View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15621_high_4 (Length: 335)

Name: NF15621_high_4
Description: NF15621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15621_high_4
NF15621_high_4
[»] scaffold0036 (3 HSPs)
scaffold0036 (102-335)||(66277-66510)
scaffold0036 (11-106)||(66045-66140)
scaffold0036 (11-106)||(71186-71281)
[»] scaffold0031 (4 HSPs)
scaffold0031 (102-335)||(53576-53809)
scaffold0031 (11-106)||(53946-54041)
scaffold0031 (194-325)||(36046-36171)
scaffold0031 (272-325)||(65838-65891)
[»] chr7 (114 HSPs)
chr7 (102-335)||(11312659-11312892)
chr7 (105-335)||(12318138-12318368)
chr7 (102-332)||(15605134-15605365)
chr7 (114-334)||(13635343-13635563)
chr7 (114-334)||(16583268-16583487)
chr7 (102-335)||(15580702-15580935)
chr7 (103-325)||(70628-70850)
chr7 (103-325)||(74737-74959)
chr7 (105-331)||(9593361-9593586)
chr7 (103-325)||(33128-33350)
chr7 (114-325)||(12714885-12715097)
chr7 (114-325)||(12718689-12718901)
chr7 (114-325)||(16114262-16114474)
chr7 (114-325)||(16117415-16117627)
chr7 (114-325)||(16907074-16907286)
chr7 (114-325)||(18283387-18283599)
chr7 (160-325)||(39722287-39722452)
chr7 (105-331)||(18923-19148)
chr7 (114-325)||(18279424-18279636)
chr7 (114-325)||(26292416-26292628)
chr7 (103-325)||(12704521-12704744)
chr7 (114-325)||(12723600-12723812)
chr7 (111-333)||(11987225-11987447)
chr7 (105-269)||(9644384-9644549)
chr7 (102-327)||(14429905-14430137)
chr7 (111-334)||(8917439-8917661)
chr7 (105-334)||(13149167-13149395)
chr7 (102-327)||(12321603-12321836)
chr7 (105-334)||(13461773-13462002)
chr7 (11-106)||(11313029-11313124)
chr7 (194-334)||(13918735-13918872)
chr7 (102-326)||(3271846-3272078)
chr7 (194-334)||(1859041-1859178)
chr7 (195-330)||(16457312-16457446)
chr7 (212-331)||(7519331-7519447)
chr7 (11-103)||(15581076-15581168)
chr7 (105-334)||(16724496-16724723)
chr7 (105-334)||(17701510-17701737)
chr7 (11-106)||(12318508-12318603)
chr7 (11-106)||(15604902-15604997)
chr7 (12-106)||(16583615-16583709)
chr7 (193-334)||(25927457-25927595)
chr7 (102-327)||(2760153-2760386)
chr7 (187-327)||(9751703-9751849)
chr7 (105-330)||(6801229-6801452)
chr7 (11-106)||(13635099-13635194)
chr7 (187-327)||(2832389-2832536)
chr7 (11-106)||(26292776-26292871)
chr7 (105-334)||(15728337-15728565)
chr7 (193-334)||(2530344-2530484)
chr7 (105-334)||(14216927-14217155)
chr7 (11-106)||(48593085-48593181)
chr7 (15-106)||(9593726-9593817)
chr7 (15-106)||(9644689-9644780)
chr7 (11-106)||(17701275-17701370)
chr7 (187-327)||(39267847-39267994)
chr7 (11-106)||(8917807-8917902)
chr7 (11-106)||(16724261-16724356)
chr7 (212-334)||(18425450-18425566)
chr7 (11-104)||(17137682-17137775)
chr7 (105-193)||(16438899-16438987)
chr7 (11-82)||(11020-11091)
chr7 (11-82)||(18688-18759)
chr7 (11-82)||(6801617-6801688)
chr7 (11-82)||(11987617-11987688)
chr7 (11-82)||(13149559-13149630)
chr7 (27-82)||(13462166-13462221)
chr7 (11-106)||(14430284-14430379)
chr7 (194-325)||(45169966-45170091)
chr7 (105-158)||(48593321-48593374)
chr7 (35-106)||(3272193-3272264)
chr7 (11-98)||(12321361-12321448)
chr7 (27-82)||(15728729-15728784)
chr7 (11-97)||(16275881-16275967)
chr7 (119-323)||(18556996-18557199)
chr7 (35-106)||(42205495-42205566)
chr7 (12-86)||(16438665-16438739)
chr7 (11-81)||(35152011-35152081)
chr7 (102-327)||(9446020-9446253)
chr7 (11-96)||(9703682-9703767)
chr7 (11-96)||(10508701-10508786)
chr7 (156-334)||(35151618-35151795)
chr7 (137-205)||(2530040-2530108)
chr7 (295-335)||(14152048-14152088)
chr7 (30-86)||(18557372-18557428)
chr7 (35-106)||(2760533-2760604)
chr7 (275-334)||(16275504-16275563)
chr7 (43-106)||(20569258-20569321)
chr7 (113-176)||(42205284-42205347)
chr7 (11-96)||(12187429-12187514)
chr7 (34-106)||(9445811-9445883)
chr7 (11-99)||(14217302-14217390)
chr7 (43-106)||(16114623-16114686)
chr7 (43-106)||(16117776-16117839)
chr7 (43-106)||(16906862-16906925)
chr7 (43-106)||(18279785-18279848)
chr7 (279-326)||(42204017-42204064)
chr7 (11-96)||(11880668-11880753)
chr7 (119-263)||(20569474-20569619)
chr7 (290-335)||(24054478-24054523)
chr7 (290-326)||(15211484-15211520)
chr7 (43-106)||(12715246-12715309)
chr7 (43-106)||(12719050-12719113)
chr7 (43-106)||(12723961-12724024)
chr7 (12-71)||(15211869-15211928)
chr7 (43-106)||(18283748-18283811)
chr7 (189-239)||(19649434-19649484)
chr7 (273-335)||(19649530-19649592)
chr7 (34-71)||(15754528-15754565)
chr7 (35-96)||(24054884-24054945)
chr7 (34-71)||(27847485-27847522)
chr7 (34-71)||(34201226-34201263)
chr7 (34-71)||(40443820-40443857)
chr7 (35-71)||(16385900-16385936)
[»] chr6 (119 HSPs)
chr6 (102-335)||(17804208-17804441)
chr6 (102-335)||(25767030-25767263)
chr6 (102-332)||(22429892-22430122)
chr6 (103-325)||(14472292-14472513)
chr6 (103-325)||(22862967-22863189)
chr6 (113-325)||(18955636-18955848)
chr6 (114-325)||(19870611-19870823)
chr6 (133-325)||(1644726-1644918)
chr6 (114-325)||(11566883-11567095)
chr6 (109-331)||(12706705-12706926)
chr6 (114-325)||(23395089-23395301)
chr6 (114-325)||(23989941-23990153)
chr6 (133-325)||(8243882-8244074)
chr6 (105-331)||(16741222-16741447)
chr6 (133-325)||(18917159-18917351)
chr6 (114-325)||(12618718-12618929)
chr6 (102-327)||(18907133-18907366)
chr6 (105-334)||(5616679-5616908)
chr6 (105-330)||(2685184-2685407)
chr6 (105-330)||(19662787-19663009)
chr6 (105-334)||(9482158-9482386)
chr6 (11-106)||(17804578-17804673)
chr6 (193-334)||(23414658-23414796)
chr6 (193-334)||(27556416-27556554)
chr6 (11-106)||(22429660-22429755)
chr6 (105-322)||(22592669-22592884)
chr6 (212-335)||(27325581-27325713)
chr6 (105-322)||(12496333-12496549)
chr6 (11-103)||(25766798-25766890)
chr6 (102-199)||(27415804-27415901)
chr6 (105-334)||(1587596-1587824)
chr6 (187-327)||(16523332-16523478)
chr6 (11-106)||(1645086-1645181)
chr6 (11-106)||(9481923-9482018)
chr6 (113-327)||(20907854-20908076)
chr6 (105-334)||(20803418-20803647)
chr6 (11-106)||(16741588-16741683)
chr6 (119-326)||(19790657-19790873)
chr6 (11-106)||(22592434-22592529)
chr6 (11-81)||(20803182-20803252)
chr6 (133-269)||(21834782-21834916)
chr6 (11-96)||(18907524-18907609)
chr6 (11-89)||(12496706-12496784)
chr6 (193-326)||(18180517-18180656)
chr6 (212-326)||(21766718-21766839)
chr6 (193-332)||(27416148-27416278)
chr6 (27-99)||(12707076-12707148)
chr6 (194-334)||(16624144-16624278)
chr6 (11-106)||(18180894-18180989)
chr6 (11-82)||(19663173-19663244)
chr6 (11-106)||(21834509-21834604)
chr6 (194-325)||(31477770-31477895)
chr6 (50-104)||(19790448-19790502)
chr6 (34-106)||(27567262-27567334)
chr6 (27-82)||(1587377-1587432)
chr6 (27-82)||(2684987-2685042)
chr6 (27-82)||(5616460-5616515)
chr6 (11-98)||(16523022-16523109)
chr6 (194-325)||(16760316-16760441)
chr6 (194-325)||(22949129-22949254)
chr6 (194-325)||(22953085-22953210)
chr6 (194-325)||(23871573-23871698)
chr6 (194-325)||(23875529-23875654)
chr6 (217-334)||(1644300-1644415)
chr6 (34-104)||(20907634-20907704)
chr6 (11-81)||(21702693-21702763)
chr6 (193-263)||(31478100-31478169)
chr6 (217-334)||(31478209-31478324)
chr6 (11-104)||(21739641-21739734)
chr6 (34-106)||(23657073-23657145)
chr6 (27-106)||(18955409-18955488)
chr6 (271-326)||(19848034-19848089)
chr6 (11-82)||(25135302-25135373)
chr6 (35-102)||(27415596-27415663)
chr6 (43-106)||(27553269-27553332)
chr6 (273-327)||(27553612-27553666)
chr6 (122-238)||(15894310-15894427)
chr6 (271-327)||(15041589-15041645)
chr6 (43-106)||(8244242-8244305)
chr6 (43-106)||(11567244-11567307)
chr6 (43-106)||(12618506-12618569)
chr6 (43-106)||(22863327-22863390)
chr6 (43-106)||(23395450-23395513)
chr6 (43-106)||(23990302-23990365)
chr6 (271-326)||(23992454-23992509)
chr6 (189-252)||(25642133-25642196)
chr6 (193-255)||(1644462-1644524)
chr6 (273-327)||(15894479-15894533)
chr6 (102-168)||(16523264-16523330)
chr6 (35-97)||(18409469-18409531)
chr6 (26-71)||(4185456-4185501)
chr6 (26-71)||(4667846-4667891)
chr6 (26-71)||(4674693-4674738)
chr6 (156-334)||(21702300-21702477)
chr6 (290-335)||(22432263-22432308)
chr6 (290-335)||(22438813-22438858)
chr6 (279-324)||(23657468-23657513)
chr6 (119-238)||(21739900-21740020)
chr6 (193-327)||(22408257-22408398)
chr6 (279-327)||(27567656-27567704)
chr6 (272-335)||(19873134-19873197)
chr6 (113-236)||(23657293-23657416)
chr6 (202-327)||(22074174-22074307)
chr6 (36-106)||(22405709-22405779)
chr6 (34-71)||(1561746-1561783)
chr6 (26-71)||(4189399-4189444)
chr6 (34-71)||(16920285-16920322)
chr6 (290-335)||(19862992-19863037)
chr6 (35-96)||(19863395-19863456)
chr6 (34-71)||(22831934-22831971)
chr6 (273-326)||(25603425-25603478)
chr6 (273-326)||(25611763-25611816)
chr6 (34-71)||(31155039-31155076)
chr6 (290-326)||(16929647-16929683)
chr6 (290-326)||(16965367-16965403)
chr6 (35-71)||(18821472-18821508)
chr6 (35-71)||(20637936-20637972)
chr6 (35-71)||(27332926-27332962)
chr6 (35-71)||(27393666-27393702)
[»] chr3 (135 HSPs)
chr3 (102-335)||(20461362-20461595)
chr3 (104-335)||(7793213-7793445)
chr3 (102-334)||(15482675-15482906)
chr3 (102-335)||(327026-327260)
chr3 (113-335)||(2897696-2897918)
chr3 (105-334)||(31097419-31097649)
chr3 (103-325)||(30065970-30066192)
chr3 (113-325)||(11854757-11854969)
chr3 (103-325)||(11070092-11070314)
chr3 (103-325)||(11165392-11165614)
chr3 (103-325)||(55022891-55023113)
chr3 (114-325)||(15617398-15617610)
chr3 (115-325)||(14499349-14499559)
chr3 (114-325)||(7109722-7109934)
chr3 (114-325)||(7113657-7113869)
chr3 (114-325)||(22336743-22336955)
chr3 (114-325)||(27409517-27409729)
chr3 (114-325)||(28949748-28949960)
chr3 (114-325)||(22321688-22321900)
chr3 (113-334)||(15849958-15850176)
chr3 (113-268)||(11300384-11300539)
chr3 (102-334)||(16797916-16798147)
chr3 (105-330)||(17241990-17242213)
chr3 (102-327)||(18383778-18384010)
chr3 (102-334)||(16808743-16808974)
chr3 (102-326)||(19725773-19726004)
chr3 (102-327)||(322614-322846)
chr3 (11-106)||(326794-326889)
chr3 (119-327)||(11862815-11863031)
chr3 (102-326)||(12496280-12496512)
chr3 (194-334)||(15464878-15465015)
chr3 (11-106)||(7792976-7793071)
chr3 (11-106)||(15483043-15483138)
chr3 (11-106)||(20461130-20461225)
chr3 (105-322)||(38814409-38814625)
chr3 (193-334)||(5223077-5223215)
chr3 (102-326)||(11298390-11298621)
chr3 (115-326)||(3402830-3403050)
chr3 (105-322)||(3833699-3833915)
chr3 (128-327)||(11851603-11851810)
chr3 (11-106)||(31097184-31097279)
chr3 (187-327)||(14665423-14665570)
chr3 (187-327)||(14668579-14668726)
chr3 (15-106)||(15849719-15849810)
chr3 (193-334)||(12339479-12339617)
chr3 (113-326)||(3389808-3390030)
chr3 (226-334)||(8489459-8489564)
chr3 (119-327)||(1982689-1982905)
chr3 (196-330)||(11300723-11300854)
chr3 (11-98)||(11298148-11298235)
chr3 (216-334)||(11854430-11854545)
chr3 (159-325)||(12037871-12038044)
chr3 (11-104)||(3402585-3402678)
chr3 (194-334)||(16750548-16750682)
chr3 (119-326)||(11595017-11595233)
chr3 (11-106)||(12496659-12496754)
chr3 (11-86)||(15941534-15941609)
chr3 (11-106)||(18383536-18383631)
chr3 (24-106)||(16862823-16862905)
chr3 (35-104)||(3389600-3389669)
chr3 (11-104)||(12173192-12173285)
chr3 (11-104)||(23077097-23077190)
chr3 (34-106)||(11594792-11594864)
chr3 (11-106)||(322993-323088)
chr3 (194-325)||(4111209-4111334)
chr3 (11-106)||(11557015-11557110)
chr3 (194-325)||(15964993-15965118)
chr3 (194-325)||(15968917-15969042)
chr3 (194-325)||(15972841-15972966)
chr3 (11-82)||(17242377-17242448)
chr3 (194-325)||(19775789-19775914)
chr3 (11-82)||(38814789-38814860)
chr3 (273-327)||(12172818-12172872)
chr3 (11-104)||(14878124-14878217)
chr3 (102-179)||(26190870-26190947)
chr3 (34-106)||(1982463-1982535)
chr3 (34-106)||(16690600-16690672)
chr3 (34-106)||(16697173-16697245)
chr3 (11-82)||(3834079-3834150)
chr3 (194-325)||(4107357-4107482)
chr3 (27-106)||(11300157-11300236)
chr3 (11-82)||(16797684-16797755)
chr3 (15-94)||(26190632-26190711)
chr3 (194-325)||(37439596-37439721)
chr3 (217-334)||(4589172-4589287)
chr3 (217-334)||(19775360-19775475)
chr3 (11-96)||(15060706-15060791)
chr3 (11-96)||(16369822-16369907)
chr3 (33-106)||(42326325-42326398)
chr3 (30-82)||(1598129-1598181)
chr3 (102-325)||(11557246-11557477)
chr3 (193-255)||(4589063-4589125)
chr3 (102-223)||(15060427-15060549)
chr3 (111-322)||(15941775-15941985)
chr3 (193-263)||(19775515-19775584)
chr3 (273-327)||(23053128-23053182)
chr3 (11-96)||(856550-856635)
chr3 (273-326)||(12511084-12511137)
chr3 (11-96)||(15051930-15052015)
chr3 (273-326)||(46822292-46822345)
chr3 (12-92)||(321634-321714)
chr3 (159-238)||(12172924-12173004)
chr3 (12-96)||(17524794-17524878)
chr3 (35-106)||(22322049-22322121)
chr3 (275-334)||(16696798-16696857)
chr3 (43-106)||(27409305-27409368)
chr3 (43-106)||(28950110-28950173)
chr3 (119-326)||(42325964-42326180)
chr3 (102-219)||(15051655-15051773)
chr3 (236-322)||(1598477-1598560)
chr3 (290-326)||(14878574-14878610)
chr3 (35-106)||(22337104-22337176)
chr3 (11-71)||(23052696-23052756)
chr3 (271-335)||(23408442-23408506)
chr3 (43-82)||(7110107-7110146)
chr3 (43-82)||(7114042-7114081)
chr3 (43-82)||(11855141-11855180)
chr3 (105-208)||(16864998-16865101)
chr3 (271-326)||(30029867-30029922)
chr3 (273-335)||(15878092-15878154)
chr3 (34-71)||(13209969-13210006)
chr3 (34-71)||(14179765-14179802)
chr3 (273-326)||(15051531-15051584)
chr3 (273-326)||(15060307-15060360)
chr3 (35-96)||(15877471-15877532)
chr3 (273-326)||(16369423-16369476)
chr3 (273-326)||(16909765-16909818)
chr3 (35-76)||(17674218-17674259)
chr3 (11-71)||(4588433-4588493)
chr3 (50-106)||(11851976-11852031)
chr3 (35-71)||(12399638-12399674)
chr3 (35-71)||(15471367-15471403)
chr3 (290-326)||(17525216-17525252)
chr3 (35-71)||(20698089-20698125)
chr3 (11-71)||(23082979-23083039)
[»] chr2 (79 HSPs)
chr2 (102-335)||(24735414-24735647)
chr2 (104-325)||(10101509-10101730)
chr2 (102-263)||(19688618-19688779)
chr2 (114-325)||(12901385-12901597)
chr2 (133-325)||(24649378-24649570)
chr2 (114-325)||(27379306-27379518)
chr2 (114-325)||(27383352-27383564)
chr2 (114-325)||(27601817-27602029)
chr2 (114-325)||(24628352-24628564)
chr2 (114-325)||(41530883-41531089)
chr2 (105-330)||(22461055-22461277)
chr2 (105-322)||(19928367-19928583)
chr2 (102-326)||(25963578-25963809)
chr2 (11-106)||(10327238-10327333)
chr2 (117-327)||(22811787-22812006)
chr2 (11-106)||(24735784-24735879)
chr2 (102-326)||(25961396-25961628)
chr2 (193-334)||(31344890-31345028)
chr2 (105-322)||(18855326-18855541)
chr2 (114-238)||(15477711-15477836)
chr2 (105-334)||(23187088-23187316)
chr2 (105-334)||(23598351-23598579)
chr2 (113-327)||(21327439-21327662)
chr2 (11-104)||(21327196-21327289)
chr2 (188-327)||(21318584-21318731)
chr2 (102-326)||(24716392-24716622)
chr2 (105-334)||(60829-61056)
chr2 (11-104)||(21318265-21318358)
chr2 (113-326)||(40428486-40428708)
chr2 (11-104)||(40428859-40428952)
chr2 (210-327)||(21916069-21916193)
chr2 (34-106)||(24870272-24870344)
chr2 (11-106)||(25963336-25963431)
chr2 (27-86)||(27263652-27263711)
chr2 (105-334)||(27263285-27263514)
chr2 (34-106)||(24175192-24175264)
chr2 (210-327)||(37524697-37524821)
chr2 (11-82)||(22460820-22460891)
chr2 (194-325)||(30344951-30345076)
chr2 (11-106)||(37525069-37525164)
chr2 (216-334)||(41666962-41667078)
chr2 (11-104)||(21917935-21918028)
chr2 (102-327)||(24174822-24175055)
chr2 (194-325)||(1283410-1283535)
chr2 (11-106)||(18855091-18855186)
chr2 (27-82)||(19928148-19928203)
chr2 (27-82)||(23187480-23187535)
chr2 (27-82)||(23598743-23598798)
chr2 (34-104)||(24654991-24655061)
chr2 (11-81)||(26125609-26125679)
chr2 (102-327)||(24655200-24655433)
chr2 (43-104)||(24716192-24716253)
chr2 (11-104)||(45677774-45677867)
chr2 (12-96)||(24658055-24658139)
chr2 (127-238)||(24673697-24673809)
chr2 (279-327)||(24869902-24869950)
chr2 (27-82)||(61220-61275)
chr2 (35-106)||(22811577-22811648)
chr2 (11-81)||(41667355-41667426)
chr2 (273-326)||(22799167-22799220)
chr2 (11-96)||(24673991-24674076)
chr2 (122-239)||(22758596-22758715)
chr2 (189-252)||(22740910-22740973)
chr2 (43-106)||(24628140-24628203)
chr2 (43-106)||(24649738-24649801)
chr2 (271-326)||(25616212-25616267)
chr2 (43-106)||(41530671-41530734)
chr2 (119-208)||(21918194-21918284)
chr2 (11-47)||(19688408-19688444)
chr2 (11-71)||(40621827-40621887)
chr2 (63-106)||(19688438-19688481)
chr2 (35-98)||(22798769-22798832)
chr2 (43-106)||(27379094-27379157)
chr2 (43-106)||(27383140-27383203)
chr2 (273-326)||(23019747-23019800)
chr2 (279-328)||(24673590-24673639)
chr2 (34-71)||(28291943-28291980)
chr2 (35-71)||(23286293-23286329)
chr2 (35-71)||(25176285-25176321)
[»] scaffold0044 (6 HSPs)
scaffold0044 (102-334)||(12916-13148)
scaffold0044 (102-334)||(19200-19432)
scaffold0044 (11-106)||(19569-19664)
scaffold0044 (12-106)||(13285-13379)
scaffold0044 (219-334)||(62273-62386)
scaffold0044 (11-81)||(62666-62736)
[»] chr4 (93 HSPs)
chr4 (102-335)||(36133824-36134057)
chr4 (103-325)||(17810293-17810515)
chr4 (103-325)||(14757285-14757507)
chr4 (105-331)||(1951626-1951851)
chr4 (114-325)||(9556551-9556763)
chr4 (114-325)||(27534047-27534258)
chr4 (114-325)||(4561207-4561419)
chr4 (105-331)||(18222243-18222468)
chr4 (114-325)||(5756811-5757023)
chr4 (187-334)||(22634369-22634516)
chr4 (105-331)||(17152352-17152576)
chr4 (114-325)||(33742399-33742610)
chr4 (105-331)||(18228718-18228943)
chr4 (102-327)||(16487939-16488172)
chr4 (105-322)||(26243530-26243746)
chr4 (112-334)||(3412811-3413030)
chr4 (105-334)||(18236904-18237133)
chr4 (105-334)||(16243265-16243493)
chr4 (105-322)||(23139296-23139511)
chr4 (105-322)||(19757466-19757682)
chr4 (105-322)||(19782124-19782340)
chr4 (102-326)||(16356814-16357045)
chr4 (105-334)||(2014791-2015019)
chr4 (193-334)||(43256367-43256505)
chr4 (11-104)||(36133592-36133685)
chr4 (102-326)||(16348526-16348757)
chr4 (102-327)||(5338842-5339076)
chr4 (105-321)||(9530460-9530674)
chr4 (187-327)||(20157407-20157554)
chr4 (102-199)||(43256023-43256120)
chr4 (14-106)||(2015159-2015251)
chr4 (11-106)||(1951391-1951486)
chr4 (187-327)||(13812966-13813113)
chr4 (11-106)||(16243030-16243125)
chr4 (11-106)||(16356572-16356667)
chr4 (11-89)||(16678219-16678297)
chr4 (34-106)||(16351501-16351573)
chr4 (11-106)||(9530814-9530909)
chr4 (34-106)||(11250214-11250286)
chr4 (27-82)||(3413201-3413256)
chr4 (194-325)||(10712874-10712999)
chr4 (194-325)||(10926644-10926769)
chr4 (11-106)||(16348311-16348406)
chr4 (11-82)||(18222008-18222079)
chr4 (11-86)||(19757231-19757306)
chr4 (11-86)||(19782500-19782575)
chr4 (11-82)||(23139675-23139746)
chr4 (11-82)||(26243295-26243366)
chr4 (111-334)||(28569314-28569537)
chr4 (11-106)||(43255790-43255885)
chr4 (11-86)||(45938548-45938623)
chr4 (11-89)||(17152117-17152195)
chr4 (50-104)||(25555899-25555953)
chr4 (11-82)||(14708264-14708335)
chr4 (216-334)||(14708611-14708727)
chr4 (194-325)||(14954127-14954252)
chr4 (113-327)||(15353179-15353402)
chr4 (11-106)||(16487697-16487792)
chr4 (27-82)||(18237297-18237352)
chr4 (194-325)||(25689891-25690016)
chr4 (122-238)||(12570142-12570259)
chr4 (11-96)||(13569927-13570012)
chr4 (11-104)||(15121422-15121515)
chr4 (34-99)||(18602398-18602463)
chr4 (34-99)||(18608992-18609057)
chr4 (119-263)||(25555599-25555744)
chr4 (119-210)||(18602624-18602715)
chr4 (207-322)||(45938173-45938284)
chr4 (119-326)||(11250439-11250655)
chr4 (11-98)||(15094186-15094273)
chr4 (11-82)||(18228505-18228576)
chr4 (27-82)||(28569090-28569145)
chr4 (217-334)||(15224807-15224922)
chr4 (34-104)||(15352959-15353029)
chr4 (11-81)||(42997080-42997150)
chr4 (11-104)||(12570428-12570521)
chr4 (156-334)||(42997366-42997543)
chr4 (43-106)||(4560995-4561058)
chr4 (194-325)||(12487732-12487857)
chr4 (279-326)||(25555503-25555550)
chr4 (43-106)||(33742759-33742822)
chr4 (273-327)||(12570036-12570090)
chr4 (276-334)||(18602766-18602824)
chr4 (119-192)||(18609218-18609291)
chr4 (11-96)||(44676047-44676132)
chr4 (11-71)||(17047702-17047762)
chr4 (278-334)||(18609340-18609396)
chr4 (11-71)||(23843919-23843979)
chr4 (43-106)||(5756599-5756662)
chr4 (271-326)||(15093798-15093853)
chr4 (212-263)||(15224962-15225012)
chr4 (34-71)||(14052954-14052991)
chr4 (290-326)||(23843501-23843537)
[»] chr1 (79 HSPs)
chr1 (102-332)||(16080306-16080536)
chr1 (102-334)||(36819170-36819403)
chr1 (102-335)||(24782962-24783195)
chr1 (103-325)||(1010744-1010966)
chr1 (114-325)||(20228682-20228894)
chr1 (114-325)||(16375331-16375543)
chr1 (105-331)||(19211883-19212108)
chr1 (114-325)||(21407376-21407588)
chr1 (114-325)||(52639562-52639774)
chr1 (105-325)||(23819164-23819383)
chr1 (105-331)||(20138099-20138324)
chr1 (102-327)||(18181982-18182215)
chr1 (105-330)||(12646888-12647110)
chr1 (11-106)||(36818938-36819033)
chr1 (105-321)||(18882393-18882608)
chr1 (193-334)||(33797295-33797433)
chr1 (102-327)||(22449127-22449360)
chr1 (113-327)||(8761505-8761728)
chr1 (11-106)||(21305695-21305790)
chr1 (105-320)||(46975494-46975708)
chr1 (11-103)||(16080074-16080166)
chr1 (112-199)||(33797680-33797767)
chr1 (102-326)||(18393825-18394059)
chr1 (11-104)||(24782730-24782823)
chr1 (119-327)||(3472804-3473017)
chr1 (12-82)||(20228440-20228510)
chr1 (102-326)||(45310228-45310462)
chr1 (11-106)||(3704716-3704811)
chr1 (11-106)||(20138464-20138559)
chr1 (11-104)||(19212250-19212343)
chr1 (34-106)||(45489396-45489468)
chr1 (11-106)||(23818929-23819024)
chr1 (102-326)||(17678449-17678679)
chr1 (34-106)||(18393616-18393688)
chr1 (34-106)||(45310019-45310091)
chr1 (194-325)||(1925089-1925214)
chr1 (11-82)||(18882772-18882843)
chr1 (194-325)||(20924103-20924228)
chr1 (289-335)||(21313139-21313185)
chr1 (102-230)||(21022767-21022896)
chr1 (11-104)||(22830997-22831090)
chr1 (14-82)||(12647274-12647342)
chr1 (194-334)||(39244101-39244235)
chr1 (194-334)||(39247656-39247790)
chr1 (194-334)||(41388201-41388335)
chr1 (43-106)||(8761284-8761347)
chr1 (27-106)||(33797914-33797993)
chr1 (119-326)||(45489621-45489837)
chr1 (14-104)||(18181743-18181833)
chr1 (11-81)||(21615843-21615913)
chr1 (50-106)||(33049756-33049812)
chr1 (14-82)||(46975872-46975940)
chr1 (43-106)||(17678249-17678312)
chr1 (119-238)||(22831256-22831375)
chr1 (273-327)||(3705105-3705159)
chr1 (193-255)||(20229099-20229161)
chr1 (217-334)||(20229208-20229323)
chr1 (102-238)||(6151976-6152113)
chr1 (19-96)||(6152270-6152347)
chr1 (11-104)||(21023045-21023138)
chr1 (212-326)||(21788014-21788136)
chr1 (35-104)||(22432426-22432495)
chr1 (11-96)||(42864830-42864915)
chr1 (35-106)||(3472569-3472640)
chr1 (43-106)||(16375119-16375182)
chr1 (43-106)||(21407737-21407800)
chr1 (274-325)||(33050067-33050118)
chr1 (43-106)||(52639923-52639986)
chr1 (271-326)||(22468735-22468790)
chr1 (273-326)||(20135214-20135267)
chr1 (26-71)||(21162171-21162216)
chr1 (15-96)||(21787665-21787746)
chr1 (35-96)||(22468339-22468400)
chr1 (35-71)||(20846872-20846908)
chr1 (279-327)||(21022653-21022701)
chr1 (35-71)||(21027112-21027148)
chr1 (35-71)||(22355827-22355863)
chr1 (35-71)||(22357513-22357549)
chr1 (35-71)||(22921509-22921545)
[»] scaffold0013 (2 HSPs)
scaffold0013 (102-334)||(2535-2766)
scaffold0013 (12-106)||(2304-2398)
[»] scaffold0001 (4 HSPs)
scaffold0001 (102-334)||(173304-173534)
scaffold0001 (11-106)||(173671-173766)
scaffold0001 (113-327)||(422404-422626)
scaffold0001 (43-104)||(422193-422254)
[»] chr5 (102 HSPs)
chr5 (102-334)||(23535451-23535681)
chr5 (103-325)||(15236643-15236865)
chr5 (187-335)||(17410451-17410599)
chr5 (114-325)||(20295868-20296080)
chr5 (114-325)||(19472593-19472805)
chr5 (105-331)||(18774219-18774445)
chr5 (105-331)||(42805436-42805661)
chr5 (105-331)||(18784062-18784288)
chr5 (106-330)||(20232568-20232790)
chr5 (102-327)||(21366527-21366759)
chr5 (105-330)||(26742611-26742835)
chr5 (105-330)||(26665996-26666219)
chr5 (105-330)||(26937593-26937816)
chr5 (105-330)||(24532913-24533136)
chr5 (105-322)||(33409253-33409469)
chr5 (193-334)||(20911125-20911263)
chr5 (193-334)||(18355970-18356108)
chr5 (112-322)||(17718311-17718520)
chr5 (105-322)||(16674177-16674393)
chr5 (11-106)||(17410828-17410923)
chr5 (187-321)||(24767493-24767634)
chr5 (105-330)||(21340632-21340855)
chr5 (102-326)||(23451371-23451601)
chr5 (102-199)||(18356474-18356571)
chr5 (119-326)||(20805575-20805788)
chr5 (102-254)||(20910662-20910813)
chr5 (32-106)||(23535240-23535314)
chr5 (34-106)||(12028218-12028290)
chr5 (11-106)||(17918781-17918876)
chr5 (102-326)||(23458615-23458845)
chr5 (102-326)||(23462876-23463106)
chr5 (105-334)||(25229271-25229499)
chr5 (105-334)||(25293427-25293655)
chr5 (34-106)||(24222269-24222341)
chr5 (34-106)||(26680971-26681043)
chr5 (34-106)||(26952578-26952650)
chr5 (111-334)||(21885059-21885282)
chr5 (11-106)||(22760046-22760141)
chr5 (11-82)||(26742376-26742447)
chr5 (12-106)||(21366286-21366380)
chr5 (122-326)||(20766997-20767207)
chr5 (35-104)||(20910454-20910523)
chr5 (113-326)||(123178-123399)
chr5 (194-325)||(10753385-10753510)
chr5 (119-326)||(12028443-12028659)
chr5 (11-82)||(17718069-17718140)
chr5 (11-106)||(20805952-20806047)
chr5 (11-82)||(21340397-21340468)
chr5 (11-82)||(21482883-21482954)
chr5 (11-82)||(26665761-26665832)
chr5 (11-82)||(26937358-26937429)
chr5 (11-82)||(33409611-33409682)
chr5 (105-334)||(4036232-4036461)
chr5 (134-263)||(22757219-22757349)
chr5 (260-325)||(40723607-40723672)
chr5 (111-323)||(26172488-26172700)
chr5 (12-76)||(31342538-31342602)
chr5 (11-82)||(16674557-16674628)
chr5 (27-82)||(18784452-18784507)
chr5 (27-82)||(21884835-21884890)
chr5 (27-82)||(24532694-24532749)
chr5 (27-82)||(25229052-25229107)
chr5 (27-82)||(25293208-25293263)
chr5 (27-82)||(26172869-26172924)
chr5 (193-326)||(1858931-1859070)
chr5 (102-147)||(17410646-17410691)
chr5 (279-327)||(26680604-26680652)
chr5 (279-327)||(26952211-26952259)
chr5 (30-81)||(4036626-4036677)
chr5 (27-82)||(18774609-18774664)
chr5 (31-82)||(42805825-42805876)
chr5 (217-334)||(10752956-10753071)
chr5 (193-263)||(10753111-10753180)
chr5 (115-326)||(17919026-17919245)
chr5 (14-104)||(23512514-23512604)
chr5 (11-96)||(18769623-18769708)
chr5 (11-96)||(21887239-21887324)
chr5 (11-96)||(22032731-22032816)
chr5 (11-96)||(23201784-23201869)
chr5 (193-327)||(24221899-24222040)
chr5 (279-327)||(31342169-31342217)
chr5 (271-326)||(17517240-17517295)
chr5 (11-78)||(18356736-18356803)
chr5 (43-106)||(19472381-19472444)
chr5 (43-106)||(20296229-20296292)
chr5 (43-104)||(1858638-1858699)
chr5 (11-60)||(23572510-23572559)
chr5 (14-103)||(122934-123027)
chr5 (11-71)||(14079588-14079648)
chr5 (193-263)||(31342219-31342289)
chr5 (34-71)||(19660478-19660515)
chr5 (34-71)||(21292622-21292659)
chr5 (273-326)||(23201383-23201436)
chr5 (273-326)||(23512121-23512174)
chr5 (273-326)||(23572107-23572160)
chr5 (35-96)||(37724319-37724380)
chr5 (35-71)||(1096910-1096946)
chr5 (27-63)||(20232954-20232990)
chr5 (35-71)||(21871213-21871249)
chr5 (290-326)||(21873277-21873313)
chr5 (35-71)||(21875493-21875529)
chr5 (35-71)||(22075451-22075487)
[»] scaffold0228 (2 HSPs)
scaffold0228 (113-334)||(18505-18726)
scaffold0228 (11-106)||(18262-18357)
[»] scaffold0177 (2 HSPs)
scaffold0177 (102-321)||(13349-13568)
scaffold0177 (66-106)||(13172-13212)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (105-334)||(228238-228466)
[»] scaffold0525 (1 HSPs)
scaffold0525 (103-325)||(3738-3960)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (105-334)||(19882-20110)
scaffold0120 (11-106)||(19647-19742)
[»] scaffold0029 (7 HSPs)
scaffold0029 (114-325)||(65401-65613)
scaffold0029 (133-325)||(61505-61697)
scaffold0029 (103-325)||(80736-80955)
scaffold0029 (11-96)||(13173-13258)
scaffold0029 (217-334)||(80307-80422)
scaffold0029 (193-263)||(80462-80531)
scaffold0029 (273-327)||(12785-12839)
[»] scaffold0405 (2 HSPs)
scaffold0405 (102-334)||(9527-9759)
scaffold0405 (11-106)||(9322-9417)
[»] scaffold0349 (1 HSPs)
scaffold0349 (103-325)||(12443-12665)
[»] chr8 (98 HSPs)
chr8 (105-331)||(16231340-16231565)
chr8 (114-325)||(19278156-19278368)
chr8 (114-325)||(21972458-21972670)
chr8 (114-325)||(21976543-21976755)
chr8 (133-325)||(43251834-43252026)
chr8 (105-331)||(22044900-22045125)
chr8 (114-293)||(22111904-22112084)
chr8 (105-331)||(23834188-23834414)
chr8 (105-334)||(30308619-30308846)
chr8 (105-268)||(18619555-18619719)
chr8 (102-327)||(20465900-20466133)
chr8 (105-255)||(22028647-22028798)
chr8 (102-327)||(30643152-30643386)
chr8 (105-322)||(23846880-23847096)
chr8 (102-327)||(15602878-15603111)
chr8 (102-327)||(15611330-15611563)
chr8 (12-98)||(23252393-23252479)
chr8 (102-326)||(16410116-16410347)
chr8 (102-326)||(17926568-17926799)
chr8 (11-106)||(22028938-22029033)
chr8 (11-106)||(22045239-22045334)
chr8 (193-334)||(14398063-14398201)
chr8 (111-322)||(15538473-15538683)
chr8 (111-322)||(15531914-15532123)
chr8 (194-334)||(21387086-21387223)
chr8 (102-326)||(20856286-20856518)
chr8 (11-106)||(16231105-16231200)
chr8 (196-334)||(21383666-21383801)
chr8 (11-106)||(23834554-23834649)
chr8 (11-104)||(39094571-39094664)
chr8 (11-106)||(15602636-15602731)
chr8 (11-106)||(15611088-15611183)
chr8 (27-106)||(18619859-18619938)
chr8 (11-106)||(30642910-30643005)
chr8 (11-96)||(377693-377778)
chr8 (11-104)||(20465658-20465751)
chr8 (11-67)||(22057768-22057824)
chr8 (114-322)||(17828457-17828663)
chr8 (194-325)||(18862605-18862730)
chr8 (11-106)||(20856044-20856139)
chr8 (194-325)||(21827974-21828099)
chr8 (11-106)||(22010298-22010393)
chr8 (27-106)||(30308400-30308479)
chr8 (102-223)||(377414-377536)
chr8 (11-81)||(15532294-15532364)
chr8 (12-81)||(15538854-15538923)
chr8 (156-334)||(32605223-32605400)
chr8 (30-86)||(24433886-24433942)
chr8 (35-106)||(16409898-16409969)
chr8 (194-325)||(21410971-21411096)
chr8 (194-325)||(21805463-21805588)
chr8 (102-327)||(22010540-22010769)
chr8 (27-82)||(22113374-22113429)
chr8 (27-82)||(22134877-22134932)
chr8 (27-82)||(22166027-22166082)
chr8 (193-326)||(16861279-16861418)
chr8 (102-223)||(19259443-19259565)
chr8 (35-104)||(16860980-16861049)
chr8 (11-96)||(17353556-17353641)
chr8 (122-238)||(24755842-24755959)
chr8 (156-334)||(32598691-32598868)
chr8 (12-81)||(32599084-32599153)
chr8 (12-81)||(32605616-32605685)
chr8 (193-326)||(39094877-39095018)
chr8 (43-106)||(17926358-17926421)
chr8 (271-326)||(18678141-18678196)
chr8 (43-106)||(22112212-22112275)
chr8 (271-326)||(32121759-32121814)
chr8 (11-81)||(17055019-17055089)
chr8 (11-96)||(16185143-16185228)
chr8 (212-326)||(23776807-23776929)
chr8 (274-334)||(17055412-17055472)
chr8 (11-98)||(21168340-21168427)
chr8 (43-106)||(21972246-21972309)
chr8 (12-71)||(25362770-25362829)
chr8 (14-96)||(19899510-19899592)
chr8 (12-98)||(21161735-21161821)
chr8 (273-327)||(24755736-24755790)
chr8 (11-96)||(16411888-16411973)
chr8 (273-326)||(23648580-23648633)
chr8 (273-325)||(377295-377347)
chr8 (34-82)||(17828236-17828284)
chr8 (50-106)||(19277953-19278009)
chr8 (11-63)||(23844544-23844596)
chr8 (43-106)||(21976331-21976394)
chr8 (43-106)||(43252194-43252257)
chr8 (11-96)||(23776452-23776538)
chr8 (34-71)||(5865918-5865955)
chr8 (273-326)||(17353984-17354037)
chr8 (11-96)||(19259221-19259305)
chr8 (273-326)||(19259632-19259685)
chr8 (273-326)||(21162099-21162152)
chr8 (273-326)||(21168772-21168825)
chr8 (34-71)||(21249824-21249861)
chr8 (34-71)||(21255662-21255699)
chr8 (34-71)||(21389094-21389131)
chr8 (11-71)||(24756161-24756221)
chr8 (113-157)||(39094814-39094858)
[»] scaffold0372 (1 HSPs)
scaffold0372 (133-325)||(4994-5186)
[»] scaffold0168 (2 HSPs)
scaffold0168 (105-331)||(3395-3620)
scaffold0168 (11-106)||(3160-3255)
[»] scaffold0028 (2 HSPs)
scaffold0028 (114-325)||(58592-58804)
scaffold0028 (43-106)||(58380-58443)
[»] scaffold0109 (6 HSPs)
scaffold0109 (114-325)||(35816-36027)
scaffold0109 (105-334)||(6957-7185)
scaffold0109 (11-97)||(10932-11018)
scaffold0109 (11-97)||(38449-38535)
scaffold0109 (43-104)||(45501-45562)
scaffold0109 (12-78)||(7461-7527)
[»] scaffold0334 (2 HSPs)
scaffold0334 (105-331)||(18225-18450)
scaffold0334 (12-82)||(17991-18061)
[»] scaffold0004 (5 HSPs)
scaffold0004 (114-245)||(10458-10589)
scaffold0004 (11-106)||(10214-10309)
scaffold0004 (122-239)||(69915-70034)
scaffold0004 (272-335)||(69808-69871)
scaffold0004 (35-96)||(70211-70272)
[»] scaffold0012 (3 HSPs)
scaffold0012 (105-331)||(24833-25059)
scaffold0012 (11-99)||(24598-24686)
scaffold0012 (194-325)||(189337-189462)
[»] scaffold0676 (3 HSPs)
scaffold0676 (102-327)||(4452-4685)
scaffold0676 (194-325)||(471-597)
scaffold0676 (35-104)||(4834-4903)
[»] scaffold0425 (2 HSPs)
scaffold0425 (102-327)||(181-415)
scaffold0425 (11-71)||(597-657)
[»] scaffold0010 (2 HSPs)
scaffold0010 (105-331)||(23232-23457)
scaffold0010 (11-106)||(23597-23692)
[»] scaffold0476 (4 HSPs)
scaffold0476 (102-327)||(5608-5840)
scaffold0476 (102-327)||(6803-7035)
scaffold0476 (12-104)||(5989-6081)
scaffold0476 (12-104)||(7184-7276)
[»] scaffold1461 (2 HSPs)
scaffold1461 (112-273)||(1-163)
scaffold1461 (11-99)||(317-405)
[»] scaffold1296 (2 HSPs)
scaffold1296 (102-327)||(415-648)
scaffold1296 (12-106)||(795-889)
[»] scaffold0546 (3 HSPs)
scaffold0546 (105-334)||(6122-6350)
scaffold0546 (11-97)||(2289-2375)
scaffold0546 (12-78)||(5780-5846)
[»] scaffold0393 (2 HSPs)
scaffold0393 (102-327)||(1516-1748)
scaffold0393 (11-106)||(1895-1990)
[»] scaffold0124 (1 HSPs)
scaffold0124 (119-327)||(42649-42860)
[»] scaffold0070 (2 HSPs)
scaffold0070 (105-334)||(9916-10144)
scaffold0070 (11-82)||(10308-10379)
[»] scaffold0346 (2 HSPs)
scaffold0346 (113-325)||(15111-15330)
scaffold0346 (35-71)||(17366-17402)
[»] scaffold0080 (2 HSPs)
scaffold0080 (102-327)||(18517-18750)
scaffold0080 (11-96)||(18275-18360)
[»] scaffold0761 (1 HSPs)
scaffold0761 (159-327)||(6227-6403)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (102-326)||(46588-46820)
scaffold0035 (11-104)||(46346-46439)
[»] scaffold0216 (2 HSPs)
scaffold0216 (187-327)||(17058-17206)
scaffold0216 (11-104)||(16740-16833)
[»] scaffold0042 (8 HSPs)
scaffold0042 (105-322)||(63878-64094)
scaffold0042 (105-322)||(75762-75978)
scaffold0042 (11-82)||(64258-64329)
scaffold0042 (122-238)||(34791-34908)
scaffold0042 (12-82)||(76142-76212)
scaffold0042 (11-104)||(34529-34622)
scaffold0042 (273-327)||(34960-35014)
scaffold0042 (24-104)||(41185-41265)
[»] scaffold1326 (2 HSPs)
scaffold1326 (113-327)||(1362-1584)
scaffold1326 (11-98)||(1119-1206)
[»] scaffold0284 (2 HSPs)
scaffold0284 (105-334)||(18367-18595)
scaffold0284 (11-106)||(18735-18830)
[»] scaffold0104 (4 HSPs)
scaffold0104 (127-326)||(9536-9741)
scaffold0104 (127-326)||(1853-2059)
scaffold0104 (37-106)||(2231-2300)
scaffold0104 (37-106)||(9913-9982)
[»] scaffold0615 (2 HSPs)
scaffold0615 (119-326)||(1962-2178)
scaffold0615 (11-106)||(1703-1798)
[»] scaffold0130 (1 HSPs)
scaffold0130 (102-334)||(5862-6093)
[»] scaffold0037 (4 HSPs)
scaffold0037 (102-269)||(21430-21597)
scaffold0037 (217-334)||(80754-80869)
scaffold0037 (11-96)||(21188-21273)
scaffold0037 (193-255)||(80644-80706)
[»] scaffold0299 (1 HSPs)
scaffold0299 (193-334)||(6693-6831)
[»] scaffold0051 (1 HSPs)
scaffold0051 (193-334)||(30897-31035)
[»] scaffold0280 (2 HSPs)
scaffold0280 (102-266)||(19153-19317)
scaffold0280 (11-104)||(18921-19014)
[»] scaffold0772 (1 HSPs)
scaffold0772 (14-106)||(6397-6489)
[»] scaffold0003 (8 HSPs)
scaffold0003 (102-199)||(71460-71557)
scaffold0003 (11-103)||(96990-97083)
scaffold0003 (105-322)||(139736-139951)
scaffold0003 (193-332)||(71083-71213)
scaffold0003 (27-106)||(140091-140170)
scaffold0003 (193-327)||(414004-414145)
scaffold0003 (35-102)||(71698-71765)
scaffold0003 (63-106)||(413732-413775)
[»] scaffold0166 (1 HSPs)
scaffold0166 (187-321)||(9990-10131)
[»] scaffold0079 (2 HSPs)
scaffold0079 (102-326)||(44104-44335)
scaffold0079 (11-106)||(44455-44550)
[»] scaffold0193 (2 HSPs)
scaffold0193 (105-322)||(9445-9661)
scaffold0193 (11-82)||(9825-9896)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (197-327)||(73725-73861)
[»] scaffold1052 (1 HSPs)
scaffold1052 (187-327)||(2927-3074)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (193-334)||(20419-20557)
[»] scaffold0268 (1 HSPs)
scaffold0268 (160-246)||(928-1014)
[»] scaffold0132 (2 HSPs)
scaffold0132 (111-322)||(36331-36540)
scaffold0132 (11-105)||(36687-36781)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (193-334)||(207792-207942)
scaffold0016 (31-71)||(207157-207197)
[»] scaffold0367 (2 HSPs)
scaffold0367 (102-326)||(920-1151)
scaffold0367 (11-106)||(1298-1393)
[»] scaffold0412 (2 HSPs)
scaffold0412 (102-326)||(6277-6508)
scaffold0412 (14-106)||(6038-6130)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (11-106)||(12134-12229)
[»] scaffold0184 (3 HSPs)
scaffold0184 (102-260)||(4086-4245)
scaffold0184 (34-106)||(3877-3949)
scaffold0184 (279-326)||(4273-4320)
[»] scaffold0171 (2 HSPs)
scaffold0171 (11-106)||(35140-35235)
scaffold0171 (117-326)||(35387-35605)
[»] scaffold0327 (2 HSPs)
scaffold0327 (102-327)||(311-534)
scaffold0327 (11-104)||(673-766)
[»] scaffold0017 (6 HSPs)
scaffold0017 (113-326)||(19604-19826)
scaffold0017 (14-106)||(56478-56570)
scaffold0017 (113-326)||(15082-15304)
scaffold0017 (34-99)||(14966-15031)
scaffold0017 (34-99)||(19488-19553)
scaffold0017 (290-326)||(193034-193070)
[»] scaffold0043 (4 HSPs)
scaffold0043 (114-334)||(77044-77264)
scaffold0043 (27-105)||(76817-76895)
scaffold0043 (11-96)||(18655-18740)
scaffold0043 (290-326)||(18259-18295)
[»] scaffold1552 (2 HSPs)
scaffold1552 (112-334)||(381-587)
scaffold1552 (27-99)||(741-813)
[»] scaffold0637 (1 HSPs)
scaffold0637 (119-326)||(8583-8799)
[»] scaffold0008 (4 HSPs)
scaffold0008 (102-326)||(30606-30836)
scaffold0008 (216-334)||(1889-2005)
scaffold0008 (11-81)||(2282-2352)
scaffold0008 (35-106)||(30388-30459)
[»] scaffold0439 (4 HSPs)
scaffold0439 (35-104)||(2089-2158)
scaffold0439 (35-104)||(9949-10018)
scaffold0439 (273-327)||(2477-2531)
scaffold0439 (273-327)||(10337-10391)
[»] scaffold0107 (2 HSPs)
scaffold0107 (43-104)||(15080-15141)
scaffold0107 (102-199)||(15280-15376)
[»] scaffold0229 (1 HSPs)
scaffold0229 (194-325)||(11461-11586)
[»] scaffold0141 (1 HSPs)
scaffold0141 (194-325)||(14047-14172)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (212-327)||(7493-7615)
[»] scaffold0371 (2 HSPs)
scaffold0371 (11-97)||(15733-15819)
scaffold0371 (275-334)||(15350-15409)
[»] scaffold1220 (2 HSPs)
scaffold1220 (43-104)||(2184-2245)
scaffold1220 (104-324)||(1817-2044)
[»] scaffold1124 (1 HSPs)
scaffold1124 (11-96)||(2291-2376)
[»] scaffold0158 (6 HSPs)
scaffold0158 (11-96)||(3254-3339)
scaffold0158 (11-96)||(6920-7005)
scaffold0158 (159-238)||(2960-3040)
scaffold0158 (159-238)||(6626-6706)
scaffold0158 (274-327)||(2854-2907)
scaffold0158 (274-327)||(6520-6573)
[»] scaffold0064 (1 HSPs)
scaffold0064 (11-96)||(64282-64367)
[»] scaffold1048 (1 HSPs)
scaffold1048 (34-106)||(1818-1890)
[»] scaffold0451 (1 HSPs)
scaffold0451 (11-63)||(11430-11482)
[»] scaffold0114 (1 HSPs)
scaffold0114 (12-96)||(7705-7789)
[»] scaffold0342 (2 HSPs)
scaffold0342 (11-106)||(6900-6995)
scaffold0342 (273-326)||(7311-7364)
[»] scaffold0015 (2 HSPs)
scaffold0015 (113-263)||(192189-192340)
scaffold0015 (34-104)||(191969-192039)
[»] scaffold0311 (2 HSPs)
scaffold0311 (102-223)||(6939-7061)
scaffold0311 (11-71)||(6697-6757)
[»] scaffold0483 (1 HSPs)
scaffold0483 (43-104)||(714-775)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (11-96)||(15816-15901)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (156-334)||(16579-16756)
scaffold0034 (31-81)||(16313-16363)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (212-326)||(38451-38573)
scaffold0023 (13-104)||(23288-23379)
scaffold0023 (11-96)||(38119-38204)
[»] scaffold0585 (2 HSPs)
scaffold0585 (275-334)||(9347-9406)
scaffold0585 (11-82)||(9739-9810)
[»] scaffold0111 (4 HSPs)
scaffold0111 (216-334)||(8512-8628)
scaffold0111 (216-334)||(15656-15772)
scaffold0111 (159-239)||(32554-32636)
scaffold0111 (293-325)||(32459-32491)
[»] scaffold0093 (1 HSPs)
scaffold0093 (226-326)||(4790-4898)
[»] scaffold0415 (1 HSPs)
scaffold0415 (194-304)||(439-543)
[»] scaffold1895 (1 HSPs)
scaffold1895 (11-96)||(867-952)
[»] scaffold0297 (3 HSPs)
scaffold0297 (11-96)||(10440-10525)
scaffold0297 (11-96)||(15298-15383)
scaffold0297 (290-326)||(15737-15773)
[»] scaffold0149 (2 HSPs)
scaffold0149 (122-228)||(3872-3980)
scaffold0149 (122-228)||(8303-8411)
[»] scaffold0101 (1 HSPs)
scaffold0101 (11-96)||(8576-8661)
[»] scaffold0096 (2 HSPs)
scaffold0096 (11-96)||(15968-16053)
scaffold0096 (273-326)||(16389-16442)
[»] scaffold0484 (1 HSPs)
scaffold0484 (11-71)||(1346-1406)
[»] scaffold0210 (6 HSPs)
scaffold0210 (11-71)||(21425-21485)
scaffold0210 (11-71)||(29317-29377)
scaffold0210 (105-175)||(21670-21740)
scaffold0210 (105-175)||(29562-29632)
scaffold0210 (273-326)||(21844-21897)
scaffold0210 (273-326)||(29736-29789)
[»] scaffold0157 (1 HSPs)
scaffold0157 (194-325)||(32620-32745)
[»] scaffold0185 (1 HSPs)
scaffold0185 (210-327)||(33569-33694)
[»] scaffold0056 (2 HSPs)
scaffold0056 (273-327)||(14127-14181)
scaffold0056 (11-104)||(13696-13789)
[»] scaffold0671 (2 HSPs)
scaffold0671 (273-326)||(6118-6171)
scaffold0671 (11-96)||(6518-6603)
[»] scaffold0475 (1 HSPs)
scaffold0475 (26-71)||(9519-9564)
[»] scaffold0220 (1 HSPs)
scaffold0220 (11-104)||(4552-4645)
[»] scaffold0555 (1 HSPs)
scaffold0555 (35-71)||(10210-10246)
[»] scaffold0215 (1 HSPs)
scaffold0215 (12-96)||(27238-27322)
[»] scaffold0165 (2 HSPs)
scaffold0165 (11-71)||(3913-3973)
scaffold0165 (11-71)||(7977-8037)
[»] scaffold0410 (2 HSPs)
scaffold0410 (279-326)||(2191-2238)
scaffold0410 (193-263)||(11472-11542)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (35-102)||(1749-1816)
scaffold0261 (189-239)||(1459-1509)
[»] scaffold0081 (4 HSPs)
scaffold0081 (11-94)||(15088-15171)
scaffold0081 (273-326)||(14687-14740)
scaffold0081 (273-326)||(23702-23755)
scaffold0081 (273-326)||(39126-39179)
[»] scaffold0021 (1 HSPs)
scaffold0021 (122-254)||(174871-175005)
[»] scaffold0026 (1 HSPs)
scaffold0026 (35-97)||(39573-39635)
[»] scaffold0598 (1 HSPs)
scaffold0598 (34-71)||(704-741)
[»] scaffold0427 (1 HSPs)
scaffold0427 (34-71)||(13927-13964)
[»] scaffold0423 (1 HSPs)
scaffold0423 (34-71)||(10913-10950)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (34-71)||(34563-34600)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (35-96)||(20398-20459)
[»] scaffold0113 (1 HSPs)
scaffold0113 (34-71)||(32496-32533)
[»] scaffold0102 (1 HSPs)
scaffold0102 (35-96)||(48103-48164)
[»] scaffold1842 (1 HSPs)
scaffold1842 (35-71)||(702-738)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (35-71)||(2727-2763)
[»] scaffold0628 (1 HSPs)
scaffold0628 (35-75)||(2445-2485)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (35-71)||(5280-5316)
[»] scaffold0389 (1 HSPs)
scaffold0389 (35-71)||(13250-13286)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (35-71)||(368-404)
scaffold0358 (35-71)||(5144-5180)
[»] scaffold0266 (1 HSPs)
scaffold0266 (35-71)||(18600-18636)
[»] scaffold0221 (1 HSPs)
scaffold0221 (35-71)||(12451-12487)
[»] scaffold0151 (1 HSPs)
scaffold0151 (35-71)||(10587-10623)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (35-71)||(13383-13419)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (35-71)||(167632-167668)


