View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15620_high_5 (Length: 396)

Name: NF15620_high_5
Description: NF15620
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15620_high_5
NF15620_high_5
[»] chr6 (44 HSPs)
chr6 (20-373)||(27284224-27284581)
chr6 (20-373)||(29555537-29555894)
chr6 (20-357)||(16755815-16756157)
chr6 (20-355)||(13518056-13518395)
chr6 (20-357)||(27063477-27063817)
chr6 (28-333)||(26110281-26110589)
chr6 (20-373)||(27355973-27356330)
chr6 (20-355)||(27491130-27491469)
chr6 (20-340)||(28166506-28166831)
chr6 (20-372)||(27623569-27623927)
chr6 (28-349)||(29579018-29579342)
chr6 (20-373)||(8899561-8899918)
chr6 (20-324)||(4763791-4764099)
chr6 (28-333)||(26772499-26772807)
chr6 (20-355)||(16680136-16680476)
chr6 (34-373)||(4531267-4531609)
chr6 (28-373)||(4539628-4539978)
chr6 (21-373)||(27200165-27200522)
chr6 (21-373)||(27248711-27249068)
chr6 (20-324)||(29507444-29507754)
chr6 (28-362)||(30551870-30552208)
chr6 (20-373)||(22928743-22929102)
chr6 (28-335)||(16937895-16938205)
chr6 (28-373)||(28213433-28213783)
chr6 (20-373)||(34458370-34458725)
chr6 (34-356)||(4778876-4779203)
chr6 (38-334)||(13292831-13293125)
chr6 (28-357)||(26791811-26792144)
chr6 (20-373)||(33370293-33370650)
chr6 (50-357)||(26926763-26927073)
chr6 (20-357)||(27013728-27014062)
chr6 (20-357)||(14139262-14139597)
chr6 (28-271)||(26666528-26666774)
chr6 (34-356)||(27031019-27031342)
chr6 (34-357)||(24869705-24870026)
chr6 (20-357)||(27208899-27209236)
chr6 (20-357)||(27239992-27240329)
chr6 (37-334)||(27025163-27025460)
chr6 (28-334)||(15406403-15406709)
chr6 (28-334)||(15418190-15418496)
chr6 (34-356)||(24299636-24299957)
chr6 (34-312)||(20174589-20174881)
chr6 (34-312)||(22161110-22161402)
chr6 (276-373)||(23851450-23851547)
[»] chr2 (41 HSPs)
chr2 (20-334)||(12661558-12661875)
chr2 (20-335)||(39896087-39896405)
chr2 (20-357)||(37383673-37384014)
chr2 (20-335)||(22922048-22922369)
chr2 (20-357)||(34160840-34161183)
chr2 (20-357)||(27809697-27810040)
chr2 (20-355)||(34867681-34868019)
chr2 (20-356)||(254557-254897)
chr2 (20-356)||(37945770-37946111)
chr2 (20-356)||(9343892-9344232)
chr2 (28-373)||(12710514-12710863)
chr2 (20-324)||(27122554-27122860)
chr2 (20-335)||(19410389-19410710)
chr2 (20-356)||(39045727-39046067)
chr2 (28-356)||(13930457-13930791)
chr2 (20-357)||(3788490-3788830)
chr2 (28-357)||(32055798-32056130)
chr2 (20-373)||(37679796-37680155)
chr2 (20-373)||(37695061-37695420)
chr2 (20-357)||(12592806-12593151)
chr2 (20-356)||(16167475-16167815)
chr2 (28-362)||(16823250-16823588)
chr2 (28-362)||(16897892-16898230)
chr2 (20-373)||(21671075-21671435)
chr2 (34-373)||(11629104-11629446)
chr2 (28-356)||(31882284-31882615)
chr2 (28-356)||(37931369-37931708)
chr2 (20-362)||(21697078-21697427)
chr2 (20-357)||(34297152-34297486)
chr2 (34-373)||(40239489-40239831)
chr2 (20-305)||(31868691-31868979)
chr2 (28-373)||(27782212-27782561)
chr2 (28-373)||(27396303-27396662)
chr2 (28-373)||(19450331-19450689)
chr2 (34-357)||(28888275-28888597)
chr2 (28-357)||(34268839-34269167)
chr2 (34-356)||(23122497-23122818)
chr2 (28-357)||(27428366-27428692)
chr2 (34-334)||(20843931-20844235)
chr2 (20-109)||(23117044-23117133)
chr2 (300-356)||(31887682-31887738)
[»] scaffold0159 (2 HSPs)
scaffold0159 (20-373)||(3094-3453)
scaffold0159 (20-209)||(17952-18147)
[»] chr5 (49 HSPs)
chr5 (20-334)||(11555382-11555699)
chr5 (20-361)||(3795539-3795885)
chr5 (20-355)||(33881133-33881472)
chr5 (20-355)||(18369347-18369686)
chr5 (20-356)||(30174471-30174812)
chr5 (28-356)||(13318651-13318982)
chr5 (34-335)||(6880331-6880636)
chr5 (28-373)||(9323466-9323814)
chr5 (28-355)||(24729977-24730308)
chr5 (28-357)||(37746151-37746484)
chr5 (20-357)||(28655247-28655589)
chr5 (20-356)||(40467368-40467708)
chr5 (28-373)||(12138165-12138513)
chr5 (20-334)||(9544522-9544842)
chr5 (34-357)||(37665315-37665642)
chr5 (20-357)||(13436489-13436836)
chr5 (28-357)||(30035431-30035763)
chr5 (28-357)||(15752681-15753008)
chr5 (28-373)||(37352467-37352816)
chr5 (20-373)||(2517054-2517412)
chr5 (20-334)||(23631997-23632317)
chr5 (28-333)||(30158063-30158372)
chr5 (28-373)||(31820233-31820580)
chr5 (28-334)||(5643828-5644136)
chr5 (20-373)||(22894405-22894761)
chr5 (20-340)||(18494583-18494906)
chr5 (28-362)||(33522382-33522721)
chr5 (20-357)||(37760987-37761329)
chr5 (20-350)||(43084270-43084604)
chr5 (20-373)||(32590091-32590447)
chr5 (20-356)||(13180608-13180944)
chr5 (20-356)||(34622524-34622865)
chr5 (28-355)||(8659295-8659625)
chr5 (20-355)||(11329644-11329985)
chr5 (28-373)||(26486385-26486723)
chr5 (34-357)||(18122245-18122572)
chr5 (34-373)||(33298522-33298869)
chr5 (34-356)||(41680710-41681037)
chr5 (34-373)||(28953609-28953952)
chr5 (20-357)||(31437469-31437803)
chr5 (20-373)||(25206266-25206630)
chr5 (20-373)||(25270422-25270786)
chr5 (34-357)||(15652589-15652914)
chr5 (34-357)||(22992953-22993272)
chr5 (28-334)||(23897902-23898206)
chr5 (34-357)||(33783492-33783814)
chr5 (34-334)||(24975877-24976175)
chr5 (37-357)||(24608250-24608570)
chr5 (28-356)||(30940642-30940968)
[»] chr3 (58 HSPs)
chr3 (20-373)||(32296574-32296932)
chr3 (20-356)||(4790591-4790932)
chr3 (20-356)||(5727940-5728281)
chr3 (20-356)||(47029415-47029756)
chr3 (20-335)||(31958413-31958734)
chr3 (20-356)||(5717030-5717371)
chr3 (20-356)||(5764087-5764428)
chr3 (34-357)||(22381553-22381879)
chr3 (20-335)||(5603271-5603592)
chr3 (20-335)||(24334156-24334477)
chr3 (20-357)||(10402110-10402450)
chr3 (20-373)||(29658926-29659283)
chr3 (20-324)||(5590319-5590627)
chr3 (28-357)||(22864814-22865145)
chr3 (28-357)||(22879873-22880204)
chr3 (20-357)||(17970824-17971163)
chr3 (20-373)||(28027236-28027591)
chr3 (20-356)||(4422880-4423220)
chr3 (20-357)||(6536701-6537042)
chr3 (28-373)||(28109917-28110271)
chr3 (20-373)||(48471872-48472233)
chr3 (20-362)||(4340634-4340980)
chr3 (20-357)||(20071994-20072337)
chr3 (20-356)||(10649033-10649373)
chr3 (20-373)||(18248683-18249040)
chr3 (34-349)||(18286327-18286645)
chr3 (34-349)||(18301628-18301946)
chr3 (20-356)||(5019675-5020014)
chr3 (20-362)||(17978908-17979255)
chr3 (28-335)||(28345154-28345464)
chr3 (20-324)||(11104319-11104628)
chr3 (20-357)||(7079183-7079529)
chr3 (20-357)||(8217593-8217936)
chr3 (20-373)||(16422128-16422485)
chr3 (20-357)||(5472949-5473289)
chr3 (28-373)||(16618455-16618808)
chr3 (34-324)||(31030217-31030504)
chr3 (28-356)||(51787984-51788316)
chr3 (34-373)||(4629730-4630072)
chr3 (34-373)||(21680646-21680988)
chr3 (34-373)||(29142726-29143072)
chr3 (28-356)||(18231155-18231487)
chr3 (34-355)||(18336591-18336910)
chr3 (28-373)||(20570812-20571161)
chr3 (34-350)||(32445122-32445433)
chr3 (20-356)||(18057222-18057565)
chr3 (28-373)||(19700431-19700792)
chr3 (34-334)||(4727617-4727915)
chr3 (34-334)||(6207884-6208184)
chr3 (34-356)||(15735072-15735393)
chr3 (28-357)||(5658095-5658425)
chr3 (34-334)||(35886748-35887048)
chr3 (28-356)||(4689613-4689939)
chr3 (34-356)||(8283430-8283767)
chr3 (247-357)||(15886894-15887006)
chr3 (271-356)||(8002522-8002607)
chr3 (28-218)||(15886707-15886895)
chr3 (207-290)||(27561018-27561101)
[»] scaffold0547 (1 HSPs)
scaffold0547 (20-357)||(9557-9897)
[»] scaffold0418 (1 HSPs)
scaffold0418 (20-357)||(12034-12374)
[»] chr8 (24 HSPs)
chr8 (34-356)||(33248365-33248690)
chr8 (20-357)||(18796704-18797046)
chr8 (20-373)||(19680430-19680786)
chr8 (20-335)||(28355827-28356148)
chr8 (20-335)||(31483747-31484068)
chr8 (20-357)||(9360620-9360960)
chr8 (28-361)||(29835317-29835653)
chr8 (20-334)||(44567002-44567322)
chr8 (22-357)||(18715478-18715819)
chr8 (20-356)||(31360527-31360867)
chr8 (20-324)||(15773605-15773913)
chr8 (28-324)||(33264762-33265061)
chr8 (28-373)||(12086608-12086958)
chr8 (20-334)||(21342047-21342366)
chr8 (28-373)||(19202260-19202598)
chr8 (20-324)||(19911039-19911349)
chr8 (28-373)||(22074814-22075164)
chr8 (101-373)||(16260205-16260480)
chr8 (34-373)||(27602805-27603141)
chr8 (28-357)||(19655232-19655562)
chr8 (34-356)||(2131159-2131479)
chr8 (28-357)||(22138904-22139231)
chr8 (34-356)||(19694094-19694416)
chr8 (34-317)||(14569194-14569479)
[»] chr4 (27 HSPs)
chr4 (20-373)||(39856630-39856985)
chr4 (20-355)||(14104554-14104892)
chr4 (20-355)||(30759775-30760112)
chr4 (20-355)||(33667718-33668055)
chr4 (20-356)||(20332337-20332678)
chr4 (20-356)||(40099551-40099892)
chr4 (20-357)||(54839400-54839740)
chr4 (34-357)||(34182893-34183218)
chr4 (20-356)||(27157227-27157569)
chr4 (20-357)||(5700549-5700890)
chr4 (34-357)||(14753423-14753749)
chr4 (20-356)||(24586276-24586617)
chr4 (28-373)||(5011870-5012220)
chr4 (34-357)||(24118672-24118998)
chr4 (28-362)||(21975708-21976046)
chr4 (34-357)||(36338455-36338774)
chr4 (28-373)||(18794540-18794889)
chr4 (20-373)||(1906245-1906607)
chr4 (28-334)||(31120433-31120744)
chr4 (34-334)||(6575894-6576190)
chr4 (28-373)||(15276552-15276904)
chr4 (28-373)||(15380161-15380510)
chr4 (20-334)||(1673892-1674213)
chr4 (20-373)||(15233809-15234170)
chr4 (34-276)||(36324246-36324484)
chr4 (34-356)||(14671026-14671349)
chr4 (34-356)||(17019062-17019384)
[»] chr1 (12 HSPs)
chr1 (20-356)||(3647147-3647487)
chr1 (20-324)||(10968698-10969007)
chr1 (28-355)||(28591085-28591415)
chr1 (20-357)||(28155726-28156069)
chr1 (28-373)||(51644204-51644555)
chr1 (28-340)||(10951108-10951425)
chr1 (20-356)||(41787224-41787566)
chr1 (20-373)||(20334330-20334689)
chr1 (20-373)||(16201942-16202307)
chr1 (20-373)||(20466761-20467126)
chr1 (190-373)||(21891837-21892020)
chr1 (34-90)||(21891691-21891746)
[»] scaffold0322 (2 HSPs)
scaffold0322 (28-373)||(1639-1988)
scaffold0322 (20-373)||(12028-12396)
[»] chr7 (32 HSPs)
chr7 (20-334)||(5164402-5164720)
chr7 (20-335)||(24586336-24586654)
chr7 (20-335)||(4139046-4139367)
chr7 (20-356)||(26518789-26519127)
chr7 (20-357)||(5154079-5154419)
chr7 (17-333)||(45393238-45393558)
chr7 (28-373)||(11446867-11447216)
chr7 (20-357)||(26509496-26509839)
chr7 (28-373)||(4205368-4205717)
chr7 (28-373)||(31084431-31084781)
chr7 (28-373)||(26313658-26314006)
chr7 (20-373)||(26268886-26269247)
chr7 (20-373)||(16745321-16745679)
chr7 (23-357)||(45737296-45737636)
chr7 (20-334)||(11418580-11418898)
chr7 (20-356)||(26663713-26664054)
chr7 (20-356)||(26678905-26679246)
chr7 (20-356)||(31558195-31558535)
chr7 (20-367)||(26441238-26441590)
chr7 (20-373)||(5141135-5141493)
chr7 (28-373)||(16047294-16047640)
chr7 (28-373)||(3451297-3451647)
chr7 (28-356)||(39206948-39207280)
chr7 (20-357)||(2779247-2779582)
chr7 (20-357)||(31129900-31130235)
chr7 (20-356)||(2160566-2160908)
chr7 (20-359)||(16443804-16444148)
chr7 (28-373)||(10847562-10847915)
chr7 (20-270)||(26595750-26596006)
chr7 (34-357)||(16512255-16512576)
chr7 (28-334)||(10910735-10911039)
chr7 (271-356)||(26531926-26532011)
[»] scaffold0237 (1 HSPs)
scaffold0237 (20-357)||(8844-9184)
[»] scaffold0254 (1 HSPs)
scaffold0254 (20-356)||(18584-18926)
[»] scaffold0143 (2 HSPs)
scaffold0143 (20-357)||(9912-10252)
scaffold0143 (34-357)||(33295-33619)
[»] scaffold0792 (1 HSPs)
scaffold0792 (20-357)||(4518-4862)
[»] scaffold0038 (1 HSPs)
scaffold0038 (28-373)||(13931-14281)
[»] scaffold0336 (1 HSPs)
scaffold0336 (20-373)||(15551-15915)
[»] scaffold0109 (1 HSPs)
scaffold0109 (28-373)||(25097-25454)
[»] scaffold0089 (1 HSPs)
scaffold0089 (34-356)||(6065-6388)
[»] scaffold0240 (1 HSPs)
scaffold0240 (34-334)||(24835-25135)
[»] scaffold0288 (1 HSPs)
scaffold0288 (192-373)||(359-540)
[»] scaffold0241 (1 HSPs)
scaffold0241 (209-373)||(26241-26405)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (20-134)||(12-126)
[»] scaffold0099 (2 HSPs)
scaffold0099 (203-308)||(40744-40855)
scaffold0099 (34-80)||(40559-40606)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 296; Significance: 1e-166; HSPs: 44)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 296; E-Value: 1e-166
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 27284224 - 27284581
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27284224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27284323  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  27284324 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagct 27284423  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27284424 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27284523  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||| |||||    
T  27284524 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaagcttcagatga 27284581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 29555894 - 29555537
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaagt 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||| |    
T  29555894 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagcttttaattttctaaaat 29555795  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||    
T  29555794 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcacaagct 29555695  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555694 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 29555595  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29555594 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 29555537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 16756157 - 16755815
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagt- 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |     
T  16756157 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattgtcaaaata 16756058  T
Q  119 -gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
     ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16756057 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagc 16755958  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755957 tcaaattgatgtataagagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 16755858  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  16755857 acagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 16755815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 13518056 - 13518395
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13518056 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 13518155  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  13518156 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 13518255  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13518256 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 13518355  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  13518356 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 13518395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27063817 - 27063477
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  27063817 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 27063718  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  27063717 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggct 27063619  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  27063618 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaaca 27063519  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| | ||||||||||||||    
T  27063518 cagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcacaagca 27063477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 251; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 26110281 - 26110589
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  26110281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26110380  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  26110381 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 26110480  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26110481 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 26110580  T
Q  325 ccacatttc 333  Q
    | |||||||    
T  26110581 ctacatttc 26110589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 27355973 - 27356330
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  27355973 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27356072  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  27356073 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggct 27356172  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27356173 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27356272  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  27356273 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 27356330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 27491469 - 27491130
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  27491469 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 27491370  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  27491369 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagct 27491270  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27491269 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 27491170  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    | |||| ||| ||| |||   |||| | ||||||||||||    
T  27491169 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaag 27491130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 28166831 - 28166506
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28166831 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28166732  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28166731 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggc 28166632  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28166631 tcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 28166532  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaa 340  Q
    |||| |||||  |||||||| |||||    
T  28166531 acagcaatcattacatttcctggaaa 28166506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 372
Target Start/End: Original strand, 27623569 - 27623927
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  27623569 gacatcaacatatactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaatg 27623668  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaa-tgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  27623669 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27623768  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27623769 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27623868  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatg 372  Q
    |||||||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||||||||    
T  27623869 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttctgatg 27623927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 349
Target Start/End: Complemental strand, 29579342 - 29579018
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaagtgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||    
T  29579342 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaatgtttgttt 29579243  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   ||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29579242 caagcattgtcattatcaagatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 29579144  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29579143 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 29579044  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaatt 349  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||||    
T  29579043 attacatttcctggaaactttgaatt 29579018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 8899561 - 8899918
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  8899561 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 8899660  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  8899661 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 8899759  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8899760 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 8899859  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  8899860 acagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 8899918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 4764099 - 4763791
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4764099 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4764000  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4763999 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4763901  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4763900 tcaaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4763801  T
Q  315 acagtaatca 324  Q
    ||||||||||    
T  4763800 acagtaatca 4763791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Original strand, 26772499 - 26772807
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||  |||||||||    
T  26772499 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26772598  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26772599 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 26772697  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26772698 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 26772797  T
Q  324 accacatttc 333  Q
    || |||||||    
T  26772798 actacatttc 26772807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 16680476 - 16680136
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16680476 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16680377  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||    
T  16680376 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagc 16680277  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16680276 tcaaattgacgtataagagtggtggtcagccgacggcgtgactccacggattttcaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 16680177  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  16680176 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 16680136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4531609 - 4531267
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4531609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4531511  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
    ||   |||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4531510 ttgtcattatcaaaatggaaagagaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 4531411  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    ||||||||| ||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  4531410 agagtggtgatcagccgaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 4531311  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||| |||| |  ||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4531310 tttcccagaaacttcgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4531267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 4539628 - 4539978
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4539628 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 4539727  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagt-agaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  4539728 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttga 4539827  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  4539828 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaac 4539927  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  4539928 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 4539978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27200522 - 27200165
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-agtg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27200522 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27200423  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||| |||    
