View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15621_low_1 (Length: 373)

Name: NF15621_low_1
Description: NF15621
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15621_low_1
NF15621_low_1
[»] chr6 (30 HSPs)
chr6 (112-364)||(25175563-25175815)
chr6 (112-364)||(27653983-27654235)
chr6 (112-364)||(16825752-16826006)
chr6 (26-353)||(23153458-23153786)
chr6 (27-360)||(14626045-14626377)
chr6 (25-360)||(1650020-1650352)
chr6 (100-353)||(1657748-1657999)
chr6 (100-364)||(35009439-35009702)
chr6 (100-353)||(15862484-15862734)
chr6 (26-95)||(23148266-23148335)
chr6 (1-58)||(19983167-19983224)
chr6 (1-58)||(35015032-35015089)
chr6 (100-296)||(29665941-29666137)
chr6 (100-185)||(27751603-27751688)
chr6 (116-200)||(29605612-29605696)
chr6 (12-58)||(18583640-18583686)
chr6 (26-58)||(18002395-18002427)
chr6 (26-58)||(23995247-23995279)
chr6 (26-58)||(26090059-26090091)
chr6 (27-58)||(4991396-4991427)
chr6 (116-198)||(18629608-18629691)
chr6 (26-56)||(15742120-15742150)
chr6 (118-200)||(17083200-17083282)
chr6 (26-58)||(1657661-1657693)
chr6 (26-58)||(15862789-15862821)
chr6 (117-157)||(18399144-18399184)
chr6 (26-58)||(18823283-18823315)
chr6 (26-58)||(18839138-18839170)
chr6 (26-58)||(27751742-27751774)
chr6 (26-58)||(32276659-32276691)
[»] chr5 (36 HSPs)
chr5 (112-364)||(25426628-25426880)
chr5 (112-364)||(12374-12626)
chr5 (112-364)||(19499899-19500151)
chr5 (112-364)||(22366481-22366733)
chr5 (115-364)||(18777995-18778244)
chr5 (112-364)||(21073595-21073847)
chr5 (26-364)||(23506965-23507302)
chr5 (115-364)||(43443398-43443647)
chr5 (26-364)||(27182471-27182810)
chr5 (112-364)||(4199985-4200237)
chr5 (116-364)||(27009841-27010089)
chr5 (26-364)||(22053753-22054096)
chr5 (26-364)||(18530988-18531330)
chr5 (112-312)||(29188284-29188483)
chr5 (100-353)||(34939289-34939540)
chr5 (100-247)||(20623085-20623232)
chr5 (100-247)||(21233528-21233675)
chr5 (102-246)||(25900408-25900552)
chr5 (100-247)||(16536313-16536460)
chr5 (100-247)||(37052860-37053007)
chr5 (116-200)||(29918127-29918212)
chr5 (107-196)||(32950862-32950951)
chr5 (26-58)||(16105967-16105999)
chr5 (26-58)||(20623286-20623318)
chr5 (26-58)||(21233442-21233474)
chr5 (26-58)||(25900320-25900352)
chr5 (320-360)||(29190482-29190522)
chr5 (26-58)||(37053061-37053093)
chr5 (116-198)||(21310709-21310792)
chr5 (117-198)||(5450844-5450926)
chr5 (12-57)||(11584374-11584419)
chr5 (323-364)||(17471803-17471844)
chr5 (26-58)||(108728-108760)
chr5 (26-58)||(9730278-9730310)
chr5 (26-58)||(16536514-16536546)
chr5 (117-157)||(16595713-16595753)
[»] chr2 (34 HSPs)
chr2 (112-364)||(19886661-19886913)
chr2 (26-359)||(462743-463075)
chr2 (1-364)||(20627213-20627576)
chr2 (1-364)||(19794604-19794967)
chr2 (26-364)||(8891242-8891581)
chr2 (1-364)||(43642856-43643220)
chr2 (26-364)||(36982364-36982704)
chr2 (100-364)||(17396653-17396916)
chr2 (26-364)||(24341309-24341652)
chr2 (100-364)||(25265390-25265653)
chr2 (150-364)||(7507894-7508107)
chr2 (100-247)||(19689401-19689548)
chr2 (100-247)||(23820187-23820334)
chr2 (100-247)||(14906440-14906587)
chr2 (26-122)||(22863169-22863267)
chr2 (100-247)||(20015127-20015274)
chr2 (3-58)||(22284278-22284333)
chr2 (1-58)||(22275045-22275102)
chr2 (1-57)||(15633538-15633594)
chr2 (117-198)||(68156-68238)
chr2 (25-58)||(19689314-19689347)
chr2 (26-58)||(9652796-9652828)
chr2 (26-58)||(14906354-14906386)
chr2 (26-58)||(23820388-23820420)
chr2 (27-58)||(25213372-25213403)
chr2 (117-198)||(22775206-22775288)
chr2 (117-198)||(22780584-22780666)
chr2 (26-58)||(7507757-7507789)
chr2 (26-58)||(17396567-17396599)
chr2 (26-58)||(20015328-20015360)
chr2 (26-58)||(28031134-28031166)
chr2 (26-92)||(31146073-31146138)
chr2 (26-58)||(33128372-33128404)
chr2 (117-196)||(43646059-43646139)
[»] chr1 (22 HSPs)
chr1 (1-364)||(41394222-41394584)
chr1 (26-364)||(20931345-20931682)
chr1 (26-364)||(20913037-20913367)
chr1 (112-364)||(5072388-5072640)
chr1 (112-364)||(18601118-18601370)
chr1 (26-364)||(20893551-20893889)
chr1 (26-364)||(37844374-37844714)
chr1 (26-364)||(20445679-20446019)
chr1 (26-364)||(20531444-20531783)
chr1 (27-364)||(22227809-22228146)
chr1 (27-364)||(22232506-22232843)
chr1 (112-360)||(2116258-2116506)
chr1 (25-298)||(45051489-45051759)
chr1 (100-247)||(51452608-51452755)
chr1 (1-58)||(21860334-21860391)
chr1 (1-58)||(44034846-44034903)
chr1 (15-92)||(27675086-27675161)
chr1 (5-58)||(41218728-41218781)
chr1 (27-58)||(15861327-15861358)
chr1 (117-157)||(16646118-16646158)
chr1 (320-360)||(45051446-45051486)
chr1 (26-58)||(51452809-51452841)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (26-362)||(3508-3843)
scaffold0266 (26-364)||(1124-1462)
[»] chr4 (29 HSPs)
chr4 (112-364)||(47357654-47357906)
chr4 (1-364)||(54118143-54118507)
chr4 (26-364)||(13246430-13246769)
chr4 (116-364)||(10644219-10644467)
chr4 (26-264)||(121989-122226)
chr4 (100-356)||(13048221-13048477)
chr4 (26-364)||(15675009-15675352)
chr4 (26-296)||(10104170-10104445)
chr4 (100-364)||(26680201-26680463)
chr4 (127-364)||(31115629-31115865)
chr4 (100-247)||(10488678-10488825)
chr4 (100-247)||(16327926-16328073)
chr4 (26-163)||(33240900-33241043)
chr4 (267-364)||(111395-111492)
chr4 (26-132)||(31132545-31132657)
chr4 (1-58)||(25119082-25119139)
chr4 (116-296)||(40885570-40885749)
chr4 (5-58)||(5682407-5682460)
chr4 (117-198)||(15044992-15045074)
chr4 (320-364)||(10104450-10104494)
chr4 (26-58)||(14952085-14952117)
chr4 (26-58)||(15135907-15135939)
chr4 (26-58)||(15272211-15272243)
chr4 (26-58)||(16327840-16327872)
chr4 (26-58)||(16609013-16609045)
chr4 (26-58)||(26680517-26680549)
chr4 (117-198)||(15109350-15109432)
chr4 (26-58)||(8045272-8045304)
chr4 (26-58)||(16523146-16523178)
[»] chr3 (55 HSPs)
chr3 (26-364)||(14842487-14842824)
chr3 (112-364)||(55316219-55316471)
chr3 (112-364)||(41270075-41270327)
chr3 (26-364)||(2049810-2050147)
chr3 (26-364)||(12030073-12030410)
chr3 (26-353)||(13838905-13839232)
chr3 (1-364)||(16744016-16744377)
chr3 (137-364)||(16821139-16821366)
chr3 (100-364)||(13975722-13975985)
chr3 (63-364)||(15858986-15859287)
chr3 (100-364)||(45860805-45861068)
chr3 (90-365)||(51158008-51158282)
chr3 (100-364)||(13954890-13955153)
chr3 (107-364)||(15936634-15936890)
chr3 (107-361)||(15938476-15938729)
chr3 (25-360)||(15614838-15615170)
chr3 (3-163)||(19231981-19232144)
chr3 (100-364)||(17912483-17912744)
chr3 (26-146)||(19260749-19260869)
chr3 (100-247)||(2449238-2449385)
chr3 (3-58)||(17955861-17955916)
chr3 (1-58)||(3992873-3992930)
chr3 (1-58)||(55513193-55513250)
chr3 (1-61)||(15857138-15857198)
chr3 (1-58)||(2844514-2844571)
chr3 (1-58)||(45581954-45582012)
chr3 (5-58)||(54038003-54038056)
chr3 (5-58)||(7854305-7854358)
chr3 (251-364)||(47984650-47984763)
chr3 (251-364)||(47993937-47994050)
chr3 (251-364)||(48003224-48003337)
chr3 (251-364)||(48012510-48012623)
chr3 (107-196)||(11986173-11986262)
chr3 (116-157)||(14080715-14080756)
chr3 (323-364)||(15468555-15468596)
chr3 (26-58)||(2449152-2449184)
chr3 (116-200)||(4145814-4145898)
chr3 (26-58)||(16261777-16261809)
chr3 (26-58)||(16933869-16933901)
chr3 (26-58)||(17912398-17912430)
chr3 (26-58)||(23492696-23492728)
chr3 (26-58)||(38168237-38168269)
chr3 (26-58)||(53771365-53771397)
chr3 (117-198)||(30207380-30207462)
chr3 (116-200)||(6228625-6228710)
chr3 (323-364)||(22275209-22275250)
chr3 (26-58)||(11986080-11986112)
chr3 (26-58)||(13954804-13954836)
chr3 (117-157)||(14059214-14059254)
chr3 (26-58)||(14285289-14285321)
chr3 (26-58)||(19947026-19947058)
chr3 (26-58)||(30153265-30153297)
chr3 (26-58)||(33342204-33342236)
chr3 (26-58)||(45861122-45861154)
chr3 (26-58)||(51961031-51961063)
[»] scaffold0023 (3 HSPs)
scaffold0023 (26-364)||(48598-48935)
scaffold0023 (137-364)||(36093-36320)
scaffold0023 (26-58)||(61122-61154)
[»] chr7 (43 HSPs)
chr7 (112-364)||(10989410-10989661)
chr7 (1-364)||(3059966-3060328)
chr7 (111-364)||(2437457-2437710)
chr7 (26-362)||(16211768-16212103)
chr7 (26-364)||(13036938-13037277)
chr7 (112-364)||(13911024-13911277)
chr7 (26-359)||(11580661-11580997)
chr7 (26-364)||(36052667-36053003)
chr7 (116-364)||(13572676-13572924)
chr7 (107-364)||(18253842-18254098)
chr7 (100-358)||(25292338-25292595)
chr7 (100-364)||(47481031-47481294)
chr7 (137-364)||(16478987-16479213)
chr7 (100-364)||(7293017-7293279)
chr7 (101-364)||(13321014-13321278)
chr7 (100-247)||(11516343-11516490)
chr7 (100-247)||(15441564-15441711)
chr7 (100-247)||(30262129-30262276)
chr7 (1-58)||(32493921-32493978)
chr7 (3-58)||(126738-126793)
chr7 (28-221)||(295893-296087)
chr7 (1-58)||(1936892-1936949)
chr7 (26-132)||(36024372-36024485)
chr7 (117-198)||(13377693-13377775)
chr7 (13-58)||(111156-111201)
chr7 (26-58)||(2029244-2029276)
chr7 (26-58)||(7293333-7293365)
chr7 (26-58)||(11516544-11516576)
chr7 (26-58)||(14113903-14113935)
chr7 (26-58)||(15441478-15441510)
chr7 (26-95)||(15709428-15709501)
chr7 (26-58)||(30262043-30262075)
chr7 (26-58)||(42056188-42056220)
chr7 (116-198)||(16914928-16915011)
chr7 (15-57)||(7283945-7283987)
chr7 (26-58)||(371417-371449)
chr7 (26-58)||(3049905-3049937)
chr7 (26-58)||(13321334-13321366)
chr7 (100-132)||(14113989-14114021)
chr7 (100-132)||(14423639-14423671)
chr7 (30-58)||(15516765-15516793)
chr7 (26-58)||(25124450-25124482)
chr7 (26-58)||(47480944-47480976)
[»] chr8 (33 HSPs)
chr8 (26-365)||(16193643-16193980)
chr8 (112-364)||(30120722-30120974)
chr8 (26-364)||(43373392-43373731)
chr8 (174-364)||(222753-222943)
chr8 (174-364)||(736376-736566)
chr8 (174-364)||(860271-860461)
chr8 (112-364)||(16674392-16674644)
chr8 (26-353)||(24928716-24929043)
chr8 (116-364)||(21844576-21844824)
chr8 (116-364)||(21851969-21852217)
chr8 (1-364)||(16404875-16405235)
chr8 (112-360)||(6774258-6774505)
chr8 (112-360)||(24548986-24549233)
chr8 (100-364)||(22907214-22907476)
chr8 (100-353)||(17345581-17345832)
chr8 (100-247)||(5238203-5238350)
chr8 (100-247)||(24661248-24661395)
chr8 (100-247)||(43685662-43685809)
chr8 (174-236)||(691908-691970)
chr8 (1-58)||(274766-274823)
chr8 (1-58)||(641026-641083)
chr8 (1-58)||(826832-826889)
chr8 (1-58)||(24716737-24716794)
chr8 (26-58)||(5238404-5238436)
chr8 (26-58)||(22907128-22907160)
chr8 (26-58)||(24385652-24385684)
chr8 (26-58)||(24661162-24661194)
chr8 (26-58)||(43685863-43685895)
chr8 (116-198)||(26011658-26011741)
chr8 (5-58)||(39115598-39115651)
chr8 (26-58)||(2545265-2545297)
chr8 (26-58)||(3431176-3431208)
chr8 (26-58)||(22886654-22886686)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (26-364)||(5990-6326)
[»] scaffold0175 (1 HSPs)
scaffold0175 (26-364)||(882-1218)
[»] scaffold0498 (1 HSPs)
scaffold0498 (26-364)||(8878-9215)
[»] scaffold0302 (1 HSPs)
scaffold0302 (26-364)||(12115-12450)
[»] scaffold0001 (2 HSPs)
scaffold0001 (26-353)||(171916-172242)
scaffold0001 (26-353)||(177619-177945)
[»] scaffold0076 (1 HSPs)
scaffold0076 (137-364)||(42997-43224)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (26-360)||(41733-42066)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (25-364)||(36836-37176)
scaffold0077 (7-57)||(15348-15398)
[»] scaffold0012 (2 HSPs)
scaffold0012 (26-353)||(247366-247694)
scaffold0012 (26-58)||(34075-34107)
[»] scaffold0195 (2 HSPs)
scaffold0195 (29-364)||(19206-19543)
scaffold0195 (100-364)||(21290-21553)
[»] scaffold0162 (2 HSPs)
scaffold0162 (26-364)||(26340-26678)
scaffold0162 (100-247)||(8180-8327)
[»] scaffold0008 (2 HSPs)
scaffold0008 (26-364)||(128095-128431)
scaffold0008 (137-364)||(31700-31928)
[»] scaffold0218 (1 HSPs)
scaffold0218 (36-364)||(4996-5324)
[»] scaffold0011 (1 HSPs)
scaffold0011 (26-364)||(123087-123427)
[»] scaffold0772 (2 HSPs)
scaffold0772 (107-340)||(5552-5785)
scaffold0772 (26-58)||(5846-5878)
[»] scaffold0116 (1 HSPs)
scaffold0116 (116-364)||(35-283)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (26-358)||(272031-272362)
[»] scaffold0049 (2 HSPs)
scaffold0049 (107-364)||(48187-48443)
scaffold0049 (12-57)||(20493-20538)
[»] scaffold0026 (3 HSPs)
scaffold0026 (116-364)||(64527-64780)
scaffold0026 (107-364)||(107747-108003)
scaffold0026 (115-157)||(89863-89905)
[»] scaffold0018 (1 HSPs)
scaffold0018 (28-246)||(51110-51328)
[»] scaffold0139 (2 HSPs)
scaffold0139 (111-364)||(21115-21367)
scaffold0139 (137-364)||(14086-14312)
[»] scaffold0025 (3 HSPs)
scaffold0025 (74-364)||(148721-149012)
scaffold0025 (26-364)||(8849-9192)
scaffold0025 (26-126)||(146838-146938)
[»] scaffold0022 (1 HSPs)
scaffold0022 (150-364)||(5254-5466)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (150-364)||(3722-3936)
[»] scaffold0028 (3 HSPs)
scaffold0028 (26-246)||(89378-89600)
scaffold0028 (26-151)||(107708-107835)
scaffold0028 (27-58)||(130880-130911)
[»] scaffold0215 (2 HSPs)
scaffold0215 (137-360)||(9374-9596)
scaffold0215 (137-360)||(16272-16494)
[»] scaffold1711 (1 HSPs)
scaffold1711 (112-258)||(1304-1450)
[»] scaffold1542 (1 HSPs)
scaffold1542 (100-364)||(534-797)
[»] scaffold0075 (1 HSPs)
scaffold0075 (100-364)||(34460-34724)
[»] scaffold0078 (3 HSPs)
scaffold0078 (100-364)||(37066-37328)
scaffold0078 (1-58)||(41632-41689)
scaffold0078 (26-58)||(36980-37012)
[»] scaffold0125 (2 HSPs)
scaffold0125 (100-364)||(41648-41911)
scaffold0125 (26-66)||(41957-41997)
[»] scaffold0529 (1 HSPs)
scaffold0529 (111-360)||(2966-3215)
[»] scaffold0132 (3 HSPs)
scaffold0132 (100-364)||(13506-13769)
scaffold0132 (1-58)||(42677-42731)
scaffold0132 (26-58)||(13824-13856)
[»] scaffold1560 (1 HSPs)
scaffold1560 (258-364)||(9-115)
[»] scaffold0104 (1 HSPs)
scaffold0104 (258-364)||(48514-48620)
[»] scaffold0420 (1 HSPs)
scaffold0420 (112-268)||(13325-13480)
[»] scaffold0141 (4 HSPs)
scaffold0141 (100-247)||(26911-27058)
scaffold0141 (107-247)||(22656-22796)
scaffold0141 (26-58)||(22857-22889)
scaffold0141 (26-58)||(27112-27144)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (100-247)||(1582-1729)
scaffold0124 (26-58)||(1496-1528)
[»] scaffold0622 (1 HSPs)
scaffold0622 (267-364)||(9382-9479)
[»] scaffold0361 (2 HSPs)
scaffold0361 (100-193)||(3360-3453)
scaffold0361 (308-362)||(3210-3264)
[»] scaffold0034 (1 HSPs)
scaffold0034 (5-58)||(80187-80240)
[»] scaffold0016 (2 HSPs)
scaffold0016 (1-59)||(162053-162111)
scaffold0016 (1-59)||(166139-166197)
[»] scaffold0686 (2 HSPs)
scaffold0686 (1-58)||(5752-5809)
scaffold0686 (1-58)||(5958-6015)
[»] scaffold0184 (1 HSPs)
scaffold0184 (1-58)||(31155-31212)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (5-59)||(331-385)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (107-196)||(56106-56195)
[»] scaffold0123 (1 HSPs)
scaffold0123 (116-198)||(8174-8257)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (117-198)||(2317-2399)
[»] scaffold1164 (1 HSPs)
scaffold1164 (12-57)||(1701-1746)
[»] scaffold0876 (1 HSPs)
scaffold0876 (12-57)||(94-139)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (12-57)||(19836-19881)
scaffold0122 (12-57)||(24140-24185)
[»] scaffold0004 (1 HSPs)
scaffold0004 (25-58)||(193396-193429)
[»] scaffold0706 (1 HSPs)
scaffold0706 (26-58)||(6443-6475)
[»] scaffold0597 (1 HSPs)
scaffold0597 (26-58)||(878-910)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (26-58)||(9882-9914)
[»] scaffold0251 (1 HSPs)
scaffold0251 (26-58)||(13285-13317)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (26-58)||(57392-57424)
scaffold0058 (116-157)||(70307-70348)
[»] scaffold0032 (2 HSPs)
scaffold0032 (26-58)||(55904-55936)
scaffold0032 (26-58)||(108075-108107)
[»] scaffold0207 (1 HSPs)
scaffold0207 (26-69)||(18015-18058)
[»] scaffold0066 (2 HSPs)
scaffold0066 (150-196)||(45198-45244)
scaffold0066 (26-58)||(45338-45370)
[»] scaffold0456 (2 HSPs)
scaffold0456 (116-157)||(1546-1587)
scaffold0456 (116-157)||(8691-8732)
[»] scaffold0310 (2 HSPs)
scaffold0310 (20-57)||(4-41)
scaffold0310 (20-57)||(6298-6335)
[»] scaffold0589 (1 HSPs)
scaffold0589 (117-157)||(8011-8051)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (26-58)||(17209-17241)
[»] scaffold0335 (1 HSPs)
scaffold0335 (26-58)||(5476-5508)
[»] scaffold0303 (1 HSPs)
scaffold0303 (26-58)||(4346-4378)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (26-58)||(17304-17336)
[»] scaffold0173 (1 HSPs)
scaffold0173 (26-58)||(5549-5581)
[»] scaffold0118 (1 HSPs)
scaffold0118 (26-58)||(34308-34340)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (117-157)||(3525-3565)
[»] scaffold0039 (1 HSPs)
scaffold0039 (26-58)||(12418-12450)