Alignment Details
Target: scaffold0036 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0036
Description:

Target: scaffold0036; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 66277 - 66510
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  66277 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 66376  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66377 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 66476  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  66477 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 66510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 66045 - 66140
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  66045 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatt 66140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0036; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 71186 - 71281
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  71186 cagagagcatgtcgaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctaatatagattagaggatgatt 71281  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 4)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 53809 - 53576
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  53809 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 53710  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53709 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 53610  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53609 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 53576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 54041 - 53946
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  54041 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 53946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 36046 - 36171
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  36046 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 36139  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  36140 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 36171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 272 - 325
Target Start/End: Original strand, 65838 - 65891
Alignment:
Q  272 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  65838 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagt 65891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 114)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 11312892 - 11312659
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  11312892 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 11312793  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312792 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 11312693  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11312692 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 11312659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 105 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 12318368 - 12318138
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||    
T  12318368 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgatttatt 12318269  T
Q  205 gattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 304  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318268 gattgattgcattacttgaattattattgaatgattaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 12318169  T
Q  305 aattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12318168 aattaactaagttgcatgagtctgaataaga 12318138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 15605134 - 15605365
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  15605134 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgttaagtgattataatgtgattt 15605233  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15605234 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 15605333  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 332  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  15605334 tgttaattaactaaaatgcatgagtctgaata 15605365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 197; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 13635343 - 13635563
Alignment:
Q  114 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattg 213  Q
    |||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  13635343 gaaccttaggtactaatgaggcctatttaagatattaacagagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgattg 13635442  T
Q  214 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 313  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13635443 cattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 13635542  T
Q  314 agttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  13635543 agttgcatgagtctgaataag 13635563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 181; E-Value: 9e-98
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16583487 - 16583268
Alignment:
Q  114 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattg 213  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  16583487 gaaccttaggtactaatgagacctatataagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttat-gattgattg 16583389  T
Q  214 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 313  Q
    |||||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16583388 cattacttgaattattgttgaatgatcgagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 16583289  T
Q  314 agttgcatgagtctgaataag 334  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  16583288 cgttgcatgagtctgaataag 16583268  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 174; E-Value: 1e-93
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 15580935 - 15580702
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| | ||||||||||||  || ||||||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15580935 tgattaggaatggaactttaggttatagtgagacctatttaggatgttaactgaaaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 15580836  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15580835 attaattgattgcattacttgaattattattgaatgataaaaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatc 15580736  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15580735 gttatttaactaagttgcatgagtctgaataaga 15580702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 70628 - 70850
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  70628 gattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 70727  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  70728 ttgattgattgcattacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattg 70827  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  70828 ttatttaactaagttgcatgagt 70850  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 74737 - 74959
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  74737 gattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 74836  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  74837 ttgattgattgcattacttgaattattattgaataattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattg 74936  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  74937 ttatttaactaagttgcatgagt 74959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 9593586 - 9593361
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||| | || | ||||     
T  9593586 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatg 9593487  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  9593486 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 9593389  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  9593388 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 9593361  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33350 - 33128
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  33350 gattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 33251  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||    
T  33250 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgttccgattatgctgttattg 33151  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||| ||||||||||||    
T  33150 ttatttaactcagttgcatgagt 33128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12715097 - 12714885
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12715097 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12714998  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12714997 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12714898  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  12714897 aagttacatgagt 12714885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12718901 - 12718689
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12718901 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12718802  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12718801 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12718702  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  12718701 aagttacatgagt 12718689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16114474 - 16114262
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16114474 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16114375  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16114374 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16114275  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  16114274 aagttacatgagt 16114262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16117627 - 16117415
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16117627 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16117528  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16117527 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16117428  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  16117427 aagttacatgagt 16117415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 16907074 - 16907286
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16907074 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16907173  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16907174 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16907273  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  16907274 aagttacatgagt 16907286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18283599 - 18283387
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  18283599 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 18283500  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18283499 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 18283400  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  18283399 aagttacatgagt 18283387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 126; E-Value: 6e-65
Query Start/End: Original strand, 160 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 39722452 - 39722287
Alignment:
Q  160 tgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatga 259  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  39722452 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatga 39722353  T
Q  260 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
     ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  39722352 gttgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 39722287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18923 - 19148
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  18923 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatg 19022  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  19023 gattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 19120  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  19121 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 19148  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 18279636 - 18279424
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  18279636 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 18279537  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18279536 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 18279437  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  18279436 aagttacatgagt 18279424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 26292628 - 26292416
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  26292628 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgacttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 26292529  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  26292528 gcattaattgaattattattgaatgataaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 26292429  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  26292428 aagttgcatgagt 26292416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 124; E-Value: 9e-64
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 12704521 - 12704744
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    ||||||| | |||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||    
T  12704521 gattaggaatggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattt 12704620  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| | |||||||||||||||||||    
T  12704621 attgattgaatgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgctgatataatctgattatgctgctatt 12704720  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||||||| |||||||    
T  12704721 gttatttaactaagttacatgagt 12704744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12723812 - 12723600
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12723812 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12723713  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  12723712 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaataaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgatattgttatttaact 12723613  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  12723612 aagttacatgagt 12723600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 111 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 11987447 - 11987225
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaa-gatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattg 209  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||  | |||| |||| |||||    
T  11987447 aaggaaccttaggtactagtgagacctattaaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaataataagtgaattatggattg 11987348  T
Q  210 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 308  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||    
T  11987347 attgcatttacttgatttattattgaatgatcaagaaactgttgaaaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttattt 11987250  T
Q  309 aactaagttgcatgagtctgaataa 333  Q
    |||||||||||||||||||||||||    
T  11987249 aactaagttgcatgagtctgaataa 11987225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 105 - 269
Target Start/End: Complemental strand, 9644549 - 9644384
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||| | || | ||||     
T  9644549 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatg 9644450  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 269  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  9644449 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttatta 9644384  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14430137 - 14429905
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  14430137 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatt 14430038  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||  |||||| |||||||||||||||    
T  14430037 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtatactgttgttgtgatctgattatg 14429939  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14429938 cggctattgttatttaactaagttgcatgagtct 14429905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8917661 - 8917439
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga 210  Q
    |||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  8917661 aaggaactttgggtgctaatgagacctattaaagatattgaccgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 8917562  T
Q  211 ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||| ||| ||||||| | |    
T  8917561 ttgcatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgttgcaattgttattaa 8917464  T
Q  310 actaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||| ||||||||    
T  8917463 actaagttgcatgagtatgaataag 8917439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13149395 - 13149167
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  13149395 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 13149296  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  13149295 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 13149198  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  13149197 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 13149167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 86; E-Value: 4e-41
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 12321603 - 12321836
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | ||||||| || ||||||| || |||||  ||||| ||||||||    
T  12321603 tgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaaactgttatgaactgttaagttgattataatgtgatt 12321702  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  12321703 taatgattaattgcattacttgaaatattatggaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattat 12321801  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  12321802 gctgctattgttatttaactacgttgcatgagtct 12321836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13462002 - 13461773
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtg-atttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| || |||||||||| ||||||| ||||||| || ||| | ||||||| ||| | ||||    
T  13462002 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatgttgactgagaactctgaagcttttatgaattgttaattgattatgaagtgaaattat 13461903  T
Q  204 tgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     |||||||||   |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  13461902 ggattgattgtttttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 13461805  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    | | | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  13461804 taattaaactaatttgcatgagtatgaataag 13461773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11313124 - 11313029
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11313124 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 11313029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 13918735 - 13918872
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  13918735 tgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatg 13918831  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  13918832 ctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 13918872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 3272078 - 3271846
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||||||| ||||||| |  |||| | ||||||||||||||    
T  3272078 tgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatt 3271979  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||    
T  3271978 tactgattaattgcattacttgaa-tattattgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgatta 3271881  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  3271880 tgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 3271846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 1859041 - 1859178
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| |||||||||  || |||||| ||||||||    
T  1859041 tgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgttattaagct--tgttgtgatttgattatg 1859137  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  1859138 ctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 1859178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 195 - 330
Target Start/End: Original strand, 16457312 - 16457446
Alignment:
Q  195 gtgatttattgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    |||| |||| ||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||||||||    
T  16457312 gtgaattatggattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatg 16457409  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    |||| ||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  16457410 ctgcaattgttattaaactatgttgcatgagtctgaa 16457446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 212 - 331
Target Start/End: Original strand, 7519331 - 7519447
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||    
T  7519331 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaac 7519427  T
Q  312 taagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||||||| ||||||||||||    
T  7519428 taagttggatgagtctgaat 7519447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 15581168 - 15581076
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||||||||||||||||    
T  15581168 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatg 15581076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 16724496 - 16724723
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||     
T  16724496 ttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatg 16724594  T
Q  205 gattg-attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||| |||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  16724595 gattgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattg 16724691  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  16724692 ttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 16724723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 17701510 - 17701737
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | ||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||     
T  17701510 ttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaag-ttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatg 17701608  T
Q  205 gattg-attgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||| |||  | ||| |||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| | |||||||||| ||||    
T  17701609 gattgaattatatttatttgaattattgttgaatgatcaagaa-ctattgagaatgacttgttatttaac--ctgatgtgatttcattatgctgcaattg 17701705  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  17701706 ttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 17701737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12318603 - 12318508
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||||    
T  12318603 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaagattagagggtgatt 12318508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 15604902 - 15604997
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||| ||||||||||||||    
T  15604902 cagagagcatgtcgaattctgagcttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtttactaaatattagaggatgatt 15604997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16583709 - 16583615
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16583709 agagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 16583615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 25927457 - 25927595
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||  ||||||| |  ||||||||| |||||||    
T  25927457 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaatttttattaagtt--tgatgtgatttgattat 25927553  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  25927554 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 25927595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2760386 - 2760153
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| ||| || | || ||||||||  ||  | ||||||||    
T  2760386 tgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 2760288  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||  |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| |         ||||| ||||||||||||||    
T  2760287 taatgattaaatgcattacttgagatattattgaatgatcatgatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctgattat 2760188  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| | |||| |||||||||||||||||||||    
T  2760187 gctgctttcgttatttaactaagttgcatgagtct 2760153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 9751703 - 9751849
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgat 279  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| || ||||||||||||| |       ||||||||    
T  9751703 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttggaa-tgaattgatattatgaattatactgttgat 9751801  T
Q  280 gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
     ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9751802 atgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 9751849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 6801452 - 6801229
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtg-atttat 203  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||||| ||| | ||||    
T  6801452 ttaggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagccattatgatatattaagtgattatgaagtgaaattat 6801354  T
Q  204 tgattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  ||||  |||| |||||||||||| ||||    
T  6801353 ggattgattgcccttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacatgatttgattatgctgcaattg 6801257  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    ||| | ||||| |||||||| |||||||    
T  6801256 ttattaaactatgttgcatgggtctgaa 6801229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 13635099 - 13635194
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| ||||||| ||||||    
T  13635099 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtctactaaaaattagagaatgatt 13635194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 2832389 - 2832536
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||      ||||||    
T  2832389 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatattgttga 2832487  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  2832488 tgggatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 2832536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26292871 - 26292776
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  26292871 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 26292776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15728565 - 15728337
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||| || |||| ||||     
T  15728565 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatg 15728467  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  15728466 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 15728369  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  15728368 ttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 15728337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 2530344 - 2530484
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatg-tgatctgatta 291  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||  ||  ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||||||  ||||  |||| ||||||    
T  2530344 atgtgatttaatgattaaatgcattactcaaaaaattatggaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagct--tgattatgatttgatta 2530441  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  2530442 tgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 2530484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 14217155 - 14216927
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||     
T  14217155 ttaggaaaggaactgtaggtgctaatgagacctaataatgatattgactaagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgagttatg 14217057  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  14217056 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 14216959  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  14216958 ttattgaactaagttgcatgaatatgaataag 14216927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 48593085 - 48593181
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagttttt-gacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  48593085 cagagagcatgtcgaattctgagttttttgacttttgagttgaaccttggatgtctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatt 48593181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9593817 - 9593726
Alignment:
Q  15 gagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  9593817 gagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 9593726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9644780 - 9644689
Alignment:
Q  15 gagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  9644780 gagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 9644689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 17701275 - 17701370
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  17701275 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagagaatgatt 17701370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #56
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 39267847 - 39267994
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  39267847 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatagtattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 39267945  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  39267946 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 39267994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8917902 - 8917807
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  8917902 cagagagcatgtctttttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 8917807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16724261 - 16724356
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||  ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16724261 cagagagcatgtcaaattctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtaactactattgattagagaatgatt 16724356  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 212 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18425566 - 18425450
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 311  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||| |||||    
T  18425566 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttatttaac 18425473  T
Q  312 taagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||| || | ||||||||    
T  18425472 taagttgcaagaatatgaataag 18425450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 17137682 - 17137775
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  17137682 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 17137775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #61
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 105 - 193
Target Start/End: Original strand, 16438899 - 16438987
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatga 193  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||  ||||||||| ||||| |||||||    
T  16438899 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattaaagatatggactgagaactgtgaagcttatatgaaatgttaagtgattatga 16438987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #62
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 11020 - 11091
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11020 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 11091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #63
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 18688 - 18759
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18688 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 6801688 - 6801617
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  6801688 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 6801617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11987688 - 11987617
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  11987688 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 11987617  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13149630 - 13149559
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  13149630 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 13149559  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 13462221 - 13462166
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13462221 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 13462166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 14430379 - 14430284
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  14430379 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttgagatgtttattaaagattagatgatgatt 14430284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 45169966 - 45170091
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  45169966 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 45170059  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  45170060 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 45170091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #70
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 105 - 158
Target Start/End: Original strand, 48593321 - 48593374
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa 158  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48593321 ttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaa 48593374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #71
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 3272264 - 3272193
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || |||||||||||||||||||    
T  3272264 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagaggatgatt 3272193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #72
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 12321361 - 12321448
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||    
T  12321361 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagacgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaga 12321448  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #73
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 15728784 - 15728729
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15728784 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 15728729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #74
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 16275967 - 16275881
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattct-gagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||| || |||| ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  16275967 cagagagcatgttga-ttctcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattag 16275881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #75
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 18557199 - 18556996
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-t 216  Q
    |||||| ||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||  ||||||  || ||||| |||| ||  ||| ||||   |||| ||| | |    
T  18557199 ttaggtgctagtgagacctattaaagatattatctgagaactgtgaagc-cttatgagttgttaagtgattaagaaatgaattatgatttgatttgtatt 18557101  T
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  18557100 tacttgaattattgttaaatgatcaagaaactattgagaatgatttgctattgaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactaagt 18557003  T
Q  317 tgcatga 323  Q
    |||||||    
T  18557002 tgcatga 18556996  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #76
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 42205566 - 42205495
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||    
T  42205566 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttttctatagattagaggatgatt 42205495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #77
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 86
Target Start/End: Original strand, 16438665 - 16438739
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    ||||||||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||    
T  16438665 agagagcatgtcattttctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatcta 16438739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #78
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 35152081 - 35152011
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  35152081 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 35152011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #79
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 9446020 - 9446253
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| || |||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||    
T  9446020 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacatatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatt 9446119  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  9446120 taacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattat 9446218  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  9446219 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 9446253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #80
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 9703767 - 9703682
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  9703767 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagatta 9703682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #81
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 10508701 - 10508786
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  10508701 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 10508786  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #82
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 35151795 - 35151618
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||  | || ||||||||||| ||||||||| |||||| | ||||    
T  35151795 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttgcttgaattattgttgaatgatgaagaagctattga 35151697  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
      |||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  35151696 gtatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 35151618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #83
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 137 - 205
Target Start/End: Original strand, 2530040 - 2530108
Alignment:
Q  137 tatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattg 205  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||||| |||||    
T  2530040 tatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgatatattg 2530108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #84
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 295 - 335
Target Start/End: Original strand, 14152048 - 14152088
Alignment:
Q  295 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14152048 tgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 14152088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #85
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 18557428 - 18557372
Alignment:
Q  30 tgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  18557428 tgagtttttgacttttgagttgaaccttagaggcctttgagtacctttaggtgtcta 18557372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #86
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2760604 - 2760533
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||||    
T  2760604 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatt 2760533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #87
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16275563 - 16275504
Alignment:
Q  275 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16275563 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16275504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #88
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 20569258 - 20569321
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| ||||| || ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||||||||    
T  20569258 tttgagttgaacttttgatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattataggatgatt 20569321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #89
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 113 - 176
Target Start/End: Complemental strand, 42205347 - 42205284
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaa 176  Q
    ||||||||||||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| |||||||    
T  42205347 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaa 42205284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #90
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 12187514 - 12187429
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||| ||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  12187514 cagagaacatgttgaattctgtagttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 12187429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #91
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 9445811 - 9445883
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||| ||| || ||||||||||||| |||||    
T  9445811 ttttggacttttgagttgaaccttagatgctttcgagtagctttagatgtttactaaagattagaggttgatt 9445883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #92
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 14217390 - 14217302
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||||||||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||| ||| ||  ||||||||    
T  14217390 cagagagcatgtctttttctgagttttttacttttgagttgaaccttagatgccttggagtaccattaggtgcctactattgattagag 14217302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #93
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16114686 - 16114623
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16114686 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactatcgattagagaatgatt 16114623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #94
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16117839 - 16117776
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16117839 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactatcgattagagaatgatt 16117776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #95
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 16906862 - 16906925
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16906862 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 16906925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #96
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18279848 - 18279785
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18279848 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 18279785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #97
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42204064 - 42204017
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  42204064 tgtgatctgattatgctgctgttgttgtttaactaagttgcatgagtc 42204017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #98
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 11880753 - 11880668
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||| |||||    
T  11880753 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 11880668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #99
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Original strand, 20569474 - 20569619
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||| |  ||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  20569474 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgatacatgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 20569573  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  20569574 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 20569619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #100
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24054523 - 24054478
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  24054523 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataaga 24054478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #101
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15211520 - 15211484
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  15211520 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 15211484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12715309 - 12715246
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  12715309 tttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 12715246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #103
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12719113 - 12719050
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  12719113 tttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 12719050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #104
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12724024 - 12723961
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  12724024 tttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 12723961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #105
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15211928 - 15211869
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| ||||||||   | ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15211928 agagagcatgttgaattctgtactcttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15211869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #106
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18283811 - 18283748
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18283811 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgcctactattgattagagaatgatt 18283748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #107
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Original strand, 19649434 - 19649484
Alignment:
Q  189 tatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 239  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  19649434 tatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 19649484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #108
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 19649530 - 19649592
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19649530 tgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataaga 19649592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 15754528 - 15754565
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15754528 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 15754565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24054945 - 24054884
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  24054945 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 24054884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 27847485 - 27847522
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  27847485 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 27847522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34201263 - 34201226
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34201263 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 34201226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 40443857 - 40443820
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  40443857 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 40443820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 16385900 - 16385936
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16385900 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16385936  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 218; Significance: 1e-120; HSPs: 119)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17804441 - 17804208
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  17804441 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 17804342  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804341 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 17804242  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17804241 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 17804208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 25767030 - 25767263
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||    
T  25767030 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaaactattatgaaatgctaagtgattataatgtaattt 25767129  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25767130 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttggtgtgatctgattatgctgctatt 25767229  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25767230 gttacttaactaagttgcatgagtctgaataaga 25767263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 22429892 - 22430122
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| | ||||||||||||  |  ||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  22429892 tgattaggaatggaactttaggttatggtgagacctatttaagatgttagctgagaactgtgaagttattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 22429991  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22429992 attgattgattgcattacttgaattattattaaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctata 22430091  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaata 332  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22430092 gttaattaactaagttgcatgagtctgaata 22430122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 151; E-Value: 7e-80
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14472513 - 14472292
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  14472513 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 14472414  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||    
T  14472413 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattg 14472314  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  14472313 tt-attaactaagttgcatgagt 14472292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22863189 - 22862967
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  22863189 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 22863090  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  22863089 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattagaaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattg 22862990  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  22862989 ttatttaactaagttgcatgagt 22862967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 113 - 325
Target Start/End: Original strand, 18955636 - 18955848
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||| |||||||||||    
T  18955636 ggaactttaggtactaatgagacctatataagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattgattgattgatt 18955735  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | ||||    
T  18955736 gcattacttgaattattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaact 18955835  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  18955836 aagttgcatgagt 18955848  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19870823 - 19870611
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19870823 gaactttaggtacatagtgtgacctatttaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19870724  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19870723 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgataataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19870624  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  19870623 aagttacatgagt 19870611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1644918 - 1644726
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1644918 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 1644819  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||||||||    
T  1644818 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaactaagttgcatgagt 1644726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11567095 - 11566883
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11567095 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11566996  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  11566995 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 11566896  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  11566895 aagttacatgagt 11566883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 109 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 12706926 - 12706705
Alignment:
Q  109 ggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgatt 208  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| |  ||| |||| ||||    
T  12706926 ggaagaaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaaatgaattatggatt 12706827  T
Q  209 gattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 307  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  12706826 gattgcatttacttgaattatttttgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 12706729  T
Q  308 taactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||||||||||||||||||||||||    
T  12706728 taactaagttgcatgagtctgaat 12706705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23395301 - 23395089
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  23395301 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 23395202  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23395201 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 23395102  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  23395101 aagttacatgagt 23395089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23990153 - 23989941
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  23990153 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 23990054  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || |||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  23990053 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtaataagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 23989954  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  23989953 aagttacatgagt 23989941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 8244074 - 8243882
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||| ||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8244074 gacctattaaagataatgattgtgaattgtggagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 8243975  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  8243974 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaactaagttacatgagt 8243882  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 16741447 - 16741222
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||     
T  16741447 ttaggaaatgaactttaggtactagtgagacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatg 16741348  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| | ||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||| | |||||    
T  16741347 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgacagtgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctacaattgt 16741250  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || | |||||||||||||| ||||||||    
T  16741249 tattaaactaagttgcatgtgtctgaat 16741222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 117; E-Value: 1e-59
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Original strand, 18917159 - 18917351
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18917159 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattgcttgaattattatt 18917258  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||| |||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18917259 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattgggctgttgatatgatataattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 18917351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 12618718 - 12618929
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12618718 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgatt 12618817  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  12618818 gcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 12618916  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  12618917 aagttacatgagt 12618929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 18907366 - 18907133
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||||||||    
T  18907366 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatatgtgaagctgttatgaactgttaagttcattataatgtgatt 18907267  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18907266 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattat 18907168  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  18907167 gctgctattgttatttaactaagctgcatgagtct 18907133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 5616679 - 5616908
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtaattatgatgtgatttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||    
T  5616679 ttaggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattat 5616778  T
Q  204 tgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||| ||| |||||| ||  ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  5616779 ggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgagaatgatttgttattaaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattg 5616876  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  5616877 ttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 5616908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 2685184 - 2685407
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  2685184 ttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 2685283  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  2685284 gattgattgcccttacttgaattattgtcgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 2685380  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  2685381 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 2685407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 19663009 - 19662787
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  19663009 ttaggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 19662911  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  19662910 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 19662814  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  19662813 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 19662787  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 9482158 - 9482386
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||| | ||||  |||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  ||| ||||     
T  9482158 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgaactattaaagataatgactgtaaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattatgaaatgaattata 9482257  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | |||    
T  9482258 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgcttatgctgcaaatgt 9482355  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9482356 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 9482386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17804673 - 17804578
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  17804673 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 17804578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23414796 - 23414658
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  23414796 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 23414700  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23414699 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 23414658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27556554 - 27556416
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  27556554 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 27556458  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  27556457 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 27556416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 22429660 - 22429755
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  22429660 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttctgagtgcctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 22429755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 22592669 - 22592884
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  22592669 ttaggaaagaaactttaggtactaatgtgacctattaaagataataactgtgaactgtgaag-ttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 22592767  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||| | | |||    
T  22592768 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctacaaatgt 22592865  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  22592866 tatttaactaagttgcatg 22592884  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 212 - 335
Target Start/End: Original strand, 27325581 - 27325713
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||||||||  |||||| |||||||||||||||||| |        ||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  27325581 tgcattacttgaaatattatggaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatgtgatatgattatgctgctattg 27325680  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27325681 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 27325713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 12496549 - 12496333
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||| | |||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||| ||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  12496549 ttaggaaaggaactttaggtagttatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttaggaactgttaagagattatgaactgaaatatg 12496450  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-taagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||  || ||||   ||||||||||||||||||| | ||    
T  12496449 gattgattgcctttacttgaaatattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttatagaacctgt---tgtgatctgattatgctgcaaatg 12496353  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatg 322  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  12496352 ttatttaactaagttgcatg 12496333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 25766798 - 25766890
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatg 103  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  25766798 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccattaggtgtctactaaagattagaggatg 25766890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 27415804 - 27415901
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  27415804 tgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 27415901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 1587596 - 1587824
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||| | |||| || |||| ||||     
T  1587596 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattaggaagtgaattatg 1587694  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  1587695 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 1587792  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  1587793 ttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 1587824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 16523332 - 16523478
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgat 279  Q
    ||||| |||||||||| ||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |  ||       || |    
T  16523332 attataatgtgatttaatgattaattgcattacctgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataaagttgtt 16523430  T
Q  280 gtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16523431 gtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 16523478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1645181 - 1645086
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  1645181 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttatatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 1645086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 9481923 - 9482018
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||  |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  9481923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 9482018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 20907854 - 20908076
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| ||| |||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| |    
T  20907854 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgggaagttgttaagaattgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaa 20907952  T
Q  211 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  ||    
T  20907953 atgcattacttgaattattcttgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattatgctgctgctg 20908051  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  20908052 ttatttaactaagttgcatgagtct 20908076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 20803418 - 20803647
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||| |||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||     
T  20803418 ttaggaaaagaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgacttagaactgtgaagcttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatg 20803517  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  20803518 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 20803615  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||| ||||||| | ||||||||    
T  20803616 ttattaaactaagctgcatgaatatgaataag 20803647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16741683 - 16741588
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||| ||  |||||||| ||||||    
T  16741683 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtatctactattgattagagaatgatt 16741588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 19790657 - 19790873
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  19790657 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 19790756  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || |||||||||||||||||||| |||||| |||    
T  19790757 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgatgttgtgatctgattatgctgctgttgttattta 19790856  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  19790857 actaagttgcatgagtc 19790873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 22592434 - 22592529
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  22592434 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacatttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattaggggatgatt 22592529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 20803182 - 20803252
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20803182 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 20803252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 133 - 269
Target Start/End: Original strand, 21834782 - 21834916
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattat 231  Q
    |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| ||   || ||||||||  ||||| |||||||||| ||||| | || |||||||||| ||||||    
T  21834782 gacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgttt--aactgctaagttgattataatgtgatttaatgattaaatgtattacttgaaatattat 21834879  T
Q  232 tgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 269  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21834880 tgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21834916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18907609 - 18907524
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||| || ||| ||||||||||||    
T  18907609 cagagagcatgtcgaattctgtattttttacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtaccttcagatgtgtattaaagatta 18907524  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Complemental strand, 12496784 - 12496706
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctatta 89  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  12496784 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcatttgagtacctttaggtgcctatta 12496706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18180656 - 18180517
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatc 285  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||    
T  18180656 atgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatc 18180558  T
Q  286 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  18180557 tgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 18180517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21766839 - 21766718
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||| |||||||||    
T  21766839 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctatgttgctattgt 21766741  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  21766740 tatttaactaagttgcatgagtc 21766718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Original strand, 27416148 - 27416278
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | |||||||||  || ||||| ||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||      |||||||    
T  27416148 atgtgatttaatgattaaatgcattactctaaatattaatgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgat------tgattat 27416238  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 332  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  27416239 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 27416278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 12707148 - 12707076
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  12707148 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagag 12707076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16624278 - 16624144
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| |||||||   ||||| |||  ||||||||    
T  16624278 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaagtattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaag--tttgatatgaattgattatg 16624185  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16624184 ctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 16624144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18180989 - 18180894
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| |||||  | | ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||||    
T  18180989 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatgatt 18180894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 19663244 - 19663173
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19663244 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 19663173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 21834509 - 21834604
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  |  ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21834509 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaaaatgtttattaaagattagatgatgatt 21834604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 31477770 - 31477895
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  31477770 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 31477863  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  31477864 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 31477895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Original strand, 19790448 - 19790502
Alignment:
Q  50 tgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19790448 tgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatga 19790502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 27567262 - 27567334
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  27567262 ttttggacgtttgagttgaaccttatatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 27567334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 1587377 - 1587432
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  1587377 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 1587432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 2684987 - 2685042
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  2684987 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 2685042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 5616460 - 5616515
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  5616460 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 5616515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 16523022 - 16523109
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||  |||| || ||| ||||||||||||||    
T  16523022 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagcgccttaagatgtttattaaagattaga 16523109  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 16760441 - 16760316
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  16760441 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 16760348  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||| ||||    
T  16760347 ctgcaattgttgttaaactaagttgcacgagt 16760316  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22949254 - 22949129
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  22949254 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 22949161  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22949160 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 22949129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22953210 - 22953085
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  22953210 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 22953117  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  22953116 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 22953085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23871698 - 23871573
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  23871698 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 23871605  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  23871604 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 23871573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 23875654 - 23875529
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  23875654 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 23875561  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  23875560 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 23875529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #64
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 1644415 - 1644300
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  1644415 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 1644318  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  1644317 tgcaagagtatgaataag 1644300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 20907634 - 20907704
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||    
T  20907634 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgaatacctttagatgtgtattatagattagaggatga 20907704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #66
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21702763 - 21702693
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21702763 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 21702693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #67
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Original strand, 31478100 - 31478169
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  31478100 atgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 31478169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #68
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 31478209 - 31478324
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  31478209 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 31478306  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  31478307 tgcaagagtatgaataag 31478324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #69
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21739641 - 21739734
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| || ||||||||||| |||||    
T  21739641 cagagagcatgttgaattctgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttactaaagattagatgatga 21739734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #70
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 23657073 - 23657145
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| | ||||||||| |||||||    
T  23657073 ttttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctacttaagattagatgatgatt 23657145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 18955409 - 18955488
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18955409 ttctgagtttttgatttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 18955488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 19848034 - 19848089
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19848034 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19848089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #73
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 25135302 - 25135373
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  25135302 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagtacctttaggtg 25135373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #74
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Original strand, 27415596 - 27415663
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  27415596 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggat 27415663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #75
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 27553269 - 27553332
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||| |||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  27553269 tttgagttgaaccttggatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 27553332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #76
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 27553612 - 27553666
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||    
T  27553612 tgttgttgtgatctgattatgctgctgttgttctttaactaagttgcatgagtct 27553666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 15894310 - 15894427
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattact 220  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| ||||||   | |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  15894310 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactacaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 15894409  T
Q  221 tgaattattattgaatga 238  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  15894410 tgaaatgttaatgaatga 15894427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #78
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 271 - 327
Target Start/End: Original strand, 15041589 - 15041645
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||| |||||||||  |||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15041589 gctgttgttgtgatctgcctatgctactattgttatttaactaagttgcatgagtct 15041645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 8244305 - 8244242
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  8244305 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 8244242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11567307 - 11567244
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  11567307 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 11567244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 12618506 - 12618569
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  12618506 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 12618569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22863390 - 22863327
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  22863390 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 22863327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23395513 - 23395450
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  23395513 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 23395450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23990365 - 23990302
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  23990365 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 23990302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23992509 - 23992454
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  23992509 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttagctaagttgcatgagtc 23992454  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #86
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 25642133 - 25642196
Alignment:
Q  189 tatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 252  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  25642133 tatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 25642196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #87
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 1644524 - 1644462
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 255  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  1644524 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatatttttgaatgatcaagatgttgttgaaa 1644462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #88
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 15894479 - 15894533
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  15894479 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtct 15894533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #89
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 168
Target Start/End: Original strand, 16523264 - 16523330
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagct 168  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  16523264 tgattagggttggatccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagct 16523330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #90
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 97
Target Start/End: Original strand, 18409469 - 18409531
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||| |  |||||||||| ||||||    
T  18409469 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagtgccttaacatgtctattaatgattag 18409531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #91
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Original strand, 4185456 - 4185501
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4185456 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 4185501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #92
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Original strand, 4667846 - 4667891
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4667846 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 4667891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #93
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Original strand, 4674693 - 4674738
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4674693 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 4674738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #94
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21702477 - 21702300
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||  | || |||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  21702477 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatactttcttgaatttttgttgaatgatcaagaaactattga 21702379  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
      |||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| |||| |||||||||||| | ||||||||    
T  21702378 gtatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattttgctgcaattgttatttaattaagttgcatgattatgaataag 21702300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #95
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22432308 - 22432263
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22432308 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataaga 22432263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #96
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 22438858 - 22438813
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  22438858 tatgctgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcggtataaga 22438813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #97
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 324
Target Start/End: Original strand, 23657468 - 23657513
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgag 324  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||    
T  23657468 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgag 23657513  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #98
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 21739900 - 21740020
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| |  |||| |||||| ||| ||||| ||||||||    
T  21739900 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctggttataatgtgacttaatgattaattgcatt 21739999  T
Q  218 acttgaattattattgaatga 238  Q
    ||||||| | ||| |||||||    
T  21740000 acttgaaatgttaatgaatga 21740020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #99
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 22408257 - 22408398
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa---ttgatattaagct-----gttgatgtgat 284  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||||| |||||||   ||| ||| ||| |     |||| ||||||    
T  22408257 atgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgat 22408355  T
Q  285 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||| ||||| |||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  22408356 ctgattatactgcttttgttatttaaccaagttgcacgagtct 22408398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #100
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Original strand, 27567656 - 27567704
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||| ||||||||    
T  27567656 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgtatgagtct 27567704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #101
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19873197 - 19873134
Alignment:
Q  272 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19873197 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataaga 19873134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #102
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 113 - 236
Target Start/End: Original strand, 23657293 - 23657416
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| ||||  || |||| | |||| |||||||||| |||||| ||| |||||| ||| ||||   || | ||||||||||  |||| | |    
T  23657293 ggaactttaggtagtaatatgatctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgatatgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaat 23657392  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaat 236  Q
    ||||||||||| ||||| ||||||    
T  23657393 gcattacttgatttattcttgaat 23657416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #103
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 202 - 327
Target Start/End: Original strand, 22074174 - 22074307
Alignment:
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||| | |||| || |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || |    
T  22074174 attgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaaaatgttgctg-aaatgaattgataatcatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgt 22074272  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||| |||| ||| ||||||| | |||||||||||    
T  22074273 gctgttattattatttaactatgatgcatgagtct 22074307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #104
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 36 - 106
Target Start/End: Original strand, 22405709 - 22405779
Alignment:
Q  36 tttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||| |||| |||| || ||| || |||||||| || |||||||    
T  22405709 tttgacttttgagttgaaccttagatgctttagagtgccttgagatgtttaataaagattggatgatgatt 22405779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #105
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1561783 - 1561746
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1561783 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1561746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #106
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 4189444 - 4189399
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  4189444 attctgtgttttttacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 4189399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #107
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 16920285 - 16920322
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  16920285 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 16920322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #108
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 290 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 19863037 - 19862992
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  19863037 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataaga 19862992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #109
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19863456 - 19863395
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  19863456 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 19863395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #110
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22831971 - 22831934
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22831971 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22831934  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #111
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 25603425 - 25603478
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25603425 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25603478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #112
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 25611763 - 25611816
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25611763 tgttgttgtaatctgcctatgctgctgttgttaattaactaagtcgcatgagtc 25611816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #113
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 31155039 - 31155076
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  31155039 tttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 31155076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #114
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 16929647 - 16929683
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16929647 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtc 16929683  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #115
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 16965367 - 16965403
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  16965367 tatgctgctactgttaattaaccaagttgcatgagtc 16965403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #116
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 18821472 - 18821508
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  18821472 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 18821508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #117
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 20637936 - 20637972
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20637936 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 20637972  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #118
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 27332926 - 27332962
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27332926 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagt 27332962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #119
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 27393666 - 27393702
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||    
T  27393666 ttttgacctttaagttgaaccttagatgcttttgagt 27393702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 135)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 20461362 - 20461595
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  20461362 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 20461461  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461462 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatctgattatgctgctatt 20461561  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20461562 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 20461595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 205; E-Value: 1e-112
Query Start/End: Original strand, 104 - 335
Target Start/End: Original strand, 7793213 - 7793445
Alignment:
Q  104 attagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttat 203  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| |    
T  7793213 attaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttgt 7793312  T
Q  204 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctg-attatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  7793313 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgaattatgctgctattg 7793412  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7793413 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 7793445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15482906 - 15482675
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  15482906 tgattaggaaatgaactt-aggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 15482808  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482807 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgctcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 15482708  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15482707 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 15482675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 327026 - 327260
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  327026 tgattagaaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 327125  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctga-ttatgctgctat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||    
T  327126 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatcttagttatgctgctat 327225  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  327226 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 327260  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 175; E-Value: 3e-94
Query Start/End: Original strand, 113 - 335
Target Start/End: Original strand, 2897696 - 2897918
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || |||| |||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2897696 ggaactttaggtaatagtgaggcctatttaagatgttaactgttaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 2897795  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2897796 gcattactggaattattattgaatgatcaagaagttgatgaaaataaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttatttaact 2897895  T
Q  313 aagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  2897896 aagttgcatgagtctgaataaga 2897918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 31097419 - 31097649
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga-aatgctaagtaattatgatgtgatttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||| |||||| |||||| |||    
T  31097419 ttaggaaaggaactttaggtactactgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgagaatgctaagtgattatgttgtgatatat 31097518  T
Q  204 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  31097519 tgattgattccactacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagctattgatgtgatctgattatgctgcaattgt 31097618  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  31097619 taattaactatgttgcatgagtctgaataag 31097649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 30066192 - 30065970
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  30066192 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 30066093  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30066092 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 30065993  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  30065992 ttatttaactaagttgcatgagt 30065970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 149; E-Value: 1e-78
Query Start/End: Original strand, 113 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11854969 - 11854757
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11854969 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11854870  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||| | ||||    
T  11854869 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatgttaagttgttgatatgatctgattatgctgctattgttattaaact 11854770  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  11854769 aagttgcatgagt 11854757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 11070314 - 11070092
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||   ||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  11070314 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatatcgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 11070215  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  11070214 ttgattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattg 11070115  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  11070114 ttatttaactaagttgcatgagt 11070092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 11165392 - 11165614
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||| ||||  |||||||| ||||  |||| ||||||||||    
T  11165392 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaaactatattgaaatgccaagtgtttataatgtgattta 11165491  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  11165492 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 11165591  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  11165592 ttatttaactaagttacatgagt 11165614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 55023113 - 55022891
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | |||||||||| |||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  55023113 gattaggaatggaactttagatactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 55023014  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||    
T  55023013 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatactgctattg 55022914  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  55022913 ttatttaactaagttacatgagt 55022891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15617610 - 15617398
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  15617610 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 15617511  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
     |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15617510 acattacttgaattattattgaatgatcaggaacttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 15617411  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  15617410 aagttgcatgagt 15617398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 131; E-Value: 6e-68
Query Start/End: Original strand, 115 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 14499559 - 14499349
Alignment:
Q  115 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgc 214  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||||||| |  |||| ||||||||||||||||||||||    
T  14499559 aactttaggtagtaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaattgtttataatgtgatttattgattgattgc 14499460  T
Q  215 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaa 314  Q
    ||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||| | |||||||| ||||||||    
T  14499459 attacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgataagatctgattatgcggttattgttatttaactaa 14499360  T
Q  315 gttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||    
T  14499359 gttgcatgagt 14499349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7109934 - 7109722
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  7109934 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 7109835  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7109834 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 7109735  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  7109734 aagttacatgagt 7109722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 7113869 - 7113657
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  7113869 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 7113770  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  7113769 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 7113670  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  7113669 aagttacatgagt 7113657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22336955 - 22336743
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22336955 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22336856  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22336855 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 22336756  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  22336755 aagttacatgagt 22336743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 27409517 - 27409729
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27409517 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27409616  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27409617 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27409716  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  27409717 aagttacatgagt 27409729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 28949960 - 28949748
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  28949960 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 28949861  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  28949860 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 28949761  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  28949760 aagttacatgagt 28949748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 22321900 - 22321688
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22321900 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22321801  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  22321800 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctattgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 22321701  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  22321700 aagttacatgagt 22321688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 113 - 334
Target Start/End: Original strand, 15849958 - 15850176
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||| | |||||||| |||||||||||||| | |||||  |||||| ||| ||||||||    
T  15849958 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatatttaatgagatcggtgaagcttttatgaaatgctaaatgattatattgtgatatatggattgatt 15850057  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||| |||||||||||| ||||||||||||||| ||| ||||||||||||| |||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  15850058 gcataacttgaattattgttgaatgatcaagaaattg-tgaaaatgaattgttattaaac--ttgatatgatctgattatgctgcaattgttatttaact 15850154  T
Q  313 aagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||| |||||||||    
T  15850155 aagttgcatgagactgaataag 15850176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 113 - 268
Target Start/End: Original strand, 11300384 - 11300539
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  || ||| |||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  11300384 ggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttaattgtaaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 11300483  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 268  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  11300484 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttattgaaaatgaattgatatt 11300539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 16797916 - 16798147
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||    
T  16797916 tgattaggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaatt 16798015  T
Q  202 attgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 300  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||   |||||||||| |||||||| |||  |    
T  16798016 atggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaag--tttgatgtgatttgattatgttgcact 16798113  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| | ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16798114 tgttattaaactatgttgcatgagtatgaataag 16798147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 17242213 - 17241990
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  17242213 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 17242114  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  17242113 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 17242017  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  17242016 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 17241990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 18383778 - 18384010
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| | |||||||| ||||||| || |||| | ||| | ||||||||    
T  18383778 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatcagtgaagctgttatgaactgttaagctgattttaatgtgatt 18383877  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| |||||||||||||||    
T  18383878 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatg 18383976  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18383977 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 18384010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 16808743 - 16808974
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| |||||||| ||||||||||||  ||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||    
T  16808743 tgattaggaaaggaactataggtactaatggaacctattaaagatattgactgagaattgtgaagcttttacgaaatgttaagtgattataaagtgaatt 16808842  T
Q  202 attgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 300  Q
    || ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||| |||||| |||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||| |||  |    
T  16808843 atggattgattgtatttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgcaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgttgcact 16808940  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| | |||||  |||||||||| ||||||||    
T  16808941 tgttattaaactatattgcatgagtatgaataag 16808974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 91; E-Value: 5e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 19725773 - 19726004
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||| ||||||||| | |||||| | ||||||| ||  |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  19725773 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacccatttaagatgtcaactgaaatctgtgaaactgctatgaactgttaagctgattataatgtgatt 19725872  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-------aagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||       | |||||||||||||||||||||||    
T  19725873 taatgattaattacattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagtcatgctgttgatgtgatctgattatg 19725971  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  19725972 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 19726004  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 322846 - 322614
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||| ||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  322846 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactaagatctgtgaagctgttatgaagtgttaagctgattataatgtgatt 322747  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   | ||| |||||||||||||||    
T  322746 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatattgttgtgatctgattatg 322648  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    | |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  322647 ccgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 322614  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 326794 - 326889
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  326794 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 326889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11863031 - 11862815
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||  ||| | ||||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||    
T  11863031 ttaggtattaatgtgacctatttaagatgttatttgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcatt 11862932  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt--tgat------gtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    ||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||  | ||      |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  11862931 acttgaaatattattgaatgaccaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatattttggtgatctgattatgctgctattgttattta 11862833  T
Q  310 actaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||    
T  11862832 actaagttgcatgagtct 11862815  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12496512 - 12496280
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  12496512 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 12496414  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| ||||||| |||||||||||||    
T  12496413 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgatta 12496315  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  12496314 tgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 12496280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15465015 - 15464878
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  15465015 tgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatg 15464919  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  15464918 ctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 15464878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 7792976 - 7793071
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  7792976 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 7793071  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 15483138 - 15483043
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  15483138 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 15483043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 20461130 - 20461225
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  20461130 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagatcagaggatgatt 20461225  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 38814625 - 38814409
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  38814625 ttaggaaaggaactttaggtactaatgcgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 38814526  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  38814525 gaatgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 38814428  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  38814427 tatttaactaagttgcatg 38814409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 5223215 - 5223077
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  5223215 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 5223119  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| |||||| ||||||||    
T  5223118 gctgcaattgttatttaactaagttgtatgagtatgaataag 5223077  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 11298390 - 11298621
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  11298390 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatttgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 11298488  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| | ||||| |||||||||  |||    
T  11298489 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgttgttgttgtgatctgcctat 11298587  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  11298588 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 11298621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 115 - 326
Target Start/End: Original strand, 3402830 - 3403050
Alignment:
Q  115 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattg 213  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| || |||| |  || | |||||||||| ||||| | ||    
T  3402830 aactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctattatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatg 3402929  T
Q  214 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtta 305  Q
    |||| ||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  3402930 cattccttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctattgtta 3403029  T
Q  306 attaactaagttgcatgagtc 326  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  3403030 tttaactaagttgcatgagtc 3403050  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 3833915 - 3833699
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||  | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  3833915 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagatgatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 3833816  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  3833815 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagcaattgttgagaatgacttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 3833718  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  3833717 tatttaactaagttgcatg 3833699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 128 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 11851810 - 11851603
Alignment:
Q  128 aatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaatt 226  Q
    |||| |||||||||||||| ||| |||| |  |||||||||  |||||| || |||| | |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |    
T  11851810 aatgtgacctatttaagatgttatctgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattatgatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaat 11851711  T
Q  227 attattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 318  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||| |         ||||| |||||||| |||||||| |||| |||| ||||||||||||    
T  11851710 attattgaatgaacaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttataatgttgttgtgatctaattatgctactatcgttatttaactaagttg 11851612  T
Q  319 catgagtct 327  Q
    |||||||||    
T  11851611 catgagtct 11851603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 31097184 - 31097279
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  31097184 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaaagattagagaatgatt 31097279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14665570 - 14665423
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||   |||     |||||||    
T  14665570 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattttaaagttatactgttga 14665472  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14665471 tgtgatctgattatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 14665423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 14668726 - 14668579
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---ag-----ctgttga 278  Q
    ||||| || ||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||   ||     |||||||    
T  14668726 attataatatgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttatactgttga 14668628  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14668627 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 14668579  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 15 - 106
Target Start/End: Original strand, 15849719 - 15849810
Alignment:
Q  15 gagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  15849719 gagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattagaggatgatt 15849810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 12339617 - 12339479
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| |  |||||| ||  |||||||    
T  12339617 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaaac--ttgatgagaattgattat 12339521  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  12339520 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 12339479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Original strand, 3389808 - 3390030
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |  || | |||||||||| ||||| |     
T  3389808 ggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 3389907  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||||| ||||| |||||  | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || |||||||||||||||||||| ||||    
T  3389908 tgcattacttgatttattcttgaaaaaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgtcatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgttgt 3390007  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  3390008 tatttaactaagttgcatgagtc 3390030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 226 - 334
Target Start/End: Original strand, 8489459 - 8489564
Alignment:
Q  226 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||    
T  8489459 tattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgagt 8489555  T
Q  326 ctgaataag 334  Q
     ||||||||    
T  8489556 atgaataag 8489564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Original strand, 1982689 - 1982905
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcatta 218  Q
    ||||||| ||||| |||||| ||||||| |||||||  |  ||||||| | ||||||| || ||||| ||| | |||||||||| ||||| | |||||||    
T  1982689 ttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaactgcaatatgtgaagttgttatgaactgttaagttattgtaatgtgatttaatgattaaatgcatta 1982788  T
Q  219 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 310  Q
    |||||| |||| |||||||| | | | |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| |||||| ||||    
T  1982789 cttgaactatttttgaatgacctatatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttatagtgttgttgtgatctgattatgctgcttttgttatttaa 1982888  T
Q  311 ctaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||    
T  1982889 ctaagttgcatgagtct 1982905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 196 - 330
Target Start/End: Original strand, 11300723 - 11300854
Alignment:
Q  196 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 295  Q
    ||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| | ||| ||||||| ||||||||||    
T  11300723 tgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaac-gtt-atgtgatttgattatgct 11300819  T
Q  296 gctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
     | ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11300820 acaattgttatttaactaagttgcatgagtctgaa 11300854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 11298148 - 11298235
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11298148 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattaga 11298235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 11854545 - 11854430
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||| || ||||||| |||||||||    
T  11854545 ttactcgaaatattattgaaagattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgccgcaattgttatttaactaag 11854449  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| ||||||||    
T  11854448 ttgcatgagtatgaataag 11854430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 159 - 325
Target Start/End: Original strand, 12037871 - 12038044
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 257  Q
    ||||||| | ||| ||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||| ||||    
T  12037871 ctgtgaaaccattttgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaat 12037969  T
Q  258 gaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||        ||| ||||   ||||| |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  12037970 gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagt 12038044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 3402585 - 3402678
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||| ||||||||| ||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3402585 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatga 3402678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 16750548 - 16750682
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  16750548 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 16750641  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  16750642 ctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 16750682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 11595017 - 11595233
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  11595017 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11595116  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  11595117 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 11595216  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  11595217 actaagttgcatgagtc 11595233  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12496754 - 12496659
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  12496754 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 12496659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 15941534 - 15941609
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  15941534 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtcta 15941609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 18383536 - 18383631
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  18383536 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 18383631  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 24 - 106
Target Start/End: Original strand, 16862823 - 16862905
Alignment:
Q  24 gaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||||| ||||||    
T  16862823 gaattctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaatgattagagaatgatt 16862905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 3389600 - 3389669
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  3389600 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatga 3389669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12173285 - 12173192
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  12173285 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 12173192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 23077097 - 23077190
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||| ||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  23077097 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttggatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 23077190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 11594792 - 11594864
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  11594792 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 11594864  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 323088 - 322993
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| | || || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  323088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcgttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 322993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 4111209 - 4111334
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  4111209 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 4111302  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  4111303 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 4111334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 11557015 - 11557110
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| |||||||||   | |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||  ||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  11557015 cagagagcttgtcgaatttgtaattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacccatagatgtttattaaagattagaggatgatt 11557110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15965118 - 15964993
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  15965118 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 15965025  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15965024 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15964993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15969042 - 15968917
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  15969042 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 15968949  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15968948 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15968917  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15972966 - 15972841
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  15972966 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 15972873  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  15972872 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 15972841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 17242448 - 17242377
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17242448 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 17242377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 19775914 - 19775789
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  19775914 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 19775821  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  19775820 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 19775789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 38814860 - 38814789
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  38814860 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 38814789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12172872 - 12172818
