  149 gcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccca 248  Q
     || ||||||| |||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |||||||| |||| ||||||||   |||||||||| |||| |||||    
T  36200580 acataaaacacatgagtctcttctccatttcaaccacccaacttaaatatgatgatttacatatgctactatttctatgtcattttgtactatgaaccca 36200481  T
Q  249 agatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    | |||||||||| |||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  36200480 aaatatttaaacggtgtaacttgaggtatgatatgacctcccactttcacc 36200430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 166 - 357
Target Start/End: Original strand, 27302451 - 27302638
Alignment:
Q  166 ctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgt 265  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||||||| ||||||||||   |||||||||||  | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27302451 ctcttttccatttcaaccactcaacttgaatacgatgatttacatct---tctatttctccgccgttttgtattatggacacaagatatttaaaccgtgt 27302547  T
Q  266 aacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttg 357  Q
    |  ||| ||||||||||||||||||||  |||||  ||||||||| |   ||||  ||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||    
T  27302548 agtttgaggtatgatatgatctccaacactcaccttcaaggtagaac--tactttaccttttgttgaagttacattccatatactcagtcttg 27302638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 13 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 27828 - 27622
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||| | |||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||| ||| ||||  |||| ||||    
T  27828 acatcctcatctccgttatgcttacttaattctcatgttggttcttaaccgcccaacactccgtaccatacaacatcgtctgtccgactattgtcagata 27729  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||  || |||||| ||||||||||  ||||||||| |  |||||||  |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| ||| |||||||| |    
T  27728 gaattttcctttcaacttaagtggtactttcttatcacgtaaaacactcgagactcttctctatttccaccacccaacttgaatatgatgatttacattt 27629  T
Q  213 gcttcta 219  Q
    | |||||    
T  27628 gattcta 27622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 13 - 164
Target Start/End: Original strand, 16347726 - 16347877
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || |||||||||| || |||||||||    
T  16347726 acatcctcatctccgctacacttacttaactctcgtgttggctcttaaccgctcaacactccgtaccatacaatatcgtcggtctgagtgttgtccgata 16347825  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgag 164  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  |||||||| ||||||| ||| ||||    
T  16347826 gaactttcctttcaacttaagtggtaatttcttattgcacaaatcacatgag 16347877  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 169 - 298
Target Start/End: Original strand, 43558318 - 43558448
Alignment:
Q  169 ttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaac 268  Q
    ||||||||||| || |||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||  |  |||||||  ||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  43558318 ttctccatttccactaccctgcttgaattcgatgatttacatctgcttctatttctctgtggttttgtacaatggacctaagatatttaaatcgtgtaac 43558417  T
Q  269 ttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  43558418 ttgtggtatgctatgatctccaactttcacc 43558448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 55; E-Value: 2e-22
Query Start/End: Original strand, 212 - 309
Target Start/End: Original strand, 17341748 - 17341846
Alignment:
Q  212 tgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    |||||||||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  17341748 tgcttctatttctctatcattttctactatggacccaatatatttaaaccatgtaatttcaggtatgatatgatctccaacttccacctccaaggtaga 17341846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 51; E-Value: 4e-20
Query Start/End: Original strand, 170 - 248
Target Start/End: Original strand, 43423578 - 43423656
Alignment:
Q  170 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggaccca 248  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||| |||||||||| || |||||||    
T  43423578 tctccatttcaaccacccaacttgaatatgatgatttacatctgcttctgtttctccgtcattttgtactacggaccca 43423656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 153 - 260
Target Start/End: Original strand, 20077305 - 20077413
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtat-tatggacccaaga 251  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| | |||| | ||| |||| |||||||||  |||||||| |||||||||||  ||| |||||| |    
T  20077305 aaaacacctgaggctcttctccatttcaaccatccaacctgaaaatgatgatttgcatctgctttaatttctccgtcattttgtataaatgaacccaaaa 20077404  T
Q  252 tatttaaac 260  Q
    |||||||||    
T  20077405 tatttaaac 20077413  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 153 - 293
Target Start/End: Original strand, 38578992 - 38579130
Alignment:
Q  153 aaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagat 252  Q
    ||||||| |||| | || ||||||||||||||| ||||||| || ||||  |||||||   ||||| |||  || |||||||||| |||  || ||||||    
T  38578992 aaaacacatgaggcactcctccatttcaaccactcagcttggattcgatcgtttacat---cttctgttttcccgtcattttgtactatcaactcaagat 38579088  T
Q  253 atttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    |||||||| |||||||||| | ||| ||||||||||||||||    
T  38579089 atttaaactgtgtaacttgtgctataatatgatctccaactt 38579130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 81 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 3097041 - 3096830
Alignment:
Q  81 tacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttca 180  Q
    |||||||| |||||||| || | ||| ||||||||  |||| |||| |||||| ||| |||||  ||| || ||||||||| || ||||  |||||||||    
T  3097041 tacaacatcgtcggtcttaccgttgttcgataaaaa-tttccttcaacttaagcggtattttcacatcacataaaacacctaaggctctcatccatttca 3096943  T
Q  181 accacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgat 279  Q
    |||||||| |||||||  |||  |||| |||  ||| ||| ||      |||||||| |||  |||||||||||||||||| ||||||||| | |  |||    
T  3096942 accacccaacttgaatttgatggtttatatccccttatatgtc------attttgtactataaacccaagatatttaaaccatgtaacttgtgctgagat 3096849  T
Q  280 atgatctccaactttcacc 298  Q
    |||||||| ||||||||||    
T  3096848 atgatctctaactttcacc 3096830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 161 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 28676314 - 28676253
Alignment:
Q  161 tgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttc 223  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||| |||| ||| ||||||||||||    
T  28676314 tgagattcttctccatttcaaccacaca-cttgaatacgatgatttgcatatgcttctatttc 28676253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 218 - 298
Target Start/End: Original strand, 6368478 - 6368559
Alignment:
Q  218 tatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||| || ||||||| ||| ||  |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||| ||||||||    
T  6368478 tatttctccgtcgttttgtactatagatacaagatatttaaattgtgtaacttgtggtatgttatgatctccatctttcacc 6368559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 214 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 21915619 - 21915534
Alignment:
Q  214 cttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||| | | |||||||| ||| || |||| |||||||||||||||||||||   |||||||| ||||| ||||||||||    
T  21915619 cttctatttcttcgttattttgtactattgaaccaatatatttaaaccgtgtaacttgtattatgatataatctcgaactttcacc 21915534  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 239 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 25937780 - 25937720
Alignment:
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgggta-tgatatgatctccaactttcacc 298  Q
    ||||||||||||||||||||   |||||| ||||| | |||||||||||||||||||||||    
T  25937780 tatggacccaagatatttaatttgtgtaatttggggaatgatatgatctccaactttcacc 25937720  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 239 - 309
Target Start/End: Complemental strand, 37124278 - 37124207
Alignment:
Q  239 tatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtaga 309  Q
    ||||||| |||| |||||||||  |||||||||  ||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||    
T  37124278 tatggactcaagctatttaaacaatgtaacttgttgtatgatttgatctccaactttcacctctaaggtaga 37124207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0570 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 1)
Name: scaffold0570
Description:

Target: scaffold0570; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 13 - 347
Target Start/End: Original strand, 2618 - 2951
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||| | || |||||||| | | || ||||| |||||||||||||| |||||| |||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||    
T  2618 acatcctcatctctgctacacttacttgattatcatgttgactcttaaccgcccaacactccataccatacaacaacgtcagtctgactgctgtccgata 2717  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  2718 gaactttcctttcaacttaagtggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatgacttacatct 2817  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||| | ||||||||||  | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||      
T  2818 gcttctatttcttcgtcattttgtacgaaggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaatgtaga-- 2915  T
Q  312 cacacttctccttttgttgaagttacatgccatata 347  Q
    |  ||||||||||  | ||||||||||| |||||||    
T  2916 ctgacttctccttccgctgaagttacattccatata 2951  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0024 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0024
Description:

Target: scaffold0024; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 13 - 311
Target Start/End: Complemental strand, 82655 - 82356
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||| |  |||||||| | |||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||||| |||||||||    
T  82655 acatcctcatctccgctgcacttacttgattctcatgttggctcttaaccgcccaacactccgtaccatacaagatcgtcggtctgactgttgtccgata 82556  T
Q  113 aaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatct 212  Q
     ||| || |||||| ||||||  ||  |||||||||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  82555 gaactttcctttcaacttaaggagtactttcttatcgcacaaaacacatgaggctctttcccattgcaaccacccagcttgaatacgatgatttacatct 82456  T
Q  213 gcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttg-ggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacc 311  Q
    |||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| || |||||| |||||    
T  82455 gcttctatttctccgtcattttttactatggacccaagatatttaaaccgtgtaacttgtggtatgatataatctccaactttcgcctccaaggcagacc 82356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 156; Significance: 8e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 32 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 31383 - 31055
Alignment:
Q  32 acttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgataaaacctttctttcagctta 131  Q
    |||||||| | |||| ||||| ||||||||| |||| ||||||||||| |||||||  | ||||||||||||||| ||||| ||| || |||||| ||||    
T  31383 acttacttgattctcatgttgactcttaaccacccaacactccgtaccgtacaacaccgccggtctgactgctgttcgatagaactttcctttcaactta 31284  T
Q  132 agtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcat 231  Q
    ||||||  |||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||||| ||| ||||||||| ||||    
T  31283 agtggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggctcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgatggcctacatctacttttatttctccgtcat 31184  T
Q  232 tttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttg 330  Q
    ||||||  | ||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||   ||||||||||  | ||    
T  31183 tttgtacgaaggacccaagatgtttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacttccaaggtagacc--tacttctccttccgctg 31086  T
Q  331 aagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||||| |||||||| | ||||||||||    
T  31085 aagttacattccatatactcagtcttgcttc 31055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 133; Significance: 4e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 95 - 361
Target Start/End: Original strand, 12028 - 12293
Alignment:
Q  95 tctgactgctgtccgataaaacctttctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttga 194  Q
    ||||| ||||| |||||||||| || |||| | |||||| |||  |||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||| ||||||||| |    
T  12028 tctgattgctgaccgataaaactttccttttaacttaagaggtactttcttatcgcacaaaacacttgaggttcttctccatttcaacgacccagcttaa 12127  T
Q  195 atacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactt 293  Q
    |||||||   |||||| ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12128 atacgatggcttacatatgcttctatttctccgtcattttgtactatggacccaagatatttaaaccatgtaacttggggtatgatatgatctccaactt 12227  T
Q  294 tcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtcttgcttc 361  Q
    ||||||| ||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||| | |||||  ||||||| ||||    
T  12228 tcaccgcgaaggtagacc--tacttctccttttgctgaagttacattctatataatccgtcttacttc 12293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 228 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 5911 - 5834
Alignment:
Q  228 tcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaactt-gggtatgatatgatctccaactttcaccgccaag 304  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  5911 tcattttgtattgtggacccaagatatttaaaccgtgtaacttggggtatgatatgatctccaactttcacctccaag 5834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1493 (Bit Score: 57; Significance: 1e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold1493
Description:

Target: scaffold1493; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 121 - 234
Target Start/End: Original strand, 41 - 156
Alignment:
Q  121 ctttcagcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaacca--cccagcttgaatacgataatttacatctgcttct 218  Q
    |||||| ||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||  ||| ||||| ||||||| |||||||| |||||||    
T  41 ctttcaacttaattggtactttcttatcgcacaaaacacctgaggctcttctccatttcaaacaccccctgcttgcatacgatgatttacatatgcttct 140  T
Q  219 atttctccatcatttt 234  Q
    ||||| || |||||||    
T  141 atttccccgtcatttt 156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0045
Description:

Target: scaffold0045; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 13 - 260
Target Start/End: Original strand, 86955 - 87204
Alignment:
Q  13 acatcatcatctccgttatacttactttactctcgtgttggctcttaaccgcccagcactccgtaccttacaacattgtcggtctgactgctgtccgata 112  Q
    ||||| ||||||||  || |||||||| | |||| ||| |||||||||||||| | ||||  ||||| ||||| || || |||||||||||||||| |||    
T  86955 acatcctcatctcctctacacttacttgagtctcatgtcggctcttaaccgccaa-cact--gtaccatacaaaatcgttggtctgactgctgtccaata 87051  T
Q  113 aaacctttctttc-----agcttaagtggttttttcttatcgcacaaaacacctgagactcttctccatttcaaccacccagcttgaatacgataattta 207  Q
     | | ||| ||||     | |||||||| |  |||||||| ||| ||||| || ||| || |||||||||||||||| | | | |||||| ||| | |||    
T  87052 gagcttttttttcttttcaacttaagtgatactttcttattgcataaaacccccgaggcttttctccatttcaaccatcaaacatgaatatgatgagtta 87151  T
Q  208 catctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaac 260  Q
    |||||| ||||||||||||  |||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  87152 catctgattctatttctccgacattttatactatggacccaagatatttaaac 87204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0045; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 256 - 361
Target Start/End: Original strand, 88514 - 88618
Alignment:
Q  256 taaaccgtgtaacttgg-gtatgatatgatctccaactttcaccgccaaggtagacccacacttctccttttgttgaagttacatgccatataccccgtc 354  Q
    |||||| |||||||||  ||||| |||||| |||| |||||| | |||||||| ||| ||  ||||||||||| ||||||||||| |||||||| | |||    
T  88514 taaaccatgtaacttgaagtatggtatgatttccatctttcatctccaaggtaaacctac--ttctccttttgctgaagttacattccatatactctgtc 88611  T
Q  355 ttgcttc 361  Q
    |||||||    
T  88612 ttgcttc 88618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0606 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0606
Description:

Target: scaffold0606; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 170 - 294
Target Start/End: Complemental strand, 9434 - 9309
Alignment:
Q  170 tctccatttcaaccacccagcttgaatacgataatttacatctgcttctatttctccatcattttgtattatggacccaagatatttaaaccgtgtaact 269  Q
    ||||| ||||||| |||||| |||||| | ||  ||||||||| |||| |||||| |||| |||| || |||  ||| |||||||||||| |||||||||    
T  9434 tctccctttcaactacccagtttgaatcctatgttttacatctccttccatttcttcatcgttttataatataaacctaagatatttaaatcgtgtaact 9335  T
Q  270 -tgggtatgatatgatctccaacttt 294  Q
         |||||||||||||||||||||    
T  9334 aataatatgatatgatctccaacttt 9309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University