Alignment Details
Target: chr6 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 30)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25175815 - 25175563
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175815 tgctaaattcgtgctcttgctgtgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25175716  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175715 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25175616  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25175615 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25175563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 27653983 - 27654235
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27653983 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgcttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 27654082  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  27654083 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttccaatgatgttatgaatgttatttga 27654182  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  27654183 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattaatgatg 27654235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 16825752 - 16826006
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgta--taattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 209  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16825752 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtaattaattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaa 16825851  T
Q  210 atgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttattt 309  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16825852 atgataagttatgaagattgtgctaaattggtggatttctcctaatttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatct 16825951  T
Q  310 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  16825952 gatattatgattgatgaataattgctttgttatgcatattcatggattgatgatg 16826006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 23153786 - 23153458
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||| ||||||||||    
T  23153786 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgtttctaaattcgt 23153687  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  23153686 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 23153587  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||| |||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  23153586 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatattatggctgttaattgatgttgtggttga 23153488  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    ||||| ||| ||||||||| ||||||||||    
T  23153487 tgaatcattacttgggtatacatattcatg 23153458  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 27 - 360
Target Start/End: Original strand, 14626045 - 14626377
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgct 126  Q
    |||||||||||||||||  |||||| ||||||| ||| |||  ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||    
T  14626045 aaggtaagggggttagttattatcacaatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtttgaattgtgattatggataattattgctaaattcgtgct 14626144  T
Q  127 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 226  Q
    |   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |    
T  14626145 cttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaa 14626244  T
Q  227 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 326  Q
    |||||   ||  |||||| || | ||||||||||||||| ||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||||||    
T  14626245 ttgtgtgcaattggtgaa-ttatgctaagttgttgttaacttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatga 14626343  T
Q  327 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    || |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14626344 atcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 14626377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 110; E-Value: 2e-55
Query Start/End: Original strand, 25 - 360
Target Start/End: Original strand, 1650020 - 1650352
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  1650020 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 1650116  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||    
T  1650117 gctcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaagaatgataagttgtga 1650216  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||    
T  1650217 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttga 1650315  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  1650316 tgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 1650352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 353
Target Start/End: Original strand, 1657748 - 1657999
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||| ||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  1657748 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttggatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 1657847  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  1657848 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 1657945  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  1657946 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 1657999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 35009439 - 35009702
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  35009439 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttaagtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 35009538  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  35009539 ttatgtaaaaatgtgaagttttgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 35009637  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  35009638 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 35009702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 78; E-Value: 3e-36
Query Start/End: Original strand, 100 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 15862734 - 15862484
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  15862734 atggataattgttactaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 15862635  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||| | | |||||||     
T  15862634 ttatgtataaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttc-atttatgttatt 15862538  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
      || || ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  15862537 gctgataattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 15862484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 66; E-Value: 4e-29
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 23148335 - 23148266
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 95  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23148335 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 23148266  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 19983167 - 19983224
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  19983167 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 19983224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 35015032 - 35015089
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35015032 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 35015089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 100 - 296
Target Start/End: Complemental strand, 29666137 - 29665941
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttca 198  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| | || || |||||| ||  |||| ||||||||||| || |||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  29666137 atggataattgttgttaaattcgtgctctagctgtgatgttattttcttatgtatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtttca 29666038  T
Q  199 ta-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 296  Q
     | |||||| |||||  |||||||||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| |  |||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  29666037 aagtatgcataaatgtcaagttatgaa-attgtactcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaaatgagatatgattcatgttcaattgatgtt 29665941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 100 - 185
Target Start/End: Complemental strand, 27751688 - 27751603
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtga 185  Q
    |||||| | ||| ||||||||||||||| || | || |||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |||||||||||    
T  27751688 atggataaatgtagctaaattcgtgctctaattgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgacaattgtatgattgttggtga 27751603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 37; E-Value: 0.000000000009
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29605696 - 29605612
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||  || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  29605696 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatgcatgaattagtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 29605612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 18583686 - 18583640
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  18583686 tagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 18583640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 18002395 - 18002427
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18002395 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 18002427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23995279 - 23995247
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23995279 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23995247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26090091 - 26090059
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26090091 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26090059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 4991427 - 4991396
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4991427 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 4991396  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 18629608 - 18629691
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  18629608 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 18629691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 26 - 56
Target Start/End: Original strand, 15742120 - 15742150
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 56  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15742120 taaggtaagggggttagtctttatcataatc 15742150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 118 - 200
Target Start/End: Original strand, 17083200 - 17083282
Alignment:
Q  118 attcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    |||||||||| || |||| || |||||||| |||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||  |||||||||    
T  17083200 attcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgtatgttcata 17083282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 1657661 - 1657693
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  1657661 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 1657693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 15862821 - 15862789
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  15862821 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 15862789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 18399184 - 18399144
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  18399184 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 18399144  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 18823283 - 18823315
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18823283 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18823315  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 18839138 - 18839170
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18839138 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 18839170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27751774 - 27751742
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  27751774 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 27751742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 32276659 - 32276691
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  32276659 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 32276691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 36)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 25426880 - 25426628
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426880 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 25426781  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426780 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 25426681  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25426680 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 25426628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12626 - 12374
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  12626 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 12527  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12526 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 12427  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12426 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19500151 - 19499899
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500151 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 19500052  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19500051 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19499952  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  19499951 tattatgattgattaataattgctttggtatgcatattcatggattgatgatg 19499899  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 221; E-Value: 1e-121
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 22366481 - 22366733
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366481 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 22366580  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366581 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 22366680  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22366681 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 22366733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 218; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Original strand, 18777995 - 18778244
Alignment:
Q  115 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 214  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18777995 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 18778094  T
Q  215 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 314  Q
    ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  18778095 aagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatattatttgatat 18778194  T
Q  315 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18778195 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 18778244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 217; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 21073595 - 21073847
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073595 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatggatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 21073694  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21073695 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttcttctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatcaatgttatttga 21073794  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21073795 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 21073847  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 23507302 - 23506965
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||  ||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  23507302 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatctccattttgtaagatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 23507203  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||  | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  23507202 tccatttgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 23507103  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  23507102 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 23507004  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  23507003 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 23506965  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 115 - 364
Target Start/End: Original strand, 43443398 - 43443647
Alignment:
Q  115 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 214  Q
    |||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443398 taaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgat 43443497  T
Q  215 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 314  Q
    |||||||||| |||||||| ||  ||||||||||| ||||||||||||| ||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43443498 aagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttcttctaagttgttgttgatttgagatgtgagtcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatat 43443597  T
Q  315 tatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43443598 tatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 43443647  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 27182471 - 27182810
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  27182471 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 27182570  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||| ||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  27182571 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaactgatgataattgtatgattgttgatgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 27182670  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  27182671 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 27182769  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    
T  27182770 tgaatcattgcttgagtatgcatattcatgaattgatgatg 27182810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 4199985 - 4200237
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4199985 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 4200084  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||  |||||||||||| || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  4200085 gataagttatgaatattatgctaaattggtgaatttctcttatgttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 4200184  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||    
T  4200185 tattatgattgatgaatgattgcttgggtttgcatattcatgggttgatgatg 4200237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 27010089 - 27009841
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| | |||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  27010089 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgagtgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 27009990  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||||| ||||| || ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27009989 agttatgaatattgtactcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 27009890  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  27009889 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 27009841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 22053753 - 22054096
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  22053753 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgaaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 22053852  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 219  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  22053853 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgtatgaattgatgatagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 22053952  T
Q  220 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 319  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  22053953 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttg 22054051  T
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  22054052 ttgatgaatcattgcttgggtctacatattcatgaattgatgatg 22054096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 134; E-Value: 1e-69
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 18530988 - 18531330
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatc---atcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat-tttgattat-ggatgattgttgctaaatt 120  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| || || |||| ||||||||||||||    
T  18530988 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcgtcatcatcattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatgtttcataattggataattgttgctaaatt 18531087  T
Q  121 cgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta 220  Q
    |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||     
T  18531088 cgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagttg 18531187  T
Q  221 tgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgat 320  Q
    |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |    
T  18531188 tgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgt 18531286  T
Q  321 tgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||| |||||| |||||| |||||||||| ||||||||||    
T  18531287 tgatgaatcattgctcgggtatacatattcatgaattgatgatg 18531330  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 93; E-Value: 3e-45
Query Start/End: Original strand, 112 - 312
Target Start/End: Original strand, 29188284 - 29188483
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  29188284 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 29188383  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  29188384 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 29188482  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 34939540 - 34939289
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| | ||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  34939540 atggataactgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 34939441  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||  |||| || ||||||| |||||||||||||  |||||||||     
T  34939440 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagtcattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatgttatt 34939343  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  34939342 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 34939289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20623232 - 20623085
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  20623232 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 20623133  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20623132 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20623085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 21233528 - 21233675
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  21233528 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 21233627  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  21233628 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 21233675  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 102 - 246
Target Start/End: Original strand, 25900408 - 25900552
Alignment:
Q  102 ggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatat 201  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||| |||||| |||||   ||    
T  25900408 ggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggttaaattatatgtttgaat 25900507  T
Q  202 atgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatt 246  Q
    |||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || ||||||    
T  25900508 atgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatt 25900552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 16536460 - 16536313
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16536460 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaatttataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16536361  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16536360 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16536313  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 68; E-Value: 3e-30
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 37053007 - 37052860
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37053007 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37052908  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||   |||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  37052907 atatgtggaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 37052860  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Complemental strand, 29918212 - 29918127
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    ||||||||||||||| |||| || |||||||| || |||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||||    
T  29918212 aaattcgtgctccaattatgatgatatgtttgaatacatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttcata 29918127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 32950951 - 32950862
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || || |||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  32950951 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgtatgatttgatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 32950862  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16105999 - 16105967
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16105999 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16105967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20623318 - 20623286
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20623318 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 20623286  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 21233442 - 21233474
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233442 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 21233474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 25900320 - 25900352
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25900320 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25900352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 360
Target Start/End: Original strand, 29190482 - 29190522
Alignment:
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  29190482 ttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 29190522  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 37053093 - 37053061
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37053093 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37053061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 21310709 - 21310792
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||| ||||||| ||||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  21310709 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 21310792  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 5450844 - 5450926
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  5450844 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 5450926  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 11584419 - 11584374
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  11584419 tagttggtgataattaaggtaagggggttagaattcatcataatca 11584374  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Original strand, 17471803 - 17471844
Alignment:
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||||||||    
T  17471803 atgaatcattgcttgggtacgcatattcatgaattgatgatg 17471844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 108728 - 108760
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  108728 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 108760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 9730278 - 9730310
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  9730278 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 9730310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16536546 - 16536514
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16536546 taagataagggggttagtctttatcataatcat 16536514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16595753 - 16595713
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16595753 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16595713  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 34)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 19886661 - 19886913
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19886661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaagt 19886760  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886761 gataagttatgaagattgtgctaaagtggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 19886860  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19886861 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19886913  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 202; E-Value: 1e-110
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Complemental strand, 463075 - 462743
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  463075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 462976  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  462975 tccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 462876  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| |  |||||||||    
T  462875 attgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgtcgtgattgatg 462777  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattga 359  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| |||||    
T  462776 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattga 462743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 20627213 - 20627576
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaa-ttttcaaatgttgtatgaattttgatt 99  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||| |||||    
T  20627213 gctagagctaatagttggagataattaaggtaacggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaaattttcaaatattgtatgaattatgatt 20627312  T
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||| ||     
T  20627313 atggataattgttgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcacgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtccaa 20627412  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| ||||||||||| || |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | | |||||||||||| |||| |||||    
T  20627413 atatgtaaaaatgataacttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttaattcttgttcaattgattttatg 20627511  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||| | || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||| ||||    
T  20627512 gttgttaattggtgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatggatattcatgaattgaggatg 20627576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 19794604 - 19794967
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||   ||    
T  19794604 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtaaattt-caaatgttgtatgaatttttgcat 19794702  T
Q  99 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
     |||||| ||||| | |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19794703 aatggataattgtcgttaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 19794802  T
Q  199 tatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 298  Q
     ||| | | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  19794803 aataggaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttat 19794901  T
Q  299 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
        |||| ||||| ||||  ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19794902 ttccgttaattgatgttatagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 19794967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 8891581 - 8891242
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  8891581 taaggtaaaggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 8891482  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  8891481 gctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggcgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 8891382  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||    
T  8891381 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttga 8891283  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  8891282 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 8891242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 43642856 - 43643220
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||    
T  43642856 gctagagctaatagttggagataattaagggaaggaggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 43642955  T
Q  99 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
      ||||| |||||||||||||| ||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  43642956 agtggataattgttgctaaatttgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 43643055  T
Q  199 tatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 298  Q
     ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | || ||||||| |||||||||| | |||||||||||||| ||||| |||    
T  43643056 aataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-ttcttagttgttattaatttgagatatgattcttgttcaattgatgctat 43643154  T
Q  299 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
       ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43643155 tgctgttaattgatgttgtagttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43643220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 167; E-Value: 2e-89
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 36982364 - 36982704
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  36982364 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 36982463  T
Q  123 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 222  Q
    |||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36982464 tgctccaactgtgatgatatgtttgtattcatgaattgatgataattgtaagattgctggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 36982563  T
Q  223 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 322  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | | ||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||    
T  36982564 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgccaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttg 36982662  T
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36982663 atgaatcattgtttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36982704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 17396653 - 17396916
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17396653 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17396751  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  17396752 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 17396851  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  17396852 aatgttatttgatattatgattaatggataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 17396916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 125; E-Value: 3e-64
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 24341309 - 24341652
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  24341309 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 24341408  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 219  Q
    || |||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||| |||||||  |||| |||||||  |||||    
T  24341409 tcatgcttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattatatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 24341508  T
Q  220 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 319  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| ||        
T  24341509 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttcctg 24341607  T
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  24341608 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 24341652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 25265390 - 25265653
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  25265390 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 25265489  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  25265490 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 25265588  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||||| || |  || |||||| || ||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  25265589 gttgttaattgatgttgttgtttatgaatcatggcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 25265653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 84; E-Value: 8e-40
Query Start/End: Original strand, 150 - 364
Target Start/End: Original strand, 7507894 - 7508107
Alignment:
Q  150 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 249  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||| |||||| | ||  |||||||||      
T  7507894 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-g 7507992  T
Q  250 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 348  Q
     ||||||||||||||| ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||    
T  7507993 gctaagttgttgttaa-ttgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatat 7508091  T
Q  349 tcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  7508092 tcatggattgatgatg 7508107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 19689401 - 19689548
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  19689401 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 19689500  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  19689501 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 19689548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 23820334 - 23820187
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  23820334 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 23820235  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  23820234 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 23820187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 14906440 - 14906587
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  14906440 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 14906539  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  14906540 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 14906587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 122
Target Start/End: Complemental strand, 22863267 - 22863169
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcg 122  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  22863267 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 22863169  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 64; E-Value: 7e-28
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 20015274 - 20015127
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| ||||||||||||||  || |||| | ||||||||| ||||||||||||       
T  20015274 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgcatgcatgaattgataataattgtgtgattgttggttaaattacatgtttga 20015175  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  20015174 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 20015127  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22284333 - 22284278
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22284333 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22284278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22275102 - 22275045
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22275102 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcctttatcataatcat 22275045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 45; E-Value: 1e-16
Query Start/End: Original strand, 1 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 15633594 - 15633538
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15633594 gctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtctttatcataatca 15633538  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 68238 - 68156
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  68238 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 68156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 58
Target Start/End: Original strand, 19689314 - 19689347
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19689314 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 19689347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 9652796 - 9652828
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9652796 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9652828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 14906354 - 14906386
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14906354 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14906386  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23820420 - 23820388
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23820420 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23820388  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25213403 - 25213372
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25213403 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 25213372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 22775206 - 22775288
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22775206 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22775288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 22780584 - 22780666
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  22780584 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttggtaattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 22780666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 7507757 - 7507789
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  7507757 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 7507789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 17396567 - 17396599
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  17396567 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 17396599  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 20015360 - 20015328
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  20015360 taaggtaagggggttagtctttatcatgatcat 20015328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 28031134 - 28031166
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28031134 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 28031166  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 92
Target Start/End: Original strand, 31146073 - 31146138
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaa-tgttgtatgaat 92  Q
    |||||||||||||||||  || |||||||||||| |  || |||||||||||||| ||||||||||||    
T  31146073 taaggtaagggggttagaattcatcataatcatctt--ttgtgtaaattttcaaattgttgtatgaat 31146138  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33128404 - 33128372
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  33128404 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 33128372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 43646139 - 43646059
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 196  Q
    ||||||||||| || ||||||| |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||    
T  43646139 aattcgtgctctaattatgttgatatgtttgaatgcatgaagttgttgataattggattgttgttggtgaaatttcatgtt 43646059  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 224; Significance: 1e-123; HSPs: 22)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 224; E-Value: 1e-123
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41394584 - 41394222
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394584 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 41394485  T
Q  101 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||| ||||||||||| |    
T  41394484 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaagttacatgttcaaa 41394385  T
Q  201 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 300  Q
    |||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||  ||||| | ||||||||| |||| |||||||||      
T  41394384 tatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttatgttgagatttgattcttgctcaattgatgttattg 41394286  T
Q  301 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||||||||| || |  ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41394285 ttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgattgggtatgcatattcatggattgatgatg 41394222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20931682 - 20931345