T  27200422 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaatcaaaagcacaagct 27200324  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27200323 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 27200224  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  27200223 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27200165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 21 - 373
Target Start/End: Original strand, 27248711 - 27249068
Alignment:
Q  21 acatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-agtg 119  Q
    |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  27248711 acatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaagaatg 27248810  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatg-ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| || |||||||||| |||    
T  27248811 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttaatcaaaagcacaagct 27248909  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27248910 caaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 27249009  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  27249010 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 27249068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 29507754 - 29507444
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  29507754 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttccatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 29507655  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaat--agagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||   ||||||||||||||||||||| |    
T  29507654 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaag 29507555  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29507554 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 29507455  T
Q  314 cacagtaatca 324  Q
    |||||||||||    
T  29507454 cacagtaatca 29507444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Original strand, 30551870 - 30552208
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  30551870 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 30551969  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  30551970 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattga 30552069  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30552070 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 30552169  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  30552170 attacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 30552208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 22928743 - 22929102
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  22928743 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctattgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 22928842  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22928843 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcatagg 22928942  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22928943 ctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 22929042  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  22929043 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 22929102  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Original strand, 16937895 - 16938205
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  16937895 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 16937994  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||  ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  16937995 caagcattgccattatcaaaatagaaggaaaataatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttga 16938093  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16938094 tgtataagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 16938193  T
Q  324 accacatttccc 335  Q
    |  |||||||||    
T  16938194 attacatttccc 16938205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28213783 - 28213433
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  28213783 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 28213684  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  28213683 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttga 28213584  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  28213583 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaac 28213484  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  28213483 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 28213433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 34458370 - 34458725
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  34458370 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 34458468  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||| ||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  34458469 tttgtttcaaccattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagcttagaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggct 34458567  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34458568 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34458667  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  34458668 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 34458725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 223; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4779203 - 4778876
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  4779203 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 4779105  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    ||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4779104 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatacagcttttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 4779005  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  4779004 aagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 4778905  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  4778904 catttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4778876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 38 - 334
Target Start/End: Original strand, 13292831 - 13293125
Alignment:
Q  38 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcattat- 136  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||||     
T  13292831 ctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcattatc 13292925  T
Q  137 --tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagt 234  Q
      |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13292926 attatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataagagt 13293025  T
Q  235 ggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  ||||||||    
T  13293026 ggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaatcattacatttcc 13293125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26792144 - 26791811
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  26792144 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 26792045  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  26792044 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 26791946  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    | ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791945 acgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 26791846  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  26791845 catgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26791811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 33370293 - 33370650
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  33370293 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggttcgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaat 33370392  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  33370393 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgctttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 33370491  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33370492 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 33370591  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    || |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  33370592 acggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 33370650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 50 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 26927073 - 26926763
Alignment:
Q  50 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagcatt---attatcaagat 145  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||   |||||||| ||    
T  26927073 tcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaat 26926974  T
Q  146 agaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagcc 245  Q
    |||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  26926973 agaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtataagagtggtggtcagcc 26926875  T
Q  246 gaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctg 345  Q
    |||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||    
T  26926874 gaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttg 26926775  T
Q  346 aattcacaagca 357  Q
    ||||| ||||||    
T  26926774 aattcgcaagca 26926763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27014062 - 27013728
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||| ||    
T  27014062 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 27013969  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  27013968 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 27013869  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27013868 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 27013769  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  27013768 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 27013728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 14139262 - 14139597
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||| ||    
T  14139262 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 14139356  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  14139357 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 14139456  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14139457 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 14139556  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  14139557 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 14139597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 178; E-Value: 7e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 271
Target Start/End: Original strand, 26666528 - 26666774
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaagtgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||    
T  26666528 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaaaagttttcaatcttcaaaaatgtttgttt 26666627  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  26666628 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 26666726  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaa 271  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||    
T  26666727 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaa 26666774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 27031342 - 27031019
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  27031342 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaaa----aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27031248  T
Q  134 t----attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || |||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27031247 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 27031148  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||  |    
T  27031147 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaatacagcaatcatta 27031048  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||  |||| | |||||||||||||    
T  27031047 catttcctagaaactttgaattcacaagc 27031019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24870026 - 24869705
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24870026 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24869935  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24869934 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 24869835  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  24869834 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatga 24869735  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  24869734 catttcctagaaactttgaattcgcaagca 24869705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27209236 - 27208899
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  ||    
T  27209236 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27209145  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-------attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
    |||||||| ||||||       ||||  || |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27209144 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 27209045  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27209044 cgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattg 27208945  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  27208944 aacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27208899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 27239992 - 27240329
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  ||    
T  27239992 gacatcaacatactctcgctcatgcacgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatg 27240083  T
Q  120 tttgtttcaagcatt-------attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
    |||||||| ||||||       ||||  || |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||    
T  27240084 tttgtttcgagcatttgtcattattaaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 27240183  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  27240184 cgctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattg 27240283  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  27240284 aacacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27240329  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 37 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27025460 - 27025163
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcatt-- 134  Q
    |||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  || ||||||| ||||||      
T  27025460 gctcatgcatgtctcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcatttg 27025368  T
Q  135 --attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
      ||||| || | ||||| |||||||||||  ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27025367 tcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 27025268  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  27025267 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattaca 27025168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 15406403 - 15406709
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  15406403 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15406495  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15406496 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 15406595  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15406596 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagca 15406695  T
Q  321 atcaccacatttcc 334  Q
    ||||  ||||||||    
T  15406696 atcatgacatttcc 15406709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 15418190 - 15418496
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      ||   ||| |||||||| |  ||||||||||    
T  15418190 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aactttttccaattttccagatgtttgtttc 15418282  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15418283 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatatctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 15418382  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  15418383 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagca 15418482  T
Q  321 atcaccacatttcc 334  Q
    ||||  ||||||||    
T  15418483 atcatgacatttcc 15418496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 24299636 - 24299957
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||| ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  |||||||| | |||||    
T  24299636 ctcgcttatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttactcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgttccgagcat 24299729  T
Q  134 t----attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |    ||||| || | |||| | ||| ||||| ||| ||| |||||| |||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24299730 ttgtcattattaaaaaagaagggaaacgtttttgtacataactttgagagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 24299829  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||  |||||  ||    
T  24299830 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtgatacattgaacacaacaatcattac 24299929  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  24299930 atttcctagaaactttgaattcgcaagc 24299957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 312
Target Start/End: Complemental strand, 20174881 - 20174589
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaagtgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||      ||| | | |||||||||    
T  20174881 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 20174782  T
Q  127 -caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagta--gaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaa 219  Q
     ||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20174781 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagactcaaa 20174682  T
Q  220 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20174681 ttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20174589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 34 - 312
Target Start/End: Original strand, 22161110 - 22161402
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaca-aaaagttttcaat------tttcaaagtgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| || |  ||      ||| | | |||||||||    
T  22161110 ctcgctcatgcatgtttcacttgaaagtaccttgttgctaaggtttgcttttcaaaatagacagaaaacttcttgatatttttttttagaatgtttgttt 22161209  T
Q  127 -caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagta--gaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaa 219  Q
     ||||||||   || ||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||||  ||  |||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22161210 tcaagcattgtcatcatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacataactttggaagtaaagagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagactcaaa 22161309  T
Q  220 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22161310 ttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgggactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 22161402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 74; E-Value: 8e-34
Query Start/End: Original strand, 276 - 373
Target Start/End: Original strand, 23851450 - 23851547
Alignment:
Q  276 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  23851450 tggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 23851547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 276; Significance: 1e-154; HSPs: 41)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 276; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12661875 - 12661558
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12661875 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12661776  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  12661775 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctc 12661676  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12661675 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 12661576  T
Q  317 agtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  12661575 agtaatcattacatttcc 12661558  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 265; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 39896405 - 39896087
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  39896405 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 39896306  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  39896305 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctc 39896206  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39896205 aaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 39896106  T
Q  317 agtaatcaccacatttccc 335  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  39896105 agtaatcattacatttccc 39896087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 256; E-Value: 1e-142
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37384014 - 37383673
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  37384014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 37383915  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  37383914 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctc 37383815  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  37383814 aaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaaca 37383715  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||| |||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  37383714 cagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 37383673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 22922048 - 22922369
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  22922048 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 22922147  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  22922148 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 22922247  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22922248 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 22922347  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  22922348 cacagtaatcattacatttccc 22922369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34161183 - 34160840
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  34161183 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 34161084  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| |    
T  34161083 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaag 34160984  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34160983 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 34160884  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  34160883 cacagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 34160840  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 27810040 - 27809697
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27810040 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaacctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27809941  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa--tagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||| |||    
T  27809940 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27809841  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27809840 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27809741  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  27809740 cacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 27809697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 34868019 - 34867681
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  34868019 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 34867920  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  34867919 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggct 34867821  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34867820 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactctacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 34867721  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||||||||   ||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  34867720 cagtaatcatttcatttcctggaaactttgaattcgcaag 34867681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 254557 - 254897