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12172872 tgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 12172818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #74
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 14878124 - 14878217
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  14878124 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttatatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 14878217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #75
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 179
Target Start/End: Original strand, 26190870 - 26190947
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatg 179  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||| ||||| |||||||    
T  26190870 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgagacctatttaagatgttaactgaaaattgtgaacctattttgaaatg 26190947  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #76
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 1982463 - 1982535
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  1982463 ttttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 1982535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #77
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16690672 - 16690600
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| |||||| ||||||||    
T  16690672 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacgattaggggatgatt 16690600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #78
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 16697245 - 16697173
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| |||  ||||||||||||||    
T  16697245 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgactactaacaattagaggatgatt 16697173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #79
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3834150 - 3834079
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||    
T  3834150 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtg 3834079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #80
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 4107357 - 4107482
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  4107357 tgtgaattaatgattaaatgcattagttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 4107450  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  4107451 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 4107482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #81
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 11300157 - 11300236
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||  |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  11300157 ttctgagtttttgacttttgaattgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 11300236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #82
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 16797684 - 16797755
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16797684 cagagagcatgtcattttctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 16797755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #83
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 15 - 94
Target Start/End: Original strand, 26190632 - 26190711
Alignment:
Q  15 gagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagat 94  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||    
T  26190632 gagcatgttgaattatgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagat 26190711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #84
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 37439596 - 37439721
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  37439596 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 37439689  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    || | ||||||  | |||||||||||||||||    
T  37439690 ctacaattgttgttaaactaagttgcatgagt 37439721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #85
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 4589172 - 4589287
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  4589172 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 4589269  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  4589270 tgcaagagtatgaataag 4589287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #86
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19775475 - 19775360
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  19775475 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 19775378  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  19775377 tgcaagagtatgaataag 19775360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #87
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15060791 - 15060706
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  15060791 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15060706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #88
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16369907 - 16369822
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| | |  || ||| ||||||||||||    
T  16369907 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcataaagatgtttattaaagatta 16369822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #89
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 33 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 42326398 - 42326325
Alignment:
Q  33 gtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||| ||| |||||| ||||||||||| |||||||||||||||| | ||| || |||||||||||||||||||    
T  42326398 gttttggacttttgagttgaaccttagaagcttttgagtacctttcgatgtttactaaagattagaggatgatt 42326325  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #90
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 30 - 82
Target Start/End: Original strand, 1598129 - 1598181
Alignment:
Q  30 tgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  1598129 tgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacttttgagtacctttaggtg 1598181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #91
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 325
Target Start/End: Original strand, 11557246 - 11557477
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |||||| ||||||||||| | ||| |||  | |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||    
T  11557246 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgaaacctatttaaggtgttagctggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatt 11557345  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| |   ||| |||| ||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  11557346 taacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaattagatgttgatgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattat 11557444  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  11557445 gctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 11557477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #92
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 4589063 - 4589125
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 255  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  4589063 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 4589125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #93
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 15060549 - 15060427
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| || || ||||||| ||||||  ||||||  | |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  15060549 tgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatggtaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatt 15060450  T
Q  201 tattgattgattgcattacttga 223  Q
    || ||||| ||| ||||||||||    
T  15060449 taatgattaatttcattacttga 15060427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #94
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Original strand, 15941775 - 15941985
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgatt-g 209  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  || || | |||| || || ||||| | ||||||| || |||   || |||| ||||  ||| |||| |    
T  15941775 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagaggtaatgactgtgagctttgaagattttatgaactgttaaaggataatgaagtgaaatatggatttg 15941874  T
Q  210 attgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 308  Q
    ||||| || |||||| |||||  | | |||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||  |  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||    
T  15941875 attgcctttacttgatttattgctaattgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttattaaatt--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattt 15941971  T
Q  309 aactaagttgcatg 322  Q
    ||||||||||||||    
T  15941972 aactaagttgcatg 15941985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #95
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 19775584 - 19775515
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  19775584 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 19775515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #96
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 23053128 - 23053182
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23053128 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtct 23053182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #97
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 856635 - 856550
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  856635 cagagaacatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 856550  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #98
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 12511137 - 12511084
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  12511137 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 12511084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #99
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15052015 - 15051930
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   |||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  15052015 cagagagcatgttgaattctgtaattttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 15051930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #100
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 46822345 - 46822292
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  46822345 tgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 46822292  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #101
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 92
Target Start/End: Original strand, 321634 - 321714
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaag 92  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||    
T  321634 agagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaag 321714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #102
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12173004 - 12172924
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 238  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  12173004 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 12172924  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #103
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Original strand, 17524794 - 17524878
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||||| |||||| |  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  17524794 agagagcatgtagaattcagtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagatta 17524878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #104
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22322121 - 22322049
Alignment:
Q  35 ttttgaccttt-gagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  22322121 ttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 22322049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #105
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 16696857 - 16696798
Alignment:
Q  275 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| || ||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  16696857 ttgatgtgatttgtttatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 16696798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #106
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 27409305 - 27409368
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  27409305 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 27409368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #107
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 28950173 - 28950110
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  28950173 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 28950110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #108
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 42326180 - 42325964
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||  ||||||| | ||| ||| || ||| |  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  42326180 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacttgtgaagttgttaagaactgttaacttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 42326081  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||||||||  ||||  |||    
T  42326080 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgtttttta 42325981  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  42325980 actaagttgcatgagtc 42325964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #109
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 102 - 219
Target Start/End: Complemental strand, 15051773 - 15051655
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| || || ||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  15051773 tgattagggatggacccttaggtagtattgtgacctatataagatgttaactgcaatttgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatt 15051674  T
Q  201 tattgattgattgcattac 219  Q
    || ||||| ||| ||||||    
T  15051673 taatgattaatttcattac 15051655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #110
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 236 - 322
Target Start/End: Original strand, 1598477 - 1598560
Alignment:
Q  236 tgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatg 322  Q
    |||||||||| ||||||||||||| ||| |||| |||||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| ||||||||||||||||    
T  1598477 tgatcaagaa-ttgttgaaaatgatttgttatttaagct--tgatgtgatttgattatgctgc-aatgttatttaactaagttgcatg 1598560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #111
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 14878574 - 14878610
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  14878574 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 14878610  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #112
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22337176 - 22337104
Alignment:
Q  35 ttttgaccttt-gagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  22337176 ttttgaccttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 22337104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #113
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 23052696 - 23052756
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||| || | ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23052696 cagagagcatgttgaattttgtgattttgacctgtgagttgaaccttagatgtttttgagt 23052756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #114
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 271 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 23408506 - 23408442
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  23408506 gctgttgttgtaatctgtctatgttgctattgttaattaaccaagttgcatgagtcagtataaga 23408442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #115
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7110146 - 7110107
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7110146 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 7110107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #116
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 7114081 - 7114042
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  7114081 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 7114042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #117
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 11855180 - 11855141
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  11855180 tttgagatgaaccttagatgccttttagtacctttaggtg 11855141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #118
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 105 - 208
Target Start/End: Original strand, 16864998 - 16865101
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||  |||||| | | |  ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  ||||||||     
T  16864998 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctatcaaagataatgattatgaactgtgaagattttatgaattgttaagagattatgaaatgatttatg 16865097  T
Q  205 gatt 208  Q
    ||||    
T  16865098 gatt 16865101  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #119
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 30029922 - 30029867
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| ||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  30029922 gctgttgttgtaatctgtctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 30029867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #120
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 335
Target Start/End: Original strand, 15878092 - 15878154
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  15878092 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataaga 15878154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #121
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 13209969 - 13210006
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13209969 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13210006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #122
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14179802 - 14179765
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14179802 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 14179765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #123
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15051584 - 15051531
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15051584 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15051531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #124
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15060360 - 15060307
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15060360 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15060307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #125
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 15877471 - 15877532
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  15877471 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 15877532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #126
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16369476 - 16369423
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||| |||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16369476 tgttgttgtgaactgcctatgctgctattgttacttaaccaagttgcatgagtc 16369423  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #127
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 16909818 - 16909765
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  16909818 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 16909765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #128
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 76
Target Start/End: Original strand, 17674218 - 17674259
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctt 76  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  17674218 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 17674259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #129
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 4588433 - 4588493
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||   ||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  4588433 cagagagcatgtcattttccgaggttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 4588493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #130
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 11852031 - 11851976
Alignment:
Q  50 tgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||| |||||||    
T  11852031 tgaaccttagatgcttttgagtgccttaagat-tttattaaagattagatgatgatt 11851976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #131
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 12399674 - 12399638
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12399674 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 12399638  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #132
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 15471403 - 15471367
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  15471403 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 15471367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #133
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 17525216 - 17525252
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  17525216 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 17525252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #134
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 20698089 - 20698125
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20698089 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 20698125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #135
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 23082979 - 23083039
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||  ||| || | ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  23082979 cagagagcatgtcagattttgtgattttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagt 23083039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 210; Significance: 1e-115; HSPs: 79)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 210; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 24735647 - 24735414
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24735647 tgattaagaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 24735548  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735547 attgattgatcgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 24735448  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24735447 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 24735414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 158; E-Value: 5e-84
Query Start/End: Original strand, 104 - 325
Target Start/End: Original strand, 10101509 - 10101730
Alignment:
Q  104 attagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttat 203  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||    
T  10101509 attaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttat 10101608  T
Q  204 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10101609 tgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgt 10101708  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagt 325  Q
    || |||||||||||||||||||    
T  10101709 tatttaactaagttgcatgagt 10101730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 138; E-Value: 4e-72
Query Start/End: Original strand, 102 - 263
Target Start/End: Original strand, 19688618 - 19688779
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19688618 tgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 19688717  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  19688718 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattg 19688779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 12901385 - 12901597
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  12901385 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 12901484  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| ||||||    
T  12901485 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttatttaact 12901584  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  12901585 aagttgcatgagt 12901597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 24649570 - 24649378
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24649570 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 24649471  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  24649470 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 24649378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 27379306 - 27379518
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27379306 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27379405  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27379406 gcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27379505  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  27379506 aagttgcatgagt 27379518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 27383352 - 27383564
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27383352 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27383451  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27383452 gcattactttaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27383551  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  27383552 aagttgcatgagt 27383564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27602029 - 27601817
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  27602029 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 27601930  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27601929 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 27601830  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  27601829 aagttacatgagt 27601817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 24628352 - 24628564
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  24628352 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 24628451  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||| || | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24628452 gcattgcttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttaatataatctgattatgctgctattgttatttaact 24628551  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  24628552 aagttacatgagt 24628564  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 7e-43
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 41530883 - 41531089
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  41530883 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 41530982  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||||  | ||||    
T  41530983 gcattacttgaattattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgttgttaaact 41531076  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  41531077 aagttgcatgagt 41531089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 22461055 - 22461277
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  22461055 ttaggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 22461153  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  22461154 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 22461250  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  22461251 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 22461277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 19928367 - 19928583
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || || |  |||||||  |||  |||     
T  19928367 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaggagattatgaaatgaaatatg 19928466  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | ||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  19928467 gattgattgtctttatttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 19928564  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19928565 tatttaactaagttgcatg 19928583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 25963578 - 25963809
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  25963578 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 25963676  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||    
T  25963677 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 25963775  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  25963776 gctgctattgttattgaactaagttgcatgagtc 25963809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 10327333 - 10327238
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10327333 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttccattcttttgagtacatttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 10327238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 117 - 327
Target Start/End: Original strand, 22811787 - 22812006
Alignment:
Q  117 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattga-ttgc 214  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | ||||||||||  |||||| |  |||||  ||||| |||||||||| ||||| | ||||    
T  22811787 ctttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaagtgaaatctgtgaagctgctatgaactattaagttgattataatgtgatttaatgattaaattgc 22811886  T
Q  215 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 306  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        |||   ||||| |||||| ||||||||||||||||||||     
T  22811887 attacctgaagtattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatgatgaagttataatgttgttgtgatttgattatgctgctattgttat 22811985  T
Q  307 ttaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  22811986 ttaactaagttgcatgagtct 22812006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24735879 - 24735784
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  24735879 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttcagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 24735784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 25961396 - 25961628
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| |||  |  ||||||  | ||||||| || |||||  || | |||||||||    
T  25961396 tgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagctgcaatatgtgaatttgttatgaactgttaagttgttgtaatgtgattt 25961495  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    | ||||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||    
T  25961496 aatgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatg 25961595  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25961596 ctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtc 25961628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31345028 - 31344890
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  31345028 atgtgatttcatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 31344932  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31344931 gctgcaattattatttaactaagttgcatgagtatgaataag 31344890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 18855326 - 18855541
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||||||  |||  |||     
T  18855326 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaaatgaaatatg 18855425  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
     | |||||| | |||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  18855426 aagtgattgcctttacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 18855522  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    |  ||||||||||||||||    
T  18855523 tgtttaactaagttgcatg 18855541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 114 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 15477836 - 15477711
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  15477836 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 15477737  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatga 238  Q
    ||||||||||||||||||||||||||    
T  15477736 gcattacttgaattattattgaatga 15477711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23187316 - 23187088
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||| |||| || |     
T  23187316 ttaggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtg 23187217  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  23187216 gattaattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgt 23187119  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || | ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  23187118 tattaaaccaagttccatgagtatgaataag 23187088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 23598579 - 23598351
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||  |||||||||||||||||||||| |||||| | |||| ||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||| |||| || |     
T  23598579 ttaggaaaggaatcttaggtactaatgagacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaattgtg 23598480  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||| |||| | |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||  |||| | |   |||| |||| |||||||||||| |||||    
T  23598479 gattaattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgattttttatttaac--ctgatatgatttgattatgctgcaattgt 23598382  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || | ||| ||||| ||||||| ||||||||    
T  23598381 tattaaaccaagttccatgagtatgaataag 23598351  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 21327439 - 21327662
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    ||||||||| ||| || |||||| ||||||| || |||| |||   |||||||||| ||||||| |  |||| |  ||||||||||||||||||||| ||    
T  21327439 ggaactttaagtagtagtgagacatatttaaaatgttaagtgaattctgtgaagctgttatgaactattaagctgtttatgatgtgatttattgattaat 21327538  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  21327539 tgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgctgtgatctgattatgctgcttttg 21327637  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||| ||||| |||||||||||||||    
T  21327638 ttatttaaccaagttgcatgagtct 21327662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21327196 - 21327289
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  21327196 cagagagcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatga 21327289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 188 - 327
Target Start/End: Original strand, 21318584 - 21318731
Alignment:
Q  188 ttatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttga 278  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||  |||| |||||| ||||||| ||||| | |||||||||||||         ||| |||| ||     
T  21318584 ttatgatgtgatttattgattaattgcattacttgagatattgttgaataatcaagatgttgtag-aaatgaattgataattatgaagttatgctgctgt 21318682  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  21318683 tgtgatctgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 21318731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 24716392 - 24716622
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  24716392 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaacctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 24716490  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||  |||| | ||||||||| ||  |||||||||||||| | || ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  24716491 taacgattaaatgcattactagacatattattgaatgattatgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatg 24716589  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  24716590 ctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 24716622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 61056 - 60829
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| || ||||||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||| |||| ||||     
T  61056 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccgagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatg 60958  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  60957 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgat-tgattatgctgcaattg 60861  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  60860 ttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 60829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21318265 - 21318358
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| ||||||||| ||||  ||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  21318265 cagagatcatgtcgaaatctgtatttttgaccttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcagtaaagattagaggatga 21318358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 40428708 - 40428486
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |  || | |||||||||| ||||| |     
T  40428708 ggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 40428609  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||||| ||||| || ||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         | ||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  40428608 tgcattacttgatttattcttaaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatattgttgtgatctgaatatgctgcttttgt 40428509  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || | ||||||||||||||||||    
T  40428508 tattgaactaagttgcatgagtc 40428486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 40428952 - 40428859
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  40428952 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatga 40428859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Original strand, 21916069 - 21916193
Alignment:
Q  210 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||| ||| ||||||||||||||| || | ||    
T  21916069 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaatttatgcttttgttgtgatctgattatgttgttttt 21916167  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||| |||||||||||||||||||||    
T  21916168 gttatttaactaagttgcatgagtct 21916193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24870344 - 24870272
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24870344 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatt 24870272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 25963336 - 25963431
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  25963336 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 25963431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 27263711 - 27263652
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27263711 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 27263652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 27263514 - 27263285
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| |||||||||||||||||| ||| | | || ||| | ||||||| |||| ||||     
T  27263514 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgtgaagct-ttacggattgttaaatgattatgaagtgaattatg 27263416  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaa-ttattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||  ||    || |||||| ||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| |||    
T  27263415 gattgaaatatacttgcttgaatttattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaatt 27263318  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  27263317 gttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 27263285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24175264 - 24175192
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  24175264 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 24175192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 37524821 - 37524697
Alignment:
Q  210 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||| ||||||| | ||| |         |||||||||||||||||||||||||| ||    
T  37524821 attgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttattgaaa-tgaattgttgttatgaagttacaatgttgatgtgatctgattatgctgctttt 37524723  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||    
T  37524722 gttatttaaccaagttgcatgagtct 37524697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 22460820 - 22460891
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22460820 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 22460891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 30344951 - 30345076
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  30344951 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 30345044  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  30345045 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 30345076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 37525164 - 37525069
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  37525164 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttaaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 37525069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 41667078 - 41666962
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  41667078 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 41666981  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  41666980 ttgcatgattatgaataag 41666962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 21917935 - 21918028
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| | |||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  21917935 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagtttaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 21918028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24175055 - 24174822
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||    
T  24175055 tgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatt 24174956  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24174955 taacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattat 24174857  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24174856 gctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 24174822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1283535 - 1283410
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  1283535 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 1283442  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | | |||||||||||||||    
T  1283441 ctgcaattgttgttaatctaagttgcatgagt 1283410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 18855091 - 18855186
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18855091 cagagagcatgtcattttctgagattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 18855186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 19928148 - 19928203
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19928148 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 19928203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23187535 - 23187480
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23187535 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 23187480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23598798 - 23598743
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23598798 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 23598743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 24654991 - 24655061
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||    
T  24654991 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttcgttgtgtattaaagattagaggatga 24655061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 26125679 - 26125609
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  26125679 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 26125609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 24655200 - 24655433
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||| ||| | |  | |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||    
T  24655200 tgattaggaatggaacattaggtagtaatgaaacctatttaagatgttagccggaatctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatt 24655299  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||    
T  24655300 taacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctgattat 24655398  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    | ||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24655399 gttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 24655433  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #52
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 24716192 - 24716253
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||||||||||    
T  24716192 tttgagatgaaccttagatgtttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagaggatga 24716253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #53
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 45677774 - 45677867
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||  |||||||||||||| |||||    
T  45677774 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagattagatgatga 45677867  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #54
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24658139 - 24658055
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||| |||||    
T  24658139 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 24658055  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #55
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 127 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24673809 - 24673697
Alignment:
Q  127 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 225  Q
    ||||| ||||||| || ||| |||| || || ||||||||||||||||||||| |||| | |||||  ||||||||| ||||| |||||||||||||||     
T  24673809 taatgtgacctatataggatgttaattgcgatctgtgaagctattatgaaatgttaagctgattatactgtgatttaatgattaattgcattacttgaaa 24673710  T
Q  226 tattattgaatga 238  Q
    | ||| |||||||    
T  24673709 tgttaatgaatga 24673697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #56
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24869950 - 24869902
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  24869950 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 24869902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 61275 - 61220
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  61275 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtg 61220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #58
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 22811577 - 22811648
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  22811577 ttttgacttttgagttgaaccttaggtgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 22811648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #59
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 41667426 - 41667355
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattct-gagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || || | ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  41667426 cagagagcatgttgatttttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 41667355  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 22799167 - 22799220
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22799167 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22799220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 24674076 - 24673991
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| ||| ||| |||| || ||| |||| |||||||    
T  24674076 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttaagtgccttaagatgtttattgaagatta 24673991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #62
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Original strand, 22758596 - 22758715
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--taattatgatgtgatttattgattgattgcattac 219  Q
    |||| ||||||||||||| ||||| ||||||||  | || ||||||| |||||| ||| |||   | | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  22758596 ggtagtaatgagacctatataagaaattaactgcaatctatgaagctgttatgagatgttaatgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 22758695  T
Q  220 ttgaattattattgaatgat 239  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  22758696 ttgaattatgaatgaatgat 22758715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #63
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 252
Target Start/End: Original strand, 22740910 - 22740973
Alignment:
Q  189 tatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttg 252  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||| |||| |||||||    
T  22740910 tatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgattaagatgttgttg 22740973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 24628140 - 24628203
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  24628140 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 24628203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24649801 - 24649738
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  24649801 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 24649738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25616267 - 25616212
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  25616267 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgtaatttaactaagttgcatgagtc 25616212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 41530671 - 41530734
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  41530671 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 41530734  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #68
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 208
Target Start/End: Original strand, 21918194 - 21918284
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgatt 208  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||  |||||| || |||| | ||||| |||||||||| |||||    
T  21918194 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatttaatgatt 21918284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #69
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 47
Target Start/End: Original strand, 19688408 - 19688444
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttga 47  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19688408 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttga 19688444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #70
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 40621827 - 40621887
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  40621827 cagagagcatgttgaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 40621887  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #71
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 19688438 - 19688481
Alignment:
Q  63 cttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||    
T  19688438 cttttgaatacctttaggtgtcaactaaagattagaggatgatt 19688481  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #72
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 98
Target Start/End: Original strand, 22798769 - 22798832
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||    
T  22798769 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaga 22798832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #73
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 27379094 - 27379157
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  27379094 tttgagttgaaccttagatgccttttagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 27379157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #74
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 27383140 - 27383203
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  27383140 tttgagttgaaccttagatgccttttagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 27383203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #75
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 23019747 - 23019800
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| |||||||||||  |||||||    
T  23019747 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttttatgagtc 23019800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #76
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 279 - 328
Target Start/End: Complemental strand, 24673639 - 24673590
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctg 328  Q
    ||||||||| || |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  24673639 tgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaaccatgttgcatgagtctg 24673590  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #77
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 28291943 - 28291980
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  28291943 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 28291980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23286329 - 23286293
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23286329 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 23286293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 25176321 - 25176285
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  25176321 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 25176285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 6)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 13148 - 12916
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13148 tgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 13049  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  13048 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctatt 12949  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12948 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 12916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 19432 - 19200
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || ||||||| |||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  19432 tgattaggaaatgaactttcggtactaatgagatatatttaagatattaactgagaactgtggagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 19333  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19332 attgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaagatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctcctatt 19233  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19232 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 19200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #3
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 19664 - 19569
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19664 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 19569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #4
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 13379 - 13285
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||| | ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  13379 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccatagatacctttgagtacgtttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 13285  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #5
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 219 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 62386 - 62273
Alignment:
Q  219 cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 318  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  62386 cttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgagttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttg 62289  T
Q  319 catgagtctgaataag 334  Q
    ||||| | ||||||||    
T  62288 catgattatgaataag 62273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 62736 - 62666
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  62736 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 62666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 194; Significance: 1e-105; HSPs: 93)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 36133824 - 36134057
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  36133824 tgattaggaaagaaactttaggtattaatgagacctatttaagatattaactgggaactgtgaagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 36133923  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36133924 attgattgattgcattacttgagttattattgaatgatcaggaagttgttgaagatgaatggatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 36134023  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36134024 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 36134057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 17810515 - 17810293
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  ||||||| |||||  |||| ||||||||||    
T  17810515 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgttaagtgtttataatgtgattta 17810416  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17810415 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 17810316  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  17810315 ttatttaactaagttgcatgagt 17810293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 147; E-Value: 2e-77
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 14757285 - 14757507
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  14757285 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 14757384  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  14757385 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgatctgattatgctgttattg 14757484  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  14757485 ttatttaactaagttgcatgagt 14757507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 1951626 - 1951851
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| | ||| | || | ||||     
T  1951626 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgaatataaagtaaattatg 1951725  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  1951726 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 1951823  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  1951824 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 1951851  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 9556763 - 9556551
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  9556763 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 9556664  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  9556663 gcattacttgaattagtattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 9556564  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  9556563 aagttgcatgagt 9556551  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 136; E-Value: 6e-71
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 27534258 - 27534047
Alignment:
Q  114 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattg 213  Q
    |||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  || |||||||||||  |||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  27534258 gaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttaattgtgaagctatattgaaatgctaagttgttataatgtgatttattgattgattg 27534159  T
Q  214 cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaacta 313  Q
    |||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||| |||||||| | |||||    
T  27534158 cattacttgaatcattattgaatgattaagaagttattgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatccgattatgctgttattgttattaaacta 27534059  T
Q  314 agttgcatgagt 325  Q
    ||||||||||||    
T  27534058 agttgcatgagt 27534047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 4561207 - 4561419
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  4561207 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 4561306  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  4561307 gcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaataaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaact 4561406  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  4561407 aagttgcatgagt 4561419  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18222243 - 18222468
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  18222243 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatg 18222342  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18222343 gattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 18222440  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  18222441 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 18222468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 5756811 - 5757023
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  5756811 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 5756910  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  5756911 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagttgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaact 5757010  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  5757011 aagttacatgagt 5757023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 120; E-Value: 2e-61
Query Start/End: Original strand, 187 - 334
Target Start/End: Original strand, 22634369 - 22634516
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 286  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22634369 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 22634468  T
Q  287 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22634469 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgcgtctgaataag 22634516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 17152352 - 17152576
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||||||||||||||||||  |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||| | |||||| ||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  17152352 ttagggaaggaactttaggtgttaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagattttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatg 17152451  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  17152452 gattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 17152548  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  17152549 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 17152576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 113; E-Value: 3e-57
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 33742610 - 33742399
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  33742610 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttattatgtgatttattgattgatt 33742511  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  33742510 gcattacttgaattattattgaatgatcagggagttgttg-aaatgaattggtatcaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 33742412  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  33742411 aagttacatgagt 33742399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 109; E-Value: 8e-55
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18228718 - 18228943
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| ||| || ||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  18228718 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttacgatatgttaagtgaatataaagtgaattatg 18228817  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | |||||| |||||||||| ||| ||||  |||||||||| |||||||||||| ||| |    
T  18228818 gattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttggaaatgaattgttatgaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatttt 18228915  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  18228916 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 18228943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 16487939 - 16488172
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||| ||||| | |||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  16487939 tgatttgggatggacccttaggtagtaatgtgtcctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatt 16488038  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||        ||| |||| |  ||||||||||||||    
T  16488039 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgcttttgtgatctgattat 16488137  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16488138 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 16488172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 26243530 - 26243746
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  26243530 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatg 26243629  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  26243630 gaatgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 26243727  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  26243728 tatttaactaagttgcatg 26243746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 112 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 3413030 - 3412811
Alignment:
Q  112 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattg-a 210  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||| |    
T  3413030 aggaaccttaggtactaatgagacctattaaagatattga-tgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattgaa 3412933  T
Q  211 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 310  Q
    ||  |||  |||||||||| ||||||||||||||| || |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  3412932 ttatatttattgaattattgttgaatgatcaagaaattattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgctattgttattaaa 3412835  T
Q  311 ctaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||||||||| ||||||||    
T  3412834 ctaagttgcatgagtatgaataag 3412811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18237133 - 18236904
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctatt-atgaaatgctaagtaattatgatgtgatttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||| | ||| ||||||| | |||||||  |||||||||| ||||| | || ||||| || ||||| ||||||| |||| ||||    
T  18237133 ttaggaaaggaactttaggtgcaaataagacctactaaagatatggactgagaactttgaagatttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattat 18237034  T
Q  204 tgattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     ||||||||| ||| |||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18237033 ggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgattaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattg 18236936  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18236935 ttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 18236904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 16243265 - 16243493
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  ||| |||  |||  |||     
T  16243265 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagagattgtgaaatgaaatatg 16243364  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  16243365 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 16243462  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  16243463 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 16243493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 23139511 - 23139296
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  23139511 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 23139412  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| |  ||||||||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  23139411 gattgattgcccatacttgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 23139315  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  23139314 tatttaactaagttgcatg 23139296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 19757466 - 19757682
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  19757466 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 19757565  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  19757566 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 19757663  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19757664 tatttaactaagttgcatg 19757682  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 19782340 - 19782124
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  19782340 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 19782241  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  19782240 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 19782143  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  19782142 tatttaactaagttgcatg 19782124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 16356814 - 16357045
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  16356814 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttttttgtaatgtgatt 16356912  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||    
T  16356913 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16357011  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16357012 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16357045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2015019 - 2014791
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || |||||||||||||||| | |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || |||| ||||||||  |||  |||     
T  2015019 ttaggaaatgaactttaggtactaaggtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaattgttaagaaattatgaaatgaaatatg 2014920  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| | ||||||||||||| ||||||  ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  2014919 gattgattgcctttacttgaattattgtggaatgatcaagaaattgttgcgaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 2014822  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  2014821 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 2014791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 43256367 - 43256505
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  43256367 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 43256463  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  43256464 gctacaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 43256505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 36133592 - 36133685
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  36133592 cagagagcatgttgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctgctaaagattagaggatga 36133685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 16348526 - 16348757
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || ||||||||  ||  | ||||||||    
T  16348526 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 16348624  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||    
T  16348625 taatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16348723  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16348724 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16348757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 5338842 - 5339076
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | ||| |||||| |||||||    |||| | ||||||||||||||    
T  5338842 tgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgagaagctgttatgaaccattaagctgattatgatgtgatt 5338941  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| |||||||  |||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| ||     
T  5338942 tattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagattttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttg 5339040  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| |||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  5339041 tgctgttattgttatttaactatgatgcatgagtct 5339076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 105 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 9530674 - 9530460
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||| |||||| | || ||||||||||||||| ||||||  || ||||| |||| ||  |||  |||     
T  9530674 ttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctattaaagataatgaccgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattaggaaatgaaatatg 9530575  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || |||||| | ||||| |||||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||  ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  9530574 gagtgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttattattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 9530478  T
Q  304 taattaactaagttgcat 321  Q
     | |||||||||||||||    
T  9530477 catttaactaagttgcat 9530460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 20157407 - 20157554
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||| ||| |||||||||| |||||||||||||   || |     |||||    
T  20157407 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgatattataaagttataccgttga 20157505  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  20157506 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaatttgcatgagtct 20157554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 43256023 - 43256120
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  43256023 tgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgggaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 43256120  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2015251 - 2015159
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  2015251 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 2015159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 1951391 - 1951486
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  1951391 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 1951486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 13812966 - 13813113
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |         |||||     
T  13812966 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttttaatgttgt 13813064  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
     || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13813065 ggtaatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 13813113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16243030 - 16243125
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16243030 cagatagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctaatattgattagagaatgatt 16243125  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16356572 - 16356667
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16356572 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 16356667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 16678219 - 16678297
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctatta 89  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||| ||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||    
T  16678219 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaatcttagattcttttgattacctttaggtttctatta 16678297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 16351501 - 16351573
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  16351501 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatt 16351573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9530909 - 9530814
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  9530909 cagagagcatgtcattttctgagattttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactactgattagagaatgatt 9530814  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 11250214 - 11250286
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  11250214 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 11250286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 3413256 - 3413201
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3413256 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 3413201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10712999 - 10712874
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  10712999 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 10712906  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10712905 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10712874  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10926769 - 10926644
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  10926769 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 10926676  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10926675 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10926644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16348311 - 16348406
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||| |||||||    
T  16348311 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatt 16348406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 18222008 - 18222079
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18222008 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18222079  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Original strand, 19757231 - 19757306
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19757231 cagagagcatgtcattttctgagttattgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtcta 19757306  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 19782575 - 19782500
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||||   ||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19782575 cagagagcatgtcattttctgagttattgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtcta 19782500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 23139746 - 23139675
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23139746 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 23139675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 26243295 - 26243366
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26243295 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 26243366  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Original strand, 28569314 - 28569537
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattg 209  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||| |||| |||| |||||    
T  28569314 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 28569412  T
Q  210 a-ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 307  Q
    | ||  | | ||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| |   ||||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  28569413 aattatactcacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaa--gttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 28569510  T
Q  308 taactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  28569511 taactaagttgcatgattatgaataag 28569537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 43255790 - 43255885
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  43255790 cagagagcatgtcattttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 43255885  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 86
Target Start/End: Complemental strand, 45938623 - 45938548
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  45938623 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgtcta 45938548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #52
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 89
Target Start/End: Original strand, 17152117 - 17152195
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctatta 89  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||| ||||||    
T  17152117 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgactacctttaggtgcctatta 17152195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 50 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 25555953 - 25555899
Alignment:
Q  50 tgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  25555953 tgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatga 25555899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 14708264 - 14708335
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14708264 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 14708335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Original strand, 14708611 - 14708727
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||  | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||||||    
T  14708611 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatctaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaag 14708708  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  14708709 ttgcatgattatgaataag 14708727  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #56
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 14954127 - 14954252
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  14954127 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 14954220  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14954221 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 14954252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #57
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 15353179 - 15353402
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| ||||||| || |||| |  || | |||||||||| ||||| |     
T  15353179 ggaactttaggtagtaatgaaacctatctaagatgttaactggaatttgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 15353278  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgat-caagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| || |  || ||||||| ||||||||        ||| |||| | ||||| ||||||||||||||| ||||  ||    
T  15353279 tgcattacttgatttattcttgaataatccttgatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgttgctgctg 15353377  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  15353378 ttatttaactaagttgcatgagtct 15353402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16487697 - 16487792
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| | |||||||||||| |||| || |||  || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16487697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgggtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatt 16487792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18237352 - 18237297
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18237352 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18237297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 25690016 - 25689891
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  25690016 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 25689923  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  25689922 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 25689891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 12570259 - 12570142
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattact 220  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  12570259 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 12570160  T
Q  221 tgaattattattgaatga 238  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  12570159 tgaaatgttaatgaatga 12570142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13570012 - 13569927
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  13570012 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagatta 13569927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 15121422 - 15121515
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  15121422 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 15121515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #64
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 18602398 - 18602463
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  18602398 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagag 18602463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #65
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 18608992 - 18609057
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  18608992 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactactgattagag 18609057  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 119 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 25555744 - 25555599
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| || |||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  25555744 ttaggtagtaatgaaacttatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 25555645  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  25555644 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 25555599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 119 - 210
Target Start/End: Original strand, 18602624 - 18602715
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga 210  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||||||    
T  18602624 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatggattga 18602715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 207 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 45938284 - 45938173
Alignment:
Q  207 ttgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 306  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||     
T  45938284 ttgattgccttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttat 45938189  T
Q  307 ttaactaagttgcatg 322  Q
    ||||||||| ||||||    
T  45938188 ttaactaagatgcatg 45938173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 11250439 - 11250655
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| || ||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  11250439 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctatgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 11250538  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    || ||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||| ||||  ||||| |||    
T  11250539 acatgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgttgctgctgttattta 11250638  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  11250639 actaagttgcatgagtc 11250655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Complemental strand, 15094273 - 15094186
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||| ||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||    
T  15094273 cagaaagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaga 15094186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 18228505 - 18228576
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   |||||| ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18228505 cagagagcatgtcattttctgattttttcacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18228576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #72
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 28569090 - 28569145
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  28569090 ttctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 28569145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15224922 - 15224807
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  15224922 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 15224825  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| || | ||||||||    
T  15224824 tgcaagaatatgaataag 15224807  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 15352959 - 15353029
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||    
T  15352959 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttagttatgtattaaagatttgaggatga 15353029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 42997080 - 42997150
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||| ||||||||| |||||||||||||||||    
T  42997080 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaacttagatgcctttgagtacctttaggt 42997150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 12570521 - 12570428
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||  || | | |||||||||||||| |||||    
T  12570521 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatga 12570428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Original strand, 42997366 - 42997543
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || || ||||||||||||  | ||||    
T  42997366 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttaaatgatcaagaaactattga 42997464  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| | ||||| |||||| |||||||||| | ||||||||    
T  42997465 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttatttaactgagttgcatgattatgaataag 42997543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #78
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 4560995 - 4561058
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  4560995 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 4561058  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #79
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12487857 - 12487732
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  ||||||||    
T  12487857 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattgattatg 12487764  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  12487763 ctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagt 12487732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #80
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 25555550 - 25555503
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  25555550 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 25555503  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #81
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33742822 - 33742759
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  33742822 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 33742759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #82
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12570090 - 12570036
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  12570090 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtct 12570036  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #83
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 276 - 334
Target Start/End: Original strand, 18602766 - 18602824
Alignment:
Q  276 tgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18602766 tgatgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18602824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #84
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 192
Target Start/End: Original strand, 18609218 - 18609291
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaaga-tattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatg 192  Q
    |||||||||||| ||||||||| |||| |||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||    
T  18609218 ttaggtactaataagacctattaaagaatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatg 18609291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #85
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 44676132 - 44676047
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||   |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||| |||||    
T  44676132 cagagagcatgtagaattctatatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 44676047  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #86
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 17047702 - 17047762
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  17047702 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagt 17047762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #87
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 278 - 334
Target Start/End: Original strand, 18609340 - 18609396
Alignment:
Q  278 atgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||| |||||||||||| ||||||| | ||||||||| ||||||| ||||||||    
T  18609340 atgtgatttgattatgctgcaattgttactaaactaagtttcatgagtatgaataag 18609396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 23843979 - 23843919
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  23843979 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 23843919  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #89
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 5756599 - 5756662
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  5756599 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacccttaggtgcctactattgattagagaatgatt 5756662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #90
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 15093853 - 15093798
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| ||||||||   |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  15093853 gctgttgttgtgatctttctatgctgctattgttctttaactaagttgcatgagtc 15093798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #91
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 212 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 15225012 - 15224962
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||    
T  15225012 tgcattacttgaaatattattgaatgaccaagatgttgtt-aaaatgaattg 15224962  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 14052954 - 14052991
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  14052954 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 14052991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #93
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23843537 - 23843501
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  23843537 tatgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 23843501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 79)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 102 - 332
Target Start/End: Original strand, 16080306 - 16080536
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  16080306 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagagattaactgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 16080405  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||    
T  16080406 attgattgattgcattacttgaattattattggatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgataataagttattgatgtgatctgattatgctgctatt 16080505  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaata 332  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16080506 tttaattaactaagttgcatgagtctgaata 16080536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 186; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 36819170 - 36819403
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||  ||||||||    
T  36819170 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattatattgtgattt 36819269  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa-ttgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 300  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  36819270 atttattgattgcatttcttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaatttgatattaagctggtgatgtgatctgattatgctgctat 36819369  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36819370 tgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 36819403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 335
Target Start/End: Original strand, 24782962 - 24783195
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| | ||||||||| ||  || ||||||||| ||||||| |||||||| || ||||||||| |||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  24782962 tgattaggaatggaactttaagttatagtgagacctacttaagatgttaactgaaaattgtgaagctgttatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 24783061  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24783062 attaattaattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttcatgtgatctgattatgctgctatt 24783161  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  24783162 gttatttaactaagttgcatgagtctgaataaga 24783195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 1010966 - 1010744
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  1010966 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 1010867  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1010866 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 1010767  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  1010766 ttatttaactaagttgcatgagt 1010744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 20228682 - 20228894
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  20228682 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 20228781  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | ||||    
T  20228782 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgccattgttattaaact 20228881  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  20228882 aagttgcatgagt 20228894  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 16375331 - 16375543
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  16375331 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 16375430  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  16375431 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 16375530  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  16375531 aagttacatgagt 16375543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 19212108 - 19211883
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| ||||| | |||| ||||     
T  19212108 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctataaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgattataaagtgaattatg 19212009  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  19212008 gattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 19211911  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  19211910 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 19211883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21407588 - 21407376
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  21407588 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21407489  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21407488 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21407389  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  21407388 aagttacatgagt 21407376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 52639774 - 52639562
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  52639774 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 52639675  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  52639674 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgttattgttatttaact 52639575  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  52639574 aagttacatgagt 52639562  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 105 - 325
Target Start/End: Original strand, 23819164 - 23819383
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||     
T  23819164 ttaggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatg 23819263  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| |||||    
T  23819264 gattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattgt 23819361  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagt 325  Q
    || | ||| |||||||||||||    
T  23819362 tattaaacgaagttgcatgagt 23819383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 20138324 - 20138099
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  ||| |||  |||  |||     
T  20138324 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagataataactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattttgaaatgaaatatg 20138225  T
Q  205 gattgattgcatta-cttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||| |||| ||  ||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| |||||    
T  20138224 gattggttgcctttgcttgaattattgttgaatgttcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaattgt 20138127  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  20138126 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 20138099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 18181982 - 18182215
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatt-atgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| |||   ||||||| ||||| ||| | | |||||  |||||||  |||||||||||| |||||| |||||||||  || || ||||||||    
T  18181982 tgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacttgtataagaagttaactgcaaactgtgaagctgttatgagatgctaagttgtttataatgtgatt 18182081  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
     | ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||        ||| ||||||| ||||||||||||||    
T  18182082 caatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaataaattgatattatgaagttatgctgttgttgtgatctgattat 18182180  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18182181 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 18182215  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 12647110 - 12646888
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||| |||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  12647110 ttaggaaaggaactt-aggtgctagtgagacctattggagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 12647012  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  12647011 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 12646915  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||| ||||||    
T  12646914 tattaaactatgttgcatgaatctgaa 12646888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 36818938 - 36819033
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||| |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  36818938 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttaaatgcctttgagtacctttaggtgcctattaaagattagaggatgatt 36819033  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 105 - 321
Target Start/End: Complemental strand, 18882608 - 18882393
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||| || ||||  |||||||   ||  |||     
T  18882608 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagatattaactgagaattgtgaagcctttatgaattgttaagagattatgaaaagaaatatg 18882509  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || | ||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||  | |||    
T  18882508 gaataattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgataatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgaaaatgt 18882411  T
Q  304 taattaactaagttgcat 321  Q
    || |||||||||||||||    
T  18882410 tatttaactaagttgcat 18882393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 33797433 - 33797295
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||| | ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  33797433 atgtgatttaatgattaaatgcattaatcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 33797337  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  33797336 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 33797295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 22449127 - 22449360
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||| | ||||||| ||||| ||| ||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||||||||    
T  22449127 tgattaggaatggacccttaggtagtaatgtgacatatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatt 22449226  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaa----tga-at--tgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||    ||| ||  ||| |||| ||| ||| |||||||||||||||    
T  22449227 taatgattaatttcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaagtattgatattatgaaattatgctcttgttgtgatctgattatg 22449326  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| | ||| |||||||||||||||||||||    
T  22449327 ctgctactattatttaactaagttgcatgagtct 22449360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 8761505 - 8761728
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    ||||||||||||| || ||| |||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| |||||||||||||||||||||||| ||    
T  8761505 ggaactttaggtagtagtgaaacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctaattatgatgtgatttattgattaat 8761604  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| | ||||| ||||||||| || ||||| |||||    
T  8761605 tgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcttgtgctgttattg 8761703  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||| ||||||| | |||||||||||    
T  8761704 ttatttaactatgatgcatgagtct 8761728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21305790 - 21305695
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||    
T  21305790 cagagagcatgtcgagttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtttactaaagattagaggatgatt 21305695  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 105 - 320
Target Start/End: Complemental strand, 46975708 - 46975494
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||  || ||||  |||||||  |||  |||     
T  46975708 ttaggaaatgaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgacctgttaagagattatgaaatgaaatatg 46975609  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  46975608 gattgattgtctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 46975511  T
Q  304 taattaactaagttgca 320  Q
    || ||||||||||||||    
T  46975510 tatttaactaagttgca 46975494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Original strand, 16080074 - 16080166
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16080074 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaacattggatgcctttgagtacctttaggtgtctactatagattagaggatg 16080166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 112 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 33797767 - 33797680
Alignment:
Q  112 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  33797767 aggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 33797680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 18393825 - 18394059
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |  || | ||||||||    
T  18393825 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatt 18393924  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat-gaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||  ||||| |        ||||   || || |||||||||||||    
T  18393925 taatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaataaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgatta 18394024  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18394025 tgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 18394059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 24782730 - 24782823
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || ||| |||||||||||||    
T  24782730 cagagagcatgtcgaattttgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaatgattagaggatga 24782823  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Original strand, 3472804 - 3473017
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatga--tgtgatttattgattgattgca 215  Q
    ||||||| ||||| |||||||| ||||| |||| || ||| |||||||||| ||||||||||||||||  || |||  ||||||||| ||||| | || |    
T  3472804 ttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaa-tgggaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgtt-tgaaatgtgatttaatgattaaatgaa 3472900  T
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgat------gtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    ||||||||| |||| |||||||||||||| |||||||||  ||| ||||||||| |  ||| ||      |||||||||||||||||||||||||| |||    
T  3472901 ttacttgaaatattgttgaatgatcaagatgttgttgaag-tgatttgatattatgaagttaatactcttgtgatctgattatgctgctattgttattta 3472999  T
Q  310 actaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||    
T  3473000 actaagttgcatgagtct 3473017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 20228440 - 20228510
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  20228440 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagtatctttaggtg 20228510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 58; E-Value: 2e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 45310228 - 45310462
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| |  || | ||||||||    
T  45310228 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgtggcctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatt 45310327  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatg-aattgat--------attaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    || ||||| | |||||| ||||| ||||| |||||| | |  |||||||||||||||| ||||| |        ||||   || || |||||||||||||    
T  45310328 taatgattaaatgcattgcttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaaattgttgttatggaattataatgctgttgtgatctgatta 45310427  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| | |||| ||||||||||||||||||||    
T  45310428 tgctgctgtcgttatttaactaagttgcatgagtc 45310462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 3704716 - 3704811
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| |||||  | ||||| ||| |||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  3704716 cagagagcatgttgaatttcgtgttttggacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatgatt 3704811  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20138559 - 20138464
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  20138559 cagagagcatgtcatcttctgggtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatt 20138464  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 19212343 - 19212250
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||||||||||  |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||    
T  19212343 cagagagcatgtcgttttctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatga 19212250  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 45489396 - 45489468
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  45489396 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 45489468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 23818929 - 23819024
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  23818929 cagagagcatgtcattttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 23819024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 17678449 - 17678679
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||| | ||| || |||| || |||||  ||  | |||| |||    
T  17678449 tgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtaaggctgtt-tgaactgttaagttgtttgtaatgttatt 17678547  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  17678548 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatg 17678646  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17678647 ctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 17678679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 18393616 - 18393688
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  18393616 ttttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatt 18393688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 45310019 - 45310091
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  45310019 ttttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatt 45310091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 1925089 - 1925214
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  1925089 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 1925182  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  1925183 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 1925214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18882843 - 18882772
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18882843 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18882772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 20924103 - 20924228
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  20924103 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 20924196  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  20924197 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 20924228  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 289 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 21313185 - 21313139
Alignment:
Q  289 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21313185 ttatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 21313139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 21022896 - 21022767
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||| ||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| | ||||| |||||| |    
T  21022896 tgattaaggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagctgattataatgtgaat 21022797  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattatta 230  Q
    || ||||| ||||||||||||||| |||||    
T  21022796 taatgattaattgcattacttgaaatatta 21022767  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 22830997 - 22831090
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  22830997 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 22831090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 12647342 - 12647274
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12647342 agagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 12647274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 39244101 - 39244235
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  ||||||||    
T  39244101 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattgattatg 39244194  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  39244195 ctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 39244235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 39247656 - 39247790
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  |||||||   ||||| |||  ||||||||    
T  39247656 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattcttattaag--tttgatatgaattgattatg 39247749  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  39247750 ctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 39247790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #45
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Original strand, 41388201 - 41388335
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||  ||||||||  |||||  ||  ||||||||    
T  41388201 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaatttttattaagc--ttgatacgaattgattatg 41388294  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| |||||||||||||| || | ||||||||    
T  41388295 ctgcaattgttatttaactaagttgcaagaatatgaataag 41388335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 8761284 - 8761347
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||||||  || ||||||||||||||||||||||    
T  8761284 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagacgtgtattaaagattagaggatgatt 8761347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #47
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 33797993 - 33797914
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  33797993 ttctaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 33797914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #48
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 45489621 - 45489837
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||| |  || | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  45489621 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 45489720  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || ||||||||||||||||        ||| ||||   || || ||||||||||||||||||||  | ||| |||    
T  45489721 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctattattta 45489820  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  45489821 actaagttgcatgagtc 45489837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #49
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Original strand, 18181743 - 18181833
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||||||||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||| ||||||| |||||    
T  18181743 agagcatgtcgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaatgattagatgatga 18181833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #50
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 21615913 - 21615843
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  21615913 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 21615843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #51
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 33049756 - 33049812
Alignment:
Q  50 tgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  33049756 tgaaccttagatgcttttgagtacccttagatgtttactaaagattagaggatgatt 33049812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #52
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 14 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 46975940 - 46975872
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||   |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  46975940 agagcatgtcattttctgagttttttacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacttttaggtg 46975872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #53
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 17678249 - 17678312
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | ||||||||||| |||||||    
T  17678249 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagatgatgatt 17678312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #54
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 119 - 238
Target Start/End: Original strand, 22831256 - 22831375
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcatta 218  Q
    ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| ||  | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||    
T  22831256 ttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttagctgattataatgtgatttaatgattaattgcatta 22831355  T
Q  219 cttgaattattattgaatga 238  Q
    |||||| | ||| |||||||    
T  22831356 cttgaaatgttaatgaatga 22831375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #55
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 3705105 - 3705159
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  3705105 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 3705159  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #56
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 20229099 - 20229161
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 255  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20229099 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 20229161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #57
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 20229208 - 20229323
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  | ||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||    
T  20229208 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaacttttgagaatgatttgttatttaact--taatgtgatttgattatgctggaattgttatttaactaagt 20229305  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  20229306 tgcaagagtatgaataag 20229323  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #58
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6152113 - 6151976
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||| || ||| |||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||| |  |||| ||||||||    
T  6152113 tgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataggatgttaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgtttataatgtgatt 6152014  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 238  Q
    || ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6152013 taatgattaattgcattacttgaaatgttagtgaatga 6151976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #59
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 19 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6152347 - 6152270
Alignment:
Q  19 atgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  6152347 atgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagttgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 6152270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #60
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 21023138 - 21023045
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| ||   || ||| |||||||||||||| |||||    
T  21023138 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgccaaaagatgtttattaaagattagatgatga 21023045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #61
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 21788014 - 21788136
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   ||||||||||| |        |||||| |||||||||  ||||||||||| ||    
T  21788014 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattacgaagtcatgctgttgttgtgatctgcctatgctgctatggt 21788113  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  21788114 tatttaactaagttgcatgagtc 21788136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #62
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 22432426 - 22432495
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  22432426 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 22432495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #63
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 42864830 - 42864915
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||| |||||    
T  42864830 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagttgtttattaatgatta 42864915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #64
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 3472569 - 3472640
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |  | || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  3472569 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgctataagatgtttattaaagattagatgatgatt 3472640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #65
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 16375119 - 16375182
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  16375119 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 16375182  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #66
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 21407800 - 21407737
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  21407800 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 21407737  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #67
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 274 - 325
Target Start/End: Original strand, 33050067 - 33050118
Alignment:
Q  274 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||    
T  33050067 gttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagt 33050118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #68
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 52639986 - 52639923
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  52639986 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 52639923  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #69
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 22468735 - 22468790
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||| ||| |||||  |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22468735 gctgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 22468790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #70
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20135267 - 20135214
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  20135267 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttgtttaactaagttgcatgagtc 20135214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #71
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21162216 - 21162171
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  21162216 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttaaatgcttttgagt 21162171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #72
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 96
Target Start/End: Original strand, 21787665 - 21787746
Alignment:
Q  15 gagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||| ||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| || |||||||||    
T  21787665 gagcatgttgaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttaataaagatta 21787746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #73
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 22468339 - 22468400
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  22468339 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 22468400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #74
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 20846872 - 20846908
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  20846872 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagt 20846908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #75
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 21022701 - 21022653
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||  | |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  21022701 tgtgatctgcctgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtct 21022653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #76
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21027148 - 21027112
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  21027148 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagt 21027112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #77
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 22355827 - 22355863
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22355827 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22355863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #78
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 22357513 - 22357549
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22357513 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22357549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #79
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 22921509 - 22921545
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  22921509 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 22921545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013 (Bit Score: 169; Significance: 1e-90; HSPs: 2)
Name: scaffold0013
Description:

Target: scaffold0013; HSP #1
Raw Score: 169; E-Value: 1e-90
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 2535 - 2766
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||| |||||||| |||||  |||||| |    
T  2535 tgattaggaaatgaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaattgtgaagcttttatgaactgctaagtgattatattgtgatat 2634  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||| |||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||    
T  2635 attgattgattggattacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttg-aaatgaattgttattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcaatt 2733  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2734 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 2766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0013; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 2304 - 2398
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||| | ||||| |||| ||||||| ||| |||||||||||| ||||||    
T  2304 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatacatttgaataccattaggtgactaataaagattagagaatgatt 2398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 166; Significance: 8e-89; HSPs: 4)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 8e-89
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 173534 - 173304
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||  |||||| |    
T  173534 tgattaggaaaggaactttaggtactaaagagacctattaaagatattaactgagaactttgaagctattatgaaatgctaagtgattatattgtgatat 173435  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||    
T  173434 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgataaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaatt 173337  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  173336 gttatttaactaagttgcatgagtctgaataag 173304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 173766 - 173671
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  173766 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgactttttagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaatgattagaggatgatt 173671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 422404 - 422626
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaa-ctgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattga 210  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||| |||| |||||||| | ||| ||| |  |||||  ||  | ||||||||||  || | |    
T  422404 ggaactttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaact-agaatctgtgaagttgttaagaactattaagttgtttgtaatgtgatttaacgactaa 422502  T
Q  211 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| |||||||| |||||||||||  ||    
T  422503 atgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgatctaattatgctgctgctg 422601  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||| |||||||||||||||||||||    
T  422602 ttatttaactaagttgcatgagtct 422626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 422193 - 422254
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  422193 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttaaataaagattagaggatga 422254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 165; Significance: 3e-88; HSPs: 102)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 165; E-Value: 3e-88
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 23535451 - 23535681
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||||||||||||| ||||| | |||||||    
T  23535451 tgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctgtttaagatattaaatgagaactgtgaagcttctatgaaatgctaagtgattat-acgtgattt 23535549  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23535550 attgatagattgcattactttaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa-tgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctatt 23535648  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  23535649 gttatttaactaagttgcatgagtctgaataag 23535681  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 3e-70
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 15236643 - 15236865
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||| || |||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  15236643 gattaggaatggaacctttggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 15236742  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||    
T  15236743 ttaattgattgcattacttgaattattcttgaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattg 15236842  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  15236843 ttatttaactaagttgcatgagt 15236865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 187 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 17410599 - 17410451
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatct 286  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  17410599 attataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtcgaagatgaattgatattaagttgttgatgtgatct 17410500  T
Q  287 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410499 gattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 17410451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 20296080 - 20295868
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  20296080 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 20295981  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  20295980 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 20295881  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  20295880 aagttacatgagt 20295868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 19472593 - 19472805
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19472593 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19472692  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19472693 gcattacttaaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19472792  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  19472793 aagttacatgagt 19472805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18774445 - 18774219
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtg-atttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| || | ||| ||||||| ||| | ||||    
T  18774445 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattacctgagaactgtgaagcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattat 18774346  T
Q  204 tgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18774345 ggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattg 18774248  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  18774247 ttattaaactatgttgcatgagtctgaat 18774219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 42805661 - 42805436
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  42805661 ttaggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaatataaagtgaattatg 42805562  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||  | ||||||||||||||||| |||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  42805561 gattgattttatttacttgaattattattaaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 42805464  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||    
T  42805463 tatttaaccaagttgcatgagtctgaat 42805436  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 18784288 - 18784062
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtg-atttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||| ||| ||||||| || | ||| ||||||| ||| | ||||    
T  18784288 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagaccaattaaagatattgactgagaactgtgaggcttttatgaattgttcagtgattatgaagtgaaattat 18784189  T
Q  204 tgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  18784188 ggattgattgtatttacttgaattattgttgaatgataaagaaattgttgaaaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattg 18784091  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  18784090 ttattaaactatgttgcatgagtctgaat 18784062  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 99; E-Value: 8e-49
Query Start/End: Original strand, 106 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 20232790 - 20232568
Alignment:
Q  106 tagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattg 205  Q
    |||| ||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| |||| |    
T  20232790 taggaaagaaactttaggtactaataagacctatttaagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatgg 20232691  T
Q  206 attgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 304  Q
    |||||||| | |||||||||||||| |||| ||||||| || ||||||| ||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  20232690 attgattgcctttacttgaattattgttgattgatcaataa-ttgttgagaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgtt 20232594  T
Q  305 aattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    | | ||||| ||||||| ||||||||    
T  20232593 attaaactatgttgcataagtctgaa 20232568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 21366527 - 21366759
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  21366527 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatt 21366626  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||   ||||| |||||||||||||||    
T  21366627 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgattatg 21366725  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21366726 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 21366759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 26742611 - 26742835
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| | | ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||  ||||| ||||| | |||| ||||     
T  26742611 ttaggaaaggaactttaggtgccattgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgatatattaagtgattataaagtgaattatg 26742710  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    | ||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||| | ||||||| ||||| ||| ||||||||   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  26742711 gtttgattgtatttactcgaattattattgaatgatcaaggaattgttgagaatgagttgttattaagc--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 26742808  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  26742809 tatttaactaagttgcatgagtctgaa 26742835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 26665996 - 26666219
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  26665996 ttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 26666095  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  26666096 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 26666192  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  26666193 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 26666219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 26937593 - 26937816
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| ||  ||||| ||||||| |||| ||||     
T  26937593 ttaggaaaggaactctaggtgctagtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatattaagtgattatgaagtgaattatg 26937692  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||||||| |||||    
T  26937693 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgctgcaattgt 26937789  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  26937790 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 26937816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 84; E-Value: 7e-40
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 24532913 - 24533136
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||  |||||||||||  ||||||| |||||||||||||||||  |||||| || |||||| ||||||| |||| ||||     
T  24532913 ttaggaaaggaactctaggtgcttgtgagacctattagagatattgactgagaactgtgaagcctttatgatatactaagtgattatgaagtgaattatg 24533012  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| ||| |||||    
T  24533013 gattgattgcccttacttgaattattgttgattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagc--ttgacgtgatttgattatgttgcaattgt 24533109  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || | ||||| ||||||||||||||||    
T  24533110 tattaaactatgttgcatgagtctgaa 24533136  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 33409469 - 33409253
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  33409469 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 33409370  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  33409369 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 33409272  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  33409271 tatttaactaagttgcatg 33409253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20911125 - 20911263
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20911125 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 20911221  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20911222 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 20911263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18356108 - 18355970
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||| ||  ||||||||| |||||||    
T  18356108 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaaact--tgatgtgatttgattat 18356012  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18356011 gttgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 18355970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 112 - 322
Target Start/End: Original strand, 17718311 - 17718520
Alignment:
Q  112 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga- 210  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||||||||||| | ||||||| || | ||  |||||||  |||  |||  |||||     
T  17718311 aggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgtttagagattatgaaatgaaatatgaattgat 17718410  T
Q  211 ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 310  Q
    || | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||  || |||| | |   ||||||||| ||||||||| || | ||||| ||||    
T  17718411 ttcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatctgttattgaac--atgatgtgatttgattatgcggcaaatgttatttaa 17718508  T
Q  311 ctaagttgcatg 322  Q
    ||||||||||||    
T  17718509 ctaagttgcatg 17718520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 16674393 - 16674177
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || |||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||| ||| | ||||||| || ||||  | |||||  |||  |||     
T  16674393 ttaggaaacgaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtaaagtttttatgaactgttaagagactatgaaatgaaatata 16674294  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  16674293 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 16674196  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  16674195 tatttaactaagttgcatg 16674177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 17410923 - 17410828
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||    
T  17410923 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgccttggagtacctttaggtgtctactaaagattagatgatgatt 17410828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 321
Target Start/End: Original strand, 24767493 - 24767634
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  24767493 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 24767591  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24767592 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 24767634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 330
Target Start/End: Original strand, 21340632 - 21340855
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||||  || |||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  21340632 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgggaactgtgaagcctttttgaattgttaagggattatgaaatgaaatatg 21340731  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || ||||||| || ||| |||||||| || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  21340732 gagtgattgcctttactcgaattattgttaattgatcaagaa-ttgtttagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 21340828  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaa 330  Q
    || ||||||||||||||||||||||||    
T  21340829 tatttaactaagttgcatgagtctgaa 21340855  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23451601 - 23451371
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | | ||||||    
T  23451601 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaaagtgatt 23451503  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||||||||||| |||||||| ||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  23451502 taacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaaa-gaattgatgttatgaagtataatgttgttgtgatctgattatg 23451404  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23451403 ctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23451371  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18356571 - 18356474
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    ||||||||  |||||| |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  18356571 tgattaggagaggaaccttagatactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 18356474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20805788 - 20805575
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| |||||||| |||  | |||||||||| ||||| | ||||||    
T  20805788 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttattggtaatgtgatttaatgattaaatgcatt 20805690  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    ||||||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||||| |         ||||  |||||||||  |||||||||||||||| |||    
T  20805689 acttgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaaattattttgttcttgtgatctgcctatgctgctattgttattta 20805592  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  20805591 actaagttgcatgagtc 20805575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 254
Target Start/End: Original strand, 20910662 - 20910813
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    ||||||||  ||||||  ||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  20910662 tgattaggagaggaaccctaggtactaatgagacctatttaagatgttatctgaggactgtgaagctattgtgaaatgctaagtgattataatgtgatat 20910761  T
Q  202 attgattgattgcattactt--gaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 254  Q
    | || || | ||||||||||  |||||||  ||||||| |||||| |||||||||    
T  20910762 aatgtttta-tgcattacttaagaattat--ttgaatgttcaagatgttgttgaa 20910813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 59; E-Value: 6e-25
Query Start/End: Original strand, 32 - 106
Target Start/End: Original strand, 23535240 - 23535314
Alignment:
Q  32 agtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  23535240 agtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 23535314  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 12028218 - 12028290
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  12028218 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctattaaagattagaggatgatt 12028290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 17918781 - 17918876
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  17918781 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagttgtgtattaaagattagaggatgatt 17918876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23458845 - 23458615
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  23458845 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 23458747  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  23458746 taacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatg 23458648  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23458647 cttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23458615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23463106 - 23462876
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || ||||||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  23463106 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 23463008  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || | ||||||||| |||||| | ||| |        ||||| |||||||||||||||    
T  23463007 taacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgctgttgaaaa-gaattgctgttatgaagtatagtgttgttgtgatctgattatg 23462909  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || || |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23462908 cttcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 23462876  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 25229271 - 25229499
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||     
T  25229271 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatg 25229369  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25229370 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 25229467  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25229468 ttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 25229499  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 25293427 - 25293655
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||||||||||| |||| | ||||||| || ||| | ||||||| |||| ||||     
T  25293427 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgactgagaactgagaag-ttttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatg 25293525  T
Q  205 gattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||  ||    || ||||||||||| |||||||||||| ||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| ||||    
T  25293526 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaataaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattg 25293623  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  25293624 ttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 25293655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 24222341 - 24222269
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||    
T  24222341 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatgatt 24222269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26681043 - 26680971
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26681043 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatt 26680971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 26952650 - 26952578
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  26952650 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatt 26952578  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 111 - 334
Target Start/End: Original strand, 21885059 - 21885282
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattg 209  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||| |||| |||| |||||    
T  21885059 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataattattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 21885157  T
Q  210 a-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 307  Q
    | ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  21885158 aattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 21885255  T
Q  308 taactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||||| | ||||||||    
T  21885256 taactaagttgcatgattatgaataag 21885282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22760141 - 22760046
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| || ||| |  |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  22760141 cagagagcatgttgatttccgtattttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtactaaagattagaggatgatt 22760046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 26742376 - 26742447
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||  ||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26742376 cagagagcatgtaaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 26742447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Original strand, 21366286 - 21366380
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  21366286 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 21366380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 122 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 20767207 - 20766997
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcattact 220  Q
    |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||| | ||||||  ||  | |||||||||| ||||| | |||||||||    
T  20767207 ggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgaactactaagttgttggtaatgtgatttaatgattaaatgcattact 20767109  T
Q  221 tgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    |||| | ||||||||||||| ||| |||||||  ||||||||||||        ||| | ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||    
T  20767108 tgaaatgttattgaatgatctagatgttgttg--aatgaattgatattatgaacttatgttgttgttgtgatttgcctatgctgctattgttatttaact 20767011  T
Q  313 aagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||||    
T  20767010 aagttgcatgagtc 20766997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 20910454 - 20910523
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  20910454 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatga 20910523  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Original strand, 123178 - 123399
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||| ||||||| ||||  ||||||| | |||| |||||||||| |||||| ||| ||||||| || ||||   || | ||||||||||  |||| | |    
T  123178 ggaaccttaggtagtaatatgacctatgtgagatgttaactgagatctgtgaggctgttatgaattgttaagctgttgtaatgtgatttaaagattaaat 123277  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 304  Q
    ||||||||||||||||| |||||| |    || ||||||||||||||||        ||| ||||   ||||| ||||||||||||||||||||  ||||    
T  123278 gcattacttgaattattcttgaataactttgatgttgttgaaaatgaattgttgtgatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgtt 123377  T
Q  305 aattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    | ||||||||||||||||||||    
T  123378 atttaactaagttgcatgagtc 123399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 10753510 - 10753385
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  10753510 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 10753417  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  10753416 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 10753385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 12028443 - 12028659
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  12028443 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 12028542  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| | |||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  12028543 acttgaattattctcgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 12028642  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  12028643 actaagttgcatgagtc 12028659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 17718069 - 17718140
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17718069 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 17718140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20806047 - 20805952
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  20806047 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttatatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 20805952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 21340397 - 21340468
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21340397 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 21340468  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #49
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 21482954 - 21482883
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21482954 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 21482883  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #50
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 26665761 - 26665832
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26665761 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 26665832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #51
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Original strand, 26937358 - 26937429
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26937358 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 26937429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 33409682 - 33409611
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  33409682 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 33409611  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #53
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 4036461 - 4036232
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||| | | |||||| ||  |||||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||| |||| ||||     
T  4036461 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctaataatgatattgaccaagaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatg 4036363  T
Q  205 gattga--ttgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagt-tgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    ||||||  |    || ||||||||||| |||||||||||||||   | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| |||    
T  4036362 gattgaaatatacttgcttgaattattgttgaatgatcaagaaaactattgagaatgatttgttatttaacc--tgatgtgatttgattatgctgcaatt 4036265  T
Q  302 gttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| | ||||||||||||||| | ||||||||    
T  4036264 gttattaaactaagttgcatgaatatgaataag 4036232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #54
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 134 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 22757349 - 22757219
Alignment:
Q  134 acctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| ||||||||  ||  | ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||||||    
T  22757349 acctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattatt 22757250  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  22757249 gaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 22757219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #55
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 260 - 325
Target Start/End: Original strand, 40723607 - 40723672
Alignment:
Q  260 attgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||    
T  40723607 attgatattaagttgttgatatgatccgattatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagt 40723672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #56
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 111 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 26172700 - 26172488
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattg 209  Q
    |||||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| ||  || | ||||||| |||| |||| |||||    
T  26172700 aaggaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgtcaaatgattatgaagtgaattatggattg 26172602  T
Q  210 a-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 307  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| || || ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| |    
T  26172601 aattacacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaacgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatt 26172504  T
Q  308 taactaagttgcatga 323  Q
    ||||||||||| ||||    
T  26172503 taactaagttgaatga 26172488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #57
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 76
Target Start/End: Complemental strand, 31342602 - 31342538
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctt 76  Q
    |||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||    
T  31342602 agagagcatgtcaaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctt 31342538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #58
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 16674628 - 16674557
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16674628 cagagagcatgtcattttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 16674557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #59
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18784507 - 18784452
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18784507 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18784452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #60
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 21884835 - 21884890
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21884835 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 21884890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #61
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 24532694 - 24532749
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24532694 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 24532749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #62
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 25229052 - 25229107
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25229052 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 25229107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #63
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 25293208 - 25293263
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  25293208 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 25293263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #64
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 26172924 - 26172869
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  26172924 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 26172869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #65
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 1858931 - 1859070
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatc 285  Q
    ||||||||||  |||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || |||||||||| ||||||| | ||| |        ||||| |||||||    
T  1858931 atgtgatttaacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgattatgatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatc 1859029  T
Q  286 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  1859030 tgattatgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 1859070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #66
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 102 - 147
Target Start/End: Complemental strand, 17410691 - 17410646
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagata 147  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17410691 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagata 17410646  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #67
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26680652 - 26680604
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680652 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26680604  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #68
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 26952259 - 26952211
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  26952259 tgtgatctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgagtct 26952211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #69
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 30 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 4036677 - 4036626
Alignment:
Q  30 tgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  4036677 tgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 4036626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #70
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 18774664 - 18774609
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  18774664 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagaagcctttgagtacctttaggtg 18774609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #71
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 42805876 - 42805825
Alignment:
Q  31 gagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  42805876 gagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 42805825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10753071 - 10752956
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  10753071 tacttgaattcttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 10752974  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  10752973 tgcaagagtatgaataag 10752956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #73
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 10753180 - 10753111
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  10753180 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 10753111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #74
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 115 - 326
Target Start/End: Original strand, 17919026 - 17919245
Alignment:
Q  115 aactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgc 214  Q
    ||||||||||| ||| || |||||||||| || || | ||||  ||||||  || ||||||| || |||||  || | ||||||||||  |||| | |||    
T  17919026 aactttaggtagtaaggaaacctatttaatatgttgagtgaggtctgtgagactgttatgaattgttaagttgttgtaatgtgatttaaagattaaatgc 17919125  T
Q  215 attacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaa 306  Q
    ||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||||||||  |||||     
T  17919126 attacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattacaatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttat 17919225  T
Q  307 ttaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  17919226 ttaactaagttgcatgagtc 17919245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #75
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 14 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 23512604 - 23512514
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||||| ||||||||  |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  23512604 agagcatgttgaattctgtattttcgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 23512514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #76
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 18769623 - 18769708
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||| ||||| ||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  18769623 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacttttaagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18769708  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #77
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 21887324 - 21887239
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  21887324 cagagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 21887239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #78
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 22032816 - 22032731
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||| || || ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  22032816 cagagaacacgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 22032731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #79
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 23201869 - 23201784
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  23201869 cagagagcatgtagaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 23201784  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #80
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24222040 - 24221899
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgat 284  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||    
T  24222040 atgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaactagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgttgtgat 24221942  T
Q  285 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||||||||||    
T  24221941 ctgattatgctgctgctgttatttaactaggttgcatgagtct 24221899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #81
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 279 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 31342217 - 31342169
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||||||||||||||||    
T  31342217 tgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtct 31342169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #82
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 17517240 - 17517295
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  17517240 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttattaaactaagttgcatgagtc 17517295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #83
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 18356803 - 18356736
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtaccttta 78  Q
    |||||||||||||   || | |||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||    
T  18356803 cagagagcatgtcattttttaagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaccttta 18356736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #84
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 19472381 - 19472444
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  19472381 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 19472444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #85
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 20296292 - 20296229
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  20296292 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 20296229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #86
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 1858638 - 1858699
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | |  | ||||||||||| |||||    
T  1858638 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatattcactaaagattagaagatga 1858699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #87
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 60
Target Start/End: Complemental strand, 23572559 - 23572510
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttaga 60  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||    
T  23572559 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttaga 23572510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #88
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 14 - 103
Target Start/End: Original strand, 122934 - 123027
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagat----gcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatg 103  Q
    ||||| ||||||||| || | ||||||| |||||| ||||||||||||    || |||||||||| |||| ||| || ||||||||||||||||    
T  122934 agagcttgtcgaattttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatagatgcctttgagtacccttagatgtttaataaagattagaggatg 123027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #89
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 14079648 - 14079588
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| | ||||||||||| ||||||||    
T  14079648 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttcaaccttagatgtttttgagt 14079588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #90
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 31342289 - 31342219
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    ||||||||||  |||| |||||||||||||||||||  |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  31342289 atgtgatttaacgattaattgcattacttgaattatccttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 31342219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 19660478 - 19660515
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  19660478 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 19660515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 21292622 - 21292659
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21292622 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21292659  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23201436 - 23201383
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  23201436 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 23201383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23512174 - 23512121
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||| ||||||  |||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||    
T  23512174 tgttgatgcgatctgcctatgctgctattgttatttaactaaagtgcatgagtc 23512121  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23572160 - 23572107
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | ||||||||||||||||||    
T  23572160 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtc 23572107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 37724380 - 37724319
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  37724380 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 37724319  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1096946 - 1096910
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  1096946 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 1096910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 27 - 63
Target Start/End: Complemental strand, 20232990 - 20232954
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgc 63  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  20232990 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 20232954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #99
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 21871213 - 21871249
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21871213 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21871249  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #100
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 21873313 - 21873277
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  21873313 tatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 21873277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #101
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 21875493 - 21875529
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21875493 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21875529  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #102
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 22075487 - 22075451
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  22075487 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 22075451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 113 - 334
Target Start/End: Original strand, 18505 - 18726
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    |||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  18505 ggaactttaggtactgctgagacctattaaagatattgaatgagaactgtgaagcttttatgaaatgctaagtgattataatgtgatttattgattgatt 18604  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||    
T  18605 gcattacttgaattatttttgaatgatcaagaaattattgaaaatgaattgttattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttacct 18704  T
Q  313 aagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||||||||||||||||    
T  18705 aagttgcatgagtctgaataag 18726  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 18262 - 18357
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  18262 cagagagcatgtcaaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctttaggtgtctattaaagattagagaatgatt 18357  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 160; Significance: 3e-85; HSPs: 2)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 3e-85
Query Start/End: Original strand, 102 - 321
Target Start/End: Original strand, 13349 - 13568
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||    
T  13349 tgattaggaaatgaattttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgataactgtgtagctattatgaaatgctaagtgattataatgtgattt 13448  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctatt 301  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  13449 attgattgattgcattactttaattattattgaatgatcaagaagttgttgaagatcgattgatattaagttgttgatgtgatctgattattctgttatt 13548  T
Q  302 gttaattaactaagttgcat 321  Q
    ||||||||||| ||||||||    
T  13549 gttaattaactgagttgcat 13568  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 66 - 106
Target Start/End: Original strand, 13172 - 13212
Alignment:
Q  66 ttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13172 ttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 13212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 156; Significance: 7e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 7e-83
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 228238 - 228466
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||| |||||   ||||||||||    
T  228238 ttaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctacttaagatattaactgagaactgtgaagtttttatgaaatgctaagtgattatatagtgatttatt 228337  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  228338 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaatagttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgctgcaattgt 228435  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  228436 tatttaactaagttgcatgagtctgaataag 228466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0525 (Bit Score: 155; Significance: 3e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0525
Description:

Target: scaffold0525; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Original strand, 3738 - 3960
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| | |||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  3738 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctgagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 3837  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  3838 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 3937  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| |||||||||||||||||||    
T  3938 ttatttaactaagttgcatgagt 3960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 152; Significance: 2e-80; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 19882 - 20110
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||| |||||||| | ||||| ||||| ||||||||||||    
T  19882 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattaattgagaactgtgaagcttttatgaaacgttaagtgattataatgtgatttatt 19981  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||||| ||| |||||    
T  19982 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattatgttgcaattgt 20079  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || | ||||||||||||||| ||||||||||    
T  20080 tattaaactaagttgcatgaatctgaataag 20110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 19647 - 19742
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  19647 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacatttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 19742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 145; Significance: 3e-76; HSPs: 7)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 65401 - 65613
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  65401 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 65500  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  65501 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaact 65600  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  65601 aagttgcatgagt 65613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Original strand, 61505 - 61697
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  61505 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 61604  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  61605 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 61697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 108; E-Value: 3e-54
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 80955 - 80736
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  ||||||||| |  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  80955 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctgtattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 80856  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||| ||||||||  ||||| |||  |||||||||||| ||||    
T  80855 ttaattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaagatgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatgctgcaattg 80759  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| | |||||||||||||||||    
T  80758 ttattaaactaagttgcatgagt 80736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 13258 - 13173
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  13258 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 13173  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #5
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 80422 - 80307
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  80422 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagt 80325  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  80324 tgcaagagtatgaataag 80307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #6
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 80531 - 80462
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||    
T  80531 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgtt-aaaatgaattg 80462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #7
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 12839 - 12785
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||    
T  12839 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattgttattgaactaagttgcatgagtct 12785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 144; Significance: 1e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 1e-75
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 9527 - 9759
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  ||||| ||||| |||||||||    
T  9527 tgattaggaaaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagcttttatgaaattttaagtgattataatgtgattt 9626  T
Q  202 attgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgtt-gaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcta 299  Q
    |||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||   |||||||||| ||||||||  ||||||||||||||||| ||||| |    
T  9627 attgattgatcgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttattaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatctgattacgctgcaa 9724  T
Q  300 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||    
T  9725 ttgttaattaactatgttgcatgagtctaaataag 9759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 9322 - 9417
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||    
T  9322 cagagagcatgtcgaattttgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctataggtgtctactaatgattagagaatgatt 9417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0349 (Bit Score: 143; Significance: 4e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0349
Description:

Target: scaffold0349; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 4e-75
Query Start/End: Original strand, 103 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 12665 - 12443
Alignment:
Q  103 gattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattta 202  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||  |  |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||    
T  12665 gattaggaatggaactttaggtactaatgagacctatctaagatgttaactgttatttgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgattta 12566  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  12565 ttgattgattgcattacttgaattattattaaatgattgggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgctattg 12466  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||| ||||||||||| |||||||    
T  12465 ttatttaactaagttacatgagt 12443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 141; Significance: 7e-74; HSPs: 98)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 16231340 - 16231565
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  16231340 ttaggaaagggactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatg 16231439  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  16231440 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaatttgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 16231537  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  16231538 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 16231565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 19278156 - 19278368
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  19278156 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 19278255  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  19278256 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 19278355  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  19278356 aagttacatgagt 19278368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 21972458 - 21972670
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  21972458 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21972557  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21972558 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21972657  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  21972658 aagttacatgagt 21972670  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 21976543 - 21976755
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  21976543 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 21976642  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  21976643 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 21976742  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  21976743 aagttacatgagt 21976755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 43252026 - 43251834
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43252026 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 43251927  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  43251926 gaatgattaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatatgatctgattatgctgttattgttatttaactaagttgcatgagt 43251834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 22045125 - 22044900
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| ||||| | |||| ||||     
T  22045125 ttaggaaatgaactttagatactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgattataaagtgaattatg 22045026  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||| |||||| |||||    
T  22045025 gattgattgcatttacttgaattattatggaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattgtgctgcaattgt 22044928  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||   |||||||||||||||||||||||    
T  22044927 tatcaaactaagttgcatgagtctgaat 22044900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 114 - 293
Target Start/End: Complemental strand, 22112084 - 22111904
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  22112084 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 22111985  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | |||||||||||    
T  22111984 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatg 22111904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 102; E-Value: 1e-50
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23834414 - 23834188
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtg-atttat 203  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| || ||||||| || ||||| ||||||| ||| ||||||    
T  23834414 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaatcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaatttat 23834315  T
Q  204 tgattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
     || |||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| ||| |||| ||| ||||    
T  23834314 ggactgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgactatgatgcaattg 23834217  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||| | ||||| |||||||||||||||||    
T  23834216 ttattaaactatgttgcatgagtctgaat 23834188  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 30308619 - 30308846
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| ||| || ||||| ||||||| |||| ||||     
T  30308619 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttaagaattgttaagtgattatgaagtgaattatg 30308718  T
Q  205 gattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgtt 304  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||  ||||| ||| ||||||     ||||| ||| |||||||| ||| ||||||    
T  30308719 gattgattgtattacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgtgaatgatttgttattaa--atctgatgggatttgattatgttgcaattgtt 30308816  T
Q  305 aattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    | | |||||| |||||||||| ||||||||    
T  30308817 attaaactaatttgcatgagtatgaataag 30308846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 105 - 268
Target Start/End: Complemental strand, 18619719 - 18619555
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| | ||| | |||||||||     
T  18619719 ttaggaaaggaaccttaggtgctaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgagatgttaagtgaatataaagtgatttatg 18619620  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt 268  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| |||    
T  18619619 gattgattgtctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgctgaaaatgaattganatt 18619555  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 20465900 - 20466133
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  20465900 tgattagggacggacccttaggtagtaatgtgacctatataagaggttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatt 20465999  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||  |||    
T  20466000 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgcctat 20466098  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
     |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20466099 actgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 20466133  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 255
Target Start/End: Complemental strand, 22028798 - 22028647
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| | |||| ||||     
T  22028798 ttaggaaaggaactttaagtactaatgagacctattgaagatattgactaagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatg 22028699  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 255  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  22028698 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgaaa 22028647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 30643152 - 30643386
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaa-gctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgat 199  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||||| ||| ||| ||| || |||||  ||||| || ||||    
T  30643152 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgcaatctgtgaaagctgttacgaactgttaagttgattataatatgat 30643251  T
Q  200 ttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    ||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||        ||| | ||||| |||||||||||||    
T  30643252 ttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgatta 30643350  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  30643351 tgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 30643386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Original strand, 23846880 - 23847096
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  23846880 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 23846979  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt-aagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||| || ||||   |||||| |||||||||||| | ||    
T  23846980 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaatctgt---tgtgatttgattatgctgcaaatg 23847076  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatg 322  Q
    ||| ||||||||||||||||    
T  23847077 ttatttaactaagttgcatg 23847096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 15602878 - 15603111
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtaat-tatgatgtgat 199  Q
    |||||||||  ||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| ||||||||  | | | |||||||    
T  15602878 tgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactgctaagttgtctgtaatgtgat 15602976  T
Q  200 ttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||         |||||||||||||||||||||    
T  15602977 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaatcgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgatta 15603075  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15603076 tgctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 15603111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 15611330 - 15611563
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtaat-tatgatgtgat 199  Q
    |||||||||  ||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || ||||| | ||||||  | | | |||||||    
T  15611330 tgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctgtt-tgaaactactaagttgtctgtaatgtgat 15611428  T
Q  200 ttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgatta 291  Q
    ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||         |||||||||||||||||||||    
T  15611429 ttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattttgctgttgatgtgatctgatta 15611527  T
Q  292 tgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  15611528 tgctggttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 15611563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 23252393 - 23252479
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  23252393 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattaga 23252479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 16410116 - 16410347
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  16410116 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 16410214  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaat--------tgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||        ||| |||| ||||||| |||||||||  |||    
T  16410215 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattggtattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 16410313  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  16410314 gctgctattgttatttcactaagttgcatgagtc 16410347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 17926568 - 17926799
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||| | |||||||||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  17926568 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaattgaaatctgtgaagctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 17926666  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| | |||||||  |||    
T  17926667 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattgtgaaattatgctgttgttttgatctgcctat 17926765  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  17926766 gctactattgttatttaactaagttgcatgagtc 17926799  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22029033 - 22028938
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  22029033 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaagtgtctactattgattagagaatgatt 22028938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 68; E-Value: 2e-30
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22045334 - 22045239
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  22045334 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 22045239  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 14398063 - 14398201
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||  |||||||||| ||||||| ||||||||| |  ||| ||| |||||||    
T  14398063 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagttgttgttgaaa-tgaattgttattaagcttt--atgcgatttgattat 14398159  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  14398160 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 14398201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15538683 - 15538473
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| |||| |||||| | ||||||| || ||||  || ||||  |||  ||| ||||||    
T  15538683 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaacagtgaagattttatgaactgttaagggataatgaaatgaaatatggattga 15538584  T
Q  211 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||| || |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  15538583 ttgcctttacttgagttattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 15538486  T
Q  310 actaagttgcatg 322  Q
    |||||||||||||    
T  15538485 actaagttgcatg 15538473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 15532123 - 15531914
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga 210  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||  ||||| | |||| ||||| ||||| | |||| || || ||||  || ||||  |||  ||| ||||||    
T  15532123 aaggaactttaggtgctaatgagacctattagagataatgactgtgaactatgaagattttat-aactgttaagggataatgaaatgaaatatggattga 15532025  T
Q  211 ttgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  15532024 ttgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 15531927  T
Q  310 actaagttgcatg 322  Q
    |||||||||||||    
T  15531926 actaagttgcatg 15531914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 194 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21387223 - 21387086
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||  | ||| || ||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| ||||||||    
T  21387223 tgtgatttaatgattaaatgcattgttcgaaatagtatcgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatg 21387127  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21387126 ctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 21387086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 20856286 - 20856518
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | |||| || ||||| ||||| |||||||| ||||| ||| |||||| ||||||| || ||||||| ||||||| |  || | ||||||||    
T  20856286 tgattaggaatggaaattcaggtagtaatgtgacctattaaagatgttagctgagatctgtgaacctgttatgaattgctaagctgtttgtaatgtgatt 20856385  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | |||||||||||||||||| |||||| | | ||| |||||||||||||||||| | ||| |         | ||| ||||||||||||||    
T  20856386 taatgattaaatgcattacttgaattattcttgaataacctagatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaagttataatattgttgtgatctgattat 20856485  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  20856486 gctgct-ttgttatttaactaagttgcatgagtc 20856518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 16231105 - 16231200
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||  |||||||||||||  |||||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||    
T  16231105 cagagagcatgtcgaattctgagttttcgacttttgatttgaaccttagatgtctttgagtacccttaggtgtctactaaagattagagaatgatt 16231200  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 196 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 21383801 - 21383666
Alignment:
Q  196 tgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgct 295  Q
    ||||||| ||||| | |||||| || ||| || ||||||||||| |||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||| |    
T  21383801 tgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatagtattgaatgattaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattatgtt 21383705  T
Q  296 gctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  21383704 gcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 21383666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23834649 - 23834554
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  23834649 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 23834554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 39094571 - 39094664
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| || ||  | ||||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  39094571 cagagagcatgttgattttcgtgttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagaggatga 39094664  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 15602636 - 15602731
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15602636 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 15602731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 15611088 - 15611183
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  15611088 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 15611183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18619938 - 18619859
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18619938 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 18619859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 30642910 - 30643005
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  30642910 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatgatt 30643005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 377778 - 377693
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| | ||||||||||    
T  377778 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttgttaaagatta 377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 20465658 - 20465751
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||  ||||||||||||| |||||    
T  20465658 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgttaattaaagattagatgatga 20465751  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 67
Target Start/End: Complemental strand, 22057824 - 22057768
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgctttt 67  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||    
T  22057824 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgctttt 22057768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 114 - 322
Target Start/End: Original strand, 17828457 - 17828663
Alignment:
Q  114 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgatt-gatt 212  Q
    ||||||||||| |||| ||||||||||  ||||| | |||| ||||||||||| | ||||||  || ||||  || ||||  |||  ||| |||| ||||    
T  17828457 gaactttaggtgctaacgagacctattagagataatgactgtgaactgtgaagattttatgatttgttaagggataatgaaatgaaatatggatttgatt 17828556  T
Q  213 g-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 311  Q
    | | |||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||||||  ||||||||| |||||||||||| | |||||||||||    
T  17828557 gtctttacttga-ttattgttaattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttattaagct--tgatgtgatttgattatgctgcaaatgttaattaac 17828652  T
Q  312 taagttgcatg 322  Q
    |||||||||||    
T  17828653 taagttgcatg 17828663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 18862605 - 18862730
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  18862605 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 18862698  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  18862699 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 18862730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 20856044 - 20856139
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| |||||  | | ||||||  |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||||| |||||||    
T  20856044 cagagagcatgttgaatttcgtgattttgaattttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgtccattaaagattagatgatgatt 20856139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 21827974 - 21828099
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21827974 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21828067  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21828068 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21828099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 22010298 - 22010393
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| ||| || |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||||    
T  22010298 cagagagcatgttgaattctgtatttttgactttttagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatt 22010393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Original strand, 30308400 - 30308479
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||  |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  30308400 ttctgagtttttgatttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 30308479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Complemental strand, 377536 - 377414
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| | || || ||||||||    
T  377536 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgatcataatgtgatt 377437  T
Q  201 tattgattgattgcattacttga 223  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  377436 taatgattaattgcattacttga 377414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15532364 - 15532294
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15532364 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 15532294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 15538923 - 15538854
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15538923 agagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 15538854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32605400 - 32605223
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32605400 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32605302  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
     ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32605301 gaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 32605223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 30 - 86
Target Start/End: Original strand, 24433886 - 24433942
Alignment:
Q  30 tgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtcta 86  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  24433886 tgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtcta 24433942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 16409898 - 16409969
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  16409898 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 16409969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21411096 - 21410971
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21411096 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21411003  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21411002 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21410971  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 21805588 - 21805463
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  21805588 tgtgaattaatgattaaatgcattatttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 21805495  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  21805494 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 21805463  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 22010540 - 22010769
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || | |||| |||||||||| |||||||| | |||||| | | || |||| ||||||||  ||  | ||||||||    
T  22010540 tgattaggaatggaactttaggtagtagtaagacatatttaagatgttaactgaaatctgtgaggttgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 22010638  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| |||| |||||||||| ||| ||||    |||||||||| | |||   || |     |||| ||||||||||||||    
T  22010639 taatgattaaatgcattacttgaaatattcttgaatgatctagatgttg----aaatgaattgttgttatgaagttataaagttgttgtgatctgattat 22010734  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| |||||| ||||| |||||||||||||||    
T  22010735 gctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtct 22010769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 22113374 - 22113429
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22113374 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 22113429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 22134877 - 22134932
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22134877 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 22134932  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 82
Target Start/End: Original strand, 22166027 - 22166082
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22166027 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 22166082  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 16861279 - 16861418
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatc 285  Q
    |||||||||| ||||| | | ||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||| |||||||||| | ||| |        ||||| |||||||    
T  16861279 atgtgatttaatgattaaatacattacttgaaatattattgaatgattaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaaatataatgttgttgtgatc 16861377  T
Q  286 tgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| |||||| |||||  |||||||||||||    
T  16861378 tgattatgctgcttttgttatttaaccgagttgcatgagtc 16861418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Original strand, 19259443 - 19259565
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||  ||||| |||||||  | |||||||||||||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  19259443 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatacaagatgttaactgcaatctgtgaagctattatgaactgttaagttgattataatgtgatt 19259542  T
Q  201 tattgattgattgcattacttga 223  Q
    || ||||| ||| ||||||||||    
T  19259543 taatgattaatttcattacttga 19259565  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 16860980 - 16861049
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  16860980 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 16861049  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 17353556 - 17353641
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  17353556 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 17353641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #60
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 24755959 - 24755842
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattact 220  Q
    |||| ||||| ||||||| || ||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  24755959 ggtagtaatgtgacctatataggatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 24755860  T
Q  221 tgaattattattgaatga 238  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  24755859 tgaaatgttaatgaatga 24755842  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #61
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 32598868 - 32598691
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  32598868 gaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 32598770  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
     ||||| ||| ||||   ||  ||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  32598769 gaatgatttgttatttgact--tgatgtgatttgattgtgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 32598691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #62
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32599153 - 32599084
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32599153 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 32599084  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #63
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 12 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 32605685 - 32605616
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    ||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  32605685 agagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 32605616  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #64
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 326
Target Start/End: Original strand, 39094877 - 39095018
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgat 284  Q
    |||| ||||| ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| ||||| |         ||||| ||||||    
T  39094877 atgtaatttaatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttattatgaagttataatgttgttgtgat 39094976  T
Q  285 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||| ||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  39094977 ctgaatatgctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtc 39095018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #65
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 17926358 - 17926421
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  17926358 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 17926421  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #66
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Original strand, 18678141 - 18678196
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18678141 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 18678196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #67
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 22112275 - 22112212
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||  |||||||| ||||||    
T  22112275 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctattattgattagagaatgatt 22112212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #68
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 271 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 32121814 - 32121759
Alignment:
Q  271 gctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  32121814 gctgttgatgtaatctgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 32121759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #69
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Original strand, 17055019 - 17055089
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||    
T  17055019 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaactttagatgcctttgagtacctttaggt 17055089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #70
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 16185228 - 16185143
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  16185228 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccatagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16185143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #71
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 23776807 - 23776929
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||        ||| || |||||||||  ||||||||||| ||    
T  23776807 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgctgatgttgtgatctgcctatgctgctatagt 23776906  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  23776907 tatttaactaagttgcatgagtc 23776929  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #72
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 274 - 334
Target Start/End: Original strand, 17055412 - 17055472
Alignment:
Q  274 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  17055412 gttgatgttatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 17055472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #73
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 21168340 - 21168427
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    ||||||||| || ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||    
T  21168340 cagagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaga 21168427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #74
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 21972246 - 21972309
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  21972246 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 21972309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #75
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 12 - 71
Target Start/End: Original strand, 25362770 - 25362829
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  25362770 agagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 25362829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #76
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 14 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 19899592 - 19899510
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||| |||||    
T  19899592 agagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaatgatta 19899510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #77
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 98
Target Start/End: Original strand, 21161735 - 21161821
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||| || ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||  || ||| ||||||||||||||    
T  21161735 agagagcaggttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagaagtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattaga 21161821  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #78
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 24755790 - 24755736
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  24755790 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtct 24755736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #79
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 16411888 - 16411973
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||| ||||||||| ||| |||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  16411888 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttaaatgtttttgagtgccttaagatgtgtattaaagatta 16411973  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #80
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23648633 - 23648580
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23648633 tgttgttgtaatctgcctatgttgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 23648580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #81
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 273 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 377347 - 377295
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||    
T  377347 tgttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagt 377295  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #82
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 34 - 82
Target Start/End: Original strand, 17828236 - 17828284
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||  |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17828236 tttttgagttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 17828284  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #83
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 50 - 106
Target Start/End: Original strand, 19277953 - 19278009
Alignment:
Q  50 tgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  19277953 tgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 19278009  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #84
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 23844544 - 23844596
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgc 63  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  23844544 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 23844596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #85
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 21976331 - 21976394
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  21976331 tttgagttgaaccttagatgcctttaagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 21976394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #86
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 43252257 - 43252194
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||| | |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  43252257 tttgagttgaaccttagattcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 43252194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #87
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 23776452 - 23776538
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaacc-ttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||| ||||||| |||||||| |||  || ||  ||||||||||||    
T  23776452 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaacctttagatgtttttgagtgcctaaagatgattattaaagatta 23776538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #88
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 5865918 - 5865955
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5865918 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 5865955  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #89
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 17353984 - 17354037
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  17353984 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 17354037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #90
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 19259221 - 19259305
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| |||||||    ||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  19259221 cagagagcatgttgaattcttgaattttgacttttgagttgaaccttagatgc-tttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 19259305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #91
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 19259632 - 19259685
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||| ||| ||||||| ||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  19259632 tgttgttgtgaactgcttatgctactattgttatttaaccaagttgcatgagtc 19259685  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #92
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 21162099 - 21162152
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21162099 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtc 21162152  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #93
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 21168772 - 21168825
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  ||||||| |||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  21168772 tgttgttgtgatctgcctatgctgttattattatttaactaagttgcatgagtc 21168825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #94
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21249861 - 21249824
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21249861 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21249824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #95
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 21255699 - 21255662
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21255699 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21255662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #96
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 21389094 - 21389131
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21389094 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 21389131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #97
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 24756221 - 24756161
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| | ||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  24756221 cagagagcatgtaggattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 24756161  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #98
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 113 - 157
Target Start/End: Original strand, 39094814 - 39094858
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgaga 157  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||    
T  39094814 ggaacttaaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaga 39094858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0372 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 1)
Name: scaffold0372
Description:

Target: scaffold0372; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 133 - 325
Target Start/End: Original strand, 4994 - 5186
Alignment:
Q  133 gacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 232  Q
    |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4994 gacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattatt 5093  T
Q  233 gaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5094 gaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattgatattaagttgttgatatgagctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagt 5186  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0168
Description:

Target: scaffold0168; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 3395 - 3620
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | |||   |||| ||||     
T  3395 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacccattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatatagagtgaattatg 3494  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| ||||||| |||| |||||    
T  3495 gattgattgcatttacttgaattgttattgaatgatcaagaaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatactgcaattgt 3592  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  3593 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 3620  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0168; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 3160 - 3255
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| | |||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  3160 cagagagcatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctatgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 3255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 129; Significance: 1e-66; HSPs: 2)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 58592 - 58804
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  58592 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 58691  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  58692 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttgaaaatgaattggtattaagctgttgatataatctgattatgctgctattgttatttaact 58791  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    ||||| |||||||    
T  58792 aagttacatgagt 58804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 43 - 106
Target Start/End: Original strand, 58380 - 58443
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  58380 tttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 58443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 125; Significance: 2e-64; HSPs: 6)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 2e-64
Query Start/End: Original strand, 114 - 325
Target Start/End: Original strand, 35816 - 36027
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgatt 212  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | || ||| |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||    
T  35816 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattgtgaattgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgatt 35915  T
Q  213 gcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaact 312  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||| ||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||| ||||||    
T  35916 gcattacttgaattattattgaatgatcaggaagttgttg-aaattaattgatattaagctgttgatatgatctaattatgctgctattgttatttaact 36014  T
Q  313 aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||||    
T  36015 aagttgcatgagt 36027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 7185 - 6957
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || ||||||| |||| ||||     
T  7185 ttaggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatg 7086  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  7085 gattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 6988  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || | ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6987 tattaaactatgttgcatgagcatgaataag 6957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #3
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 10932 - 11018
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  10932 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattag 11018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #4
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Original strand, 38449 - 38535
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||| || ||   |||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  38449 cagagagcatgttgattttccagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattag 38535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #5
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 45562 - 45501
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  45562 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatga 45501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #6
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Complemental strand, 7527 - 7461
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtaccttta 78  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  7527 agagagcatgtcattttctaagtttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagtaccttta 7461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334 (Bit Score: 121; Significance: 6e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0334
Description:

Target: scaffold0334; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 6e-62
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 18225 - 18450
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||| |||||| | |||||||||||||||||| |||||| ||| ||||| |  || | |||| ||||     
T  18225 ttaggaaaggaactttaggtgctaatgagacctattaaagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatatgttaagtgaaaataaagtgaattatg 18324  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  18325 gattgattgtatttacttgaattattattgaatgatcaaggaattgttgaaaatgaattgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 18422  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || |||||||||||||||||||||||||    
T  18423 tatttaactaagttgcatgagtctgaat 18450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0334; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Original strand, 17991 - 18061
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  17991 agagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 18061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 5)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 114 - 245
Target Start/End: Original strand, 10458 - 10589
Alignment:
Q  114 gaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattg 213  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  10458 gaactttaagtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatactaagtgattataatgtgatttattgattgattg 10557  T
Q  214 cattacttgaattattattgaatgatcaagaa 245  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10558 cattacttgaattattattgaatgatcaagaa 10589  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 10214 - 10309
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  10214 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatgatt 10309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 70034 - 69915
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--taattatgatgtgatttattgattgattgcattac 219  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||| ||| ||    | | ||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  70034 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgagatgttagtgttgaatatgatgtgatataatgattaattgcattac 69935  T
Q  220 ttgaattattattgaatgat 239  Q
    ||||||||| | ||||||||    
T  69934 ttgaattatgaatgaatgat 69915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #4
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 272 - 335
Target Start/End: Complemental strand, 69871 - 69808
Alignment:
Q  272 ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataaga 335  Q
    |||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||    
T  69871 ctgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtcggtataaga 69808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 70272 - 70211
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  70272 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtatattaaagatta 70211  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 114; Significance: 9e-58; HSPs: 3)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 9e-58
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Original strand, 24833 - 25059
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||| |||||| ||||| ||||| | |||| ||||     
T  24833 ttaggaaaggaactttaggtactaatgagacctattaaagatattgactgagaactgtgaagcttttaggaaatgttaagtgattataaagtgaattatg 24932  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatc-aagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattg 302  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| | || |||||||||  ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| ||||    
T  24933 gattgattgcatttacttgaattattattgaatgatcaaaggaattattgaaaatgtgttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaattg 25030  T
Q  303 ttaattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    ||| | |||| ||||||||||||||||||    
T  25031 ttattaaactgagttgcatgagtctgaat 25059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Original strand, 24598 - 24686
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    ||||||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  24598 cagagagcatgtcgttttctgagtttttaacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagag 24686  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #3
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 189337 - 189462
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  189337 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 189430  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  189431 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 189462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 110; Significance: 2e-55; HSPs: 3)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 4685 - 4452
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| || |||||||||| |||||  |||||||  ||||||||| |||||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  4685 tgattaggaatggaactttaggtagtagtgagacctatataagaagttaactgtaaactgtgaaactattatgaaatgctaagttgattataatgtgatt 4586  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||| ||||||||||||||| |||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| ||||||||||||||    
T  4585 tattgattaattgcattacttgaaatattatcgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgattat 4487  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  4486 gctgccattgttatttaactaagttgcatgagtct 4452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 597 - 471
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  597 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 504  T
Q  294 ctgctattgttaattaact-aagttgcatgagt 325  Q
    |||||||||||| |||||| |||||||||||||    
T  503 ctgctattgttatttaactaaagttgcatgagt 471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 4903 - 4834
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||||| ||||||||| |||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  4903 ttttgacttttgagttgaaccttaaatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 4834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425 (Bit Score: 106; Significance: 5e-53; HSPs: 2)
Name: scaffold0425
Description:

Target: scaffold0425; HSP #1
Raw Score: 106; E-Value: 5e-53
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 415 - 181
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||| || | |||||||||| ||||||| || |||||  ||||| ||||||||    
T  415 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctaattaagatgttaacggaaatctgtgaagctgttatgaactgttaagttgattataatgtgatt 316  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||| | ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||        ||| | ||||||||||||||||||||    
T  315 taatgactaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaagttatgttgttgatgtgatctgattat 216  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  215 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0425; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 657 - 597
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||| |||||||||||||||    
T  657 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccctagatgcttttgagt 597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 97; Significance: 1e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 97; E-Value: 1e-47
Query Start/End: Original strand, 105 - 331
Target Start/End: Complemental strand, 23457 - 23232
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||| |||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||| ||||     
T  23457 ttaggaaaggaaccttagttactaatgagacctattcaagatattgactgagaactatgaagcttttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatg 23358  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||| ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||| |    
T  23357 gattgattgtatttacttgaattattgttgaatgaccaagaaattgttgagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattaagctgcaattat 23260  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaat 331  Q
    || | ||||| ||| |||||||||||||    
T  23259 tattaaactatgtttcatgagtctgaat 23232  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 23692 - 23597
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  23692 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactactgattagagaatgatt 23597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 96; Significance: 5e-47; HSPs: 4)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 5840 - 5608
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  5840 tgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgatt 5742  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
     | ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| |||||||||||||||    
T  5741 aaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatg 5642  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  5641 ctgctactgttatttaactaagttgcatgagtct 5608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 5e-47
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7035 - 6803
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||| || ||||||| ||||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  7035 tgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatt-aagatgttaactgagatctttgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgatt 6937  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
     | ||| | ||||||||||||||  ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||       || ||||||| |||||||||||||||    
T  6936 aaatgaataattgcattacttgagatattattgaatgatcaagatgttgttgaaaatgaattgatattatgaactatgctgttgttgtgatctgattatg 6837  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  6836 ctgctactgttatttaactaagttgcatgagtct 6803  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #3
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 6081 - 5989
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  6081 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 5989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #4
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 12 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 7276 - 7184
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||    
T  7276 agagagcatgtcgaattctgtgtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatga 7184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461 (Bit Score: 95; Significance: 2e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1461
Description:

Target: scaffold1461; HSP #1
Raw Score: 95; E-Value: 2e-46
Query Start/End: Original strand, 112 - 273
Target Start/End: Complemental strand, 163 - 1
Alignment:
Q  112 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||| || ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||| | ||| | |||| |||| |||||||    
T  163 aggaactttaggtactaatgagacttattaaaaatattgactgagaactgtgaagcttttatgaaatgttaagtgaatataaagtgaattatggattgat 64  T
Q  212 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagct 273  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||||||    
T  63 tgcatttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaagct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1461; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 405 - 317
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  ||||||||    
T  405 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagag 317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296 (Bit Score: 94; Significance: 7e-46; HSPs: 2)
Name: scaffold1296
Description:

Target: scaffold1296; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 7e-46
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 648 - 415
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  648 tgatttgggatggacccttaggtagtaatgcgacctatttaagatgttaattgagatctgtgaagctactatgaactgttaagctgattataatgtgatt 549  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||        ||| |||| || ||||||||||||||    
T  548 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgtcgttgaaaa-gaattgatattatgaagttatgctgctgttgtgatctgattat 450  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  449 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1296; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 12 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 889 - 795
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||   | ||| |||||||||||||| |||||||    
T  889 agagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctaatgatgtttattaaagattagatgatgatt 795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 3)
Name: scaffold0546
Description:

Target: scaffold0546; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Original strand, 6122 - 6350
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| || ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| || || || ||||||| |||| ||||     
T  6122 ttaggaaaagaactttaggtgctaatgtgacctattaaagatattgactgagaactctgaagcttttatgaattgttatgtgattatgaagtgaattatg 6221  T
Q  205 gattgattgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||  ||||| ||| |||||| |  |||||||||| |||||||||||| |||||    
T  6222 gattgattgtatttacttgaattattgttgaatgatcaagaagttgctgtgaatgatttgttattaaac--ttgatgtgatttgattatgctgcaattgt 6319  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || | ||||| ||||||||||  ||||||||    
T  6320 tattaaactatgttgcatgagcatgaataag 6350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 2375 - 2289
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  2375 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattag 2289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0546; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 78
Target Start/End: Original strand, 5780 - 5846
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtaccttta 78  Q
    ||||||||||||   |||| |||||||||| |||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  5780 agagagcatgtcattttctaagtttttgacttttgagttgaaccttggatgcctttgagtaccttta 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 1748 - 1516
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  1748 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatt 1649  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatat-------taagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||       ||    |||| |||||||||||||||    
T  1648 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatg-aaatgaattgatatgatgaagtataaagttgttgtgatctgattatg 1550  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  1549 ctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 1516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393; HSP #2
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1990 - 1895
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  1990 cagagagcatgttgaattctgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagattagatgatgatt 1895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 92; Significance: 1e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 1e-44
Query Start/End: Original strand, 119 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 42860 - 42649
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||| | |||||||||| ||||| | ||||||    
T  42860 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaactgttaagctgattctaatgtgatttaatgattaaatgcatt 42761  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 311  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||||||||| |       ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  42760 acttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgatattatgaagttaatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaac 42665  T
Q  312 taagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||    
T  42664 taagttgcatgagtct 42649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070 (Bit Score: 88; Significance: 3e-42; HSPs: 2)
Name: scaffold0070
Description:

Target: scaffold0070; HSP #1
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 10144 - 9916
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  10144 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 10045  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| |||||||||||| | |||    
T  10044 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 9947  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  9946 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 9916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0070; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 10379 - 10308
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10379 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 10308  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 2)
Name: scaffold0346
Description:

Target: scaffold0346; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 113 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 15330 - 15111
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    ||||||||||||| || |||||||| | |||||| |||||||  | |||||||||| |||| ||| | |||||  ||||| |||||||||| ||||| ||    
T  15330 ggaactttaggtagtagtgagacctttataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttataaaaagttaagttgattataatgtgatttaatgattaat 15231  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgt-------tgatgtgatctgattatgctgctattgtt 304  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||| |  ||       || |||||||||||||||||| |||||||    
T  15230 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaagttatgctgtgttgtgatctgattatgctgttattgtt 15132  T
Q  305 aattaactaagttgcatgagt 325  Q
    | |||||||||||||||||||    
T  15131 atttaactaagttgcatgagt 15111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0346; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 17366 - 17402
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  17366 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 17402  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 82; Significance: 1e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 82; E-Value: 1e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Original strand, 18517 - 18750
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    ||||| |||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| |||||||||| || ||  ||||| ||||||||    
T  18517 tgatttgggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatggtatgttgattataatgtgatt 18616  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||| |||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||    
T  18617 taatgattaattccattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaacgaattgatattatgaagttattctgttgttgtgatctgcctat 18715  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  18716 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 18750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 18275 - 18360
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||||||||||||  ||||| || |||||| |||||||||||||| ||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  18275 cagagagcatgtcgaattctgcattttttacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0761 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0761
Description:

Target: scaffold0761; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 159 - 327
Target Start/End: Original strand, 6227 - 6403
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaagtaatt-atgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaat 257  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||  || ||  ||||||||| | ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  6227 ctgtgaagctattatgaaatgttaagttgtttatattgtgatttaattattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagaagttgttg-aaat 6325  T
Q  258 gaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  6326 gaattgatattatgaagttatgatgttgttgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 6403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 81; Significance: 4e-38; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 4e-38
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 46588 - 46820
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| |||   ||||||| ||||| ||||||| |||||  |||||||  | |||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||||||    
T  46588 tgattagggatggactcttaggtagtaatgtgacctatataagaagttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgctaagttgattataatgtgatt 46687  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||        ||| ||| ||| |||||||||  |||    
T  46688 taatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg-tggaaatgaattgatattatgaagttatgctattgttgtgatctgcctat 46786  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  46787 gctgctattgttatgtaactaagttgcatgagtc 46820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 46346 - 46439
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  46346 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 46439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold0216
Description:

Target: scaffold0216; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Original strand, 17058 - 17206
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttga 278  Q
    ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||| |||||| ||||||| |||||||||||||        ||| ||||||||    
T  17058 attataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgttcaagatgttgttggaaatgaattgatattatgaagttatgctgttga 17157  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17158 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttccatgagtct 17206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0216; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 16740 - 16833
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||| |||| ||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||| |||||| |||||    
T  16740 cagagagcatgtagaattctgtgtttttgacttttgagttgaagcttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaatattagatgatga 16833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 80; Significance: 2e-37; HSPs: 8)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 80; E-Value: 2e-37
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 64094 - 63878
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||  ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  64094 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactatgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 63995  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||| || |||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||| | |||    
T  63994 gattgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgcaaatgt 63897  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  63896 tatttaactaagttgcatg 63878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 75978 - 75762
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||| ||| |||||||||| ||| |||| |||||| | |||| ||||||||||| | ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  75978 ttaggaaaggaaatttcggtactaatgtgacatattaaagataatgactgtgaactgtgaagtttttatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 75879  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||| |||||| || |||||||||||| ||||||| ||||||| ||||||| ||||||||| |||||| |   || |||||| |||||||||||  | |||    
T  75878 gatagattgcctttacttgaattattgttgaatggtcaagaaattgttgagaatgaattgttattaaac--ctgttgtgatttgattatgctgaaaatgt 75781  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  75780 tatttaactaagttgcatg 75762  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #3
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 64329 - 64258
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  64329 cagagagcatgtcattttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 64258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 122 - 238
Target Start/End: Original strand, 34791 - 34908
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagta-attatgatgtgatttattgattgattgcattact 220  Q
    |||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||| || |||||  ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||    
T  34791 ggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaattgttaagttgattataatgtgatttaatgattaattgcattact 34890  T
Q  221 tgaattattattgaatga 238  Q
    |||| | ||| |||||||    
T  34891 tgaaatgttaatgaatga 34908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #5
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 76212 - 76142
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||   || |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  76212 agagagcatgtcattttatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtaactttaggtg 76142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #6
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 34529 - 34622
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||| || | | | |||||||||||| |||||    
T  34529 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgtttttgagtgccttaagattttttttaaagattagatgatga 34622  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #7
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 34960 - 35014
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  34960 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtct 35014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #8
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 24 - 104
Target Start/End: Original strand, 41185 - 41265
Alignment:
Q  24 gaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||||  |||||||| | |||| ||||||||||||| |||||||| |||  || | | |||||||||||||| |||||    
T  41185 gaattctgtatttttgacttgtgagttgaaccttagatgattttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatga 41265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 2)
Name: scaffold1326
Description:

Target: scaffold1326; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 113 - 327
Target Start/End: Original strand, 1362 - 1584
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || |||| | ||||| |||||| |||  || | ||    
T  1362 ggaactttagttagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagctgattataatgtgacttaacgaataat 1461  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| | ||| |         ||||| |||||||||||||||||||| | ||    
T  1462 tgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttgttatgaagttataatgttgttgtgatctgattatgctgctttggt 1560  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  1561 tatttaactaagttgcatgagtct 1584  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1326; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 98
Target Start/End: Original strand, 1119 - 1206
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattaga 98  Q
    |||||||||||||||||||||   ||||||| | |||| ||||| |||||||||||||||| ||||||| ||| ||||||||||||||    
T  1119 cagagagcatgtcgaattctgtagttttgacttgtgagttgaactttagatgcttttgagtgcctttagatgtttattaaagattaga 1206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284 (Bit Score: 76; Significance: 4e-35; HSPs: 2)
Name: scaffold0284
Description:

Target: scaffold0284; HSP #1
Raw Score: 76; E-Value: 4e-35
Query Start/End: Original strand, 105 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 18595 - 18367
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||| ||||| | ||||||| || ||||  ||||| |  ||| ||||     
T  18595 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactatgaagtttttatgaattgttaagagattattaaatgaattatg 18496  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || |||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   ||||||||| || ||||||||| | |||    
T  18495 gactgattgcctttacttgaattattgttgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgatgtgatttgtttatgctgcaaatgt 18398  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    || |||||||||||||||| || ||||||||    
T  18397 tatttaactaagttgcatgtgtatgaataag 18367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0284; HSP #2
Raw Score: 60; E-Value: 1e-25
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 18830 - 18735
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  18830 cagagagcatgtcgaattatgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 18735  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 74; Significance: 6e-34; HSPs: 4)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 6e-34
Query Start/End: Original strand, 127 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 9741 - 9536
Alignment:
Q  127 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 225  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| ||||||||  ||  | |||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  9741 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 9643  T
Q  226 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata-------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttg 318  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||       ||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||    
T  9642 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgagttatgctgttgatgtgatctgattatgttgttattgttatttaactaagttg 9544  T
Q  319 catgagtc 326  Q
    ||||||||    
T  9543 catgagtc 9536  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 127 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2059 - 1853
Alignment:
Q  127 taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcattacttgaat 225  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| || | ||||||| || || |||| ||||||||  ||  | |||||||||| ||||| | |||||||||||||     
T  2059 taatgtgacctatttaagatgttaaccgaaatctgtgaaactgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaa 1961  T
Q  226 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 317  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||||||| ||||||| |||||||||||    
T  1960 tattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctatgctgccattgttatttaactaagtt 1862  T
Q  318 gcatgagtc 326  Q
    |||||||||    
T  1861 gcatgagtc 1853  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 2300 - 2231
Alignment:
Q  37 ttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||||    
T  2300 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatt 2231  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #4
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 37 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 9982 - 9913
Alignment:
Q  37 ttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||||| ||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||||    
T  9982 ttgacttttgagttgaaccttagatgcttttaagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatgatt 9913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0615
Description:

Target: scaffold0615; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Original strand, 1962 - 2178
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaa-tgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcat 216  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||  ||  | |||| ||||| ||||| | |||||    
T  1962 ttaggtagtaatgtgacctatttaagatattaactgaaatatgtgaagctgttatgaaaatgctaagttgtttgtaatgtaatttaatgattaaatgcat 2061  T
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata--------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatt 308  Q
    |||||||| | | ||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||        ||| | ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2062 tacttgaaatttcattgaatgatcaagatgttgttg-aaatggattgatattatgaagttatgttgttgttgtgatctgattatgctgctattgttattt 2160  T
Q  309 aactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||||||||    
T  2161 aactaagttgcatgagtc 2178  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0615; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 1703 - 1798
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||| ||   |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  1703 cagagagcatgtcgaattttgtaattttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtgtattaaagattagatgatgatt 1798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 334
Target Start/End: Original strand, 5862 - 6093
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||| | | |||||| |||||||| ||||||||| ||||||| || ||| | ||||| | |||| ||    
T  5862 tgattaggaaaggaactttaggtactaatgagacctaataatgatattgactgagaattgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattattaagtgaatt 5960  T
Q  202 attgattg--attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgcta 299  Q
    || |||||  ||    |||||||||||||| |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | |   ||||||||| |||||||||||| |    
T  5961 atggattgaaatatacttacttgaattattgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaa 6058  T
Q  300 ttgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||| | ||||||||||||||||| ||||||||    
T  6059 ttgttattaaactaagttgcatgagtatgaataag 6093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 4)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 102 - 269
Target Start/End: Original strand, 21430 - 21597
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  |||||||||  |||||| || |||| | ||||| ||||||||    
T  21430 tgattagggatggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatttgtgaagctgctatgaactgttaagctgattataatgtgatt 21529  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta 269  Q
    || ||||| |||| |||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  21530 taatgattaattgtattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatatta 21597  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 217 - 334
Target Start/End: Original strand, 80754 - 80869
Alignment:
Q  217 tacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagt 316  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||  | | || ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| | |||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  80754 tacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactttcgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttaattatgctgcaattgttatttaactaagt 80851  T
Q  317 tgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||| |||| ||||||||    
T  80852 tgcaagagtatgaataag 80869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #3
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 21188 - 21273
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||| |||| |||||||| || ||| |||||| |||||    
T  21188 cagagagcatgtcgaattctatattttttacttttgagttgaaccttagatgttttttagtaccttaagatgtgtattaaggatta 21273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 193 - 255
Target Start/End: Original strand, 80644 - 80706
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaa 255  Q
    |||||||||| ||||| | |||||| || ||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  80644 atgtgatttaatgattaaatgcattgctcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa 80706  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0299 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0299
Description:

Target: scaffold0299; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 6831 - 6693
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||||||| |||||||||| ||||||| |||||||||  ||||| ||| |||||||    
T  6831 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattatagaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgagatttgattat 6735  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6734 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 6693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0051 (Bit Score: 71; Significance: 4e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0051
Description:

Target: scaffold0051; HSP #1
Raw Score: 71; E-Value: 4e-32
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 31035 - 30897
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||| ||| |||||||    
T  31035 atgtgatttaatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgatgagatttgattat 30939  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||  ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||    
T  30938 gctgtaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaataag 30897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280 (Bit Score: 70; Significance: 2e-31; HSPs: 2)
Name: scaffold0280
Description:

Target: scaffold0280; HSP #1
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 266
Target Start/End: Original strand, 19153 - 19317
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| | |||||||||| ||||||| |  |||| | ||||||||||||||    
T  19153 tgattaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatctgtgaagctgttatgaactattaagctgattatgatgtgatt 19252  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata 266  Q
    |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  19253 tattgattaattgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgata 19317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0280; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 18921 - 19014
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||||||||  || | ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||||||| |||  | ||||||||||| |||||    
T  18921 cagagagcatgtcgaatcttgtgattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctttagatgttcactaaagattagatgatga 19014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 69; Significance: 6e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 6e-31
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 6489 - 6397
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||    
T  6489 agagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagacgcctttgagtacctttaggtgtctactacagattagaggatgatt 6397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 66; Significance: 4e-29; HSPs: 8)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 71557 - 71460
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    ||||||||  |||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  71557 tgattaggagaggaaccttaggtactaatgagacctatttaagatgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgttaagtgattataatgtgat 71460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #2
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 11 - 103
Target Start/End: Complemental strand, 97083 - 96990
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgaccttt-gagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatg 103  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||    
T  97083 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgaccttttgagttgaacctcagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaacgattagaggatg 96990  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #3
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 139951 - 139736
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | ||||||||||||||||   ||||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  139951 ttaggaaaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaaggctttatgaattgttaagagattatgaaatgaaatatg 139852  T
Q  205 gattgattg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    || |||||| | ||||| ||||||||  | | |||||||||| ||||||| ||||| ||| | ||||||  |||||||||| |||||||||||| | |||    
T  139851 gagtgattgcctttactcgaattattgattattgatcaagaa-ttgttgagaatgatttgttgttaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgt 139755  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  139754 tatttaactaagttgcatg 139736  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #4
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 193 - 332
Target Start/End: Complemental strand, 71213 - 71083
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||  ||||| | ||||||| || || ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||| ||||||||  |||||      |||||||    
T  71213 atgtgattttatgattaaatgcattattttaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgttattaagc--ttgat------tgattat 71123  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaata 332  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  71122 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgagtatgaata 71083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #5
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 27 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 140170 - 140091
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||| ||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| ||||||    
T  140170 ttctgggtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgatt 140091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #6
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 193 - 327
Target Start/End: Original strand, 414004 - 414145
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgat 284  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||||||| ||| ||||||||||  |||||| | ||| |         ||||| ||||||    
T  414004 atgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaac-gaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgat 414102  T
Q  285 ctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| ||||    
T  414103 ctgattatgctgctgttgttatttaactaagttgcatgcgtct 414145  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #7
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 71765 - 71698
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggat 102  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||||| || | ||||||||||    
T  71765 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggtgtctactagatattagaggat 71698  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003; HSP #8
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 63 - 106
Target Start/End: Original strand, 413732 - 413775
Alignment:
Q  63 cttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  413732 cttttgagtacctttagatgtttactaaagattagaggatgatt 413775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0166 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0166
Description:

Target: scaffold0166; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 187 - 321
Target Start/End: Original strand, 9990 - 10131
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatt---aag-----ctgttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||   |||     || ||||    
T  9990 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattataaagttatactattga 10088  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcat 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10089 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcat 10131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 44335 - 44104
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||||||| || | || ||||||||  ||  | ||||||||    
T  44335 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaagctttt-taaactgctaagttgtttgtaatgtgatt 44237  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | |||||||||| || ||||||||||| ||||||| ||||| |||| ||||||||||||| |        |||||| |||||||||  |||    
T  44236 taatgattaaatgcattacttaaaatattattgaattatcaagatgttgtggaaa-tgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 44138  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  44137 gctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 44104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 44550 - 44455
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||||||| ||||| ||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | | |||||||||||||| |||||||    
T  44550 cagagagcatgttgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatatttattaaagattagatgatgatt 44455  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 2)
Name: scaffold0193
Description:

Target: scaffold0193; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 105 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 9661 - 9445
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttatt 204  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| | |||| ||||||||||| | | ||||| || ||||  |||||||  |||  |||     
T  9661 ttaggaaaggaactttaggtactaatgtgacctattaaagataatgactgtgaactgtgaagttttcatgaactgttaagagattatgaaatgaaatatg 9562  T
Q  205 gattgattgcatt-acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
     ||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||| |||||| |   || | |||| | ||||| |||| | |||    
T  9561 aattgattgcctttacttgaattattattgaatgatcaagaaattgttgagaatgatttgttattaaac--ctgttatgatttaattatactgcaaatgt 9464  T
Q  304 taattaactaagttgcatg 322  Q
    || ||||||||||||||||    
T  9463 tatttaactaagttgcatg 9445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0193; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9896 - 9825
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    |||||||||||||   ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9896 cagagagcatgtcattttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtg 9825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 64; Significance: 6e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 64; E-Value: 6e-28
Query Start/End: Original strand, 197 - 327
Target Start/End: Original strand, 73725 - 73861
Alignment:
Q  197 gatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc-------tgttgatgtgatctgat 289  Q
    |||||| ||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||||||||| | |        ||||| |||||||||||    
T  73725 gatttaatgattaattgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgatgaaa-tgaattgatatgatgaagtataatgttgttgtgatctgat 73823  T
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  73824 tatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtct 73861  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1052 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold1052
Description:

Target: scaffold1052; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 187 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 3074 - 2927
Alignment:
Q  187 attatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta---agct-----gttga 278  Q
    ||||| |||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||| | |||||||||||   || |     |||||    
T  3074 attataatgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaatt-aattgatattataaagttatattgttga 2976  T
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||    
T  2975 tgtgatctgattatgctgctattgttatttaactaagttgcataagtct 2927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 20419 - 20557
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||  ||| ||||||||||| ||||||| |||| ||||| ||||||| |||||||||  ||||||||| |||||||    
T  20419 atgtgatttaatgattaaatgcattacacgaaatattattgaataatcaagatgttgatgaaa-tgaattgttattaagct--tgatgtgatttgattat 20515  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  20516 gctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 20557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0268 (Bit Score: 63; Significance: 2e-27; HSPs: 1)
Name: scaffold0268
Description:

Target: scaffold0268; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 2e-27
Query Start/End: Original strand, 160 - 246
Target Start/End: Original strand, 928 - 1014
Alignment:
Q  160 tgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaag 246  Q
    |||||||||||  |||||||||||||  |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  928 tgtgaagctatattgaaatgctaagtgtttataatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaggaag 1014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 111 - 322
Target Start/End: Complemental strand, 36540 - 36331
Alignment:
Q  111 aaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga 210  Q
    |||||||||||||| ||| |||||||||||  ||||| | |||||||||||||||||| ||||||  || ||||| ||||||| ||||  ||| ||||||    
T  36540 aaggaactttaggtgctagtgagacctattagagataatgactgagaactgtgaagcttttatgatttgttaagtgattatgaagtgaaatatggattga 36441  T
Q  211 ttg-cattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    ||| ||||||   |||| || || | |||||||||| ||||| | ||||| ||| ||||||||  |||||||||| |||||||||||| | ||||| |||    
T  36440 ttgccattacccaaattgttgttaattgatcaagaa-ttgttaagaatgatttgttattaagc--ttgatgtgatttgattatgctgcaaatgttattta 36344  T
Q  310 actaagttgcatg 322  Q
    | |||||||||||    
T  36343 attaagttgcatg 36331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 105
Target Start/End: Complemental strand, 36781 - 36687
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgat 105  Q
    |||||||||||||   ||||||| ||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||    
T  36781 cagagagcatgtcattttctgagattttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgat 36687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 62; Significance: 9e-27; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 9e-27
Query Start/End: Original strand, 193 - 334
Target Start/End: Original strand, 207792 - 207942
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttg-ttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtga 283  Q
    |||||||||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||  |||| |||||||||||||||||||| |        |||||||| |||    
T  207792 atgtgatttaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagttgttgtttgaaaatgaattgatattatgaagttatactgttgatatga 207891  T
Q  284 tctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    | |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  207892 tatgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgaatatgaataag 207942  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 71
Target Start/End: Original strand, 207157 - 207197
Alignment:
Q  31 gagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  207157 gagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 207197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 61; Significance: 4e-26; HSPs: 2)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 4e-26
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 1151 - 920
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||| ||| ||||| |||||||||||||| |||||||| | |||||| ||| || |||  ||||||||  ||  | ||||||||    
T  1151 tgattagggttggacccttaagtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatctgtgaggctgtt-tgacctgctaagttgtttgtaatgtgatt 1053  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    ||  |||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||||||| |||||||||  |||    
T  1052 taacgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctgttgttgtgatctgcctat 954  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||    
T  953 gctgctattgttattgaactaagttgcatgagtc 920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367; HSP #2
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1393 - 1298
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||||||||||||    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||| |||||||    
T  1393 cagagagcatgtcgaattctataattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtctattaaagattagatgatgatt 1298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412 (Bit Score: 57; Significance: 9e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0412
Description:

Target: scaffold0412; HSP #1
Raw Score: 57; E-Value: 9e-24
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 6277 - 6508
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||||  ||| | ||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||| || |||| |||||| |  ||  | ||||||||    
T  6277 tgattagggttggacccttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgaaatatgtgaagctgtt-tgaactgctaacttgtttgtaatgtgatt 6375  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattat 292  Q
    || ||||| | ||||||||| ||| ||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||        |||| ||| ||| ||||||||   |||    
T  6376 taatgattaaatgcattactcgaaatattattgaatgatcaagatgttgttg-aaatgaattgatattatgaaattatgctattgttgtgatcttcctat 6474  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  6475 gctgctattgttatttaactatgttgcatgagtc 6508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0412; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Original strand, 6038 - 6130
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| |||||||||||||| |||||||    
T  6038 agagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttcagatgtttattaaagattagatgatgatt 6130  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 12229 - 12134
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| ||||||  ||||||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||| ||||||    
T  12229 cagagagtatgtcgttttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagagaatgatt 12134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 3)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 260
Target Start/End: Original strand, 4086 - 4245
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||  |||||| || ||||||| || |||| |  || | ||||||||    
T  4086 tgattaggaatggaactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatatgtgaatctgttatgaattgttaagctgtttgtaatgtgatt 4185  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa 260  Q
    || ||||| | |||||||||||| ||||| |||||| | |  ||||||||||||||||||    
T  4186 taatgattaaatgcattacttgatttattcttgaataaccttgaagttgttgaaaatgaa 4245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Original strand, 3877 - 3949
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||    
T  3877 ttttggacttttgagttgaactttagatgcttttgagtacctttagatgtctactaaagattagaggatgatt 3949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 326
Target Start/End: Original strand, 4273 - 4320
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  4273 tgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 4320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171 (Bit Score: 56; Significance: 4e-23; HSPs: 2)
Name: scaffold0171
Description:

Target: scaffold0171; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 4e-23
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 35140 - 35235
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||   ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||||||||||||||    
T  35140 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtataataaagattagaggatgatt 35235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0171; HSP #2
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 117 - 326
Target Start/End: Original strand, 35387 - 35605
Alignment:
Q  117 ctttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgca 215  Q
    ||||| ||| ||||| ||||||||| |||| |||||||||| |||||||||| ||||||| |  |||| |  || | |||||||||| ||||| | ||||    
T  35387 ctttatgtagtaatgtgacctatttgagatgttaactgagacctgtgaagctgttatgaattattaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaatgca 35486  T
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaat 307  Q
    |||||||| ||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |    
T  35487 ttacttgatttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatt 35586  T
Q  308 taactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||||    
T  35587 taactaagttgcatgagtc 35605  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327 (Bit Score: 55; Significance: 1e-22; HSPs: 2)
Name: scaffold0327
Description:

Target: scaffold0327; HSP #1
Raw Score: 55; E-Value: 1e-22
Query Start/End: Original strand, 102 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 534 - 311
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgattt 201  Q
    |||||||| | || |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| || ||||           |||||     
T  534 tgattaggaatgggactttaggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgttaagc----------tgatta 445  T
Q  202 attgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaa----ttgatattaagct-----gttgatgtgatctgattat 292  Q
      ||| | |||||||||||| || ||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    ||| ||| ||| |     |||| ||||||||||||||    
T  444 catgaataattgcattactttaaatattattgaatgatcaagatgttgttgaaa-tgaaattgttgttatgaagttatattgttgttgtgatctgattat 346  T
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||||||||    
T  345 gctgcttttgttatttaactaagttgcatgagtct 311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0327; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 766 - 673
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||| ||||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| || ||||||||||| |||||    
T  766 cagagagcatgttgaaatctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttaataaagattagatgatga 673  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 54; Significance: 6e-22; HSPs: 6)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Original strand, 19604 - 19826
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||  | |||||||||| ||||| |     
T  19604 ggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaa 19703  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| ||||||||| ||||    
T  19704 tgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgctgcttttgt 19803  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  19804 tatttaactaagttgcatgagtc 19826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 14 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 56570 - 56478
Alignment:
Q  14 agagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||| ||| || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  56570 agagcatgtcattttctgagtttttgacttttaagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactattgattagaggatgatt 56478  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 113 - 326
Target Start/End: Original strand, 15082 - 15304
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||| ||||||| |||||||||| |||||||||| ||||||| ||||||| | ||  | |||||||||| ||||| |     
T  15082 ggaacttagggtagtaatgtgacctacttaagatgttaactgagatctgtgaagctgttatgaattgctaagcagtttgtaatgtgatttaatgattaaa 15181  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag--------ctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||| || ||||| |         ||||| |||||||||| |||| |||| ||||    
T  15182 tgcattactgggtttattcttgaataaccttgatgttgttgaaaatgaagtgttattatgaagttataatgttgttgtgatctgaatatgatgcttttgt 15281  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  15282 tatttaactaagttgcatgagtc 15304  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #4
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 14966 - 15031
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  14966 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagag 15031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #5
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 34 - 99
Target Start/End: Original strand, 19488 - 19553
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    |||| ||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19488 ttttggacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtgtattaaagattagag 19553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #6
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 193034 - 193070
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  193034 tatgctgctgttgttaattaactaagttgcatgagtc 193070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043 (Bit Score: 53; Significance: 2e-21; HSPs: 4)
Name: scaffold0043
Description:

Target: scaffold0043; HSP #1
Raw Score: 53; E-Value: 2e-21
Query Start/End: Original strand, 114 - 334
Target Start/End: Original strand, 77044 - 77264
Alignment:
Q  114 gaactttaggtac-taatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-t 211  Q
    ||||||||||||| || || |||||||| |||||| | | |  ||||||||||||| ||||||| || ||| | ||||||| |||| |||| |||||| |    
T  77044 gaactttaggtacatagtgtgacctattaaagataatgattatgaactgtgaagct-ttatgaattgttaaatgattatgaagtgaattatggattgaat 77142  T
Q  212 tgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaa 310  Q
    |  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||    
T  77143 tatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaa 77240  T
Q  311 ctaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    ||||||||||||| | ||||||||    
T  77241 ctaagttgcatgattatgaataag 77264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 27 - 105
Target Start/End: Original strand, 76817 - 76895
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgat 105  Q
    |||||||||| | || | |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||  |||||||| |||||    
T  76817 ttctgagtttattacttctgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactattgattagagaatgat 76895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #3
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 18740 - 18655
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| |||| | |  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  18740 cagagagcatgtagaataccgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 18655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0043; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 18295 - 18259
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18295 tatgctgctattgttaattaactatgttgcatgagtc 18259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 2)
Name: scaffold1552
Description:

Target: scaffold1552; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 112 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 587 - 381
Alignment:
Q  112 aggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||| ||||||| || ||||| ||||||| |||| |||| ||         
T  587 aggaaccttaggtactaatgaaacctattaaagatattgactgagaactgtgaagct-ttatgaattgttaagtgattatgaagtgaattatgga----- 494  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaac 311  Q
            |||||||||| ||||||||| ||||| || |||| ||||| ||| | || | |   ||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||     
T  493 --------ttgaattattgttgaatgattaagaaattattgagaatgatttgttgtttaac--ctgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaat 404  T
Q  312 taagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||||| | ||||||||    
T  403 taagttgcatgattatgaataag 381  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1552; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 5e-19
Query Start/End: Original strand, 27 - 99
Target Start/End: Complemental strand, 813 - 741
Alignment:
Q  27 ttctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagag 99  Q
    ||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||    
T  813 ttctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgcctactattgattagag 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0637 (Bit Score: 52; Significance: 9e-21; HSPs: 1)
Name: scaffold0637
Description:

Target: scaffold0637; HSP #1
Raw Score: 52; E-Value: 9e-21
Query Start/End: Original strand, 119 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 8799 - 8583
Alignment:
Q  119 ttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatttattgattgattgcatt 217  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||| ||| || |||||  ||  | ||||||||||  |||| | ||||||    
T  8799 ttaggtagtaatgaaacctatttaagatgttaactgagacctgtgaagttgttaagaactgttaagttgtttgtaatgtgatttaacgattaaatgcatt 8700  T
Q  218 acttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaatta 309  Q
    |||||||||||| |||||| | |  || |||||||||||||||||| | ||| |         || || ||||||||||||||||||||  ||||| |||    
T  8699 acttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattgttgttatgaaattataatgctgttgtgatctgattatgctgctgctgttattta 8600  T
Q  310 actaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||||    
T  8599 actaagttgcatgagtc 8583  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 51; Significance: 3e-20; HSPs: 4)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 51; E-Value: 3e-20
Query Start/End: Original strand, 102 - 326
Target Start/End: Original strand, 30606 - 30836
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgatt 200  Q
    |||||||| | ||||||||||||| |  ||||||||||||||||| |||||||| | |||| ||| | || |||| | ||||||  ||  | ||||||||    
T  30606 tgattaggaatggaactttaggtagttgtgagacctatttaagatgttaactgaaatctgtaaagttgtt-tgaacttctaagttgtttgtaatgtgatt 30704  T
Q  201 tattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaag-------ctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    || ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| |||| || |||| |||||||||| | ||| |        ||||| ||||||| |||||||    
T  30705 taatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataaagatgtagttg-aaatgaattgttgttatgaagtataatgttgttgtgatccgattatg 30803  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  30804 ctgcttttgttatttaaccaagttgcatgagtc 30836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 2005 - 1889
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||||||| ||||| | |||||||||    
T  2005 ttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgctgcaattgtgatttaactaag 1908  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  1907 ttgcatgattatgaataag 1889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 81
Target Start/End: Complemental strand, 2352 - 2282
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  2352 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgtctttgagtacctttaggt 2282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 106
Target Start/End: Original strand, 30388 - 30459
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    ||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || | | || ||||||||||| |||||||    
T  30388 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatctttaataaagattagatgatgatt 30459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 4)
Name: scaffold0439
Description:

Target: scaffold0439; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 2089 - 2158
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  2089 ttttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatga 2158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 35 - 104
Target Start/End: Original strand, 9949 - 10018
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||||| |||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  9949 ttttgacttttgcgttgaaccttagatgcttttgagtacctttagttgtgtattaaagattagaggatga 10018  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 2477 - 2531
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2477 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtct 2531  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0439; HSP #4
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 10337 - 10391
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| ||||||||||||    
T  10337 tgttgttgtgatctgattatgctgctgctgttatttaactaaattgcatgagtct 10391  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107 (Bit Score: 50; Significance: 1e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0107
Description:

Target: scaffold0107; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 1e-19
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Original strand, 15080 - 15141
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  15080 tttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgtctactaaagattagaggatga 15141  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0107; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 102 - 199
Target Start/End: Original strand, 15280 - 15376
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgat 199  Q
    ||||||||  |||||| || |||||||||||||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| |||||||    
T  15280 tgattaggagaggaacctttggtactaatgagacatattaaa-atgttaactgagaactgtgaagctattgtgaaatgataagtgattataatgtgat 15376  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0229 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0229
Description:

Target: scaffold0229; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 11461 - 11586
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  11461 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 11554  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  11555 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 11586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 48; Significance: 2e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 14047 - 14172
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  14047 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 14140  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||| ||||||  | |||||||||||||||||    
T  14141 ctgcaattgttgttaaactaagttgcatgagt 14172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 212 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 7615 - 7493
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgat--------attaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||||| ||||||| |        |||| | ||||| ||||||||||||||||||||  |||    
T  7615 tgcattacttgaattattcttgaatgatctagatgttgttgaaa-tgaattgttgttatgaaattatgatgttgctgtgatctgattatgctgctgctgt 7517  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    || |||||||||||||||||||||    
T  7516 tatttaactaagttgcatgagtct 7493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371 (Bit Score: 47; Significance: 8e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0371
Description:

Target: scaffold0371; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 8e-18
Query Start/End: Original strand, 11 - 97
Target Start/End: Complemental strand, 15819 - 15733
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    |||||||||||| || ||  ||||||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| ||| ||| ||||||    
T  15819 cagagagcatgttgattttcgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagtacctttaggtgcctactaatgattag 15733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0371; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15409 - 15350
Alignment:
Q  275 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| | | ||||||||    
T  15409 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcataattatgaataag 15350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold1220
Description:

Target: scaffold1220; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 2245 - 2184
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  |||||||||||||||||||    
T  2245 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcattaaagattagaggatga 2184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1220; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 104 - 324
Target Start/End: Complemental strand, 2044 - 1817
Alignment:
Q  104 attagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaatta-tgatgtgattta 202  Q
    |||||| | ||||| ||||||| || |||||||||| |||||| |||| ||| |  ||||| ||| || |||| ||||||||  ||  | ||||||||||    
T  2044 attaggaatggaacattaggtagtagtgagacctatataagatgttaaatgaaatatgtgaggctgtt-tgaactgctaagttgtttgtaatgtgattta 1946  T
Q  203 ttgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgc 294  Q
     ||||| | ||||||||||||| |||||||||||||| | || ||| |||||| |||||||   ||| |         ||||| |||| |||||||||||    
T  1945 atgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgataacgatgttattgaaa-tgaattgtggttatgaacttataatgttgttgtggtctgattatgc 1847  T
Q  295 tgctattgttaattaactaagttgcatgag 324  Q
    |||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  1846 tgcctttgttatttaactaagttgcatgag 1817  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1124 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold1124
Description:

Target: scaffold1124; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 2376 - 2291
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  2376 cagagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 2291  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 6)
Name: scaffold0158
Description:

Target: scaffold0158; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 3339 - 3254
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| |||| |||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  3339 cagagagcatgttgaatcctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 3254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7005 - 6920
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  7005 cagagagcatgttgaattttgtttttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 6920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 3040 - 2960
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 238  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  3040 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 2960  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #4
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 159 - 238
Target Start/End: Complemental strand, 6706 - 6626
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatga 238  Q
    |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||||||| | ||| |||||||    
T  6706 ctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgaaatgttaatgaatga 6626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #5
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 2907 - 2854
Alignment:
Q  274 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  2907 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtct 2854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0158; HSP #6
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 274 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 6573 - 6520
Alignment:
Q  274 gttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    |||| ||||||||| || |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  6573 gttgttgtgatctgcttgtgctgctattgttatttaactatgttgcatgagtct 6520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0064 (Bit Score: 46; Significance: 3e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0064
Description:

Target: scaffold0064; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 3e-17
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 64282 - 64367
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||| |||| || ||| ||||||||||||    
T  64282 cagagagcatgttgaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagtgccttaagatgtttattaaagatta 64367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1048 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold1048
Description:

Target: scaffold1048; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 34 - 106
Target Start/End: Complemental strand, 1890 - 1818
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||||||||| ||||    
T  1890 ttttggacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtacctttagatgtttattaaagattagaggaggatt 1818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0451 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0451
Description:

Target: scaffold0451; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 63
Target Start/End: Original strand, 11430 - 11482
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgc 63  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  11430 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacttttgagttgaaccttagatgc 11482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 45; Significance: 1e-16; HSPs: 1)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 7789 - 7705
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||| ||||| ||||||||  ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  7789 agagaacatgttgaattctgtatttttgacctttgagttgaaccttagatgcttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 7705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 11 - 106
Target Start/End: Original strand, 6900 - 6995
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatgatt 106  Q
    |||||||| ||||||||| ||   ||||||| || ||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |  || ||||||||||||||||    
T  6900 cagagagcttgtcgaattttgtaattttgactttcgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgtttgctatagattagaggatgatt 6995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 7311 - 7364
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  7311 tgttgttgtgatctgattatgttgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 7364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015 (Bit Score: 44; Significance: 5e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0015
Description:

Target: scaffold0015; HSP #1
Raw Score: 44; E-Value: 5e-16
Query Start/End: Original strand, 113 - 263
Target Start/End: Original strand, 192189 - 192340
Alignment:
Q  113 ggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatttattgattgat 211  Q
    |||||||  |||| ||||| |||||||||||||| |||||||||| |||||||| | ||||||| |  |||| |  || | |||||||||| ||||| |     
T  192189 ggaacttagggtagtaatgtgacctatttaagatgttaactgagatctgtgaagttgttatgaatttttaagctgtttgtaatgtgatttaatgattaaa 192288  T
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    |||||||||||| ||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  192289 tgcattacttgatttattcttgaattaccttgatgttgttgaaaatgaattg 192340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0015; HSP #2
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 34 - 104
Target Start/End: Original strand, 191969 - 192039
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||| ||| |||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||| ||| ||||||||||||||| ||||    
T  191969 ttttggacttttgagttgaaccttagatgttttcgagtacctttagatgtgtattaaagattagagaatga 192039  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311 (Bit Score: 43; Significance: 0.000000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0311
Description:

Target: scaffold0311; HSP #1
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 102 - 223
Target Start/End: Original strand, 6939 - 7061
Alignment:
Q  102 tgattagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag-taattatgatgtgatt 200  Q
    |||||||||| ||  | ||||||| ||||| ||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| |||||||||| |||| | ||||| ||| ||||    
T  6939 tgattagggatgggcccttaggtagtaatgtgacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaagctgattataatgagatt 7038  T
Q  201 tattgattgattgcattacttga 223  Q
    || ||||| ||||||||||||||    
T  7039 taatgattaattgcattacttga 7061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0311; HSP #2
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000003
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 6697 - 6757
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  6697 cagagagcatgtcgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 6757  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0483 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0483
Description:

Target: scaffold0483; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 43 - 104
Target Start/End: Complemental strand, 775 - 714
Alignment:
Q  43 tttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||  | |||||||||||||||||    
T  775 tttgagttgaaccttagatgcttttgagtacctttagatgttcactaaagattagaggatga 714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 15901 - 15816
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |||||  ||||||||||||    
T  15901 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaaggtggttattaaagatta 15816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 156 - 334
Target Start/End: Original strand, 16579 - 16756
Alignment:
Q  156 gaactgtgaagctattatgaaatgctaagtaattatgatgtgatttattgattga-ttgca-ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttga 253  Q
    |||||||||||| |||||||| || ||| |||||| || |||| |||| |||||| ||  | ||||||||||| || |||||||||||||||  | ||||    
T  16579 gaactgtgaagc-attatgaattgttaaataattaagaagtgaattatggattgaattatacttacttgaattgttgttgaatgatcaagaaactattga 16677  T
Q  254 aaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
     ||||| ||| |||| |   |||||| |||| |||||||||||| ||||||| |||||||||| |||||| | ||||||||    
T  16678 gaatgatttgttatttaa--gttgatatgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagtcgcatgattatgaataag 16756  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 81
Target Start/End: Original strand, 16313 - 16363
Alignment:
Q  31 gagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggt 81  Q
    ||||||||||| |||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  16313 gagtttttgacttttgagttaaaccttagatgcctttgagtacctttaggt 16363  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 42; Significance: 0.000000000000008; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000008
Query Start/End: Original strand, 212 - 326
Target Start/End: Original strand, 38451 - 38573
Alignment:
Q  212 tgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagc--------tgttgatgtgatctgattatgctgctattgt 303  Q
    |||||||||| |  |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||||         ||||| |||||||||  ||||||||||||||    
T  38451 tgcattacttaagatattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattaagaagtcatgttgttgttgtgatctgtctatgctgctattgt 38550  T
Q  304 taattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    || ||||||||||||||||||||    
T  38551 tatttaactaagttgcatgagtc 38573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 13 - 104
Target Start/End: Original strand, 23288 - 23379
Alignment:
Q  13 gagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||| |||||  |||| |||||||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  23288 gagagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatagatattttttagtacctaaagatgtttattaaagattagatgatga 23379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 38119 - 38204
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||| ||||||| ||||||||   ||||||| |||||| |||||| || ||| ||||||||||||  || ||| ||||||||||||    
T  38119 cagaaagcatgttgaattctgtacttttgacttttgagttgaaccatatatgtttttgagtacctaaagatgtttattaaagatta 38204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 275 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 9406 - 9347
Alignment:
Q  275 ttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||||| |||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||| | ||||||||    
T  9406 ttgatgtgatttgattatgctgcaattgttatttaactaagttgcatgattatgaataag 9347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 11 - 82
Target Start/End: Complemental strand, 9810 - 9739
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtg 82  Q
    ||||||||||||||| ||| ||||||||||| | | || |||| ||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9810 cagagagcatgtcgatttccgagtttttgacttctaagttgaatcttagatgcctttgagtacctttaggtg 9739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 4)
Name: scaffold0111
Description:

Target: scaffold0111; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 8628 - 8512
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  8628 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 8531  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  8530 ttgcatgattatgaataag 8512  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #2
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 216 - 334
Target Start/End: Complemental strand, 15772 - 15656
Alignment:
Q  216 ttacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaag 315  Q
    ||||| ||||| || |||||||||||||||  | |||| ||||| ||| |||| | ||  ||||||||| |||||||| ||| ||||||| |||||||||    
T  15772 ttactagaattgttgttgaatgatcaagaaactattgagaatgatttgttatttaact--tgatgtgatttgattatgttgcaattgttatttaactaag 15675  T
Q  316 ttgcatgagtctgaataag 334  Q
    |||||||| | ||||||||    
T  15674 ttgcatgattatgaataag 15656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 159 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 32636 - 32554
Alignment:
Q  159 ctgtgaagctattatgaaatgctaag--taattatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 239  Q
    |||||||||| |||||||||| |||   | ||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  32636 ctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattacttgagttatgaatgaatgat 32554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0111; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 293 - 325
Target Start/End: Complemental strand, 32491 - 32459
Alignment:
Q  293 gctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32491 gctgctattgttaattaactatgttgcatgagt 32459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0093 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0093
Description:

Target: scaffold0093; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000001
Query Start/End: Original strand, 226 - 326
Target Start/End: Original strand, 4790 - 4898
Alignment:
Q  226 tattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatatta--------agctgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagtt 317  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||   |||||||||||        |||||||| |||||||||  |||||||||||| ||| |||||||||||    
T  4790 tattattgaatgattaagatgttgttgaaatgaaattgatattatgaagtcaagctgttgttgtgatctgcctatgctgctattattatttaactaagtt 4889  T
Q  318 gcatgagtc 326  Q
    |||||||||    
T  4890 gcatgagtc 4898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0415 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0415
Description:

Target: scaffold0415; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000005
Query Start/End: Original strand, 194 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 543 - 439
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||||||||| ||||||||  ||||| |||  ||||||||    
T  543 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaatgaattgttattaagc--ttgatatgaattgattatg 450  T
Q  294 ctgctattgtt 304  Q
    |||| ||||||    
T  449 ctgcaattgtt 439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1895 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold1895
Description:

Target: scaffold1895; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 867 - 952
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  867 cagagagcatgtagaattatgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcctattaaagatta 952  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 3)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 10440 - 10525
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| | |  || || |||||||||||||    
T  10440 cagagagcatgtagaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttgaagatgcctattaaagatta 10525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 15298 - 15383
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | |  || ||||||||||||||||    
T  15298 cagagagcatgtagaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcttaaagatgtctattaaagatta 15383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 290 - 326
Target Start/End: Original strand, 15737 - 15773
Alignment:
Q  290 tatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  15737 tatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 15773  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 3980 - 3872
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--taattatgatgtgatttattgattgattgcattac 219  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  3980 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 3881  T
Q  220 ttgaattat 228  Q
    |||| ||||    
T  3880 ttgagttat 3872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 122 - 228
Target Start/End: Complemental strand, 8411 - 8303
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgctaag--taattatgatgtgatttattgattgattgcattac 219  Q
    |||| ||||| ||||||| ||||||||||| ||  | |||||||||| |||||||||| |||   | ||||| |||||||||| ||||| ||||||||||    
T  8411 ggtagtaatgtgacctatataagatattaattgcaatctgtgaagctgttatgaaatgttaatgttgattataatgtgatttaatgattaattgcattac 8312  T
Q  220 ttgaattat 228  Q
    |||| ||||    
T  8311 ttgagttat 8303  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0101 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0101
Description:

Target: scaffold0101; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 8576 - 8661
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||||||  ||||| |  ||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  8576 cagagagcatgtaaaattcggtatttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagtccctgaagatgcctattaaagatta 8661  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0096
Description:

Target: scaffold0096; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Original strand, 15968 - 16053
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||||    
T  15968 cagagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagatta 16053  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0096; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 16389 - 16442
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||| ||  |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  16389 tgttgttgtgatatgcctatgctgctattgttatttaactaagttgcatgagtc 16442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0484 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0484
Description:

Target: scaffold0484; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 1406 - 1346
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||| |||||||    
T  1406 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgcctttgagt 1346  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210 (Bit Score: 37; Significance: 0.000000000008; HSPs: 6)
Name: scaffold0210
Description:

Target: scaffold0210; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 21425 - 21485
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  21425 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 21485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #2
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000008
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Original strand, 29317 - 29377
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  29317 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagt 29377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #3
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Original strand, 21670 - 21740
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 175  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  21670 ttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 21740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #4
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 105 - 175
Target Start/End: Original strand, 29562 - 29632
Alignment:
Q  105 ttagggaaggaactttaggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatga 175  Q
    ||||||| ||| | ||||||| ||||||||||||| |||||| |||||||  | |||||||||| ||||||    
T  29562 ttagggatggacccttaggtagtaatgagacctatataagatgttaactgcaatctgtgaagctgttatga 29632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #5
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 21844 - 21897
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  21844 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 21897  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0210; HSP #6
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Original strand, 29736 - 29789
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| ||| |||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  29736 tgttgttgtaatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 29789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0157 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0157
Description:

Target: scaffold0157; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 194 - 325
Target Start/End: Original strand, 32620 - 32745
Alignment:
Q  194 tgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgatattaagctgttgatgtgatctgattatg 293  Q
    ||||| ||| ||||| | ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||    |||| ||||| ||||||||  ||||  |||  ||||||||    
T  32620 tgtgaattaatgattaaatgcattacttgaaatattattgaatgatcaagatgttg----aaataaattgttattaagc--ttgacatgaattgattatg 32713  T
Q  294 ctgctattgttaattaactaagttgcatgagt 325  Q
    |||  ||||||  | |||||||||||||||||    
T  32714 ctgtaattgttgttaaactaagttgcatgagt 32745  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0185 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0185
Description:

Target: scaffold0185; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 210 - 327
Target Start/End: Complemental strand, 33694 - 33569
Alignment:
Q  210 attgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattgata---------ttaagctgttgatgtgatctgattatgctgctat 300  Q
    ||||||||||||||  ||||||||||| ||||||| ||||||| |||||||||||||         ||| ||||||| ||||||||| || ||||| |||    
T  33694 attgcattacttgagatattattgaataatcaagatgttgttg-aaatgaattgataattatgaagttatgctgttgttgtgatctgcttgtgctgttat 33596  T
Q  301 tgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||| | || ||||||||    
T  33595 tgttatttaactatgatggatgagtct 33569  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 327
Target Start/End: Original strand, 14127 - 14181
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtct 327  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||| ||||||| | |||||||||||    
T  14127 tgttgttgtgatctgcttatgctgctattgttatttaactatgatgcatgagtct 14181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 13696 - 13789
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||| | |||||||| |||  || | | |||||||||||||| |||||    
T  13696 cagagagcatgtagaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagaggtttttgagtgcctaaagatatttattaaagattagatgatga 13789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0671
Description:

Target: scaffold0671; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 6171 - 6118
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||    
T  6171 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgcatgagtc 6118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0671; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 6603 - 6518
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    |||||||||||| ||||| ||  |||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  |  ||| ||||||||||||    
T  6603 cagagagcatgttgaattttgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagttcctaaatttgtttattaaagatta 6518  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0475 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0475
Description:

Target: scaffold0475; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 9564 - 9519
Alignment:
Q  26 attctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9564 attctgtgtttttgacttttgagatgacccttagatgcttttgagt 9519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0220 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0220
Description:

Target: scaffold0220; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 11 - 104
Target Start/End: Original strand, 4552 - 4645
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggatga 104  Q
    ||||| |||||| ||||||||  |||||||| |||||| ||||||||||||  |||||| | |||  || ||| |||||||||||||| |||||    
T  4552 cagagcgcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatatttttgaatgcctaaagatgtttattaaagattagatgatga 4645  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0555 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0555
Description:

Target: scaffold0555; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 10210 - 10246
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  10210 ttttgacctttgagatgaaccttagatgtttttgagt 10246  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 12 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 27322 - 27238
Alignment:
Q  12 agagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||||||| ||||||||  ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||  ||||||||||||    
T  27322 agagagcatgttgaattctgtattttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgcatattaaagatta 27238  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 3973 - 3913
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  3973 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagt 3913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 11 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 8037 - 7977
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||| ||||||||  |||||||| |||||| |||||||||||||  |||||||    
T  8037 cagagagcatgttgaattctgtatttttgacttttgagttgaaccttagatgactttgagt 7977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0410
Description:

Target: scaffold0410; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 279 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 2238 - 2191
Alignment:
Q  279 tgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    |||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||    
T  2238 tgtgatttgattatgctgctgctgttatttaactaagttgcatgagtc 2191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0410; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 193 - 263
Target Start/End: Complemental strand, 11542 - 11472
Alignment:
Q  193 atgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaaaatgaattg 263  Q
    ||||||||||  |||| | |||||||||||||||||| |||||| | |  || ||||||||||||||||||    
T  11542 atgtgatttaacgattaaatgcattacttgaattattcttgaataaacttgatgttgttgaaaatgaattg 11472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 35 - 102
Target Start/End: Complemental strand, 1816 - 1749
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattagaggat 102  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| |||||||||||| |||||    
T  1816 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctgaagatgtttattaaagattaaaggat 1749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 189 - 239
Target Start/End: Complemental strand, 1509 - 1459
Alignment:
Q  189 tatgatgtgatttattgattgattgcattacttgaattattattgaatgat 239  Q
    ||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||    
T  1509 tatgatgtgatataatgattaattgcattacttgaattatgaatgaatgat 1459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 4)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 11 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 15171 - 15088
Alignment:
Q  11 cagagagcatgtcgaattctgagtttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagat 94  Q
    |||||||||||| |||||||   ||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || ||| ||||||||||    
T  15171 cagagagcatgttgaattctattttttttacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctaaagatgtttattaaagat 15088  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 14740 - 14687
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  14740 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtc 14687  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 23755 - 23702
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  23755 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtc 23702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #4
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 273 - 326
Target Start/End: Complemental strand, 39179 - 39126
Alignment:
Q  273 tgttgatgtgatctgattatgctgctattgttaattaactaagttgcatgagtc 326  Q
    ||||| |||||||||  |||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||    
T  39179 tgttgttgtgatctgcctatgctgctattgttatttaaccaagttgtatgagtc 39126  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0021 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0021
Description:

Target: scaffold0021; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000007
Query Start/End: Original strand, 122 - 254
Target Start/End: Complemental strand, 175005 - 174871
Alignment:
Q  122 ggtactaatgagacctatttaagatattaactgagaactgtgaagctattatgaaatgcta--agtaattatgatgtgatttattgattgattgcattac 219  Q
    |||| ||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||||||||||||||| ||| ||    | | ||||| ||||| || || ||  |||||||||    
T  175005 ggtagtaatgagacctatataagaagttaactgaaatctgtgaagctattatgagatgttagtgttgaatatgacgtgatataatgtttagttgcattac 174906  T
Q  220 ttgaattattattgaatgatcaagaagttgttgaa 254  Q
    ||||||||| | ||||||||  ||| |||||||||    
T  174905 ttgaattatgaatgaatgattgagatgttgttgaa 174871  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 35 - 97
Target Start/End: Original strand, 39573 - 39635
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagattag 97  Q
    ||||||| |||||| ||| ||||||||||||||||||||||  |  |||||||||| ||||||    
T  39573 ttttgacttttgagttgatccttagatgcttttgagtacctgaacatgtctattaatgattag 39635  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0598 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0598
Description:

Target: scaffold0598; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 704 - 741
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  704 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 741  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0427 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0427
Description:

Target: scaffold0427; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13964 - 13927
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13964 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13927  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0423 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0423
Description:

Target: scaffold0423; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Original strand, 10913 - 10950
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  10913 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 10950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 34600 - 34563
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  34600 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 34563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Complemental strand, 20459 - 20398
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||| |||||||| |||  || || |||||||||||||    
T  20459 ttttgacttttgagttgaaccttagatgtttttgagtgcctggagatgcctattaaagatta 20398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0113 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0113
Description:

Target: scaffold0113; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 34 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 32533 - 32496
Alignment:
Q  34 tttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  32533 tttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 32496  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 35 - 96
Target Start/End: Original strand, 48103 - 48164
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacctttaggtgtctattaaagatta 96  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||  ||  || ||| ||||||||||||    
T  48103 ttttgacttttgagatgaaccttagatgtttttgagtgtctgaagatgtatattaaagatta 48164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1842 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1842
Description:

Target: scaffold1842; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 702 - 738
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  702 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 2727 - 2763
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2727 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 2763  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0628 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0628
Description:

Target: scaffold0628; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 75
Target Start/End: Original strand, 2445 - 2485
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagtacct 75  Q
    ||||||| |||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  2445 ttttgacttttgggatgatccttagatgcttttgagtacct 2485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 5316 - 5280
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5316 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 5280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0389 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0389
Description:

Target: scaffold0389; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 13250 - 13286
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  13250 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 13286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 404 - 368
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  404 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 368  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 5180 - 5144
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  5180 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 5144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 18600 - 18636
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||    
T  18600 ttttgacttttgagatgatccttagatgcttttgagt 18636  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0221 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0221
Description:

Target: scaffold0221; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 12451 - 12487
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||    
T  12451 ttttgacttttgagatgaaccttagatgcctttgagt 12487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0151 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0151
Description:

Target: scaffold0151; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 10623 - 10587
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||    
T  10623 ttttgacctttgagttgatccttagatgcttttgagt 10587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Complemental strand, 13419 - 13383
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||    
T  13419 ttttgacctttgagttgaaccttagatgtttttgagt 13383  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 35 - 71
Target Start/End: Original strand, 167632 - 167668
Alignment:
Q  35 ttttgacctttgagatgaaccttagatgcttttgagt 71  Q
    ||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||    
T  167632 ttttgacttttgagttgaaccttagatgcttttgagt 167668  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University