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||| |||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  20931682 taaggtaagggggttagcctttatcataatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaagtttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 20931583  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20931582 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20931483  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||||||  ||||||||| | |||| |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20931482 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 20931384  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  20931383 aataatttcttgggtatgcatattcatgaattaatgatg 20931345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20913367 - 20913037
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||| |||||||||||||||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  20913367 taaggtaagggggttagtctttatcgtaatcatcctcattttgcaaattttcaattgttgtatgaattttgcttacggataattgttgctaaattcgtgc 20913268  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||     
T  20913267 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcatatatgtaaaaatgataagttatgaaa 20913168  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | |||||||||||||||       |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  20913167 attgtgctcaattggtgaattt-tgcaaagttgttgttaatt-------tgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatcttgtggttgatg 20913076  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20913075 aataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 20913037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 5072388 - 5072640
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072388 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 5072487  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5072488 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 5072587  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5072588 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 5072640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 18601118 - 18601370
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    |||||||||| |||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601118 tgctaaattcatgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 18601217  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18601218 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 18601317  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  18601318 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 18601370  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 20893551 - 20893889
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  20893551 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtaa-ttttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattctt 20893649  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  20893650 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgttgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 20893749  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  |||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  20893750 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgatttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 20893848  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||  ||||||||||    
T  20893849 tgaatcattgtttgggtatgcatattcataaattgatgatg 20893889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 37844374 - 37844714
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||| |    
T  37844374 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcat 37844473  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtta-tg 222  Q
    |||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||  || ||    
T  37844474 gctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataaaatagtg 37844573  T
Q  223 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 322  Q
    || |||||||| ||    ||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37844574 aaaattgtgctcaattaatgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 37844672  T
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  37844673 atgagtcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 37844714  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 159; E-Value: 1e-84
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20446019 - 20445679
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 122  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  20446019 taaggtaagggagttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 20445920  T
Q  123 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 222  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  ||    
T  20445919 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtg 20445820  T
Q  223 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 322  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  |||    
T  20445819 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttg 20445721  T
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20445720 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20445679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 150; E-Value: 3e-79
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 20531783 - 20531444
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  20531783 taaggtaaggaaattagtctttatcataatcatcatcattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 20531684  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||| | || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  || | | |||||||||||  |||    
T  20531683 gctccaaatgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaagtaggaacaaatgataagtggtga 20531584  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||| ||| ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  20531583 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgtgttatgattcttgatcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtagttga 20531485  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  20531484 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 20531444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22228146 - 22227809
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22228146 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22228047  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22228046 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22227947  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22227946 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22227848  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22227847 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22227809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 131; E-Value: 7e-68
Query Start/End: Original strand, 27 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22232843 - 22232506
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||  |||||||||||||   || ||| |  ||||||  ||||||||||||  | | || ||| |  ||| |||||||||||||||    
T  22232843 aaggtaagggggttagttattatcataatcatgtacaatttttgcattttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcttgctaaattcgtgc 22232744  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||   || || |||||| ||  | |||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||     
T  22232743 tcttgctgtgatgttattttcttgtgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaa 22232644  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    ||||||   ||  | ||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||    
T  22232643 attgtgtccaattgttgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatg 22232545  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22232544 aataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 22232506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 2116506 - 2116258
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||| |||||||||   ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  2116506 tgctagattcgtgcttttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 2116407  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttga-gttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 310  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  || ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| |||    
T  2116406 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatattttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattg 2116308  T
Q  311 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    || || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  2116307 atgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 2116258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 88; E-Value: 3e-42
Query Start/End: Original strand, 25 - 298
Target Start/End: Complemental strand, 45051759 - 45051489
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||||||    
T  45051759 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-tgattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagattcgt 45051663  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    | ||  ||| || ||||| ||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  45051662 gttcttactgtgatgttacgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 45051563  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 298  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| | ||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||    
T  45051562 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttatggttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttat 45051489  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 51452755 - 51452608
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  51452755 atggataattgttgctaaattcgtgcttcaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 51452656  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  51452655 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 51452608  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 21860391 - 21860334
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  21860391 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 21860334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 44034846 - 44034903
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  44034846 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 44034903  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 15 - 92
Target Start/End: Complemental strand, 27675161 - 27675086
Alignment:
Q  15 ttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaat 92  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||| |  |  |  ||||||||||||| ||||||||||||    
T  27675161 ttggagataattaaggtaagggggttagaatttatcataatcgt--ttttagtgtaaattttcaattgttgtatgaat 27675086  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 41218781 - 41218728
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||    
T  41218781 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcatgatcat 41218728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Original strand, 15861327 - 15861358
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15861327 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15861358  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 16646158 - 16646118
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  16646158 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 16646118  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 320 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 45051486 - 45051446
Alignment:
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  45051486 ttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 45051446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 51452841 - 51452809
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  51452841 taaggtaagggggttagtctttatcttaatcat 51452809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Original strand, 3508 - 3843
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||    
T  3508 taaggtaagggggttagtctttgtcataatcatcttcattttgtaaattttcaaaagttgtatgaattttgattatagataattgttgctaaattcgtgc 3607  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  3608 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 3707  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || ||||||| |    
T  3708 attgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgagg 3806  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 362  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  3807 aataattgcttgggtatgcatattgatggattgatga 3843  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 208; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 1462 - 1124
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  |||||||| ||||||||||||||||||    
T  1462 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttcttatggataattgttgctaaattcgtg 1363  T
Q  125 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 224  Q
    |||||||| || || |||||| ||||||||||||||||  || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  1362 ctccaactttgatgatatgttagtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 1263  T
Q  225 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 324  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| |||||||| || |||||    
T  1262 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatattgtggttgat 1164  T
Q  325 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  1163 gaataattgcttgggtgtgcatattcatgaattgatgatg 1124  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 213; Significance: 1e-117; HSPs: 29)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 213; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47357906 - 47357654
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357906 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatggattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 47357807  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  47357806 gataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 47357707  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  47357706 tattatgattgatgaataattgattgggtatgtatattcatggattgatgatg 47357654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 54118143 - 54118507
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gat 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||   ||    
T  54118143 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattttgtgaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 54118242  T
Q  99 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
     |||||| |||||||||||||||||||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  54118243 aatggataattgttgctaaattcgtgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 54118342  T
Q  199 tatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 298  Q
     ||| | | || ||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| |||||||||    
T  54118343 aataggaacaattgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagatttagttatgattcttgttcaattgatgttat 54118441  T
Q  299 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
       ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  54118442 agttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 54118507  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13246769 - 13246430
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| |||||||||    
T  13246769 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcgt 13246670  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||| ||||| || || |||||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13246669 gctacaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattaatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13246570  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  13246569 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttga 13246471  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13246470 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13246430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10644467 - 10644219
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||| ||    
T  10644467 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgtta 10644368  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||||  |||||||||||  ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10644367 agttatgagtattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatatt 10644268  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10644267 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10644219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 155; E-Value: 3e-82
Query Start/End: Original strand, 26 - 264
Target Start/End: Complemental strand, 122226 - 121989
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||    
T  122226 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaatttgtgc 122127  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  122126 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 122027  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgtta 264  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||    
T  122026 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgtta 121989  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 356
Target Start/End: Original strand, 13048221 - 13048477
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||||||||||    || ||||||||||||||||| |||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  13048221 atggataattgttgctaaattcatgctccaacttcaatgatatgtttgtatgcatgatttgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 13048320  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||||||| |||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13048321 atatgtaaaaaggataagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgttgttagtttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13048420  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggat 356  Q
    ||||||||| |||| ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13048421 aatgttattagataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggat 13048477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 141; E-Value: 7e-74
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 15675009 - 15675352
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  15675009 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 15675108  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 219  Q
    ||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  15675109 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 15675208  T
Q  220 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 319  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |      
T  15675209 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttg 15675307  T
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  15675308 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 15675352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 109; E-Value: 9e-55
Query Start/End: Original strand, 26 - 296
Target Start/End: Original strand, 10104170 - 10104445
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  10104170 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 10104269  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 219  Q
     |||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  10104270 ccgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 10104369  T
Q  220 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 296  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  10104370 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 10104445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 26680463 - 26680201
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  26680463 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 26680364  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  26680363 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatagatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 26680266  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  26680265 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 26680201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 90; E-Value: 2e-43
Query Start/End: Original strand, 127 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 31115865 - 31115629
Alignment:
Q  127 ccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaaga 226  Q
    |||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||   |||| |||||||  ||||| |||| |    
T  31115865 ccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttccattatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaa 31115766  T
Q  227 ttgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatga 326  Q
    || |||| ||  ||||||||| ||||||||||||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  |||||||    
T  31115765 ttatgctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgttattgttgttaattgatgttgttgttgatga 31115667  T
Q  327 ataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  31115666 atcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 31115629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 10488825 - 10488678
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  10488825 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 10488726  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  10488725 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 10488678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 16327926 - 16328073
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  16327926 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 16328025  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  16328026 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 16328073  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 26 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 33241043 - 33240900
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  33241043 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 33240944  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 163  Q
    ||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||    
T  33240943 tcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatg 33240900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 54; E-Value: 6e-22
Query Start/End: Original strand, 267 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 111492 - 111395
Alignment:
Q  267 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  111492 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 111395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 31132657 - 31132545
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||    |||| || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  31132657 taaggtaagggggttagtcttcatcataattatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgttgctaaat 31132558  T
Q  120 tcgtgctccaact 132  Q
    |||||||||||||    
T  31132557 tcgtgctccaact 31132545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 25119082 - 25119139
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||    
T  25119082 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggagttagtttttatcataatcat 25119139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 116 - 296
Target Start/End: Original strand, 40885570 - 40885749
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata-tatgcaaaaatgat 214  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||  ||||||||||||||||||||||| | |||| | |||||      
T  40885570 aaattcgtactccaactgtggtgctatgtttgtatgcatgaattggtgataattgaatgtttgttggtgaaattacatgttcaaagtatgtataaatgtc 40885669  T
Q  215 aagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtt 296  Q
    |||||||||| ||| |||| ||  |||||| || | ||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| |||||||    
T  40885670 aagttatgaa-attatgctcaattggtgaactt-tgctaagttattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtt 40885749  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 5682407 - 5682460
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  5682407 gagctaatagttggtgataattaaggtaagtgggttagtttttatcataatcat 5682460  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 15045074 - 15044992
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15045074 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15044992  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 320 - 364
Target Start/End: Original strand, 10104450 - 10104494
Alignment:
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10104450 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 10104494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 14952117 - 14952085
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14952117 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14952085  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 15135907 - 15135939
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15135907 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15135939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 15272211 - 15272243
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15272211 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15272243  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 16327840 - 16327872
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16327840 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16327872  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 16609013 - 16609045
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16609013 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16609045  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 26680549 - 26680517
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26680549 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 26680517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 15109350 - 15109432
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    ||||| |||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  15109350 aattcatgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 15109432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 8045304 - 8045272
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  8045304 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 8045272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16523178 - 16523146
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  16523178 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 16523146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 211; Significance: 1e-115; HSPs: 55)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 14842487 - 14842824
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  14842487 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 14842586  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||| | || |||||| ||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||     
T  14842587 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgaagataattgtatgattgttggtgaaattgcatgttcaaatgtgtaaaaatgataagttatgaaa 14842686  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||    
T  14842687 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatg 14842785  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14842786 aataattgattgggtttgcatattcatggattgatgatg 14842824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 55316471 - 55316219
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316471 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 55316372  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55316371 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 55316272  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  55316271 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 55316219  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41270327 - 41270075
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41270327 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtggaattacatgttcatatatgcaaaaat 41270228  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41270227 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 41270128  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41270127 taatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 41270075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2050147 - 2049810
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  2050147 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatcaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 2050048  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| ||  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||| || ||||     
T  2050047 tccaactgtgacgatatgtttgtatgcctgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaacatgataacttgtgaaa 2049948  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||| |||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  2049947 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgatttttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttgatg 2049849  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  2049848 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 2049810  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 12030073 - 12030410
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  12030073 taaggtaagggggttaatcattatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgacttttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 12030172  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||||||||| ||||     
T  12030173 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaagtgataagttgtgaaa 12030272  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
     ||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||  | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| ||||| ||||||    
T  12030273 gttgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgatatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttatggttgatg 12030371  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12030372 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 12030410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 13839232 - 13838905
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 124  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  13839232 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatgaataattgttgctaaattcgtg 13839133  T
Q  125 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 224  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  13839132 ctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 13839033  T
Q  225 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 324  Q
     |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||||    
T  13839032 aattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgat 13838934  T
Q  325 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    |||| |||| |||||||||||||||||||    
T  13838933 gaatcattgtttgggtatgcatattcatg 13838905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 16744016 - 16744377
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| | |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16744016 gctagagctaatagttggagataattaaggtaacgaggttagtctttaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 16744115  T
Q  101 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||| || || ||||||||||| |||||||||||  ||  ||||| ||||||||| ||||||||| || | |    
T  16744116 tggatgattgttgttaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatccatgaattgataataagtgtatgattgttggttaaattacatttttaaa 16744215  T
Q  201 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 300  Q
    |||| |||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||| | ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |      
T  16744216 tatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttatagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgttg 16744313  T
Q  301 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||| || |  || || |  ||||||||| ||||||||||||| ||| |||||||||||||||||    
T  16744314 atgctaataaatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatgttcatggattgatgatg 16744377  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 156; E-Value: 8e-83
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 16821366 - 16821139
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||| |||||  |||||||||||    
T  16821366 tgttatgtttgtatgcataaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagctatgagtattgtgctaaa 16821267  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16821266 ttggtgaatttctcctaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 16821167  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||| ||||||    
T  16821166 gggtttgcatattcatggattaatgatg 16821139  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 13975722 - 13975985
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13975722 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13975820  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13975821 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13975920  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13975921 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13975985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 63 - 364
Target Start/End: Original strand, 15858986 - 15859287
Alignment:
Q  63 attttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattg 160  Q
    ||||||||||||| ||| |||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15858986 attttgtaaattt-caattgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattg 15859084  T
Q  161 atgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgtt 260  Q
    ||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||    
T  15859085 atgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgaacaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgtt 15859183  T
Q  261 gttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||| | ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15859184 gttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15859283  T
Q  361 gatg 364  Q
    ||||    
T  15859284 gatg 15859287  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 153; E-Value: 5e-81
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 45861068 - 45860805
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  45861068 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 45860970  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||| | ||||||||||||||||||| |||||||| ||  |||||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  45860969 ataagtaaaaatgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 45860870  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  45860869 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 45860805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 152; E-Value: 2e-80
Query Start/End: Original strand, 90 - 365
Target Start/End: Original strand, 51158008 - 51158282
Alignment:
Q  90 aattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaatt 189  Q
    ||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||    
T  51158008 aattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatt 51158107  T
Q  190 acatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaa 289  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| ||||||||||||||     
T  51158108 acatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaat 51158206  T
Q  290 tgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 365  Q
    ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  51158207 tgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 51158282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 145; E-Value: 3e-76
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 13954890 - 13955153
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||| || |  |||||| |||||||||| ||||||||||| |     
T  13954890 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtt-gtatgcatgaattgttgatgattgtatgattgttggtggaattacatgtttaa 13954988  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||| | ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | |||||||||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  13954989 ataagtaaaaatgatcagttatgaatattgtgctcaattgatgaatttctcctaagttgtcattaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 13955088  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13955089 aatgttatttgataatatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13955153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 142; E-Value: 2e-74
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Original strand, 15936634 - 15936890
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15936634 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15936733  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15936734 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15936832  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  15936833 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 15936890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 107 - 361
Target Start/End: Original strand, 15938476 - 15938729
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||| |||||| |||||||||||| |  || ||||||||||  |||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  15938476 attgttactaaatacgtgctccaactgtaatgatatgtttgtaatcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 15938575  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  15938576 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 15938674  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatg 361  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  15938675 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatg 15938729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 106; E-Value: 6e-53
Query Start/End: Original strand, 25 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 15615170 - 15614838
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatt-atggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||  | |||||| |  |||||  ||||||||||||  | | || ||| |  |||  ||||| ||| ||    
T  15615170 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatg-taattttgca--ttttctcatgttgtatgaaaatgggttgatgaacaattcatgctagatttgt 15615074  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||  ||| || |||||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  15615073 gctcttactgtggtgttatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaggattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 15614974  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||    
T  15614973 atatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtagttga 15614875  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  15614874 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 15614838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 3 - 163
Target Start/End: Complemental strand, 19232144 - 19231981
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaatttt--gatt 99  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||   ||     
T  19232144 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcttaatcatcatcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcata 19232045  T
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatg 163  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||    
T  19232044 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttatattcatgaattgatg 19231981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 98; E-Value: 3e-48
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 17912483 - 17912744
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  17912483 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact-tgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 17912581  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| |||||||| |||||||||| ||||||| |||  | ||||||  |  || ||||| ||| | ||||| | |||||| |||||||  ||||||||     
T  17912582 atatgtaaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaattgatgaatt--tgatatgttgtagttgaattgagctatgattcatgttcaatcgatgttatt 17912679  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17912680 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 17912744  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 89; E-Value: 8e-43
Query Start/End: Original strand, 26 - 146
Target Start/End: Original strand, 19260749 - 19260869
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||  |||||||| |||||||||||||||||||    
T  19260749 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaagttttcaaatgttgtatgaattttttttatggataattgttgctaaattcgtgc 19260848  T
Q  126 tccaactatgttgttatgttt 146  Q
    || || |||| || |||||||    
T  19260849 tctaattatgatgatatgttt 19260869  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 2449238 - 2449385
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  2449238 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 2449337  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  2449338 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 2449385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Original strand, 17955861 - 17955916
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17955861 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17955916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3992930 - 3992873
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3992930 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3992873  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 55513250 - 55513193
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  55513250 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 55513193  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 49; E-Value: 6e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 61
Target Start/End: Original strand, 15857138 - 15857198
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcat 61  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15857138 gctagagctaatacttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcat 15857198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 2844571 - 2844514
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  2844571 gctagagctaatagtttgagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 2844514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000002
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45582012 - 45581954
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaag-ggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  45582012 gctagagctaatagttggagataattaaggtaaggggggttagtttttatcataatcat 45581954  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Original strand, 54038003 - 54038056
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  54038003 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 54038056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7854358 - 7854305
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  7854358 gagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 7854305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47984763 - 47984650
Alignment:
Q  251 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 350  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47984763 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47984664  T
Q  351 atggattgatgatg 364  Q
    ||| ||||||||||    
T  47984663 atgaattgatgatg 47984650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 47994050 - 47993937
Alignment:
Q  251 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 350  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  47994050 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 47993951  T
Q  351 atggattgatgatg 364  Q
    ||| ||||||||||    
T  47993950 atgaattgatgatg 47993937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48003337 - 48003224
Alignment:
Q  251 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 350  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48003337 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48003238  T