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  254557 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaatg 254655  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  254656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 254755  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  254756 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 254855  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  254856 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 254897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 37945770 - 37946111
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37945770 gacatcaacatactcttactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 37945869  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  37945870 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 37945969  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  37945970 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattgaac 37946069  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  37946070 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37946111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 9343892 - 9344232
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |    
T  9343892 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatggacaaaaagttttcaattttcaaaaat 9343991  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  9343992 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagct 9344091  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9344092 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 9344191  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  9344192 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 9344232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 12710514 - 12710863
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  12710514 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 12710613  T
Q  126 tcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12710614 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 12710712  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12710713 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 12710812  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  12710813 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 12710863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 27122860 - 27122554
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27122860 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttctcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27122761  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||    
T  27122760 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcaaaggctc 27122662  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27122661 aatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 27122562  T
Q  317 agtaatca 324  Q
    ||||||||    
T  27122561 agtaatca 27122554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 19410389 - 19410710
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19410389 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtatcctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19410488  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  19410489 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 19410588  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19410589 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 19410688  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  19410689 cacagtaatcattacatttccc 19410710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 39045727 - 39046067
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  39045727 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 39045826  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||| |||   ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  39045827 gtttgtttcaagtattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagct 39045926  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  39045927 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttagtggtacattgaaca 39046026  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||||  |||||| | ||||| | ||||||| |||||    
T  39046027 cagtaatcattacattttctggaaactttgaattcgcaagc 39046067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 13930457 - 13930791
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  13930457 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 13930556  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  13930557 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 13930656  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  13930657 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 13930756  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  13930757 tcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13930791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 3788830 - 3788490
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3788830 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3788731  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  3788730 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 3788632  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3788631 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3788532  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  3788531 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 3788490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 32056130 - 32055798
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  32056130 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 32056031  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  32056030 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattttaaacaaaagcacaggctcaatttga 32055932  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  32055931 tgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatc 32055832  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||||| ||||||    
T  32055831 atgacatttcctggaaactttgaattcgcaagca 32055798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 37679796 - 37680155
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       
T  37679796 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37679895  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37679896 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacagg 37679994  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37679995 ctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattga 37680094  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  37680095 acacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 37680155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 37695061 - 37695420
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||       
T  37695061 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaaa 37695160  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  37695161 tgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacagg 37695259  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  37695260 ctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattga 37695359  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  37695360 acacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 37695420  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12593151 - 12592806
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||       
T  12593151 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 12593052  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcaca 211  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |    
T  12593051 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaa 12592952  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12592951 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 12592852  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  12592851 aacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 12592806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 16167815 - 16167475
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16167815 gacatcaacataccctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 16167716  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  16167715 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 16167617  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16167616 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 16167517  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  16167516 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 16167475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Original strand, 16823250 - 16823588
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16823250 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16823349  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16823350 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattga 16823449  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16823450 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 16823549  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  16823550 attacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16823588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16898230 - 16897892
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  16898230 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 16898131  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16898130 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattga 16898031  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  16898030 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 16897931  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  16897930 attacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 16897892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 21671075 - 21671435
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagt-tttcaattttcaaag- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||      
T  21671075 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaaatttcaattttcaaaaa 21671174  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
     ||||||||||||||||| |   |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  21671175 atgtttgtttcaagcattgtctttatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacag 21671273  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattg 311  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  21671274 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattg 21671373  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||| |||||  |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21671374 aacacagcaatcattacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21671435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Original strand, 11629104 - 11629446
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||  ||||| |||||||||    
T  11629104 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtttttcaaaatagacaaagagttttcaattttcaaaaatgtttatttcaagca 11629202  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11629203 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaaataaaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 11629301  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  11629302 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattac 11629401  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  11629402 atttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 11629446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31882615 - 31882284
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  31882615 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaagtttgcttttcaaaatagaaaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 31882516  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31882515 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 31882417  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||    
T  31882416 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagcaatc 31882317  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  31882316 attacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31882284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 37931708 - 37931369
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaagtgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||    
T  37931708 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 37931609  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag------aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  37931608 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctc 37931509  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37931508 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 37931409  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    || |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  37931408 agcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 37931369  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 21697078 - 21697427
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaag 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||      
T  21697078 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 21697176  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||| |  | | ||||||||||||||||||||||    
T  21697177 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaggaagatagtagagtttcaaacaaaagcaca 21697276  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21697277 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 21697376  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| |||||||||||    
T  21697377 aacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaa 21697427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 34297486 - 34297152
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  |||||||||||| || ||    
T  34297486 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcgaaatg 34297393  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  34297392 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 34297293  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34297292 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 34297193  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  34297192 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 34297152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 40239831 - 40239489
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  40239831 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 40239733  T
Q  134 t---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |   |||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  40239732 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 40239634  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  40239633 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 40239534  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  40239533 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 40239489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 20 - 305
Target Start/End: Original strand, 31868691 - 31868979
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31868691 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31868790  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  31868791 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggct 31868889  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggt 305  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  31868890 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaatgcttgaaaaatggtaattttattggttggtggt 31868979  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27782561 - 27782212
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  27782561 catacactcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 27782462  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    
T  27782461 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 27782363  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  27782362 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 27782263  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  27782262 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 27782212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 27396662 - 27396303
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag----------ttttcaattttcaaag 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||  ||||||||           ||||||||||||||      
T  27396662 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgcttaggtttgcttt-caaaaaggacaaaaaactttttttttttttcaattttcaaga 27396564  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
    |||||||||||||||||   ||||| |||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||    
T  27396563 tgtttgtttcaagcattgtcattataaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacag 27396464  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  27396463 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattga 27396364  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||| |||| ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||||||| || ||||||||||    
T  27396363 acacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttctgatga 27396303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 19450331 - 19450689
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt------caattttcaaagtgtt 121  Q
    ||||| ||| ||||||||  |||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||| ||||      ||||||||||  ||||    
T  19450331 catacgctcactcatgcacatttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttacttt-caaaacagacaaaaacttttttttttcaattttcaagatgtt 19450429  T
Q  122 tgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||     ||| ||| |||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||| |    
T  19450430 tgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttttgtacatacctttgaaagtagagagaaaatagagtttcaaacaaaagcacatg 19450529  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19450530 ctcgaattgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgattccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaa 19450629  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| |||| ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  19450630 cacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 19450689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28888597 - 28888275
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  28888597 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 28888505  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28888504 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 28888405  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  28888404 taagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatga 28888305  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  28888304 catttcctagaaactttgaattcgcaagca 28888275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 34268839 - 34269167
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  34268839 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaatttttaagatgtttgtttc 34268931  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    |||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||| ||    
T  34268932 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacatgctcaattt 34269031  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  34269032 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggagaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaa 34269131  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||  ||||||||  |||| | ||||||||||||||    
T  34269132 tcatgacatttcctagaaactttgaattcacaagca 34269167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 23122497 - 23122818
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  23122497 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 23122589  T
Q  134 t----attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |    ||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23122590 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 23122689  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  |    
T  23122690 aagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttgcaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagcaatcatta 23122789  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  23122790 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 23122818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 27428366 - 27428692
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| ||||||||||  ||||||||||    
T  27428366 catacactcgctcatgcacgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttgcaattttcaagatgtttgtttc 27428456  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     | ||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| | | ||| ||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27428457 gaacatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgcacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaggctcaaatt 27428556  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27428557 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaa 27428656  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||  ||||||||  |||| | |||| |||||||||    
T  27428657 tcattacatttcctagaaactttgaactcacaagca 27428692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 20844235 - 20843931
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  20844235 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 20844141  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgt--atatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatg 225  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| |  | ||| |||| ||| ||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20844140 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataacttttgaaggtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatg 20844041  T
Q  226 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    |||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20844040 tataagagtggtgtccagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 20843941  T
Q  325 ccacatttcc 334  Q
      ||||||||    
T  20843940 ttacatttcc 20843931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 20 - 109
Target Start/End: Complemental strand, 23117133 - 23117044
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 109  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23117133 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgcccaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaat 23117044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 300 - 356
Target Start/End: Original strand, 31887682 - 31887738
Alignment:
Q  300 ggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  31887682 ggtggtacattgaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 31887738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159 (Bit Score: 275; Significance: 1e-154; HSPs: 2)
Name: scaffold0159
Description:

Target: scaffold0159; HSP #1
Raw Score: 275; E-Value: 1e-154
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 3094 - 3453
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3094 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3193  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  3194 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 3293  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3294 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 3393  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3394 cacagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacagaaacttctgatga 3453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0159; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 20 - 209
Target Start/End: Complemental strand, 18147 - 17952
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  18147 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 18048  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaga--aaaatag-agtttcaaacaaaagca 209  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| | |||||||||||||||    
T  18047 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagca 17952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 272; Significance: 1e-152; HSPs: 49)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 272; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11555699 - 11555382
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||    
T  11555699 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaagaagttttcaattttcaaaatg 11555600  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  11555599 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctc 11555500  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11555499 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 11555400  T
Q  317 agtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||||||||  ||||||||    
T  11555399 agtaatcattacatttcc 11555382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 3795885 - 3795539
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  3795885 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 3795786  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  3795785 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 3795686  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3795685 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 3795586  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 361  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  3795585 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcacaga 3795539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 33881472 - 33881133
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  33881472 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 33881373  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  33881372 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtggaaaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggct 33881273  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33881272 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 33881173  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  33881172 cagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33881133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 18369347 - 18369686
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18369347 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18369446  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||| |    
T  18369447 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcgaaggtt 18369546  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18369547 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18369646  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  18369647 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 18369686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30174812 - 30174471
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  30174812 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 30174713  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  30174712 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 30174613  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30174612 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 30174513  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  30174512 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 30174471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 13318651 - 13318982
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  13318651 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 13318750  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  13318751 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 13318850  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13318851 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 13318950  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
      ||||||||| |||| | ||||||| |||||    
T  13318951 taacatttcccagaaactttgaattcgcaagc 13318982  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 34 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 6880636 - 6880331
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  6880636 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 6880537  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
    ||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  6880536 ttgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtcttaaacaaaagcacaggctcaatttgatgtata 6880437  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  6880436 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattaca 6880337  T
Q  330 tttccc 335  Q
    ||||||    
T  6880336 tttccc 6880331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 9323814 - 9323466
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  9323814 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 9323715  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  9323714 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 9323616  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9323615 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 9323516  T
Q  325 ccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
      |||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  9323515 ttacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 9323466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 24730308 - 24729977
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag--tgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||    
T  24730308 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtt 24730209  T
Q  126 tcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||||   |||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| |||    
T  24730208 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaggctcaatttg 24730110  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24730109 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 24730010  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    ||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  24730009 cattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 24729977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 37746151 - 37746484
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37746151 catactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37746250  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
     ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||    
T  37746251 gagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattga 37746350  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37746351 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 37746450  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  37746451 atgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 37746484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28655589 - 28655247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaag- 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||      
T  28655589 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaaa 28655490  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     |||||||||| ||||||   ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||    
T  28655489 atgtttgtttcgagcattgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacagg 28655391  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28655390 ctcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28655291  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  28655290 cacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 28655247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 40467368 - 40467708
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  40467368 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 40467467  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  40467468 gtttgtttcaagcattgtcattattaaaatggaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagct 40467567  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40467568 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 40467667  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  40467668 cagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40467708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12138513 - 12138165
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  12138513 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 12138414  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  12138413 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 12138315  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12138314 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 12138215  T
Q  325 ccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
      |||||||||   ||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  12138214 ttacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 12138165  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 9544522 - 9544842
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  9544522 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 9544621  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  9544622 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacag 9544720  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9544721 gctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 9544820  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||||||||||||  ||||||||    
T  9544821 acacagtaatcattacatttcc 9544842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 37665315 - 37665642
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||    
T  37665315 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagc 37665413  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  37665414 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 37665513  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  37665514 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 37665613  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| |||||| ||||||| ||||||    
T  37665614 atttcccagaaattttgaattcgcaagca 37665642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 13436489 - 13436836
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  13436489 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 13436588  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaa-tgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagtttcaaacaaaagcac 210  Q
      |||||||||||||| ||   |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13436589 aatgtttgtttcaagcgttgccattatcaaaatagaaagaaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagtttcaaacaaaagcac 13436688  T
Q  211 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacat 309  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13436689 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacat 13436788  T
Q  310 tgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||| |||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  13436789 tgaacacagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 13436836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 30035763 - 30035431
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||  |||||||||    
T  30035763 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcagttttcaaaaatgtttgttt 30035664  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  30035663 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattttaaacaaaagcacaggctcaatttga 30035565  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  30035564 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatc 30035465  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  30035464 atgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 30035431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 15752681 - 15753008
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  15752681 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 15752780  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    ||| |||   |||||||    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15752781 aagtattgtcattatca----agaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 15752875  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  15752876 gtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacagtaatca 15752975  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
      ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  15752976 tgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 15753008  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 37352467 - 37352816
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37352467 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 37352566  T
Q  128 aagcatt---attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||   |||||||| | | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  37352567 aagcattgtcattatcaaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 37352665  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37352666 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 37352765  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||  ||||||||| |||| | ||||| ||||||  ||||| ||| ||||||    
T  37352766 catgacatttcccagaaactttgaatccacaagtgcagaagcttttgatga 37352816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 2517412 - 2517054
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  2517412 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 2517313  T
Q  118 -tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||| |    
T  2517312 atgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatctcaaacaaaagcacaag 2517214  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2517213 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgagggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 2517114  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||  ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  2517113 cacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 2517054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23632317 - 23631997
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaag--ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||  ||||||||||||||     
T  23632317 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaaatagacaaaaagctttttcaattttcaag 23632218  T
Q  117 gtgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     ||||| |||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  23632217 atgtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaag 23632118  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23632117 ctcaaattgatgcataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacgaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 23632018  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||| |||||||  ||||||||    
T  23632017 cacggtaatcattacatttcc 23631997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 30158372 - 30158063
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  30158372 catattctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 30158273  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  30158272 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaggtagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattga 30158173  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  30158172 tgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 30158073  T
Q  324 accacatttc 333  Q
    || |||||||    
T  30158072 actacatttc 30158063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 31820233 - 31820580
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  31820233 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 31820332  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  31820333 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 31820431  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  31820432 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaacca 31820531  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  31820532 ctacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 31820580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5644136 - 5643828
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||    
T  5644136 catactctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcgattttcaaaaatgtttgttt 5644038  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    || |||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5644037 caggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaa-tagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 5643939  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5643938 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtgatc 5643839  T
Q  324 accacatttcc 334  Q
    |  ||||||||    
T  5643838 atgacatttcc 5643828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 22894761 - 22894405
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  22894761 gacatcaacatacactcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaccttttcaattttcaagat 22894663  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  22894662 gtttgtttcaagcatggtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggct 22894563  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22894562 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 22894463  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||| ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  22894462 cagtaaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 22894405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 340
Target Start/End: Original strand, 18494583 - 18494906
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18494583 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18494682  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| |||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||||| |||||    
T  18494683 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaagtaaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tggagttttcaaacaaaagcaaaggct 18494781  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18494782 caaattgatgtatgagagtggtggtcggccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18494881  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaa 340  Q
    ||| |||||  |||||||| |||||    
T  18494882 cagcaatcattacatttcctggaaa 18494906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 33522721 - 33522382
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  33522721 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 33522622  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaaga-aaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || | |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  33522621 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattg 33522522  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33522521 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 33522422  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    ||  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  33522421 cattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 33522382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 37761329 - 37760987
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaag- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||      
T  37761329 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 37761230  T
Q  118 tgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  37761229 tgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 37761131  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37761130 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 37761031  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  37761030 cacagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 37760987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 43084604 - 43084270
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||    
T  43084604 gacatcaacatactctcgttcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaactttcaaaatg 43084505  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| |||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  43084504 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 43084406  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43084405 tcaaattgatgcataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 43084306  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattc 350  Q
    ||||||||||  |||||||||| ||| | |||||||    
T  43084305 acagtaatcattacatttcccgaaaactttgaattc 43084270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 32590091 - 32590447
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  32590091 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 32590190  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||| |||||| |||||   |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||    
T  32590191 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagttttaaacaaaagcacaggct 32590289  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||| |||| ||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32590290 caatttgatgtataagagtggtagtcggccaaaggcatgaccccacgaattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 32590389  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||| |||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  32590390 cagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 32590447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 13180608 - 13180944
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  ||    
T  13180608 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatg 13180702  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  13180703 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 13180802  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  13180803 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 13180902  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  13180903 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 13180944  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 34622865 - 34622524
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  34622865 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 34622766  T
Q  119 gtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  34622765 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagct 34622666  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  34622665 caaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 34622566  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  34622565 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 34622524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Original strand, 8659295 - 8659625
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  8659295 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 8659394  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| || |||||||| |||    
T  8659395 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaaacaaaggctcaacttg 8659493  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  8659494 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggcgaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 8659593  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    ||  ||||||||| |||| | ||||||||||||    
T  8659594 cattacatttccc-gaaactttgaattcacaag 8659625  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 11329985 - 11329644
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||  |    
T  11329985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttaaaaat 11329886  T
Q  119 gtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatat--agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaa-caaaagcacag 212  Q
    ||||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||| ||    
T  11329885 gtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaaacaaaagcaaag 11329787  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11329786 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 11329687  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  11329686 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 11329644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 26486723 - 26486385
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26486723 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26486624  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26486623 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa-----------atagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 26486535  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26486534 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 26486435  T
Q  325 ccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
      |||||||||   ||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  26486434 ttacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 26486385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 18122245 - 18122572
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||  |||||||||||||||    
T  18122245 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttctcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 18122343  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-atagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    ||   |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18122344 ttgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 18122443  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18122444 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 18122543  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    || |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  18122544 atctcctagaaactttgaattcgcaagca 18122572  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 33298869 - 33298522
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  33298869 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 33298770  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatg 225  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | |||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  33298769 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatg 33298670  T
Q  226 tataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 325  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  33298669 tataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccac 33298570  T
Q  326 cacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
     ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  33298569 tacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 33298522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 41681037 - 41680710
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41681037 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagca 41680939  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    ||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41680938 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 41680839  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||| | |||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |    
T  41680838 taagagtggtggtcagccaagggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccatta 41680739  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  41680738 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 41680710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Original strand, 28953609 - 28953952
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||  ||||  ||||||||||||||    
T  28953609 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattcccaaaaatgtttgtttcaagc 28953707  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  28953708 attgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgta 28953806  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  28953807 taagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacta 28953906  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||  ||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28953907 cagctcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28953952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31437803 - 31437469
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||| ||    
T  31437803 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatg 31437710  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31437709 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 31437610  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31437609 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 31437510  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  31437509 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31437469  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25206630 - 25206266
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25206630 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25206532  T
Q  115 aagtgtttgtttcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagc 208  Q
    |  |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25206531 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagc 25206432  T
Q  209 acaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25206431 acaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtac 25206332  T
Q  308 attgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||   ||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  25206331 attgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatga 25206266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25270786 - 25270422
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-----ttttcaattttca 114  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||      |||||||||||||    
T  25270786 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgttcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaactttttcaattttca 25270688  T
Q  115 aagtgtttgtttcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagc 208  Q
    |  |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  25270687 agatgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagc 25270588  T
Q  209 acaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtac 307  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  25270587 acaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtac 25270488  T
Q  308 attgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||| |||||| ||||||||   ||| ||||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  25270487 attgaacacagcaatcactacatttcctataaactctgaattcgcaaacataggagcttctgatga 25270422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 15652589 - 15652914
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    | | | ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  15652589 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttttttaaaaaaaaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 15652687  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15652688 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 15652787  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  15652788 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattagttggtggtacattgaacacagcaatcatgacat 15652887  T
Q  331 ttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  15652888 ttcctagaaactttgaattcgcaagca 15652914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 22992953 - 22993272
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||| || ||||||| |||||    
T  22992953 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgcttgtttcgagcat 22993045  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
     ||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22993046 catcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 22993145  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||   ||||    
T  22993146 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcgatacat 22993245  T
Q  331 ttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  22993246 ttcctgaaaactttgaattcgcaagca 22993272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23898206 - 23897902
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||          |||||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  23898206 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt----------caaaactttttcaattttcaagatgtttgtttc 23898117  T
Q  128 aagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaa 219  Q
    |||||||    ||||| || ||||||||||||||||||    ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  23898116 aagcatttgtcattattaaaatagaaagaaaatgttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaa 23898017  T
Q  220 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23898016 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatgaatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagc 23897917  T
Q  320 aatcaccacatttcc 334  Q
    |||||  ||||||||    
T  23897916 aatcattacatttcc 23897902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33783814 - 33783492
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  33783814 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 33783723  T
Q  134 t----attatcaaga--tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 226  Q
    |    ||||| || |  ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33783722 ttgtcattattaaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 33783623  T
Q  227 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||      
T  33783622 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 33783523  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  33783522 acatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33783492  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 24976175 - 24975877
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| ||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24976175 ctcgctcatgcatatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24976084  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  24976083 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacagactcaaattgatgta 24975984  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |    
T  24975983 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacaacaatcatta 24975884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 37 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24608570 - 24608250
Alignment:
Q  37 gctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcatt-- 134  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||||      
T  24608570 gctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcatttg 24608478  T
Q  135 --attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
      ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||   |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24608477 tcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttcaaacaaaagcacatgctcaaattgatgtataa 24608378  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||  |||    
T  24608377 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaacaatcattaca 24608278  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  24608277 tttcctagaaactttgaattcgcaagca 24608250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 30940968 - 30940642
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  30940968 catacactcgctcatgcatgtt-cttttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------actttttcaattttcaagatgtttgtttc 30940878  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  30940877 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagaatttcaaacaaaagcacaggctcaaata 30940778  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  30940777 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagca 30940678  T
Q  321 atcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  30940677 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 30940642  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 58)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 32296932 - 32296574
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  32296932 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 32296833  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||| ||||    
T  32296832 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaaggc 32296733  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32296732 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcacgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 32296633  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  32296632 acagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcacaagcgcagaaacttctgatga 32296574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 4790591 - 4790932
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4790591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4790690  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4790691 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagct 4790790  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  4790791 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgaatccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 4790890  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    || |||||||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  4790891 acggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 4790932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5728281 - 5727940
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5728281 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5728182  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5728181 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5728082  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5728081 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5727982  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  5727981 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5727940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 47029756 - 47029415
