View Alignment

This page shows all the targets hit by the same query that passed the project filter. Click a track to view the detailed alignment.

Legend
 Query
 Query hiting target  Query hiting target's complemental strand
 Query's complemental strand hiting target  Query's complemental strand hiting target's complemental strand

Alignment Overview

Query: NF15629_high_2 (Length: 497)

Name: NF15629_high_2
Description: NF15629
Algorithm: BLASTN 2.2.26 [Sep-21-2011]
Database: JCVI.Medtr.v4.20130313.fasta (1949 entries, 411831487 letters)


[»] NF15629_high_2
NF15629_high_2
[»] chr7 (55 HSPs)
chr7 (22-469)||(14956459-14956906)
chr7 (22-469)||(11551020-11551467)
chr7 (22-469)||(12689407-12689854)
chr7 (22-469)||(11235131-11235578)
chr7 (22-469)||(15158975-15159422)
chr7 (22-469)||(8709510-8709957)
chr7 (22-469)||(14334301-14334748)
chr7 (22-469)||(10872595-10873042)
chr7 (22-470)||(15267-15715)
chr7 (30-469)||(44789269-44789708)
chr7 (28-469)||(18179656-18180097)
chr7 (99-469)||(13688023-13688393)
chr7 (28-470)||(15146801-15147244)
chr7 (123-469)||(18588089-18588435)
chr7 (34-466)||(14041612-14042044)
chr7 (34-466)||(14351642-14352074)
chr7 (228-470)||(9590479-9590721)
chr7 (28-469)||(48813170-48813610)
chr7 (28-470)||(15100498-15100940)
chr7 (28-448)||(12204717-12205137)
chr7 (28-448)||(15626436-15626856)
chr7 (29-448)||(14262162-14262580)
chr7 (28-448)||(19149123-19149541)
chr7 (28-448)||(20748522-20748940)
chr7 (28-440)||(16070222-16070632)
chr7 (22-466)||(14139585-14140029)
chr7 (28-470)||(13675364-13675806)
chr7 (28-448)||(16948389-16948809)
chr7 (22-466)||(23503769-23504213)
chr7 (28-470)||(13023269-13023711)
chr7 (28-193)||(11770435-11770600)
chr7 (28-470)||(11386324-11386766)
chr7 (63-470)||(12458587-12458994)
chr7 (63-470)||(13966563-13966970)
chr7 (28-470)||(15342343-15342785)
chr7 (28-470)||(19614587-19615029)
chr7 (22-466)||(18051852-18052296)
chr7 (63-470)||(26116485-26116892)
chr7 (28-470)||(26092693-26093135)
chr7 (28-470)||(49154213-49154655)
chr7 (28-337)||(14284404-14284713)
chr7 (29-469)||(7825812-7826252)
chr7 (29-469)||(27105692-27106132)
chr7 (29-469)||(27172193-27172633)
chr7 (28-470)||(11301108-11301550)
chr7 (22-121)||(14213579-14213678)
chr7 (22-107)||(8200533-8200618)
chr7 (366-469)||(11770320-11770423)
chr7 (410-470)||(16727300-16727360)
chr7 (410-470)||(17704372-17704432)
chr7 (22-75)||(13687969-13688022)
chr7 (339-469)||(4442150-4442280)
chr7 (170-323)||(39210-39363)
chr7 (346-468)||(17925879-17926001)
chr7 (404-469)||(13379170-13379235)
[»] chr2 (44 HSPs)
chr2 (22-469)||(21143490-21143937)
chr2 (22-469)||(24875199-24875646)
chr2 (30-469)||(44384019-44384458)
chr2 (29-469)||(41606834-41607274)
chr2 (22-469)||(24263917-24264364)
chr2 (22-469)||(27372816-27373263)
chr2 (30-469)||(16926915-16927354)
chr2 (30-469)||(17000555-17000994)
chr2 (22-468)||(24711581-24712027)
chr2 (22-469)||(9485763-9486210)
chr2 (30-469)||(10870405-10870844)
chr2 (30-469)||(27219571-27220010)
chr2 (28-469)||(21323715-21324156)
chr2 (22-470)||(24677036-24677484)
chr2 (22-469)||(24705931-24706378)
chr2 (22-436)||(23189466-23189879)
chr2 (99-469)||(9337206-9337576)
chr2 (28-466)||(22734226-22734664)
chr2 (28-469)||(23106177-23106618)
chr2 (28-469)||(23073416-23073857)
chr2 (28-469)||(24818679-24819120)
chr2 (29-448)||(23112290-23112712)
chr2 (28-470)||(19650498-19650940)
chr2 (22-194)||(22323580-22323752)
chr2 (213-470)||(25255657-25255914)
chr2 (22-466)||(27789287-27789731)
chr2 (22-466)||(12575900-12576344)
chr2 (28-470)||(23098466-23098908)
chr2 (39-470)||(23278340-23278771)
chr2 (45-448)||(30209387-30209790)
chr2 (108-470)||(1065384-1065746)
chr2 (28-448)||(30010654-30011074)
chr2 (63-470)||(19717465-19717872)
chr2 (63-470)||(31832246-31832653)
chr2 (39-376)||(24950154-24950491)
chr2 (28-190)||(25264607-25264769)
chr2 (28-288)||(27208802-27209062)
chr2 (39-245)||(23295499-23295705)
chr2 (29-469)||(24829637-24830077)
chr2 (28-148)||(45534493-45534613)
chr2 (371-436)||(23611069-23611134)
chr2 (392-466)||(22280022-22280096)
chr2 (434-470)||(23204273-23204309)
chr2 (405-469)||(25130539-25130603)
[»] scaffold0431 (1 HSPs)
scaffold0431 (22-469)||(9313-9760)
[»] chr6 (60 HSPs)
chr6 (22-469)||(22828409-22828856)
chr6 (30-469)||(25114340-25114779)
chr6 (29-468)||(24293837-24294276)
chr6 (30-469)||(2872857-2873296)
chr6 (22-470)||(19866467-19866915)
chr6 (22-470)||(27563886-27564334)
chr6 (30-469)||(28261251-28261690)
chr6 (30-469)||(28284226-28284665)
chr6 (30-469)||(28340000-28340439)
chr6 (30-469)||(27189224-27189663)
chr6 (30-469)||(27259577-27260016)
chr6 (22-470)||(22435649-22436097)
chr6 (28-470)||(16925692-16926133)
chr6 (28-468)||(16961537-16961977)
chr6 (28-470)||(5837272-5837714)
chr6 (28-454)||(25763297-25763723)
chr6 (31-474)||(22760504-22760947)
chr6 (28-469)||(20633994-20634435)
chr6 (28-466)||(25607918-25608356)
chr6 (22-390)||(22444047-22444415)
chr6 (28-469)||(18405998-18406439)
chr6 (231-469)||(16573879-16574117)
chr6 (231-469)||(16621263-16621501)
chr6 (31-333)||(23080258-23080560)
chr6 (90-469)||(23085825-23086204)
chr6 (28-470)||(25769630-25770072)
chr6 (227-468)||(18183422-18183663)
chr6 (28-445)||(19881084-19881501)
chr6 (28-448)||(14377991-14378411)
chr6 (28-448)||(14379541-14379961)
chr6 (311-470)||(21755002-21755160)
chr6 (39-470)||(19454821-19455251)
chr6 (39-470)||(21473398-21473828)
chr6 (28-469)||(15461122-15461563)
chr6 (26-470)||(10466902-10467346)
chr6 (28-448)||(18796476-18796896)
chr6 (226-469)||(18963142-18963385)
chr6 (28-232)||(18196024-18196228)
chr6 (22-466)||(28280870-28281314)
chr6 (28-470)||(34643639-34644081)
chr6 (116-470)||(19436876-19437230)
chr6 (29-469)||(16380427-16380867)
chr6 (63-470)||(24366233-24366640)
chr6 (315-469)||(30679061-30679215)
chr6 (28-189)||(18965629-18965790)
chr6 (261-470)||(24516461-24516670)
chr6 (29-469)||(16648023-16648463)
chr6 (28-277)||(19487528-19487767)
chr6 (28-468)||(21568046-21568486)
chr6 (29-469)||(23998035-23998475)
chr6 (29-469)||(1646868-1647308)
chr6 (378-469)||(23080559-23080650)
chr6 (345-470)||(8761805-8761930)
chr6 (28-156)||(5295573-5295701)
chr6 (28-441)||(18450289-18450702)
chr6 (346-469)||(14130573-14130696)
chr6 (346-469)||(23025800-23025923)
chr6 (431-469)||(28311819-28311857)
chr6 (434-470)||(23496245-23496281)
chr6 (346-469)||(16100119-16100242)
[»] chr4 (42 HSPs)
chr4 (22-469)||(14682483-14682930)
chr4 (22-469)||(14301628-14302075)
chr4 (22-469)||(40474956-40475403)
chr4 (22-469)||(8051272-8051719)
chr4 (22-469)||(12478516-12478963)
chr4 (22-469)||(19776442-19776889)
chr4 (22-469)||(23957663-23958110)
chr4 (30-469)||(8388336-8388775)
chr4 (22-469)||(27713252-27713699)
chr4 (22-470)||(18225094-18225542)
chr4 (22-470)||(15145541-15145981)
chr4 (98-469)||(16234641-16235012)
chr4 (101-469)||(17092798-17093166)
chr4 (22-384)||(16353241-16353604)
chr4 (28-469)||(14849015-14849456)
chr4 (29-469)||(14696036-14696476)
chr4 (28-470)||(15001273-15001714)
chr4 (39-469)||(14161403-14161833)
chr4 (201-468)||(16218325-16218592)
chr4 (201-468)||(16221645-16221912)
chr4 (28-470)||(15357028-15357470)
chr4 (29-448)||(15072282-15072701)
chr4 (22-199)||(18613743-18613920)
chr4 (22-466)||(51604704-51605148)
chr4 (28-470)||(16149633-16150075)
chr4 (28-470)||(16153779-16154221)
chr4 (28-470)||(8707833-8708271)
chr4 (312-469)||(22631910-22632067)
chr4 (118-448)||(1647207-1647537)
chr4 (237-468)||(23443237-23443467)
chr4 (28-470)||(27902308-27902750)
chr4 (65-470)||(44659774-44660179)
chr4 (99-469)||(15257921-15258290)
chr4 (28-470)||(29451445-29451887)
chr4 (28-470)||(3262702-3263144)
chr4 (28-274)||(15323139-15323385)
chr4 (108-470)||(11205140-11205502)
chr4 (366-470)||(16251498-16251602)
chr4 (22-132)||(1640326-1640436)
chr4 (29-469)||(15291067-15291507)
chr4 (404-474)||(16353174-16353244)
chr4 (22-95)||(29037427-29037500)
[»] chr5 (48 HSPs)
chr5 (22-469)||(22349767-22350214)
chr5 (22-469)||(14997830-14998277)
chr5 (22-466)||(22330981-22331425)
chr5 (22-469)||(37289587-37290034)
chr5 (22-469)||(27612202-27612649)
chr5 (22-469)||(29474164-29474611)
chr5 (22-469)||(41772690-41773137)
chr5 (22-469)||(27520254-27520701)
chr5 (22-469)||(16358350-16358797)
chr5 (22-469)||(22136516-22136963)
chr5 (22-469)||(27683491-27683938)
chr5 (22-469)||(34568342-34568789)
chr5 (22-469)||(19771808-19772255)
chr5 (30-469)||(27666581-27667020)
chr5 (30-469)||(40710636-40711075)
chr5 (22-446)||(20801245-20801669)
chr5 (22-469)||(18780962-18781409)
chr5 (28-469)||(25428287-25428728)
chr5 (28-469)||(26736818-26737259)
chr5 (28-469)||(21337385-21337826)
chr5 (28-466)||(23473081-23473519)
chr5 (28-469)||(20466190-20466631)
chr5 (29-448)||(22234032-22234451)
chr5 (72-470)||(21562115-21562512)
chr5 (22-466)||(17267428-17267872)
chr5 (28-470)||(20823289-20823731)
chr5 (28-470)||(28893032-28893474)
chr5 (28-470)||(28921858-28922300)
chr5 (63-470)||(20344153-20344560)
chr5 (63-470)||(24796487-24796894)
chr5 (28-470)||(25849911-25850353)
chr5 (63-470)||(14885081-14885488)
chr5 (22-470)||(22463781-22464229)
chr5 (28-470)||(22504515-22504957)
chr5 (28-470)||(20777749-20778191)
chr5 (45-470)||(37541471-37541896)
chr5 (29-469)||(21935279-21935719)
chr5 (29-469)||(23507521-23507961)
chr5 (28-448)||(21408991-21409408)
chr5 (28-333)||(28914640-28914945)
chr5 (28-333)||(28929908-28930213)
chr5 (28-301)||(21679037-21679310)
chr5 (29-469)||(24583047-24583487)
chr5 (32-155)||(24618700-24618823)
chr5 (32-155)||(24714931-24715054)
chr5 (32-155)||(24747959-24748082)
chr5 (22-70)||(23442056-23442104)
chr5 (333-448)||(21676946-21677061)
[»] scaffold0454 (1 HSPs)
scaffold0454 (22-469)||(8885-9332)
[»] chr3 (73 HSPs)
chr3 (22-469)||(15400665-15401112)
chr3 (30-469)||(12888252-12888691)
chr3 (30-469)||(5108759-5109198)
chr3 (28-469)||(10007141-10007582)
chr3 (28-469)||(10907751-10908192)
chr3 (22-469)||(13254225-13254672)
chr3 (22-469)||(20060202-20060649)
chr3 (30-469)||(3687486-3687925)
chr3 (30-469)||(5423078-5423517)
chr3 (30-469)||(15346393-15346832)
chr3 (22-469)||(48426982-48427429)
chr3 (22-469)||(16637308-16637755)
chr3 (28-469)||(6602277-6602718)
chr3 (22-469)||(15587540-15587987)
chr3 (29-470)||(16805094-16805535)
chr3 (30-467)||(53383168-53383605)
chr3 (30-469)||(16754849-16755288)
chr3 (22-470)||(16693699-16694147)
chr3 (22-440)||(14874676-14875094)
chr3 (22-381)||(15723170-15723529)
chr3 (28-466)||(17491391-17491829)
chr3 (22-331)||(12499783-12500092)
chr3 (28-469)||(15261171-15261612)
chr3 (22-294)||(15340804-15341076)
chr3 (290-469)||(15357886-15358065)
chr3 (248-468)||(14579557-14579777)
chr3 (45-470)||(11959305-11959730)
chr3 (28-448)||(15229154-15229574)
chr3 (28-448)||(15235022-15235442)
chr3 (28-470)||(12179889-12180337)
chr3 (332-469)||(24185035-24185172)
chr3 (28-470)||(11950044-11950486)
chr3 (128-448)||(16826439-16826754)
chr3 (28-448)||(17187925-17188345)
chr3 (39-470)||(31693321-31693752)
chr3 (39-470)||(31940465-31940896)
chr3 (28-470)||(12358663-12359105)
chr3 (29-469)||(15013904-15014344)
chr3 (28-474)||(13318634-13319080)
chr3 (22-466)||(16379068-16379512)
chr3 (22-466)||(41179067-41179511)
chr3 (22-466)||(13943569-13944013)
chr3 (22-466)||(44778792-44779236)
chr3 (28-470)||(10418181-10418623)
chr3 (28-470)||(14088224-14088666)
chr3 (63-470)||(47125530-47125937)
chr3 (22-470)||(16834651-16835094)
chr3 (28-466)||(28755869-28756307)
chr3 (284-445)||(11888526-11888687)
chr3 (239-448)||(14291690-14291899)
chr3 (28-448)||(18132504-18132924)
chr3 (378-469)||(15714204-15714295)
chr3 (28-448)||(13970278-13970698)
chr3 (29-469)||(30139358-30139798)
chr3 (29-469)||(30148909-30149349)
chr3 (378-469)||(43164566-43164657)
chr3 (142-396)||(12269875-12270129)
chr3 (29-468)||(8272548-8272987)
chr3 (51-469)||(15948618-15949036)
chr3 (229-470)||(10407720-10407961)
chr3 (29-469)||(13965500-13965941)
chr3 (29-469)||(15611655-15612095)
chr3 (99-274)||(11889623-11889798)
chr3 (203-470)||(12510619-12510886)
chr3 (28-470)||(16327796-16328238)
chr3 (249-470)||(24189076-24189297)
chr3 (369-469)||(18437022-18437122)
chr3 (417-469)||(26791561-26791613)
chr3 (63-237)||(10385257-10385431)
chr3 (261-466)||(8745530-8745735)
chr3 (29-469)||(6151001-6151441)
chr3 (393-463)||(12272254-12272324)
chr3 (405-470)||(17200562-17200627)
[»] chr1 (44 HSPs)
chr1 (22-469)||(21838881-21839328)
chr1 (22-469)||(19108299-19108746)
chr1 (30-469)||(16348576-16349016)
chr1 (22-469)||(21832233-21832680)
chr1 (30-469)||(33389010-33389449)
chr1 (22-457)||(24792609-24793044)
chr1 (22-470)||(21233711-21234159)
chr1 (29-469)||(51331474-51331914)
chr1 (22-470)||(17042995-17043443)
chr1 (22-457)||(22503282-22503717)
chr1 (30-469)||(41351649-41352082)
chr1 (29-470)||(20140021-20140462)
chr1 (28-469)||(430097-430538)
chr1 (28-448)||(50618400-50618820)
chr1 (28-469)||(21750877-21751318)
chr1 (28-470)||(22360224-22360666)
chr1 (31-469)||(21862354-21862792)
chr1 (28-448)||(21743554-21743974)
chr1 (146-469)||(16378150-16378473)
chr1 (28-470)||(19661116-19661558)
chr1 (22-193)||(21026104-21026275)
chr1 (28-474)||(19856242-19856688)
chr1 (22-470)||(20854740-20855188)
chr1 (28-448)||(20833902-20834322)
chr1 (228-472)||(41310694-41310938)
chr1 (63-470)||(20296384-20296791)
chr1 (28-466)||(24097587-24098025)
chr1 (180-301)||(20944119-20944240)
chr1 (28-470)||(20938043-20938485)
chr1 (63-470)||(37679052-37679459)
chr1 (28-470)||(48424841-48425283)
chr1 (28-470)||(52987709-52988151)
chr1 (63-470)||(21952881-21953288)
chr1 (28-470)||(38910806-38911248)
chr1 (29-469)||(20829373-20829813)
chr1 (28-470)||(31537977-31538419)
chr1 (28-194)||(41308610-41308776)
chr1 (28-105)||(16378079-16378156)
chr1 (39-156)||(23196543-23196660)
chr1 (393-469)||(35930806-35930882)
chr1 (404-469)||(20527366-20527431)
chr1 (404-469)||(41215837-41215902)
chr1 (102-190)||(20927065-20927153)
chr1 (327-469)||(20927290-20927432)
[»] scaffold0109 (2 HSPs)
scaffold0109 (22-469)||(40100-40547)
scaffold0109 (22-474)||(14031-14484)
[»] scaffold0079 (4 HSPs)
scaffold0079 (22-470)||(35442-35891)
scaffold0079 (201-384)||(28225-28408)
scaffold0079 (28-470)||(2669-3111)
scaffold0079 (404-474)||(28405-28475)
[»] scaffold0028 (4 HSPs)
scaffold0028 (29-466)||(10428-10865)
scaffold0028 (29-466)||(16890-17327)
scaffold0028 (30-465)||(45106-45541)
scaffold0028 (28-448)||(48447-48867)
[»] chr8 (59 HSPs)
chr8 (30-469)||(17672375-17672814)
chr8 (22-469)||(18858559-18859006)
chr8 (22-469)||(20016615-20017062)
chr8 (22-469)||(22118527-22118974)
chr8 (22-469)||(22127311-22127758)
chr8 (22-470)||(30311495-30311943)
chr8 (22-470)||(15535365-15535813)
chr8 (22-470)||(22041809-22042257)
chr8 (22-470)||(21164889-21165337)
chr8 (22-470)||(22131392-22131840)
chr8 (28-470)||(32602132-32602575)
chr8 (22-470)||(19979949-19980397)
chr8 (30-469)||(19482424-19482855)
chr8 (28-448)||(23652029-23652449)
chr8 (28-469)||(21252932-21253373)
chr8 (28-469)||(21392213-21392654)
chr8 (28-469)||(21782772-21783213)
chr8 (28-469)||(21786707-21787148)
chr8 (22-469)||(22422244-22422691)
chr8 (28-468)||(19864446-19864887)
chr8 (28-468)||(22375806-22376246)
chr8 (28-466)||(22246788-22247226)
chr8 (28-384)||(21920185-21920541)
chr8 (28-470)||(29301777-29302219)
chr8 (31-469)||(23887015-23887457)
chr8 (28-448)||(21927415-21927836)
chr8 (28-247)||(22988718-22988937)
chr8 (28-448)||(20008294-20008714)
chr8 (42-470)||(31414820-31415248)
chr8 (28-466)||(20394488-20394926)
chr8 (31-466)||(23656918-23657353)
chr8 (205-469)||(22522711-22522975)
chr8 (28-439)||(19861423-19861834)
chr8 (22-184)||(19114672-19114834)
chr8 (28-470)||(21323630-21324071)
chr8 (63-470)||(16269575-16269982)
chr8 (22-466)||(31569198-31569641)
chr8 (31-470)||(20390090-20390516)
chr8 (270-467)||(22989275-22989472)
chr8 (317-469)||(21781539-21781691)
chr8 (28-470)||(22052851-22053293)
chr8 (261-448)||(19984401-19984588)
chr8 (63-470)||(4984065-4984472)
chr8 (63-470)||(28982934-28983341)
chr8 (63-470)||(28988153-28988560)
chr8 (63-470)||(27356559-27356966)
chr8 (63-387)||(6605681-6606005)
chr8 (29-469)||(16875447-16875887)
chr8 (345-470)||(22373173-22373298)
chr8 (63-277)||(22372954-22373168)
chr8 (29-469)||(21848689-21849129)
chr8 (407-470)||(22030470-22030533)
chr8 (255-470)||(22061030-22061245)
chr8 (63-304)||(14567165-14567406)
chr8 (29-469)||(20650707-20651147)
chr8 (170-323)||(19869823-19869976)
chr8 (346-469)||(23155394-23155517)
chr8 (404-469)||(16414455-16414520)
chr8 (404-469)||(21194892-21194957)
[»] scaffold0042 (2 HSPs)
scaffold0042 (22-470)||(37731-38179)
scaffold0042 (31-469)||(22661-23099)
[»] scaffold0029 (3 HSPs)
scaffold0029 (28-469)||(107723-108164)
scaffold0029 (28-472)||(114512-114956)
scaffold0029 (230-470)||(94805-95045)
[»] scaffold0080 (6 HSPs)
scaffold0080 (22-470)||(11150-11598)
scaffold0080 (22-466)||(30829-31273)
scaffold0080 (22-466)||(36294-36739)
scaffold0080 (78-469)||(53638-54029)
scaffold0080 (29-244)||(50044-50259)
scaffold0080 (392-470)||(13805-13883)
[»] scaffold0008 (5 HSPs)
scaffold0008 (33-468)||(85709-86144)
scaffold0008 (30-469)||(85142-85581)
scaffold0008 (327-469)||(132401-132543)
scaffold0008 (29-151)||(132719-132841)
scaffold0008 (102-190)||(25853-25941)
[»] scaffold0044 (2 HSPs)
scaffold0044 (30-470)||(16113-16553)
scaffold0044 (30-469)||(2375-2816)
[»] scaffold0017 (3 HSPs)
scaffold0017 (22-470)||(57962-58410)
scaffold0017 (28-424)||(195444-195840)
scaffold0017 (22-472)||(17975-18426)
[»] scaffold0031 (2 HSPs)
scaffold0031 (22-470)||(54902-55350)
scaffold0031 (29-468)||(109584-110023)
[»] scaffold0102 (2 HSPs)
scaffold0102 (58-468)||(51258-51668)
scaffold0102 (28-470)||(41650-42091)
[»] scaffold0081 (2 HSPs)
scaffold0081 (22-466)||(35973-36417)
scaffold0081 (22-466)||(20549-20993)
[»] scaffold0055 (1 HSPs)
scaffold0055 (126-469)||(21296-21639)
[»] scaffold0621 (1 HSPs)
scaffold0621 (28-469)||(3385-3826)
[»] scaffold0022 (5 HSPs)
scaffold0022 (31-469)||(40588-41026)
scaffold0022 (31-469)||(74308-74746)
scaffold0022 (28-448)||(55708-56128)
scaffold0022 (29-190)||(9017-9178)
scaffold0022 (393-469)||(8738-8814)
[»] scaffold0256 (1 HSPs)
scaffold0256 (28-360)||(23095-23427)
[»] scaffold0309 (2 HSPs)
scaffold0309 (28-469)||(16594-17035)
scaffold0309 (28-448)||(11746-12167)
[»] scaffold0243 (1 HSPs)
scaffold0243 (28-469)||(24857-25298)
[»] scaffold0138 (1 HSPs)
scaffold0138 (28-469)||(6999-7440)
[»] scaffold0023 (4 HSPs)
scaffold0023 (28-469)||(151063-151504)
scaffold0023 (29-469)||(2417-2857)
scaffold0023 (28-398)||(86722-87091)
scaffold0023 (22-62)||(27725-27765)
[»] scaffold0908 (1 HSPs)
scaffold0908 (31-469)||(691-1126)
[»] scaffold0647 (2 HSPs)
scaffold0647 (28-469)||(7571-8012)
scaffold0647 (28-469)||(2852-3293)
[»] scaffold0319 (1 HSPs)
scaffold0319 (28-468)||(719-1157)
[»] scaffold0120 (2 HSPs)
scaffold0120 (28-469)||(7973-8414)
scaffold0120 (405-469)||(24506-24570)
[»] scaffold2004 (1 HSPs)
scaffold2004 (28-469)||(725-1162)
[»] scaffold0312 (1 HSPs)
scaffold0312 (28-469)||(12-453)
[»] scaffold0575 (1 HSPs)
scaffold0575 (28-468)||(3534-3974)
[»] scaffold0324 (1 HSPs)
scaffold0324 (28-469)||(13123-13564)
[»] scaffold1602 (1 HSPs)
scaffold1602 (28-447)||(1-420)
[»] scaffold0358 (2 HSPs)
scaffold0358 (28-469)||(8002-8443)
scaffold0358 (28-469)||(17198-17639)
[»] scaffold0228 (1 HSPs)
scaffold0228 (28-469)||(20191-20632)
[»] scaffold0011 (3 HSPs)
scaffold0011 (29-469)||(24445-24885)
scaffold0011 (28-470)||(150522-150964)
scaffold0011 (28-136)||(193949-194057)
[»] scaffold0676 (1 HSPs)
scaffold0676 (22-388)||(7961-8327)
[»] scaffold0084 (1 HSPs)
scaffold0084 (28-469)||(7174-7615)
[»] scaffold0403 (1 HSPs)
scaffold0403 (29-469)||(8326-8765)
[»] scaffold1423 (1 HSPs)
scaffold1423 (28-469)||(1294-1735)
[»] scaffold0501 (1 HSPs)
scaffold0501 (22-355)||(4141-4474)
[»] scaffold0282 (1 HSPs)
scaffold0282 (28-466)||(14394-14832)
[»] scaffold0114 (3 HSPs)
scaffold0114 (31-469)||(18253-18691)
scaffold0114 (203-474)||(22002-22273)
scaffold0114 (326-466)||(39307-39447)
[»] scaffold0333 (1 HSPs)
scaffold0333 (28-469)||(17607-18042)
[»] scaffold0010 (4 HSPs)
scaffold0010 (28-457)||(3867-4296)
scaffold0010 (28-470)||(40244-40686)
scaffold0010 (228-466)||(45342-45580)
scaffold0010 (28-155)||(45626-45752)
[»] scaffold0026 (2 HSPs)
scaffold0026 (28-404)||(30898-31274)
scaffold0026 (28-448)||(50763-51183)
[»] scaffold0215 (3 HSPs)
scaffold0215 (72-417)||(28446-28772)
scaffold0215 (22-178)||(28774-28930)
scaffold0215 (438-470)||(28406-28438)
[»] scaffold0006 (1 HSPs)
scaffold0006 (28-468)||(103186-103618)
[»] scaffold0278 (1 HSPs)
scaffold0278 (29-457)||(405-832)
[»] scaffold0018 (3 HSPs)
scaffold0018 (28-469)||(10653-11094)
scaffold0018 (28-469)||(24210-24651)
scaffold0018 (28-356)||(16958-17286)
[»] scaffold0001 (3 HSPs)
scaffold0001 (35-469)||(494978-495412)
scaffold0001 (28-448)||(453146-453566)
scaffold0001 (28-470)||(515264-515706)
[»] scaffold0040 (2 HSPs)
scaffold0040 (28-469)||(16830-17270)
scaffold0040 (28-94)||(111775-111841)
[»] scaffold0270 (2 HSPs)
scaffold0270 (29-468)||(5825-6264)
scaffold0270 (29-468)||(12955-13394)
[»] scaffold0540 (1 HSPs)
scaffold0540 (32-360)||(6352-6680)
[»] scaffold0074 (2 HSPs)
scaffold0074 (28-468)||(5065-5504)
scaffold0074 (126-440)||(11172-11486)
[»] scaffold0293 (1 HSPs)
scaffold0293 (30-448)||(14423-14841)
[»] scaffold0342 (1 HSPs)
scaffold0342 (28-467)||(15135-15574)
[»] scaffold0413 (1 HSPs)
scaffold0413 (99-469)||(2623-2993)
[»] scaffold0012 (1 HSPs)
scaffold0012 (28-466)||(217335-217773)
[»] scaffold1985 (1 HSPs)
scaffold1985 (22-314)||(407-699)
[»] scaffold0181 (1 HSPs)
scaffold0181 (201-468)||(29828-30095)
[»] scaffold0393 (1 HSPs)
scaffold0393 (248-469)||(15906-16128)
[»] scaffold0331 (1 HSPs)
scaffold0331 (28-469)||(15890-16330)
[»] scaffold0083 (3 HSPs)
scaffold0083 (28-457)||(8958-9387)
scaffold0083 (367-457)||(1324-1414)
scaffold0083 (367-457)||(6628-6718)
[»] scaffold0509 (1 HSPs)
scaffold0509 (28-470)||(10781-11223)
[»] scaffold0004 (2 HSPs)
scaffold0004 (28-470)||(201379-201821)
scaffold0004 (28-440)||(324657-325069)
[»] scaffold0149 (3 HSPs)
scaffold0149 (249-466)||(1-218)
scaffold0149 (39-470)||(5262-5692)
scaffold0149 (39-470)||(9693-10123)
[»] scaffold0379 (1 HSPs)
scaffold0379 (28-466)||(5804-6242)
[»] scaffold0067 (4 HSPs)
scaffold0067 (63-469)||(28610-29016)
scaffold0067 (102-448)||(50113-50459)
scaffold0067 (102-448)||(59147-59493)
scaffold0067 (102-448)||(65535-65881)
[»] scaffold0130 (3 HSPs)
scaffold0130 (28-229)||(44795-44996)
scaffold0130 (28-301)||(8888-9161)
scaffold0130 (315-448)||(4822-4955)
[»] scaffold0865 (1 HSPs)
scaffold0865 (39-470)||(2183-2614)
[»] scaffold0133 (1 HSPs)
scaffold0133 (39-470)||(29196-29627)
[»] scaffold0523 (1 HSPs)
scaffold0523 (28-470)||(1822-2264)
[»] scaffold0122 (2 HSPs)
scaffold0122 (28-259)||(38070-38301)
scaffold0122 (404-469)||(41417-41482)
[»] scaffold0108 (1 HSPs)
scaffold0108 (38-448)||(49067-49477)
[»] scaffold0244 (1 HSPs)
scaffold0244 (28-448)||(19305-19725)
[»] scaffold0104 (2 HSPs)
scaffold0104 (28-470)||(24167-24609)
scaffold0104 (40-448)||(44350-44758)
[»] scaffold0035 (2 HSPs)
scaffold0035 (28-469)||(4702-5143)
scaffold0035 (30-469)||(42019-42458)
[»] scaffold0266 (2 HSPs)
scaffold0266 (31-448)||(16068-16485)
scaffold0266 (29-474)||(7768-8213)
[»] scaffold0297 (1 HSPs)
scaffold0297 (22-230)||(7844-8052)
[»] scaffold0049 (1 HSPs)
scaffold0049 (28-448)||(49808-50228)
[»] scaffold0751 (1 HSPs)
scaffold0751 (38-448)||(4139-4552)
[»] scaffold0106 (1 HSPs)
scaffold0106 (28-470)||(33287-33730)
[»] scaffold0993 (1 HSPs)
scaffold0993 (196-470)||(1-275)
[»] scaffold0476 (2 HSPs)
scaffold0476 (193-423)||(10284-10514)
scaffold0476 (28-424)||(1502-1898)
[»] scaffold0585 (1 HSPs)
scaffold0585 (31-448)||(5022-5439)
[»] scaffold0261 (2 HSPs)
scaffold0261 (28-470)||(13247-13689)
scaffold0261 (28-470)||(21426-21868)
[»] scaffold0304 (1 HSPs)
scaffold0304 (39-448)||(1418-1827)
[»] scaffold0192 (1 HSPs)
scaffold0192 (31-448)||(28481-28898)
[»] scaffold0100 (1 HSPs)
scaffold0100 (28-468)||(22099-22538)
[»] scaffold0009 (1 HSPs)
scaffold0009 (28-470)||(250573-251015)
[»] scaffold0560 (2 HSPs)
scaffold0560 (301-466)||(8657-8822)
scaffold0560 (246-305)||(10916-10975)
[»] scaffold0016 (1 HSPs)
scaffold0016 (31-448)||(176277-176694)
[»] scaffold0298 (1 HSPs)
scaffold0298 (28-470)||(9969-10410)
[»] scaffold0034 (2 HSPs)
scaffold0034 (28-442)||(2892-3306)
scaffold0034 (28-470)||(69323-69765)
[»] scaffold0124 (2 HSPs)
scaffold0124 (28-470)||(14153-14601)
scaffold0124 (29-469)||(5718-6160)
[»] scaffold0056 (1 HSPs)
scaffold0056 (22-178)||(3556-3712)
[»] scaffold0404 (1 HSPs)
scaffold0404 (28-415)||(6703-7090)
[»] scaffold1288 (1 HSPs)
scaffold1288 (28-470)||(766-1207)
[»] scaffold0405 (1 HSPs)
scaffold0405 (141-470)||(566-895)
[»] scaffold0053 (2 HSPs)
scaffold0053 (28-448)||(46967-47387)
scaffold0053 (28-448)||(55780-56200)
[»] scaffold0739 (1 HSPs)
scaffold0739 (22-181)||(999-1158)
[»] scaffold0206 (1 HSPs)
scaffold0206 (28-470)||(25066-25508)
[»] scaffold1477 (1 HSPs)
scaffold1477 (29-470)||(181-621)
[»] scaffold0148 (1 HSPs)
scaffold0148 (28-442)||(950-1364)
[»] scaffold0077 (2 HSPs)
scaffold0077 (76-470)||(19545-19939)
scaffold0077 (29-190)||(26457-26618)
[»] scaffold0054 (1 HSPs)
scaffold0054 (29-448)||(64452-64860)
[»] scaffold0445 (1 HSPs)
scaffold0445 (28-330)||(1900-2202)
[»] scaffold0190 (1 HSPs)
scaffold0190 (28-448)||(31252-31672)
[»] scaffold0139 (1 HSPs)
scaffold0139 (39-470)||(37612-38043)
[»] scaffold0007 (2 HSPs)
scaffold0007 (28-470)||(268561-269003)
scaffold0007 (30-469)||(84432-84870)
[»] scaffold0076 (4 HSPs)
scaffold0076 (28-470)||(31588-32030)
scaffold0076 (261-470)||(54322-54531)
scaffold0076 (29-469)||(42212-42652)
scaffold0076 (28-247)||(55034-55253)
[»] scaffold0020 (1 HSPs)
scaffold0020 (28-470)||(99473-99915)
[»] scaffold0037 (2 HSPs)
scaffold0037 (28-191)||(115171-115334)
scaffold0037 (256-469)||(114950-115163)
[»] scaffold0239 (1 HSPs)
scaffold0239 (72-470)||(10697-11095)
[»] scaffold0005 (1 HSPs)
scaffold0005 (28-470)||(262177-262619)
[»] scaffold0058 (2 HSPs)
scaffold0058 (28-469)||(27160-27600)
scaffold0058 (105-470)||(21150-21515)
[»] scaffold0420 (2 HSPs)
scaffold0420 (72-470)||(642-1038)
scaffold0420 (318-470)||(7857-8007)
[»] scaffold0046 (1 HSPs)
scaffold0046 (31-470)||(79742-80181)
[»] scaffold0126 (1 HSPs)
scaffold0126 (63-470)||(42905-43311)
[»] scaffold0090 (2 HSPs)
scaffold0090 (28-470)||(20802-21244)
scaffold0090 (28-268)||(24964-25204)
[»] scaffold0222 (2 HSPs)
scaffold0222 (28-470)||(9014-9456)
scaffold0222 (228-470)||(1400-1642)
[»] scaffold0730 (1 HSPs)
scaffold0730 (28-379)||(3-354)
[»] scaffold0165 (1 HSPs)
scaffold0165 (318-448)||(11201-11331)
[»] scaffold0072 (1 HSPs)
scaffold0072 (28-470)||(52998-53440)
[»] scaffold1373 (1 HSPs)
scaffold1373 (28-468)||(747-1187)
[»] scaffold0225 (1 HSPs)
scaffold0225 (29-469)||(25348-25788)
[»] scaffold0162 (3 HSPs)
scaffold0162 (29-469)||(14862-15302)
scaffold0162 (102-190)||(11365-11453)
scaffold0162 (405-466)||(11089-11150)
[»] scaffold0550 (1 HSPs)
scaffold0550 (351-472)||(11067-11189)
[»] scaffold1830 (1 HSPs)
scaffold1830 (28-253)||(947-1172)
[»] scaffold1715 (1 HSPs)
scaffold1715 (45-470)||(922-1347)
[»] scaffold0235 (2 HSPs)
scaffold0235 (28-470)||(9372-9810)
scaffold0235 (28-470)||(19586-20024)
[»] scaffold0088 (1 HSPs)
scaffold0088 (63-470)||(28921-29327)
[»] scaffold0170 (1 HSPs)
scaffold0170 (29-469)||(34039-34479)
[»] scaffold0285 (1 HSPs)
scaffold0285 (65-140)||(9215-9290)
[»] scaffold2111 (1 HSPs)
scaffold2111 (227-448)||(520-741)
[»] scaffold0177 (1 HSPs)
scaffold0177 (402-470)||(12267-12335)
[»] scaffold0180 (3 HSPs)
scaffold0180 (26-220)||(33914-34108)
scaffold0180 (39-241)||(380-582)
scaffold0180 (39-241)||(4700-4902)
[»] scaffold0708 (1 HSPs)
scaffold0708 (45-470)||(6056-6481)
[»] scaffold0060 (1 HSPs)
scaffold0060 (28-277)||(44736-44985)
[»] scaffold1646 (1 HSPs)
scaffold1646 (28-268)||(1277-1517)
[»] scaffold0894 (1 HSPs)
scaffold0894 (31-147)||(3882-3998)
[»] scaffold0348 (3 HSPs)
scaffold0348 (261-470)||(18394-18603)
scaffold0348 (28-424)||(9831-10242)
scaffold0348 (392-470)||(5760-5838)
[»] scaffold0089 (2 HSPs)
scaffold0089 (67-304)||(14790-15027)
scaffold0089 (39-241)||(416-618)
[»] scaffold0203 (1 HSPs)
scaffold0203 (102-301)||(12379-12578)
[»] scaffold0367 (1 HSPs)
scaffold0367 (28-301)||(16229-16502)
[»] scaffold0302 (2 HSPs)
scaffold0302 (29-470)||(165-606)
scaffold0302 (29-470)||(7107-7548)
[»] scaffold0146 (2 HSPs)
scaffold0146 (362-470)||(9865-9973)
scaffold0146 (362-470)||(17532-17640)
[»] scaffold0692 (1 HSPs)
scaffold0692 (339-468)||(1797-1926)
[»] scaffold0234 (1 HSPs)
scaffold0234 (28-121)||(23339-23432)
[»] scaffold0003 (1 HSPs)
scaffold0003 (28-145)||(195193-195310)
[»] scaffold0387 (1 HSPs)
scaffold0387 (404-468)||(16387-16451)
[»] scaffold0697 (1 HSPs)
scaffold0697 (28-95)||(6939-7006)
[»] scaffold0218 (3 HSPs)
scaffold0218 (399-469)||(26651-26721)
scaffold0218 (404-468)||(1865-1929)
scaffold0218 (31-190)||(2143-2302)
[»] scaffold0467 (2 HSPs)
scaffold0467 (392-469)||(1533-1610)
scaffold0467 (114-190)||(1812-1888)
[»] scaffold1488 (1 HSPs)
scaffold1488 (393-469)||(715-791)
[»] scaffold0876 (2 HSPs)
scaffold0876 (404-468)||(859-923)
scaffold0876 (102-190)||(1137-1225)
[»] scaffold0610 (1 HSPs)
scaffold0610 (402-469)||(4838-4905)
[»] scaffold0369 (1 HSPs)
scaffold0369 (339-466)||(7008-7135)
[»] scaffold0156 (1 HSPs)
scaffold0156 (31-130)||(36069-36168)
[»] scaffold0465 (1 HSPs)
scaffold0465 (392-469)||(13537-13614)
[»] scaffold0269 (1 HSPs)
scaffold0269 (29-85)||(2218-2274)
[»] scaffold0249 (1 HSPs)
scaffold0249 (28-112)||(242-326)
[»] scaffold0092 (1 HSPs)
scaffold0092 (405-469)||(422-486)
[»] scaffold0827 (1 HSPs)
scaffold0827 (228-323)||(5259-5354)
[»] scaffold0375 (1 HSPs)
scaffold0375 (435-470)||(2838-2873)
[»] scaffold0062 (1 HSPs)
scaffold0062 (45-244)||(8920-9119)
[»] scaffold1208 (1 HSPs)
scaffold1208 (227-301)||(1769-1843)


Alignment Details
Target: chr7 (Bit Score: 408; Significance: 0; HSPs: 55)
Name: chr7
Description:

Target: chr7; HSP #1
Raw Score: 408; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 14956459 - 14956906
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956459 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14956558  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956559 gacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 14956658  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14956659 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14956758  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956759 tctgcatattttcatcttttactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14956858  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14956859 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14956906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #2
Raw Score: 400; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11551467 - 11551020
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551467 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 11551368  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11551367 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggaataaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 11551268  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||    
T  11551267 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtct 11551168  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551167 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11551068  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11551067 aattcttggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11551020  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #3
Raw Score: 392; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 12689407 - 12689854
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689407 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 12689506  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12689507 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12689606  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| | ||||||||    
T  12689607 atgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctcagagctgtct 12689706  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12689707 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 12689806  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  12689807 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 12689854  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #4
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11235578 - 11235131
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  11235578 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 11235479  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  11235478 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 11235379  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  11235378 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtct 11235279  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235278 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11235179  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11235178 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 11235131  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #5
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15159422 - 15158975
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15159422 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 15159323  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15159322 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15159223  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15159222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15159123  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159122 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15159023  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15159022 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15158975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 8709510 - 8709957
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8709510 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 8709609  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  || |||||||||||||||||||||    
T  8709610 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccataaaccgatccaaaaatgcatggaag 8709709  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8709710 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 8709809  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8709810 tctgcatatcttcatcctttaccttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 8709909  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8709910 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8709957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 14334301 - 14334748
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334301 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14334400  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14334401 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14334500  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  14334501 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 14334600  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  14334601 tctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 14334700  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14334701 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14334748  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #8
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 10872595 - 10873042
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| | ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  10872595 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 10872694  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||||| |||||||||||||    
T  10872695 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacgaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 10872794  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  10872795 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 10872894  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10872895 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 10872994  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10872995 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10873042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #9
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15715 - 15267
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15715 catcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15616  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  15615 gacaatcatcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacgcaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 15516  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15515 atgcgattcatatactccataaacactctaggcgcattgtttacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15416  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15415 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcctc 15316  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15315 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 15267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #10
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44789708 - 44789269
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44789708 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 44789609  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789608 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44789509  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  44789508 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 44789409  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| ||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44789408 tcttcgtcttttactttaatctggtgacaacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 44789309  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44789308 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 44789269  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #11
Raw Score: 319; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 18179656 - 18180097
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttc-ttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |||||||    
T  18179656 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcatacttagacaatttggcataaagtgtcnttctctt-caacacttgtaagacaa 18179754  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| ||||||| |||||| | ||||||||||||||||||||||||    
T  18179755 tcttgagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatggtcgataaacacaattacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcg 18179854  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  18179855 attcatatactccataaacactctaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcgtagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgc 18179954  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18179955 atatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 18180054  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18180055 tctgaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18180097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #12
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 99 - 469
Target Start/End: Original strand, 13688023 - 13688393
Alignment:
Q  99 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 198  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  13688023 ttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 13688122  T
Q  199 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 298  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  13688123 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagggacc 13688222  T
Q  299 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 398  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||    
T  13688223 ataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcctttactttaatctagtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcaccc 13688322  T
Q  399 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13688323 actaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13688393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #13
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15147244 - 15146801
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  15147244 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 15147145  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaa-tgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15147144 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagataaaaatatcatcaatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaaatgcatggaaaatgcg 15147045  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    |||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||| || | ||||| |||||||||    
T  15147044 attcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttatactcgtaatgtccatatcgcgttttaaaagccgtcttctgc 15146945  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  15146944 atatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattc 15146845  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
      |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  15146844 ttggaagtggatacctattcttcatagttactttattcaactga 15146801  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #14
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 123 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18588435 - 18588089
Alignment:
Q  123 acaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaaga 222  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||    
T  18588435 acaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaga 18588336  T
Q  223 tgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtctt 322  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  18588335 tgcaattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttattttcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtctt 18588236  T
Q  323 ctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatca 422  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  18588235 ctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatca 18588136  T
Q  423 attcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18588135 attctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18588089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #15
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 466
Target Start/End: Original strand, 14041612 - 14042044
Alignment:
Q  34 taacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcag 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14041612 taacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaa 14041711  T
Q  134 atgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcata 233  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  14041712 atgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatg 14041811  T
Q  234 tactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatctt 333  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14041812 tactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatctt 14041911  T
Q  334 catcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaag 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  14041912 catctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaag 14042011  T
Q  434 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14042012 tggacacctattctttatcgttactttgttcaa 14042044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #16
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 34 - 466
Target Start/End: Original strand, 14351642 - 14352074
Alignment:
Q  34 taacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcag 133  Q
    ||||||| |||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || || ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  14351642 taacatgtccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgataatttagcataaagtttattctctttcaacacttgcaaaacaatcttcaa 14351741  T
Q  134 atgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcata 233  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| | ||||||||| ||||||||||||||||| || ||| |||||||     
T  14351742 atgctcatcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaataactacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtgattcatg 14351841  T
Q  234 tactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatctt 333  Q
    ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||| ||||||||    
T  14351842 tactccataaacacatcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttgtactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctccatatctt 14351941  T
Q  334 catcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaag 433  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||  |||||    
T  14351942 catctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagttctcaattcttggaag 14352041  T
Q  434 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||| |||||||||| || ||||| ||||||||    
T  14352042 tggacacctattctttatcgttactttgttcaa 14352074  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #17
Raw Score: 191; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 228 - 470
Target Start/End: Original strand, 9590479 - 9590721
Alignment:
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9590479 ttcatatactccataaacactccaagtgcattggtcacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 9590578  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  9590579 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaattttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 9590678  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  9590679 cagaagtggatacctatacttgatagttaccttgttcaactga 9590721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #18
Raw Score: 190; E-Value: 1e-103
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 48813610 - 48813170
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||||| |||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  48813610 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatt-ggcatataacttcttctccttcagcacttgcaacacaat 48813512  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || | |    
T  48813511 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacaa 48813412  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || | |||||||||||    
T  48813411 ttcatgtactccataaacacacttggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggttgtcttctgca 48813312  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || ||||| |||||||| |||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||     
T  48813311 tatcctcgtctttcactttaatttggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcgcccactaactgatccatcaaatcatcaattct 48813212  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     ||||||||||||| || ||| || ||||| || ||||||||    
T  48813211 tggaagtggataccaatactttatcgttactttattcaactg 48813170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #19
Raw Score: 175; E-Value: 5e-94
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15100940 - 15100498
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  15100940 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacgat 15100841  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  15100840 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 15100741  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  15100740 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 15100641  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  15100640 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 15100541  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  15100540 cggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 15100498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #20
Raw Score: 165; E-Value: 5e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 12205137 - 12204717
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  12205137 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 12205038  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| || |||||||| || ||||| || ||  ||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  12205037 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttaaaataaattaagatatcatcaataaacacgaccacagatttatccagataagcatggaaaattcta 12204938  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| || || || || || || |||||||    
T  12204937 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtatcctaaaggccgttttctgca 12204838  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||  || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  12204837 tatcttcatacttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcatgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 12204738  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  12204737 cggaagtggatacctattctt 12204717  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #21
Raw Score: 157; E-Value: 3e-83
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 15626436 - 15626856
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  15626436 cagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 15626535  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| || |||  ||||||||||||||| |||  |||| || |||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || ||     
T  15626536 cttcaaatactcgacatgttcttcttcagacttatagtatattaaaatatcatcgatgaacgcaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatacgg 15626635  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||  |||||||| ||   |||||| || || |  |||||  | || ||||| ||||||| |     
T  15626636 ttcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacactgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttcttcg 15626735  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  15626736 tatcttcatctttcagtttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 15626835  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  15626836 tggaagtggatacctattctt 15626856  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #22
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14262580 - 14262162
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | ||||    
T  14262580 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataatc 14262481  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | ||    
T  14262480 ttcagatgctctgcatgctcttcttcagtc-tagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctat 14262382  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||||||||  |  | || || ||  ||||||||||    
T  14262381 tcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatattgtgtcctaaaggccatcttctgcat 14262282  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||  | |    
T  14262281 atcctcatccttcaccttaatatgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaaacctc 14262182  T
Q  429 ggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  14262181 ggaagtggatacctattctt 14262162  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #23
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 19149123 - 19149541
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19149123 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 19149222  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  19149223 cttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcaa 19149322  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  19149323 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19149422  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
     ||| ||||| || || |||||||   | |||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  19149423 -atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattct 19149520  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  19149521 tggaagtggatacctattctt 19149541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #24
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 20748522 - 20748940
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| || | |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  20748522 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacacacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 20748621  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  20748622 cttcagatgctctgcatgctcttcatcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 20748721  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| |||||  | || || || ||||||||||    
T  20748722 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20748821  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
     ||| ||||| || || |||||||   | |||| |||||||||||||||||| || || | |||||||||||||||| ||||||| ||||| |||||||     
T  20748822 -atcctcatccttcaccttaatct-taggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacatacgtgcacccactaaccgatccattaaatcgtcaattct 20748919  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
     ||||||||||||||||||||    
T  20748920 tggaagtggatacctattctt 20748940  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #25
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 16070632 - 16070222
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || |||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  16070632 cagaaataatatgacccagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 16070533  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||| ||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | |  ||||||| || |      
T  16070532 cttcagatactctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatgagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatagacatggaaaattctg 16070433  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||  ||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16070432 ttcatatactccataaacact--aggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16070335  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || |  ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||     
T  16070334 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaagcacacgagcacccactaactggtccatcaagtcatcaattct 16070235  T
Q  428 cggaagtggatac 440  Q
    |||||||||||||    
T  16070234 cggaagtggatac 16070222  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #26
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 14139585 - 14140029
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  14139585 catcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 14139684  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  14139685 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 14139784  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  14139785 attcgattcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 14139884  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| | ||| |||||||| |||||    
T  14139885 tctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaacctttgcacccaccagctggtccatcaagtcatc 14139984  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  14139985 aatcctcggaagtggatacctattcttaattgtaactttgttcaa 14140029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #27
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 13675364 - 13675806
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||| ||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  13675364 cagaaataatgtggccaagataactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctcattcaatacttgcaatacaat 13675463  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  13675464 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 13675563  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||| ||    
T  13675564 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctcca 13675663  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| |||||||   ||||||||||||||||||||| |  |||||||| |     
T  13675664 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttgaaaacctttgcacccactaactgatccattatgtcatcaatcct 13675763  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  13675764 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 13675806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #28
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16948809 - 16948389
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  16948809 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccaaaactcacactttgacagcttagcatacaacttcttttctttcaagacttgcaacacaat 16948710  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| || || || |||||  | || || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  16948709 cttcagatgctctgcgtgctcctcttcgattttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 16948610  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16948609 ttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16948510  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  16948509 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 16948410  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||| |||||||||||||||||    
T  16948409 cgggagtggatacctattctt 16948389  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #29
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 23504213 - 23503769
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  23504213 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 23504114  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  23504113 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 23504014  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  23504013 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 23503914  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  23503913 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 23503814  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  23503813 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 23503769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #30
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 13023269 - 13023711
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  13023269 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccacaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 13023368  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||||| ||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  13023369 tctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaattatcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 13023468  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| | |||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  13023469 ttcatataatacataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 13023568  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || ||    |||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  13023569 tatcctcatcattcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctaaacaccttcgcacccaccaattgatccatcaaatcatcaattct 13023668  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  13023669 cggaagtggatatctattctttatcgtaactttgttcaactga 13023711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #31
Raw Score: 110; E-Value: 3e-55
Query Start/End: Original strand, 28 - 193
Target Start/End: Complemental strand, 11770600 - 11770435
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||||||||  |||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  11770600 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 11770501  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaac 193  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  11770500 cttcaaatgctcagcatgttctccctcagacttggagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaac 11770435  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #32
Raw Score: 107; E-Value: 2e-53
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11386766 - 11386324
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  || || || |||||    
T  11386766 cagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagaacctgtaatacaat 11386667  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| || || |      
T  11386666 cctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaagcatgaaaaattctg 11386567  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||| ||||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||| ||||  | || ||  | ||||||||||    
T  11386566 ttcttatactccataaatacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccacaacgtgtcctaaagtccgtcttctgca 11386467  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  11386466 tatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 11386367  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  11386366 cggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 11386324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #33
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 12458587 - 12458994
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  12458587 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 12458686  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || ||||||||||| || |||||||| |||||   ||||| ||| |||||||||||    |||| ||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  12458687 aatagattaaaatatcatcaataaacacaacaacgaaattatccagaaaagcatggaagattatgttcaaatactccatgaacacaccaggcgcgttagt 12458786  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| || ||||      
T  12458787 aacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatggtaacca 12458886  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    ||||||||||| || || ||||| ||    ||||| |||||||||||||| |  |||||||| | |||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  12458887 gacctcaaatcgatcttactgaacactttcgcacctactaactgatccattaggtcatcaatcctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgt 12458986  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  12458987 tcaactga 12458994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #34
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13966970 - 13966563
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  13966970 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 13966871  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  13966870 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagt 13966771  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || |  |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||      
T  13966770 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacca 13966671  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    || ||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  13966670 gatctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgt 13966571  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  13966570 tcaactga 13966563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #35
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 15342343 - 15342785
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  15342343 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 15342442  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || ||   ||||| |||  ||||||| || |      
T  15342443 cctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaattaggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcag 15342542  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  15342543 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 15342642  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |     
T  15342643 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcct 15342742  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    || ||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  15342743 cgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 15342785  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #36
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 19614587 - 19615029
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19614587 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 19614686  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  19614687 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 19614786  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19614787 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 19614886  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  19614887 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 19614986  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  19614987 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 19615029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #37
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 18052296 - 18051852
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  18052296 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 18052197  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  18052196 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 18052097  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  18052096 attcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 18051997  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  18051996 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 18051897  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  18051896 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 18051852  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #38
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26116892 - 26116485
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  26116892 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 26116793  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || |||||||| || || ||||| || |  ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  26116792 aatagattaaaatatcgtcaataaacaccacaagaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagt 26116693  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||| |  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||      
T  26116692 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataatgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacca 26116593  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  26116592 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 26116493  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  26116492 tcaactga 26116485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #39
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 26093135 - 26092693
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  26093135 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 26093036  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  26093035 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 26092936  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  26092935 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 26092836  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  26092835 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 26092736  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  26092735 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 26092693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #40
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 49154213 - 49154655
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  49154213 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 49154312  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  49154313 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 49154412  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||| ||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  49154413 ttcatgtaccccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 49154512  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  49154513 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 49154612  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  49154613 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 49154655  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #41
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 337
Target Start/End: Complemental strand, 14284713 - 14284404
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| | |||    
T  14284713 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaactagaactcacatttcgacaacttagcatacagcttcttctctttcaatacttgcaatataat 14284614  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || | ||| || ||||||||||| || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| || ||   |||||  || ||||| || || |      
T  14284613 cctcagatgttctgtatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctg 14284514  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    || ||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||| ||||||  | || || || ||||||||||    
T  14284513 tttatatactccatgaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacaataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14284414  T
Q  328 tatcttcatc 337  Q
    ||||||||||    
T  14284413 tatcttcatc 14284404  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 7825812 - 7826252
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7825812 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 7825911  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  7825912 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 7826011  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  7826012 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 7826111  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  7826112 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 7826211  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  7826212 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 7826252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #43
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27106132 - 27105692
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27106132 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 27106033  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  27106032 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 27105933  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  27105932 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 27105833  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  27105832 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 27105733  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  27105732 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 27105692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #44
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 27172193 - 27172633
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  27172193 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 27172292  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  27172293 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 27172392  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  27172393 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 27172492  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  27172493 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 27172592  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  27172593 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 27172633  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #45
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11301550 - 11301108
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||  |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||    
T  11301550 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagatctcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactat 11301451  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  11301450 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 11301351  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  11301350 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 11301251  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  11301250 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 11301151  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  11301150 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 11301108  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #46
Raw Score: 76; E-Value: 6e-35
Query Start/End: Original strand, 22 - 121
Target Start/End: Original strand, 14213579 - 14213678
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14213579 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14213678  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #47
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 22 - 107
Target Start/End: Original strand, 8200533 - 8200618
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctct 107  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||    
T  8200533 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctct 8200618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #48
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 366 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11770423 - 11770320
Alignment:
Q  366 ctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 465  Q
    ||||||| ||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||    
T  11770423 ctcaaattaatcttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgttactttgttca 11770324  T
Q  466 actg 469  Q
    ||||    
T  11770323 actg 11770320  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #49
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 410 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16727360 - 16727300
Alignment:
Q  410 catcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16727360 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16727300  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #50
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 410 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17704432 - 17704372
Alignment:
Q  410 catcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17704432 catcaaatcatcaattctcagaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 17704372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #51
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 75
Target Start/End: Original strand, 13687969 - 13688022
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcac 75  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  13687969 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcac 13688022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #52
Raw Score: 35; E-Value: 0.0000000002
Query Start/End: Original strand, 339 - 469
Target Start/End: Original strand, 4442150 - 4442280
Alignment:
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||    
T  4442150 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggat 4442249  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||| |||||| || || ||||| ||||||||    
T  4442250 accgattcttaatcgtcaccttcttcaactg 4442280  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #53
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 170 - 323
Target Start/End: Complemental strand, 39363 - 39210
Alignment:
Q  170 caaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca 269  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||| ||| |||||| || |  ||||||||||||||||| ||||| || || ||||  || |||    
T  39363 caaaatatcatcaatgaatactacaacgaactgatctaaatatggatggaaaattctgttcatatactccataaaaactcctggcgcgttggacactcca 39264  T
Q  270 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 323  Q
    |||||||| ||   ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  39263 aaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 39210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #54
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 346 - 468
Target Start/End: Original strand, 17925879 - 17926001
Alignment:
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| || || ||     |||| || | ||||||| ||||||||||||| | |||||| ||||||  |||    
T  17925879 taatctgatgatatcttgatctcaaatcaattttactaaatacttccacaccaaccagctgatccctcaaatcatcaatcctcggaagcggatactgatt 17925978  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||| || || |||||||||||||    
T  17925979 cttaatcgtcaccttgttcaact 17926001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr7; HSP #55
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Original strand, 13379170 - 13379235
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| |||||   |||||| ||||| ||||||||||||||    
T  13379170 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagaggataaagattcttaatagtcaccttgttcaactg 13379235  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2 (Bit Score: 404; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr2
Description:

Target: chr2; HSP #1
Raw Score: 404; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21143937 - 21143490
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143937 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21143838  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21143837 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 21143738  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  21143737 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 21143638  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143637 tctgtatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21143538  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21143537 aattctcggaagttgatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21143490  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24875646 - 24875199
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875646 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 24875547  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  24875546 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24875447  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  24875446 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 24875347  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||    
T  24875346 tctgcatatcctcatcttttactttaatctgatgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaatcgatccatcaaatcatc 24875247  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24875246 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24875199  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #3
Raw Score: 376; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 44384458 - 44384019
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  44384458 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 44384359  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384358 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 44384259  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  44384258 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 44384159  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  44384158 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctaatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 44384059  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  44384058 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 44384019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #4
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41607274 - 41606834
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  41607274 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 41607175  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||| |||    
T  41607174 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtgat 41607075  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  41607074 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 41606975  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  41606974 atcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 41606875  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41606874 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41606834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 24263917 - 24264364
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24263917 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 24264016  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  24264017 aacaatcttcagatgctcaacatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccaatccaaaaatgcatggaag 24264116  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24264117 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24264216  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264217 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24264316  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24264317 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24264364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #6
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 27372816 - 27373263
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27372816 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 27372915  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27372916 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27373015  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27373016 atgcgattcatatattccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27373115  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27373116 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 27373215  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27373216 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27373263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #7
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 16926915 - 16927354
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16926915 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 16927014  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927015 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16927114  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  16927115 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 16927214  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  16927215 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 16927314  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16927315 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16927354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 17000555 - 17000994
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  17000555 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 17000654  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000655 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 17000754  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  17000755 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 17000854  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17000855 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 17000954  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17000955 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17000994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #9
Raw Score: 355; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 468
Target Start/End: Original strand, 24711581 - 24712027
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24711581 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 24711680  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||     
T  24711681 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaaa 24711780  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24711781 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24711880  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711881 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24711980  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24711981 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 24712027  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 9485763 - 9486210
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  9485763 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 9485862  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9485863 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 9485962  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  9485963 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 9486062  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  9486063 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 9486162  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9486163 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9486210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #11
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 10870405 - 10870844
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  10870405 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 10870504  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  10870505 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 10870604  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  10870605 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 10870704  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  10870705 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 10870804  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  10870805 gaagtggatacctgttcttgatagttaccttgttcaactg 10870844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #12
Raw Score: 340; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 27219571 - 27220010
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27219571 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27219670  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219671 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27219770  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||| ||||||||||||    
T  27219771 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagccgtcttctgcata 27219870  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  27219871 tcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 27219970  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27219971 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27220010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #13
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21324156 - 21323715
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  21324156 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaat 21324057  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||    
T  21324056 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaaaacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgcga 21323957  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||  |||||||||||||||||||||    
T  21323956 ttcatatactccataaatactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatactcatagtggccataacgtgttctgaaagctgtcttctgca 21323857  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21323856 tatcttcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 21323757  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  21323756 cggaagtggatatctattcttgatagttaccttgtttaactg 21323715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #14
Raw Score: 333; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 24677036 - 24677484
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  24677036 catcaccagaaataacatggcccagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 24677135  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24677136 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgaaaaaaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24677235  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||    
T  24677236 atgcgattcatatactccataaacactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatct 24677335  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24677336 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaatcttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24677435  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  24677436 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 24677484  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #15
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24706378 - 24705931
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24706378 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 24706279  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||||||||| || |||    
T  24706278 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacagccacgaaccgatccaaaaatgcgtgaaag 24706179  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||  ||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24706178 atatgattcatgtactccataaacactccaggtacattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24706079  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    ||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24706078 tctgcatatcttctttttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactaatccatcaaatcatc 24705979  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  24705978 aattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 24705931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #16
Raw Score: 299; E-Value: 1e-168
Query Start/End: Original strand, 22 - 436
Target Start/End: Original strand, 23189466 - 23189879
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||| || |  |||||||||||| |||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  23189466 catcaccagaaataacatggcccagaaaacttactttcttcaaccagaat-cacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 23189564  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  23189565 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtctataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 23189664  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23189665 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 23189764  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  23189765 tctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacctaacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatc 23189864  T
Q  422 aattcacggaagtgg 436  Q
    ||||| |||||||||    
T  23189865 aattctcggaagtgg 23189879  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #17
Raw Score: 291; E-Value: 1e-163
Query Start/End: Original strand, 99 - 469
Target Start/End: Original strand, 9337206 - 9337576
Alignment:
Q  99 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 198  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || |    
T  9337206 ttcttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaa 9337305  T
Q  199 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 298  Q
    | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||    
T  9337306 accgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgacc 9337405  T
Q  299 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 398  Q
    ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  9337406 ataacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcaccc 9337505  T
Q  399 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9337506 actagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9337576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #18
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22734664 - 22734226
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  22734664 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaatttacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 22734565  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||| |||| |||||||||    
T  22734564 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaattcatgaaagatgcga 22734465  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||| |||||| ||||||||||||||  ||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||| |||||||||||    
T  22734464 ttcatgtactacataaatactccaggtgcatttataacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagttgtcttctgca 22734365  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || ||| ||||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22734364 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 22734265  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||    
T  22734264 cggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaa 22734226  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #19
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23106618 - 23106177
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  23106618 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccataattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 23106519  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||  |||||||||||||||| || ||||||    
T  23106518 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 23106419  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  23106418 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgca 23106319  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  23106318 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 23106219  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  23106218 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 23106177  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #20
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 23073416 - 23073857
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || || |     
T  23073416 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttggaaaaccaa 23073515  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||   || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |  |||||||||||||| ||||||||     
T  23073516 cttcaaatggctagtatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacattccaaaaatgcatgaaagatgcgg 23073615  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  23073616 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcataatggccatatcgcgttctgaaagctgtcttctgca 23073715  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23073716 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaatacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 23073815  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  23073816 cggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 23073857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #21
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24819120 - 24818679
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  24819120 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 24819021  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  24819020 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 24818921  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  24818920 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 24818821  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  24818820 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttct 24818721  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24818720 tggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 24818679  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #22
Raw Score: 161; E-Value: 1e-85
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Original strand, 23112290 - 23112712
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||||    
T  23112290 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttccttcaacacttgcaacacaatc 23112389  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    || | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| |||||||| || ||||||||||| ||  |||||| | | |||||||| || | ||    
T  23112390 tttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatatcatcaataaacacaactacaaactgatccagataagcatggaaaattctat 23112489  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| |||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||| ||| | || || || || |||| |||    
T  23112490 tcatgtactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccatatcgcgtcctaaaggccgttttctacat 23112589  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaa---atcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    |||||||||||| || |||||||| || ||||  ||||||||   |||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  23112590 atcttcatctttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcatcaatcttgctgaatatgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatt 23112689  T
Q  426 cacggaagtggatacctattctt 448  Q
    | |||||||||||||||||||||    
T  23112690 ctcggaagtggatacctattctt 23112712  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #23
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19650940 - 19650498
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||| |||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  19650940 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 19650841  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||||| |||||||| ||  |     
T  19650840 cttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaaaaagcatggaaaatttgg 19650741  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  19650740 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtgacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 19650641  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| |||| |||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  19650640 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 19650541  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  19650540 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaactga 19650498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 194
Target Start/End: Complemental strand, 22323752 - 22323580
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||| ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22323752 catcaccagaaacaacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22323653  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaact 194  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||    
T  22323652 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgataaacacaact 22323580  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #25
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 213 - 470
Target Start/End: Original strand, 25255657 - 25255914
Alignment:
Q  213 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctga 312  Q
    |||||||| || || |||||||||||||||||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || |    
T  25255657 gcatggaaaattcggttcatatactccataaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 25255756  T
Q  313 aagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 412  Q
    | || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  25255757 aggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccat 25255856  T
Q  413 caaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     || |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  25255857 taagtcatcaatcctcggaagtggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 25255914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #26
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 27789287 - 27789731
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  27789287 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 27789386  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  27789387 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 27789486  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  27789487 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 27789586  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  27789587 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 27789686  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  27789687 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 27789731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #27
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 12575900 - 12576344
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  12575900 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 12575999  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||||||| ||||| ||     
T  12576000 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccaaaaaagcatgaaaa 12576099  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  12576100 attcgattcatatactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 12576199  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  12576200 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 12576299  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  12576300 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 12576344  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #28
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23098908 - 23098466
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |   | ||||||||||  || || || |||||    
T  23098908 cagaaataatgtggccgagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacattttctctttcagaacctgtaatacaat 23098809  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | |||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || ||||| || ||||||| ||||| ||| ||||| || || | |    
T  23098808 cctcagatgctcggcatgctcttcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaataaacaccaccacgaatctatccagaaaagcatgaaaaatccta 23098709  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  23098708 ttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttctattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 23098609  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || || ||||| || || | ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  23098608 tatcttcatccttcacctttatctgatggtatcctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 23098509  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | |||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  23098508 cagaagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaactga 23098466  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Original strand, 23278340 - 23278771
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  23278340 tggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 23278439  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||   ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  23278440 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaattatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 23278539  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |  |||||||||||||| |  ||     
T  23278540 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgcatatccttgtcc 23278639  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || ||||| || || |||| |||| |||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||    
T  23278640 ttcaccttaatttgatggtaacctgacttcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggat 23278739  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  23278740 acctgttcttgattgtaactttgttcaactga 23278771  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 45 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30209790 - 30209387
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||| | |  ||||||||||||| |||||| || |||||  ||| ||| ||  |||    
T  30209790 agaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcagataacttcttctctttcagcacttgaaaaacaattctcaaatgttcgacat 30209691  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    |||| || || | ||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||| | | | ||| || ||  |||||||||| ||||||||    
T  30209690 gttcctcctcggacttggagtatatcaaaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatatgattcatatattccataaa 30209591  T
Q  245 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 344  Q
    ||||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||  || || |  |||||  | || || || |||||||| ||||| |||||||| |||    
T  30209590 cactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatctttcact 30209491  T
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    || ||||||||||| | |||||| || |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || || | ||||||||||||| |||    
T  30209490 ttgatctggtgatagcctgaccttaactcaattttactgaacacacgcgcacccactaactgatccatcaaatcttcgatcctcggaagtggatacttat 30209391  T
Q  445 tctt 448  Q
    ||||    
T  30209390 tctt 30209387  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 108 - 470
Target Start/End: Original strand, 1065384 - 1065746
Alignment:
Q  108 ttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatcca 207  Q
    |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   |||||    
T  1065384 ttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccaccacaaacttatcca 1065483  T
Q  208 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcat 307  Q
     ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  |    
T  1065484 gaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 1065583  T
Q  308 tctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactga 407  Q
     || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || ||||||    
T  1065584 cctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactga 1065683  T
Q  408 tccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  1065684 tccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 1065746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #32
Raw Score: 97; E-Value: 2e-47
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 30011074 - 30010654
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||| ||  | || || |||||||| |  |||||||||| || ||||||||| |||||    
T  30011074 cagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacatcgataacttggcatataacttcttctcttgcagcacttgcaaaacaat 30010975  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||| ||||||  ||||||| || || | ||||||||| |||||||||||||| || ||||| || || || ||||||| | | | ||| || || |||    
T  30010974 tctcaaatgctcgacatgttcctcctcggacttggagtatatcaaaatatcatctataaacacgacaacaaaacgatccagataagtatgaaaaatacga 30010875  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| | |||||||||||| || ||||| |||||||  |||||||| ||   |||||| || || || |||||  | || || |  |||||||| |    
T  30010874 ttcatatatttcataaacactcctggcgcattagtaacactgaaaggcatcacagaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaa 30010775  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| | | | || || || ||||| ||||| ||||| |||||||||||| ||||||||||||| || || |     
T  30010774 tatcctcatctttcactttaatctggtgatagcctaatcttaagtccattttactgaacacacgcgcacccactaacggatccatcaaatcgtcgatcct 30010675  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||| |||||||    
T  30010674 cggaagtggatacttattctt 30010654  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #33
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19717872 - 19717465
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |  ||||||||||| |    
T  19717872 aaccagaactcacacttcgacaacttagcatacagcttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctgatcttcagtcttag 19717773  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| | ||||||||| || ||||||||    |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  19717772 aataaattagaatatcatcaataaacacaacccaaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagt 19717673  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||| |||||||| ||||| || |  || ||||| || |||| |    
T  19717672 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttgtgcatatcctcatccttcaacttgatctgatggtaacct 19717573  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||| ||||| ||| | |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | | |||||||||| || ||||| || || || ||||    
T  19717572 gacctcaagtcaatcttgttaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcagaagtggatatctgttctttatcgtaactttgt 19717473  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  19717472 tcaactga 19717465  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #34
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 31832246 - 31832653
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  31832246 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 31832345  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  31832346 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 31832445  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| || || || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  31832446 aacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 31832545  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  31832546 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 31832645  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  31832646 tcaactga 31832653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #35
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 39 - 376
Target Start/End: Original strand, 24950154 - 24950491
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||| |||||| ||  | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| |    
T  24950154 tggccaagaagactcacttcacttaaccataactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaatcttcagatgtt 24950253  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| |  || |||||  | |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  24950254 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaacaaatacaaccgcaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 24950353  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||||||||||||     
T  24950354 catgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatcc 24950453  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaat 376  Q
    ||||| |||||||| || |||| ||||||||| |||||    
T  24950454 tttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaat 24950491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #36
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 190
Target Start/End: Original strand, 25264607 - 25264769
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25264607 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaagacaat 25264706  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||    
T  25264707 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacac 25264769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #37
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 28 - 288
Target Start/End: Complemental strand, 27209062 - 27208802
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  27209062 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaagttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 27208964  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| ||||| |||||  | ||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  27208963 tcttcaggtgctctgcatgcacctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 27208864  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatt 288  Q
     |||||||||||||| ||||| | ||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||    
T  27208863 gttcatatactccatgaacacactaggcgctttagtaacaccgaaagacatcactttgtatt 27208802  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #38
Raw Score: 52; E-Value: 1e-20
Query Start/End: Original strand, 39 - 245
Target Start/End: Original strand, 23295499 - 23295705
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| |    
T  23295499 tggcccagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaatcttcagatgtt 23295598  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  23295599 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaggatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 23295698  T
Q  239 cataaac 245  Q
    ||| |||    
T  23295699 catnaac 23295705  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #39
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24830077 - 24829637
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || || ||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| | |||||| ||||||    
T  24830077 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttgaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagaattgcaacacaatc 24829978  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||| ||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  24829977 ctcaaatgctccgcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 24829878  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | |||  || || || ||    ||    
T  24829877 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttggatat 24829778  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| |||||   ||| ||| ||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  24829777 atcttccgcctttactctaatctgatgatattctgatctctaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 24829678  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24829677 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24829637  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #40
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 148
Target Start/End: Original strand, 45534493 - 45534613
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  45534493 cagaaataatatgaccgagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 45534592  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttc 148  Q
      ||| |||||| ||||||||    
T  45534593 tctcaaatgctcggcatgttc 45534613  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #41
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 371 - 436
Target Start/End: Original strand, 23611069 - 23611134
Alignment:
Q  371 atcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgg 436  Q
    |||||| |||||||||||   ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  23611069 atcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaaccgatccatcaaatcatcaattctcggaagtgg 23611134  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #42
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 466
Target Start/End: Original strand, 22280022 - 22280096
Alignment:
Q  392 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||    
T  22280022 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaa 22280096  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #43
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 470
Target Start/End: Original strand, 23204273 - 23204309
Alignment:
Q  434 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23204273 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 23204309  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr2; HSP #44
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Original strand, 25130539 - 25130603
Alignment:
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||| ||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||| |||||||||    
T  25130539 tgatccataaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcacctagttcaactg 25130603  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0431 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0431
Description:

Target: scaffold0431; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 9313 - 9760
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9313 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 9412  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  9413 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaataaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 9512  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  9513 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 9612  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||    
T  9613 tctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgtacccactaactgatccatcagatcatc 9712  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9713 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 60)
Name: chr6
Description:

Target: chr6; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22828856 - 22828409
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828856 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22828757  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22828756 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacgcaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22828657  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22828656 atacgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22828557  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22828556 tctgcatatctttatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22828457  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  22828456 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttattcaactg 22828409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #2
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 25114340 - 25114779
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114340 gaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttgacataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 25114439  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114440 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcatcgatgaacaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 25114539  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  25114540 catatactccataaacactccaggtgtattggtaacaccaaaaggcataactttatattcacagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 25114639  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||| | |||||||||||||| ||||||| || || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  25114640 tcttcaacctttactttaatctgatgataacctggccccaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 25114739  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  25114740 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 25114779  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #3
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 24294276 - 24293837
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24294276 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 24294177  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  24294176 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 24294077  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||||    
T  24294076 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtcttctgcat 24293977  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  24293976 atcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 24293877  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24293876 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 24293837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2873296 - 2872857
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||    
T  2873296 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctccttcaacacttgcaaaacaatct 2873197  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  2873196 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacataaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 2873097  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  2873096 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 2872997  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  2872996 tcttcatcctttactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 2872897  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2872896 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 2872857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #5
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 19866467 - 19866915
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866467 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacgcttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 19866566  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19866567 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaag 19866666  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  19866667 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 19866766  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19866767 tctgcatatcttcatcttttactttaatctcgtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 19866866  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19866867 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 19866915  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #6
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 27564334 - 27563886
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564334 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 27564235  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||    
T  27564234 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatttcatcgatgaacacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaag 27564135  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  ||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||    
T  27564134 atgcgattcatatactccataaacactttaggtgcaatggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgcct 27564035  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27564034 tctgcatatcttcatcttttactttaatttggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 27563935  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  27563934 aattctcggaagtggatacctattcttgatagtaactttgttcaactga 27563886  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #7
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28261690 - 28261251
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28261690 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28261591  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28261590 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28261491  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28261490 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28261391  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28261390 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28261291  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28261290 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28261251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #8
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 28284226 - 28284665
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28284226 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28284325  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28284326 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28284425  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28284426 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28284525  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28284526 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28284625  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28284626 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28284665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #9
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 28340439 - 28340000
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||| | |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  28340439 gaaataacatggccagggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 28340340  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  28340339 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 28340240  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||    
T  28340239 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaacgaaaggcataactttgtattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtcttctgcata 28340140  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  28340139 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 28340040  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  28340039 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactg 28340000  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #10
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 27189224 - 27189663
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27189224 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27189323  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27189324 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27189423  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27189424 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27189523  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27189524 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27189623  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27189624 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27189663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #11
Raw Score: 328; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27260016 - 27259577
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27260016 gaaataacatggccaaggaaactcacttctttcaaccagaattcacacttggacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27259917  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27259916 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaatacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatggaagatgcgatt 27259817  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27259816 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcgtagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27259717  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||| ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27259716 tcctcatcttttaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 27259617  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27259616 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27259577  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #12
Raw Score: 325; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 22435649 - 22436097
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435649 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22435748  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22435749 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 22435848  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22435849 atgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttttgaaagctgtct 22435948  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22435949 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22436048  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||    
T  22436049 aattctcggaagtggatacctattattgatagttactttgtttaactga 22436097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #13
Raw Score: 323; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16926133 - 16925692
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16926133 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 16926034  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  16926033 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgc 16925934  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||| |||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||| ||    
T  16925933 ttcatatactccaaaaacactccaggtgcattggtcacaccgaacggcataacattatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctaca 16925834  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| | ||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  16925833 tatcttcatctttcactttaatctggtgataaccttacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 16925734  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16925733 c-gaagtagatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16925692  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #14
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 16961977 - 16961537
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| |||||  | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16961977 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagatgacttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 16961878  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  16961877 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 16961778  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||| || | ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16961777 ttcatatactccataaacacttcaggtgcattggtcacaccgaacgacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 16961678  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||     
T  16961677 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaactttcgcaccgactaactgatccatcaaatcatcaattct 16961578  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16961577 tggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 16961537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #15
Raw Score: 311; E-Value: 1e-175
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5837714 - 5837272
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||| |    
T  5837714 cagaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagacaacttggcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacagt 5837615  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| || || ||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||    
T  5837614 cttcagatgctcaacatgttcttcctcagtcttggaataaatcagaatgtcgtcaatgaagacaaccacaaagcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 5837515  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  5837514 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagcggtcttctgca 5837415  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  5837414 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacaaaagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 5837315  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  5837314 cggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 5837272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #16
Raw Score: 295; E-Value: 1e-165
Query Start/End: Original strand, 28 - 454
Target Start/End: Complemental strand, 25763723 - 25763297
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | |||  |||||||||||||||||||||||||    
T  25763723 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacaattagataatttagcatacatttttatctctttcaacacttgcaagacaat 25763624  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| |  || ||||||||||||||| |||||||||||    
T  25763623 cttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaattaaaatgtcatcaataaagacaaccataaagcgatccaaaaatgcaaggaagatgcga 25763524  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25763523 ttcatatactccataaacagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtggccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 25763424  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||  |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25763423 tatcttcatcttttacttttttctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 25763324  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagt 454  Q
    |||||||||||||||||||||||||||    
T  25763323 cggaagtggatacctattcttgatagt 25763297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #17
Raw Score: 288; E-Value: 1e-161
Query Start/End: Original strand, 31 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 22760947 - 22760504
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || | |||    
T  22760947 aaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccagctt 22760848  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || |||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||||||  || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  22760847 caaatgctcagcatgctcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcattaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 22760748  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||||||||| |||||||||||||||| |||||||    
T  22760747 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttgtgcatat 22760648  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||    
T  22760647 cttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgacaacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattctcgg 22760548  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||    
T  22760547 aagtggatacctattctttattgttacattgttcaactgttgat 22760504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #18
Raw Score: 282; E-Value: 1e-158
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20634435 - 20633994
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  20634435 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 20634336  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  20634335 cttcaaatgctcagcatgttcttctttagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 20634236  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20634235 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 20634136  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  20634135 tatcttcatcttctactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 20634036  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  20634035 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 20633994  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #19
Raw Score: 279; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 25608356 - 25607918
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || |||||    
T  25608356 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaat 25608257  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |    
T  25608256 cttcaaatgctcagcatcttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaactacgaatcgatccaaaaatgcatgaaagatgcaa 25608157  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||  |||| || || || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25608156 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacagcattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 25608057  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  25608056 tgtcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 25607957  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||    
T  25607956 cggaagtggatacctattctttatagtcaccttgttcaa 25607918  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #20
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 22 - 390
Target Start/End: Original strand, 22444047 - 22444415
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22444047 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttaggataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22444146  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  22444147 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttctttagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 22444246  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| | || ||||||||||||    
T  22444247 atgcgattcatgtactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacacgttatgaaagctgtct 22444346  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacac 390  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||    
T  22444347 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacac 22444415  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #21
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18406439 - 18405998
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| ||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| || |     
T  18406439 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttaaacaatttagcatatagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 18406340  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  18406339 tttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 18406240  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||  | ||||||| |||||||||||||    
T  18406239 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataatacgttctgaaggctgtcttctgca 18406140  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||| |||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  18406139 tatcttaatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 18406040  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||| |||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  18406039 cggaggtggatacctattctttattgttaccttgttcaactg 18405998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #22
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 231 - 469
Target Start/End: Original strand, 16573879 - 16574117
Alignment:
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16573879 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16573978  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16573979 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16574078  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16574079 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16574117  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #23
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 231 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16621501 - 16621263
Alignment:
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  16621501 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 16621402  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  16621401 cttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcgg 16621302  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16621301 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16621263  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #24
Raw Score: 187; E-Value: 1e-101
Query Start/End: Original strand, 31 - 333
Target Start/End: Original strand, 23080258 - 23080560
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||| | || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||    
T  23080258 aaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcaaactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaatctt 23080357  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||||||||| || |||||||||    
T  23080358 caaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctagaaatgcatgaaaaatgcgattc 23080457  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| | |||||||||||||    
T  23080458 atgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaatccgtcttctgcatat 23080557  T
Q  331 ctt 333  Q
    |||    
T  23080558 ctt 23080560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #25
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 90 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23086204 - 23085825
Alignment:
Q  90 gcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaca 189  Q
    |||||||| |||||||| | || ||||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||  ||| ||||| ||||||||||||||||||||||    
T  23086204 gcataaagcttcttctcctccagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcatacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaaca 23086105  T
Q  190 caactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattc 289  Q
    |||| ||||| ||||||||| | ||||| || || |||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||    
T  23086104 caaccacgaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtactccataaacacacccggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattc 23086005  T
Q  290 atagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaaca 389  Q
    ||| || ||||||||  | || || || |||||||  |||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| || |||    
T  23086004 ataatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctagatatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaacaca 23085905  T
Q  390 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||| || |||||||  ||||| | |||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23085904 cgtgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaattcttggaagggaatacctattctttatcgttactttattcaactg 23085825  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #26
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 25769630 - 25770072
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||| | | ||||||||||||||| |||||    
T  25769630 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttagcatacaacttcatttatttcaacacttgcaacacaat 25769729  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||  ||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||  | | |||||||| || ||     
T  25769730 cttcagatgctctgcatgctcttcttcatacttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccggataagcatggaaaattcgg 25769829  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || ||  | |||||||    
T  25769830 ttcatatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccattttctgca 25769929  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  25769930 tatcctcatcattcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 25770029  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  25770030 cggaagtggatacctgttctttatcgtcactttattcaactga 25770072  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #27
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 227 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 18183663 - 18183422
Alignment:
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    |||||| ||| |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| | || ||||  |||||||||    
T  18183663 attcatgtacaccataaacacaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgtgctaaaagacgtcttctgc 18183564  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||    
T  18183563 atatcttcatctttcactttaatctggtgataaccggacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatgcatcaagtcatcaattc 18183464  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||    
T  18183463 tcggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaact 18183422  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #28
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 445
Target Start/End: Original strand, 19881084 - 19881501
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  19881084 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcactttgacaatttggcatacagtttcttctctttcaatacttgcaatacaat 19881183  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||||||||| || |||  |||||   | ||||| || || | |    
T  19881184 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaatccta 19881283  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||  || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19881284 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatttgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 19881383  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  19881384 tgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 19881483  T
Q  428 cggaagtggatacctatt 445  Q
    |||||| ||||| |||||    
T  19881484 cggaagcggatatctatt 19881501  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #29
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14378411 - 14377991
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14378411 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaat 14378312  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||| || || ||||| || |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  14378311 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcgg 14378212  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14378211 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14378112  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |     
T  14378111 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcct 14378012  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  14378011 aggaagtggatacctgttctt 14377991  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #30
Raw Score: 117; E-Value: 2e-59
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14379961 - 14379541
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || |||||||| ||||| |||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  14379961 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcacatttcgacaacttggcatacaactttttctctttcaagacttgcaatacaat 14379862  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| | ||||||| || || ||||| || |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  14379861 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagactatcatcaataaatacaaccacaaatttatccagaaaagcatgtaaaattcgg 14379762  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14379761 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 14379662  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||| ||| |||| ||| |     
T  14379661 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaattcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccaacaagtcataaatcct 14379562  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
     |||||||||||||| |||||    
T  14379561 aggaagtggatacctgttctt 14379541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #31
Raw Score: 116; E-Value: 8e-59
Query Start/End: Original strand, 311 - 470
Target Start/End: Original strand, 21755002 - 21755160
Alignment:
Q  311 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcc 410  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  21755002 gaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacaaatgcacccactaactgatcc 21755101  T
Q  411 atcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||| | ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  21755102 atcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagtta-cttgttcaactga 21755160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #32
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Original strand, 19454821 - 19455251
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||    
T  19454821 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatactatcttcagatgct 19454920  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| ||||||| |||||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || |||  ||||||  | |||||||| || || |||||||||||    
T  19454921 ctgcatgctcttctttagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactc 19455020  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||| ||||||||||||     
T  19455021 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctacatatcttcatcc 19455120  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||| | ||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| | ||| |||||||    
T  19455121 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtaaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcgg-agtggat 19455219  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||| ||| | || || || ||||||||||||    
T  19455220 tcctgttcgttatcgtaactttgttcaactga 19455251  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #33
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Original strand, 21473398 - 21473828
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| ||| |||| |  ||| | ||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  21473398 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttgacatacaacttcctttctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 21473497  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| || |||||| |||| || ||||| |  |||||||  || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || || |||||||||||    
T  21473498 ctgcatgctcctcttcattcttagaataaattaggatatcataaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcggttcatatactc 21473597  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||||||||| ||||  ||||| |||||| | |||| ||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||| |||||     
T  21473598 cataaacacaccagc-gcattagtaacatcgaaagacatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcctcatcc 21473696  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||| ||| |||||||||||||  |||||| |||    
T  21473697 ttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaacacacgagcacccactaactgattcattaaatcatcaattctaggaagtcgat 21473796  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    || | ||||| || || || || |||||||||    
T  21473797 acatgttctttatcgtcactttattcaactga 21473828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #34
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 15461122 - 15461563
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  15461122 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaaccagaaatcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 15461220  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||  || || || ||||| |||||||| || || ||||||| ||||||||| || ||||| || || |||  ||| | ||| |||||||| || ||    
T  15461221 tcttcaagtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaatcagaatatcatctataaacaccaccacaaatttatctagaaaggcatggaaaattcg 15461320  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || ||||| |||    
T  15461321 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttttgc 15461420  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  15461421 atatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatcc 15461520  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||| ||||||||||| || || |||||||||||    
T  15461521 gcggaagtggatatctattcttgattgtaactttgttcaactg 15461563  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #35
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 26 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10467346 - 10466902
Alignment:
Q  26 atcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagaca 125  Q
    |||||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||    
T  10467346 atcagaaataatgtgacccagaaaactcacttcgcttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaataca 10467247  T
Q  126 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 225  Q
    ||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || || | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || |    
T  10467246 attctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccataaaagcatggaaaattc 10467147  T
Q  226 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 325  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||  || ||  | || || || ||||||||    
T  10467146 ggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgactttatcgtgtcctaaaggccgtcttctg 10467047  T
Q  326 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    |||||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  10467046 catatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatt 10466947  T
Q  426 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | ||||||||||||||| ||||| |  || || ||||||||||||    
T  10466946 ctcggaagtggatacctgttctttactgtaactttgttcaactga 10466902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #36
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 18796476 - 18796896
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  18796476 cagaaataatgtggccatgaaaactcacttcatttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 18796575  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||||||| | ||| ||||| ||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  18796576 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcaaaatgttatcaatgaatacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattctg 18796675  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| |||||  |||| |||||||  |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  18796676 ttcatatactccatgaacacaccaggcacattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 18796775  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || || | ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  18796776 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 18796875  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||| |||||||| |||||    
T  18796876 cggaagcggatacctgttctt 18796896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #37
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 226 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18963385 - 18963142
Alignment:
Q  226 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 325  Q
    ||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || ||||  ||||||||    
T  18963385 gattcatgtactccataaatacacctggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaagtcgtcttctg 18963286  T
Q  326 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    |||||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  18963285 catatcgtcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcatcaatt 18963186  T
Q  426 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |  |||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  18963185 cttggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactg 18963142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #38
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 232
Target Start/End: Complemental strand, 18196228 - 18196024
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||| |||||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  18196228 cagaaataacatggccaagaaaattcacatctttcaaccaaaattcatactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 18196129  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||| |||||| |||||||| | ||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||    
T  18196128 cttcaaatgcttagcatgctcttcttcggacttggagtatatcaaaatatcataaatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacga 18196029  T
Q  228 ttcat 232  Q
    |||||    
T  18196028 ttcat 18196024  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #39
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 28281314 - 28280870
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||  || ||||| |||||||| ||  | | ||| ||||||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| ||||||||    
T  28281314 catcaccagaaataatgtgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaattcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcaa 28281215  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| ||| |||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  28281214 cacaattctcagatgttctgcatgctctccttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 28281115  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||    
T  28281114 attcgattcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtct 28281015  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   |||||| || | ||| |||||||| |||||    
T  28281014 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacctaccagctggtccatcaagtcatc 28280915  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  28280914 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 28280870  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #40
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 34644081 - 34643639
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  34644081 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 34643982  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      | ||||| || ||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||| ||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  34643981 tcttagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagatcaaaatgtcatcaatgtacacaaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcta 34643882  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  34643881 ttcatatactccatgaacaccccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 34643782  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | ||||||||||| || || || || || |||| ||||||||| |||||||| || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  34643781 tgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 34643682  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  34643681 cggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 34643639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #41
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 116 - 470
Target Start/End: Original strand, 19436876 - 19437230
Alignment:
Q  116 ttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgca 215  Q
    |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||    
T  19436876 ttgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggca 19436975  T
Q  216 tggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaag 315  Q
    ||||| ||  | |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |    
T  19436976 tggaaaatttggttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaagg 19437075  T
Q  316 ctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa 415  Q
    |||||||||||||||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||||||    
T  19437076 ctgtcttctgcatatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctctgcacccaccaactgatccatcaa 19437175  T
Q  416 atcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||| ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19437176 gtcataaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19437230  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #42
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16380867 - 16380427
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16380867 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16380768  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16380767 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16380668  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16380667 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16380568  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16380567 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16380468  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16380467 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16380427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #43
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 24366233 - 24366640
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  24366233 aaccagaactcacacttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcctcattcttgg 24366332  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || || ||  |||| ||    
T  24366333 aatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaatacacctggcacattagt 24366432  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||| |||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  24366433 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 24366532  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24366533 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 24366632  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  24366633 tcaactga 24366640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #44
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 30679215 - 30679061
Alignment:
Q  315 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 414  Q
    ||||||||||||||||| |||||  | ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||    
T  30679215 gctgtcttctgcatatcctcatccgtcactttaatctgatgatagcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatca 30679116  T
Q  415 aatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||  |||||| ||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  30679115 aatcatcaattcttggaagtagatacctattctttattgtcactttgttcaactg 30679061  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #45
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 189
Target Start/End: Complemental strand, 18965790 - 18965629
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| |||||| || |||||    
T  18965790 cagaaataatatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcatcacttgaaaaacaat 18965691  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaca 189  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||||| ||| |  || |||||||||||||| |||||||    
T  18965690 cttcaaatgctcagaatgttcttcttcagacttagcatatatcaaaatatcatcaatgaaca 18965629  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #46
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 261 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24516670 - 24516461
Alignment:
Q  261 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  24516670 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaac 24516571  T
Q  361 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 460  Q
     ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||    
T  24516570 ctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttattgtaacttt 24516471  T
Q  461 gttcaactga 470  Q
     |||||||||    
T  24516470 attcaactga 24516461  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16648463 - 16648023
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16648463 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16648364  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16648363 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16648264  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16648263 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16648164  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16648163 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctttgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16648064  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16648063 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16648023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #48
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Complemental strand, 19487767 - 19487528
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  |||||  | |||||||||||||| |||||    
T  19487767 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttctttaccttcaacacttgcaacacaat 19487668  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||| | ||||          |    
T  19487667 ctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaaaacaaccacaaaccgatccaaataagcat----------a 19487578  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 277  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  19487577 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcat 19487528  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #49
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 21568486 - 21568046
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| |||||||| || ||  | | ||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| || |  ||  ||||    
T  21568486 cagaaataatgtggccgagaaaacttacttcaattagccagaattcacatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacctataattcaat 21568387  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| ||  |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| |  |||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  21568386 cctcagatgttctacatgctcctcttcggtcttagaataaatcagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgg 21568287  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| ||||| ||||| || ||||||||| |  | || || || ||||||||||    
T  21568286 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcactttgtattcgtaatgaccataaagtgtcctaaaggccgtcttctgca 21568187  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    |||||| |  || ||||||||||| || ||||| |     
T  21568186 tatcttcatccttcacctttatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaatctttgcaccaaacaattgatccatcaagtcgtcaatcct 21568087  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||| || |||||||| ||||| || || || ||||||||||    
T  21568086 cggcagcggatacctgttctttatcgtcactttgttcaact 21568046  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #50
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 23998035 - 23998475
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||| ||| ||||||    
T  23998035 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttcctccaaccaaaactcacacttagacaacttggcacataactggttctctttcaagacttacaacacaatc 23998134  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| ||| |||||||| ||||| || | |||  | || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  23998135 ctcaaatgttcagcatgctcttcctcggactttcaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 23998234  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  23998235 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 23998334  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  23998335 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 23998434  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  23998435 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 23998475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #51
Raw Score: 53; E-Value: 3e-21
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1647308 - 1646868
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |     || |||||||| |||||||| ||||||    
T  1647308 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaagacttgcaacacaatc 1647209  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||  ||| || || | |||||| ||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  1647208 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaacttcgaatacaccaaaatgtcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 1647109  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||| |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  1647108 tcatatattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 1647009  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  1647008 atcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 1646909  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  1646908 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 1646868  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #52
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 378 - 469
Target Start/End: Original strand, 23080559 - 23080650
Alignment:
Q  378 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||| ||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23080559 ttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtgaatatctattctttatcgttactttattcaactg 23080650  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #53
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 345 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 8761930 - 8761805
Alignment:
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||| | |    
T  8761930 ttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacttgt 8761831  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| || ||  | ||||||||||||    
T  8761830 tctttattgtacctttgttcaactga 8761805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #54
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 5295701 - 5295573
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||  | ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| |||||    
T  5295701 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaacacgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaat 5295602  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcag 156  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  5295601 tttcagatgctctgcatgctcttcttcag 5295573  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #55
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 441
Target Start/End: Original strand, 18450289 - 18450702
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||| | || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||| | |||| ||||||||| |||||    
T  18450289 cagaaataatatgaccaagaaaactcccttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttccccttcagcacttgcaaaacaat 18450388  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttc-ttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
      ||| ||||||  ||||||| || || | | || ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || ||    
T  18450389 tctcaaatgctcgacatgttcctccttgaat-ttagagtatatcagaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacg 18450487  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     || ||||| |||||||| |||||  | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| || |  |  |||||  | || || |  ||||||||     
T  18450488 gttaatatattccataaatactcccagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatttctgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctga 18450587  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||| || ||||| ||||| |||| |||||| |  || || || |||||||| ||||| ||| | ||||||||||| |||||||||||||| |  || |    
T  18450588 atatcctcttctttcactttgatctagtgatagcccgagcttaagtcaattttactgaacacaagcgcacccactaattgatccatcaaatcgttgatcc 18450687  T
Q  427 acggaagtggatacc 441  Q
     ||||||||||||||    
T  18450688 tcggaagtggatacc 18450702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #56
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 469
Target Start/End: Original strand, 14130573 - 14130696
Alignment:
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||| || ||    ||||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||    
T  14130573 taatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttgctaaacacttccgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgatt 14130672  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     || || || || |||||||||||    
T  14130673 tttaatcgtcactttgttcaactg 14130696  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #57
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 346 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23025923 - 23025800
Alignment:
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    ||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || || ||     |||| || | ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||    
T  23025923 taatctgatgatatcttgacctcaaatcaatcttactaaacacctccacaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgatt 23025824  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  23025823 cttaatcgtcaccttgttcaactg 23025800  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #58
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 431 - 469
Target Start/End: Original strand, 28311819 - 28311857
Alignment:
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28311819 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 28311857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #59
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 434 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 23496281 - 23496245
Alignment:
Q  434 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23496281 tggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 23496245  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr6; HSP #60
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 469
Target Start/End: Original strand, 16100119 - 16100242
Alignment:
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| |  || |||||||||| |||    
T  16100119 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatccttggtagtggataccgatt 16100218  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  16100219 cttaatcgtcaccttgttcaactg 16100242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4 (Bit Score: 396; Significance: 0; HSPs: 42)
Name: chr4
Description:

Target: chr4; HSP #1
Raw Score: 396; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 14682483 - 14682930
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682483 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14682582  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  14682583 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 14682682  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14682683 atgcgattcatatactccataaactctccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataaccttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14682782  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682783 tctgcatatcgtcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcagatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14682882  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14682883 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14682930  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #2
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14302075 - 14301628
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14302075 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14301976  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14301975 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14301876  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14301875 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 14301776  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301775 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14301676  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14301675 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14301628  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #3
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 40474956 - 40475403
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40474956 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 40475055  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  40475056 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaag 40475155  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  40475156 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgggttctgaaagctgtct 40475255  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475256 tatgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 40475355  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40475356 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40475403  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8051719 - 8051272
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051719 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8051620  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8051619 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 8051520  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  8051519 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 8051420  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8051419 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 8051320  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8051319 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8051272  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #5
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 12478516 - 12478963
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478516 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 12478615  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  12478616 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12478715  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12478716 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 12478815  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  12478816 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 12478915  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12478916 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12478963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #6
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19776889 - 19776442
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776889 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 19776790  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  19776789 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 19776690  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19776689 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 19776590  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  19776589 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 19776490  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19776489 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19776442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #7
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 23957663 - 23958110
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  23957663 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 23957762  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  23957763 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 23957862  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  23957863 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 23957962  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  23957963 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 23958062  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23958063 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 23958110  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #8
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 8388336 - 8388775
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8388336 gaaataacatggccaaggaaactcacctcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 8388435  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388436 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 8388535  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  8388536 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 8388635  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  8388636 tcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 8388735  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8388736 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 8388775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 27713252 - 27713699
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27713252 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 27713351  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27713352 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27713451  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27713452 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27713551  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||| |||||||||||||    
T  27713552 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgacccatcaaatcatc 27713651  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27713652 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27713699  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #10
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18225542 - 18225094
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225542 catcaccagaaataacatggccaagaaaaggtacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18225443  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18225442 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 18225343  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18225342 atgcgattcatatactccataaacagtccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 18225243  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225242 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 18225143  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18225142 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 18225094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #11
Raw Score: 324; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15145981 - 15145541
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  15145981 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcctctctttcaacacttgcaa 15145882  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||    
T  15145881 gacaatgttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaagacaaccacgaatcgatccaaaaatgcatgaaag 15145782  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15145781 atacgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15145682  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||        ||    
T  15145681 tctgcatatcttcatcttttactttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatgttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca--------tc 15145590  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15145589 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 15145541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #12
Raw Score: 316; E-Value: 1e-178
Query Start/End: Original strand, 98 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16235012 - 16234641
Alignment:
Q  98 tttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacg 197  Q
    |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16235012 tttcttctctttcaacacttgcaaaacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacg 16234913  T
Q  198 aatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgac 297  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234912 aaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgtattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgac 16234813  T
Q  298 cataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacc 397  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||    
T  16234812 cataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacc 16234713  T
Q  398 cactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16234712 cactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16234641  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #13
Raw Score: 293; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 101 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17093166 - 17092798
Alignment:
Q  101 cttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaat 200  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || ||     
T  17093166 cttctctttcaacacttgtaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaac 17093067  T
Q  201 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17093066 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccat 17092967  T
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 400  Q
    ||||| |||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  17092966 aacgcgttctgaaagccgtcttctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccac 17092867  T
Q  401 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||  |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17092866 tagttgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17092798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #14
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 22 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 16353604 - 16353241
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggcca-agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| ||||||||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16353604 catcaccagaaataacatggccanagaaaacttacctcttttaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 16353505  T
Q  121 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  16353504 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaa 16353405  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  16353404 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtc 16353305  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 384  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  16353304 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 16353241  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #15
Raw Score: 218; E-Value: 1e-119
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14849456 - 14849015
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  14849456 cagaaataacttggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 14849357  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||| | ||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  14849356 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcggacttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 14849257  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||  ||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| ||||||||||    
T  14849256 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatctctttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgca 14849157  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||| | |||||||| ||||||||||  || ||||||||||  ||||| || ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||      
T  14849156 tatcttcatctctcactttaatttggtgataacccgatctcaaatcaaccttgctaaatacacgcgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatttt 14849057  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||||||    
T  14849056 tggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaactg 14849015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #16
Raw Score: 185; E-Value: 1e-100
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 14696036 - 14696476
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||||    
T  14696036 agaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttagcatataaattcttctctttcagcacttgcaaaacaatc 14696135  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| | ||||||| | ||||| || ||    |    
T  14696136 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacgaagcaatccaaatacgcatgaaaaatagagt 14696235  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| |||  ||||| ||| || ||||||||| |||| || || |||||||||||    
T  14696236 tcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccaaaaggcatcactgaatattaataatgtccataacgcgttctaaaggccgtcttctgcat 14696335  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| | |||||| |||||||| ||||| ||||  || ||||||||||| ||||| || |||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  14696336 atccttatctttcactttaatttggtgttaacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtacacccactaactgatccataaaatcatcaattctt 14696435  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||| ||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  14696436 ggaagtagatacatattctttatcgttactttgttcaactg 14696476  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #17
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15001714 - 15001273
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||| | |||||||| |||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15001714 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagact-cacatttaaacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 15001616  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  15001615 cctcagatgttctgcatgctcttcttcaatcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcgg 15001516  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||| |||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   | || || || ||||||||||    
T  15001515 ttcatatactccataaacacaacaggcgcattagtatcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttctgca 15001416  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  15001415 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcct 15001316  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  15001315 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 15001273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #18
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 39 - 469
Target Start/End: Original strand, 14161403 - 14161833
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 137  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||| || |||||||| || |  |||||||||| ||||    
T  14161403 tggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacatttcgacaacttggcatacaacttactt-tccttcaacacctgtagaacaatcttcaaatgc 14161501  T
Q  138 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 237  Q
    ||||||||||||||||| ||||  || ||||| |  |||||||| || || |||||||||||   ||||| | | ||||| || || |  ||||||||||    
T  14161502 tcagcatgttcttcttctgtctcagaataaattaggatatcatcaataaatacaactacgaacttatccagataagcatgaaaaattctgttcatatact 14161601  T
Q  238 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatc 337  Q
    ||||||| |||||||||||||| | |||||| |||||||| |||  | ||||||| || |  |||||  | || ||||| |||||||| ||||||||||     
T  14161602 ccataaatactccaggtgcattagaaacaccgaaaggcatcactgaaaattcataatgtctgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctgtatatcttcatt 14161701  T
Q  338 ttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgga 437  Q
     |||||| |||||||||||||||  || ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||    
T  14161702 ctttactctaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtgga 14161801  T
Q  438 tacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||  || |||||||||||||||||    
T  14161802 tacctattctgtatcgttaccttgttcaactg 14161833  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #19
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 201 - 468
Target Start/End: Original strand, 16218325 - 16218592
Alignment:
Q  201 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16218325 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16218424  T
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 400  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16218425 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16218524  T
Q  401 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16218525 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 16218592  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #20
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 201 - 468
Target Start/End: Original strand, 16221645 - 16221912
Alignment:
Q  201 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 300  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||| || |   |||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||    
T  16221645 cgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacacacctgacacatttgtaacaccgaagggcatcactttatattcataatgtccat 16221744  T
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 400  Q
    ||||  |||| |||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||  |||||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||    
T  16221745 aacgtgttctaaaagctgtcttctgcatatcctcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccac 16221844  T
Q  401 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||| |||||| || |||||||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  16221845 taactaatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 16221912  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #21
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 15357470 - 15357028
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| |  ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  15357470 cagaaataatgtggccaagaaaacttaattcacttaaccagaactcacatttcgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaat 15357371  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || |||||  ||||   |||||   | |||||||| || ||     
T  15357370 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccgcgaacttatccaggtaggcatggaaaattcgg 15357271  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  15357270 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 15357171  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  15357170 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 15357071  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  15357070 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 15357028  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #22
Raw Score: 136; E-Value: 1e-70
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Original strand, 15072282 - 15072701
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||  || ||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  15072282 agaaataatgtgaccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaatc 15072381  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||||||||| ||||| |||| |||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| |  | ||    
T  15072382 ttcagatgctctgcatgctcttattcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaactctat 15072481  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || || ||| |    
T  15072482 tcatgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttttgcgt 15072581  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||  |    
T  15072582 atcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattatc 15072681  T
Q  429 ggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||| || |||||    
T  15072682 ggaagtggatatctgttctt 15072701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #23
Raw Score: 130; E-Value: 4e-67
Query Start/End: Original strand, 22 - 199
Target Start/End: Complemental strand, 18613920 - 18613743
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||| |||||||| || | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18613920 catcaccagatataacatggcctagaaaacttacttttttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18613821  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaa 199  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||||    
T  18613820 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcaataaacacaactacgaa 18613743  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #24
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 51605148 - 51604704
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  51605148 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 51605049  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  51605048 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 51604949  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || ||||| ||||    
T  51604948 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaagccgtct 51604849  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  51604848 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 51604749  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  51604748 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 51604704  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #25
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 16149633 - 16150075
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16149633 cagaaataatgtggcaaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaat 16149732  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| || || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16149733 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaatcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 16149832  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16149833 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16149932  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16149933 tatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 16150032  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  16150033 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 16150075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #26
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 16153779 - 16154221
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||| ||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || || || || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  16153779 cagaaataatgtggctaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgataacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaatacaat 16153878  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||| | || ||||||| |||||| || || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16153879 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcattgaataaatcagaatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 16153978  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  16153979 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16154078  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  16154079 tatcctcatccttcaccttaatctggtggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 16154178  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  16154179 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 16154221  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #27
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 8707833 - 8708271
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||| |||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  8707833 cagaaataatatggccaataaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttccttcaacacttgcaacacaac 8707932  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||  |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||||| || | |    
T  8707933 tttctaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattcta 8708032  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||  | || || |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  8708033 ttcatgtactccataaacacaccccgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtgctaaaggccgttttctaca 8708132  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||  |||||||||||    || || || || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  8708133 tatcttcatcttttactttaatatgatggtaacccgacctcaaatc----ttactaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 8708228  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  8708229 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 8708271  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #28
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 312 - 469
Target Start/End: Original strand, 22631910 - 22632067
Alignment:
Q  312 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatcca 411  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  22631910 aaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatcca 22632009  T
Q  412 tcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  22632010 tcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 22632067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #29
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 118 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1647537 - 1647207
Alignment:
Q  118 gcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatg 217  Q
    |||| ||||||||||| || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| |||||    
T  1647537 gcaacacaatcttcaggtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaatgaataccaccacgaatttatccagaaaagcatg 1647438  T
Q  218 gaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagct 317  Q
    ||| || | ||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||     
T  1647437 gaaaatcctattcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgagtcctaaaggcc 1647338  T
Q  318 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 417  Q
    |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || ||||| |||||||| |    
T  1647337 gtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaactggtccatcaagt 1647238  T
Q  418 catcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||| | |||||||||||||||||||||    
T  1647237 catcaatcctcggaagtggatacctattctt 1647207  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #30
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 237 - 468
Target Start/End: Original strand, 23443237 - 23443467
Alignment:
Q  237 tccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcat 336  Q
    ||||||||||| || || ||||| |||| ||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||||||  |||| |||| |||||| |||||||||||||    
T  23443237 tccataaacacacctggcgcattcgtaa-accgaaaggcatcactttatactcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttatgcatatcttcat 23443335  T
Q  337 cttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgg 436  Q
    |||| |||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||| | || |||| |||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||    
T  23443336 ctttcactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttggtaaacacacatgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtgg 23443435  T
Q  437 atacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    |||| ||||||| || ||||| ||||||||||    
T  23443436 atacatattctttatcgttactttgttcaact 23443467  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #31
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 27902308 - 27902750
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| || || ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  27902308 cagaaataatgtggcctagaaaactcacttcatttaactagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 27902406  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||  || || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||| ||| || || || || ||||||  |||||  || |||||||| || ||    
T  27902407 tcttcatgtgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatgatcaataaataccaccacgaatttatccaggaaagcatggaaaattcg 27902506  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||    
T  27902507 gttcatatactccatgaacactccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 27902606  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || |  || |||||||| |||||||| |    
T  27902607 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccatttggtccatcaagtcatcaatcc 27902706  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  27902707 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 27902750  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #32
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 65 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 44660179 - 44659774
Alignment:
Q  65 ccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggag 164  Q
    |||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| |||||||     
T  44660179 ccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaa 44660080  T
Q  165 taaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaa 264  Q
    || || |||||||| || || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||    
T  44660079 tagattaaaatatcgtcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaa 44659980  T
Q  265 caccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttga 364  Q
    |||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||| |||    
T  44659979 caccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacctga 44659880  T
Q  365 cctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttc 464  Q
    |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  || || ||||| || |||||||| || |||||||||    
T  44659879 cctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctagggagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttc 44659780  T
Q  465 aactga 470  Q
    ||||||    
T  44659779 aactga 44659774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #33
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 99 - 469
Target Start/End: Original strand, 15257921 - 15258290
Alignment:
Q  99 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 198  Q
    ||||| |||||| | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||||| ||| | || |||||||| |||||||| || |||||||| || |    
T  15257921 ttcttttctttcgatacttgcaatacaatctttagatgctctgcatgctcttcttcggtccttgaataaatcaagatatcatcaataaacacaaccacaa 15258020  T
Q  199 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 298  Q
    ||  || || | | |||||||| || || |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||    
T  15258021 atttattcagataggcatggaaaattcggttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgacc 15258120  T
Q  299 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 398  Q
    ||| ||  | || || || |||||||||||||  ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||| || ||||| ||||||    
T  15258121 atatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatattctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctaaacacacgagcaccc 15258220  T
Q  399 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||| ||  |||||||||| | || |||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  15258221 actaactgatcgat-taatcatcaatcctcgaaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactg 15258290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #34
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29451887 - 29451445
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||    
T  29451887 cagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaat 29451788  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||||||| || ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  29451787 tctcagatgatctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 29451688  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  29451687 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 29451588  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  29451587 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 29451488  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||    
T  29451487 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaaccttgttcaactga 29451445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #35
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 3263144 - 3262702
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  3263144 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 3263045  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  3263044 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 3262945  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  3262944 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 3262845  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  3262844 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 3262745  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  3262744 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 3262702  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #36
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 274
Target Start/End: Original strand, 15323139 - 15323385
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  15323139 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaat 15323238  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |    
T  15323239 tttcagatgctctgcatgctcttcttcactcttagaataaattacaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcta 15323338  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaagg 274  Q
    ||||| || ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||    
T  15323339 ttcatgtattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagg 15323385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #37
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 108 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11205502 - 11205140
Alignment:
Q  108 ttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatcca 207  Q
    |||||||||||||| |||||  |||| || || ||||| || |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   |||||    
T  11205502 ttcaacacttgcaatacaattctcaggtgttctgcatgctcctcttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatcca 11205403  T
Q  208 aaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcat 307  Q
     ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  |    
T  11205402 gaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgt 11205303  T
Q  308 tctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactga 407  Q
     || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| ||||| || |     ||||| || || |||    
T  11205302 cctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttgctaaagatcttagcaccaaccaattga 11205203  T
Q  408 tccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  11205202 tccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 11205140  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #38
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 366 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16251602 - 16251498
Alignment:
Q  366 ctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 465  Q
    ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16251602 ctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatacatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 16251503  T
Q  466 actga 470  Q
    |||||    
T  16251502 actga 16251498  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #39
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 22 - 132
Target Start/End: Complemental strand, 1640436 - 1640326
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||| ||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1640436 catcaccagaaataacatggctaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 1640337  T
Q  122 gacaatcttca 132  Q
     ||||||||||    
T  1640336 aacaatcttca 1640326  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #40
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15291507 - 15291067
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  15291507 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 15291408  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || ||  | |||| | | | ||| || ||   ||    
T  15291407 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaatggtccagataaggatgaaatattttat 15291308  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15291307 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15291208  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15291207 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15291108  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15291107 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15291067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #41
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 16353244 - 16353174
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  16353244 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgat 16353174  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr4; HSP #42
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 22 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 29037500 - 29037427
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataa 95  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  29037500 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataa 29037427  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5 (Bit Score: 388; Significance: 0; HSPs: 48)
Name: chr5
Description:

Target: chr5; HSP #1
Raw Score: 388; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 22349767 - 22350214
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22349767 catcaccataaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22349866  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22349867 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22349966  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  22349967 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 22350066  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350067 tctgcatatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22350166  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22350167 aattctcggaaatggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22350214  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 14998277 - 14997830
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  14998277 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 14998178  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  14998177 aacaatcttcagatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 14998078  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  14998077 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 14997978  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997977 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14997878  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14997877 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 14997830  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #3
Raw Score: 369; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22331425 - 22330981
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22331425 catcaccagaaataacatagcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22331326  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22331325 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22331226  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22331225 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22331126  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331125 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22331026  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22331025 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 22330981  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #4
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 37290034 - 37289587
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37290034 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 37289935  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  37289934 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 37289835  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||    
T  37289834 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtct 37289735  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  37289734 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 37289635  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||    
T  37289634 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactg 37289587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #5
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 27612202 - 27612649
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27612202 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 27612301  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  27612302 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 27612401  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27612402 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 27612501  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||| ||||||||||||||    
T  27612502 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctggtccatcaaatcatc 27612601  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27612602 aattctcggaagtggatacctatttttgatagttaccttgttcaactg 27612649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 29474611 - 29474164
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474611 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgataatttatcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 29474512  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || ||  |||||||||||||||| |||    
T  29474511 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaag 29474412  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  29474411 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 29474312  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474311 tctgcatatctccatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 29474212  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  29474211 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 29474164  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 41772690 - 41773137
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |||||||||||||||||||||||    
T  41772690 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacatttagacaatttagcataaaaattcttctctttcaacacttgcaa 41772789  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  41772790 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 41772889  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  41772890 atgcgattcatatactccataaacactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 41772989  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  41772990 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 41773089  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  41773090 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 41773137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 27520254 - 27520701
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  27520254 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 27520353  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27520354 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27520453  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  27520454 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 27520553  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  27520554 tctgcatatcctcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 27520653  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27520654 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27520701  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #9
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 16358350 - 16358797
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16358350 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 16358449  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16358450 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 16358549  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16358550 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 16358649  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16358650 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 16358749  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16358750 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16358797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #10
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 22136516 - 22136963
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136516 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22136615  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22136616 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22136715  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  22136716 atgcgattcatataccccataaacactccaggtgcattagtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtct 22136815  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136816 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22136915  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22136916 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22136963  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #11
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27683938 - 27683491
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||| |||||||||||||    
T  27683938 catcaccagagataacatggcctagaaaactcacttctttgaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctctcaacacttgcaa 27683839  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||  ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  27683838 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcgtcagtcttggagtaaatcaaaatattgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 27683739  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  27683738 atgcgattcatatactccatagacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 27683639  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683638 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 27683539  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27683538 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27683491  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 34568342 - 34568789
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  34568342 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 34568441  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  34568442 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 34568541  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  34568542 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 34568641  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  34568642 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 34568741  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  34568742 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 34568789  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #13
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 19771808 - 19772255
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19771808 catcaccaaaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 19771907  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  19771908 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 19772007  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  19772008 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 19772107  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | | ||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  19772108 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgatatcctcacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagttgatccatcaaatcatc 19772207  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19772208 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19772255  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #14
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27667020 - 27666581
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  27667020 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 27666921  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666920 tcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 27666821  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  27666820 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcaaaactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 27666721  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||    
T  27666720 tcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattctcg 27666621  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  27666620 aaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 27666581  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #15
Raw Score: 344; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 40710636 - 40711075
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  40710636 gaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 40710735  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  40710736 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 40710835  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  40710836 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 40710935  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  40710936 tcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 40711035  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40711036 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40711075  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #16
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 446
Target Start/End: Original strand, 20801245 - 20801669
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  20801245 catcaccagaaatgacatggccaaggaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaa 20801344  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || | ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  20801345 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgataaagaaaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 20801444  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20801445 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 20801544  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  20801545 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatgaaatcatc 20801644  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattc 446  Q
    ||||| |||||| ||||||||||||    
T  20801645 aattctcggaagaggatacctattc 20801669  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #17
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 18780962 - 18781409
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18780962 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaatcagaattcacacttagacaatttcgcaaaaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18781061  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||    
T  18781062 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 18781161  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  18781162 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcgttggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 18781261  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  18781262 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaaatcatc 18781361  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18781362 aattctcggaggtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 18781409  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #18
Raw Score: 286; E-Value: 1e-160
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 25428287 - 25428728
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  25428287 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaactagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 25428386  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||    
T  25428387 attcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaatcggtccaaaaatgcatgaaagatgcga 25428486  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| | |||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  25428487 ttcatgtactccataaatagtccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtggccataccgcgttctgaaagttgtcttctgca 25428586  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  25428587 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 25428686  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||    
T  25428687 cggaagtggatacctattctttattgttaccttgttcaactg 25428728  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #19
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26737259 - 26736818
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||| ||||||| ||||||||| | |||    
T  26737259 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttatctttcagcacttgcaaaataat 26737160  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||  ||    
T  26737159 cttcaaatgttcagcatgttcttcttcggacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatctaaaaatgcatgaaaaatttga 26737060  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  26737059 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 26736960  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  26736959 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaatacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 26736860  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  26736859 cggaagtggatacatattctttatcgttactttgttcaactg 26736818  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #20
Raw Score: 226; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21337826 - 21337385
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21337826 cagaaataacgtggccgagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 21337727  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| || || | ||||||||| ||||| || || |||    
T  21337726 cttcaagtgctcagcatgttcttcttcaaacttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaatacaaccactaagctatccaaaaacgcatgaaaaatacga 21337627  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||  |||| |||||||| |||||||    
T  21337626 ttcatgtattccataaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatatccataacgtgttctaaaagctgtattctgca 21337527  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| || |||| |||||||| ||||||||||||||| ||||||||||     
T  21337526 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacatgcacccaataactgatccatcaagtcatcaattct 21337427  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||| ||||||||||||||| || ||||| ||| |||||||    
T  21337426 tggaattggatacctattctttatcgttactttggtcaactg 21337385  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #21
Raw Score: 211; E-Value: 1e-115
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 23473081 - 23473519
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| ||||     
T  23473081 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaac 23473180  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     || | | ||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  23473181 ttttaaacgctcagcatgttcttcttcagactttgagtacatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 23473280  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||| |||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||| ||    
T  23473281 ttcatgtactccatagacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctaca 23473380  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||| || ||||||   || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  23473381 tatcttcatctttcactttaatttgatgataaaccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 23473480  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||    
T  23473481 tggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaa 23473519  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #22
Raw Score: 194; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20466631 - 20466190
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  20466631 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 20466532  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||| |||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  20466531 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgatcacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 20466432  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||| ||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||| ||||    
T  20466431 ttcatgtacttcataaacacacccggtgcattagtaacaccaaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttttgca 20466332  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || ||||| ||||||||||||||||||| ||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||     
T  20466331 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccagtaactgatccatcaaatcatcaattct 20466232  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||  || ||||||||    
T  20466231 tggaagtggatacttattctttattgttagtttattcaactg 20466190  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #23
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 22234451 - 22234032
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| || || ||| |||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  22234451 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgataacttgacatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatc 22234352  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||    |    
T  22234351 ttcagatgatctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgt 22234252  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||||||||||| |||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||   | || || || |||||| ||||    
T  22234251 tcatatactccacaaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacatgtcctaaaggccgtcttcggcat 22234152  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| |||||  | || |||||||| || |||| | |||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |    
T  22234151 atcctcatccatcaccttaatctgatggtaacctaacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctc 22234052  T
Q  429 ggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||||||||||    
T  22234051 ggaagtggatacctattctt 22234032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #24
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 72 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21562512 - 21562115
Alignment:
Q  72 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 171  Q
    |||||||| || || |||||||| || || || || ||||||||||| || ||||| || | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||    
T  21562512 tcacatttggaaaacttggcatacagctttttttccttcaacacttgaaacacaatttttaaatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatca 21562413  T
Q  172 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 271  Q
      || ||||| || ||||||||||| || | ||| ||| | |||||||| || | |||||| |||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| ||    
T  21562412 ggatgtcatctataaacacaactacaaaccaatctaaataggcatggaaaattctattcatgtactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaa 21562313  T
Q  272 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 371  Q
    || ||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||  |||||||||    
T  21562312 agacatcactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtggtaacccgacctcaaa 21562213  T
Q  372 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||| || |||||| |||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  21562212 tcaatcttgctgaacacgcgtgca-ccactaactgatccattaaaccatcaattctcggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 21562115  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #25
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 17267872 - 17267428
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || | |||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||||||||||||    
T  17267872 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaacttacatttcgacaatttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaa 17267773  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  |||| || || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||| ||     
T  17267772 cacaattctcaggtgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaggcatgaaaa 17267673  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  17267672 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 17267573  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| |||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  17267572 tctgcatatcctcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 17267473  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  17267472 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 17267428  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #26
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 20823289 - 20823731
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| ||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  20823289 cagaaataacgtggccgaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 20823387  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  20823388 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaatatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 20823487  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  20823488 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 20823587  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||| ||||| |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |    
T  20823588 atatcttcgtctttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatcc 20823687  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  20823688 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 20823731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #27
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28893474 - 28893032
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28893474 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28893376  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28893375 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28893276  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28893275 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28893176  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  28893175 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28893076  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  28893075 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 28893032  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #28
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28922300 - 28921858
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28922300 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28922202  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28922201 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28922102  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28922101 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28922002  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  28922001 atatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 28921902  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  28921901 gcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 28921858  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #29
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 20344153 - 20344560
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| ||||||||||||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  20344153 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaagacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 20344252  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||    
T  20344253 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcacgttagt 20344352  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||||      
T  20344353 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacca 20344452  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  20344453 gacctcaagtcaatcttgctaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgtgactttgt 20344552  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  20344553 tcaactga 20344560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #30
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 24796894 - 24796487
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  24796894 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 24796795  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  24796794 aataaattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 24796695  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||      
T  24796694 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataacca 24796595  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  24796594 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 24796495  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  24796494 tcaactga 24796487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #31
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 25849911 - 25850353
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||    
T  25849911 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatactat 25850010  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| |||| || |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||| ||| |||||||||||  |     
T  25850011 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttcgaataaatcaagatatcatcaatgaacactacaacaaacttatccagaaaagcatggaagatttgg 25850110  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  25850111 ttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 25850210  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  25850211 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaattttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 25850310  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || |||||||||||||||    
T  25850311 cggaagcggatatctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 25850353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #32
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 14885488 - 14885081
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| || ||||| || ||| ||||||    
T  14885488 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgtgttcctcctcattcttgg 14885389  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  14885388 aataaattaagatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 14885289  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || ||||| |||||||      
T  14885288 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcctttacctttatctgatgataacca 14885189  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  14885188 gacctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 14885089  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  14885088 tcaactga 14885081  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #33
Raw Score: 94; E-Value: 1e-45
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 22463781 - 22464229
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||  | || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |  ||||    
T  22463781 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgtacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgca 22463879  T
Q  121 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    | ||||||||||  || || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||||||    
T  22463880 acacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaa 22463979  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
     || || |||||||||||||| ||||  ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||    
T  22463980 aattcggttcatatactccatgaacataccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtc 22464079  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||| || |||||||| || || ||||  |||||||  ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  22464080 ttctgcatatcttcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaggtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcat 22464179  T
Q  421 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  22464180 caatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 22464229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #34
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 22504515 - 22504957
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||| |||||||| |||||    
T  22504515 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaaaacttgcaatacaat 22504614  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || |||||  |||| || ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  22504615 tctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttagaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 22504714  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||  | || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || ||  |||||||||    
T  22504715 ttcatgtactccataaacacaccaggctcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgca 22504814  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||| ||||| || |||||||  |  ||||| || ||||||| |||||| ||||||||||     
T  22504815 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaactgattcatcaagtcatcaattct 22504914  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
      |||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  22504915 atgaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 22504957  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #35
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 20777749 - 20778191
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    ||||| |||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  20777749 cagaagtaacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 20777847  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    |||| || || |  || ||||| |||||| | || || || |||||||||||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  20777848 tctttaggtgtttggcgtgttcctcttcaattttagaatagatcaaaatatcatctataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 20777947  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| || || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  |||| || || |||||||||    
T  20777948 gttcatatactccatgaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgc 20778047  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| || ||||| |    
T  20778048 atatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcgtcaatcc 20778147  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  20778148 gcgggagtggatacctattctttattgtaaccttgttcaactga 20778191  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #36
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 45 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 37541896 - 37541471
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| || |    
T  37541896 agaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcgt 37541797  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    |||| || ||| ||||||| || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || |||||||| || ||||||||    
T  37541796 gttcctcctcattcttggaatagattagaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaggcatggaaaattcgattcatgtattccataaa 37541697  T
Q  245 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 344  Q
     || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||     
T  37541696 aacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacc 37541597  T
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |    
T  37541596 tttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgt 37541497  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||| || || ||||||||||||    
T  37541496 tcttgatcgtaactttgttcaactga 37541471  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #37
Raw Score: 77; E-Value: 2e-35
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21935719 - 21935279
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21935719 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 21935620  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  21935619 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 21935520  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| |   ||| ||| || || ||    ||    
T  21935519 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatat 21935420  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  21935419 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 21935320  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21935319 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21935279  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #38
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 23507521 - 23507961
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| |    |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  23507521 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaactttgcacatcactggttctctttcaatacttgcaacacaatc 23507620  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  23507621 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 23507720  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  23507721 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 23507820  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  23507821 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 23507920  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  23507921 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 23507961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #39
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 21408991 - 21409408
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||   |||| ||||||||| |||||    
T  21408991 cagaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataaattcttc---ttcagcacttgcaaaacaat 21409087  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||| |||||| |||||||| || |||| ||| |||||  ||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || | |    
T  21409088 tctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatttcagaatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacaa 21409187  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||| ||   |||||| |  || || ||| |  | || || || |||||||| |    
T  21409188 ttcatatattccataaatactcctggcgcattaataacaccgaaaggcatcacagaatattcgttatgtccgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 21409287  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| ||||| || |||||||| |   | || || |||||||| ||||| ||||| |||||||  ||||||||||||||||| || || |     
T  21409288 tatcctcatctttcactttgatatggtgatagccccatcttaagtcaattttactgaacacacgcgcacccatcaactgatccatcaaatcgtcgatcct 21409387  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||| ||||||| ||||||||    
T  21409388 cggaggtggatatctattctt 21409408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #40
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28914945 - 28914640
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28914945 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28914847  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28914846 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28914747  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28914746 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28914647  T
Q  327 atatctt 333  Q
    |||||||    
T  28914646 atatctt 28914640  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #41
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 28 - 333
Target Start/End: Complemental strand, 28930213 - 28929908
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    ||||||| |||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  28930213 cagaaatgacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 28930115  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  28930114 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaatagatcaatatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 28930015  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  28930014 gttcatatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 28929915  T
Q  327 atatctt 333  Q
    |||||||    
T  28929914 atatctt 28929908  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #42
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 21679310 - 21679037
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21679310 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 21679211  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | || |||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  ||| |   |  |||| || || |      
T  21679210 cctcggatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatctaggtaaacatgaaaaattctg 21679111  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||| | || ||||||||    
T  21679110 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatatccgtaatgaccata 21679037  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #43
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 24583047 - 24583487
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| |||||     
T  24583047 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatt 24583146  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||  ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  24583147 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcaaactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 24583246  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  24583247 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 24583346  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  24583347 atcttttgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 24583446  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24583447 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24583487  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #44
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24618823 - 24618700
Alignment:
Q  32 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 131  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24618823 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24618724  T
Q  132 agatgctcagcatgttcttcttca 155  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24618723 agatgctctgcatgctcttcttca 24618700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #45
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24715054 - 24714931
Alignment:
Q  32 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 131  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24715054 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24714955  T
Q  132 agatgctcagcatgttcttcttca 155  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24714954 agatgctctgcatgctcttcttca 24714931  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #46
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 32 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 24748082 - 24747959
Alignment:
Q  32 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 131  Q
    ||||| |||||| |||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  24748082 aataatatggcccagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttc 24747983  T
Q  132 agatgctcagcatgttcttcttca 155  Q
    |||||||| ||||| |||||||||    
T  24747982 agatgctctgcatgctcttcttca 24747959  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #47
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 22 - 70
Target Start/End: Original strand, 23442056 - 23442104
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaa 70  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  23442056 catcaccagaaatgacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaa 23442104  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr5; HSP #48
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 333 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21677061 - 21676946
Alignment:
Q  333 tcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaa 432  Q
    |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || ||||||| |||||    
T  21677061 tcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattctcggaa 21676962  T
Q  433 gtggatacctattctt 448  Q
    | ||||| ||||||||    
T  21676961 gcggatatctattctt 21676946  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0454 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 1)
Name: scaffold0454
Description:

Target: scaffold0454; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 8885 - 9332
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8885 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8984  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  8985 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 9084  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  9085 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 9184  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9185 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 9284  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9285 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 9332  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 73)
Name: chr3
Description:

Target: chr3; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15401112 - 15400665
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15401112 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaa 15401013  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15401012 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15400913  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  15400912 atgcgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 15400813  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400812 tctgcatatcttcatctttcactttaatttggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15400713  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15400712 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15400665  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #2
Raw Score: 372; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 12888252 - 12888691
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  12888252 gaaataacatggccaagtaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaattttgcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 12888351  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888352 tcaggtgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacactactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 12888451  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  12888452 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 12888551  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  12888552 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 12888651  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12888652 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 12888691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #3
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5109198 - 5108759
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||    
T  5109198 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatct 5109099  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5109098 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaagatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5108999  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  5108998 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 5108899  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5108898 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5108799  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5108798 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 5108759  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #4
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 10007141 - 10007582
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10007141 cagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 10007240  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10007241 cttcagatgctcagaatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 10007340  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10007341 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 10007440  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10007441 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattct 10007540  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10007541 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10007582  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #5
Raw Score: 362; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 10907751 - 10908192
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  10907751 cagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 10907850  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  10907851 cttcagatgctcaaaatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 10907950  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  10907951 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 10908050  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||     
T  10908051 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattct 10908150  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10908151 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 10908192  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #6
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 13254225 - 13254672
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  13254225 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 13254324  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  13254325 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 13254424  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  13254425 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 13254524  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  13254525 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagttgatccatcaaatcatc 13254624  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13254625 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 13254672  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #7
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20060649 - 20060202
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060649 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccaaaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 20060550  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  20060549 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 20060450  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20060449 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 20060350  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20060349 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 20060250  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20060249 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 20060202  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #8
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 3687486 - 3687925
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  3687486 gaaataacatgacctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 3687585  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687586 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 3687685  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||||    
T  3687686 catatactccataaacactccaggtgcattggtaactccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcata 3687785  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  3687786 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgctcccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 3687885  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3687886 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 3687925  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #9
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 5423517 - 5423078
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  5423517 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaacaagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 5423418  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423417 tcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttagagtaaatcaagatatcgtcgatgaacataactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 5423318  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||    
T  5423317 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctaaaagctgtcttctgcata 5423218  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  5423217 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 5423118  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  5423117 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 5423078  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #10
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15346832 - 15346393
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  15346832 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 15346733  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346732 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 15346633  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  15346632 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 15346533  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| |||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  15346532 tcttcatcctttactttaagctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 15346433  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15346432 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15346393  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #11
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 48426982 - 48427429
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  48426982 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 48427081  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  48427082 aacaatcttcagatgctcggcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 48427181  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  48427182 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 48427281  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  48427282 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 48427381  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  48427382 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 48427429  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #12
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 16637308 - 16637755
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| ||    
T  16637308 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgtaa 16637407  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  16637408 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 16637507  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||    
T  16637508 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaagggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtct 16637607  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  16637608 tctgcatatcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 16637707  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16637708 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16637755  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #13
Raw Score: 350; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 6602277 - 6602718
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  6602277 cagaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaat 6602376  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  6602377 cgtcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 6602476  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||| ||||    
T  6602477 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttttgca 6602576  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  6602577 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 6602676  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  6602677 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgctcaactg 6602718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #14
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15587987 - 15587540
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  15587987 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 15587888  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||| |||||||||||||    
T  15587887 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccagaaatgcatggaag 15587788  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  15587787 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgcgttctgaaagctgtct 15587688  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  15587687 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 15587588  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15587587 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15587540  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #15
Raw Score: 346; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16805535 - 16805094
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805535 agaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 16805436  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  16805435 ttcagatgctcagcatgttctccttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 16805336  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||    
T  16805335 tcatgtactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtgctgaaagctgtcttctgcat 16805236  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  16805235 atcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctc 16805136  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  16805135 ggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 16805094  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #16
Raw Score: 342; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 53383605 - 53383168
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||    
T  53383605 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacctgtaagacaatct 53383506  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  53383505 tcagatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 53383406  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  53383405 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 53383306  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  53383305 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 53383206  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 467  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  53383205 gaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaac 53383168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #17
Raw Score: 320; E-Value: 1e-180
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16755288 - 16754849
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||   | ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||    
T  16755288 gaaataacatggccaaggaaactcacttcattcaaccagaattcacacacaaacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaaaacaatct 16755189  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||| ||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16755188 tcaaatgttccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16755089  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  16755088 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 16754989  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16754988 tcctcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 16754889  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16754888 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16754849  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #18
Raw Score: 309; E-Value: 1e-174
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 16693699 - 16694147
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16693699 catcaccagaaataacatgaccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaa 16693798  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||| || |||||||||||||||||||||    
T  16693799 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatttcgtctataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaag 16693898  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  16693899 atgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaatggcataactttatattcatagtgaccatagcgcgttctgaaagctgtct 16693998  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||    ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16693999 tctgcatatcttcatctttcacattaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaagactttcgcacccactaactgatccatcaagtcatc 16694098  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||    
T  16694099 aattctcggaagtggatacatattcttgatagttaccttattcaactga 16694147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #19
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 22 - 440
Target Start/End: Complemental strand, 14875094 - 14874676
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14875094 catcaccagaaataacaaggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14874995  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  14874994 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaatcgatccaaaaaggcatgaaag 14874895  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| ||| ||||||||| |||||    
T  14874894 atgcgattcatgtactccatgaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataccgcgttctgaaagatgtct 14874795  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14874794 tctgcaaatcttcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 14874695  T
Q  422 aattcacggaagtggatac 440  Q
    ||||| |||||||||||||    
T  14874694 aattctcggaagtggatac 14874676  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #20
Raw Score: 292; E-Value: 1e-164
Query Start/End: Original strand, 22 - 381
Target Start/End: Complemental strand, 15723529 - 15723170
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15723529 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttcgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15723430  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||    
T  15723429 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatgaaag 15723330  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||    
T  15723329 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgtgttctgaaagctgtct 15723230  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgc 381  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||    
T  15723229 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgc 15723170  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #21
Raw Score: 267; E-Value: 1e-149
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 17491391 - 17491829
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17491391 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17491490  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||| ||| |||||||||    
T  17491491 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgaatgaaagatgcga 17491590  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||| |||||| |||||||||||||| |||||||  |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| ||||||||||||| |||||||    
T  17491591 ttcatgtacttcataaatactccaggtgcatttgtaacactgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgttttctgca 17491690  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||     
T  17491691 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaataatcaattct 17491790  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  17491791 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 17491829  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #22
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 22 - 331
Target Start/End: Original strand, 12499783 - 12500092
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  12499783 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctatcaacacttgcaa 12499882  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  12499883 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 12499982  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  12499983 atgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 12500082  T
Q  322 tctgcatatc 331  Q
    | ||||||||    
T  12500083 tatgcatatc 12500092  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #23
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 15261171 - 15261612
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||  ||||||| |||||||| |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  15261171 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttttacaatttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 15261270  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||    
T  15261271 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatatatcaaaatatcatcgatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaagatacga 15261370  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||  ||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  15261371 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttctaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccatcttctgca 15261470  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| | |||||||| ||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15261471 tatcttcatctttcagtttaatctagtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaattcatcaattct 15261570  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||| |||||    
T  15261571 cggaagtggatatctattctttatcgtcactttgtttaactg 15261612  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #24
Raw Score: 237; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 22 - 294
Target Start/End: Original strand, 15340804 - 15341076
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  15340804 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacactcgcaa 15340903  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  15340904 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 15341003  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagt 294  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15341004 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagt 15341076  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #25
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 290 - 469
Target Start/End: Original strand, 15357886 - 15358065
Alignment:
Q  290 atagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaaca 389  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15357886 atagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcatcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaaca 15357985  T
Q  390 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  15357986 cgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagtaaccttgttcaactg 15358065  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #26
Raw Score: 141; E-Value: 1e-73
Query Start/End: Original strand, 248 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 14579777 - 14579557
Alignment:
Q  248 tccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttacttta 347  Q
    |||||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  14579777 tccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccgcattctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcacttta 14579678  T
Q  348 atctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattct 447  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||    
T  14579677 atctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctattct 14579578  T
Q  448 tgatagttaccttgttcaact 468  Q
    | || |||||||| |||||||    
T  14579577 ttatcgttaccttattcaact 14579557  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #27
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 45 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11959730 - 11959305
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    ||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  11959730 agaaaactcacttcacttaaccagaattcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 11959631  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    | || |||||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||||||||  |||  ||||| ||| |||||||| || | ||||||||| ||||||||    
T  11959630 gctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacacaactagaaatttatccagaaaagcatggaaaatcctattcatatattccataaa 11959531  T
Q  245 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 344  Q
    ||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||  |||||||||||||| ||||| || ||     
T  11959530 cacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgtcttctgcatatcctcatccttgacc 11959431  T
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    || ||||| || ||||  |||||||||||||| || ||||| ||   ||||| |||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||    
T  11959430 ttcatctgatggtaaccagacctcaaatcaatcttactgaacacctttgcactcactaactgatccatcaagtcatcaattctcggaagtggatacctat 11959331  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| || || || ||||||||||||    
T  11959330 tctttatcgtaactttgttcaactga 11959305  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #28
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 15229154 - 15229574
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15229154 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 15229253  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | ||||||||  | | |    
T  15229254 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttcta 15229353  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  15229354 ttcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctaca 15229453  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||  | || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  15229454 tatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattct 15229553  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15229554 cggaagtggatacctattctt 15229574  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #29
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 15235022 - 15235442
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||| |||||||||||| |||||  ||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  15235022 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaacccgaattcacatttggacaacatggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 15235121  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | ||||||||  | | |    
T  15235122 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaagttcta 15235221  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || ||||||||||| | ||| ||||| ||||| || |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || || |||| ||    
T  15235222 ttcatgtattccataaacacactaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctaca 15235321  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||  | || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||||||||     
T  15235322 tatcttcccccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatcgattaaatcatcaattct 15235421  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  15235422 cggaagtggatacctattctt 15235442  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #30
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 12179889 - 12180337
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  12179889 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaat 12179988  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||| ||  ||||||| ||||||  || ||   | |||||||| || ||     
T  12179989 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcgg 12180088  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata------gtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||      ||||||||||||  | || || || ||||    
T  12180089 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 12180188  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  12180189 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatc 12180288  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  12180289 aatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 12180337  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #31
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 332 - 469
Target Start/End: Original strand, 24185035 - 24185172
Alignment:
Q  332 ttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgga 431  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  24185035 ttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgga 24185134  T
Q  432 agtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24185135 agtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 24185172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #32
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11950486 - 11950044
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  11950486 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 11950387  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  11950386 cttcaaatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 11950287  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||  | || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  11950286 ttcatctactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatccccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 11950187  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || ||||| | ||||||||| || ||||||||||| || ||||| |     
T  11950186 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacccttgcacccaccaaatgatccatcaagtcgtcaatcct 11950087  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  11950086 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 11950044  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #33
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 128 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 16826754 - 16826439
Alignment:
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||  || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |||||     |||||||| || ||     
T  16826754 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctcagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcca-----gcatggaaaattcgg 16826660  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||  ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||| ||||  | || || |  ||||||||||    
T  16826659 ttcatatactccataaacacaccagacgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 16826560  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |     
T  16826559 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaatcct 16826460  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  16826459 cggaagtggatacctattctt 16826439  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #34
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 17187925 - 17188345
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  17187925 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 17188024  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||||||| || ||||| ||||| |||||| | || ||||||| ||| ||||| ||||| ||||| || |||  ||||||| | ||||| || || |      
T  17188025 tttcagatgttctgcatgctcttcctcagtccttgaataaatcagaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaaataggcatgaaaaattctg 17188124  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || ||  | || || || ||||||||||    
T  17188125 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 17188224  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||| || |     
T  17188225 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatccatcct 17188324  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  17188325 cggaagtggatacctgttctt 17188345  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #35
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31693752 - 31693321
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  31693752 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31693653  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| ||||||||||||||  | |||||||  || ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || |  |||||||||||    
T  31693652 ctgcatgctcttcttcagtctttaaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcagttcatatactc 31693553  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| || ||||| ||  | || ||||| |||||||||||||| |||||     
T  31693552 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcatatcctcatcc 31693453  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || || || || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||  | |||||||||||    
T  31693452 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaaccctcggaagtggat 31693353  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  31693352 acctgttctttatcgtaactttgttcaactga 31693321  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #36
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Original strand, 31940465 - 31940896
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| |    
T  31940465 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgtt 31940564  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| | |||||||||||| || |||||||  || ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  31940565 ctgcatgctattcttcagtctttgaataaatcagtatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 31940664  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| ||  |||| ||  | || || |||||||| |||||||| |||||     
T  31940665 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgtgcatatcgtgtcctaaaggctgtcttatgcatatcctcatcc 31940764  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || || || || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||||||||| |||||||| || ||||| | |||||||||||    
T  31940765 ttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaatcctcggaagtggat 31940864  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  31940865 acctgttctttatcgtaactttgttcaactga 31940896  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #37
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12359105 - 12358663
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  12359105 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 12359006  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  12359005 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaatacaaccactaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 12358906  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  |  | || || ||||||||||    
T  12358905 ttcatatactccatgaacacaccaggcgctttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgca 12358806  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||| | || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  12358805 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcattcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 12358706  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || |||| |||||||    
T  12358705 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgtgcaactga 12358663  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #38
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15014344 - 15013904
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat- 127  Q
    |||||||| |||||||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||     
T  15014344 agaaataatatggccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatt 15014245  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    || || |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || | ||||||||| || |||||||| || |||||||||||| | ||||| || || |||    
T  15014244 ctaca-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattagaatatcatctataaacacaacaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatacga 15014146  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || || |||||||   | || || |  |||||||| |    
T  15014145 ttcatatattccataaacactccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacatgtcctaaaggtcgtcttctgaa 15014046  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| ||| | || |||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||||||| |  || |     
T  15014045 tatcctcatctttcactctgatatggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcatccactaactaatccatcaaatcgtggatcct 15013946  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  15013945 cggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 15013904  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #39
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 13319080 - 13318634
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| | ||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || |||||||| ||||| || ||||| ||||||||| | |||||| | ||    
T  13319080 cagaaataacgtagcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaatttagcatacaaatttct-ctctttcaaaatttgcaacataa 13318982  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    |||||||||| || ||||| || |||| ||||||||| ||||| ||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||| || || ||    
T  13318981 tcttcagatgttctgcatgctcctctttagtcttggaataaattaaaatatcatcaataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatgaaaaattcg 13318882  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || || ||||| || ||||||||  |  | || || || |||||||||    
T  13318881 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgc 13318782  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  13318781 atatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatcc 13318682  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
     ||| |||||||| || ||||| || || || || |||||||||||||    
T  13318681 tcgggagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactgatgat 13318634  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #40
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 16379512 - 16379068
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| ||||| || ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  16379512 catcaccagaaataatatgaccaaggaaacttacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 16379413  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| ||||||| |||||| || ||||||| ||||||||| || || || || | ||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  16379412 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttaagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaataccaccaggaatttatccagaaaggcatgaaaa 16379313  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  16379312 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 16379213  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||||||||| || || |||||   |||||||||||  || |||||||| |||||    
T  16379212 tctgcatatcttcatcattcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatcttactaaaaacctttgcacccactaggtggtccatcaagtcatc 16379113  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | ||||||||||| ||||||||| || || || ||||||||    
T  16379112 aatcctcggaagtggatgcctattcttaattgtaactttgttcaa 16379068  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #41
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 41179067 - 41179511
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  41179067 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 41179166  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || | ||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  41179167 cacaattctcagatgttctgaatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 41179266  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || ||||| || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  41179267 attcgattcatatactccatgaacacaccgggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 41179366  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  41179367 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 41179466  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  41179467 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 41179511  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #42
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 13943569 - 13944013
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| |  ||| | |||||||| |||||||     
T  13943569 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaacttcctttctttcaaaacttgcag 13943668  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     | |||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  13943669 cataattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 13943768  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  13943769 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 13943868  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  13943869 tctgcatatcttcatctttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 13943968  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  13943969 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 13944013  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #43
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 44778792 - 44779236
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||| ||||||||| | |||| | |||||||| ||||||||    
T  44778792 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacagtttggcatacaatttcctttctttcaaaacttgcaa 44778891  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  44778892 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 44778991  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||| ||||||| || || || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  44778992 attcgattcataaactccatgaatacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 44779091  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  44779092 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 44779191  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||| |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  44779192 aattctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 44779236  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #44
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10418623 - 10418181
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| || || |||||||| || || || ||||  |||||||| |  ||| |||||||||| | |||||| |||||    
T  10418623 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacagcttggcatacaacttcctctctttcaatatttgcaacacaat 10418524  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||| || || || ||||| |||||||| || || || ||||| |||||||| || || || || || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  10418523 cttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagtttttgaatagatcaagatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 10418424  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || ||||| || ||  | || || || ||||||||||    
T  10418423 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 10418324  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||| || || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| ||||||||||||||||| |     
T  10418323 tatcttcgtccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaaatcatcaatccg 10418224  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  10418223 cggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 10418181  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #45
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 14088224 - 14088666
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  14088224 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 14088323  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  14088324 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 14088423  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  14088424 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 14088523  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  14088524 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 14088623  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  14088624 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 14088666  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #46
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 47125530 - 47125937
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  47125530 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 47125629  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || | ||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  47125630 aatagattagaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 47125729  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  47125730 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 47125829  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  47125830 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 47125929  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  47125930 tcaactga 47125937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #47
Raw Score: 89; E-Value: 1e-42
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16835094 - 16834651
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||||||||    
T  16835094 catcaccagaaataatatggccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaa 16834995  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||| ||||||| || ||||| || || |||||||| || ||||| |  || ||||| || || ||||| || ||   ||||| ||||||||| ||     
T  16834994 tacaatcctcagatgttctgcatgctcctcgtcagtcttagaataaattaggatgtcatcaataaatacaaccacaaacttatccagaaatgcatgaaaa 16834895  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||| | || |||||||||||  | || || || ||||    
T  16834894 attcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtatacgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 16834795  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||| |||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||      
T  16834794 tctgcatatctccatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtca-- 16834697  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
       || |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  16834696 ---tctcggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 16834651  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #48
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Original strand, 28755869 - 28756307
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  28755869 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacacaat 28755968  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  28755969 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 28756068  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  28756069 ttcatgtactccataaaaacacccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 28756168  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||      |||| || || ||||||||||| || |||||||     
T  28756169 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttaacaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattct 28756268  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||    
T  28756269 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaa 28756307  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #49
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 284 - 445
Target Start/End: Complemental strand, 11888687 - 11888526
Alignment:
Q  284 atattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctg 383  Q
    ||||||||| || ||||||||  | || || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||     
T  11888687 atattcataatgtccataacgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcta 11888588  T
Q  384 aaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||    
T  11888587 aacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatacctatt 11888526  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #50
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 239 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 14291899 - 14291690
Alignment:
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| |  |||||||||||||||||| ||||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  14291899 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaatgcatcatcttatattcatagtgaccaaaacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 14291800  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| | |||||||||    
T  14291799 ttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcagaagtggat 14291700  T
Q  439 acctattctt 448  Q
    |||| |||||    
T  14291699 acctgttctt 14291690  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #51
Raw Score: 85; E-Value: 3e-40
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 18132924 - 18132504
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||| |||| ||  | || ||||| || || || ||||| || ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  18132924 cagaaataatgtggccaagaaaagtcacttcacttaatcagaactcgcacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 18132825  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || | | | || ||||||||||| || ||||| |  ||||| || || |||||||| || |||  |||||   | ||||| || || ||     
T  18132824 cctcagatgttccgtaagctcctcttcagtctttgaataaattaggatatcgtcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattcgg 18132725  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||| ||||    
T  18132724 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtcttttgca 18132625  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  18132624 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 18132525  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||||| |||||    
T  18132524 cggaagtggatacctgttctt 18132504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #52
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 378 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15714295 - 15714204
Alignment:
Q  378 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15714295 ttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 15714204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #53
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 13970698 - 13970278
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||     
T  13970698 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaac 13970599  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  13970598 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 13970499  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  13970498 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 13970399  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||| ||||| |||||||| || ||||     ||||| || |||||||||||||  || ||||| |     
T  13970398 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgatctcaagtcaattttactaaaaatcttcgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaatcct 13970299  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||| ||||| || |||||    
T  13970298 cggaagcggatatctgttctt 13970278  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #54
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 30139358 - 30139798
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30139358 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 30139457  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  30139458 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 30139557  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  30139558 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 30139657  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  30139658 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 30139757  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  30139758 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 30139798  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #55
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 30148909 - 30149349
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  30148909 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 30149008  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  30149009 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 30149108  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  30149109 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 30149208  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  30149209 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 30149308  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  30149309 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 30149349  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #56
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 378 - 469
Target Start/End: Original strand, 43164566 - 43164657
Alignment:
Q  378 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  43164566 ttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 43164657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #57
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 142 - 396
Target Start/End: Original strand, 12269875 - 12270129
Alignment:
Q  142 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 241  Q
    |||| ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || || ||||||||||||||    
T  12269875 catgctcttcttcaatctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatcaagataagcatggaaaattcggttcatatactccat 12269974  T
Q  242 aaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt 341  Q
    ||||||  ||||  |||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| ||     
T  12269975 aaacacatcaggaacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttc 12270074  T
Q  342 actttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcac 396  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||    
T  12270075 accttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcac 12270129  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #58
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 8272987 - 8272548
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8272987 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcgcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 8272888  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  8272887 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 8272788  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  8272787 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 8272688  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  8272687 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 8272588  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  8272587 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 8272548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #59
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 51 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 15949036 - 15948618
Alignment:
Q  51 ctcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttctt 150  Q
    ||||| || |||||||| |||||||| |||||||| |||||  | |  |  ||||||||||| |||||||| |||||| ||||||||||| |||| ||||    
T  15949036 ctcacttccttcaaccaaaattcacacttagacaacttggctcacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatcctcagatgctcaacatgctctt 15948937  T
Q  151 cttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactcc 250  Q
    | |||| ||| || || | |||||||||||| ||||| || || || ||||| |||||| | | ||| || || | ||||||||| |||||||| || ||    
T  15948936 cctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaaaaccaccacaaatcggtccaaataaggatgaaatattctattcatatattccataaagacacc 15948837  T
Q  251 aggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatc 350  Q
     || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||||||||  | |||||| |||||    
T  15948836 tggcgcattggatactccaaatggcatcacggaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatatatcttccgcctttactctaatc 15948737  T
Q  351 tggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttga 450  Q
    || ||||| | | | ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| |    
T  15948736 tgatgatatcctaatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaa 15948637  T
Q  451 tagttaccttgttcaactg 469  Q
    | ||||| |||||||||||    
T  15948636 tcgttactttgttcaactg 15948618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #60
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 229 - 470
Target Start/End: Original strand, 10407720 - 10407961
Alignment:
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||    
T  10407720 tcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacacagaaaggcattactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 10407819  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||      
T  10407820 atcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattcta 10407919  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  10407920 ggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 10407961  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #61
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13965941 - 13965500
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  |||||||||||  ||||||| ||||||    
T  13965941 agaaatcacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaaattggcagacaactggttctctttcaagtcttgcaacacaatc 13965842  T
Q  129 ttcagatgctcagcatg-ttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||| |||||||||||| |||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | |    
T  13965841 ctcaaatgctcagcatgcttcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattcta 13965742  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| || || || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    |    
T  13965741 ttcatgtattccataaagacacctggcgcattggatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggata 13965642  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||| |  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||| ||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |     
T  13965641 tatctaccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcgaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcct 13965542  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  13965541 tggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 13965500  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #62
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 15611655 - 15612095
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||  |||||||| |||||| | |     || |||||||| |||||||||||||||    
T  15611655 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacgcttagacaacttggcacacaaccggttatctttcaaaacttgcaagacaatc 15611754  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  15611755 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 15611854  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||| |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15611855 tcatatattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15611954  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15611955 atcttccgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctcagcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15612054  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15612055 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15612095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #63
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 99 - 274
Target Start/End: Complemental strand, 11889798 - 11889623
Alignment:
Q  99 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 198  Q
    |||||||| |||| ||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||| | |  ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||    
T  11889798 ttcttctccttcagcacttgcaaaacaatcttcaaatgctcagcatgttcttccttaaacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccacga 11889699  T
Q  199 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaagg 274  Q
    | ||||| ||| | ||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || || ||||| || ||||| |||||    
T  11889698 agcgatctaaatacgcatgaaaaatacgattcatgtattccatgaacacacctggcgcattagtgacaccgaaagg 11889623  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #64
Raw Score: 64; E-Value: 9e-28
Query Start/End: Original strand, 203 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12510886 - 12510619
Alignment:
Q  203 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataa 302  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| | ||| || || || |||||||||    
T  12510886 atccagaaaagcatggaaaattcggttcatatacttcataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcattttgtactcgtaatgaccataa 12510787  T
Q  303 cgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccacta 402  Q
    ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||  || ||||  |||||||| ||||| || |||||||     ||||| || |    
T  12510786 cgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctaatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatcttagcaccaacca 12510687  T
Q  403 actgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  12510686 actgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaacctttttcaactga 12510619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #65
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16328238 - 16327796
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | ||||| || |||||||| ||||| || ||||| |   |||||||||||||  ||||||| |||||    
T  16328238 cagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccataactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaaatcttgcaatacaat 16328139  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| |||| || || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||  ||| |||||||| || ||     
T  16328138 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttagaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccggaaaggcatggaaaattcgg 16328039  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |  || |||||||| |||||||| || || || || || |||||||| ||  | || ||||  || |||||||    
T  16328038 ttcatgtactccataaacacaccaggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagtcgttttctgca 16327939  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||  || || |||||||| || ||||  ||| |||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  16327938 tatcctcattcttcaccttaatctgatggtaaccagacatcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 16327839  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    || |||||||||||| ||||| ||  | ||||| |||||||||    
T  16327838 cgaaagtggatacctgttctttatcatgaccttattcaactga 16327796  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #66
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 249 - 470
Target Start/End: Original strand, 24189076 - 24189297
Alignment:
Q  249 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 348  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||| ||| ||||||||||| || ||||| || ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || |    
T  24189076 ccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcactttatattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggcagtcttctgcatatcctcatccttcaccttga 24189175  T
Q  349 tctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||    
T  24189176 tctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctt 24189275  T
Q  449 gatagttaccttgttcaactga 470  Q
     || || || || |||||||||    
T  24189276 tatcgtaactttattcaactga 24189297  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #67
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 369 - 469
Target Start/End: Original strand, 18437022 - 18437122
Alignment:
Q  369 aaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||| || ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||| ||||||| || || || ||||| ||||    
T  18437022 aaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgggagtggatacatattctttattgtcactttgttaaact 18437121  T
Q  469 g 469  Q
    |    
T  18437122 g 18437122  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #68
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 417 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 26791613 - 26791561
Alignment:
Q  417 tcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  26791613 tcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 26791561  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #69
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 63 - 237
Target Start/End: Original strand, 10385257 - 10385431
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| ||||| ||  ||||||    
T  10385257 aaccagaactcacattttgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgccctgcatgctcttcctcgttcttgg 10385356  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 237  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||    
T  10385357 aataaatcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtact 10385431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #70
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 261 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8745735 - 8745530
Alignment:
Q  261 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || |  |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || ||||    
T  8745735 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaagggcgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaac 8745636  T
Q  361 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 460  Q
     || |||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||    
T  8745635 ctgtcctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatcaatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaacttt 8745536  T
Q  461 gttcaa 466  Q
    ||||||    
T  8745535 gttcaa 8745530  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #71
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6151441 - 6151001
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || || || |||||||| || ||| | |  |  ||||| |||||||||||||| ||||||    
T  6151441 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcgcacttagacaacttagcacataactggttctccttcaacacttgcaacacaatc 6151342  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     |||||||||||||||| || || ||||  || || || | |||||||||||| || ||||| || || || || || | | | | ||| || ||   ||    
T  6151341 gtcagatgctcagcatgctcctcctcagatttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtctagataaggatgaaatattttat 6151242  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||||||||||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| |||  | || ||    ||    
T  6151241 tcatatactccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacacagttttggatat 6151142  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | || ||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |      
T  6151141 atcttctgccttcactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctt 6151042  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||| | |||||| || || ||||||||||||||    
T  6151041 ggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 6151001  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #72
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 393 - 463
Target Start/End: Original strand, 12272254 - 12272324
Alignment:
Q  393 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgtt 463  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || ||||||||    
T  12272254 gcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttgtt 12272324  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr3; HSP #73
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 405 - 470
Target Start/End: Original strand, 17200562 - 17200627
Alignment:
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| || ||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  17200562 tgatccatcaaatcatcaatcctcgggagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 17200627  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1 (Bit Score: 384; Significance: 0; HSPs: 44)
Name: chr1
Description:

Target: chr1; HSP #1
Raw Score: 384; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 21838881 - 21839328
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21838881 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21838980  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21838981 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 21839080  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21839081 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 21839180  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839181 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21839280  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21839281 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21839328  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #2
Raw Score: 380; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 19108299 - 19108746
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  19108299 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttggaa 19108398  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||||    
T  19108399 gacaatcttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttagagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcgtggaag 19108498  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  19108499 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatggtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 19108598  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108599 tctgcatatcttcatcttttacttttatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 19108698  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19108699 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19108746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #3
Raw Score: 361; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16349016 - 16348576
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||| || ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  16349016 gaaataacatgacctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 16348917  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348916 tcagatgctctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16348817  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaac-accaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  16348816 catatactccataaacactccaggtgcattggtaactcccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 16348717  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  16348716 atcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 16348617  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16348616 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 16348576  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #4
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 21832233 - 21832680
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21832233 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21832332  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  21832333 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 21832432  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  21832433 atgcgattcatatactccataaacactccatgtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 21832532  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  21832533 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 21832632  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  21832633 aattctcggaagtggatacctaatcttgatagttaccttgttcaactg 21832680  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #5
Raw Score: 356; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 33389449 - 33389010
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  33389449 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 33389350  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389349 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 33389250  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  33389249 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 33389150  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  33389149 tcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 33389050  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  33389049 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 33389010  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #6
Raw Score: 352; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 24793044 - 24792609
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  24793044 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaa 24792945  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  24792944 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 24792845  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  24792844 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccaaaaggcatacctttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 24792745  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792744 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 24792645  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  24792644 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 24792609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #7
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21234159 - 21233711
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21234159 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21234060  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  21234059 gacaatcttcagatgttcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 21233960  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  21233959 atgcgattcatatactccataaacactcgaggtgcattgatcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 21233860  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233859 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21233760  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21233759 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 21233711  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 51331914 - 51331474
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  51331914 agaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 51331815  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331814 ttcagatgctccgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 51331715  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  51331714 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 51331615  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||| ||||||||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |    
T  51331614 atcttcgtcttttactttaatctggtgatagcctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctc 51331515  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51331514 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 51331474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17043443 - 17042995
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  17043443 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaatacttgcaa 17043344  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  17043343 gacaatcttcatatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 17043244  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  17043243 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagatgtct 17043144  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17043143 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 17043044  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  17043043 aattctcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 17042995  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #10
Raw Score: 332; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 22503717 - 22503282
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| || |||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  22503717 catcaccataaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 22503618  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  22503617 gacaatcttcagatgctcaacatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccccgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22503518  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  22503517 atgcgattcatttactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaagacataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 22503418  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  22503417 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactatctgatccatcaaatcatc 22503318  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22503317 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 22503282  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #11
Raw Score: 307; E-Value: 1e-173
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41352082 - 41351649
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  41352082 gaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 41351983  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  41351982 tcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 41351883  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  41351882 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 41351783  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||||||||||||||       | ||| ||    
T  41351782 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatccatca-------atttctcg 41351690  T
Q  430 gaagtggataccta-ttcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  41351689 gaagtggatacctatttcttgatagttaccttgttcaactg 41351649  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #12
Raw Score: 274; E-Value: 1e-153
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 20140021 - 20140462
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||| ||||| | |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||||| ||||||    
T  20140021 agaaataacatggccaagaaagctcacttttttcaaccagaattcacacttagacaatttagcatagagcttcttttctttcaacacttgcaaaacaatc 20140120  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||  || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |  || ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  20140121 ttcaagtgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccaaaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 20140220  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| ||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || | ||| || || || ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  20140221 tcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtgacaccgaacgacattaccttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcat 20140320  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||| |    
T  20140321 atcttcatcttttactttaatctggtgataacctgaactcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattctc 20140420  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  20140421 ggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactga 20140462  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #13
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 430538 - 430097
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  430538 cagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 430439  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  430438 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 430339  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  430338 atcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgca 430239  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  430238 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 430139  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  430138 tggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 430097  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #14
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50618820 - 50618400
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  50618820 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 50618721  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  50618720 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtga 50618621  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  50618620 ttcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgca 50618521  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  50618520 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 50618421  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  50618420 cggaagtggatacctattctt 50618400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #15
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21750877 - 21751318
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||| ||||||||||||||| || |     
T  21750877 cagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctttttcaacacttgcaaaaccaa 21750976  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21750977 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21751076  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| | ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||| | || |||| |||||||| ||    
T  21751077 ttcatgtactccataaatactccaagagcattagtaacaccaaaaggcataactttatactcataatgtccataccgcgtcctaaaagttgtcttctaca 21751176  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||| ||  || |||||||| || ||| ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |     
T  21751177 tatcttcatctttcactttaatctggtgatgacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacttgcacctactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21751276  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  21751277 cggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 21751318  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #16
Raw Score: 243; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22360666 - 22360224
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||| | ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||   |||||||||||||||| ||||| || |     
T  22360666 cagaaataacatgtccaagatagctcacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaatcatcttctctttcaacacctgcaaaaccag 22360567  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||| |||||||||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||| |||||||||| |||||||||    
T  22360566 tttcaaatgctcagcaggttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaacgacgaaccgatcctaaaatgcatgaaagatgcga 22360467  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  22360466 ttcatgtactccataaatactcaaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 22360367  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  22360366 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 22360267  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| |||||||| || || |||||||||||||||    
T  22360266 cggaagtggatatctattctttattgtcaccttgttcaactga 22360224  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #17
Raw Score: 235; E-Value: 1e-130
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21862792 - 21862354
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||    
T  21862792 aaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttgaacacttgcaaaaccatctt 21862693  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || |||||||||||||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||||| || |||||||||||||| || |||||||||    
T  21862692 caaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaattaaaatgtcatcaataaaaacaaccacgaaacggtccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 21862593  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || | |||||||||||| | ||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |||| ||| |||| |||||||||||||||||||    
T  21862592 atgtgctccataaacacactaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtgcataccgcgttctaaaagctgtcttctgcatat 21862493  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||  || |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||  ||    
T  21862492 cttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatgtatcttgctgaacacacgtgcacccaccaactgatccatcaagtcatctattcttgg 21862393  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||  | ||||| |||||||||||    
T  21862392 aagtggatacctattctttctcgttactttgttcaactg 21862354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #18
Raw Score: 173; E-Value: 8e-93
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 21743974 - 21743554
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||| ||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21743974 cagaaataatgtggccaagaagacttacttcacttaaccagaactcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 21743875  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || | ||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  21743874 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 21743775  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  21743774 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 21743675  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||  || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  21743674 tatcctcattcttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattct 21743575  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  21743574 cggaagtggatacctattctt 21743554  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #19
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 146 - 469
Target Start/End: Original strand, 16378150 - 16378473
Alignment:
Q  146 ttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaac 245  Q
    ||||||||| | |||| |||| |||||||| ||||| || |||||||| ||||| |||||||||||  |||| || || |||||||| |||||||| |||    
T  16378150 ttcttcttcggacttgaagtatatcaaaatgtcatcaataaacacaaccacgaaacgatccaaaaacacatgaaaaattcgattcatgtactccatgaac 16378249  T
Q  246 actccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactt 345  Q
    || ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||||| |||||||| ||||    
T  16378250 acaccaggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcctcatctttcactt 16378349  T
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    |||||| |||||||| ||| ||||||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||    
T  16378350 taatctagtgataacctgatctcaaatcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttggaagtggatacctatt 16378449  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||| || ||||| || ||||||||    
T  16378450 ctttatcgttactttattcaactg 16378473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #20
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19661558 - 19661116
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||| |||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||| ||| |||||    
T  19661558 cagaaataatgtggccaggaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttacaatacaat 19661459  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||  ||||| |||||||||||| | || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  ||| |   | |||||||| || ||     
T  19661458 cttcagatgctatgcatgctcttcttcagtccttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaggcatggaaaattcgg 19661359  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | ||  | || ||||||||||    
T  19661358 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctagaggccgtcttctgca 19661259  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || |||||||||  ||||||||||||||||||||| || || |||||||     
T  19661258 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacatttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaattct 19661159  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19661158 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 19661116  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #21
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 22 - 193
Target Start/End: Original strand, 21026104 - 21026275
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21026104 catcaccagaaataacatggccaaaaaaactcacttctttcaaccagaactcacacttagatattttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 21026203  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaac 193  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21026204 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgaaaacaac 21026275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #22
Raw Score: 119; E-Value: 1e-60
Query Start/End: Original strand, 28 - 474
Target Start/End: Original strand, 19856242 - 19856688
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||| |||||||| ||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| || | |||||| || ||    
T  19856242 cagaaataatgtggccaaggaaactcacttcacttaactagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatatttgcaatactat 19856341  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  19856342 cttcagatgttcttcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcaccaataaacacaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 19856441  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||  |||||| | |||||||| || ||||||||||||| |||||||||  | || || || ||||||||||    
T  19856442 ttcatatactccataaacacaccaggcgcatgagtaacaacgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19856541  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||||| || || |||||||     
T  19856542 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattct 19856641  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||||||    
T  19856642 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactgatgat 19856688  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #23
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20855188 - 20854740
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||| ||||| |  ||||    
T  20855188 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctccttcaaaatctgca 20855090  T
Q  121 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    | ||||||||||  || || ||||| || |||||||| || || ||||||||||||||||| || || || || || |||  ||||| ||| ||||||||    
T  20855089 acacaatcttcaagtgttctgcatgctcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacaaatttatccagaaaagcatggaa 20854990  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
     || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||    
T  20854989 aattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtc 20854890  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 420  Q
    ||||||||||||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| ||||    
T  20854889 ttctgcatatcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcat 20854790  T
Q  421 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| | |||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  20854789 caatccgcggaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 20854740  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #24
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20834322 - 20833902
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||| | ||    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |   | ||||||||||| | |||||| |||||    
T  20834322 cagaaataatgtggccaagaaaactcgcttcacataaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaaccttttctctttcaaaatttgcaacacaat 20834223  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  20834222 cttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 20834123  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  20834122 ttcatatactccatgaacacaccacgcgcattagtaacacctaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20834023  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||  | ||||||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  20834022 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcatactgaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 20833923  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||| || |||||    
T  20833922 cggaagtggatatctgttctt 20833902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #25
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 228 - 472
Target Start/End: Original strand, 41310694 - 41310938
Alignment:
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  41310694 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaagacatcacgttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 41310793  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||| |||| |  || |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  41310794 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcagttttacgaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattct 41310893  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 472  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||||    
T  41310894 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactgatg 41310938  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #26
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 20296384 - 20296791
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| |||||  | |||||||| ||||| || |||||| |||| |    
T  20296384 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaatacaattcttagatgctctgcatgctcctcttcattcttag 20296483  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||    
T  20296484 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccatgaacacaccaggcgcgttagt 20296583  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||      
T  20296584 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacca 20296683  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||    
T  20296684 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcctcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgt 20296783  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  20296784 tcaactga 20296791  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #27
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 24098025 - 24097587
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||| ||| |||||    
T  24098025 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaagacttacaatacaat 24097926  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||  || ||||| || ||||||||||| || || |||| ||| ||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| ||  |     
T  24097925 cttcagattttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagatcagaatgtcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatttgg 24097826  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||  |||| ||  | || || || ||||||||||    
T  24097825 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgttcatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 24097726  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| || || |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  24097725 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcgatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 24097626  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  24097625 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 24097587  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #28
Raw Score: 102; E-Value: 2e-50
Query Start/End: Original strand, 180 - 301
Target Start/End: Original strand, 20944119 - 20944240
Alignment:
Q  180 tcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataa 279  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  20944119 tcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataa 20944218  T
Q  280 ctttatattcatagtgaccata 301  Q
    |||| |||||||| ||||||||    
T  20944219 ctttttattcataatgaccata 20944240  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #29
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20938485 - 20938043
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| ||||| || || ||    
T  20938485 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgtaatactat 20938386  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||||||||||  |||| |||||||||||||| || ||||||| | | ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  | |||||||| || ||     
T  20938385 tctcagatgctctacatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagactgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagtaagcatggaaaattcgg 20938286  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || || |||||||    
T  20938285 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgca 20938186  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  20938185 tatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 20938086  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  20938085 aggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 20938043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #30
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 37679052 - 37679459
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||||||||||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| |  || ||| ||||||    
T  37679052 aaccagaattcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgcttctcctcattcttgg 37679151  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  37679152 aatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 37679251  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||||| || || ||||| |||||||      
T  37679252 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatctttcacctttatctgatgataacca 37679351  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || || |     ||||| || || ||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  37679352 gacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaattgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 37679451  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  37679452 tcaactga 37679459  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #31
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 48424841 - 48425283
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  48424841 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 48424940  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  48424941 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 48425040  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  48425041 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 48425140  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  48425141 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 48425240  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  48425241 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 48425283  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #32
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 52987709 - 52988151
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  52987709 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 52987808  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  52987809 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 52987908  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  52987909 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 52988008  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  52988009 tatcctcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 52988108  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  52988109 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 52988151  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #33
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 21952881 - 21953288
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||  ||||||    
T  21952881 aaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcgttcttgg 21952980  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| ||||| || || ||    
T  21952981 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcgttagt 21953080  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| || ||||      
T  21953081 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccc 21953180  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || || || ||||    
T  21953181 gacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattccaggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgt 21953280  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  21953281 tcaactga 21953288  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #34
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38911248 - 38910806
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||| ||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  38911248 cagaaataatatgacccagaaagctcacttcacttaaccagaactcacatttcgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 38911149  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || || ||   |||||  || |||||||| ||  |     
T  38911148 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccaggaaagcatggaaaatttgg 38911049  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  38911048 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 38910949  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || || ||||| |||||||  |||||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  38910948 tatcttcatccttcacctttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactgaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 38910849  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  38910848 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 38910806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #35
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20829813 - 20829373
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  20829813 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 20829714  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  20829713 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 20829614  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  20829613 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 20829514  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  20829513 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 20829414  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  20829413 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 20829373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #36
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31538419 - 31537977
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  31538419 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 31538320  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  31538319 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 31538220  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  31538219 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 31538120  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  ||||||||||| || || || || |     ||||| || |  ||||||||||| || |||||||     
T  31538119 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatctatcttactaaatatcttagcaccaaccagttgatccatcaagtcgtcaattct 31538020  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| ||||| || |||||||| || || ||||||||||||    
T  31538019 aggaagcggatatctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 31537977  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #37
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 28 - 194
Target Start/End: Original strand, 41308610 - 41308776
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  41308610 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 41308709  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaact 194  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||||    
T  41308710 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaact 41308776  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #38
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 105
Target Start/End: Original strand, 16378079 - 16378156
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttct 105  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || |||||||    
T  16378079 cagaaataacatggccaagaaaactaacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttct 16378156  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #39
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 39 - 156
Target Start/End: Complemental strand, 23196660 - 23196543
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| ||||| |||||||| |   |||| ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||    
T  23196660 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcatttggacaacttggcatacaacctcttttctttcaacacttgcaacacaattttcagatgct 23196561  T
Q  139 cagcatgttcttcttcag 156  Q
    |  |||| ||||||||||    
T  23196560 ctacatgctcttcttcag 23196543  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #40
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 35930882 - 35930806
Alignment:
Q  393 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  35930882 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 35930806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #41
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Original strand, 20527366 - 20527431
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  20527366 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 20527431  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #42
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41215902 - 41215837
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  41215902 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 41215837  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #43
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Original strand, 20927065 - 20927153
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| ||||||| |||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  20927065 ttctccttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcatcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 20927153  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr1; HSP #44
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 327 - 469
Target Start/End: Original strand, 20927290 - 20927432
Alignment:
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| |||| |||||| ||||| || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  20927290 atatcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcatatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcc 20927389  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
       |||||||||| | |||||| || || || |||||||||||    
T  20927390 tttgaagtggatatcgattcttaatcgtcactttgttcaactg 20927432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109 (Bit Score: 368; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0109
Description:

Target: scaffold0109; HSP #1
Raw Score: 368; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 40100 - 40547
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40100 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 40199  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  40200 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 40299  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  40300 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 40399  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||| |||||| | ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40400 tctgcatatcttcatctttcactttaatctagtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 40499  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  40500 agttctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 40547  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0109; HSP #2
Raw Score: 314; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 22 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 14484 - 14031
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14484 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaacagaattcacacttagaaaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 14385  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaa-tatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||| |||| |||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||||||    
T  14384 gacaatcttcagatgctcagcatattcttcttcagtcatggagtaaataaaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaa 14285  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||    
T  14284 gatgcgattcatatactccataaacattccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatc 14185  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 420  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||||||| |||||| |  || ||||||||||| |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||    
T  14184 ttctgcatatcatcatctttcactttaatctagtgataccccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcat 14085  T
Q  421 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  14084 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 14031  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0079
Description:

Target: scaffold0079; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 35442 - 35891
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35442 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 35541  T
Q  121 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||  ||||| ||||| ||||||||||||||||||||    
T  35542 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaattaaaatatcatcgatgagaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaa 35641  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||    
T  35642 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtc 35741  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  35742 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 35841  T
Q  421 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  35842 caattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 35891  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 201 - 384
Target Start/End: Original strand, 28225 - 28408
Alignment:
Q  201 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 300  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||    
T  28225 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttgtattcatagtgaccat 28324  T
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 384  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||    
T  28325 aacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctga 28408  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #3
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 2669 - 3111
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||||||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  2669 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacatttagacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaat 2768  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  2769 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 2868  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |   | || || |  ||||||||||    
T  2869 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggtcgtcttctgca 2968  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| ||    |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| || ||||||||       
T  2969 tatcctcatccttcgacttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcgt 3068  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  3069 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 3111  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0079; HSP #4
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 404 - 474
Target Start/End: Original strand, 28405 - 28475
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  28405 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttattcaactgatgat 28475  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028 (Bit Score: 366; Significance: 0; HSPs: 4)
Name: scaffold0028
Description:

Target: scaffold0028; HSP #1
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 10428 - 10865
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10428 agaaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 10527  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    || ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  10528 tttagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 10627  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||  |||||||||||    
T  10628 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagtcgtcttctgcat 10727  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  10728 atcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctt 10827  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  10828 ggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaa 10865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #2
Raw Score: 366; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 29 - 466
Target Start/End: Original strand, 16890 - 17327
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||||||||| |||||||| ||| |||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16890 agaaataacatggccaaggaaactcacttctctcaaccagaactcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 16989  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||| |||    
T  16990 ttcagatgctcagcatgttctttttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatacaactacgaaccaatccaaaaatgcatggaagatgtgat 17089  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||    
T  17090 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgcat 17189  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  17190 atcctcatcttttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctt 17289  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17290 ggaagtcgatacctattcttgatagttaccttgttcaa 17327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 465
Target Start/End: Original strand, 45106 - 45541
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||    
T  45106 gaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagttttttctctttcaatacttgcaagacaatct 45205  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  45206 tcagatgatcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 45305  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  45306 catatactccataaatactctaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 45405  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||  |    
T  45406 tcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattcttg 45505  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttca 465  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  45506 gaagcggatacctattcttgatagttaccttgttca 45541  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0028; HSP #4
Raw Score: 101; E-Value: 7e-50
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 48867 - 48447
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  48867 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 48768  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  48767 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 48668  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  48667 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtgctaaaggcagtcttctgca 48568  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  48567 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 48468  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||| ||||| ||||||||    
T  48467 cggaagcggatatctattctt 48447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8 (Bit Score: 364; Significance: 0; HSPs: 59)
Name: chr8
Description:

Target: chr8; HSP #1
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 17672814 - 17672375
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  17672814 gaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacaatct 17672715  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672714 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 17672615  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  17672614 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 17672515  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||    
T  17672514 tcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaattctcg 17672415  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  17672414 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 17672375  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #2
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Original strand, 18858559 - 18859006
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858559 catcaccagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 18858658  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  18858659 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 18858758  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||| ||||    
T  18858759 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtcctgaaagccgtct 18858858  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18858859 tctgcatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 18858958  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  18858959 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttccactg 18859006  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #3
Raw Score: 364; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20017062 - 20016615
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20017062 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 20016963  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  20016962 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 20016863  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  20016862 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 20016763  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  20016762 tctgcatatcctcatcctttaccttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaactcgtgcacccactagctgatccatcaaatcatc 20016663  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  20016662 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 20016615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #4
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22118974 - 22118527
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22118974 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22118875  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22118874 aacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22118775  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22118774 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22118675  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118674 tctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22118575  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22118574 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22118527  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #5
Raw Score: 360; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22127758 - 22127311
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  22127758 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacctctttcgaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 22127659  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||    
T  22127658 aacaatcttcagatgctcagcacgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaag 22127559  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||    
T  22127558 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcaaagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 22127459  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||| |||||||||||| |||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127458 tctacatatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22127359  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22127358 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 22127311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #6
Raw Score: 353; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 30311943 - 30311495
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311943 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 30311844  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  30311843 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcgtcaataaacacaacaacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 30311744  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  30311743 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtct 30311644  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311643 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 30311544  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30311543 aattatcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 30311495  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #7
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 15535365 - 15535813
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535365 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 15535464  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  15535465 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 15535564  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| | |||| |    
T  15535565 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgataactgttt 15535664  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  15535665 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 15535764  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  15535765 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 15535813  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #8
Raw Score: 341; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 22041809 - 22042257
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  22041809 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttatttctttcaaccagaattctcacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacgcttgcaa 22041908  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||    
T  22041909 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtacatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaag 22042008  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| | |||||||||||||||    
T  22042009 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgaattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacacgttctgaaagctgtct 22042108  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042109 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactttcgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22042208  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22042209 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22042257  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #9
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21165337 - 21164889
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  21165337 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttggataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcaa 21165238  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| || ||||| |||||||||||||| |||||||| |||    
T  21165237 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcatagataaaaacaaccacgaatcgatccaagaatgcatgaaag 21165138  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  21165137 atgcgattcatgtactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 21165038  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21165037 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaatgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 21164938  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  21164937 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 21164889  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #10
Raw Score: 337; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22131840 - 22131392
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131840 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22131741  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  22131740 gacaatcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtagatcaaaatatcatcgataaacacaacaaagaatcgatccaaaaaggcatggaag 22131641  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||| ||||||||||    
T  22131640 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccgtaatgcgttcttaaagctgtct 22131541  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||  ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131540 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgttctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22131441  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22131440 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22131392  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #11
Raw Score: 336; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 32602132 - 32602575
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaacca-gaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||||||||||| |||||| || ||||||||||| ||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602132 cagaaataacatggccaaaaaaacttacttctttcaaccaagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 32602231  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  32602232 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacacaacaacgaaccgatccaaaaaggcatggaagatgcg 32602331  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  32602332 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 32602431  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| || |||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  32602432 atatcttcatctttcaccttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcaccctctaactgatccatcaaatcatcaattc 32602531  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  32602532 tcggtagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 32602575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #12
Raw Score: 329; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 19979949 - 19980397
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||| | ||||| ||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  19979949 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaaatcatacttagataatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaa 19980048  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  19980049 gacaatcttcagattctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 19980148  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |  ||||||||| |||||    
T  19980149 atgcgattcatgtactccataaacactccaggcgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatacagtgttctgaaagttgtct 19980248  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19980249 tctacatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatc 19980348  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  19980349 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 19980397  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #13
Raw Score: 315; E-Value: 1e-177
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 19482855 - 19482424
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||    
T  19482855 gaaataacatgaccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaatct 19482756  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||  ||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482755 tcagatgttctgcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 19482656  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||| ||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19482655 catataccccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcata 19482556  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || ||||| |||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||        ||||||| ||    
T  19482555 tcctcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcgcgcacccactaactgatcca--------tcaattctcg 19482464  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  19482463 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 19482424  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #14
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 23652029 - 23652449
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || |||||    
T  23652029 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacacttagacaatttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaat 23652128  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  23652129 cttcaaatgctcagcatgttcctcttcagtcttggagtaaatcaaagtatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 23652228  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  23652229 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcataactttgtactcataatgtccataacgcgttctgaaacctgtcttctgca 23652328  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  23652329 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatcttaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 23652428  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    | ||||| |||||||||||||    
T  23652429 cagaagtagatacctattctt 23652449  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #15
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 21252932 - 21253373
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||| |||||||  || |     
T  21252932 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattctcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaatacttgcagaaccag 21253031  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || |||||  |||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  21253032 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaacctcgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21253131  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  21253132 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 21253231  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  21253232 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 21253331  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    || |||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21253332 cgaaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21253373  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #16
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21392654 - 21392213
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21392654 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21392555  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21392554 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21392455  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21392454 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21392355  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21392354 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21392255  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21392254 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21392213  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #17
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21783213 - 21782772
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21783213 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21783114  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21783113 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21783014  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21783013 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21782914  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21782913 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21782814  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21782813 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21782772  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #18
Raw Score: 270; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21787148 - 21786707
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  21787148 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaattttgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 21787049  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||||| | ||||||||||||||| |||||||||    
T  21787048 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaatatatcatcgataaaaacaaccacgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgcga 21786949  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| |||  |||||||| |||||||||||    
T  21786948 ttcatgtaatccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgcgctctgaaagttgtcttctgca 21786849  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  21786848 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 21786749  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21786748 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21786707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #19
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 22 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 22422691 - 22422244
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| |||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22422691 catcaccagaaataacatggccaaggaaactcacctctttcaaccataattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 22422592  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||||||| ||| ||| ||||||||||||| | |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||     
T  22422591 aacaatcttcaaatgttcaacatgttcttcttcggacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaa 22422492  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| ||||||| ||| |||    
T  22422491 atgcgattcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctgaatgctatct 22422392  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22422391 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 22422292  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||||||| |||||||||||| || || || || ||||||||    
T  22422291 aattctcggaagtgaatacctattctttatcgtcactttattcaactg 22422244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #20
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 19864887 - 19864446
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaga-caa 126  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||| || | | |    
T  19864887 cagaaataacatgtccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgtaaaaacca 19864788  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
      |||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||| |    
T  19864787 gtttcaaatgctcaatatgttcttcttcagacttagagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgag 19864688  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    |||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||||||||||||||    
T  19864687 attcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttctactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgc 19864588  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||     |||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  19864587 atatcttcatattttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaaatttagcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcc 19864488  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||    
T  19864487 tcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaact 19864446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #21
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22376246 - 22375806
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||  | |||||||||||||| | | || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22376246 cagaaataacatggccaagaaaactcatctatttcaaccagaatttatagtttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22376147  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||||||||| || || |||    
T  22376146 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatataaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 22376047  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || |||||||| ||||  |  |||||||| |||||||||| ||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  22376046 ttcatgtactccataaacacacctggtgcatttgtaatgctgaaaggcatcactttatattaataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgca 22375947  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| |||||||  || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  22375946 tatcttcatctttcactttaatctgttgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 22375847  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||| |||||||| || ||||| || |||||||    
T  22375846 tggaagtggatatctattctttatcgttactttattcaact 22375806  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #22
Raw Score: 223; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 22247226 - 22246788
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||| |||||||| | |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22247226 cagaaataacatggccatgaaaactcgcctctttcaaccagaattcacactttgaaaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22247127  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    || || ||||||| |||||||| ||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| | ||| ||||||||||| ||| | || || |||    
T  22247126 ctacaaatgctcaacatgttctccttcaatcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccatgaaacgatccaaaaacgcaggaaaaatacga 22247027  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  22247026 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacttgttctaaaagcggtcttctgca 22246927  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||     
T  22246926 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaagcatcaattct 22246827  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     ||||||||||||| |||||| || |||||||| |||||    
T  22246826 tggaagtggatacccattctttatcgttaccttattcaa 22246788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #23
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 28 - 384
Target Start/End: Complemental strand, 21920541 - 21920185
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  21920541 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaactcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaactaa 21920442  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| | |    
T  21920441 cttcaaatgctcagcatattcttcttcagtcttgaagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatacaa 21920342  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  21920341 ttcatgtactccataaatactccatgtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgca 21920242  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctga 384  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||    
T  21920241 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctga 21920185  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #24
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29302219 - 29301777
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| |||||||||||||| || ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||| |||||||||||||||| || |||||    
T  29302219 cagaaataacgtggccaagaaaacttacttcactcaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcctctctttcaacacttgtaacacaat 29302120  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||  || || ||||||| |||||| ||||| |||||||||| ||| ||||| || || || || || ||  |||| || |||||||| || || |      
T  29302119 cttcaagtgttctgcatgttattcttcggtcttagagtaaatcagaatgtcatcaataaataccacaacaaactgatctaagaatgcatgaaaaattctg 29302020  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||| || ||||||||  ||||||| || ||||||||||    
T  29302019 ttcatgtactccataaataccccaggtgcatttgtaacaccaaaaggcatcaccttatactcataatgcccataacgtgttctgaatgccgtcttctgca 29301920  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||  |||||||| || ||||||| ||||||||  |||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |     
T  29301919 tattctcatctttcaccttaatctagtgataacccgacctcaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcagatcatcaatcct 29301820  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  29301819 cggaagcggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 29301777  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #25
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 23887015 - 23887457
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||| |||||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||||||    
T  23887015 aaataacatggccaagaaaactcacctcattcaactagaattcacactttgacaacttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaatctt 23887114  T
Q  131 cagatgctca----gcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    || |||||||     |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || ||  |    
T  23887115 caaatgctcaacatacatgttcttctttagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaataagcatgaaaaatatg 23887214  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||| || || || ||||||||  | || || || ||||| |||    
T  23887215 attcatgtactccataaacacatctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatactcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttatgc 23887314  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||| || ||||| |||||||||||||||||||   ||||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  23887315 atatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccaacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattc 23887414  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
       ||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23887415 ttcgaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 23887457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #26
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 21927415 - 21927836
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||| || || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  21927415 cagaaataatatggccaagaaatcttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 21927514  T
Q  128 cttcagatgctcagca-tgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    |||||||||||| ||| || |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |     
T  21927515 cttcagatgctctgcaatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattct 21927614  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||  |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || |  |||||||||    
T  21927615 gttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgc 21927714  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||  ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| || || |||||||    
T  21927715 atatgctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccattaagtcgtcaattc 21927814  T
Q  427 acggaagtggatacctattctt 448  Q
     |||||||||||||||||||||    
T  21927815 tcggaagtggatacctattctt 21927836  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #27
Raw Score: 152; E-Value: 3e-80
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Original strand, 22988718 - 22988937
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  22988718 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 22988817  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||| ||    
T  22988818 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggaatatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgtga 22988917  T
Q  228 ttcatatactccataaacac 247  Q
    ||||| || |||||||||||    
T  22988918 ttcatgtattccataaacac 22988937  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #28
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 20008714 - 20008294
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||| |||||| |||||    
T  20008714 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacagttgcaacacaat 20008615  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  ||||||||  | |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  20008614 cttcatatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcactaaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 20008515  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  20008514 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 20008415  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || |||| ||| ||||||||||| || ||||| || |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||     
T  20008414 tatcctcatctttcaccttaatctgatggtaacctgagctcaaatcaatcttactgaacacgcgtgcacccactaattgatccattaaatcatcaattct 20008315  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||| ||||||||    
T  20008314 cggaagtggatatctattctt 20008294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #29
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 42 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 31415248 - 31414820
Alignment:
Q  42 ccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcag 141  Q
    ||||||||| |||| ||  | |||||||| | ||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| ||||||||||| ||||||||||||||||| |    
T  31415248 ccaagaaaattcacttcacttaaccagaacttacactttgacaacttagcatacaacttcttttcttttaacacttgcaatacaatcttcagatgctctg 31415149  T
Q  142 catgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccat 241  Q
    |||| || ||||| ||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || || ||||||||||||||    
T  31415148 catgctcctcttcggtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccat 31415049  T
Q  242 aaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt 341  Q
     ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| ||     
T  31415048 gaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttc 31414949  T
Q  342 actttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacc 441  Q
    || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||||||||    
T  31414948 accttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattctcggaagtggatacc 31414849  T
Q  442 tattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||| || || || ||||||||||||    
T  31414848 tattctttatcgtaactttgttcaactga 31414820  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #30
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 20394926 - 20394488
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |  ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |  || |||||||||| ||||||||| |||||    
T  20394926 cagaaataatatggccaagaaaactcaccttattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataactttttctctttcagcacttgcaaaacaat 20394827  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||| |||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  20394826 cttcaaatgctcggcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcgtcaatgaacacaacaacaaagcgatctaaataagcatgaaaaatacga 20394727  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| ||| ||| ||||||||| | |   ||||| || || || |||||  | || ||||| ||||||| ||    
T  20394726 ttcatgtattccataaatacacccggtgcatttgtagcactaaaaggcatcattgattattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaagccgtcttctaca 20394627  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || | ||||||||| ||||| |  || ||||||||||| ||  | || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  20394626 tatcttcatccttcagtttaatctgatgatagcccgatctcaaatcaatcttaataaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattct 20394527  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
      ||||||||| ||||||||| || || || ||||||||    
T  20394526 tagaagtggatccctattctttattgtcactttgttcaa 20394488  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #31
Raw Score: 140; E-Value: 4e-73
Query Start/End: Original strand, 31 - 466
Target Start/End: Original strand, 23656918 - 23657353
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| || ||||| || ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  23656918 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccataactcacactttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatctt 23657017  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    |||||| || ||||| |||||||||||||| || || || | ||||||||| || || ||||| |  |||  ||||| ||| |||||||| || || |||    
T  23657018 cagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaatatattagaatatcatcaataaatacaaccataaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttc 23657117  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||    
T  23657118 atatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 23657217  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    | ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||   |||||| || ||||||||||| || |||||||| | |||    
T  23657218 cctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacttttgcacctacgaactgatccattaagtcatcaatcctcgg 23657317  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  23657318 aagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 23657353  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #32
Raw Score: 133; E-Value: 6e-69
Query Start/End: Original strand, 205 - 469
Target Start/End: Original strand, 22522711 - 22522975
Alignment:
Q  205 ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 304  Q
    ||||||||||||| || ||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || | ||||||    
T  22522711 ccaaaaatgcatgaaaaatgcgattcatgtactccataaacactcctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtcgataacg 22522810  T
Q  305 cattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 404  Q
      |||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||    
T  22522811 tgttctaaaagccgttttctgcatatcttcatctttcactttattctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaac 22522910  T
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||| ||||| || ||||| |||||||||||    
T  22522911 tgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctgttctttatcgttactttgttcaactg 22522975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #33
Raw Score: 132; E-Value: 2e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 439
Target Start/End: Original strand, 19861423 - 19861834
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| | |||||||||||||||  ||||    
T  19861423 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttatttcaacacttgcaactcaat 19861522  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  19861523 cttcagatgctctgcatgttcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 19861622  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  19861623 ttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaagggcattaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19861722  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||| |||||   |||| |||||  ||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  19861723 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattaatttacatgaacacacgaccacccactaactgatccattaaatcatcaattct 19861822  T
Q  428 cggaagtggata 439  Q
    ||||||| ||||    
T  19861823 cggaagtcgata 19861834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #34
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 22 - 184
Target Start/End: Original strand, 19114672 - 19114834
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  19114672 catcaccagaaataacatggcctagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaa 19114771  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgat 184  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  19114772 aacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcggtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgat 19114834  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #35
Raw Score: 127; E-Value: 2e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21324071 - 21323630
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  21324071 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactt-ttctctttcaaaatttgcaacacaat 21323973  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||| |||||||| |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  21323972 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagatcagaatgtcatcgataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 21323873  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  21323872 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacattgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 21323773  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  21323772 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 21323673  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  21323672 cggaagtggatacctattctttattgtaactttattcaactga 21323630  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #36
Raw Score: 112; E-Value: 2e-56
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 16269982 - 16269575
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||| ||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  16269982 aaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcaggtgctctgcatgctcctcttcattcttgg 16269883  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | |||||||| |||||||| |||||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| |||||||||||||| |||||  | || ||    
T  16269882 aataaatcaagatatcatcaatgaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaacacaccaggcccgttagt 16269783  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||     
T  16269782 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatgataacta 16269683  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || ||||||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || |||||||    
T  16269682 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttgt 16269583  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  16269582 tcaactga 16269575  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #37
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 31569641 - 31569198
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||| ||| ||||| |||||||| ||  | | ||| || |||||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||     
T  31569641 catcaccagaaataatatgaccaaggaaactcacttcacttagccaaaactcacatttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaaaacttgcag 31569542  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
     |||||  ||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| ||||| ||     
T  31569541 cacaattctcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcgaataaatcagaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaa 31569442  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||| || ||  | || || || ||||    
T  31569441 attcgattcatatactccatgaacacaccgggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccgtatcgtgtcctaaaggccgtct 31569342  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||| |||||||| |||||    
T  31569341 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaac-tgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactagctggtccatcaagtcatc 31569243  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| | |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  31569242 aatcctcggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 31569198  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #38
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Original strand, 20390090 - 20390516
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| |||||||||||||||  | ||  | ||| |||||||| |||| ||||| |||||||| |  || || || |||||||||||||| ||||||||    
T  20390090 aaataatatggccaagaaaacttgcttcacttaactagaattcaaatttggacaacttggcatacaactttttttccttcaacacttgcaacacaatctt 20390189  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
     | |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || || |||||||| || |||||||| || | ||||    
T  20390190 taaatgctccgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaagaaagcatggaaaattctattc 20390289  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||  ||             ||||  |||| |||||||| |||| ||| ||||||||||  || || ||||| ||  | || || || || ||||||||||    
T  20390290 atgcac-------------caggcacattagtaacaccgaaagacatcactttatatttgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatat 20390376  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| || ||||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  20390377 cttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgaacccactaactgatccataaaatcatcaattctcgg 20390476  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  20390477 aagtggatacctattatttatcgtcactttattcaactga 20390516  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #39
Raw Score: 106; E-Value: 8e-53
Query Start/End: Original strand, 270 - 467
Target Start/End: Original strand, 22989275 - 22989472
Alignment:
Q  270 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctca 369  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||| ||||||||||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||    
T  22989275 aaaggcatcactttatattcataatacccataacgcgttctgaaagctgtattctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctca 22989374  T
Q  370 aatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 467  Q
    ||||||| ||||| || |||| |||| ||||||||||||||||||| |||||||||   |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  22989375 aatcaatcttgctaaacacacttgcagccactaactgatccatcaagtcatcaattattggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaac 22989472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #40
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 317 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21781691 - 21781539
Alignment:
Q  317 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaa 416  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||||    
T  21781691 tgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaa 21781592  T
Q  417 tcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  21781591 tcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 21781539  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #41
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 22052851 - 22053293
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||||||||||||  |||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  22052851 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcaacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 22052950  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |  |||||||| ||||| ||| | || ||   ||||| ||| ||||| || || ||     
T  22052951 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaggatatcatcaatgaatacacccacaaacttatccagaaaggcatgaaaaattcgg 22053050  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |  ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  22053051 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacctggtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 22053150  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| ||  ||||||    |||||| || | |||||||||||| ||||||||||     
T  22053151 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccaaccagctgatccatcaagtcatcaattct 22053250  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  22053251 cggaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 22053293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #42
Raw Score: 88; E-Value: 4e-42
Query Start/End: Original strand, 261 - 448
Target Start/End: Original strand, 19984401 - 19984588
Alignment:
Q  261 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  19984401 gtaacaccgaaaggcatcaccttttattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaac 19984500  T
Q  361 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
     |||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| | | |||||||||||||||||||    
T  19984501 ctgacctcaaatcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaatcctcagaagtggatacctattctt 19984588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #43
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 4984065 - 4984472
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||  |||| | |  |||||| || ||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| ||||| ||  ||||||    
T  4984065 aaccagaactcacattttgacaacttaacatacaatcgcttctcctttaacacttgcaatactattctcagatgctctgcatgctcttcctcgttcttgg 4984164  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||||||  ||||||  |||||||| || || ||   ||| | ||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  4984165 aataaatcaaggtatcattaatgaacaccacaacaaacttatctagaaaagcatggaagattcgattcatgtactccataaaaacaccaggcgctttagt 4984264  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
     ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||      
T  4984265 tacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatgataacca 4984364  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||| | |||||||| || || ||||    
T  4984365 gacctcaaatcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacttgttcttgatcgtaactttgt 4984464  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  4984465 tcaactga 4984472  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #44
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 28982934 - 28983341
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  28982934 aaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 28983033  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  28983034 aatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 28983133  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  28983134 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 28983233  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    | |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  28983234 gccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 28983333  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  28983334 tcaactga 28983341  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #45
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 28988153 - 28988560
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||||||||||||||  || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| || ||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  28988153 aaccagaattcacattgtgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaacactattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 28988252  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || | ||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  28988253 aatagattagaatatcatcaataaataccaccacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 28988352  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| |||||||      
T  28988353 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatgataacca 28988452  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    | |||||||||||| || |||||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| |||||||| || || ||||    
T  28988453 gccctcaaatcaatcttactgaaaatcttggcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgt 28988552  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  28988553 tcaactga 28988560  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #46
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 27356559 - 27356966
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||||||||| || |||||||| |||||  |||||||||| ||||| || |||||| ||||||    
T  27356559 aaccagaactcacatttcgacaacttcgcatacaacctcttctcttttaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttgg 27356658  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||    
T  27356659 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattcggttcatgtactccataaacacaccaggcgcattagt 27356758  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || || ||||| |  ||||      
T  27356759 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcacctttatctgatagtaacca 27356858  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    || ||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || |||||||  ||||| |||||||| ||||| || |  || ||||    
T  27356859 gatctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattctaggaagcggatacctgttctttatcgaaactttgt 27356958  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  27356959 tcaactga 27356966  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #47
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 63 - 387
Target Start/End: Original strand, 6605681 - 6606005
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||| ||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||    
T  6605681 aaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacctgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttgg 6605780  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || ||||||||||| || || || || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| ||    
T  6605781 aatagattaaaatatcatcaataaataccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagt 6605880  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||      
T  6605881 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatgataacca 6605980  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaa 387  Q
    |||||||||||||| || |||||||    
T  6605981 gacctcaaatcaatcttactgaaaa 6606005  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #48
Raw Score: 73; E-Value: 4e-33
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16875887 - 16875447
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  16875887 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 16875788  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  16875787 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 16875688  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  16875687 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 16875588  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  16875587 atcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 16875488  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  16875487 ggaagtggataccaattcttaatcgtcaccttgttcaactg 16875447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #49
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 345 - 470
Target Start/End: Original strand, 22373173 - 22373298
Alignment:
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||  ||||||||||| ||||    
T  22373173 ttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattcttggaagtggatatctat 22373272  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| || || || || |||||||||    
T  22373273 tctttatcgtcactttattcaactga 22373298  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #50
Raw Score: 67; E-Value: 1e-29
Query Start/End: Original strand, 63 - 277
Target Start/End: Original strand, 22372954 - 22373168
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    ||||| ||||||||||| ||| | |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||||||| |||| |    
T  22372954 aaccataattcacatttggaccacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatcttaagatgctctgcatggtcttcttcattcttag 22373053  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| |  ||||||||  | |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| ||    
T  22373054 aataaattaggatatcatcagtaaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcaattcatgtactccatgaacacaccaggcgcattagt 22373153  T
Q  263 aacaccaaaaggcat 277  Q
    |||||| ||||||||    
T  22373154 aacacccaaaggcat 22373168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #51
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21849129 - 21848689
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || || |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  21849129 agaaatcacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcccacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 21849030  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  21849029 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 21848930  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| |   ||| ||| || || ||    ||    
T  21848929 tcatgtattccataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccataccttgttcggaacgcagttttggatat 21848830  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  21848829 atctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 21848730  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||| |||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21848729 ggaaatggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21848689  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #52
Raw Score: 60; E-Value: 2e-25
Query Start/End: Original strand, 407 - 470
Target Start/End: Original strand, 22030470 - 22030533
Alignment:
Q  407 atccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  22030470 atccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 22030533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #53
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 255 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 22061245 - 22061030
Alignment:
Q  255 gcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggt 354  Q
    ||||| |||||||| |||||||| || || |||||||| |||||||| ||  | || || ||  |||||||||| || ||||| || || |||||||| |    
T  22061245 gcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccttcttctgcatttcctcatccttcaccttaatctgat 22061146  T
Q  355 gataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagt 454  Q
    | |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   ||||||||| ||||||| ||| || |||||||| |  |||||||||||||| ||||| || ||    
T  22061145 ggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacttttgcacccaccaactgattcattaagtcatcaatcctgggaagtggatacctgttctttatcgt 22061046  T
Q  455 taccttgttcaactga 470  Q
     || ||||||||||||    
T  22061045 aactttgttcaactga 22061030  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #54
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 63 - 304
Target Start/End: Original strand, 14567165 - 14567406
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| | | |||| || |||||||||||||| || || || || ||||  ||||| || || ||| ||||||    
T  14567165 aaccagaactcacatttcgacaactttgcatacaatctcttttccttcaacacttgcaacactatttttaggtgctttgcatgctcctcctcattcttgg 14567264  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | ||||| || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || || ||||| ||||||||||| || ||||| || || ||    
T  14567265 aataaattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatgtactccataaaaacaccaggcgccttagt 14567364  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 304  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14567365 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacg 14567406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #55
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 20651147 - 20650707
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| |  ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||| ||||| |||||||| ||||||    
T  20651147 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaatctcacacttagacaacttagcacataactggttctccttcaagacttgcaacacaatc 20651048  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||| ||||| || || ||||  || || || | |||||||||||| |||||||| ||||| || || |||| | | | ||  || || | ||    
T  20651047 ctcaaatgctcggcatgctcctcctcagatttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccactacaaaacggtccagataaggataaaatattctat 20650948  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||||||||| || || || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| ||||| ||    ||    
T  20650947 tcatatactctatgaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgctgttttggatat 20650848  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| |||| || ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| ||||  |||||||||||||||||||| | |    
T  20650847 atcttctgcctttactctaatttgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaactagttgatccatcaaatcatcaatcctc 20650748  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  20650747 ggaagtggataccgattcttaattgtcaccttgttcaactg 20650707  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #56
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 170 - 323
Target Start/End: Original strand, 19869823 - 19869976
Alignment:
Q  170 caaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca 269  Q
    |||||||||||| ||||| || || |||||  |||| ||| | | |||||| || |  ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || |||    
T  19869823 caaaatatcatcaatgaatactacaacgaactgatctaaatacggatggaaaattctgttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactcca 19869922  T
Q  270 aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 323  Q
    |||||||| |||  ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  19869923 aaaggcatcactgaatactcataatgaccataacgggttctgaaggcagtcttc 19869976  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #57
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 346 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 23155517 - 23155394
Alignment:
Q  346 taatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctatt 445  Q
    ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||| ||||||| |||    
T  23155517 taatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacttctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctcagaagcggataccgatt 23155418  T
Q  446 cttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||| || || ||||||||||||||    
T  23155417 cttaatcgtcaccttgttcaactg 23155394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #58
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Original strand, 16414455 - 16414520
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  16414455 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 16414520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: chr8; HSP #59
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 21194957 - 21194892
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||| ||||||||||| | | |||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  21194957 ctgatccattaaatcatcaatcctcagaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 21194892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042 (Bit Score: 357; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0042
Description:

Target: scaffold0042; HSP #1
Raw Score: 357; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 38179 - 37731
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  38179 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 38080  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||| |||||||||||||||||||||    
T  38079 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaaaacaaccgcgaaccgatccaaaaatgcatggaag 37980  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  37979 atgcgatttatatactccataaacactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 37880  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||    
T  37879 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatc 37780  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  37779 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 37731  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0042; HSP #2
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 22661 - 23099
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| || |||  ||||||||| ||||||||    
T  22661 aaataacatggccaagaaaacttacctcattcaaccagaactcacactttgacaacttggcatataacttcttttccttcggcacttgcaaaacaatctt 22760  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || ||||||||  ||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| |||||  |||||||| | ||||| || || ||||||    
T  22761 caaatgctcagtgtgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcattgatgaacacaaccacgaagtgatccaaatacgcatgaaaaatacgattc 22860  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || |||||||||||||| || || ||| | |||||| | |||||||| ||   |||||| || || ||||||||  | || || || |||||||||||||    
T  22861 atgtactccataaacacacctggcgcagttgtaacaacgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 22960  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    | || ||||| |||||||||||||| || |  || ||||||||||| ||||| || | || | |||||||||||||||||||||||||||| ||||  ||    
T  22961 cctcgtctttcactttaatctggtggtagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacagacattcacccactaactgatccatcaaatcatctattcttgg 23060  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  23061 aagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 23099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029 (Bit Score: 354; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0029
Description:

Target: scaffold0029; HSP #1
Raw Score: 354; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 108164 - 107723
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  108164 cagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 108065  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||    
T  108064 cttcagatgctcagcatgttcctcttcaatcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaaccgatccaaaaacgcatggaagatgcga 107965  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
     |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||| ||    
T  107964 ctcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctatcttctaca 107865  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  107864 tatcctcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaactcttgcacccactaactgatccatcaaatcatccattct 107765  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  107764 cggaagtggatacctattcttgatagttatcttgttcaactg 107723  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #2
Raw Score: 113; E-Value: 5e-57
Query Start/End: Original strand, 28 - 472
Target Start/End: Original strand, 114512 - 114956
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| || || |||||||| || || || |||||||||||||| | ||||||||||||||| |||||||| |||||    
T  114512 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcatttaaccagaactcgcacttcgacaatttggcatacaatttcttctctttcaatacttgcaatacaat 114611  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || | |    
T  114612 catcagatgttctgcatgctcttcctcagttcttgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattcta 114711  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  114712 ttcatatattccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 114811  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | ||||||||||| || || ||||| || |||| ||||| ||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  114812 tgtcttcatctttcaccttgatctgatggtaacctgaccacaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcaattct 114911  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 472  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||||    
T  114912 cggaagaggatatctgttctttatcgtaactttattcaactgatg 114956  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0029; HSP #3
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 230 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 95045 - 94805
Alignment:
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||||||||| ||||| || || || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||  | || ||||| ||||||||||||    
T  95045 catatactccatgaacacacccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcata 94946  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    |||||||| || ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||||| |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| | ||    
T  94945 tcttcatccttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgctaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatccgcg 94846  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||| |||||||| || || || ||||||||||||    
T  94845 gaagtggatatctattctttattgtaactttgttcaactga 94805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080 (Bit Score: 349; Significance: 0; HSPs: 6)
Name: scaffold0080
Description:

Target: scaffold0080; HSP #1
Raw Score: 349; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11598 - 11150
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  11598 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttccttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaaatttcttctctttcaacacttgcaa 11499  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||||    
T  11498 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgataaacaccaccacgaaccgatccaaaaaggcatggaag 11399  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  11398 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagttgtct 11299  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11298 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatc 11199  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  11198 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 11150  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #2
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 30829 - 31273
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||    
T  30829 catcaccagaaataacatggccaagaaaactgacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgcaa 30928  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||| |||||  ||||||||||||||||||||    
T  30929 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaattaaaatatcttcgatgaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatggaag 31028  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31029 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 31128  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  31129 tctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 31228  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |  || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  31229 atatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 31273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #3
Raw Score: 306; E-Value: 1e-172
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 36294 - 36739
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||||    
T  36294 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttttcttttaacacctgca 36393  T
Q  121 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || || ||||| || ||  |||||||||||||||||||    
T  36394 agacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaataaaaatatcatcaataaaaacaaccacaaaaagatccaaaaatgcatggaa 36493  T
Q  221 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 320  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  ||||| | |||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36494 gatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattcataacatcgaaaggcataactttgtattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtc 36593  T
Q  321 ttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 420  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| | | ||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  36594 ttctgcatatcttcatcttttactttgatctggtgataacctaatctcaaattaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcat 36693  T
Q  421 caattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| || |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  36694 caaatctcggaagtggatacctattcttgatagttactttgttcaa 36739  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #4
Raw Score: 244; E-Value: 1e-135
Query Start/End: Original strand, 78 - 469
Target Start/End: Original strand, 53638 - 54029
Alignment:
Q  78 ttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatat 177  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||    
T  53638 ttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatat 53737  T
Q  178 catcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 277  Q
    ||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||    
T  53738 catcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcat 53837  T
Q  278 aactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaatt 377  Q
    |||||| || |||||| ||||||| ||  ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| ||     
T  53838 aactttgtactcatagggaccataccgtgttcagaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatc 53937  T
Q  378 ttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  53938 ttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 54029  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #5
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 29 - 244
Target Start/End: Original strand, 50044 - 50259
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |    
T  50044 agaaataacatgtccaagaaagcccacttctttcaaccaaaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagc 50143  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||| |||    
T  50144 ttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcattgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtgat 50243  T
Q  229 tcatatactccataaa 244  Q
    |||| |||||||||||    
T  50244 tcatgtactccataaa 50259  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0080; HSP #6
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13883 - 13805
Alignment:
Q  392 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  13883 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 13805  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008 (Bit Score: 348; Significance: 0; HSPs: 5)
Name: scaffold0008
Description:

Target: scaffold0008; HSP #1
Raw Score: 348; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 33 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 86144 - 85709
Alignment:
Q  33 ataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttca 132  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||    
T  86144 ataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctccttcaacacttgcaagacaatcttca 86045  T
Q  133 gatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcat 232  Q
    ||||||||  ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  86044 gatgctcaatatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcat 85945  T
Q  233 atactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatct 332  Q
     ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||    
T  85944 ttactctataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatct 85845  T
Q  333 tcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaa 432  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||    
T  85844 tcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttactgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcgtaa 85745  T
Q  433 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  85744 gtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 85709  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #2
Raw Score: 264; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 85581 - 85142
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||    
T  85581 gaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaacaagct 85482  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||| ||||||| |||| ||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| |||||||||||    
T  85481 tcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggaggaaattaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatgaaagatgcgatt 85382  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||  |||||||||||||||||||||||    
T  85381 catgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagctgtcttctgcata 85282  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||| | | |||||||| || |||||||||||   || |||||||||||||||||||||||||||||| | ||    
T  85281 tcttcatcttttactttaatctggtgataaccttatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgtacccactaactgatccatcaaatcatcaatcctcg 85182  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  85181 taagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 85142  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 327 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 132543 - 132401
Alignment:
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||| | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| |    
T  132543 atatcttcagcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcc 132444  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
      ||||||||||||| |||||| || |  || |||||||||||    
T  132443 ttggaagtggataccgattcttaatcgccactttgttcaactg 132401  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #4
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 29 - 151
Target Start/End: Complemental strand, 132841 - 132719
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  132841 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 132742  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttc 151  Q
     ||| |||||||||||| |||||    
T  132741 ctcaaatgctcagcatgctcttc 132719  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0008; HSP #5
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Original strand, 25853 - 25941
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    ||||| |||||  ||||||| |||||| ||| |||||||||||||||||| ||||  || || || | |||||||||||| ||||||||    
T  25853 ttctccttcaaatcttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgttcttcctcagatttcgaatataccaaaatatcatctatgaacac 25941  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0044
Description:

Target: scaffold0044; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 470
Target Start/End: Original strand, 16113 - 16553
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16113 gaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagacaagttagcataaattttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 16212  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16213 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaacacaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 16312  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||    
T  16313 catatactccataaacactccaggtgcattggtcacacggaaaggcataactttatattcatagtgaccacaacgcgttctgaaaactgtcttctgcata 16412  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  16413 tcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcg 16512  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  16513 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 16553  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0044; HSP #2
Raw Score: 334; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Original strand, 2375 - 2816
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagac-aatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||| |  |||||||||||||||||||| |||||| || || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||    
T  2375 gaaataacatggccaagaaaacttaattctttcaaccagaattcacacttagaccaagttagcataaaggttattctctttcaacacttgcaagacaatc 2474  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||    
T  2475 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 2574  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacca-aaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  2575 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccggaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaaactgtcttctgca 2674  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| ||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  2675 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgttcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 2774  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  2775 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 2816  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017 (Bit Score: 345; Significance: 0; HSPs: 3)
Name: scaffold0017
Description:

Target: scaffold0017; HSP #1
Raw Score: 345; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Original strand, 57962 - 58410
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||    
T  57962 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttggaa 58061  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||  ||||||||||||||||||||    
T  58062 gacaatcttcagatgcacagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcgataaacacaactacgaactgatccaaaaatgcatggaag 58161  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  58162 atgcgattcatataatccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 58261  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||  |||||||||||||| ||||| |||||   |||||||||||| |||||||||||||||||    
T  58262 tctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgacctcaaatcaatcttgctaaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatc 58361  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  58362 aattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 58410  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #2
Raw Score: 285; E-Value: 1e-159
Query Start/End: Original strand, 28 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 195840 - 195444
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  195840 cagaaatgacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaac 195741  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| || || ||||||| |||||||||||||||||||    
T  195740 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaagacaaccacaaaacgatccagaaatgcatggaagatgcga 195641  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| ||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| ||||||||||    
T  195640 ttcatatactccataaatacttctggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttctgaaagccgtcttctgca 195541  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 424  Q
    |||||||||| ||||  ||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  195540 tatcttcatcatttatcttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 195444  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0017; HSP #3
Raw Score: 273; E-Value: 1e-152
Query Start/End: Original strand, 22 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 18426 - 17975
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaac-tcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgca 120  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||| | || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||    
T  18426 catcaccagaaataacatggccaacaaaaccttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgca 18327  T
Q  121 agacaatcttc-agatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatgga 219  Q
    ||||||| ||  ||||| |||||||||||||||| |  |||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||||||||||| ||||    
T  18326 agacaattttttagatgttcagcatgttcttcttaatacttggagtaaat-aaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaccgctccaaaaatgcttgga 18228  T
Q  220 agatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgt 319  Q
    ||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| | ||||||| | |    
T  18227 agatgcgattcatgtactacataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgtactgaaagatat 18128  T
Q  320 cttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatca 419  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  18127 cttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacatgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatca 18028  T
Q  420 tcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatg 472  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  18027 tcaattctcggtagtggatacctatttttgatagttactttgttcaactgatg 17975  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031 (Bit Score: 321; Significance: 0; HSPs: 2)
Name: scaffold0031
Description:

Target: scaffold0031; HSP #1
Raw Score: 321; E-Value: 0
Query Start/End: Original strand, 22 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 55350 - 54902
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || | |||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  55350 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctttttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttaaacacttgcaa 55251  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| |  || ||||| || ||  ||||||||||||||||||||    
T  55250 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtattggagtaaataaaaatatcatccagaaaaacaaccacaaagggatccaaaaatgcatggaag 55151  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||  |||||||||||||||    
T  55150 atgcgattcaattactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccatatcgtgttctgaaagctgtct 55051  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  55050 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggttataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 54951  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||  ||||||||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  54950 aattcttggaagtggatatctattcttgatagttactttgttcaactga 54902  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0031; HSP #2
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Original strand, 109584 - 110023
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| || ||||| |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| ||||||    
T  109584 agaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcgcattttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaatc 109683  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||  || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || || |    
T  109684 ttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcacgatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaattcggt 109783  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||| ||||||||||||| | |||  |||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || ||||| |||||||||||    
T  109784 tcatagactccataaacacactaggcacattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgcat 109883  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |    
T  109884 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctc 109983  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||| |||||||| ||||| || || ||| |||||||||    
T  109984 ggaagcggatacctgttctttatcgtaaccatgttcaact 110023  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102 (Bit Score: 303; Significance: 1e-170; HSPs: 2)
Name: scaffold0102
Description:

Target: scaffold0102; HSP #1
Raw Score: 303; E-Value: 1e-170
Query Start/End: Original strand, 58 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 51668 - 51258
Alignment:
Q  58 ctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagt 157  Q
    |||||||| |||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  51668 ctttcaactagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatcttcttcttcagt 51569  T
Q  158 cttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgca 257  Q
    |||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| || ||  ||||||||| |||||| |||||||||||||||||||||||||| |||| |||||||    
T  51568 cttggagtaaatcaaaatgtcatcgatgaaaacaaccacaaagtgatccaaaagtgcatgaaagatgcgattcatatactccataaatactcgaggtgca 51469  T
Q  258 ttggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgat 357  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||    
T  51468 ttggtaacaccaaaaggcatgactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtgat 51369  T
Q  358 aacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    |||  || ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||    
T  51368 aacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttac 51269  T
Q  458 cttgttcaact 468  Q
     ||||||||||    
T  51268 tttgttcaact 51258  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0102; HSP #2
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 41650 - 42091
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||| |||| ||||||||||||||| || ||    |||||||||||||| || ||||  ||| |||| |  ||||| |||| |||||||||||| |||||    
T  41650 cagatataatatggccaagaaaacttacttcgcgtaaccagaattcacacttggacagcttgtcatacaacttcttttctt-caacacttgcaacacaat 41748  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || |      
T  41749 cttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccatataagcatgcaaaattctg 41848  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || || |||||||    
T  41849 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaactccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtattctgca 41948  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  41949 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 42048  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  42049 cggaagtggatacctgttcttaatcgtcactttattcaactga 42091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081 (Bit Score: 289; Significance: 1e-162; HSPs: 2)
Name: scaffold0081
Description:

Target: scaffold0081; HSP #1
Raw Score: 289; E-Value: 1e-162
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 35973 - 36417
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  35973 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctattaacacttgcaa 36072  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  36073 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaag 36172  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  36173 atgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 36272  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||     
T  36273 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcatt 36372  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  36373 aattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 36417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0081; HSP #2
Raw Score: 281; E-Value: 1e-157
Query Start/End: Original strand, 22 - 466
Target Start/End: Original strand, 20549 - 20993
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||| | |||||||||||    
T  20549 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcatccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctcttaacacttgcaa 20648  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||    
T  20649 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtaaattaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaatcgatccaaaaatgcatgaaag 20748  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||| |||| || |||||||||||||| ||| |||||||||||||||    
T  20749 atgtgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcatatctttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagctgtct 20848  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |  ||||||||||||||||||||||||||     
T  20849 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttcaacccactaactgatccatcaaatcatt 20948  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||| || || |||||||||||    
T  20949 aattctcggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaa 20993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0055 (Bit Score: 280; Significance: 1e-156; HSPs: 1)
Name: scaffold0055
Description:

Target: scaffold0055; HSP #1
Raw Score: 280; E-Value: 1e-156
Query Start/End: Original strand, 126 - 469
Target Start/End: Original strand, 21296 - 21639
Alignment:
Q  126 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 225  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||| || || |||||||||||||||||||||||||    
T  21296 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaaccacaaaccgatccaaaaatgcatggaagatgc 21395  T
Q  226 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 325  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||| |||||||||||||||||||    
T  21396 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtaaccataacgcgttctgaaagctgtcttctg 21495  T
Q  326 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    ||| ||| |||| |||||||||||||||||||| | ||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||    
T  21496 catctctccatcctttactttaatctggtgatatcctgacctcaaatcaatcttgctaaaaacacgtgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatt 21595  T
Q  426 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  21596 ctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 21639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0621 (Bit Score: 278; Significance: 1e-155; HSPs: 1)
Name: scaffold0621
Description:

Target: scaffold0621; HSP #1
Raw Score: 278; E-Value: 1e-155
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 3385 - 3826
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||| || |     
T  3385 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacaattgcaaaaccag 3484  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||  ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  3485 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagagttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 3584  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  3585 ttcatgtactccataaatactccaggtgaattagtaacaccgaaaggcataactttatactcataatgtccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 3684  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  3685 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 3784  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    || |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  3785 cgaaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 3826  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022 (Bit Score: 271; Significance: 1e-151; HSPs: 5)
Name: scaffold0022
Description:

Target: scaffold0022; HSP #1
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 40588 - 41026
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  40588 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 40687  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  40688 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 40787  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  40788 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 40887  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  40888 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 40987  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  40988 aagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 41026  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #2
Raw Score: 271; E-Value: 1e-151
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Original strand, 74308 - 74746
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||    
T  74308 aaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagtctt 74407  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || |||||||||||| ||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| | ||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||||    
T  74408 caaatgctcagcatgatcttcctcggtcttggagtaaattaaaatgtcatcaatgaaaaaaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgattc 74507  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||||||||||||||    
T  74508 atgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcattctaaaagctgtcttctgcatat 74607  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||| |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| |||  ||    
T  74608 ctttatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcagttcttgg 74707  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  74708 aagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 74746  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #3
Raw Score: 253; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 55708 - 56128
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| || || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  55708 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 55807  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||| ||    
T  55808 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatcaaaaaatgcatgaaaaatgtga 55907  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  55908 ttcatgtactccataaacactccaggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatactcataatgtccatatcgcgttctaaaagttgtcttctgca 56007  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||| | || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  56008 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 56107  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  56108 cggaagtggatacctattctt 56128  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #4
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 9178 - 9017
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || ||  || | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  9178 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagataacttaacacataactagttctctttcaatacttgcaacacaatc 9079  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  9078 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 9017  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0022; HSP #5
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8814 - 8738
Alignment:
Q  393 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| ||||| |  |||||||||||    
T  8814 gcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatagtcaaattgttcaactg 8738  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0256 (Bit Score: 269; Significance: 1e-150; HSPs: 1)
Name: scaffold0256
Description:

Target: scaffold0256; HSP #1
Raw Score: 269; E-Value: 1e-150
Query Start/End: Original strand, 28 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 23427 - 23095
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||    
T  23427 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagacagtttggcataaagtttcttctctttcaacacttgtaagacaat 23328  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||||||| ||    
T  23327 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagttttggagtaaatcaaaatgtcgtcgataaacacaactactaaccgatccaaaaatgcatggaagatgtga 23228  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||    
T  23227 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaacgctgtcttctgca 23128  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  23127 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac 23095  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 2)
Name: scaffold0309
Description:

Target: scaffold0309; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 16594 - 17035
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| ||| || |     
T  16594 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcaattagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttacaaaaccag 16693  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||||||| |||||| |||||||||    
T  16694 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaaccaccacgaaccgatccaaaagtgcatgaaagatgcga 16793  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  16794 ttcatgtactccataaatactcctggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgaccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 16893  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  16894 tatcttcacctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 16993  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  16994 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 17035  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0309; HSP #2
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 11746 - 12167
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| |  ||  ||||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  11746 cagaaataatatggccaagaaaacttaattcactcaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 11845  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | ||||| || || |      
T  11846 cttcagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatgaaaaattctg 11945  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  11946 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 12045  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa-tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||    
T  12046 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaattcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattc 12145  T
Q  427 acggaagtggatacctattctt 448  Q
     ||||||||||||||| |||||    
T  12146 tcggaagtggatacctgttctt 12167  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0243 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0243
Description:

Target: scaffold0243; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 25298 - 24857
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||  |||||||||||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||| || |     
T  25298 cagaaataacatatccaagaaaactcaattctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagtttcttatctttcaacacttgcaaaaccag 25199  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||| || || || | ||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  25198 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcaatcttggagtaaatcaaaatatcgtcaataaaaagaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 25099  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||||||| |||||||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  25098 ttcatgtactccataaacacttcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatattgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 24999  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||      
T  24998 tatcatcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattat 24899  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||    
T  24898 cggaagtggatacctattctttatcgttattttgttcaactg 24857  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0138 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 1)
Name: scaffold0138
Description:

Target: scaffold0138; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 7440 - 6999
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  7440 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaacagt 7341  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||| ||||||||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||| ||||| |||    
T  7340 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaaccaaaatgtcatcgatgaatacaaccatgaaacgatccaaaaatgcatgaaagattcga 7241  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || | ||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| |||| |||||||||||    
T  7240 ttcatgtactccataaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagttgtcttctgca 7141  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||     
T  7140 tatctccatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattct 7041  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || || || ||||| |||||    
T  7040 tggaagtggatacctattctttatcgtcactttgtttaactg 6999  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023 (Bit Score: 266; Significance: 1e-148; HSPs: 4)
Name: scaffold0023
Description:

Target: scaffold0023; HSP #1
Raw Score: 266; E-Value: 1e-148
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 151063 - 151504
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||| || |     
T  151063 cagaaattacatgtcctagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttattctctttcaacacttgcaacaccag 151162  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| ||||||| |||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  151163 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaattaaaatattatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 151262  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| |||||||  ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  151263 ttcatgtactccataaatactccaagtgcattcataacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgca 151362  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   ||||||||||||||||||||||||||||||||| |     
T  151363 tatcttcatcttttactttaatctggtgataaccagatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatcct 151462  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  151463 cggaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 151504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #2
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 2857 - 2417
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||    
T  2857 agaaataacatggccaagaaaactcatctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaactagtc 2758  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| |||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || |||||||    
T  2757 ttcaaatgctcagcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcgat 2658  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| |||||||||||||| ||| | || || ||||||||| ||||||| |||||||| ||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  2657 tcatgtactccataaacacaccaagcgcgtttgtaacaccagaaggcatcactttatactcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcat 2558  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| | ||||||||| |||||||||| |    
T  2557 atcttcatctttcactttaatatggtgataaccggatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattcatccatcaagtcatcaattctc 2458  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2457 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 2417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #3
Raw Score: 71; E-Value: 6e-32
Query Start/End: Original strand, 28 - 398
Target Start/End: Original strand, 86722 - 87091
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || |||||||||||||| || || || || | |||||| |  || ||||| |||| ||||||||| ||| |    
T  86722 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataactaggcatataacttattctccttcagcacttgcaaaacatt 86821  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||| | |||||| |||||||| || || ||||| ||||| || | ||| ||||| || |||| ||| || ||||||| |||| | ||||| || ||  ||    
T  86822 cttaa-atgctcggcatgttcctcctcggtcttagagtatattagaatctcatctataaacataacaacaaatcgattcaaataagcatgaaaaatatga 86920  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| ||||||||||||||||| || || |||||||| |||||||| |    |||||  || || || |||||  | || || || |||||||| |    
T  86921 ttcatatattccataaacactccaggggcgttagtaacaccgaaaggcatcatcgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgaa 87020  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 398  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||| |  || || |||||||| || ||||| ||||||||||||    
T  87021 tatcctcatctttcactttgatctggtgatagcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcaccc 87091  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0023; HSP #4
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 22 - 62
Target Start/End: Complemental strand, 27765 - 27725
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttc 62  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||    
T  27765 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttc 27725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0908 (Bit Score: 265; Significance: 1e-147; HSPs: 1)
Name: scaffold0908
Description:

Target: scaffold0908; HSP #1
Raw Score: 265; E-Value: 1e-147
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1126 - 691
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||| |||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | |||    
T  1126 aaataacatgtccaagaaagctcacttctctcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagctt 1027  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || ||||||||||||||||||   || |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  1026 caaatgctcagcatgttcttc---agacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 930  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  929 atgtactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatat 830  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||  ||    
T  829 cttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgttcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcttgg 730  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  729 aagtggatacctattctttattgttaccttattcaactg 691  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0647
Description:

Target: scaffold0647; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 8012 - 7571
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| |||||  ||||||||||||||||| | ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  8012 cagaaataacatgtccaagaaagctcactcctttcaaccagaattcatacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 7913  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| || || ||||||| ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  7912 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaactatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 7813  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||| | |||||||||| ||||||||||    
T  7812 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatgtccataacccgttctgaaagcagtcttctgca 7713  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  7712 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacatttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 7613  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     | |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  7612 tgaaagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 7571  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0647; HSP #2
Raw Score: 170; E-Value: 5e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 2852 - 3293
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||| | |||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||  ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| | |||    
T  2852 cagaaataatatggccacggaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaattgagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaataat 2951  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| ||||||||||||||||||| ||| || || |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| | ||||| || || |||    
T  2952 cttcaaatgttcagcatgttcttcttcagacttagattatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaataagcatgaaaaatacga 3051  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || |||||||| || || |||||||| |||||||| |||||||| |||  |||||  || || || |||||  | || || ||  |||||||||    
T  3052 ttcatgtattccataaatacacccggtgcattagtaacaccgaaaggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccatcttctgca 3151  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| ||||||||||||||||| |  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  3152 tatcctcatctttcactttaatctggtgatagcccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattct 3251  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||| ||||||||||| || || || || ||||||||    
T  3252 tggaagtgggtacctattctttatcgtcactttattcaactg 3293  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0319 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 1)
Name: scaffold0319
Description:

Target: scaffold0319; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 719 - 1157
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||  ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  719 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacccttagacaatttcgcataaaggttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 818  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  819 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgaagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 918  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  919 ttcatgtactccataaatactccaggcgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 1018  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || |||||||| || |||||||||||   ||||||||| ||||||||||||||||||||||| |     
T  1019 tatcttcatcttttactttaatctggtgataac--gatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaaatcatcaatact 1116  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||    
T  1117 cggaagtggatacctattcttgattgtcaccttgttcaact 1157  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120 (Bit Score: 262; Significance: 1e-146; HSPs: 2)
Name: scaffold0120
Description:

Target: scaffold0120; HSP #1
Raw Score: 262; E-Value: 1e-146
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 7973 - 8414
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  7973 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaactag 8072  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||| ||||||||||||||||| | |||||||||||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||||||||||| |||||||||    
T  8073 cttcaaatgcttagcatgttcttcttcagacatggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacaaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 8172  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| |  ||||||||| |||||||| ||||||||||||    
T  8173 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatctccataacgcgttctgaaaactgtcttctgca 8272  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  8273 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 8372  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  8373 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 8414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0120; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Original strand, 24506 - 24570
Alignment:
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||| ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  24506 tgatccatcaaatcatcaatccttggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 24570  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2004 (Bit Score: 260; Significance: 1e-144; HSPs: 1)
Name: scaffold2004
Description:

Target: scaffold2004; HSP #1
Raw Score: 260; E-Value: 1e-144
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1162 - 725
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  1162 cagaaataacatgtccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 1063  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| |||| ||||| ||||| || ||  |||||||||||||||| |||||||||    
T  1062 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaataccatctatgaaaacaaccacaaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 963  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |||| ||||||||||||||||    
T  962 ttcatgtactccataaacactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgaccataccgcgttctaaaagctgtcttctgca 863  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||  ||   ||||   |||||||| || ||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  862 tatcttcatctttcactttaatcttctg--cactt--tctcaaatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 767  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  766 cggaagtggatacctattctttattgttacttttttcaactg 725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0312 (Bit Score: 258; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0312
Description:

Target: scaffold0312; HSP #1
Raw Score: 258; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 12 - 453
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  12 cagaaataacatgcccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcacacttagataatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 111  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  112 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 211  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
     |||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||||||| |||| ||| ||||||| |||||||||||||    
T  212 atcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataaccttgtactcatagtgagcataccgcgttctgaaggctgtcttctgca 311  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  312 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 411  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||| ||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  412 tggaagttgatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 453  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0575 (Bit Score: 257; Significance: 1e-143; HSPs: 1)
Name: scaffold0575
Description:

Target: scaffold0575; HSP #1
Raw Score: 257; E-Value: 1e-143
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 3534 - 3974
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| | |||||||||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| |||||||  || |||||||||||||||| ||| ||| |    
T  3534 cagaaataacatgtctaagaaaactcacctctttcaaccataattcacactttgacaatttagcataaaactttttctctttcaacacttccaaaacagt 3633  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  3634 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 3733  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||  ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||||||| |||| ||||||||||||||||    
T  3734 ttcacgtactccataaacacagcaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccataacgcgttctaaaagctgtcttctgca 3833  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||||||||  || |||||||| || |||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  3834 tatcttcatctttcactttaatatggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 3933  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||    
T  3934 tggaagtggatacctattttttatcgttactttgttcaact 3974  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0324 (Bit Score: 254; Significance: 1e-141; HSPs: 1)
Name: scaffold0324
Description:

Target: scaffold0324; HSP #1
Raw Score: 254; E-Value: 1e-141
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13564 - 13123
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| ||||| ||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  13564 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttcttttaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 13465  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||  | ||  |||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  13464 cttcaaatgctcatcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcttttaaatcaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 13365  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||| ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||  ||||||||| |||||||||||    
T  13364 ttcatgtactccataaatactccacgtgcattcgtaacaccaaaaggcataactttgtactcatagtgaccataccgtgttctgaaagttgtcttctgca 13265  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||| ||||||  || |||||||| ||| | ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  13264 tatcttcatctttcactttaatctggagataacccgatctcaaatctattcttctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 13165  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||| ||||||| || ||||| |||||||||||    
T  13164 tggaagtggatacttattctttatcgttactttgttcaactg 13123  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1602 (Bit Score: 252; Significance: 1e-140; HSPs: 1)
Name: scaffold1602
Description:

Target: scaffold1602; HSP #1
Raw Score: 252; E-Value: 1e-140
Query Start/End: Original strand, 28 - 447
Target Start/End: Complemental strand, 420 - 1
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||||||| || |||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| ||| |    
T  420 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaacacagt 321  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  320 cttcaaatgctcagcatgttcttcctcagtcttggagtaaatcaaaatgtcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 221  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||||| | |||| ||||||||||||||||    
T  220 ttcatgtactccatcaacacaccaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcacgttatactcataatgtccataacacgttctaaaagctgtcttctgca 121  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  120 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 21  T
Q  428 cggaagtggatacctattct 447  Q
     |||||||||||||||||||    
T  20 tggaagtggatacctattct 1  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 2)
Name: scaffold0358
Description:

Target: scaffold0358; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 8002 - 8443
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  8002 cagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 8101  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||| |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  ||||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  8102 cttcaaatgctcaacatattcttcctcaaacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaagcacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtga 8201  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  8202 ttcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 8301  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  8302 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcct 8401  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  8402 cgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactg 8443  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0358; HSP #2
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 17198 - 17639
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||  |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17198 cagaaataacatatccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17297  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||  || |||||| |||  |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||  | ||| ||||||||||||||||| |||||| ||    
T  17298 cttcaaatgctcaaaatattcttcatcaaacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaagcaagaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgtga 17397  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||  || |||||||||||||||||||||    
T  17398 ttcatatactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 17497  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| |||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   |||||||||||| |||||||||||||||||||| |     
T  17498 tatcttcatcctttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcacccactaattgatccatcaaatcatcaatcct 17597  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    || |||||||||||||||||| || |  ||||||||||||||    
T  17598 cgaaagtggatacctattctttattgacaccttgttcaactg 17639  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0228 (Bit Score: 250; Significance: 1e-139; HSPs: 1)
Name: scaffold0228
Description:

Target: scaffold0228; HSP #1
Raw Score: 250; E-Value: 1e-139
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 20191 - 20632
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||| |||| |||||||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  20191 cagaaatagcatgtccaagaaagctcaattctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaa 20290  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||  ||    
T  20291 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatatga 20390  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || ||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| ||||||||| |||||||||||    
T  20391 ttcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctgaaagttgtcttctgca 20490  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||| ||||| ||||| |||||||||||||  |||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  20491 tatcttcatctttcactttaatctgttgataacctgatctcaagtcaatcttgctgaaaacactagcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 20590  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  20591 tggaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 20632  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011 (Bit Score: 249; Significance: 1e-138; HSPs: 3)
Name: scaffold0011
Description:

Target: scaffold0011; HSP #1
Raw Score: 249; E-Value: 1e-138
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24885 - 24445
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||    
T  24885 agaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaattcacactttgataatttagcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaatc 24786  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| || |||||||||||||| || || ||||    
T  24785 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaaacgttccaaaaatgcatgaaaaatacgat 24686  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||||| |||||||||||    
T  24685 tcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgcgttctaaaagccgtcttctgcat 24586  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||| |||||||| || || |||||||      
T  24585 atcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcgtcaattctt 24486  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  24485 ggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 24445  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #2
Raw Score: 147; E-Value: 3e-77
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 150522 - 150964
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  150522 cagaaataatgtggccaagaaaacttacctcacttaaccagaattcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 150621  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||  |||| | ||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  150622 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaaaatgtcatcaataaattcaaccatgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 150721  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  150722 ttcatatactccatgaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 150821  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  150822 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaatacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 150921  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  150922 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 150964  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0011; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 28 - 136
Target Start/End: Complemental strand, 194057 - 193949
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || |||||    ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  194057 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacgacttcttttctttcaaaacttgtaacacaat 193958  T
Q  128 cttcagatg 136  Q
    | |||||||    
T  193957 cctcagatg 193949  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0676 (Bit Score: 247; Significance: 1e-137; HSPs: 1)
Name: scaffold0676
Description:

Target: scaffold0676; HSP #1
Raw Score: 247; E-Value: 1e-137
Query Start/End: Original strand, 22 - 388
Target Start/End: Original strand, 7961 - 8327
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||||| | |||||| || |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  7961 catcaccagaaataacatggcccataaaacttacctctttcaaccagaactcacatttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 8060  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||| ||||||||||| || ||||| ||| |||||||||||||||| ||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||    
T  8061 gacaatcttcagatgttcagcatgttcctcctcagttttgaagtaaatcaaaatatcgtcgataaacacaacaatgaaccgatccaaaaaggcatggaag 8160  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  8161 atgtgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatattcatagtgaccataaagcattctgaaagctgtct 8260  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaac 388  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||||||||    
T  8261 tctgcatatcttcatccttcactttaatatggtgataccctgatctcaaatcaatcttgctgaaaac 8327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0084 (Bit Score: 246; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0084
Description:

Target: scaffold0084; HSP #1
Raw Score: 246; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 7174 - 7615
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  7174 cagaaataacatgtccaagaaaactcacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccaa 7273  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||| || |||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||    
T  7274 cttcaaatgctcaacatgttcttcctcggtcttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacgaaccgatctaaaaatgcatgaaagatacga 7373  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||| || | ||| || ||||| ||||| || ||||| | | ||||||| |||||||||||||    
T  7374 ttcatgtactccataaacactctaggtgcatttgtaacaccgaacgacatcaccttatactcataatgtccataccacgttctgaacgctgtcttctgca 7473  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||||||||||   ||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  7474 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctgaaaacattagcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 7573  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  7574 cggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 7615  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0403 (Bit Score: 245; Significance: 1e-136; HSPs: 1)
Name: scaffold0403
Description:

Target: scaffold0403; HSP #1
Raw Score: 245; E-Value: 1e-136
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 8326 - 8765
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||| | ||||| ||||||||||||||||| || | |    
T  8326 agaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataatgcttcttttctttcaacacttgcaaaaccagc 8425  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| |||||||| ||||||||| | || ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||    
T  8426 ttcaaatgctcagaatgttcttccttagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 8525  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| ||||||||||| ||| |||||||||| |||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||||| || |||||| ||||||||||||    
T  8526 tcatgtactccataaatactacaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgaccataacgcgttatgaaagatgtcttctgcat 8625  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||| ||| |||||||| || |||||| ||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| | |    
T  8626 atcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctg-aaacttttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcctc 8724  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||| |||||||||||| || || ||||| ||||||||    
T  8725 ggaagtgaatacctattctttattgtcacctttttcaactg 8765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1423 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold1423
Description:

Target: scaffold1423; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1735 - 1294
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||  ||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  1735 cagaaataacatgtacaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 1636  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| | ||| | ||||||||||||||| |||||| ||    
T  1635 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccatgaaccaatccaaaaatgcatgaaagatgtga 1536  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||  || |||||||||||||||||||||    
T  1535 ttcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcataatggccatactgcgttctgaaagctgtcttctgca 1436  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||| ||||||||||  || |||||| | || |||||||||||   ||||||||||||||||||||| ||||||||||| |     
T  1435 tatcttcatcttttactttaatatggtgataacccgatctcaaagctatcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccataaaatcatcaatcct 1336  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||    
T  1335 cggaagtggataccttttctttattgtcaccttgtttaactg 1294  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0501 (Bit Score: 242; Significance: 1e-134; HSPs: 1)
Name: scaffold0501
Description:

Target: scaffold0501; HSP #1
Raw Score: 242; E-Value: 1e-134
Query Start/End: Original strand, 22 - 355
Target Start/End: Original strand, 4141 - 4474
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| || |||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  4141 catcaccaaaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 4240  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||||||| ||||||||| || || ||||| || || | |||||||||||||||||||    
T  4241 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcattcttgaagtaaatcagaatatcatcaataaaaacaaccacaaagccatccaaaaatgcatggaag 4340  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||||    
T  4341 atacgattcatatactccataaacactccaagtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcgttttgaaagctgtct 4440  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtg 355  Q
    |||||||||||||||||||||| |||||||||||    
T  4441 tctgcatatcttcatcttttaccttaatctggtg 4474  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0282 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 1)
Name: scaffold0282
Description:

Target: scaffold0282; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 14832 - 14394
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  14832 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 14733  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || |||    
T  14732 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcaatcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaactatccaaaaatgcatgaaaaatacga 14633  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  14632 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagcagtcttctgca 14533  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||     
T  14532 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaacacacgtgcacccactaactgatccataaaatcattaattct 14433  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     |||||||||||  ||||||| || ||||| || |||||    
T  14432 tggaagtggatatttattctttatcgttactttattcaa 14394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114 (Bit Score: 239; Significance: 1e-132; HSPs: 3)
Name: scaffold0114
Description:

Target: scaffold0114; HSP #1
Raw Score: 239; E-Value: 1e-132
Query Start/End: Original strand, 31 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 18691 - 18253
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||| ||||||| ||||||||||| || | |||    
T  18691 aaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcatctcttttaacacttgcaaaaccagctt 18592  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    || ||||||| ||||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||||||| || ||||| |||||  |||||||||||||||| ||||||||||||    
T  18591 caaatgctcatcatgttcttcttcaaacttggggtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattc 18492  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || ||||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||| |||| ||| ||||||||| ||||||||||||||    
T  18491 atgtactccataaatactctaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttgtactcatagtgatcataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatat 18392  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||||||| |||||| |||||||| ||| |||||||| || |||||||||||   ||||| ||||||||||||||||||||||||||| | | |    
T  18391 cttcatcttttactataatctagtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacttttgcactcactaactgatccatcaaatcatcaatcctcag 18292  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  18291 aagtggatacctattctttattgtcaccttgttcaactg 18253  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #2
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 203 - 474
Target Start/End: Original strand, 22002 - 22273
Alignment:
Q  203 atccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataa 302  Q
    ||||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||| |||||||| || || || ||||| ||||||||     
T  22002 atccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggtgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtactcataatgaccatat 22101  T
Q  303 cgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccacta 402  Q
    ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   | ||||||| |    
T  22102 cgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaactttttcacccacca 22201  T
Q  403 actgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    |||| |||||||| |||||||| | |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||||||    
T  22202 actggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaactgatgat 22273  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0114; HSP #3
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 326 - 466
Target Start/End: Original strand, 39307 - 39447
Alignment:
Q  326 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    |||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| ||||| ||||| || ||||||||     
T  39307 catatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatgaagtcatcaatc 39406  T
Q  426 cacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||    
T  39407 ctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaa 39447  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0333 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 1)
Name: scaffold0333
Description:

Target: scaffold0333; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 17607 - 18042
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  17607 cagaaataacatggccaagaaaactcacttctttcaaccagaattcacacttagataatttagcataaagattcttctctttcaacacttgcaaaaccag 17706  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||||||||||||||||||||| ||| |||||||||     |||||  |||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  17707 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtattgaagtaaatca-----tcatcattgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 17801  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||| |||| |||| |||||||||||    
T  17802 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccataccgcgttctaaaagttgtcttctgca 17901  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||||||||||||||| ||||||| |||||||||||||| |||||||||      
T  17902 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgctgaaaacacgt-cacccaccaactgatccatcaagtcatcaattat 18000  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  18001 tggaagtggatacctattctttattgttactttgttcaactg 18042  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010 (Bit Score: 238; Significance: 1e-131; HSPs: 4)
Name: scaffold0010
Description:

Target: scaffold0010; HSP #1
Raw Score: 238; E-Value: 1e-131
Query Start/End: Original strand, 28 - 457
Target Start/End: Original strand, 3867 - 4296
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  3867 cagaaataacattgccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaatacaat 3966  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  3967 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 4066  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || | ||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || | ||||||  |||| ||||| ||||||||||    
T  4067 ttcatgtactccataaacacacctggcgtatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtctataacgtgttctaaaagccgtcttctgca 4166  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||  || || |||||||| ||||| || |||||||||||||| || ||||||||||||||||||||||     
T  4167 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatcttaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccacaaaatgatccatcaaatcatcaattct 4266  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
     ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  4267 tggaagcggatacctattctttatcgttac 4296  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #2
Raw Score: 95; E-Value: 3e-46
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 40686 - 40244
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  40686 cagaaataatgtgacccagaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 40587  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| || || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  40586 tctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 40487  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  40486 ttcatgtactccataaaaacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 40387  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||||||||| || || || |     ||||| || |||||||||||||| || |||||||     
T  40386 tatcctcatccttcacttttatctgatgataaccagacctcaaatcaatcttactaaatatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaattct 40287  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||    
T  40286 aggaagcggatacctgttcttgatcgtaactttgttcaactga 40244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #3
Raw Score: 75; E-Value: 2e-34
Query Start/End: Original strand, 228 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 45580 - 45342
Alignment:
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||  |||||||||    
T  45580 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttttattcttaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgca 45481  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  45480 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 45381  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||| ||||| |||||||| || || || ||||||||    
T  45380 cggaagcggatatctattcttaattgtaactttgttcaa 45342  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0010; HSP #4
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 28 - 155
Target Start/End: Complemental strand, 45752 - 45626
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||||| | |||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  45752 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaattag-catacaacttcttctctttcaaaacttgtaacacaat 45654  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttca 155  Q
    ||||||||| |  ||||| |||||||||    
T  45653 cttcagatgttttgcatgctcttcttca 45626  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026 (Bit Score: 229; Significance: 1e-126; HSPs: 2)
Name: scaffold0026
Description:

Target: scaffold0026; HSP #1
Raw Score: 229; E-Value: 1e-126
Query Start/End: Original strand, 28 - 404
Target Start/End: Original strand, 30898 - 31274
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  30898 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttaacataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 30997  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||||||||||||||||||||| || || ||||| | ||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  30998 cttcaaatgctcagcatgttcttattaagacttggagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccatgaaccgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 31097  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||  |||||||||| |||| ||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  31098 ttcatgcactccataaatactctaggtgcatttgtaacaccgaaaggcataactttatattcatagtggccataccgcgttctgaaagctgtcttctgca 31197  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 404  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||||||||| || |||| ||| || ||||||||||||| |||||||||||||    
T  31198 tatcttcatctttcactttaatctggtgataactcgatctcagatctatcttgctgaaaacacttgcacccactaac 31274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0026; HSP #2
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 50763 - 51183
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  50763 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaat 50862  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| |  |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  50863 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcatagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccaaaaatttatccagataggcatgaaaaattcta 50962  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || || |||||| |||    
T  50963 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcggca 51062  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| || || ||| | |||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  51063 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactaaatacaagagcacccactaactgatccattaaatcttcaattct 51162  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    || ||||||||||||||||||    
T  51163 cgaaagtggatacctattctt 51183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 3)
Name: scaffold0215
Description:

Target: scaffold0215; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 72 - 417
Target Start/End: Complemental strand, 28772 - 28446
Alignment:
Q  72 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 171  Q
    ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28772 tcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 28673  T
Q  172 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 271  Q
    ||||||| ||||| || ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                     
T  28672 aaatatcgtcgataaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggt----------------- 28590  T
Q  272 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 371  Q
      |||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||    
T  28589 --gcataactttgtattcatagtgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaa 28492  T
Q  372 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 417  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||    
T  28491 tcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccattaaat 28446  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #2
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 28930 - 28774
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| || | ||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28930 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccataacttacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 28831  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 178  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28830 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 28774  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0215; HSP #3
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 438 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 28438 - 28406
Alignment:
Q  438 tacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  28438 tacctattcttgatagttactttgttcaactga 28406  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0006 (Bit Score: 228; Significance: 1e-125; HSPs: 1)
Name: scaffold0006
Description:

Target: scaffold0006; HSP #1
Raw Score: 228; E-Value: 1e-125
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 103186 - 103618
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||| ||||||||||| || || ||||| |||||||| ||||||||||||| ||||||||| ||| |    
T  103186 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaatcagaattcacactttgataatttagcataaagcttcttctctttcagcacttgcaaaacagt 103285  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || ||||||||||| |||| |||||||||||||||||||||||||||||| || || ||||| ||||||||||||||||| || ||||||    
T  103286 cttcaaatgttcggcatgttcttcctcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaatactaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatgcga 103385  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||  ||||||||||||| || || ||||| | |||||| |||||||| |||||||| |||||||| ||||||||| |||| ||| |  |||||||||    
T  103386 ttcatgcactccataaacacacctggcgcatttgcaacaccgaaaggcatcactttatactcatagtgtccataacgcgttctaaaatccatcttctgca 103485  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||| |||||        |||||||||     
T  103486 tatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaattgatc--------catcaattct 103577  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  103578 cggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 103618  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0278 (Bit Score: 225; Significance: 1e-124; HSPs: 1)
Name: scaffold0278
Description:

Target: scaffold0278; HSP #1
Raw Score: 225; E-Value: 1e-124
Query Start/End: Original strand, 29 - 457
Target Start/End: Original strand, 405 - 832
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || | |    
T  405 agaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccaaaattcacagttagataacttcgcataaagtttcttctctttcaacacttgcaaaaccagc 504  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| |||||||  |||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||  || || |||||||||||  |||||||||||||||| ||||||||||    
T  505 ttcaaatgctcat-atgttcttcttcagacttagagtaaatcaaaatatcataaataaaaacaactacgaactgatccaaaaatgcatgaaagatgcgat 603  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||||||||||||||| |||||||||||||| |||| ||  |||||||| || ||||| ||||| || |||||  ||||||| |||||||||||||| |     
T  604 tcatatactccataaatactccaggtgcattagtaaaactgaaaggcattaccttatactcataatgtccatactgcattctaaaagctgtcttctggac 703  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || |||| |||||||||||||| |||||||||||||||||| | |||||||| |    
T  704 atcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgcggaaaacacgtgcactcactaactgatccatcaagttatcaattctc 803  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    |||||||||||||||||||| || |||||    
T  804 ggaagtggatacctattctttattgttac 832  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018 (Bit Score: 222; Significance: 1e-122; HSPs: 3)
Name: scaffold0018
Description:

Target: scaffold0018; HSP #1
Raw Score: 222; E-Value: 1e-122
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 11094 - 10653
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  11094 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 10995  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  10994 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 10895  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  10894 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 10795  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||     
T  10794 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaatacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcagttct 10695  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  10694 tggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 10653  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #2
Raw Score: 198; E-Value: 1e-107
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 24651 - 24210
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||| ||||||||||| || |||||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  24651 cagaaataacatggcctagaaaactcacctcattcaaccagaattcacattttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 24552  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||| || || |||||||||||||||| ||||| |||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | | | ||||| || ||||||    
T  24551 cttcaaatgcgcaacaagttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatgtcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcga 24452  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| |  || || || |||||||| |||||||| |||  ||||| |||||| | ||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  24451 ttcatgtactccataaacacacttggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcactgaatatttatagtgtcaataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 24352  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || |||||||||||||||| ||||||||   | ||||| ||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  24351 tatcctcgtcttttactttaatctagtgataacccaatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 24252  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || |||||||| ||||||||    
T  24251 cggaagtggatacctattctttatcgttaccttattcaactg 24210  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0018; HSP #3
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 356
Target Start/End: Complemental strand, 17286 - 16958
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || || |||||||||| |||||| || ||||| || |||||||| |||||||| |||| |||||||||||||||    
T  17286 cagaaataacatggccaagaaaacttacttcattcaaccagagttcacactttgacaacttagcataaagcttcttctccttcagcacttgcaagacaat 17187  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||| ||||||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  17186 cctcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 17087  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||  |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  17086 ttcaagtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 16987  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtga 356  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||    
T  16986 tatcttcatcttttactttaatctggtga 16958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001 (Bit Score: 219; Significance: 1e-120; HSPs: 3)
Name: scaffold0001
Description:

Target: scaffold0001; HSP #1
Raw Score: 219; E-Value: 1e-120
Query Start/End: Original strand, 35 - 469
Target Start/End: Original strand, 494978 - 495412
Alignment:
Q  35 aacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcaga 134  Q
    ||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||| | || |||||||| ||||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||||| |    
T  494978 aacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcagactttgacaatttagcatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatcttcaaa 495077  T
Q  135 tgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatat 234  Q
    | |||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || || |||||||| |    
T  495078 tactcagcatgttcttcttcagacttcgagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacaaaacgatccaaaaacgcatgaaaaatacgattcatgt 495177  T
Q  235 actccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttc 334  Q
    |||| |||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||| |||||||||||||||||    
T  495178 actcaataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagccgtcttctgcatatcttc 495277  T
Q  335 atcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagt 434  Q
    |||||| ||||||||| |||||||||  || ||||||| ||| ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  ||||||    
T  495278 atctttcactttaatcaggtgataaccagatctcaaataaatattgctaaacacacgtgaacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagt 495377  T
Q  435 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  495378 ggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 495412  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #2
Raw Score: 149; E-Value: 2e-78
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 453566 - 453146
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| |||||||| ||||| ||| |||| |  |||||||||||||| ||||| || |||||    
T  453566 cagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttgacatacaacttcttctctttcaatacttgtaatacaat 453467  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  453466 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttcaaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcgg 453367  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| ||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||||||||||||||| ||||| ||  |  | || || ||||||||||    
T  453366 ttcatatattccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttatattcatagtgtccatatcgtgtcttaaaggccgtcttctgca 453267  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||||||||| ||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |     
T  453266 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttgctgaatacactagcacccactaactgatccattaaatcatcgatcct 453167  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  453166 cggaagtggatacctattctt 453146  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0001; HSP #3
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 515706 - 515264
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   ||||||||||||||||||||||||||||    
T  515706 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttctctttcaacacttgcaagacaat 515607  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| || ||||| |||||| ||||||| ||||| || |||||||| || |||||||| || ||   ||||| ||| |||||||| || ||     
T  515606 tctcagatgctctgcgtgttcctcttcattcttggaataaattaagatatcatcaataaacacaacgacaaacttatccagaaaagcatggaaaattcgg 515507  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| || ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  515506 ttcatgtactccataaatacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtaatcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 515407  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| ||||||||||     
T  515406 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaattct 515307  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||||    
T  515306 aggaagcggatacctattctttatcgtaaccttgttcaactga 515264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040 (Bit Score: 214; Significance: 1e-117; HSPs: 2)
Name: scaffold0040
Description:

Target: scaffold0040; HSP #1
Raw Score: 214; E-Value: 1e-117
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 16830 - 17270
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||| ||||| || |||||| |||||||| ||||||| ||| || |||||||||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16830 cagaaataacattgccaaaaacactcacctctttcaatcagaattgacactttgacaatttggcatataacttcttctctttcaacacttgcaaaacaat 16929  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  16930 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 17029  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |||||||||||||| ||||| || |||  ||||||||| || ||||||||  |||| |||| |||||||||||    
T  17030 ttcatgtactccataaacacacctggcgcattggtaacaccgaaagg-atcactgaatattcataatgtccataacgtgttctaaaagttgtcttctgca 17128  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||| ||| || || || ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||     
T  17129 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaattaatcttactaaacacacgtgcacccactaattgatccatcaaatcatcaattct 17228  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| || ||||||||    
T  17229 tggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaactg 17270  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0040; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 28 - 94
Target Start/End: Complemental strand, 111841 - 111775
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata 94  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||    
T  111841 cagaaataatatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcata 111775  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270 (Bit Score: 212; Significance: 1e-116; HSPs: 2)
Name: scaffold0270
Description:

Target: scaffold0270; HSP #1
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Original strand, 5825 - 6264
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  5825 agaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatc 5924  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  || ||||    
T  5925 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgat 6024  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  6025 tcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcat 6124  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||      
T  6125 atcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattctt 6224  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  6225 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 6264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0270; HSP #2
Raw Score: 212; E-Value: 1e-116
Query Start/End: Original strand, 29 - 468
Target Start/End: Original strand, 12955 - 13394
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||||| ||| ||  ||| ||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||    
T  12955 agaaataacgtggccaagaaaacttacctctttcaaccagaatttacactttaacagtttagcatatagcttcttctctttcaacacttgtaaaacaatc 13054  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||| ||||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| || |  || ||||    
T  13055 ttcaaatgctcagcatgttcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcatcgatgaacacaaccacgaagcgatcaaaaaatgcttgaataatacgat 13154  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || ||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||  |||||||||||    
T  13155 tcatgtattccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaagacatcactttatattcataatgtccataacgcattctaaaagtcgtcttctgcat 13254  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| | |||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || |||||||||| |||||||||||||| ||| ||||||||||      
T  13255 atcctgatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcactcactaactgatccaacaagtcatcaattctt 13354  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  13355 ggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 13394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0540 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 1)
Name: scaffold0540
Description:

Target: scaffold0540; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 32 - 360
Target Start/End: Complemental strand, 6680 - 6352
Alignment:
Q  32 aataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttc 131  Q
    ||||||||| |||||||| | ||| ||||||||||||||||| || ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || | ||||    
T  6680 aataacatgtccaagaaagcacacttctttcaaccagaattcgcacttagacaatttcgcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccagcttc 6581  T
Q  132 agatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattca 231  Q
    | ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||| || ||||| ||||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||    
T  6580 aaatgctcagcatgttcttcttcagacttggagtaaatcaaaatatcatcgataaaaacaaccacgaaccgatccaaaaacgcatgaaagatgcgattca 6481  T
Q  232 tatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatc 331  Q
    | ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||| |||||| || |||||||||||||| ||| ||||||||| |||||||||||||||    
T  6480 tgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcaaaactttgtactcatagtgaccataccgcgttctgaaagttgtcttctgcatatc 6381  T
Q  332 ttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||||    
T  6380 ttcatctttcactttaatctggtgataac 6352  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074 (Bit Score: 209; Significance: 1e-114; HSPs: 2)
Name: scaffold0074
Description:

Target: scaffold0074; HSP #1
Raw Score: 209; E-Value: 1e-114
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Original strand, 5065 - 5504
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || ||||||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  5065 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcattcaaccagaactcacactttgacaactttgcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 5164  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| || ||||||||||| || || ||||||||| | ||||| || || |||    
T  5165 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcaatgaacacaaccacaaagcgatccaaatacgcatgaaaaatacga 5264  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||| ||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  |||||||||  | ||||||||  |||| || || ||||||||||    
T  5265 ttcatgtact-catgaacacacctggcgcattcgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataaagcccataacgtgttctaaaggccgtcttctgca 5363  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||   | ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||      
T  5364 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacccaatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccaacaaatcatcaattat 5463  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| ||||||||||    
T  5464 aggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaact 5504  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0074; HSP #2
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 126 - 440
Target Start/End: Original strand, 11172 - 11486
Alignment:
Q  126 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc 225  Q
    ||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || |    
T  11172 atcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaagaagcatggaaaattc 11271  T
Q  226 gattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctg 325  Q
    | |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||    
T  11272 ggttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctg 11371  T
Q  326 catatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaatt 425  Q
    |||||| | ||| || || |||||| | || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| ||||||||     
T  11372 catatcctaatccttcaccttaatcagatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatc 11471  T
Q  426 cacggaagtggatac 440  Q
    | |||||||||||||    
T  11472 ctcggaagtggatac 11486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0293 (Bit Score: 207; Significance: 1e-113; HSPs: 1)
Name: scaffold0293
Description:

Target: scaffold0293; HSP #1
Raw Score: 207; E-Value: 1e-113
Query Start/End: Original strand, 30 - 448
Target Start/End: Original strand, 14423 - 14841
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||||||||| ||||| || |||||||| | ||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||||    
T  14423 gaaataacatggccaagaaaactaacctcattcaaccagaactcacactttgacaatttagaatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaatct 14522  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||| |||||||||||| |||||||| | ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||| ||||| || || |||||    
T  14523 tcaaatgctcagcatgctcttcttcggacttcgagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatccaaaaacgcatgaaaaattcgatt 14622  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    ||| || ||||||||||| |||||||| || |||||| | |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| ||||  ||||||||||||    
T  14623 catgtattccataaacacaccaggtgcctttgtaacatcgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaagtcgtcttctgcata 14722  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||||||||||| ||||||||| ||||||||| ||| |||||||  || ||||| || ||||||| ||||||||||||||||||||| ||||||||||  |    
T  14723 tcttcatctttcactttaatcgggtgataacctgatctcaaattgatgttgctaaacacacgtgtacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttg 14822  T
Q  430 gaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||    
T  14823 gaagtggatacctattctt 14841  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0342 (Bit Score: 204; Significance: 1e-111; HSPs: 1)
Name: scaffold0342
Description:

Target: scaffold0342; HSP #1
Raw Score: 204; E-Value: 1e-111
Query Start/End: Original strand, 28 - 467
Target Start/End: Complemental strand, 15574 - 15135
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||| |||||||||| || |||||||| ||||| |  || |||||||| | ||||||||| |||||    
T  15574 cagaaattacatggccaagaaaactcacctctttcaactagaattcacactttgacaatttagcatataactttttctcttttagcacttgcaaaacaat 15475  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||| ||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||  ||||| ||||||||||||||||| || || |||    
T  15474 cttcaaatgctcagcttgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaatcacgaaacgatccaaaaatgcatgaaaaatacga 15375  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| ||||||||||| |  || || ||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||| || | |||||   |||| ||||| ||||||||||    
T  15374 ttcatgtactccataaagatacctggcgcatttgtaacaccgaaaggaatcactttatattcataatgtctataacaagttctaaaagccgtcttctgca 15275  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | |||||||  || |||||| |||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  15274 tatcttcatctttcactttaatccgatgataacccgatctcaaagcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 15175  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaac 467  Q
     ||||||| |||||||||||| || ||||| || ||||||    
T  15174 tggaagtgtatacctattctttattgttactttcttcaac 15135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0413 (Bit Score: 199; Significance: 1e-108; HSPs: 1)
Name: scaffold0413
Description:

Target: scaffold0413; HSP #1
Raw Score: 199; E-Value: 1e-108
Query Start/End: Original strand, 99 - 469
Target Start/End: Original strand, 2623 - 2993
Alignment:
Q  99 ttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacga 198  Q
    |||||||| || ||||||||||| || | ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| || || ||||| ||||    
T  2623 ttcttctcctttaacacttgcaaaaccagcttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgcagtaaatcaaaatatcatcaataaaaacaaccacga 2722  T
Q  199 atcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgacc 298  Q
    |  ||| |||||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||| ||||||||| |||||||  || ||||| ||||| ||||||||||| ||    
T  2723 aatgattcaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaacactcgaggtgcatttgtaacactgaacggcatcactttttattcatagtgtcc 2822  T
Q  299 ataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcaccc 398  Q
    ||| ||| |||| |||| ||||||||| |||||||||||||| |||||||||||||||||||  || |||||||| || ||| |||||||||||||| ||    
T  2823 atatcgcgttctaaaaggtgtcttctggatatcttcatctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatctatcttgatgaaaacacgtgcatcc 2922  T
Q  399 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||| || ||||| |||||||||||    
T  2923 actaactgatccatcaagtcatcaattcatggaagtggatacctattctttatcgttactttgttcaactg 2993  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0012 (Bit Score: 195; Significance: 1e-106; HSPs: 1)
Name: scaffold0012
Description:

Target: scaffold0012; HSP #1
Raw Score: 195; E-Value: 1e-106
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 217773 - 217335
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||| ||||||||||||||||| || |||||| |||| ||||| || ||||||||  |||| || ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  217773 cagaaataacgtggccaagaaaactcacctcattcaactagaactcacactttgacaatttaacatatagcttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 217674  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||||   ||| ||||| |||||||||||||| |||| |||||| ||||| ||||| ||||| ||||| || ||  ||    
T  217673 cttcaaatgctcaacatgttcttcttcgaacttcgagtatatcaaaatatcatcaatgatcacaaccacgaaacgatcaaaaaacgcatgaaaaatatga 217574  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||||||  |||| || |  ||||||||||    
T  217573 ttcatgtactccataaacacacctggggcatttgtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgtccataacgtgttctaaaggacgtcttctgca 217474  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || ||||| |||||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||  || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||     
T  217473 tatcctcgtctttcactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgcaaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattct 217374  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     |||||||||||||||||||| || || || ||||||||    
T  217373 tggaagtggatacctattctttatcgtcactttgttcaa 217335  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1985 (Bit Score: 193; Significance: 1e-105; HSPs: 1)
Name: scaffold1985
Description:

Target: scaffold1985; HSP #1
Raw Score: 193; E-Value: 1e-105
Query Start/End: Original strand, 22 - 314
Target Start/End: Complemental strand, 699 - 407
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || ||||||| |||||| ||||| || || ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  699 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacttctttcagccagaactcacactttgataatttagcataaagtttcttctcttttaacacttgcag 600  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||| ||||||||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||    
T  599 gacaatcttcaaatgctcagcatgttcttctttagtcttggagtcaatcaaattatcatcgatgaacacaactaagaaccgatccaaaaatgcatggaag 500  T
Q  222 atgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaa 314  Q
    ||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||| |||||||||||| ||  ||||||||    
T  499 atgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcattcgtaacaccgaaaggcataactttatattaatagtgaccataccgtgttctgaaa 407  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0181 (Bit Score: 192; Significance: 1e-104; HSPs: 1)
Name: scaffold0181
Description:

Target: scaffold0181; HSP #1
Raw Score: 192; E-Value: 1e-104
Query Start/End: Original strand, 201 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 30095 - 29828
Alignment:
Q  201 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 300  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||  |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  30095 cgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataattactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccat 29996  T
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 400  Q
    | ||  || ||||||||||||||| ||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || ||||||||||| |||||||||||  ||||||||||    
T  29995 atcgggttttgaaagctgtcttctacatgtcttcatcttttactttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctgaaaacttgtgcacccac 29896  T
Q  401 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| | || ||||||||||    
T  29895 tatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatactaactttgttcaact 29828  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0393 (Bit Score: 183; Significance: 9e-99; HSPs: 1)
Name: scaffold0393
Description:

Target: scaffold0393; HSP #1
Raw Score: 183; E-Value: 9e-99
Query Start/End: Original strand, 248 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16128 - 15906
Alignment:
Q  248 tccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttt-acttt 346  Q
    ||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||| |||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||    
T  16128 tccaggtgcattggtaacaccaaaacgcataaccttatattcataatgaccataacgcgttctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctttttacttt 16029  T
Q  347 aatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattc 446  Q
    |||||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||    
T  16028 aatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattc 15929  T
Q  447 ttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||||||||||||||||||||    
T  15928 ttgatagttaccttgttcaactg 15906  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0331 (Bit Score: 182; Significance: 3e-98; HSPs: 1)
Name: scaffold0331
Description:

Target: scaffold0331; HSP #1
Raw Score: 182; E-Value: 3e-98
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 16330 - 15890
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||| || |||||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  |||||||| || ||||||||||| | |||    
T  16330 cagaaataacacggtcaagaaaacttacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctccttgaacacttgcaaaa-aat 16232  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||| ||| ||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||||| | | | ||||| || ||||||    
T  16231 cttcaaatgctcagcatattcctcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcgatgaatataaccacgaaacgatctagatacgcatgaaaaatgcga 16132  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||| ||||||||| || || || || |||||||| |||||||| |||  ||| ||||| || ||||||||  |||| |||||  |||||||||    
T  16131 ttcatgtactacataaacacacctggcgcgtttgtaacacccaaaggcatcactgaatactcataatgtccataacgttttctaaaagccatcttctgca 16032  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || ||||||||||||||||||||||||| ||| ||||||||||| |||||||| ||| ||||||||||||||| ||||||||||||||||||||     
T  16031 tatcctcgtcttttactttaatctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaacacatgtgcacccactaactaatccatcaaatcatcaattct 15932  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  15931 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 15890  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083 (Bit Score: 178; Significance: 8e-96; HSPs: 3)
Name: scaffold0083
Description:

Target: scaffold0083; HSP #1
Raw Score: 178; E-Value: 8e-96
Query Start/End: Original strand, 28 - 457
Target Start/End: Complemental strand, 9387 - 8958
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| || | ||||||||||||||| || ||||  |||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  9387 cagaaataacatggccaagaaaactcacctcatccaaccagaattcacactttgacagcttggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 9288  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||| ||||||| ||||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  9287 cctcaaatgctcaacatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatccatgaacacaaccacgaaacgatctaaatacgcatgaaaaatacga 9188  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||||||| |||  ||||||||| || ||||||||  | || ||||| ||||||| ||    
T  9187 ttcatgtactccataaacacacctggcgcatttgtaacaccgaaaggcatcactgaatattcataatgtccataacgtgtcctaaaagccgtcttctcca 9088  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||  | ||||| || ||||||||||||||||  || ||||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |     
T  9087 tatccccgtctttcaccttaatctggtgataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatcct 8988  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
     |||||||||||||||||||| || |||||    
T  8987 tggaagtggatacctattctttatcgttac 8958  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #2
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 457
Target Start/End: Original strand, 1324 - 1414
Alignment:
Q  367 tcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  1324 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttac 1414  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0083; HSP #3
Raw Score: 51; E-Value: 5e-20
Query Start/End: Original strand, 367 - 457
Target Start/End: Original strand, 6628 - 6718
Alignment:
Q  367 tcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttac 457  Q
    |||||||||| ||||| || || |||||||||||||||||||||||||||||||| || |  |||||||||||||||||||| || |||||    
T  6628 tcaaatcaatcttgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccatcaaatcatctatccttggaagtggatacctattctttatcgttac 6718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0509 (Bit Score: 171; Significance: 1e-91; HSPs: 1)
Name: scaffold0509
Description:

Target: scaffold0509; HSP #1
Raw Score: 171; E-Value: 1e-91
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 10781 - 11223
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  10781 cagaaatgatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaat 10880  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||| | |||||| | ||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || ||||||||||| ||| |||||||| | |||||||| || | |    
T  10881 ctttaaatgctctgtatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaactacaaattgatccaaataagcatggaaaattcta 10980  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| ||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||||||||| || || || ||  |  | || || || |||||||    
T  10981 ttcatgtactccataaacacaccaggcgcattggtaacaccgaaaggcatcactttatattcataatgcccgtatcgtgtcttaaaggccgttttctgca 11080  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||  ||||| ||||||||||| || ||||  |||||||| ||||| ||| |||| || ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  11081 tatctttttctttcactttaatctgatggtaacccgacctcaagtcaatcttgttgaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattct 11180  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  11181 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactga 11223  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004 (Bit Score: 167; Significance: 3e-89; HSPs: 2)
Name: scaffold0004
Description:

Target: scaffold0004; HSP #1
Raw Score: 167; E-Value: 3e-89
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 201821 - 201379
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||| ||| |||||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||     
T  201821 cagaaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggaccatttggcatacagcttcttttccttcaacacttgcaacacaac 201722  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || |||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||| || |||||||| || || ||||||||| | |||||||| || | |    
T  201721 cttcaaatgttctgcatgttcttcttcagtcttagagtatatcaaaatatcatcaataaacacaaccacaaaccgatccaaataagcatggaaaattcta 201622  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || |  || |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||| ||  | || || || || |||||||    
T  201621 ttcatgtactccataaacacacccggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgca 201522  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    ||||||||||||||||||||||||| || ||||  |||||||||||||| ||||| || || |||| |||||||||||||||||| |||||||||||||     
T  201521 tatcttcatcttttactttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaatcttgctaaacactcgtgtacccactaactgatccattaaatcatcaattct 201422  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||||||| || || || || || |||||||||    
T  201421 cggaagtggatacctattttttatcgtcactttattcaactga 201379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0004; HSP #2
Raw Score: 105; E-Value: 3e-52
Query Start/End: Original strand, 28 - 440
Target Start/End: Original strand, 324657 - 325069
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||||||||| || ||| | || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  324657 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacacttcgacgacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaatacaat 324756  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| ||  |||| |||||||||||| | || || |||| ||| ||||| || || ||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  324757 cttcagatgttctacatgctcttcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaatacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcgg 324856  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  324857 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 324956  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || |||||||| || |||| |||||| || ||||| || || |||||    ||||||||||||||||||||||| || ||||| |     
T  324957 tatcttcatccttcaccttaatctgatggtaacctgaccttaagtcaatcttactaaaaaccttcgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcct 325056  T
Q  428 cggaagtggatac 440  Q
    |||||||||||||    
T  325057 cggaagtggatac 325069  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149 (Bit Score: 166; Significance: 1e-88; HSPs: 3)
Name: scaffold0149
Description:

Target: scaffold0149; HSP #1
Raw Score: 166; E-Value: 1e-88
Query Start/End: Original strand, 249 - 466
Target Start/End: Original strand, 1 - 218
Alignment:
Q  249 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 348  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| ||  |||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  1 ccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatatacatagtgaccataccgtgttctgaaatctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaa 100  T
Q  349 tctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||| ||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||    
T  101 tctggtgataacctgatctcaaatcaatcttgctgaaaacgcgtgcacccacaaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctt 200  T
Q  449 gatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||| || ||||||||    
T  201 gatagtcacattgttcaa 218  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #2
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5692 - 5262
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  5692 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 5593  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  5592 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 5493  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  5492 cataaacac-gcagtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 5394  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  5393 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 5294  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  5293 acctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 5262  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0149; HSP #3
Raw Score: 164; E-Value: 2e-87
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10123 - 9693
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| |    
T  10123 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgtt 10024  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  10023 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 9924  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    |||||||||  |||  ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||||||||||||||| ||  | || || || |||||||||||||| |||||     
T  9923 cataaacac-gcagtcgcattagtaacaccgaaatgcatcaccttatattcatagtgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 9825  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | |||||||||||    
T  9824 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaatacacgagcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggat 9725  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || |||||||||||||||    
T  9724 acctgttctttatcgtaaccttgttcaactga 9693  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0379 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 1)
Name: scaffold0379
Description:

Target: scaffold0379; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 28 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 6242 - 5804
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  6242 cagaaataacatgaccaagaaaaatgacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttagcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 6143  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||  |||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||| | | |||||||||| || |||    
T  6142 cttcaattgctcagcatgttcttcttcagccttagagtatatcaaaatatcgtcgatgaacacaaccacgaaacgatctagatatgcatggaaaatacga 6043  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || || ||||  ||  |||| ||||| ||||| ||||    
T  6042 ttcatgtactccataaacacacctggcgcgtttgtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcctaatgtccatgtcgtgttctaaaagccgtcttttgca 5943  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||  || || || |||||||||||||||||||  || ||||| ||||| ||||| || |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||     
T  5942 tattgtcgtccttcactttaatctggtgataacccgatctcaagtcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactggtccatcaagtcgtcaattct 5843  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
     |||||||||||||||||||| || ||||| || |||||    
T  5842 tggaagtggatacctattctttatcgttactttattcaa 5804  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067 (Bit Score: 163; Significance: 8e-87; HSPs: 4)
Name: scaffold0067
Description:

Target: scaffold0067; HSP #1
Raw Score: 163; E-Value: 8e-87
Query Start/End: Original strand, 63 - 469
Target Start/End: Original strand, 28610 - 29016
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||| | |  ||||| ||||||||||||| |||||| ||||||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  28610 aaccagaactcacattttgacaacttcgcagacaacttcttttctttcaacactttcaagacgatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttag 28709  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||||||| ||| ||||| ||||| ||    
T  28710 aataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactccataagcacaccaggcgcattagt 28809  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |    
T  28810 aacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacct 28909  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||||||||||||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||| | |||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  28910 gacctcaaatcaattttgttgaatacacgagcacccactaactgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 29009  T
Q  463 tcaactg 469  Q
    |||||||    
T  29010 tcaactg 29016  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #2
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50459 - 50113
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  50459 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 50360  T
Q  202 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  50359 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 50260  T
Q  302 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 401  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  50259 tcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 50160  T
Q  402 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  50159 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 50113  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #3
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 59493 - 59147
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  59493 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 59394  T
Q  202 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  59393 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 59294  T
Q  302 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 401  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  59293 tcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 59194  T
Q  402 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  59193 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 59147  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0067; HSP #4
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 102 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 65881 - 65535
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 201  Q
    |||||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| ||||| ||||| ||||||     
T  65881 ttctctttcaacacttgcaacacaatcttcagatgttccgcatgctcttcttccgtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatacaaccacgaatt 65782  T
Q  202 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
     ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || |  || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || |||||    
T  65781 tatccaaaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccgggcgtgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgtccata 65682  T
Q  302 acgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccact 401  Q
     ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||| |||     
T  65681 tcgtgtcctaaatgccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcactcacc 65582  T
Q  402 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||||||||| |||||    
T  65581 aactggtccatcaagtcatcaatcctcggtagtggatacctgttctt 65535  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130 (Bit Score: 162; Significance: 3e-86; HSPs: 3)
Name: scaffold0130
Description:

Target: scaffold0130; HSP #1
Raw Score: 162; E-Value: 3e-86
Query Start/End: Original strand, 28 - 229
Target Start/End: Complemental strand, 44996 - 44795
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  44996 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccagaagtcacacttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacatttgcaagacaat 44897  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||| ||  |||||||||| |||||||||||||||||||||||||||    
T  44896 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtatatcaaaatatcttcgattaattcaactacgaaccgatccaaaaatgcatggaagatgcga 44797  T
Q  228 tt 229  Q
    ||    
T  44796 tt 44795  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #2
Raw Score: 82; E-Value: 2e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 9161 - 8888
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| ||| ||    ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| | |||    
T  9161 cagaaataatatggcgaagaaaacacacttcacataaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacataat 9062  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || |||||||| || ||||| || || |||  ||||| | | |||||||| ||        
T  9061 tttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaataaagatatcatcaataaacacgaccacaaatttatccagataagcatggaaaattaag 8962  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
    ||||| |||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| || |||||    
T  8961 ttcatgtacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgtccata 8888  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0130; HSP #3
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 315 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 4955 - 4822
Alignment:
Q  315 gctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatca 414  Q
    ||||| ||||||||||||||||| || || |||||| | || |||| | ||||||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |    
T  4955 gctgttttctgcatatcttcatccttcaccttaatcagatggtaacctaacctcaaataaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatta 4856  T
Q  415 aatcatcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||| | |||||||||| ||||||||    
T  4855 aatcatcaattctcagaagtggatatctattctt 4822  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0865 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0865
Description:

Target: scaffold0865; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2614 - 2183
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  2614 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgct 2515  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  2514 ctgcatgctcttcttcattcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactc 2415  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||| |||||     
T  2414 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatcc 2315  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  2314 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggat 2215  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||    
T  2214 acctgttctttatcgtaactttattcaactga 2183  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0133 (Bit Score: 160; Significance: 5e-85; HSPs: 1)
Name: scaffold0133
Description:

Target: scaffold0133; HSP #1
Raw Score: 160; E-Value: 5e-85
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 29627 - 29196
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||||||||| |||||||| |  ||| | ||||| ||||||||||| | ||||||||||||||    
T  29627 tggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttagacaacttggcatacaacttcctttctttaaacacttgcaacaaaatcttcagatgct 29528  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| ||||||||| |||| || ||||| | ||||||||| || |||||||| || |||  ||||||| | |||||||| || || |||||||||||    
T  29527 ctgcatgctcttcttcattcttagaataaattagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaaataagcatggaaaattcggttcatatactc 29428  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||| |||||     
T  29427 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcattactttatattcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatatcctcatcc 29328  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| ||||||||||||||||||| |||| ||||  |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||||||||||    
T  29327 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgttgaatacacaagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcggaagtggat 29228  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || || || |||||||||    
T  29227 acctgttctttatcgtaactttattcaactga 29196  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0523 (Bit Score: 159; Significance: 2e-84; HSPs: 1)
Name: scaffold0523
Description:

Target: scaffold0523; HSP #1
Raw Score: 159; E-Value: 2e-84
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 1822 - 2264
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||| |||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||    
T  1822 cagaaataatatggtcaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttattttctttcaacacttgcaatacaat 1921  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || | |  ||||| | | |||||||| || |      
T  1922 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaattttatccagataagcatggaaaattctg 2021  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| ||| |||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  2022 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtagcaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 2121  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  2122 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaaatcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattct 2221  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || |||||||||    
T  2222 cggaagtggatacctattctttatcgtcactttattcaactga 2264  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122 (Bit Score: 156; Significance: 1e-82; HSPs: 2)
Name: scaffold0122
Description:

Target: scaffold0122; HSP #1
Raw Score: 156; E-Value: 1e-82
Query Start/End: Original strand, 28 - 259
Target Start/End: Complemental strand, 38301 - 38070
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| || |     
T  38301 cagaaataacatgtccaagaaagctcacttctttcaaccagaattcacacttagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaaccag 38202  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| |||| ||||||||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||||||||    
T  38201 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttgtagtaaatcaaaatatcatcaatgaaaacaaccacgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcga 38102  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcatt 259  Q
    ||||| ||||||||||| ||||||||||||||    
T  38101 ttcatgtactccataaatactccaggtgcatt 38070  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0122; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 404 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 41482 - 41417
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||||| || || ||||||||||||||    
T  41482 ctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattctttatggtcaccttgttcaactg 41417  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0108 (Bit Score: 155; Significance: 4e-82; HSPs: 1)
Name: scaffold0108
Description:

Target: scaffold0108; HSP #1
Raw Score: 155; E-Value: 4e-82
Query Start/End: Original strand, 38 - 448
Target Start/End: Original strand, 49067 - 49477
Alignment:
Q  38 atggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 137  Q
    ||||||||||||||| || |   | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  49067 atggccaagaaaacttacttgacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgt 49166  T
Q  138 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 237  Q
    || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||    ||||||||||    
T  49167 tctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattttgttcatatact 49266  T
Q  238 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatc 337  Q
    |||||||||| ||||| ||||| ||||| || |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || |||||||||||||| |||||    
T  49267 ccataaacacaccaggcgcattagtaacgccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatc 49366  T
Q  338 ttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtgga 437  Q
     || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||| |||| || | | ||||||||    
T  49367 cttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaatacacgagcacccactaactgatccattaaaccatcgatcctcagaagtgga 49466  T
Q  438 tacctattctt 448  Q
    |||||| ||||    
T  49467 tacctaatctt 49477  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0244 (Bit Score: 153; Significance: 7e-81; HSPs: 1)
Name: scaffold0244
Description:

Target: scaffold0244; HSP #1
Raw Score: 153; E-Value: 7e-81
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Original strand, 19305 - 19725
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||    
T  19305 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttatctttcaacacttgcaatacaat 19404  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||| || || ||||| || |||| ||| || |||  ||| | | | |||||||| ||        
T  19405 cttcagatgctctgcatgctcctcttcggtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacataaccacaaatttatctagataagcatggaaaattttg 19504  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    || ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  19505 tttatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 19604  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| |||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| | ||||||||| |     
T  19605 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcacccactaattgatccattagatcatcaatcct 19704  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  19705 cggaagtggatacctattctt 19725  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104 (Bit Score: 151; Significance: 1e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0104
Description:

Target: scaffold0104; HSP #1
Raw Score: 151; E-Value: 1e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 24167 - 24609
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| ||||| || |||||||| |||||    
T  24167 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttcttttaatacttgcaacacaat 24266  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  24267 cttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagagaagcatggaaaattcgg 24366  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||||||    
T  24367 ttcatatactccataaacaccccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 24466  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || ||||||||||| |||||||||||||| ||||| || ||||| || | ||||||||||||||||||||| || ||||||||||     
T  24467 tatcgtcatccttcaccttaatctggtggtaacttgacctcaagtcaatcttactgaacacccttgcacccactaactgatccattaagtcatcaattct 24566  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||| ||||||    
T  24567 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgtttaactga 24609  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0104; HSP #2
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 40 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 44758 - 44350
Alignment:
Q  40 ggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctc 139  Q
    ||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  || || |||||||| |||||||| |||||||||||||| |     
T  44758 ggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttattttctttcaatacttgcaatacaatcttcagatgttt 44659  T
Q  140 agcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactcc 239  Q
     | ||| ||||||| |||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | |||||||||| ||    ||||||||||||    
T  44658 tgtatgctcttctttagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagatatgcatggaaaatttttttcatatactcc 44559  T
Q  240 ataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatctt 339  Q
    |||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || ||||||| |||||| ||||| |    
T  44558 ataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctccatatcctcatcct 44459  T
Q  340 ttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggata 439  Q
    | || |||||||| || ||||  ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||||||||||||||||||||| ||||||| ||||||||||||    
T  44458 tcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaattttactgaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcgtcaattctcggaagtggata 44359  T
Q  440 cctattctt 448  Q
    ||| |||||    
T  44358 cctgttctt 44350  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035 (Bit Score: 150; Significance: 4e-79; HSPs: 2)
Name: scaffold0035
Description:

Target: scaffold0035; HSP #1
Raw Score: 150; E-Value: 4e-79
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Original strand, 4702 - 5143
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||| || |||||    
T  4702 cagaaataatgtggccaagaaaactgacttcacttaaccagaactcacaattcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttgtaatacaat 4801  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || |||||||||||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  4802 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatgtcatcaataaacacaactacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 4901  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||||| |||||||||    || || || |||||| |||    
T  4902 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtaaccataacgtgacctaaaggccgtcttcggca 5001  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| |||||||| ||||| |||||||     
T  5002 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaacacacgtgcacccactaattgatccattaaatcgtcaattct 5101  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| ||||||||    
T  5102 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactg 5143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0035; HSP #2
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 42458 - 42019
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || ||  ||||||| |  |||||||| |||| ||||||||| ||||       
T  42458 gaaataatatgaccaagaaaactcacttcgttcaaccagaattcgcacttcgataaactggcatataacttcttctccttcagcacttgcaaaacaaatc 42359  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||| |||||| |||||||| || || ||||||||||| |||| ||||||||| || |||||||  || |||||||||||| | ||||| || ||  ||||    
T  42358 tcaaatgctcggcatgttcctcctcggtcttggagtatatcagaatatcatctataaacacaaaaacaaatcgatccaaataagcatgaaaaatatgatt 42259  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||| ||||||||||||||  | || || |||||||| |||||||| ||   |||||| || ||  | ||| |  | || || || |||||||| |||    
T  42258 catatattccataaacactccttgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatattcgtaatgttcgtaatgtgtcctaaaggccgtcttctgaata 42159  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    ||  ||||||| ||||| ||||||||||| | ||| || || ||||| ||   ||| |||  ||||||||||||||||||||||||||| || || | |     
T  42158 tccccatctttcactttgatctggtgatagcctgatcttaagtcaatcttaaagaacacaaatgcacccactaactgatccatcaaatcgtcgatcctca 42059  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||| || || || |||||||||||    
T  42058 gaagtggatacctattctttattgtcactttgttcaactg 42019  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266 (Bit Score: 146; Significance: 1e-76; HSPs: 2)
Name: scaffold0266
Description:

Target: scaffold0266; HSP #1
Raw Score: 146; E-Value: 1e-76
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Original strand, 16068 - 16485
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |   |||| || |||||||||||||| ||||||||    
T  16068 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaatctt 16167  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    ||||||||| ||||| |||||||||||| | || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |  |||    
T  16168 cagatgctctgcatgctcttcttcagtcgtagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattccgttc 16267  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||||||||||||||||||  | || || || |||||||||| ||    
T  16268 atatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcaaat 16367  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    | ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||| |||||| || || ||||  |||||||||||||||||||| ||||| ||||||| |||    
T  16368 cctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaataaattttactaaacacacaagcacccactaactgatccattaaatcgtcaattctcgg 16467  T
Q  431 aagtggatacctattctt 448  Q
    || ||||||||| |||||    
T  16468 aactggatacctgttctt 16485  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0266; HSP #2
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 29 - 474
Target Start/End: Complemental strand, 8213 - 7768
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| ||  |||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  8213 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaacacacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 8114  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||||||||||| |||| ||||| || | ||| || || |  ||||||||||| || ||||| || |  || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  8113 ctcagatgctcaacatgctcttcctccgacttcgaatacactaaaatatcatctataaacaccaccaaaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 8014  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  8013 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 7914  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    |||||   | |||||| ||||||| ||||| | ||||||||||||||| || || || ||   |||||| || |  |||||||||||||||||||| |      
T  7913 atctttcgcctttactctaatctgatgatatcctgacctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagttgatccatcaaatcatcaatccgt 7814  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactgatgat 474  Q
    ||||||||||| | |||||| || || |||||||||||||| ||||    
T  7813 ggaagtggatatcgattcttaatcgtcaccttgttcaactgttgat 7768  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0297 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0297
Description:

Target: scaffold0297; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 22 - 230
Target Start/End: Complemental strand, 8052 - 7844
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| |||||||||||||| |||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  8052 catcaccagaaataacatgggcaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 7953  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaag 221  Q
    ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||  || ||||| ||||| ||||||||||||||||| |||    
T  7952 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcgtcgacaaaaacaaccacgaaccgatccaaaaatgcatgaaag 7853  T
Q  222 atgcgattc 230  Q
    |||||||||    
T  7852 atgcgattc 7844  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0049 (Bit Score: 145; Significance: 4e-76; HSPs: 1)
Name: scaffold0049
Description:

Target: scaffold0049; HSP #1
Raw Score: 145; E-Value: 4e-76
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 50228 - 49808
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||| ||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||||||||| || |||||    
T  50228 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaacaagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgaaacacaat 50129  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  50128 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcgg 50029  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||| | |||||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || |  || |||||||    
T  50028 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacatcgaaaggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaagggcgtattctgca 49929  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||  || |||| ||||||||||||||| |||| ||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||| |||||||     
T  49928 tatcctcatcattcaccttaatctaatggtaacctgacctcaaatcaatcttgcagaacacacgagcacccactaactgatccatgaaatcgtcaattct 49829  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    || |||| ||||||| |||||    
T  49828 cgaaagtagatacctgttctt 49808  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0751 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0751
Description:

Target: scaffold0751; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 38 - 448
Target Start/End: Original strand, 4139 - 4552
Alignment:
Q  38 atggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgc 137  Q
    |||||| |||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||     
T  4139 atggcccagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgt 4238  T
Q  138 tcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatact 237  Q
    |  ||||| ||||||||||||||  | |||||||| || | ||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || ||||||||||    
T  4239 tatgcatgctcttcttcagtcttataataaatcaagatgtgatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggttcatatact 4338  T
Q  238 ccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataac---tttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttc 334  Q
    |||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||    ||||||||||| |||||||||||  | || || || |||||||||||||| ||    
T  4339 ccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttattatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctc 4438  T
Q  335 atcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagt 434  Q
    ||| || ||||||||||| || ||||  ||||||||||||||||| || || ||| |||||||||| ||||||||||| ||||| ||||||| |||||||    
T  4439 atccttcactttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaattttactaaacacaggtgcacccacaaactgatccattaaatcgtcaattctcggaagt 4538  T
Q  435 ggatacctattctt 448  Q
    |||||||| |||||    
T  4539 ggatacctgttctt 4552  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0106 (Bit Score: 144; Significance: 2e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0106
Description:

Target: scaffold0106; HSP #1
Raw Score: 144; E-Value: 2e-75
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 33287 - 33730
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||| |||| ||||||||  |||| |||||||| |  ||||||||||||||||| || || |||||    
T  33287 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaactagaactcacattttaacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacctgtaatacaat 33386  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||| ||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||||| ||||||  ||||||| | |||||||| ||  |     
T  33387 ctttagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaatgaacacaaccacgaatttatccaaataggcatggaaaatttgg 33486  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  33487 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 33586  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| ||| | || ||||||||||||||||| |||||||| || |||||||| |     
T  33587 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgttaaacacacgtgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcct 33686  T
Q  428 cggaagtggatacctattc-ttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||| || || || |||||||||||||||    
T  33687 cggaagtggatacctgttctttaatggtaaccttgttcaactga 33730  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0993 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 1)
Name: scaffold0993
Description:

Target: scaffold0993; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 196 - 470
Target Start/End: Original strand, 1 - 275
Alignment:
Q  196 cgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtg 295  Q
    |||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||  | ||||| ||||||||| ||||| ||    
T  1 cgaaacgatccaaaaatgcatgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacactgagaggcaaaactttatactcataatg 100  T
Q  296 accataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgca 395  Q
     ||||| ||| |||| ||||| |||||||||||||||||||| || |||||||||| ||||||||  || |||||||| || ||| |||||||||| |||    
T  101 tccataccgcgttctaaaagccgtcttctgcatatcttcatccttcactttaatctagtgataacccgatctcaaatctatcttgttgaaaacacgcgca 200  T
Q  396 cccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||| |||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| |||||||| || |||||||||    
T  201 cccactaacggatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatagttacttttttcaactga 275  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476 (Bit Score: 143; Significance: 6e-75; HSPs: 2)
Name: scaffold0476
Description:

Target: scaffold0476; HSP #1
Raw Score: 143; E-Value: 6e-75
Query Start/End: Original strand, 193 - 423
Target Start/End: Original strand, 10284 - 10514
Alignment:
Q  193 ctacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata 292  Q
    ||||||| |||||||||||||| || |||||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||| |||||||| |||||||| || ||||| |||||    
T  10284 ctacgaaccgatccaaaaatgcttgaaagatgcgattcatgtactccataaatactccaggtgcatttgtaacaccgaaaggcatcaccttatactcata 10383  T
Q  293 gtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgt 392  Q
     |||||||  ||| |||| ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||| |||||||| || ||||||||||||| |    
T  10384 atgaccatcccgcgttctaaaagctgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacacat 10483  T
Q  393 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaa 423  Q
    ||||||||||||||||||||||| |||||||    
T  10484 gcacccactaactgatccatcaagtcatcaa 10514  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0476; HSP #2
Raw Score: 93; E-Value: 4e-45
Query Start/End: Original strand, 28 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 1898 - 1502
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  1898 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 1799  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||| | || | ||||| ||| ||||| ||||| | ||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  1798 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtccttgaattaatcagaatgtcatcaatgaatagaaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 1699  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||| | |||| ||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  1698 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaacgaaagacatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 1599  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaat 424  Q
    |||| | ||| || || || ||||| || || | ||||||||| ||||| || |||||||| |  |||||||||| |||||||||||| ||||||||    
T  1598 tatccttatccttcaccttgatctgatggtagcctgacctcaagtcaatcttactgaaaaccctcgcacccactagctgatccatcaagtcatcaat 1502  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0585 (Bit Score: 142; Significance: 3e-74; HSPs: 1)
Name: scaffold0585
Description:

Target: scaffold0585; HSP #1
Raw Score: 142; E-Value: 3e-74
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 5439 - 5022
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| ||  |  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||||||||||| ||||||||    
T  5439 aaataatatggccaagaaaacttactccacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaacacttgcaacacaatctt 5340  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    ||||||||| ||||| ||||||||| |||| || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || | ||||    
T  5339 cagatgctctgcatgctcttcttcattcttagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctattc 5240  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||| ||| |  ||||| ||||| || ||||| ||  | || || || || ||||||||||    
T  5239 atgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagacatcatcttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggccgttttctgcatat 5140  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||||||||||  ||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  5139 cttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaaatcaatttgtctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaatcatcaattctcgg 5040  T
Q  431 aagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  5039 aagtggatatctattctt 5022  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261 (Bit Score: 139; Significance: 2e-72; HSPs: 2)
Name: scaffold0261
Description:

Target: scaffold0261; HSP #1
Raw Score: 139; E-Value: 2e-72
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 13689 - 13247
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| |||||||| ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  13689 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaattttgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 13590  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | || ||||| || ||     
T  13589 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcgg 13490  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  13489 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 13390  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |     
T  13389 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcct 13290  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  13289 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactga 13247  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0261; HSP #2
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 21868 - 21426
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  21868 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 21769  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||| ||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | || ||||| || ||     
T  21768 cttcagatgttctgcatgctcttcttctgtcttcgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcgtggaaaattcgg 21669  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||| ||| |||||||| || |||||||| || || ||||| |   | || || || ||||||||||    
T  21668 ttcatatactccataaacacaccaggcgcattagtaagaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcatgtcctaaaggccgtcttctgca 21569  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||||||||| ||||| || ||||| ||||||||||| |||||||| || | |||||| |     
T  21568 tatcctcatccttcacattaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttgctaaacacacgagcacccactaaatgatccatgaagttatcaatcct 21469  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||||    
T  21468 cggaagtggatacctgttctttatcgtaaccttattcaactga 21426  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0304 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0304
Description:

Target: scaffold0304; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 39 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 1827 - 1418
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||||||||||||||||||||| |||||||||||||  |    
T  1827 tggccaagaaaactaacttcatttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaacacttgcaatacaatcttcagatctt 1728  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || || ||||||||    
T  1727 ctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcggtttatatactc 1628  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || || ||||||||||||||  |||| ||  | || ||  | |||||||||||||| |||||     
T  1627 cataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcaccttatattcatagtgttcatatcgtgtcctaaagaccgtcttctgcatatcctcatcc 1528  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| ||||||||| |||||||||| ||||||||||| | ||||| |||||    
T  1527 ttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttactatacacacgagcacccactgactgatccattaaatcatcaatcctcggaaatggat 1428  T
Q  439 acctattctt 448  Q
    |||| |||||    
T  1427 acctgttctt 1418  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0192 (Bit Score: 138; Significance: 6e-72; HSPs: 1)
Name: scaffold0192
Description:

Target: scaffold0192; HSP #1
Raw Score: 138; E-Value: 6e-72
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Original strand, 28481 - 28898
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| | |||||| ||||||||||||||||| |||||| |    
T  28481 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaatttcttttctttcaacacttgcaacacaatcat 28580  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    ||||||||| ||||| | ||||||| || | || ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |  |||    
T  28581 cagatgctctgcatgcttttcttcattcctagaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattctgttc 28680  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    |||||||||||||| || ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||| ||||| || ||||| ||  | || || |  || ||||||||||    
T  28681 atatactccataaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatactcataatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttctgcatat 28780  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    | ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| |||||||| ||||| || |||||||||||||||||||| || ||||||||||||| |||    
T  28781 cctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactgaacacgcgtgcacccactaactgatctattaaatcatcaattctcgg 28880  T
Q  431 aagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||| ||||||||    
T  28881 aagtggatatctattctt 28898  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0100 (Bit Score: 137; Significance: 2e-71; HSPs: 1)
Name: scaffold0100
Description:

Target: scaffold0100; HSP #1
Raw Score: 137; E-Value: 2e-71
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 22538 - 22099
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||| ||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||| |   | ||||||| || ||||||||| |||||    
T  22538 cagaaataatatggccaaaaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatataacgttttctcttgcagcacttgcaaaacaat 22439  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| |||||  || ||||||||||||| ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| || |  ||||| ||| | |||||  | |||| |    
T  22438 cttcaaatgcttggcgtgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaacaacaatgcgatctaaataagcatgagaaatgcaa 22339  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| || ||| |||| || || |||||||| ||||||| ||| ||||| |||  |||||  || || || |||||  | || || || ||||||||||    
T  22338 ttcatgtattccgtaaatacacccggtgcattagtaacacgaaa-ggcatcactgaatatttgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 22240  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| ||||| || || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||     
T  22239 tatcctcatccttcactttaatctgatgatagctcgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcgattct 22140  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
     ||||||||||| |||||||| || || || ||||||||||    
T  22139 tggaagtggataactattctttattgtcactttgttcaact 22099  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0009 (Bit Score: 135; Significance: 4e-70; HSPs: 1)
Name: scaffold0009
Description:

Target: scaffold0009; HSP #1
Raw Score: 135; E-Value: 4e-70
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 250573 - 251015
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||    
T  250573 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacatttcgacaacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaat 250672  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  250673 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaacaacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 250772  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  250773 ttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 250872  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||  ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||| ||||| |||||||| ||   ||||||||| || |||||||| || ||||||||||     
T  250873 tattctcatccttcaccttaatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttgctgaacacctttgcacccaccaattgatccattaagtcatcaattct 250972  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  250973 cggaagtggatacctattctttatcgtaactttgttcaactga 251015  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 2)
Name: scaffold0560
Description:

Target: scaffold0560; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 301 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 8822 - 8657
Alignment:
Q  301 aacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccac 400  Q
    ||||| ||||||||| |||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||||||| ||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||    
T  8822 aacgcgttctgaaagatgtcttctgcatatcttcatctttcactttaatctggtgataacctgacctcaaatcaatcttgctgaaaacacgtgcacccac 8723  T
Q  401 taactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |||||    
T  8722 taactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggattcctattcttgatagttaccttcttcaa 8657  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0560; HSP #2
Raw Score: 48; E-Value: 3e-18
Query Start/End: Original strand, 246 - 305
Target Start/End: Complemental strand, 10975 - 10916
Alignment:
Q  246 actccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgc 305  Q
    ||||||||||||||||| ||||| ||||||||||||||||| ||||||||||||||||||    
T  10975 actccaggtgcattggtcacaccgaaaggcataactttatactcatagtgaccataacgc 10916  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0016 (Bit Score: 134; Significance: 2e-69; HSPs: 1)
Name: scaffold0016
Description:

Target: scaffold0016; HSP #1
Raw Score: 134; E-Value: 2e-69
Query Start/End: Original strand, 31 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 176694 - 176277
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||| | || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || |||||||||| ||| ||||||||    
T  176694 aaataatatggccaagaaaatttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttcattcaacacttacaacacaatctt 176595  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
     | |||||| ||||| |||||||||| ||| || |||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||||||| | |||||||| || | ||||    
T  176594 taaatgctctgcatgctcttcttcagacttagaataaatcaagatgtcatcaataaatacaacaacaaaccgatccaaataagcatggaaaattctattc 176495  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    || |||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| ||||  || |||  |||||| || || ||||| ||  | || || |  || || |||||||    
T  176494 atgtactccataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaagatatcactgaatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgttttatgcatat 176395  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    |||||||||||||||||||||  || ||||  ||||||||||||||  |||| || || ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||| |||    
T  176394 cttcatcttttactttaatctaatggtaacccgacctcaaatcaatcatgctaaacacgcgtgcacccactaactgatccattaaatcatcaattcgcgg 176295  T
Q  431 aagtggatacctattctt 448  Q
    ||||||||||||||||||    
T  176294 aagtggatacctattctt 176277  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0298 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 1)
Name: scaffold0298
Description:

Target: scaffold0298; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 10410 - 9969
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||| |||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  10410 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttgacatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 10311  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| ||||||  ||| |   | |||||||| || ||     
T  10310 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatctaggtaagcatggaaaattcgg 10211  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| | ||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | |  || || ||||||||||    
T  10210 ttcatatactccataaacacactaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcccaaaggccgtcttctgca 10111  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| || |||||||| || | || |||||| || ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| |     
T  10110 tatcctcatctttcaccttaatctgatggt-acctgaccttaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcct 10012  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  10011 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 9969  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034 (Bit Score: 131; Significance: 9e-68; HSPs: 2)
Name: scaffold0034
Description:

Target: scaffold0034; HSP #1
Raw Score: 131; E-Value: 9e-68
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Complemental strand, 3306 - 2892
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||  || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |||||||| |||||    
T  3306 cagaaataatgtggccaagaaaacaaacttcactaaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaatacttgcaatacaat 3207  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| |  || ||||| || |||||||| ||||||  ||||| | | |||||||| || ||     
T  3206 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaggatgtcatcaataaacacaaccacgaatttatccagataggcatggaaaattcgg 3107  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  3106 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 3007  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || |||||||| |     
T  3006 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcatcaatcct 2907  T
Q  428 cggaagtggatacct 442  Q
    |||||||||||||||    
T  2906 cggaagtggatacct 2892  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0034; HSP #2
Raw Score: 108; E-Value: 5e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 69323 - 69765
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | ||| |||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  69323 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcacttaacaagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 69421  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||   | || ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  69422 tcttcaagcgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatcaataaataccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaattcg 69521  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| |||||||||    
T  69522 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgc 69621  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| |||||||| || |||||   |||||| || || || |||||||| |||||||| |    
T  69622 atatcttcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacctaccaattggtccatcaagtcatcaatcc 69721  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  69722 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 69765  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124 (Bit Score: 126; Significance: 9e-65; HSPs: 2)
Name: scaffold0124
Description:

Target: scaffold0124; HSP #1
Raw Score: 126; E-Value: 9e-65
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 14153 - 14601
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| | |||||| |||||    
T  14153 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcaattaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatatttgcaacacaat 14252  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| ||||||||||||||  | ||||| | ||| ||||| ||  ||||||| ||||||  || ||   | |||||||| || ||     
T  14253 cttcagatgctctgcatgctcttcttcagtcttataataaattagaatgtcatcaatagacacaaccacgaatttattcaggtaggcatggaaaattcgg 14352  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcata------gtgaccataacgcattctgaaagctgtct 321  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||| ||| || |||||||||||      ||||||||||||  | || || || ||||    
T  14353 ttcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaagacatcaccttatattcatatatatagtgaccataacgtgtcctaaaggccgtct 14452  T
Q  322 tctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatc 421  Q
    |||||||||| ||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || || |||||||||||||||||||||||||| || |||||    
T  14453 tctgcatatcctcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaacacacgtgcacccactaactgatccattaagtcatc 14552  T
Q  422 aattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  14553 aatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 14601  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0124; HSP #2
Raw Score: 59; E-Value: 9e-25
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 6160 - 5718
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  6160 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 6061  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgc-ga 227  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || |  |    
T  6060 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctta 5961  T
Q  228 ttcatata-ctccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    ||||| ||  || ||||| || || || ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||        
T  5960 ttcatgtatttcaataaagacacctggcgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggat 5861  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |    
T  5860 atatcttctgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcc 5761  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
      ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  5760 ttggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 5718  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0056 (Bit Score: 125; Significance: 4e-64; HSPs: 1)
Name: scaffold0056
Description:

Target: scaffold0056; HSP #1
Raw Score: 125; E-Value: 4e-64
Query Start/End: Original strand, 22 - 178
Target Start/End: Complemental strand, 3712 - 3556
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3712 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagataatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 3613  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 178  Q
    || ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  3612 gataatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatc 3556  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0404 (Bit Score: 124; Significance: 1e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold0404
Description:

Target: scaffold0404; HSP #1
Raw Score: 124; E-Value: 1e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 415
Target Start/End: Original strand, 6703 - 7090
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  6703 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 6802  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| ||  |||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  |  || ||| ||||| || || ||     
T  6803 cttcagatgttctacatgctcttcctcagtcttagaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttaatcagaaaagcatgaaaaattcgg 6902  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||||||| ||||||||  |||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  6903 ttcatatactctataaacacatcaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 7002  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaa 415  Q
    |||| ||||| || ||||||||||| || |||| ||||||||||||||| || | ||| ||||| |||||||||||| ||||||||||    
T  7003 tatcctcatccttcactttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaatcttacggaatacacgagcacccactaaccgatccatcaa 7090  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1288 (Bit Score: 123; Significance: 6e-63; HSPs: 1)
Name: scaffold1288
Description:

Target: scaffold1288; HSP #1
Raw Score: 123; E-Value: 6e-63
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1207 - 766
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  |||||||| || || |||||||| |||||    
T  1207 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaattcacacttcgacaacttggcatacaacttcttctcctttaatacttgcaatacaat 1108  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||  ||||||||| |||| || |||||||| || ||||| || ||| |||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  1107 cttcagatgttctgcattctcttcttcattcttagaataaatcaagatgtcatcaataaactcaaccacgaatttatccaggtaggcatggaaaattcgg 1008  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || || ||||| ||  | || || |  ||||||||||    
T  1007 ttcatatactccataaacacgccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 908  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || |||| ||||||||| ||||| |||||| ||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| |     
T  907 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttgctg-aaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcct 809  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  808 cggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 766  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0405 (Bit Score: 122; Significance: 2e-62; HSPs: 1)
Name: scaffold0405
Description:

Target: scaffold0405; HSP #1
Raw Score: 122; E-Value: 2e-62
Query Start/End: Original strand, 141 - 470
Target Start/End: Original strand, 566 - 895
Alignment:
Q  141 gcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactcca 240  Q
    ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| || |  |||||||||||||    
T  566 gcatgctcttcttcagtcttagaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataagcatggaaaattctgttcatatactcca 665  T
Q  241 taaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttt 340  Q
    ||||||| ||||| ||||| |||||||| || ||||| || ||||||||||| |||||||| ||  | || || ||||||||||||||||| ||||| ||    
T  666 taaacacaccaggcgcattagtaacaccgaatggcatcaccttatattcataatgaccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgcatatcctcatcctt 765  T
Q  341 tactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatac 440  Q
     || |||||||| || |||| |||||||||| |||||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||| |||||    
T  766 caccttaatctgatggtaacctgacctcaaaccaattttgctaaacacacgagcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagttgatac 865  T
Q  441 ctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||| || || || || |||||||||    
T  866 ctattctttatcgtcactttattcaactga 895  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053 (Bit Score: 121; Significance: 9e-62; HSPs: 2)
Name: scaffold0053
Description:

Target: scaffold0053; HSP #1
Raw Score: 121; E-Value: 9e-62
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 47387 - 46967
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||  || ||  | ||||| ||||||||||| |||||  | ||||| |  || || ||||||||||||||||| |||||    
T  47387 cagaaataatatggccaagaaaacctacttcacttaaccaaaattcacattttgacaacgtcgcatacaactttttttctttcaacacttgcaatacaat 47288  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    || ||||||||| ||||| || |||||| ||||  | ||||| |  |||||||| || |||||||| || |||  ||| | | | |||||||| ||  |     
T  47287 ctgcagatgctctgcatgctcatcttcattcttaaaataaattaggatatcatcaataaacacaaccacaaatttatctagataggcatggaaaatttgg 47188  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || ||||||||||| |||||||||||  | || || ||  |||||||||    
T  47187 ttcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcataatgaccataacgtgtcctaaaggccatcttctgca 47088  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||| |||||||||| || || |||||||||||||||| ||||||||| ||||| | |||||     
T  47087 tatcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctccaatcaattttactaaacacacgtgcacccactagctgatccattaaatcgttaattct 46988  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  46987 cggaagtggatacctattctt 46967  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0053; HSP #2
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 56200 - 55780
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||| |||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  56200 cagaaataatgtggctaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 56101  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| || |||||||||||||| ||||| |  || ||||| ||||| ||||| |  ||   ||||| ||| ||||| || || ||     
T  56100 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttggaataaattaggatgtcatcaatgaatacaaccataaacttatccagaaaagcatgaaaaatacgg 56001  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||| ||||| || |||||||||||  | || || |  ||||||||||    
T  56000 ttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaatttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggtcgtcttctgca 55901  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || | ||| || || |||| ||||||||| ||||| ||  ||||||    |||||| || ||||| |||||||| || ||||| |     
T  55900 tatcttcatccttcacctgaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttattgaaaatctttgcaccgaccaactggtccatcaagtcgtcaatcct 55801  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||| ||||| || |||||    
T  55800 cggaagcggatatctgttctt 55780  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0739 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0739
Description:

Target: scaffold0739; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 22 - 181
Target Start/End: Original strand, 999 - 1158
Alignment:
Q  22 catcatcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||||| || |||||||||||||| ||||| ||||| | ||| |||||||||||||| |||||||||||||||||    
T  999 catcaccagaaataacatggccaagaaaacttacctctttcaaccagaactcacacttagatagtttagcataaagtttcttttctttcaacacttgcaa 1098  T
Q  122 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatc 181  Q
    |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| |||||||||    
T  1099 gacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcagaatatcatc 1158  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0206 (Bit Score: 120; Significance: 3e-61; HSPs: 1)
Name: scaffold0206
Description:

Target: scaffold0206; HSP #1
Raw Score: 120; E-Value: 3e-61
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 25066 - 25508
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||| ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  25066 cagaaataacgtggcctagaaaactcacttcagttaaccagaactcccacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 25164  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||  ||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||||||||||||| || || || || ||||||  ||||| ||| |||||||| || ||    
T  25165 tcttcaagtgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcaaaatatcatctataaataccaccacgaatttatccagaaaggcatggaaaattcg 25264  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || ||  ||||||| |||||||| ||||| ||||| || ||||||||  |  | || || || |||||||||    
T  25265 gttcatatactccatgaacacgccaggcgcgttaataacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatattgtgtcctaaaggccgtcttctgc 25364  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||| || || ||||  |||||||| |||||||| || |||||   ||||||||| ||||| |||||||| ||||||| ||    
T  25365 atatcttcatctttcactttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaattttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaaatc 25464  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  25465 tcggaagtggatatctgttctttattgtaactttgttcaactga 25508  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1477 (Bit Score: 118; Significance: 5e-60; HSPs: 1)
Name: scaffold1477
Description:

Target: scaffold1477; HSP #1
Raw Score: 118; E-Value: 5e-60
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 181 - 621
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||    
T  181 agaaataatgtggccaagaaaactaacatcacttaaccagaaatcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatc 280  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    |||||||| || ||||| |||||||||||| |  | | ||||||||| ||||| || || ||||| | ||||  ||||| | | |||||||| || || |    
T  281 ttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcctaaaat-aatcaaaatgtcatcaataaatacaaccatgaatttatccagataggcatggaaaattcggt 379  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||    
T  380 tcatatacttcataaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcttaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcat 479  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || |||  ||||||||| ||||| |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| | |    
T  480 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaagctgacctcaagtcaatcttgctgaaaacctttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctc 579  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||||  ||||| || || || ||||||||||||    
T  580 ggaagtggatacccgttctttattgtaactttgttcaactga 621  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0148 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 1)
Name: scaffold0148
Description:

Target: scaffold0148; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 28 - 442
Target Start/End: Original strand, 950 - 1364
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||| | ||||||||||||| |||| || ||||||||||||||||| || || ||||||||||| |  |||||||| ||||  |||||||| |||||    
T  950 cagaaatgatatggccaagaaaagtcacttcgttcaaccagaattcacacttcgataatttggcatataacttcttctccttcagtacttgcaaaacaat 1049  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||| |||||| |||||||| ||||| ||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || ||  |||||||| | ||||| || || |||    
T  1050 tctcaaatgctccgcatgttcctcttcggtcttagagtatatcataatatcatctataaacacaacaacaaactgatccaaataagcatgaaaaatacga 1149  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| |||||||||||||| || || || |||||||| |||||||| ||   |||||  || || |  |||||  | || || |||||||| || |    
T  1150 ttcatatattccataaacactcccggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccgaatatttgtaatgtctgtaacgtgtcctaaaggctgtcttatgaa 1249  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| ||||| ||||||||||  |  || || |||||||| || ||||| |||||||||||||||||||||||||||||||  || || |     
T  1250 tatcctcatctttcactttgatctggtgatggcccgatcttaaatcaatcttactgaacacacgtgcacccactaactgatccatcaaattgtcgatcct 1349  T
Q  428 cggaagtggatacct 442  Q
    |||||||||||||||    
T  1350 cggaagtggatacct 1364  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077 (Bit Score: 115; Significance: 3e-58; HSPs: 2)
Name: scaffold0077
Description:

Target: scaffold0077; HSP #1
Raw Score: 115; E-Value: 3e-58
Query Start/End: Original strand, 76 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 19939 - 19545
Alignment:
Q  76 atttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaat 175  Q
    |||||||||| |||||||| |  || |||||||| || |||||||| |||||||||||||| || ||||| ||||||||| |||| || |||||||| ||    
T  19939 atttagacaacttggcatacaacttattctctttgaatacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcattcttagaataaatcaagat 19840  T
Q  176 atcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggc 275  Q
     ||||| || |||||||| ||||||  ||||||  | |||||||| || || ||||||||||||||||||||  |||  ||||| |||||||  ||||||    
T  19839 gtcatcaataaacacaaccacgaatttatccaagtaggcatggaaaattcggttcatatactccataaacacgtcagacgcattagtaacactgaaaggc 19740  T
Q  276 ataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaa 375  Q
    || || |||||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||||    
T  19739 atcaccttatattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacccgacctcaaatcaa 19640  T
Q  376 ttttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | |||||||||||   ||||||||||||||||||||| || || ||||| | | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19639 tcttgctgaaaacttttgcacccactaactgatccattaagtcgtcaatcctcagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19545  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0077; HSP #2
Raw Score: 46; E-Value: 5e-17
Query Start/End: Original strand, 29 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 26618 - 26457
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  26618 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 26519  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
     ||| ||| |||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  26518 ctcaaatgttcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 26457  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0054 (Bit Score: 114; Significance: 1e-57; HSPs: 1)
Name: scaffold0054
Description:

Target: scaffold0054; HSP #1
Raw Score: 114; E-Value: 1e-57
Query Start/End: Original strand, 29 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 64860 - 64452
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    ||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||||| ||||||||||||||| ||||||    
T  64860 agaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacattttgacaacttggcatacaacttcttctttttcaacacttgcaacacaatc 64761  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
    ||||||||||| ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |    
T  64760 ttcagatgctctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggt 64661  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||||||||| |||||           | || || ||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || |  |||||||||||    
T  64660 tcatatactccataaacacaccagg-----------cgccgaacggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggacgtcttctgcat 64572  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||| ||||| || || |||||||| || ||||  |||||||||||||| |||||||| ||||| ||| ||||||||||||| || ||| ||||||| | |    
T  64571 atcctcatccttcaccttaatctgatggtaaccggacctcaaatcaatcttgctgaacacacgagcatccactaactgatcaattaaaccatcaatcctc 64472  T
Q  429 ggaagtggatacctattctt 448  Q
    | ||||||||||||||||||    
T  64471 gtaagtggatacctattctt 64452  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0445 (Bit Score: 111; Significance: 8e-56; HSPs: 1)
Name: scaffold0445
Description:

Target: scaffold0445; HSP #1
Raw Score: 111; E-Value: 8e-56
Query Start/End: Original strand, 28 - 330
Target Start/End: Complemental strand, 2202 - 1900
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||||||| |||||||||||||| || ||||||||||||||||| || ||||| |||||||  |  |||||||| |||| ||||||||| |||||    
T  2202 cagaaataacatgaccaagaaaactcacctcattcaaccagaattcacactttgacaacttggcatttaacttcttctccttcagcacttgcaaaacaat 2103  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||||||| |||||||||||| || ||| ||||| |||||||||||||| ||||||||||| | ||| ||||| ||| | ||||| || || |||    
T  2102 cttcaaatgctcaacatgttcttcttgagacttagagtatatcaaaatatcatcaatgaacacaaccatgaagcgatctaaatacgcatgaaaaatacga 2003  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||| |||||||||||||| || || ||||| |||||||| |||| ||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || || ||||||||||    
T  2002 ttcatgtactccataaacacacccggcgcattagtaacaccgaaagccatcactgcatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 1903  T
Q  328 tat 330  Q
    |||    
T  1902 tat 1900  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0190 (Bit Score: 109; Significance: 1e-54; HSPs: 1)
Name: scaffold0190
Description:

Target: scaffold0190; HSP #1
Raw Score: 109; E-Value: 1e-54
Query Start/End: Original strand, 28 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 31672 - 31252
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||  || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| | |||    
T  31672 cagaaataatgtgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacactttgacagctttgcatacaacttcttttctttcaagacttgcaatataat 31573  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    |||||||||||| ||||| || ||||||||||| || ||||||| ||||||||| || ||||| || || |||  | ||| ||| |||||||| || ||     
T  31572 cttcagatgctctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaacaccaccacaaatttaaccagaaaagcatggaaaattcgg 31473  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| |||||||| || ||||| ||||| |||||||  |||||||| |  || ||||| || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  31472 ttcatatattccataaataccccaggcgcattagtaacactgaaaggcatcaacttgtattcgtaatgtccatatcgtctcctaaaggccgtcttctgca 31373  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| |||||||| || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || ||||| ||   |||||||||||||||||||||||| ||||||||||     
T  31372 tatcctcatctttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattct 31273  T
Q  428 cggaagtggatacctattctt 448  Q
    |||||||||||||||||||||    
T  31272 cggaagtggatacctattctt 31252  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0139 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0139
Description:

Target: scaffold0139; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 39 - 470
Target Start/End: Original strand, 37612 - 38043
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||||||||||||||| |   | ||||| || ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| ||||  || |||||||||||||| |    
T  37612 tggccaagaaaactcactttacttaaccaaaactcacactttgacaacttagcatacaacttcttttctttcaatacttctaatacaatcttcagatgtt 37711  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||| ||||| || ||  |||| || |||  |||||   | |||||||| || || |||||||||||    
T  37712 ctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcagaatgtcatcaataaattcaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaattcggttcatatactc 37811  T
Q  239 cataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatct 338  Q
    ||| ||||| ||||| ||||| ||||||||  ||||||| || || ||||| || |||||||||||  |||| || || |||||||||||||| |||||     
T  37812 catgaacacaccaggcgcattagtaacaccgtaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcctcatcc 37911  T
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||| |||||||| || |||||||| | || ||||||||    
T  37912 ttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaattgatccattaagtcatcaatcctcgaaagtggat 38011  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  38012 acctgttctttattgtaactttgttcaactga 38043  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007 (Bit Score: 104; Significance: 1e-51; HSPs: 2)
Name: scaffold0007
Description:

Target: scaffold0007; HSP #1
Raw Score: 104; E-Value: 1e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 268561 - 269003
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcata-aagtttcttctctttcaacacttgcaagacaa 126  Q
    |||||||||||||||| || |||||||| ||  | |||||||| || || || ||||| |||||||| || ||||| ||||||||| |  ||||| ||||    
T  268561 cagaaataacatggcctaggaaactcacttcacttaaccagaactcgcacttcgacaacttggcatacaactttct-ctctttcaaaatctgcaacacaa 268659  T
Q  127 tcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcg 226  Q
    ||||||| || || || ||||| |||||||| || || ||||||||||||||||| || ||||| || ||||||  ||||| ||| |||||||| ||  |    
T  268660 tcttcaggtgttcggcgtgttcctcttcagttttagaataaatcaaaatatcatctataaacaccaccacgaatttatccagaaaagcatggaaaatctg 268759  T
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
     |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||| | ||  | || || || |||||||||    
T  268760 gttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccacatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 268859  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    ||||| ||||| || |||||||| || || ||||  |||||||| ||||| || || |||||    ||||| || ||||| |||||||| |||||||| |    
T  268860 atatcctcatccttcactttaatttgatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaactttagcacctaccaactggtccatcaagtcatcaatcc 268959  T
Q  427 acggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     ||| ||||||||||||||||| || || || ||||||||||||    
T  268960 gcgggagtggatacctattctttattgtaactttgttcaactga 269003  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0007; HSP #2
Raw Score: 80; E-Value: 3e-37
Query Start/End: Original strand, 30 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 84870 - 84432
Alignment:
Q  30 gaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatct 129  Q
    ||||||| ||| ||||| |||||||| |  |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||      
T  84870 gaaataatatgaccaaggaaactcactttgttcaaccagaattcgcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaattc 84771  T
Q  130 tcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgatt 229  Q
    ||| |||||| ||||| || || |  ||||| ||||| |||| ||||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || |||||    
T  84770 tcaaatgctcggcatgctcctccttggtcttagagtatatcataatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacgatt 84671  T
Q  230 catatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcata 329  Q
    |||||| |||||||| ||||   | ||||| |||||||| |||||||| ||   |||||| || || || |||||  | || || |  |||||||| |||    
T  84670 catatattccataaatactctcagcgcattagtaacaccgaaaggcatcacaaaatattcgtaatgtccgtaacgtgtcctaaaggtcgtcttctgaata 84571  T
Q  330 tcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacg 429  Q
    || |||||||| ||||| ||| ||||||| |  || ||||| ||||||||  |||| ||||| ||||||||||||| |||||||||||| | ||| | ||    
T  84570 tcctcatctttcactttgatccggtgatagcccgatctcaagtcaattttattgaacacacgcgcacccactaact-atccatcaaatcgttaatcctcg 84472  T
Q  430 gaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| ||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  84471 gaagtcgatacctattctttattgtcactttattcaactg 84432  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 4)
Name: scaffold0076
Description:

Target: scaffold0076; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 32030 - 31588
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | ||||| || || || || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  32030 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccaaaactcgcactttgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaatacaat 31931  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| |||||  | || || |||||||| ||||| ||||| ||||| || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  31930 cctcagatgttctgcatgctcttcctcagttctcgaatagatcaaaatgtcatcaatgaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatgaaaaattctg 31831  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  31830 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 31731  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || || ||||| || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || |||||||||||||  || |||||||     
T  31730 tgtcctcatctttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcatgtcgtcaattct 31631  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  31630 cggaagtggatatcttttctttattgtaactttattcaactga 31588  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #2
Raw Score: 70; E-Value: 2e-31
Query Start/End: Original strand, 261 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 54531 - 54322
Alignment:
Q  261 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || || |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || ||||    
T  54531 gtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaac 54432  T
Q  361 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 460  Q
     ||||||||| ||||| || ||||| ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||||| |||||||||||| |||||||| || || || ||    
T  54431 ctgacctcaagtcaatcttactgaacacctttgcacccactatctgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatatctattctttatcgtaacttt 54332  T
Q  461 gttcaactga 470  Q
    ||||||||||    
T  54331 gttcaactga 54322  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #3
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 42212 - 42652
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  42212 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 42311  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  42312 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 42411  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || ||  | ||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  42412 tcatgtattccataaagacacctagcgcattagatactccaaatggcatcacaaaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 42511  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |      
T  42512 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 42611  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  42612 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 42652  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0076; HSP #4
Raw Score: 44; E-Value: 8e-16
Query Start/End: Original strand, 28 - 247
Target Start/End: Complemental strand, 55253 - 55034
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | ||||| || ||  |||| ||||| || ||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  55253 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaactcttatttcgacaacttagcatacaacttcttttctttcaaaacttgcaatacaat 55154  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| || ||||||||||| || || || | ||||||||| || || || || ||||||  | | | ||| |||||||| || ||     
T  55153 cttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaatagattagaatatcatcaataaataccaccacgaatttaactagaaaagcatggaaaattcgg 55054  T
Q  228 ttcatatactccataaacac 247  Q
    |||||||||||||| |||||    
T  55053 ttcatatactccatgaacac 55034  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0020 (Bit Score: 103; Significance: 5e-51; HSPs: 1)
Name: scaffold0020
Description:

Target: scaffold0020; HSP #1
Raw Score: 103; E-Value: 5e-51
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 99915 - 99473
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || |||||||| |  | |||||| |||||    
T  99915 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatataactttttctcttttagaatttgcaacacaat 99816  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||  | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |||    
T  99815 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagttctagaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaattcga 99716  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || || ||||| ||  | || || |||||||||||||    
T  99715 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggctgtcttctgca 99616  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| ||||||||||| || |||||||| |     
T  99615 tatcctcatccttcaccttgatctgatggtaacctgacctcaattcaatcttactaaaaacctttgcacccaccaactgatccattaagtcatcaatcct 99516  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  99515 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 99473  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037 (Bit Score: 100; Significance: 3e-49; HSPs: 2)
Name: scaffold0037
Description:

Target: scaffold0037; HSP #1
Raw Score: 100; E-Value: 3e-49
Query Start/End: Original strand, 28 - 191
Target Start/End: Complemental strand, 115334 - 115171
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||| |||||||| || ||||| |||||||| |  | |||||| |||| ||||||||| |||||    
T  115334 cagaaataacatggccaagaaaactcacctctttcaaccaaaattcacactttgacaacttggcatataactacttctccttcagcacttgcaaaacaat 115235  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacaca 191  Q
    ||||| ||||||||||||||||||||||| ||| ||||| ||||||||||||||||||||||||    
T  115234 cttcaaatgctcagcatgttcttcttcagacttagagtatatcaaaatatcatcgatgaacaca 115171  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0037; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 256 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 115163 - 114950
Alignment:
Q  256 cattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtg 355  Q
    |||| |||||||| |||||||| |||  |||||| || || ||||||||  | || || ||  ||||||| ||||| || ||||| ||||||||||||||    
T  115163 catttgtaacaccgaaaggcatcactcaatattcgtaatgtccataacgtgtcctaaaggccatcttctggatatcctcgtctttcactttaatctggtg 115064  T
Q  356 ataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagtt 455  Q
    |||||  || ||||||||||| ||||| || ||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||  |||||||||||||||||||| || |||    
T  115063 ataacccgatctcaaatcaatcttgctaaacacacgtgcacccactaactgatccatcaagtcatcaattcttggaagtggatacctattctttatcgtt 114964  T
Q  456 accttgttcaactg 469  Q
    || || ||||||||    
T  114963 actttattcaactg 114950  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0239 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0239
Description:

Target: scaffold0239; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 72 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 11095 - 10697
Alignment:
Q  72 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 171  Q
    |||||||| |||||||||||||| |  ||||||||||| || |||||||| |||||| ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  11095 tcacattttgacaatttggcatacaacttcttctctttaaatacttgcaatacaatcctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatta 10996  T
Q  172 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 271  Q
    |||||||||| || || || |||||||||  |||||  || ||||| || || || |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| ||    
T  10995 aaatatcatcaataaataccactacgaatttatccaggaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaa 10896  T
Q  272 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 371  Q
    |||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || || ||||| || ||||  ||||||||     
T  10895 aggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaag 10796  T
Q  372 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    || || || || |||| |  |||||| || |||||||||||||| ||||||||   | ||||  ||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  10795 tcgatcttactaaaaatatttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcttcagaagcagatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 10697  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0005 (Bit Score: 99; Significance: 1e-48; HSPs: 1)
Name: scaffold0005
Description:

Target: scaffold0005; HSP #1
Raw Score: 99; E-Value: 1e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 262177 - 262619
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  262177 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 262276  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| || |||| |||||| || ||||| |  ||||| || ||||| ||||| || ||   ||||| |||  ||||||| || |      
T  262277 cctcagatgttctgcatgctcctctttagtcttagaataaattaggatatcgtcaatgaatacaaccacaaacttatccagaaagacatggaaaattcag 262376  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||||||  | || || || ||||||||||    
T  262377 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccataacgtgtcctaaaggccgtcttctgca 262476  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || ||||  |||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||| ||| |     
T  262477 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcataaatcct 262576  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    || ||| |||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  262577 cgaaagcggatacctgttctttattgtaactttgttcaactga 262619  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058 (Bit Score: 98; Significance: 5e-48; HSPs: 2)
Name: scaffold0058
Description:

Target: scaffold0058; HSP #1
Raw Score: 98; E-Value: 5e-48
Query Start/End: Original strand, 28 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 27600 - 27160
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| |||||||||||||| || |||||||||||||| || || || || |||||||| |  ||||||||||||| ||||||||| |||||    
T  27600 cagaaataatatgaccaagaaaactcac-tcgttcaaccagaattctcactttgataacttggcatataacttcttctctttcagcacttgcaaaacaat 27502  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||| |||||| |||||||| || |||| ||| ||||| ||||  |||||||| || |||||||| || || ||||| | | | | ||| || || |||    
T  27501 tctcaaatgctcggcatgttcctcctcagacttagagtatatcaggatatcatctataaacacaacaacaaaacgatctagataagtatgaaaaatacga 27402  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||| |||| ||| ||||| || ||||| |||||||| |||||||| ||   ||||||||| |  || ||||| || || ||  |  ||||||| |    
T  27401 ttcatatattccacaaatactcccggcgcattagtaacaccgaaaggcatcacagaatattcataatttccgtaacgtatcctaaagtccatcttctgaa 27302  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| | ||| ||| ||||||| |  || || || |||||||| ||||| |||||||||||||||||||||| |||||||||||  || |     
T  27301 tgtcctcatctttcagtttgatccggtgatagcccgatcttaagtcaattttactgaacacacgtgcacccactaactgatacatcaaatcattgatcct 27202  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||| || || || || ||||||||    
T  27201 cggaagtggatacctattctttattgtcactttattcaactg 27160  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0058; HSP #2
Raw Score: 86; E-Value: 7e-41
Query Start/End: Original strand, 105 - 470
Target Start/End: Original strand, 21150 - 21515
Alignment:
Q  105 tctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgat 204  Q
    |||||||| |||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| | ||||||||| |  || |||||||| |||  ||    
T  21150 tctttcaaaacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattagaatatcatcaagaaatacaactacaaatttat 21249  T
Q  205 ccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 304  Q
    ||| ||| ||||| || || || |||||||||||||| || || ||||| ||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||||| |  ||    
T  21250 ccagaaaagcatgaaaaattcggttcatatactccatgaatacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggtatcaccttctattcataatgaccgtgtcg 21349  T
Q  305 cattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaac 404  Q
      | || || || |||||||||||||| ||||| || |||||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |      
T  21350 tgtcctaaaggccgtcttctgcatatcctcatccttcactttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccact 21449  T
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||| ||| || ||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  21450 tgatccaccaagtcgtcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 21515  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 2)
Name: scaffold0420
Description:

Target: scaffold0420; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 72 - 470
Target Start/End: Original strand, 642 - 1038
Alignment:
Q  72 tcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatca 171  Q
    |||||||| |||||||| ||||| |  ||||| ||||||||||||||||| |||||||||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| |    
T  642 tcacatttcgacaatttagcatacaacttcttttctttcaacacttgcaatacaatcttcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaatta 741  T
Q  172 aaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaa 271  Q
     ||| ||||| || ||||| || || |||  ||||| ||| |||||||| || || |||||||||| ||| ||||| || || ||||| |||||||| ||    
T  742 gaatgtcatcaataaacaccaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactacatgaacacacccggcgcattagtaacaccgaa 841  T
Q  272 aggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaa 371  Q
    |||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| |||||||||     
T  842 aggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaag 941  T
Q  372 tcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||| || || ||||    ||  | ||| |||||||||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  942 tcaatattactaaaaaactttg--ctcaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 1038  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0420; HSP #2
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 318 - 470
Target Start/End: Original strand, 7857 - 8007
Alignment:
Q  318 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 417  Q
    |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || ||||    ||| |  || |||||||||||||| |    
T  7857 gtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatattactaaaaaactttgctc--accaactgatccatcaagt 7954  T
Q  418 catcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  7955 catcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttattcaactga 8007  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0046 (Bit Score: 96; Significance: 7e-47; HSPs: 1)
Name: scaffold0046
Description:

Target: scaffold0046; HSP #1
Raw Score: 96; E-Value: 7e-47
Query Start/End: Original strand, 31 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 80181 - 79742
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || |||||| |    
T  80181 aaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaatcct 80082  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattc 230  Q
    ||||||||  ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || || ||   |||||  || ||||| || || |  |||    
T  80081 cagatgctttgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatactaccacaaacttatccaggaaagcatgaaaaatcctgttc 79982  T
Q  231 atatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatat 330  Q
    ||||||||||| ||||| ||| | ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||||||    
T  79981 atatactccatgaacacaccaagcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatat 79882  T
Q  331 cttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacgg 430  Q
    ||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || |||||||    |||||| || |||||||||||||| |||||||| | ||     
T  79881 cttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactgaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcatcaatcctcga 79782  T
Q  431 aagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  79781 aagtggatacctgttctttatggtaactttgttcaactga 79742  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0126 (Bit Score: 92; Significance: 2e-44; HSPs: 1)
Name: scaffold0126
Description:

Target: scaffold0126; HSP #1
Raw Score: 92; E-Value: 2e-44
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 42905 - 43311
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  |||||||||||||| | |||||| ||||| |||||||| || ||||| |||||||||||||| |    
T  42905 aaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttctctttcaatatttgcaacacaattttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttg 43004  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || |||| ||||||||| || |||||||| || |||  |||||   | |||| ||| || || ||||||||||| || ||||| ||||| ||||| ||    
T  43005 aatagatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttatccaggtaagcatagaa-attcggttcatatactcgatgaacacaccaggcgcattagt 43103  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || ||  ||||||||||| | ||||| || || ||||| || || |||| |    
T  43104 aacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccctcttctgcataccctcatccttcaccttaatttgatggtaacct 43203  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
    |||||||| ||||| || ||||||||   |||||||||||||||||||||||| || ||||| | || |||||||||||| ||||| || || || || |    
T  43204 gacctcaagtcaatcttactgaaaacctttgcacccactaactgatccatcaagtcgtcaatcctcgaaagtggatacctgttctttattgtaactttat 43303  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  43304 tcaactga 43311  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090 (Bit Score: 91; Significance: 7e-44; HSPs: 2)
Name: scaffold0090
Description:

Target: scaffold0090; HSP #1
Raw Score: 91; E-Value: 7e-44
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 20802 - 21244
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  20802 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagt 20901  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| ||| |  | || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  20902 cctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaatagatcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 21001  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| ||| |||| || |||||||| ||||||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  21002 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaagcatcaccttatattcgtagtgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 21101  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    | || |||||||| || |||||||  || |||| ||||||||| |||||||| || ||||    |||||| || ||||| |||||||| ||||||||||     
T  21102 tgtcctcatctttcaccttaatctaatggtaacctgacctcaagtcaattttactaaaaatctttgcaccaaccaactggtccatcaagtcatcaattct 21201  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||| ||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  21202 cggaagcggatatctgttctttatcgtaactttattcaactga 21244  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0090; HSP #2
Raw Score: 49; E-Value: 8e-19
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 24964 - 25204
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| |||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  ||||||||| | || |||||||| ||| |    
T  24964 cagaaataatatggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctatgaatacttgcaatacagt 25063  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| ||||| ||| |  | || || |||||||| ||||| ||||| || || || |||  |||||   | ||||| || || |      
T  25064 cctcagatgttctgcatgctcttcctcatttctagaatagatcaaaatgtcatcaatgaataccaccacaaatttatccaggtaggcatgaaaaattctg 25163  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacc 268  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| ||||||||    
T  25164 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacacc 25204  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222 (Bit Score: 87; Significance: 2e-41; HSPs: 2)
Name: scaffold0222
Description:

Target: scaffold0222; HSP #1
Raw Score: 87; E-Value: 2e-41
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 9014 - 9456
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | ||| |||| ||||| || ||||| || ||| | |  || ||||||||||| ||||| || |||||    
T  9014 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaactagaactcacacttcgacaacttagcacacaactttttctctttcaaaacttgtaacacaat 9113  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||| || || ||||| || || ||||| || |||  ||||| | | |||||||| ||  |     
T  9114 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaattaagatgtcatcaataaatacaaccacaaatttatccagataggcatggaaaatttgg 9213  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||| ||| || || ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  9214 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaagacatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 9313  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| || || || || ||||| || || |||| ||| ||||| ||||| || || |||||   |||| ||||||||||||||||||| |||||||| |     
T  9314 tatcctcgtccttcaccttaatttgatggtaacctgatctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcatccactaactgatccatcaagtcatcaatcct 9413  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  9414 cggaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 9456  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0222; HSP #2
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 228 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 1642 - 1400
Alignment:
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    ||||||| |||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||| ||    
T  1642 ttcatatcctccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttcttca 1543  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   ||||||||| |||||||||||||| |||||||| |     
T  1542 tatcctcatcctttaccttaatctgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcacccaccaactgatccatcaagtcatcaatcct 1443  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||||||||||| || ||||| || || || ||||||||||||    
T  1442 cggaagtggatatctgttctttatcgtaactttgttcaactga 1400  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0730 (Bit Score: 84; Significance: 1e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0730
Description:

Target: scaffold0730; HSP #1
Raw Score: 84; E-Value: 1e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 379
Target Start/End: Complemental strand, 354 - 3
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | |||||||| ||||| || |||||||||||||| |  |||||||||||||| |||||||| |||||    
T  354 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaatttggcatacaacttcttctctttcaatacttgcaacacaat 255  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||||||| || ||||| ||||| || ||  | || || |||||||| ||||| ||| |||| || || |||  ||||| | | ||||| || || | |    
T  254 tctcagatgttctgcatgctcttcctccgttgtcgaatagatcaaaatgtcatcaatgtacactaccacaaatttatccagataagcatgaaaaattcta 155  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  154 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggcagtcttctgca 55  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaatttt 379  Q
    | ||||||||||| || || || || || |||| ||||||||| ||||||||    
T  54 tgtcttcatctttcaccttgatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttt 3  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0165 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0165
Description:

Target: scaffold0165; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 318 - 448
Target Start/End: Original strand, 11201 - 11331
Alignment:
Q  318 gtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaat 417  Q
    |||||||||||||| ||||| || || |||||||| || |||| |||||||||||||||||||||||| ||||| |||||||||||||||||||| ||||    
T  11201 gtcttctgcatatcctcatccttcaccttaatctgatggtaacctgacctcaaatcaattttgctgaacacacgagcacccactaactgatccattaaat 11300  T
Q  418 catcaattcacggaagtggatacctattctt 448  Q
    | ||||||| |||||||||||||||||||||    
T  11301 cgtcaattctcggaagtggatacctattctt 11331  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0072 (Bit Score: 83; Significance: 4e-39; HSPs: 1)
Name: scaffold0072
Description:

Target: scaffold0072; HSP #1
Raw Score: 83; E-Value: 4e-39
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Original strand, 52998 - 53440
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||| ||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| ||  |||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  52998 cagaaataatgtggcccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttaacatacaactttttctctttcaatatttgcaacacaat 53097  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| || ||||| |||||||||||||| || ||||||| ||||||||| || || ||||| || |||  |||||   | |||||||| || ||     
T  53098 cttcagatgttctgcatgctcttcttcagtcttagaataaatcagaatatcatcaataaatacaaccacaaatttatccaggtaagcatggaaaatccgg 53197  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||  |||||  |||| |||||| | ||||| || || || || || || || ||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  53198 ttcatatactccatgaacaaaccaggcacattagtaacatcgaaaggtatcaccttgtactcgtaatgtccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 53297  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| ||||| || || |||||   |||||||||||| ||||||||||| |||||||| |     
T  53298 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatcttactaaaaacctttgcacccactaattgatccatcaagtcatcaatcct 53397  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
     | ||||||||| || ||||| || || || || |||||||||    
T  53398 agaaagtggatatctgttctttattgtaactttattcaactga 53440  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1373 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold1373
Description:

Target: scaffold1373; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 28 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1187 - 747
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||| || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||    
T  1187 cagaaataatatgacccagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacaactttgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaat 1088  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      |||||||||| ||||| || |||||| ||||||| || || |||||||| || ||||| ||||| || |||  ||||| |||  ||||||| ||  |     
T  1087 tctcagatgctctgcatgctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcgtcaatgaatacaacaacaaatttatccagaaaatcatggaaaatttgg 988  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||||||||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || ||||||||||    
T  987 ttcatatactccataaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgca 888  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||| ||||| || || || ||||| || ||||  |||||||| ||||| || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || ||||| |     
T  887 tatcctcatccttcacctttatctgatggtaaccagacctcaagtcaatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcct 788  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||  ||||||  ||||| || || || ||||||||||    
T  787 cggaagcagataccggttctttatcgtaactttgttcaact 747  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0225 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 1)
Name: scaffold0225
Description:

Target: scaffold0225; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 25348 - 25788
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  25348 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 25447  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  25448 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 25547  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  25548 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 25647  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  25648 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 25747  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  25748 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 25788  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162 (Bit Score: 81; Significance: 6e-38; HSPs: 3)
Name: scaffold0162
Description:

Target: scaffold0162; HSP #1
Raw Score: 81; E-Value: 6e-38
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 14862 - 15302
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| |||||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  14862 agaaatcacatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttggcacacaactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 14961  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  14962 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 15061  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || |||||||| |  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  15062 tcatgtattccataaagacacctggtgcattagatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcagttttggatat 15161  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   ||||||||||| ||||||||||||||||||||| |      
T  15162 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcacccactagctgatccatcaaatcatcaatcctt 15261  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  15262 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 15302  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 11453 - 11365
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    ||||||||||| |||||||| |||||| ||| |||||||  ||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| ||||||||    
T  11453 ttctctttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcattatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacac 11365  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0162; HSP #3
Raw Score: 30; E-Value: 0.0000002
Query Start/End: Original strand, 405 - 466
Target Start/End: Complemental strand, 11150 - 11089
Alignment:
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    |||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||    
T  11150 tgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaa 11089  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0550 (Bit Score: 79; Significance: 1e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold0550
Description:

Target: scaffold0550; HSP #1
Raw Score: 79; E-Value: 1e-36
Query Start/End: Original strand, 351 - 472
Target Start/End: Complemental strand, 11189 - 11067
Alignment:
Q  351 tggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttga 450  Q
    |||||||||| ||| |||||||| || |||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||||||||| ||||| |    
T  11189 tggtgataacctgatctcaaatctatcttgctgaaaacatgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctgttcttaa 11090  T
Q  451 tagttac-cttgttcaactgatg 472  Q
    |||||||  ||||||||||||||    
T  11089 tagttacttttgttcaactgatg 11067  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1830 (Bit Score: 78; Significance: 4e-36; HSPs: 1)
Name: scaffold1830
Description:

Target: scaffold1830; HSP #1
Raw Score: 78; E-Value: 4e-36
Query Start/End: Original strand, 28 - 253
Target Start/End: Original strand, 947 - 1172
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || || || ||| |||| |||||||| ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| |||||    
T  947 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcatttaactagaactcacattttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaat 1046  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
     |||||||| || ||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || |      
T  1047 attcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattctg 1146  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccagg 253  Q
    |||||||||||||||||||| |||||    
T  1147 ttcatatactccataaacacaccagg 1172  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1715 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 1)
Name: scaffold1715
Description:

Target: scaffold1715; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 45 - 470
Target Start/End: Original strand, 922 - 1347
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    ||||||||||| ||  | ||| |||| |||||||| ||||  || ||||| | | |||| |||||||| |||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  922 agaaaactcacttcacttaactagaactcacattttgacagctttgcatacaatctcttttctttcaaaacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 1021  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    | || |||||| |||| || ||||| ||||||||||| || || ||||| || |||   |||| ||| |||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  1022 gctcctcttcattcttagaataaattaaaatatcatcaataaatacaacaacaaatttgtccagaaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaa 1121  T
Q  245 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 344  Q
    ||| ||||| || || |||||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || || |||||||| ||||| ||||| || ||     
T  1122 cacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcattactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgaatatcctcatccttcacc 1221  T
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    |||||||| || ||||  |||||||| || || || || ||||     ||||| || |||||||||||||| || ||||| | |||||| |||||  | |    
T  1222 ttaatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatcttagcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcggaagcggatatatgt 1321  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  1322 tctttatcgtaaccttgttcaactga 1347  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235 (Bit Score: 74; Significance: 1e-33; HSPs: 2)
Name: scaffold0235
Description:

Target: scaffold0235; HSP #1
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9810 - 9372
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  9810 cagaaataatgtggccaagaaatcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaat 9711  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || | ||| || ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |   |     |||||||| || ||     
T  9710 cttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttaggtag----gcatggaaaattcgg 9615  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  9614 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 9515  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |     
T  9514 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcct 9415  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  9414 cagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 9372  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0235; HSP #2
Raw Score: 74; E-Value: 1e-33
Query Start/End: Original strand, 28 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 20024 - 19586
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||| || || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| | |||||| |||||    
T  20024 cagaaataatgtggccaagaaagcttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatttgcaacacaat 19925  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||| ||| || | ||| || ||||||||| | |  ||||||| ||||||||| || |||||||| || |||  |   |     |||||||| || ||     
T  19924 cttcaaatgttctgtatgctcctcttcagtcctagcttaaatcagaatatcatcaataaacacaaccacaaatttaggtag----gcatggaaaattcgg 19829  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgca 327  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || |||||||| ||  | || ||||| ||||||||||    
T  19828 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaagccgtcttctgca 19729  T
Q  328 tatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattca 427  Q
    |||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| |||||||  |  |||||   ||||||||||| ||||||| |||| |||||||| |     
T  19728 tatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcaatttaacaaaaaacctttgcacccactagctgatccgtcaagtcatcaatcct 19629  T
Q  428 cggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    | ||||||||||||| ||||| || || || || |||||||||    
T  19628 cagaagtggatacctgttctttattgtaactttattcaactga 19586  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0088 (Bit Score: 72; Significance: 2e-32; HSPs: 1)
Name: scaffold0088
Description:

Target: scaffold0088; HSP #1
Raw Score: 72; E-Value: 2e-32
Query Start/End: Original strand, 63 - 470
Target Start/End: Original strand, 28921 - 29327
Alignment:
Q  63 aaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttgg 162  Q
    |||||||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| |||||||| |||||||| |||||  |||| ||||| ||||| ||| ||||| |||| |    
T  28921 aaccagaactcacattttgacaacttcgcatacaacctcttttctttcaaaacttgcaacacaattctcaggtgctctgcatgctct-cttcattcttag 29019  T
Q  163 agtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggt 262  Q
    | || || || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| ||  | |||||||||| ||||||||| ||||| || || ||    
T  29020 aatagattaagatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaattaggttcatatactacataaacacaccaggcgcgttagt 29119  T
Q  263 aacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataactt 362  Q
    |||||| |||||||| ||||| || || || |||||||| ||  | || || ||  ||||||||||||| ||||| || ||||| ||||| || ||||      
T  29120 aacaccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccatcttctgcatatcctcatccttcacttttatctgatggtaacca 29219  T
Q  363 gacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgt 462  Q
     ||||||| ||||| || |||||||  |  ||||| || || |||||||||||||| ||||||| |||||| |||||||| ||||| || || ||||| |    
T  29220 aacctcaagtcaatcttactgaaaatcctagcaccaaccaattgatccatcaaatcgtcaattctcggaagcggatacctgttctttatcgtaaccttat 29319  T
Q  463 tcaactga 470  Q
    ||||||||    
T  29320 tcaactga 29327  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0170 (Bit Score: 69; Significance: 9e-31; HSPs: 1)
Name: scaffold0170
Description:

Target: scaffold0170; HSP #1
Raw Score: 69; E-Value: 9e-31
Query Start/End: Original strand, 29 - 469
Target Start/End: Original strand, 34039 - 34479
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| ||||| ||||| ||||| || || | |||||| |||||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  34039 agaaatcacatgaccaaggaaacttacttcctccaaccaaaattcacacttagacaactttgcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 34138  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| |||||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  34139 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctatgaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 34238  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    ||||||||||||| || || || || |||||||  || ||||| ||||| ||   ||| |||||||| ||||| | | |||  || || || ||  | ||    
T  34239 tcatatactccatgaagacacctggcgcattggatactccaaatggcatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcgaaacgcggttttgggtat 34338  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | |    
T  34339 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccgaccagctgatccatcaaatcatcaatcctc 34438  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||| ||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  34439 ggaagtgcataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 34479  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0285 (Bit Score: 68; Significance: 4e-30; HSPs: 1)
Name: scaffold0285
Description:

Target: scaffold0285; HSP #1
Raw Score: 68; E-Value: 4e-30
Query Start/End: Original strand, 65 - 140
Target Start/End: Original strand, 9215 - 9290
Alignment:
Q  65 ccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctca 140  Q
    |||||||||||| ||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  9215 ccagaattcacacttagacaatttagcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctca 9290  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold2111 (Bit Score: 66; Significance: 6e-29; HSPs: 1)
Name: scaffold2111
Description:

Target: scaffold2111; HSP #1
Raw Score: 66; E-Value: 6e-29
Query Start/End: Original strand, 227 - 448
Target Start/End: Complemental strand, 741 - 520
Alignment:
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgc 326  Q
    ||||||||||||||| ||||| ||||||||||| |||||||| |||||||| || |||||||| || |||||||| ||  | || || || |||||||||    
T  741 attcatatactccatgaacacaccaggtgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttatattcgtaatgaccatatcgtgtcctaaaggccgtcttctgc 642  T
Q  327 atatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattc 426  Q
    |||||||||||||| |||||||| |  || ||||  |||||||| ||||| || || |||||   |||||| || |||||||||||||  || ||| |||    
T  641 atatcttcatctttcactttaatttcatggtaacccgacctcaagtcaatcttactaaaaacttttgcaccaaccaactgatccatcaggtcgtcagttc 542  T
Q  427 acggaagtggatacctattctt 448  Q
     |||||| ||||| || |||||    
T  541 tcggaagcggatatctgttctt 520  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0177 (Bit Score: 65; Significance: 2e-28; HSPs: 1)
Name: scaffold0177
Description:

Target: scaffold0177; HSP #1
Raw Score: 65; E-Value: 2e-28
Query Start/End: Original strand, 402 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 12335 - 12267
Alignment:
Q  402 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||||| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    
T  12335 aactgatccatcaaatcatcaattctcggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 12267  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180 (Bit Score: 63; Significance: 4e-27; HSPs: 3)
Name: scaffold0180
Description:

Target: scaffold0180; HSP #1
Raw Score: 63; E-Value: 4e-27
Query Start/End: Original strand, 26 - 220
Target Start/End: Complemental strand, 34108 - 33914
Alignment:
Q  26 atcagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagaca 125  Q
    ||||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || || ||||||||||| | |    
T  34108 atcagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacatcttcttttcctttaacacttgcaacata 34009  T
Q  126 atcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaa 220  Q
    ||||| | |||||| ||||| |||||||||| | | || ||||||||||| ||||| || || ||||| ||||| | ||||||| | ||||||||    
T  34008 atctttaaatgctctgcatgctcttcttcagacctagaataaatcaaaatgtcatcaataaatacaaccacgaaccaatccaaataagcatggaa 33914  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 582 - 380
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  582 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 483  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  482 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 383  T
Q  239 cat 241  Q
    |||    
T  382 cat 380  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0180; HSP #3
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 4902 - 4700
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  4902 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 4803  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  4802 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 4703  T
Q  239 cat 241  Q
    |||    
T  4702 cat 4700  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0708 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0708
Description:

Target: scaffold0708; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 45 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 6481 - 6056
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    ||||||||||| ||  | ||||| || ||||||||  |||| || ||||| |  ||||| |||||||| || ||||| |||||  ||||||| || ||||    
T  6481 agaaaactcacttcacttaaccataactcacattttaacaactttgcatacaacttcttttctttcaaaacgtgcaatacaattctcagatgttctgcat 6382  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    | || |||||| ||||||| || || ||||||||||| || || || || | ||||  |||||  || |||||||| || || |||||||||||||| ||    
T  6381 gctcctcttcattcttggaatagattaaaatatcatcaataaataccaccatgaatttatccaggaaagcatggaaaattcggttcatatactccatgaa 6282  T
Q  245 cactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttact 344  Q
    ||| ||| | || || |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||  ||  | || || || ||||||||||| |||||||| ||  |     
T  6281 cacaccatgcgcgttagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatttcgtgtcctaaaggccgtcttctgcatgtcttcatccttcccc 6182  T
Q  345 ttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctat 444  Q
    || ||||| || ||||  |||||||| || || || || ||||    |||||| || |||||||||||||| || ||||| | | |||| |||||||| |    
T  6181 tttatctgatggtaaccagacctcaagtcgatcttactaaaaatctttgcaccaaccaactgatccatcaagtcgtcaatcctcagaagcggatacctgt 6082  T
Q  445 tcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    |||| || || |||||||||||||||    
T  6081 tctttatcgtaaccttgttcaactga 6056  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0060 (Bit Score: 62; Significance: 1e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0060
Description:

Target: scaffold0060; HSP #1
Raw Score: 62; E-Value: 1e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 277
Target Start/End: Original strand, 44736 - 44985
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  || || ||||||||||| ||  | |||||||| |||||||| ||||  || ||||| |   |||| || |||||||||||||| | |||    
T  44736 cagaaataatgtgacctagaaaactcacttcacttaaccagaactcacattttgacagcttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatataat 44835  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
      ||||||| |  ||||| || |||||| ||||||| |||||||| || ||||| || |||||||| || |||  ||||| ||| |||||||| || ||     
T  44836 tctcagatgttttgcatgctcctcttcattcttggaataaatcaagatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagaaaagcatggaaaattcgg 44935  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcat 277  Q
    |||||||||||||| ||||||||||| ||||| |||||||| ||||||||    
T  44936 ttcatatactccatgaacactccaggcgcattagtaacaccgaaaggcat 44985  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1646 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold1646
Description:

Target: scaffold1646; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 28 - 268
Target Start/End: Original strand, 1277 - 1517
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || || ||||| |||||||| ||||| |  ||||| |||||||| || || || |||||    
T  1277 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcgcattttgacaatttagcatacaacttcttttctttcaaaacctgtaatacaat 1376  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| ||||||||||| ||||| || || ||||||  ||||| ||| ||||| || || ||     
T  1377 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaaaatatcatcaatgaatactaccacgaatttatccagaaaagcatgaaaaattcgg 1476  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacacc 268  Q
    |||||||||||||| ||||| ||||| || || ||||||||    
T  1477 ttcatatactccatgaacacaccaggcgcgttagtaacacc 1517  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0894 (Bit Score: 61; Significance: 6e-26; HSPs: 1)
Name: scaffold0894
Description:

Target: scaffold0894; HSP #1
Raw Score: 61; E-Value: 6e-26
Query Start/End: Original strand, 31 - 147
Target Start/End: Original strand, 3882 - 3998
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||||||| | ||||||||| || ||||| ||||||||||||||  |||||||||| |||||||| ||||||||||||||||||||||| |  | |||    
T  3882 aaataacatgtctaagaaaacttacttcttttaaccagaattcacacatagacaatttagcataaagcttcttctctttcaacacttgcaaaatcacctt 3981  T
Q  131 cagatgctcagcatgtt 147  Q
    || ||||||||||||||    
T  3982 caaatgctcagcatgtt 3998  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 3)
Name: scaffold0348
Description:

Target: scaffold0348; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 261 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 18603 - 18394
Alignment:
Q  261 gtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataac 360  Q
    |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  |||| || || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || ||||    
T  18603 gtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgttctaaaggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaac 18504  T
Q  361 ttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttacctt 460  Q
     ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| || || |||||||| |||||||| | |||| |||||||||| ||||| || || || ||    
T  18503 ctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaattggtccatcaagtcatcaatcctcggatgtggatacctgttctttatcgtaacttt 18404  T
Q  461 gttcaactga 470  Q
    ||||||||||    
T  18403 gttcaactga 18394  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #2
Raw Score: 57; E-Value: 1e-23
Query Start/End: Original strand, 28 - 424
Target Start/End: Complemental strand, 10242 - 9831
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    ||||||||| ||||||||| ||||| || ||  | ||||| || |||||||| |||||||||||||| |  ||||| |||||||| ||  | || |||||    
T  10242 cagaaataatatggccaaggaaacttacttcacttaaccaaaactcacattttgacaatttggcatacaacttcttttctttcaaaacacgtaacacaat 10143  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaat----------cg-----atccaaaaat 212  Q
    | ||||||| || ||||| || ||||||||||| || ||||| || |||||||| || || || || ||||||          ||     | ||| |||     
T  10142 cctcagatgttctgcatgctcctcttcagtcttagaataaattaacatatcatcaataaataccaccacgaatttaaccagaacgaatttaaccagaaaa 10043  T
Q  213 gcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctga 312  Q
    ||||| || || || |||||||||||||| ||||| || || ||||| |||||||| |||||||| ||||| ||||| || |||||||| ||  | || |    
T  10042 gcatgaaaaattcggttcatatactccatgaacacacctggcgcattagtaacaccgaaaggcatcactttgtattcgtaatgaccatatcgtgtcctaa 9943  T
Q  313 aagctgtcttctgcatatcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccat 412  Q
    | || |||||||||||||||||||| || || ||||| || || |||| ||||||||| || || || || |||||   ||||||||| ||||| |||||    
T  9942 aggccgtcttctgcatatcttcatccttcaccttaatttgatggtaacctgacctcaagtcgatcttactaaaaacttttgcacccaccaactggtccat 9843  T
Q  413 caaatcatcaat 424  Q
    ||| ||||||||    
T  9842 caagtcatcaat 9831  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0348; HSP #3
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 5838 - 5760
Alignment:
Q  392 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||| ||||| |||||||| |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || || ||||||||||||    
T  5838 tgcacccaccaactggtccatcaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaactttgttcaactga 5760  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089 (Bit Score: 58; Significance: 3e-24; HSPs: 2)
Name: scaffold0089
Description:

Target: scaffold0089; HSP #1
Raw Score: 58; E-Value: 3e-24
Query Start/End: Original strand, 67 - 304
Target Start/End: Complemental strand, 15027 - 14790
Alignment:
Q  67 agaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagta 166  Q
    |||| |||||||| ||||| || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||| || || ||| ||||||| ||    
T  15027 agaactcacatttcgacaactttgcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcatgctcctcctcattcttggaata 14928  T
Q  167 aatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaaca 266  Q
     || ||||||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||||||  ||||||| ||||||||||| || ||||| || || ||||||    
T  14927 gattaaaatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaagattagattcatgtactccataaaaacaccaggcgcgttagtaaca 14828  T
Q  267 ccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacg 304  Q
    || |||||||| ||||| || || || |||||||||||    
T  14827 ccgaaaggcatcactttgtactcgtaatgaccataacg 14790  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0089; HSP #2
Raw Score: 43; E-Value: 0.000000000000003
Query Start/End: Original strand, 39 - 241
Target Start/End: Complemental strand, 618 - 416
Alignment:
Q  39 tggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgct 138  Q
    ||||||||||||||||| ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  || ||||||||||| |  ||||| |||||||||||||| |    
T  618 tggccaagaaaactcacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaactttttctctttcaaaatctgcaacacaatcttcagatgtt 519  T
Q  139 cagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactc 238  Q
    | | ||| | |||||||||| | || || |||| ||| ||||| || |||||||| || |||  ||||| | | |||||||| || || |||||||||||    
T  518 ctgaatgctattcttcagtccttgaatagatcagaatgtcatcaataaacacaaccacaaatttatccagataagcatggaaaattcggttcatatactc 419  T
Q  239 cat 241  Q
    |||    
T  418 cat 416  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0203 (Bit Score: 56; Significance: 5e-23; HSPs: 1)
Name: scaffold0203
Description:

Target: scaffold0203; HSP #1
Raw Score: 56; E-Value: 5e-23
Query Start/End: Original strand, 102 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 12578 - 12379
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatc 201  Q
    ||||||||||| | |||||| |||||||||||||| || ||||| |||||||||||||| || || |||| ||||| ||| || || ||||| || |||     
T  12578 ttctctttcaataattgcaacacaatcttcagatgttctgcatgctcttcttcagtctttgaatagatcagaatattatcaataaatacaaccacaaatt 12479  T
Q  202 gatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
      |||||  | |||||||| || || ||| |||||||||| ||||| ||||| ||||| |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  12478 tttccaagtaagcatggaaaattcggttcgtatactccatgaacacaccaggcgcattagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccata 12379  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0367 (Bit Score: 54; Significance: 8e-22; HSPs: 1)
Name: scaffold0367
Description:

Target: scaffold0367; HSP #1
Raw Score: 54; E-Value: 8e-22
Query Start/End: Original strand, 28 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 16502 - 16229
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  |||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| || ||||| |  ||||| || ||||| | |||||| || ||    
T  16502 cagaaataatgtggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacacttcgacaacttagcatacaacttcttttccttcaatatttgcaatactat 16403  T
Q  128 cttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcga 227  Q
    ||||||||| ||  ||||  ||| ||||||||| || ||||||| ||||||||| || |||||||| ||||||  |||||   | |||||||| || ||     
T  16402 cttcagatgttctacatgcactttttcagtctttgaataaatcagaatatcatcaataaacacaaccacgaatttatccaggtaagcatggaaaattcgg 16303  T
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
    ||||||||||| |  ||||| ||||| || || |||||||| |||||||| || || ||||| || ||||||||    
T  16302 ttcatatactctaggaacacaccaggcgcgttagtaacaccgaaaggcatcaccttgtattcgtaatgaccata 16229  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302 (Bit Score: 50; Significance: 2e-19; HSPs: 2)
Name: scaffold0302
Description:

Target: scaffold0302; HSP #1
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 165 - 606
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| ||||| || || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  165 agaaatcaaatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagaaaacttagcacataactggttctctttcaaaacttgcaacacaatc 264  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || ||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  265 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 364  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| | ||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  365 tcatgtattccataaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 464  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||||||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | | ||||||||||||||||||| |      
T  465 atcttccgcctttactctaatctggtgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagcagatccatcaaatcatcaatcctt 564  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  565 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 606  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0302; HSP #2
Raw Score: 50; E-Value: 2e-19
Query Start/End: Original strand, 29 - 470
Target Start/End: Original strand, 7107 - 7548
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatc 128  Q
    |||||| | ||| ||||| |||||||| || |||||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| |||||||| ||||||    
T  7107 agaaatcaaatgaccaaggaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacttgcaacacaatc 7206  T
Q  129 ttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgat 228  Q
     ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || ||||| || || || || |||| | | | ||| || || | ||    
T  7207 ctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacaccaccacaaaacggtccagataaggatgaaatattctat 7306  T
Q  229 tcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttctgcat 328  Q
    |||| || |||||||| || || || ||||| |  || ||||| | ||| ||   ||| |||||||| ||||| | | ||| ||| || || ||    ||    
T  7307 tcatgtattccataaaaacacctggcgcattagatactccaaatgacatcacagaatactcatagtgtccatacctcgttcggaacgcggttttggatat 7406  T
Q  329 atcttcatcttttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcac 428  Q
    ||||||  | |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||| ||||||||| |      
T  7407 atcttccgcctttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctatgcaccaaccagctgatccatcatatcatcaatcctt 7506  T
Q  429 ggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||||    
T  7507 ggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactga 7548  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146 (Bit Score: 45; Significance: 2e-16; HSPs: 2)
Name: scaffold0146
Description:

Target: scaffold0146; HSP #1
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 9973 - 9865
Alignment:
Q  362 tgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttg 461  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  9973 tgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacctta 9874  T
Q  462 ttcaactga 470  Q
    |||||||||    
T  9873 ttcaactga 9865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0146; HSP #2
Raw Score: 45; E-Value: 2e-16
Query Start/End: Original strand, 362 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 17640 - 17532
Alignment:
Q  362 tgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttg 461  Q
    ||||||||| ||||| || || || ||||| ||||||||||| |||||||| || |||||||| | ||||||||||||||| ||||| || || |||||     
T  17640 tgacctcaagtcaatcttactaaacacacgagcacccactaagtgatccattaagtcatcaatcctcggaagtggatacctgttctttatcgtaacctta 17541  T
Q  462 ttcaactga 470  Q
    |||||||||    
T  17540 ttcaactga 17532  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0692 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0692
Description:

Target: scaffold0692; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 339 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1926 - 1797
Alignment:
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| ||||| || ||   |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||    
T  1926 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttgctaaacacctctgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggat 1827  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||| |||| | || || || ||||||||||    
T  1826 accgattcataatcgtcactttgttcaact 1797  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0234 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0234
Description:

Target: scaffold0234; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 121
Target Start/End: Complemental strand, 23432 - 23339
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaa 121  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||||||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| || ||||||||||||||    
T  23432 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaattcacatttggacaacttggcatacaccttcttttccttcaacacttgcaa 23339  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0003 (Bit Score: 42; Significance: 0.00000000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0003
Description:

Target: scaffold0003; HSP #1
Raw Score: 42; E-Value: 0.00000000000001
Query Start/End: Original strand, 28 - 145
Target Start/End: Original strand, 195193 - 195310
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaat 127  Q
    |||||||||  ||||||||||||||||| ||  | ||||||||||||||||| ||||| || ||||| |  || ||||||||||  |||||||| |||||    
T  195193 cagaaataatgtggccaagaaaactcacttcacttaaccagaattcacatttcgacaacttagcatacaactttttctctttcagtacttgcaatacaat 195292  T
Q  128 cttcagatgctcagcatg 145  Q
    | ||||||| || |||||    
T  195293 cctcagatgttctgcatg 195310  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0387 (Bit Score: 41; Significance: 0.00000000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0387
Description:

Target: scaffold0387; HSP #1
Raw Score: 41; E-Value: 0.00000000000005
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Original strand, 16387 - 16451
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||||||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  16387 ctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagtggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 16451  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0697 (Bit Score: 40; Significance: 0.0000000000002; HSPs: 1)
Name: scaffold0697
Description:

Target: scaffold0697; HSP #1
Raw Score: 40; E-Value: 0.0000000000002
Query Start/End: Original strand, 28 - 95
Target Start/End: Complemental strand, 7006 - 6939
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataa 95  Q
    ||||||||||||| ||||||||| | || ||||| |||||||||||||| ||||||||||| ||||||    
T  7006 cagaaataacatgtccaagaaaaattacttcttttaaccagaattcacacttagacaatttagcataa 6939  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218 (Bit Score: 39; Significance: 0.0000000000007; HSPs: 3)
Name: scaffold0218
Description:

Target: scaffold0218; HSP #1
Raw Score: 39; E-Value: 0.0000000000007
Query Start/End: Original strand, 399 - 469
Target Start/End: Original strand, 26651 - 26721
Alignment:
Q  399 actaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||| |||||| | |||||| ||||||| |||||| ||||| ||| ||||||||||    
T  26651 actaactgatccatcaaataatcaatcctcggaagcggataccaattctttatagtcaccatgttcaactg 26721  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #2
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 1929 - 1865
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || ||||||||||    
T  1929 ctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaact 1865  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0218; HSP #3
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 31 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 2302 - 2143
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||| ||||| ||||| |||||||| || | |||||| || ||||| |||||||| || ||| | |  |  ||||||||||| || ||||| | |||| |    
T  2302 aaatcacatgaccaaggaaactcacttcctccaaccaaaactcacacttagacaacttagcacataactggttctctttcaagacctgcaacataatcct 2203  T
Q  131 cagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    || |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  2202 caaatgctcagcatgctcttcctcagactttgaatacaccaaaatatcatctattaacac 2143  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467 (Bit Score: 38; Significance: 0.000000000003; HSPs: 2)
Name: scaffold0467
Description:

Target: scaffold0467; HSP #1
Raw Score: 38; E-Value: 0.000000000003
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 1610 - 1533
Alignment:
Q  392 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||| || ||||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||| |||||| || || || |||||||||||    
T  1610 tgcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggataccgattcttaatcgtcactttgttcaactg 1533  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0467; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 114 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1888 - 1812
Alignment:
Q  114 acttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    |||||||| |||||| ||| |||||||||||| ||||| |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  1888 acttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcttcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacac 1812  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1488 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 1)
Name: scaffold1488
Description:

Target: scaffold1488; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 393 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 791 - 715
Alignment:
Q  393 gcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||| || ||||||||||||||||||||||| | |||||  ||||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  791 gcaccaaccaactgatccatcaaatcatcaatcctcggaatcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 715  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876 (Bit Score: 37; Significance: 0.00000000001; HSPs: 2)
Name: scaffold0876
Description:

Target: scaffold0876; HSP #1
Raw Score: 37; E-Value: 0.00000000001
Query Start/End: Original strand, 404 - 468
Target Start/End: Complemental strand, 923 - 859
Alignment:
Q  404 ctgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaact 468  Q
    ||||||||||||||||||||| | |||||| ||||||| |||||| || || |||||||||||||    
T  923 ctgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcggataccgattcttaatcgtcaccttgttcaact 859  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0876; HSP #2
Raw Score: 29; E-Value: 0.0000007
Query Start/End: Original strand, 102 - 190
Target Start/End: Complemental strand, 1225 - 1137
Alignment:
Q  102 ttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcatgttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacac 190  Q
    ||||| ||||| |||||||| |||||| ||| |||||||||||| || || |||| ||| || || | |||||||||||| || |||||    
T  1225 ttctccttcaagacttgcaacacaatcctcaaatgctcagcatgctcctcctcagacttcgaatacaccaaaatatcatctataaacac 1137  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0610 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0610
Description:

Target: scaffold0610; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 402 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 4905 - 4838
Alignment:
Q  402 aactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||||| | ||||||  |||||| |||||| || || ||||||||||||||    
T  4905 aactgatccatcaaatcatcaatcctcggaagcagataccgattcttaatcgtcaccttgttcaactg 4838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0369 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0369
Description:

Target: scaffold0369; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 339 - 466
Target Start/End: Original strand, 7008 - 7135
Alignment:
Q  339 tttactttaatctggtgataacttgacctcaaatcaattttgctgaaaacacgtgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggat 438  Q
    |||||| ||||||| ||||| | ||| ||||||||||| || || || ||   |||||| || | ||||||||||||||||||||| | | |||||||||    
T  7008 tttactctaatctgatgatatcctgatctcaaatcaatcttactaaacacctctgcaccaaccagctgatccatcaaatcatcaatcctctgaagtggat 7107  T
Q  439 acctattcttgatagttaccttgttcaa 466  Q
    ||| ||| || || || |||||||||||    
T  7108 accgatttttaatcgtcaccttgttcaa 7135  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0156 (Bit Score: 36; Significance: 0.00000000005; HSPs: 1)
Name: scaffold0156
Description:

Target: scaffold0156; HSP #1
Raw Score: 36; E-Value: 0.00000000005
Query Start/End: Original strand, 31 - 130
Target Start/End: Original strand, 36069 - 36168
Alignment:
Q  31 aaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatctt 130  Q
    |||||| ||||||||||||||| || ||  | |||||||| ||||| || ||||| |||||||| |  ||||| |||||||| |||||||| ||||||||    
T  36069 aaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccagaactcacactttgacaacttggcatacaacttcttttctttcaatacttgcaatacaatctt 36168  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0465 (Bit Score: 34; Significance: 0.0000000007; HSPs: 1)
Name: scaffold0465
Description:

Target: scaffold0465; HSP #1
Raw Score: 34; E-Value: 0.0000000007
Query Start/End: Original strand, 392 - 469
Target Start/End: Complemental strand, 13614 - 13537
Alignment:
Q  392 tgcacccactaactgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    |||||| |||| ||||||||||||||||||||| |  ||||||||||||  |||||| || || || |||||||||||    
T  13614 tgcaccaactagctgatccatcaaatcatcaatccttggaagtggatactcattcttaatcgtcactttgttcaactg 13537  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0269 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0269
Description:

Target: scaffold0269; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 29 - 85
Target Start/End: Original strand, 2218 - 2274
Alignment:
Q  29 agaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaa 85  Q
    |||||||||||| |||||||||||||| || |||||||| || ||||| ||||||||    
T  2218 agaaataacatgaccaagaaaactcacttccttcaaccaaaactcacacttagacaa 2274  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0249 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0249
Description:

Target: scaffold0249; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 28 - 112
Target Start/End: Complemental strand, 326 - 242
Alignment:
Q  28 cagaaataacatggccaagaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaa 112  Q
    ||||||||| ||||||||||||||| || ||  | ||||| ||||||||||| ||||| |||||||| |  ||||| ||||||||    
T  326 cagaaataatatggccaagaaaacttacttcacttaaccaaaattcacatttggacaacttggcatacaacttcttttctttcaa 242  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0092 (Bit Score: 33; Significance: 0.000000003; HSPs: 1)
Name: scaffold0092
Description:

Target: scaffold0092; HSP #1
Raw Score: 33; E-Value: 0.000000003
Query Start/End: Original strand, 405 - 469
Target Start/End: Original strand, 422 - 486
Alignment:
Q  405 tgatccatcaaatcatcaattcacggaagtggatacctattcttgatagttaccttgttcaactg 469  Q
    ||||||||||||||||||||   ||||||||||| || |||||| || ||||| |||||||||||    
T  422 tgatccatcaaatcatcaatcttcggaagtggattccgattcttaatcgttactttgttcaactg 486  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0827 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0827
Description:

Target: scaffold0827; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 228 - 323
Target Start/End: Original strand, 5259 - 5354
Alignment:
Q  228 ttcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccataacgcattctgaaagctgtcttc 323  Q
    ||||||||||||||||||||||| || || ||||  || ||||||||||| ||   ||| ||||| |||||||||||  ||||||| || ||||||    
T  5259 ttcatatactccataaacactcctggcgcgttggacactccaaaaggcatcaccgaatactcataatgaccataacggcttctgaaggcagtcttc 5354  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0375 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0375
Description:

Target: scaffold0375; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 435 - 470
Target Start/End: Complemental strand, 2873 - 2838
Alignment:
Q  435 ggatacctattcttgatagttaccttgttcaactga 470  Q
    ||||||||||||||||||||||| ||||||||||||    
T  2873 ggatacctattcttgatagttactttgttcaactga 2838  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold0062 (Bit Score: 32; Significance: 0.00000001; HSPs: 1)
Name: scaffold0062
Description:

Target: scaffold0062; HSP #1
Raw Score: 32; E-Value: 0.00000001
Query Start/End: Original strand, 45 - 244
Target Start/End: Complemental strand, 9119 - 8920
Alignment:
Q  45 agaaaactcacgtctttcaaccagaattcacatttagacaatttggcataaagtttcttctctttcaacacttgcaagacaatcttcagatgctcagcat 144  Q
    |||||||| || || || |||||||| |||||||| || || || ||||| |   |||| || |||||||||||||| |||||  |||||||||| ||||    
T  9119 agaaaacttacttcatttaaccagaactcacattttgataacttagcatacaacctcttttccttcaacacttgcaatacaattctcagatgctctgcat 9020  T
Q  145 gttcttcttcagtcttggagtaaatcaaaatatcatcgatgaacacaactacgaatcgatccaaaaatgcatggaagatgcgattcatatactccataaa 244  Q
    | || || ||| ||||||| || || || |||||||| || ||||| || || ||   ||||| ||| |||||||| ||  | ||||| |||||||||||    
T  9019 gctcctcctcattcttggaatatattaatatatcatcaataaacaccacaacaaacttatccagaaaagcatggaaaatttggttcatgtactccataaa 8920  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]

Target: scaffold1208 (Bit Score: 31; Significance: 0.00000004; HSPs: 1)
Name: scaffold1208
Description:

Target: scaffold1208; HSP #1
Raw Score: 31; E-Value: 0.00000004
Query Start/End: Original strand, 227 - 301
Target Start/End: Complemental strand, 1843 - 1769
Alignment:
Q  227 attcatatactccataaacactccaggtgcattggtaacaccaaaaggcataactttatattcatagtgaccata 301  Q
    |||||| | |||||| |||||||| |||||||| || || ||||||||||||||   |||||| |||||||||||    
T  1843 attcatgtgctccatgaacactcctggtgcattagtcaccccaaaaggcataaccaaatattcgtagtgaccata 1769  T

Back To: [ HSP Overview ] [ Target Overview ] [ Alignment Overview ]



© Oklahoma State University