Q  351 atggattgatgatg 364  Q
    ||| ||||||||||    
T  48003237 atgaattgatgatg 48003224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 251 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48012623 - 48012510
Alignment:
Q  251 ctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattc 350  Q
    |||||||||||||   ||||| |||||||| ||||||| ||||||| |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||    
T  48012623 ctaagttgttgttggattgagatgtgattcatgttcaattgatgtttttgttgttaattgattttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattc 48012524  T
Q  351 atggattgatgatg 364  Q
    ||| ||||||||||    
T  48012523 atgaattgatgatg 48012510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Original strand, 11986173 - 11986262
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| || ||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  11986173 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttaatgataattgtatgattgtggttgaaattacatgtt 11986262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 14080756 - 14080715
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  14080756 aaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 14080715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Original strand, 15468555 - 15468596
Alignment:
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15468555 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 15468596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 2449152 - 2449184
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2449152 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2449184  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 4145814 - 4145898
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    |||||||| |||||| |||| || |||||||| || ||||||||| || || ||| ||  |||||| ||||||||||||||||||    
T  4145814 aaattcgtactccaattatggtgatatgtttgaatacatgaattggtgataattgaattgttgttgatgaaattacatgttcata 4145898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 16261809 - 16261777
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16261809 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16261777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 16933869 - 16933901
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16933869 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 16933901  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 17912398 - 17912430
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17912398 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 17912430  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 23492728 - 23492696
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23492728 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 23492696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 38168269 - 38168237
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38168269 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 38168237  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 53771397 - 53771365
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  53771397 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 53771365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 30207462 - 30207380
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||| | ||||||||    
T  30207462 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaacttcatgttca 30207380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 200
Target Start/End: Original strand, 6228625 - 6228710
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| || |||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||||    
T  6228625 aaattcgtgctctaattatggtgatatgtttgaatacatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttcata 6228710  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 323 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 22275250 - 22275209
Alignment:
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||||| ||||||||||    
T  22275250 atgaatcattgcttaggtatgcatattcatgaattgatgatg 22275209  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 11986080 - 11986112
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  11986080 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 11986112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 13954804 - 13954836
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  13954804 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 13954836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Original strand, 14059214 - 14059254
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  14059214 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 14059254  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 14285321 - 14285289
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  14285321 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 14285289  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 19947058 - 19947026
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  19947058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 19947026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 30153297 - 30153265
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  30153297 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 30153265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 33342236 - 33342204
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33342236 taaggtaagagggttagtctttatcataatcat 33342204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45861154 - 45861122
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  45861154 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 45861122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 51961031 - 51961063
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  51961031 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 51961063  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 203; Significance: 1e-111; HSPs: 3)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 203; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48935 - 48598
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  48935 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 48836  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||     
T  48835 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaaaaaatgataagttgtgaaa 48736  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| |   ||||||||| | ||||||||||| ||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  | ||| ||||| || || ||||||    
T  48735 attgtgctcagttggtgaattt-tgctaagttgttgctagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctattaattgatgttgtggttgatg 48637  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  48636 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 48598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 184; E-Value: 2e-99
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36320 - 36093
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36320 tgttatgtttgtatgtatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 36221  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  36220 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaatagatgttatgaatgttatttgataatatgattgatgaataattgctt 36121  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  36120 gggtttgcatattcatggattgatgatg 36093  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 61122 - 61154
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  61122 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 61154  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7 (Bit Score: 201; Significance: 1e-109; HSPs: 43)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 201; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 10989661 - 10989410
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989661 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 10989562  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10989561 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttg-taatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 10989463  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  10989462 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 10989410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 196; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3060328 - 3059966
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta 100  Q
    |||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  3060328 gctagagctaatagttggagataatgaaggtaagggggtaagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttatatgaattttgctta 3060229  T
Q  101 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcata 200  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |  ||| ||||||||||| |||||||| || |||||  | |||||||||||||||||||||| |    
T  3060228 tggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgataatatatttgtatgcattaattgatgataattgtaatactgttggtgaaattacatgttcaaa 3060129  T
Q  201 tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatga 300  Q
    |||| ||||||||||| || |||| ||| |||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| |||||||||||    
T  3060128 tatgtaaaaatgataaattgtgaaaattatgctcaaatggtgaattt-tgttaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatga 3060030  T
Q  301 atgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  3060029 ctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 3059966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 111 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 2437710 - 2437457
Alignment:
Q  111 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||    | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437710 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 2437611  T
Q  211 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 310  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||  ||||||||| |||||||||||||||||| |||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2437610 tgataagttatgaagattgtgttcaattggtgaatttttcctaagttgttgttaatatgagatttgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 2437511  T
Q  311 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  2437510 atattatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 2437457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 16212103 - 16211768
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  16212103 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaattttgcttatggacaattgttgctaaattcgtgc 16212004  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16212003 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgtttgtgaaattgcatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16211904  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | ||||||||||| || ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16211903 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttaaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16211805  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 362  Q
    | | |||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  16211804 attcattgcttgggtatgcatattcatgaattaatga 16211768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 178; E-Value: 6e-96
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 13036938 - 13037277
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  13036938 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 13037037  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||| ||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  13037038 gctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttgatgaaattgcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 13037137  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| | ||||||||||| ||| ||||| || || ||||    
T  13037138 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattaatgttatgaatattaattgatgttgtggttga 13037236  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13037237 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 13037277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 170; E-Value: 4e-91
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 13911024 - 13911277
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||    | || |||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13911024 tgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttaattgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 13911123  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 310  Q
    ||||||||||||| ||| |||| ||  |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  13911124 gataagttatgaatattatgctcaattggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttg 13911223  T
Q  311 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13911224 atattatgattgatgaataatttcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 13911277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 168; E-Value: 6e-90
Query Start/End: Original strand, 26 - 359
Target Start/End: Original strand, 11580661 - 11580997
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg---attatggatgattgttgctaaattc 121  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    || |||||| ||| |||||||||||    
T  11580661 taaggtaaggggattagtctttatcataatcatcatcatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttttgcataatggataattattgctaaattc 11580760  T
Q  122 gtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 221  Q
    ||||||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| |    
T  11580761 gtgctccaactgtgataatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgt 11580860  T
Q  222 gaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgatt 321  Q
    ||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||    
T  11580861 gaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggtt 11580959  T
Q  322 gatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattga 359  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||||    
T  11580960 gatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattga 11580997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 164; E-Value: 1e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 36053003 - 36052667
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||  |    
T  36053003 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattgttgctaaatttat 36052904  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
     |||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  36052903 actccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtaaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 36052804  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||  ||||| ||||| || || ||||    
T  36052803 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttgtggttgttaattgatgttgtggttga 36052708  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  36052707 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 36052667  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13572924 - 13572676
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||| | |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  13572924 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtgtgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 13572825  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13572824 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 13572725  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  13572724 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 13572676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Original strand, 18253842 - 18254098
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  18253842 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 18253941  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  18253942 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 18254040  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  18254041 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgagtatgcatattcatggattgatgatg 18254098  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 143; E-Value: 5e-75
Query Start/End: Original strand, 100 - 358
Target Start/End: Original strand, 25292338 - 25292595
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||| |||||||| || |  |||||| |||||||||||||||||||||| |     
T  25292338 atggataattgttgctaaatttgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgtatgaattgttgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaa 25292437  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||| |||||||| ||  |||||||| |||||| ||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||    
T  25292438 atatgtaaaaaggataagctatgaatattgtgctcaattggtgaatt-ctcctaggttgtcgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatg 25292536  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattg 358  Q
    |||||||||||||||||||| | |||||||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  25292537 aatgttatttgatattatgactaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattg 25292595  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 129; E-Value: 1e-66
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 47481031 - 47481294
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||| |||||||||||||||||     
T  47481031 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttagtgaaattacatgttcaa 47481130  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  47481131 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcttgttcaattgatgttatc 47481229  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      | ||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  47481230 gctcttaattgatgtttttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 47481294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Original strand, 16478987 - 16479213
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||    
T  16478987 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaa 16479086  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||| |  |||||| || |||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||| || |  ||||||||| | |||||    
T  16479087 ttggtgaattt-tgttaagttatttttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactgctt 16479185  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16479186 gggtatgcatattcatggattgatgatg 16479213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 7293279 - 7293017
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||| ||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  7293279 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattaataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 7293180  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||||||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  7293179 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgttgttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 7293082  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  7293081 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 7293017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 101 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13321278 - 13321014
Alignment:
Q  101 tggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatg-ttcat 199  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||| ||||     
T  13321278 tggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgtttcaa 13321179  T
Q  200 a-tatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg-ttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgtta 297  Q
    | |||| | |||||  |||||||||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||| ||||| | ||||| | |||||| ||||||| ||||||||    
T  13321178 agtatgtataaatgtcaagttatgaa-attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgattgttgaattgagatatgattcatgttcaattgatgtta 13321081  T
Q  298 tgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |   ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  ||||||| |||| ||||||| ||||||||||    
T  13321080 ttgttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtttgcacattcatgaattgatgatg 13321014  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 11516490 - 11516343
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  11516490 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 11516391  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  11516390 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 11516343  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 15441564 - 15441711
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  15441564 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 15441663  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  15441664 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 15441711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 30262129 - 30262276
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  30262129 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 30262228  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  30262229 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 30262276  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 32493921 - 32493978
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  32493921 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 32493978  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 3 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 126793 - 126738
Alignment:
Q  3 tagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  126793 tagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 126738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 48; E-Value: 2e-18
Query Start/End: Original strand, 28 - 221
Target Start/End: Original strand, 295893 - 296087
Alignment:
Q  28 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||| ||||| | ||||||  |||||||||| |  |||||||||  ||||||||| ||||| || ||| || ||||||||||||||||||     
T  295893 aggtaagggggtttgtcttcaacataattctcatcatttt-tgcattttcaaactttgtatgaaattttgcataatgaataattgttgctaaattcgtgt 295991  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttat 221  Q
    || || |  | |||||||||||| ||||||||| |||| || |  ||| ||||||||||||||| |||||| |  |||| |||||||| |||||||    
T  295992 tctaattgaggtgttatgtttgtgtgcatgaatcgatgataatgttatgattgttggtgaaatttcatgttgaattatgtaaaaatgagaagttat 296087  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 42; E-Value: 0.000000000000009
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 1936892 - 1936949
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||    
T  1936892 gctagagttaatagttggagataattaaggtaaggaggttagtttttatcataatcat 1936949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 36024485 - 36024372
Alignment:
Q  26 taaggtaaggggg-ttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaa 118  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||    |||  || ||||||||||| |||||||||||   ||  ||||| |||||| |||||    
T  36024485 taaggtaaggggggttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttacaatttttcaaatgtggtatgaatttttcataattggataattgtttctaaa 36024386  T
Q  119 ttcgtgctccaact 132  Q
    ||||||||||||||    
T  36024385 ttcgtgctccaact 36024372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 13377775 - 13377693
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  13377775 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 13377693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 13 - 58
Target Start/End: Original strand, 111156 - 111201
Alignment:
Q  13 agttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  111156 agttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 111201  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 2029276 - 2029244
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2029276 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 2029244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 7293365 - 7293333
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7293365 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 7293333  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 11516576 - 11516544
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11516576 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 11516544  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 14113903 - 14113935
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14113903 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 14113935  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 15441478 - 15441510
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15441478 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 15441510  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 15709501 - 15709428
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatc----attttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt 95  Q
    ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||    |||||| || ||||||||||| |||||||||||    
T  15709501 taaggtaagaggattagtcttcatcataatcatcatcatcaattttgcaatttttcaaatgtggtatgaatttt 15709428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 30262043 - 30262075
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30262043 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 30262075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 42056188 - 42056220
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  42056188 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 42056220  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Original strand, 16914928 - 16915011
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||| |||||||| || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  16914928 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaaattgcatgttca 16915011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 15 - 57
Target Start/End: Original strand, 7283945 - 7283987
Alignment:
Q  15 ttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  7283945 ttggtgataattaaggtaagggggttagttttcatcataatca 7283987  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 371449 - 371417
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  371449 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 371417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 3049937 - 3049905
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  3049937 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 3049905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13321366 - 13321334
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13321366 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13321334  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 132
Target Start/End: Original strand, 14113989 - 14114021
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14113989 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14114021  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 100 - 132
Target Start/End: Original strand, 14423639 - 14423671
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaact 132  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  14423639 atggataattgttgctaaattcgtgctccaact 14423671  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 30 - 58
Target Start/End: Original strand, 15516765 - 15516793
Alignment:
Q  30 gtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15516765 gtaagggggttagtctttatcataatcat 15516793  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 25124482 - 25124450
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  25124482 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 25124450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 47480944 - 47480976
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  47480944 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 47480976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 200; Significance: 1e-109; HSPs: 33)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 200; E-Value: 1e-109
Query Start/End: Original strand, 26 - 365
Target Start/End: Original strand, 16193643 - 16193980
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16193643 taaggtaagggg-ttagtctttatcataatcatcatcatttggtaaattttcaaatattgtatgaattttgcttatggatgattgttgctaaattcgtgc 16193741  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    |||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  16193742 tccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggggaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 16193841  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | | || |||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  16193842 attgtgctcaattggtgaattt-tgccaaattgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttgatg 16193940  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatgt 365  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  16193941 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgaggatgt 16193980  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 189; E-Value: 1e-102
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 30120974 - 30120722
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30120974 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 30120875  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  30120874 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttga 30120775  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  30120774 tattatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatcgattgatgatg 30120722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 186; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 43373392 - 43373731
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| |||  ||||||||||||    
T  43373392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgtataatggataattaatgctaaattcgt 43373491  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || || ||||||||||||||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||    
T  43373492 gctccaactgtgatgatacgtttgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtga 43373591  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||| || || ||||    
T  43373592 aaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgctatggttgttaattgatgttgtggttga 43373690  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  43373691 tgaataattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 43373731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 222753 - 222943
Alignment:
Q  174 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222753 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 222852  T
Q  274 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  222853 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 222943  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 736376 - 736566
Alignment:
Q  174 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736376 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 736475  T
Q  274 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  736476 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 736566  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 183; E-Value: 6e-99
Query Start/End: Original strand, 174 - 364
Target Start/End: Original strand, 860271 - 860461
Alignment:
Q  174 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 273  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860271 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagtt 860370  T
Q  274 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  860371 gtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 860461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 177; E-Value: 2e-95
Query Start/End: Original strand, 112 - 364
Target Start/End: Original strand, 16674392 - 16674644
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || |||||||||| |||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674392 tgctaaattcgtgctctttctgtgatgttatgtttttatgcatgaatttatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 16674491  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16674492 gataagttatgaatattgtgcttaattggtgaatttctcctaagttgttgttaagttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 16674591  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || ||||||| ||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||    
T  16674592 taatatgattaatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattgatgatg 16674644  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 173; E-Value: 6e-93
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Original strand, 24928716 - 24929043
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt-aaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 124  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  24928716 taaggtaatggggttagtctttatcataatcatcgtcattttgtgaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 24928815  T
Q  125 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 224  Q
    |||||||| || |  |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||    
T  24928816 ctccaactgtgattatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaa 24928915  T
Q  225 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 324  Q
     |||||||| ||  ||||||||||  ||||||||| |||   ||||||| ||  |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  24928916 aattgtgctcaattggtgaatttc-gctaagttgtggttggattgagttatgtctcttgttcaattgaggttatggttgttaattgatgttgtgattgat 24929014  T
Q  325 gaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||    
T  24929015 gaatcattgcttgggtatgcatattcatg 24929043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Original strand, 21844576 - 21844824
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  21844576 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 21844675  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21844676 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatttttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21844775  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21844776 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21844824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 165; E-Value: 4e-88
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Original strand, 21851969 - 21852217
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||| ||||| | ||||| ||||||||||    
T  21851969 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattaaatgtttaaatatgtaaaaatgata 21852068  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21852069 agttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 21852168  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||    
T  21852169 atgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcattgattgttgatg 21852217  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 1 - 364
Target Start/End: Original strand, 16404875 - 16405235
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--at 98  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||   ||    
T  16404875 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtcttcatcataatcatcattattt-gtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcat 16404973  T
Q  99 tatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
     |||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16404974 gatggataattattgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttca 16405073  T
Q  199 tatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttat 298  Q
     ||| | | ||||| |||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||   |||||||| ||||  | |||||||||||||| |||||||||    
T  16405074 aataggaacaaatgttaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaa---gttgttaaattgacatatgattcttgttcaattgatgttat 16405169  T
Q  299 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
       ||||| ||||| || |  ||||||||| | |||||||||||||| ||||||| ||||||||||    
T  16405170 tgttgttaattgatgttttagttgatgaatcactgcttgggtatgcaaattcatgaattgatgatg 16405235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 112 - 360
Target Start/End: Original strand, 6774258 - 6774505
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  6774258 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 6774357  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||| |||||||||   ||||||||||    
T  6774358 gataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaattgatgttattgttgttatttga 6774456  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    | || |  ||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||||    
T  6774457 tgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatgaattgat 6774505  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 113; E-Value: 4e-57
Query Start/End: Original strand, 112 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 24549233 - 24548986
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||| ||||||||||  ||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  24549233 tgctagattcgtgctcttactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 24549134  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttga 311  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||| | | ||||||||| |||| ||||||||||  ||||| ||||    
T  24549133 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgggatttgattcttgctcaattgatgttatggttgttaattga 24549035  T
Q  312 tattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    | || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24549034 tgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgat 24548986  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 22907214 - 22907476
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  22907214 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 22907313  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| ||| | ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  22907314 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttgaattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 22907411  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22907412 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 22907476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 17345832 - 17345581
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||| |||||||||||| |||| || |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||| |||||||||     
T  17345832 atggataattgttgcgaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttatatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaatcacatgttcaa 17345733  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  |||||||||| |||||||| ||  | || |||| | ||||||| |||| || ||||||| |||||||||||||  |||| ||||     
T  17345732 ttatgtaaaaatgtgaagttatgaaaattgtgctcaattgatggattt-tgctaagttattgtgaa-ttgagttatgattcttgttcagttgatattatt 17345635  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  17345634 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcactgcttgggtatgcatattcatg 17345581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 5238350 - 5238203
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  5238350 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 5238251  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  5238250 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 5238203  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 24661248 - 24661395
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  24661248 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 24661347  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  24661348 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 24661395  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 76; E-Value: 5e-35
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 43685809 - 43685662
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| |||||||||||| |     
T  43685809 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttaa 43685710  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  43685709 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 43685662  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 63; E-Value: 3e-27
Query Start/End: Original strand, 174 - 236
Target Start/End: Original strand, 691908 - 691970
Alignment:
Q  174 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  691908 aattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 691970  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 274823 - 274766
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  274823 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 274766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 641026 - 641083
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  641026 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 641083  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 826832 - 826889
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  826832 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcataatcat 826889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 24716737 - 24716794
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24716737 gctagagctaatagttggtgataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24716794  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5238436 - 5238404
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5238436 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 5238404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 22907128 - 22907160
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22907128 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22907160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 24385652 - 24385684
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24385652 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24385684  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 24661162 - 24661194
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24661162 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 24661194  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 43685895 - 43685863
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43685895 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 43685863  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 26011741 - 26011658
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||| || |||| || |||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  26011741 aaattcgtgctctaattatgatgatatgtttgaatgcatgaaattggtgataattgaattgttgttggtgaaattacatgttca 26011658  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 39115651 - 39115598
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| |||||||  |||||||||||||||| |||||| || |||||||||||    
T  39115651 gagctaatagttggtaataattaaggtaagggtgttagttttcatcataatcat 39115598  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 2545297 - 2545265
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  2545297 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 2545265  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 3431176 - 3431208
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  3431176 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 3431208  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22886686 - 22886654
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22886686 taaggtaagggggttagtcttaatcataatcat 22886654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 5990 - 6326
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||| |||| ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  5990 taaggtaagggggttagtctttatcataatcattttcactttgcaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 6089  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| | ||     
T  6090 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtaaaa 6189  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||  | ||||||||||||    
T  6190 attgtgctgaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttttgttatgattgatg 6287  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6288 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 6326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0175 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0175
Description:

Target: scaffold0175; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 882 - 1218
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||  ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcactttacaaattctcaaatgttgtatgaattgtgattatggataattgttgctaaattcgtgc 981  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||| ||||||| ||||     
T  982 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaataataagttgtgaaa 1081  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  | ||||||| | ||||||||||||||| ||||| | | |||||||||||| |||||||||| |||||| || || ||||||||||||    
T  1082 attgtgctcaattgatgaattt-tgctaagttgttgttaa-ttgagattttattcttgttcaagtgatgttatggatgttaatttatgttatgattgatg 1179  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1180 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 1218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0498 (Bit Score: 191; Significance: 1e-103; HSPs: 1)
Name: scaffold0498
Description:

Target: scaffold0498; HSP #1
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9215 - 8878
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||| |||||||| |||||||  |||||||||||||||||||    
T  9215 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtacgaattttgcttatggaaaattgttgctaaattcgtgc 9116  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||  | || |||||||||||||||||||||| |||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||||| |||||| ||||     
T  9115 tccatttgtgatgttatgtttgtatgcatgaatcgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgttaagttgtgaaa 9016  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| ||||| || |||||||||    
T  9015 attgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaattgatgttgtgattgatg 8917  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8916 aataattgcttgggtatgcatattcatgtattgatgatg 8878  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 185; Significance: 1e-100; HSPs: 1)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 12450 - 12115
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaa-ttttgattatggatgattgttgctaaattcgtg 124  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||| ||| |||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12450 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttaattttgtaacttt-caaatgctgtatgaaattttgattatggataattgttgctaaattcgtg 12352  T
Q  125 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 224  Q
    ||| |||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||| |||||||| | || || |||||||||||||| ||||    
T  12351 ctctaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaaatacatgtttaaatgtgtaaaaatgataagttgtgaa 12252  T
Q  225 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 324  Q
     |||||||||||  ||||||||| |  |||||||||||  | ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||    
T  12251 aattgtgctaaattggtgaattt-tgttaagttgttgt--aattgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattcat 12155  T
Q  325 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12154 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 12115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 180; Significance: 4e-97; HSPs: 2)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 172242 - 171916
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  172242 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 172143  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  172142 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 172043  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  172042 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 171944  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  171943 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 171916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 180; E-Value: 4e-97
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Complemental strand, 177945 - 177619
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| | ||||||||||| |||||    
T  177945 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtataaattttgattatggataactgttgctaaatacgtgc 177846  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  177845 tccaactgtgatgatatgtttgtatggatgaattgatgataattgtatgattgatggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 177746  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| ||| | |||||||  ||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||    
T  177745 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttgaattgagttacgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatg 177647  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    ||| ||||||| ||||||||||||||||    
T  177646 aatcattgcttaggtatgcatattcatg 177619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 176; Significance: 1e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 176; E-Value: 1e-94
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 43224 - 42997
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    |||||||||| |||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  43224 tgttatgtttctatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgttaagttatgaagattgtgctaaa 43125  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43124 ttggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgattcgtgttcaagtgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 43025  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||    
T  43024 gggtttgcatattcatggattgatgatg 42997  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 42066 - 41733
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  42066 taaggtaagggggttggtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 41967  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||   |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||     
T  41966 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtcatattgttggtgaaattacatgctcaaatatgtaaaaatgataatttgtgaaa 41867  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||| | || |   |||||    
T  41866 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgctatggctgttaattgttgttgtagatgatg 41768  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||| |||| ||||||||||||||||||| ||||||    
T  41767 aatcattggttgggtatgcatattcatgaattgat 41733  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 25 - 364
Target Start/End: Original strand, 36836 - 37176
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 122  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||   || |||||| ||||||| ||||||||    
T  36836 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtgaaatttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgttaaattcg 36935  T
Q  123 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 222  Q
    |||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||   ||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||    
T  36936 tgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagcttgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtg 37035  T
Q  223 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 322  Q
    || |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| ||| |||||||||| ||| ||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  37036 aaaattgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgaatcttgttcaattgacgttatggctgttaattgatgttgtggttg 37134  T
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  37135 atgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 37176  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 7 - 57
Target Start/End: Original strand, 15348 - 15398
Alignment:
Q  7 gctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||    
T  15348 gctaatagttggagataattaaggtaagggggttagcattcatcataatca 15398  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 175; Significance: 4e-94; HSPs: 2)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 175; E-Value: 4e-94
Query Start/End: Original strand, 26 - 353
Target Start/End: Original strand, 247366 - 247694
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  247366 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 247465  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||  ||||||||| |||||||| ||| | | |||||||||||| |||    
T  247466 gctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgagggtgaaatttcatgttcaaataggaacaaatgataagttgtga 247565  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattga 323  Q
    | |||||||| ||  ||| ||||| | ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || ||||    
T  247566 aaattgtgctcaattggtaaattt-tgctaagttgttgttagattgagttatgattcttgttcaattgatgttatgactgttaattgatgttgtggttga 247664  T
Q  324 tgaataattgcttgggtatgcatattcatg 353  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  247665 tgaatcattgcttgggtatgcatattcatg 247694  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 34075 - 34107
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34075 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0195
Description:

Target: scaffold0195; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 29 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 19543 - 19206
Alignment:
Q  29 ggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||||    
T  19543 ggtaagggggttagtcttcatcataatcatcataatttttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgtgc 19444  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||     
T  19443 tccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaa 19344  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||   ||||| ||||| || |  ||||||    
T  19343 attgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttattgctgttaattgatgttgttgttgatg 19245  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19244 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 19206  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0195; HSP #2
Raw Score: 133; E-Value: 4e-69
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 21553 - 21290
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  ||||||||||||||||||||||||     
T  21553 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaa 21454  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||||| |||||| ||||||| |||||||||     
T  21453 atatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagttatgattcctgttcaattgatgttatt 21355  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  21354 gctgttaattgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 21290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 172; Significance: 2e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 172; E-Value: 2e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 26340 - 26678
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtg 124  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||| || ||||||||||||||||||    
T  26340 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatgatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatgtataattgttgctaaattcgtg 26439  T
Q  125 ctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaa 224  Q
    |||||||| || || ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||| ||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||    
T  26440 ctccaactttgatgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattattggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaa 26539  T
Q  225 gattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgat 324  Q
     ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || ||||||||    
T  26540 aattgttctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgat 26638  T
Q  325 gaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||| |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||    
T  26639 gaatcattgcttgggtatgcatattgatgaattgaggatg 26678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 8180 - 8327
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || |||||||||||||||||||||||| || || |||||| |||||||||||||||||| |||||     
T  8180 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattggtgataattgtatgattgttggtgaaattacaggttcaa 8279  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  |||||||||    
T  8280 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 171; Significance: 9e-92; HSPs: 2)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 9e-92
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 128095 - 128431
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  128095 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcttcattttgcaaattttcaaaagttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgc 128194  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    | ||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| || || |||  || |||||| ||||     
T  128195 ttcaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgtaaaggtgttaagttgtgaaa 128294  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||| ||  || |||||| |  || ||||||||||| ||||| | |||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| || |||||||||    
T  128295 attgtgctcaattggcgaattt-tgttaggttgttgttaa-ttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgttaatggatgttgtgattgatg 128392  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  128393 aataattgattgggtatgcatattcatgaattgatgatg 128431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 161; E-Value: 9e-86
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Original strand, 31700 - 31928
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||    
T  31700 tgttatgtttgaatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatattcatatatgcaaaaatgataagttatgaatattatgctcaa 31799  T
Q  237 ggggtgaatttctcct-aagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgct 335  Q
      |||||||||||||| ||||||||||| ||||||| |||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  31800 ttggtgaatttctcctaaagttgttgttgatttgagatgtgattcatgttcaattgatgttatgaatgttatttaatattatgattgatgaataattgct 31899  T
Q  336 tgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||    
T  31900 tgggtttgcatattcatggattaatgatg 31928  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 166; Significance: 9e-89; HSPs: 1)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 9e-89
Query Start/End: Original strand, 36 - 364
Target Start/End: Original strand, 4996 - 5324
Alignment:
Q  36 gggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg-attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactat 134  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||||||||||| |||||||| |    
T  4996 gggttagtctttatcataatcattatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttcataatggataattgttgctaaattcgtactccaactgt 5095  T
Q  135 gttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgcta 234  Q
    |  | ||||||||||||| |||||||||| || |||||  ||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| ||||||||     
T  5096 gacgatatgtttgtatgcgtgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaagtacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctc 5195  T
Q  235 aaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgc 334  Q
    ||  ||||||||| | | ||||||||||||   |||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || |||||||||||| |||||    
T  5196 aattggtgaattt-tgcaaagttgttgttagaatgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtgattgatgaatcattgc 5294  T
Q  335 ttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  5295 ttgggtatgcatattcatgaattgaggatg 5324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 163; Significance: 6e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 6e-87
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Original strand, 123087 - 123427
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcatttt-gtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcg 122  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||| ||||| |||||||| |||||||||||||||||||   || |||||| ||||||||||||||||    
T  123087 taaggtaagggggttagtcttcaccataatcatcataatttttgtaaatttgcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcg 123186  T
Q  123 tgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatg 222  Q
    |||||||| | || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||    
T  123187 tgctccaattgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtg 123286  T
Q  223 aagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattg 322  Q
    || |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||||  || |||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || |||    
T  123287 aaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttagattaagttatgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgatgttgtggttg 123385  T
Q  323 atgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  123386 atgaataatggcttgggtatgcatattcatgaattgaagatg 123427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772 (Bit Score: 162; Significance: 2e-86; HSPs: 2)
Name: scaffold0772
Description:

Target: scaffold0772; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 2e-86
Query Start/End: Original strand, 107 - 340
Target Start/End: Complemental strand, 5785 - 5552
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |    
T  5785 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgta 5686  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  5685 aaaatgataagtcatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 5586  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggt 340  Q
    ||||||| ||||||| ||||||||||||||||||    
T  5585 tttgataatatgattaatgaataattgcttgggt 5552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0772; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5878 - 5846
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  5878 taaggtaagggggttagtctttaccataatcat 5846  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0116 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0116
Description:

Target: scaffold0116; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 283 - 35
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgata 215  Q
    ||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||||||||    
T  283 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaatgata 184  T
Q  216 agttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 315  Q
    ||||||| | |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  183 agttatgtatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatatt 84  T
Q  316 atgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    |||||| |||||||||||||||||| |||||||||||| |||| |||||    
T  83 atgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatgaattgttgatg 35  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 157; Significance: 2e-83; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 157; E-Value: 2e-83
Query Start/End: Original strand, 26 - 358
Target Start/End: Complemental strand, 272362 - 272031
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||| | | ||||||||| ||| |    
T  272362 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatattgtataaattttgattatggataaatattgctaaatacgtac 272263  T
Q  126 tccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaag 225  Q
    ||||||| |  || |||||||||||| ||||||||||| || |||||| |||| ||| ||||||||||||||| ||| | | |||||||||||| ||||     
T  272262 tccaactgtaatgatatgtttgtatgaatgaattgatgataattgtatgattgatggagaaattacatgttcaaataggaacaaatgataagttgtgaaa 272163  T
Q  226 attgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatg 325  Q
    |||||||||||  ||||||||| | ||||||||| |||   ||||||| |||||||||||||| || ||||||   ||||| ||||| || || ||||||    
T  272162 attgtgctaaattggtgaattt-tgctaagttgtggttggattgagttatgattcttgttcaattggtgttatagctgttaattgatgttgtggttgatg 272064  T
Q  326 aataattgcttgggtatgcatattcatggattg 358  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||| ||||    
T  272063 aatcattgcttgggtatgcatattcatgaattg 272031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 2)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48443 - 48187
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || || |    
T  48443 attgttgctaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgta 48344  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||  ||||||    
T  48343 aaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgttaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatagatgtta 48245  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  48244 attgatgttgtgattgatgaataattgcctgggtatgcatattcatggattgatgatg 48187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 20538 - 20493
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  20538 tagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 20493  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 146; Significance: 8e-77; HSPs: 3)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 116 - 364
Target Start/End: Original strand, 64527 - 64780
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaatt-----gatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 210  Q
    ||||||||||||   || || |||||||||| ||||||||||||     |||| |  |||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| |||||    
T  64527 aaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttatatgcatgaattatattgatgatgattgtatgattgttggtgaaattacatgtttaaatatgtaaaaa 64626  T
Q  211 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 310  Q
    |||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  64627 tgataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagatgtgatgcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 64726  T
Q  311 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  64727 atattatgattaatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgttgatg 64780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 146; E-Value: 8e-77
Query Start/End: Original strand, 107 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 108003 - 107747
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||| ||||||||||||||||||| |  || |||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  108003 attgttactaaattcgtgctccaactgtaatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatgtgca 107904  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgtta 306  Q
    ||||||||||||| | || |||||||| ||  ||||||||| |  |||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||||||| ||||||    
T  107903 aaaatgataagttgtaaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgataagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatggatgtta 107805  T
Q  307 tttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||||| || |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  107804 attgatgttgtgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggattgatgatg 107747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #3
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 115 - 157
Target Start/End: Original strand, 89863 - 89905
Alignment:
Q  115 taaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  89863 taaattcgtgctccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 89905  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 139; Significance: 1e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 1e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 246
Target Start/End: Original strand, 51110 - 51328
Alignment:
Q  28 aggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgctc 127  Q
    |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||    
T  51110 aggtaaggagattagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttgctaaattcgtgctc 51209  T
Q  128 caactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagat 227  Q
    ||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||  |||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| |||| ||    
T  51210 caactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtaagattgttggtgaaattacatgttcaaataggtaaaaatgataagttgtgaaaat 51309  T
Q  228 tgtgctaaaggggtgaatt 246  Q
    |||||| ||  ||||||||    
T  51310 tgtgctcaattggtgaatt 51328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 111 - 364
Target Start/End: Original strand, 21115 - 21367
Alignment:
Q  111 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||    | || |||||||||||||| ||| |||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||||| ||||| |||||    
T  21115 ttgctaaattcgtgctcttgttgtgatgttatgtttgtatccattaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaa 21214  T
Q  211 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttg 310  Q
    ||||||||||||||||||| ||| ||  ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21215 tgataagttatgaagattgagctcaattggtgaattt-tcctaagttgttgttaatttgagattggattcttgttcaattgatgttatgaatgttatttg 21313  T
Q  311 atattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    || |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||||||    
T  21314 atgttatgattgatgaataattgcttgagtttgcatattcatggattaatgatg 21367  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139; HSP #2
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 137 - 364
Target Start/End: Original strand, 14086 - 14312
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || || ||| |||||| ||||||||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  14086 tgttatgtctgtatgcatgaattgatgataattatatgattgttagtgaaattacatgttgaaatatgtaaaaatgataagttatgaagattgtgctcaa 14185  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |  ||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14186 ttggtgaattt-tcctaagttgttgataatttgagattggattcttgttcaattaatgttatgaatgttgtttgatgttatgattgatgaataattgctt 14284  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    | || |||||||||||||||||||||||    
T  14285 gagtttgcatattcatggattgatgatg 14312  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025 (Bit Score: 138; Significance: 5e-72; HSPs: 3)
Name: scaffold0025
Description:

Target: scaffold0025; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 5e-72
Query Start/End: Original strand, 74 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 149012 - 148721
Alignment:
Q  74 tttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgt 171  Q
    ||||||||||||||||||||||   || || ||| ||||||| |||||| ||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || ||||    
T  149012 tttcaaatgttgtatgaatttttgcataattgataattgttgttaaatttgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgt 148913  T
Q  172 ataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgag 271  Q
    |  |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  148912 aagattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttaatttgag 148814  T
Q  272 ttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     | |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||  || || ||||||||| |||||||||||||| ||||||||| ||||||||||    
T  148813 atttgattcttgttcaattgatgttatggttgttaattgaagttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgtatattcatgaattgatgatg 148721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #2
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 26 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9192 - 8849
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcat----tttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgatta--tggatgattgttgctaaat 119  Q
    ||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||||    |||| || ||||||||||| ||||| |||||   ||  ||||| |||||||||||||    
T  9192 taaggtaagtgtgttagtcttcatcataatcatcatcatcatttttgcaatttttcaaatgtggtatgtatttttcataattggataattgttgctaaat 9093  T
Q  120 tcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagtt 219  Q
    |||||||||| || || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||||  |||||    
T  9092 tcgtgctccatctgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaatgtgaagtt 8993  T
Q  220 atgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatga 319  Q
     |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||  ||||||| |||||||||   | ||| ||||| || |      
T  8992 gtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattaatgttcaattgatgttattgctattaattgatgttgttg 8894  T
Q  320 ttgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||| ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  8893 ttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatgaattgatgatg 8849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0025; HSP #3
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 26 - 126
Target Start/End: Complemental strand, 146938 - 146838
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgattatggatgattgttgctaaattcgtgc 125  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| |||||||| |||    
T  146938 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttgcttatggataattgttcctaaattcatgc 146839  T
Q  126 t 126  Q
    |    
T  146838 t 146838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 123; Significance: 4e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 4e-63
Query Start/End: Original strand, 150 - 364
Target Start/End: Original strand, 5254 - 5466
Alignment:
Q  150 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttct 249  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| | ||  ||||||||| |    
T  5254 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttatgaaaattgtgttcaattggtgaattt-t 5352  T
Q  250 cctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatatt 349  Q
     || |||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||||||||| ||||||||    
T  5353 gctgagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttgtgattaatgaataattgcttgggt-tgcatatt 5451  T
Q  350 catggattgatgatg 364  Q
    |||||||||||||||    
T  5452 catggattgatgatg 5466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 150 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 3936 - 3722
Alignment:
Q  150 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa-tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttc 248  Q
    |||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||| | ||||||   ||  |||||||||     
T  3936 tgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaaatgataagttatggaaattgtgtccaattggtgaattt- 3838  T
Q  249 tcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatat 348  Q
    | ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||| |||||||    
T  3837 tgctaagttgttgttaatttgagatttgattcttgttcaattgatgttatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattacttgggtttgcatat 3738  T
Q  349 tcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||||||||||||    
T  3737 tcatggattgatgatg 3722  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 3)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 26 - 246
Target Start/End: Original strand, 89378 - 89600
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaattttg--attatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||   || |||||| |||||||||||||||||    
T  89378 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttctatgaatttttgcataatggataattgttgctaaattcgt 89477  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatga 223  Q
    ||||||||| || || ||| |||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||| | | |||| ||||||| |||    
T  89478 gctccaactgtgatgatatatttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaataggaacaaattataagttgtga 89577  T
Q  224 agattgtgctaaaggggtgaatt 246  Q
    | |||||||| ||  ||||||||    
T  89578 aaattgtgctcaattggtgaatt 89600  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 77; E-Value: 1e-35
Query Start/End: Original strand, 26 - 151
Target Start/End: Original strand, 107708 - 107835
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttt--gattatggatgattgttgctaaattcgt 123  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   || |||||| ||| |||||||||||||    
T  107708 taaggtaagggggttagtcttcatcatgatcatcatcattttgtaaattttcaaatgttgtatgaatttttgcataatggataatttttgctaaattcgt 107807  T
Q  124 gctccaactatgttgttatgtttgtatg 151  Q
    ||||||||| || || ||| ||||||||    
T  107808 gctccaactgtgatgatatatttgtatg 107835  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 27 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 130911 - 130880
Alignment:
Q  27 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  130911 aaggtaagggggttagtctttatcataatcat 130880  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 116; Significance: 6e-59; HSPs: 2)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 360
Target Start/End: Original strand, 9374 - 9596
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  9374 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 9473  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  9474 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 9572  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  9573 gggtatgcatattcatgaattgat 9596  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 116; E-Value: 6e-59
Query Start/End: Original strand, 137 - 360
Target Start/End: Original strand, 16272 - 16494
Alignment:
Q  137 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaa 236  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||| || ||||| ||    
T  16272 tgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaatgataagttgtgaaaatggtgctcaa 16371  T
Q  237 ggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgctt 336  Q
      ||||||||| | ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| |||||||||||||||  ||||| ||||| || |  ||||||||| |||||||    
T  16372 ttggtgaattt-tgctaagttattgttaatttgagatttgattcttgctcaaatgatgttatggttgttaattgatgttgtagttgatgaatcattgctt 16470  T
Q  337 gggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||||||||||||||||| ||||||    
T  16471 gggtatgcatattcatgaattgat 16494  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1711 (Bit Score: 107; Significance: 1e-53; HSPs: 1)
Name: scaffold1711
Description:

Target: scaffold1711; HSP #1
Raw Score: 107; E-Value: 1e-53
Query Start/End: Original strand, 112 - 258
Target Start/End: Original strand, 1304 - 1450
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||||||||||||||   || || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1304 tgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtatgattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 1403  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttg 258  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||  ||||||||||||||||||||    
T  1404 gataagttatgaatattgtgctcaattggtgaatttctcctaagttg 1450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1542 (Bit Score: 105; Significance: 2e-52; HSPs: 1)
Name: scaffold1542
Description:

Target: scaffold1542; HSP #1
Raw Score: 105; E-Value: 2e-52
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 534 - 797
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  534 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactgtgatgatatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 633  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    ||| | | ||||||| |||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | |||||||  |||||  || |||| ||||||||||| || ||||||||||    
T  634 ataggaacaaatgatgagttgtgaaaattgtactcaattggtgaattt-tgctaagttactgttagattaagttatgattcttgtttaattgatgttatg 732  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      || || ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||| | ||||| ||||    
T  733 gctgctaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcaggaattgaggatg 797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0075 (Bit Score: 94; Significance: 8e-46; HSPs: 1)
Name: scaffold0075
Description:

Target: scaffold0075; HSP #1
Raw Score: 94; E-Value: 8e-46
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 34460 - 34724
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||| ||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  34460 atggataattattgctaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 34559  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttat 298  Q
     | || ||||||   ||||| |||| ||||| || ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||    
T  34560 ttgtgtaaaaatatgaagttgtgaaaattgttctcaataggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttat 34658  T
Q  299 gaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
       ||||||||||| || |  ||||||||| | | |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34659 tgttgttatttgatgttgttgttgatgaatcactacttgggtatgcatattcatggattgatgatg 34724  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078 (Bit Score: 86; Significance: 5e-41; HSPs: 3)
Name: scaffold0078
Description:

Target: scaffold0078; HSP #1
Raw Score: 86; E-Value: 5e-41
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Original strand, 37066 - 37328
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  37066 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 37165  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||  |  | ||||| |||   ||||| | |||||||||| ||| ||||||| |     
T  37166 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaatttgac--atgttgtagttggattgagctatgattcttgtgcaattgatgttgtt 37263  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
     ||| || | ||| || |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  37264 gatgctaatagatgttgtagttgatgaatcattgcttgggtatacatattcatggattgatgatg 37328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 41689 - 41632
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  41689 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 41632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0078; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 36980 - 37012
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36980 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 37012  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125 (Bit Score: 85; Significance: 2e-40; HSPs: 2)
Name: scaffold0125
Description:

Target: scaffold0125; HSP #1
Raw Score: 85; E-Value: 2e-40
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 41911 - 41648
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||| ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  41911 atggataattgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 41812  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||| | ||  ||||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  41811 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgttcaattggtgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 41713  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      |||||  |||| || |  ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41712 gttgttaaatgatgttgttgttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 41648  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0125; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 66
Target Start/End: Complemental strand, 41997 - 41957
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattt 66  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||    
T  41997 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcatgttcattt 41957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0529 (Bit Score: 83; Significance: 3e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0529
Description:

Target: scaffold0529; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 3e-39
Query Start/End: Original strand, 111 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 3215 - 2966
Alignment:
Q  111 ttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaa 210  Q
    |||||||||||||||||   || || |||||||||||||| |||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| |||||    
T  3215 ttgctaaattcgtgctcttgctgtgatgttatgtttgtatccatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaattatgtaaaaa 3116  T
Q  211 tgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttg-ttcaaatgatgttatgaatgttattt 309  Q
    ||  ||||| |||| |||||||| ||  ||||||||| | ||||||||||||| | ||||| | |||||| || || || |||||||||   ||||||||    
T  3115 tgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattggtgaattt-tgctaagttgttgttgaattgagatatgattcatgttttaattgatgttattgttgttattt 3017  T
Q  310 gatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgat 360  Q
    ||| || |  ||||||||| | |||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  3016 gatgttgttgttgatgaatcactgcttgtgtatgcatattcatgaattgat 2966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132 (Bit Score: 81; Significance: 5e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0132
Description:

Target: scaffold0132; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 5e-38
Query Start/End: Original strand, 100 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 13769 - 13506
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||||||||||||||     
T  13769 atggataattgttgctaaattcgtgctctaactttgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaa 13670  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatg 299  Q
     |||| |||||||  ||||| |||| |||||||| ||  | ||||||| | ||| ||||||||| | ||  | || ||  | ||||||| ||||||| |     
T  13669 ttatgtaaaaatgtgaagttgtgaaaattgtgctcaattgatgaattt-tgctatgttgttgttgaattatgatgagaaccatgttcaattgatgttgtt 13571  T
Q  300 aatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
      ||||| ||||| || |  ||||||||| ||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||    
T  13570 gttgttaattgatgttgttgttgatgaatcatgacttgggtatgcatattcatgaattgacgatg 13506  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #2
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 42731 - 42677
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||   |||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  42731 gctagagctaatagttggagataa---aggtaagggggttagtttttatcataatcat 42677  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0132; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 13856 - 13824
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  13856 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 13824  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1560 (Bit Score: 79; Significance: 7e-37; HSPs: 1)
Name: scaffold1560
Description:

Target: scaffold1560; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 7e-37
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Original strand, 9 - 115
Alignment:
Q  258 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 357  Q
    |||||||||||||  | ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  9 gttgttaatttgatatttgattcttgttcaaatgatattatgaatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 108  T
Q  358 gatgatg 364  Q
    |||||||    
T  109 gatgatg 115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 75; Significance: 2e-34; HSPs: 1)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 258 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 48620 - 48514
Alignment:
Q  258 gttgttaatttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggatt 357  Q
    |||||||||||||| | |||||||||||||  |||||||||| |||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  48620 gttgttaatttgagatttgattcttgttcacttgatgttatggatgttaattgatgttatgattgatgaataattgcttgggtttgcatattcatggatt 48521  T
Q  358 gatgatg 364  Q
    |||||||    
T  48520 gatgatg 48514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 73; Significance: 3e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 73; E-Value: 3e-33
Query Start/End: Original strand, 112 - 268
Target Start/End: Original strand, 13325 - 13480
Alignment:
Q  112 tgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgcaaaaat 211  Q
    ||||| ||||||||||  | | || ||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||    
T  13325 tgctagattcgtgctcttagtgtgatgttatgtttgtatgcatgaattgatgataattgtatgattgttggtgaaattacatgttcaaatatgtaaaaat 13424  T
Q  212 gataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaatttctcctaagttgttgttaattt 268  Q
    |||||||| |||| || ||||| ||  ||||||||| | ||||||| ||||||||||    
T  13425 gataagttgtgaaaatggtgctcaattggtgaattt-tgctaagttattgttaattt 13480  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 4)
Name: scaffold0141
Description:

Target: scaffold0141; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 27058 - 26911
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  27058 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 26959  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  26958 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 26911  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #2
Raw Score: 69; E-Value: 7e-31
Query Start/End: Original strand, 107 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 22796 - 22656
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcatatatgca 206  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||   |||||      
T  22796 attgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttgaatatgtg 22697  T
Q  207 aaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  22696 aaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 22656  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #3
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 22889 - 22857
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22889 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 22857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0141; HSP #4
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 27144 - 27112
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27144 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 27112  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 72; Significance: 1e-32; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 1e-32
Query Start/End: Original strand, 100 - 247
Target Start/End: Original strand, 1582 - 1729
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttcat 199  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||  || |||||| ||||||||| ||||||||||||       
T  1582 atggataattgttgctaaattcgtgctccaactttgatgatatgtttgtatgcatgaattgataataattgtatgattgttggttaaattacatgtttga 1681  T
Q  200 atatgcaaaaatgataagttatgaagattgtgctaaaggggtgaattt 247  Q
    |||||  ||||||| |||||||||| ||||||| ||| || |||||||    
T  1682 atatgtgaaaatgaaaagttatgaaaattgtgcaaaatggatgaattt 1729  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 1496 - 1528
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1496 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 1528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0622 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 1)
Name: scaffold0622
Description:

Target: scaffold0622; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 267 - 364
Target Start/End: Complemental strand, 9479 - 9382
Alignment:
Q  267 ttgagttgtgattcttgttcaaatgatgttatgaatgttatttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatgatg 364  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||||  ||||| ||||| || || ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  9479 ttgagttatgattcttgttcaattgatgttatggctgttaattgatgttgtggttgatgaatcattgcttgggtatgcatattcatgaattgatgatg 9382  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0361
Description:

Target: scaffold0361; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 100 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 3453 - 3360
Alignment:
Q  100 atggatgattgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacat 193  Q
    |||||| |||| |||||||||||||||| | || || ||||| ||||||||||||||||| ||| || |||||| |||||||||||||||||||    
T  3453 atggataattgatgctaaattcgtgctctagctgtgatgttaagtttgtatgcatgaattaatgatatttgtatgattgttggtgaaattacat 3360  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0361; HSP #2
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 308 - 362
Target Start/End: Complemental strand, 3264 - 3210
Alignment:
Q  308 ttgatattatgattgatgaataattgcttgggtatgcatattcatggattgatga 362  Q
    ||||| || |||||||||||| |||| ||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  3264 ttgatgttgtgattgatgaatcattgtttgggtaggcatattcatgaattgatga 3210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 1)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 5 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 80240 - 80187
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  80240 gagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 80187  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 47; Significance: 9e-18; HSPs: 2)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 162053 - 162111
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 59  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  162053 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 162111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016; HSP #2
Raw Score: 47; E-Value: 9e-18
Query Start/End: Original strand, 1 - 59
Target Start/End: Original strand, 166139 - 166197
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 59  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  166139 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcatc 166197  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 2)
Name: scaffold0686
Description:

Target: scaffold0686; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 5752 - 5809
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5752 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 5809  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0686; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 5958 - 6015
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||    
T  5958 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagttttcatcataatcat 6015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0184 (Bit Score: 46; Significance: 4e-17; HSPs: 1)
Name: scaffold0184
Description:

Target: scaffold0184; HSP #1
Raw Score: 46; E-Value: 4e-17
Query Start/End: Original strand, 1 - 58
Target Start/End: Original strand, 31155 - 31212
Alignment:
Q  1 gctagagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||    
T  31155 gctagagctaatagttggagataattaaggtaagggggttagtttttatcacaatcat 31212  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000006; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000006
Query Start/End: Original strand, 5 - 59
Target Start/End: Original strand, 331 - 385
Alignment:
Q  5 gagctagtagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatcatc 59  Q
    |||||| ||||||| |||||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||    
T  331 gagctaatagttggtgataattaaggtaacggggttattctttatcataatcatc 385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000002
Query Start/End: Original strand, 107 - 196
Target Start/End: Original strand, 56106 - 56195
Alignment:
Q  107 attgttgctaaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 196  Q
    ||||||| ||||||||||||| |||| || |||||| || || ||||||| |||||| || |||||| ||||| | ||||||||||||||    
T  56106 attgttgttaaattcgtgctctaactgtgatgttattttcgtgtgcatgatttgatgataattgtatgattgtggctgaaattacatgtt 56195  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0123 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0123
Description:

Target: scaffold0123; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000003
Query Start/End: Original strand, 116 - 198
Target Start/End: Complemental strand, 8257 - 8174
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatg-aattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||| ||||||| || |||||||||||||||| |||||||| || ||| ||  ||||||||||| || ||||||||    
T  8257 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaaattgatgataattgaattgttgttggtgaatttgcatgttca 8174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 35; Significance: 0.0000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000001
Query Start/End: Original strand, 117 - 198
Target Start/End: Original strand, 2317 - 2399
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa-ttgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgttca 198  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||| ||| || || ||| ||  |||||||||||||| ||||||||    
T  2317 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaagttgttgataattgaattgttgttggtgaaatttcatgttca 2399  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1164 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold1164
Description:

Target: scaffold1164; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 1746 - 1701
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  1746 tagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 1701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Complemental strand, 139 - 94
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  139 tagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 94  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 19836 - 19881
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  19836 tagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 19881  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 12 - 57
Target Start/End: Original strand, 24140 - 24185
Alignment:
Q  12 tagttggagataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  24140 tagttggtgataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 24185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000005
Query Start/End: Original strand, 25 - 58
Target Start/End: Original strand, 193396 - 193429
Alignment:
Q  25 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  193396 ttaaggtaagggggttagtctttatcataatcat 193429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0706 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0706
Description:

Target: scaffold0706; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 6443 - 6475
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  6443 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 6475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0597 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0597
Description:

Target: scaffold0597; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 878 - 910
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  878 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 910  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 9882 - 9914
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9882 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 9914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0251 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0251
Description:

Target: scaffold0251; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 13285 - 13317
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13285 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 13317  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 57392 - 57424
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  57392 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 57424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 70307 - 70348
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||    
T  70307 aaattcgtactccaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 70348  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000002; HSPs: 2)
Name: scaffold0032
Description:

Target: scaffold0032; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 55936 - 55904
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55936 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 55904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0032; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000002
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 108075 - 108107
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108075 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 108107  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0207 (Bit Score: 32; Significance: 0.000000008; HSPs: 1)
Name: scaffold0207
Description:

Target: scaffold0207; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.000000008
Query Start/End: Original strand, 26 - 69
Target Start/End: Complemental strand, 18058 - 18015
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcatcatcattttgt 69  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||    
T  18058 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcataattattttgt 18015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0066
Description:

Target: scaffold0066; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000003
Query Start/End: Original strand, 150 - 196
Target Start/End: Complemental strand, 45244 - 45198
Alignment:
Q  150 tgcatgaattgatgttagttgtataattgttggtgaaattacatgtt 196  Q
    |||||||||||||| || |||||| ||||| ||||||||||||||||    
T  45244 tgcatgaattgatgataattgtatgattgtgggtgaaattacatgtt 45198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0066; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 45370 - 45338
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  45370 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 45338  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0456
Description:

Target: scaffold0456; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 1546 - 1587
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  1546 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 1587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0456; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 116 - 157
Target Start/End: Original strand, 8691 - 8732
Alignment:
Q  116 aaattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||| ||||||| || ||||||||||||||||||    
T  8691 aaattcgtgctctaactatgatgatatgtttgtatgcatgaa 8732  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310 (Bit Score: 30; Significance: 0.0000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0310
Description:

Target: scaffold0310; HSP #1
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 4 - 41
Alignment:
Q  20 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  4 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 41  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0310; HSP #2
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000001
Query Start/End: Original strand, 20 - 57
Target Start/End: Original strand, 6298 - 6335
Alignment:
Q  20 gataattaaggtaagggggttagtctttatcataatca 57  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  6298 gataattaaggtaagggggttagtgttcatcataatca 6335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0589 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0589
Description:

Target: scaffold0589; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 8051 - 8011
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  8051 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 8011  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 17209 - 17241
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  17209 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 17241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0335 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0335
Description:

Target: scaffold0335; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 5476 - 5508
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5476 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0303 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0303
Description:

Target: scaffold0303; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 4346 - 4378
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  4346 taaggtaagggggttagactttatcataatcat 4378  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 17304 - 17336
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17304 taaggtaagcgggttagtctttatcataatcat 17336  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0173 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0173
Description:

Target: scaffold0173; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Complemental strand, 5581 - 5549
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  5581 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 5549  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0118 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0118
Description:

Target: scaffold0118; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 34308 - 34340
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  34308 taaggtaagggggttagtcttcatcataatcat 34340  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 117 - 157
Target Start/End: Complemental strand, 3565 - 3525
Alignment:
Q  117 aattcgtgctccaactatgttgttatgtttgtatgcatgaa 157  Q
    |||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||||||    
T  3565 aattcgtgctccaattatgatgttatgtttgaatgcatgaa 3525  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0039 (Bit Score: 29; Significance: 0.0000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0039
Description:

Target: scaffold0039; HSP #1
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000005
Query Start/End: Original strand, 26 - 58
Target Start/End: Original strand, 12418 - 12450
Alignment:
Q  26 taaggtaagggggttagtctttatcataatcat 58  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  12418 taaggtaagggggttagtttttatcataatcat 12450  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University