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  47029756 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 47029657  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  47029656 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 47029557  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47029556 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 47029457  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  47029456 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 47029415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 31958413 - 31958734
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31958413 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31958512  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  31958513 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31958612  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31958613 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31958712  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  31958713 cacagtaatcattacatttccc 31958734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5717371 - 5717030
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5717371 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5717272  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5717271 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5717172  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5717171 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5717072  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  5717071 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5717030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 5764087 - 5764428
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5764087 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5764186  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5764187 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5764286  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5764287 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5764386  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  5764387 acagcaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 5764428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 22381553 - 22381879
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  22381553 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtacactgtcgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 22381651  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  22381652 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 22381751  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  22381752 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 22381851  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  22381852 tttcctagaaactttgaattcgcaagca 22381879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 5603271 - 5603592
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5603271 gacatcaacatactctcgctcatgcatgttttatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5603370  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  5603371 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 5603470  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5603471 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5603570  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  5603571 cacagtaatcattacatttccc 5603592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24334477 - 24334156
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  24334477 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 24334378  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  24334377 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtgtatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 24334278  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24334277 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 24334178  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  24334177 cacagtaatcattacatttccc 24334156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10402450 - 10402110
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10402450 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10402351  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||| || ||||||||||||||    
T  10402350 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaa-aaaaatagaattttaatcaaaagcacaggct 10402252  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10402251 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 10402152  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  10402151 cagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 10402110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 29658926 - 29659283
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  29658926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 29659025  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  29659026 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaaaggct 29659125  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29659126 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 29659225  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  29659226 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 29659283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 5590319 - 5590627
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  5590319 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 5590418  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||    
T  5590419 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggct 5590518  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5590519 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 5590618  T
Q  316 cagtaatca 324  Q
    |||||||||    
T  5590619 cagtaatca 5590627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 22864814 - 22865145
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22864814 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22864913  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22864914 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagc-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 22865012  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22865013 gtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 22865112  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
      ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22865113 tgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22865145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 22879873 - 22880204
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  22879873 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 22879972  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||   | ||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22879973 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaagc-atagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 22880071  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22880072 gtataagagtggtgatcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 22880171  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
      ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  22880172 tgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 22880204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 17970824 - 17971163
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  17970824 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 17970923  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||   |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  17970924 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctc 17971022  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17971023 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacac 17971122  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    || |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  17971123 agcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 17971163  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 28027591 - 28027236
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28027591 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28027492  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||||||||||||| ||||    
T  28027491 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaattttaaacaaaagcacaagctc 28027393  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28027392 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcctgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 28027293  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||| ||| |||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  28027292 agtaatcactacagttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 28027236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4423220 - 4422880
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  4423220 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4423121  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||| |||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4423120 gtttatttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4423022  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4423021 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4422922  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  4422921 acagtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 4422880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 6536701 - 6537042
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||  |    
T  6536701 gacatcaacatactctcgctcatgcatgcttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 6536800  T
Q  119 gtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  6536801 gtttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagct 6536900  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6536901 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 6537000  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  ||||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  6537001 cagtaatcatgacatttcccagaaactttgaattcgcaagca 6537042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 28109917 - 28110271
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagt----gtttg 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||||    
T  28109917 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaacgtttg 28110016  T
Q  124 tttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaa 219  Q
    |||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||||||    
T  28110017 tttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaa 28110116  T
Q  220 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28110117 ttgatgtataagagtggtggtcagcccaaggcatgactccacggattcataaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 28110216  T
Q  320 aatcaccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||  |||||||||   ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  28110217 aatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 28110271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 48472233 - 48471872
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||       
T  48472233 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacagaaagttttcaatttttaaaaaa 48472134  T
Q  118 ---tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
       |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472133 aaatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 48472034  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
     |||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48472033 agctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgagggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 48471934  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||  |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||  || ||||| ||||||    
T  48471933 aacacatcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagcgtaggaacttttgatga 48471872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 4340634 - 4340980
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |    
T  4340634 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaat 4340733  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  4340734 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 4340832  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4340833 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 4340932  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    ||||||||||| |||||||   |||| | ||||| |||||| ||||||    
T  4340933 acagtaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaa 4340980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 234; E-Value: 1e-129
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 20072337 - 20071994
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  20072337 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 20072238  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  20072237 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacag 20072139  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20072138 gctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20072039  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  20072038 acacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 20071994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 10649373 - 10649033
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10649373 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10649274  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10649273 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10649175  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10649174 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10649075  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  ||| |||| ||||| | ||||||| |||||    
T  10649074 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 10649033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 18249040 - 18248683
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||  |    
T  18249040 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagaccaaaggttttcaattttcaaaaat 18248941  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18248940 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatgtagctttgaaagtagaagaaaaatagagttccaaacaaaagcaaaggct 18248841  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18248840 caacttgatgtataagagtgatggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagctcggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 18248741  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18248740 cggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18248683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 349
Target Start/End: Original strand, 18286327 - 18286645
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18286327 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18286425  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18286426 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtat 18286524  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18286525 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 18286624  T
Q  329 atttcccggaaattctgaatt 349  Q
    ||||||| |||| | ||||||    
T  18286625 atttcccagaaactttgaatt 18286645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 34 - 349
Target Start/End: Original strand, 18301628 - 18301946
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  18301628 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 18301726  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  18301727 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtat 18301825  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  18301826 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 18301925  T
Q  329 atttcccggaaattctgaatt 349  Q
    ||||||| |||| | ||||||    
T  18301926 atttcccagaaactttgaatt 18301946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 5020014 - 5019675
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  5020014 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 5019915  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||| |||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||| |||    
T  5019914 gttcgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaag-tagagttttaaacaaaagcacaagct 5019816  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5019815 caaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 5019716  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  5019715 cagtaatcatgacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 5019675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 362
Target Start/End: Original strand, 17978908 - 17979255
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  17978908 gacatcaacataccctcgctcatgcatatttcctttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 17979007  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |    
T  17979008 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtc 17979107  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17979108 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 17979207  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |||| |||||  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  17979208 acagcaatcattacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 17979255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 28345464 - 28345154
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaagtgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  28345464 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 28345365  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  28345364 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcataggctcaatttga 28345266  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28345265 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 28345166  T
Q  324 accacatttccc 335  Q
    |  |||||||||    
T  28345165 attacatttccc 28345154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 11104319 - 11104628
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  11104319 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 11104418  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatat--agctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||||   |||||| |||||| ||||||   ||||||||  ||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104419 tttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaggaaaataaattgtatatttagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 11104518  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11104519 tcaaattgatgtataagagtggtagtcagccgaaggcgtggctccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 11104618  T
Q  315 acagtaatca 324  Q
    |||| |||||    
T  11104619 acagcaatca 11104628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 7079529 - 7079183
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc-aattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||| |    
T  7079529 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttttaattttcaaaat 7079430  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgtatata----gctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcac 210  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||| ||||||||||||||||||||||||    |||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||    
T  7079429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagaatagaaagaaaatgttttgtatatatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcac 7079330  T
Q  211 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 310  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7079329 aagctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 7079230  T
Q  311 gaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  7079229 gaacacagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 7079183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 8217936 - 8217593
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  8217936 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 8217837  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacag 212  Q
    |||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||    
T  8217836 tgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaag 8217738  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8217737 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggatccacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 8217638  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||||| |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  8217637 acacagtaatcactacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 8217593  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16422485 - 16422128
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| |||| ||||||||||  |    
T  16422485 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatacacaaaaactttttcaattttcaagat 16422387  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||| |||    
T  16422386 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaagg 16422287  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16422286 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16422187  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||  |||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16422186 cacagtaatcattacattt-ccggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 16422128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5473289 - 5472949
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |    
T  5473289 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaat 5473191  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  5473190 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 5473092  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5473091 tcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 5472992  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  5472991 acagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 5472949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 16618455 - 16618808
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaagtgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||| ||||   ||||||||||  |||||||    
T  16618455 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatggacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 16618553  T
Q  125 ttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaa 218  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618554 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaa 16618653  T
Q  219 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16618654 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 16618753  T
Q  319 taatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16618754 taaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 16618808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 34 - 324
Target Start/End: Original strand, 31030217 - 31030504
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  31030217 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 31030310  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  31030311 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgacgtataa 31030410  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31030411 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 31030504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 51788316 - 51787984
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  51788316 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 51788217  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  51788216 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 51788118  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  51788117 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 51788018  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||  ||| |||| ||||| | ||||||| |||||    
T  51788017 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 51787984  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4630072 - 4629730
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4630072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 4629974  T
Q  134 t---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4629973 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 4629875  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  4629874 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattaacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 4629775  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4629774 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4629730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 21680988 - 21680646
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  21680988 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 21680890  T
Q  134 t---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |   |||||||| || |||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21680889 tgtcattatcaaaatggaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtat 21680791  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  21680790 aagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccactac 21680691  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  21680690 agttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 21680646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Original strand, 29142726 - 29143072
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttc--aaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagc 131  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||   |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  29142726 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccatgttgctcaggtttgttttttcaaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagc 29142825  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 226  Q
    |||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||    
T  29142826 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaaaaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgt 29142925  T
Q  227 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  29142926 ataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccact 29143025  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  29143026 acagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 29143072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18231487 - 18231155
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  18231487 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgactgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaaatgtttgttt 18231388  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  18231387 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagttttaaacaaaagcaaaggctcaaattga 18231288  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18231287 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcgcaaatcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 18231188  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |  |||||||| | ||| | ||||||| |||||    
T  18231187 attacatttcctgaaaactttgaattcgcaagc 18231155  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 18336910 - 18336591
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  18336910 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 18336817  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  18336816 tatcattatcataatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatcgatgtataa 18336717  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  18336716 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcattaca 18336617  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    |||||  |||| | ||||||| ||||    
T  18336616 tttcctagaaactttgaattcgcaag 18336591  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 20570812 - 20571161
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  20570812 catacacttgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttattt 20570911  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||    
T  20570912 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaacggctcaacttg 20571010  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20571011 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 20571110  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  20571111 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 20571161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 34 - 350
Target Start/End: Complemental strand, 32445433 - 32445122
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  32445433 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 32445342  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  32445341 tatcattatcaaaacagaaagaaaatgttttgtatataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 32445242  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||    
T  32445241 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgacat 32445142  T
Q  331 ttcccggaaattctgaattc 350  Q
    ||||| |||| | |||||||    
T  32445141 ttcccagaaactttgaattc 32445122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18057565 - 18057222
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  18057565 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 18057466  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| ||    
T  18057465 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacggg 18057366  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18057365 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattga 18057266  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  18057265 acacagcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 18057222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19700792 - 19700431
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaagtgtttgtt 125  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||  ||||||||    
T  19700792 catacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaagatgtttgtt 19700694  T
Q  126 tcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt-----------gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcac 210  Q
    |||||||||    |||||||| ||||||||||||||||||           ||| ||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  19700693 tcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttttttttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcac 19700594  T
Q  211 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 310  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19700593 aggcttaacttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacatt 19700494  T
Q  311 gaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||||||| ||||||||  |||| | ||||||| ||| || || | ||||||||||    
T  19700493 gaacacagtaatcactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacataggagcttctgatga 19700431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4727915 - 4727617
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  4727915 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 4727823  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |    ||||| || | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  4727822 ttgtcattattaaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtat 4727723  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  4727722 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcac 4727623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6208184 - 6207884
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| ||| |    
T  6208184 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcct 6208092  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  6208091 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgacgta 6207992  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  6207991 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatt 6207892  T
Q  327 acatttcc 334  Q
    ||||||||    
T  6207891 acatttcc 6207884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 15735072 - 15735393
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  15735072 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 15735165  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| | ||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15735166 ttgtcattattaaaaatagaagggaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaagaaagc-agagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 15735264  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  15735265 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 15735364  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  15735365 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 15735393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5658425 - 5658095
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||      |||  ||||||||||| ||  ||||||||||    
T  5658425 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcttaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaatttttaagatgtttgtttc 5658333  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    |||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| | ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5658332 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacgttgaaagtaaaaggaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaaat 5658233  T
Q  222 gat--gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 319  Q
    |||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  5658232 gatatgtataagagtggtggtcagccgaaggcctgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacgttgaacacagc 5658133  T
Q  320 aatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  5658132 aatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5658095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35887048 - 35886748
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  35887048 ctcgctcatgtatgtt-cgtttgaatgtaccctgttacacaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 35886956  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35886955 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 35886856  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  35886855 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatt 35886756  T
Q  327 acatttcc 334  Q
    ||||||||    
T  35886755 acatttcc 35886748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 141; E-Value: 8e-74
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 4689939 - 4689613
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  ||||||||||    
T  4689939 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttc 4689848  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||| ||||||| ||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4689847 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataacttagaaagtaaaagaaagc-agagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 4689749  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  4689748 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacgaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacgcagca 4689649  T
Q  321 atcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  4689648 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 4689613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 8283430 - 8283767
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---------ttttcaattttcaaagtgtttgt 124  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | | |||||          ||||||||||||||  || ||||    
T  8283430 ctcgctcatgcatgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttccaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaaactttttcaattttcaagatgcttgt 8283529  T
Q  125 ttcaagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaa 218  Q
    ||| ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||   ||||||||||||||| |||| ||||||    
T  8283530 ttcgagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagtttcaaacaaaaacacatgctcaa 8283629  T
Q  219 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8283630 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacat 8283729  T
Q  319 taatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
     |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  8283730 caatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 8283767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 247 - 357
Target Start/End: Original strand, 15886894 - 15887006
Alignment:
Q  247 aaggcgtgactccacagattc-acaaagcttggaaaatggtaatttt-attggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattct 344  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||||||  |||| | |    
T  15886894 aaggcgtgactccacggattttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctagaaacttt 15886993  T
Q  345 gaattcacaagca 357  Q
    |||||| ||||||    
T  15886994 gaattcgcaagca 15887006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 54; E-Value: 7e-22
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 8002607 - 8002522
Alignment:
Q  271 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||| |||| ||||| | ||||||| |||||    
T  8002607 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 8002522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 218
Target Start/End: Original strand, 15886707 - 15886895
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||||  ||||||||||||||  |||||| |||    
T  15886707 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaa-------aaaactttttcaattttcaagatgtttgcttc 15886798  T
Q  128 aagcatt----atta-tcaagatagaaagaaaat-gttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaa 218  Q
     ||||||    |||| | || |||||| |||| |  ||||||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||    
T  15886799 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaagtatttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaaacacaggctcaa 15886895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 207 - 290
Target Start/End: Original strand, 27561018 - 27561101
Alignment:
Q  207 gcacaggctcaaattgatgtataagag-tggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaatt 290  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||| | ||||||||||| || | |||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  27561018 gcacaggctcaaattgatttaaaagagatggtagccagccgaaggcttggcaccacagat-cacaaagtttggaaaatggtaatt 27561101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0547 (Bit Score: 267; Significance: 1e-149; HSPs: 1)
Name: scaffold0547
Description:

Target: scaffold0547; HSP #1
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 9557 - 9897
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9557 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9656  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  9657 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctc 9756  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  9757 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacac 9856  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  9857 agtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0418 (Bit Score: 264; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0418
Description:

Target: scaffold0418; HSP #1
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 12374 - 12034
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  12374 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 12275  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  12274 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttatatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggct 12176  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12175 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 12076  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||| |||||||| ||||||| ||||||| ||||||    
T  12075 cagtaatcactacatttcctggaaattttgaattcgcaagca 12034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 260; Significance: 1e-145; HSPs: 24)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-145
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 33248690 - 33248365
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  33248690 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 33248591  T
Q  134 t---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33248590 tgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttttaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 33248491  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  ||||    
T  33248490 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacat 33248391  T
Q  331 ttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||  |||| | ||||||| |||||    
T  33248390 ttcctagaaactttgaattcgcaagc 33248365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18797046 - 18796704
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  18797046 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 18796947  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  18796946 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagct 18796847  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  18796846 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttataaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 18796747  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    || |||||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  18796746 acggtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 18796704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 19680786 - 19680430
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  19680786 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 19680687  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  19680686 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctc 19680588  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19680587 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 19680488  T
Q  317 agtaatcaccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||  |||||||||   ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  19680487 agtaatcattacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 19680430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 28355827 - 28356148
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  28355827 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 28355926  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag---tttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||   ||||||||||||||| |||    
T  28355927 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 28356026  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28356027 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 28356126  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  28356127 cacagtaatcattacatttccc 28356148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 31483747 - 31484068
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  31483747 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaggtaccttgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 31483846  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  31483847 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 31483946  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31483947 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 31484046  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  31484047 cacagtaatcattacatttccc 31484068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 9360960 - 9360620
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  9360960 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 9360861  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||    
T  9360860 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggct 9360762  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  9360761 caacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattggaca 9360662  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  9360661 cagtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 9360620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 28 - 361
Target Start/End: Complemental strand, 29835653 - 29835317
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  29835653 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 29835554  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||||||||||||||||| ||||    
T  29835553 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tggagttttcaaacaaaagcacaggctcaatttga 29835455  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  29835454 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 29835355  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagcacaga 361  Q
    |  |||||||||| ||| | |||||||||||| |||||    
T  29835354 attacatttcccgaaaactttgaattcacaagtacaga 29835317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 44567322 - 44567002
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  44567322 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 44567223  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  44567222 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacag 44567124  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44567123 gctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 44567024  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcc 334  Q
    |||||| |||||  ||||||||    
T  44567023 acacagcaatcattacatttcc 44567002  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 22 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 18715819 - 18715478
Alignment:
Q  22 catcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc----aaag 117  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |||     
T  18715819 catcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaaaa 18715720  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||    
T  18715719 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggc 18715621  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18715620 tcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 18715521  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  18715520 acagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 18715478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 31360867 - 31360527
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  31360867 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 31360768  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  31360767 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31360669  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31360668 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31360569  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  ||| |||| ||||| | ||||||| |||||    
T  31360568 acagcaatcattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 31360527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 15773913 - 15773605
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  15773913 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 15773814  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| | |||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| |||    
T  15773813 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaagagaaagaaaatgttttgtatatagctctgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagct 15773714  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15773713 caaattgacgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 15773614  T
Q  316 cagtaatca 324  Q
    |||||||||    
T  15773613 cagtaatca 15773605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 28 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 33265061 - 33264762
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||| ||||    
T  33265061 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgttcgttt 33264962  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33264961 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 33264863  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33264862 tgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 33264763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 12086608 - 12086958
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  12086608 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacagacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 12086707  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  12086708 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttga 12086807  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  12086808 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaac 12086907  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  12086908 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 12086958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 21342047 - 21342366
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  21342047 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 21342146  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    | ||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||| |||||||||||    
T  21342147 gcttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacagaagcacaggct 21342246  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  21342247 caaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 21342346  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcc 334  Q
    ||||||||||  ||||||||    
T  21342347 acagtaatcattacatttcc 21342366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 19202260 - 19202598
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  19202260 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 19202359  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||           ||||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  19202360 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaa-----------atagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 19202448  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19202449 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 19202548  T
Q  325 ccacatttcccggaa-attctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
      |||||||||  || | | |||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  19202549 ttacatttcccaaaagactttgaattcacaagtacagaaacttcagatga 19202598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Original strand, 19911039 - 19911349
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  19911039 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 19911138  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  19911139 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagttttaaacaaaagcacagg 19911238  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19911239 ctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaaaggtaattttattggttggtggtacattgaa 19911338  T
Q  314 cacagtaatca 324  Q
    |||||||||||    
T  19911339 cacagtaatca 19911349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 172; E-Value: 3e-92
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 22074814 - 22075164
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||| | ||||||| ||||| ||||||||| ||||  ||||||||   |||||||||    
T  22074814 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcatgcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttattttcaagaagtttgtttc 22074912  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||||  |||||| ||||    
T  22074913 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcctaggctcgaatt 22075012  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  22075013 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggcaa 22075112  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
     ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||| |||| || ||||||||||    
T  22075113 ccactacatttcctagaaactttgaattcgcaaacacaaaagcttctgatga 22075164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 101 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16260480 - 16260205
Alignment:
Q  101 gttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt 197  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16260480 gttttcgattttcaaaatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttt 16260382  T
Q  198 -caaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattg 296  Q
     |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16260381 tcaaacaaaagcaaaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccgcggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattg 16260282  T
Q  297 gttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||| |||||||   |||| | ||||| |||||| |||||| ||| ||||||    
T  16260281 gttggtggtacattgaacacagcaatcactacatttcttagaaactttgaatccacaagtacagaagcttttgatga 16260205  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 34 - 373
Target Start/End: Original strand, 27602805 - 27603141
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||        || ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  27602805 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgcacaggtttgcttttcaaaa--------aacttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 27602895  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  27602896 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtc 27602995  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  27602996 taagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaaccacta 27603095  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    || |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  27603096 cagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 27603141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Original strand, 19655232 - 19655562
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||      |||| ||||||||||||||  ||||||||||    
T  19655232 catacactcgctcatgcacgttttgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaa------aaaacttttcaattttcaagatgtttgtttc 19655324  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    |||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19655325 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 19655424  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa--ttttattggttggtggtacattgaacacagt 319  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||     
T  19655425 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgagactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttttattggttggtggtacattgaacacagc 19655524  T
Q  320 aatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  19655525 aatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 19655562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Original strand, 2131159 - 2131479
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  2131159 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 2131250  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2131251 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 2131350  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |||||  |    
T  2131351 taagagtggtggtcagccgaaggcgcgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaacacatcaatcatta 2131450  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  2131451 catttcctagaaactttgaattcgcaagc 2131479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 22139231 - 22138904
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||        |  ||||||||||||||   |||||||||    
T  22139231 catacactcgctcatgcacgtttcatttcaatgtaccctgttgctcaagtttgcttt-caaaa--------actttttcaattttcaagacgtttgtttc 22139141  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    |||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22139140 aagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaatt 22139041  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagta 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  22139040 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacaaca 22138941  T
Q  321 atcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  22138940 atcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 22138904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 19694416 - 19694094
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  19694416 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 19694324  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  19694323 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcggagttttaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 19694224  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  19694223 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 19694124  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  19694123 acatttcctagaaactttgaattcgcaagc 19694094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 34 - 317
Target Start/End: Complemental strand, 14569479 - 14569194
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||       ||  ||||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  14569479 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgtctttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttcgagcat 14569388  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgtat-----atagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| | |     ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569387 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 14569288  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 317  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14569287 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacaca 14569194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 27)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 39856985 - 39856630
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  39856985 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 39856886  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| ||||||    
T  39856885 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-agagttttaaacaaaagcaaaggctc 39856787  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  39856786 aaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 39856687  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  39856686 agtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 39856630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 14104892 - 14104554
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14104892 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 14104793  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| ||||||||||||| ||||    
T  14104792 tttgtttcaagcattgtcattaccaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaaagaaaacagagttttaaacaaaagcacaagctc 14104693  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14104692 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 14104593  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    || |||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  14104592 agcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 14104554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 30760112 - 30759775
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  30760112 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 30760013  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  30760012 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctc 30759914  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30759913 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 30759814  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  30759813 agtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 30759775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 20 - 355
Target Start/End: Original strand, 33667718 - 33668055
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  33667718 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaaagtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 33667817  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  33667818 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctc 33667916  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33667917 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 33668016  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  33668017 agtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaag 33668055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 20332337 - 20332678
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  20332337 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 20332436  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  20332437 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 20332536  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20332537 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 20332636  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  20332637 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 20332678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 40099551 - 40099892
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  40099551 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 40099650  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||    
T  40099651 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 40099750  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40099751 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 40099850  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  40099851 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 40099892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 54839740 - 54839400
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  54839740 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 54839641  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  54839640 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttcaagcaaaagcacaggct 54839542  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  54839541 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 54839442  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  54839441 cagtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 54839400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 34182893 - 34183218
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  34182893 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaa-gttttcaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 34182990  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
    ||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  34182991 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 34183090  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  34183091 agagcggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 34183190  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  34183191 tttcccagaaactttgaattcgcaagca 34183218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 27157227 - 27157569
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27157227 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 27157326  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  27157327 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 27157426  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27157427 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 27157526  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  27157527 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 27157569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5700890 - 5700549
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  5700890 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 5700791  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  5700790 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagct 5700692  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  5700691 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 5700592  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  5700591 acagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 5700549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 14753423 - 14753749
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag--tgtttgtttcaagc 131  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||||||||||||||    
T  14753423 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcagatttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaatgtttgtttcaagc 14753521  T
Q  132 att---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtat 228  Q
    |||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  14753522 attgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaatcaaaagcacaggctcaaattgatgtat 14753620  T
Q  229 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccac 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  14753621 aagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgac 14753720  T
Q  329 atttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  14753721 atttcccagaaactttgaattcgcaagca 14753749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 24586276 - 24586617
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586276 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctattgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586375  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagag-tttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||| ||||||    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||    
T  24586376 tttgtttcgagcattgtccttatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 24586475  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  24586476 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaac 24586575  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||  |||||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  24586576 acatcaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 24586617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 5012220 - 5011870
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||    
T  5012220 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtgccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgttt 5012121  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  5012120 caagcattgccattatccaagtagaaagaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaagtagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttga 5012021  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5012020 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaat 5011921  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||  |||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5011920 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5011870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 24118998 - 24118672
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||    
T  24118998 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctccggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaatgtttgtttcaagca 24118900  T
Q  133 tt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtata 229  Q
    ||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24118899 ttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcagacaaaagcacaagctcaaattgatgtata 24118800  T
Q  230 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccaca 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||    
T  24118799 agagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatgaca 24118700  T
Q  330 tttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||| |||| | ||||||| ||||||    
T  24118699 tttcccagaaactttgaattcgcaagca 24118672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 21976046 - 21975708
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  21976046 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 21975947  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    |||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||    
T  21975946 aagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcgcagtctcaaattga 21975847  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  21975846 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatc 21975747  T
Q  324 accacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaa 362  Q
    |  |||||||| || || | ||||| |||||| ||||||    
T  21975746 attacatttcctgggaactttgaatccacaagtacagaa 21975708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 36338455 - 36338774
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36338455 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36338547  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36338548 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 36338647  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||||    
T  36338648 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggcggtacattgaacacagtaatcatgacat 36338747  T
Q  331 ttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
     |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  36338748 ctcctagaaactttgaattcgcaagca 36338774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 18794540 - 18794889
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaa-agtgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||    
T  18794540 catactctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaagaatgtttgttt 18794639  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  18794640 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaatttg 18794738  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  18794739 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacggtaac 18794838  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| ||    |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  18794839 cactacagtttttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 18794889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 215; E-Value: 1e-118
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1906607 - 1906245
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaag 117  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||      
T  1906607 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1906509  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgttt----tgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagca 209  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| |||||||||||||||||    |||| || |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||    
T  1906508 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttcttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaaaagca 1906409  T
Q  210 caggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 309  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1906408 cagactcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagatatacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacat 1906309  T
Q  310 tgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||  | ||||||||||    
T  1906308 tgaacacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacatgagcttctgatga 1906245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 31120433 - 31120744
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-tagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgttt 126  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  31120433 cataccctcgctcatgcatgtttcatttgattgtaccctgttgctcgggtttgcttttcaaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgttt 31120532  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  31120533 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacagtctcaaattg 31120632  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31120633 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttgaaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 31120732  T
Q  323 caccacatttcc 334  Q
    ||  ||||||||    
T  31120733 cattacatttcc 31120744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6576190 - 6575894
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       |||  ||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  6576190 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaag------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcaagcat 6576098  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6576097 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 6575998  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  6575997 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcatcacat 6575898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 15276552 - 15276904
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt---caattttcaaagtgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| |||| ||||| ||||||||| ||||   ||||||||||  |||||||    
T  15276552 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaagtttacttt-caaaacagacaaaaactttttttcaattttcaagatgtttgt 15276650  T
Q  125 ttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaa 219  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| |||||||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15276651 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcgaa 15276750  T
Q  220 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagt 319  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15276751 ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacggt 15276850  T
Q  320 aatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    || ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  15276851 aaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 15276904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 15380161 - 15380510
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||| ||||  | ||||||  ||||||||||    
T  15380161 catacgctcgctcatgcacgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggcttgcttt-caaaacagacaaaaacttttttaatttcaagatgtttgtttc 15380259  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15380260 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcgaattg 15380359  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||  |||     
T  15380360 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacgataac 15380459  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||||||||  |||| | ||||||| |||||||| || |||| |||||    
T  15380460 cactacatttccttgaaactttgaattcgcaagcacaaaagcttcggatga 15380510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1674213 - 1673892
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag--ttttcaattttcaaag 117  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||   ||||||||||||||      
T  1674213 gacatcaacacacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttt-caaaatagacaaaaaactttttcaattttcaaga 1674115  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
    |||||||||||||||||    |||||||| ||||||||||||| ||||  ||| || |||||||||||||||  | | ||||||||||||||||||||||    
T  1674114 tgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttttgtacatggctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaaaagcaca 1674015  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  1674014 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggagtgacaccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtatattg 1673915  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcc 334  Q
    |||||||||| ||| ||||||||    
T  1673914 aacacagtaaccactacatttcc 1673892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15234170 - 15233809
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag------ttttcaattttc 113  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||       ||||||| ||||    
T  15234170 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgcccaggtttgcttt-caaaatagacaaaaaaaaaactttttcaagtttc 15234072  T
Q  114 aaagtgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcac 210  Q
    ||  |||||| ||||||||||   |||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||     
T  15234071 aagatgtttgcttcaagcattgtcattatcaagataaaaagaaatttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaa 15233972  T
Q  211 aggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 310  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15233971 aggctcaaattgatgtataagagtggtggttagccgaaggcgtgactctacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacatt 15233872  T
Q  311 gaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | ||| ||||| ||| ||||||||   ||| | ||||||| |||||||| || ||| ||||||    
T  15233871 ggacatagtaaccactacatttcctataaactttgaattcgcaagcacaaaagcttatgatga 15233809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 34 - 276
Target Start/End: Original strand, 36324246 - 36324484
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  36324246 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaaaatgtttgtttcgagcat 36324338  T
Q  134 tat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataa 230  Q
    |||   |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  36324339 tatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtataa 36324438  T
Q  231 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagctt 276  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  36324439 gagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagctt 36324484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 14671349 - 14671026
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  14671349 ctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 14671256  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtt-ttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  14671255 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttcttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacgggctcaaattgatgta 14671156  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||      
T  14671155 taagagtggtggtcagccgaaggcgtaactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatt 14671056  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||||  |||| | |||||||||||||    
T  14671055 acatttcctagaaactttgaattcacaagc 14671026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 154; E-Value: 1e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17019384 - 17019062
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      |||  ||||||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  17019384 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa------aaactttttcaattctcaagatgtttgtttcgagcat 17019292  T
Q  134 t----attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagcttt-gaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || |||||| ||||||||||| ||| |||||||| ||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  17019291 ttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacatagcttttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcataggctcaaattgatgta 17019192  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||      
T  17019191 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacagtaatcatt 17019092  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  17019091 acatttcctagaaactttgaattcgcaagc 17019062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 259; Significance: 1e-144; HSPs: 12)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 259; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 3647487 - 3647147
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  3647487 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 3647388  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| |||||    
T  3647387 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcaaaggct 3647288  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3647287 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 3647188  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||| ||  ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  3647187 cagtaaccattacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 3647147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 248; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 10969007 - 10968698
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10969007 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 10968908  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  10968907 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggc 10968808  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10968807 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 10968708  T
Q  315 acagtaatca 324  Q
    ||||||||||    
T  10968707 acagtaatca 10968698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 355
Target Start/End: Complemental strand, 28591415 - 28591085
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28591415 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 28591316  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28591315 aagcattgtcattatcaaaatagaaagagaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgat 28591216  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  28591215 gtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatca 28591116  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaag 355  Q
      |||||||| ||||| | ||||||| ||||    
T  28591115 ttacatttcctggaaactttgaattcgcaag 28591085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 28156069 - 28155726
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  28156069 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 28155970  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  28155969 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacag 28155871  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28155870 gctcaatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 28155771  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  28155770 acacagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 28155726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 51644555 - 51644204
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaagtgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||    
T  51644555 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgttt 51644456  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||||||    
T  51644455 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaatt 51644356  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51644355 gatgtgtaagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 51644256  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||  ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  51644255 tcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 51644204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 28 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 10951425 - 10951108
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10951425 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttacttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatgtttgtttc 10951326  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||   |||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||||||||||    
T  10951325 aagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaaattg 10951226  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  10951225 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaat 10951126  T
Q  323 caccacatttcccggaaa 340  Q
    ||  |||||||| |||||    
T  10951125 cattacatttcctggaaa 10951108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 41787224 - 41787566
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  41787224 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 41787323  T
Q  117 gtgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     |||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  41787324 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttaaacaaaagcacaag 41787422  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  41787423 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattga 41787522  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  41787523 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 41787566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 20334330 - 20334689
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  20334330 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 20334428  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||||||     
T  20334429 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaa 20334528  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20334529 tttcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaggcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 20334628  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  20334629 acacagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 20334689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 16201942 - 16202307
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaa 116  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||||||||||||||     
T  16201942 gacatcaacatacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacgaaaaaactttttcaattttcaag 16202040  T
Q  117 gtgtttgtttcaagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-----gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaa 206  Q
     |||||||||||||||||    |||||||| | |||||||||||||||||     ||| || |||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||    
T  16202041 atgtttgtttcaagcatttgtcattatcaaaaatagaaagaaaatgtttttttttgtacatggctttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaa 16202140  T
Q  207 gcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16202141 gcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 16202240  T
Q  307 cattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||| || |||| ||| ||||| | ||||||| ||||||||| | ||||||||||    
T  16202241 cattgaacacagtaattactacatgtcctggaaactttgaattcgcaagcacaggagcttctgatga 16202307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 177; E-Value: 3e-95
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 20467126 - 20466761
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttc--------aattt 111  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||| || |||||||||||||||| |||||||||||  || ||||         |||||    
T  20467126 gacatcaacatacactcgctcacgcatgtttcgtttgaatgtaccttgctgctcaggtttgcttt-caaaatagacaggaactttttttttttctaattt 20467028  T
Q  112 tcaaagtgtttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatg--ttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaa 206  Q
    | ||  |||||||||||||||||||   |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||  ||| |||||||||||||||||    
T  20467027 tgaagatgtttgtttcaagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatggtttttgtacatagctttgaaagtggaaagaaagtagagtttcaaacaaaa 20466928  T
Q  207 gcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 306  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20466927 gcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggta 20466828  T
Q  307 cattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||  || ||||||||  |||| | ||||||  |||||| |||| ||||||||||    
T  20466827 cattgaacacagtaacgactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcatagaagcttctgatga 20466761  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 156; E-Value: 9e-83
Query Start/End: Original strand, 190 - 373
Target Start/End: Original strand, 21891837 - 21892020
Alignment:
Q  190 tagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaat 289  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  21891837 tagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaat 21891936  T
Q  290 tttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21891937 tttattggttggtggtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgaattcacaagcacagaagcttctgatga 21892020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 90
Target Start/End: Original strand, 21891691 - 21891746
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa 90  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21891691 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa 21891746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 2)
Name: scaffold0322
Description:

Target: scaffold0322; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 1988 - 1639
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  1988 catactctcgctcatgcatgtttcatttgatcgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaagtaaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 1889  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1888 caagcattgtcattatcaaaatggaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 1790  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1789 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 1690  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| |||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1689 cactacatttcctggaaattttgaattcataagcacagaaacttctgatga 1639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0322; HSP #2
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 12396 - 12028
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  12396 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 12298  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtat-----------atagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaa 204  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||| ||||||||| | |           ||||||||||||||||||  | | |||||||||||||||    
T  12297 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagcaaatgtttttttttttttttttacatagctttgaaagtagaaagatagtagagtttcaaacaa 12198  T
Q  205 aagcacaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 303  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12197 aagcacaggctcaaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccatggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtg 12098  T
Q  304 gtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||||||| ||||| | ||| ||| |||| |||||| ||||||||||    
T  12097 gtacattgaacatagtaatcactacatttcctggaaactttgagttcgcaagtacagaagcttctgatga 12028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 32)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5164720 - 5164402
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5164720 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5164621  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatag-ctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  5164620 tttgtttcaagcattgttattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatataggctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagct 5164521  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5164520 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaagcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 5164421  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcc 334  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  5164420 cagtaatcattacatttcc 5164402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 24586336 - 24586654
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  24586336 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 24586435  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||||||||    
T  24586436 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaataggaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtcttaaacgaaagcacaggctc 24586535  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24586536 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 24586635  T
Q  317 agtaatcaccacatttccc 335  Q
    ||||||||  |||||||||    
T  24586636 agtaatcattacatttccc 24586654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 20 - 335
Target Start/End: Original strand, 4139046 - 4139367
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4139046 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 4139145  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaa--aaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||| ||| |||||||||||| |||    
T  4139146 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaacaaaatagaattttcaaacaaaagcaaagg 4139245  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4139246 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 4139345  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttccc 335  Q
    |||||||||||  |||||||||    
T  4139346 cacagtaatcattacatttccc 4139367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 26519127 - 26518789
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  26519127 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 26519028  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||    
T  26519027 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctc 26518929  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26518928 aatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 26518829  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  26518828 agtaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26518789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 5154419 - 5154079
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||    
T  5154419 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttggatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatg 5154320  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  5154319 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 5154220  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5154219 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 5154120  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  5154119 agtaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 5154079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 17 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 45393558 - 45393238
Alignment:
Q  17 atggacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 116  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393558 atggacatcaccatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaa 45393459  T
Q  117 g-tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacag 212  Q
      ||||||||||| |||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  45393458 aatgtttgtttcaggcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtgtatagctttgaaagtagaagaaaagtagagttttaaacaaaagcacaa 45393359  T
Q  213 gctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 312  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45393358 gctcaaattgatgtgtaagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattga 45393259  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttc 333  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  45393258 acacagtaatcactacatttc 45393238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 11447216 - 11446867
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc--aaagtgtttgtt 125  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||| ||||||||    
T  11447216 cataccctcgctcatgcatgtttcacttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttttcaaaaatgtttgtt 11447117  T
Q  126 tcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    |||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  11447116 tcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattg 11447018  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11447017 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 11446918  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| |||||||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  11446917 cactacatttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 11446867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 26509496 - 26509839
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-ttttcaattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |    
T  26509496 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaggttttcaattttcaaaat 26509595  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||    
T  26509596 gtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatggagttttcaaacaaaagcacaggc 26509695  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  26509696 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaa 26509795  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||| |||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  26509796 cacagcaatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 26509839  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 4205717 - 4205368
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaatttt-caaagtgtttgttt 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  4205717 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaatttttcaaaatgtttgttt 4205618  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  4205617 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttga 4205519  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 323  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4205518 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatc 4205419  T
Q  324 accacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |  |||||||||   ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  4205418 attacatttcccaaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 4205368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 241; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 31084431 - 31084781
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  31084431 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaaaatttcaattttcaaaaatgtttgttt 31084530  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||    
T  31084531 caagcattgccattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagaatttcaaacaaaagcacaagctcaaattga 31084630  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  31084631 tgtataagagtggtggtcaaccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacagcaat 31084730  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||  |||||||||  ||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  31084731 cattacatttcccaaaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 31084781  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 240; E-Value: 1e-133
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Original strand, 26313658 - 26314006
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  26313658 catactctcgcttatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaggttttcaattttcaaaatgtttgtttc 26313757  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| |||||    
T  26313758 aagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggctcaatttgat 26313856  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26313857 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 26313956  T
Q  325 ccacatttccc-ggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
      |||||||||   ||| | |||||||| ||| ||||||||||| |||||    
T  26313957 ttacatttcccaaaaaactttgaattcataagtacagaaacttcagatga 26314006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 26268886 - 26269247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  26268886 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 26268985  T
Q  118 --tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcaca 211  Q
      |||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  26268986 aatgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtacatagctttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcaca 26269085  T
Q  212 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26269086 ggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattg 26269185  T
Q  312 aacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||||  ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  26269186 aacacagtaatcatgacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 26269247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 16745321 - 16745679
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-- 117  Q
    ||||||| |||||||||  ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
T  16745321 gacatcaacatactctcattcatgcatgtttcgtttgaatataccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 16745420  T
Q  118 tgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    |||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  16745421 tgtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 16745519  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16745520 ctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16745619  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||||||  |||||||||  ||| | ||||||| ||||||||||| |||| |||||    
T  16745620 cacagtaatcattacatttcccaaaaactttgaattcgcaagcacagaagcttcagatga 16745679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 23 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 45737636 - 45737296
Alignment:
Q  23 atcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag----t 118  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     |    
T  45737636 atcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaaat 45737537  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  45737536 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggct 45737438  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45737437 caatttgatgtataagaggggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 45737338  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||| ||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  45737337 cagtgatcatgacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 45737296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 233; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 334
Target Start/End: Original strand, 11418580 - 11418898
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |    
T  11418580 gacatcaacatactctcgctcgtgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaacagacagaaagttttcaattttcaaaaat 11418679  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11418680 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggct 11418779  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11418780 caaatcgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 11418879  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcc 334  Q
    |||||||||  ||||||||    
T  11418880 cagtaatcattacatttcc 11418898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 26663713 - 26664054
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26663713 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26663812  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||| |||||| |   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||    
T  26663813 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26663912  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26663913 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26664012  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  26664013 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26664054  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 26678905 - 26679246
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26678905 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccccgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26679004  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||| |||||| |   |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| | ||||    
T  26679005 tttgtttcgagcattgtcgttatcaaaatataaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagtaaaggc 26679104  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26679105 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26679204  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  26679205 acagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26679246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Original strand, 31558195 - 31558535
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  31558195 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 31558294  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||| |||   |||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| ||||    
T  31558295 gtttgtttcaagtattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgatttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggc 31558393  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31558394 tcaacttgatgtataaaagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 31558493  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||| ||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  31558494 acagtgatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 31558535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 367
Target Start/End: Complemental strand, 26441590 - 26441238
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  26441590 gacatcaacacactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaatg 26441491  T
Q  120 tttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaa-tagagtttc-aaacaaaagcacaggc 214  Q
    |||||||||||||||   |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||  ||||||||||| ||||    
T  26441490 tttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaagaaaaaatggagtttttaaacaaaagcaaaggc 26441391  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26441390 tcaaattgatgtataagagtggcggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 26441291  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttc 367  Q
    ||||||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||||    
T  26441290 acagtaaccactacagttcatagaaactttgaattcacaagtacagaagcttc 26441238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 230; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Original strand, 5141135 - 5141493
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  5141135 gacatcaacataccctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaat 5141234  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||    
T  5141235 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatatttttgtatataactttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaagg 5141333  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5141334 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 5141433  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||||||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  5141434 cacagtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 5141493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 227; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 16047640 - 16047294
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||   ||||||||||    
T  16047640 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtatcctgttgctcaggcttgcttt-caaaatagacaaaaacttttcaattttcaggatgtttgtttc 16047542  T
Q  128 aagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgat 224  Q
    |||||||   |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||||  ||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16047541 aagcattgtcattatcaagatagaaagaaaat-ttttgtacatagctttgacagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcaaaggctcaaattgat 16047443  T
Q  225 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatca 324  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  16047442 gtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacatagtaatca 16047343  T
Q  325 ccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    | |||||||| ||||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  16047342 ctacatttcctggaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 16047294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 3451647 - 3451297
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag---tgtttgt 124  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |||||||    
T  3451647 cataccctcgctcatgcatgttccatttgattgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaaatgtttgt 3451548  T
Q  125 ttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
    ||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||  |||||||||    
T  3451547 ttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcaccagctcaaatt 3451449  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  3451448 gatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaaacttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtga 3451349  T
Q  322 tcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| |||| |||||    
T  3451348 tcactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttcagatga 3451297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 220; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Original strand, 39206948 - 39207280
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  39206948 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaataaacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 39207047  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaagcacaggctcaaattg 222  Q
    ||||||||   |||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||| |||||||| |||    
T  39207048 caagcattgtcattatcaaaatagaaggaaaatattttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaagcaaaggctcaacttg 39207146  T
Q  223 atgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  39207147 atgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttatcggttggtggtacattgaacacagcaat 39207246  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||  ||| |||| ||||| | ||||||| |||||    
T  39207247 cattacacttcctggaaactttgaattcgcaagc 39207280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 2779582 - 2779247
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||| ||    
T  2779582 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 2779488  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  2779487 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 2779388  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2779387 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 2779288  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  2779287 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 2779247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 31130235 - 31129900
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtg 119  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     ||||  ||||||||||||||| ||    
T  31130235 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtctcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-----aaaactttttcaattttcaaaatg 31130141  T
Q  120 tttgtttcaagcattat---tatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctc 216  Q
    |||||||| ||||||||   |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||| ||||    
T  31130140 tttgtttcgagcattatcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaagctc 31130041  T
Q  217 aaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 316  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31130040 aaatagatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacac 31129941  T
Q  317 agtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| |||  |||| | ||||||| ||||||    
T  31129940 agtaatcatgacatctcctagaaactttgaattcgcaagca 31129900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 2160908 - 2160566
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  2160908 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcagatttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 2160809  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||| ||   ||||||||||| |||||||||||||||    
T  2160808 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtaaaaaggaaatagagttttaaacaaaagcacagg 2160709  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  2160708 ctcaatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaa 2160609  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    ||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  2160608 cacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 2160566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 359
Target Start/End: Original strand, 16443804 - 16444148
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||  |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  16443804 gacatcaacatatgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttt-caaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 16443902  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt--gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||  ||| |||||||| ||||||||||| |||    
T  16443903 gtttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgttttttgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagttttaaacaaaagcaaagg 16444002  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16444003 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcaggcgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaa 16444102  T
Q  314 cacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcaca 359  Q
    ||||||||  || |||||||   |||| | ||||||| ||||||||    
T  16444103 cacagtaacgactacatttcttagaaactttgaattcgcaagcaca 16444148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 10847915 - 10847562
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag---ttttcaattttcaaagtgtttgt 124  Q
    ||||| ||| |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| |||||||||    ||||||||||||||  |||||||    
T  10847915 catacgctcactcatgcacgtttcgtttgaacgtaccttgttgctcaggtttacttt-caaaacagacaaaaaacttttttcaattttcaagatgtttgt 10847817  T
Q  125 ttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaa 218  Q
    ||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||   ||| |||||||||||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||| |    
T  10847816 ttcaagcattgtcattatcaagatagaaagaaaatgtttttttgtacatagctttgaaagtagagagaaaatagagtttcagacaaaagcacaggctcga 10847717  T
Q  219 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacag 318  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10847716 attgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaacacag 10847617  T
Q  319 taatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| ||||||||  |||| | ||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  10847616 taaccactacatttcctagaaactttgaattcgcaagcacagaagcttctgatga 10847562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 179; E-Value: 2e-96
Query Start/End: Original strand, 20 - 270
Target Start/End: Complemental strand, 26596006 - 26595750
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc-aaagt 118  Q
    ||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  26596006 gacatcaacatactctcactcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 26595907  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaaatagag-tttcaaacaaaagcacagg 213  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| |||    
T  26595906 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaataaaaagaaaatgtgttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaaatagagttttcaaacaaaagcaaagg 26595807  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcaca 270  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||    
T  26595806 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcaca 26595750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Original strand, 16512255 - 16512576
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        |  ||| ||||| ||||  |||||||||| |||||    
T  16512255 ctcgctcatgcatatttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa--------acttttccaattatcaagatgtttgtttcgagcat 16512346  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16512347 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggcttaaattgatgta 16512446  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |    
T  16512447 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcatta 16512546  T
Q  328 catttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  16512547 catttcctagaaactttgaattcgcaagca 16512576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 334
Target Start/End: Original strand, 10910735 - 10911039
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttc 127  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  || |||||||    
T  10910735 catacactcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccatgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgcttgtttc 10910826  T
Q  128 aagcatt----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 221  Q
     ||||||    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10910827 gagcatttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaatt 10910926  T
Q  222 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaa 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| |||| ||| |||||||||||||| ||    
T  10910927 gatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaattttatgggttagtgatacattgaacacagcaa 10911026  T
Q  322 tcaccacatttcc 334  Q
    |||  ||||||||    
T  10911027 tcattacatttcc 10911039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 271 - 356
Target Start/End: Original strand, 26531926 - 26532011
Alignment:
Q  271 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  26531926 aagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaacacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 26532011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0237 (Bit Score: 244; Significance: 1e-135; HSPs: 1)
Name: scaffold0237
Description:

Target: scaffold0237; HSP #1
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 8844 - 9184
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  8844 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaagtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttttaattttcaaaaat 8943  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||| ||||||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||| |||    
T  8944 gttcgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagaatttcaaacaaaagcacaagct 9042  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9043 caaattgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 9142  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  |||||||||  ||| | ||||||| ||||||    
T  9143 cagtaatcatgacatttcccaaaaactttgaattcgcaagca 9184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0254 (Bit Score: 236; Significance: 1e-130; HSPs: 1)
Name: scaffold0254
Description:

Target: scaffold0254; HSP #1
Raw Score: 236; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 20 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 18926 - 18584
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttc---aaa 116  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||    
T  18926 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaaa 18827  T
Q  117 gtgtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacagg 213  Q
     |||||||||| ||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |    
T  18826 atgtttgtttcgagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaag-aaaatagagttttaaacaaaagcacaag 18728  T
Q  214 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  18727 ctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccggaggcgtgaccccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattga 18628  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
    |||||| |||||  |||||||| ||||| | ||||||| |||||    
T  18627 acacagcaatcattacatttcctggaaactttgaattcgcaagc 18584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143 (Bit Score: 232; Significance: 1e-128; HSPs: 2)
Name: scaffold0143
Description:

Target: scaffold0143; HSP #1
Raw Score: 232; E-Value: 1e-128
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 10252 - 9912
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-t 118  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |    
T  10252 gacatcaacatactctcgcttatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaat 10153  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggct 215  Q
    ||||||||||| ||||   |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  10152 gtttgtttcaaacattgtcattatcaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaaatagaagaaaa-tagagttttaaacaaaagcacaggct 10054  T
Q  216 caaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaaca 315  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  10053 caatttgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcatggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtgatacattgaaca 9954  T
Q  316 cagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    |||||||||  ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  9953 cagtaatcattacatttcctagaaactttgaattcgcaagca 9912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0143; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 6e-84
Query Start/End: Original strand, 34 - 357
Target Start/End: Complemental strand, 33619 - 33295
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagca 132  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||     ||||  ||||||||||||||  |||||||||| ||||    
T  33619 ctcgctcatgcatgtt-catttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttacaaaa-----aaaactttttcaattttcaagatgtttgtttcgagca 33526  T
Q  133 tt----attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    ||    ||||| || |||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33525 tttgtcattattaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaaacagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 33426  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||  |||||      
T  33425 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtgatacattgaacacaacaatcatt 33326  T
Q  327 acatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||  |||| | ||||||| ||||||    
T  33325 acatttcctagaaactttgaattcgcaagca 33295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0792 (Bit Score: 231; Significance: 1e-127; HSPs: 1)
Name: scaffold0792
Description:

Target: scaffold0792; HSP #1
Raw Score: 231; E-Value: 1e-127
Query Start/End: Original strand, 20 - 357
Target Start/End: Original strand, 4518 - 4862
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagtttt-caattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||| ||||||||||  |    
T  4518 gacatcaacatacactcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttcaaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 4617  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||||   |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  4618 gtttgtttcaagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgtttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaagc 4717  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattgg-ttggtggtacattga 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  4718 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggtttggtggtacattga 4817  T
Q  313 acacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagca 357  Q
    ||||||||||||  |||||||| | ||| | ||||||| ||||||    
T  4818 acacagtaatcattacatttcctgaaaactttgaattcgcaagca 4862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0038 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0038
Description:

Target: scaffold0038; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 14281 - 13931
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag-tgtttgttt 126  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14281 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaacgtaccctgttgctcaggcttgcttttcaaaacacacaaaaagttttcaattttcaaaaatgtttgttt 14182  T
Q  127 caagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattga 223  Q
    ||||||||   |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||    
T  14181 caagcattgtcattatcaaaatagaaagaaaatgttttgtatacagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaacagcacaagctcaatttga 14082  T
Q  224 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaat 322  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  14081 tgtataagagtggtggtcagccgaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacacggtaac 13982  T
Q  323 caccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  13981 cactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 13931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0336 (Bit Score: 206; Significance: 1e-112; HSPs: 1)
Name: scaffold0336
Description:

Target: scaffold0336; HSP #1
Raw Score: 206; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 20 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 15915 - 15551
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttt-caaaatagacaaaaagttttcaattttcaaag- 117  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||      
T  15915 gacatcaacatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgctttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaaaa 15816  T
Q  118 -----tgtttgtttcaagcattattatc----aagatagaaagaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagttt-caaacaaaag 207  Q
         |||||||||| |||||| | |||    || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||    
T  15815 aaaaatgtttgtttcgagcattgtcatcgtttaaaatagaaggaaaatgttttgtatatagctttgaaagtagaagaaaa-tagagttttcaaacaaaag 15717  T
Q  208 cacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 307  Q
    || |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15716 caaaggctcaacttgatgtataagagtggtggtcagccaaaggcatgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtac 15617  T
Q  308 attgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||| |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  15616 attgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 15551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 189; Significance: 1e-102; HSPs: 1)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 28 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 25454 - 25097
Alignment:
Q  28 catactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaag-------ttttcaattttcaaagtgt 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||        ||||||||||||||  |||    
T  25454 catacgctcgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccttgttgctcaggtttgcttt-caaaacagacaaaaaacttttttttttcaattttcaagatgt 25356  T
Q  121 ttgtttcaagcatt---attatcaagatagaaagaaaatgtttt---gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggc 214  Q
    ||||||||||||||   |||||||||||||||||| ||||||||   ||| ||||||||||||||||||  ||| ||||||||||||||||||| |||||    
T  25355 ttgtttcaagcattgtcattatcaagatagaaagataatgttttttcgtacatagctttgaaagtagaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcgcaggc 25256  T
Q  215 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtacattgaac 314  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  25255 tcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggtgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggcaattttattggttggtggtacattgaac 25156  T
Q  315 acagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    || |||| ||| ||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  25155 acggtaaccactacatttcctagaaactttgaatttgcaagcacagaagcttctgatga 25097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 153; Significance: 5e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 34 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 6388 - 6065
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       ||  ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  6388 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaa-------aactttttcaattttcaagatgtttgtttcaagcat 6296  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgttttgt--atatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgt 226  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| |  | ||| ||||||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||  ||||||    
T  6295 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgttttttgaacataactttgaaagtaaaaagaaagtagagtttcaaacaaaagcacaggctcaatatgatgt 6196  T
Q  227 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcac 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||     
T  6195 ataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttactggttggtggtacattgaacacagcaatcat 6096  T
Q  326 cacatttcccggaaattctgaattcacaagc 356  Q
     ||||||||  |||| | ||||||| |||||    
T  6095 tacatttcctagaaactttgaattcgcaagc 6065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0240 (Bit Score: 148; Significance: 5e-78; HSPs: 1)
Name: scaffold0240
Description:

Target: scaffold0240; HSP #1
Raw Score: 148; E-Value: 5e-78
Query Start/End: Original strand, 34 - 334
Target Start/End: Original strand, 24835 - 25135
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaagttttcaattttcaaagtgtttgtttcaagcat 133  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||      |||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||    
T  24835 ctcgctcatgcatgtt-cgtttgaatgtaccctgttgctcaggttttcttttcaaaa------aaaaattttcaattttcaagatgtttgtttcgagcat 24927  T
Q  134 t----attatcaaga-tagaaagaaaatgtttt-gtatatagctttgaaagtagaagaaaaatagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 227  Q
    |    ||||| || | ||||| ||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||  |||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24928 ttgtcattattaaaaatagaaggaaaatgtttttgtacataactttgaaagtaaaaagaaagcagagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgta 25027  T
Q  228 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaa-ttttattggttggtggtacattgaacacagtaatcacc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||      
T  25028 taagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggatttacaaagcttggaaaatggtaatttttattggttggtggtacattgaacccagcaatcatt 25127  T
Q  327 acatttcc 334  Q
    ||||||||    
T  25128 acatttcc 25135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0288 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0288
Description:

Target: scaffold0288; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 192 - 373
Target Start/End: Complemental strand, 540 - 359
Alignment:
Q  192 gagtttcaaacaaaagcacaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattt 291  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  540 gagtttcaaacaaaagcacaagctcaaattgatgtatgagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacggattcacaaagcttggaaaatggtaattt 441  T
Q  292 tattggttggtggtacattgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| ||| |||   |||| | |||||||||||| |||||| ||| ||||||    
T  440 tattggttggtggtacattgaacacggtaaccactacagttcttagaaactttgaattcacaagtacagaagcttttgatga 359  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0241 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0241
Description:

Target: scaffold0241; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 209 - 373
Target Start/End: Original strand, 26241 - 26405
Alignment:
Q  209 acaggctcaaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgactccacagattcacaaagcttggaaaatggtaattttattggttggtggtaca 308  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||||||    
T  26241 acaggctcgaattgatgtataagagtggtggtcagccgaaggcgtgacttcacagatttacaaagcttgaaaaatggaaattttatttgttggtggtaca 26340  T
Q  309 ttgaacacagtaatcaccacatttcccggaaattctgaattcacaagcacagaaacttctgatga 373  Q
    |||| ||| |||| ||| ||||||||  |||| | ||||||  ||||||||||| ||||||||||    
T  26341 ttgagcacggtaaccactacatttcctagaaactttgaattagcaagcacagaagcttctgatga 26405  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 20 - 134
Target Start/End: Complemental strand, 126 - 12
Alignment:
Q  20 gacatcatcatactctcgctcatgcatgtttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttgcttttcaaaatagacaaaaa-gttttcaattttcaaagt 118  Q
    ||||||| ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||  ||||||||||||||  |    
T  126 gacatcaacatacacttgctcatgcatgtttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttgc-tttcaaaatagacaaaaactttttcaattttcaagat 28  T
Q  119 gtttgtttcaagcatt 134  Q
    ||||||||||||||||    
T  27 gtttgtttcaagcatt 12  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099 (Bit Score: 52; Significance: 1e-20; HSPs: 2)
Name: scaffold0099
Description:

Target: scaffold0099; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 203 - 308
Target Start/End: Original strand, 40744 - 40855
Alignment:
Q  203 aaaagcacaggctcaaa-ttgatgtataagagtggtggtc-agccgaaggcgtgactcc-acagattcac-aaagcttgg-aaaatggtaa-ttttattg 296  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| || |||| || ||||||||| |||||||||| ||||||||    
T  40744 aaaagcacagactcaaaattgatgtataagagtggtggtcaagccgaaggcgtgactccaacggatttacaaaagcttggaaaaatggtaatttttattg 40843  T
Q  297 gttggtggtaca 308  Q
    ||||||||||||    
T  40844 gttggtggtaca 40855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0099; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000009
Query Start/End: Original strand, 34 - 80
Target Start/End: Original strand, 40559 - 40606
Alignment:
Q  34 ctcgctcatgcatg-tttcatttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 80  Q
    |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  40559 ctcgctcatgcattatttcgtttgaatgtaccctgttgctcaggtttg 40606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University